View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2472-Insertion-5 (Length: 961)

Name: NF2472-Insertion-5
Description: NF2472
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2472-Insertion-5
NF2472-Insertion-5
[»] chr6 (77 HSPs)
chr6 (11-790)||(28185049-28185846)
chr6 (11-886)||(28180797-28181687)
chr6 (116-886)||(28226754-28227522)
chr6 (113-718)||(28234367-28234968)
chr6 (120-886)||(28325291-28326048)
chr6 (172-831)||(28242666-28243329)
chr6 (152-804)||(28297428-28298058)
chr6 (152-804)||(28514015-28514645)
chr6 (273-664)||(27337901-27338289)
chr6 (273-664)||(27398641-27399029)
chr6 (138-454)||(26341980-26342290)
chr6 (166-594)||(27718285-27718710)
chr6 (184-594)||(27610908-27611315)
chr6 (166-567)||(27724778-27725176)
chr6 (183-669)||(28139414-28139897)
chr6 (253-659)||(26949604-26950007)
chr6 (310-594)||(27677520-27677801)
chr6 (310-453)||(27678946-27679086)
chr6 (273-567)||(27592953-27593244)
chr6 (166-657)||(28786134-28786622)
chr6 (166-657)||(28792255-28792743)
chr6 (166-448)||(27698546-27698825)
chr6 (335-453)||(27706449-27706564)
chr6 (344-454)||(28149971-28150078)
chr6 (132-443)||(2184113-2184418)
chr6 (174-405)||(26893563-26893794)
chr6 (138-537)||(28098332-28098725)
chr6 (273-453)||(25579682-25579859)
chr6 (166-442)||(26802298-26802571)
chr6 (793-886)||(28185869-28185963)
chr6 (227-642)||(31284205-31284617)
chr6 (404-660)||(26848751-26849007)
chr6 (349-494)||(26823879-26824021)
chr6 (228-657)||(28781057-28781483)
chr6 (273-453)||(25481705-25481882)
chr6 (273-453)||(26142828-26143005)
chr6 (170-666)||(26936954-26937459)
chr6 (166-594)||(27604611-27605036)
chr6 (557-659)||(26635934-26636036)
chr6 (335-487)||(26646504-26646653)
chr6 (557-659)||(26741900-26742002)
chr6 (335-487)||(26752472-26752621)
chr6 (557-659)||(26959410-26959512)
chr6 (253-636)||(27214360-27214743)
chr6 (253-636)||(27234485-27234868)
chr6 (205-448)||(26622871-26623111)
chr6 (205-448)||(26728849-26729089)
chr6 (227-664)||(26861533-26861964)
chr6 (192-357)||(28491660-28491825)
chr6 (192-357)||(29804070-29804235)
chr6 (310-448)||(26055926-26056061)
chr6 (310-448)||(26075896-26076031)
chr6 (184-437)||(26884037-26884287)
chr6 (339-453)||(26048874-26048985)
chr6 (339-453)||(26070043-26070154)
chr6 (254-515)||(26811453-26811711)
chr6 (193-515)||(29825910-29826229)
chr6 (401-457)||(25071747-25071803)
chr6 (335-453)||(25538565-25538680)
chr6 (229-439)||(27531258-27531465)
chr6 (346-442)||(26656025-26656118)
chr6 (346-442)||(26761996-26762089)
chr6 (581-659)||(26975320-26975398)
chr6 (11-65)||(28149375-28149429)
chr6 (558-647)||(26617867-26617956)
chr6 (558-647)||(26723795-26723884)
chr6 (401-442)||(26975140-26975181)
chr6 (166-407)||(27229088-27229329)
chr6 (401-453)||(2184986-2185038)
chr6 (253-329)||(26617269-26617345)
chr6 (552-664)||(26656228-26656340)
chr6 (253-329)||(26723197-26723273)
chr6 (552-664)||(26762199-26762311)
chr6 (579-669)||(28098188-28098278)
chr6 (622-671)||(28150235-28150284)
chr6 (248-304)||(26848598-26848654)
chr6 (558-613)||(26811754-26811809)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (116-886)||(27252-28020)
scaffold0038 (113-718)||(34528-35130)
scaffold0038 (120-886)||(116606-117363)
scaffold0038 (172-831)||(42828-43491)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (96-869)||(57925-58683)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (177-515)||(3279555-3279893)
chr2 (232-329)||(17993852-17993949)
chr2 (562-649)||(17993535-17993622)
chr2 (579-659)||(3279969-3280049)
[»] chr4 (6 HSPs)
chr4 (172-515)||(5090939-5091279)
chr4 (166-487)||(18731504-18731822)
chr4 (166-668)||(18655296-18655795)
chr4 (166-504)||(18679550-18679885)
chr4 (166-487)||(18699400-18699718)
chr4 (166-487)||(18724085-18724403)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (166-453)||(3468-3753)
scaffold0349 (166-567)||(14289-14686)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (166-643)||(4528-5002)
scaffold0277 (228-515)||(13617-13901)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (273-515)||(268329-268568)
chr1 (343-453)||(28164396-28164503)
chr1 (337-453)||(28127713-28127826)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (273-453)||(29273817-29273994)
chr8 (187-369)||(31903728-31903910)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (205-392)||(22-209)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (205-392)||(7420-7607)
[»] scaffold0781 (1 HSPs)
scaffold0781 (132-246)||(102-213)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (166-369)||(16688867-16689070)
chr5 (580-674)||(16689290-16689384)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 594; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 594; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 790
Target Start/End: Original strand, 28185049 - 28185846
Alignment:
Q  11 aaatgggaaggaagtttaactcacgatggtctttggtcaatggatcctcttaagtttcacttcttgatttattttgaaaccctatatatacactcatcca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28185049 aaatgggaaggaagtttaactcacgatggtctttggtcaatggatcctcttaagtttcacttcttgatttattttgaaaccctatatatacactcatcca 28185148  T
Q  111 aattc------------------ttacttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatgga 192  Q
     ||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28185149 cattcttacttctcatactattcttacttcctttttattctctattctcatggctatgcttcaatcatccgtctcctcatcctcttccttctcctatgga 28185248  T
Q  193 ttcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaacct 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28185249 ttcacctatgacgtgttccttagctttagaggtagtgacactcgttatcgttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaacct 28185348  T
Q  293 tcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28185349 tcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 28185448  T
Q  393 ttatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtg 492  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28185449 ttatg---cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattaactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtg 28185545  T
Q  493 gaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgc 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28185546 gaaccttctcacgtgcgacatcacacgggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgc 28185645  T
Q  593 agaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatc---ctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacata 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28185646 agaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacata 28185745  T
Q  690 tgttatacttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgt 789  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28185746 tgtcatatctctttaatattctattatcttactgtttcatcttacggtttaaatagaatatattctttttattcttaacaagtgtaagttacttgtatgt 28185845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 567; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 886
Target Start/End: Original strand, 28180797 - 28181687
Alignment:
Q  11 aaatgggaaggaagtttaactcacgatggtctttggtcaatggatcctcttaagtttcacttcttgatttattttgaaaccctatatatacactcatcca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28180797 aaatgggaaggaagtttaactcacgatggtctttggtcaatggatcctcttaagtttcacttcttgatttattttgaaaccctatatatacactcatcca 28180896  T
Q  111 aattc------------------ttacttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatgga 192  Q
     ||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28180897 cattcttacttctcatactattcttacttcctttttattctctattctcatggctatgcttcaatcatccgtctcctcatcctcttccttctcctatgga 28180996  T
Q  193 ttcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaacct 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28180997 ttcacctatgacgcgttccttagctttagaggtggtgacactcgttatggttttactggaaatctcaatagagctctttgtgacaagggaatccgaacct 28181096  T
Q  293 tcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28181097 tcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataacatcatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 28181196  T
Q  393 ttatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtg 492  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28181197 ttatg---cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtg 28181293  T
Q  493 gaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28181294 gaaccttctcacgtgcgacatcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgc 28181393  T
Q  593 agaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgt 692  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  28181394 agaaatggaagattgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccaaatcaatcctaggtaccgtagtgcactcatgttttacattcaaacataggt 28181493  T
Q  693 tatacttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaa 792  Q
     ||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||| |   || |||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  28181494 gatatttcttgaatgttctattttcgaactgttttatcttatagttgaaataggtaatattaattttattcttaacaagtgtaaggtacttgtatgtcaa 28181593  T
Q  793 aacaatatttgaattgaatttacacaactattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgca-tttactc-aacttatttgattgggtag 886  Q
    | |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28181594 atcaatatttgaattgta-ttatacaactattattaa-aaattgatgtggttgagcatttatgatgtattttgctcaaacttatttgattgggtag 28181687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 886
Target Start/End: Original strand, 28226754 - 28227522
Alignment:
Q  116 ttacttcctttttattctctattctcat--ggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttcctt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28226754 ttacttcctttctattctctattctcatatggctatgcttcaatcatccgtctctcccccttcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttcctt 28226853  T
Q  214 agctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttc 313  Q
    || |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || | ||||||| | |||||||| |  || ||| | ||||| ||||||||||    
T  28226854 agttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttc 28226953  T
Q  314 aaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcatt 413  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  28226954 aaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttc---ttcttcatt 28227050  T
Q  414 ttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacat 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28227051 ttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggaaaatcggcgccttgttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcatgtgcgacat 28227150  T
Q  514 cacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctta 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  28227151 cacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgcagaaatggaagatggctctta 28227250  T
Q  614 ctcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctat 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28227251 ctcaaactgctaacttctctggccaccaaatcaatcctaggtaccgtagttcactcatgttttacattcttacatatgtcatacttctttaatattctat 28227350  T
Q  714 tttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaattt 813  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28227351 tttctaactatttcatctcactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaa-ttacttgtatgtcaaaacaatatttgaattgtattt 28227449  T
Q  814 acacaactattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactcaacttatttgattgggtag 886  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28227450 atacaactattattaataaattgatatgattgtgaatttgtgatgcatttactcaaattatttgattgggtag 28227522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 718
Target Start/End: Original strand, 28234367 - 28234968
Alignment:
Q  113 ttcttacttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttcct 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28234367 ttcttacttcctttttgttctctactctcatggctctgcttcaatcatccgtccccccctcttcttctttctcctatggattcacctatgacgtgttcct 28234466  T
Q  213 tagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagctt 312  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  28234467 tagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgacagggagctt 28234566  T
Q  313 caaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcat 412  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  28234567 caaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatg---cttcttcttcat 28234663  T
Q  413 tttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgaca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28234664 tttgcttggacgaacttgtccacatcatt-tatgcttcgaggaaaatagacgcctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgaca 28234762  T
Q  513 tcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctt 612  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28234763 tcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatggctctt 28234862  T
Q  613 actcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattcta 712  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||| || | ||  |||||||||  ||||    
T  28234863 actcaaacatctaacttttctggccaccatttcaatccagggtacaccaattccctcatatttttcattcatacaaatataatgtttctttaattctcta 28234962  T
Q  713 ttttct 718  Q
    ||||||    
T  28234963 ttttct 28234968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 886
