View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2479_high_87 (Length: 275)

Name: NF2479_high_87
Description: NF2479
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2479_high_87
NF2479_high_87
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (2-265)||(35965552-35965815)
chr8 (2-265)||(45455367-45455630)
chr8 (1-265)||(43688977-43689241)
chr8 (2-265)||(43370758-43371021)
chr8 (1-265)||(7341070-7341334)
chr8 (1-265)||(30304416-30304680)
chr8 (1-265)||(32377714-32377978)
chr8 (1-265)||(32431671-32431935)
chr8 (2-265)||(39751835-39752098)
chr8 (1-265)||(1115763-1116027)
chr8 (1-265)||(8422662-8422926)
chr8 (20-265)||(7168891-7169136)
chr8 (110-260)||(22580899-22581049)
chr8 (2-265)||(2145806-2146060)
chr8 (141-245)||(44320872-44320976)
chr8 (139-245)||(17316471-17316577)
chr8 (141-245)||(45116258-45116362)
chr8 (139-245)||(17340021-17340127)
chr8 (99-245)||(14401676-14401824)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (2-265)||(436302-436565)
chr2 (1-265)||(12907298-12907562)
chr2 (1-261)||(27275166-27275426)
chr2 (1-265)||(3802372-3802636)
chr2 (2-265)||(11692622-11692884)
chr2 (2-265)||(24604896-24605159)
chr2 (2-265)||(41007787-41008050)
chr2 (1-265)||(212247-212511)
chr2 (1-265)||(10623260-10623524)
chr2 (5-265)||(43949092-43949352)
chr2 (2-265)||(24750649-24750912)
chr2 (1-265)||(5348158-5348422)
chr2 (2-265)||(39794961-39795224)
chr2 (1-265)||(41561003-41561267)
chr2 (1-265)||(38946754-38947018)
chr2 (2-265)||(28354709-28354972)
chr2 (2-227)||(45476387-45476611)
chr2 (2-265)||(34920589-34920842)
chr2 (2-218)||(9655194-9655410)
chr2 (54-265)||(7264023-7264234)
chr2 (14-265)||(17996991-17997242)
chr2 (2-160)||(1098633-1098791)
chr2 (154-265)||(1100042-1100153)
chr2 (141-245)||(9639183-9639287)
chr2 (216-265)||(9652182-9652231)
chr2 (143-207)||(28423423-28423487)
chr2 (136-245)||(21535200-21535309)
chr2 (152-197)||(24683458-24683503)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (1-265)||(36816322-36816586)
chr3 (2-265)||(21955045-21955308)
chr3 (2-265)||(46992053-46992316)
chr3 (2-265)||(48249674-48249937)
chr3 (1-265)||(13746527-13746791)
chr3 (2-265)||(7841822-7842085)
chr3 (2-265)||(14399546-14399809)
chr3 (1-265)||(9428639-9428903)
chr3 (2-265)||(77827-78090)
chr3 (2-265)||(7838587-7838850)
chr3 (1-265)||(6741878-6742142)
chr3 (1-265)||(3949734-3949998)
chr3 (1-265)||(8159789-8160053)
chr3 (2-265)||(6504762-6505025)
chr3 (2-265)||(16445611-16445874)
chr3 (1-265)||(30946448-30946712)
chr3 (46-265)||(29930359-29930578)
chr3 (46-265)||(29979513-29979732)
chr3 (153-265)||(50954264-50954376)
chr3 (99-245)||(33399546-33399692)
chr3 (141-245)||(2285003-2285107)
chr3 (141-245)||(9556727-9556831)
chr3 (141-245)||(51548479-51548583)
chr3 (141-245)||(4120740-4120843)
chr3 (152-252)||(8263742-8263842)
chr3 (141-245)||(32426622-32426726)
chr3 (141-245)||(40468155-40468259)
chr3 (139-245)||(4510287-4510393)
chr3 (139-193)||(12491150-12491204)
chr3 (46-182)||(1275240-1275376)
chr3 (2-44)||(29908031-29908073)
chr3 (2-44)||(29949197-29949239)
chr3 (2-44)||(29998351-29998393)
chr3 (136-207)||(25059882-25059953)
chr3 (136-245)||(8117600-8117709)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (2-265)||(37015905-37016168)
chr1 (1-265)||(29355494-29355758)
chr1 (1-265)||(41454828-41455092)
chr1 (2-264)||(50116570-50116832)
chr1 (2-265)||(38691746-38692009)
chr1 (2-265)||(44619910-44620173)
chr1 (2-265)||(46974155-46974418)
chr1 (1-265)||(3947267-3947531)
chr1 (1-265)||(3984104-3984368)
chr1 (1-265)||(44466573-44466837)
chr1 (2-265)||(13630407-13630670)
chr1 (1-265)||(5078926-5079190)
chr1 (1-265)||(13174772-13175036)
chr1 (1-265)||(20350447-20350711)
chr1 (1-265)||(38774921-38775185)
chr1 (2-265)||(21943171-21943434)
chr1 (2-265)||(12649386-12649647)
chr1 (2-265)||(51663249-51663512)
chr1 (54-265)||(7980071-7980282)
chr1 (33-253)||(26466108-26466328)
chr1 (50-265)||(16246609-16246821)
chr1 (14-253)||(32106462-32106698)
chr1 (141-245)||(36360466-36360570)
chr1 (142-245)||(18887570-18887673)
chr1 (141-245)||(45472363-45472467)
chr1 (141-245)||(7403629-7403733)
chr1 (141-245)||(28862901-28863005)
chr1 (139-253)||(25231305-25231419)
chr1 (136-182)||(39914011-39914057)
chr1 (139-245)||(25593679-25593785)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (2-265)||(25895908-25896171)
chr5 (1-265)||(34078771-34079035)
chr5 (2-265)||(18537143-18537406)
chr5 (2-265)||(7799813-7800076)
chr5 (1-265)||(37819683-37819947)
chr5 (1-265)||(7020686-7020950)
chr5 (1-265)||(27866651-27866915)
chr5 (1-265)||(28885214-28885478)
chr5 (2-253)||(4202746-4202997)
chr5 (2-265)||(11032259-11032522)
chr5 (2-265)||(38858997-38859260)
chr5 (1-265)||(13566897-13567172)
chr5 (104-265)||(1035459-1035620)
chr5 (2-183)||(1036424-1036605)
chr5 (14-250)||(20286015-20286251)
chr5 (115-250)||(20286515-20286650)
chr5 (192-265)||(33994242-33994315)
chr5 (139-253)||(13157978-13158092)
chr5 (16-253)||(23028381-23028625)
chr5 (141-245)||(6552800-6552904)
chr5 (141-245)||(42343502-42343606)
chr5 (141-245)||(43295232-43295336)
chr5 (141-245)||(27013615-27013719)
chr5 (143-193)||(11819279-11819329)
chr5 (139-190)||(25048464-25048515)
chr5 (14-120)||(20287404-20287510)
chr5 (163-245)||(30617320-30617402)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-265)||(1872-2136)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (6-265)||(17060-17319)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (2-265)||(4976746-4977009)
chr4 (2-265)||(9891013-9891276)
chr4 (1-265)||(19072463-19072727)
chr4 (1-265)||(49565270-49565534)
chr4 (1-265)||(3404781-3405045)
chr4 (2-265)||(11502497-11502760)
chr4 (2-265)||(4978765-4979024)
chr4 (1-265)||(41024191-41024454)
chr4 (2-265)||(18580138-18580398)
chr4 (2-265)||(51643305-51643570)
chr4 (2-265)||(21471785-21472047)
chr4 (1-207)||(4769179-4769389)
chr4 (2-179)||(38463644-38463821)
chr4 (2-146)||(44049720-44049864)
chr4 (141-245)||(17916198-17916302)
chr4 (211-265)||(17140580-17140634)
chr4 (111-253)||(6182679-6182821)
chr4 (141-245)||(4617714-4617818)
chr4 (222-265)||(38463824-38463867)
chr4 (139-245)||(1590845-1590950)
chr4 (141-241)||(46517380-46517480)
chr4 (141-245)||(32716305-32716409)
chr4 (136-182)||(20971446-20971492)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (1-265)||(18106379-18106643)
chr7 (1-265)||(30787530-30787794)
chr7 (1-265)||(43622941-43623205)
chr7 (1-265)||(617555-617819)
chr7 (2-265)||(47061874-47062138)
chr7 (1-265)||(45764370-45764634)
chr7 (2-265)||(15060605-15060867)
chr7 (2-265)||(42500398-42500661)
chr7 (2-265)||(43827413-43827676)
chr7 (2-265)||(8400577-8400840)
chr7 (112-265)||(21800003-21800156)
chr7 (141-245)||(46791336-46791440)
chr7 (141-245)||(1296997-1297101)
chr7 (141-245)||(45172855-45172959)
chr7 (142-245)||(40445512-40445615)
chr7 (143-245)||(8194228-8194330)
chr7 (136-206)||(20908458-20908528)
chr7 (141-193)||(47867442-47867494)
chr7 (139-182)||(16794557-16794600)
chr7 (144-245)||(40793934-40794035)
chr7 (141-193)||(43379254-43379306)
chr7 (46-182)||(3761979-3762115)
chr7 (139-171)||(16796810-16796842)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (5-265)||(29287758-29288018)
chr6 (2-265)||(18606987-18607250)
chr6 (1-265)||(1611557-1611821)
chr6 (18-265)||(28250887-28251134)
chr6 (2-265)||(31147313-31147576)
chr6 (16-265)||(24220157-24220408)
chr6 (2-259)||(21358157-21358411)
chr6 (2-259)||(23962139-23962393)
chr6 (125-265)||(7362170-7362310)
chr6 (159-265)||(7362307-7362413)
chr6 (136-245)||(34111603-34111712)
chr6 (222-265)||(13387721-13387764)
chr6 (215-265)||(35243594-35243644)
chr6 (141-193)||(22864869-22864921)
chr6 (143-193)||(26684976-26685026)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (1-265)||(16163-16427)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-265)||(33800-34064)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-265)||(12253-12517)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (120-265)||(95-240)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (141-245)||(3847-3951)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 35965552 - 35965815
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  35965552 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 35965651  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965652 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 35965751  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965752 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 35965815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45455630 - 45455367
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  45455630 attgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggtattttgttctt 45455531  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455530 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcattttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 45455431  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45455430 tctaaagtcggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgtccaatccccattcctttg 45455367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 43688977 - 43689241
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43688977 aattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 43689076  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43689077 tcaaatgtatcaaaatatttcttcgaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcttttaatctaccggcaagaatgtgtcc 43689176  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43689177 ttctaaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttaaatccccattcctttg 43689241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43371021 - 43370758
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43371021 attgcaacgacttcttgtcagctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 43370922  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43370921 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcct 43370822  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43370821 tctaaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaaaccccattcctttg 43370758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7341334 - 7341070
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  7341334 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 7341235  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341234 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 7341135  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341134 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 7341070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 30304416 - 30304680
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  30304416 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctatggttct 30304515  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304516 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30304615  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304616 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30304680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 32377714 - 32377978
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  32377714 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32377813  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377814 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 32377913  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377914 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 32377978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 32431671 - 32431935
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  32431671 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32431770  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431771 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 32431870  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431871 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 32431935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 39751835 - 39752098
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39751835 attgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 39751934  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  39751935 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcataaatatgtcat 39752034  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39752035 tctaaagccggttccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttg 39752098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1116027 - 1115763
