View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2485_high_9 (Length: 472)

Name: NF2485_high_9
Description: NF2485
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2485_high_9
NF2485_high_9
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (36-455)||(28310364-28310783)
chr4 (1-455)||(6963678-6964132)
chr4 (1-455)||(168000-168454)
chr4 (1-455)||(35319357-35319811)
chr4 (1-455)||(33281289-33281744)
chr4 (2-455)||(15542310-15542763)
chr4 (5-455)||(49374524-49374974)
chr4 (4-455)||(2013194-2013644)
chr4 (1-455)||(9035578-9036032)
chr4 (1-456)||(52416411-52416865)
chr4 (5-455)||(35158929-35159379)
chr4 (5-455)||(55136878-55137320)
chr4 (5-455)||(31093316-31093765)
chr4 (36-455)||(45462478-45462895)
chr4 (5-454)||(1602993-1603442)
chr4 (5-455)||(28780251-28780703)
chr4 (5-433)||(40728236-40728665)
chr4 (131-455)||(45924927-45925250)
chr4 (9-455)||(45229283-45229727)
chr4 (84-456)||(16452238-16452609)
chr4 (5-453)||(16024083-16024522)
chr4 (5-455)||(56463138-56463575)
chr4 (1-456)||(4048357-4048793)
chr4 (151-452)||(38217766-38218056)
chr4 (143-456)||(38550751-38551064)
chr4 (36-454)||(51538873-51539273)
chr4 (151-366)||(43841473-43841687)
chr4 (236-454)||(30003996-30004214)
chr4 (211-455)||(4189381-4189614)
chr4 (271-455)||(52501883-52502067)
chr4 (1-177)||(4189609-4189788)
chr4 (5-179)||(30003823-30003998)
chr4 (1-100)||(45924822-45924921)
chr4 (74-275)||(52499599-52499800)
chr4 (332-455)||(5419385-5419508)
chr4 (1-108)||(38551075-38551184)
chr4 (6-53)||(43841754-43841801)
chr4 (264-308)||(4353067-4353111)
chr4 (5-53)||(38218142-38218190)
chr4 (127-155)||(9035872-9035900)
chr4 (69-105)||(38218104-38218140)
chr4 (127-155)||(43841679-43841707)
chr4 (127-155)||(45229407-45229435)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-455)||(27114507-27114962)
chr5 (1-455)||(37883648-37884102)
chr5 (5-454)||(3556831-3557280)
chr5 (9-455)||(12785370-12785816)
chr5 (5-455)||(8734903-8735353)
chr5 (4-456)||(11719396-11719849)
chr5 (9-455)||(12723887-12724333)
chr5 (5-455)||(16513069-16513518)
chr5 (1-456)||(26279258-26279715)
chr5 (3-454)||(13821564-13822002)
chr5 (2-453)||(18809188-18809627)
chr5 (33-455)||(38678941-38679364)
chr5 (65-455)||(8197647-8198035)
chr5 (5-424)||(37013034-37013454)
chr5 (131-455)||(37029776-37030099)
chr5 (1-456)||(9714775-9715224)
chr5 (1-456)||(25976614-25977049)
chr5 (221-408)||(2605862-2606047)
chr5 (301-455)||(8298729-8298883)
chr5 (5-272)||(8298881-8299147)
chr5 (332-455)||(20336971-20337094)
chr5 (218-410)||(27950519-27950707)
chr5 (218-386)||(27347000-27347162)
chr5 (339-391)||(23342125-23342177)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (1-455)||(50261453-50261906)
chr1 (4-455)||(23983500-23983950)
chr1 (1-453)||(52631825-52632275)
chr1 (4-455)||(41899755-41900205)
chr1 (1-454)||(38860900-38861350)
chr1 (5-455)||(14586815-14587265)
chr1 (1-429)||(12528669-12529098)
chr1 (5-452)||(29961607-29962053)
chr1 (8-455)||(44496698-44497143)
chr1 (1-455)||(41086623-41087075)
chr1 (1-455)||(41091391-41091843)
chr1 (65-455)||(33801601-33801990)
chr1 (2-456)||(27217022-27217481)
chr1 (36-455)||(12700031-12700450)
chr1 (36-455)||(3517072-3517487)
chr1 (151-455)||(44754886-44755191)
chr1 (1-454)||(49851932-49852384)
chr1 (5-404)||(42882129-42882518)
chr1 (151-455)||(41723847-41724137)
chr1 (36-455)||(22858924-22859329)
chr1 (66-302)||(48964595-48964830)
chr1 (295-455)||(37952710-37952870)
chr1 (301-455)||(48963813-48963967)
chr1 (5-203)||(37952510-37952707)
chr1 (5-110)||(41723740-41723845)
chr1 (22-168)||(11952166-11952314)
chr1 (233-308)||(6603613-6603685)
chr1 (220-308)||(7562618-7562705)
chr1 (218-358)||(43253151-43253289)
chr1 (5-57)||(44757430-44757482)
chr1 (260-308)||(50891057-50891105)
chr1 (332-386)||(34551273-34551327)
chr1 (260-305)||(30516386-30516431)
chr1 (127-155)||(33801668-33801696)
chr1 (258-306)||(34551198-34551246)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (1-455)||(25528587-25529041)
chr7 (5-455)||(33951143-33951593)
chr7 (1-455)||(14816136-14816588)
chr7 (1-455)||(15263132-15263584)
chr7 (27-455)||(34847302-34847730)
chr7 (1-455)||(46255071-46255515)
chr7 (5-455)||(44866259-44866697)
chr7 (1-455)||(36311559-36312014)
chr7 (36-455)||(35794705-35795115)
chr7 (1-292)||(43458388-43458679)
chr7 (315-455)||(43458676-43458816)
chr7 (5-71)||(34847734-34847800)
chr7 (212-386)||(31267714-31267888)
chr7 (258-306)||(18501700-18501748)
chr7 (127-155)||(36311851-36311879)
chr7 (127-155)||(46255202-46255230)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (1-455)||(20092084-20092535)
chr8 (5-455)||(11076438-11076889)
chr8 (1-455)||(43098005-43098459)
chr8 (5-455)||(39318075-39318523)
chr8 (5-455)||(42131381-42131828)
chr8 (5-455)||(8239466-8239916)
chr8 (3-455)||(39259781-39260222)
chr8 (8-455)||(35683493-35683940)
chr8 (1-455)||(13545732-13546173)
chr8 (1-455)||(13678300-13678741)
chr8 (1-399)||(32947230-32947628)
chr8 (5-455)||(40104728-40105177)
chr8 (2-455)||(6347520-6347971)
chr8 (1-456)||(32338034-32338490)
chr8 (1-455)||(31700524-31700961)
chr8 (68-404)||(37098604-37098940)
chr8 (1-456)||(585873-586325)
chr8 (1-456)||(627598-628050)
chr8 (298-456)||(28249245-28249403)
chr8 (245-452)||(23143609-23143816)
chr8 (1-208)||(23143826-23144035)
chr8 (261-382)||(28286366-28286485)
chr8 (1-49)||(37098557-37098605)
chr8 (329-379)||(16795389-16795439)
chr8 (258-308)||(42191248-42191298)
chr8 (127-155)||(32947362-32947390)
chr8 (127-155)||(39318368-39318396)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (5-455)||(16395528-16395979)
chr6 (8-455)||(303969-304415)
chr6 (1-455)||(9304435-9304888)
chr6 (5-455)||(31722372-31722810)
chr6 (151-455)||(11975342-11975644)
chr6 (5-394)||(439244-439622)
chr6 (5-343)||(31271559-31271896)
chr6 (65-389)||(31318788-31319111)
chr6 (381-453)||(31319133-31319205)
chr6 (384-455)||(439640-439711)
chr6 (260-308)||(3513425-3513473)
chr6 (399-455)||(31271894-31271950)
chr6 (54-109)||(11975243-11975298)
chr6 (1-38)||(31318758-31318795)
chr6 (127-155)||(439373-439401)
chr6 (127-155)||(16395657-16395685)
chr6 (258-306)||(17523018-17523066)
chr6 (258-306)||(19630521-19630569)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (1-455)||(38208537-38208990)
chr2 (1-455)||(1209394-1209844)
chr2 (5-456)||(38703063-38703512)
chr2 (5-455)||(17137181-17137631)
chr2 (8-455)||(6404327-6404773)
chr2 (1-452)||(45117280-45117734)
chr2 (151-455)||(15912067-15912369)
chr2 (75-455)||(44760324-44760705)
chr2 (5-374)||(17309169-17309538)
chr2 (9-451)||(45234447-45234883)
chr2 (4-455)||(13278920-13279345)
chr2 (1-453)||(1115322-1115760)
chr2 (197-454)||(7941008-7941263)
chr2 (151-454)||(31993557-31993858)
chr2 (5-235)||(30490374-30490606)
chr2 (193-395)||(16414907-16415105)
chr2 (340-453)||(30490249-30490362)
chr2 (258-402)||(16251722-16251866)
chr2 (260-381)||(18965409-18965530)
chr2 (2-108)||(31993882-31993990)
chr2 (211-308)||(32980661-32980752)
chr2 (1-85)||(7942573-7942657)
chr2 (260-354)||(45536838-45536932)
chr2 (260-308)||(31715499-31715547)
chr2 (127-155)||(15912047-15912075)
chr2 (127-155)||(44760383-44760411)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (1-455)||(39586776-39587230)
chr3 (5-455)||(41182110-41182559)
chr3 (36-453)||(32530044-32530462)
chr3 (5-454)||(47647129-47647575)
chr3 (1-456)||(49165581-49166024)
chr3 (74-456)||(41193224-41193606)
chr3 (5-406)||(10508744-10509146)
chr3 (74-455)||(47013241-47013622)
chr3 (5-456)||(26501677-26502117)
chr3 (171-455)||(6936803-6937084)
chr3 (151-452)||(40940122-40940408)
chr3 (131-455)||(53816284-53816594)
chr3 (1-454)||(31764675-31765118)
chr3 (214-455)||(36402302-36402541)
chr3 (234-455)||(39353568-39353789)
chr3 (5-455)||(149536-149957)
chr3 (211-399)||(227777-227964)
chr3 (3-96)||(36402547-36402640)
chr3 (5-101)||(40937427-40937523)
chr3 (74-110)||(53814920-53814956)
chr3 (69-109)||(6936744-6936784)
chr3 (1-58)||(6936690-6936747)
chr3 (275-308)||(9332585-9332618)
chr3 (127-155)||(26501962-26501990)
chr3 (1-37)||(53814881-53814917)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-456)||(46908-47350)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (256-454)||(14636-14834)
[»] scaffold1301 (1 HSPs)
scaffold1301 (60-110)||(1874-1924)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (258-306)||(181433-181481)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (258-306)||(11614-11662)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (264-308)||(17525-17569)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (261-305)||(245936-245980)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 335; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28310783 - 28310364
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||||    
T  28310783 tccggaaaacagaagtgcattccggattttatattccataatgcatcagtcatggtcggtggtctgtaccacacgtttttgtcggtgatcaagtcaaaaa 28310684  T
Q  136 acgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacac 235  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28310683 atgcgttttaccacatttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagttttccaaactccaccattgctcacac 28310584  T
Q  236 accatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttaggg 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28310583 accatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttcaatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactttcaggg 28310484  T
Q  336 tttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctga 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28310483 tttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgcgctgcaaagaagtgtggttcatttgagggtcatgtggatcagtgtggttcttagcttagcctgtctga 28310384  T
Q  436 gcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28310383 gcgtaagttcgagcaccccc 28310364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 6963678 - 6964132
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6963678 cgttcaccatcatcgcattaatccgtaaaatatattccggaaaacatatgtgcattccatattttatattccggaatgcatcagtcatggtcggtggtct 6963777  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt--caaaaaacgcgttttacca-cgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||   |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6963778 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaaacgcgttttaccaccatttttgactgcatttatggcatcccaaccgtttttgacccacccctc 6963877  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    |||||| ||||  |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6963878 cctataaatagccttccaaaccccaccatttct--cacactatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttaccatcattgg 6963975  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  6963976 -ctttcatggataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagagt 6964074  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6964075 catgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 6964132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 168454 - 168000