Target Start/End: Original strand, 28325291 - 28326048
Alignment:
Q  120 ttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagcttt 219  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28325291 ttcctctttattcactactctcatggctctacttcaatcatccatctcttcctcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagtttt 28325390  T
Q  220 agaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggag 319  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |||||||   ||| |||| || |||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  28325391 agaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgag 28325490  T
Q  320 gtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgctt 419  Q
    |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  28325491 gtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatg---cttcttcttccttttgctt 28325587  T
Q  420 ggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgag 519  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28325588 ggatgaacttgtccacattattcactgcttcaaagaaaatgggcgcctagtttagccagttttctacgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacaag 28325687  T
Q  520 ggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28325688 ggcagttatggtaaagcactggccgagcatattgagaggtt----aatagcacggatagcatggagaggttgcagaaatggaagatggctcttactcaaa 28325783  T
Q  620 ctgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctattttcta 719  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||   ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28325784 ctgctaacttctcaggccaccatttcagtcctgggtaacctacttaactaatgttttgtgttcttacata---tatatttctttaattttctattttcta 28325880  T
Q  720 accgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaatttacacaa 819  Q
    |||| ||||||| ||  || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  28325881 accgattcatcttacagttgaaattggaaatattaattttattcttaacaagtgtaagttacttgtatgtcaaaacaatatttgaattgtattcatacaa 28325980  T
Q  820 ctattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactc-aacttatttgattgggtag 886  Q
    |  |||| || | |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28325981 cagttatcaacacattgatgttattgtgaatttgcgatgcatttactcaaacttatttgattgggtag 28326048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 172 - 831
Target Start/End: Original strand, 28242666 - 28243329
Alignment:
Q  172 tcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctcttt 271  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |||||    
T  28242666 tcctcttccctctcctatgggtttacctatgatgtcttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 28242765  T
Q  272 gtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggatttt 371  Q
    || | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28242766 gtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagagaacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 28242865  T
Q  372 cattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggtt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  || || || |||    
T  28242866 cattcctgtcttgtctatcaattatg---cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagtt 28242962  T
Q  472 ttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataaca 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||    
T  28242963 ttgccaattttctatgatgtggaaccttctaacgtgagacatcagattggcagttatggtaaagcactggctgagcatattgagaagttccaaaatagca 28243062  T
Q  572 aggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcat 671  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  28243063 cggataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctaactcaaacagctaacttctctggccaccatttcagttctaggtacaccacttaactcat 28243162  T
Q  672 gttttacattcttacatatgt---tat-----acttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattc 763  Q
    ||||  ||||||||||||  |   |||     | ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||  || |||| ||||||||||  |||||||    
T  28243163 gtttagcattcttacatagttacatataacacatttctttaattttctattttctaaccaattcatcttacagttgaaatagaaaatattaaatttattc 28243262  T
Q  764 ttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaatttacacaactattattaata 831  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  28243263 ttaacaagtgtaagttacttgtatg-caaaacaatatttgaattgtatttatacaactattatcaata 28243329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 152 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 28298058 - 28297428
Alignment:
Q  152 ctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctgg 251  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||    
T  28298058 ctcaatcatccatctcttcctcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattgg 28297959  T
Q  252 aaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggcc 351  Q
    |||||||   | || |||||||   |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||  |    
T  28297958 aaatctccacaaagatctttgtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcac 28297859  T
Q  352 attgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttca 451  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28297858 attgaagagactaggattttcattcctgtcttatctaccaattatgcttcttcttc---attttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttca 28297762  T
Q  452 aggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatat 551  Q
    |||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28297761 aggaaagtagccgtctagttttgccgattttttatgatgtggaaccttctcatgtgcgacatcaacatggaagttatgctaaagcactggatgatcatat 28297662  T
Q  552 aaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 651  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28297661 agagaagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 28297562  T
Q  652 gggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaata 751  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||                  |||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||||| |||||||    
T  28297561 aggtaccccacttcactcatgttttgcattctta------------------aatattctattttccaaccgtttcatcatattgtttaaatagaaaata 28297480  T
Q  752 ttatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttga 804  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  28297479 ttatttctattcttaacaagtgaaagtta-ttttatgtcaaaacaatatttga 28297428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 152 - 804
Target Start/End: Original strand, 28514015 - 28514645
Alignment:
Q  152 ctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctgg 251  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||    
T  28514015 ctcaatcatccatctcttcctcctcttccttctcctatggattcactcatgacgttttcctaagttttagaggtagtgacacacgctacagttttattgg 28514114  T
Q  252 aaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggcc 351  Q
    |||||||   | || |||||||   |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||  |    
T  28514115 aaatctccacaaagatctttgtaggaagggaattcgcaccttcattgatgacagagagcttaaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaagcac 28514214  T
Q  352 attgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttca 451  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28514215 attgaagagactaggattttcattcctgtcttatctaccaattatgcttc---ttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttca 28514311  T
Q  452 aggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatat 551  Q
    |||||||  | ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28514312 aggaaagtagccgtctagttttgccgattttttatgatgtggaaccttctcatgtgcgacatcaacatggaagttatgctaaagcactggatgatcatat 28514411  T
Q  552 aaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 651  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28514412 agagaagttccaaaataacaagaataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 28514511  T
Q  652 gggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaata 751  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||                  |||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||||| |||||||    
T  28514512 aggtaccccacttcactcatgttttgcattctta------------------aatattctattttccaaccgtttcatcatattgtttaaatagaaaata 28514593  T
Q  752 ttatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttga 804  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||    
T  28514594 ttatttctattcttaacaagtgaaagtta-ttttatgtcaaaacaatatttga 28514645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 273 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27338289 - 27337901
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||| || |||| || ||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27338289 tgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttg 27338190  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttt 472  Q
    |||||| | || |||   || ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||  ||  |||||    
T  27338189 attcccatattttctgcaaactatg---catcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttt 27338093  T
Q  473 tgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagca-ctggatgatcatataaagaagttccaaaataaca 571  Q
    ||||  ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||    || |||||||||  |||| ||   | | |||  | | ||||||||||||||||    
T  27338092 tgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggt-gagcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataaca 27337994  T
Q  572 aggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccactt 664  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  27337993 aggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccattttagtcaagggtaccccactt 27337901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 273 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 27399029 - 27398641
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || ||| || |||| || ||||  | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27399029 tgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaacgatcttgaaagaggagatgaaagcacaccatcacttgtcaaggccattgaagagtctaggattttg 27398930  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttt 472  Q
    |||||| | || |||   || ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||  ||  |||||    
T  27398929 attcccatattttctgcaaactatg---catcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaggggttgttcggttt 27398833  T
Q  473 tgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagca-ctggatgatcatataaagaagttccaaaataaca 571  Q
    ||||  ||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||    || |||||||||  |||| ||   | | |||  | | ||||||||||||||||    
T  27398832 tgcctgttttctatggtgcggatcctactcacgtacgacatcagactgggagttatggt-gagcatcttactaagcatgaagataagttccaaaataaca 27398734  T
Q  572 aggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccactt 664  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||  |||||||||||||    
T  27398733 aggaaaacatggagaggttgaagaaatggaagatggctcttacccaagctgctaacttctccggccaccattttagtcaagggtaccccactt 27398641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 138 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26342290 - 26341980
Alignment:
Q  138 tctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgc 237  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    ||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||   || |||||||    
T  26342290 tctcatggctatgctccaatcatcg---tcctctttctcttcattctcatatggattcacatatgatgtgttcctcaattttaggggcattggcactcgc 26342194  T
Q  238 tatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcat 337  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||   ||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  |||| | |  ||    
T  26342193 tatggttttactggcaatatctatagagctctatgtgacggtggagtccgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgacaaaatcacacaat 26342094  T
Q  338 cacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 437  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||||    
T  26342093 cacttgtcaaagccattgaagagtccaggattttcattccaattttctcaatcaactatgcttcttcttcgt---tttgtttggacgaacttgtccacat 26341997  T
Q  438 cattcgctgcttcaagg 454  Q
    |||||  ||||||||||    
T  26341996 cattcattgcttcaagg 26341980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 166 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27718710 - 27718285
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   |||||||||  |  ||||| | ||||||||||  |  |    
T  27718710 tcctcatcctcttcattctcccatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggcacagttttaccggaaatctctacaagg 27718611  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  27718610 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctag 27718511  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || ||     
T  27718510 gatttttattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgc 27718414  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  ||||||  |  ||||||||| || |||||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| ||||    
T  27718413 ctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaa 27718314  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcag 594  Q
    || | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27718313 atgataagaataacatggagaggttgcag 27718285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27611315 - 27610908
Alignment:
