View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2449_high_6 (Length: 299)

Name: NF2449_high_6
Description: NF2449
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2449_high_6
NF2449_high_6
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-287)||(12497802-12498088)
chr3 (1-287)||(14876789-14877075)
chr3 (1-287)||(17489404-17489690)
chr3 (1-289)||(9522273-9522561)
chr3 (1-287)||(16370967-16371253)
chr3 (1-287)||(16492471-16492757)
chr3 (1-284)||(16807219-16807502)
chr3 (10-287)||(10905773-10906050)
chr3 (1-287)||(16691714-16692000)
chr3 (4-287)||(15348535-15348818)
chr3 (10-287)||(10005163-10005440)
chr3 (10-287)||(48425010-48425287)
chr3 (4-287)||(15725223-15725506)
chr3 (10-287)||(13252253-13252530)
chr3 (10-287)||(15589682-15589959)
chr3 (10-287)||(16635336-16635613)
chr3 (10-287)||(43162660-43162937)
chr3 (10-287)||(20062344-20062621)
chr3 (4-287)||(15338826-15339109)
chr3 (4-287)||(15402800-15403083)
chr3 (1-286)||(15208445-15208730)
chr3 (7-287)||(53385308-53385588)
chr3 (4-287)||(5425220-5425502)
chr3 (5-287)||(26792689-26792971)
chr3 (4-287)||(6600304-6600587)
chr3 (4-287)||(16412572-16412855)
chr3 (4-287)||(16756875-16757158)
chr3 (25-289)||(15247725-15247989)
chr3 (16-287)||(15227228-15227499)
chr3 (25-287)||(13972399-13972661)
chr3 (13-287)||(47123520-47123794)
chr3 (16-287)||(13322931-13323202)
chr3 (1-287)||(10383533-10383819)
chr3 (34-287)||(15953247-15953500)
chr3 (16-287)||(18134625-18134896)
chr3 (1-287)||(14571412-14571698)
chr3 (13-289)||(16329936-16330212)
chr3 (64-287)||(12850558-12850781)
chr3 (137-287)||(15016034-15016184)
chr3 (16-287)||(10420324-10420595)
chr3 (25-287)||(14086261-14086523)
chr3 (34-289)||(8759359-8759614)
chr3 (34-289)||(13941621-13941876)
chr3 (34-289)||(41177119-41177374)
chr3 (16-284)||(11304055-11304323)
chr3 (16-284)||(12360824-12361092)
chr3 (13-287)||(11961313-11961587)
chr3 (16-140)||(31689049-31689173)
chr3 (16-142)||(31945051-31945177)
chr3 (111-289)||(16836787-16836965)
chr3 (34-199)||(16381294-16381459)
chr3 (16-287)||(44776826-44777097)
chr3 (157-287)||(8274689-8274819)
chr3 (157-287)||(16742993-16743123)
chr3 (157-275)||(6153141-6153259)
chr3 (157-287)||(13975335-13975465)
chr3 (157-287)||(15576470-15576600)
chr3 (173-275)||(21686681-21686783)
chr3 (235-287)||(17192892-17192944)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (1-286)||(24675055-24675340)
chr2 (1-287)||(22757054-22757340)
chr2 (1-287)||(21325857-21326143)
chr2 (1-287)||(23188574-23188860)
chr2 (1-287)||(24708073-24708359)
chr2 (1-287)||(23138603-23138889)
chr2 (1-287)||(23550393-23550679)
chr2 (1-248)||(27377101-27377348)
chr2 (10-287)||(16924835-16925112)
chr2 (10-287)||(16998575-16998852)
chr2 (22-287)||(23063664-23063929)
chr2 (4-287)||(44386160-44386443)
chr2 (10-287)||(16981727-16982004)
chr2 (10-287)||(17063292-17063569)
chr2 (4-287)||(21145621-21145904)
chr2 (10-287)||(9609711-9609988)
chr2 (10-287)||(27217591-27217868)
chr2 (4-287)||(22325447-22325730)
chr2 (4-287)||(24709602-24709885)
chr2 (4-287)||(24261939-24262222)
chr2 (4-287)||(24878586-24878869)
chr2 (4-287)||(27370838-27371121)
chr2 (10-287)||(10868425-10868702)
chr2 (10-287)||(17066953-17067227)
chr2 (11-286)||(23087026-23087301)
chr2 (13-287)||(30211508-30211782)
chr2 (100-287)||(24825873-24826060)
chr2 (25-287)||(27365670-27365932)
chr2 (13-287)||(31830236-31830510)
chr2 (13-287)||(11358465-11358739)
chr2 (18-287)||(45529100-45529363)
chr2 (4-175)||(41609047-41609218)
chr2 (13-286)||(20832563-20832836)
chr2 (16-287)||(23293539-23293810)
chr2 (13-287)||(1063329-1063603)
chr2 (16-287)||(23276357-23276628)
chr2 (34-289)||(27787340-27787595)
chr2 (36-275)||(24653946-24654185)
chr2 (13-91)||(24833360-24833438)
chr2 (34-199)||(24944966-24945131)
chr2 (34-289)||(12573952-12574207)
chr2 (157-287)||(22276001-22276131)
chr2 (1-42)||(45676685-45676726)
chr2 (1-41)||(23599837-23599877)
chr2 (175-287)||(25128387-25128499)
chr2 (157-287)||(12640510-12640640)
chr2 (157-287)||(24831778-24831908)
chr2 (258-287)||(27368423-27368452)
chr2 (19-59)||(17967577-17967617)
chr2 (173-221)||(23817750-23817798)
chr2 (173-221)||(28144701-28144749)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (1-287)||(23516408-23516694)
chr5 (1-287)||(23573609-23573895)
chr5 (1-287)||(23440092-23440378)
chr5 (1-286)||(18775644-18775929)
chr5 (1-287)||(21984538-21984824)
chr5 (1-287)||(25423056-25423342)
chr5 (33-284)||(20798659-20798910)
chr5 (4-287)||(22333120-22333403)
chr5 (12-287)||(26738938-26739213)
chr5 (4-287)||(14999972-15000255)
chr5 (10-287)||(40708656-40708933)
chr5 (4-287)||(19769830-19770113)
chr5 (4-287)||(27610224-27610507)
chr5 (1-287)||(23471096-23471382)
chr5 (10-287)||(34566370-34566647)
chr5 (4-289)||(41770712-41770997)
chr5 (4-287)||(27668723-27669006)
chr5 (4-287)||(27685633-27685916)
chr5 (10-287)||(16356378-16356655)
chr5 (4-287)||(22134538-22134821)
chr5 (4-287)||(27518277-27518560)
chr5 (4-289)||(29476304-29476589)
chr5 (4-287)||(37291729-37292012)
chr5 (11-275)||(20468341-20468605)
chr5 (10-212)||(21343666-21343868)
chr5 (23-287)||(22348314-22348576)
chr5 (1-239)||(20573388-20573626)
chr5 (77-287)||(21498269-21498479)
chr5 (35-284)||(21564202-21564451)
chr5 (25-287)||(23442526-23442788)
chr5 (16-287)||(21890992-21891263)
chr5 (13-287)||(25847936-25848210)
chr5 (16-287)||(22461816-22462087)
chr5 (16-287)||(24735844-24736115)
chr5 (16-287)||(24737018-24737289)
chr5 (16-287)||(24749787-24750058)
chr5 (16-287)||(28924001-28924272)
chr5 (13-287)||(14887224-14887498)
chr5 (16-287)||(28895175-28895446)
chr5 (13-287)||(37545729-37546004)
chr5 (13-287)||(24798630-24798904)
chr5 (13-260)||(21662300-21662546)
chr5 (13-287)||(20342143-20342417)
chr5 (13-287)||(22381060-22381334)
chr5 (13-286)||(22502540-22502813)
chr5 (16-287)||(22236153-22236424)
chr5 (13-221)||(21404715-21404923)
chr5 (16-287)||(20773624-20773895)
chr5 (34-260)||(21665761-21665986)
chr5 (13-287)||(23080322-23080596)
chr5 (16-287)||(20821317-20821588)
chr5 (34-287)||(17269566-17269819)
chr5 (210-287)||(21339519-21339596)
chr5 (157-287)||(11210927-11211057)
chr5 (157-287)||(27011089-27011219)
chr5 (157-287)||(21937421-21937551)
chr5 (13-86)||(21625397-21625470)
chr5 (173-287)||(23503464-23503578)
chr5 (157-287)||(24581216-24581346)
chr5 (253-289)||(21404939-21404975)
chr5 (177-274)||(25244598-25244695)
chr5 (177-274)||(25308750-25308847)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (1-287)||(21167031-21167317)
chr8 (1-287)||(30313638-30313924)
chr8 (1-287)||(19977968-19978254)
chr8 (1-287)||(15533381-15533667)
chr8 (1-287)||(16408539-16408825)
chr8 (1-287)||(21250943-21251229)
chr8 (1-287)||(22164685-22164971)
chr8 (1-287)||(22133535-22133821)
chr8 (1-287)||(32600145-32600431)
chr8 (1-287)||(21394359-21394645)
chr8 (1-287)||(21788852-21789138)
chr8 (1-287)||(21922229-21922515)
chr8 (12-284)||(22046385-22046657)
chr8 (3-287)||(23650044-23650328)
chr8 (1-287)||(22032033-22032319)
chr8 (4-287)||(17674517-17674800)
chr8 (10-287)||(19112700-19112977)
chr8 (4-287)||(20018244-20018527)
chr8 (4-287)||(19485364-19485647)
chr8 (1-239)||(15441182-15441420)
chr8 (1-287)||(22987202-22987488)
chr8 (4-287)||(22120668-22120951)
chr8 (11-273)||(23948900-23949162)
chr8 (13-287)||(20396619-20396893)
chr8 (34-286)||(20388133-20388385)
chr8 (16-287)||(20010394-20010665)
chr8 (35-286)||(21681965-21682216)
chr8 (145-287)||(22377947-22378089)
chr8 (145-287)||(22384122-22384264)
chr8 (16-287)||(1266255-1266526)
chr8 (13-287)||(6679124-6679398)
chr8 (16-287)||(19851427-19851698)
chr8 (16-287)||(19857463-19857734)
chr8 (13-287)||(804167-804441)
chr8 (16-287)||(21324903-21325175)
chr8 (16-287)||(22061927-22062198)
chr8 (16-284)||(20007866-20008134)
chr8 (16-287)||(23654943-23655214)
chr8 (13-287)||(14565155-14565429)
chr8 (16-287)||(21840433-21840704)
chr8 (16-287)||(31416968-31417239)
chr8 (13-287)||(6603671-6603945)
chr8 (13-287)||(29303920-29304194)
chr8 (13-272)||(16265127-16265386)
chr8 (34-289)||(31571334-31571589)
chr8 (13-275)||(28982370-28982632)
chr8 (13-275)||(28987590-28987852)
chr8 (13-287)||(12304771-12305045)
chr8 (13-210)||(27347239-27347436)
chr8 (157-287)||(20652827-20652957)
chr8 (155-287)||(22051018-22051150)
chr8 (157-287)||(22982593-22982723)
chr8 (238-287)||(23949158-23949207)
chr8 (157-273)||(21197010-21197126)
chr8 (157-287)||(16877589-16877719)
chr8 (157-287)||(21850831-21850961)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (1-287)||(278884-279170)
scaffold0005 (13-287)||(164763-165037)
scaffold0005 (4-287)||(308628-308911)
scaffold0005 (16-287)||(260289-260560)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (1-287)||(65372-65657)
scaffold0042 (1-206)||(39924-40129)
scaffold0042 (254-286)||(39874-39906)
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (1-287)||(19864486-19864772)
chr6 (1-287)||(12497825-12498111)
chr6 (1-287)||(12510790-12511076)
chr6 (1-286)||(21833178-21833463)
chr6 (1-287)||(12505154-12505440)
chr6 (1-286)||(25765487-25765771)
chr6 (1-287)||(16963563-16963849)
chr6 (1-287)||(16927836-16928122)
chr6 (1-289)||(25610055-25610343)
chr6 (1-287)||(27331629-27331915)
chr6 (1-287)||(27392369-27392655)
chr6 (1-286)||(22078885-22079170)
chr6 (1-286)||(18408140-18408425)
chr6 (1-287)||(5839415-5839701)
chr6 (4-287)||(1543280-1543563)
chr6 (4-287)||(16626913-16627196)
chr6 (4-287)||(28263393-28263676)
chr6 (4-287)||(28342142-28342425)
chr6 (10-287)||(29592116-29592393)
chr6 (4-287)||(24313364-24313647)
chr6 (4-287)||(25112354-25112637)
chr6 (1-287)||(23078268-23078554)
chr6 (4-287)||(2874999-2875282)
chr6 (4-287)||(27187238-27187521)
chr6 (4-287)||(27261719-27262002)
chr6 (1-286)||(22762652-22762937)
chr6 (4-287)||(28292568-28292851)
chr6 (4-222)||(17032364-17032582)
chr6 (16-287)||(25750623-25750894)
chr6 (13-287)||(21471412-21471686)
chr6 (24-287)||(18197743-18198006)
chr6 (1-133)||(22433796-22433928)
chr6 (34-287)||(25768023-25768276)
chr6 (25-287)||(14131375-14131637)
chr6 (16-287)||(15459150-15459421)
chr6 (13-287)||(10469045-10469319)
chr6 (35-284)||(22796831-22797080)
chr6 (16-287)||(19879112-19879383)
chr6 (52-287)||(34645782-34646017)
chr6 (13-287)||(24364223-24364497)
chr6 (25-286)||(21564329-21564590)
chr6 (16-287)||(18794504-18794775)
chr6 (16-286)||(8766345-8766615)
chr6 (27-287)||(11287794-11288054)
chr6 (208-287)||(11291818-11291897)
chr6 (81-286)||(17415365-17415570)
chr6 (34-287)||(27560813-27561066)
chr6 (27-287)||(11280701-11280961)
chr6 (156-280)||(25750900-25751024)
chr6 (145-289)||(1640715-1640859)
chr6 (16-91)||(1640613-1640688)
chr6 (34-289)||(28283007-28283262)
chr6 (109-287)||(14381663-14381841)
chr6 (16-82)||(18787702-18787768)
chr6 (157-287)||(25743283-25743413)
chr6 (157-286)||(16098005-16098134)
chr6 (118-287)||(18800858-18801027)
chr6 (157-287)||(16382569-16382699)
chr6 (173-287)||(18571622-18571736)
chr6 (173-287)||(1648980-1649094)
chr6 (157-275)||(18838116-18838234)
chr6 (157-287)||(23996203-23996333)
chr6 (160-280)||(16233167-16233287)
[»] chr4 (56 HSPs)
chr4 (1-287)||(16252236-16252522)
chr4 (1-287)||(16355236-16355522)
chr4 (4-287)||(12523614-12523897)
chr4 (31-287)||(15149797-15150053)
chr4 (1-286)||(7090368-7090652)
chr4 (4-287)||(14680505-14680788)
chr4 (1-287)||(18227237-18227523)
chr4 (13-287)||(14652255-14652529)
chr4 (10-287)||(18297149-18297426)
chr4 (10-287)||(23955691-23955968)
chr4 (4-287)||(19778584-19778867)
chr4 (1-287)||(14159427-14159713)
chr4 (10-287)||(8386356-8386633)
chr4 (10-287)||(12476544-12476821)
chr4 (15-287)||(14851157-14851429)
chr4 (4-287)||(14303769-14304051)
chr4 (16-287)||(27711286-27711557)
chr4 (10-287)||(29039195-29039472)
chr4 (4-287)||(14266690-14266973)
chr4 (4-286)||(40472978-40473260)
chr4 (4-287)||(8053414-8053697)
chr4 (10-263)||(15364330-15364583)
chr4 (1-186)||(14927151-14927336)
chr4 (16-287)||(15003415-15003686)
chr4 (13-287)||(3264845-3265119)
chr4 (16-287)||(16145862-16146133)
chr4 (13-287)||(11207282-11207556)
chr4 (13-287)||(15070360-15070634)
chr4 (13-287)||(29453588-29453862)
chr4 (13-287)||(33222865-33223139)
chr4 (16-287)||(1649328-1649599)
chr4 (16-287)||(15245874-15246145)
chr4 (13-287)||(20890930-20891203)
chr4 (13-287)||(44661917-44662191)
chr4 (166-287)||(15415077-15415198)
chr4 (4-85)||(18607823-18607904)
chr4 (34-289)||(51606230-51606485)
chr4 (203-287)||(16676494-16676578)
chr4 (34-199)||(42702871-42703036)
chr4 (115-287)||(15359141-15359313)
chr4 (53-195)||(18164332-18164474)
chr4 (157-287)||(13247736-13247866)
chr4 (210-287)||(1640216-1640293)
chr4 (138-287)||(16752665-16752814)
chr4 (159-287)||(55375409-55375537)
chr4 (16-91)||(15415226-15415301)
chr4 (173-275)||(12132472-12132574)
chr4 (157-287)||(14997407-14997537)
chr4 (135-200)||(9849616-9849681)
chr4 (139-287)||(27900459-27900607)
chr4 (157-287)||(16445263-16445393)
chr4 (157-287)||(9290926-9291056)
chr4 (157-287)||(15293208-15293338)
chr4 (16-125)||(15319533-15319642)
chr4 (1-30)||(15351934-15351963)
chr4 (16-69)||(15359326-15359379)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-287)||(64085-64371)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-287)||(642-928)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-287)||(5980-6266)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-287)||(33627-33913)
scaffold0109 (1-287)||(8562-8848)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-287)||(14326-14612)
scaffold0044 (4-287)||(589-872)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (1-285)||(15154714-15154998)
chr7 (1-287)||(17376-17662)
chr7 (4-287)||(11553162-11553445)
chr7 (4-287)||(12687428-12687711)
chr7 (4-287)||(11237273-11237556)
chr7 (4-287)||(14954547-14954830)
chr7 (10-287)||(8198561-8198838)
chr7 (4-287)||(8707532-8707815)
chr7 (4-287)||(10870922-10871205)
chr7 (4-287)||(15161117-15161400)
chr7 (1-287)||(14332321-14332607)
chr7 (1-289)||(14037731-14038019)
chr7 (1-289)||(14347761-14348049)
chr7 (4-287)||(23516829-23517112)
chr7 (12-287)||(15203814-15204089)
chr7 (4-287)||(18177669-18177952)
chr7 (4-287)||(18551818-18552101)
chr7 (10-287)||(44791411-44791688)
chr7 (4-287)||(13685990-13686274)
chr7 (64-287)||(15624539-15624762)
chr7 (16-287)||(12206838-12207109)
chr7 (16-287)||(15102639-15102910)
chr7 (16-287)||(19147151-19147422)
chr7 (16-287)||(20746550-20746821)
chr7 (16-287)||(8212166-8212437)
chr7 (16-287)||(14264282-14264553)
chr7 (13-287)||(11306301-11306575)
chr7 (13-287)||(49152238-49152512)
chr7 (16-287)||(16072332-16072603)
chr7 (16-287)||(11388466-11388736)
chr7 (13-289)||(21661900-21662173)
chr7 (16-287)||(13665493-13665759)
chr7 (34-287)||(16950509-16950762)
chr7 (34-286)||(14286415-14286667)
chr7 (34-289)||(18053989-18054244)
chr7 (34-289)||(23199779-23200034)
chr7 (34-289)||(23505906-23506161)
chr7 (13-287)||(13021294-13021568)
chr7 (181-287)||(35964910-35965016)
chr7 (34-287)||(6413469-6413722)
chr7 (16-287)||(14129813-14130084)
chr7 (16-287)||(14433631-14433902)
chr7 (13-287)||(12455640-12455913)
chr7 (1-59)||(12254326-12254384)
chr7 (34-289)||(1443-1698)
chr7 (34-199)||(26288162-26288327)
chr7 (230-286)||(11772302-11772358)
chr7 (34-149)||(15340454-15340569)
chr7 (118-287)||(26118643-26118812)
chr7 (173-287)||(14936443-14936557)
chr7 (157-287)||(7823980-7824110)
chr7 (157-287)||(12368636-12368766)
chr7 (173-287)||(15364036-15364150)
chr7 (13-91)||(26118818-26118896)
chr7 (157-287)||(27107834-27107964)
chr7 (16-125)||(15479338-15479447)
chr7 (166-280)||(41213-41327)
chr7 (157-287)||(4440008-4440138)
chr7 (256-287)||(9596236-9596267)
chr7 (157-280)||(21674600-21674723)
chr7 (173-275)||(45146652-45146753)
chr7 (173-201)||(13353247-13353275)
chr7 (172-272)||(20466877-20466977)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-287)||(127253-127539)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-287)||(17045138-17045424)
chr1 (1-287)||(20249800-20250086)
chr1 (1-287)||(50620367-50620653)
chr1 (4-287)||(19106320-19106603)
chr1 (1-287)||(20136728-20137014)
chr1 (16-287)||(16350722-16350993)
chr1 (1-287)||(21747485-21747770)
chr1 (11-287)||(19760989-19761265)
chr1 (4-287)||(33391152-33391435)
chr1 (1-233)||(16078810-16079042)
chr1 (4-287)||(21830256-21830539)
chr1 (4-287)||(51333616-51333899)
chr1 (21-286)||(16369267-16369532)
chr1 (4-284)||(21836903-21837183)
chr1 (4-287)||(41354592-41354875)
chr1 (1-224)||(50612602-50612825)
chr1 (16-287)||(19664999-19665270)
chr1 (1-152)||(21163230-21163381)
chr1 (34-287)||(20940186-20940439)
chr1 (13-287)||(37677041-37677316)
chr1 (13-284)||(31550307-31550578)
chr1 (16-287)||(20856884-20857155)
chr1 (16-284)||(19854279-19854547)
chr1 (13-287)||(20294374-20294648)
chr1 (13-284)||(20075185-20075456)
chr1 (16-287)||(22433239-22433510)
chr1 (34-287)||(20244183-20244436)
chr1 (135-287)||(11382678-11382830)
chr1 (117-287)||(41307891-41308061)
chr1 (13-209)||(20395194-20395390)
chr1 (64-287)||(20836011-20836237)
chr1 (13-91)||(24476942-24477020)
chr1 (157-287)||(20831515-20831645)
chr1 (157-287)||(46518827-46518957)
chr1 (157-219)||(22142232-22142294)
chr1 (256-287)||(16078775-16078806)
chr1 (157-275)||(20914316-20914434)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-287)||(4459-4745)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (1-287)||(27933-28219)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-283)||(32810-33092)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-287)||(219471-219757)
scaffold0012 (1-287)||(229009-229295)
scaffold0012 (157-287)||(33049-33179)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-289)||(875-1162)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (5-287)||(180187-180469)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-287)||(36-322)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-287)||(5989-6275)
scaffold0120 (34-287)||(1578-1831)
scaffold0120 (157-287)||(22816-22946)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-287)||(6348-6624)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-287)||(16953-17239)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (1-287)||(162079-162365)
scaffold0001 (1-287)||(448025-448311)
scaffold0001 (34-287)||(90986-91239)
scaffold0001 (157-280)||(78690-78813)
scaffold0001 (124-199)||(175352-175427)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (5-286)||(749-1029)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-286)||(9309-9594)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (11-294)||(111997-112280)
scaffold0004 (13-287)||(203522-203796)
scaffold0004 (16-289)||(117549-117822)
scaffold0004 (34-287)||(322703-322956)
scaffold0004 (13-287)||(385797-386071)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (1-287)||(1105-1391)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-287)||(5187-5473)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (4-287)||(109865-110148)
scaffold0029 (16-287)||(112540-112811)
scaffold0029 (16-287)||(96056-96327)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-287)||(14843-15129)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-287)||(15133-15409)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (4-287)||(383-666)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (4-284)||(43123-43403)
scaffold0028 (4-287)||(8454-8737)
scaffold0028 (203-287)||(13834-13918)
scaffold0028 (25-287)||(50568-50830)
scaffold0028 (157-287)||(106627-106757)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (4-287)||(7346-7629)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-287)||(971-1257)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-287)||(3998-4284)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-287)||(15459-15744)
scaffold0333 (212-287)||(15832-15907)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-287)||(14005-14291)
scaffold0106 (16-287)||(31391-31662)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (10-287)||(3115-3392)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (10-287)||(26587-26864)
scaffold0011 (16-287)||(148551-148822)
scaffold0011 (16-286)||(195758-196027)
scaffold0011 (16-199)||(68582-68765)
scaffold0011 (157-287)||(122004-122134)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (1-287)||(16519-16805)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (4-287)||(6906-7191)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (11-287)||(314-590)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (1-220)||(16923-17142)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (13-287)||(116959-117233)
scaffold0037 (157-287)||(98137-98267)
scaffold0037 (157-221)||(23586-23650)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (34-287)||(1-254)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (11-287)||(13031-13307)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (13-280)||(886-1153)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (48-287)||(49506-49745)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (100-286)||(21932-22118)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-287)||(16470-16756)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (100-287)||(7855-8042)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (13-287)||(25773-26047)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (13-287)||(5645-5918)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (13-287)||(25125-25399)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (112-287)||(9047-9222)
scaffold0507 (1-91)||(6943-7033)
scaffold0507 (157-275)||(399-517)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (16-287)||(10793-11064)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (13-289)||(86556-86832)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (25-287)||(26132-26394)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (34-284)||(28826-29076)
scaffold0064 (34-284)||(40817-41067)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (34-282)||(3874-4122)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (16-287)||(13955-14226)
scaffold0034 (70-287)||(5007-5224)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (16-286)||(79-349)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (25-287)||(7090-7352)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (25-287)||(19973-20235)
scaffold0298 (16-287)||(13415-13686)
scaffold0298 (16-287)||(17185-17456)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (34-287)||(47123-47376)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (79-280)||(58467-58668)
scaffold0058 (35-287)||(19120-19372)
scaffold0058 (13-71)||(59042-59100)
scaffold0058 (173-275)||(74038-74140)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (34-286)||(51918-52170)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (49-199)||(4567-4717)
scaffold0023 (1-113)||(36974-37086)
scaffold0023 (235-287)||(4508-4560)
scaffold0023 (34-86)||(18993-19045)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (34-287)||(2750-3003)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (160-284)||(7522-7646)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (16-287)||(10137-10408)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (16-287)||(18591-18862)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (16-287)||(27500-27771)
scaffold0139 (16-287)||(1203-1473)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (136-286)||(835-985)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (25-287)||(1223-1485)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (34-287)||(5968-6220)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (16-287)||(9779-10045)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (16-287)||(14067-14337)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (16-286)||(3872-4142)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (25-243)||(1167-1385)
scaffold0165 (1-59)||(26203-26261)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (16-287)||(172-443)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (16-287)||(25919-26190)
scaffold0113 (13-287)||(16654-16928)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (25-287)||(21725-21987)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (16-286)||(27207-27476)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (34-287)||(5056-5309)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (16-287)||(14305-14576)
scaffold0203 (16-179)||(9039-9202)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (16-287)||(509-780)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-287)||(39720-39991)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (16-287)||(18830-19101)
scaffold0090 (118-287)||(23094-23263)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (16-287)||(49261-49532)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (16-287)||(42387-42658)
scaffold0010 (16-287)||(47453-47724)
scaffold0010 (137-215)||(2252-2330)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (1-286)||(38942-39227)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (34-287)||(37201-37454)
scaffold0026 (115-287)||(27391-27563)
scaffold0026 (115-287)||(38228-38400)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (16-287)||(49087-49358)
scaffold0053 (16-287)||(57871-58141)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (45-287)||(4760-5002)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (13-287)||(16767-17041)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (16-287)||(6164-6436)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (16-287)||(10869-11140)
scaffold0124 (25-287)||(453-715)
scaffold0124 (157-287)||(7864-7994)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (16-287)||(20103-20374)
scaffold0114 (1-286)||(43471-43756)
scaffold0114 (1-286)||(44483-44768)
scaffold0114 (16-199)||(36036-36219)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (13-287)||(26239-26513)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (25-287)||(33731-33993)
scaffold0076 (157-287)||(40380-40510)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (16-245)||(4235-4464)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (34-286)||(12836-13088)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (16-287)||(61267-61538)
scaffold0067 (34-287)||(67655-67908)
scaffold0067 (16-287)||(52233-52504)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (34-184)||(2023-2173)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (25-194)||(136109-136278)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (34-287)||(248612-248865)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (34-214)||(13380-13560)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-91)||(6239-6329)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (157-287)||(1916-2046)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (34-287)||(7292-7543)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (36-209)||(42784-42957)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-59)||(7498-7556)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (25-133)||(45835-45943)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (140-280)||(28327-28467)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (157-287)||(964-1094)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (173-287)||(14661-14775)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (157-287)||(46276-46406)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (135-287)||(5313-5465)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (166-286)||(1-121)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (159-287)||(23518-23646)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (157-287)||(3929-4059)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (157-287)||(14779-14909)
scaffold0132 (234-287)||(43737-43790)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (157-280)||(24002-24125)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (173-287)||(1108-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (157-287)||(440-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (157-287)||(8217-8347)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (173-287)||(10493-10607)
scaffold0447 (173-287)||(5879-5993)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (157-287)||(14791-14921)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (16-122)||(3487-3593)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (157-287)||(13030-13160)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (250-287)||(3773-3810)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (16-91)||(887-962)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (157-287)||(3281-3411)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (173-287)||(8488-8602)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (16-85)||(9200-9269)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (230-287)||(1288-1345)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (173-280)||(4005-4112)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (233-287)||(26211-26265)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 12497802 - 12498088
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12497802 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12497901  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497902 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 12498001  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498002 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14877075 - 14876789
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  14877075 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccaa 14876976  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876975 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 14876876  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876875 aggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14876789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 17489404 - 17489690
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  17489404 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 17489503  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489504 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 17489603  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489604 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17489690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 9522273 - 9522561
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| || |    
T  9522273 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaaccca 9522372  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9522373 ctcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 9522472  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9522473 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtg 9522561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 16370967 - 16371253
