View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2469_low_2 (Length: 331)

Name: NF2469_low_2
Description: NF2469
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2469_low_2
NF2469_low_2
[»] chr1 (109 HSPs)
chr1 (36-314)||(10399831-10400109)
chr1 (36-314)||(51750039-51750317)
chr1 (36-314)||(47906270-47906548)
chr1 (36-315)||(17324639-17324918)
chr1 (44-314)||(2617516-2617786)
chr1 (36-314)||(15294837-15295115)
chr1 (36-314)||(28840680-28840957)
chr1 (36-315)||(31735524-31735803)
chr1 (36-314)||(6823015-6823292)
chr1 (36-314)||(12302508-12302786)
chr1 (36-314)||(46431709-46431988)
chr1 (36-314)||(50076675-50076953)
chr1 (36-310)||(50307549-50307824)
chr1 (44-314)||(13215081-13215356)
chr1 (36-315)||(16226166-16226445)
chr1 (36-314)||(2949235-2949512)
chr1 (36-314)||(15823546-15823824)
chr1 (36-314)||(20302459-20302736)
chr1 (36-314)||(24325664-24325941)
chr1 (36-314)||(27336943-27337219)
chr1 (47-314)||(50078834-50079102)
chr1 (36-314)||(39932073-39932352)
chr1 (36-314)||(2510328-2510605)
chr1 (36-314)||(6995703-6995981)
chr1 (36-314)||(13761837-13762114)
chr1 (36-310)||(41646924-41647198)
chr1 (74-314)||(21948229-21948468)
chr1 (36-314)||(9459420-9459698)
chr1 (36-314)||(9463247-9463525)
chr1 (44-314)||(16428653-16428924)
chr1 (36-314)||(11457478-11457756)
chr1 (36-314)||(20291457-20291734)
chr1 (36-314)||(28842495-28842772)
chr1 (36-314)||(28998256-28998534)
chr1 (36-314)||(29003972-29004250)
chr1 (46-314)||(18307109-18307377)
chr1 (44-314)||(38925492-38925759)
chr1 (36-314)||(47179713-47179990)
chr1 (36-314)||(3579620-3579897)
chr1 (36-314)||(27339134-27339411)
chr1 (36-314)||(39462519-39462797)
chr1 (43-307)||(9241095-9241360)
chr1 (36-314)||(18839587-18839866)
chr1 (36-314)||(25127872-25128151)
chr1 (49-314)||(40133944-40134210)
chr1 (92-314)||(48665177-48665400)
chr1 (36-314)||(51752365-51752641)
chr1 (47-310)||(17186141-17186405)
chr1 (36-314)||(14097972-14098251)
chr1 (36-314)||(47177362-47177639)
chr1 (36-314)||(6756527-6756806)
chr1 (45-314)||(4131387-4131660)
chr1 (36-314)||(31425018-31425300)
chr1 (36-314)||(50248573-50248853)
chr1 (36-314)||(25251277-25251556)
chr1 (36-314)||(31489915-31490190)
chr1 (36-314)||(28207071-28207347)
chr1 (36-314)||(17318893-17319165)
chr1 (36-315)||(17324064-17324342)
chr1 (37-314)||(47451648-47451919)
chr1 (100-314)||(31422940-31423155)
chr1 (36-218)||(23785935-23786117)
chr1 (59-290)||(15669419-15669648)
chr1 (115-314)||(6823885-6824091)
chr1 (43-314)||(14183600-14183867)
chr1 (43-245)||(16231632-16231834)
chr1 (36-229)||(16429042-16429236)
chr1 (36-245)||(25248554-25248764)
chr1 (43-310)||(42922238-42922503)
chr1 (46-314)||(8347284-8347550)
chr1 (36-222)||(51757623-51757808)
chr1 (36-268)||(16432440-16432674)
chr1 (43-230)||(6115112-6115300)
chr1 (92-314)||(8349110-8349329)
chr1 (36-173)||(23816027-23816164)
chr1 (100-314)||(18800640-18800850)
chr1 (45-287)||(49495222-49495461)
chr1 (87-314)||(13125511-13125737)
chr1 (36-235)||(30790403-30790603)
chr1 (98-230)||(30738695-30738828)
chr1 (74-230)||(155790-155947)
chr1 (44-230)||(16561550-16561739)
chr1 (126-315)||(26520206-26520398)
chr1 (92-230)||(26613298-26613438)
chr1 (47-315)||(27916499-27916765)
chr1 (92-230)||(28279348-28279489)
chr1 (87-228)||(43104245-43104389)
chr1 (36-109)||(13358778-13358851)
chr1 (43-142)||(15916562-15916663)
chr1 (157-230)||(26332613-26332686)
chr1 (155-217)||(4144804-4144865)
chr1 (92-230)||(14353049-14353187)
chr1 (43-214)||(21353356-21353525)
chr1 (155-217)||(2232597-2232658)
chr1 (155-217)||(14997040-14997101)
chr1 (155-214)||(2401342-2401400)
chr1 (155-214)||(9526469-9526527)
chr1 (155-214)||(25134074-25134132)
chr1 (155-214)||(9521718-9521776)
chr1 (190-315)||(26332719-26332837)
chr1 (156-214)||(2393404-2393461)
chr1 (36-98)||(47102871-47102933)
chr1 (126-230)||(49959131-49959237)
chr1 (190-314)||(13127790-13127910)
chr1 (155-217)||(13785392-13785455)
chr1 (43-85)||(31422870-31422912)
chr1 (273-315)||(32261037-32261078)
chr1 (61-124)||(13127715-13127779)
chr1 (155-218)||(37990772-37990836)
[»] chr3 (142 HSPs)
chr3 (36-314)||(4308280-4308558)
chr3 (36-314)||(38890020-38890298)
chr3 (36-314)||(18099169-18099447)
chr3 (36-314)||(10956026-10956304)
chr3 (36-314)||(25533422-25533700)
chr3 (36-314)||(42990284-42990562)
chr3 (36-314)||(43226066-43226343)
chr3 (36-314)||(43228271-43228549)
chr3 (36-314)||(53917663-53917941)
chr3 (45-314)||(18096908-18097177)
chr3 (36-307)||(1313396-1313667)
chr3 (36-314)||(10958322-10958600)
chr3 (36-314)||(27101180-27101458)
chr3 (36-314)||(45882919-45883198)
chr3 (36-314)||(30005821-30006099)
chr3 (36-313)||(10084388-10084665)
chr3 (36-290)||(1321483-1321737)
chr3 (36-314)||(4103895-4104172)
chr3 (36-314)||(11170384-11170662)
chr3 (36-314)||(28102001-28102279)
chr3 (36-314)||(43423462-43423740)
chr3 (36-314)||(51727006-51727283)
chr3 (36-314)||(53915495-53915773)
chr3 (36-314)||(25388886-25389163)
chr3 (36-314)||(43421414-43421692)
chr3 (36-314)||(746737-747015)
chr3 (36-314)||(6065795-6066073)
chr3 (36-314)||(1626682-1626960)
chr3 (36-314)||(3859508-3859785)
chr3 (36-314)||(5191633-5191909)
chr3 (36-314)||(458264-458542)
chr3 (36-307)||(9604606-9604877)
chr3 (36-314)||(36011807-36012085)
chr3 (36-314)||(455887-456165)
chr3 (36-314)||(10621529-10621807)
chr3 (36-314)||(51943351-51943628)
chr3 (43-314)||(6063452-6063723)
chr3 (51-314)||(18162643-18162907)
chr3 (36-314)||(32264036-32264316)
chr3 (36-314)||(24979687-24979966)
chr3 (36-314)||(50493979-50494257)
chr3 (36-314)||(5926763-5927041)
chr3 (36-313)||(10191309-10191585)
chr3 (74-314)||(29956666-29956906)
chr3 (36-314)||(880450-880729)
chr3 (36-310)||(3314668-3314943)
chr3 (43-310)||(26720532-26720798)
chr3 (36-314)||(22114304-22114582)
chr3 (47-295)||(28413042-28413290)
chr3 (36-272)||(7606587-7606822)
chr3 (36-314)||(38210350-38210628)
chr3 (36-314)||(47148894-47149172)
chr3 (36-307)||(48361670-48361941)
chr3 (78-314)||(6561790-6562028)
chr3 (36-314)||(53468452-53468732)
chr3 (36-268)||(5522626-5522857)
chr3 (37-314)||(35917944-35918226)
chr3 (43-314)||(889779-890048)
chr3 (36-272)||(32219106-32219343)
chr3 (99-310)||(39715453-39715664)
chr3 (36-314)||(12267974-12268243)
chr3 (36-280)||(6484373-6484618)
chr3 (43-314)||(28761433-28761705)
chr3 (45-315)||(54691582-54691852)
chr3 (36-230)||(5886264-5886456)
chr3 (36-230)||(5899737-5899929)
chr3 (38-243)||(25688161-25688367)
chr3 (36-314)||(51674765-51675032)
chr3 (129-314)||(35777401-35777587)
chr3 (36-231)||(11168164-11168359)
chr3 (36-314)||(42992266-42992528)
chr3 (36-273)||(4666535-4666772)
chr3 (139-314)||(28100143-28100318)
chr3 (36-314)||(15780840-15781137)
chr3 (59-315)||(31151328-31151579)
chr3 (36-268)||(53591210-53591441)
chr3 (74-287)||(13420222-13420432)
chr3 (36-245)||(6231850-6232058)
chr3 (134-307)||(28181009-28181182)
chr3 (47-276)||(17795280-17795506)
chr3 (47-276)||(19103720-19103946)
chr3 (73-313)||(54884138-54884376)
chr3 (47-315)||(23633439-23633700)
chr3 (117-315)||(23637006-23637200)
chr3 (46-287)||(561783-562024)
chr3 (44-287)||(25635391-25635632)
chr3 (36-314)||(27635657-27635904)
chr3 (45-216)||(3306839-3307009)
chr3 (74-314)||(53597220-53597457)
chr3 (106-315)||(1673955-1674160)
chr3 (146-272)||(28137415-28137541)
chr3 (43-314)||(36871306-36871575)
chr3 (36-167)||(47701670-47701801)
chr3 (202-314)||(41849132-41849244)
chr3 (47-188)||(24181486-24181629)
chr3 (82-230)||(14634486-14634636)
chr3 (59-230)||(1620483-1620655)
chr3 (154-250)||(4560401-4560497)
chr3 (190-315)||(24177259-24177380)
chr3 (237-314)||(11163130-11163207)
chr3 (45-151)||(25634030-25634137)
chr3 (241-314)||(6231429-6231502)
chr3 (158-295)||(13419883-13420015)
chr3 (247-314)||(47701805-47701872)
chr3 (155-230)||(11066654-11066731)
chr3 (59-205)||(11007545-11007683)
chr3 (155-214)||(27762107-27762165)
chr3 (155-217)||(10094195-10094256)
chr3 (155-217)||(10201075-10201136)
chr3 (155-217)||(16462203-16462264)
chr3 (155-217)||(22626105-22626166)
chr3 (190-287)||(25633930-25634024)
chr3 (36-110)||(41849243-41849317)
chr3 (155-217)||(47883003-47883064)
chr3 (155-315)||(7768553-7768709)
chr3 (36-101)||(35919114-35919179)
chr3 (251-314)||(3306779-3306842)
chr3 (155-214)||(29914074-29914132)
chr3 (155-214)||(47878292-47878350)
chr3 (155-214)||(54193229-54193287)
chr3 (155-209)||(4535622-4535675)
chr3 (155-217)||(10100212-10100273)
chr3 (155-217)||(10208121-10208182)
chr3 (155-217)||(16996875-16996936)
chr3 (155-217)||(27544273-27544334)
chr3 (36-101)||(53894056-53894121)
chr3 (169-217)||(6303310-6303358)
chr3 (155-214)||(10897008-10897066)
chr3 (155-214)||(20031439-20031497)
chr3 (155-214)||(54188512-54188570)
chr3 (169-217)||(7418064-7418112)
chr3 (157-217)||(38002869-38002928)
chr3 (155-217)||(5858546-5858605)
chr3 (155-214)||(10595155-10595213)
chr3 (155-205)||(11073033-11073084)
chr3 (192-230)||(31021300-31021339)
chr3 (179-213)||(10949404-10949438)
chr3 (155-217)||(11079517-11079578)
chr3 (155-209)||(13893470-13893523)
chr3 (40-90)||(28181192-28181241)
chr3 (205-250)||(7606828-7606873)
chr3 (36-84)||(3716036-3716084)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (36-314)||(40637128-40637406)
chr4 (36-314)||(8631420-8631698)
chr4 (36-314)||(24348272-24348550)
chr4 (36-314)||(48486373-48486651)
chr4 (36-314)||(37089373-37089650)
chr4 (36-315)||(2484874-2485152)
chr4 (36-314)||(11435009-11435286)
chr4 (36-314)||(22046687-22046964)
chr4 (36-314)||(22800863-22801141)
chr4 (36-314)||(22802735-22803013)
chr4 (36-314)||(14633373-14633650)
chr4 (36-314)||(22044392-22044669)
chr4 (36-314)||(24888850-24889128)
chr4 (36-310)||(47868459-47868733)
chr4 (36-314)||(24879043-24879322)
chr4 (36-314)||(24880505-24880784)
chr4 (44-314)||(5198474-5198744)
chr4 (44-296)||(26085986-26086237)
chr4 (36-311)||(9148310-9148584)
chr4 (36-314)||(18847207-18847484)
chr4 (36-314)||(36921494-36921773)
chr4 (45-314)||(11006247-11006516)
chr4 (36-314)||(22132393-22132669)
chr4 (36-314)||(38409259-38409536)
chr4 (36-314)||(51015300-51015577)
chr4 (36-314)||(7941375-7941655)
chr4 (36-314)||(6764893-6765176)
chr4 (36-314)||(36919585-36919864)
chr4 (36-314)||(38928178-38928457)
chr4 (36-314)||(12395846-12396124)
chr4 (36-314)||(40091416-40091694)
chr4 (36-314)||(19095936-19096215)
chr4 (36-314)||(22782739-22783017)
chr4 (36-314)||(44599839-44600117)
chr4 (36-314)||(12400808-12401086)
chr4 (36-314)||(11008569-11008845)
chr4 (36-314)||(14787430-14787710)
chr4 (43-314)||(56030498-56030766)
chr4 (36-268)||(17662246-17662478)
chr4 (43-314)||(36378346-36378618)
chr4 (36-314)||(31849600-31849878)
chr4 (36-314)||(619449-619726)
chr4 (36-314)||(18709165-18709442)
chr4 (36-314)||(47274781-47275057)
chr4 (46-314)||(9176485-9176753)
chr4 (38-314)||(33415491-33415766)
chr4 (44-314)||(16453363-16453634)
chr4 (36-314)||(22780374-22780652)
chr4 (36-314)||(22134619-22134894)
chr4 (36-312)||(16934144-16934420)
chr4 (94-314)||(5637524-5637744)
chr4 (36-314)||(37313066-37313345)
chr4 (36-312)||(16931790-16932066)
chr4 (55-314)||(13544013-13544272)
chr4 (92-295)||(3824627-3824830)
chr4 (36-314)||(9174147-9174425)
chr4 (44-314)||(47210761-47211019)
chr4 (36-314)||(19322751-19323027)
chr4 (43-292)||(36380425-36380675)
chr4 (36-255)||(16455354-16455574)
chr4 (36-294)||(41997566-41997824)
chr4 (36-314)||(53405184-53405465)
chr4 (74-315)||(18537513-18537750)
chr4 (43-314)||(18409355-18409626)
chr4 (43-288)||(38890232-38890476)
chr4 (60-315)||(8756276-8756529)
chr4 (36-226)||(2891433-2891624)
chr4 (36-191)||(4215483-4215638)
chr4 (45-220)||(13547302-13547477)
chr4 (36-173)||(5635477-5635614)
chr4 (76-287)||(18534873-18535082)
chr4 (113-314)||(52942537-52942725)
chr4 (140-314)||(3937314-3937488)
chr4 (36-174)||(11437557-11437694)
chr4 (150-313)||(6132927-6133090)
chr4 (36-280)||(30136640-30136882)
chr4 (36-285)||(27499128-27499374)
chr4 (45-230)||(12102224-12102412)
chr4 (43-315)||(28453741-28454009)
chr4 (45-314)||(15032557-15032815)
chr4 (43-230)||(25357774-25357968)
chr4 (47-315)||(47150904-47151168)
chr4 (74-230)||(31983566-31983724)
chr4 (74-229)||(3982215-3982374)
chr4 (43-217)||(16185842-16186018)
chr4 (102-315)||(40999017-40999227)
chr4 (74-315)||(9863764-9864004)
chr4 (36-167)||(5101130-5101260)
chr4 (207-314)||(38270158-38270265)
chr4 (43-315)||(10112926-10113196)
chr4 (229-314)||(5101051-5101136)
chr4 (207-286)||(24446756-24446835)
chr4 (74-315)||(9022361-9022600)
chr4 (251-314)||(2891371-2891434)
chr4 (155-217)||(5336903-5336964)
chr4 (74-148)||(24446680-24446754)
chr4 (36-120)||(47563009-47563093)
chr4 (155-214)||(16489352-16489410)
chr4 (155-214)||(25699752-25699810)
chr4 (155-217)||(4570094-4570155)
chr4 (155-217)||(7050378-7050439)
chr4 (155-217)||(11853549-11853610)
chr4 (155-214)||(4556180-4556238)
chr4 (155-214)||(4558314-4558372)
chr4 (155-214)||(8529270-8529328)
chr4 (155-214)||(15316961-15317019)
chr4 (155-214)||(18586969-18587027)
chr4 (155-214)||(31300427-31300485)
chr4 (155-217)||(55822265-55822326)
chr4 (104-230)||(54906724-54906852)
chr4 (175-262)||(10114435-10114520)
chr4 (155-214)||(15831144-15831202)
chr4 (155-214)||(16689061-16689119)
chr4 (155-218)||(29609591-29609654)
chr4 (155-214)||(47566496-47566554)
chr4 (159-217)||(16638827-16638884)
chr4 (145-183)||(38270120-38270158)
chr4 (156-211)||(3760105-3760161)
chr4 (36-100)||(6133105-6133169)
chr4 (127-230)||(22295295-22295399)
chr4 (179-214)||(4884877-4884912)
chr4 (36-100)||(14789429-14789495)
chr4 (155-217)||(36771396-36771457)
chr4 (176-217)||(4874620-4874661)
[»] chr5 (103 HSPs)
chr5 (38-314)||(25804025-25804300)
chr5 (36-314)||(18511213-18511491)
chr5 (36-314)||(10529100-10529378)
chr5 (36-314)||(38882106-38882383)
chr5 (43-314)||(4236629-4236900)
chr5 (36-314)||(2174919-2175196)
chr5 (36-314)||(6745069-6745346)
chr5 (36-314)||(25921474-25921752)
chr5 (36-314)||(40221522-40221801)
chr5 (36-314)||(18509319-18509597)
chr5 (36-314)||(21948026-21948304)
chr5 (36-314)||(39854483-39854761)
chr5 (36-314)||(34477054-34477333)
chr5 (36-314)||(18466684-18466962)
chr5 (36-314)||(16092200-16092479)
chr5 (36-314)||(18469011-18469287)
chr5 (35-297)||(18596662-18596925)
chr5 (36-314)||(31545080-31545358)
chr5 (36-314)||(16776158-16776435)
chr5 (36-314)||(25904103-25904381)
chr5 (36-314)||(27912536-27912814)
chr5 (36-314)||(34479419-34479698)
chr5 (36-314)||(31179372-31179650)
chr5 (36-314)||(6747306-6747582)
chr5 (36-314)||(24126856-24127134)
chr5 (36-295)||(27910469-27910728)
chr5 (36-314)||(31542735-31543012)
chr5 (36-292)||(658357-658610)
chr5 (36-314)||(1189608-1189888)
chr5 (36-314)||(15552245-15552523)
chr5 (36-314)||(17072883-17073162)
chr5 (36-314)||(21684453-21684730)
chr5 (36-307)||(26097740-26098009)
chr5 (36-314)||(10474324-10474602)
chr5 (36-315)||(31472613-31472893)
chr5 (36-314)||(2818336-2818615)
chr5 (36-314)||(17818493-17818769)
chr5 (36-314)||(36402329-36402607)
chr5 (45-314)||(39398003-39398272)
chr5 (44-314)||(6756494-6756762)
chr5 (36-307)||(37705781-37706052)
chr5 (36-314)||(2954416-2954694)
chr5 (36-272)||(10586873-10587110)
chr5 (36-268)||(695924-696156)
chr5 (36-230)||(20505844-20506036)
chr5 (92-314)||(34530722-34530945)
chr5 (96-290)||(31466040-31466233)
chr5 (36-230)||(39798131-39798325)
chr5 (36-245)||(4410092-4410300)
chr5 (36-218)||(10749796-10749978)
chr5 (38-310)||(12555926-12556198)
chr5 (36-245)||(41585745-41585954)
chr5 (36-314)||(6661185-6661461)
chr5 (36-310)||(21288768-21289039)
chr5 (36-218)||(3373138-3373320)
chr5 (36-218)||(10757273-10757454)
chr5 (36-218)||(15354576-15354757)
chr5 (36-218)||(23665140-23665321)
chr5 (36-218)||(23793266-23793447)
chr5 (156-314)||(20043050-20043208)
chr5 (152-314)||(20045010-20045172)
chr5 (36-257)||(2723959-2724171)
chr5 (41-290)||(9020246-9020493)
chr5 (36-218)||(15356852-15357033)
chr5 (36-218)||(38960133-38960314)
chr5 (36-211)||(23741860-23742034)
chr5 (163-310)||(26098379-26098526)
chr5 (44-314)||(20053847-20054107)
chr5 (43-230)||(36208659-36208847)
chr5 (74-315)||(17413205-17413442)
chr5 (59-230)||(15143549-15143722)
chr5 (99-188)||(42770936-42771025)
chr5 (43-218)||(23667415-23667589)
chr5 (100-214)||(4897828-4897943)
chr5 (74-315)||(2144601-2144841)
chr5 (146-281)||(42770804-42770934)
chr5 (238-314)||(20507665-20507741)
chr5 (160-315)||(29748351-29748502)
chr5 (43-217)||(15445274-15445453)
chr5 (155-272)||(4754198-4754312)
chr5 (155-217)||(1170811-1170872)
chr5 (155-217)||(31782578-31782639)
chr5 (100-230)||(34033632-34033766)
chr5 (155-217)||(35385573-35385634)
chr5 (44-124)||(26098297-26098378)
chr5 (36-230)||(35430261-35430460)
chr5 (155-214)||(25452498-25452556)
chr5 (155-217)||(2298122-2298183)
chr5 (155-217)||(10627364-10627425)
chr5 (155-212)||(25445501-25445557)
chr5 (155-218)||(32520533-32520597)
chr5 (155-263)||(15224889-15224997)
chr5 (155-214)||(28786407-28786465)
chr5 (155-217)||(1240428-1240489)
chr5 (156-217)||(16093413-16093473)
chr5 (155-214)||(11962554-11962612)
chr5 (155-214)||(17841370-17841428)
chr5 (155-214)||(22672837-22672895)
chr5 (272-314)||(695889-695931)
chr5 (155-209)||(26406594-26406647)
chr5 (157-217)||(13295835-13295896)
chr5 (274-314)||(4410061-4410101)
chr5 (282-314)||(10586842-10586874)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (36-314)||(3874066-3874344)
chr8 (43-314)||(32339365-32339636)
chr8 (36-314)||(608790-609068)
chr8 (36-314)||(28251568-28251846)
chr8 (36-314)||(30480504-30480782)
chr8 (36-314)||(22684654-22684935)
chr8 (36-314)||(27829353-27829630)
chr8 (36-314)||(14807807-14808095)
chr8 (36-314)||(15809275-15809552)
chr8 (36-314)||(27106898-27107176)
chr8 (36-314)||(28283222-28283498)
chr8 (36-314)||(14419191-14419470)
chr8 (36-314)||(27827042-27827319)
chr8 (36-314)||(15072766-15073045)
chr8 (36-314)||(43079658-43079936)
chr8 (36-314)||(4424074-4424352)
chr8 (38-314)||(27911071-27911345)
chr8 (38-314)||(27957490-27957764)
chr8 (43-314)||(15068037-15068308)
chr8 (36-314)||(43082029-43082307)
chr8 (36-314)||(41384800-41385078)
chr8 (36-314)||(1225222-1225501)
chr8 (36-314)||(44720899-44721177)
chr8 (36-314)||(18810764-18811041)
chr8 (36-272)||(43530213-43530449)
chr8 (43-314)||(36865594-36865864)
chr8 (47-314)||(24873193-24873460)
chr8 (43-314)||(13858492-13858763)
chr8 (36-315)||(41382728-41382996)
chr8 (44-314)||(5372185-5372457)
chr8 (36-272)||(18812980-18813215)
chr8 (126-314)||(14477332-14477520)
chr8 (36-314)||(25952577-25952855)
chr8 (36-314)||(15185715-15185989)
chr8 (36-280)||(15956051-15956292)
chr8 (43-287)||(21480589-21480830)
chr8 (38-314)||(33541413-33541667)
chr8 (43-287)||(21482397-21482638)
chr8 (43-279)||(3005638-3005872)
chr8 (74-279)||(31162303-31162506)
chr8 (174-314)||(5622877-5623017)
chr8 (99-245)||(181624-181772)
chr8 (43-230)||(31578284-31578474)
chr8 (74-230)||(31035257-31035414)
chr8 (193-314)||(26775257-26775378)
chr8 (103-230)||(31573794-31573922)
chr8 (152-280)||(37214317-37214436)
chr8 (45-164)||(2468139-2468259)
chr8 (207-286)||(35872555-35872634)
chr8 (132-217)||(13985176-13985262)
chr8 (113-218)||(17847677-17847782)
chr8 (198-315)||(31035125-31035238)
chr8 (74-230)||(3895959-3896119)
chr8 (74-148)||(35872479-35872553)
chr8 (45-217)||(6376141-6376315)
chr8 (259-314)||(12517248-12517303)
chr8 (155-217)||(9021228-9021289)
chr8 (155-217)||(16752643-16752704)
chr8 (155-217)||(16757388-16757449)
chr8 (155-217)||(28327908-28327969)
chr8 (155-217)||(28895502-28895563)
chr8 (155-217)||(30423212-30423274)
chr8 (156-230)||(13985933-13986009)
chr8 (155-214)||(590797-590855)
chr8 (155-214)||(33032657-33032715)
chr8 (190-274)||(2468261-2468341)
chr8 (155-217)||(4812608-4812669)
chr8 (155-217)||(28332631-28332692)
chr8 (157-214)||(29554908-29554964)
chr8 (155-214)||(3276347-3276405)
chr8 (155-214)||(25684646-25684704)
chr8 (155-217)||(2267144-2267205)
chr8 (179-217)||(17799568-17799606)
chr8 (155-230)||(33839043-33839118)
chr8 (36-90)||(37214265-37214319)
chr8 (270-314)||(3886153-3886197)
chr8 (155-217)||(15949534-15949596)
chr8 (74-150)||(16833769-16833846)
chr8 (59-100)||(28895618-28895659)
chr8 (73-124)||(14419735-14419787)
chr8 (181-217)||(21033870-21033906)
chr8 (166-214)||(23179692-23179740)
[»] chr7 (106 HSPs)
chr7 (36-314)||(38393996-38394274)
chr7 (36-308)||(20299475-20299748)
chr7 (38-314)||(20297372-20297648)
chr7 (36-314)||(44724589-44724867)
chr7 (36-314)||(48457663-48457941)
chr7 (36-314)||(35639-35917)
chr7 (36-314)||(7471981-7472259)
chr7 (36-314)||(20626048-20626326)
chr7 (36-314)||(20629939-20630217)
chr7 (36-314)||(20642358-20642636)
chr7 (36-314)||(7470023-7470301)
chr7 (43-314)||(4295942-4296214)
chr7 (36-314)||(1849991-1850269)
chr7 (36-314)||(3878587-3878865)
chr7 (36-310)||(40836744-40837017)
chr7 (36-314)||(42330998-42331278)
chr7 (36-314)||(1049297-1049574)
chr7 (36-314)||(21990160-21990438)
chr7 (36-314)||(27306231-27306508)
chr7 (36-315)||(443604-443884)
chr7 (36-314)||(20137110-20137388)
chr7 (38-314)||(37412128-37412407)
chr7 (36-314)||(44574-44852)
chr7 (36-314)||(1046926-1047203)
chr7 (36-314)||(11355268-11355546)
chr7 (36-314)||(18345551-18345829)
chr7 (36-314)||(40946338-40946616)
chr7 (89-308)||(11757245-11757465)
chr7 (36-314)||(13099475-13099755)
chr7 (36-314)||(3035731-3036012)
chr7 (44-314)||(24748604-24748875)
chr7 (36-314)||(28487563-28487841)
chr7 (38-314)||(43253520-43253795)
chr7 (36-314)||(28485576-28485853)
chr7 (36-314)||(7351653-7351931)
chr7 (36-314)||(31155912-31156190)
chr7 (36-314)||(31435047-31435326)
chr7 (44-314)||(21680037-21680307)
chr7 (36-314)||(25542540-25542816)
chr7 (36-314)||(9679069-9679347)
chr7 (43-314)||(21678076-21678347)
chr7 (36-314)||(39145987-39146266)
chr7 (45-314)||(9680829-9681099)
chr7 (47-314)||(7349285-7349552)
chr7 (36-314)||(42223167-42223446)
chr7 (36-314)||(21592144-21592422)
chr7 (36-254)||(7092214-7092431)
chr7 (47-314)||(24258473-24258744)
chr7 (54-314)||(27832651-27832912)
chr7 (92-305)||(25276160-25276374)
chr7 (38-254)||(7094463-7094678)
chr7 (75-314)||(22828672-22828912)
chr7 (43-295)||(24813505-24813755)
chr7 (36-218)||(2935374-2935556)
chr7 (36-230)||(38396729-38396922)
chr7 (45-314)||(24817362-24817628)
chr7 (74-290)||(20091586-20091797)
chr7 (131-314)||(26804579-26804765)
chr7 (36-218)||(1606486-1606667)
chr7 (36-218)||(22137184-22137365)
chr7 (36-218)||(40552211-40552392)
chr7 (36-218)||(9027195-9027376)
chr7 (36-218)||(22108173-22108354)
chr7 (36-218)||(40549933-40550114)
chr7 (75-314)||(7188553-7188789)
chr7 (92-314)||(22251602-22251821)
chr7 (44-287)||(24465578-24465817)
chr7 (36-191)||(26295580-26295736)
chr7 (43-315)||(11081521-11081792)
chr7 (43-170)||(22393876-22394004)
chr7 (43-222)||(6332321-6332503)
chr7 (206-314)||(18567623-18567731)
chr7 (44-230)||(16297030-16297220)
chr7 (100-194)||(6348912-6349006)
chr7 (177-287)||(22392502-22392608)
chr7 (124-229)||(40281466-40281572)
chr7 (100-315)||(6048884-6049094)
chr7 (155-263)||(11084438-11084544)
chr7 (155-217)||(21369642-21369703)
chr7 (155-230)||(26210633-26210710)
chr7 (155-217)||(2120899-2120960)
chr7 (155-217)||(3320171-3320232)
chr7 (155-217)||(3324919-3324980)
chr7 (155-217)||(7069780-7069841)
chr7 (155-217)||(7074787-7074848)
chr7 (155-217)||(25351353-25351414)
chr7 (155-217)||(25357047-25357108)
chr7 (155-217)||(25405393-25405454)
chr7 (155-217)||(25410130-25410191)
chr7 (155-217)||(42006663-42006724)
chr7 (155-214)||(30246973-30247031)
chr7 (155-214)||(44512646-44512704)
chr7 (41-176)||(6046641-6046778)
chr7 (155-217)||(8378625-8378686)
chr7 (155-217)||(15541116-15541177)
chr7 (176-217)||(12310157-12310198)
chr7 (100-230)||(13290540-13290671)
chr7 (166-214)||(44143997-44144045)
chr7 (155-214)||(34546984-34547042)
chr7 (263-314)||(38396326-38396377)
chr7 (239-315)||(6348829-6348903)
chr7 (36-99)||(46516339-46516402)
chr7 (36-82)||(11759369-11759415)
chr7 (167-208)||(6067332-6067373)
chr7 (176-217)||(8260584-8260625)
chr7 (286-314)||(7092426-7092454)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (36-314)||(69293-69570)
scaffold0025 (219-314)||(73207-73302)
scaffold0025 (208-256)||(73160-73208)
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (36-314)||(1230250-1230528)
chr6 (36-314)||(11983030-11983308)
chr6 (36-310)||(14458768-14459040)
chr6 (36-314)||(4816232-4816510)
chr6 (36-314)||(28241322-28241600)
chr6 (36-314)||(30967236-30967514)
chr6 (36-314)||(19704568-19704848)
chr6 (36-315)||(14507177-14507455)
chr6 (36-315)||(9019960-9020239)
chr6 (36-314)||(13057229-13057508)
chr6 (36-314)||(20915357-20915635)
chr6 (36-315)||(30034604-30034883)
chr6 (36-314)||(2628887-2629164)
chr6 (36-314)||(26065021-26065294)
chr6 (36-314)||(26084990-26085263)
chr6 (36-314)||(13039789-13040068)
chr6 (36-314)||(3631940-3632217)
chr6 (78-311)||(15530166-15530398)
chr6 (36-314)||(3390414-3390693)
chr6 (45-314)||(32280031-32280301)
chr6 (44-314)||(3233739-3234010)
chr6 (36-307)||(3629866-3630136)
chr6 (36-314)||(12195516-12195794)
chr6 (36-314)||(15541141-15541419)
chr6 (36-314)||(25477309-25477595)
chr6 (36-314)||(15532683-15532960)
chr6 (36-314)||(26932563-26932841)
chr6 (36-314)||(30728825-30729107)
chr6 (36-250)||(5273217-5273431)
chr6 (36-314)||(12161559-12161834)
chr6 (36-218)||(26066125-26066307)
chr6 (36-218)||(26068396-26068578)
chr6 (36-229)||(1069719-1069913)
chr6 (36-218)||(33308988-33309169)
chr6 (77-315)||(3027895-3028129)
chr6 (45-314)||(24338458-24338727)
chr6 (100-295)||(22490694-22490889)
chr6 (36-218)||(29754710-29754892)
chr6 (36-218)||(33311257-33311438)
chr6 (44-315)||(16455433-16455702)
chr6 (141-314)||(19227514-19227687)
chr6 (100-287)||(15719708-15719891)
chr6 (43-272)||(14466399-14466630)
chr6 (43-262)||(15367121-15367338)
chr6 (43-230)||(12186079-12186268)
chr6 (102-287)||(17012105-17012287)
chr6 (43-315)||(19696478-19696748)
chr6 (100-227)||(26945265-26945393)
chr6 (44-315)||(22857961-22858229)
chr6 (43-174)||(15346522-15346653)
chr6 (99-230)||(28037794-28037926)
chr6 (74-230)||(20526924-20527081)
chr6 (237-314)||(1072079-1072156)
chr6 (241-314)||(17852577-17852650)
chr6 (222-314)||(32447502-32447595)
chr6 (100-262)||(25078623-25078783)
chr6 (157-230)||(11138425-11138499)
chr6 (250-315)||(8995513-8995578)
chr6 (221-310)||(13870608-13870697)
chr6 (104-218)||(7542452-7542567)
chr6 (41-173)||(30445699-30445834)
chr6 (155-209)||(5165936-5165989)
chr6 (44-117)||(10584227-10584301)
chr6 (155-217)||(13878727-13878788)
chr6 (155-217)||(13883475-13883536)
chr6 (155-217)||(16785919-16785980)
chr6 (155-217)||(26887345-26887406)
chr6 (155-217)||(31248835-31248896)
chr6 (155-217)||(35201447-35201508)
chr6 (74-217)||(12937232-12937376)
chr6 (43-154)||(25465598-25465710)
chr6 (155-217)||(3577636-3577696)
chr6 (60-217)||(12911471-12911629)
chr6 (155-214)||(17036058-17036116)
chr6 (155-214)||(17694972-17695030)
chr6 (155-210)||(12166267-12166321)
chr6 (155-214)||(22351973-22352031)
chr6 (157-214)||(19701985-19702041)
chr6 (155-211)||(25941650-25941704)
chr6 (134-214)||(26643179-26643259)
chr6 (134-214)||(26749145-26749225)
chr6 (155-214)||(13467585-13467642)
chr6 (91-150)||(28078251-28078310)
chr6 (155-214)||(22342922-22342980)
chr6 (155-214)||(33215830-33215888)
chr6 (257-295)||(10584175-10584213)
chr6 (155-209)||(11262596-11262649)
chr6 (204-287)||(15346445-15346524)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (36-314)||(14383-14661)
scaffold0131 (44-314)||(15028-15298)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (36-315)||(79193-79472)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (36-314)||(11474-11752)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (36-314)||(41484-41762)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (36-314)||(19504347-19504624)
chr2 (36-314)||(45279985-45280264)
chr2 (36-314)||(19502012-19502290)
chr2 (36-314)||(23452238-23452516)
chr2 (36-314)||(42923510-42923788)
chr2 (36-314)||(13910046-13910323)
chr2 (36-314)||(27104775-27105051)
chr2 (45-314)||(21520703-21520972)
chr2 (36-314)||(42064491-42064769)
chr2 (36-314)||(42452759-42453034)
chr2 (36-314)||(19007616-19007894)
chr2 (36-314)||(22287337-22287615)
chr2 (36-314)||(28196613-28196889)
chr2 (36-313)||(11739560-11739838)
chr2 (36-314)||(35215587-35215865)
chr2 (36-314)||(35217964-35218242)
chr2 (36-314)||(40032054-40032337)
chr2 (36-314)||(17848419-17848694)
chr2 (113-314)||(15539553-15539754)
chr2 (36-314)||(6258818-6259094)
chr2 (36-314)||(24162224-24162491)
chr2 (36-314)||(43623581-43623847)
chr2 (36-314)||(6264149-6264424)
chr2 (58-314)||(45239000-45239255)
chr2 (44-314)||(14837249-14837514)
chr2 (36-315)||(44289068-44289348)
chr2 (36-240)||(5375347-5375550)
chr2 (51-314)||(17849093-17849356)
chr2 (36-314)||(34979578-34979858)
chr2 (77-314)||(11578150-11578383)
chr2 (36-218)||(36558865-36559047)
chr2 (36-218)||(36561142-36561324)
chr2 (36-314)||(3022139-3022426)
chr2 (43-314)||(31732784-31733044)
chr2 (36-281)||(28459191-28459436)
chr2 (74-315)||(20146647-20146885)
chr2 (36-218)||(45332182-45332364)
chr2 (74-313)||(17897284-17897519)
chr2 (74-280)||(18800352-18800555)
chr2 (47-287)||(22874137-22874374)
chr2 (36-177)||(22407455-22407596)
chr2 (133-314)||(38020178-38020349)
chr2 (38-164)||(7462950-7463077)
chr2 (59-235)||(40699428-40699606)
chr2 (47-295)||(35107294-35107539)
chr2 (105-282)||(27136195-27136370)
chr2 (100-217)||(20589763-20589881)
chr2 (193-314)||(22163106-22163226)
chr2 (217-314)||(22407591-22407688)
chr2 (36-154)||(22707752-22707872)
chr2 (148-245)||(38414194-38414289)
chr2 (100-315)||(43139355-43139564)
chr2 (236-314)||(5377630-5377708)
chr2 (43-230)||(37962949-37963134)
chr2 (100-230)||(15693961-15694094)
chr2 (155-230)||(17921756-17921833)
chr2 (36-124)||(22163023-22163111)
chr2 (52-155)||(23870951-23871054)
chr2 (155-217)||(28458949-28459011)
chr2 (36-194)||(13828342-13828503)
chr2 (175-230)||(27583479-27583534)
chr2 (155-217)||(2740941-2741002)
chr2 (157-230)||(26345664-26345738)
chr2 (155-217)||(2736205-2736266)
chr2 (157-218)||(10942634-10942696)
chr2 (157-218)||(10948503-10948565)
chr2 (155-217)||(17462436-17462497)
chr2 (155-217)||(20054886-20054947)
chr2 (155-217)||(22712637-22712698)
chr2 (155-217)||(22717346-22717407)
chr2 (155-217)||(39686983-39687044)
chr2 (155-217)||(45567409-45567470)
chr2 (155-230)||(34575230-34575306)
chr2 (157-226)||(7502981-7503052)
chr2 (155-214)||(12781342-12781400)
chr2 (155-214)||(17932637-17932695)
chr2 (155-214)||(17943540-17943598)
chr2 (155-214)||(27517760-27517818)
chr2 (155-214)||(30478997-30479055)
chr2 (157-272)||(35028595-35028707)
chr2 (127-230)||(30720703-30720809)
chr2 (74-217)||(33603994-33604138)
chr2 (155-214)||(37170873-37170931)
chr2 (157-211)||(41303155-41303210)
chr2 (155-208)||(27248021-27248075)
chr2 (155-217)||(39680045-39680106)
chr2 (169-217)||(38190997-38191045)
chr2 (179-217)||(20050166-20050204)
chr2 (239-315)||(41304596-41304668)
chr2 (181-214)||(33674551-33674584)
chr2 (157-217)||(45158308-45158369)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (36-314)||(183642-183919)
scaffold0005 (36-314)||(52020-52300)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (44-314)||(6208-6478)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (36-314)||(4006-4282)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (44-314)||(2889-3158)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (36-314)||(50-328)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (36-314)||(29180-29457)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (36-314)||(79868-80146)
scaffold0004 (155-217)||(188363-188424)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (36-256)||(1454-1673)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (74-314)||(2051-2290)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (54-314)||(85239-85500)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (43-310)||(15828-16093)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (143-314)||(35648-35819)
scaffold0011 (36-100)||(35817-35881)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (100-315)||(16716-16926)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (36-218)||(22221-22402)
scaffold0140 (36-218)||(24496-24677)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (74-314)||(1681-1910)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (92-222)||(4911-5043)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (59-217)||(57452-57613)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (258-314)||(1054-1110)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (155-217)||(224819-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (155-214)||(16328-16386)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (36-85)||(4680-4729)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (36-71)||(1452-1487)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (155-214)||(17107-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 109)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10399831 - 10400109
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399831 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 10399930  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10399931 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacct 10400030  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400031 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 10400109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51750317 - 51750039
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750317 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 51750218  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51750217 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 51750118  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51750117 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 51750039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47906548 - 47906270
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906548 tgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 47906449  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  47906448 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccc 47906349  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47906348 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 47906270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 17324639 - 17324918
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17324639 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagt 17324738  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17324739 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 17324838  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324839 tcaaaccctagtgtttgttccatagagacaaactctatacaaaccccagttttgttgttgccattctaaacccttgtttt 17324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2617786 - 2617516
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617786 cagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 2617687  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  2617686 taagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacc 2617587  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2617586 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 2617516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 15294837 - 15295115
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294837 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 15294936  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15294937 tacaagaataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 15295036  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15295037 tcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15295115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28840957 - 28840680
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28840957 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 28840859  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28840858 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 28840759  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28840758 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttcctttctaaacccttgttt 28840680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 31735524 - 31735803
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31735524 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggat 31735623  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||     
T  31735624 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaaccttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31735723  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31735724 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 31735803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6823292 - 6823015
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6823292 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgagt 6823193  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  6823192 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccc 6823093  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6823092 acaaaccctagt-tttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6823015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12302508 - 12302786
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  12302508 tgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 12302607  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12302608 tataagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 12302707  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12302708 tcaaaccctagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgttt 12302786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 46431709 - 46431988
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--agaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46431709 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgg 46431807  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46431808 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccatcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 46431907  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  46431908 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctacttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 46431988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 50076675 - 50076953
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  50076675 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctggg-gagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgga 50076773  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50076774 ttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 50076873  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  50076874 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaatccttgttt 50076953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 50307549 - 50307824
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  50307549 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 50307648  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  50307649 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 50307748  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  50307749 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaaccctt 50307824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13215356 - 13215081
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    ||||||||||||    
T  13215356 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaaatttacaaaagagaaaaatatcaatgggttac 13215257  T
Q  139 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13215256 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctca 13215157  T
Q  239 aaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13215156 aaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 13215081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16226445 - 16226166
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16226445 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 16226347  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16226346 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 16226247  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  16226246 cacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgtttt 16226166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 2949235 - 2949512
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  2949235 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggg-gagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 2949333  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2949334 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctattctcgtaaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacca 2949433  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949434 tcaacccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 2949512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15823824 - 15823546
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15823824 tgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggt 15823725  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||     
T  15823724 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatattaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 15823625  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15823624 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15823546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20302736 - 20302459
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20302736 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactatctgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 20302638  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20302637 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20302538  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20302537 tcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20302459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24325941 - 24325664
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24325941 tgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggt 24325842  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  24325841 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccc 24325742  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  24325741 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttct-aacccttgttt 24325664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27336943 - 27337219
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27336943 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 27337041  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27337042 tacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagacccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27337141  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27337142 acaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaa-tctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27337219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Original strand, 50078834 - 50079102
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50078834 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 50078933  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  50078934 agtctccctcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 50079033  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  50079034 gtgtttgttcccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgttt 50079102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39932352 - 39932073
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39932352 tgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatggg 39932253  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  39932252 ttacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagtctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggttaatcaacc 39932153  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39932152 ctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 39932073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 2510328 - 2510605
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2510328 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggt 2510427  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  2510428 tacaagaataagtctct-gcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccc 2510526  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  2510527 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtggttgcctttataaacccttgttt 2510605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 6995703 - 6995981
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||    
T  6995703 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatgtcaatgagt 6995802  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  6995803 tacaagaaaaagtatcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 6995902  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6995903 ttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccgttgttt 6995981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13762114 - 13761837
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13762114 tgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccggtccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 13762016  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||     
T  13762015 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagttgaatcaaccc 13761916  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13761915 ccaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttatgttgttgcctttctaaacccttgttt 13761837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41647198 - 41646924
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41647198 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagt 41647099  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41647098 tacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacca 41646999  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    | ||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  41646998 taaaaaccaagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 41646924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Original strand, 21948229 - 21948468
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948229 gagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 21948328  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948329 ccagcgtcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctat 21948427  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21948428 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 21948468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 9459420 - 9459698
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9459420 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 9459518  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9459519 tacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 9459618  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9459619 cacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgactttctaaacccttgttt 9459698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 9463247 - 9463525
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9463247 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 9463345  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9463346 tacaaggataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 9463445  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9463446 cacaaaccctagtgttttctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 9463525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16428924 - 16428653
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16428924 cagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 16428825  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16428824 ataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 16428725  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     || ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16428724 ttagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 16428653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 11457478 - 11457756
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11457478 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 11457577  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  11457578 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaacccccaatctcttcgcgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 11457677  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11457678 tcaaaccctagtaattgttgccaagaatcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgttt 11457756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20291734 - 20291457
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  20291734 tgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctccgatccactatatgatgagaatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 20291636  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20291635 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20291536  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20291535 tcaaaacttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28842772 - 28842495
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28842772 tgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 28842674  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  28842673 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccc 28842574  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28842573 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28842495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28998256 - 28998534
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || || | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  28998256 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagt 28998355  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28998356 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 28998455  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998456 tcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 28998534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 29003972 - 29004250
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || || || | | ||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  29003972 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccatatgatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagt 29004071  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29004072 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 29004171  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004172 tcaaaccctagtgtttattcgcaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 29004250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18307377 - 18307109
Alignment:
Q  46 gttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  18307377 gttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgcgtcacaagaat 18307279  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  18307278 aagtctctcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccct 18307179  T
Q  245 aatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18307178 agtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18307109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Original strand, 38925492 - 38925759
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38925492 cagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttttactat--gatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 38925588  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  38925589 taagtctccagcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 38925688  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||||||    
T  38925689 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaactcttgttt 38925759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47179990 - 47179713
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47179990 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 47179893  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47179892 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 47179793  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47179792 cacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 47179713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 3579620 - 3579897
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3579620 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcacta-atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 3579718  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||     
T  3579719 tacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctctttccgtaatcaagagactcaatcctaattgtgtttcctaaggtgaatcaaccc 3579818  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||| |||||||||||    
T  3579819 tcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgctgcctttctgaacccttgttt 3579897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27339134 - 27339411
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339134 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 27339232  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  27339233 tacaagaataagtcgcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaactaagagactcaatcgtaatagtatttcccaaggtgaatcaaccc 27339332  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  27339333 acaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaagcccttgttt 27339411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39462797 - 39462519
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  39462797 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgaataacttttcaaaagagatatcaaagggt 39462698  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39462697 tacaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 39462598  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| ||||||    
T  39462597 taaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcatttctaaacctttgttt 39462519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 43 - 307
Target Start/End: Original strand, 9241095 - 9241360
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9241095 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaag 9241194  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  9241195 aataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaataatgttttccaaggtgaatcaaccctcaaac 9241294  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  9241295 cctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 9241360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18839866 - 18839587
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18839866 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 18839767  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18839766 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcattctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 18839667  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     | |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18839666 ctaaaaccctactgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctatctaaacccttgttt 18839587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25128151 - 25127872
