View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2460_high_6 (Length: 341)
Name: NF2460_high_6
Description: NF2460
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2460_high_6 |
 | |
|
| [»] scaffold0129 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 335521 - 335776
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|
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| T |
335521 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
335620 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
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|
| T |
335621 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
335720 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
335721 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
335776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 3522632 - 3522887
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522632 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
3522731 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3522732 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
3522831 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3522832 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3522887 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10269463 - 10269208
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
10269463 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
10269364 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10269363 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
10269264 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
10269263 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10269208 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 2272545 - 2272800
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2272545 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
2272644 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2272645 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
2272744 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
2272745 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgttgatgt |
2272800 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 3534859 - 3535114
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3534859 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
3534958 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3534959 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
3535058 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3535059 |
caccgacatggcataaagttatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
3535114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 7356769 - 7356517
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7356769 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgttt--gagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
7356672 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
7356671 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttggg-aattcaag |
7356573 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7356572 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtttgttgatgt |
7356517 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 12532919 - 12533175
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaa-ccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacag |
106 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12532919 |
gagcggagatcaaaagacacaaaaccagcaaaatatcctgacaaggagaatgttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacag |
12533018 |
T |
|
| Q |
107 |
aagaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaa |
206 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12533019 |
gagaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaa |
12533118 |
T |
|
| Q |
207 |
gcactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
12533119 |
gcaccgacatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
12533175 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9313817 - 9313562
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
9313817 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcatagg |
9313718 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9313717 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
9313618 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
9313617 |
cactgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
9313562 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 23717495 - 23717240
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717495 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
23717396 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23717395 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
23717296 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
23717295 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23717240 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 32742474 - 32742219
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742474 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
32742375 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32742374 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
32742275 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
32742274 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
32742219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 35216376 - 35216631
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216376 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
35216475 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35216476 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
35216575 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
35216576 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
35216631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 38223132 - 38223387
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223132 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
38223231 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38223232 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaacgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
38223331 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
38223332 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38223387 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 42988912 - 42989167
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42988912 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
42989011 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42989012 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaacttctgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
42989111 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |
|
|
| T |
42989112 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgagtctgttgatgt |
42989167 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 14218933 - 14219188
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14218933 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
14219032 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14219033 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
14219132 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14219133 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14219188 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 30704360 - 30704105
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704360 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccaacaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
30704261 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30704260 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaag |
30704161 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
30704160 |
caccgacatggcataaagtcatttcatcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
30704105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 14677100 - 14677355
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677100 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
14677199 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14677200 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
14677299 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
14677300 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
14677355 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 45106859 - 45107114
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106859 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
45106958 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45106959 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
45107058 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
45107059 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
45107114 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 252
Target Start/End: Original strand, 21395667 - 21395911
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395667 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
21395766 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395767 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
21395866 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtggg |
252 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21395867 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtggg |
21395911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 1085848 - 1085593
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085848 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
1085749 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1085748 |
agaattaattttgtagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
1085649 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
1085648 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
1085593 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 17195633 - 17195378
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195633 |
gagcggagatcaaaagacacaaacaagcaaaatatcctgatatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
17195534 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17195533 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctgtacaggatggcttgggaaattcaag |
17195434 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17195433 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
17195378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 10485414 - 10485669
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485414 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacgtggagaaggttgtttatgagtggtttttacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
10485513 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10485514 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatgacttgggaaattcaag |
10485613 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
10485614 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
10485669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 49550350 - 49550105
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550350 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccaataaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
49550251 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550250 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
49550151 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggt |
253 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49550150 |
caccgacatggcataaagtcatttcatccttttggcgagagtgggt |
49550105 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Original strand, 5926518 - 5926647
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926518 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
5926617 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatac |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926618 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatac |
5926647 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27182604 - 27182475
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182604 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
27182505 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatac |
137 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27182504 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatac |
27182475 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 5)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 44553556 - 44553301
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553556 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
44553457 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44553456 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
44553357 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
44553356 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
44553301 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 38518418 - 38518163
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518418 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
38518319 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38518318 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
38518219 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
38518218 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
38518163 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 34945534 - 34945789
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945534 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaatgttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
34945633 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34945634 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgcaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
34945733 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
34945734 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcattttggcgagagtgggtctgttgatgt |
34945789 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 27644654 - 27644504
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
27644654 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatattacagg |
27644555 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctca |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27644554 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctca |
27644504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Original strand, 20394847 - 20394982
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20394847 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
20394946 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaa |
143 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
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| T |
20394947 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaa |
20394982 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 16642080 - 16641825
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|
|
| T |
16642080 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
16641981 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
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| T |
16641980 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
16641881 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16641880 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
16641825 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 41773873 - 41774128
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41773873 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
41773972 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41773973 |
agaattaattttgtagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
41774072 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
41774073 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
41774128 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 2026640 - 2026895
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2026640 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
2026739 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2026740 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
2026839 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
2026840 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttgtcgagagtgggtctgttgatgt |
2026895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 37039015 - 37038760
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37039015 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
37038916 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37038915 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
37038816 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
37038815 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
37038760 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 43488033 - 43488288
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488033 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaagttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
43488132 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43488133 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
43488232 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
43488233 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
43488288 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 23415626 - 23415881
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23415626 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagtaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatttcacagg |
23415725 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23415726 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
23415825 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
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|
| T |
23415826 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggtctgttgatgt |
23415881 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 8 - 263
Target Start/End: Original strand, 3615249 - 3615504
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3615249 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacaacatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
3615348 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
3615349 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttataccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
3615448 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggtatgatgatgt |
263 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
3615449 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttgacgagagtgggtctgttgatgt |
3615504 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0129 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0129
Description:
Target: scaffold0129; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39325 - 39080
Alignment:
| Q |
8 |
gagcagagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacaga |
107 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39325 |
gagcggagatcaaaagacacaaaccagcaaaatatcctgacatggagaaggttgtttatgagtggtttctacagcatcaagaacgtgtgaatatcacagg |
39226 |
T |
|
| Q |
108 |
agaattaattttgcagaaggcaagagataccatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacaggatggcttgggaaattcaag |
207 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39225 |
agaattaattttgcagaaggcaagagatacaatgaaactcttgtaccctcatgatgattcagattttaacttctctacatgatggcttgggaaattcaag |
39126 |
T |
|
| Q |
208 |
cactgacatggcataaaatcatttcgtcgttttggcgagagtgggt |
253 |
Q |
| |
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|
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| T |
39125 |
caccgacatggcataaagtcatttcgtcgttttggcgagagtgggt |
39080 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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