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16370967 tcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16371066  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16371067 ctcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 16371166  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371167 aggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16371253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16492757 - 16492471
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16492757 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16492658  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16492657 ctcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagtcac 16492558  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492557 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16492471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 16807502 - 16807219
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  16807502 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccca 16807403  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16807402 ctcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 16807303  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16807302 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgact 16807219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906050
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10906050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 16691714 - 16692000
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16691714 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16691813  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || || |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16691814 cacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 16691913  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16691914 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16692000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15348818 - 15348535
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  15348818 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 15348719  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  15348718 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15348619  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348618 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15348535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005440
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10005440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425287
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 48425287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15725506 - 15725223
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  15725506 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15725407  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |    
T  15725406 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagg 15725307  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15725306 agtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 15725223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252530
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 13252530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589682
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15589682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635613
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16635613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43162937
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 43162937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062344
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 20062344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15339109
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| || ||||    
T  15338826 tcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 15338925  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| || |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  15338926 ggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcatagg 15339025  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15339026 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15339109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15403083 - 15402800
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || | ||| || ||||    
T  15403083 tcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 15402984  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |    
T  15402983 ggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcatagg 15402884  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15402883 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 15402800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 15208445 - 15208730
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||  ||| || |    
T  15208445 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaaccca 15208544  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  15208545 ctcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 15208644  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15208645 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 15208730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 53385588 - 53385308
Alignment:
Q  7 ctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggt 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||    
T  53385588 ctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggt 53385489  T
Q  107 acgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagt 206  Q
    | |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53385488 aagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagt 53385389  T
Q  207 gactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385388 gactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 53385308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5425502 - 5425220
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  5425502 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 5425403  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  5425402 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 5425303  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5425302 agtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 5425220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792689
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 104  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | |||  | |||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  105 gtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 204  Q
    ||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26792689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 6600304 - 6600587
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  6600304 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 6600403  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  6600404 ggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 6600503  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6600504 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 6600587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16412855 - 16412572
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |  | |||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  16412855 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 16412756  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  16412755 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16412656  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16412655 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctg 16412572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16757158 - 16756875
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  16757158 tcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 16757059  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | |  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  16757058 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16756959  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756958 agtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 16756875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 289
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15247989
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    |||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
     ||| ||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtg 15247989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227499
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 15227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972399
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13972399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 47123520 - 47123794
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  47123520 atcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 47123619  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  47123620 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 47123719  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  47123720 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 47123794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322931
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||||  |  || ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||  ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| |||||| | || |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 13322931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 10383533 - 10383819
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||||    
T  10383533 tcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaaccaa 10383632  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  || ||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||     
T  10383633 ctctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaa 10383732  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||| |||| ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10383733 aggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10383819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953247
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||||| |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| | ||||| ||| || || ||| | ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15953247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134625
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| | |||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| ||  | ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 18134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14571412 - 14571698
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || || |    
T  14571412 tcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagccca 14571511  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  || ||||| |||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  14571512 ctctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcat 14571611  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||    
T  14571612 aggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctg 14571698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329936
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | |||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtg 16329936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850558
Alignment:
Q  64 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  164 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 263  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  264 atgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctg 12850558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15016184 - 15016034
Alignment:
Q  137 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttg 236  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |  || | ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15016184 gatacggagcaataaacctcggagttagtttcttcgactttagtgctcatccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttg 15016085  T
Q  237 aaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15016084 aaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctg 15016034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10420595 - 10420324
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  10420595 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 10420496  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10420495 ttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 10420396  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10420395 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 10420324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086523
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 14086523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759359
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 8759359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941876
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 13941876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177374
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 41177374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11304323 - 11304055
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  11304323 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacta 11304224  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |    |||||||     
T  11304223 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcatagggaaaactctcag 11304124  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  11304123 aaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 11304055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360824
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||  | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||  |||| |  ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 12360824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961313
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |  ||  ||||||  || ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |  |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||  |||| | ||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11961313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 31689173 - 31689049
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  31689173 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaaccaactctatatgccactg 31689074  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgata 140  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||    
T  31689073 ttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 142
Target Start/End: Original strand, 31945051 - 31945177
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  31945051 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 31945150  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacg 142  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  31945151 ttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16836965 - 16836787
Alignment:
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    |||||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| |||    
T  16836965 caccgttccaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaact 16836866  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    |||||||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16836865 ctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtg 16836787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381294
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| ||||  || ||||| |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 16381294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 44776826 - 44777097
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||    
T  44776826 acatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccg 44776925  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||| |  || ||||| | ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||| |     
T  44776926 ttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgtcatcggagtgactcttag 44777025  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | ||||| ||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  44777026 aaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 44777097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274689
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 8274689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742993
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16742993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6153259 - 6153141
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || ||  |  ||||||||| || ||| ||||| |    
T  6153259 ggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatgatcaccaacttgaaacttaatatcctttctcc 6153160  T
Q  257 gcttatcatgataactctt 275  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6153159 tcttatcatgataactctt 6153141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975335
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 13975335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576600
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 15576600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 21686681 - 21686783
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| | ||||| ||||| || || ||  |  ||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  21686681 acttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaacttgaaactgaatatcttttctcctcttataatgataact 21686780  T
Q  273 ctt 275  Q
    |||    
T  21686781 ctt 21686783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 287
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192944
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 17192944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 24675055 - 24675340
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24675055 tcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccaa 24675154  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675155 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 24675254  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24675255 aggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 24675340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22757340 - 22757054
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22757340 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22757241  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22757240 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagtcac 22757141  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757140 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22757054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21326143 - 21325857
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21326143 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21326044  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21326043 ctcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 21325944  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325943 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21325857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23188574 - 23188860
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  23188574 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatctca 23188673  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188674 ctcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23188773  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188774 aggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23188860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24708359 - 24708073
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  24708359 tcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 24708260  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24708259 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 24708160  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24708159 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctg 24708073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23138603 - 23138889
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23138603 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 23138702  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23138703 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 23138802  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138803 aagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23138889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23550393 - 23550679
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23550393 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 23550492  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23550493 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 23550592  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550593 aagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23550679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27377348 - 27377101
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27377348 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 27377249  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27377248 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 27377149  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatc 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27377148 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatc 27377101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925112
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16925112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998852
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16998852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063929
Alignment:
Q  22 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaa 121  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  122 ctctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 221  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  222 gtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctg 23063929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44386443 - 44386160
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  44386443 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 44386344  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  44386343 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 44386244  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386243 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44386160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982004
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16982004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063569
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17063569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145621
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21145621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9609988
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9609988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217868
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27217868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22325730 - 22325447
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  22325730 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 22325631  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  22325630 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 22325531  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22325530 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22325447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 24709602 - 24709885
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  24709602 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 24709701  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  24709702 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24709801  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709802 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24709885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 24261939 - 24262222
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || ||||    
T  24261939 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactc 24262038  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  24262039 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24262138  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262139 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24262222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24878869 - 24878586
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||     
T  24878869 tcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactt 24878770  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  24878769 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 24878670  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878669 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24878586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27370838 - 27371121
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | |||  | ||||    
T  27370838 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaatccactc 27370937  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |    
T  27370938 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagtcatagg 27371037  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27371038 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 27371121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868702
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctg 10868702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067227
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |  ||||| |||||||||||||| | ||| || |||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagt-gcgacacatgaaaaacgtg-tgcaa-ttcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17067227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 286
Target Start/End: Original strand, 23087026 - 23087301
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |  ||||  |||||    
T  23087026 ggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacacactctatacgc 23087125  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    ||| ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  23087126 cactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaagagtgact 23087225  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23087226 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactct 23087301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211508
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||   ||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    ||   |||||| |||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |  || ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctg 30211508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24826060 - 24825873
Alignment:
Q  100 actcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24826060 actcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtca 24825961  T
Q  200 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || |||||||||| ||||| || |  ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24825960 caggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctg 24825873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365670
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 27365670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 31830236 - 31830510
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  31830236 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 31830335  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  31830336 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 31830435  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  31830436 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 31830510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358465
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||| | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11358465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 287
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529363
Alignment:
Q  18 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgtt 117  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||||||| ||| ||| || ||||  ||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  118 ccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 217  Q
    ||||||||||| || | |||||| ||  ||||||| ||||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  218 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| ||||||||      |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45529300 acacatggtcttc------aaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctg 45529363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 41609218 - 41609047
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||   ||| || ||||    
T  41609218 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaacccactc 41609119  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgact 175  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609118 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 20832563 - 20832836
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20832563 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20832662  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20832663 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20832762  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  20832763 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 20832836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293810
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctg 23293810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 1063329 - 1063603
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||    
T  1063329 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgcca 1063428  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  1063429 cagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 1063528  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1063529 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1063603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 23276357 - 23276628
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  23276357 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23276456  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||| ||||  | |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| | |||||     