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  25128151 tgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgaa 25128052  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  25128051 ttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccaaatagtgtttcacaaggtgaatcaacc 25127952  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25127951 ctcaaaccctagtgtttgtttccaagacacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 25127872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40134210 - 40133944
Alignment:
Q  49 cggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataag 147  Q
    ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40134210 cggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgtgttacaagaataag 40134111  T
Q  148 tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  40134110 tctcccgcctaattttacccaaaacctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctagtagtatttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagt 40134011  T
Q  248 gtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134010 gtttgttgccaagagacaaattctatacaaaccttcgttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 40133944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48665400 - 48665177
Alignment:
Q  92 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccg-taa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  48665400 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccggtaa 48665301  T
Q  191 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48665300 ccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgt 48665201  T
Q  291 tgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  48665200 tgttgcctttctaaacccttgttt 48665177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51752641 - 51752365
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51752641 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 51752543  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  51752542 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaat-ctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccc 51752444  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||  | |||||||| |||||||    
T  51752443 tcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaagccctaattttgttgttacctttctaaactcttgttt 51752365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 47 - 310
Target Start/End: Original strand, 17186141 - 17186405
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17186141 ttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaagaata 17186240  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17186241 agtctcccttctaattctacccaaagttcaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacccta 17186340  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17186341 gtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 17186405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 14097972 - 14098251
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14097972 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatggg 14098071  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14098072 ttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 14098171  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||    
T  14098172 ctcaaactctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtagttgcctttttaaaccattgttt 14098251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47177639 - 47177362
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  47177639 tgttgacccagttcgatccaatctgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 47177542  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  47177541 tacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcccatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 47177442  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  47177441 cacaaaccctagtgcttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 47177362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6756806 - 6756527
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | ||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6756806 tgttgatccagttcggtccaaactgacctagtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatag 6756707  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6756706 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatca--agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 6756609  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  6756608 cctcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgttt 6756527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 4131387 - 4131660
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttaca 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4131387 agttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttaca 4131486  T
Q  140 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaa 239  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4131487 agaataagtttctcgcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccctcaa 4131585  T
Q  240 accctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4131586 accctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaatccttgttt 4131660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 31425018 - 31425300
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  31425018 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccttccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgag 31425116  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag---actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatct 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31425117 ttacaagaataagcctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagatcactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatca 31425216  T
Q  232 accatcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31425217 accctcaaaccctagtgtttgttgccaaagatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31425300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 50248573 - 50248853
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagag--cagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  || ||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  50248573 tgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgg 50248672  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50248673 gttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcgatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaac 50248772  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  50248773 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatataaatcatagttttgttgttgtctttttaaacctttgttt 50248853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 25251277 - 25251556
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| || || | | ||||||| |||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  25251277 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcactataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatggg 25251376  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25251377 ttacaagaataagttttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc 25251476  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25251477 ctcaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaacgttatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacctttgttt 25251556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31490190 - 31489915
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  31490190 tgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctggggg-gagagcagccctccgtttcaccatatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagt 31490092  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31490091 tacaagaataagtcttccgcctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacca 31489992  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  31489991 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaa--ctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 31489915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28207071 - 28207347
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  28207071 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat--gatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 28207168  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||      
T  28207169 tacaagaaaaagtctcccgcgtaattatattcaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaactc 28207268  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28207269 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttacacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 28207347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17319165 - 17318893
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  |    
T  17319165 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagg-gagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaacttaacaaaagagatatcaataag 17319067  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||    
T  17319066 ttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctgttcccgtaaccaagagactcaatcc------tgtttcccaaggtgaatcaacc 17318973  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17318972 ttccaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctaaacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 17318893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 17324342 - 17324064
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  17324342 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgtttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatggg 17324243  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17324242 ttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagttccaatctcttcccatattcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 17324143  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  17324142 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctataaaaa--tcagttttgttgtggcctttctgaacccttgtttt 17324064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47451919 - 47451648
Alignment:
Q  37 gttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  47451919 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagtt 47451820  T
Q  137 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccat 236  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | || ||||||| ||| |    
T  47451819 acaagaaaaagtttcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa------acactaatgtgaatcaaccct 47451726  T
Q  237 caaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47451725 caaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattccaaacccttgttt 47451648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 314
Target Start/End: Original strand, 31422940 - 31423155
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31422940 atgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagac 31423039  T
Q  200 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgttt-gttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtca 298  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |     
T  31423040 tcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactttcaaaccctagtgtttaatgccaaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcct 31423139  T
Q  299 ttctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||||||||    
T  31423140 ttctaaacccttgttt 31423155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23786117 - 23785935
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23786117 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 23786019  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23786018 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23785935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 59 - 290
Target Start/End: Original strand, 15669419 - 15669648
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 157  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669419 tgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 15669518  T
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||    
T  15669519 aattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 15669616  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||||    
T  15669617 aagag-caaactttatacaaaccctacttttgt 15669648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 115 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6824091 - 6823885
Alignment:
Q  115 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacc-------aagagactcaatcct 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||||| |||||| |    
T  6824091 acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctgccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaacccgtaaccaagagattcaatcgt 6823992  T
Q  208 aatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  6823991 aatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 6823892  T
Q  308 cttgttt 314  Q
    |||||||    
T  6823891 cttgttt 6823885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 14183600 - 14183867
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14183600 ccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaa 14183699  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||  | ||    
T  14183700 gaataagtcttccgcctaattctacccaaaattctaatctcttcccgtaaccaagagactcaattataatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaa 14183797  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  14183798 ccctagtgtttgttgccaagag-caacctctatacaaaccctagttt--gtgttg-cattctaaacccttgttt 14183867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16231834 - 16231632
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16231834 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaga 16231736  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  16231735 ataagtctcccgcctaattctacccaaaggctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 16231636  T
Q  242 ccta 245  Q
    ||||    
T  16231635 ccta 16231632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16429236 - 16429042
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16429236 tgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 16429137  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16429136 ttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaattcccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaagttgaat 16429042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 25248554 - 25248764
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25248554 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 25248653  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25248654 ttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctgtaaccgagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 25248753  T
Q  235 atcaaacccta 245  Q
     ||||||||||    
T  25248754 ctcaaacccta 25248764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42922503 - 42922238
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |   ||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42922503 ccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 42922404  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||    
T  42922403 gaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc-tc-aa 42922306  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    ||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  42922305 ccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccctt 42922238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 8347284 - 8347550
Alignment:
Q  46 gttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  || |||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8347284 gttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 8347383  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||     
T  8347384 taagtctcccgcctaattctactcaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ctaacct 8347481  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  8347482 tggtgtttgttgccaagag-caatctctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 8347550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51757808 - 51757623
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||    
T  51757808 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatggtgagtatcgttacaaa-gagaaatcgataggt 51757710  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51757709 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 51757623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16432674 - 16432440
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16432674 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactataatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgg 16432575  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16432574 gttacaagaataattgtcccgcataattctacccaaagtttcaatctcttcccataaccaagagattcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaac 16432475  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  16432474 cctcaaaccctagtgtttgtcgccaagagacaaac 16432440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 6115112 - 6115300
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6115112 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaattggttacaag 6115211  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6115212 aataagtcccccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttttcaaggtgaatc 6115300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 314
Target Start/End: Original strand, 8349110 - 8349329
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  8349110 tccactataatgatgagtaacttaacaaaagagataccaatgagttacaagaataagtcacccgcctaattctacctaaagtcctaatctcttcccgtga 8349209  T
Q  191 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  8349210 ccatcaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaataaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccttaattttct 8349306  T
Q  291 tgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| | ||||||||||||||||    
T  8349307 tgttgac-ttctaaacccttgttt 8349329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23816164 - 23816027
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816164 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatccattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 23816065  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23816064 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 23816027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 314
Target Start/End: Original strand, 18800640 - 18800850
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  18800640 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggatacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttcaaatctctacccgtgacctagagac 18800739  T
Q  200 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcat 299  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||  | ||||||| | |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  18800740 tcaatcctaatagtgtttctcagggtgaatcaacc--ccaaccctagtatttgtggccaagag-caaactctatacaaaccgtagttttcttgttgac-t 18800835  T
Q  300 tctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| ||||||    
T  18800836 tctaaacctttgttt 18800850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 287
Target Start/End: Original strand, 49495222 - 49495461
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |  ||||||  |||| | || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49495222 agttcggtctaaattgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 49495321  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||  || ||||     
T  49495322 tgagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttaccgtgaccaaaagactcaattttattagtgtttcccaaggtgaatcaac--tc-aacca 49495418  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    || |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| ||||||    
T  49495419 tagtgtttgttgccaagag-caaactatatgcaaaccctagttt 49495461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 87 - 314
Target Start/End: Original strand, 13125511 - 13125737
Alignment:
Q  87 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttc 184  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13125511 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttc 13125610  T
Q  185 ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctata-caaacctta 283  Q
    || | |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13125611 ccttgaccaagagcctcaatcctaacagcgtttcccaatgtgaatcaacc-tc-aaccctagtgtttgtcgccaagag-caaactctataccaaacccta 13125707  T
Q  284 gttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||  |||||| | |||| |||||||||||    
T  13125708 gtttccttgttggc-ttcttaacccttgttt 13125737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 235
Target Start/End: Original strand, 30790403 - 30790603
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  30790403 tgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctggga-agagagcagtcatccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 30790501  T
Q  134 gttacaagaataagtctcc-cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  30790502 gttacaagaataagtctccaaacctaattctacacaaagtctccatctcttcgcgtaaccaaaagactc-atcctaacagtgtttcccaaggtaaatcaa 30790600  T
Q  233 cca 235  Q
    |||    
T  30790601 cca 30790603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 230
Target Start/End: Original strand, 30738695 - 30738828
Alignment:
Q  98 atatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaaga 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||    
T  30738695 atatgatgagtaactttacaaaagagacatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaaatcccaatctcttcctatgaccaaga 30738794  T
Q  197 gactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30738795 gactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 30738828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 155947 - 155790
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||  |||||||||||| | ||| |   |||||||||| ||||||    
T  155947 gagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagataacaaaaggttacaagaattactcttcaaacctaattctatccaaag 155849  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155848 tcccaatctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 155790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16561739 - 16561550
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||||| || |  | |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16561739 cagttcggtccaatactgacctagtctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaag 16561640  T
Q  142 aataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||| |   |||| |||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561639 aataagtcttcaaacctatttctacccaaagtctcaatctatttccgtggccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 16561550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 315
Target Start/End: Original strand, 26520206 - 26520398
Alignment:
Q  126 atcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttccc------gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26520206 atcaatgggttacaagaataagtttccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgactgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttc 26520305  T
Q  219 ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||||| ||| || || | || |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  26520306 ccaaggtgaatcaacc-tc-aatcttagtgtttgttgccaagag-caaactctatagaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccgttgtttt 26520398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Original strand, 26613298 - 26613438
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 189  Q
    ||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  26613298 tccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtg 26613397  T
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26613398 accaagtgactcaatccgaatagtgtttcccaaggtgaatc 26613438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27916765 - 27916499
Alignment:
Q  47 ttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg--ggttacaaga 142  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||    
T  27916765 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaagaaggttaaaaga 27916667  T
Q  143 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    || ||||| |   |||||||| |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |   || |||    
T  27916666 attagtcttcaaacctaattccacccaaagtcacaatctcttcatgtgaccaagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaatcaa--ttccaac 27916569  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  27916568 cctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgctggc-ttctaaacccttgtttt 27916499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28279489 - 28279348
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 189  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  28279489 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgccaatgagttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtg 28279390  T
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28279389 accaagaagctcaatcctaatagtgtttctccaaggggaatc 28279348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104245
Alignment:
Q  87 tccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataag-tctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctctt 183  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |   ||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaaaaaaatcttcaaacctaattctacccaaagtttcaatgtctt 43104290  T
Q  184 cccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaa 228  Q
    || || ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43104289 cctgtgaccaaaagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaa 43104245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13358851 - 13358778
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagta 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13358851 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgaagagta 13358778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15916663 - 15916562
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaa-ttgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15916663 ccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaactttataaaagagatatcaatgggttacaa 15916564  T
Q  141 ga 142  Q
    ||    
T  15916563 ga 15916562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Original strand, 26332613 - 26332686
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26332613 taattctacacaaagtctcaatctcttctcgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatc 26332686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 4144804 - 4144865
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4144804 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 4144865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14353187 - 14353049
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgta 189  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||     
T  14353187 tccactataatgatgaataactttacaaaagatt--tcaaagggttacaagaata-gtttcaaacctaattctacccaaagtctcgaatctctttccgtg 14353091  T
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14353090 accaagagactaaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 14353049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 214
Target Start/End: Original strand, 21353356 - 21353525
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||| ||   || |||||||    
T  21353356 ccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa-gagatat---tgagttacaa 21353451  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21353452 gaatcagtcttcaaacctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 21353525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2232658 - 2232597
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232658 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2232597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14997101 - 14997040
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14997101 cctaattctacccaa-gtctcaatctcttccagtaaccaagagactcaatcctaacagtgttt 14997040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 2401342 - 2401400
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2401342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2401400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9526527 - 9526469
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9526527 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 9526469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25134132 - 25134074
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25134132 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25134074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9521776 - 9521718
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9521776 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 9521718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 315
Target Start/End: Original strand, 26332719 - 26332837
Alignment:
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttg 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |  | | || |||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| || |||||    
T  26332719 accaagagactaaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaa--acccaaacctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctatttttg 26332813  T
Q  290 ttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||| | |||||||||||||||||    
T  26332814 -tgttggc-ttctaaacccttgtttt 26332837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 214
Target Start/End: Original strand, 2393404 - 2393461
Alignment:
Q  156 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2393404 ctaattctacccaa-gtcccagactattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 2393461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 47102933 - 47102871
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccacta 98  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  47102933 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatccacta 47102871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 49959237 - 49959131
Alignment:
Q  126 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaag 223  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| ||   ||||||| || |||||||| | ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49959237 atcaaagggttaaaagaatcagtttcaaacctaattttatccaaagtctcgaatctcttctcatgaccaagagactcattcctaatagtgtttctccaag 49959138  T
Q  224 gtgaatc 230  Q
    |||||||    
T  49959137 gtgaatc 49959131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 314
Target Start/End: Original strand, 13127790 - 13127910
Alignment:
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttg 289  Q
    ||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||| |  | ||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||| ||||| || ||||     
T  13127790 accaagagacttaattccaacaatgtttcccaaggtgaatctatc--ccaaccctagtgtttgttgccaaaag-gaaactctatataaaccctacttttc 13127886  T
Q  290 ttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  13127887 ttgttggc-ttctaaacccttgttt 13127910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 13785392 - 13785455
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13785392 cctaattctacccaaagtcccgaatctctttttgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgttt 13785455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 85
Target Start/End: Original strand, 31422870 - 31422912
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagcc 85  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  31422870 ccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagcc 31422912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 32261078 - 32261037
Alignment:
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32261078 tacaaaccttagttttgttgttggc-ttctaaacccttgtttt 32261037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 124
Target Start/End: Original strand, 13127715 - 13127779
Alignment:
Q  61 acctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 124  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13127715 acctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagaga 13127779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 37990836 - 37990772
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  37990836 cctaattctacccaaaatttcgaatctcttctcgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 37990772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 142)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 4308280 - 4308558
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308280 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 4308379  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4308380 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 4308479  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4308480 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4308558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38890298 - 38890020
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890298 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 38890199  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38890198 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 38890099  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38890098 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 38890020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 18099169 - 18099447
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18099169 tgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggt 18099268  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18099269 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18099368  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18099369 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 18099447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10956026 - 10956304
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10956026 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 10956125  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  10956126 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcccaaggtgaatcaacct 10956225  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10956226 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 10956304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25533700 - 25533422
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533700 tgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 25533601  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25533600 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 25533501  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25533500 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 25533422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42990562 - 42990284
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990562 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcaccatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 42990463  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42990462 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 42990363  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42990362 tcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 42990284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43226343 - 43226066
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226343 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 43226244  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43226243 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 43226144  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43226143 acaaaccctagtgtttgttccaacgagacaaactctatacaaa-cgtagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 43226066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43228549 - 43228271
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228549 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 43228450  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43228449 tacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 43228350  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  43228349 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacgctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 43228271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 53917663 - 53917941
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53917663 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 53917762  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  53917763 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 53917862  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53917863 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccattgttt 53917941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 18096908 - 18097177
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18096908 agttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaagaat 18097007  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18097008 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 18097107  T
Q  245 aatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18097108 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 18097177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1313667 - 1313396
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1313667 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggat 1313568  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1313567 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1313468  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1313467 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattgtaaacc 1313396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10958322 - 10958600
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10958322 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 10958421  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10958422 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtgtcagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacct 10958521  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10958522 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 10958600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27101180 - 27101458
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27101180 tgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggt 27101279  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27101280 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccattctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27101379  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27101380 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27101458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45883198 - 45882919
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45883198 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgag 45883099  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45883098 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 45882999  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45882998 ctcaaaccttattgtttgttccaaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 45882919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30006099 - 30005821
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30006099 tgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 30006000  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  30005999 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 30005900  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30005899 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 30005821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 10084388 - 10084665
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10084388 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaacgggt 10084487  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10084488 tacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 10084587  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10084588 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgtt 10084665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 1321737 - 1321483
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321737 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 1321638  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1321637 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1321538  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1321537 acaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccgagttttgt 1321483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 4103895 - 4104172
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4103895 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 4103993  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4103994 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 4104093  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4104094 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaagctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4104172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11170662 - 11170384
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170662 tgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 11170563  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  11170562 tacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcc 11170463  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11170462 gcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11170384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28102001 - 28102279
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28102001 tgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactatatgataagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 28102100  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  28102101 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggtgaatcaaccc 28102200  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28102201 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28102279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 43423462 - 43423740
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43423462 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagt 43423561  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43423562 tacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 43423661  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43423662 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 43423740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 51727006 - 51727283
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727006 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 51727105  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51727106 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttaccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 51727205  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51727206 tcaaaccc-agtgtttgttccaaagagacaaactctatacataccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 51727283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 53915495 - 53915773
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53915495 tgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactaaatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggt 53915594  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||    
T  53915595 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaataatgtttcacaaggtaaatcaacca 53915694  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53915695 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgtcatcctaaacccttgttt 53915773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25389163 - 25388886
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25389163 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 25389065  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25389064 tacaagaatatgtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacc 25388966  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  25388965 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 25388886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 43421414 - 43421692
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43421414 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 43421513  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43421514 tacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaatccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 43421613  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  43421614 tcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 43421692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 747015 - 746737
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  747015 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 746917  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  746916 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 746817  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  746816 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 746737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 6065795 - 6066073
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  6065795 tgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 6065893  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6065894 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 6065993  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6065994 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaaatctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6066073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 1626682 - 1626960
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1626682 tgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 1626781  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  1626782 tacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacct 1626881  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1626882 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 1626960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3859785 - 3859508
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  3859785 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgtgt 3859687  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3859686 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 3859587  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3859586 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 3859508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5191909 - 5191633
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5191909 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagaacagccctctgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 5191812  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  5191811 tacaagaatgagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 5191712  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5191711 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5191633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 458542 - 458264
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  458542 tgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 458444  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  458443 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 458344  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  458343 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 458264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 9604606 - 9604877
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604606 tgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 9604705  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9604706 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 9604805  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    ||||| |||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  9604806 tcaaaacctagtgtttctttcaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacc 9604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36012085 - 36011807
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaaga-gagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36012085 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct-gaagaagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggg 36011987  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  36011986 ttacaagaataagtctcccaactaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagatattcaatcctaatagtgtttcccaacgtgaatcaacc 36011887  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  36011886 ctcaaaccatagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccttagtttcgttgttgtctttctaaatccttgttt 36011807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 456165 - 455887
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  456165 tgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 456067  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  456066 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 455967  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  455966 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 455887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10621529 - 10621807
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10621529 tgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 10621627  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621628 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 10621727  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  10621728 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 10621807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51943628 - 51943351
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  51943628 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagacgtcaatgagt 51943529  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51943528 tacaagaa-aagtctcccgcctaattctacctaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 51943430  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  51943429 tcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgttt 51943351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 6063452 - 6063723
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6063452 ccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaaga 6063550  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||    
T  6063551 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaac 6063650  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6063651 cctagtgtttgctcctaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6063723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 51 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18162907 - 18162643
Alignment:
Q  51 gtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 149  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  18162907 gtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaagaataagtc 18162808  T
Q  150 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgt 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||    
T  18162807 tcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgt 18162708  T
Q  250 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18162707 ttgttcaaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18162643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 32264036 - 32264316
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgg 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  32264036 tgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgg 32264135  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32264136 gttacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagttccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 32264235  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32264236 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 32264316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24979966 - 24979687
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||  |    
T  24979966 tgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatttg 24979867  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24979866 ttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaacc 24979767  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24979766 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 24979687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 50494257 - 50493979
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  50494257 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 50494159  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50494158 tacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatcccttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 50494059  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  50494058 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 50493979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 5926763 - 5927041
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  5926763 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcattatatgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggt 5926862  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  5926863 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggcgaatcaaccc 5926962  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5926963 tcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcatttctaaacccttgttt 5927041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 10191309 - 10191585
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10191309 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatgaacgggt 10191408  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10191409 tacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagtcc-agcctcttcctgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 10191507  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  10191508 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttattgcctttctaaacccttgtt 10191585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29956906 - 29956666
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956906 gagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 29956807  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
    |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29956806 ccagcctcttctcgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctaatgtttgttccaaagagacaaactctat 29956707  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  29956706 acaaaccctaattttgttgttgaatttctaaacccttgttt 29956666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 880450 - 880729
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  880450 tgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 880549  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  880550 tacaagaataactctcccgtctaattctacccaaagccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 880649  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  880650 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacgaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaactcttgttt 880729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3314943 - 3314668