Q  184 tcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaa 283  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |  ||||||  |||||||||||    
T  27611315 tcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaa 27611216  T
Q  284 tccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtctt 383  Q
    |||  |||||||| |||||||  || |||| | |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||    
T  27611215 tccataccttcattgatgacaatgatcttccaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctaggatttttattcctgtgtt 27611116  T
Q  384 gtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttc 483  Q
     |||||||| ||||   | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||    
T  27611115 ttctatcaactatg---cctcttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttttgcctgttttc 27611019  T
Q  484 tatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatgg 583  Q
    |  |  ||||||||| || | |||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||    
T  27611018 ttcggcgtggaacctactaaagtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgataagaataacatgg 27610919  T
Q  584 agaggttgcag 594  Q
    |||||||||||    
T  27610918 agaggttgcag 27610908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27725176 - 27724778
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||   |||||||||  | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  27725176 tcctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaagg 27725077  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  27725076 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctag 27724977  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| ||||   | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || ||     
T  27724976 gatttttattcctgtgttttctatcaactatg---cctattcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgc 27724880  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  ||||||  |  ||||||||| || |||||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| ||||    
T  27724879 ctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaa 27724780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 669
Target Start/End: Original strand, 28139414 - 28139897
Alignment:
Q  183 ctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaaggga 282  Q
    ||||||||| ||||| || || || || || ||||| |||||  |||||||||| |  |||||  ||||||||||||  | ||||||| |||||   |||    
T  28139414 ctcctatggcttcacatacgatgtctttctcagcttcagaggcagtgacactcgtttcggtttcactggaaatctctacaaagctcttcgtgactgtgga 28139513  T
Q  283 atccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtct 382  Q
    ||||  || || || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | | |||||  | || ||||||||||| |||||||||||||| || || |    
T  28139514 atccacacttttattgatgatagggagcttcaaggaggtgacgaaatatcaccgtcactcgtaaaagccattgaagaatctaggattttcatccctgtgt 28139613  T
Q  383 tgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaatttt 482  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||  ||  || ||||||||||  ||||    
T  28139614 tttccatcaactatgcctcttcttcgt---tttgcttggacgaacttgtccacatcattgactgcttcaacacaaagggatgtttggttttgcctgtttt 28139710  T
Q  483 ctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatg 582  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | ||||||||    |   ||| |||| ||||| | | | | ||   |  ||||||||||||| | ||||||  ||||    
T  28139711 ctatggtgtggatccttctcacattcgacatcaaaccgaatgttttggtgaagcaatagctaagcaagaagtgaagttccaaaatcaaaaggatgacatg 28139810  T
Q  583 gagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactc 669  Q
    || |||||||  ||||||||  |||||||||   || | |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  28139811 gataggttgctaaaatggaaatgtgctcttaacaaagcagctaacttttctggccaccatttcaattttgggtaccccacttgactc 28139897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 253 - 659
Target Start/End: Original strand, 26949604 - 26950007
Alignment:
Q  253 aatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggcca 352  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||   |||||| ||||| | | | |||||  |||||   |    
T  26949604 aatctctataaagctctctctgacaagggaatccgaaccttcattgatgataaggagcttcagaaaggtgacgaaatcacaccttcactcctcaagagaa 26949703  T
Q  353 ttgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaa 452  Q
    ||||||| || || |||  ||||  |||||| ||||   | ||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  26949704 ttgaagaatcgagaattgccattatcgtcttttctaaggaatatgcttc---ttcttcattttgtttagacgaacttgtccatatcattcactacttcaa 26949800  T
Q  453 ggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatata 552  Q
    |||||  || || || ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    ||||||||| ||||||| | | | |||  |    
T  26949801 ggaaaaaggtcgccttgttctgccagttttctatgatgtagaaccttctcacgtgcgacatcagaattatagttatggtgaagcacttgctaagcatgaa 26949900  T
Q  553 aagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctg 652  Q
     ||| ||||||||| | |||  | | ||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |   ||  |||| |||| |||||| |||||||||||| ||    
T  26949901 gagaggttccaaaagagcaaaaaaaacatggagcggttgctgaaatggaagatagctctgaacaaagttgctgacttatctggctaccatttcaatcttg 26950000  T
Q  653 ggtaccc 659  Q
    |||||||    
T  26950001 ggtaccc 26950007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 310 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27677801 - 27677520
Alignment:
Q  310 cttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttctt 409  Q
    |||||| |||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| ||||   | |||||||    
T  27677801 cttcaaagaggggatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattgctgtgttttctatcaactatg---cctcttctt 27677705  T
Q  410 cattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcg 509  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||  || || || ||| ||||  |||||| || |||||||||| ||   |||||    
T  27677704 cattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgcctcgttctgcctgttttctttgctgtggaacctactattgtgcg 27677605  T
Q  510 acatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcag 594  Q
    ||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| |||||| |   | | ||||||||||||||||||    
T  27677604 acatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaatgatccgaaaagcatggagaggttgcag 27677520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 453
Target Start/End: Original strand, 27678946 - 27679086
Alignment:
Q  310 cttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttctt 409  Q
    |||||| |||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||    
T  27678946 cttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttctt 27679042  T
Q  410 cattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27679043 cattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 27679086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 27593244 - 27592953
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||  |  |||||| ||||  | ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27593244 tgacaagggaatcaacaccttcattgatgacaatggtcttcaaagaggaaatgaaatcacaccatcacttctcaaggccattgaagagtctaggattttt 27593145  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttt 472  Q
    ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||  ||  || || |  ||||    
T  27593144 attcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcgttttgtttggacgaacttgaccacatcattcattgctacaagacaaagggtcgccctgttt 27593048  T
Q  473 tgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaat 567  Q
    ||||  |||||| || |||||| |||||||| |||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| ||||||    
T  27593047 tgcctgttttctttggtgtggatccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaaat 27592953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 657
Target Start/End: Original strand, 28786134 - 28786622
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  28786134 tcctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaagg 28786233  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  28786234 ctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctag 28786333  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| || |   |  | ||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||  ||  || ||     
T  28786334 gatttttattcctgtgttttctatcaactacg---ccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgc 28786430  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  |||||| || ||| || ||| || | |||||||||||    ||  |||||||| ||||| ||| ||  |||  ||||| ||| ||||    
T  28786431 ctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaa 28786530  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtac 657  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||    
T  28786531 atgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcctgggtac 28786622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 166 - 657
Target Start/End: Original strand, 28792255 - 28792743
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  28792255 tcctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaagg 28792354  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  28792355 ctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctag 28792454  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| || |   |  | ||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||| ||||  ||  || ||     
T  28792455 gatttttattcctgtgttttctatcaactacg---ccacatcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgc 28792551  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  |||||| || ||| || ||| || | |||||||||||    ||  |||||||| ||||| ||| ||  |||  ||||| ||| ||||    
T  28792552 ctcgttttgcctgttttctttggtgtcgatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcgttatggtgaagcattggctgggcatgaaaagaggtttcaaa 28792651  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtac 657  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||  | ||||||||||    
T  28792652 atgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcctgggtac 28792743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 166 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 27698825 - 27698546
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||  | |||||| | || ||||| ||   |||||||||  | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  27698825 tcctcatccacttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaagg 27698726  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  27698725 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctag 27698626  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    |||||| ||||| || || ||| |||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27698625 gatttttattcctgtgttttctctcaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacataattcactgct 27698546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 335 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27706564 - 27706449
Alignment:
Q  335 catcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||  ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27706564 catcacttctcaaggccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctatcacctatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtcca 27706468  T
Q  435 catcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  27706467 catcattcactgctacaag 27706449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 344 - 454
Target Start/End: Original strand, 28149971 - 28150078
Alignment:
Q  344 tcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcg 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  28149971 tcaaggccattgaagagtccaggattttcattccaatcttctctatcaactatacttc---ttcttcattttgtttggacgaacttgtccacattattca 28150067  T
Q  444 ctgcttcaagg 454  Q
    |||||||||||    
T  28150068 ctgcttcaagg 28150078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 443
Target Start/End: Original strand, 2184113 - 2184418
Alignment:
Q  132 ctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgac 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| || || ||||||||| |   |||||||||| |||||||||| || || ||||| | ||||    
T  2184113 ctctattctcatggctatgccacaatcatcttcctcctcttcttcatcctcctccaa---attcacctataacgtgttcctaagtttcagaggagctgac 2184209  T
Q  232 actcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataa 331  Q
    |||||| |||||||| | || ||||| |     ||||| ||| | |  ||| |||  || |||| |||||||   ||||||||| |||| |  |||||||    
T  2184210 actcgccatggttttaccggcaatctttacgatgctctatgtaaaagtggagtccacactttcaaggatgacgaggagcttcaacgagggggtgaaataa 2184309  T
Q  332 tatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgt 431  Q
     | |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || || || || |  || ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2184310 cagcatcacttatgaaagccattgaagagtccagaattttcatccctgttttctcaaagaactatg---cttcttcttcattttgtttggacgaacttgt 2184406  T
Q  432 ccacatcattcg 443  Q
    ||||||||||||    
T  2184407 ccacatcattcg 2184418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 26893794 - 26893563
Alignment:
Q  174 ctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgt 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |  ||||||||   ||||||||| | ||||||| | ||  |||| | || ||||||||||    
T  26893794 ctcttcctcctcgtatggattcacctacgatgtcttcctcaattttagaggctctgacactcgttttggttttacgggtcatctttataaagctctttgt 26893695  T