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  1116027 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 1115928  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115927 tcaattgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtactatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1115828  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1115827 ttctaaagccggctctatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 1115763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 8422662 - 8422926
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  8422662 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8422761  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8422762 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtca 8422861  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8422862 ttctaaagccggctccatgggatagttgtgaactccattaagaatgtttaatccccattcctttg 8422926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 20 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7169136 - 7168891
Alignment:
Q  20 cacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7169136 cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatt 7169037  T
Q  120 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7169036 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcatcttgtcgtcctcctttaatctactagcaagaatgtatccttctaaagtcggctccatc 7168937  T
Q  220 gcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7168936 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccactcctttg 7168891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 22581049 - 22580899
Alignment:
Q  110 tcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22581049 tcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagt 22580950  T
Q  210 cggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattc 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580949 cggctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccattc 22580899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 2145806 - 2146060
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatt-----tgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttg 96  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2145806 attgcaacaacttcttgtcacctctattatatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtgatcttttg 2145905  T
Q  97 tacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2145906 ttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgtt--------------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatat 2145991  T
Q  197 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  2145992 gtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaaaaatgttcaatctccattcatttg 2146060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44320976 - 44320872
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  44320976 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgtttatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 44320877  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  44320876 agaat 44320872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17316577 - 17316471
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   ||   |||| ||||||||| || |||||    
T  17316577 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatggaaacatctcatggttgtgaattccat 17316478  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  17316477 taagaat 17316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45116362 - 45116258
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45116362 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggaaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45116263  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45116262 agaat 45116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17340127 - 17340021
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   | |  |||| ||||||||| || |||||    
T  17340127 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatgacaacatctcatggttgtgaattccat 17340028  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  17340027 taagaat 17340021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 14401676 - 14401824
Alignment:
Q  99 cttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcac--gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||  ||| |   |||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||    
T  14401676 cttcaaattcatcaaaatattttttggtggcaccaaactcttggtcaagtcatatgtacaatcttcttgtcatcatcccttaatcttcctgcaagaatgt 14401775  T
Q  197 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    | | |||||||   ||| |||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  14401776 gccattctaaacttggcaccaattcatggttgtgaactccattaagaat 14401824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 436565 - 436302
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  436565 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 436466  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436465 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 436366  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436365 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 436302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 12907298 - 12907562
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  12907298 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttat 12907397  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907398 tcaaatgtatcagaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 12907497  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12907498 ttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttg 12907562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 27275166 - 27275426
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  27275166 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 27275265  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275266 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 27275365  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcc 261  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275366 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcc 27275426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 3802372 - 3802636
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  3802372 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 3802471  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802472 tcaaatgtatcaaaatatttattggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3802571  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802572 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3802636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 11692622 - 11692884
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11692622 attgcaacggcttcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgt-ctt 11692720  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692721 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 11692820  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11692821 tctaaagtcggctcgatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 11692884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 24604896 - 24605159
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24604896 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 24604995  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  24604996 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaattttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtact 24605095  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605096 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 24605159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 41007787 - 41008050
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  41007787 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 41007886  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41007887 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcat 41007986  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41007987 tctaaagccggctacatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 41008050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 212247 - 212511
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  212247 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 212346  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212347 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 212446  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212447 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 212511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 10623260 - 10623524
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  10623260 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 10623359  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623360 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 10623459  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623460 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 10623524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 43949092 - 43949352
Alignment:
Q  5 gcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43949092 gcaacggcttcttgtcacctatatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaa 43949191  T
Q  105 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949192 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 43949291  T
Q  205 aaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43949292 aaagccggctccttcgcatggttgtgaactccattaataatgttcaatccccattcctttg 43949352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24750912 - 24750649
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24750912 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 24750813  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750812 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctcggtcaattcatgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 24750713  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750712 tctaaatccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 24750649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5348422 - 5348158
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  5348422 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 5348323  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348322 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 5348223  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348222 ttctaaagccggctccatgggatggctgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 5348158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 39795224 - 39794961
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  39795224 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 39795125  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39795124 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgccct 39795025  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39795024 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcttttg 39794961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41561267 - 41561003
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  41561267 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 41561168  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561167 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 41561068  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41561067 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccttattcctttg 41561003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38947018 - 38946754
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||    
T  38947018 aattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctctagttct 38946919  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946918 tcaagtgtatcaaaatatttcatggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgttgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 38946819  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946818 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38946754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 28354709 - 28354972
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||    