T  23276457 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccatcataggagtaaatctcag 23276556  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  23276557 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctg 23276628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787595
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 27787595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 275
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  36 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataac 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| ||||||||  |  |||| | |    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 235  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  236 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833360
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 24833360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945131
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || | ||| |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 24945131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574207
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| ||||  || ||||| |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   | || || || | ||| || || ||  | ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 12574207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276131
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22276131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 45676726 - 45676685
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 42  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676726 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 23599837 - 23599877
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 41  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599837 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 287
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128499
Alignment:
Q  175 ttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  275 tttgtcgactctg 287  Q
    | |||| ||||||    
T  25128487 tctgtctactctg 25128499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640510
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831778
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 24831778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368423
Alignment:
Q  258 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctg 27368423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  19 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 59  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23817798 - 23817750
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  23817798 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacac 23817750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 28144701 - 28144749
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 221  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||||||||||    
T  28144701 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacac 28144749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23516408 - 23516694
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23516408 tcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 23516507  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516508 ctcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23516607  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516608 atgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23516694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23573609 - 23573895
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23573609 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 23573708  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573709 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23573808  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573809 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23573895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23440092 - 23440378
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||      
T  23440092 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccct 23440191  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440192 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 23440291  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440292 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23440378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 18775644 - 18775929
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18775644 tcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 18775743  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18775744 ctcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagtcac 18775843  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775844 aggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 18775929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21984824 - 21984538
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| |    
T  21984824 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatccca 21984725  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21984724 ctcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaatcac 21984625  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21984624 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 21984538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 25423056 - 25423342
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  25423056 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 25423155  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25423156 cctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagtcac 25423255  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25423256 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 25423342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 284
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798910
Alignment:
Q  33 aacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgat 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  133 aactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttctt 232  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgact 20798910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22333403 - 22333120
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  22333403 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 22333304  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  22333303 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 22333204  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333203 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22333120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738938
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  112 accgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| |  || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 26738938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15000255 - 14999972
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  15000255 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15000156  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  15000155 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15000056  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000055 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 14999972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40708933
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 40708933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 19769830 - 19770113
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  19769830 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 19769929  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  19769930 ggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19770029  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770030 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19770113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27610224 - 27610507
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||    
T  27610224 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaacccactc 27610323  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  27610324 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27610423  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610424 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27610507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23471096 - 23471382
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |    
T  23471096 tcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaaccca 23471195  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23471196 ctcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 23471295  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23471296 ttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctg 23471382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566647
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 34566647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Original strand, 41770712 - 41770997
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  41770712 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 41770811  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  41770812 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 41770911  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41770912 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 41770997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27669006 - 27668723
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  27669006 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 27668907  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  27668906 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27668807  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27668806 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27668723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27685916 - 27685633
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  27685916 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 27685817  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  27685816 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcatagg 27685717  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685716 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27685633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356655
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16356655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 22134538 - 22134821
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  22134538 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 22134637  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  22134638 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 22134737  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22134738 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 22134821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27518277 - 27518560
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  27518277 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 27518376  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  27518377 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27518476  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518477 agtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27518560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29476589 - 29476304
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  29476589 tcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 29476490  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |    
T  29476489 ggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgtcatagg 29476390  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29476389 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtg 29476304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37292012 - 37291729
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  37292012 tcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 37291913  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  37291912 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcatagg 37291813  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291812 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctg 37291729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20468605 - 20468341
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||  |||||    
T  20468605 ggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcaatacgc 20468506  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    ||| ||| | | ||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20468505 cactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 20468406  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20468405 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactctt 20468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  210 tct 212  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 287
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348576
Alignment:
Q  23 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaac 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  123 tctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacg 222  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  223 tggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctg 22348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 20573388 - 20573626
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  20573388 tcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 20573487  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20573488 ctcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcag 20573587  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 239  Q
      |||||||||||||||| || || ||| ||||||||||    
T  20573588 tggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 77 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498269
Alignment:
Q  77 tcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 176  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttt 276  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||| | ||||||||||| |  ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  277 tgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctg 21498269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564202
Alignment:
Q  35 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| || | |||||| || ||||     
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
    |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgact 21564202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442526
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||  | |||  ||| ||||| |||||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 23442526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890992
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| | | || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 21890992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 25847936 - 25848210
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  25847936 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctgtatgcca 25848035  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  25848036 cagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 25848135  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || || ||  | || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25848136 caaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462087
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 22462087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735844
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24735844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737018
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24737018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749787
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 24749787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28924272 - 28924001
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |    
T  28924272 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 28924173  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  28924172 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28924073  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28924072 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28924001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14887498 - 14887224
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  14887498 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14887399  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  14887398 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14887299  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14887298 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14887224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28895446 - 28895175
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||  |    
T  28895446 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccagag 28895347  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  28895346 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 28895247  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28895246 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 28895175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 37546004 - 37545729
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  37546004 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 37545905  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| || || | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  37545904 cagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37545805  T
Q  213 ca-aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || |||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37545804 cagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctg 37545729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798630
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24798630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21662546 - 21662300
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||    
T  21662546 atcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtca 21662447  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
      |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | ||||||||||    
T  21662446 ttgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactct 21662348  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
     | |||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21662347 tagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 20342143 - 20342417
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20342143 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 20342242  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  20342243 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtcaaaggggtgactct 20342342  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20342343 cagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20342417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381334
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22381334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 286
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502813
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 22502813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22236424 - 22236153
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || | ||| |    
T  22236424 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgacactg 22236325  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22236324 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22236225  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22236224 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 22236153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21404923
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||| || ||||  ||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || ||||||||||| || | ||||||||  |||||||| | ||||||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  213 caaaaacac 221  Q
     ||||||||    
T  21404915 aaaaaacac 21404923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 20773624 - 20773895
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |    
T  20773624 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacag 20773723  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| || || |||| | |||| || ||||     
T  20773724 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgtcataggagtaaccctcag 20773823  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || ||| |  |||| ||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20773824 aaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 20773895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||  || || ||||  |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgataca-accaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080322
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  || ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||| | ||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctg 23080322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821588
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  |||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 20821588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269566
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| || |  || ||||| |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 17269566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339519
Alignment:
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||| || ||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21339519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210927
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| |||||| || |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 11210927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011219
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 27011219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937421
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 21937421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 21625397 - 21625470
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 86  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21625397 atcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatg 21625470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503578
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||| | || || |||||||| || ||  |   ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  23503564 cttctgtctactctg 23503578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581346
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || || | ||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 24581346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 289
Target Start/End: Original strand, 21404939 - 21404975
Alignment:
Q  253 ctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21404939 ctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtg 21404975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25244695 - 25244598
Alignment:
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25244695 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25244598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25308847 - 25308750
Alignment:
Q  177 caaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactct 274  Q
    ||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||  | | ||||| |||||||||||    
T  25308847 caaagcacgtccaacaccgactacatgattcactctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactct 25308750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21167317 - 21167031
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21167317 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacccaa 21167218  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21167217 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 21167118  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167117 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21167031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 30313924 - 30313638
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  30313924 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccca 30313825  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313824 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 30313725  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313724 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 30313638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 19977968 - 19978254
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  19977968 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 19978067  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978068 ctcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 19978167  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978168 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19978254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 15533381 - 15533667
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15533381 tcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 15533480  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15533481 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccac 15533580  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533581 aggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 15533667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16408825 - 16408539
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16408825 tcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16408726  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408725 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16408626  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408625 aagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16408539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21250943 - 21251229
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21250943 tcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21251042  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21251043 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 21251142  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21251143 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 21251229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22164971 - 22164685
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22164971 tcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22164872  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22164871 ctcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 22164772  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||| ||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164771 atgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22164685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22133821 - 22133535
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  22133821 tcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattccga 22133722  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22133721 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 22133622  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133621 atgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 22133535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 32600145 - 32600431
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||| |||||| |    
T  32600145 tcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatccca 32600244  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32600245 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 32600344  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32600345 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 32600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21394645 - 21394359
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  21394645 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 21394546  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21394545 ctcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcac 21394446  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21394445 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21394359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21789138 - 21788852
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  21789138 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 21789039  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21789038 ctcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagtcac 21788939  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21788938 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 21788852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21922515 - 21922229
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  21922515 tcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaaccca 21922416  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21922415 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagtcac 21922316  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21922315 atgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctg 21922229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 284
Target Start/End: Original strand, 22046385 - 22046657
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22046385 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcctactcgatacgcc 22046484  T
Q  112 accgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 211  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22046485 accgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcactggagtgactc 22046584  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22046585 tcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgact 22046657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 287
Target Start/End: Original strand, 23650044 - 23650328
Alignment:
Q  3 atcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaact 102  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23650044 atcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaact 23650143  T
Q  103 cggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacat 202  Q
    || || |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  23650144 cgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcacag 23650243  T
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23650244 gagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 23650328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 22032033 - 22032319