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||  |||||||||||| |||||||||    
T  3314943 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataattttacaaaagagatatcaatggg 3314844  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3314843 ttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 3314744  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  3314743 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaaccctt 3314668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26720798 - 26720532
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26720798 ccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaaagggttaaaaga 26720699  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||    
T  26720698 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagt-taacccaaggtgaatcaaccctcaaacc 26720600  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26720599 ctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 26720532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22114304 - 22114582
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || | || | |  |||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114304 tgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 22114403  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22114404 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22114503  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  22114504 acaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgttt 22114582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Original strand, 28413042 - 28413290
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 146  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28413042 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataa 28413140  T
Q  147 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  28413141 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 28413240  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28413241 gtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 28413290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Original strand, 7606587 - 7606822
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  7606587 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaat-agaaatcaatgtgt 7606685  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7606686 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 7606785  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7606786 tcaaaacctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 7606822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38210628 - 38210350
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  38210628 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagt 38210530  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38210529 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 38210430  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  38210429 cacaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 38210350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 47148894 - 47149172
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||| | || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  47148894 tgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactatatgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatgggt 47148993  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47148994 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttt-ccaaggtgaatcaacca 47149092  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttg-ttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| || | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47149093 tcaaatcccagtgtttgtttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47149172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 48361670 - 48361941
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  48361670 tgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactatattatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaatgagt 48361769  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  48361770 tacaagaaaaagtcttccgcctaattctaccaaaagccccaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccc 48361869  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48361870 tcaaaccctagtttttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacc 48361941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 78 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561790
Alignment:
Q  78 gagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 175  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 6561929  T
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatac 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6561928 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatac 6561829  T
Q  276 aaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6561828 aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6561790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 53468452 - 53468732
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagt--ctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  || |  |  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  53468452 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg 53468551  T
Q  133 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53468552 ggttacaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccaatctctccccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 53468651  T
Q  233 ccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
       |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53468652 tgctcaaaccctagtgtttcttccaaagagacaaactctatacaaacc-tggttttgttgttgccattctaaacccttgttt 53468732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Original strand, 5522626 - 5522857
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5522626 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 5522724  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  5522725 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccc 5522824  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
     ||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  5522825 acaaacccgagtgtttgttccgaagagacaaac 5522857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 314
Target Start/End: Original strand, 35917944 - 35918226
Alignment:
Q  37 gttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 136  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35917944 gttgatccagttcggtctaaattgacc-agtctgagggagagagcagctctccgttccactatataatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 35918042  T
Q  137 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccat 236  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  35918043 acaagaataagtctccctcctatttctacccaaattcccagtctcttctcgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcgcaaggtgaatcaaccct 35918142  T
Q  237 caaacccta------atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35918143 caaactctagtgtttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 35918226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 889779 - 890048
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  889779 ccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 889878  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  889879 ataactctcctgcctaattctacccaaagccccaa-ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 889977  T
Q  243 ctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | | |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  889978 ccagtgtttgttgccaaatagacaaactctatacaaaccctaggtt--ttgttgccattctaaacccttgttt 890048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32219343 - 32219106
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  32219343 tgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatggg 32219244  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  32219243 ttacaaaaataagtcttccgcctaattctgcccaaagtcccaatctcttcccgcaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 32219144  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
     |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  32219143 ttcaaaccctagtgtttgttacaaagagacaaactcta 32219106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39715664 - 39715453
Alignment:
Q  99 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715664 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttgcaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 39715565  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtca 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |     
T  39715564 ctcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgtttcaaatagacaaactctatacaaaccctagttttggtgttgcct 39715465  T
Q  299 ttctaaaccctt 310  Q
     |||||||||||    
T  39715464 ctctaaaccctt 39715453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12267974 - 12268243
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  12267974 tgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagag-----------t 12268062  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  12268063 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccgaaggtgaatcaaccc 12268162  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttag-ttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12268163 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttttgttgttgtctttctaaactcttgttt 12268243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 6484618 - 6484373
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  6484618 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggt 6484519  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6484518 tacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaacctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 6484419  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaacc 280  Q
    ||||||||   | |||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  6484418 tcaaaccccggtatttgttgccgaagagacaaactctacacaaacc 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 28761433 - 28761705
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaa-ttgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28761433 ccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 28761532  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  28761533 gaataagtatcccgcctaattctacctaaagtctcaatatcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaactctcaaa 28761632  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28761633 cccttgtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 28761705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 315
Target Start/End: Original strand, 54691582 - 54691852
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||    
T  54691582 agttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactatatgatgggtaacgttacaaaagagatatcaatgaaatacaagaat 54691681  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  54691682 aagtctcccgcctaattcaactcaaagccctaatctcttcccataaccaaaaaattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccct 54691781  T
Q  245 aatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  54691782 agtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtcgcctttctaaaaccttgtttt 54691852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5886456 - 5886264
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  5886456 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgtttcaaa-gacaaatcaatgggt 5886358  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5886357 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatc 5886264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5899929 - 5899737
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  5899929 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttgcaaa-gagaaatcaatgggt 5899831  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5899830 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcacttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgttt-ccaaggtgaatc 5899737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 243
Target Start/End: Original strand, 25688161 - 25688367
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatgggtt 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25688161 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggtt 25688260  T
Q  137 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25688261 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 25688360  T
Q  237 caaaccc 243  Q
    |||||||    
T  25688361 caaaccc 25688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 51674765 - 51675032
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| || | |  |||||||||||| |||  | || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  51674765 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagtatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggat 51674864  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  51674865 tacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaaatcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 51674964  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |           |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51674965 tcaaaccctagtgtttgttccaaaggg-----------acaaaccttagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 51675032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 129 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35777587 - 35777401
Alignment:
Q  129 aatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtga 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35777587 aatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtga 35777488  T
Q  228 atctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35777487 atcaacccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 35777401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11168359 - 11168164
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168359 tgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccaatatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 11168260  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatct 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11168259 tacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaattcccagcctcttcccgtaaccaagacactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatct 11168164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42992528 - 42992266
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42992528 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactatatgatgactaacgttacaaaagagaaatcaatgagt 42992429  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||               ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  42992428 tacaagaataa---------------ctacccaaagtcc-actctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccc 42992345  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  42992344 tcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 42992266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4666772 - 4666535
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  4666772 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgga 4666676  T
Q  135 ttacaagaataag--tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  4666675 ttacaagaataaggatctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaacctagagactcaatcataatagtgtttcccaagatgaatcaa 4666576  T
Q  233 ccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
    || |||||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||||    
T  4666575 ccctcaaaccctagtgtctgttgtcaagagacaaaccctat 4666535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 139 - 314
Target Start/End: Original strand, 28100143 - 28100318
Alignment:
Q  139 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatca 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||    
T  28100143 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagcgttttccaaggtgaatcaaccctca 28100242  T
Q  239 aaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  28100243 aaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 28100318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15781137 - 15780840
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcag---ccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaat---- 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||   || | || ||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||        
T  15781137 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccactataatgataaataactttacaaaagagaaatatat 15781038  T
Q  128 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15781037 caatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctaccgaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccaaggtga 15780938  T
Q  228 atctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagaca-----------aactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||           ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15780937 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 15780840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31151579 - 31151328
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 157  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  31151579 tgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaactttacaaaagagatatca--gggttacaagaataagtcacccgcct 31151482  T
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||  |||||||| ||    
T  31151481 aattctacccaaagtcccaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctggtgtttgttgcc 31151384  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||    
T  31151383 aagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg-atttctaaacccttgtttt 31151328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53591441 - 53591210
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||| || | || | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  53591441 tgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctggg-gagagagcatcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaatgagatatcaatggat 53591343  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||     
T  53591342 tagaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatccaaatctattctcgtaaccaagagactcaattcgaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 53591243  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  53591242 tcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaac 53591210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 287
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420432
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 13420321  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  13420322 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac--tc-aaccctagtgtttgttgcctagaga-aaactcta 13420417  T
Q  273 tacaaaccttagttt 287  Q
    |||||||| ||||||    
T  13420418 tacaaaccctagttt 13420432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6232058 - 6231850
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |  |||| ||||||| |||| || ||| || ||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  6232058 tgttgacccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccgttc-actgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatggg 6231960  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6231959 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaacactaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 6231861  T
Q  235 atcaaacccta 245  Q
     ||||||||||    
T  6231860 ctcaaacccta 6231850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 134 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28181182 - 28181009
Alignment:
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28181182 gttataagaatacgtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaatagactcaatcctaatggtgtttcccaaagtgaatcaac 28181083  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    | ||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28181082 cctcaaatcccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacc 28181009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 17795506 - 17795280
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17795506 ttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 17795407  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   | |||||||    
T  17795406 agtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaac---ccaacccta 17795310  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctataca 276  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  17795309 gtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 17795280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 19103946 - 19103720
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19103946 ttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcattataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaata 19103847  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||   | |||||||    
T  19103846 agtcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcccaaagtgaatcaac---ccaacccta 19103750  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctataca 276  Q
     |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  19103749 gtgtttgttgccaaaag-caaactctataca 19103720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 73 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54884376 - 54884138
Alignment:
Q  73 agagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  54884376 agagagaaaagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa-aataagtctccctcctaattctattcaaag 54884278  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactct 271  Q
    |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||     
T  54884277 tttcaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaagatgaatcaaccatcaaaccctagtgtttgttccaaagaaacaaactc- 54884179  T
Q  272 atacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
     ||||||   |||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  54884178 -tacaaattctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtt 54884138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23633700 - 23633439
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||    
T  23633700 ttcggtctaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcatcgggttacaagaata 23633603  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||  | |||||||    
T  23633602 agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc--ggtaaatcaacc--ccaacccta 23633507  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  23633506 gtgtttgttgccaagag-caaacactatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaatccttgtttt 23633439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 117 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 23637200 - 23637006
Alignment:
Q  117 aaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  23637200 aaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatatcttcccatgaacaagagactcaatcctaatagtgtt 23637101  T
Q  217 tcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    || |||||| |||| |||  ||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  23637100 tctcaaggtaaatcaacc--caaaccctagtgtttgttgccaagag-cagactctatacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttt 23637006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 287
Target Start/End: Original strand, 561783 - 562024
Alignment:
Q  46 gttcggtccaaat-tgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| || | ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  561783 gttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgacttacaaga 561882  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||    ||||    
T  561883 ataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaacc--tgaacc 561980  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  561981 ctagtgtttgttgccaagaga-aaactctatacaaaccctagttt 562024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25635632 - 25635391
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||  ||||||||| || || | | ||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25635632 cagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaaga 25635533  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |  | ||||    
T  25635532 ataagtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaatc--ccaacc 25635435  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  25635434 ctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaaccctagttt 25635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27635657 - 27635904
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  27635657 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 27635756  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||            |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||                   
T  27635757 tacaagaaaaagtctcccgcctaattttacccaaag------------cccgtaaccaagagactcaatcttaatattgtttccc--------------- 27635829  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27635830 ----accctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgtttgcattctaaacccttgttt 27635904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3307009 - 3306839
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3307009 agttcggtccaaattgacctagtctag--gagagagcaaccatccttttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 3306912  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 216  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306911 taactctcccgcctaattctacccaaaactccaatatctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtt 3306839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 53597457 - 53597220
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |    
T  53597457 gagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaacgggttacaagaataagtctcttgcctaattctactcaaaat 53597358  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    | |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  53597357 ctcaatctattctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac--ttcaaccctagtgtttgttgccaagaga-aaactcta 53597261  T
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| || ||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  53597260 tacaacccctagttttcttgttgac-ttataaacccttgttt 53597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 106 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1674160 - 1673955
Alignment:
Q  106 agtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 205  Q
    |||||| |||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1674160 agtaactttacaaaagacatatcaaagggttacacgaataagtctcccgtctatttctacccaaagtcccaatctcttcccgtgatcaagagactcaatc 1674061  T
Q  206 ctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaa 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | |  | ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||||||| |||||  | |||||||    
T  1674060 ctaatagtgtttcccatggtgaatcaatc--ctaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactatatacaaacactagttttcttgttaac-ttctaaa 1673965  T
Q  306 cccttgtttt 315  Q
    ||||| ||||    
T  1673964 cccttatttt 1673955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 272
Target Start/End: Original strand, 28137415 - 28137541
Alignment:
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  28137415 agtcttccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttcatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaacccta 28137514  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  28137515 gtgtttgttcccaagagacaaactcta 28137541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 36871306 - 36871575
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| | ||| ||||| |||    
T  36871306 ccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaactttacaaa-gagataacaaagggttgcaa 36871404  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaa 239  Q
    |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| | |  | |    
T  36871405 gaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttttccaaggtgaatcaatc--cta 36871502  T
Q  240 accctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  36871503 accctggtgtttgttgccaagag-caaactctatacaagccctagttttcttgttggc-ttgtaaacccttgttt 36871575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Original strand, 47701670 - 47701801
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47701670 tgttgatccagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 47701769  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47701770 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 47701801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 202 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41849244 - 41849132
Alignment:
Q  202 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattc 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41849244 aatcctaatagagtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgttattc 41849145  T
Q  302 taaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||    
T  41849144 taaacccttgttt 41849132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24181629 - 24181486
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  24181629 ttcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaatgggttacaagaat 24181530  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 188  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24181529 aagtctcccgtctaattctacccaaagtcccaatcttttcccgt 24181486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 230
Target Start/End: Original strand, 14634486 - 14634636
Alignment:
Q  82 agccatccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatc 179  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||| |||||    
T  14634486 agccatccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggtttacaagaatcagtcttcaaacctaatgctacccaaagtctcaatc 14634585  T
Q  180 tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634586 tcttctcgtgactaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 14634636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Original strand, 1620483 - 1620655
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 156  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||  || || |   ||    
T  1620483 tgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaagtttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaactagccttcaaacc 1620581  T
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1620582 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagacctaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 1620655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 154 - 250
Target Start/End: Original strand, 4560401 - 4560497
Alignment:
Q  154 gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  4560401 gcctaattctacccaaagctccaatctcttccggtaaccaacaggctcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtt 4560497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24177380 - 24177259
Alignment:
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | |||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  24177380 accaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccttagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttc 24177284  T
Q  290 ttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||    
T  24177283 ttgttgaca-tctaaactcttgtttt 24177259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 237 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11163207 - 11163130
Alignment:
Q  237 caaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11163207 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11163130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 25634137 - 25634030
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  25634137 agttcggtgcaaattgtcctagtctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaagaa 25634038  T
Q  144 taagtctc 151  Q
    ||||||||    
T  25634037 taagtctc 25634030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6231502 - 6231429
Alignment:
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6231502 ccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgttt 6231429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13420015 - 13419883
Alignment:
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    ||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||| |||||||| ||    
T  13420015 aattctacccaaaatttgaatctctttccgtgaccaagagacttgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgcc 13419918  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  13419917 aagag-caaactc--tacaaaccctagttttcttgttg 13419883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 47701805 - 47701872
Alignment:
Q  247 tgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47701805 tgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47701872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11066731 - 11066654
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11066731 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcccgtgatcaaaagattcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 11066654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007683
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 157  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||  ||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||||| |         |||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaaagagttacaagaaaa---------cct 11007635  T
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatc 205  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11007636 aattctacccaaagtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatc 11007683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 27762107 - 27762165
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27762107 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27762165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 10094195 - 10094256
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10094195 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10094256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 10201075 - 10201136
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10201075 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10201136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16462264 - 16462203
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16462264 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16462203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 22626105 - 22626166
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626105 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22626166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25634024 - 25633930
Alignment:
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |  | | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  25634024 accaagagactcaatcctaataatgtctcccaaggtgaatcaatc--ccagccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 25633930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 41849317 - 41849243
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  41849317 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 47883003 - 47883064
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47883003 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 47883064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 7768709 - 7768553
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta--atgtttg 252  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | || |||| ||   ||||||    
T  7768709 cctaattctactcaaagttccaattttagcccgtgagcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaatc-tc-aaccttagtttgtttg 7768612  T
Q  253 ttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    || |||||||   || ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  7768611 ttgccaagag---aattctctacaaaccttagttttgatgttggc-ttctaaacccttgtttt 7768553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 35919114 - 35919179
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatat 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35919114 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatat 35919179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3306842 - 3306779
Alignment:
Q  251 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3306842 tgttccaaagagacaaactctattcaaatcctagttttgttgttgtatttctaaacccttgttt 3306779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 29914074 - 29914132
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29914074 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29914132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 47878292 - 47878350
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47878292 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47878350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54193287 - 54193229
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54193287 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 54193229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4535675 - 4535622
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 209  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4535675 cctaattctacccaat-tcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 4535622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 10100212 - 10100273
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100212 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 10100273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 10208121 - 10208182
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10208121 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcgtaatagtgttt 10208182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16996936 - 16996875
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16996936 cctaattctacccaaa-tcccaatttctttccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16996875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27544334 - 27544273
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544334 cctaattctacccaa-gttccacgctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 27544273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 101
Target Start/End: Original strand, 53894056 - 53894121
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatat 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  53894056 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatatat 53894121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6303358 - 6303310
Alignment:
Q  169 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303358 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 6303310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10897066 - 10897008
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10897066 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagaatcaatcctaatagtg 10897008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 20031439 - 20031497
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20031439 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 20031497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 54188570 - 54188512
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  54188570 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaattctaatagtg 54188512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7418112 - 7418064
Alignment:
Q  169 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  7418112 aagtcccaatctcttcccgtgaccaatagactcaatcataatggtgttt 7418064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38002928 - 38002869
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38002928 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaaacctaatggtgttt 38002869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5858605 - 5858546
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5858605 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaga--ctcaatcctaatagtgttt 5858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 10595155 - 10595213
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10595155 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacttaatcctaatagtg 10595213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 11073084 - 11073033
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatc 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11073084 cctaattctacctaaagtcccaaatctcttctcgtgaccaagagactcaatc 11073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 31021300 - 31021339
Alignment:
Q  192 caagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31021300 caagagactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 31021339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Original strand, 10949404 - 10949438
Alignment:
Q  179 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagt 213  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10949404 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagt 10949438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11079578 - 11079517
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||| || ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11079578 cctaattctacctaa-gtcccagccttttcccgtgaccaagagactcaatcctgatagtgttt 11079517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13893523 - 13893470
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 209  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13893523 cctaattttacccaa-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaattctaa 13893470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28181241 - 28181192
Alignment:
Q  40 gatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccg 90  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  28181241 gatccagttcagtccaaattgacctagtctag-ggagagagcagccttccg 28181192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Original strand, 7606828 - 7606873
Alignment:
Q  205 cctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||    
T  7606828 cctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctactgtt 7606873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 36 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 3716084 - 3716036
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagc 84  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3716084 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagc 3716036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40637406 - 40637128
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637406 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 40637307  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40637306 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 40637207  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40637206 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 40637128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 8631420 - 8631698
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631420 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 8631519  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  8631520 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 8631619  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8631620 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 8631698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24348550 - 24348272
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348550 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 24348451  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24348450 tacaagaataagtctaccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 24348351  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24348350 acaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24348272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48486651 - 48486373
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  48486651 tgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatttcaatgtgt 48486552  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  48486551 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 48486452  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486451 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 48486373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 37089373 - 37089650
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37089373 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 37089471  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37089472 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 37089571  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37089572 tcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 37089650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 2484874 - 2485152
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2484874 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 2484972  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2484973 tacaagaataagtctcccgcctatctctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 2485072  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2485073 agaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 2485152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11435286 - 11435009
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11435286 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 11435188  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11435187 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagactcttccggtaaccaggagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 11435088  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11435087 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11435009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22046687 - 22046964
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22046687 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22046785  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22046786 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22046885  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22046886 acaaaccctagtgtttgttccgaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22046964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22800863 - 22801141
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22800863 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 22800962  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  22800963 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 22801062  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801063 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 22801141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22802735 - 22803013
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22802735 tgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttccactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggt 22802834  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22802835 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22802934  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22802935 tcaaaccctaatgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 22803013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14633650 - 14633373
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14633650 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggt 14633551  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14633550 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 14633452  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  14633451 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgttt 14633373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22044392 - 22044669
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22044392 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22044490  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  22044491 tacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggggaatcaaccc 22044590  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22044591 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22044669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24889128 - 24888850
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24889128 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 24889029  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24889028 tacatgaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 24888929  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24888928 tcaaagcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24888850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47868733 - 47868459
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47868733 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 47868634  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  47868633 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 47868534  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  47868533 tcaaaacctagtgtttgttccaaggagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 47868459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24879322 - 24879043
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  24879322 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatggg 24879223  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24879222 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 24879123  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24879122 ctcaaaccctggtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctagttt 24879043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24880784 - 24880505
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgtt-acaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24880784 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatggg 24880685  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24880684 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaaccaacc 24880585  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24880584 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctagttt 24880505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5198744 - 5198474
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198744 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 5198645  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||    
T  5198644 taagtctcccgcctaattctacacaaagccccaatctcttcccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccctcaaaacc 5198545  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5198544 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5198474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 44 - 296
Target Start/End: Original strand, 26085986 - 26086237
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26085986 cagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaaacaatgggttacaagaa 26086084  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26086085 taagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 26086184  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgt 296  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26086185 tagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgt 26086237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9148584 - 9148310
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9148584 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 9148486  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9148485 tacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 9148386  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttg 311  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  9148385 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttg 9148310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18847484 - 18847207
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  18847484 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 18847387  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18847386 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatgctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 18847287  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18847286 cacaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18847207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 36921494 - 36921773
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36921494 tgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggat 36921593  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36921594 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 36921693  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  36921694 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactatatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcccttgttt 36921773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 11006247 - 11006516
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11006247 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccattacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaat 11006345  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  11006346 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccc 11006445  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11006446 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11006516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22132393 - 22132669
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22132393 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22132491  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22132492 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22132591  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22132592 acaaaccctagtgtttgtt-cgaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22132669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38409536 - 38409259
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38409536 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 38409438  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38409437 tacaagaataagtctccagcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 38409338  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  38409337 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaaccattgttt 38409259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 51015577 - 51015300
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  51015577 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 51015479  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  51015478 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 51015379  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  51015378 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 51015300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7941655 - 7941375
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7941655 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 7941556  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7941555 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 7941456  T