T  28354709 attgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtcttttattctt 28354808  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  28354809 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcatggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccagcaagaatgtgtcat 28354908  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354909 tctaaagcaggctccatcgcatggttatgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 28354972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45476611 - 45476387
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45476611 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatt-gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 45476513  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476512 caaacgtatcaaaatatttcttgtaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 45476413  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggtt 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45476412 tctaaagccggatccatcgcatggtt 45476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 34920589 - 34920842
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34920589 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 34920688  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34920689 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggtaagaatgtgtcct 34920788  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||          ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34920789 tctaaagccggct----------gttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttg 34920842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9655410 - 9655194
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  9655410 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttctt 9655311  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9655310 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggttaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcct 9655211  T
Q  202 tctaaagccggctccat 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  9655210 tctaaagccggctccat 9655194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264023
Alignment:
Q  54 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaccatcttgctcttggtcaagtcacgt 7264135  T
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7264134 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggttccatgagatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7264035  T
Q  254 cccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||    
T  7264034 cccattcctttg 7264023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 17996991 - 17997242
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||| || |||||  |||||||| ||||||    
T  17996991 tcttgtcacctctatttgacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtcttttgctcttcaaatttatcaa 17997090  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17997091 aatatttcttggaagcaccttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctaccagcaagcatgtgtccttctaaagccggc 17997190  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17997191 tccatcgcatggttgcgaacttcatgaagaatgttcaatctccattcctttg 17997242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 1098633 - 1098791
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1098633 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 1098732  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1098733 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctcggtcaagtcacgtacaatct 1098791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 265
Target Start/End: Original strand, 1100042 - 1100153
Alignment:
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1100042 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccatctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 1100141  T
Q  254 cccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||    
T  1100142 cccattcctttg 1100153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 9639183 - 9639287
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9639183 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccagcaagaaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 9639282  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  9639283 agaat 9639287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9652231 - 9652182
Alignment:
Q  216 catcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9652231 catcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 9652182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 28423423 - 28423487
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||    
T  28423423 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaa 28423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21535309 - 21535200
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||   |||  |||| ||||||||| ||| |    
T  21535309 ctcttgatcaagtcatgtataatcttcttgtcgtcattcattaatcttcccacaagaaggtgcccttctaaatatggcaacatctcatggttgtgaacac 21535210  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
     |||||||||    
T  21535209 aattaagaat 21535200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24683503 - 24683458
Alignment:
Q  152 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtg 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24683503 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttcccgcaagaatgtg 24683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 36816322 - 36816586
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36816322 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 36816421  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816422 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 36816521  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816522 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 36816586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 21955045 - 21955308
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21955045 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21955144  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21955145 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaataatgtgtcct 21955244  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955245 tctagagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 21955308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 46992053 - 46992316
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46992053 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 46992152  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992153 caaatgtatcaaaaaatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 46992252  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992253 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 46992316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 48249674 - 48249937
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  48249674 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 48249773  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249774 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacagtcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 48249873  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249874 tataaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 48249937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 13746527 - 13746791
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  13746527 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 13746626  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746627 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 13746726  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746727 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13746791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 7841822 - 7842085
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7841822 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 7841921  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7841922 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacaggcaagaatgtgtcct 7842021  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7842022 tctaaagccggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 7842085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14399809 - 14399546
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14399809 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 14399710  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399709 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 14399610  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14399609 tctaaagccggctccatggcatggttgtgaactccatttagaatgttcaatccccattcctttg 14399546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 9428639 - 9428903
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  9428639 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 9428738  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428739 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 9428838  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428839 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 9428903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 77827 - 78090
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  77827 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 77926  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77927 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcaataatgtgtcct 78026  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78027 tctaaagccggctccatcaaatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 78090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7838850 - 7838587
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7838850 attgcaacggcttcttgccacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 7838751  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7838750 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatattgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggaaagaatgtgtcct 7838651  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7838650 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccactaagaatgttcaatccccattcctttg 7838587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6742142 - 6741878
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  6742142 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 6742043  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742042 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 6741943  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741942 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 6741878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3949998 - 3949734
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3949998 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3949899  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949898 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3949799  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949798 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3949734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 8159789 - 8160053
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  8159789 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8159888  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159889 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 8159988  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159989 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 8160053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 6504762 - 6505025
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6504762 attgcaacggcttcttgtcacctctatgtgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 6504861  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6504862 caaatgtatcaaaatatttcttggaaacatcttgttcttggtcaagtcatgtacaatcttcttttcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcat 6504961  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504962 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 6505025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16445874 - 16445611