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  168454 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattctggaaaccacatgtgcatttcagattttatattctggaatgcttcagtcatggctggtggtct 168355  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||| ||        ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168354 gcaccaaacatttatgtcggtggtcaggtcaaaaaaacgcgttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 168255  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  168254 ctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--cattctctcccaccctctcctcctcttcttccttctccaaccatggttttctatcgttggc 168157  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  168156 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcagttcatctgagggtc 168057  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  168056 atgtggctcagtgtggttcttagcttggcctgtctaggcgtaagtttgagcaccccc 168000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35319811 - 35319357
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35319811 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatatttcgaaaaacagatgtgcattccggattttatatttcggaatgcattagtcatggctggtggtct 35319712  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35319711 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacgcgttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccgtccgtttttgacccacccctcc 35319612  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35319611 ctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccactatctcctcctcttcttccttctacaactatggttttccatcgttggc 35319514  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  35319513 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttttatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctacaatgaagtgcggttcatctgagggtc 35319414  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | ||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  35319413 atgtgggtcagtgtgattgttagcttggtctgtctaggcgtaagtttgagctccccc 35319357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 33281289 - 33281744
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  33281289 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaaacagatatgcatttcggattttatattccggaatgcatcagtaatgggcggtggtct 33281388  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac-gcgtttt-accacgtttt-tgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||       || || ||| || ||||||  | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33281389 gcaccacacgtttttgtcgatggtcaggtaaaaaaaatgtgtttttaccacgttttgtgactgcaattatggcctccaaaccgtttttgacccacccctc 33281488  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    |||||| ||||  |||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33281489 cctataaatagcattccaagccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 33281586  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  33281587 cctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtgaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctaagggt 33281686  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  33281687 catgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 33281744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 2 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15542763 - 15542310
Alignment:
Q  2 gttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctg 101  Q
    ||||||||| || |||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15542763 gttcaccataatcgcattaatcttgaaaatatattctggaaaacagatgtacattccagattttattttccgaaatgcatcagtcatggccggtggactg 15542664  T
Q  102 caccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac-gcgttttaccacgt-ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    |||||||||       ||||| |||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15542663 caccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaatgtgttttaccacgtgttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcgg 15542564  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
     ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542563 gataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 15542466  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  15542465 tttcatcgataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgtgctgcaacgaagtgcggttcatttgagggtca 15542366  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15542365 tgtgggtcagtgttgttcgtagcttggtctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 15542310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 49374524 - 49374974
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49374524 caccattatcacattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatactccggaatgcatcagccatggccggtggtctgcac 49374623  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtc-aaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||       ||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49374624 cacacgtttttgtcggtggtcaggtcaaaaaaacgcgtttcaccacgtttttttactgcatttatggcctctcaaccgtttttgacccacccctccctat 49374723  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49374724 aaatagccttccaaaccccaccatttct--cacatcatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggccttt 49374821  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  49374822 catagataagggccttgttgaaaaatttcagggtttgtataaatggtcaatgaggatggaactgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtcacgt 49374921  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  49374922 gggtcagtgtgattcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 49374974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 2013644 - 2013194
Alignment:
Q  4 tcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 103  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| |||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2013644 tcaccattatcgcattaatttggaaaataaattccggaaaatacatgtgcatttcggattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 2013545  T
Q  104 ccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt--gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    |||||||       ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||    
T  2013544 ccacacgtttttgtcggtggtcaagt-aaaaaacgctttttaccacgtttttttgactgcatttatggcctcccaatcgttttttacccacccatcccta 2013446  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2013445 taaatagccttccaaaccccaccatttcttacac--catcctctcccaccctctcctcctcttctttcttctacaaccatggatttccatcgttggcctt 2013348  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2013347 tcatagataagggcttcattgaaaactttcagggtttgtatgaacgatcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgaggttcatctgagggtcatg 2013248  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2013247 tgggtcagtgtggttcttagtttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 2013194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9036032 - 9035578
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036032 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 9035933  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||||| |       || || ||||||||||||| || | |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9035932 gcaccacatgtttttgtcgatggtcaagtcaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 9035833  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    |||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9035832 ctataattagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctcttccaccctctcctcctcttcgtccttctacaaccatggttttcgatcattggc 9035735  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  9035734 ctttcatagataagggccttgttgaaaactttcagggtttgtatgaacgatcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatttgagggtc 9035635  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||| || |  |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  9035634 atgcggattggtgtggttcttagcttggcctacctgggcgtaagtttgagcaccccc 9035578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 52416865 - 52416411
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  52416865 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatatttcggaaaacagatgtgcattccggattttatattccggaatgcattagtcatggtcggtggtct 52416766  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||||||||| || | |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52416765 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacgtggtaaaacgcgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 52416666  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  |||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  52416665 tataaatagccttctgaaccccaccatttctcacac--catcctctctcaccctctcctcctcttattccttgtacaaccatggtttttcatcgttggcc 52416568  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  52416567 tttcatagataagggtcttgttaaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgatgatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgatggtca 52416468  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  52416467 tgtgattcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccct 52416411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 35158929 - 35159379
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35158929 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaa-caggtgtgcattccggatttaatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcat 35159027  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| | |||| ||||||  |||  ||  |||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35159028 cacacgtttttgtcggtggtaaagtaaaaaaaaacgtggtaaaacgagttttttgactgcatttatagcctcccaaccatttttgactcacccctcccta 35159127  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35159128 taaatagccttccaaaccccaccatttctcatac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 35159225  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  35159226 tcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaataaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcgattcatctgagggtcatg 35159325  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35159326 tggatcagtgtggttcttagcttggcctgtctaggcgtaagtttgagcaccccc 35159379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 55136878 - 55137320
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55136878 caccattatcacattaatccggaaaatatattccggaaat-agatgtgcatttcagattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcat 55136976  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatat 204  Q