Q  236 tcaaaccctaatg--tttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7941455 acaaaccctagtgcatttgctcgtaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 7941375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6765176 - 6764893
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765176 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 6765077  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  6765076 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 6764977  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcc-----caagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| ||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  6764976 tcaaaacctagtgtttgttccaaactaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 6764893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 36919585 - 36919864
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36919585 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccactatatgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggat 36919684  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  36919685 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 36919784  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36919785 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactttatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 36919864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 38928178 - 38928457
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  38928178 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 38928277  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38928278 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatcttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 38928377  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  38928378 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 38928457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12395846 - 12396124
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12395846 tgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 12395945  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  12395946 tacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 12396045  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12396046 tcaaaccctagtgtttgttggctagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgttt 12396124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 40091416 - 40091694
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40091416 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggt 40091515  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  40091516 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 40091615  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40091616 tcaaaccatagtgtttgttccaaagagacaaactctaaacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 40091694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19096215 - 19095936
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19096215 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgataagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 19096116  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19096115 tacaagaattagtctcccgcctaattctacccaaagctctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccc 19096016  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19096015 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttt 19095936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22782739 - 22783017
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22782739 tgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22782837  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22782838 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacc 22782937  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22782938 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgttt 22783017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 44599839 - 44600117
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  44599839 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagt 44599937  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44599938 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 44600037  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  44600038 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 44600117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12400808 - 12401086
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12400808 tgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 12400907  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  12400908 tacaacaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 12401007  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  12401008 tcaaaccctagtgtttgttggccagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgttt 12401086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 11008569 - 11008845
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||    
T  11008569 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccattacaaa---gaaatcaatgggt 11008665  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11008666 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 11008765  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11008766 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11008845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 14787430 - 14787710
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaga--agagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  14787430 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 14787529  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  14787530 gttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaat 14787629  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14787630 cctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 14787710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 56030766 - 56030498
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||   |||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  56030766 ccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttca---tatgatgaataacgttacaaaagaaatgtcaatgagttacaaga 56030670  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  56030669 aaaagtctcccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 56030570  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030569 ctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 56030498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Original strand, 17662246 - 17662478
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662246 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 17662345  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  17662346 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 17662445  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||    
T  17662446 tcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaac 17662478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36378618 - 36378346
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  36378618 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttcacaagagagatatcaatgagttacaag 36378519  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  36378518 aataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccttcaaac 36378419  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36378418 cctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 36378346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 31849600 - 31849878
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31849600 tgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 31849698  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta-cc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31849699 tacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaagcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 31849798  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31849799 acaaaaccttagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31849878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 619449 - 619726
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  619449 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 619547  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    || |||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
T  619548 tataagaataattttcccgcctaattctacccaaagacccaatctcttcccttaaccaagacagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaaccc 619647  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  619648 tcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctagttttgttgttgtctttataaacccttgttt 619726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 18709165 - 18709442
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  18709165 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 18709263  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18709264 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcgcaatctcttcccgtaaccaagagactcaaccctaatagtgtttcccaaggtgaatcaactc 18709363  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18709364 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18709442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 47275057 - 47274781
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47275057 tgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 47274959  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  47274958 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccc 47274859  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47274858 tcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47274781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 314
Target Start/End: Original strand, 9176485 - 9176753
Alignment:
Q  46 gttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9176485 gttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaata 9176583  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  9176584 agtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccct 9176683  T
Q  245 aatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9176684 agtgcttgctcctaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 9176753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Original strand, 33415491 - 33415766
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33415491 ttgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggtta 33415590  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  33415591 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcgatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 33415690  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  33415691 aaaccttagtgtttgtt-ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 33415766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16453634 - 16453363
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16453634 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 16453535  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  16453534 ataagtctcccgcctaatactacccaaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 16453435  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  16453434 ctagtgtttgttccaaagagacaaactttgtacaaactctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 16453363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22780374 - 22780652
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22780374 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22780472  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22780473 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacc 22780572  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  22780573 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgttt 22780652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22134619 - 22134894
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22134619 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22134716  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  22134717 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaatgtcccagccttttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 22134816  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22134817 acaaaccctagtgtttgtt-tgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22134894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Original strand, 16934144 - 16934420
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16934144 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 16934242  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16934243 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc 16934342  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgt 312  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16934343 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgt 16934420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 94 - 314
Target Start/End: Original strand, 5637524 - 5637744
Alignment:
Q  94 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacca 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5637524 cactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaacca 5637623  T
Q  194 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5637624 agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgt 5637723  T
Q  294 tgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || | |||||||| |||||||    
T  5637724 tgcctttctaaactcttgttt 5637744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 37313066 - 37313345
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |  || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  37313066 tgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatggg 37313165  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     
T  37313166 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaatcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaact 37313265  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  37313266 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatgcaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 37313345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 312
Target Start/End: Original strand, 16931790 - 16932066
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  16931790 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 16931888  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16931889 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc 16931988  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgt 312  Q
      ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16931989 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgt 16932066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 55 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544013
Alignment:
Q  55 aaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg 154  Q
    ||||||||||||||| | | |||||||||   |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccg 13544173  T
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgtt 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||| ||||||||    
T  13544172 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaa-cctagtgtttgtt 13544074  T
Q  255 -cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13544073 gccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgttt 13544013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 92 - 295
Target Start/End: Original strand, 3824627 - 3824830
Alignment:
Q  92 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3824627 tccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaac 3824726  T
Q  192 caagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgtt 291  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3824727 caatagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtt 3824826  T
Q  292 gttg 295  Q
    ||||    
T  3824827 gttg 3824830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 9174147 - 9174425
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  9174147 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgagt 9174245  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  9174246 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaact 9174345  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9174346 cacgaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 9174425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Original strand, 47210761 - 47211019
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47210761 cagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 47210860  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           || |||||||    
T  47210861 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa-----------ca-caaaccc 47210948  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  47210949 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 47211019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19323027 - 19322751
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19323027 tgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgg 19322928  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19322927 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 19322828  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  19322827 c--caaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 19322751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 43 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36380675 - 36380425
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36380675 ccagttcgctccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaag 36380576  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36380575 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttccggtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaac 36380476  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttg 292  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36380475 cctaatggtttttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 36380425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16455574 - 16455354
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  16455574 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactataatgacgagtaaccttacaaaagagatatcaatgag 16455475  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16455474 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 16455375  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttc 255  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  16455374 atcaaaccctagtgtttgttc 16455354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41997824 - 41997566
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  41997824 tgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctggg-gagagagcggccctccgtttcactatgatgatgagtaactttacaaaagagatattaaaggg 41997726  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41997725 ttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaaatctcaatcttttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 41997626  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgtt 294  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41997625 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgtt 41997566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 53405465 - 53405184
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||  || | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53405465 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgg--gggagagcagctctctgttccactatatgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggt 53405368  T
Q  136 tacaagaataag------tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 229  Q
    ||||||||||||      |||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53405367 tacaagaataagaataagtctcccgcttaattctacctaaagtctcagcctctttccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaat 53405268  T
Q  230 ctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | ||| ||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  53405267 caaccctcaaaacctagt-tttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 53405184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Original strand, 18537513 - 18537750
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18537513 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagt 18537612  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||| || ||||| ||||||| |||||||||    
T  18537613 ctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtggttgttgccaagag-caaactcta 18537709  T
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  18537710 tacaaaccctag-tttgttgtt-tgtttctaaacccttgtttt 18537750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 18409355 - 18409626
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||    ||||||||| |  || | | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409355 ccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcactataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaag 18409453  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||||    
T  18409454 aataaatctcccgcctaattctaccaaaagtctcaatctcttcctataactaagagactcaatcctaatagtgttcccgaaggttaatcaaccctcaaac 18409553  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18409554 cctagtgtttgttgccaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18409626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 43 - 288
Target Start/End: Original strand, 38890232 - 38890476
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38890232 ccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 38890331  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  | ||    
T  38890332 gaataagtctcccttctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaatatgaatcaacc--ccaa 38890429  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagtttt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38890430 ccctaatgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagtttt 38890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 315
Target Start/End: Original strand, 8756276 - 8756529
Alignment:
Q  60 gacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgccta 158  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8756276 gacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgtcta 8756375  T
Q  159 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaacc-aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||    
T  8756376 attctactcaaagtctcaatctcttcccgtgaccaaagagactcaatcctagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgcc 8756473  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||| ||||||||||||||| | || |||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  8756474 aagag-caaactctatacaaatcctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgtttt 8756529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2891624 - 2891433
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||| |  |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2891624 tgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 2891525  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 226  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2891524 ttacaagaacaagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtg 2891433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4215638 - 4215483
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4215638 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 4215539  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  4215538 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagtcacaacctcttcccgtaac 4215483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13547477 - 13547302
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  13547477 agttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaat 13547378  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 220  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13547377 aagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccc 13547302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 173
Target Start/End: Original strand, 5635477 - 5635614
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635477 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 5635576  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635577 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 5635614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 287
Target Start/End: Original strand, 18534873 - 18535082
Alignment:
Q  76 gagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 174  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| | |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18534873 gagagcacccctccgttccactataattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtct 18534972  T
Q  175 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctata 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18534973 caatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctata 18535069  T
Q  275 caaaccttagttt 287  Q
    |||||| ||||||    
T  18535070 caaaccctagttt 18535082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 314
Target Start/End: Original strand, 52942537 - 52942725
Alignment:
Q  113 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942537 ttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaa-------------cccgtaaccaagagactcaatcctaatag 52942623  T
Q  213 tgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgt 312  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  52942624 tgtttcccaaggtgaatcaatcctcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgt 52942723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 140 - 314
Target Start/End: Original strand, 3937314 - 3937488
Alignment:
Q  140 agaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaa 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3937314 agaataagtctcccacctaattctacccaaagcctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaattccaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaa 3937413  T
Q  240 accctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  3937414 accctagtgtttgttcccaagaaacaaactctatacaaactctagtttttttgttgcctttctaaacccttgttt 3937488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11437694 - 11437557
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11437694 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggt 11437596  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437595 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 11437557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6133090 - 6132927
Alignment:
Q  150 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| |||    
T  6133090 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccagggtgactcaaccctcaaaccctagtgt 6132991  T
Q  250 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  6132990 ttgttgccaatagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgtt 6132927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 36 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 30136882 - 30136640
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| | | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |    
T  30136882 tgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttacaaaagagatatcgatgag 30136783  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  30136782 tcacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcacaatttcttctcgtgaccaagagacccaatcatagtagtgtttcccaaggtgaatcaacc 30136683  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 280  Q
      | ||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  30136682 --ccaaccctagtgtttgttgccaagag-taaactctatacaaacc 30136640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27499374 - 27499128
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| | || | || |||| ||||||||||| |||||||||||| || |   ||    
T  27499374 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggg-gaaagagcagcccttcgtttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatatta---gg 27499279  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  27499278 ttacaaaaataagtctcccgcctaattatacccaaagcctcaatctcttatcgtaaccaatagactcaatcctaatagtgtttctcaggatgaatcaacc 27499179  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagt 285  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27499178 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagt 27499128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12102412 - 12102224
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12102412 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcagtgggttacaaga 12102313  T
Q  143 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12102312 ataagtctccaaacctaattctacccaaagttccaatcttttcccatgaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 12102224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 28454009 - 28453741
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |  ||||||| ||   |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  | ||||||    
T  28454009 ccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaagtttacaa 28453910  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    |||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |  | ||    
T  28453909 gaattagtcttcaacctaattctacccaaggtccaaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaa 28453812  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||| ||||| || ||||||| |||||||  | |||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  28453811 ccctagtgtttcttgccaagag-caaactc--tgcaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgtttt 28453741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 15032557 - 15032815
Alignment:
Q  45 agttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | |  |||||||||||  | || |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15032557 agttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 15032656  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| |||        
T  15032657 ataaatctcccgcctaattctaccaaaagtccaaatcttttctcgtgtccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaatatgaatcaacc-tca---- 15032751  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
          |||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  15032752 ------tttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 15032815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25357968 - 25357774
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25357968 ccagttaggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 25357869  T
Q  141 gaataagtc-tcccgcctaattc----tacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||| ||   | ||||||    || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25357868 gaataagtcttcaaacttaattctatatatccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatc 25357774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 315
Target Start/End: Original strand, 47150904 - 47151168
Alignment:
Q  47 ttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||| | || | ||| | ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  47150904 ttcggtccaatattgacctagtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaaagggttacaagaat 47151003  T
Q  145 aagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||| |   |||||||||||||||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |  |||||    
T  47151004 aagtcttcaaacctaattctacccaaattctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttcaaccc 47151101  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    || |||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  47151102 tagtgttggttaccaagag-caaactctat--aaaccttagttttg-tgttggc-ttctaaacccttgtttt 47151168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 31983566 - 31983724
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||    
T  31983566 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaaagggttacaaaaataagtcttcaaacctaattctacccaaag 31983665  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31983666 tctcaatctcttcccatgaccaagagacttaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatc 31983724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 3982215 - 3982374
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctacccaaag 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |   || ||||||||||||||    
T  3982215 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagtgttacaagaatcagtcttcaaacttaattctacccaaag 3982314  T
Q  172 tcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 229  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3982315 tcccaaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaat 3982374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 16185842 - 16186018
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||| |||    
T  16185842 ccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaagggttgcaa 16185940  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16185941 gaataagtcttcaaacctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16186018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 315
Target Start/End: Original strand, 40999017 - 40999227
Alignment:
Q  102 gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  40999017 gatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaaaacacagtctccaaacctaattctacccaaagtctcgatctcttcccgtgaccaagagact 40999116  T
Q  201 caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcatt 300  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||| | | || || |||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| |  |    
T  40999117 caatcctaataatgttttcctaggtgaatcaatc-tc-aatcctagtgtttgttgtcaagag-caaactctatacaacccctagttttcttgttgac-gt 40999212  T
Q  301 ctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||||||||    
T  40999213 ctaaacccttgtttt 40999227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9864004 - 9863764
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata----tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctaccca 168  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||    ||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| |   || |||||||||||    
T  9864004 gagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacttaattctaccca 9863906  T
Q  169 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  | | |||| || |||||||| |||||| ||||||    
T  9863905 aagtctcaatctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagggtttcccaaggtgaatcaa--acccaaccttagtgtttgttgccaaga-acaaac 9863809  T
Q  269 tctatacaaaccttag-ttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||  |||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9863808 tc--tacaaaccctagtttttgtttttggc-ttctaaacccttgtttt 9863764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5101260 - 5101130
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||    
T  5101260 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagatagcagccctccgttttactatatgatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggt 5101162  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctaccc 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5101161 tacaagaataagtctcctgcctaagtctaccc 5101130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 314
Target Start/End: Original strand, 38270158 - 38270265
Alignment:
Q  207 taatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaac 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  38270158 taatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaaaagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaac 38270257  T
Q  307 ccttgttt 314  Q
    ||||||||    
T  38270258 ccttgttt 38270265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 43 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 10113196 - 10112926
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-ggttaca 139  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |  |||||||||||  |||  ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||   |||||||    
T  10113196 ccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccactataatgattagtaacattacaaa-gagatatcaaaaaggttaca 10113098  T
Q  140 agaataagtctcccgc-ctaattctacccaaagtcccaatctcttccc-gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    ||||| ||||| |    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||    
T  10113097 agaattagtcttcaaatctaattctacccaaagtcctaatctcttccccgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaatc-tc 10112999  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  10112998 -aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaaccctagtttttgtgttggc-ttctaaacccttgtttt 10112926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5101136 - 5101051
Alignment:
Q  229 tctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5101136 tctaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagtgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacctttgttt 5101051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 24446756 - 24446835
Alignment:
Q  207 taatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24446756 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt 24446835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9022600 - 9022361
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg--gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaa 169  Q
    |||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||| |  ||||||||||| ||||| |   |||||||| ||||||    
T  9022600 gagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatagaggttacaagaattagtcttcaaacctaattcaacccaa 9022502  T
Q  170 agtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||| |||||||||||| | |  | |||| || |||||||| |||||||   ||     
T  9022501 agtctcaatctcttcccgtgaccaagaaattctatcctaatactgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaagag---aat 9022407  T
Q  269 tctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  9022406 tctctacaaaccctagttttgatgttgac-ttctaaacccttgtttt 9022361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2891434 - 2891371
Alignment:
Q  251 tgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2891434 tgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2891371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 5336903 - 5336964
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5336903 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 5336964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 24446680 - 24446754
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 148  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  24446680 gagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 24446754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 36 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 47563093 - 47563009
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa 120  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47563093 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16489410 - 16489352
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16489410 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16489352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25699810 - 25699752
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25699810 cctaattctacc-aaagtcccagtctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25699752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4570155 - 4570094
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4570155 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcgatcctaatagtgttt 4570094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 7050378 - 7050439
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7050378 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7050439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11853610 - 11853549
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11853610 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 11853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 4556180 - 4556238
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4556180 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4556238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4558372 - 4558314
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4558372 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4558314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 8529328 - 8529270
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8529328 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 8529270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15317019 - 15316961
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15317019 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15316961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18587027 - 18586969
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18587027 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 18586969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31300485 - 31300427
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31300485 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 31300427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 55822326 - 55822265
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55822326 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 55822265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54906852 - 54906724
Alignment:
Q  104 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactc 201  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||||||||||||    
T  54906852 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagagttacaagaatcagtcttcaaacctaattctacctaaagtcttgaatctcttccagtgaccaagagactc 54906754  T
Q  202 aatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  54906753 aattctaatagtgtttctccatggtgaatc 54906724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 10114520 - 10114435
Alignment:
Q  175 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagag 262  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |  | ||||||| |||||||| |||||||    
T  10114520 caatctcttatcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaagtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag 10114435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 15831202 - 15831144
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15831202 cctaattctacgcaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 15831144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 16689061 - 16689119
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  16689061 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16689119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Original strand, 29609591 - 29609654
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29609591 cctaattctactcgaagtctcaatctcttgccgtgatcaagagactcaattctaatagtgtttc 29609654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47566554 - 47566496
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  47566554 cctaattctacccaaattcc-agtctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 47566496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16638884 - 16638827
Alignment:
Q  159 attctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16638884 attctacccaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 16638827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 183
Target Start/End: Original strand, 38270120 - 38270158
Alignment:
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38270120 aagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctctt 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3760161 - 3760105
Alignment:
Q  156 ctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 211  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3760161 ctaattctacccaaagtgctaaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaata 3760105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6133169 - 6133105
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata 100  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  6133169 tgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22295399 - 22295295
Alignment:
Q  127 tcaatgggttacaagaataagtctcccgcc-taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 225  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |  || ||||| ||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | ||||| | |||||    
T  22295399 tcaaagggttacaggaataagtcttcaaccctaattatactcaaagtttcaatctctttccgtgaccaagagactaaatcctaacaatgtttactaaggt 22295300  T
Q  226 gaatc 230  Q
    |||||    
T  22295299 gaatc 22295295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4884912 - 4884877
Alignment:
Q  179 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4884912 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 4884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Original strand, 14789429 - 14789495
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--agaagagagagcagccatccgatccactata 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  14789429 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36771457 - 36771396
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  36771457 cctaattctacccaa-gtcacagcctcttcccatgaccaagagactcaatcataatagtgttt 36771396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Original strand, 4874620 - 4874661
Alignment:
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4874620 aatctcttcccgtgaccaagagactctatcttaatagtgttt 4874661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 103)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25804300 - 25804025
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804300 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 25804202  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25804201 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 25804102  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25804101 aaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 25804025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 18511213 - 18511491
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  18511213 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaacgggt 18511312  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18511313 tacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18511412  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511413 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 18511491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10529100 - 10529378
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529100 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 10529199  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10529200 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 10529299  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10529300 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctataaaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 10529378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38882383 - 38882106
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38882383 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 38882285  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38882284 tacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 38882185  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38882184 acaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 38882106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4236900 - 4236629
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236900 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 4236801  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  4236800 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaacc 4236701  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  4236700 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 4236629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2175196 - 2174919
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2175196 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 2175098  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  2175097 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 2174998  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2174997 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2174919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6745346 - 6745069
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745346 tgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 6745247  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6745246 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 6745147  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  6745146 tcaaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacacttgttt 6745069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 25921474 - 25921752
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921474 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 25921573  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  25921574 tacaagaataagtcttccgcctaattctacccagagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccc 25921673  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25921674 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 25921752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40221801 - 40221522
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40221801 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 40221702  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  40221701 ttacaagaataagtcttccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 40221602  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40221601 ctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 40221522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 18509319 - 18509597
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||    
T  18509319 tgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaacgagt 18509418  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18509419 tacaagaataagtctcccgcttaattctacccaaagtcccattctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18509518  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509519 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 18509597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21948304 - 21948026
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21948304 tgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaaggggt 21948205  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  21948204 tacaagaataagtctcccgcctaattccacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 21948105  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948104 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 21948026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39854761 - 39854483
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39854761 tgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggt 39854662  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39854661 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccatgagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 39854562  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39854561 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 39854483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 34477054 - 34477333
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34477054 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 34477152  T
Q  136 tacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34477153 tacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaac 34477252  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34477253 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 34477333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18466962 - 18466684
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18466962 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 18466863  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18466862 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18466763  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18466762 tcaaaacctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18466684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 16092200 - 16092479
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  16092200 tgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatggg 16092299  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16092300 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 16092399  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16092400 ctcaaaccctagtgtttgttgcaaagagacagactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 16092479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18469287 - 18469011
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  | || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18469287 tgttaatccagttcggtccaaattgacctagtctgg--gagagagcagctcttcgttccactagatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 18469190  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18469189 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18469090  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18469089 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18469011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 35 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18596925 - 18596662
Alignment:
Q  35 ctgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  18596925 ctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatga 18596826  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  18596825 gttacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaacagtgttttccaaggtgaatcaac 18596726  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtc 297  Q
    | ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18596725 cctcaaaccatattgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtc 18596662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31545358 - 31545080
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31545358 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatgggt 31545260  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31545259 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatttcttcccgtaaccaagagactctaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31545160  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31545159 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31545080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16776435 - 16776158
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16776435 tgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg-t 16776337  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16776336 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 16776237  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  16776236 acaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttgtaaacccttgttt 16776158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25904381 - 25904103
