View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2479_low_63 (Length: 324)

Name: NF2479_low_63
Description: NF2479
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2479_low_63
NF2479_low_63
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (2-316)||(35965552-35965866)
chr8 (2-316)||(45455316-45455630)
chr8 (1-316)||(43688977-43689292)
chr8 (2-316)||(43370707-43371021)
chr8 (1-316)||(7341019-7341334)
chr8 (1-316)||(30304416-30304731)
chr8 (1-316)||(32377714-32378029)
chr8 (1-316)||(32431671-32431986)
chr8 (2-316)||(39751835-39752149)
chr8 (1-316)||(1115712-1116027)
chr8 (1-316)||(8422662-8422977)
chr8 (20-316)||(7168840-7169136)
chr8 (2-316)||(2145806-2146111)
chr8 (110-296)||(22580864-22581049)
chr8 (141-245)||(44320872-44320976)
chr8 (139-245)||(17316471-17316577)
chr8 (141-245)||(45116258-45116362)
chr8 (139-245)||(17340021-17340127)
chr8 (99-245)||(14401676-14401824)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (2-316)||(46992053-46992367)
chr3 (1-316)||(36816322-36816637)
chr3 (2-316)||(21955045-21955359)
chr3 (2-316)||(48249674-48249988)
chr3 (2-316)||(7841822-7842136)
chr3 (2-315)||(14399496-14399809)
chr3 (1-316)||(13746527-13746842)
chr3 (2-316)||(77827-78141)
chr3 (2-316)||(7838536-7838850)
chr3 (2-316)||(6504762-6505076)
chr3 (1-316)||(9428639-9428954)
chr3 (1-316)||(6741827-6742142)
chr3 (2-316)||(16445560-16445874)
chr3 (1-316)||(3949683-3949998)
chr3 (1-316)||(8159789-8160104)
chr3 (1-316)||(30946448-30946763)
chr3 (46-316)||(29930308-29930578)
chr3 (46-316)||(29979462-29979732)
chr3 (153-316)||(50954213-50954376)
chr3 (99-316)||(33399475-33399692)
chr3 (141-245)||(2285003-2285107)
chr3 (141-245)||(9556727-9556831)
chr3 (141-245)||(51548479-51548583)
chr3 (141-245)||(4120740-4120843)
chr3 (152-252)||(8263742-8263842)
chr3 (141-245)||(32426622-32426726)
chr3 (141-245)||(40468155-40468259)
chr3 (139-245)||(4510287-4510393)
chr3 (139-193)||(12491150-12491204)
chr3 (275-316)||(11389065-11389106)
chr3 (46-182)||(1275240-1275376)
chr3 (2-44)||(29908031-29908073)
chr3 (2-44)||(29949197-29949239)
chr3 (2-44)||(29998351-29998393)
chr3 (136-207)||(25059882-25059953)
chr3 (136-245)||(8117600-8117709)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (2-316)||(436251-436565)
chr2 (1-316)||(12907298-12907613)
chr2 (1-316)||(27275166-27275481)
chr2 (2-316)||(11692622-11692935)
chr2 (2-316)||(41007787-41008101)
chr2 (5-316)||(43949092-43949403)
chr2 (2-316)||(24604896-24605210)
chr2 (2-316)||(24750598-24750912)
chr2 (1-316)||(3802372-3802687)
chr2 (1-316)||(212247-212562)
chr2 (1-316)||(10623260-10623575)
chr2 (2-316)||(28354709-28355023)
chr2 (2-316)||(39794910-39795224)
chr2 (1-316)||(5348107-5348422)
chr2 (1-316)||(41560952-41561267)
chr2 (2-316)||(34920589-34920893)
chr2 (1-316)||(38946703-38947018)
chr2 (2-315)||(45476305-45476611)
chr2 (54-316)||(7263972-7264234)
chr2 (14-316)||(17996991-17997293)
chr2 (2-218)||(9655194-9655410)
chr2 (154-316)||(1100042-1100204)
chr2 (2-160)||(1098633-1098791)
chr2 (216-316)||(9652131-9652231)
chr2 (141-245)||(9639183-9639287)
chr2 (143-207)||(28423423-28423487)
chr2 (136-245)||(21535200-21535309)
chr2 (152-197)||(24683458-24683503)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (2-316)||(37015854-37016168)
chr1 (1-316)||(41454777-41455092)
chr1 (2-316)||(50116570-50116884)
chr1 (1-316)||(29355494-29355809)
chr1 (2-316)||(38691746-38692060)
chr1 (2-316)||(46974104-46974418)
chr1 (1-316)||(13174721-13175036)
chr1 (2-316)||(13630356-13630670)
chr1 (2-316)||(44619910-44620224)
chr1 (1-316)||(3947267-3947582)
chr1 (1-316)||(3984053-3984368)
chr1 (1-316)||(38774921-38775236)
chr1 (1-316)||(44466522-44466837)
chr1 (1-316)||(20350396-20350711)
chr1 (1-316)||(5078875-5079190)
chr1 (2-316)||(12649386-12649698)
chr1 (2-316)||(21943171-21943485)
chr1 (2-316)||(51663198-51663512)
chr1 (54-316)||(7980071-7980333)
chr1 (33-316)||(26466108-26466391)
chr1 (50-316)||(16246609-16246872)
chr1 (14-315)||(32106462-32106760)
chr1 (141-245)||(36360466-36360570)
chr1 (142-245)||(18887570-18887673)
chr1 (141-245)||(45472363-45472467)
chr1 (139-268)||(25231290-25231419)
chr1 (141-245)||(7403629-7403733)
chr1 (141-245)||(28862901-28863005)
chr1 (136-182)||(39914011-39914057)
chr1 (139-245)||(25593679-25593785)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (2-316)||(25895908-25896222)
chr5 (1-316)||(34078720-34079035)
chr5 (2-316)||(7799813-7800127)
chr5 (2-312)||(18537143-18537453)
chr5 (1-316)||(27866651-27866966)
chr5 (2-316)||(4202746-4203060)
chr5 (1-316)||(37819683-37819998)
chr5 (1-316)||(28885214-28885529)
chr5 (2-316)||(11032259-11032573)
chr5 (2-316)||(38858997-38859311)
chr5 (1-316)||(7020686-7020997)
chr5 (1-316)||(13566897-13567223)
chr5 (104-316)||(1035459-1035671)
chr5 (14-316)||(20285947-20286251)
chr5 (2-183)||(1036424-1036605)
chr5 (115-316)||(20286448-20286650)
chr5 (192-316)||(33994191-33994315)
chr5 (240-316)||(31097980-31098056)
chr5 (139-286)||(13157978-13158125)
chr5 (16-268)||(23028381-23028640)
chr5 (141-245)||(6552800-6552904)
chr5 (141-245)||(42343502-42343606)
chr5 (141-245)||(43295232-43295336)
chr5 (141-245)||(27013615-27013719)
chr5 (143-193)||(11819279-11819329)
chr5 (139-190)||(25048464-25048515)
chr5 (14-120)||(20287404-20287510)
chr5 (163-245)||(30617320-30617402)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (6-316)||(17009-17319)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (2-316)||(18606936-18607250)
chr6 (1-316)||(1611557-1611872)
chr6 (5-316)||(29287758-29288068)
chr6 (18-316)||(28250836-28251134)
chr6 (2-313)||(31147265-31147576)
chr6 (16-316)||(24220106-24220408)
chr6 (2-259)||(21358157-21358411)
chr6 (2-259)||(23962139-23962393)
chr6 (125-316)||(7362119-7362310)
chr6 (159-315)||(7362307-7362463)
chr6 (215-316)||(35243543-35243644)
chr6 (222-316)||(13387721-13387815)
chr6 (255-316)||(23985364-23985425)
chr6 (136-245)||(34111603-34111712)
chr6 (141-193)||(22864869-22864921)
chr6 (143-193)||(26684976-26685026)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (1-316)||(1821-2136)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (2-316)||(47061823-47062138)
chr7 (1-315)||(18106329-18106643)
chr7 (1-316)||(30787479-30787794)
chr7 (1-316)||(43622941-43623256)
chr7 (1-316)||(617555-617870)
chr7 (1-316)||(45764319-45764634)
chr7 (2-316)||(15060554-15060867)
chr7 (2-316)||(42500347-42500661)
chr7 (2-315)||(43827413-43827726)
chr7 (2-315)||(8400527-8400840)
chr7 (112-316)||(21799952-21800156)
chr7 (141-245)||(46791336-46791440)
chr7 (141-245)||(1296997-1297101)
chr7 (141-245)||(45172855-45172959)
chr7 (142-245)||(40445512-40445615)
chr7 (143-245)||(8194228-8194330)
chr7 (136-206)||(20908458-20908528)
chr7 (141-193)||(47867442-47867494)
chr7 (139-182)||(16794557-16794600)
chr7 (144-245)||(40793934-40794035)
chr7 (141-193)||(43379254-43379306)
chr7 (46-182)||(3761979-3762115)
chr7 (139-171)||(16796810-16796842)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (2-316)||(9890962-9891276)
chr4 (2-307)||(4976704-4977009)
chr4 (2-316)||(11502446-11502760)
chr4 (1-316)||(19072463-19072778)
chr4 (1-316)||(49565270-49565585)
chr4 (2-316)||(4978765-4979075)
chr4 (2-316)||(18580138-18580449)
chr4 (1-316)||(3404730-3405045)
chr4 (1-316)||(41024140-41024454)
chr4 (2-312)||(51643305-51643617)
chr4 (2-316)||(21471734-21472047)
chr4 (1-207)||(4769179-4769389)
chr4 (2-179)||(38463644-38463821)
chr4 (2-146)||(44049720-44049864)
chr4 (222-316)||(38463824-38463918)
chr4 (211-316)||(17140529-17140634)
chr4 (141-245)||(17916198-17916302)
chr4 (111-268)||(6182664-6182821)
chr4 (141-245)||(4617714-4617818)
chr4 (139-245)||(1590845-1590950)
chr4 (141-241)||(46517380-46517480)
chr4 (141-245)||(32716305-32716409)
chr4 (136-182)||(20971446-20971492)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (1-316)||(16163-16478)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (2-316)||(12202-12517)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (1-316)||(33749-34064)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (120-316)||(95-291)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (141-245)||(3847-3951)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 35965552 - 35965866
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  35965552 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 35965651  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965652 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 35965751  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965752 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 35965851  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  35965852 atccacattttcttg 35965866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45455630 - 45455316
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  45455630 attgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggtattttgttctt 45455531  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455530 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcattttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 45455431  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455430 tctaaagtcggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgtccaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 45455331  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  45455330 acccacattttcttg 45455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 43688977 - 43689292
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43688977 aattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 43689076  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43689077 tcaaatgtatcaaaatatttcttcgaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcttttaatctaccggcaagaatgtgtcc 43689176  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689177 ttctaaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttaaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 43689276  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  43689277 cacccacattttcttg 43689292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 43371021 - 43370707
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43371021 attgcaacgacttcttgtcagctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 43370922  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43370921 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcct 43370822  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43370821 tctaaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaaaccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 43370722  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  43370721 atccacattttcttg 43370707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7341334 - 7341019
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  7341334 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 7341235  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341234 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 7341135  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7341134 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 7341035  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  7341034 caaccgcattttcttg 7341019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 30304416 - 30304731
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  30304416 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctatggttct 30304515  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304516 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30304615  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30304616 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 30304715  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  30304716 caaccgcattttcttg 30304731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 32377714 - 32378029
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  32377714 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32377813  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377814 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 32377913  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32377914 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 32378013  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  32378014 caaccgcattttcttg 32378029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 32431671 - 32431986
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  32431671 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 32431770  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431771 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 32431870  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32431871 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 32431970  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  32431971 caaccgcattttcttg 32431986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 39751835 - 39752149
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  39751835 attgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 39751934  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |    
T  39751935 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcataaatatgtcat 39752034  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  39752035 tctaaagccggttccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgcttactttgatatccaccaatcatgaacaaac 39752134  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  39752135 atccacattttcttg 39752149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1116027 - 1115712
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  1116027 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 1115928  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115927 tcaattgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtactatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1115828  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1115827 ttctaaagccggctctatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 1115728  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  1115727 caaccgcattttcttg 1115712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 8422662 - 8422977
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  8422662 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8422761  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8422762 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtca 8422861  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8422862 ttctaaagccggctccatgggatagttgtgaactccattaagaatgtttaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 8422961  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  8422962 caaccgcattttcttg 8422977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7169136 - 7168840
Alignment:
Q  20 cacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatt 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7169136 cacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatt 7169037  T