    ||||||        |||| ||||||||||||||  ||   ||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||     
T  55136977 cacacgtttttgttggtggtcaagtcaaaaaactggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgttct-----cacccctccctataa 55137071  T
Q  205 atagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttca 304  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55137072 atagctttccaaactgcaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttca 55137169  T
Q  305 tagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgg 404  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  55137170 tagataagggcctcattgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggacatgtgg 55137269  T
Q  405 gtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || | ||||||||    
T  55137270 gtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaaatttgtgcaccccc 55137320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 31093316 - 31093765
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31093316 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaggtgtgcattccagagtttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 31093415  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    | |||         |||| |||||| ||||||  | |  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31093416 cgcacatttttgttggtggtcaagtaaaaaaaa-catggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgactcaccc-tcccta 31093513  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31093514 taaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctatcctcctcttctttcttctacaatcatggttttccatcgttggcctt 31093611  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  31093612 tcatagataagggcctcgttgaaaacattcagggtttgtatgaacgatcaatgaggatggaaccgcgctgtaacgaagcgcggttcatctgagggtcatg 31093711  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  31093712 tgggtcagtgtggttcttaacttggtctgtttgggcgtaagtttgagcaccccc 31093765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Original strand, 45462478 - 45462895
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||       ||||| |||||| |||||    
T  45462478 tccggaaaagaggtgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggtcggtggtctgcatcaaacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaa 45462577  T
Q  136 acgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacac 235  Q
    |   ||   ||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||     
T  45462578 agtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcctaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccatcatttctcaca- 45462676  T
Q  236 accatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttaggg 335  Q
     |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  45462677 -ccatcctctcccaccctctcctcatcttattccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagagcctcgttgaaaactttcaggg 45462775  T
Q  336 tttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctga 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  45462776 tttgtatgaacggtcaatgaggatggaactgcgctgcaatgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggtttttagcttggcctgtctgg 45462875  T
Q  436 gcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  45462876 gcgtaagtttgagcaccccc 45462895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 454
Target Start/End: Original strand, 1602993 - 1603442
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  1602993 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaggtgtgctttccggattttatattccggaatgcatcagacatggccggtggtctgcat 1603092  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    |||||        ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1603093 cacacatttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaa-cgtagtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 1603191  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| ||||||||||||  ||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1603192 taaatagcattccaaaccccaccatttctctaac--cattctctcccagcctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccttcgttggcctt 1603289  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1603290 tcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgatgatggatccgcgctgcaaagaagtgatgttcatctgggggtcatg 1603389  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||    
T  1603390 tgggtcagtatggttcttagcttgtcctgcatgggcgtaagtttgagcacccc 1603442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28780703 - 28780251
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28780703 caccattatcgcattaatcaggaaaacatattccggaaaacatatgtgcattccggaatgtagattctgaaatgcatcagtgatggccggtggtctgcac 28780604  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac-gcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccct 200  Q
    |||| |       ||||| |||||| ||||||  | ||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28780603 cacatgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaaagggtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccct 28780504  T
Q  201 atatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcct 300  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28780503 ataaatagccttccaaaccccaccatttctcacat--catcctctcctaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatgattttccatagttggcct 28780406  T
Q  301 ttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcat 400  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28780405 ttcatagataagggtttcgttgaaaactttcagggtttgcatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgatgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcat 28780306  T
Q  401 gtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28780305 gtgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 28780251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 433
Target Start/End: Original strand, 40728236 - 40728665
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| || | || ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40728236 caccattatcgtattaatccggaaaacatattccgtaaaacatatgtgcattccggaatgtagattccggaatgcatcaatgatggccggtggtctgcac 40728335  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||       ||||| |||||| |||||| || | |  | |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40728336 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaacgtgtttttcgactgcatttatggccttccaaccgtttttgacccacccctccctat 40728435  T
Q  203 -atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
     | ||||  |||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40728436 taaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--caacctctcccgccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 40728533  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  40728534 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccacgctgcaacgaagcgcgattcatctgagggtcatg 40728633  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtct 433  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40728634 tgggtcggtgtggttcttagcttggcctgtct 40728665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 131 - 455
Target Start/End: Original strand, 45924927 - 45925250
Alignment:
Q  131 aaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttc 229  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  45924927 aaaaaacgctttttaccatgttttttgactgcatttatggcctcccaaccatttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttc 45925026  T
Q  230 tcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactt 329  Q
    ||| ||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45925027 tcaaac--catcctctcccaccctatcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggtctcgttgaaaactt 45925124  T
Q  330 ttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcct 429  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45925125 tcagggtttgtatgaacggtcaatcaagatggaaccacgctgcaacgaagtgcagttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcct 45925224  T
Q  430 gtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45925225 gtctgggcgtaagtttgagcaccccc 45925250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Original strand, 45229283 - 45229727
Alignment:
Q  9 attattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccaca 108  Q
    ||||| |||||||| || |||| |||||||  ||| ||||||||  |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45229283 attatcgcattaattcggaaaacatattccagaaagcagatgtgtgttctggattgtatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccaca 45229382  T
Q  109 cgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatat 206  Q
    |        ||||| |||||| |||||| || | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  45229383 catttttatcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccaccc-tccctataaat 45229481  T
Q  207 agttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||  || ||||| ||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45229482 agcctttcaaaccccaccatt---ctcacaccatcctctcccaccctctcctcctcttcttcattctacaaccatggttttccatcgttggtctttcata 45229578  T
Q  307 gataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggt 406  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45229579 gataagggtctcgttgaaaactttgagggtctgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacaaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggt 45229678  T
Q  407 cagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  45229679 cagtgtggttcttcgcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 45229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 84 - 456
Target Start/End: Original strand, 16452238 - 16452609
Alignment:
Q  84 gtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtt 182  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |       ||||| |||| || ||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  16452238 gtcatggccggtggtttgcaccacatgtttttgtcggtggtcaaatccaaaaacgtgtgttaccacgttttttgactacatttatgacctcccaaccgtt 16452337  T
Q  183 tttgacccacccc-tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccat 281  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16452338 tttgacccaccccctccctataaatatccttccaaaccccaccatttctcacac--catccactcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccat 16452435  T
Q  282 ggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||    
T  16452436 ggttttccatcgttggcctttcataaataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaattgtgctgcaacgaagtg 16452535  T
Q  382 cggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16452536 cggttcatct-agggtcatgtgggtcagtgtggttcttggcttggcctgtctgagcgtaagtttgagcaccccct 16452609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 453
