View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2479_low_30 (Length: 413)

Name: NF2479_low_30
Description: NF2479
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2479_low_30
NF2479_low_30
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (18-400)||(45455618-45456000)
chr8 (131-395)||(2145549-2145813)
chr8 (131-401)||(35965295-35965565)
chr8 (131-401)||(43371008-43371278)
chr8 (131-396)||(7169137-7169402)
chr8 (131-397)||(22581073-22581339)
chr8 (143-401)||(43688733-43688991)
chr8 (135-401)||(7341320-7341586)
chr8 (135-401)||(30304164-30304430)
chr8 (135-401)||(32377462-32377728)
chr8 (135-401)||(32431419-32431685)
chr8 (135-401)||(8422410-8422676)
chr8 (316-394)||(39751763-39751841)
chr8 (311-401)||(1116013-1116103)
chr8 (147-307)||(45116582-45116742)
chr8 (163-313)||(14401355-14401505)
chr8 (146-307)||(44321173-44321334)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (131-401)||(37016155-37016425)
chr1 (134-401)||(50116316-50116583)
chr1 (131-401)||(38691489-38691759)
chr1 (131-401)||(12649129-12649399)
chr1 (134-401)||(46974405-46974672)
chr1 (131-401)||(13175022-13175292)
chr1 (131-401)||(41455078-41455348)
chr1 (131-396)||(51663504-51663769)
chr1 (131-395)||(19498014-19498277)
chr1 (135-401)||(29355242-29355508)
chr1 (135-401)||(13630657-13630923)
chr1 (135-401)||(3947015-3947281)
chr1 (135-401)||(3984354-3984620)
chr1 (135-401)||(5079176-5079442)
chr1 (135-401)||(44466823-44467089)
chr1 (135-401)||(20350697-20350963)
chr1 (135-401)||(38774669-38774935)
chr1 (183-395)||(21942966-21943178)
chr1 (135-393)||(32106208-32106455)
chr1 (277-393)||(25231551-25231667)
chr1 (227-307)||(36360166-36360246)
chr1 (152-307)||(28863225-28863380)
chr1 (321-395)||(26466010-26466084)
chr1 (169-307)||(7403953-7404093)
chr1 (147-307)||(45472687-45472847)
chr1 (169-223)||(25231667-25231721)
[»] chr3 (27 HSPs)
chr3 (131-401)||(46991796-46992066)
chr3 (131-401)||(6504505-6504775)
chr3 (131-401)||(36816066-36816336)
chr3 (134-401)||(14399796-14400064)
chr3 (131-401)||(7838837-7839107)
chr3 (131-401)||(7841566-7841835)
chr3 (131-401)||(77570-77840)
chr3 (131-401)||(29949226-29949495)
chr3 (131-401)||(29998380-29998649)
chr3 (131-401)||(21954789-21955058)
chr3 (131-401)||(48249416-48249687)
chr3 (135-401)||(13746275-13746541)
chr3 (135-401)||(16445861-16446127)
chr3 (135-401)||(3949984-3950250)
chr3 (135-401)||(6742128-6742394)
chr3 (135-401)||(8159537-8159803)
chr3 (187-401)||(29908060-29908273)
chr3 (143-401)||(30946204-30946462)
chr3 (260-401)||(9428512-9428653)
chr3 (134-278)||(28610472-28610616)
chr3 (169-307)||(2284645-2284783)
chr3 (152-300)||(9556335-9556483)
chr3 (147-307)||(12491422-12491582)
chr3 (146-307)||(51548098-51548259)
chr3 (227-307)||(4120440-4120520)
chr3 (227-307)||(40467854-40467934)
chr3 (147-307)||(33940190-33940350)
[»] chr5 (18 HSPs)
chr5 (131-401)||(7799556-7799826)
chr5 (131-401)||(4202489-4202759)
chr5 (131-401)||(18536886-18537156)
chr5 (131-401)||(1036592-1036862)
chr5 (131-401)||(34079021-34079291)
chr5 (131-394)||(27866395-27866658)
chr5 (131-401)||(7020430-7020700)
chr5 (131-374)||(25895647-25895890)
chr5 (135-401)||(38858744-38859010)
chr5 (135-401)||(37819431-37819697)
chr5 (135-397)||(11032006-11032268)
chr5 (135-401)||(28884962-28885228)
chr5 (131-401)||(13566657-13566911)
chr5 (131-386)||(20287524-20287780)
chr5 (226-386)||(20286265-20286424)
chr5 (147-307)||(11819551-11819711)
chr5 (169-307)||(27013257-27013395)
chr5 (227-307)||(43295549-43295629)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (131-401)||(38463387-38463657)
chr4 (131-401)||(4976996-4977266)
chr4 (128-401)||(11502747-11503020)
chr4 (134-401)||(4769375-4769642)
chr4 (131-401)||(44049851-44050121)
chr4 (131-401)||(21472034-21472305)
chr4 (131-401)||(4978508-4978778)
chr4 (135-401)||(9891263-9891529)
chr4 (135-401)||(3405031-3405297)
chr4 (135-401)||(19072211-19072477)
chr4 (135-401)||(49565018-49565284)
chr4 (135-396)||(41024445-41024706)
chr4 (146-393)||(6182927-6183174)
chr4 (294-398)||(51643211-51643315)
chr4 (147-307)||(1591168-1591328)
chr4 (152-307)||(32716628-32716783)
chr4 (189-285)||(34979910-34980006)
chr4 (147-293)||(4617906-4618052)
chr4 (226-258)||(11693442-11693474)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (131-401)||(17310-17580)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (131-401)||(31147563-31147833)
chr6 (131-401)||(18607237-18607507)
chr6 (131-401)||(21357900-21358170)
chr6 (131-401)||(23961882-23962152)
chr6 (131-386)||(29287503-29287757)
chr6 (131-401)||(28357559-28357829)
chr6 (135-401)||(1611305-1611571)
chr6 (147-307)||(9095463-9095623)
chr6 (167-307)||(34111305-34111446)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (131-401)||(24604639-24604909)
chr2 (131-401)||(1098376-1098646)
chr2 (131-401)||(45476598-45476868)
chr2 (131-401)||(41007530-41007800)
chr2 (131-401)||(43948832-43949102)
chr2 (131-401)||(34920332-34920602)
chr2 (131-401)||(24750899-24751170)
chr2 (131-401)||(12907042-12907312)
chr2 (137-401)||(9655397-9655661)
chr2 (131-401)||(436552-436823)
chr2 (131-401)||(27274910-27275180)
chr2 (135-401)||(211995-212261)
chr2 (135-401)||(5348408-5348674)
chr2 (135-401)||(39795211-39795477)
chr2 (135-401)||(41561253-41561519)
chr2 (131-386)||(17996722-17996977)
chr2 (135-401)||(10623008-10623274)
chr2 (131-401)||(11692380-11692635)
chr2 (135-397)||(38947008-38947270)
chr2 (228-401)||(28354549-28354722)
chr2 (131-401)||(3802116-3802386)
chr2 (135-393)||(7264229-7264487)
chr2 (131-286)||(24941200-24941355)
chr2 (169-307)||(28423062-28423200)
chr2 (194-286)||(3353894-3353986)
[»] chr7 (22 HSPs)
chr7 (131-401)||(47062125-47062394)
chr7 (135-401)||(18106629-18106895)
chr7 (135-401)||(42500648-42500914)
chr7 (135-397)||(617303-617565)
chr7 (135-401)||(43827160-43827426)
chr7 (135-401)||(30787780-30788046)
chr7 (135-401)||(43622689-43622955)
chr7 (135-401)||(45764620-45764886)
chr7 (135-369)||(15067162-15067396)
chr7 (220-396)||(8400832-8401008)
chr7 (131-250)||(12116919-12117038)
chr7 (169-307)||(43378896-43379034)
chr7 (169-307)||(16794201-16794339)
chr7 (147-307)||(40794258-40794418)
chr7 (152-307)||(16795667-16795822)
chr7 (169-307)||(45172497-45172635)
chr7 (169-307)||(46791660-46791798)
chr7 (146-307)||(40445130-40445291)
chr7 (227-307)||(1297321-1297401)
chr7 (365-401)||(15060854-15060890)
chr7 (147-307)||(47867065-47867225)
chr7 (214-307)||(8193913-8194006)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (131-401)||(15907-16177)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (135-401)||(2122-2388)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (135-401)||(34050-34316)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (132-223)||(1-92)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (131-246)||(25496-25611)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (325-401)||(12504-12580)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 18 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45456000 - 45455618
Alignment:
Q  18 atattaatcttttacattttgtttacaattataaatttagtttgtttttctgattgaatttaatgttattgtgatgtgttgtgtgtgattttgcaaatga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45456000 atattaatcttttacattttgtttacaattataaatttagtttgtttttgtgattgaatttaatgttattctgatgtgttgtgtgtaattttgcaaatga 45455901  T
Q  118 atatatagatgtattcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcat 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  45455900 atatatagatgtattcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccaaatatgtcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcat 45455801  T
Q  218 cctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcg 317  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  45455800 cctgtacatgttggttttgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttg 45455701  T
Q  318 attgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggctt 400  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45455700 attgtggtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctt 45455618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 131 - 395
Target Start/End: Original strand, 2145549 - 2145813
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  2145549 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 2145648  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145649 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 2145748  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaac 395  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2145749 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 2145813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 35965295 - 35965565
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  35965295 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagggaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgttg 35965394  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35965395 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaactgtagtacttt 35965494  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35965495 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 35965565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 43371278 - 43371008
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||    
T  43371278 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacgttgacatcctgtacatgttg 43371179  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43371178 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 43371079  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  43371078 cactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttc 43371008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 7169402 - 7169137
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7169402 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccctaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 7169303  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7169302 gttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 7169203  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacg 396  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  7169202 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg 7169137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 22581339 - 22581073
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||    
T  22581339 ttcctctttctcatgtgtcgcaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttg 22581240  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22581239 gttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatattttcgattgtagtacttt 22581140  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacgg 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22581139 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgg 22581073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 143 - 401
Target Start/End: Original strand, 43688733 - 43688991
Alignment:
Q  143 atgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtg 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  43688733 atgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtg 43688832  T
Q  243 gagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctc 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43688833 gagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgttc 43688932  T