Q  120 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7169036 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcatcttgtcgtcctcctttaatctactagcaagaatgtatccttctaaagtcggctccatc 7168937  T
Q  220 gcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7168936 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccactcctttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaagcacccacattttcttg 7168840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 2145806 - 2146111
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatt-----tgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttg 96  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||     ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2145806 attgcaacaacttcttgtcacctctattatatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtgatcttttg 2145905  T
Q  97 tacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2145906 ttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgtt--------------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatat 2145991  T
Q  197 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 296  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2145992 gtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaaaaatgttcaatctccattcatttgtttgcttactttgatatccactaatcacgaa 2146091  T
Q  297 caagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2146092 caagcatccacattttcttg 2146111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22581049 - 22580864
Alignment:
Q  110 tcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22581049 tcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagt 22580950  T
Q  210 cggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580949 cggctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccatt-ctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaa 22580864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 44320976 - 44320872
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  44320976 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgtttatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 44320877  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  44320876 agaat 44320872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17316577 - 17316471
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   ||   |||| ||||||||| || |||||    
T  17316577 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatggaaacatctcatggttgtgaattccat 17316478  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  17316477 taagaat 17316471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45116362 - 45116258
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45116362 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggaaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45116263  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45116262 agaat 45116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17340127 - 17340021
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| || ||||||   | |  |||| ||||||||| || |||||    
T  17340127 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcttgcaagaaggtgcccatctaaatatgacaacatctcatggttgtgaattccat 17340028  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  17340027 taagaat 17340021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 14401676 - 14401824
Alignment:
Q  99 cttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcac--gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||  ||| |   |||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||||    
T  14401676 cttcaaattcatcaaaatattttttggtggcaccaaactcttggtcaagtcatatgtacaatcttcttgtcatcatcccttaatcttcctgcaagaatgt 14401775  T
Q  197 gtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    | | |||||||   ||| |||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  14401776 gccattctaaacttggcaccaattcatggttgtgaactccattaagaat 14401824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 46992053 - 46992367
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  46992053 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 46992152  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992153 caaatgtatcaaaaaatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 46992252  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992253 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 46992352  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  46992353 acccacattttcttg 46992367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 36816322 - 36816637
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36816322 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 36816421  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816422 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 36816521  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816522 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 36816621  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  36816622 caaccacattttcttg 36816637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 21955045 - 21955359
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21955045 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21955144  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21955145 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaataatgtgtcct 21955244  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955245 tctagagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttacttactttgatatccactaatcatgaacaagc 21955344  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21955345 acccacattttcttg 21955359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 48249674 - 48249988
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  48249674 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 48249773  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249774 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacagtcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 48249873  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249874 tataaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 48249973  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  48249974 acccacattttcttg 48249988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 7841822 - 7842136
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7841822 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 7841921  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7841922 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacaggcaagaatgtgtcct 7842021  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7842022 tctaaagccggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 7842121  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  7842122 acccacattttcttg 7842136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 14399809 - 14399496
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14399809 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 14399710  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399709 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 14399610  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14399609 tctaaagccggctccatggcatggttgtgaactccatttagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaac 14399510  T
Q  302 acccacattttctt 315  Q
    ||||||||||||||    
T  14399509 acccacattttctt 14399496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 13746527 - 13746842
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  13746527 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 13746626  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746627 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 13746726  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13746727 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 13746826  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  13746827 caaccacattttcttg 13746842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 77827 - 78141
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  77827 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgcctttcatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 77926  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  77927 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcaataatgtgtcct 78026  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78027 tctaaagccggctccatcaaatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 78126  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    || ||||||||||||    
T  78127 actcacattttcttg 78141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7838850 - 7838536
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  7838850 attgcaacggcttcttgccacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 7838751  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7838750 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatattgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggaaagaatgtgtcct 7838651  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838650 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccactaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 7838551  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  7838550 atccacattttcttg 7838536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 6504762 - 6505076
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6504762 attgcaacggcttcttgtcacctctatgtgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 6504861  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  6504862 caaatgtatcaaaatatttcttggaaacatcttgttcttggtcaagtcatgtacaatcttcttttcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcat 6504961  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504962 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 6505061  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  6505062 acccacattttcttg 6505076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 9428639 - 9428954
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  9428639 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 9428738  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428739 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 9428838  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9428839 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 9428938  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  9428939 caaccgcattttcttg 9428954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6742142 - 6741827
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  6742142 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 6742043  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742042 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 6741943  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6741942 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 6741843  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  6741842 caaccgcattttcttg 6741827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16445874 - 16445560
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  16445874 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttctt 16445775  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16445774 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtcct 16445675  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16445674 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 16445575  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  16445574 aaccacattttcttg 16445560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3949998 - 3949683
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3949998 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3949899  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949898 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3949799  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3949798 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 3949699  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  3949698 caaccgcattttcttg 3949683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 8159789 - 8160104
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  8159789 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 8159888  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159889 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 8159988  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8159989 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 8160088  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  8160089 caaccgcattttcttg 8160104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 30946448 - 30946763
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  30946448 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 30946547  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946548 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30946647  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30946648 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 30946747  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  30946748 caaccgcattttcttg 30946763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 46 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29930578 - 29930308
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29930578 tgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggtca 29930479  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29930478 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaagaat 29930379  T
Q  246 gttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930378 gttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 29930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 46 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 29979732 - 29979462
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29979732 tgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatgtcttggaagcatcttgctcttggtca 29979633  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29979632 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccgccaagaatgtgtccttctaaagccggcatcatcgcatggttgtgaactccattaagaat 29979533  T
Q  246 gttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979532 gttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 29979462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50954376 - 50954213
Alignment:
Q  153 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50954376 tacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaat 50954277  T
Q  253 ccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  50954276 ccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttcttg 50954213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33399692 - 33399475
Alignment:
Q  99 cttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgt 198  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33399692 cttcaaatttaacaaaatattttttggaagcaccaaactcttggtcaagtcacgtacaagcttcttgccatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgt 33399593  T
Q  199 ccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaaca 298  Q