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22032033 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatccta 22032132  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032133 ctcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 22032232  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032233 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 22032319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17674800 - 17674517
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  17674800 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 17674701  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  17674700 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 17674601  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674600 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17674517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19112977
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19112977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20018527 - 20018244
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  20018527 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 20018428  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  20018427 ggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 20018328  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20018327 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20018244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19485647 - 19485364
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  19485647 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 19485548  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  19485547 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19485448  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485447 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19485364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 15441182 - 15441420
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  15441182 tcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcaaa 15441281  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  15441282 cacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagccac 15441381  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 239  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  15441382 aggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 22987202 - 22987488
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22987202 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22987301  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  22987302 ctcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagtcac 22987401  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22987402 tggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22987488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22120951 - 22120668
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |  | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  22120951 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactc 22120852  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  22120851 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagtcatagg 22120752  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22120751 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 22120668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 23948900 - 23949162
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  23948900 ggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgctacgc 23948999  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  23949000 caccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagtcacaggagtgact 23949099  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactc 273  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  23949100 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396619
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |  || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctg 20396619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388385
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||  || | ||| || |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     || ||| ||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactct 20388385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010394
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||   ||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20010394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21682216 - 21681965
Alignment:
Q  35 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||||||| || || ||||     
T  21682216 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 21682117  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
    ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | |||    
T  21682116 ctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 21682017  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21682016 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 21681965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22378089 - 22377947
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22378089 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22377990  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377989 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22377947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 145 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22384264 - 22384122
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||    
T  22384264 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaa 22384165  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384164 tatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 22384122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266526
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||   |||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctg 1266526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 6679124 - 6679398
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  6679124 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6679223  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  6679224 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6679323  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6679324 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6679398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851698
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19851698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857734
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||||   ||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctg 19857734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 804441 - 804167
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  804441 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 804342  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  804341 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 804242  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  804241 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 804167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324903
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa-gatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 114  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||  || |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  115 gttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  215 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 21324903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22062198 - 22061927
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  22062198 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 22062099  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22062098 ttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 22061999  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22061998 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22061927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008134
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||  || ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||| ||  | ||||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    |||||| || ||| | ||||| ||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgact 20008134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 23654943 - 23655214
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || | |   ||  |||| |    
T  23654943 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaatatatataccactg 23655042  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  23655043 ttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23655142  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||  || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  23655143 aaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 23655214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 14565155 - 14565429
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  14565155 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 14565254  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  14565255 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 14565354  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  14565355 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 14565429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 21840433 - 21840704
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  21840433 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 21840532  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||| ||| ||||| || | | |||| ||||| |     
T  21840533 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgttataggagtaactcttag 21840632  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21840633 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 21840704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416968
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||  ||||||  || ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctg 31416968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 6603671 - 6603945
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  6603671 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 6603770  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  6603771 ctgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 6603870  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6603871 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6603945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303920
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||| ||| ||||| | |||||||||||| || |   | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||   ||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 29303920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 16265386 - 16265127
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  16265386 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16265287  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16265286 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16265187  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  16265186 cagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571334
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 31571334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 28982370 - 28982632
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  28982370 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28982469  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||    
T  28982470 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28982569  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28982570 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Original strand, 28987590 - 28987852
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  28987590 atcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 28987689  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||| ||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||| ||    
T  28987690 ctgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaacggagtgaccct 28987789  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactctt 275  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28987790 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305045
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||| |||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12305045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 27347239 - 27347436
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  27347239 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactttatatgcca 27347338  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    | || ||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27347339 ctgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652827
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||| || || ||  |  |||||||||| | ||| ||||| |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctg 20652827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051150
Alignment:
Q  155 tcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttct 254  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||| ||||||| || || ||  | ||||||||||||||  | || ||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  255 acgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 22051150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982723
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||| | || ||  |  | |||||||||| ||||||||  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctg 22982723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 287
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949207
Alignment:
Q  238 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23949207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21197010
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||| ||| || | |||||||||||||| || ||  || | |||||||||| ||| ||||| |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  257 gcttatcatgataactc 273  Q
     ||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactc 21197010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877589
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||| |||||  || | || ||||| ||||| || ||| |  | |||||||||| ||| || || |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850831
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||  | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 21850831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 279170 - 278884
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  279170 tcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 279071  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  279070 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtcac 278971  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278970 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 278884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 165037 - 164763
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||    
T  165037 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgcca 164938  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164937 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 164838  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164837 caaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 164763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 308628 - 308911
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  308628 tcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 308727  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  308728 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 308827  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  308828 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 308911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 260289 - 260560
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||  || | |||||  || |||||||    
T  260289 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaacaaactctatatgccaccg 260388  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||  || ||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||    
T  260389 ttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 260488  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  260489 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 260560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 65372 - 65657
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  65372 tcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 65470  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  65471 ctcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagtcac 65570  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65571 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 65657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 40129 - 39924
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40129 tcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccaa 40030  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40029 ctcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 39930  T
Q  201 atgagt 206  Q
    | ||||    
T  39929 aggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39906 - 39874
Alignment:
Q  254 tacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39906 tacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 39874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 19864486 - 19864772
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19864486 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 19864585  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19864586 ctcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagtcac 19864685  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864686 aggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctg 19864772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 12497825 - 12498111
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12497825 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12497924  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12497925 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12498024  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498025 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12498111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12511076 - 12510790
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12511076 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 12510977  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12510976 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12510877  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510876 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12510790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21833463 - 21833178
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21833463 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 21833364  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21833363 ctcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagtcac 21833264  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833263 aggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactct 21833178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 12505154 - 12505440
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  12505154 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccca 12505253  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  12505254 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtcac 12505353  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505354 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12505440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25765771 - 25765487
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  25765771 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatccca 25765672  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25765671 ctcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 25765572  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25765571 a-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactct 25765487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16963849 - 16963563
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16963849 tcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 16963750  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||| |||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963749 cacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16963650  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963649 aggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16963563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16928122 - 16927836
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16928122 tcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatccaa 16928023  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
      || |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16928022 gacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagtcac 16927923  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16927922 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctg 16927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25610343 - 25610055
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  25610343 tcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 25610244  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25610243 cacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcac 25610144  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25610143 aggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtg 25610055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27331915 - 27331629
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  27331915 tcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 27331816  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27331815 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 27331716  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27331715 aggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27331629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27392655 - 27392369
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  27392655 tcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 27392556  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27392555 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 27392456  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27392455 aggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 27392369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22079170 - 22078885
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22079170 tcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22079071  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22079070 ctcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaatcac 22078971  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22078970 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactct 22078885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 18408425 - 18408140
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  18408425 tcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 18408326  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18408325 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 18408226  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18408225 acgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactct 18408140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5839701 - 5839415
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5839701 tcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 5839602  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  5839601 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgtcat 5839502  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5839501 aggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 5839415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543280
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 1543280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16627196 - 16626913
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  16627196 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 16627097  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  16627096 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 16626997  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626996 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16626913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28263676 - 28263393
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  28263676 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28263577  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  28263576 ggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28263477  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263476 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28263393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28342425 - 28342142
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  28342425 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28342326  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  28342325 ggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28342226  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28342225 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28342142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592116
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29592116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24313647 - 24313364
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  24313647 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 24313548  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  24313547 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 24313448  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24313447 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 24313364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 25112354 - 25112637
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  25112354 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 25112453  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  25112454 ggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 25112553  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25112554 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctg 25112637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 23078268 - 23078554
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  23078268 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 23078367  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23078368 ctcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagtcac 23078467  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23078468 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctg 23078554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2875282 - 2874999
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  2875282 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 2875183  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  2875182 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 2875083  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2875082 agtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 2874999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 27187238 - 27187521
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| || ||||    
T  27187238 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactc 27187337  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  27187338 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27187437  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187438 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27187521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27262002 - 27261719
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | | ||| || ||||    
T  27262002 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaacccactc 27261903  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  27261902 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 27261803  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261802 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27261719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22762937 - 22762652
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  22762937 tcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 22762838  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22762837 cttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 22762738  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  22762737 aggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactct 22762652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28292851 - 28292568
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  28292851 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 28292752  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  28292751 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 28292652  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28292651 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 28292568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 222
Target Start/End: Original strand, 17032364 - 17032582
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  17032364 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 17032463  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  17032464 ggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagtcatagg 17032563  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacg 222  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17032564 agtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 25750623 - 25750894
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  25750623 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 25750722  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||||||     
T  25750723 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgtcacaagagtgactctcag 25750822  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25750823 aaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25750894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471686
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||| | ||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21471686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 24 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197743