Target Start/End: Original strand, 16024083 - 16024522
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||        |||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16024083 caccattatcgcattaatccggaaaatatat--------acagatgtgctttccggattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 16024174  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgt---ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||    |  ||  ||||   |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  16024175 cacacgttttgt-cggtggtcaagtgaaaaaaata-tggtaaaacgtattttttgattgtatttatggcctcctaaccgtttttgacccacctctcccta 16024272  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16024273 taaatagccttccaaaccccactatttctcaca--ccatcctctctcactctctcctcctcttcttccttctaaaaccatggttttccatcgttggcctt 16024370  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16024371 tcatagataagggcatcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggtttatctgagggtcatg 16024470  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  16024471 tgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctgggcgtaagtttgagcaccc 16024522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 56463575 - 56463138
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56463575 caccattatcgcattaatctgaaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccgaattatatattccggaatgcatcagtcatggcaggtggtctgcac 56463476  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       | ||| |||||| ||||||  | |  ||  |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56463475 cacacgtttatgtcagtggtcaagtaaaaaaaa-catggtaaaacgcattttttgactgcatttattgcctcccaaccgtttttgacccaccc-tcccta 56463378  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||||              |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56463377 taaatagccttccaaaccccaccat--------------cctctcccaccctctcctcctcttcgtccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 56463292  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  56463291 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacgggcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggacatg 56463192  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  56463191 tgagtcagtgtggttcttagcttggtctgcctgagtgtaagtttgagcaccccc 56463138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 4048357 - 4048793
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||| |   ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4048357 cgttcaccatcatcgtattaatccggaaaatatattccggaaaaaaa--gtgcattacggattttatattccggaatgcatcagtcatggccgatggtct 4048454  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       |||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4048455 gcaccacacgtttttttcggtggccaagtcaagaaaacacgttttaccacattttttgacagcatttatgacctcccaaccgtttttgacccacccctcc 4048554  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    | ||| ||||  |||||||| |||||||              |||||||||||||||  |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4048555 ccataaatagccttccaaaccccaccat--------------cctctcccaccctctttt-----tcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 4048635  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4048636 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcaggatttgtatgaacggtcaatgaggatggagccgcgctgcaacgaagtgcggttcatttgcgggtc 4048735  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4048736 atgtgggtcagtttggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 4048793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 151 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 38218056 - 38217766
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38218056 tttttgactgcatttatggcctcccagccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccac 38217959  T
Q  251 cctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtc 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38217958 cctctcctcctcttcttccttctaacaccatggttttccattgttggcctttcatagataagggtctcgttgaaattttttagggtttgtatgaacggtc 38217859  T
Q  351 aatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagca 450  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  38217858 aatgaggatggaaccgcgctgctacgaagtgcggttcatctgagg---------gtcagtgtggttcttagcttggcctgtcttggcgtaagtttgagca 38217768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 143 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38551064 - 38550751
Alignment:
Q  143 ttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc-tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccat 240  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| |||||||| |||||  |||||||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||  |||    
T  38551064 ttaccacgttttttgactacatttatgaccgcccaaccatttttgactcaccctgtccctataaatagcttttcaaaccccactatttctcacac--cat 38550967  T
Q  241 cctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgt 340  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  38550966 cctctcccaccctctcctcctcatcttccttctacaaccatggttttcgatcgttggcctttcataaataagggcctcgttgaaaacttttagaggttgt 38550867  T
Q  341 atgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgta 440  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| | |||    
T  38550866 atgaacggccaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgggggtcatgtgggttagtgtggttcttaacttgacctgtctgggtgta 38550767  T
Q  441 agttcgagcaccccct 456  Q
    |||| |||||| ||||    
T  38550766 agtttgagcacgccct 38550751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 36 - 454
Target Start/End: Original strand, 51538873 - 51539273
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||        ||||| ||| ||||||||    
T  51538873 tccgaaaaacagatgtgtattccggattttatattccattatgtatcagtcatggccgatggtcagcaacacacattttttacggtggtcaggtcaaaaa 51538972  T
Q  136 a-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcac 233  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||                   
T  51538973 aacgcgttttaccacgttttttgattgcatttatgggctccagaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttctaaac--------------- 51539057  T
Q  234 acaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttag 333  Q
        ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  51539058 ----catcctctcccaccctctcctcctcttctaccttcaataaccatagttttccatcgttgacctttcatatataagggtctcgttgaaaactttcag 51539153  T
Q  334 ggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtct 433  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  51539154 ggtttgtatgaacggtcaacgaggatggaaccgcgctgcaacgaagggcggttcatttgagggtcacgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcct 51539253  T
Q  434 gagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  51539254 ga-cgtaagtttgagcacccc 51539273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 151 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 43841687 - 43841473
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctccc-aaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctccca 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  43841687 tttttgactgcatttatggtctccccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctccca 43841590  T
Q  250 ccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggt 349  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43841589 ccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgacctttcatggataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggt 43841490  T
Q  350 caatgaggatggtaccg 366  Q
    |||||||||||| ||||    
T  43841489 caatgaggatggaaccg 43841473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 236 - 454
Target Start/End: Original strand, 30003996 - 30004214
Alignment:
Q  236 accatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttaggg 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  30003996 accatcctctcccaccctctcctcctctttttccttctacaaccatggtttttcatcgttggcctttcatagataagagcctcgttgaaaacttttaggg 30004095  T
Q  336 tttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctga 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||     
T  30004096 tttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacaaagtacgattcatatgagggtcatgtgggtcagtgcggttcttaacttggcctgtctgg 30004195  T
Q  436 gcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  30004196 gcgtaagtttgagcacccc 30004214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 211 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 4189614 - 4189381
Alignment:
Q  211 ttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagata 310  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4189614 ttccaaaccccaccatttctcacaa--cattctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttctatcgttggcctttcatagata 4189517  T
Q  311 agggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||         |||||||||||    
T  4189516 agggcctcgttgaaaactttccgggtttatatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatc---------tgtgggtcagt 4189426  T
Q  411 gtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4189425 gtggttcttagcttggtctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 4189381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 271 - 455
Target Start/End: Original strand, 52501883 - 52502067
Alignment:
Q  271 tctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||    
T  52501883 tctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggccttgttaaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaattaggatgaaaccacgct 52501982  T
Q  371 gcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52501983 gcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 52502067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4189788 - 4189609
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4189788 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgttcattccggattttatactccagaatgcatcagtcatggctggtggtct 4189689  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt--caaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaa 177  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4189688 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaaatgcgttttaccacgttttttgattgcatttatggccttccaa 4189609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 179
Target Start/End: Original strand, 30003823 - 30003998
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30003823 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacaagtgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcat 30003922  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaacc 179  Q
    ||||||       ||||| |||||| |||||| | | |  | | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30003923 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaagtggtaaaacgcgttttttaactgcatttatggcctcccaacc 30003998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 45924822 - 45924921