Q  274 gacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttca 373  Q
    || |  ||||| |  |||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| |||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  26893694 gatagtggaattcacaccttcattgatgatacagagcttcatagaggtgacgaaatctcaccatcacttatcaaggcaattgaagagtctatgatataca 26893595  T
Q  374 ttcccgtcttgtctatcaattatgcttcttct 405  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||||||    
T  26893594 ttccagtcctctctatcaactatgcttcttct 26893563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 28098725 - 28098332
Alignment:
Q  138 tctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgc 237  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    ||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    ||||||||     
T  28098725 tctcatggctatgctccaatcatct---tcctctttctcttcattctcttatggattcacctatgacgtgtttcttaattttaggggcaccgacactcgg 28098629  T
Q  238 tatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcat 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||   ||| |||| |||||||| ||  | | ||| ||||| | ||||||   ||| | |  ||    
T  28098628 tatggttttactggaaatctctacaaagctctttgtgacggaggagtccgcaccttcattgaccataaagatcttcatgaaggtgatagaatcacacaat 28098529  T
Q  338 cacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 437  Q
    | ||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||  || ||||   |||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28098528 cccttgtcaaggccatcgaagagtccaggattttaattccggtcttctctaagaactatg---cttcttctttgttttgtttggatgaacttgtccacat 28098432  T
Q  438 cattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagca 537  Q
    ||||| | | | | | ||||  ||  |  | ||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||    
T  28098431 cattcaccgttacgaagaaaagggttgcttcgtttttcctattttttgtgacgtggaaccttctcacgtgcgacatcagacggggagttatggtgaagca 28098332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 453
Target Start/End: Original strand, 25579682 - 25579859
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||| |  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  25579682 tgacaagggaattcgtaccttctttgatgataatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggattttt 25579781  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25579782 attcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 25579859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 442
Target Start/End: Original strand, 26802298 - 26802571
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   ||||||||| || |||||| | || |||||||  |  |    
T  26802298 tcctcatcctcttcattttcttatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcactgacactcggtacggttttacgggcaatctctacaagg 26802397  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26802398 ctcttattgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctag 26802497  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattc 442  Q
     ||||| ||||| || || |||||||| ||||   | |||||   ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26802498 aatttttattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcaaaattttgcttggacgaacttgttcacattattc 26802571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 793 - 886
Target Start/End: Original strand, 28185869 - 28185963
Alignment:
Q  793 aacaatatttgaattgaatttacacaactattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactc-aacttatttgattgggtag 886  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||    
T  28185869 aacaatatttgaattgtatttatacaactattattaataaattgatgtggctgtgaatttgtgatgcacttaatcaaacttattttattgggtag 28185963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 642
Target Start/End: Original strand, 31284205 - 31284617
Alignment:
Q  227 gtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaaga 326  Q
    |||||||||| ||||||||  | || |||||||  |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||| || || |||||| |||| || ||    
T  31284205 gtgacactcggtatggtttcaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatagtgaacttcaaagaggggatga 31284304  T
Q  327 aataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaa 426  Q
    ||| | | |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||  ||| ||||   | ||||| || ||||| |||||||||    
T  31284305 aatcacaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggatttttatccccgtgttttctgccaactatg---cctcttcgtcgttttgtttggacgaa 31284401  T
Q  427 cttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagtt 526  Q
    |||||||||||||||| ||  |  ||| |||  || || || ||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||    || ||||    
T  31284402 cttgtccacatcattcacttgtataagcaaaatggtcgcctcgttttgcccgttttctttggcgtggatccttctcatgtgcgacatcatagaggtagtt 31284501  T
Q  527 atggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaa 626  Q
    ||||  ||||| ||| | | |||  | ||| ||||||| |||| |  |||   ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||||    
T  31284502 atggagaagcattggctaagcatgaagagaggttccaacataatacagatcatatggaaaggttgcaaaaatggaagatagctcttactcaagcagctaa 31284601  T
Q  627 cttctctggccaccat 642  Q
    ||| |||||| |||||    
T  31284602 cttgtctggcgaccat 31284617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 404 - 660
Target Start/End: Original strand, 26848751 - 26849007
Alignment:
Q  404 cttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctca 503  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||  |  ||||| | ||  |||||||||   | |||||||||||    
T  26848751 cttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgctccaaggaaaagggtagcatggttattcctgttttctatggcatagaaccttctca 26848850  T
Q  504 cgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaag 603  Q
     |||||||||||  |  | ||||||||| ||||||| | | | |||  | ||  ||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||    
T  26848851 tgtgcgacatcagaatagtagttatggtgaagcacttgctaagcatgaagaggtgtttcaaaataacaaggaaagcatggagcgtttgcgtaaatggaag 26848950  T
Q  604 agtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtacccc 660  Q
    |  |||||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26848951 aaagctcttaaccatgctgctaacttatctggccaccatttcaattttgggtacccc 26849007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 349 - 494
Target Start/End: Original strand, 26823879 - 26824021
Alignment:
Q  349 gccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  26823879 gccattgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctgccaactatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcgcgtct 26823975  T
Q  449 tcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtgga 494  Q
     ||||||||  ||||| || ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  26823976 acaaggaaaaggggcgcctcgttttgcctgttttctatggtgtgga 26824021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 657
Target Start/End: Original strand, 28781057 - 28781483
Alignment:
Q  228 tgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaa 327  Q
    |||||||||| | |||||| | || |||||||  |  ||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  28781057 tgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 28781156  T
Q  328 ataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaac 427  Q
    || | | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||   |  ||||   |||||||||||||||||    
T  28781157 atcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatg---ccacttcaaaattttgcttggacgaac 28781253  T
Q  428 ttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagtta 527  Q
    |||| ||||| ||||  |||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||| || |||||| ||| || | |||||||||||    ||   |||    
T  28781254 ttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatcatacaggtcctta 28781353  T
Q  528 tggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaac 627  Q
    |||| ||||| ||| ||  |||  ||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||| || ||| ||||||||    
T  28781354 tggtgaagcattggctggacatgaaaagaggtttcaaaatgataaggataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaac 28781453  T
Q  628 ttctctggccaccatttcaatcctgggtac 657  Q
    || || ||| ||||||  | ||||||||||    
T  28781454 ttgtccggctaccattctagtcctgggtac 28781483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 453
Target Start/End: Original strand, 25481705 - 25481882
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||| |  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||      
T  25481705 tgacaagggaattcgtactttcattgatgaaaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggatttgt 25481804  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25481805 attcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 25481882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 273 - 453
Target Start/End: Original strand, 26142828 - 26143005
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||| |  || ||| || |||| || ||||| | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  26142828 tgacaagggaattcgtactttcattgatgataatgatcttgaaagaggagatgaaatcacaccatcacttgtcaaggccattgaagaatctaggattttt 26142927  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26142928 attcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 26143005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 666
Target Start/End: Original strand, 26936954 - 26937459
Alignment:
Q  170 catcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctct 269  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||    ||||||||||    ||||  |||  |||| |  | ||||||    
T  26936954 catcatcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttcctcagtttcagaggcaccgacactcgcttccattttattggtcatctttacaaagctct 26937053  T
Q  270 ttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggatt 369  Q
    ||||||    ||||| || |||||||| |||||||  ||||| || ||||| |||||||| | | |||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||    
T  26937054 ttgtgattgtggaattcgcaccttcattgatgacaaggagctccatggaggagaagaaatcacaccatcacttgtcaaggcaattgaagattccgggatt 26937153  T
Q  370 ttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctgg 469  Q
      ||| || || || |||||||| |||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  ||  || | |||      
T  26937154 gccatacctgtattctctatcaactatgccacttcttc---attttgtttggacgaacttgtccacatcgttgactgcttcaagacaaaaggtcatctaa 26937250  T
Q  470 ttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataa-agaagttccaaaata 568  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    || |||||||||  |||| | | | | || |||| |||||||  ||||||    
T  26937251 ttttgcctattttctatgaagtggatccttctcacgttcgacaccaaactgggagttatggtgcagcattagctaaaca-ataacagaagtttaaaaata 26937349  T
Q  569 acaagga------------tagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggta 656  Q
    |||| ||            || |||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26937350 acaatgaaaagtacataggtaacatggagaggttgcggaaatggaagatagctcttaaccaagcggcaaacttgtctggccaccatttcaatcttgggta 26937449  T
Q  657 ccccacttca 666  Q
    | ||| ||||    
T  26937450 caccatttca 26937459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 27605036 - 27604611
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||   ||||||||| || |||||| | || |||||||  |  |    
T  27605036 tcctcatcctcttcattttcctatgcattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcgatacggttttaccggcaatctctacaagg 27604937  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  |||||||||||| |  |||||||| ||||| |  || |||| | |||| || ||||| | | || ||||| ||||||||||||| || || ||    
T  27604936 ctcttactgacaagggaattcataccttcattgatgaaaatgatcttcgaagaggagatgaaatcacaccagcacttctcaaggccattgatgaatccag 27604837  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| || |  ||  || ||     
T  27604836 gatttttattcctgtgttttctatcaaatatg---cctcttcttccttttgtttggatgaacttgttcacatcattcattgctacacgacaaagggtcgc 27604740  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
     | ||||||||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||| ||||| ||| ||| |||| ||| | ||| ||||    
T  27604739 gtcgttttgcctgttttctttggtgtggaaccttctcatgtgcgacatcataaaggtagttacggtcaagcattggctgagcataaaaaaaggtttcaaa 27604640  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcag 594  Q
    || |  |||||| |||  |||||||||||    
T  27604639 atgatgaggataacataaagaggttgcag 27604611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 557 - 659
Target Start/End: Original strand, 26635934 - 26636036
Alignment:
Q  557 agttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggta 656  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26635934 agtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccaccatttcaatcttgggta 26636033  T
Q  657 ccc 659  Q
    |||    
T  26636034 ccc 26636036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 487
Target Start/End: Original strand, 26646504 - 26646653
Alignment:
Q  335 catcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||     |||||| |||||||||||||||||    
T  26646504 catcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaa---attttgtttggacgaacttgtcca 26646600  T
Q  435 catcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatg 487  Q
    ||||||||  |||| ||||  ||  || ||||| ||||||||  |||||||||    
T  26646601 catcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatg 26646653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 557 - 659