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  16445874 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttctt 16445775  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16445774 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtcct 16445675  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445674 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 16445611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 30946448 - 30946712
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  30946448 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 30946547  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946548 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30946647  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946648 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30946712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29930578 - 29930359
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29930578 tgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggtca 29930479  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29930478 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaagaat 29930379  T
Q  246 gttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29930378 gttcaatccccattcctttg 29930359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 46 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29979732 - 29979513
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29979732 tgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggtca 29979633  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29979632 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaagaat 29979533  T
Q  246 gttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29979532 gttcaatccccattcctttg 29979513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 50954376 - 50954264
Alignment:
Q  153 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50954376 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 50954277  T
Q  253 ccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||    
T  50954276 ccccattcctttg 50954264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33399692 - 33399546
Alignment:
Q  99 cttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgt 198  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33399692 cttcaaatttaacaaaatattttttggaagcaccaaactcttggtcaagtcacgtacaagcttcttgccatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgt 33399593  T
Q  199 ccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    | |||||||    | | |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  33399592 ctttctaaacttcgttacatctcttggttgtgaactccattaagaat 33399546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 2285003 - 2285107
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  2285003 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 2285102  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  2285103 agaat 2285107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 9556727 - 9556831
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9556727 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgccctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 9556826  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  9556827 agaat 9556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 51548479 - 51548583
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| || |||    
T  51548479 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgtcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccgtta 51548578  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  51548579 agaat 51548583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 4120740 - 4120843
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4120740 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccgtcaag-aggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4120838  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  4120839 agaat 4120843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8263842 - 8263742
Alignment:
Q  152 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaa 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  8263842 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaatggtcaa 8263743  T
Q  252 t 252  Q
    |    
T  8263742 t 8263742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32426726 - 32426622
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32426726 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctgcataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 32426627  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  32426626 agaat 32426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 40468155 - 40468259
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  40468155 ggtcaagtaatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtaccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 40468254  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  40468255 agaat 40468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4510393 - 4510287
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| | ||||||| ||| ||||    
T  4510393 ttggtcaagtcatgtataattttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaaaacggcaccatctcgtggttgtgaacaccat 4510294  T
Q  239 taagaat 245  Q
     ||||||    
T  4510293 aaagaat 4510287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12491204 - 12491150
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12491204 ttggtcaagtcgtgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 12491150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Original strand, 1275240 - 1275376
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||| | | | || |||| | ||| |||| | ||||||||||| ||||   ||||   || |||||||    
T  1275240 tgacgttcattgtagacttgcttgatatttttcatggactcttgtctttttttctttaaatttgtcaaaatattttttggtttcatcgaactattggtca 1275339  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1275340 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 1275376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29908073 - 29908031
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29908073 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29908031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29949239 - 29949197
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29949239 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29949197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29998393 - 29998351
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29998393 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 25059882 - 25059953
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||| |||||    
T  25059882 ctcttggtcaagtcacatataatctccttgtcgtccttcattaatctttccgcaagaatgtgccctgctaaa 25059953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8117709 - 8117600
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  |||| ||||||||| ||| |    
T  8117709 ctcttagtcaaatcacgtacaatctctttgtcgtccttcattaattttcctgcaagaaggtgccctgctaaacatggcaacatctcatggttgtgaacac 8117610  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
    ||||||||||    
T  8117609 cattaagaat 8117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37016168 - 37015905
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37016168 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 37016069  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016068 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgcacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 37015969  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015968 tctaaagccagctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 37015905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 29355494 - 29355758
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  29355494 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 29355593  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355594 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 29355693  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355694 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 29355758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41455092 - 41454828
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  41455092 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 41454993  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454992 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 41454893  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454892 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 41454828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 50116570 - 50116832
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50116570 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 50116669  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116670 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctaactcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 50116769  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattccttt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50116770 tctaaagccggctccatcgcatggtagtgaactccattaagaatgttcaatctccattccttt 50116832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 38691746 - 38692009
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  38691746 attgcaacggcttcttgtcatctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttatt 38691845  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38691846 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggcaagaacgtgtcct 38691945  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691946 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38692009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 44619910 - 44620173
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  44619910 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 44620009  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620010 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 44620109  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620110 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 44620173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 46974418 - 46974155
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  46974418 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 46974319  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46974318 taaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatgtaccggcaagaatgtgtcct 46974219  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974218 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 46974155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 3947267 - 3947531
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3947267 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3947366  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947367 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3947466  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947467 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3947531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3984368 - 3984104
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3984368 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3984269  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984268 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3984169  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984168 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3984104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 44466837 - 44466573
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  44466837 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 44466738  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466737 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 44466638  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466637 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 44466573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13630670 - 13630407
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  13630670 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttctt 13630571  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13630570 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtcct 13630471  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630470 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13630407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5079190 - 5078926