    | |||||||    | | |||| | ||||||| ||||||||||||||| || |||| | | || |||| |||| ||||  ||||||||| || ||||||||    
T  33399592 ctttctaaacttcgttacatctcttggttgtgaactccattaagaatatttaatctcgaatcatttgcttgcctactaagatatccacgaaccatgaaca 33399493  T
Q  299 agcacccacattttcttg 316  Q
      |||| |||||||||||    
T  33399492 tacacctacattttcttg 33399475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 2285003 - 2285107
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  2285003 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 2285102  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  2285103 agaat 2285107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 9556727 - 9556831
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9556727 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgccctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 9556826  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  9556827 agaat 9556831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 51548479 - 51548583
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| || |||    
T  51548479 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgtcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccgtta 51548578  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  51548579 agaat 51548583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 4120740 - 4120843
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4120740 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccgtcaag-aggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4120838  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  4120839 agaat 4120843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8263842 - 8263742
Alignment:
Q  152 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaa 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  8263842 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaatggtcaa 8263743  T
Q  252 t 252  Q
    |    
T  8263742 t 8263742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32426726 - 32426622
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||  |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32426726 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctgcataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 32426627  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  32426626 agaat 32426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 40468155 - 40468259
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  40468155 ggtcaagtaatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtaccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 40468254  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  40468255 agaat 40468259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4510393 - 4510287
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| | ||||||| ||| ||||    
T  4510393 ttggtcaagtcatgtataattttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaaaacggcaccatctcgtggttgtgaacaccat 4510294  T
Q  239 taagaat 245  Q
     ||||||    
T  4510293 aaagaat 4510287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12491204 - 12491150
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12491204 ttggtcaagtcgtgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 12491150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Original strand, 11389065 - 11389106
Alignment:
Q  275 tttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11389065 tttgatatccactaatcatgaacaagcacccgcattttcttg 11389106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Original strand, 1275240 - 1275376
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||| | | | || |||| | ||| |||| | ||||||||||| ||||   ||||   || |||||||    
T  1275240 tgacgttcattgtagacttgcttgatatttttcatggactcttgtctttttttctttaaatttgtcaaaatattttttggtttcatcgaactattggtca 1275339  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1275340 agtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 1275376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29908073 - 29908031
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29908073 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29908031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29949239 - 29949197
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29949239 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29949197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 29998393 - 29998351
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttg 44  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29998393 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttg 29998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 207
Target Start/End: Original strand, 25059882 - 25059953
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 207  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||||||||||| ||| |||||    
T  25059882 ctcttggtcaagtcacatataatctccttgtcgtccttcattaatctttccgcaagaatgtgccctgctaaa 25059953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 8117709 - 8117600
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  |||| ||||||||| ||| |    
T  8117709 ctcttagtcaaatcacgtacaatctctttgtcgtccttcattaattttcctgcaagaaggtgccctgctaaacatggcaacatctcatggttgtgaacac 8117610  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
    ||||||||||    
T  8117609 cattaagaat 8117600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 436565 - 436251
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  436565 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 436466  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436465 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 436366  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  436365 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgataaccactaatcatgaacaagc 436266  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  436265 acccacattttcttg 436251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 12907298 - 12907613
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  12907298 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttat 12907397  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907398 tcaaatgtatcagaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 12907497  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907498 ttctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 12907597  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  12907598 cacccacattttcttg 12907613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 27275166 - 27275481
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  27275166 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 27275265  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275266 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 27275365  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27275366 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcccttgtttgcttactttgatatccattaatcatgaacaag 27275465  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  27275466 cacccacattttcttg 27275481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 11692622 - 11692935
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  11692622 attgcaacggcttcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgt-ctt 11692720  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692721 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 11692820  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692821 tctaaagtcggctcgatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 11692920  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11692921 acccacattttcttg 11692935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 41007787 - 41008101
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  41007787 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttacatatttgttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 41007886  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41007887 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcat 41007986  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007987 tctaaagccggctacatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 41008086  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  41008087 acccacattttcttg 41008101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 43949092 - 43949403
Alignment:
Q  5 gcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43949092 gcaacggcttcttgtcacctatatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaa 43949191  T
Q  105 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949192 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 43949291  T
Q  205 aaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacc 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949292 aaagccggctccttcgcatggttgtgaactccattaataatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacc 43949391  T
Q  305 cacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||    
T  43949392 cacattttcttg 43949403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 24604896 - 24605210
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24604896 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccctatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 24604995  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  24604996 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaattttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtact 24605095  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605096 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 24605195  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  24605196 atccacattttcttg 24605210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24750912 - 24750598
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  24750912 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 24750813  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750812 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctcggtcaattcatgtacaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 24750713  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750712 tctaaatccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 24750613  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  24750612 acccacattttcttg 24750598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3802372 - 3802687
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  3802372 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 3802471  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802472 tcaaatgtatcaaaatatttattggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3802571  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  3802572 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccaataatcatgaataag 3802671  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  3802672 caaccacattttcttg 3802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 212247 - 212562
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  212247 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 212346  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212347 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 212446  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  212447 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 212546  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  212547 caaccgcattttcttg 212562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 10623260 - 10623575
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  10623260 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 10623359  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623360 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 10623459  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10623460 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 10623559  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  10623560 caaccgcattttcttg 10623575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 28354709 - 28355023
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||    
T  28354709 attgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtcttttattctt 28354808  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  28354809 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcatggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccagcaagaatgtgtcat 28354908  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28354909 tctaaagcaggctccatcgcatggttatgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 28355008  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  28355009 acccacattttcttg 28355023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 39795224 - 39794910
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  39795224 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 39795125  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39795124 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgccct 39795025  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39795024 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 39794925  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | || ||||||||||    
T  39794924 aaccgcattttcttg 39794910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5348422 - 5348107
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  5348422 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 5348323  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348322 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 5348223  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  5348222 ttctaaagccggctccatgggatggctgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccgctaatcatgaataag 5348123  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  5348122 caaccgcattttcttg 5348107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41561267 - 41560952
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  41561267 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 41561168  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561167 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 41561068  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41561067 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccttattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 41560968  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  41560967 caaccgcattttcttg 41560952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 34920589 - 34920893
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34920589 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 34920688  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34920689 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggtaagaatgtgtcct 34920788  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||          ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920789 tctaaagccggct----------gttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 34920878  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  34920879 acccacattttcttg 34920893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 38947018 - 38946703