Target Start/End: Original strand, 26741900 - 26742002
Alignment:
Q  557 agttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggta 656  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26741900 agtttcaaaatagcaaggaaaacatggagtggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccaccatttcaatcttgggta 26741999  T
Q  657 ccc 659  Q
    |||    
T  26742000 ccc 26742002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 487
Target Start/End: Original strand, 26752472 - 26752621
Alignment:
Q  335 catcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||     |||||| |||||||||||||||||    
T  26752472 catcactcatcaaggccattgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactatgcctcttctaa---attttgtttggacgaacttgtcca 26752568  T
Q  435 catcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatg 487  Q
    ||||||||  |||| ||||  ||  || ||||| ||||||||  |||||||||    
T  26752569 catcattcattgctacaagacaaagggtcgtctcgttttgcccgttttctatg 26752621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 557 - 659
Target Start/End: Original strand, 26959410 - 26959512
Alignment:
Q  557 agttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggta 656  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26959410 agtttcaaaatagcaaggaaaacatggagcggttgctgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccaccatttcaatcttgggta 26959509  T
Q  657 ccc 659  Q
    |||    
T  26959510 ccc 26959512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 636
Target Start/End: Original strand, 27214360 - 27214743
Alignment:
Q  253 aatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggcca 352  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||| | ||| || ||   ||||   |    
T  27214360 aatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacatcttcgctccacaagaaaa 27214459  T
Q  353 ttgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaa 452  Q
    ||||||| || |||||||   ||   || || ||    || ||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  27214460 ttgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatg---ctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaa 27214556  T
Q  453 ggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatc---acgagggcagttatggtaaagcactggatgatcat 549  Q
    |||||  || || || ||| | ||  |||||||||  || |||||||||||| |||||||||   || |   |||||||||| |||| || | | | |||    
T  27214557 ggaaaaaggtcgccttgttctacctgttttctatggcgttgaaccttctcacttgcgacatctgaacaacaacagttatggtgaagcgcttgctaagcat 27214656  T
Q  550 ataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggc 636  Q
      | ||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  27214657 gaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggc 27214743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 27234868 - 27234485
Alignment:
Q  253 aatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggcca 352  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||| | ||| || ||   ||||   |    
T  27234868 aatctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacatcttcgctccacaagaaaa 27234769  T
Q  353 ttgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaa 452  Q
    ||||||| || |||||||   ||   || || ||    || ||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||    
T  27234768 ttgaagactcgaggatttctgttattgtattctcagagaactatg---ctacttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcactcattgctccaa 27234672  T
Q  453 ggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatc---acgagggcagttatggtaaagcactggatgatcat 549  Q
    |||||  || || || ||| | ||  |||||||||  || |||||||||||| |||||||||   || |   |||||||||| |||| || | | | |||    
T  27234671 ggaaaaaggtcgccttgttctacctgttttctatggcgttgaaccttctcacttgcgacatctgaacaacaacagttatggtgaagcgcttgctaagcat 27234572  T
Q  550 ataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggc 636  Q
      | ||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||    
T  27234571 gaagagaggtttcaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagctgctaacttatctggc 27234485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 448
Target Start/End: Original strand, 26622871 - 26623111
Alignment:
Q  205 gtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 304  Q
    |||||||| || || |||||  |||||||||| || |||||  ||||||||||||  |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||      
T  26622871 gtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatc 26622970  T
Q  305 gagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttc 404  Q
    | || |||||| |||| || ||||| | | ||||||||  ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||   | |     
T  26622971 gtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatg---cata 26623067  T
Q  405 ttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26623068 ttcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgct 26623111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 448
Target Start/End: Original strand, 26728849 - 26729089
Alignment:
Q  205 gtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 304  Q
    |||||||| || || |||||  |||||||||| || |||||  ||||||||||||  |  ||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||      
T  26728849 gtgttcctaagtttcagaggcagtgacactcggtacggtttcactggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgatc 26728948  T
Q  305 gagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttc 404  Q
    | || |||||| |||| || ||||| | | ||||||||  ||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||  ||| ||||   | |     
T  26728949 gtgaacttcaaagaggggacgaaatcaaaccatcacttgacaatgctatcgaagagtctaggatttttattcctgtgttttctcccaactatg---cata 26729045  T
Q  405 ttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26729046 ttcttcattttgtttggatgaacttgtccacatcattcactgct 26729089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 664
Target Start/End: Original strand, 26861533 - 26861964
Alignment:
Q  227 gtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaaga 326  Q
    |||||||||| ||||||||| | || |||||||  |  ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||  | || |||||| |||| || ||    
T  26861533 gtgacactcggtatggttttaccggtaatctctacaaggctcttactgacaagggaattcacaccttcatggatgatcgtgaacttcaaagaggggatga 26861632  T
Q  327 aataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaa 426  Q
    ||| | |  ||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||  ||| ||||   | ||||| |||||||| ||||| |||    
T  26861633 aatcaaaagatcactcgacaatgccattgaagagtctagaattttcattcctgtgttttctgccaactatg---cctcttcgtcattttgtttggatgaa 26861729  T
Q  427 cttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagtt 526  Q
    |||||||| ||||||  |||   ||||||||  || ||  | ||||||||  |||||||||   |||| ||| || | |||||||||||    || | ||    
T  26861730 cttgtccaaatcattaactg---caaggaaaagggtcgcgtcgttttgcctgttttctatggcatggatcctactaatgtgcgacatcatagaggtattt 26861826  T
Q  527 atggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaa 626  Q
    ||||| ||||| ||| | | |||  ||| | ||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||| |  ||| |||||||    
T  26861827 atggtgaagcattggctaagcatgaaaaaaggtttcaaaatgatatggataacatggagaggttgcagagatggaaagttgctctgaaccaagctgctaa 26861926  T
Q  627 cttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccactt 664  Q
    ||| || ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  26861927 cttgtcaggctaccattttagtcctgggtaccccactt 26861964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28491825 - 28491660
Alignment:
Q  192 attcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaacc 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||  |||||||||| || | ||||||   |||||| ||| |||| ||     
T  28491825 attcacctatgatgtgttccttagctttcgaggtgaggatactcgctacggtttcactggaaatctatggaaagctctccatgacaaaggagtccgtact 28491726  T
Q  292 ttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaa 357  Q
    |||||||| |||   |||||||||  |||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||    
T  28491725 ttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 28491660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29804235 - 29804070
Alignment:
Q  192 attcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaacc 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||  |||||||||| || | ||||||   |||||| ||| |||| ||     
T  29804235 attcacctatgatgtgttccttagctttcgaggtgaggatactcgctacggtttcactggaaatctatggaaagctctccatgacaaaggagtccgtact 29804136  T
Q  292 ttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaa 357  Q
    |||||||| |||   |||||||||  |||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||    
T  29804135 ttcatggacgacgaggagcttcaaaaaggtgaagaaatcacaccatcactcatcaaagccattgaa 29804070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 448
Target Start/End: Original strand, 26055926 - 26056061
Alignment:
Q  310 cttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttctt 409  Q
    |||||| |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||   |||    
T  26055926 cttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt---ctt 26056022  T
Q  410 cattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26056023 cattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 26056061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 448
Target Start/End: Original strand, 26075896 - 26076031
Alignment:
Q  310 cttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttctt 409  Q
    |||||| |||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||   |||    
T  26075896 cttcaaagaggagatgaaatcacatcatcacttgtcaaggccatcgaagaatctgggatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt---ctt 26075992  T
Q  410 cattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgct 448  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26075993 cattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgct 26076031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 437
Target Start/End: Original strand, 26884037 - 26884287
Alignment:
Q  184 tcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaa 283  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |  ||||||  | |||||||||    
T  26884037 tcctatggattcacttaccaagtgttcctcagtttcagaggaagtgacactcggtatggtttcactggaaatctctacaaggctcttactaacaagggaa 26884136  T
Q  284 tccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtctt 383  Q
    |||  |||||||| ||||| |   | |||| | ||||    ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||    
T  26884137 tccacaccttcattgatgataatcatcttccaagaggaagcgaaatcacaccatcactcatcaaggccattgaagaatctagaatttttattccaatatt 26884236  T
Q  384 gtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacat 437  Q
     |||| ||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26884237 ttctaccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacat 26884287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 453
Target Start/End: Original strand, 26048874 - 26048985
Alignment:
Q  339 acttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatc 438  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26048874 acttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatc 26048970  T
Q  439 attcgctgcttcaag 453  Q
    |||| ||||| ||||    
T  26048971 attcactgctacaag 26048985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 339 - 453
Target Start/End: Original strand, 26070043 - 26070154
Alignment:
Q  339 acttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatc 438  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26070043 acttgtcaaggccatggaagaatctaggatttttattcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatc 26070139  T
Q  439 attcgctgcttcaag 453  Q
    |||| ||||| ||||    
T  26070140 attcactgctacaag 26070154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 515
Target Start/End: Original strand, 26811453 - 26811711
Alignment:
Q  254 atctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccat 353  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||| | | | || ||  |||||  |||    
T  26811453 atctctataaagctctttgtgacaaaggaatccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgacgaaatcacaccttcgctcctcaagagcat 26811552  T
Q  354 tgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||| | |||||||||  ||||   || || |||   || |||||  |||| || |   |||| || || || |||||||||||||||  || |||||||    
T  26811553 tgaacactctaggattgccattattgtattctctgagaactatgcaacttcgtcgt---tttgtttagatgagcttgtccacatcattaactacttcaag 26811649  T
Q  454 gaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    ||||  || || || ||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26811650 gaaaaaggtcgccttgttctaccagttttctatggtgtggaaccttctcacgtgcgacatca 26811711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 515
Target Start/End: Original strand, 29825910 - 29826229
Alignment:
Q  193 ttcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaacct 292  Q
    ||||||||||| || ||||| || || | |||||  || ||||||| ||||||| | || |||||||  | ||||||   |||||||  ||| || ||||    
T  29825910 ttcacctatgatgtcttcctcagtttcacaggtgcagatactcgctttggttttaccggcaatctctacaaagctctaactgacaagaaaattcgcacct 29826009  T
Q  293 tcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 392  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||| | | | |||||| | ||||| ||| |||| ||||||||   ||||||  | || |||| |||    