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5079190 aattgcaacggcttcttgtcacccctatctgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 5079091  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079090 tcaaatgtattaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 5078991  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5078990 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 5078926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13175036 - 13174772
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13175036 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 13174937  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13174936 tcaaatgtatcaaaatatttattggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccagcgagaatgtgtcc 13174837  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13174836 tcctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttg 13174772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20350711 - 20350447
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  20350711 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 20350612  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350611 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 20350512  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20350511 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgtttaatccccattcctttg 20350447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 38774921 - 38775185
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  38774921 aattgcaacggcttcttgtcacccatatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 38775020  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775021 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 38775120  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775121 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38775185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 21943171 - 21943434
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21943171 attgcaacagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21943270  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21943271 caaatttatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcct 21943370  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21943371 tctaaacccggctccatcccatggttgtgaactccattgagaatgttcaatccccattcctttg 21943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 12649386 - 12649647
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||    
T  12649386 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttattttt 12649485  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12649486 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtgctc--ttaatttaccggcaagaatgtgtcct 12649583  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649584 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 12649647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51663512 - 51663249
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51663512 attgcaacgacttattgtcacctctatttgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 51663413  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  51663412 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcgcgtacaatcttcttgtcctcctcctttaatctaccagcaagaatgtgtcat 51663313  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51663312 tctaaagccggcttcatcgcatggttgtgagctccattaagaatgttcaatccccattcttttg 51663249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 54 - 265
Target Start/End: Original strand, 7980071 - 7980282
Alignment:
Q  54 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980071 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 7980170  T
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7980171 acaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactgcattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7980270  T
Q  254 cccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||    
T  7980271 cccattcctttg 7980282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Original strand, 26466108 - 26466328
Alignment:
Q  33 cttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatc 132  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  26466108 cttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgttttttgttcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcacc 26466207  T
Q  133 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaa 232  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26466208 ttagtcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtcattctaaagccggctccatctcatggttgtgaa 26466307  T
Q  233 ctccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  26466308 ctccattaagaatgtttaatc 26466328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 265
Target Start/End: Original strand, 16246609 - 16246821
Alignment:
Q  50 gttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtc 149  Q
    |||||||| | | |||||| | |||||| ||||||| | || ||||   |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  16246609 gttgattgcataattgcttgatatttgttatgcaatcttgtctttttctcttcaaatttaacaaaatatt-cttggatgcaccttgcttttggt-aagtc 16246706  T
Q  150 acgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  16246707 acgtacaatcttcttgtcatcctcttttaatctaccggtaagcatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaacttcattaacaat-ttc 16246805  T
Q  250 aatccccattcctttg 265  Q
    |||| |||||| ||||    
T  16246806 aatctccattcatttg 16246821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 32106462 - 32106698
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| |||||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  32106462 tcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 32106561  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
      ||||| ||  ||||| |   |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||    
T  32106562 c-tattttttcaaagcaccaaactcttggtcaagtcacatacaagctttttgtcattctcctttaatctaccagcaatcatgtgtccttctaaacttggc 32106660  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||| |||| |||| |||||  |||||||| |||||||    
T  32106661 tccatctcatgattgtgaactc--ttaagaatattcaatc 32106698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 36360466 - 36360570
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  36360466 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccgacaagaatgtgtcctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 36360565  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  36360566 agaat 36360570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Original strand, 18887570 - 18887673
Alignment:
Q  142 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18887570 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccattaa 18887669  T
Q  242 gaat 245  Q
    ||||    
T  18887670 gaat 18887673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45472467 - 45472363
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45472467 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccacaccatctcatggttgtgaacgccatta 45472368  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45472367 agaat 45472363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7403733 - 7403629
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  7403733 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 7403634  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  7403633 agaat 7403629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28863005 - 28862901
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  28863005 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtccttcattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 28862906  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  28862905 agaat 28862901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25231419 - 25231305
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| | || || |||||| ||||||||    
T  25231419 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttggtatcctcccttgatctacctgcaagcatgtgtccttccaaacttggcttcgtctcacggttgtgaactccat 25231320  T
Q  239 taagaatgttcaatc 253  Q
    | | ||| |||||||    
T  25231319 tgaaaatattcaatc 25231305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39914057 - 39914011
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39914057 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttcattaatct 39914011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25593785 - 25593679
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  ||||  |||||||| ||| ||||    
T  25593785 ttggtcaagtcacatacaatcgccttgtcgtcctccattaatattcccgcaagaaggtgccctgctaaatatggcaacatcttatggttgtgaacaccat 25593686  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  25593685 taagaat 25593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 25895908 - 25896171
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  25895908 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 25896007  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896008 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 25896107  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896108 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 25896171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34079035 - 34078771
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  34079035 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 34078936  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078935 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 34078836  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078835 ttctaaagccggctccatgggatggttttgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 34078771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 18537143 - 18537406
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18537143 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 18537242  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537243 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctcactcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 18537342  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537343 tctaaagctggctcaatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18537406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 7799813 - 7800076
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  7799813 attgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 7799912  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7799913 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtcct 7800012  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7800013 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaattcccattcctttg 7800076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 37819683 - 37819947
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  37819683 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 37819782  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37819783 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaacaatgtgtcc 37819882  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819883 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 37819947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 7020686 - 7020950
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  7020686 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 7020785  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020786 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttcctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 7020885  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7020886 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 7020950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 27866651 - 27866915
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  27866651 aattgcaaaggtttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 27866750  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866751 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 27866850  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27866851 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 27866915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 28885214 - 28885478