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  45924822 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaataaattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattctggaatgcatcagtcatggccggtggtct 45924921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 275
Target Start/End: Original strand, 52499599 - 52499800
Alignment:
Q  74 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggc 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| ||||||   ||  ||  |||   ||||||||| ||||||||||    
T  52499599 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacatttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaaa-gtgataaaacgcattttttgactacatttatggc 52499697  T
Q  171 ctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttcct 270  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  52499698 cttccaaccgtttttgacccacccctgcctattaatagccttccaaaccccacaatttct--cacaccatcctctaccaccctctcctcctcttcttcct 52499795  T
Q  271 tctac 275  Q
    |||||    
T  52499796 tctac 52499800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 455
Target Start/End: Original strand, 5419385 - 5419508
Alignment:
Q  332 agggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |  |||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5419385 agggtttgtatgaacggtcaacgaggatggaatcacgctgcaataaagtgtggttcatctaagggtcatgtgagtcagtgtggttcttagcttggcctgt 5419484  T
Q  432 ctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||  | ||||||| ||| ||||||    
T  5419485 ctaggggtaagtttgagtaccccc 5419508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38551184 - 38551075
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatca--gtcatggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||| | |||||||||| ||||||| || | ||||||||||  |||||||| ||||||    
T  38551184 cgttcaccattatcgtattaatccggaaaatatatttcggaaaacaaaggtgcattccaaattttatttttcggaatgcatcagtgtcatggctggtggt 38551085  T
Q  99 ctgcaccaca 108  Q
     |||||||||    
T  38551084 ttgcaccaca 38551075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 43841801 - 43841754
Alignment:
Q  6 accattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgc 53  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43841801 accattatcgcattaatccggaaaatatattctgaaaaacagatgtgc 43841754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 308
Target Start/End: Original strand, 4353067 - 4353111
Alignment:
Q  264 tcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4353067 tcttccttctacaacgatgtgtttccatcgttggcctttcataga 4353111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38218190 - 38218142
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgc 53  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  38218190 caccattatcgcattaattcggaaaatatatttcgaaaaacagatgtgc 38218142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Original strand, 9035872 - 9035900
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9035872 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 9035900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 38218140 - 38218104
Alignment:
Q  69 ttccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcacc 105  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38218140 ttccggaatgcattagtcatggccggtggtctgcacc 38218104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Original strand, 43841679 - 43841707
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841679 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 43841707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45229435 - 45229407
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45229435 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 45229407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 27114507 - 27114962
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27114507 cgttcaccattatcgcatgaatccggataatatattccagaaaacagatgtgcattccaaattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 27114606  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt--gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||       || || ||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27114607 gcaccacacgtttttgtcgatggtcaagtcaaaaaaacgtgttttaccacgtttttttgactgcaattatggtctcccaaccgtttttgacccacccctc 27114706  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27114707 cctataaatagtcttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccatctcctcctcttcttccttctacaaccatagttttccatcgttgg 27114804  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27114805 cctttcatagataaggacctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtacggttcatctgagggt 27114904  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27114905 catgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 27114962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 37883648 - 37884102
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37883648 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 37883747  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||||||        |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37883748 gcaccacacatttttgtcggtggccaagtcaaaaaaacgcgttttaccacgtttttttactacatttatggcctcccaactgtttttgacccacccctcc 37883847  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  37883848 ctataaatatccttccaaaccccaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttttacaaccatcgttttccaacgttggc 37883945  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37883946 ctttcatagataagggtctcgttgaaaattttcagggtttgtatgaacggtcaataaggatggaaccgcattgcaatgaagtgcggttcatctgagggtc 37884045  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||  | |||||| ||||||||||    
T  37884046 atgtgggtcagtgtggttcttaacttggtatgtctggtcataagtttgagcaccccc 37884102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 454
Target Start/End: Original strand, 3556831 - 3557280
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  3556831 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaggtgtgcattccgaattttatatttcggaatgcatcagtcattgccggtggtttgcat 3556930  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||  | |  ||  | |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3556931 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaa-catggtaaaatgcattttttgactgcatttatggcctcccaactgtttttgacccacccctcccta 3557029  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3557030 taaatagtcttccaaaccccaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcttt 3557127  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3557128 tcatagataagggtctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacgatcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcagttcatctgagggtcatg 3557227  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3557228 tgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcacccc 3557280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Original strand, 12785370 - 12785816
Alignment:
Q  9 attattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccaca 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12785370 attatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccgaattatatattctggaatacatcagtcatggccggtggtctacaccaca 12785469  T
Q  109 cgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgc-gttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatat 206  Q
    ||       |||||  ||||| ||||||    |    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12785470 cgtttttgtcggtggccaagtaaaaaaaaattggcaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccttataaat 12785569  T
Q  207 agttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12785570 agtcttccaaaccccactatttctcaca--ccatcctctcccatcctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatggttggcctttcata 12785667  T
Q  307 gataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggt 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12785668 gataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaataaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggt 12785767  T
Q  407 cagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12785768 cagtgtggttcttagcttggcctgcctgagcgtaagtttgagcaccccc 12785816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 8734903 - 8735353
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8734903 caccattatcgcattaattcggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccggattataaattccagaatgcatcagtcatggtcgatggtctgcac 8735002  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgt---ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       | ||| |||||| ||||||  |||  ||  ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8735003 cacacgtttttgtctgtggtcaagtaaaaaaaa-cgtggtaaaacgtattttttgacagcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccatcccta 8735101  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8735102 taaatagccttccaaagtccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctccttctcttcttccttctacaaccatggttttccattgttggcctt 8735199  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8735200 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtataaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatg 8735299  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || |||||||||||||||| ||| || ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  8735300 tgagtcagtgtggttcttaacttggcgtgtttgggcgtaagtttgagcaccccc 8735353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11719849 - 11719396
Alignment:
Q  4 tcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggtctg 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| || | || |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  11719849 tcaccattatcgcattaatccgaaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattatatttttcggactgcatcagtgtcatggtcggtggtctg 11719750  T
Q  102 caccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttg--actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||||||| |       ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11719749 caccacatgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaacgtgttttaccactttttttttactacatttatgacctcccaaccgtttttgactcacccctccc 11719650  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11719649 tataaatagccttccaaaccccactttttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggattttcatcgttggcc 11719552  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11719551 tttcatagataagggcctcgttgaaa-ctttcagggtttgtatgaacggttaatgaggatggaaccatgctgcaacgaagtgcggttcctctgagggtca 11719453  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || || | |  |||||||| |||||||||||    