Alignment:
Q  24 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaact 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| |||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  124 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgt 223  Q
    ||||| |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  224 ggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | | | | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18197743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 22433796 - 22433928
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22433796 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 22433895  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22433896 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgata 22433928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768276
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||| ||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| ||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25768276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131375
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||  || || ||||  || ||||| ||||||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| |||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 14131375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459421
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctg 15459421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10469045
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10469045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 22797080 - 22796831
Alignment:
Q  35 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||||||| || || ||||     
T  22797080 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatat 22796981  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
     |||||| ||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | |||    
T  22796980 atgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatgatctccctct 22796881  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    |||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  22796880 tgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagact 22796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879383
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| | || | |||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 19879383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645782
Alignment:
Q  52 gacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataa 151  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || |||| |||||| || |||||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  152 atctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttt 251  Q
    |  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  252 tctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 34645782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364497
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 24364497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564329
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||| || |  || || ||||  |||||||| |||||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
     ||| | |||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactct 21564329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794775
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||| || ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || |  |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctg 18794775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766345
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |  |||| |  ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 8766345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287794
Alignment:
Q  27 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctt 126  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||||||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  127 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 226  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | | ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  227 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11287794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 287
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291897
Alignment:
Q  208 actctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctg 11291897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 286
Target Start/End: Original strand, 17415365 - 17415570
Alignment:
Q  81 aagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaa 180  Q
    |||||||||||  || || ||||  || ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||     
T  17415365 aagatgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaat 17415464  T
Q  181 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||||||| ||||    
T  17415465 gcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtc 17415564  T
Q  281 gactct 286  Q
    ||||||    
T  17415565 gactct 17415570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560813
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||||||||  || ||||| |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 27560813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280701
Alignment:
Q  27 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctt 126  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || || |  || ||||| |||||||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  127 tctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggt 226  Q
    || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||| |||| ||||| |||| | | |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  227 cttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11280701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 156 - 280
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  156 cggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttcta 255  Q
    ||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 145 - 289
Target Start/End: Original strand, 1640715 - 1640859
Alignment:
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 244  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||| | |||||| || ||| |||| | ||| ||||    
T  1640715 ccaataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaa 1640814  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1640815 ggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtg 1640859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640688
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtg 1640688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28283007
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||||||| || |  || ||||| |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 28283007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14381841 - 14381663
Alignment:
Q  109 gccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtga 208  Q
    ||||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  14381841 gccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaa 14381742  T
Q  209 ctctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||||||    
T  14381741 ccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctg 14381663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787768
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaa 82  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaa 18787768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743283
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 25743283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 286
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098134
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactct 16098134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 287
Target Start/End: Original strand, 18800858 - 18801027
Alignment:
Q  118 ccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 217  Q
    ||||| || ||||||| |||||| |||||||| ||  | | |||||||| ||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| ||    
T  18800858 ccaaccctctctgatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaa 18800957  T
Q  218 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | || || ||  | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18800958 atacatgatccccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 18801027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382569
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16382569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571736
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  18571722 cttctgtctactctg 18571736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648980
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1648994 cttctgtctactctg 1648980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838116
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||| |||||| || | || | ||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  257 gcttatcatgataactctt 275  Q
     ||||||||||||||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactctt 18838116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996333
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 23996333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 280
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233287
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||| || |||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtc 16233287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 56)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16252522 - 16252236
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  16252522 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatccca 16252423  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252422 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16252323  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16252322 aagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16252236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16355522 - 16355236
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16355522 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16355423  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16355422 ctcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 16355323  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16355322 aggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctg 16355236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 12523614 - 12523897
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12523614 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatccaactc 12523713  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  12523714 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 12523813  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523814 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 12523897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149797
Alignment:
Q  31 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  131 ataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttc 230  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  231 ttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15149797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 7090368 - 7090652
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  7090368 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 7090467  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  7090468 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg-agcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagtcac 7090566  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7090567 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactct 7090652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 14680505 - 14680788
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14680505 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactc 14680604  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  14680605 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 14680704  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14680705 agtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14680788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18227523 - 18227237
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  18227523 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatccca 18227424  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18227423 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 18227324  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227323 aggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18227237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 14652255 - 14652529
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||    
T  14652255 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaacccactcgatacgcca 14652354  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652355 ccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 14652454  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652455 caaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14652529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297426
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18297426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23955968
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23955968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19778867 - 19778584
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  19778867 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 19778768  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  19778767 gataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 19778668  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778667 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19778584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14159427 - 14159713
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  14159427 tcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14159526  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14159527 ctcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcat 14159626  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      |||| |||||||  ||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14159627 gggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctg 14159713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386633
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8386633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476821
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||| |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12476821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14851429 - 14851157
Alignment:
Q  15 cacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccacc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||    
T  14851429 cacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgccacc 14851330  T
Q  115 gttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14851329 gttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggtcacatgagtgactctaa 14851230  T
Q  215 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| || || ||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851229 aaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14851157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14304051 - 14303769
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  14304051 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 14303952  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |    
T  14303951 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcatagg 14303853  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303852 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 14303769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 27711286 - 27711557
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |||||||    
T  27711286 acatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 27711385  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27711386 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcacaggagtgactctcaa 27711485  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711486 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 27711557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039195
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || | ||| || |||||||| |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 29039195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14266973 - 14266690
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  14266973 tcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 14266874  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |    
T  14266873 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagtcatagg 14266774  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266773 ggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14266690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 286
Target Start/End: Original strand, 40472978 - 40473260
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  40472978 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 40473077  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  40473078 ggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 40473177  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40473178 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactct 40473260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8053697 - 8053414
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || || |    
T  8053697 tcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccacac 8053598  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  8053597 ggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 8053498  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8053497 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8053414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 263
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 263  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 14927336 - 14927151
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  14927336 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14927237  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgt 186  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14927236 ctcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaatgcacgt 14927151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003415
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||| |||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15003415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3265119 - 3264845
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  3265119 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 3265020  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  3265019 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 3264920  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3264919 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 3264845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146133
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 16146133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11207556 - 11207282
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11207556 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 11207457  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  11207456 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 11207357  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11207356 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11207282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070634
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || || | ||| ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||  ||| ||| || |||||||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| | ||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 15070634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 29453862 - 29453588
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  29453862 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 29453763  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  29453762 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 29453663  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  29453662 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 29453588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223139
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 33223139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649328
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctg 1649328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 15245874 - 15246145
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  15245874 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacgcactctgtatgccactg 15245973  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | | || |||||||     
T  15245974 ttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggggtaactctcag 15246073  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||| | || ||||||||||   | || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15246074 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15246145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891203
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | ||  || ||| | |  || ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaacccatc-ctatatgcca 20891028  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||| || ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20891203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661917
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||  ||||| |||||||| |||| | |||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctg 44661917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15415198 - 15415077
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15415198 ttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcat 15415099  T
Q  266 gataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15415098 gataactcttttgtcgactctg 15415077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18607904 - 18607823
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 85  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18607904 tcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagat 18607823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606230
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 51606230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16676578 - 16676494
Alignment:
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676578 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16676494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703036
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
     ||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtca 42703036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359141
Alignment:
Q  115 gttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  215 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| || || ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctg 15359141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164332
Alignment:
Q  53 acacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaa 152  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  153 tctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacca 195  Q
      | ||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaatgcacatcctacacca 18164332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247866
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||  |||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||||||||| |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13247866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640216
Alignment:
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 1640216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 287
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752814
Alignment:
Q  138 atacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttga 237  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  238 aactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 16752814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375409
Alignment:
Q  159 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 258  Q
    |||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||| ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  259 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctg 55375409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415226
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtg 15415226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132472
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  ||||||||||||  || || || | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  273 ctt 275  Q
    |||    
T  12132474 ctt 12132472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997537
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctg 14997537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9849681 - 9849616
Alignment:
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  9849681 ctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 9849616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 287
Target Start/End: Original strand, 27900459 - 27900607
Alignment:
Q  139 tacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaa 238  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||  |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | || ||||    
T  27900459 tacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaa 27900558  T
Q  239 actcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||    
T  27900559 actcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttctatcgactctg 27900607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445263
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 16445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291056
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||| | |||||| || | || |||||||| || || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 9291056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293208
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| || || ||| ||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctg 15293208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 15319533 - 15319642
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||| |||||||| | ||  || || |||| ||| ||||| |    
T  15319533 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaacccactctgtatgccactg 15319632  T
Q  116 ttccaactct 125  Q
    ||||||||||    
T  15319633 ttccaactct 15319642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 15351963 - 15351934
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatcc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351963 tcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatca 69  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 64371 - 64085
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  64371 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatccca 64272  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  64271 ctcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagccac 64172  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  64171 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 64085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 642 - 928
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  642 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagccaa 741  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  742 cacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 841  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  842 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctg 928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6266
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5980 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatccaa 6079  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6080 ctcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagtcac 6179  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6180 aggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctg 6266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33913 - 33627
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  33913 tcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccca 33814  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33813 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 33714  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33713 atgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 8562 - 8848
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8562 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 8661  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8662 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 8761  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8762 aagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14326 - 14612
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14326 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 14425  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14426 cccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 14525  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14526 aggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 589 - 872
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || |||     
T  589 tcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactt 688  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  689 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 788  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  789 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctg 872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 15154998 - 15154714
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  15154998 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaaccca 15154899  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15154898 ctcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 15154799  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactc 285  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15154798 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactc 15154714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17662 - 17376