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  28885214 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 28885313  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28885314 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatctatcc 28885413  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885414 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 28885478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 253
Target Start/End: Original strand, 4202746 - 4202997
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  4202746 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 4202845  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202846 caaatgtatcaaaatattacttggaagcatcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagagtgtgtcct 4202945  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4202946 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 4202997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 11032259 - 11032522
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  11032259 attgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 11032358  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11032359 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcat 11032458  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11032459 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcttttg 11032522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 38858997 - 38859260
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  38858997 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 38859096  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859097 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgttttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 38859196  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  38859197 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcttttg 38859260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 13566897 - 13567172
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtac- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |     
T  13566897 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttca 13566996  T
Q  100 ----------ttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggca 189  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13566997 cacttgcttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtccttctttaatctaccggca 13567096  T
Q  190 agaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567097 agaatgtgtccttctaaagctggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13567172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 265
Target Start/End: Original strand, 1035459 - 1035620
Alignment:
Q  104 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035459 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 1035558  T
Q  204 taaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035559 taaagccggctccatggcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1035620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1036605 - 1036424
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1036605 attgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 1036506  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatcta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1036505 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatcta 1036424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20286251 - 20286015
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  20286251 tcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 20286152  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20286151 aatatttcttggaagcaccttactcttggttaagtcacatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggc 20286052  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttca 250  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286051 tccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttca 20286015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20286650 - 20286515
Alignment:
Q  115 atatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggct 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20286650 atatttcttggatgcaccttactcttggtcaagtcatgtacaatctttttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggct 20286551  T
Q  215 ccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttca 250  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286550 ccatcacatggttgtaaactccattaagaatgttca 20286515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33994315 - 33994242
Alignment:
Q  192 aatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33994315 aatgtgtccttctaaagccggctccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcgttcctttg 33994242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Original strand, 13157978 - 13158092
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  13157978 ttggtgaagtcacatacaagtttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgcgtccttttaaatttgactccatttcatggttgtgaactccat 13158077  T
Q  239 taagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||||    
T  13158078 taagaatgttcaatc 13158092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 253
Target Start/End: Original strand, 23028381 - 23028625
Alignment:
Q  16 ttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaa 115  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||  | ||||| |||||| |||||| | | |||||||||||| | |  | ||||   |||||||| ||  ||||    
T  23028381 ttgtcacctctgtttgacttgaatatttttttacgttcattgtatacttgcatgatatttgtcatgcactcttttctttttctcttcaaatttaataaaa 23028480  T
Q  116 tatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcac-------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaag 208  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  23028481 tattttttgaaagcatcaaactcttggtcaagtcaccaatcatgtacaatcttcttgtcatcctcccttaatctacccgcaagcatgtgttcttctaaac 23028580  T
Q  209 ccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
      | || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  23028581 ttgccttcatctcatggttgtgaactccattaataatattcaatc 23028625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6552904 - 6552800
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6552904 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacacaccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 6552805  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  6552804 agaat 6552800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42343606 - 42343502
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  42343606 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttatgaacaccatta 42343507  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  42343506 agaat 42343502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43295336 - 43295232
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  43295336 ggtcaaatcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtggcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 43295237  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  43295236 agaat 43295232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 27013615 - 27013719
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  27013615 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaatgccatta 27013714  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  27013715 agaat 27013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11819329 - 11819279
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11819329 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 11819279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25048515 - 25048464
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaa 190  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25048515 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaa 25048464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20287510 - 20287404
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||| |||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  20287510 tcttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 20287411  T
Q  114 aatattt 120  Q
    |||||||    
T  20287410 aatattt 20287404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 245
Target Start/End: Original strand, 30617320 - 30617402
Alignment:
Q  163 ttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  30617320 ttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaat 30617402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 1872
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  2136 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 2037  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2036 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1937  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1936 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17319 - 17060
Alignment:
Q  6 caacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17319 caacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaa 17220  T
Q  106 tgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttcta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17219 tgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttcta 17120  T
Q  206 aagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17119 aagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccctattcctttg 17060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4977009 - 4976746
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4977009 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 4976910  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4976909 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtctt 4976810  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976809 tctaaagccggctccatcgcatggttgcaaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 4976746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9891276 - 9891013
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  9891276 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 9891177  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891176 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 9891077  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891076 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 9891013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 19072463 - 19072727
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19072463 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttt 19072562  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072563 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 19072662  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    || |||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072663 ttataaagcagactccatagaatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 19072727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 49565270 - 49565534
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  49565270 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 49565369  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49565370 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcc 49565469  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565470 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 49565534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3405045 - 3404781
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  3405045 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtctttggttct 3404946  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3404945 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtcc 3404846  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404845 ttctaaagccaactccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 3404781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11502760 - 11502497
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  11502760 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 11502661  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11502660 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcatgaatgtgtcct 11502561  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11502560 tctaaagccggctccatcgcatgggtgtgaactccattaagaatgttcaatactcattcctttg 11502497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 4978765 - 4979024