Q  343 ttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  43688933 ttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttc 43688991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7341586 - 7341320
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  7341586 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 7341487  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  7341486 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 7341387  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7341386 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 7341320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 30304164 - 30304430
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  30304164 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 30304263  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  30304264 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 30304363  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30304364 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 30304430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 32377462 - 32377728
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  32377462 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 32377561  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  32377562 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 32377661  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32377662 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 32377728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 32431419 - 32431685
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  32431419 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 32431518  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  32431519 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 32431618  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32431619 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 32431685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 8422410 - 8422676
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  8422410 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 8422509  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  8422510 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 8422609  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8422610 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 8422676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 316 - 394
Target Start/End: Original strand, 39751763 - 39751841
Alignment:
Q  316 cgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39751763 cgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaa 39751841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1116103 - 1116013
Alignment:
Q  311 atcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| || ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1116103 atcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 1116013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45116742 - 45116582
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| ||||| |    
T  45116742 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45116643  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  45116642 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 313
Target Start/End: Original strand, 14401355 - 14401505
Alignment:
Q  163 caatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgt 262  Q
    ||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||  |||||||||| |||||| |||| || | |||||   |    
T  14401355 caatcgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactat 14401454  T
Q  263 tggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatc 313  Q
     | |||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||    
T  14401455 cgaaaaattattaaacaacttaacagattcaggatgagcccaaaatatatc 14401505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 44321334 - 44321173
Alignment:
Q  146 tgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggag 245  Q
    ||||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || || || |||||||  | ||||| || ||| || || | |||||||||||| |||||     
T  44321334 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaa 44321235  T
Q  246 tccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||||| | |||||  || | |||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  44321234 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37016425 - 37016155
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  37016425 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 37016326  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016325 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 37016226  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37016225 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 37016155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Original strand, 50116316 - 50116583
Alignment:
Q  134 ctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggtt 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  50116316 ctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggtt 50116415  T
Q  234 ttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116416 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 50116515  T
Q  334 tttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  50116516 tttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggcttc 50116583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 38691489 - 38691759
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38691489 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 38691588  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691589 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 38691688  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  38691689 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggcttc 38691759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 12649129 - 12649399
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  12649129 ttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 12649228  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649229 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 12649328  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||    
T  12649329 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgacttc 12649399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 46974672 - 46974405
Alignment:
Q  134 ctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggtt 233  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||  ||||||||    
T  46974672 ctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcgattgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacctgttggtt 46974573  T
Q  234 ttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974572 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 46974473  T
Q  334 tttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  46974472 tttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttc 46974405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13175292 - 13175022
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||    
T  13175292 ttcctctttctcatgggtcacaaatccacacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgatg 13175193  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13175192 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttggatgagcacaaaagatatcttcgattgtagtacttt 13175093  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  13175092 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggcttc 13175022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41455348 - 41455078
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  41455348 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctttacatgttg 41455249  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  41455248 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattacttt 41455149  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41455148 caagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 41455078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 131 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 51663769 - 51663504
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  | || ||||||    
T  51663769 ttcctctttctcatgtgtcacatattcaaactcaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacactggcattttatacatgttg 51663670  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663669 gttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 51663570  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacg 396  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51663569 cactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 51663504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 131 - 395
Target Start/End: Original strand, 19498014 - 19498277
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||     
T  19498014 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagcctaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttt 19498113  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19498114 gttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaag-tatctttgattgtagtacttt 19498212  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaac 395  Q
    ||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19498213 cactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 29355242 - 29355508
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  29355242 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 29355341  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  29355342 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 29355441  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29355442 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 29355508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13630923 - 13630657
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  13630923 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 13630824  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  13630823 tgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaag 13630724  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13630723 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 13630657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 3947015 - 3947281
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  3947015 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 3947114  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  3947115 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 3947214  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3947215 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 3947281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3984620 - 3984354
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  3984620 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 3984521  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  3984520 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 3984421  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3984420 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 3984354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5079442 - 5079176