T  11719452 tgtgggtcagtgtagttcttagcttggcatgcccggacgtaagtttgagcaccccct 11719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 455
Target Start/End: Original strand, 12723887 - 12724333
Alignment:
Q  9 attattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccaca 108  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||| |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12723887 attatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccgaattatatattctggaatacatcagtcatggccagtggtctacaccaca 12723986  T
Q  109 cgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgc-gttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatat 206  Q
    ||       |||||  ||||| ||||||    |    | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  12723987 cgtttttgtcggtggccaagtaaaaaaataatggcaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccttataaat 12724086  T
Q  207 agttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12724087 agtcttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccatcctttcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatggttggcctttcata 12724184  T
Q  307 gataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggt 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12724185 gataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaataaggatggaaccgcgctgcaatgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggt 12724284  T
Q  407 cagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  12724285 cagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 12724333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16513518 - 16513069
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  16513518 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaggtgtgcattccgtattttatattccgaaaagcatcagtcatggccggtggtctgcat 16513419  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| | |||| ||||||   ||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16513418 cacacgtttttgtcggtgtttaagtaaaaaaaaa-gtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccatttttgacccactcctcccta 16513320  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16513319 taaatagccttccaaaccccacaatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaactatggttttccatcgttggcctt 16513222  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  16513221 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatccgagggtcatg 16513122  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||||||    
T  16513121 tgggtcagtgtgattcttagcttggcctgtctgggtgtaa-tttgagcaccccc 16513069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 26279258 - 26279715
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  26279258 cgttcaccattatcgtattaatccggaaaacgtattccgaaaa-caaaggtgcattccggattttattttccagaatgaatcagtgtcatggccggtggt 26279356  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt--gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc- 195  Q
     ||||||||| |       | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  26279357 ttgcaccacatgtttttgtcagtggtcaagtcaaaaaacgtgttttaccacgtttttttgactatatttatgacctcccaaccgtttttgacccaccccc 26279456  T
Q  196 tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgtt 295  Q
    |||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26279457 tccctataaatagccttctaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgtt 26279554  T
Q  296 ggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagg 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |  |||||| || ||| |||||||||| ||    
T  26279555 ggcctttcatagataatggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaatggtcaatgaggatggaactgcactgcaacgaggtgtggttcatctgggg 26279654  T
Q  396 gtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  26279655 atcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcatcccct 26279715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 13822002 - 13821564
Alignment:
Q  3 ttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgc 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822002 ttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattcaggaaaatagatgtgcattccagattttatattctggaatgcatcagtcatggccggtggtctgc 13821903  T
Q  103 accacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||||       ||||| |||||| ||||||   | |  | | | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13821902 accacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaatatggtaaaacgcattttttgactgtatttatggcctcccaaccgtttttgacccacctctcccta 13821803  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || |||   |||||||| |||||||              ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13821802 taaataaccttccaaaccccaccat--------------cctctcccatcctctcttcctcttcttccttctacaaccatggatttccatcgctggcctt 13821717  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13821716 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctacaatgaagcgcggttcatctgagggtcatg 13821617  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  13821616 tgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcacccc 13821564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 453
Target Start/End: Original strand, 18809188 - 18809627
Alignment:
Q  2 gttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctg 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18809188 gttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattctggaaaacagatgtgcattccagattttatattccggaatgcatcagtcatggtcggtggtctg 18809287  T
Q  102 caccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgt---ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    || ||||||       ||||| |||||| ||||||  |||| ||  |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809288 catcacacgtttttgtcggtggtcaagttaaaaaaa-cgttgtaaaacgcatcttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 18809386  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||  |||||              |||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18809387 ctataaatagccttccaaagcccacc--------------atcctctcccaccctctactcctctttttccttctacaatcatggttttccatcattggc 18809472  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  18809473 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaactgcgctgcaacgaagcacggttcatctgagggtc 18809572  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  18809573 atgtgggtcagtgtggttcttagcttggtctgcctgggcgtaagtttgagcaccc 18809627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 38679364 - 38678941
Alignment:
Q  33 tattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa 132  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||| ||    
T  38679364 tattccggaaaacagatgtgctttctggattatatattctgaaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgtttttgttggtggtcaagtaaa 38679265  T
Q  133 aaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttc 229  Q
    ||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  38679264 aaaaaacgtgataaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaactgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttc 38679165  T
Q  230 tcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactt 329  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  38679164 tcacac--catcctctcccaccctctccttctcttcttccttctacaaccatgattttccatcgttggtctttcatagataagggtctcgttgaaaactt 38679067  T
Q  330 ttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcct 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38679066 tcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaatgaagcgcagttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcct 38678967  T
Q  430 gtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |  ||  |||||||| ||||| ||||    
T  38678966 gcttggacgtaagtttgagcaacccc 38678941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 65 - 455
Target Start/End: Original strand, 8197647 - 8198035
Alignment:
Q  65 tatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcat 163  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||| |||||| |||||||| | |  | | ||||||| ||| | ||    
T  8197647 tatattccggaatgcatcagtcatggccgctggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgacagaat 8197746  T
Q  164 ttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcc 263  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| | ||||   ||||||||||||||| |||||     
T  8197747 ttatggcctcccaatcgtttttgacccacccgtccctataaatagccttccaaaccccaccatttctctcccacc---ctctcccaccctctcctcctct 8197843  T
Q  264 tcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggta 363  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  8197844 tcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgtggatggaa 8197943  T
Q  364 ccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8197944 ccgcgctgcaacgaagtgcggttcatcttagggtcctgtgggtcagtgtggttcttatcttggcatgtctgagcgtaagtttgagcaccccc 8198035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 5 - 424
Target Start/End: Original strand, 37013034 - 37013454
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37013034 caccaatatcgcgttaatccgaaaaatatattccggaaaacagatgtgaattccgaattttatattccggaatgcatcagtcatggctggtggtctgcac 37013133  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| ||||||| |||||  | |  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  37013134 cacacgtttttgtcggtggtcaagtctaaaaaaacttggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaactgttttttacccacccctcccaa 37013233  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37013234 taaatagcctcccaaactccaccatttctcacac--catcttctcccaccctctcttcctcttctttcttctacaaccatggttttccatcgttggtctt 37013331  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  37013332 tcatagataacgacctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggacaatgaggatggaaccgcgctgcaaagaagcgtggttcatctgggggtcatg 37013431  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagctt 424  Q
    ||||  |||||| ||||||||||    
T  37013432 tgggctagtgtgtttcttagctt 37013454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 131 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37030099 - 37029776
Alignment:
Q  131 aaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttc 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  37030099 aaaaaactcgttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccttttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttc 37030000  T
Q  230 tcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactt 329  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37029999 tcacac--catcctctcccaccctctcatcctcttcttccttctacaaccatgatttttcatcgttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaactt 37029902  T