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4978765 attgcaacggcttcttgtcacct----ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 4978860  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  4978861 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcatcctttagtctgctggcaagaatgtgtcct 4978960  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978961 tctaaagtcggctccatcgcatggttgggaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 4979024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 41024454 - 41024191
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  41024454 aattgcaacgactttttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 41024355  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41024354 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtcc 41024255  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41024254 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaattccattaagaatgttcaat-cccattcctttg 41024191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 18580138 - 18580398
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  18580138 attgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgaggtctttagttctt 18580234  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18580235 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcat 18580334  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18580335 tctaaagccggcttcattgcatggttgtgaactccattaagaatgtttaatcctcattcctttg 18580398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 51643305 - 51643570
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51643305 attgcaacggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 51643404  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51643405 caaatgtatcaaaatattttttgaaagcattttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtcct 51643504  T
Q  202 tctaaagcc-ggctccatcgcatggttgt-taactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  51643505 tataaagccgggctccatcgcatgtttgtgaaactccattaagaatgttcaatctcaattcctttg 51643570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21472047 - 21471785
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| | |    
T  21472047 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattttt-atccaatgtggtcttttgttcat 21471949  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |    
T  21471948 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttattctatcttcaagaatgtgtctt 21471849  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    | |||||  | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471848 tttaaagttgtctccattgtatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 21471785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4769389 - 4769179
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4769389 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 4769290  T
Q  101 tcaaatg----tatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    ||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4769289 tcaaatcaatttatcaaaatatttcttgaaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgt 4769190  T
Q  197 gtccttctaaa 207  Q
    |||||||||||    
T  4769189 gtccttctaaa 4769179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 38463644 - 38463821
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  38463644 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtcttttgtcctt 38463743  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38463744 caaatgtatcaaaatattttttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtgcaatcttcttgtcgtcctcctttaa 38463821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44049864 - 44049720
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  44049864 attgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 44049765  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44049764 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctattggtcaa 44049720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17916302 - 17916198
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17916302 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 17916203  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  17916202 agaat 17916198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 211 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17140634 - 17140580
Alignment:
Q  211 ggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140634 ggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 17140580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6182821 - 6182679
Alignment:
Q  111 caaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagcc 210  Q
    |||||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||||       
T  6182821 caaaatattttttgaaagcaccaaactcttggtcaagtcatgtacaattttcttgtcaccatcccttaatatacttgcaagcatatgtccttctaaactt 6182722  T
Q  211 ggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  6182721 ggcttcatctcatggttgtgaactccatcaagaatattcaatc 6182679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4617818 - 4617714
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||   || ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4617818 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccagcaagaaggttctctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4617719  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  4617718 agaat 4617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 265
Target Start/End: Original strand, 38463824 - 38463867
Alignment:
Q  222 atggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463824 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 38463867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1590950 - 1590845
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  1590950 ttggtcaagtcatgtacaatcttct-gtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccacaccatctcatggttgtgaacgccat 1590852  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  1590851 taagaat 1590845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 46517380 - 46517480
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46517380 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttctagcaagaaggtgccctgctatataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46517479  T
Q  241 a 241  Q
    |    
T  46517480 a 46517480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32716409 - 32716305
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32716409 ggtcaagtcatgtacaatctttttgtcgtcctccattaatcttccggtaataaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 32716310  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  32716309 agaat 32716305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 20971446 - 20971492
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  20971446 ctcttagtcaagtcacgtacaatctccttgtcgttctccattaatct 20971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18106643 - 18106379
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  18106643 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 18106544  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18106543 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtcc 18106444  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106443 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18106379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30787794 - 30787530
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  30787794 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttct 30787695  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787694 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30787595  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787594 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 30787530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 43622941 - 43623205
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  43622941 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 43623040  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623041 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 43623140  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623141 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 43623205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 617555 - 617819
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  617555 aattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 617654  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617655 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 617754  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617755 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 617819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47062138 - 47061874
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtca-cctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  47062138 attgcaacggcttcttgtcaacctctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 47062039  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062038 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatctttttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 47061939  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47061938 ttcaaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 47061874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 45764634 - 45764370
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||    
T  45764634 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 45764535  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45764534 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtca 45764435  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764434 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 45764370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15060867 - 15060605
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  15060867 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 15060768  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060767 caaatgtatcaaaatattccttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 15060668  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15060667 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaa-ccccattcctttg 15060605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42500661 - 42500398
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  42500661 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 42500562  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42500561 caaatgtatcaaaatatttcttgaaagcatcttgatctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtttcct 42500462  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42500461 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttg 42500398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Original strand, 43827413 - 43827676
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43827413 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 43827512  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43827513 caaatttatcaaaatatttcttggaagcatcttgcacttggtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcat 43827612  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43827613 tctaaagctggctccttcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 43827676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8400840 - 8400577
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  8400840 attgcaacgccgtcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtcttttgttctt 8400741  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8400740 caaatttatcaaaatattttttggtaacatcttgctcttggtcaagtcacctacaatcttcttgtcatcctcctttaatgtaccagcaagaatgtgtcct 8400641  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  8400640 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattgaaaatgttcaatccccattcttttg 8400577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21800156 - 21800003
Alignment:
Q  112 aaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21800156 aaaatattttttggatgcaccttgctcttgattaagtcacgtataattttcttgttatcctcctttaatctaccgacaaacatgtgtccttctaaagccg 21800057  T
Q  212 gctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21800056 actccatcgcatggttgtgaactccattaacaatgttcaatctccattgctttg 21800003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46791440 - 46791336
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46791440 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46791341  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  46791340 agaat 46791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1297101 - 1296997