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  5079442 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 5079343  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  5079342 tgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 5079243  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5079242 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 5079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44467089 - 44466823
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  44467089 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 44466990  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  44466989 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 44466890  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44466889 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 44466823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20350963 - 20350697
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  20350963 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccaaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 20350864  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  20350863 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 20350764  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20350763 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 20350697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 38774669 - 38774935
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  38774669 tctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 38774768  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  38774769 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 38774868  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38774869 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 38774935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 395
Target Start/End: Original strand, 21942966 - 21943178
Alignment:
Q  183 gtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaact 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||    
T  21942966 gtcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaact 21943065  T
Q  283 taacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagat 382  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21943066 taacgaatgatggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagat 21943165  T
Q  383 tagatattgcaac 395  Q
    |||||||||||||    
T  21943166 tagatattgcaac 21943178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 393
Target Start/End: Original strand, 32106208 - 32106455
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  |||   ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  32106208 tctttctcatgtgtcaaaaatccaaaatcaactgaatatgtcaaatcagtcaaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttt 32106307  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    ||||||||||||||||||||           |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  32106308 tgtaggtggagtccataacc-----------aaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcttaaaatatgtcttcaatagtagtactttcact 32106396  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgca 393  Q
    ||||| ||| | | |||||  |||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  32106397 ttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatgca 32106455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 25231667 - 25231551
Alignment:
Q  277 acaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaactt 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| || | | | | |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  25231667 acaacttaacgtatgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattt 25231568  T
Q  377 caagattagatattgca 393  Q
      |||||||||| ||||    
T  25231567 tgagattagatactgca 25231551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Original strand, 36360166 - 36360246
Alignment:
Q  227 gttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  36360166 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 28863380 - 28863225
Alignment:
Q  152 aaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccata 251  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| || || |||||     
T  28863380 aaatgcaaaaccaatcaaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccatt 28863281  T
Q  252 accaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | |||||  || | |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| ||||||    
T  28863280 atcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatgttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 395
Target Start/End: Original strand, 26466010 - 26466084
Alignment:
Q  321 gtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaac 395  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||    
T  26466010 gtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaac 26466084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 7404093 - 7403953
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacatta--gcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttgga 266  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| ||  |||| || || | |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||    
T  7404093 aatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgga 7403994  T
Q  267 aaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  7403993 aaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45472847 - 45472687
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| |  ||| || || | |||||||||||| ||||  |    
T  45472847 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggat 45472748  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  45472747 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25231721 - 25231667
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgta 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||    
T  25231721 aatatgtcaaatcggtcgaggtgaccctaactatctcaaacattggtatcctgta 25231667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 46991796 - 46992066
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  46991796 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 46991895  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991896 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 46991995  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46991996 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggcttc 46992066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 6504505 - 6504775
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  6504505 ttcctcttcctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 6504604  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504605 gttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 6504704  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6504705 cactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggcttc 6504775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 36816066 - 36816336
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  36816066 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 36816165  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36816166 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtattacttt 36816265  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36816266 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 36816336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14400064 - 14399796
Alignment:
Q  134 ctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc-aactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggt 232  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  14400064 ctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggt 14399965  T
Q  233 tttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399964 tttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttca 14399865  T
Q  333 ctttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14399864 ctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggcttc 14399796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7839107 - 7838837
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  7839107 ttccactttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 7839008  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7839007 gttttgtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 7838908  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838907 cactttatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 7838837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 7841566 - 7841835
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  7841566 ttcctcgttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctctacatgttg 7841665  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841666 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 7841765  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7841766 cactttgtgttcttgagtaataag-ttagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 7841835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 77570 - 77840
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||||||    
T  77570 ttcctctttctcatgtgtcaaaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttg 77669  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77670 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgatggtagtacttt 77769  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  77770 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttc 77840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29949495 - 29949226
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  29949495 ttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 29949396  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29949395 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactacttt 29949296  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29949295 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttc 29949226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29998649 - 29998380
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  29998649 ttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 29998550  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29998549 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactacttt 29998450  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  29998449 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttc 29998380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 21954789 - 21955058
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||     
T  21954789 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgttc 21954888  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21954889 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaggtatcttcgattgtggtacttt 21954988  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21954989 cactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggcttc 21955058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 48249416 - 48249687
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccc-aactaccttaaacattagcatcctgtatatgtt 229  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  48249416 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcaaccgaatatgtcaaattggtcaaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 48249515  T