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | || ||    
T  38947018 aattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctctagttct 38946919  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946918 tcaagtgtatcaaaatatttcatggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgttgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 38946819  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38946818 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 38946719  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  38946718 caaccgcattttcttg 38946703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45476611 - 45476305
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45476611 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatt-gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgttctt 45476513  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476512 caaacgtatcaaaatatttcttgtaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 45476413  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45476412 tctaaagccggatccatcgcatggttatgaactc-----ag-atgttcaatcaccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaga 45476319  T
Q  302 acccacattttctt 315  Q
    ||||||||||||||    
T  45476318 acccacattttctt 45476305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 54 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7263972
Alignment:
Q  54 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaaccatcttgctcttggtcaagtcacgt 7264135  T
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7264134 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggttccatgagatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7264035  T
Q  254 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  7264034 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccgcattttcttg 7263972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Original strand, 17996991 - 17997293
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||||||||| || |||||  |||||||| ||||||    
T  17996991 tcttgtcacctctatttgacttccatatttgttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtcttttgctcttcaaatttatcaa 17997090  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17997091 aatatttcttggaagcaccttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctaccagcaagcatgtgtccttctaaagccggc 17997190  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttc 313  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||    
T  17997191 tccatcgcatggttgcgaacttcatgaagaatgttcaatctccattcctttgtttgtctactaagatatccactaaccttgaacatgaacccacattgtc 17997290  T
Q  314 ttg 316  Q
    |||    
T  17997291 ttg 17997293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9655410 - 9655194
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  9655410 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttctt 9655311  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9655310 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggttaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcct 9655211  T
Q  202 tctaaagccggctccat 218  Q
    |||||||||||||||||    
T  9655210 tctaaagccggctccat 9655194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 316
Target Start/End: Original strand, 1100042 - 1100204
Alignment:
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1100042 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccatctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 1100141  T
Q  254 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100142 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 1100204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 1098633 - 1098791
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1098633 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 1098732  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1098733 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctcggtcaagtcacgtacaatct 1098791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9652231 - 9652131
Alignment:
Q  216 catcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 315  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652231 catcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 9652132  T
Q  316 g 316  Q
    |    
T  9652131 g 9652131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 9639183 - 9639287
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9639183 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccagcaagaaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 9639282  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  9639283 agaat 9639287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 28423423 - 28423487
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaa 207  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| |||||    
T  28423423 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgctaaa 28423487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21535309 - 21535200
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||  |||||| ||| |||||||||   |||  |||| ||||||||| ||| |    
T  21535309 ctcttgatcaagtcatgtataatcttcttgtcgtcattcattaatcttcccacaagaaggtgcccttctaaatatggcaacatctcatggttgtgaacac 21535210  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
     |||||||||    
T  21535209 aattaagaat 21535200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24683503 - 24683458
Alignment:
Q  152 gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtg 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24683503 gtacaatcttcttgtcatcctccattaatcttcccgcaagaatgtg 24683458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 37016168 - 37015854
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37016168 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 37016069  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016068 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgcacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 37015969  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015968 tctaaagccagctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 37015869  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  37015868 acccacattttcttg 37015854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41455092 - 41454777
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  41455092 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 41454993  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454992 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 41454893  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41454892 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 41454793  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  41454792 caaccacattttcttg 41454777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 50116570 - 50116884
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50116570 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 50116669  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116670 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctaactcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 50116769  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116770 tctaaagccggctccatcgcatggtagtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttatttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 50116869  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  50116870 acccacattttcttg 50116884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 29355494 - 29355809
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  29355494 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 29355593  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355594 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 29355693  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29355694 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 29355793  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  29355794 caaccgcattttcttg 29355809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 38691746 - 38692060
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  38691746 attgcaacggcttcttgtcatctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttatt 38691845  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  38691846 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatttaccggcaagaacgtgtcct 38691945  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38691946 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaac 38692045  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  38692046 acccacattttcttg 38692060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 46974418 - 46974104
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  46974418 attgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 46974319  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46974318 taaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatgtaccggcaagaatgtgtcct 46974219  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  46974218 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtaaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaac 46974119  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  46974118 acccacattttcttg 46974104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13175036 - 13174721
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13175036 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 13174937  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13174936 tcaaatgtatcaaaatatttattggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgaacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccagcgagaatgtgtcc 13174837  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13174836 tcctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttgtttgcttactttgatatccattaatcatgaacaag 13174737  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  13174736 cacccacattttcttg 13174721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13630670 - 13630356
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||    
T  13630670 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttgtttctt 13630571  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13630570 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggaaagaatgtgtcct 13630471  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13630470 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 13630371  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  13630370 aaccacattttcttg 13630356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 44619910 - 44620224
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  44619910 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 44620009  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620010 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 44620109  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44620110 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 44620209  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | || ||||||||||    
T  44620210 aaccgcattttcttg 44620224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 3947267 - 3947582
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3947267 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3947366  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947367 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3947466  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3947467 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 3947566  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  3947567 caaccgcattttcttg 3947582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3984368 - 3984053
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  3984368 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 3984269  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984268 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 3984169  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3984168 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 3984069  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  3984068 caaccgcattttcttg 3984053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 38774921 - 38775236
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  38774921 aattgcaacggcttcttgtcacccatatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 38775020  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775021 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 38775120  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38775121 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 38775220  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  38775221 caaccacattttcttg 38775236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 44466837 - 44466522
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  44466837 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 44466738  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466737 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 44466638  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44466637 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 44466538  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  44466537 caaccgcattttcttg 44466522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20350711 - 20350396
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  20350711 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 20350612  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350611 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 20350512  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20350511 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgtttaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 20350412  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  20350411 caaccgcattttcttg 20350396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 5079190 - 5078875
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  5079190 aattgcaacggcttcttgtcacccctatctgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 5079091  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079090 tcaaatgtattaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgccgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 5078991  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  5078990 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataaa 5078891  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  5078890 caaccgcattttcttg 5078875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 12649386 - 12649698
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||    