Q  330 ttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcct 429  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||  || | ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  37029901 tcagggtttgtatgaacagtcaatgaggatgtaactgcgctgcaacgaagtgcaattcatctgagggtcatatgggtcagtgtggtttttaccttggcat 37029802  T
Q  430 gtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37029801 gtctgggcgtaagtttgagcaccccc 37029776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 9715224 - 9714775
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  ||||| ||||| |    
T  9715224 cgttcaccattatcgtattaatccggaaaatatattccggaaatcaaaagtgcattccggattttattttccggaatgcattagtgtcatggtcggtgct 9715125  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnn-cggtgatcaa-gtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacc-c 194  Q
     ||||||||| |        ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9715124 ttgcaccacatgttttttgtcggtggtcaaagtcaaaaaacgtgttttaccacgttttttgactacatttatgacctcccaaccgtttttgacccaccac 9715025  T
Q  195 ctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgt 294  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||||| ||          ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9715024 ctccctataaatagccttccaaaccccacaatttctcacat--catcctctcccactct----------tcttccttctataaccatggttttccatcgt 9714937  T
Q  295 tggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgag 394  Q
    ||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  9714936 tggtctttcatagatgtgggcctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgtgctgcaacaaagtgcgggtcatctggg 9714837  T
Q  395 ggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   |||||||| |||||||||||    
T  9714836 ggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggtctgtcttgacgtaagtttgagcaccccct 9714775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 25977049 - 25976614
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  25977049 cgttcaccattatcgtattaatctggaaaatatattccggaaaacaaaggtacattccggattttattttccggactgcatcagtgtcatggccggtggt 25976950  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgt-ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
     ||||||||| |       ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  25976949 ttgcaccacatgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaacgtgttttaccacgtctttttactacatttatgacctcctaaccgtttttgacccaccc-tc 25976851  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    ||| || ||||  |||||||| |||||||              |||||||||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25976850 cctttaaatagccttccaaaccccaccat--------------cctctcccactctct--------tcttccttcaacaaccatggttttccatcgttgg 25976773  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25976772 cttttcatagataagggcctcattgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgggggt 25976673  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25976672 catgtgggtcagtgtggttcttaacttggcatgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 25976614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 221 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 2606047 - 2605862
Alignment:
Q  221 caccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgt 320  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | ||    
T  2606047 caccatttctcacac--catcctctctcattctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgtcctttcatagataaaggtcttgt 2605950  T
Q  321 tgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtca 408  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2605949 tgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtcatatgggtca 2605862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8298883 - 8298729
Alignment:
Q  301 ttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcat 400  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8298883 ttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcat 8298784  T
Q  401 gtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  8298783 gtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctggacgtaagtttgagcaccccc 8298729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8299147 - 8298881
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8299147 caccattatcgcatttatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttctggattatatattcagaaatgcatcagtcatggccggtgatctgcac 8299048  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgt-ttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||| ||       | ||| |||||| |||||| | | |  | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299047 cacgcgtttttgtcagtggtcaagtaaaaaaaagtggtaaaacgcgtattttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 8298948  T
Q  204 tatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttc 272  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8298947 aatagccttccaaaccccaccatttctc--acaccatccgctcccaccctttcctcctcttcttccttc 8298881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 332 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 20337094 - 20336971
Alignment:
Q  332 agggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgt 431  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20337094 agggtttgtatgaacggtcaacgaggatggaaccgcgctgcaataaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgc 20336995  T
Q  432 ctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||  | |||||||  |||||||||    
T  20336994 cttggggtaagttttagcaccccc 20336971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 218 - 410
Target Start/End: Original strand, 27950519 - 27950707
Alignment:
Q  218 ctccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcat 317  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |  ||| |    
T  27950519 ctccaccatttctcacaca--aacatctcccaccctctc---ctcctcttccttctacaaccatgtgtttccatcgttagcctttcataaaaagaggcct 27950613  T
Q  318 cgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatct-gagggtcatgtgggtcagt 410  Q
    | ||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27950614 ctttggaaattttcagggattgtatgaacagtcaatggagatggaaccgcgctgcgaagaagtgcggttcatctggggggtcatgttggtcagt 27950707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27347162 - 27347000
Alignment:
Q  218 ctccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcat 317  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |  ||| |    
T  27347162 ctccaccatttctcacaca--aacatctcccaccctctc---ctcctcttccttctacaaccatgtgtttccatcgttgacctttcatagaaagaggcct 27347068  T
Q  318 cgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggtt 386  Q
    | || |||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  27347067 ctttaaaaattttcagggattgtatgaacggtcaatggggatggaaccgcgctgcaaa-aagtgcggtt 27347000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23342177 - 23342125
Alignment:
Q  339 gtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatct 391  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| ||||    
T  23342177 gtatgaacggtcaatggggatggcaacgcgctgcaaagaagtgtggtttatct 23342125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 50261906 - 50261453
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50261906 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaatcatatgtgcattctagattttatattccggaatgcatcggtcatggccggtggtct 50261807  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||||||        ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50261806 gcaccacacatttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacgcgttttaccacgtttttggactgcatttatgacctcccaaccgtttttgacccacccctcc 50261707  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50261706 ctatacatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttagc 50261609  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  50261608 ttttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatgtaaccgcgctgcaacaaagtgcggttcatct-aaggtc 50261510  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50261509 atgtgggtcagtgtggttcttagcttggcttgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 50261453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 23983950 - 23983500
Alignment:
Q  4 tcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 103  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||| |||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23983950 tcaccattatcgcattaatctggaaaataaattttggaaaacacatgtgcattccagattttatattcttgaatgcatcagtaatggccggtggtctgca 23983851  T
Q  104 ccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    |||||||       ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23983850 ccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaagaaaatgctttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccatttttgacccgcccctcccta 23983751  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23983750 taaatagccttccgaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 23983653  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  23983652 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcagttcatttgagggtcatg 23983553  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    | |||||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23983552 t-ggtcagtgcggttcttagattggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 23983500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 52632275 - 52631825
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52632275 cgttcaccattatcgcattaattcggaaaatatattccggaaaacatatgtgcat-ccggattgtctattccataatgcatcagtcatggccggtggtct 52632177  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa--cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||       ||||| ||| || ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52632176 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaggtaaaaaaaaacgcgttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 52632077  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    ||| || |||   || ||||| |||||| |||||||    |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52632076 cctgtaaataacctttcaaaccccaccagttctcac----catcatctcccaccctctcctccccttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 52631981  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52631980 cctttcatagataaggacctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatagaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggt 52631881  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||    
T  52631880 catgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtttgggcgtaagtttgagcaccc 52631825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 41900205 - 41899755
Alignment:
Q  4 tcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 103  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41900205 tcaccattatcgcattaatccggaaaataaattcttgaaaacacgtgttcattccggattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 41900106  T