Q  230 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249516 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 48249615  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  48249616 tcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggcttc 48249687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 13746275 - 13746541
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  13746275 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 13746374  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  13746375 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 13746474  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13746475 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 13746541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16446127 - 16445861
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  16446127 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 16446028  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  16446027 tgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactttcaag 16445928  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16445927 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 16445861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3950250 - 3949984
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  3950250 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 3950151  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  3950150 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 3950051  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3950050 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 3949984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6742394 - 6742128
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  6742394 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 6742295  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  6742294 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 6742195  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6742194 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 6742128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 8159537 - 8159803
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  8159537 tctttctcgtgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 8159636  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  8159637 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 8159736  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8159737 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 8159803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 187 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 29908273 - 29908060
Alignment:
Q  187 aagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaac 286  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29908273 aagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 29908174  T
Q  287 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattaga 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  29908173 ggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattaga 29908075  T
Q  387 tattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||| ||||    
T  29908074 tattgcaacgacttc 29908060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 143 - 401
Target Start/End: Original strand, 30946204 - 30946462
Alignment:
Q  143 atgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtg 242  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  30946204 atgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtg 30946303  T
Q  243 gagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctc 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||    
T  30946304 gagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttc 30946403  T
Q  343 ttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30946404 ttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 30946462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 260 - 401
Target Start/End: Original strand, 9428512 - 9428653
Alignment:
Q  260 cgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatag 359  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  9428512 cgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatag 9428611  T
Q  360 ttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9428612 ttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 9428653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 278
Target Start/End: Original strand, 28610472 - 28610616
Alignment:
Q  134 ctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggtt 233  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| | || |||||||||    
T  28610472 ctctttctcatatgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaattggccgaagtgattccaactacctcaaacattgacatcttctacatgttggtt 28610571  T
Q  234 ttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaac 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28610572 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaac 28610616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 2284645 - 2284783
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| ||||| ||||| | |||||| || |||||    
T  2284645 aatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaaatagtcggaaa 2284744  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  2284745 agtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 300
Target Start/End: Original strand, 9556335 - 9556483
Alignment:
Q  152 aaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccata 251  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| |  ||||||||| | |||||||||||| ||| | |||||     
T  9556335 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatccatt 9556434  T
Q  252 accaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgag 300  Q
    | |||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9556435 atcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12491582 - 12491422
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| |  ||| || || | |||| ||||||| | ||| |    
T  12491582 gtcataaatgcaaaaccaaccaaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaat 12491483  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  12491482 ccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Original strand, 51548098 - 51548259
Alignment:
Q  146 tgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggag 245  Q
    ||||| |||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| |||||     
T  51548098 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaa 51548197  T
Q  246 tccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||||| | |||||  || | |||| | ||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  51548198 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Original strand, 4120440 - 4120520
Alignment:
Q  227 gttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  4120440 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Original strand, 40467854 - 40467934
Alignment:
Q  227 gttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40467854 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 33940350 - 33940190
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| ||||| |    
T  33940350 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 33940251  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || |  ||| | |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||    
T  33940250 ccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 18)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 7799556 - 7799826
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  7799556 ttcctctttctcatgtctcacaaatccaaacccaaccgaatatgttaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 7799655  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799656 gttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 7799755  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7799756 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 7799826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 4202489 - 4202759
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  4202489 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacagaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttg 4202588  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202589 gttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 4202688  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4202689 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 4202759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 18536886 - 18537156
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||     
T  18536886 ttcctctttctcatgcgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgtta 18536985  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18536986 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 18537085  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18537086 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 18537156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1036862 - 1036592
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  1036862 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 1036763  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036762 attttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 1036663  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1036662 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 1036592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34079291 - 34079021
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  34079291 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 34079192  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34079191 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattacttt 34079092  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34079091 cacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 34079021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 131 - 394
Target Start/End: Original strand, 27866395 - 27866658
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||| || ||||||    
T  27866395 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgttg 27866494  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27866495 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattacttt 27866594  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaa 394  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27866595 cacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaa 27866658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 7020430 - 7020700
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  7020430 ttcctctttctcatgtgtcataaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 7020529  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7020530 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaatagtattacttt 7020629  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7020630 caagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 7020700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 131 - 374
Target Start/End: Original strand, 25895647 - 25895890
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  25895647 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcacccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaagcattggcatcctatacatgttg 25895746  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25895747 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactct 25895846  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaac 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25895847 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac 25895890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 38858744 - 38859010