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  25904381 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgataagtaacgttacaatagagatatcaatgtgt 25904282  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  25904281 tacaagaataagtctcccgcctaattatactcaaagccctaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 25904182  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25904181 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaatccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 25904103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27912814 - 27912536
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||   || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27912814 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 27912715  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27912714 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27912615  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27912614 tcaaaacctattatttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27912536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 34479419 - 34479698
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34479419 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 34479517  T
Q  136 tacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34479518 tacaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactccaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaac 34479617  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34479618 ccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 34479698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 31179372 - 31179650
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||    
T  31179372 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatgaatgggt 31179470  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31179471 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31179570  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31179571 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31179650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6747582 - 6747306
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  6747582 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatccactatatgacgagtaacgttacaaaa-agaaatcaatgagt 6747484  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  6747483 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 6747384  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6747383 tcaaa-cctagtgtttgtttcaaagagacaaattttatacaaactctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 6747306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24127134 - 24126856
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  24127134 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagt 24127035  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |     
T  24127034 tacaagaataagtctatcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtcaatcaatct 24126935  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24126934 tcaaaccctagtatttgttgacaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaactcttgttt 24126856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27910728 - 27910469
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27910728 tgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 27910629  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27910628 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27910529  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27910528 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg 27910469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31543012 - 31542735
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  31543012 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtactgttacaaa-gagaaatcaatgggt 31542914  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31542913 t-cgagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31542815  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31542814 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31542735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 292
Target Start/End: Original strand, 658357 - 658610
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  658357 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg---gagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 658453  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  658454 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccc 658553  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttg 292  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  658554 tcaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttgttg 658610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 1189608 - 1189888
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1189608 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 1189707  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1189708 attacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaagtgaatcaac 1189807  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  1189808 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccgtagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 1189888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15552523 - 15552245
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15552523 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 15552425  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15552424 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 15552325  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  15552324 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagataaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 15552245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17073162 - 17072883
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  17073162 tgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgag 17073063  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17073062 ttacaagaataagtcttccgcctaattctatcgaaagccccaatctcttcccctaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 17072963  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17072962 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 17072883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 21684453 - 21684730
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  21684453 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagt 21684551  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||     
T  21684552 tacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaaccc 21684651  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  21684652 ataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 21684730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26098009 - 26097740
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26098009 tgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagt 26097911  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  26097910 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcattttcccgtaaccaagagactcattcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaaccc 26097812  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26097811 tctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatccaaaccctagttttgttgttgccattctaaacc 26097740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 10474324 - 10474602
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  10474324 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaaccttagaaaagagatatcaatgggt 10474423  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10474424 tacaaaaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccaatctcttcctgtaaccaagagattcaatcttaatagtgtttcccaaggtgtatcaaccc 10474523  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  10474524 tcaaaccccagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaatccttgttt 10474602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 31472613 - 31472893
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31472613 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 31472712  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||| ||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31472713 ttagaagaagatgcatcccgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31472812  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31472813 ctcaaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 31472893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 2818336 - 2818615
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  2818336 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 2818435  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc-tacc 234  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  2818436 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcgtaatagtgttttccaaggtgaatcaaacc 2818535  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  2818536 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 2818615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 17818493 - 17818769
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  |||| || | |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17818493 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccactgtatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 17818590  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17818591 tacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcagtcttaatagtgtttcccaaggtaaatcaacca 17818690  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  17818691 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacgaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 17818769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 36402329 - 36402607
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  36402329 tgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggat 36402428  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  36402429 tacaataataagtctccagcctaattttacccaaagttccaatctcctcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtattttccaaggtgaatcaaccc 36402528  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  36402529 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagtttcgtgattgtcattctaaacccttgttt 36402607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 39398003 - 39398272
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |  ||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39398003 agttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactatataattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 39398102  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  39398103 aagtctactgcctaattctacccaaagttccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa-cct 39398201  T
Q  245 aatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39398202 agtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 39398272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6756762 - 6756494
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || | | ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  6756762 cagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc-gtttcactataatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaatg--ttacaaga 6756666  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  6756665 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaaggagaatcaaccctcaaacc 6756566  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6756565 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaaccattgttt 6756494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 37705781 - 37706052
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37705781 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 37705880  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37705881 tacaagaataagtctcccacctaattctatccaaaaccctaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 37705980  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||    
T  37705981 tcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaagtctatacaaaccctagatttgtcgttgcctttctaaacc 37706052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2954694 - 2954416
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  2954694 tgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactatatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggt 2954596  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||     
T  2954595 tacaagaatacgtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttctcgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtgaatcaaccc 2954496  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2954495 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaattatacacaaaccctagttttgttgctgtctttctaaacccttgttt 2954416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 10587110 - 10586873
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10587110 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatggg 10587012  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10587011 ttaaaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtctcaatctctttccgtaagcaagagactgaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 10586912  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttccc-aagagacaaactcta 272  Q
     ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  10586911 ctcaaaccctatcgtttgttcccaaagagacaaactcta 10586873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 696156 - 695924
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  696156 tgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaatggg 696057  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  696056 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt-ccaaggtgaatcaacc 695958  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaac 268  Q
     |||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  695957 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagatacaaac 695924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Original strand, 20505844 - 20506036
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20505844 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg--gggagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgtgt 20505941  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505942 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 20506036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 92 - 314
Target Start/End: Original strand, 34530722 - 34530945
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 190  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  34530722 tccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataaatctcccgcctaattctactcaaagtcctaatctcttcccgtag 34530821  T
Q  191 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34530822 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 34530921  T
Q  291 tgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||   |||||||| |||||||    
T  34530922 tgttgcatttctaaacacttgttt 34530945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 31466040 - 31466233
Alignment:
Q  96 ctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaag 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31466040 ctatatgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtccaaatctcttcccgtaaccaag 31466138  T
Q  196 agactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31466139 agactcaatcctaatactgtttctcaaggtgaatcaaccgtcaaaccctggtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 31466233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39798325 - 39798131
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  39798325 tgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatacgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggt 39798226  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798225 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 39798131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4410300 - 4410092
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  4410300 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaataggt 4410202  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4410201 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 4410102  T
Q  236 tcaaacccta 245  Q
     |||||||||    
T  4410101 acaaacccta 4410092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10749978 - 10749796
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10749978 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 10749880  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10749879 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10749796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 38 - 310
Target Start/End: Original strand, 12555926 - 12556198
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggtt 136  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |  |||| ||||||| |||| | | || || ||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||    
T  12555926 ttgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctccgtttcgctttaagatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgagtt 12556025  T
Q  137 acaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccat 236  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  12556026 acaagaaaaagtctcttgtctaattctaccaaaactcc-aatctcttcccgtagccaagagacacaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccct 12556124  T
Q  237 caaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12556125 caaaccttagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaaccctt 12556198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 245
Target Start/End: Original strand, 41585745 - 41585954
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  41585745 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgact 41585844  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  41585845 tacaaaaataagtctcctgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtagccaagagactcaatcctactagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 41585944  T
Q  236 tcaaacccta 245  Q
    ||||||||||    
T  41585945 tcaaacccta 41585954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 6661185 - 6661461
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  6661185 tgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaaaagagatatcaatgg 6661284  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6661285 gttacaagaataagtctcctgcctaattgtacccaaaatctcaatttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccatggtgaatcaac 6661384  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  | ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  6661385 c--ccaactctagtgtttgttgccaaga-acaaactctatacataccctaattttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 6661461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 21289039 - 21288768
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||        || ||    
T  21289039 tgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataagatgagtaacgttacaaaaga--------tgagt 21288948  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||     
T  21288947 tacaagaaaaaatctcccgcttaattctatccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgttt-tcaaggtgaatcaaccc 21288849  T
Q  236 tcaaaccctaa------tgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||||    
T  21288848 tcaaaccctaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctatttttattgttgctattctaaaccctt 21288768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 3373138 - 3373320
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3373138 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 3373236  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  3373237 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaactaagagacttcaatcctaatagtgtttc 3373320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10757454 - 10757273
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10757454 tgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gaaaaatcaatgggt 10757356  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10757355 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 10757273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 15354576 - 15354757
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15354576 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 15354674  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15354675 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23665321 - 23665140
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23665321 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 23665223  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23665222 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23665140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 23793266 - 23793447
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23793266 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 23793364  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23793365 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 23793447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20043208 - 20043050
Alignment:
Q  156 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttc 255  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||     
T  20043208 ctaattctatccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttt 20043109  T
Q  256 ccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  20043108 ccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacacttgttt 20043050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20045172 - 20045010
Alignment:
Q  152 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgttt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20045172 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 20045073  T
Q  252 gttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  20045072 gttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttcctaaacccttgttt 20045010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2724171 - 2723959
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2724171 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggt 2724072  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||     
T  2724071 tacaagaataaatcacccgcctaattcta---------ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcatccc 2723981  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  2723980 tcaaaccctagtgtttgctccc 2723959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 41 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9020493 - 9020246
Alignment:
Q  41 atccagttcggtccaaatt-gacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 138  Q
    |||||||||||||||||   |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  9020493 atccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttac 9020394  T
Q  139 aagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatca 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |      
T  9020393 aagaataagtcttccgcctaattctacccaaagctccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcttaatagtgttttccaaggtgaatcaac--ttc 9020296  T
Q  239 aaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||| || ||||||    
T  9020295 aaccctagtgtttgttgccaagag--caactctatacaaaccctacttttgt 9020246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 15356852 - 15357033
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15356852 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactatttaatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 15356950  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15356951 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 15357033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 38960133 - 38960314
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960133 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggt 38960231  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38960232 tacaagaat-agtctcccgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 38960314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 211
Target Start/End: Original strand, 23741860 - 23742034
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23741860 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggt 23741958  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaata 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23741959 tacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttctcgtaatcaagagactccaatcctaata 23742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Original strand, 26098379 - 26098526
Alignment:
Q  163 tacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagag 262  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26098379 tacccaaaaccccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttgtcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagag 26098478  T
Q  263 acaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||    
T  26098479 acaaactctatacaaaccctagtcttcttgttgccattctaaaccctt 26098526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20054107 - 20053847
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| | || |||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||    
T  20054107 cagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatc---gggttacaag 20054011  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  20054010 aataagtctcccacctaattctacttaaagtcccaatct-----ccaaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc-tc-aac 20053918  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  |||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  20053917 cctagtgtttgttgccaagag-caaactttatataaactctagtttttgtgttg-ccttctaaacccttgttt 20053847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36208847 - 36208659
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36208847 ccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaag 36208749  T
Q  142 aataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  36208748 aataagtctacaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgttaccaagagactcaatcttagtaatgtttcccaaggtgaatc 36208659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Original strand, 17413205 - 17413442
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    ||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |   |||||||||||| ||||    
T  17413205 gagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagttttcaaacctaattctacctaaag 17413304  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactct 271  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||     
T  17413305 tctcaatctcttcccttgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc- 17413400  T
Q  272 atacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||| |||||||  || || | |||||||||||||||||    
T  17413401 -tacaaaccatagttttagtgctg-ccttctaaacccttgtttt 17413442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15143722 - 15143549
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 156  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |   ||    
T  15143722 tgacctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacc 15143623  T
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  15143622 taattctacccaaaatccaaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgcttccaaaggtgaatc 15143549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42771025 - 42770936
Alignment:
Q  99 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 188  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42771025 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgt 42770936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 43 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23667589 - 23667415
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |   ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  23667589 ccagttcggtccaatctgtcctagtctggggaagagagcagccctccgatccattatttgatgagtgacgttac-aaagagaaatcaatgggttgcaagc 23667491  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    || ||| |  |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  23667490 at-agtttttcgcctaattctttccaaagtcccaatctctttctgtaagcaagagagtccaatccttatagtgtttc 23667415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4897943 - 4897828
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctccc-gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  4897943 atgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaagaatcagtcttcaagcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagata 4897844  T
Q  199 ctcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4897843 ctcaatcctaacagtg 4897828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Original strand, 2144601 - 2144841
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatg-ggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaa 170  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||   |||||||||||| ||||| |   |||||||| |||||||    
T  2144601 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatataaaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattccacccaaa 2144699  T
Q  171 gtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgt-ttgttcccaagagacaaa 267  Q
    ||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |  | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  2144700 gtcctgaatctcttcccgcgaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtgttgttgccaagag-caaa 2144796  T
Q  268 ctctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||  |||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  2144797 ctc--tacaaaccctagttttagtgttggc-ttctaaacccttgtttt 2144841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 42770934 - 42770804
Alignment:
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||  |||  | |||| ||    
T  42770934 agtctctcgtctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcagtcctaata--gtttcccatggtgaatgaacc--ccaacctta 42770839  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacct 281  Q
     |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||    
T  42770838 gtgtttgttgccaagag-caaattctatataaacct 42770804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 314
Target Start/End: Original strand, 20507665 - 20507741
Alignment:
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  20507665 aaacccttgtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttaatttttttgttgcctttctaaacccttgttt 20507741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 29748502 - 29748351
Alignment:
Q  160 ttctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| | |  | ||||||| |||||||| ||    
T  29748502 ttctacccaaagtcccgaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctattagtgtttctccaagacgaatcaatc--ctaaccctactgtttgttgcc 29748405  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||   || ||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  29748404 aagag---aattctctacaaaccctagttttcttgttggc-ttctaaacccttgtttt 29748351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 15445274 - 15445453
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| | | ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15445274 ccagttcagtccaatactgacctagtctggga-agagagcagcccttcgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaa 15445372  T
Q  141 gaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt---aaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||| | || ||   ||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||     ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15445373 gaatcattcttcaaacctaattctactcaaagtctcaatctcttcatgtggccgccaagagactcaatcctaacagtgttt 15445453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4754312 - 4754198
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgtt 254  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| | | || ||||||| ||||||||    
T  4754312 cctaattctatccaaagtcacaatctcttccagtgaccaagaggctcaattctaatagtgtttttcaaggtgaatcaatc-tc-aaccctagtgtttgtt 4754215  T
Q  255 cccaagagacaaactcta 272  Q
     ||||||| |||||||||    
T  4754214 gccaagag-caaactcta 4754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1170872 - 1170811
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1170872 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 1170811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 31782578 - 31782639
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  31782578 cctaattctacccaat-tcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 31782639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Original strand, 34033632 - 34033766
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatc-aatgggttacaagaataagtctcccgcct-aattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaaga 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| | || |||||| |   || ||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||||    
T  34033632 atgatgagtaactttacaaaagagatatcgaaggggttaccataacaagtcttcaaacttaattctacccaaaatcctgaatctcttcccgcgaccaaga 34033731  T
Q  197 gactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34033732 gactcaatcctaatagtgtttctccaaggtaaatc 34033766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 35385573 - 35385634
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35385573 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35385634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 124
Target Start/End: Original strand, 26098297 - 26098378
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 124  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26098297 cagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccatatgatgagtaacgttacaaaagaga 26098378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 35430460 - 35430261
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||| | |||| || |||  |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  |    
T  35430460 tgtttatccagttcagtccaatactgacctactctaaaggagataggagctttccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaag 35430362  T
Q  134 g-ttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaat 229  Q
      |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  35430361 aattacaagaatcagtcttcaaacctaattctacccaaagacccgaatctcttccctagaccaagagactcaattgtaatagtgtttctccaaggtgaat 35430262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25452556 - 25452498
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25452556 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 25452498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 2298122 - 2298183
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2298122 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2298183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10627425 - 10627364
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10627425 cctaattctacccta-gtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 10627364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25445557 - 25445501
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445557 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatag 25445501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32520597 - 32520533
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  32520597 cctaattctacccaaagtcatgaatctcttcccgtaatcgagagactcaatcttaatagtgtttc 32520533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Original strand, 15224889 - 15224997
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttg 252  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||  ||||||| ||||||    
T  15224889 cctaattttacccaaagtctcgaatctcttcccatgaccaaaagactttatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatcat--aaccctagtgtttg 15224986  T
Q  253 ttcccaagaga 263  Q
    || ||||||||    
T  15224987 ttgccaagaga 15224997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28786465 - 28786407
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28786465 cctaattctgcccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 28786407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1240489 - 1240428
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  1240489 cctaattctacccaaa-tcccagcctcttcccgtgcctaagagactcaatcctaatagtgttt 1240428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 217
Target Start/End: Original strand, 16093413 - 16093473
Alignment:
Q  156 ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||| || ||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093413 ctaattctacctaa-gtcccagacttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16093473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 11962554 - 11962612
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11962554 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagacacaatcctaatagtg 11962612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 17841370 - 17841428
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17841370 cctaattctacccaa-gttccagcctcttcccgtgacctagagactcaatcctaatagtg 17841428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22672895 - 22672837
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22672895 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 695931 - 695889
Alignment:
Q  272 atacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  695931 atacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 695889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 26406594 - 26406647
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 209  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  26406594 cctaattctactcaa-gtctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaa 26406647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13295896 - 13295835
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  || | |||||||||||||||||| |||||||    
T  13295896 taattctacccaaagtctcgaatctcttcatgtgatcaagagactcaatcctaaaagtgttt 13295835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4410101 - 4410061
Alignment:
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4410101 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4410061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10586874 - 10586842
Alignment:
Q  282 tagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10586874 tagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 10586842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3874344 - 3874066
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874344 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 3874245  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3874244 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 3874145  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3874144 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 3874066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32339636 - 32339365
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32339636 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 32339537  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  32339536 ataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaacccacaaacc 32339437  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32339436 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 32339365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 609068 - 608790
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  609068 tgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 608969  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  608968 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccc 608869  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  608868 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcatttctaaacccttgttt 608790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28251568 - 28251846
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28251568 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggt 28251667  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28251668 tataagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 28251767  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28251768 acaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 28251846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 30480504 - 30480782
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30480504 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggt 30480603  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  30480604 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 30480703  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30480704 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactttagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 30480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22684654 - 22684935
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat---g 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  22684654 tgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaatagagaaatcaatattg 22684753  T
Q  133 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22684754 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 22684853  T
Q  233 ccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22684854 ccttcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 22684935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27829630 - 27829353
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27829630 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 27829532  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27829531 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27829432  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27829431 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27829353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14808095 - 14807807
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct-----aga-----agagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaa 125  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||     |||      |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808095 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaa 14807996  T
Q  126 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807995 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 14807896  T
Q  226 gaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14807895 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 14807807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15809552 - 15809275
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809552 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 15809453  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  15809452 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagtttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 15809353  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15809352 acaaaccctagtgtttgtt-ccaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15809275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27106898 - 27107176
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  27106898 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactatatgatgagtaaccctacaaaagagatatctatgggt 27106997  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27106998 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27107097  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27107098 tcaaactctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27107176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28283222 - 28283498
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28283222 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 28283319  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  28283320 tgcaagaataagtctaccacctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccc 28283419  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28283420 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagtcaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 28283498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 14419191 - 14419470
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||| | || ||||||    
T  14419191 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatggg 14419290  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  14419291 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 14419390  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  14419391 ctcaaaccccaatgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgttt 14419470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27827319 - 27827042
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  27827319 tgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 27827221  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27827220 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaggtcccagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27827121  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27827120 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27827042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15073045 - 15072766
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15073045 tgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactgtatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 15072946  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15072945 tacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaaccctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 15072846  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15072845 ctaaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15072766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43079936 - 43079658
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  43079936 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 43079838  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43079837 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 43079738  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43079737 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 43079658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4424352 - 4424074
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4424352 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggt 4424253  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  4424252 tacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccacggtgaatcaaccc 4424153  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4424152 acaaaccctagtgtttgtttcgaagcgacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatccttgttt 4424074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27911345 - 27911071
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  27911345 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtta 27911247  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27911246 caagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 27911147  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27911146 aaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg-ccttctaaacccttgttt 27911071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27957764 - 27957490
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  27957764 ttgacccagttcggtccaaattgacttagtctggg-gagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaatagagatatcaatgagtta 27957666  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27957665 caagaataactctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 27957566  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27957565 aaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttg-ccttctaaacccttgttt 27957490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15068308 - 15068037
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15068308 ccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccattatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 15068209  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15068208 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaacctctttccgtaaccaaaagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaattaaccctcaaacc 15068109  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  15068108 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctggttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 15068037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43082307 - 43082029
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  43082307 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 43082209  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  43082208 tacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 43082109  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  43082108 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 43082029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 41385078 - 41384800
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  41385078 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 41384979  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41384978 tacaagaaaaattctcccacctaattctacctaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaacct 41384879  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384878 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgttt 41384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1225501 - 1225222
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  1225501 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcggccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaaagagatgtcaatgag 1225402  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1225401 ttacaagaataagtctcccgtctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 1225302  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1225301 ctcaaaccgtagtgtttgttccaaagagacaaactctttacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 1225222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44721177 - 44720899
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  44721177 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 44721079  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg-tttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  44721078 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttcccaaggtgaatcaacc 44720979  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44720978 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacagactctatacaaaacatagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 44720899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18811041 - 18810764
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  18811041 tgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 18810943  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18810942 tacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccagcctattcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18810843  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18810842 acaaaccctagtgtttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18810764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 43530449 - 43530213
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43530449 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccgatccactatatgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaatgggt 43530350  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  43530349 tacaggaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccgagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacct 43530250  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43530249 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactcta 43530213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 36865864 - 36865594
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  36865864 ccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaa 36865765  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36865764 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtga---agagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaa 36865668  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  36865667 ccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 36865594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Original strand, 24873193 - 24873460
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 146  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24873193 ttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatcggttacaagaataa 24873291  T
Q  147 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  24873292 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaacccacaaacccta 24873391  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24873392 gtgtttgctcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24873460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 13858492 - 13858763
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||| | ||||    
T  13858492 ccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatat-aatgggctgcaag 13858590  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13858591 aataagtctcccgcttaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagaaactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaac 13858690  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13858691 cctagtgtttgttgtcaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 13858763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 41382996 - 41382728
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  41382996 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 41382897  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||           ||||||| | |||     
T  41382896 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataat-----------aggtgaaacaaccc 41382808  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382807 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaattctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 41382728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Original strand, 5372185 - 5372457
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtct-agaagagagagcagccatccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| | || |||| | |||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  5372185 cagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaatgagttacaag 5372284  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  5372285 aataagtctgccgcctaattatactcaaagtcccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaattaaccctcaaac 5372384  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5372385 cctagtgtttgtttccaagagacaaactctatataaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5372457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18813215 - 18812980
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| | | |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  18813215 tgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 18813117  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18813116 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcacagcctcttcccgtacccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18813017  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
     ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18813016 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactcta 18812980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 126 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14477520 - 14477332