T  12649386 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttattttt 12649485  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12649486 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtgctc--ttaatttaccggcaagaatgtgtcct 12649583  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12649584 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatacccactaatcatgaacaagc 12649683  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  12649684 acccacattttcttg 12649698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 21943171 - 21943485
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21943171 attgcaacagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21943270  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21943271 caaatttatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcct 21943370  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21943371 tctaaacccggctccatcccatggttgtgaactccattgagaatgttcaatccccattcctttgtttgcctactttgatatccactaaccataaacaagc 21943470  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21943471 acccacattttcttg 21943485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 51663512 - 51663198
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51663512 attgcaacgacttattgtcacctctatttgccttccatttttgttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 51663413  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  51663412 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcgcgtacaatcttcttgtcctcctcctttaatctaccagcaagaatgtgtcat 51663313  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51663312 tctaaagccggcttcatcgcatggttgtgagctccattaagaatgttcaatccccattcttttgtttgcttactttgatattcactaatcatgaacaagc 51663213  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    || || |||||||||    
T  51663212 acacatattttcttg 51663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 54 - 316
Target Start/End: Original strand, 7980071 - 7980333
Alignment:
Q  54 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980071 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgt 7980170  T
Q  154 acaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatc 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7980171 acaatcttcttgtcatcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccgactgcattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatc 7980270  T
Q  254 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7980271 cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaacacccacattttcttg 7980333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 316
Target Start/End: Original strand, 26466108 - 26466391
Alignment:
Q  33 cttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatc 132  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | || |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  26466108 cttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgttttttgttcttcaaatttaacaaaatatttcttggaagcacc 26466207  T
Q  133 ttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaa 232  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  26466208 ttagtcttggtcaagtcacgtacaatcttcttatcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtcattctaaagccggctccatctcatggttgtgaa 26466307  T
Q  233 ctccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| ||||  ||||||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  26466308 ctccattaagaatgtttaatctccaatcatttgtttgcctactaagatatccacgaacaatgaacatacacctacattttcttg 26466391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 316
Target Start/End: Original strand, 16246609 - 16246872
Alignment:
Q  50 gttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtc 149  Q
    |||||||| | | |||||| | |||||| ||||||| | || ||||   |||||||| || ||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  16246609 gttgattgcataattgcttgatatttgttatgcaatcttgtctttttctcttcaaatttaacaaaatatt-cttggatgcaccttgcttttggt-aagtc 16246706  T
Q  150 acgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttc 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||    
T  16246707 acgtacaatcttcttgtcatcctcttttaatctaccggtaagcatgtgtccttctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaacttcattaacaat-ttc 16246805  T
Q  250 aatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||   ||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16246806 aatctccattcatttgtttgcctacacagatattcactaaccatgaacatacacccacattttcttg 16246872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Original strand, 32106462 - 32106760
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||| |||| | |||||||| | ||||||| |||||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  32106462 tcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttgatgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 32106561  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
      ||||| ||  ||||| |   |||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |||    
T  32106562 c-tattttttcaaagcaccaaactcttggtcaagtcacatacaagctttttgtcattctcctttaatctaccagcaatcatgtgtccttctaaacttggc 32106660  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttc 313  Q
    |||||| |||| |||| |||||  |||||||| ||||||| ||| || ||||||| | | ||  ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  32106661 tccatctcatgattgtgaactc--ttaagaatattcaatctccaatcatttgtttaccttctaagatatccacgaaccatgaacattcacccacattttc 32106758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 36360466 - 36360570
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  36360466 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccgacaagaatgtgtcctgctacatactgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 36360565  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  36360566 agaat 36360570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Original strand, 18887570 - 18887673
Alignment:
Q  142 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  18887570 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccattaa 18887669  T
Q  242 gaat 245  Q
    ||||    
T  18887670 gaat 18887673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 45472467 - 45472363
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45472467 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctactacataccacaccatctcatggttgtgaacgccatta 45472368  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45472367 agaat 45472363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 139 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25231419 - 25231290
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| | || || |||||| ||||||||    
T  25231419 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttggtatcctcccttgatctacctgcaagcatgtgtccttccaaacttggcttcgtctcacggttgtgaactccat 25231320  T
Q  239 taagaatgttcaatccccattcctttgttt 268  Q
    | | ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  25231319 tgaaaatattcaatctccagtcatttgttt 25231290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7403733 - 7403629
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  7403733 ggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaataaagtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 7403634  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  7403633 agaat 7403629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28863005 - 28862901
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  28863005 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtccttcattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 28862906  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  28862905 agaat 28862901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39914057 - 39914011
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39914057 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcatccttcattaatct 39914011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25593785 - 25593679
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| |||||   |||  ||||  |||||||| ||| ||||    
T  25593785 ttggtcaagtcacatacaatcgccttgtcgtcctccattaatattcccgcaagaaggtgccctgctaaatatggcaacatcttatggttgtgaacaccat 25593686  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  25593685 taagaat 25593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 25895908 - 25896222
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  25895908 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 25896007  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896008 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 25896107  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896108 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 25896207  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  25896208 acccacattttcttg 25896222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34079035 - 34078720
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  34079035 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 34078936  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078935 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 34078836  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078835 ttctaaagccggctccatgggatggttttgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 34078736  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  34078735 cacccacattttcttg 34078720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 7799813 - 7800127
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  7799813 attgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttttt 7799912  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7799913 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccgacaagaatgtgtcct 7800012  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7800013 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaattcccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 7800112  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  7800113 acccacattttcttg 7800127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 312
Target Start/End: Original strand, 18537143 - 18537453
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18537143 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 18537242  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537243 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctcactcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 18537342  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537343 tctaaagctggctcaatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgttttcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 18537442  T
Q  302 acccacatttt 312  Q
    |||||||||||    
T  18537443 acccacatttt 18537453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 27866651 - 27866966
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  27866651 aattgcaaaggtttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 27866750  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866751 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 27866850  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866851 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 27866950  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  27866951 cacccacattttcttg 27866966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 4202746 - 4203060
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  4202746 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 4202845  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4202846 caaatgtatcaaaatattacttggaagcatcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagagtgtgtcct 4202945  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202946 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcatctttcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 4203045  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  4203046 acccacattttcttg 4203060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 37819683 - 37819998
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  37819683 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 37819782  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37819783 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaacaatgtgtcc 37819882  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37819883 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 37819982  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |  ||||||||||    
T  37819983 caactgcattttcttg 37819998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 28885214 - 28885529
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  28885214 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 28885313  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28885314 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatctatcc 28885413  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28885414 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgttttcttactttgatatccactaatcatgaataag 28885513  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |  ||||||||||    
T  28885514 caacagcattttcttg 28885529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 11032259 - 11032573
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  11032259 attgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 11032358  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11032359 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcat 11032458  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11032459 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 11032558  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | || ||||||||||    
T  11032559 aaccgcattttcttg 11032573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 38858997 - 38859311
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  38858997 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 38859096  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859097 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgttttttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 38859196  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38859197 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcttttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 38859296  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | || ||||||||||    
T  38859297 aaccgcattttcttg 38859311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 7020686 - 7020997
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  7020686 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 7020785  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020786 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttcctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 7020885  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| |||    
T  7020886 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccact----atgaataag 7020981  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  7020982 caaccacattttcttg 7020997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 13566897 - 13567223
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtac- 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |     
T  13566897 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttca 13566996  T