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38858744 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatatatgttggttt 38858843  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  38858844 tgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 38858943  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38858944 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 38859010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 37819431 - 37819697
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  37819431 tctttctcatgtgtcataaatccaaacctaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 37819530  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  37819531 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 37819630  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  37819631 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 37819697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Original strand, 11032006 - 11032268
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  11032006 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 11032105  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  11032106 tgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 11032205  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacgg 397  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11032206 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgg 11032268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 28884962 - 28885228
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  28884962 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaacggattatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccaatacatgttggttt 28885061  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  28885062 cgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 28885161  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28885162 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 28885228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 13566657 - 13566911
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||    
T  13566657 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctagacatgttg 13566756  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |                ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13566757 gttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatgatcccaaaagatatcttcaattgtattacttt 13566840  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13566841 caagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 13566911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 131 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20287780 - 20287524
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  20287780 ttcctctttctcatgcgtcacaaattcaaagccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacataggcatcttgtacatgttg 20287681  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatt-tttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||    
T  20287680 gtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttggatgagcgcaaaatatgtcttcaatagtagtactt 20287581  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattaga 386  Q
    | ||  | || ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20287580 tgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattaga 20287524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 226 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 20286424 - 20286265
Alignment:
Q  226 tgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagt 325  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  20286424 tgttggttaggtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagt 20286326  T
Q  326 actttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattaga 386  Q
    ||||||| |||||| | ||||| |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20286325 actttcattttgtgttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattaga 20286265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 11819711 - 11819551
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | ||||||||||||  ||  | ||||| |||||||  | ||||| ||||||||| || | |||||||||||| ||||| |    
T  11819711 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttaaggtgactccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaat 11819612  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||    
T  11819611 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgattttggatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 27013257 - 27013395
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| |  ||| || || | |||||||||||| ||||| || || | |||||  || |||||    
T  27013257 aatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaatctattatcaaaacagtcggaaa 27013356  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  27013357 attgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 43295629 - 43295549
Alignment:
Q  227 gttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  || | |||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  43295629 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 38463387 - 38463657
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  38463387 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgactccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgttg 38463486  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463487 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 38463586  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38463587 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttc 38463657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4977266 - 4976996
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  4977266 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttg 4977167  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4977166 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 4977067  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  4977066 cactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttc 4976996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 128 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11503020 - 11502747
Alignment:
Q  128 gtattcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  11503020 gtattcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatg 11502921  T
Q  228 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502920 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 11502821  T
Q  328 tttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11502820 tttctctttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 11502747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4769642 - 4769375
Alignment:
Q  134 ctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggtt 233  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||    
T  4769642 ctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggtt 4769543  T
Q  234 ttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769542 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 4769443  T
Q  334 tttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||    
T  4769442 tttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggcttc 4769375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44050121 - 44049851
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  44050121 ttcctctttctcatgtgtcacaaatttaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 44050022  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44050021 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtagttt 44049922  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44049921 cactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttc 44049851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21472305 - 21472034
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21472305 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 21472206  T
Q  231 gt-tttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21472205 gtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctttgattttagtactt 21472106  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  21472105 tcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttc 21472034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 4978508 - 4978778
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||| ||||||    
T  4978508 ttcctctttctcatgtatcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccctaactacctcaaacattgacatcatgtacatgttg 4978607  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978608 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttggaagagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 4978707  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4978708 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggcttc 4978778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9891529 - 9891263
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9891529 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 9891430  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  9891429 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 9891330  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9891329 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 9891263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3405297 - 3405031
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3405297 tctttctcatgtgccataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 3405198  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  3405197 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 3405098  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3405097 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 3405031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 19072211 - 19072477
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  19072211 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 19072310  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  19072311 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 19072410  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19072411 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 19072477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 49565018 - 49565284
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  49565018 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 49565117  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  49565118 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 49565217  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49565218 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 49565284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 135 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 41024706 - 41024445
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||| || ||||||||||    