Alignment:
Q  126 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 225  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14477520 atcaatggattacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagcgtttcccaaggt 14477421  T
Q  226 gaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14477420 gaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 14477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25952855 - 25952577
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |    
T  25952855 tgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgag 25952756  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  25952755 ttacaagaataagtcttctgcctaattctacccaatgtctcaatttcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatattgttttccaaggtgaatcaacc 25952656  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  25952655 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactatatac-aaccctaattttattgttgcctttctaaacccttgttt 25952577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 15185715 - 15185989
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | |||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  15185715 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactataatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatggg 15185814  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag--actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |    
T  15185815 ttacaagaataggtctctcgcctaattctacccaaa-------tctcttcccgtaaccaagagagactcaattctaatagtgttttacaaggtgaatcaa 15185907  T
Q  233 ccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  15185908 ccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccatagttttgttattttctttctaaacccttgttt 15185989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 15956292 - 15956051
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||| | || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15956292 tgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 15956193  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  15956192 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaaaagattcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaac- 15956094  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacc 280  Q
      | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15956093 --ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaacc 15956051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21480830 - 21480589
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21480830 ccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaag 21480731  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||     
T  21480730 aataagtcacccgcctaattctaccaaaaaccccaatatcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--caaa- 21480634  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21480633 cctagtgtttgttgccaagag-caaactccatacaaaccctagttt 21480589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Original strand, 33541413 - 33541667
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||         
T  33541413 ttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatg----- 33541507  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
                     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  33541508 -----------------cctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagatactcaatcctaatagtgtttcccaatgtgaatcaaccctc 33541590  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33541591 aaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 33541667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 43 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21482638 - 21482397
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21482638 ccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctttataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaag 21482539  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   | |||    
T  21482538 aataagtcactcgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgactcaac---ccaac 21482442  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21482441 cctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt 21482397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 43 - 279
Target Start/End: Original strand, 3005638 - 3005872
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3005638 ccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaa 3005737  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||   | ||| ||    
T  3005738 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgaccaagagactcaatgctaatagtgttttccaaagtgaat---caatccaa 3005834  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaac 279  Q
    ||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  3005835 ccctattgtttgttgttaagag-caaactctatacaaac 3005872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31162506 - 31162303
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  31162506 gagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagt 31162407  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||  || |||||||| ||||||| |||||| ||    
T  31162406 cccaatctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ctaacgttagtgtttgttgccaagag-caaacttta 31162310  T
Q  273 tacaaac 279  Q
    |||||||    
T  31162309 tacaaac 31162303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 314
Target Start/End: Original strand, 5622877 - 5623017
Alignment:
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5622877 ccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatccaaataatgtttccaaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaatagacaaactctat 5622976  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5622977 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5623017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 181772 - 181624
Alignment:
Q  99 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcc--cgtaaccaaga 196  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  181772 tatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaatgggttacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccattctcttcccgcgtaactaaga 181674  T
Q  197 gactcaatcct-aatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  181673 gacttaatcctaaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccttcaaacccta 181624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 31578284 - 31578474
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||    
T  31578284 ccagttcggtcctatactgacctagtctaggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaa 31578383  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31578384 gaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcataacagtgtttcccaaggtgaatc 31578474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31035414 - 31035257
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||    
T  31035414 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacctaaag 31035316  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31035315 tctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcataacggtgtttcccaaggtgaatc 31035257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26775378 - 26775257
Alignment:
Q  193 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttg 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  26775378 aagagactcaattctaatagtgttttccaaggtgaattaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactatatacaaaccctagtattgttg 26775279  T
Q  293 ttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  26775278 ttgcctttctaaacccttgttt 26775257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 103 - 230
Target Start/End: Original strand, 31573794 - 31573922
Alignment:
Q  103 atgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc 201  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31573794 atgagtaactttacaaaagagatatcaaagaattacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactc 31573893  T
Q  202 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31573894 aatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 31573922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 280
Target Start/End: Original strand, 37214317 - 37214436
Alignment:
Q  152 ccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgttt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37214317 ccgcctaattctacccaaagttccaatcgcttcccgtaaccaagagactcaat---------gtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttt 37214407  T
Q  252 gttcccaagagacaaactctatacaaacc 280  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37214408 gttccaaagagacaaactctatacaaacc 37214436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 164
Target Start/End: Original strand, 2468139 - 2468259
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||   | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2468139 agttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggctacaagaa 2468238  T
Q  144 taagtctcccgcctaattcta 164  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  2468239 taagtctcccgtctaattcta 2468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 35872555 - 35872634
Alignment:
Q  207 taatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagtt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35872555 taatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttcgtttccaagagacaaactctatacaaaccctagtt 35872634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 13985176 - 13985262
Alignment:
Q  132 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13985176 gggttacaagaatcagtttcaaacctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13985262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17847782 - 17847677
Alignment:
Q  113 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 211  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  17847782 ttacaaaagagatatcaaagg-ttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgatcaagagattcaatcctaata 17847684  T
Q  212 gtgtttc 218  Q
    |||||||    
T  17847683 gtgtttc 17847677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 198 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 31035238 - 31035125
Alignment:
Q  198 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtc 297  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  31035238 actcaatcctaatggtgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac 31035142  T
Q  298 attctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||||| |||||||    
T  31035141 -ttctaaaccattgtttt 31035125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3896119 - 3895959
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatca-atgggttacaagaat-aagtctcccgcctaattctacccaaa 170  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| | | ||||||||||| || | ||   ||||||| ||| ||||    
T  3896119 gagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatcataagagttacaagaattaattttcaaacctaattatactcaaa 3896020  T
Q  171 gtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  3896019 gtcccaatttcttcccgtgacgaagagactcaatcgcaatagtgtttctccaaagtgaatc 3895959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 148
Target Start/End: Original strand, 35872479 - 35872553
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagt 148  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  35872479 gagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaaaaataagt 35872553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6376315 - 6376141
Alignment:
Q  45 agttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    |||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||  ||| ||||||    
T  6376315 agttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaggtaacaaga 6376217  T
Q  143 ataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    || ||||| |   |||||||||||  |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  6376216 attagtcttcaaacctaattctacataaagtctcaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcttaacagtgttt 6376141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 259 - 314
Target Start/End: Original strand, 12517248 - 12517303
Alignment:
Q  259 agagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12517248 agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 12517303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 9021228 - 9021289
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9021228 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 9021289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 16752643 - 16752704
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752643 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16752704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 16757388 - 16757449
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16757388 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16757449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28327969 - 28327908
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28327969 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28895563 - 28895502
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28895563 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30423274 - 30423212
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30423274 cctaattctatccaaagttccaatctcttcccgcgaccaagagactcaatcctaaaagtgttt 30423212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 13985933 - 13986009
Alignment:
Q  156 ctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13985933 ctaattatacccaaagtcccgaatctcttcccgtgattaagagtctcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 13986009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 590855 - 590797
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  590855 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 590797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33032715 - 33032657
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33032715 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Original strand, 2468261 - 2468341
Alignment:
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctata 274  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||    
T  2468261 accaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtatttgttgccaagag-caaactctata 2468341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 4812608 - 4812669
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4812608 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaaaagactcaatcctaatagtgttt 4812669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 28332692 - 28332631
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28332692 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28332631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 29554908 - 29554964
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29554908 taattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 29554964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3276405 - 3276347
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3276405 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 3276347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 25684704 - 25684646
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  25684704 cctaattctacccaa-gtccctgtctcttcccgtgaccaagagattcaatcctaatagtg 25684646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 2267144 - 2267205
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2267144 cctaattctacccaa-gtcctaatctcttcatgtgaccaagagactcaatcctaacagtgttt 2267205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 17799568 - 17799606
Alignment:
Q  179 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17799568 ctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17799606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 33839043 - 33839118
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33839043 cctaattctacccaaagtcttgaatctcttcctg--accaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatc 33839118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 90
Target Start/End: Original strand, 37214265 - 37214319
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccg 90  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  37214265 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 314
Target Start/End: Original strand, 3886153 - 3886197
Alignment:
Q  270 ctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3886153 ctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 3886197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15949596 - 15949534
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  15949596 cctaattttacccaa-gtcccgaatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaatagtgttt 15949534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16833846 - 16833769
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtct 150  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  16833846 gagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaatgattacaagagtaagtct 16833769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 28895659 - 28895618
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28895659 tgacctagtctagaggagagagcagctctccgatccactata 28895618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14419787 - 14419735
Alignment:
Q  73 agagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 124  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14419787 agagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagaga 14419735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21033906 - 21033870
Alignment:
Q  181 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033906 cttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 23179692 - 23179740
Alignment:
Q  166 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  23179692 ccaaagtcacagcctcttccggtgaccaagagactcaatcctaatagtg 23179740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 106)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38394274 - 38393996
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394274 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 38394175  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38394174 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 38394075  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38394074 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 38393996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 36 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20299748 - 20299475
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299748 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 20299649  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20299648 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20299549  T
Q  236 tc-aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccc 308  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20299548 tcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaccc 20299475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20297648 - 20297372
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20297648 ttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggtta 20297549  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20297548 caagaataagtctcccacctatttctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 20297449  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20297448 aaaccctactgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgccattctaaacccttgttt 20297372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44724867 - 44724589
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44724867 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 44724768  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44724767 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 44724668  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44724667 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 44724589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48457941 - 48457663
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457941 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 48457842  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||     
T  48457841 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccctaggtgaatgaaccc 48457742  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  48457741 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 48457663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35917 - 35639
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35917 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 35818  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  35817 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 35718  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35717 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgtctttctgaacccttgttt 35639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 7471981 - 7472259
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7471981 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 7472080  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  7472081 tacaagaataagtgtcccgcctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 7472180  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  7472181 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 7472259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20626326 - 20626048
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626326 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 20626227  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20626226 tacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20626127  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20626126 tcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20626048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20630217 - 20629939
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630217 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 20630118  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20630117 tacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20630018  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20630017 tcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20629939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20642636 - 20642358
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642636 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 20642537  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  20642536 tacaagaataagtctccatcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 20642437  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20642436 tcaaaacctagtgtttgttccaaacagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20642358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 7470023 - 7470301
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470023 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 7470122  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  7470123 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcacaaggtgaatcaaccc 7470222  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7470223 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaatctctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 7470301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 4295942 - 4296214
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  4295942 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaaga 4296041  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4296042 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccatcaaacc 4296141  T
Q  243 ctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296142 ctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 4296214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1850269 - 1849991
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850269 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 1850170  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  1850169 tacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaagtcccagcctcttcccgtaagcaagaaactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 1850070  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  1850069 acaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagtttttttgttgcctttctaaacccttgttt 1849991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3878865 - 3878587
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878865 tgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 3878766  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  3878765 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttaccaaggtgaatcaaccc 3878666  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3878665 acaagccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 3878587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 40836744 - 40837017
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  40836744 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 40836842  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  40836843 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 40836942  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  40836943 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 40837017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 42330998 - 42331278
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||  |||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42330998 tgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactatataatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 42331097  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt--aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42331098 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 42331197  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331198 cctcaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 42331278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 1049297 - 1049574
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1049297 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 1049395  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  1049396 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctgatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1049495  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1049496 acaaaccctagtgtttattccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 1049574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21990438 - 21990160
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21990438 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgagt 21990339  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  21990338 tacaagaaaaagtctcccgcctaattctactcaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaattctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccc 21990239  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21990238 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcatagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 21990160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 27306231 - 27306508
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27306231 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 27306330  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27306331 tgcaagaataagtctcccgcctaattttacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27306430  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27306431 tcaaaccctagtttttgttccaaagagacaaactctata-aaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 27306508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 443884 - 443604
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  | ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  443884 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttataaaagagatatcaatgga 443785  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  443784 ttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 443685  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  443684 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaaccattgtttt 443604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 20137110 - 20137388
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20137110 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 20137208  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20137209 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaatcaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 20137308  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20137309 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20137388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Original strand, 37412128 - 37412407
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||    
T  37412128 ttgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaatgagt 37412227  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  37412228 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 37412327  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37412328 tcaaaccctagtgtttgttgctaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 37412407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44852 - 44574
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44852 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 44753  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||     
T  44752 tacaagaataagtctcccacataattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaaaagactcaatcataatagtgtttcctaaggtgaatcaaccc 44653  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44652 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 44574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 1046926 - 1047203
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1046926 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 1047024  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1047025 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1047124  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||    
T  1047125 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccctgttt 1047203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11355546 - 11355268
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||  || | |||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  11355546 tgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttccactatatgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaatgagt 11355447  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11355446 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 11355347  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  11355346 tcaaaccctagtgtttattgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 11355268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18345829 - 18345551
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18345829 tgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 18345730  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18345729 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 18345630  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18345629 tcaaaacctagtatttgttgcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 18345551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 40946616 - 40946338
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40946616 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaataggt 40946517  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||     
T  40946516 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaactaagagactcaatcctaatagtgttttccaaagtaaatcaaccc 40946417  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40946416 acaaaccctagtgtttgtttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 40946338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 89 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11757465 - 11757245
Alignment:
Q  89 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgt 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11757465 cgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgt 11757366  T
Q  189 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc-aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11757365 aaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttt 11757266  T
Q  288 tgttgttgtcattctaaaccc 308  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11757265 tgttgttgtcattctaaaccc 11757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 13099475 - 13099755
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13099475 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgg 13099574  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13099575 gttacaagaataaatctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 13099674  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13099675 cctcaaactctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 13099755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3036012 - 3035731
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3036012 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggt 3035913  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatc---tcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcta 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3035912 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccagcctcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaa 3035813  T
Q  233 ccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3035812 cccacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 3035731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24748875 - 24748604
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24748875 cagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24748776  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  24748775 ataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccggaaccaagagactcaatcgtaatagtgtttcccagggtgaatcaaccctcaaacc 24748676  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24748675 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgttt 24748604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28487841 - 28487563
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487841 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 28487742  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  28487741 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccc 28487642  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     | ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28487641 acgaaccctagtgttagtttcgaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 28487563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Original strand, 43253520 - 43253795
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253520 ttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtta 43253619  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43253620 caagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctctttccgtaatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 43253719  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43253720 aaa-cctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaaaccttgttt 43253795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28485853 - 28485576
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28485853 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-gaggagagagcaaccctctgattcattatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggat 28485755  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  28485754 tacaagaataaatctcccgcctaattatactcaaagccccaatctcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttccaaaggtgaatcaaccc 28485655  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28485654 gcaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28485576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 7351653 - 7351931
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  7351653 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 7351751  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7351752 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 7351851  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7351852 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaagcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 7351931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 31155912 - 31156190
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31155912 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataggatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 31156010  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31156011 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtacccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31156110  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31156111 cacaaatcctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31156190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 31435047 - 31435326
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  31435047 tgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 31435146  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31435147 ttacaagaataagtcttccacctaattctacccaaagttccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 31435246  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31435247 ctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31435326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21680307 - 21680037
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21680307 cagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcattgggttacaagaa 21680208  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  21680207 taaatctcccgtctaattctacccaaagtcccaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccc 21680108  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21680107 tagtgtttgttaccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 21680037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25542816 - 25542540
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25542816 tgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 25542718  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||     
T  25542717 tacaagaataagtctcccgcataattctacccaaagtcccagtctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtcttt-ccaaggtgaatcaaccc 25542619  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||||    
T  25542618 acaaaccctagtgttttttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacctttgttt 25542540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9679347 - 9679069
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||| | | |||||||||   |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9679347 tgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 9679248  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  9679247 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcacgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatcc 9679148  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9679147 tcaaa-cctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctagatccttgttt 9679069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21678347 - 21678076
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  | | | ||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21678347 ccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactatatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaaga 21678248  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21678247 atacgtctcccgcctaatgctacccaaagtcccaatatcttctcgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 21678148  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21678147 ctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgatgttgcctttctaaacccttgttt 21678076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 39145987 - 39146266
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  39145987 tgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgtg 39146086  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  39146087 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcataatagtgttttccaaggtgaatcaacc 39146186  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  39146187 ttcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctatctaaacccttgttt 39146266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9681099 - 9680829
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  | |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  9681099 agttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaactttacaaaagatatatcaatgagttacaagaat 9681000  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  9680999 aagtctaccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaaccctcaaaccct 9680900  T
Q  245 aatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9680899 agtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgcccttctaaacccttgttt 9680829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Original strand, 7349285 - 7349552
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataa 146  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7349285 ttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataa 7349383  T
Q  147 gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  7349384 gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacccta 7349483  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  7349484 gtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccctgttt 7349552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42223446 - 42223167
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  42223446 tgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaataggt 42223347  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  42223346 ttcaagaataagttttccgcctaattctatccaaagctccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 42223247  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42223246 tcaaaccctagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 42223167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 21592144 - 21592422
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  21592144 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 21592243  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||     
T  21592244 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcgcgtaaccaagagactaaatcctaatagtgcttgccaaggtgaatcaaccc 21592343  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  21592344 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaatcctacttttgttgttgcatttctaaacctttgttt 21592422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 254
Target Start/End: Original strand, 7092214 - 7092431
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7092214 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggt 7092312  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  7092313 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtatttcccaaggtgaatcaaccc 7092412  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt 254  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  7092413 tcaaaccctagtgtttgtt 7092431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 47 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24258744 - 24258473
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata----tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24258744 ttcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaga 24258645  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  24258644 ataagttttccgcctaattctatccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaacc 24258545  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24258544 atagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24258473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Original strand, 27832651 - 27832912
Alignment:
Q  54 caaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc 152  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27832651 caaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactataatgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 27832750  T
Q  153 cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttg 252  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| ||    
T  27832751 cgcctaattttacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtatg 27832850  T
Q  253 ttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||    
T  27832851 ttgccaagagacaaactctatacaaaccttagttctgttgttgcctttttaaacccttgttt 27832912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 92 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 25276374 - 25276160
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25276374 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaa 25276275  T
Q  191 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgt 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25276274 ccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgt 25276175  T
Q  291 tgttgtcattctaaa 305  Q
    ||||| | |||||||    
T  25276174 tgttgcctttctaaa 25276160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Original strand, 7094463 - 7094678
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtta 137  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7094463 ttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggtta 7094562  T
Q  138 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  7094563 caagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaattaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctc 7094662  T
Q  238 aaaccctaatgtttgtt 254  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7094663 aaaccct-atgtttgtt 7094678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828912
Alignment:
Q  75 agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    ||||||||||| || | | ||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 22828771  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  22828772 tcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttctaatctgaatcaaccatcaaactctagtgtttgttttcaagagataaactctat 22828871  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22828872 acaaaccttagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 22828912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 43 - 295
Target Start/End: Original strand, 24813505 - 24813755
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||    
T  24813505 ccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagccatccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaa 24813604  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   | ||    
T  24813605 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatcacttcccgtcaccaagagactcaatcctaatagtgcttcccaaggtgaatcaac---ccaa 24813701  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    ||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24813702 ccctagtgtttcttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 24813755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2935556 - 2935374
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2935556 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 2935458  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2935457 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 2935374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38396922 - 38396729
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  38396922 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagccctccgatccactatatgatgagtaaagttacaaa-gagaaatcaatgggt 38396824  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38396823 tacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcgatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 38396729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 24817362 - 24817628
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaat-tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||  ||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24817362 agttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaatgagttacaaga 24817461  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||   | ||||    
T  24817462 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatactgctttccaaggtgaatcaac---ccaacc 24817558  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||| | ||||||||||||||||    
T  24817559 ctagtgtttgttgcaaagag-caaactctatacaaaccctagttctcttgttgac-ttctaaacccttgttt 24817628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 290
Target Start/End: Original strand, 20091586 - 20091797
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20091586 gagagagcagccctccgttccactat--gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 20091683  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
     |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||    
T  20091684 tcaatctcttcccgtgaccaagagatttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctaatctttgttgccaatag-caaactctat 20091780  T
Q  274 acaaaccttagttttgt 290  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20091781 acaaaccctagttttgt 20091797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 131 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26804765 - 26804579
Alignment:
Q  131 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804765 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 26804666  T
Q  231 taccatcaaacc---ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||| |||||||   ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26804665 aaccctcaaaccctactagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 26804579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1606667 - 1606486
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1606667 tgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 1606569  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1606568 tacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 1606486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22137365 - 22137184
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22137365 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 22137267  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22137266 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22137184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40552392 - 40552211
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40552392 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 40552294  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40552293 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40552211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 9027195 - 9027376
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9027195 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 9027293  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9027294 tacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 9027376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22108354 - 22108173
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108354 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggt 22108256  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22108255 tacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40550114 - 40549933
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550114 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggt 40550016  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40550015 tacaagaat-agtcttccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 40549933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7188789 - 7188553
Alignment:
Q  75 agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7188789 agagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttacaaaagaaatatcaatgggttataaaaataagtctcccgcttaattctacccaaagtc 7188690  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
     |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  7188689 tcaatctattcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaaccctat 7188593  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| || |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  7188592 acaaaccctatttttattgttgac-ttctaaacccttgttt 7188553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 92 - 314
Target Start/End: Original strand, 22251602 - 22251821
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttccc 186  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22251602 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttccc 22251701  T
Q  187 gtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagtt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||    
T  22251702 gtaaccaagagactcaatccta--------tcccaaggtgaatcaacccttaaaccctagtgtttgttccaaatagacaaactctatacaaactctagtt 22251793  T
Q  287 ttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22251794 ttgttgttgcctttctaaactcttgttt 22251821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24465817 - 24465578
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||| |  |||||||||| || ||| | || |||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  24465817 cagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcattataatgatgagta-ctttacaaaagacatatcaatgagttaaaaga 24465719  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||  ||||    
T  24465718 ataaatctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaat---caattcaacc 24465622  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24465621 ctagtgtttgttgccaagag-caaacgctatacaaaccctagttt 24465578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26295736 - 26295580
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26295736 tgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 26295637  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaac 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  26295636 ttacaagaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcacaatcgcttcctgtaac 26295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 11081792 - 11081521
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat--gggttac 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| | ||  |||||||||| ||||| |||||| |||||   |||||||    
T  11081792 ccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccgttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaaaaagggttac 11081693  T
Q  139 aagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc 237  Q
    |||||| ||||| |   ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||    
T  11081692 aagaattagtcttcaaacctaattttacacaaaatcctaatctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaatc-tc 11081594  T
Q  238 aaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||| |||||||| |||||||   || ||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11081593 -aaccctagtgtttgttgccaagag---aattctctacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgtttt 11081521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22394004 - 22393876
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22394004 ccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaag 22393905  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaa 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22393904 aataagtctcccgcctaattctacccaaa 22393876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6332503 - 6332321