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1297101 ggtcaagtcatgtacaatcttctcgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttattaacaccatta 1297002  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  1297001 agaat 1296997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 45172855 - 45172959
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45172855 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45172954  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45172955 agaat 45172959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Original strand, 40445512 - 40445615
Alignment:
Q  142 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  40445512 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggttccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaa 40445611  T
Q  242 gaat 245  Q
    ||||    
T  40445612 gaat 40445615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 245
Target Start/End: Original strand, 8194228 - 8194330
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaag 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| | |||  || | ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  8194228 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgcaaaatacgccaccatctcatggttgtgaacaccattaag 8194327  T
Q  243 aat 245  Q
    |||    
T  8194328 aat 8194330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 20908458 - 20908528
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaa 206  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20908458 ctcttggtaaagtcacgcacaatcttcttgtcatcctcccttaatcttcctgcaagaatgtgcccttctaa 20908528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 47867442 - 47867494
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47867442 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 47867494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 182
Target Start/End: Original strand, 16794557 - 16794600
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16794557 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 16794600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40794035 - 40793934
Alignment:
Q  144 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaaga 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  40794035 caagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaattttcctgcaagaaggtgccctactacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccattaaga 40793936  T
Q  244 at 245  Q
    ||    
T  40793935 at 40793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 43379254 - 43379306
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  43379254 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtactctgttaatcttccggcaagaa 43379306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3762115 - 3761979
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||| | | || ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||    
T  3762115 tgacgttcattgtatgctttctttacatttgtcatgcactcttgtctttttcccttcaaattcatcaaaatattttttggctgcatcaaactcttggtca 3762016  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||| || || |||||| ||||| || ||| |||||||    
T  3762015 agttacctagaatctttttgtcatcttcccttaatct 3761979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 16796810 - 16796842
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcc 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16796810 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcc 16796842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 265
Target Start/End: Original strand, 29287758 - 29288018
Alignment:
Q  5 gcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaa 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29287758 gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaa 29287857  T
Q  105 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29287858 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttat 29287957  T
Q  205 aaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287958 aaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 29288018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18607250 - 18606987
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  18607250 attgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttatt 18607151  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18607150 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcgacaagaatgtgtcct 18607051  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607050 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 18606987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 1611557 - 1611821
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  1611557 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 1611656  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611657 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1611756  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611757 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 1611821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 18 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28250887
Alignment:
Q  18 gtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaata 28251035  T
Q  118 tttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctcca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28251034 tttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagctggctcca 28250935  T
Q  218 tcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28250934 tgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 28250887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31147576 - 31147313
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  31147576 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 31147477  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147476 caaatgtataaaaatattacttggaagcatcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcattctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 31147377  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31147376 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 31147313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220157
Alignment:
Q  16 ttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatttatcaaaa 24220309  T
Q  116 tatttcttggaagcatctt--gctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24220308 tatttcttggaagcatcttatgctcttggtcaagtcacgtataattttcttgtcgtcctcctttaatctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccgac 24220209  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24220208 tccatcgcatggttgtgaactgcattaagaattttcaatccccattcatttg 24220157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 21358157 - 21358411
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21358157 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21358253  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21358254 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcct 21358353  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccatt 259  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21358354 tctaaagccaacttcatcgcctggttgtgaacttcattgagaatgttcaatccccatt 21358411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 23962139 - 23962393
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23962139 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 23962235  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23962236 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcct 23962335  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccatt 259  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23962336 tctaaagccaacttcatcgcctggttgtgaacttcattgagaatgttcaatccccatt 23962393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 125 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7362310 - 7362170
Alignment:
Q  125 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  7362310 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatg 7362211  T
Q  225 gttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7362210 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttg 7362170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 159 - 265
Target Start/End: Original strand, 7362307 - 7362413
Alignment:
Q  159 cttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccat 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7362307 cttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcat 7362406  T
Q  259 tcctttg 265  Q
    |||||||    
T  7362407 tcctttg 7362413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Original strand, 34111603 - 34111712
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||    ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34111603 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttctagtcatcttcctttaatcttcctgcaagaattttcccttctaactttggcgccatctcatggttgtgaactc 34111702  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
    ||||||||||    
T  34111703 cattaagaat 34111712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 265
Target Start/End: Original strand, 13387721 - 13387764
Alignment:
Q  222 atggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13387721 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 13387764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35243644 - 35243594
Alignment:
Q  215 ccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35243644 ccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttg 35243594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22864921 - 22864869
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22864921 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcctcctccattaatcttccggcaagaa 22864869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Original strand, 26684976 - 26685026
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  26684976 tcaagtcatgtacaatcgtcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaa 26685026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Original strand, 16163 - 16427
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  16163 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 16262  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16263 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcttcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 16362  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16363 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttg 16427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34064 - 33800
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  34064 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 33965  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33964 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 33865  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 33800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12517 - 12253
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttcc-atatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12517 attgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcgatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 12418  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12417 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctttctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctaccggaaagaatgtgtcc 12318  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317 ttctaaagccagctccatggcatggttttgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 12253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 120 - 265
Target Start/End: Original strand, 95 - 240
Alignment:
Q  120 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgttctcctttagtctactcgtaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 194  T
Q  220 gcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttg 265  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  195 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcaccattcctttg 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3951 - 3847
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |    || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3951 ggtcaagttatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataacgcaccatctcatggttgtgaactccatta 3852  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  3851 agaat 3847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University