T  41024706 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgttggttt 41024607  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  41024606 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 41024507  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacg 396  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  41024506 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacg 41024445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6183174 - 6182927
Alignment:
Q  146 tgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggag 245  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  6183174 tgtcaaaaatccaaaaccaactaaatttgtcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggag 6183075  T
Q  246 tccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttg 345  Q
    | ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| |||||| | | |    
T  6183074 ttcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatgg 6182975  T
Q  346 agtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgca 393  Q
     | |||||  ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  6182974 tgaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgca 6182927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 398
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643315
Alignment:
Q  294 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgca 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  394 acggc 398  Q
    |||||    
T  51643311 acggc 51643315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1591328 - 1591168
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | ||||||||| || ||||| |    
T  1591328 gtcacaaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaat 1591229  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || | |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  1591228 ccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 32716783 - 32716628
Alignment:
Q  152 aaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccata 251  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||||||||||| ||||| |||||     
T  32716783 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatccatt 32716684  T
Q  252 accaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | |||||  || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  32716683 atcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 34980006 - 34979910
Alignment:
Q  189 gtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaa 285  Q
    ||||||||||||| || ||||| |  |||  |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||||    
T  34980006 gtgaccccaactatctcaaacaatgacattatgtacatgttggttttataggtgaagtccatgaccaaaatagacagaaaattgttaaacaacttaa 34979910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4618052 - 4617906
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | ||||||||||||  || || ||||| |||||||  | ||||| | || |||| || | |||||||||||| ||||| |    
T  4618052 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaat 4617953  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgtt 293  Q
    |||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4617952 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgtt 4617906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 226 - 258
Target Start/End: Original strand, 11693442 - 11693474
Alignment:
Q  226 tgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11693442 tgttggttttgtaggtggagtccatgaccaaaa 11693474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17580 - 17310
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  17580 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 17481  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17480 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttcgattgtagtacttt 17381  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17380 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttc 17310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31147833 - 31147563
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  31147833 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaacacaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttg 31147734  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147733 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgtatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 31147634  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31147633 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 31147563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18607507 - 18607237
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||    
T  18607507 ttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaatcgaatatgtcaaatctgtcgaagtgaccccaactacttcaaatattggcatcctgtacatgttg 18607408  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607407 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 18607308  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18607307 cactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttc 18607237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 21357900 - 21358170
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21357900 ttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 21357999  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21358000 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtacttt 21358099  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21358100 cactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttc 21358170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 23961882 - 23962152
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  23961882 ttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 23961981  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23961982 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtacttt 23962081  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23962082 cactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttc 23962152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 131 - 386
Target Start/End: Original strand, 29287503 - 29287757
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  29287503 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 29287602  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287603 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaa-ttttaaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 29287701  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattaga 386  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29287702 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga 29287757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28357829 - 28357559
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  28357829 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacatttgcatcctatacatgttg 28357730  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28357729 gtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattacttt 28357630  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28357629 caagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 28357559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 1611305 - 1611571
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  1611305 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctataaatgttggtct 1611404  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  1611405 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 1611504  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1611505 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 1611571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9095623 - 9095463
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| |  ||| || || | ||||| |||||| ||||| |    
T  9095623 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaat 9095524  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||  || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9095523 ccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 307
Target Start/End: Original strand, 34111305 - 34111446
Alignment:
Q  167 caaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaa-tcgttgg 265  Q
    ||||||||||| |||||  || ||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||| | ||  |    
T  34111305 caaatatgtcatatcggctgaggtgaccctaactatcttaaacatcggcatcttgtacatgttggtttgatagttggagtacatgatcaaaatttgtcag 34111404  T
Q  266 aaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | |||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  34111405 aaaactgttaaacaacttaactgattcaagatgagcccaaaa 34111446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 24604639 - 24604909
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  24604639 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 24604738  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24604739 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtacttt 24604838  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24604839 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 24604909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 1098376 - 1098646
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  1098376 ttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgattatgtcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttg 1098475  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1098476 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcggttgtagtacttt 1098575  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1098576 cactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 1098646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45476868 - 45476598
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  45476868 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcagatcgtttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 45476769  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476768 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 45476669  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45476668 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 45476598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 41007530 - 41007800
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||     
T  41007530 ttcctctttctcatgtgtcacaaatcgaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtta 41007629  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007630 gttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 41007729  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41007730 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 41007800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 43948832 - 43949102
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  43948832 ttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtagaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 43948931  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43948932 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 43949031  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  43949032 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggcttc 43949102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 34920332 - 34920602
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  34920332 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 34920431  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920432 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 34920531  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34920532 cactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggcttc 34920602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24751170 - 24750899