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||    
T  6332503 ccagttcggtccaatactgacctagtctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatattaaagggttacaa 6332404  T
Q  141 gaataagtctccc-gcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 222  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6332403 gaataagtcttcaagcctaattctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttttccaa 6332321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 206 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18567731 - 18567623
Alignment:
Q  206 ctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18567731 ctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaa 18567632  T
Q  306 cccttgttt 314  Q
    |||||||||    
T  18567631 cccttgttt 18567623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 16297030 - 16297220
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat-gggttacaa 140  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||  |||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||| || ||  |||||||||    
T  16297030 cagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatattaaaagggttacaa 16297129  T
Q  141 gaataagtctcccgc-ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||| | ||| |    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16297130 gaatcaatcttcaaatctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 16297220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6349006 - 6348912
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaa 194  Q
    |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  6349006 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatcttttcccgtgaccaa 6348912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22392608 - 22392502
Alignment:
Q  177 atctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctataca 276  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  22392608 atctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaatag-caaattctataca 22392513  T
Q  277 aaccttagttt 287  Q
    |||| ||||||    
T  22392512 aaccctagttt 22392502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 229
Target Start/End: Original strand, 40281466 - 40281572
Alignment:
Q  124 aaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  40281466 aaatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattccaccaaaagtctcaatctcttcccgtgaccaacagactcaatcctaacggtgtttcccaa 40281565  T
Q  223 ggtgaat 229  Q
    |||||||    
T  40281566 ggtgaat 40281572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6049094 - 6048884
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||||||| |||| |   |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  6049094 atgatgagtaactttacaaagg-gatatcaaagggttataagaatacgtcttcaaacctaattctatccaaagtctcaatatcttctcgtgaccaagaga 6048996  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtc 297  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||| | |  | || |||| |||||||| |||||||   || ||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  6048995 ttcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatcaatc--ccaaacctagtgtttgttgccaagag---aattctttacaaaccctagttttgatgttggc 6048901  T
Q  298 attctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||||||||||||    
T  6048900 -ttctaaacccttgtttt 6048884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11084544 - 11084438
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgtt 254  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||||||| ||||||||    
T  11084544 cctaattttacccaaagttcgaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtaaatcaatc-tc-aaccctattgtttgtt 11084447  T
Q  255 cccaagaga 263  Q
     ||||||||    
T  11084446 gccaagaga 11084438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21369703 - 21369642
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21369703 cctaattttacccaa-gtcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 21369642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26210710 - 26210633
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26210710 cctaattctaccgaaagtcccgaatctctttccgttaccaagagactcaatcctaatagtatttctccaaggtgaatc 26210633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2120960 - 2120899
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2120960 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2120899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 3320171 - 3320232
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3320171 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3320232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 3324919 - 3324980
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3324919 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3324980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7069841 - 7069780
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7069841 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7074848 - 7074787
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7074848 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 7074787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25351414 - 25351353
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351414 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25351353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25357108 - 25357047
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357108 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25357047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25405454 - 25405393
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25405454 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25405393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25410191 - 25410130
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25410191 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 25410130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 42006724 - 42006663
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42006724 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 42006663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30247031 - 30246973
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30247031 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 30246973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 44512646 - 44512704
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44512646 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44512704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 41 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6046778 - 6046641
Alignment:
Q  41 atccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 138  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||| |  |||||||||||  | |  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  6046778 atccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggtttac 6046680  T
Q  139 aagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccca 176  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  6046679 aagaataagtcttcaaacctaattctacccaaagtccca 6046641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 8378625 - 8378686
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  8378625 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 8378686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 15541116 - 15541177
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541116 cctaattatacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 15541177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Original strand, 12310157 - 12310198
Alignment:
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310157 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 12310198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Original strand, 13290540 - 13290671
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| | ||| |   |||||||||||||| ||| | ||| |||||| || |||||||||    
T  13290540 atgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattattcttcaaacctaattctacccagagttctaatatcttcctgtgaccaagaga 13290638  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    || ||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  13290639 ctaaattctaatagtgtttctcgaaggtgaatc 13290671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 214
Target Start/End: Original strand, 44143997 - 44144045
Alignment:
Q  166 ccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44143997 ccaaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 44144045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 34546984 - 34547042
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34546984 cctaattttacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 34547042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38396377 - 38396326
Alignment:
Q  263 acaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38396377 acaaacactatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 38396326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 6348903 - 6348829
Alignment:
Q  239 aaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || || |  |||||||||||||||||    
T  6348903 aaccctaatgtttgttgccaagag-caaactcgatacaaaccctagttttctt-ttttacttctaaacccttgtttt 6348829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46516402 - 46516339
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactat 99  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  46516402 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactat 46516339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11759415 - 11759369
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagca 82  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  11759415 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 208
Target Start/End: Original strand, 6067332 - 6067373
Alignment:
Q  167 caaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 208  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6067332 caaagtctcaatctcttcccgtgaccaagagactaaatccta 6067373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8260625 - 8260584
Alignment:
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8260625 aatctcttcccgtgaccaagacactcaatcctaatagggttt 8260584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 314
Target Start/End: Original strand, 7092426 - 7092454
Alignment:
Q  286 tttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092426 tttgttgttgtcattctaaacccttgttt 7092454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 69293 - 69570
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  69293 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 69391  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  69392 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 69491  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  69492 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 69570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Original strand, 73207 - 73302
Alignment:
Q  219 ccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  73207 ccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttctaaacccttgttt 73302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 256
Target Start/End: Original strand, 73160 - 73208
Alignment:
Q  208 aatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||    
T  73160 aatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgttttttcc 73208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 1230250 - 1230528
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230250 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 1230349  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1230350 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttccaataaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1230449  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1230450 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 1230528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 11983030 - 11983308
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983030 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 11983129  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  11983130 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 11983229  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| || ||||||    
T  11983230 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaagcctttgttt 11983308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 310
Target Start/End: Original strand, 14458768 - 14459040
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458768 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 14458867  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||     
T  14458868 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaag--gaatcagccc 14458965  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14458966 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 14459040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 4816232 - 4816510
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4816232 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggt 4816331  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  4816332 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 4816431  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4816432 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4816510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 28241322 - 28241600
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241322 tgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 28241421  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28241422 tacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 28241521  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28241522 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 28241600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30967514 - 30967236
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967514 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 30967415  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  30967414 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtttcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 30967315  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30967314 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccatagttttgttgttgtctttctaaacccttgttt 30967236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 19704568 - 19704848
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaa-agagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19704568 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatggg 19704667  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19704668 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 19704767  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |  ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19704768 ccacaaactctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 19704848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 14507177 - 14507455
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  14507177 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgataagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 14507275  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14507276 tacaagaataagtcttccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 14507375  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14507376 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 14507455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9020239 - 9019960
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9020239 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 9020140  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  9020139 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 9020040  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9020039 tcaaaacctagtgattgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 9019960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13057508 - 13057229
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13057508 tgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 13057409  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13057408 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 13057309  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  13057308 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttcttgcctttctaaacccttgttt 13057229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 20915357 - 20915635
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20915357 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 20915455  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20915456 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccgaagtcccaatctcttctcgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 20915555  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20915556 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 20915635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 30034604 - 30034883
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034604 tgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccgatccgctatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 30034703  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  30034704 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccttaaccaattgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 30034803  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30034804 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaactctaattttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 30034883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 2628887 - 2629164
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2628887 tgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaccgttacaaa-gagaaatcaatgggt 2628985  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  2628986 tacaagaataaattctccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 2629085  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2629086 ttaaaacctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2629164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26065294 - 26065021
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26065294 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggt 26065197  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26065196 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 26065097  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26065096 tcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 26065021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26085263 - 26084990
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26085263 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatataacgagtaacgttacaaa-gagaagtcaatgggt 26085166  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  26085165 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 26085066  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||   |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26085065 tcaaaccctagtgt---ttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 26084990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13040068 - 13039789
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13040068 tgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 13039969  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13039968 ttacaagaataagtcttccgcctaattctacgcaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacc 13039869  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  13039868 ctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttcttgcctttctaaacccttgttt 13039789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 3631940 - 3632217
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3631940 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgg--gacagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 3632037  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3632038 ttacaagaataagtctcctgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtaacaaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaacc 3632137  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3632138 cttaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 3632217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 78 - 311
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530398
Alignment:
Q  78 gagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 177  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-ttacaagaataagtctcccgcctaattcaacccaaagcctcaa 15530264  T
Q  178 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530265 tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaa 15530364  T
Q  278 accttagttttgttgttgtcattctaaacccttg 311  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15530365 accctagttttgttgttgccattctaagcccttg 15530398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3390693 - 3390414
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3390693 tgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 3390594  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3390593 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 3390494  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3390493 ctcaaaccctagtgtttgttccaaagagaaaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 3390414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32280301 - 32280031
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatat-gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32280301 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 32280202  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  32280201 taagtctcccgcctaattctacctgaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 32280102  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||||    
T  32280101 aagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagatttgttgttgcctttttaaacccttgttt 32280031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Original strand, 3233739 - 3234010
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3233739 cagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactatacggtgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagttacaagaa 3233838  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  3233839 taagtctcccgcataattctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccc 3233938  T
Q  244 taatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  3233939 tagtgtttgttaccaaagagacaaactatatacaaaccttagttttgttgttgtctttctaaatccttgttt 3234010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 307
Target Start/End: Original strand, 3629866 - 3630136
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || | | |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3629866 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctcagtttcactatattattagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 3629964  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  3629965 tacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagattcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 3630064  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacc 307  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3630065 tcaaaccctagtgtttgttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacc 3630136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12195516 - 12195794
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  12195516 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 12195614  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12195615 tacaagaataagtctcccgattaattctactcaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 12195714  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12195715 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 12195794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 15541141 - 15541419
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  || | | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15541141 tgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcactatatgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggt 15541240  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15541241 tacaagaatacgtctcccgcctaatcctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 15541340  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  15541341 tcaaaccctagtgtttattccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgtttttgcctttctaaacccttgttt 15541419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25477595 - 25477309
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacg-------ttacaaaagagaaat 127  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||       |||||||||||| ||    
T  25477595 tgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaacgagtaacgttacaaaagagatat 25477496  T
Q  128 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477495 caatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 25477396  T
Q  228 atctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  25477395 atcaaccctcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 25477309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 15532683 - 15532960
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15532683 tgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtctagg-gatagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 15532781  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  15532782 tacaagaataagtctctcgcctaattctaccaaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 15532881  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  15532882 tcaaaccctattgtttgttccaaagaaacaaactttatacaaaccctagttttgttgttacctttctaaacccttgttt 15532960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 26932563 - 26932841
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  26932563 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 26932661  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26932662 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaacc 26932761  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||| |||||||||    
T  26932762 cacaaaccctagtgtttgcttctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttattgcttttctaagcccttgttt 26932841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 30728825 - 30729107
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaat 131  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    |||||    
T  30728825 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccactataatatgagtaactttacaaaagagaaagatatcaat 30728924  T
Q  132 gggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatct 231  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30728925 gagttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccagcctcttcccgtaaccaagagagtcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatca 30729024  T
Q  232 accatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  30729025 accctcaaatcctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacccaagttttgttgttgtctttcgatacccttgttt 30729107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Original strand, 5273217 - 5273431
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  5273217 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactataagatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 5273315  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5273316 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 5273415  T
Q  235 atcaaaccctaatgtt 250  Q
      ||||||||| ||||    
T  5273416 cacaaaccctagtgtt 5273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 12161559 - 12161834
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12161559 tgttgattcagttcggtccaaattaacctagtttagg-gagagaacagccatccattttactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggt 12161657  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||     
T  12161658 tacaagaataaatctcccacttaattatacctaaagtctcaatctcttcccgtaaccaatagactcgatcttaatagtgtttcccaacgtgaaacaaccc 12161757  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12161758 tcaaaccctagtgtttgttcc--agagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcatttctaaacccttgttt 12161834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 26066125 - 26066307
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26066125 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgataagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 26066223  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26066224 tacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 26066307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 26068396 - 26068578
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26068396 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagcaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 26068494  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26068495 tacaagaataagtctcccacctaattctacctaaagtcccaatctcttcccgtaagcaagagactccaatcctaatagtgtttc 26068578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 36 - 229
Target Start/End: Original strand, 1069719 - 1069913
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |   ||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1069719 tgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggg 1069818  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069819 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaat 1069913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33309169 - 33308988
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33309169 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 33309071  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33309070 tacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33308988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 77 - 315
Target Start/End: Original strand, 3027895 - 3028129
Alignment:
Q  77 agagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  3027895 agagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataaatctccagcctaattctactcaaagtctc 3027994  T
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatac 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3027995 aatctcttcacgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatac 3028091  T
Q  276 aaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||| |||||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  3028092 aaaccctagttttg-tgttg-ccttccaaacccttgtttt 3028129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 24338458 - 24338727
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24338458 agttcggtccaaattgacatagtctgg--gggagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 24338555  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa-cc 242  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  24338556 taagtcttctgactaattctacccaaagtcttaatctctttccataaccaaaagactcaatcttaatagtgttttccaaggtaaatcaaccctcaaaccc 24338655  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||| | |||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24338656 ctagtgtttgttgctaagacacaaactttatgcaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24338727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22490889 - 22490694
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22490889 atgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctcgcataattctacccaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagac 22490790  T
Q  200 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||    | |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22490789 tcaatcctaatagtgtttcgcaaggtgtatacctcctcaaaccctagtgtttgttccaaagaggcaaactatatacaaaccctagttttgttgttg 22490694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 29754710 - 29754892
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29754710 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 29754808  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29754809 tacaagaataagtcttccgcctaattctacctaaagtcccaatctctttccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 29754892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 33311438 - 33311257
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33311438 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 33311340  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33311339 tacaagaata-gtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 33311257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Original strand, 16455433 - 16455702
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16455433 cagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaaagggttacaag 16455532  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |||    
T  16455533 aataaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctttccgtgagcaagagacttaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaacca--caac 16455630  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  16455631 cctagtgttcgttgccaagaga-aaactctgtacaaaccctagtttttgtgttgac-ttctaaacccttgtttt 16455702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 314
Target Start/End: Original strand, 19227514 - 19227687
Alignment:
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  19227514 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaa 19227613  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19227614 ccctagtgtttgatccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 19227687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15719891 - 15719708
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15719891 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccatgaccaagagac 15719792  T
Q  200 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  15719791 tcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaac--tc-aaccctagtgtttgttgccaaaag-caaactctatacaaaccctagttt 15719708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 14466630 - 14466399
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  || | ||||| |||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14466630 ccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgagttacaag 14466531  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatc-aaa 240  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |||    
T  14466530 aatatgtctctcgcctaattctactcaaactcccaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaatcctcaaaa 14466431  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  14466430 ccctagtgtttgttgccaatagacaaactcta 14466399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15367338 - 15367121
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctaga-agagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  15367338 ccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaag 15367239  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   | |||    
T  15367238 aataagtctcccgattaattttacccaaagtttcaatctcttcccgcgacgaagagactcaatcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaac 15367142  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagag 262  Q
    |||| |||||||| |||||||    
T  15367141 cctagtgtttgttgccaagag 15367121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 12186079 - 12186268
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaag-agagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12186079 ccagttcggttcaaattgacctagtcc-gaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaa 12186177  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186178 gaataagtctccaaacctaattgtacccaaagtctcaatctcttcccgtgaacaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 12186268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 17012287 - 17012105
Alignment:
Q  102 gatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc 201  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  17012287 gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcatcaatctcttctcgtgaccaagagactc 17012188  T
Q  202 aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| ||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  17012187 aatcctaatattgtttcagaaggtgaatcaacc-tc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactttatacaaaccctagttt 17012105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 43 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19696748 - 19696478
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19696748 ccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccactataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaa 19696649  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaa 239  Q
    |||||||||| |   |||||||||| |||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |  |    
T  19696648 gaataagtcttcaaacctaattctaaccaaagtctcaatctctttcagtgacaaagagactcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatcaa--tttga 19696551  T
Q  240 accctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  19696550 accctagtgattgttgccaagag-caaactctatacaaacccta-atttgttgtt-tgtttctaaacccttgtttt 19696478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26945393 - 26945265
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26945393 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaaaaataagtctacaaacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagaga 26945294  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtga 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26945293 cttaatcctaatagtgtttcccaaggtga 26945265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 315
Target Start/End: Original strand, 22857961 - 22858229
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat-gggttacaa 140  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||  |||||||||    
T  22857961 cagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaaagggttacaa 22858059  T
Q  141 gaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaa 239  Q
    |||| ||||| |   ||||| |||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | || |    
T  22858060 gaattagtcttcaaacctaaatctacctaaagtctcaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcataatagtgtttcccaaggtgaatcaatc-tc-a 22858157  T
Q  240 accctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| ||  |||||||| |||||||  ||||  | |||||||||||||||||    
T  22858158 accctagtgtttgttaccaagaga-aaattc--tacaaaccctagtttttgtgttagc-ttctaaacccttgtttt 22858229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 43 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15346653 - 15346522
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15346653 ccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactatatgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaaga 15346554  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcc 174  Q
    |||||||| |||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346553 ataagtcttccgcttaattttactcaaagtcc 15346522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 28037794 - 28037926
Alignment:
Q  99 tatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataag-tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagag 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |    ||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||| |    
T  28037794 tatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagattttaaacctaattctacccaaagtctcaatctatttccgtgaacaaggg 28037893  T
Q  198 actcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28037894 actcaatcctaacagtgtttcccaaggtgaatc 28037926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20526924
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttacaaa-gagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctaccaaaag 20526983  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||  |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20526982 tcttaatctcttcttgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 20526924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 314
Target Start/End: Original strand, 1072079 - 1072156
Alignment:
Q  237 caaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1072079 caaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaacactagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 1072156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17852650 - 17852577
Alignment:
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17852650 ccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 17852577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 314
Target Start/End: Original strand, 32447502 - 32447595
Alignment:
Q  222 aggtgaatctaccatcaaacc-ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32447502 aggtgaatcaaccctcaaaactctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 32447595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 262
Target Start/End: Original strand, 25078623 - 25078783
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||  ||| || ||||||||| |||| |||||||||    
T  25078623 atgacgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttacaagaataagtcttcaaacctaattctacttaaa-tctcaatctctttccgtgaccaagaga 25078721  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagag 262  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||||||||| |   |  |||||||||||||||| |||||||    
T  25078722 ctcaatcttaacggtgtttaccaaggtgaatcaa--tttcaaccctaatgtttgttgccaagag 25078783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11138499 - 11138425
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11138499 taattctacctaaagtccccatctcttcccgtgaccaagtgactcaatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 11138425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8995578 - 8995513
Alignment:
Q  250 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8995578 ttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 8995513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 221 - 310
Target Start/End: Original strand, 13870608 - 13870697
Alignment:
Q  221 aaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    |||||||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  13870608 aaggtgaatcaaccctcaaacccaagtgtttgttgccaagagacaaactttatataaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccctt 13870697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 7542452 - 7542567
Alignment:
Q  104 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactc 201  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||| |   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7542452 tgagtaactttacaaa-gagatatcaaagggttacaaaaattagtcttcaaacctaattctatccaaattcccaaatctcttcccgtgaccaagagactc 7542550  T
Q  202 aatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||| ||||||||||||    
T  7542551 aatcataatagtgtttc 7542567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 30445834 - 30445699
Alignment:
Q  41 atccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttac 138  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| | |  ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  30445834 atccagttcagtccaatactgacctagtatggtggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagggttac 30445735  T
Q  139 aagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    |||||| |||| ||   |||||||||||||||||||    
T  30445734 aagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtc 30445699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 5165936 - 5165989
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 209  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5165936 cctaattctacccaa-gtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaa 5165989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10584301 - 10584227
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactat-atgatgagtaacgttaca 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  10584301 cagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13878788 - 13878727
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13878788 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13883536 - 13883475
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883536 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 13883475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16785980 - 16785919
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16785980 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 16785919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 26887345 - 26887406
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26887345 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 26887406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 31248835 - 31248896
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31248835 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 31248896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 35201447 - 35201508
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35201447 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 35201508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Original strand, 12937232 - 12937376
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || ||  |||||||||||| || || |   |||||||||||| ||||    
T  12937232 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatattaaatggttacaagaattagccttcaaacctaattctaccaaaag 12937330  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |  |||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12937331 tttcaatctattctcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 154
Target Start/End: Original strand, 25465598 - 25465710
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  25465598 ccagttcggtccaatactgacatagtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gagatatcaaaggggtacaa 25465696  T
Q  141 gaataagtctcccg 154  Q
    ||||||||||||||    
T  25465697 gaataagtctcccg 25465710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 3577636 - 3577696
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3577636 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 3577696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911629
Alignment:
Q  60 gacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactat-atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcct 157  Q
    |||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| || ||  |||||||||||| || | ||   |||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaagaattagccttcaaacct 12911569  T
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    || |||||| |||||| |||||| ||  ||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  12911570 aactctaccaaaagtctcaatctattatcgtgactaagagactcaatcttaatagtgttt 12911629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17036116 - 17036058
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17036116 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17036058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 17694972 - 17695030
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17694972 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17695030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 210
Target Start/End: Original strand, 12166267 - 12166321
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaat 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166267 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaat 12166321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 22351973 - 22352031
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22351973 cctaattctacccaaa-tctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 22352031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 157 - 214
Target Start/End: Original strand, 19701985 - 19702041
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19701985 taattctacccaa-gtctcagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 19702041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25941704 - 25941650
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 211  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25941704 cctaattctacc--aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaata 25941650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26643259 - 26643179
Alignment:
Q  134 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26643259 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26643179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26749225 - 26749145
Alignment:
Q  134 gttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||   |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26749225 gttacaagaattagtcttccaacctaattctacccaa-gtcccagcatcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 26749145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 13467585 - 13467642
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13467585 cctaattctacc--aagtcacagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 13467642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 150
Target Start/End: Original strand, 28078251 - 28078310
Alignment:
Q  91 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtct 150  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28078251 atccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa-aggttacaagaataagtct 28078310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 22342922 - 22342980
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22342922 cctaatactacccaaa-tcccagcctcttcccgtgaccaagagacgcaatcctaatagtg 22342980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33215888 - 33215830
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33215888 cctaattctatccaa-gtcccagcctcttgccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33215830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10584213 - 10584175
Alignment:
Q  257 caagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10584213 caagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttg 10584175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11262649 - 11262596
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaa 209  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11262649 cctaattctacctaaa-tctcaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaa 11262596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15346524 - 15346445
Alignment:
Q  204 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||    
T  15346524 tcctaagagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaattttatacaaaccctagttt 15346445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 14383 - 14661
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14383 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 14482  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  14483 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactaaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 14582  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14583 tcaaaccctagtgtttgtttcaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccattgttt 14661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15298 - 15028
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15298 cagttcggtccaaattgacctagcatgggggagacagcagccttccgttccactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaa 15199  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  15198 taagtctcccgcataattctacccaaagtctgaatctctttccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaactc 15099  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  15098 tagtgtttgttccaaagagacaaactttataaaaaccctagttttgttgttgcctttctaaatcattgttt 15028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 79472 - 79193
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79472 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 79373  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  79372 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaattctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 79273  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  79272 ttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgtttt 79193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 11474 - 11752
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11474 tgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 11573  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||     
T  11574 tacaagaataagtatcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggaaaatcaaccc 11673  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11674 tcaaaccctagtgtttgttcgaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtcattctaaatccctgttt 11752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 41484 - 41762
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41484 tgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccgattcactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 41583  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  41584 tacaagaataagtctcccgtctaattctaccgaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 41683  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41684 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 41762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 19504347 - 19504624
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19504347 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 19504446  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19504447 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacca 19504545  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19504546 acaaacccttgtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 19504624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 45279985 - 45280264
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45279985 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 45280084  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  45280085 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggtgaatcaaccc 45280184  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg-tcattctaaacccttgttt 314  Q
    || || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  45280185 tctaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgctttttctaaacccttgttt 45280264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 19502012 - 19502290
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19502012 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 19502111  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19502112 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 19502211  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  19502212 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaactcttgttt 19502290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 23452238 - 23452516
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23452238 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggt 23452337  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  23452338 tacaagaataagtctcccacctaattctatccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccc 23452437  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  23452438 acaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 23452516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 42923510 - 42923788