Q  100 ----------ttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggca 189  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13566997 cacttgcttcttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtccttctttaatctaccggca 13567096  T
Q  190 agaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaa 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13567097 agaatgtgtccttctaaagctggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttacgttgatatccactaa 13567196  T
Q  290 tcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13567197 tcatgaataagcaaccacattttcttg 13567223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 104 - 316
Target Start/End: Original strand, 1035459 - 1035671
Alignment:
Q  104 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035459 aatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttc 1035558  T
Q  204 taaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcac 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035559 taaagccggctccatggcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcac 1035658  T
Q  304 ccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||    
T  1035659 ccacattttcttg 1035671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20286251 - 20285947
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| | |||||||||||||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  20286251 tcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 20286152  T
Q  114 aatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20286151 aatatttcttggaagcaccttactcttggttaagtcacatacaatcttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggc 20286052  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaac--aagcacccacattt 311  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||  |  |||||||||||    
T  20286051 tccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcagtttccattcatttgtttgcctactaagatatccacttaccatgaacatatacacccacattt 20285952  T
Q  312 tcttg 316  Q
    |||||    
T  20285951 tcttg 20285947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 2 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1036605 - 1036424
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1036605 attgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 1036506  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatcta 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1036505 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatattcttgtcgtcctcctttaatcta 1036424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20286650 - 20286448
Alignment:
Q  115 atatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggct 214  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20286650 atatttcttggatgcaccttactcttggtcaagtcatgtacaatctttttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgtgtccttctaaagccggct 20286551  T
Q  215 ccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccac-taatcatgaacaagcacccacattttc 313  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||    
T  20286550 ccatcacatggttgtaaactccattaagaatgttcaggttccattcatttgtttgcctactaagatatccacttacccatgaacatacacccacattttc 20286451  T
Q  314 ttg 316  Q
    |||    
T  20286450 ttg 20286448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 33994315 - 33994191
Alignment:
Q  192 aatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33994315 aatgtgtccttctaaagccggctccattgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcgttcctttgtttgcttactttgatatccactaatc 33994216  T
Q  292 atgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  33994215 atgaacaagcacccatattttcttg 33994191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 240 - 316
Target Start/End: Original strand, 31097980 - 31098056
Alignment:
Q  240 aagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31097980 aagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 31098056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 139 - 286
Target Start/End: Original strand, 13157978 - 13158125
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    ||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  13157978 ttggtgaagtcacatacaagtttcttgtcatcctcctttaatctacccgcaagcatgcgtccttttaaatttgactccatttcatggttgtgaactccat 13158077  T
Q  239 taagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccac 286  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |  |||||||||    
T  13158078 taagaatgttcaatctccaatcatttgtttgcttattaagatatccac 13158125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 23028381 - 23028640
Alignment:
Q  16 ttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaa 115  Q
    ||||||||||| |||| |||  ||||||  | ||||| |||||| |||||| | | |||||||||||| | |  | ||||   |||||||| ||  ||||    
T  23028381 ttgtcacctctgtttgacttgaatatttttttacgttcattgtatacttgcatgatatttgtcatgcactcttttctttttctcttcaaatttaataaaa 23028480  T
Q  116 tatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcac-------gtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaag 208  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  23028481 tattttttgaaagcatcaaactcttggtcaagtcaccaatcatgtacaatcttcttgtcatcctcccttaatctacccgcaagcatgtgttcttctaaac 23028580  T
Q  209 ccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgttt 268  Q
      | || |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23028581 ttgccttcatctcatggttgtgaactccattaataatattcaatctccaatcatttgttt 23028640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6552904 - 6552800
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6552904 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacacaccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 6552805  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  6552804 agaat 6552800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42343606 - 42343502
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| | ||| ||||||    
T  42343606 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttatgaacaccatta 42343507  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  42343506 agaat 42343502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 43295336 - 43295232
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  43295336 ggtcaaatcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtggcctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 43295237  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  43295236 agaat 43295232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 27013615 - 27013719
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||  ||||||    
T  27013615 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctttcggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaatgccatta 27013714  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  27013715 agaat 27013719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11819329 - 11819279
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11819329 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 11819279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25048515 - 25048464
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaa 190  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25048515 ttggtcaagtcatatacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaa 25048464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20287510 - 20287404
Alignment:
Q  14 tcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaa 113  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||| ||| || |||||||| | ||||||||| |||| | || |||||  |||||||| || |||    
T  20287510 tcttgtcacctctgtttgactttcatatttattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaatcttgtcttttgctcttcaaatttaacaa 20287411  T
Q  114 aatattt 120  Q
    |||||||    
T  20287410 aatattt 20287404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 245
Target Start/End: Original strand, 30617320 - 30617402
Alignment:
Q  163 ttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaat 245  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  30617320 ttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaagaat 30617402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 6 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17319 - 17009
Alignment:
Q  6 caacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17319 caacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaaa 17220  T
Q  106 tgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttcta 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17219 tgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttcta 17120  T
Q  206 aagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcaccc 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17119 aagccggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccctattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcaccc 17020  T
Q  306 acattttcttg 316  Q
    |||||||||||    
T  17019 acattttcttg 17009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 18607250 - 18606936
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  18607250 attgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttatt 18607151  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18607150 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcgacaagaatgtgtcct 18607051  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607050 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 18606951  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18606950 acccacattttcttg 18606936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 1611557 - 1611872
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  1611557 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 1611656  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611657 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1611756  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1611757 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 1611856  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  1611857 caaccgcattttcttg 1611872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 316
Target Start/End: Original strand, 29287758 - 29288068
Alignment:
Q  5 gcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaa 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  29287758 gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtcttttgttcttcaa 29287857  T
Q  105 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29287858 atgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtccttat 29287957  T
Q  205 aaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacc 304  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  29287958 aaagccgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatcc-ctaatcatgaacaaacatc 29288056  T
Q  305 cacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||    
T  29288057 cacattttcttg 29288068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 18 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28250836
Alignment:
Q  18 gtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaata 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttcttcaaatgtatcaaaata 28251035  T
Q  118 tttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctcca 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28251034 tttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtccttctaaagctggctcca 28250935  T
Q  218 tcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28250934 tgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagcaaccacattttcttg 28250836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31147576 - 31147265
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  31147576 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 31147477  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31147476 caaatgtataaaaatattacttggaagcatcttgctcttgatcaagtcacgtacaatcttcttgtcattctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 31147377  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31147376 tctaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgttaccttactttgatatccactaatcatgaacaacc 31147277  T
Q  302 acccacattttc 313  Q
    ||||||||||||    
T  31147276 acccacattttc 31147265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220106
Alignment:
Q  16 ttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttttcaaatttatcaaaa 24220309  T
Q  116 tatttcttggaagcatctt--gctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggc 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24220308 tatttcttggaagcatcttatgctcttggtcaagtcacgtataattttcttgtcgtcctcctttaatctaccgacaagaatgtgtccttctaaagccgac 24220209  T
Q  214 tccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttc 313  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24220208 tccatcgcatggttgtgaactgcattaagaattttcaatccccattcatttgttttcctactaagatatccactaaccatggacaagcacccacattttc 24220109  T
Q  314 ttg 316  Q
    |||    
T  24220108 ttg 24220106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 21358157 - 21358411
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  21358157 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 21358253  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21358254 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcct 21358353  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccatt 259  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21358354 tctaaagccaacttcatcgcctggttgtgaacttcattgagaatgttcaatccccatt 21358411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 259
Target Start/End: Original strand, 23962139 - 23962393
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   | ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23962139 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtcta---tcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 23962235  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23962236 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcct 23962335  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccatt 259  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23962336 tctaaagccaacttcatcgcctggttgtgaacttcattgagaatgttcaatccccatt 23962393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 125 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 7362310 - 7362119
Alignment:
Q  125 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  7362310 gaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatg 7362211  T
Q  225 gttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7362210 gttgtgaactccattaagaatgttcaatccacattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcatccacattttcttg 7362119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 159 - 315
Target Start/End: Original strand, 7362307 - 7362463
Alignment:
Q  159 cttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccat 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7362307 cttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtcattctaaagtcgactccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcat 7362406  T
Q  259 tcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttctt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7362407 tcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaaccatccacattttctt 7362463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 215 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 35243644 - 35243543