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtat-atgtt 229  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||    
T  24751170 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctataacatgtt 24751071  T
Q  230 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  24751070 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatctttgatcgtattactt 24750971  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24750970 tcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 24750899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 12907042 - 12907312
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12907042 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 12907141  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12907142 gttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagtccaaaagatattttcgattgtagtacttt 12907241  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  12907242 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggcttc 12907312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 137 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9655661 - 9655397
Alignment:
Q  137 tttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttg 236  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  9655661 tttctcatgtgttacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttg 9655562  T
Q  237 taggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcacttt 336  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9655561 taggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcacttt 9655462  T
Q  337 gtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  9655461 gtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgacttc 9655397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 436823 - 436552
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaac-attagcatcctgtatatgtt 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  436823 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacggaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaaccattggcatcctgtacatgtt 436724  T
Q  230 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  436723 ggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaagatgttagatgagcccaaaagatatcttagattgtagtactt 436624  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  436623 tcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 436552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 27274910 - 27275180
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  27274910 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 27275009  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  27275010 gttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattacttt 27275109  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27275110 caagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 27275180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 211995 - 212261
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  211995 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 212094  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  212095 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 212194  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  212195 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 212261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5348674 - 5348408
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  5348674 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 5348575  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  5348574 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 5348475  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5348474 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 5348408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39795477 - 39795211
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  39795477 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 39795378  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |||      
T  39795377 tgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactatcaag 39795278  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39795277 ttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 39795211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41561519 - 41561253
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  41561519 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 41561420  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  41561419 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 41561320  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  41561319 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 41561253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 131 - 386
Target Start/End: Original strand, 17996722 - 17996977
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17996722 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcttgtacatgttg 17996821  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  17996822 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttggatgagcctaaaagatatcttcaatagtagtacttt 17996921  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattaga 386  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17996922 cactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattaga 17996977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 10623008 - 10623274
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  10623008 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 10623107  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  10623108 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttagatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 10623207  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10623208 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 10623274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 11692380 - 11692635
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||                
T  11692380 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaactgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattggcatc------------ 11692467  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  11692468 ---ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttctattgtagtaattt 11692564  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11692565 cactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttc 11692635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38947270 - 38947008
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| |    
T  38947270 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcttatacatgttggtct 38947171  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  38947170 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 38947071  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacgg 397  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38947070 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgg 38947008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 228 - 401
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354722
Alignment:
Q  228 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  328 tttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttc 28354722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 3802116 - 3802386
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaa-cattagcatcctgtatatgtt 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||| || |||||    
T  3802116 ttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaactgaatatgtcaagtcggttgaagtcaccc-aactacctcaaaacattggcatcctatacatgtt 3802214  T
Q  230 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  3802215 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 3802314  T
Q  330 tcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3802315 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 3802386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 135 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7264487 - 7264229
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||  |||    
T  7264487 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacatcaaacattggcatcctatacatgttaattt 7264388  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  7264387 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttggatgagcctaaaaaatatcttcaatggtattactttcaag 7264288  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgca 393  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7264287 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 131 - 286
Target Start/End: Original strand, 24941200 - 24941355
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  24941200 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttg 24941299  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24941300 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaac 24941355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 28423062 - 28423200
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| |||||||  | ||||| | ||||| |||| | |||||||||||| |||||  |||| | |||||  || || ||    
T  28423062 aatatgtcacatcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcgggaa 28423161  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  28423162 attgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 28423200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 286
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353986
Alignment:
Q  194 cccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaac 286  Q
    |||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||  || | |||||| |||||||| |||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaac 3353986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 22)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47062394 - 47062125
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| || |||    
T  47062394 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacattttg 47062295  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47062294 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccgaaagatatcttcaattgtagtacttt 47062195  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47062194 cactttgtg-ttttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 47062125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18106895 - 18106629
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18106895 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattagcatcctatacatgttggttt 18106796  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  18106795 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 18106696  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18106695 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 18106629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 42500914 - 42500648
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  42500914 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 42500815  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  42500814 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 42500715  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42500714 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 42500648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 135 - 397