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  42923510 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcactatatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggat 42923609  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||     
T  42923610 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccc 42923709  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42923710 tcaaaccctagtgtttgttcccaagagacaaactctatacaaatcctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 42923788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 13910046 - 13910323
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  13910046 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgggt 13910144  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  13910145 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagttccagtctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccc 13910244  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13910245 ataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 13910323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27105051 - 27104775
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27105051 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaatgttacaaa-gagaaatcaatgggt 27104953  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  27104952 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 27104853  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  27104852 acaaaccctagt-tttgtttcgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctgaacccttgttt 27104775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 45 - 314
Target Start/End: Original strand, 21520703 - 21520972
Alignment:
Q  45 agttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21520703 agttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaagaat 21520802  T
Q  145 aagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccct 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21520803 tagtctcccgcctaattctacccaaagtcctagcctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccctcaaaccct 21520902  T
Q  245 aatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21520903 agtgtttgttccaaagagacaaactctatacaagccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 21520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42064769 - 42064491
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaatt-gacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  42064769 tgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatggg 42064671  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42064670 ttacaagaataagtctcccgcctaattctatccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 42064571  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42064570 cacaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 42064491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42453034 - 42452759
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42453034 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 42452936  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  42452935 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 42452836  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||| ||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  42452835 acaaactctagtgtttgttac--agagacaaactttatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 42452759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19007894 - 19007616
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19007894 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 19007795  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||     
T  19007794 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagccccaatctcttcccataaccaagaaactcaattctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 19007695  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19007694 ttaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccataattttgttgttgcctttctaaacccttgttt 19007616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 22287337 - 22287615
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22287337 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaacgggt 22287436  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||     
T  22287437 tacaagaataagtctcccgcccaattctacccgaagtgtcaatctcttcccgtaactaagagactcaatcctaataccgtttcccaaggtgaatcaaccc 22287536  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22287537 tcaaaccctaatgtttgttccaaagagacagactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22287615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28196889 - 28196613
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||| |  |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  28196889 tgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggt 28196792  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  28196791 tacaagaataaatcttccgcctaattctacccaaagcctcaatctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 28196692  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  28196691 ttaaaccctaatgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacctttgttt 28196613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 313
Target Start/End: Original strand, 11739560 - 11739838
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||     
T  11739560 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatgga 11739659  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11739660 ttccaagaataattctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcctataaccaagagaatcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 11739759  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
     ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11739760 ctcaaaccctagcgtttgttccaaagagacaaactccatacaaaccctaattttgttgttgtctttctaaacccttgtt 11739838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 35215587 - 35215865
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  35215587 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgagt 35215685  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35215686 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaaactcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 35215785  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35215786 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 35215865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 35217964 - 35218242
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  35217964 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaacgggt 35218062  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35218063 tacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 35218162  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35218163 cacaaaccctagtgtttgctcctaagagacaaactctatataaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 35218242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 40032054 - 40032337
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaa----tcaa 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||| |||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||||||    ||||    
T  40032054 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagagaaagatatcaa 40032153  T
Q  131 tgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032154 tgggttacaagaataagtctcacgcctaattctacccaaagtcctaacctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 40032253  T
Q  231 taccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  40032254 aaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 40032337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17848694 - 17848419
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17848694 tgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgg-t 17848596  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  17848595 tacaagaataagtctcccgcct---tctacccaaagcctcaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaagtgaatcaaccc 17848499  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17848498 tcaaacccaagtgtttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttctaaaccctcgttt 17848419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 314
Target Start/End: Original strand, 15539553 - 15539754
Alignment:
Q  113 ttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatag 212  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15539553 ttacaaaagatatatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtaaccaagagaatcaatcctaatag 15539652  T
Q  213 tgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539653 tgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaaccctaattttgttgttgtcattctaaacccttgt 15539752  T
Q  313 tt 314  Q
    ||    
T  15539753 tt 15539754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 6258818 - 6259094
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6258818 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatggg-gagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 6258916  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6258917 ttacaagaataagtctcccacctaattctacccaaagccccaatct--tcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 6259014  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  6259015 ctcaaaccctagtgtttattccaaatagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcctttctaaactcttgttt 6259094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 24162224 - 24162491
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24162224 tgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatccaatccactatatgatgagtagcattacaaa-gagaaatcaatgggt 24162322  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||     
T  24162323 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccca----------gcaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 24162412  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24162413 acaaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 24162491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 43623581 - 43623847
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43623581 tgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 43623680  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  43623681 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatattgtttcccaaggtgaatcaaccc 43623780  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |            ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  43623781 tcaaaacctagt------------gagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaaccattgttt 43623847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 6264149 - 6264424
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6264149 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggg 6264248  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6264249 ttacaagaataagtctcccgtctaattctatccaaagccccaatcttttatcgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 6264348  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
     |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||     |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  6264349 ctcaaaccctagtgtttgtaccaaagagacaaactctatacaaacc----ctttgttgttgcctttctaaacctttgttt 6264424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 58 - 314
Target Start/End: Original strand, 45239000 - 45239255
Alignment:
Q  58 ttgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcct 157  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45239000 ttgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtatcccgctt 45239099  T
Q  158 aattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttccc 257  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  45239100 aattctaccaaaaaccccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttgcc 45239199  T
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||    
T  45239200 aa-agagaaagtctatacaaaccctagttttgtttttgtctttctaaatcattgttt 45239255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14837514 - 14837249
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaaga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14837514 cagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaaga 14837415  T
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14837414 ataagtcccccgcctaattctacttaaagtctcaatctcttccc------aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccctcaaacc 14837321  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  14837320 ctagtgtttgttccaaagagacaaactatgtacaaaccctagttttgttgttgtcttttttaacccttgttt 14837249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 36 - 315
Target Start/End: Original strand, 44289068 - 44289348
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  || |||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||| |||    
T  44289068 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaacggg 44289167  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    |||||||||||||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44289168 ttacaagaataagttttccacttaattctaccctaagtcccaatctcttcccgtaaccaagtgactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 44289267  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
     |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  44289268 ctcaaaccctagtgtttgttgccaagagacagactctatacaaactctagttttgttgttgccttcctaaacctttgtttt 44289348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 240
Target Start/End: Original strand, 5375347 - 5375550
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5375347 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactatatgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggt 5375446  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  5375447 tacaagaataagtct-ccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaaccc 5375545  T
Q  236 tcaaa 240  Q
    |||||    
T  5375546 tcaaa 5375550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 51 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17849356 - 17849093
Alignment:
Q  51 gtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc 149  Q
    ||||||||||||||||| |    ||||||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17849356 gtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagccc-ccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtc 17849258  T
Q  150 tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgt 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  17849257 tcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttaccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttctcaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgt 17849158  T
Q  250 ttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17849157 ttcttccaaagaggcaaactctatacgaactctagttttgttgttatctttctaaacccttgttt 17849093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 34979578 - 34979858
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagag-agagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | |  | | |||| |||| | || ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  34979578 tgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataatgatgaggaaccttacaaaagagatataaatgg 34979677  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34979678 attacaagaataagtctcccgcctaattctaccgaaagtccgaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcttaatagtgtttcccaaggtgaatcaac 34979777  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  | |||||||| |||||||    
T  34979778 cctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactttatacaaaccctagtttttttgttacctttctaaacgcttgttt 34979858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 77 - 314
Target Start/End: Original strand, 11578150 - 11578383
Alignment:
Q  77 agagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 175  Q
    ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578150 agagcagccctccgttcgactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc 11578249  T
Q  176 aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatac 275  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | |||||||  ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  11578250 aatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccgaggtgaatcaacc--ccaacccta--gtttgttgccaagagaaaaattctatac 11578345  T
Q  276 aaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  11578346 aaaccctagtttttttgttgac-ttctaaacccttgttt 11578383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 36558865 - 36559047
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36558865 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 36558963  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36558964 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36559047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 36561142 - 36561324
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36561142 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggt 36561240  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36561241 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 36561324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3022426 - 3022139
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata----------tgatgagtaacgttacaaaagagaa 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | | || ||||          ||||||||||| ||| ||| ||||     
T  3022426 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcattataacgatgataatgatgagtaactttataaa-gagat 3022328  T
Q  126 atcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggt 225  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3022327 attaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacctaaaacctcaatctcttccggtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcctaaggt 3022228  T
Q  226 gaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  3022227 gaatcaaccctcaaaccgtagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttataaacccttgttt 3022139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 43 - 314
Target Start/End: Original strand, 31732784 - 31733044
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||| | ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31732784 ccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaag 31732883  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaac 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  31732884 aataagtctcccacctaattctacccaaagtcccaa------------accaagagactcaatcctaacagtgtttcccaacgtgaatcaaccctcaaac 31732971  T
Q  242 cctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  31732972 cttagtgtttgttgccaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 31733044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 36 - 281
Target Start/End: Original strand, 28459191 - 28459436
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggg 134  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  28459191 tgtttatctagttcgatccaaattgacctagtctaggt-agagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaaaaaagagatatcaatggg 28459289  T
Q  135 ttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28459290 ttacaagaataagtctcccacctaattatacctgaagccccaaactcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttgccaaggtgaatccacc 28459389  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacct 281  Q
     ||||| |||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28459390 ctcaaatcctagtttttgttgccaagagacaagctctatacaaacct 28459436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 315
Target Start/End: Original strand, 20146647 - 20146885
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20146647 gagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaagagttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaaat 20146746  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |  | |||| || |||||||| ||||| | |||||||||    
T  20146747 ctcaatcttttcccgtgaccaagagactcaatcctactattgtttcccaaggtgaatcaatc--ccaaccatagtgtttgttgccaag-ggcaaactcta 20146843  T
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  20146844 tacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgtttt 20146885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Original strand, 45332182 - 45332364
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  45332182 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaattcactatatgatgagtacctttacaaa-gagaaatcaatgggt 45332280  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45332281 tacaataataagtctcccgcctaattctacccaaagtcctaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 45332364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Original strand, 17897284 - 17897519
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17897284 gagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaataagtctcccgcctaattctactcaaaat 17897383  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    | |||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  |||| |||||||| | ||||| |||||||||    
T  17897384 ctcaatcttttctcatgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaatc-tcaa--cctagtgtttgttgcgaagag-caaactcta 17897479  T
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtt 313  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  17897480 tacaaaccctagttttattgttgac-ttctaaacccttgtt 17897519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 74 - 280
Target Start/End: Original strand, 18800352 - 18800555
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    ||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18800352 gagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctccctcctaattctacccaaagc 18800451  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||    
T  18800452 cccaatctcttcctgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaac---ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caacctcta 18800547  T
Q  273 tacaaacc 280  Q
    ||||||||    
T  18800548 tacaaacc 18800555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 22874374 - 22874137
Alignment:
Q  47 ttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaata 145  Q
    ||||||||||||||||||||| |    |||||||||||  || | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22874374 ttcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaaaaata 22874275  T
Q  146 agtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||   | |||| ||    
T  22874274 agtctcccacctaattctaccgaaagcctcaatctcttcccgtgactaagagactcaatcctaatactgttttccaaggtgaatcaac---ccaaccata 22874178  T
Q  246 atgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttt 287  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22874177 gtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttt 22874137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 177
Target Start/End: Original strand, 22407455 - 22407596
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22407455 tgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggt 22407554  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaa 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22407555 tacaagaataagtctcccccctaattctaccaaaagtcccaa 22407596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38020349 - 38020178
Alignment:
Q  133 ggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatct 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||           |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  38020349 ggttacaaaaataagtctcccgcctaattctacccaaagcccccaat-----------accaagagactcaatcctaatagtgtttaccatggtgaatca 38020261  T
Q  232 accatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  38020260 accctcaaaccctagtgtttgtttccaagagacaaactctacacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 38020178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Original strand, 7462950 - 7463077
Alignment:
Q  38 ttgatccagttcggtccaaa-ttgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggtt 136  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7462950 ttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatataatgggtaacgttacaaaagagaaatcaatgagtt 7463049  T
Q  137 acaagaataagtctcccgcctaattcta 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7463050 acaagaataagtctcccgcctaattcta 7463077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40699606 - 40699428
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 156  Q
    ||||||||||| |  || |||||| || || | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |   ||    
T  40699606 tgacctagtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaaaaataagtcttcaaacc 40699507  T
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40699506 taattctacccaaagtcccaatctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacca 40699428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35107539 - 35107294
Alignment:
Q  47 ttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaat 144  Q
    |||||||||| | ||||||||||| | | ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||||||    
T  35107539 ttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttccactataatgatgagtaacattacaaaagagataacaaagg-ttacaagaat 35107441  T
Q  145 aagtctcccgc--ctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    |||||| |     |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |  | ||||    
T  35107440 aagtcttcaaaatctaattctacccaaagtcacaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaataatgtttctcaaggtgaatcaatc--ccaacc 35107343  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttg 295  Q
    |   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  35107342 c---tgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttg 35107294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 282
Target Start/End: Original strand, 27136195 - 27136370
Alignment:
Q  105 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaa 203  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||    
T  27136195 gagtaactttacaaaagagatatcaatgagttacaagaataagtctccaaacctaattctactcaaagtcccaatttctttccgtgaccaagagattcaa 27136294  T
Q  204 tcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaacctt 282  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||  | ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  27136295 tcctaatagtgttttccaagatgaatcaacc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caagctctatataaacctt 27136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 100 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20589881 - 20589763
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20589881 atgatgagtaacttcacaaaagagatatcaatgggttaaaagaataagtctccaaacctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtgaccaagaga 20589782  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  20589781 ctcaatcctaacagtgttt 20589763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 314
Target Start/End: Original strand, 22163106 - 22163226
Alignment:
Q  193 aagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttg 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  22163106 aagagactcaa-cctaatagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttctaaagagacaaactctatacaaaccctagtgttgttg 22163204  T
Q  293 ttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| | ||||||| ||||||||    
T  22163205 ttgcctttctaaatccttgttt 22163226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 314
Target Start/End: Original strand, 22407591 - 22407688
Alignment:
Q  217 tcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22407591 tcccaaggtgaatcaaccctcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 22407688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 154
Target Start/End: Original strand, 22707752 - 22707872
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaga--agagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || | | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22707752 tgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcactatatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgg 22707851  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccg 154  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22707852 gttacaagaataagtctcccg 22707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 245
Target Start/End: Original strand, 38414194 - 38414289
Alignment:
Q  148 tctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacccta 245  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38414194 tctcccgcctaattctaccaaaagtcccaatcttttcc-gtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc-tcaaacccta 38414289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 43139564 - 43139355
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagaga 198  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||   | |||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  43139564 atgatgagtaactttacaaa-gagaaatcaaaaggttacaataattagtctttagacctaattctacctaaagtctcaatatcttcccgtgaccaagaga 43139466  T
Q  199 ctcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtca 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | | || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||  ||||||  ||||| |     
T  43139465 ctcaatcctaataatgtttcccaagatgaatcaatc-tc-aaccctagtgtttgttgccaagag-caaactc--tacaaacccaagtttttgtgttggc- 43139372  T
Q  299 ttctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||||||||||    
T  43139371 ttctaaacccttgtttt 43139355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 236 - 314
Target Start/End: Original strand, 5377630 - 5377708
Alignment:
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5377630 tcaaaacctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 5377708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Original strand, 37962949 - 37963134
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaag 141  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||| |  | | | ||||||| |||||| |||| ||||||||   |||||||||| |||||||    
T  37962949 ccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataactttacaaaa---aaatcaatggattacaag 37963045  T
Q  142 aataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||    
T  37963046 aataagtctctcgtctaattctacccaaagcctcaatctcttcaggtgaccaagagactcaatctcaataatgttttctaaggggaatc 37963134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15694094 - 15693961
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagag 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  15694094 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaaggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcccaaatctcttcctgtgaccaagag 15693995  T
Q  198 actcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  15693994 actttatcctaatagtgtttctccacggtgaatc 15693961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17921833 - 17921756
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17921833 cctaattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcttcaaggtgaatc 17921756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 124
Target Start/End: Original strand, 22163023 - 22163111
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 124  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163023 tgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23871054 - 23870951
Alignment:
Q  52 tccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctc 151  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  23871054 tccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactatatgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaagaataagtctg 23870955  T
Q  152 ccgc 155  Q
    ||||    
T  23870954 ccgc 23870951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 28458949 - 28459011
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28458949 cctaattctacccaaagtcccaatatctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 28459011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 194
Target Start/End: Original strand, 13828342 - 13828503
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtcca-aattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||| | | | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  13828342 tgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatcaaagg 13828441  T
Q  134 gttacaagaataagtc-tcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaa 194  Q
    | |||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  13828442 gctacaagaataagtcttcaaacataattctacccaaagtctgaatctcttcccgtgaccaa 13828503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 175 - 230
Target Start/End: Original strand, 27583479 - 27583534
Alignment:
Q  175 caatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27583479 caatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatc 27583534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2741002 - 2740941
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741002 cctaattctacccaa-gtcccaacctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2740941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26345738 - 26345664
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26345738 taattctacccaaagtctcgaatctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgtttgctaaggtgaatc 26345664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2736266 - 2736205
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2736266 cctaattctacc-aaagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 2736205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 10942634 - 10942696
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10942634 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10942696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 218
Target Start/End: Original strand, 10948503 - 10948565
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc 218  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10948503 taattctacccaaagtcccgaatttcttcccgtgacaaagagactcaatcctaatagtgtttc 10948565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17462497 - 17462436
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17462497 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 17462436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 20054886 - 20054947
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20054886 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20054947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 22712637 - 22712698
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22712637 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22712698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 22717346 - 22717407
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22717346 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 22717407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39687044 - 39686983
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39687044 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39686983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45567470 - 45567409
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45567470 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 45567409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 230
Target Start/End: Original strand, 34575230 - 34575306
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtgaatc 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34575230 cctaattctacccaaagtcccgaatct-ttcccgagaccaagagactccatcctaatagtgtttctccaaggtgaatc 34575306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7503052 - 7502981
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaa-tctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaaggtg 226  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7503052 taattctacccaaagtctcaaatctcttcccttgaccaagatactcaatcctaatagtgtttctccaaggtg 7502981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 12781342 - 12781400
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12781342 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 12781400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17932695 - 17932637
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17932695 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17932637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17943598 - 17943540
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17943598 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 27517760 - 27517818
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27517760 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 27517818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 30479055 - 30478997
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  30479055 cctaattctacccaa-gtcccagtctcttcccgtgatcaagagactcaatcctaatagtg 30478997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35028707 - 35028595
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcc 256  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | | || ||||||| |||||||| |    
T  35028707 taattctacccaaagtgtcaatctcttctcgtgatcaagagactcaatcataatagtgttttccaatgcgaatcaatc-tc-aaccctagtgtttgttac 35028610  T
Q  257 caagagacaaactcta 272  Q
    |||||| |||||||||    
T  35028609 caagag-caaactcta 35028595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 230
Target Start/End: Original strand, 30720703 - 30720809
Alignment:
Q  127 tcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttc-ccaag 223  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30720703 tcaaagggttacaagaattagtcttcaaacctaattctacccaaagtcacgaatctcttctcgtgccaaagagactcaatcctaatagtgtttctccaag 30720802  T
Q  224 gtgaatc 230  Q
     ||||||    
T  30720803 atgaatc 30720809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33604138 - 33603994
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cctaattctacccaaag 171  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||||  ||||| |||||| ||||| |   ||||||||| || ||||    
T  33604138 gagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa-gatatatcaaaaggttagaagaattagtcttcaaacctaattcttcctaaag 33604040  T
Q  172 tcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    || ||||| |||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||    
T  33604039 tctcaatcacttcccatgaccaaaagactcaattataatagtgttt 33603994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 37170873 - 37170931
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37170873 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccatgaccaagagactcaatcctaatagtg 37170931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 211
Target Start/End: Original strand, 41303155 - 41303210
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaata 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  41303155 taattctacccaaagtcccgaatctcttcctgtgaccaagagacttaatcctaata 41303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 208
Target Start/End: Original strand, 27248021 - 27248075
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtccca-atctcttcccgtaaccaagagactcaatccta 208  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27248021 cctaattctacccaaagtcctggatctcttcccgtgaccaagagactcaatccta 27248075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39680106 - 39680045
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39680106 cctaattctacccaa-gtctcagcctcttctcgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 39680045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38191045 - 38190997
Alignment:
Q  169 aagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  38191045 aagtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcttaatagtgttt 38190997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 20050166 - 20050204
Alignment:
Q  179 ctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050166 ctctttccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 20050204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 315
Target Start/End: Original strand, 41304596 - 41304668
Alignment:
Q  239 aaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgtttt 315  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||   || |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41304596 aaccctaatgtttgttgccaatagaaaa---ctttacaaaccctagttttgttgttggc-ttctaaacccttgtttt 41304668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 214
Target Start/End: Original strand, 33674551 - 33674584
Alignment:
Q  181 cttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33674551 cttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 33674584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45158369 - 45158308
Alignment:
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||    
T  45158369 taattctactcaaagtcctgaatctcttcccgtgaccaagagactatatcctaacagtgttt 45158308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 183642 - 183919
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  183642 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggt 183741  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  183742 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctctt-ccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 183840  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  183841 tcaaaccctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaactctagttttgttgttgcctttctaaacctttgttt 183919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52300 - 52020
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaga--agagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgg 133  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  52300 tgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatga 52201  T
Q  134 gttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctac 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  52200 gttacaagaaaaagtctcccacctaattctatccaaagtcacaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaat 52101  T
Q  234 catcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    | |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52100 cctcaaaccctagtgtttgttccaaaaagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgccattctaaacccttgttt 52020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6478 - 6208
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6478 cagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 6380  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac-tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||    
T  6379 taaatctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagacttcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaacc 6280  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||    
T  6279 ctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgcttttctaaacccttgttt 6208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4282 - 4006
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4282 tgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctggg-gagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggt 4184  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  4183 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcttcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaagatgaatcaaccc 4084  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4083 tcaaaccctagtgttagttccaaagagacaaact-tatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 4006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 44 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3158 - 2889
Alignment:
Q  44 cagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaa 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3158 cagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggttacaagaa 3060  T
Q  144 taagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  3059 taagtctcccgcctaattctacccaaagtccaagcctcttcccataaccaagagactcaatcctaatagtgttttccaaggtgaatcaacccacaaaccc 2960  T
Q  244 taatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2959 tagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 176; Significance: 9e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 328 - 50
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  328 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatatgatgagtttcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 230  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactc-aatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  229 tacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtctcaatctcttcacgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacc 130  T
Q  235 atcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  129 cacaaaccctagtgtttgttcctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcttttctaaacccttgttt 50  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29457 - 29180
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  29457 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtattgttacaaa-gagaaatcaatgagt 29359  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||     
T  29358 tacaagaataagtctcctgcctaattctactcaaagccccaacctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtatcccaaggcgaatcaaccc 29259  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
      |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  29258 ataaaccctagtgtttgttccgaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttttaaacccttgttt 29180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 80146 - 79868
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  80146 tgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactatatgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaatgagt 80047  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  80046 tacaggaataagtctcctgcctaat-ctacccaaagccccaatctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 79948  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgtt-cccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  79947 tcaaaccctaatttttgttgccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttattgttgtctttctaaacccttgttt 79868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Original strand, 188363 - 188424
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  188363 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 188424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 36 - 256
Target Start/End: Original strand, 1454 - 1673
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1454 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatatgatgagtatcgttacaaa-gagaaatcaatgggt 1552  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctacca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  1553 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaaccc 1652  T
Q  236 tcaaaccctaatgtttgttcc 256  Q
     ||||||||| ||||||||||    
T  1653 acaaaccctagtgtttgttcc 1673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2290 - 2051
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtc 173  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2290 gagagagtagccctccgattcactatatgatgaggaacgttacaaaagagaaattaatgggttacaagaataagtttcccgcctaattctacccaaagtc 2191  T
Q  174 ccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctat 273  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||| |    
T  2190 ccagccttttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatcaacccacaaaccctagt-tttattccgaagagacaaactctgt 2092  T
Q  274 acaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2091 acaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 54 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 85500 - 85239
Alignment:
Q  54 caaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcc 152  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85500 caaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctcc 85401  T
Q  153 cgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttg 252  Q
    || || ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||||||    
T  85400 cgtctgattctactcaaagtcacaatctcttctcgtaaccaaaagactcaatcctagtagtgttttccaaggtgaatcaaccctcaaactttagtgtttg 85301  T
Q  253 ttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  85300 ttgctaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgtctttttaaatccttgttt 85239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 310
Target Start/End: Original strand, 15828 - 16093
Alignment:
Q  43 ccagttcggtccaa-attgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 140  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |   ||||||||| | |||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15828 ccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcctccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15927  T
Q  141 gaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaa 240  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| || ||    
T  15928 gaataagtctctcgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtttttcgcaaggtgaatcaacc-tc-aa 16025  T
Q  241 ccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaaccctt 310  Q
    ||||| |||||||| | | ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  16026 ccctagtgtttgttgctaggag-caaactctatacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaaccctt 16093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35819 - 35648
Alignment:
Q  143 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaacc 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  35819 ataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccagcctcttcccgtaaccaagagacttaatcctaatagtgtttccctaggtgaattaaccctcaaacc 35720  T
Q  243 ctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  35719 ctagtgtttgttccaaagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 35648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 35881 - 35817
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactata 100  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  35881 tgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccactata 35817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 315
Target Start/End: Original strand, 16716 - 16926
Alignment:
Q  100 atgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagac 199  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  16716 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataagtctctggcctaattctacccaaagtctcaatctcttcccgtcaccaagtgac 16815  T
Q  200 tcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcat 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |  | ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  16816 tcaatcctaatagtgtttcctaaggtgaatcaatc--ccaaccctagtgtttgttgccaagag-caaactctatacaaaccctagttttg-tgttgtctt 16911  T
Q  300 tctaaacccttgtttt 315  Q
    || |||||||||||||    
T  16912 tc-aaacccttgtttt 16926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22402 - 22221
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22402 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgagt 22304  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22303 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 22221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 36 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24677 - 24496
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggt 135  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24677 tgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactatttgatgagtaacgttacaaa-gagaaatcaatgagt 24579  T
Q  136 tacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagact-caatcctaatagtgtttc 218  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24578 tacaagaata-gtcttccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactccaatcctaatagtgtttc 24496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 314
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1910
Alignment:
Q  74 gagagagcagccatccgatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagt 172  Q
    |||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1681 gagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaagaataactctcccgcctaattctacccaaagt 1780  T
Q  173 cccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgtttcccaaggtgaatctaccatcaaaccctaatgtttgttcccaagagacaaactcta 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||          ||||||||    
T  1781 cccaatctcttcccgtgaccaagaaactcaatcctaattgtgtttcccaaggtgaatcaacca--caaccctagtgtttgtt---------gaaactcta 1869  T
Q  273 tacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  1870 tacaaaccctagttttcttgttgac-ttctaaacccttgttt 1910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5043 - 4911
Alignment:
Q  92 tccactata-tgatgagtaacgttacaaaa-gagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccgcctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgta 189  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |     
T  5043 tccactataatgatgagtatctttacaaaaagagatatcaatgggttacaaaaataagtctcccgcctaattctaccaaaagcttcaatctcttctcatg 4944  T
Q  190 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4943 accaagagactcaatcctaatagtgtttcccaa 4911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 59 - 217
Target Start/End: Original strand, 57452 - 57613
Alignment:
Q  59 tgacctagtctagaagagagagcagccatccgatccactatatga-tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaagaataagtctcccg-cc 156  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||  || | |||| ||||| | |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| |   ||    
T  57452 tgacctagtctgggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaaagggttacaagaatagatcttcaaacc 57551  T
Q  157 taattctacccaaagtccc-aatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  57552 taattccacccaaagtcccgaatctcttccaatgaccaagagattcaatcctaatagtgttt 57613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 258 - 314
Target Start/End: Original strand, 1054 - 1110
Alignment:
Q  258 aagagacaaactctatacaaaccttagttttgttgttgtcattctaaacccttgttt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1054 aagagacaaactctatacaaaccctagttttgttgttgcctttctaaacccttgttt 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 224880 - 224819
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtgttt 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  224880 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtgttt 224819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 16386 - 16328
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16386 cctaattctacccaa-gtcccagcctcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 16328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 85
Target Start/End: Original strand, 4680 - 4729
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctagaagagagagcagcc 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  4680 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 71
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1487
Alignment:
Q  36 tgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctag 71  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1452 tgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctag 1487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 17107 - 17165
Alignment:
Q  155 cctaattctacccaaagtcccaatctcttcccgtaaccaagagactcaatcctaatagtg 214  Q
    ||||||||||||||| |||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17107 cctaattctacccaa-gtcctagcttcttcccgtgaccaagagactcaatcctaatagtg 17165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University