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17662 tcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 17563  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17562 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 17463  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17462 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctg 17376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11553445 - 11553162
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  11553445 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactc 11553346  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  11553345 gataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 11553246  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11553245 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctg 11553162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 12687428 - 12687711
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  12687428 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaacccactc 12687527  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  12687528 gataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 12687627  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687628 agtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 12687711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11237556 - 11237273
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  11237556 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 11237457  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  11237456 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 11237357  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237356 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctg 11237273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 14954547 - 14954830
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||    
T  14954547 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactcactc 14954646  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  14954647 gataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcatagg 14954746  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954747 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14954830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198838
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8198838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 8707532 - 8707815
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  8707532 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 8707631  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  8707632 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 8707731  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707732 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 8707815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 10870922 - 10871205
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  10870922 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 10871021  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  10871022 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 10871121  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871122 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 10871205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15161400 - 15161117
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  15161400 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 15161301  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  15161300 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 15161201  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161200 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15161117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14332321 - 14332607
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  14332321 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaaccca 14332420  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14332421 ctcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcat 14332520  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14332521 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 14332607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 14037731 - 14038019
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  14037731 tcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14037830  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  14037831 ctcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcat 14037930  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14037931 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 14038019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 14347761 - 14348049
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  14347761 tcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 14347860  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  14347861 ctcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagtcat 14347960  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14347961 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 14348049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 23517112 - 23516829
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  23517112 tcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 23517013  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  23517012 ggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 23516913  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516912 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 23516829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 287
Target Start/End: Original strand, 15203814 - 15204089
Alignment:
Q  12 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||| |     
T  15203814 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatactct 15203913  T
Q  112 accgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 211  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||  ||||||||    
T  15203914 accgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagtcacaaaagtgactc 15204013  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204014 taaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15204089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 18177669 - 18177952
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  18177669 tcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 18177768  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | | |    
T  18177769 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagttatagg 18177868  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18177869 agtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18177952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18552101 - 18551818
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  18552101 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 18552002  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  18552001 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 18551902  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551901 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 18551818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791411
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || |||||||| |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 44791411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 13685990 - 13686274
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaga-catcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaact 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||||||||||  | ||| || |||    
T  13685990 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaacccact 13686089  T
Q  103 cggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  13686090 cggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatag 13686189  T
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686190 gagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 13686274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624762
Alignment:
Q  64 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  164 acttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatc 263  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  264 atgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctg 15624762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206838
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    || ||||||| || |||| ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 12206838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15102910 - 15102639
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  15102910 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15102811  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  15102810 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcaa 15102711  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15102710 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 15102639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147422
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 19147422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746821
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  || |  |||| ||| ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20746821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212166
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 8212166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14264553 - 14264282
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  14264553 acatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 14264454  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||||||     
T  14264453 ttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcag 14264354  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14264353 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14264282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11306575 - 11306301
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  11306575 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11306476  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  11306475 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 11306376  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11306375 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11306301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 49152238 - 49152512
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  49152238 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 49152337  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  49152338 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 49152437  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49152438 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49152512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072332
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  | | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16072332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388466
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || || || |||||||||||| | || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  11388536 gaacacatgatc-tcctcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 11388466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662173
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| ||| || ||    ||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |||  ||||||||||  || | ||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||| || |  || ||||||||||| || | | | ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtg 21662173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665759
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||     | ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || |||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctg 13665759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950509
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||| |  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 16950509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286415
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||  || | ||| |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
     |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 14286415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053989
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || ||||||||||| | ||| ||||| |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 18053989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199779
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||| |  || ||||| |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 23199779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505906
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || | || |||||| |  || ||||| |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||| | ||| || || ||  | ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtg 23505906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021568
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||| ||||| | |||||||| ||||||   || || |||| | ||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||| ||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 13021568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35965016 - 35964910
Alignment:
Q  181 gcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965016 gcacgtcatacactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 35964917  T
Q  281 gactctg 287  Q
     ||||||    
T  35964916 tactctg 35964910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 6413469 - 6413722
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  6413469 acatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaa 6413568  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||| || |||||| ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| |||||| || ||  | ||    
T  6413569 tctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctc 6413668  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  6413669 ctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 6413722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 14129813 - 14130084
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||| ||    
T  14129813 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14129912  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||   |||| ||||| ||    
T  14129913 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14130012  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14130013 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14130084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 14433631 - 14433902
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||  || |||||||  || |||| ||    
T  14433631 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccatcg 14433730  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||| | | ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||  ||||   |||| ||||| ||    
T  14433731 ttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgtcatcggagtaactctaaa 14433830  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14433831 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 14433902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455913
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| ||  || ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||  | ||| |||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 12455913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 12254384 - 12254326
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254384 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1443
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||||||| |||||| | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||| ||| ||| ||| || || ||  | ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtg 1443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288162
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
     |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtca 26288162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 230 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11772358 - 11772302
Alignment:
Q  230 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772358 cttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 11772302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340569
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||||||||  || ||||| |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  134 actgatacggaccaat 149  Q
     |||||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggaccaat 15340569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118643
Alignment:
Q  118 ccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 217  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||| |||||| |||||||| |||| | ||||||| |||| ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  218 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | || || ||  | || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26118643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936557
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14936543 cttctgtctactctg 14936557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824110
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 7824110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368636
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 12368636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364150
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  15364136 cttctgtctactctg 15364150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118818
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtg 26118818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107834
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 27107834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479338
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  116 ttccaactct 125  Q
    ||||||||||    
T  15479347 ttccaactct 15479338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41213
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||| || || ||  |||| |||||||| |  | |||||| || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  266 gataactcttttgtc 280  Q
    |||| ||||| ||||    
T  41227 gatagctcttctgtc 41213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440138
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 4440138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 287
Target Start/End: Original strand, 9596236 - 9596267
Alignment:
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596236 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 9596267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674600
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||  || || || |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtc 21674600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146753
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| || ||  |  |||||||| |||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  273 ctt 275  Q
    |||    
T  45146751 ctt 45146753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 201
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353275
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcaca 13353275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20466977
Alignment:
Q  172 gacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataac 271  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||  |  | ||||| |||||||| |  |||||  || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  20466977 t 20466977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 127539 - 127253
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |    
T  127539 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 127440  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  127439 ctcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 127340  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  127339 atgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 127253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17045424 - 17045138
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  17045424 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 17045325  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17045324 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtcac 17045225  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045224 aggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17045138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 20249800 - 20250086
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  20249800 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaaccca 20249899  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20249900 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagtcac 20249999  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20250000 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20250086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50620653 - 50620367
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  50620653 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaaccca 50620554  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50620553 ctcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 50620454  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620453 aggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 50620367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 19106320 - 19106603
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19106320 tcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatccaactc 19106419  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  19106420 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagtcatagg 19106519  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106520 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19106603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 20136728 - 20137014
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  20136728 tcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaaccaa 20136827  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136828 cacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 20136927  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20136928 aggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 20137014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16350993 - 16350722
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||    
T  16350993 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaagccaccg 16350894  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  16350893 ttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaa 16350794  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350793 aaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16350722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 21747485 - 21747770
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |    
T  21747485 tcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaaccca 21747584  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21747585 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 21747684  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21747685 aggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatc-tttctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctg 21747770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19761265 - 19760989
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| |||||    
T  19761265 ggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaacccactcgatacgc 19761166  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19761165 caccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaatcacaagagtgact 19761066  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19761065 ctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 19760989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33391435 - 33391152
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  33391435 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 33391336  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  33391335 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 33391236  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391235 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 33391152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16079042 - 16078810
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16079042 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 16078943  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16078942 ctcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 16078843  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16078842 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 16078810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 21830256 - 21830539
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  21830256 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 21830355  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  21830356 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 21830455  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21830456 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 21830539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 51333899 - 51333616
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  51333899 tcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 51333800  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  51333799 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 51333700  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333699 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 51333616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 21 - 286
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369532
Alignment:
Q  21 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttcca 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  121 actctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaaca 220  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  221 cgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | || ||| ||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactct 16369532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 284
Target Start/End: Original strand, 21836903 - 21837183
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||| | ||| || ||||    
T  21836903 tcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactc 21837002  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  21837003 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 21837102  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21837103 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgact 21837183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41354875 - 41354592
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  41354875 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 41354776  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  41354775 ggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 41354676  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354675 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 41354592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 50612825 - 50612602
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |    
T  50612825 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaaccca 50612726  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50612725 ctcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 50612626  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  50612625 aggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664999
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| | |||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 19664999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21163230 - 21163381
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| ||| || |    
T  21163230 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaaccca 21163329  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaa 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21163330 ctcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940186
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 20940186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 37677041 - 37677316
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  37677041 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 37677140  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  37677141 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 37677240  T
Q  213 caa-aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| ||| || || ||  | || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37677241 caagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37677316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550307
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| ||| ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||| | ||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgact 31550307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856884
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  |||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||| || |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| |||||| |||| || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctg 20856884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 284
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854547
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||| | |||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 19854547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294648
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20294648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075185
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
     | ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgact 20075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22433510 - 22433239
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  22433510 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 22433411  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    || |||| || ||||| | |||||||| ||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  22433410 ttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22433311  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||  | || |||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  22433310 gaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 22433239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244436