Target Start/End: Original strand, 617303 - 617565
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  617303 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 617402  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  617403 tgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 617502  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacgg 397  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  617503 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgg 617565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 43827160 - 43827426
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaa-gtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggtt 233  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| | |||||||    
T  43827160 tctttctcatatgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggcatcttgtacacgttggtt 43827259  T
Q  234 ttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43827260 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatattttcaattgtagtactttcac 43827359  T
Q  334 tttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  43827360 tttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgaga-tagatattgcaacggcttc 43827426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30788046 - 30787780
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  30788046 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 30787947  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  30787946 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 30787847  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30787846 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 30787780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 43622689 - 43622955
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  43622689 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 43622788  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  43622789 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 43622888  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  43622889 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 43622955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 45764886 - 45764620
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||| |    
T  45764886 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgctggtct 45764787  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  45764786 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 45764687  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45764686 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 45764620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15067396 - 15067162
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  15067396 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggttt 15067297  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  15067296 tgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 15067197  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcct 369  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15067196 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 220 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 8401008 - 8400832
Alignment:
Q  220 tgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgat 319  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  8401008 tgtacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaat 8400909  T
Q  320 tgtagtactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacg 396  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8400908 tgtagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacg 8400832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 250
Target Start/End: Original strand, 12116919 - 12117038
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  12116919 ttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttg 12117018  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccat 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12117019 gttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 43378896 - 43379034
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| ||| ||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||||    
T  43378896 aatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaatccattatcaaaacagtcggaaa 43378995  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  43378996 attgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 16794201 - 16794339
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | ||||| |||| | ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||||    
T  16794201 aatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaa 16794300  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    
T  16794301 attgttaaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 40794418 - 40794258
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||| ||||||| ||||| |    
T  40794418 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaat 40794319  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||||   |||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40794318 ccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 307
Target Start/End: Original strand, 16795667 - 16795822
Alignment:
Q  152 aaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccata 251  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||   ||||||  | ||||| | ||||| |||| | ||| ||||||||  |||| |||||     
T  16795667 aaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatccatt 16795766  T
Q  252 accaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | |||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16795767 atcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 16795822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Original strand, 45172497 - 45172635
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||| | | |||| || || | |||||||||||| ||||| || || | |||||  || |||||    
T  45172497 aatatgtcaaataggtcgaagtgactcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatcaattatcaaaacagtcggaaa 45172596  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  45172597 agtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 46791798 - 46791660
Alignment:
Q  169 aatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaa 268  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||  || |||||    
T  46791798 aatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagtcggaaa 46791699  T
Q  269 atttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    | | ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  46791698 agtgttaaataactttactgatgttggatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 307
Target Start/End: Original strand, 40445130 - 40445291
Alignment:
Q  146 tgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggag 245  Q
    ||||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | ||||||||||||  ||||     
T  40445130 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaa 40445229  T
Q  246 tccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||||| | |||||  ||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  40445230 tccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 1297401 - 1297321
Alignment:
Q  227 gttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||||  ||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  1297401 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060854
Alignment:
Q  365 ctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttc 15060854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 307
Target Start/End: Original strand, 47867065 - 47867225
Alignment:
Q  147 gtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagt 246  Q
    |||| |||| |||| |||| | |||||||||||| ||| || ||||| |||||||  | ||||| | |||| || || | |||| ||||||| |||||||    
T  47867065 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagt 47867164  T
Q  247 ccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    |||| | ||||   ||  ||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  47867165 ccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Original strand, 8193913 - 8194006
Alignment:
Q  214 gcatcctgtatatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaa 307  Q
    ||||| |||| | |||||||||||| ||||| | ||| | |||||  || |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  8193913 gcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaatgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtccaaaa 8194006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 131 - 401
Target Start/End: Original strand, 15907 - 16177
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  15907 ttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 16006  T
Q  231 gttttgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtacttt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  16007 gttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattacttt 16106  T
Q  331 cactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16107 caagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 16177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2388 - 2122
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  2388 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 2289  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  2288 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 2189  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2188 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 2122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34316 - 34050
Alignment:
Q  135 tctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttggttt 234  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |    
T  34316 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 34217  T
Q  235 tgtaggtggagtccataaccaaaatcgttggaaaatttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  34216 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 34117  T
Q  335 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  34116 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttc 34050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 223
Target Start/End: Original strand, 1 - 92
Alignment:
Q  132 tcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgta 223  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1 tcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgta 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 131 - 246
Target Start/End: Original strand, 25496 - 25611
Alignment:
Q  131 ttcctctttcttatgtgtcacaaatccaaacccaatcaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattagcatcctgtatatgttg 230  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  25496 ttcctctttctcatatgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaattggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttg 25595  T
Q  231 gttttgtaggtggagt 246  Q
    ||||||||| ||||||    
T  25596 gttttgtagatggagt 25611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 325 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12504
Alignment:
Q  325 tactttcactttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttc 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttc 12504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University