Alignment:
Q  215 ccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttct 314  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35243644 ccatcacatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcatttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttct 35243545  T
Q  315 tg 316  Q
    ||    
T  35243544 tg 35243543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Original strand, 13387721 - 13387815
Alignment:
Q  222 atggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13387721 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccacgaatcatgaataagcaaccacattttcttg 13387815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 316
Target Start/End: Original strand, 23985364 - 23985425
Alignment:
Q  255 ccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23985364 ccattcttttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaagcacccacattttcttg 23985425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Original strand, 34111603 - 34111712
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||| |  ||||||||    ||| ||||| ||||||||| |||||    
T  34111603 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttctagtcatcttcctttaatcttcctgcaagaattttcccttctaactttggcgccatctcatggttgtgaactc 34111702  T
Q  236 cattaagaat 245  Q
    ||||||||||    
T  34111703 cattaagaat 34111712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22864921 - 22864869
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22864921 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcctcctccattaatcttccggcaagaa 22864869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Original strand, 26684976 - 26685026
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  26684976 tcaagtcatgtacaatcgtcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaa 26685026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2136 - 1821
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  2136 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 2037  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2036 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 1937  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1936 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 1837  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  1836 caaccgcattttcttg 1821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 47062138 - 47061823
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtca-cctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  47062138 attgcaacggcttcttgtcaacctctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 47062039  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062038 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatctttttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 47061939  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47061938 ttcaaaagtcggctccatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 47061839  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  47061838 cacccacattttcttg 47061823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18106643 - 18106329
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  18106643 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 18106544  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18106543 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtcc 18106444  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18106443 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 18106344  T
Q  301 cacccacattttctt 315  Q
    || || |||||||||    
T  18106343 caaccgcattttctt 18106329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 30787794 - 30787479
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  30787794 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgctttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctggttct 30787695  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787694 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 30787595  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30787594 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 30787495  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  30787494 caaccgcattttcttg 30787479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 43622941 - 43623256
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  43622941 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 43623040  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623041 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 43623140  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43623141 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 43623240  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  43623241 caaccgcattttcttg 43623256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 617555 - 617870
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  617555 aattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 617654  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617655 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 617754  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  617755 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 617854  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  617855 caaccgcattttcttg 617870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 45764634 - 45764319
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||    
T  45764634 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 45764535  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45764534 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtca 45764435  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45764434 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 45764335  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  45764334 caaccgcattttcttg 45764319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15060867 - 15060554
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  15060867 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 15060768  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060767 caaatgtatcaaaatattccttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacttacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 15060668  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15060667 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaa-ccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 15060569  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |  ||||||||||    
T  15060568 aactgcattttcttg 15060554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 42500661 - 42500347
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  42500661 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 42500562  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42500561 caaatgtatcaaaatatttcttgaaagcatcttgatctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtttcct 42500462  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42500461 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatctccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 42500362  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |  ||||||||||    
T  42500361 aactgcattttcttg 42500347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Original strand, 43827413 - 43827726
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43827413 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgctgacgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 43827512  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  43827513 caaatttatcaaaatatttcttggaagcatcttgcacttggtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgtgtcat 43827612  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  43827613 tctaaagctggctccttcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgtctactaagatatccactaaccatgaacaaac 43827712  T
Q  302 acccacattttctt 315  Q
    ||||||||||||||    
T  43827713 acccacattttctt 43827726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 8400840 - 8400527
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  8400840 attgcaacgccgtcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtcttttgttctt 8400741  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8400740 caaatttatcaaaatattttttggtaacatcttgctcttggtcaagtcacctacaatcttcttgtcatcctcctttaatgtaccagcaagaatgtgtcct 8400641  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  8400640 tctaaagccggctccatcgcatggttgtgaactccattgaaaatgttcaatccccattcttttgtttgcctactaagatatccactaaccatgaacaagc 8400541  T
Q  302 acccacattttctt 315  Q
    ||||||||||||||    
T  8400540 acccacattttctt 8400527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21800156 - 21799952
Alignment:
Q  112 aaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccg 211  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21800156 aaaatattttttggatgcaccttgctcttgattaagtcacgtataattttcttgttatcctcctttaatctaccgacaaacatgtgtccttctaaagccg 21800057  T
Q  212 gctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattt 311  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21800056 actccatcgcatggttgtgaactccattaacaatgttcaatctccattgctttgttttcctactaagatatccactaaccatgaacatgcacccacattt 21799957  T
Q  312 tcttg 316  Q
    |||||    
T  21799956 tcttg 21799952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46791440 - 46791336
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46791440 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46791341  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  46791340 agaat 46791336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1297101 - 1296997
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  1297101 ggtcaagtcatgtacaatcttctcgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttattaacaccatta 1297002  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  1297001 agaat 1296997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Original strand, 45172855 - 45172959
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  45172855 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 45172954  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  45172955 agaat 45172959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 245
Target Start/End: Original strand, 40445512 - 40445615
Alignment:
Q  142 gtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaa 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  40445512 gtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggttccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacgccattaa 40445611  T
Q  242 gaat 245  Q
    ||||    
T  40445612 gaat 40445615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 245
Target Start/End: Original strand, 8194228 - 8194330
Alignment:
Q  143 tcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaag 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| ||| | |||  || | ||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  8194228 tcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttcccgcaagaaggtgccctgcaaaatacgccaccatctcatggttgtgaacaccattaag 8194327  T
Q  243 aat 245  Q
    |||    
T  8194328 aat 8194330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Original strand, 20908458 - 20908528
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaa 206  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  20908458 ctcttggtaaagtcacgcacaatcttcttgtcatcctcccttaatcttcctgcaagaatgtgcccttctaa 20908528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 47867442 - 47867494
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  47867442 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaa 47867494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 182
Target Start/End: Original strand, 16794557 - 16794600
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16794557 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatct 16794600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 144 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40794035 - 40793934
Alignment:
Q  144 caagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaaga 243  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  40794035 caagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaattttcctgcaagaaggtgccctactacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccattaaga 40793936  T
Q  244 at 245  Q
    ||    
T  40793935 at 40793934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 43379254 - 43379306
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaa 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||    
T  43379254 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtactctgttaatcttccggcaagaa 43379306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 3762115 - 3761979
Alignment:
Q  46 tgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtacttcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtca 145  Q
    ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||| | | || ||||   ||||||||  |||||||||||| ||||  |||||   ||||||||||    
T  3762115 tgacgttcattgtatgctttctttacatttgtcatgcactcttgtctttttcccttcaaattcatcaaaatattttttggctgcatcaaactcttggtca 3762016  T
Q  146 agtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||| || || |||||| ||||| || ||| |||||||    
T  3762015 agttacctagaatctttttgtcatcttcccttaatct 3761979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 171
Target Start/End: Original strand, 16796810 - 16796842
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcc 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16796810 ttggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcc 16796842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 9891276 - 9890962
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  9891276 attgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttctt 9891177  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891176 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 9891077  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9891076 tctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataagc 9890977  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | || ||||||||||    
T  9890976 aaccgcattttcttg 9890962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4977009 - 4976704
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4977009 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgcattccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 4976910  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4976909 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttagtctaccggcaagaatgtgtctt 4976810  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976809 tctaaagccggctccatcgcatggttgcaaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 4976710  T
Q  302 acccac 307  Q
    | ||||    
T  4976709 atccac 4976704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11502760 - 11502446