T  29826010 tcattgatgacaaagagcttcaaagaggggacgaaatcacaccctcacttgtgaaggcaattcaagaatctaggatagccattcctattttctctaccaa 29826109  T
Q  393 ttatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag-gaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgt 491  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||| || |||||||| || ||  ||   ||  ||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29826110 ttatgcttcttcttcgt---tttgcttagatgaacttgtgcatatagttgagtgtgtcaagaggaag-ggtcgtctcgttttgcctattttctatgatgt 29826205  T
Q  492 ggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  29826206 ggatccttctcatgtgcgacatca 29826229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 401 - 457
Target Start/End: Original strand, 25071747 - 25071803
Alignment:
Q  401 cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaa 457  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25071747 cttcttcttcattttgtttagacgaacttgtccacatcattcactacttcaaggaaa 25071803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 335 - 453
Target Start/End: Original strand, 25538565 - 25538680
Alignment:
Q  335 catcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtcca 434  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25538565 catcacttgtcaaggccatcgaagaatctagaatttttattcccatattttctgccaactatgcatctt---cttcattttgtttggacgaacttgtcca 25538661  T
Q  435 catcattcgctgcttcaag 453  Q
     ||||||| ||||| ||||    
T  25538662 gatcattcactgctacaag 25538680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 27531465 - 27531258
Alignment:
Q  229 gacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaa 328  Q
    ||||||||| | |||||| | ||||||||||  |  ||||||  |||||||||||||   |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||    
T  27531465 gacactcgccacggttttaccggaaatctctacaaggctcttactgacaagggaatctataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaa 27531366  T
Q  329 taatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaact 428  Q
    | | | ||||||| |  || ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||   || ||||   | |||||||||||||| |||||||||||    
T  27531365 tcacaccatcactaaaaaatgccattgaaaaatctaggatttttattcccgtattttctgaaaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaact 27531269  T
Q  429 tgtccacatca 439  Q
    ||| |||||||    
T  27531268 tgttcacatca 27531258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 442
Target Start/End: Original strand, 26656025 - 26656118
Alignment:
Q  346 aaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattc 442  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26656025 aaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 26656118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 442
Target Start/End: Original strand, 26761996 - 26762089
Alignment:
Q  346 aaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattc 442  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||| | || |||  ||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26761996 aaggccattgaagaatccaggatttttattcccatattttctgccaactatg---catcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 26762089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 659
Target Start/End: Original strand, 26975320 - 26975398
Alignment:
Q  581 tggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccc 659  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26975320 tggagcggttgcttaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccaccatttcaatcttgggtaccc 26975398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 28149375 - 28149429
Alignment:
Q  11 aaatgggaaggaagtttaactcacgatggtctttggtcaatggatcctcttaagt 65  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  28149375 aaatgggaaggaagtttaactcacaacggtctttggtcagtggatcctctaaagt 28149429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 647
Target Start/End: Original strand, 26617867 - 26617956
Alignment:
Q  558 gttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaa 647  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||  |||||| |||||| | ||||||||    
T  26617867 gttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagcttataacttatctggctatcatttcaa 26617956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 558 - 647
Target Start/End: Original strand, 26723795 - 26723884
Alignment:
Q  558 gttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaa 647  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||| ||  |||||| |||||| | ||||||||    
T  26723795 gttccaaaataacaaggaaaacatggagcggttgcagaaatggaagatagctcttaaccaagcttataacttatctggctatcatttcaa 26723884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 401 - 442
Target Start/End: Original strand, 26975140 - 26975181
Alignment:
Q  401 cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattc 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26975140 cttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattc 26975181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 407
Target Start/End: Original strand, 27229088 - 27229329
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    ||||| |||||||| |  |||| ||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||   |||||||||  | |||||| | || |||||||  |  |    
T  27229088 tcctcttcctcttcattttcctttggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggcaatctctacaagg 27229187  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || ||| |    
T  27229188 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagacgaaatcacaccatcactcgtcaaggccattgacgaatctcg 27229287  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttc 407  Q
    |||||| |||||| | || |||  ||| ||||| ||||||||    
T  27229288 gatttttattcccatattttctgccaactatgcatcttcttc 27229329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 453
Target Start/End: Original strand, 2184986 - 2185038
Alignment:
Q  401 cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2184986 cttcttcttcattttgtttggacgaacttgtccatatcattcgttgctccaag 2185038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 329
Target Start/End: Original strand, 26617269 - 26617345
Alignment:
Q  253 aatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaat 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| |||||    
T  26617269 aatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaat 26617345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 664
Target Start/End: Original strand, 26656228 - 26656340
Alignment:
Q  552 aaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 651  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||  | ||      
T  26656228 aaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaa 26656327  T
Q  652 gggtaccccactt 664  Q
    |||||||||||||    
T  26656328 gggtaccccactt 26656340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 329
Target Start/End: Original strand, 26723197 - 26723273
Alignment:
Q  253 aatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaat 329  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| |||||    
T  26723197 aatctctataaagctctttgtgacaaaggagtccgaaccttcattgatgacaaggagcttcagagaggtgatgaaat 26723273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 664
Target Start/End: Original strand, 26762199 - 26762311
Alignment:
Q  552 aaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcct 651  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||| ||  || |||| ||||| |||||| ||||||  | ||      
T  26762199 aaagaagttccaaaataacaaggaaaacatgcagaggttggagcaatggaagatggctctgaccaaagctgccaacttgtctggctaccattgtagtcaa 26762298  T
Q  652 gggtaccccactt 664  Q
    |||||||||||||    
T  26762299 gggtaccccactt 26762311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 28098278 - 28098188
Alignment:
Q  579 catggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactc 669  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  28098278 catgaagaggctgcataaatggaagatggctcttaaccaagcagctaacttgtccggccaccatttcaatcctaggtaccatacttcactc 28098188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 622 - 671
Target Start/End: Original strand, 28150235 - 28150284
Alignment:
Q  622 gctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcat 671  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28150235 gctaacttgtccggccaccatttcaatcctaggtatcccacttcactcat 28150284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 26848598 - 26848654
Alignment:
Q  248 ctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 304  Q
    |||| ||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26848598 ctggtaatctctataaagctctttctgacaatggaatccgaaccttcattgatgaca 26848654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 558 - 613
Target Start/End: Original strand, 26811754 - 26811809
Alignment:
Q  558 gttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctta 613  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  26811754 gttccaaaataacaaggaaaacatggatcggttgcagaaatggaagatagctctta 26811809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 492; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 116 - 886
Target Start/End: Original strand, 27252 - 28020
Alignment:
Q  116 ttacttcctttttattctctattctcat--ggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttcctt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |  | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27252 ttacttcctttctattctctattctcatatggctatgcttcaatcatccgtctctcccccttcttccttctcttatggattcacctatgacgtgttcctt 27351  T
Q  214 agctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttc 313  Q
    || |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  || | ||||||| | |||||||| |  || ||| | ||||| ||||||||||    
T  27352 agttttagaggtattgacactcgttatggttttactggaaatctctacagtgatctttgtaagaagggaattcacacattctttgatgatagagagcttc 27451  T
Q  314 aaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcatt 413  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  27452 aaggaggtgatgaaataacatcatcacttttcaaggtcattgaagaatctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttc---ttcttcatt 27548  T
Q  414 ttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacat 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27549 ttgcttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcaaggaaaatcggcgccttgttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcatgtgcgacat 27648  T
Q  514 cacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctta 613  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27649 cacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatatagagaggttccaaaataacaagcatagcatggataggttgcagaaatggaagattgctctta 27748  T
Q  614 ctcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctat 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27749 ctcaaactgctaacttctctggccaccaaatcaatcctaggtaccgtagttcactcatgttttacattcttacatatgtcatacttctttaatattctat 27848  T
Q  714 tttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaattt 813  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27849 tttctaactatttcatctcactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaa-ttacttgtatgtcaaaacaatatttgaattgtattt 27947  T
Q  814 acacaactattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactcaacttatttgattgggtag 886  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27948 atacaactattattaataaattgatatgattgtgaatttgtgatgcatttactcaaattatttgattgggtag 28020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 113 - 718
Target Start/End: Original strand, 34528 - 35130
Alignment:
Q  113 ttcttacttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttcct 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34528 ttcttacttcctttttgttctctactctcatggctctgcttcaatcatccgtccccccctcttcttctttctcctatggattcacctatgacgtgttcct 34627  T
Q  213 tagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagctt 312  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  34628 tagttttagaggtagtgacactcgctatggttttaccgaaaatctctatagagctctttgtcacaagggaatccacaccttcattgatgacagggagctt 34727  T
Q  313 caaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcat 412  Q
    |||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  34728 caaggaggagatgaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctgtcttgtctatcaattatgcttc---ttcttcat 34824  T
Q  413 tttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgaca 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34825 tttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgcttcaaggaaagcgggcgtctagttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgaca 34924  T
Q  513 tcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctt 612  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  34925 tcacaagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggataacatggagaggttgcagaaatggaagatggctctt 35024  T
Q  613 actcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattcta 712  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| |||| ||||| |||| || | ||  |||||||||  ||||    
T  35025 actcaaacatctaacttttctggccaccatttcaatccagggtacaccaattccctcatatttttcattcatacaaatataatgtttctttaattctcta 35124  T
Q  713 ttttct 718  Q
    ||||||    
T  35125 ttttct 35130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 120 - 886
Target Start/End: Original strand, 116606 - 117363
Alignment:
Q  120 ttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagcttt 219  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| | | |||||||||| |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  116606 ttcctctttattcactactctcatggctctacttcaatcatccatctcttcctcctcttccttttcctatggattcacctatgacgtgttccttagtttt 116705  T
Q  220 agaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggag 319  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |||||||   ||| |||| || |||||||| ||||||| ||| |||||| |||    
T  116706 agaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatctttgtaggaagagaattcgtaccttcattgatgacaaagaccttcaacgag 116805  T
Q  320 gtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgctt 419  Q
    |||| ||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||    
T  116806 gtgacgaaataacaccgtcacttttcaaggccattgaagagtctaggattttcattcctattttgtctatcaattatg---cttcttcttccttttgctt 116902  T
Q  420 ggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgag 519  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||| || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  116903 ggatgaacttgtccacattattcactgcttcaaagaaaatgggcgcctagtttagccagttttctacgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacaag 117002  T
Q  520 ggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaa 619  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||| |||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  117003 ggcagttatggtaaagcactggccgagcatattgagaggtt----aatagcacggatagcatggagaggttgcagaaatggaagatggctcttactcaaa 117098  T
Q  620 ctgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttatacttctttaatattctattttcta 719  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||   ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  117099 ctgctaacttctcaggccaccatttcagtcctgggtaacctacttaactaatgttttgtgttcttacata---tatatttctttaattttctattttcta 117195  T
Q  720 accgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaatttacacaa 819  Q
    |||| ||||||| ||  || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  117196 accgattcatcttacagttgaaattggaaatattaattttattcttaacaagtgtaagttacttgtatgtcaaaacaatatttgaattgtattcatacaa 117295  T
Q  820 ctattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactc-aacttatttgattgggtag 886  Q
    |  |||| || | |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  117296 cagttatcaacacattgatgttattgtgaatttgcgatgcatttactcaaacttatttgattgggtag 117363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 172 - 831
Target Start/End: Original strand, 42828 - 43491
Alignment:
Q  172 tcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctcttt 271  Q
    |||||||||  ||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | || |||||    
T  42828 tcctcttccctctcctatgggtttacctatgatgtcttccttagttttagaggtagtgacactcgttatggttttactggaaatctctacaaagatcttt 42927  T
Q  272 gtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggatttt 371  Q
    || | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42928 gtaagaagggaattcgcaccttcattgatgacagagaacttccaggaggtgacaaaataacaccatcacttttcaaggccattgaagagtctaggatttt 43027  T
Q  372 cattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggtt 471  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  || || || |||    
T  43028 cattcctgtcttgtctatcaattatg---cttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcactgctgcaagaaaaatggacgcctagtt 43124  T
Q  472 ttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataaca 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||    
T  43125 ttgccaattttctatgatgtggaaccttctaacgtgagacatcagattggcagttatggtaaagcactggctgagcatattgagaagttccaaaatagca 43224  T
Q  572 aggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcat 671  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||    
T  43225 cggataacatggagaggttgcagaaatggaagagtgctctaactcaaacagctaacttctctggccaccatttcagttctaggtacaccacttaactcat 43324  T
Q  672 gttttacattcttacatatgt---tat-----acttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattc 763  Q
    ||||  ||||||||||||  |   |||     | ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||  || |||| ||||||||||  |||||||    
T  43325 gtttagcattcttacatagttacatataacacatttctttaattttctattttctaaccaattcatcttacagttgaaatagaaaatattaaatttattc 43424  T
Q  764 ttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaacaatatttgaattgaatttacacaactattattaata 831  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  43425 ttaacaagtgtaagttacttgtatg-caaaacaatatttgaattgtatttatacaactattatcaata 43491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 96 - 869
Target Start/End: Complemental strand, 58683 - 57925
Alignment:
Q  96 atatacactcatccaaattcttacttcctttttattctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattc 195  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  58683 atatacactcatccacattcttacttcctttttattctctactgtcatggctatgcttcaatcatccatctcttcctcctcttccttctcctatggattc 58584  T
Q  196 acctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttca 295  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58583 acctatcacgtgttccttagctttagaggttgtgacactcgctatggttttactggaaatctctacagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttca 58484  T
Q  296 tggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaatta 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  58483 tggatgacagagagcttcaaggaggtgacgaaataacaccatcacttttcaaggccattaaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaacta 58384  T
Q  396 tgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaa 495  Q
    ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  58383 tgcttctt---cttcattttgcttgaacgaacttgtccacatcattcactgcttcgaggaatatgggcgcctagttttgccaattttctatgacgtggaa 58287  T
Q  496 ccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaaataacaaggatagcatggagaggttgcaga 595  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  58286 ccttctcacgtgcgacatcaagatggaagttatggtaaagcacttgccgagcatattgagaggttccaaaatagcaaggatagcatagagaggttgcaga 58187  T
Q  596 aatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgttttacattcttacatatgttat 695  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  58186 aatggaagacagctcttactcagactgctaacttctctggccaccatttcaatactaggtaccccactttactcatgttttacattcttacatatgtcat 58087  T
Q  696 acttctttaatattctattttctaaccgtttcatctgactatttaaattgaaaatattatttttattcttaacaagtttaagttacttgtttgtcaaaac 795  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |   ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||           ||||||||    
T  58086 atctctttaatattctattttataaccgtttcatattaaagtttaaatagaaaa-aatatttttattcttaacaagtgtaa-----------gtcaaaac 57999  T
Q  796 aatatttgaattgaatttacacaactattattaataaattgatatggttgtgaatttgtgatgcatttactcaa 869  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  57998 aatatttgaattgtatttatacaactattattaataaattgacgcggttgtgaatttatgatgcatttactcaa 57925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 177 - 515
Target Start/End: Original strand, 3279555 - 3279893
Alignment:
Q  177 ttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgac 276  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||    
T  3279555 ttccttctcttatggattcacctatgacgtattcttgagttttaggggcactgacactcgctatggttttactggaaatctctatagagctttaagtgac 3279654  T
Q  277 aagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattc 376  Q
       ||| || | |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||| | |  ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  3279655 ggtggattctgcaccttcattgatgatagggagcttcatggaggtgatgaaatcacacaatcacttgtcaaggccatcgaagagtccatgatttttattc 3279754  T
Q  377 ccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttc----aaggaaagcgggcgtctggttt 472  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||  ||| || ||     |||    
T  3279755 cggtcttctctatcaactatgcttcttctat---attttgtttggacgaacttgtccacatcattcattgcttcgaccaagagaag-ggtcgcaaaattt 3279850  T
Q  473 tgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3279851 tacctattttctatgatgtggaaccttcccacgtgcgacatca 3279893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17993949 - 17993852
Alignment:
Q  232 actcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaat 329  Q
    ||||| ||||||||  | || ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||    
T  17993949 actcgatatggtttcaccggtaatctctataaagctctttctgacaagggaattcgaaccttcatcgatgacaaagagcttcagagaggtgatgaaat 17993852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 17993622 - 17993535
Alignment:
Q  562 caaaataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatc 649  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||  |||||||||||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17993622 caaaatagcaaggaaaacatggagcggttgttgaaatggaagaaagctcttaaccaagctgctaacttatctggccaccatttcaatc 17993535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 579 - 659
Target Start/End: Original strand, 3279969 - 3280049
Alignment:
Q  579 catggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccc 659  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  |||||||  ||| | |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  3279969 catgaagaggttgcataaatggaagatggctcttaaccaagcagctaacttgtccggccaccattttaatcctaggtaccc 3280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 6)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5091279 - 5090939
Alignment:
Q  172 tcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctcttt 271  Q
    |||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||    |||||||| || |||||| |||||||||||| |  ||||||      
T  5091279 tcctcttctttctcctacggatttacctacgacgtctttcttagttttagaggcaccgacactcgttacggttttactggaaatctctatgaagctctac 5091180  T
Q  272 gtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggatttt 371  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||  |||| ||  |||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |||| |||| |    
T  5091179 gtgtcaagggaattcacaccttcattgatgacagagagcttcagcgaggagaccaaataacaccgtcacttctcaaggccattcaagaatctaagattgt 5091080  T
Q  372 cattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggtt 471  Q
    ||||  ||| || |||| | | ||||||||||   |||| ||||| || || ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||  ||  | ||||||    
T  5091079 cattatcgttttctctaaccactatgcttctt---cttcgttttgtttagatgaacttgtccatattattcactgctccaaggaaaatggttgcctggtt 5090983  T
Q  472 ttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5090982 ttgcctattttctatggtgtggaaccttctcatgtgcgatatca 5090939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18731822 - 18731504
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||  ||||||||||  | |||||| ||||  ||||||  ||||    
T  18731822 tcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtgacggttttactggccatctctacagag 18731723  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | || || ||| |||| || ||||| | | |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  18731722 ctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctag 18731623  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||  || |||    
T  18731622 gatcttcattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgt 18731526  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatg 487  Q
    || ||||||||  |||||||||    
T  18731525 cttgttttgcctgttttctatg 18731504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 18655795 - 18655296
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||  ||||||||||  | |||||| ||||  ||||||  | ||    
T  18655795 tcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactgggcatctctacaaag 18655696  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | ||||| ||| | || || ||||| | | |||||||   ||| |||||| ||||||||||    
T  18655695 ctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgagctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattcaagagtctag 18655596  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    ||| || ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||  || |||    
T  18655595 gatctttattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccgcatcattcactgctacaagacaaagggtcgt 18655499  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||| ||  |||||||||  ||||| ||| ||||| | ||||||||    || ||||||||| ||   ||   | | || | |||||| |||||||    
T  18655498 ctcgtttttcctgttttctatggcgtggatcctactcacatacgacatcaaactggaagttatggtgaacatctcactaagcacagaaagaatttccaaa 18655399  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttc 665  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||  || |||||||||| || ||| ||||||  | |||||||||| || ||||    
T  18655398 ataacaagaaaaacatggagcggttgcatcaatggaagttggctctgaccgaagctgctaacttgtccggctaccattctagtcctgggtactcctcttc 18655299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 18679885 - 18679550
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    ||||||| |||||| |  |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||  ||||||||||  | |||||| ||||  ||||||  |  |    
T  18679885 tcctcattctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaagg 18679786  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  |||||| |||||||  |||||||| |||||| | || || ||| |||| || ||||| | | |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  18679785 ctcttactgacaaaggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctag 18679686  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||  || |||    