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20244436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Original strand, 11382678 - 11382830
Alignment:
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| || || ||  | ||     
T  11382678 ctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcc 11382777  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11382778 tgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 11382830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 287
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308061
Alignment:
Q  117 tccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaa 216  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||| |||| | |||| || |||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  217 aacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 41308061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20395390 - 20395194
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  20395390 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20395291  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |  |||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||    
T  20395290 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20836011
Alignment:
Q  64 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtca 163  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  164 act---tctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgctt 260  Q
    |||   |||| ||||| || | |||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | || | ||||| |||  | || | ||||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  261 atcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||| |||||||||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctg 20836011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 24476942 - 24477020
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24476942 atcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcgagagatgtggtg 24477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831515
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 20831515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518957
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 46518957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaac 219  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16078806 - 16078775
Alignment:
Q  256 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078806 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 16078775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914434
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  257 gcttatcatgataactctt 275  Q
      |||| ||||||||||||    
T  20914416 atttataatgataactctt 20914434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4745 - 4459
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  4745 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccca 4646  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4645 ctcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 4546  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4545 aagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 27933 - 28219
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27933 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 28032  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28033 ctcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagtcac 28132  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      |||| |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28133 cggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 28219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 33092 - 32810
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  33092 tcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 32993  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  32992 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagtcac 32893  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 283  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32892 aagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgac 32810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 219757 - 219471
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  219757 tcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatccca 219658  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  219657 cttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagtcac 219558  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219557 aggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 219471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 229009 - 229295
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||||||| ||| || |    
T  229009 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacccta 229108  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |     
T  229109 ttcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagtaat 229208  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  229209 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 229295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33049
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 33049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 875
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||    
T  1162 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatccaa 1063  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||  ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1062 ctcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 963  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  962 aggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtg 875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 287
Target Start/End: Original strand, 180187 - 180469
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  180187 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagccaactcg 180286  T
Q  105 gtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 204  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  180287 atacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagtcaccgga 180386  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180387 gtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 180469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 322 - 36
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  322 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaactca 223  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  222 ctcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 123  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  122 atgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 36  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 5989 - 6275
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  5989 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 6088  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6089 ctcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 6188  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6189 aggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 6275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1578
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||  ||| || || |||||  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctg 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22946
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 22946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Original strand, 6348 - 6624
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |    
T  6348 ggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatcccactcgatatac 6447  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    |||| | |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6448 caccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 6547  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6548 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctg 6624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 16953 - 17239
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  16953 tcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 17052  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  17053 cttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaatcac 17152  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17153 atgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 17239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 162079 - 162365
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  162079 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 162178  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  162179 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagtcat 162278  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  162279 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctg 162365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 448025 - 448311
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  448025 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 448124  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || | | |||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||| ||    
T  448125 cttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagttac 448224  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  448225 aggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctg 448311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90986
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     || ||| |||| ||||||  | | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||  | |||| ||||||| |||||| || ||| | ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 90986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78690
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtc 78690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  124 ctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 1029 - 749
Alignment:
Q  5 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcg 104  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  1029 cactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccacacg 930  T
Q  105 gtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatga 204  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  929 atacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacacga 830  T
Q  205 gtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  829 gggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 9309 - 9594
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  9309 tcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 9408  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9409 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 9508  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509 aggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 9594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Original strand, 111997 - 112280
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  111997 ggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 112096  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  112097 caccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 112196  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgctgct 294  Q
    |||||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  112197 ctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgct 112280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 203796 - 203522
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  203796 atcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 203697  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  203696 ctgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgtcacaagagtgactct 203597  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     | |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  203596 tagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctg 203522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 289
Target Start/End: Original strand, 117549 - 117822
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  117549 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 117648  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  |||| | |||| || ||||     
T  117649 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtcataggagtaaccctcag 117748  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  117749 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtg 117822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 322703 - 322956
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||  |||||||| || |||||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||  | ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 322956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386071
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| || |||| ||| || | ||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || ||||| |||  | ||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| |  || ||| | ||||||||||||||    ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctg 386071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 1105 - 1391
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||| |||  | |    
T  1105 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaatcca 1204  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1205 ctcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagtcac 1304  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1305 aggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctg 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 5187 - 5473
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  5187 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatccca 5286  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5287 ctcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagtcac 5386  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5387 aggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctg 5473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109865
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 109865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112811
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||| || || |  || ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 112811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 96327 - 96056
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||  |||||||| |    
T  96327 acatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 96228  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||  | |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||||    
T  96227 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcaa 96128  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  96127 aaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 96056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14843 - 15129
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |    
T  14843 tcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagccca 14942  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  14943 ctcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 15042  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  15043 aggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctg 15129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15133
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  15409 ggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 15310  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15309 caccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 15210  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| | || || ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15209 ctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 15133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 383 - 666
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||| ||| || ||||    
T  383 tcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactc 482  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  483 ggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 582  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  583 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 284
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43403
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
     ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgact 43403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 8454 - 8737
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  8454 tcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactc 8553  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |    
T  8554 ggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcatagg 8653  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8654 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 203 - 287
Target Start/End: Original strand, 13834 - 13918
Alignment:
Q  203 gagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13834 gagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 13918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50568
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  | |||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| | |||| | ||||| |||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctg 50568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106627
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||| | |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctg 106627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 7346 - 7629
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactc 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  7346 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaacccactc 7445  T
Q  104 ggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatg 203  Q
    | || ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |    
T  7446 gctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 7545  T
Q  204 agtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7546 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 971 - 1257
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  971 tcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 1070  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1071 ctcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcac 1170  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | | ||||||||||| || || || ||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1171 aggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctg 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 3998 - 4284
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  ||| || |    
T  3998 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaaccca 4097  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    || | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4098 cttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcac 4197  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4198 aggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 15459 - 15744
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||| |||| ||| || |    
T  15459 tcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaa-atgtggtggtaaaccta 15557  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15558 ctcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 15657  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15658 aagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 287
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15907
Alignment:
Q  212 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Original strand, 14005 - 14291
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||| |||||  |    
T  14005 tcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatctca 14104  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 14204  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14205 aggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 31391 - 31662
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  31391 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 31490  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |  ||| |||||||     
T  31491 ttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactctcag 31590  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31591 aaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctg 31662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3392
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26587
Alignment:
Q  10 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  110 ccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  210 tctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 26587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148822
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctg 148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 196027 - 195758
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  196027 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 195928  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  195927 ttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 195828  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  195827 aaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctct 195758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 68765 - 68582
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  68765 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 68666  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  68665 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtca 68582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 122004
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 122004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16805 - 16519
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  16805 tcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccca 16706  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16705 ctcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagtcac 16606  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16605 aggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctg 16519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 287
Target Start/End: Original strand, 6906 - 7191
Alignment:
Q  4 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaaga-tgcggtgataatccaact 102  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||| | ||| || |||    
T  6906 tcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaacccact 7005  T
Q  103 cggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacat 202  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  7006 cggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatag 7105  T
Q  203 gagtgactctc-aaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7106 gagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctg 7191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 314
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
    |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| || |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctg 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 16923 - 17142
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16923 tcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaa 17022  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17023 ctcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagtcac 17122  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaaca 220  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17123 atgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116959
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || || |||  ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctg 116959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98267
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||| | || | || || ||||||||||| ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 98267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacac 221  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 1 - 254
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| || |   | ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctg 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13307 - 13031
Alignment:
Q  11 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgc 110  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||| ||| || ||||  |||||    
T  13307 ggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaacccactccatacgc 13208  T
Q  111 caccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgact 210  Q
     ||| |||| | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13207 taccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 13108  T
Q  211 ctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13107 ctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 13031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Original strand, 886 - 1153
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| || ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
     ||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtc 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 48 - 287
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49745
Alignment:
Q  48 ttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggacca 147  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  148 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagat 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  248 cttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctg 49745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 286
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22118
Alignment:
Q  100 actcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  200 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactct 22118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16756 - 16470
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |    
T  16756 tcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaaccta 16657  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |  | ||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16656 catgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaatcac 16557  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
      ||||||| || ||||| || || ||| ||||||||||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16556 tggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctg 16470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Original strand, 7855 - 8042
Alignment:
Q  100 actcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7855 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtca 7954  T
Q  200 catgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7955 ccgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 8042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25773
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || |||| | |||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctg 25773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5645
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||  ||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | || |||||||||| ||| |  ||||||| |||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatccttt-tgcgcttatcatgataactcttttgtctactctg 5645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25125
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     | |||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||| |||| |||||||||||    
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctg 25125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 287
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9222
Alignment:
Q  112 accgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactc 211  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  212 tcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||| || || ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 9222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 6943 - 7033
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6943 tcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtg 7033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 399
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  257 gcttatcatgataactctt 275  Q
     ||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactctt 399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10793
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||  ||  | ||||  || ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||| | || |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || | ||| |||||| |||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctg 10793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86556
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |||  ||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| || |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtg 289  Q
     |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtg 86556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26394
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctg 26394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28826
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40817
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| | ||   | || ||||  || ||||| || |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgact 40817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 282
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4122
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||| ||| |||||| || ||| | ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcga 282  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcga 4122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14226 - 13955
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  14226 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacccaactctatatgccactg 14127  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||    
T  14126 ttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 14027  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14026 aaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 13955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 5007
Alignment:
Q  70 tgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttct 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  170 ttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgata 269  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || || || || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  270 actcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| |||||||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctg 5007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Original strand, 79 - 349