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  11502760 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttgacgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtcttttgttctt 11502661  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11502660 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcttcctttaatctaccggcatgaatgtgtcct 11502561  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11502560 tctaaagccggctccatcgcatgggtgtgaactccattaagaatgttcaatactcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 11502461  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  11502460 acccacattttcttg 11502446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 19072463 - 19072778
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  19072463 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgtttt 19072562  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072563 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 19072662  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    || |||||| | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19072663 ttataaagcagactccatagaatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaaaaag 19072762  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||  ||||||||||||    
T  19072763 caaacacattttcttg 19072778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 49565270 - 49565585
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  49565270 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 49565369  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49565370 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcc 49565469  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49565470 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 49565569  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  49565570 caaccgcattttcttg 49565585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 4978765 - 4979075
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4978765 attgcaacggcttcttgtcacct----ttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 4978860  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  4978861 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcatcctttagtctgctggcaagaatgtgtcct 4978960  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978961 tctaaagtcggctccatcgcatggttgggaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 4979060  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    | |||||||||||||    
T  4979061 atccacattttcttg 4979075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Original strand, 18580138 - 18580449
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||    
T  18580138 attgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgaggtctttagttctt 18580234  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18580235 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacatacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctatcggcaagaatgtgtcat 18580334  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580335 tctaaagccggcttcattgcatggttgtgaactccattaagaatgtttaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 18580434  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  18580435 acccacattttcttg 18580449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 3405045 - 3404730
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  3405045 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtctttggttct 3404946  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3404945 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtcc 3404846  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3404845 ttctaaagccaactccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 3404746  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||  | ||||||||||    
T  3404745 caatcgcattttcttg 3404730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 41024454 - 41024140
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  41024454 aattgcaacgactttttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 41024355  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41024354 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctctttgtcaagtcacgtacaatcttcttttcgtcctcctttaatctacctgcaagaatgtgtcc 41024255  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41024254 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaattccattaagaatgttcaat-cccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 41024156  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  41024155 caaccacattttcttg 41024140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 312
Target Start/End: Original strand, 51643305 - 51643617
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  51643305 attgcaacggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 51643404  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51643405 caaatgtatcaaaatattttttgaaagcattttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctactggcaagaatgtgtcct 51643504  T
Q  202 tctaaagcc-ggctccatcgcatggttgt-taactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaa 299  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51643505 tataaagccgggctccatcgcatgtttgtgaaactccattaagaatgttcaatctcaattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaa 51643604  T
Q  300 gcacccacatttt 312  Q
    |||||||||||||    
T  51643605 gcacccacatttt 51643617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 21472047 - 21471734
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||| | |    
T  21472047 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacattttt-atccaatgtggtcttttgttcat 21471949  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcct 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||| |    
T  21471948 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttattctatcttcaagaatgtgtctt 21471849  T
Q  202 tctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 301  Q
    | |||||  | |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471848 tttaaagttgtctccattgtatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagc 21471749  T
Q  302 acccacattttcttg 316  Q
    |||||||||||||||    
T  21471748 acccacattttcttg 21471734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4769389 - 4769179
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4769389 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtagacattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 4769290  T
Q  101 tcaaatg----tatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgt 196  Q
    ||||||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4769289 tcaaatcaatttatcaaaatatttcttgaaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggtaagaatgt 4769190  T
Q  197 gtccttctaaa 207  Q
    |||||||||||    
T  4769189 gtccttctaaa 4769179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 2 - 179
Target Start/End: Original strand, 38463644 - 38463821
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  38463644 attgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccgtatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtcttttgtcctt 38463743  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaa 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38463744 caaatgtatcaaaatattttttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtgcaatcttcttgtcgtcctcctttaa 38463821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44049864 - 44049720
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtactt 101  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  44049864 attgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttctt 44049765  T
Q  102 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaa 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44049764 caaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctattggtcaa 44049720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 222 - 316
Target Start/End: Original strand, 38463824 - 38463918
Alignment:
Q  222 atggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463824 atggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 38463918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 211 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17140634 - 17140529
Alignment:
Q  211 ggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacatt 310  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  17140634 ggcttcatcgcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcctactttgatatccactaaccatgaacaaacatccacatt 17140535  T
Q  311 ttcttg 316  Q
    ||||||    
T  17140534 ttcttg 17140529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17916302 - 17916198
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  17916302 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccgcaccatctcatggttgtgaacaccatta 17916203  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  17916202 agaat 17916198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 6182821 - 6182664
Alignment:
Q  111 caaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagcc 210  Q
    |||||||||| ||| ||||| |   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||| ||||| |||  ||||| || ||||||||||||       
T  6182821 caaaatattttttgaaagcaccaaactcttggtcaagtcatgtacaattttcttgtcaccatcccttaatatacttgcaagcatatgtccttctaaactt 6182722  T
Q  211 ggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgttt 268  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  6182721 ggcttcatctcatggttgtgaactccatcaagaatattcaatctccaatcgtttgttt 6182664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4617818 - 4617714
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||   || ||| |  |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  4617818 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccgttaatcttccagcaagaaggttctctgctacatacggcaccatctcatggttgtgaacaccatta 4617719  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  4617718 agaat 4617714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1590950 - 1590845
Alignment:
Q  139 ttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccat 238  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  |  | ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  1590950 ttggtcaagtcatgtacaatcttct-gtcgtcctccattaatcttccggcaagaaggtgccctgctacataccacaccatctcatggttgtgaacgccat 1590852  T
Q  239 taagaat 245  Q
    |||||||    
T  1590851 taagaat 1590845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 46517380 - 46517480
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| ||| ||| ||| |  | || ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  46517380 ggtcaagtcatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttctagcaagaaggtgccctgctatataccgcaccatctcatggttgtgaacgccatta 46517479  T
Q  241 a 241  Q
    |    
T  46517480 a 46517480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 32716409 - 32716305
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || ||| ||| ||| |  | ||  |||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32716409 ggtcaagtcatgtacaatctttttgtcgtcctccattaatcttccggtaataaggtgccctgctacataccgcatcatctcatggttgtgaacgccatta 32716310  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  32716309 agaat 32716305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 20971446 - 20971492
Alignment:
Q  136 ctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatct 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  20971446 ctcttagtcaagtcacgtacaatctccttgtcgttctccattaatct 20971492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Original strand, 16163 - 16478
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  16163 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcgttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctttggttct 16262  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16263 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcttcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 16362  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16363 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcctcattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 16462  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || |||||||||||||    
T  16463 caaccacattttcttg 16478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 2 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12517 - 12202
Alignment:
Q  2 attgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttcc-atatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12517 attgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcgatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtcttttgttct 12418  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12417 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatctttctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatctaccggaaagaatgtgtcc 12318  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12317 ttctaaagccagctccatggcatggttttgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 12218  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    ||||||||||||||||    
T  12217 cacccacattttcttg 12202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 34064 - 33749
Alignment:
Q  1 aattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttggtgacgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtattttgtact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||    
T  34064 aattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctggttct 33965  T
Q  101 tcaaatgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33964 tcaagtgtatcaaaatatttcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacgatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtcc 33865  T
Q  201 ttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaag 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33864 ttctaaagccggctccatgggatggttgtgaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaataag 33765  T
Q  301 cacccacattttcttg 316  Q
    || || ||||||||||    
T  33764 caaccgcattttcttg 33749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 120 - 316
Target Start/End: Original strand, 95 - 291
Alignment:
Q  120 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95 tcttggaagcatcttgctcttggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgttctcctttagtctactcgtaagaatgtgtccttctaaagccggctccatc 194  T
Q  220 gcatggttgttaactccattaagaatgttcaatccccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195 gcatggttgtgaactccattaagaatgttcaatcaccattcctttgtttgcttactttgatatccactaatcatgaacaagcacccacattttcttg 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3951 - 3847
Alignment:
Q  141 ggtcaagtcacgtacaatcttcttgtcgtcctcctttaatctaccggcaagaatgtgtccttctaaagccggctccatcgcatggttgttaactccatta 240  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| ||| ||| |    || ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3951 ggtcaagttatgtacaatcttcttgtcgtcctccattaatcttccggtaagaaggtgccctgctacataacgcaccatctcatggttgtgaactccatta 3852  T
Q  241 agaat 245  Q
    |||||    
T  3851 agaat 3847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University