T  18679685 gatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc---attttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagacaaagggtcgt 18679589  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcac 504  Q
    || ||||||||  |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18679588 cttgttttgcctgttttctatgtcgtggatcctactcac 18679550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18699718 - 18699400
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||   |||||||||  | |||||| ||||  ||||||  | ||    
T  18699718 tcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcactgacactcgtgacggttttactggccatctctacaaag 18699619  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | || || ||| | || || ||||| | | |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  18699618 ctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagtggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctag 18699519  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||  ||  || |||    
T  18699518 gatcttcattcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc---attttgtttggacgaacttgttcacatcattcactgctacaagacaaaaggtcgt 18699422  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatg 487  Q
    || ||||||||  |||||||||    
T  18699421 ctcgttttgcctgttttctatg 18699400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 166 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18724403 - 18724085
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||  ||||||||||  | |||||| ||||  ||||||  |  |    
T  18724403 tcctcatcctcttcattttcctatcgattcacttaccaagtgttcctcagcttcaggggcagtgacactcgtaacggttttactggtcatctctacaagg 18724304  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||| | || || ||| |||| || ||||| | | |||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  18724303 ctcttactgacaagggaatccacaccttcattgatgaccgtgacctgcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctag 18724204  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||  || |||    
T  18724203 gatcttcattcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcattttgtttgaacgaacttgtccacatcatgcactgctacaagacaaagggtcgt 18724107  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatg 487  Q
    || ||||||||  |||||||||    
T  18724106 cttgttttgcctgttttctatg 18724085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3753 - 3468
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | ||||||||||| ||||| ||   |||||||||  | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  3753 tcctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttccttagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaagg 3654  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  3653 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctag 3554  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaa-ttatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||  ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3553 gatttttattcctgtgttttctatcaacctatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 3468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 14686 - 14289
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    ||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||  | |||||| | || ||||| ||   |||||||||  | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  14686 tcctcatccacttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcatcagttttaggggcactgacactcggcacggttttaccggaaatctctacaagg 14587  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  14586 ctcttactgacaagggaatccataccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccattgatgaatctag 14487  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || |||||||| ||||| |    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || ||     
T  14486 gatttttattcctgtgttttctatcaactatgcct----ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgc 14391  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  ||||||  |  ||||||||| || |||||||||||||  | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| ||||    
T  14390 ctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatcagaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaa 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 5002 - 4528
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  | |||||||| || ||||| ||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |  |    
T  5002 tcctcatcctcttcattttcctatggattcacttaccaagtgttcctcagttttaggggcattgacactcgccacggttttaccggaaatctctacaagg 4903  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || ||||| | | |||| ||   |||||||||||| || |||||    
T  4902 ctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatccctccgcaaggccattgatgaatctag 4803  T
Q  366 gattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgt 465  Q
    |||||| ||||| || || ||||||   |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||  || ||     
T  4802 gatttttattcctgtgttttctatcttctatgc--ctt-ttcttcgttttgtttggacgaacttgtccacataattcactgctacaagacaaagggtcgc 4706  T
Q  466 ctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatcacgagggcagttatggtaaagcactggatgatcatataaagaagttccaaa 565  Q
    || ||||||||  ||||||  |  ||||||||| || ||||||||||||   | || ||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||| ||| ||||    
T  4705 ctcgttttgcctgttttcttcggcgtggaacctactaacgtgcgacatctgaaaggtagttatggtgaagcattggctgagcatgaaaagaggtttcaaa 4606  T
Q  566 ataacaaggatagcatggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatt 643  Q
    || | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||   ||||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||    
T  4605 atgataagaataacatggagaggttgcatcaatggaagttggctctgacccaagctgctaacttgtccggctaccatt 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13901 - 13617
Alignment:
Q  228 tgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaa 327  Q
    |||||||||| | |||||| | || |||||||  |  ||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||||| |||| || |||    
T  13901 tgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgacaatgatcttcaaagaggagatgaa 13802  T
Q  328 ataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaac 427  Q
    || | | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| || |   |  ||||   |||||||||||||||||    
T  13801 atcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaactacg---ccacttcaaaattttgcttggacgaac 13705  T
Q  428 ttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttttgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    |||| ||||| ||||  |||| ||||  ||  || || || ||||||||  |||||| || |||||| ||| || | |||||||||||    
T  13704 ttgttcacattattcattgctacaagacaaaaggtcgcctcgttttgcctgttttctttggtgtggatcctactaatgtgcgacatca 13617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 273 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 268568 - 268329
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||  | || |||||| |||| || ||||| | | |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||     
T  268568 tgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaaccatcactcgacaatgccattgaagagtctaggattttt 268469  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaaggaaagcgggcgtctggttt 472  Q
    ||||| || || |||||||| ||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||  || |||||  |||    
T  268468 attcctgtgttttctatcaactatg---cctcttcttcattttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaagaaaaagggtcgtctcattt 268372  T
Q  473 tgccaattttctatgatgtggaaccttctcacgtgcgacatca 515  Q
    ||||  | |||||||  ||||| ||| ||||| | ||||||||    
T  268371 tgcccgtcttctatggcgtggatcctactcacatacgacatca 268329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28164503 - 28164396
Alignment:
Q  343 atcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattc 442  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28164503 atcaaggccattgaaaaatcttgaatttttattcctgtgttatctatcaactatgcctcttcttc---attttgtttggacgaacttgtccacatcattc 28164407  T
Q  443 gctgcttcaag 453  Q
     ||||| ||||    
T  28164406 actgctacaag 28164396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28127826 - 28127713
Alignment:
Q  337 tcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccaca 436  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||    
T  28127826 tcacttttaaaggccattgaagaatctagaatttttattcctgtattttctaccaactatgcctcttcttc---attttgtttggacgaacttgtgcaca 28127730  T
Q  437 tcattcgctgcttcaag 453  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  28127729 tcattcactgctacaag 28127713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 273 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29273994 - 29273817
Alignment:
Q  273 tgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttc 372  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||  | || |||||| |||| || ||||| | |||||||||   ||| | ||||||||||||||| |||||     
T  29273994 tgacaagggaatccacaccttcattgatgatcgtgaacttcaaagaggggatgaaatcaaatcatcactcgacaatgtcattgaagagtctagaattttt 29273895  T
Q  373 attcccgtcttgtctatcaattatgcttcttcttcttcattttgcttggacgaacttgtccacatcattcgctgcttcaag 453  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29273894 attcctgtgttttctatcaactatgcctcttcttc---attttgtttggacgaacttgtccacatcattcactgctacaag 29273817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 369
Target Start/End: Original strand, 31903728 - 31903910
Alignment:
Q  187 tatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatcc 286  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||    
T  31903728 tatggattcacctacgatgtgttcctcagctttagaggcttagacactcgctatggttttactggaaatctctacaaagctctttatgataagggaatcc 31903827  T
Q  287 gaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggatt 369  Q
      ||||| || || ||   ||| |||||| ||||  | ||||| | | |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  31903828 acacctttattgacgatgaagaacttcaaagaggacatgaaatcacaccatcacttttagaggcaattgaagagtctaggatt 31903910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 22
Alignment:
Q  205 gtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 304  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||| | |||||| | || |||||||  |  ||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  209 gtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgaca 110  T
Q  305 gagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 392  Q
      || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  109 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaa 22  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Original strand, 7420 - 7607
Alignment:
Q  205 gtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagagctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgaca 304  Q
    ||||||||||| ||||| ||   |||||||||| | |||||| | || |||||||  |  ||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  7420 gtgttccttagttttaggggcactgacactcgccacggttttaccggcaatctctacaaggctcttactgacaagggaatcaaaaccttcattgatgaca 7519  T
Q  305 gagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctaggattttcattcccgtcttgtctatcaa 392  Q
      || |||||| |||| || ||||| | | |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  7520 atgatcttcaaagaggagatgaaatcacaccatcactcctcaaggccatcgaagaatctaggatttttattcctgtgttttctatcaa 7607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0781 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0781
Description:

Target: scaffold0781; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 102
Alignment:
Q  132 ctctattctcatggctatgcctcaatcatccgtctcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgac 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| || || ||||||||| |   |||||||||| |||||||||| || || ||||| | ||||    
T  213 ctctattctcatggctatgccacaatcatcttcctcctcttcttcatcctcctccaa---attcacctataacgtgttcctaagtttcagaggagctgac 117  T
Q  232 actcgctatggtttt 246  Q
    |||||| ||||||||    
T  116 actcgccatggtttt 102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Original strand, 16688867 - 16689070
Alignment:
Q  166 tcctcatcctcttcctcctcctatggattcacctatgacgtgttccttagctttagaggtggtgacactcgctatggttttgctggaaatctctgtagag 265  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |  ||| | || | ||||||||||| |  |||| |||| ||||| |  | ||    
T  16688867 tcctcttcctcatccttctcctacggattcaactatgatgttttcctaaatttttgtggcgatgacactcgctttcattttactggtaatctgtacaaag 16688966  T
Q  266 ctctttgtgacaagggaatccgaaccttcatggatgacagagagcttcaaggaggtgaagaaataatatcatcacttatcaaggccattgaagagtctag 365  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||  || |||||  |||||||  |||| | | |||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  16688967 ctctatgtgacaagggaatccgtgtcttcattgatgacaaggaacttcagagaggtgacaaaatcacaccatcacttatcaaggcaattgaagactcaag 16689066  T
Q  366 gatt 369  Q
    ||||    
T  16689067 gatt 16689070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 580 - 674
Target Start/End: Original strand, 16689290 - 16689384
Alignment:
Q  580 atggagaggttgcagaaatggaagagtgctcttactcaaactgctaacttctctggccaccatttcaatcctgggtaccccacttcactcatgtt 674  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |||| ||  | ||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||    
T  16689290 atggataggctgcagaaatggaagacggctcttaatcaagctgctaacctctccggttatcatttcaatcacgggtactccactttactaatgtt 16689384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University