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||| ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7090
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| ||| || |||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20235
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| ||||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctg 20235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 13686 - 13415
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  13686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13587  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| |     
T  13586 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 13487  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  13486 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 13415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17456 - 17185
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  17456 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 17357  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || |     
T  17356 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 17257  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  17256 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 17185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47376
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | | |||| || |||| |||||| || ||| | ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctg 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 79 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58467
Alignment:
Q  79 gaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||  ||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  179 aagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttg 278  Q
      ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  279 tc 280  Q
    ||    
T  58468 tc 58467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 287
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19372
Alignment:
Q  35 catacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataa 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||     
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
    |||||||| |||||| ||| | |||||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 19372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatg 71  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74140
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |||||| || || ||  | |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  273 ctt 275  Q
    |||    
T  74138 ctt 74140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51918
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactct 51918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  49 tgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaa 148  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  149 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 37086 - 36974
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  37086 tcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatccaa 36987  T
Q  101 ctcggtacgccac 113  Q
    || | ||||||||    
T  36986 ctagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4508
Alignment:
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctg 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18993
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatg 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatg 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3003
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || | | | ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctg 3003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 284
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7646
Alignment:
Q  160 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgct 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  260 tatcatgataactcttttgtcgact 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgact 7646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10137
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 10137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18862 - 18591
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  18862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaacccactctgtatgccactg 18763  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||| ||| || ||||||| |||||||  |||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  18762 ttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 18663  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  18662 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 18591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27771
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctg 27771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1473 - 1203
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||   || || |||   || ||||| |    
T  1473 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaacctactttttatgccactg 1374  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | || ||| |||||     
T  1373 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgtcataggaatgattctcag 1275  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1274 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctg 1203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 835
Alignment:
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttctt 235  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  236 gaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1223
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || || | |   || ||||| |||||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 1223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5968
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatgaaa-acatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||| || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||| || |||| |||||| ||  || | ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 5968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 9779 - 10045
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  9779 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 9878  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || | |||| |||||||     
T  9879 ttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgccataggagtaactctcag 9978  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | |||||||||||| |     | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9979 aaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 10045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 14067 - 14337
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||| |    
T  14067 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 14166  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||| |||| ||  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||     
T  14167 ttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgtcataggagtgactctcag 14265  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  14266 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4142
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||  |||||  ||| ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactct 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 243
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | |  |||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactca 243  Q
     ||| | ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 26261 - 26203
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26261 tcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 172 - 443
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || |  || |||||||  || ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||  ||||||| |||||||| | ||| |||| | |||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || |||||  | || ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25919
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 25919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16928
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || ||||| |  || ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    |  ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctg 16928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21725
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| || |||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||   | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 21725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 286
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27476
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||| ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| | || | |||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    ||| || || | | | |||||||| |||||  | || |||||||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactct 27476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5056
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||||  |||||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     |||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| | |||||| ||||| |||||| || ||| | ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14305
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctg 14305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||   || ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 179  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 509 - 780
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| || || || ||||  || ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| || ||| | |||||||||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctg 780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 39720 - 39991
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |    
T  39720 acatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 39819  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| | ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  39820 ttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 39919  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||    
T  39920 aaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctg 39991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19101
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  |||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    | |||||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | |||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 19101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 287
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23263
Alignment:
Q  118 ccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaa 217  Q
    |||||||| || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  218 acacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctg 23263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49261
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | || |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 49261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42658 - 42387
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  42658 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 42559  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  42558 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 42459  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  42458 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 42387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 47724 - 47453
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  47724 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 47625  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||  ||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  47624 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgtcataggagtaaccctcag 47525  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  47524 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctg 47453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 215
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  137 gatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 39227 - 38942
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| ||||||| ||||  || ||||    
T  39227 tcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaa 39128  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  || ||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||||| ||||     
T  39127 ctctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtcaa 39028  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||||||| ||| || || ||  | || ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39027 aggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactct 38942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37454
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||| | | |||||||| | |||||| || |||    |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||   | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 37454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27391
Alignment:
Q  115 gttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  215 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctg 27391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38228
Alignment:
Q  115 gttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
    |||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  215 aaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| || || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctg 38228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 49358 - 49087
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| ||||  || || |||  ||| ||| | |    
T  49358 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccgctg 49259  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | | || |||||||     
T  49258 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgtcataggtgttactctcag 49159  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || | | | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||    
T  49158 aaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctg 49087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 58141 - 57871
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||||    
T  58141 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccg 58042  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||  || ||||| | ||||||| ||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||    
T  58041 ttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaa 57942  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | |  |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  57941 aaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctg 57871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 287
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5002
Alignment:
Q  45 aagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacgga 144  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||| || |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  145 ccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaa 244  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||| || || ||| | |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  245 gatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |  | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16767
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||  | |||||||||||  | |||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctg 16767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6436
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||  || |||| ||  || ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  216 -aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| || |||||  |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctg 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11140
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  10869 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 10968  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || |     
T  10969 ttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaag 11068  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11069 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 11140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 453
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||  | || |||||||||||  | || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctg 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7864
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| || || |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctg 7864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20374
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 20374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43756
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  || ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 43756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44768
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaa 100  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  101 ctcggtacgccaccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcac 200  Q
    |||  || ||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | || ||||| |||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  201 atgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||| || |||| |||||| || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||||    
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactct 44768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtca 199  Q
    ||||||| || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26513
Alignment:
Q  13 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgcca 112  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||  || ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  113 ccgttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactct 212  Q
    | ||||| || || ||||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  213 caaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    || ||| || || ||  | || |||||||||||| | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 26513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33731
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |  || || || |  || ||||| || || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtg 224  Q
    | || |||| |||||| || ||||||||  |||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  225 gtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctg 33731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40510
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 40510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4464 - 4235
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  4464 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 4365  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| || | ||| | |||||||||||| || ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||| ||||| ||    
T  4364 ttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttaa 4265  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaag 245  Q
    |||||| || ||  | ||||||||||||||    
T  4264 aaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12836
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||| ||| |||||||||||||  || ||||| |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactct 286  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactct 12836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 61538 - 61267
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  61538 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 61439  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || ||||     
T  61438 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 61339  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  61338 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 61267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67655
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 67655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 52504 - 52233
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||  || || ||||  || ||||| |    
T  52504 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 52405  T
Q  116 ttccaactctttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaa 215  Q
    ||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||| | |||| || ||||     
T  52404 ttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcag 52305  T
Q  216 aaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  52304 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 52233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2023
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcac 184  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 2023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 25 - 194
Target Start/End: Original strand, 136109 - 136278
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  136109 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctatatgccacagttccaactc 136208  T
Q  125 tttctgataactgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacacc 194  Q
    | ||||| | ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  136209 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248865
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || |||||  |||||||| | ||||| |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| |||| ||| || || ||  | ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||| ||    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctg 248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||  || || |||| ||| | ||| |||||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctca 214  Q
     |||||||  |||||| ||  | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 6239 - 6329
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6239 tcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtg 6329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2046
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||     
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctg 2046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7292
Alignment:
Q  34 acatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgata 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||  | |||||| |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaa--ccttctgaaa 7446  T
Q  134 actgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttc 233  Q
     ||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||| |  ||| || |||| ||| || || ||  | ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||| |||  | || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctg 7292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 209
Target Start/End: Original strand, 42784 - 42957
Alignment:
Q  36 atacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactctttctgataac 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||||  || |||||||  || ||||| ||||||||  | ||||| | |    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  136 tgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgac 209  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgac 42957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7556 - 7498
Alignment:
Q  1 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 59  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7556 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 133
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45943
Alignment:
Q  25 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccgttccaactc 124  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 45934  T
Q  125 tttctgata 133  Q
    | |||||||    
T  45935 tctctgata 45943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 28467 - 28327
Alignment:
Q  140 acggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaa 239  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || ||  || |||| ||    
T  28467 acggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaa 28368  T
Q  240 ctcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  28367 ctcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtc 28327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 964
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctg 964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14775
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||  |  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  14761 cttctgtctactctg 14775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46406
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctg 46406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 287
Target Start/End: Original strand, 5313 - 5465
Alignment:
Q  135 ctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttct 234  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||| || || ||  | ||     
T  5313 ctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcc 5412  T
Q  235 tgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  5413 tgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctg 5465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 286
Target Start/End: Original strand, 1 - 121
Alignment:
Q  166 ttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcat 265  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | || |||||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  266 gataactcttttgtcgactct 286  Q
    | |||||||| || |||||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactct 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 287
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23646
Alignment:
Q  159 agtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgc 258  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| | || |||||||||||||| ||     |||||||||||| ||| ||||| | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  259 ttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctg 23646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3929
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14909
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctg 14909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 287
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43790
Alignment:
Q  234 ttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctg 43790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 280
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24125
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtc 280  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtc 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1108
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||| || || ||  |  |  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  1122 cttctgtctactctg 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 440
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| ||  |  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8347
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  || |||||||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctg 8347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10607
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  10593 cttctgtctactctg 10607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 5879 - 5993
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  5979 cttctgtctactctg 5993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14791
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || ||||||||||| || ||  |  | ||||| |||| ||| ||||| |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 14791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3593 - 3487
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtgataatccaactcggtacgccaccg 115  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||  || |||||||  || ||||| |    
T  3593 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccactg 3494  T
Q  116 ttccaac 122  Q
    |||||||    
T  3493 ttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13160
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||||||| ||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 13160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 3810 - 3773
Alignment:
Q  250 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3810 tttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 3773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 887
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtg 91  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtg 887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 287
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3411
Alignment:
Q  157 ggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctac 256  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||| |||||| || | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||| |  || ||||| |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  257 gcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctg 3411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 287
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8602
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | || | || ||||||||||| || ||  |  ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  273 cttttgtcgactctg 287  Q
    ||| |||| ||||||    
T  8588 cttctgtctactctg 8602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Original strand, 9200 - 9269
Alignment:
Q  16 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacatcatgcaaattcgaaagat 85  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  9200 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagat 9269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 230 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1345 - 1288
Alignment:
Q  230 cttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1345 cttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctg 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 4005
Alignment:
Q  173 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaacacgtggtcttcttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataact 272  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  273 cttttgtc 280  Q
    ||| ||||    
T  4012 cttatgtc 4005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26211
Alignment:
Q  233 cttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctg 287  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctg 26211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University