Q  104 ccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||| |       || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  41900105 ccacaagtttttgtcgatgatcaagtcaaaaaacgctttttaccacattttttgactgcatttatggcctcccaaccgttttttacccacccctccatat 41900006  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41900005 aaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctcccctcatcttcttccttctgcaaccatggtttttcatcgttggccttt 41899908  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41899907 catagataagggtctcgttgaaaacttccagggtttgtatgaacggtcaatgaggatgaaaccgcgcttcaacgaagtgcggttcatctgagggtcatgt 41899808  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  41899807 gggtcagtgtggttcttagcttgtcctttctgggcgtaagtttaagcaccccc 41899755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 38860900 - 38861350
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     |    
T  38860900 cgttcactattatcgcattaatccggaaaatatactccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggaa---t 38860996  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38860997 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacgcgttttaccacgttttttgactgcatttatgatctcctaaccgtttttgactcacccctcc 38861096  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38861097 ctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcccctcccaccctctcctcctattcttccttctacaacgatggttttccatcgttggc 38861194  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  38861195 ctttcatagataagggcctcgtggaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaactgcgctgcaatgaagtgcggctcatatgagggtc 38861294  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  38861295 atgcgggttagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcacccc 38861350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14587265 - 14586815
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14587265 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccagaaaacagatgtgctttccggattatatattccgtaatgcatcagtcatggccgatggtctgcac 14587166  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||        ||||||||||| |||||| ||   |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14587165 cacacgtttttgttggtgatcaagtaaaaaaaacgtagtaaaacacgttttttgactgcatttatggcctcctaaccatttttgacccacccctccctat 14587066  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  || ||||| |||| |||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14587065 aaatagcctttcaaaccccactatttctaacac--catcctctcccatcctctcttcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 14586968  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14586967 catagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaacgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgt 14586868  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  14586867 gggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctgggcgtaagtttgagcaacccc 14586815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 12528669 - 12529098
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12528669 cgttcactattatcgtattgatctggaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 12528768  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac-gcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12528769 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaatgtgttttaccacgttttttgactgtatttatgacctctcaaccttttttgacccacccctcc 12528868  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12528869 ctataaatagccttccaaaccccaacatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctattcttcttccttctacaaccatggttttccattgttggc 12528966  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaactttt-agggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  12528967 ctttcatagataagggcctcgttgaaaacttttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcgacgaagtgcaattcatctgagggt 12529066  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcct 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12529067 catgtgggtcagtgtggttctcagcttggcct 12529098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 5 - 452
Target Start/End: Original strand, 29961607 - 29962053
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29961607 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaa--gatgtgcattccggattttatattctggaatgcatcagtcatggccagtggtttgcac 29961704  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg----tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccct 200  Q
    ||||||       ||||| ||| |||||||||   ||  ||  |||    ||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  29961705 cacacgtttttgtcggtggtcaggtcaaaaaaat-gtggtaaaacgcatttttttaactgcatttatggccttccagctgtttttgacctacccctccct 29961803  T
Q  201 atatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcct 300  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29961804 ataaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctccaaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcct 29961901  T
Q  301 ttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcat 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29961902 ttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgctacaacgaagtgtggttcatctgagggtcat 29962001  T
Q  401 gtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| |||||||    
T  29962002 gtgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtatgggcgtaagtttgagcacc 29962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 455
Target Start/End: Original strand, 44496698 - 44497143
Alignment:
Q  8 cattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccac 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44496698 cattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacatatgtgaattccggattgtatattccggaatgtatcagtcatggccggtggtctgcaccac 44496797  T
Q  108 acgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatat 206  Q
    |||       ||||| ||||||| ||||| || | |  |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44496798 acgtttttgtcggtggtcaagtctaaaaatcgtggtaaaatgcgtttttgactgcatttatggcatcccaaccgtttttgacccacccctccctataaat 44496897  T
Q  207 agttttccaaactcc-accatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcat 305  Q
    ||  ||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||    
T  44496898 agccttcgaaacccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttctttcttctacaaccatggtttttcatcgttggtct--cat 44496993  T
Q  306 agataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtggg 405  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44496994 agataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtggg 44497093  T
Q  406 tcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  44497094 tcagtatggttcttagcttggcctgtctggacgtaagtttgagcaccccc 44497143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 41086623 - 41087075
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41086623 cgttcaccattatcgcattaatccaggaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccgaaatgcatcagttatggctggtggtct 41086722  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       || || ||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||    
T  41086723 gcaccacacgtttttgtcgttggtcaggtaaaaaaaacgctttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcctaaacatttttcacccacccatcc 41086822  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41086823 ctata-atagtcttcccaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggc 41086919  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41086920 ctttcatagataatgacctctttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgct-catcgaagtgaggttcatctgagggtc 41087018  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41087019 atgtgggtcagagtggttcttagcttcacctgtctggacgtaagtttgagcaccccc 41087075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 41091391 - 41091843
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41091391 cgttcaccattatcgcattaatccaggaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccgaaatgcatcagttatggctggtggtct 41091490  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       || || ||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| |||    
T  41091491 gcaccacacgtttttgtcgttggtcaggtaaaaaaaacgctttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcctaaacatttttcacccacccatcc 41091590  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41091591 ctata-atagtcttcccaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggc 41091687  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41091688 ctttcatagataatgacctctttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgct-catcgaagtgaggttcatctgagggtc 41091786  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  41091787 atgtgggtcagagtggttcttagcttcacctgtctggacgtaagtttgagcaccccc 41091843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 65 - 455
Target Start/End: Original strand, 33801601 - 33801990
Alignment:
Q  65 tatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgca 162  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| |||||| |||||| || | |  | | ||||||| |||||||    
T  33801601 tatattccggaaggcatcagtcatggtcggtggtctgcaccacacgtttttg-cggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgca 33801699  T
Q  163 tttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctc 262  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  33801700 tttatggcctcccagccgtttttgacccacccctccctataaataccttcccaaaccccaccatttcttacac--catcctctcccaccctctcttcctc 33801797  T
Q  263 ctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggt 362  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33801798 ttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaataaggatgga 33801897  T
Q  363 accgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33801898 accgcgctgcaacgaagcgcggttcatctaagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgagcgtaagtttgagcaccccc 33801990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 456
Target Start/End: Original strand, 27217022 - 27217481
Alignment:
Q  2 gttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggtc 99  Q
    |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| | |||||| | || ||||||||||| ||| |||| || |||||||||  |||||||| ||||     
T  27217022 gttcaccagtatcgtattaatccggaaaatatattctggaaaacaaaggtacattccagattatattttccggactgcatcagtatcatggccgatggtt 27217121  T
Q  100 tgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttga-ctgcatttat--ggcctcccaaccgtttttgacccacccct 196  Q
    ||||||||| |       ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27217122 tgcaccacatgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaacgtgttttaccacgttttttaactacatttatatgacctcccagccgtttttgacccaccc-t 27217220  T
Q  197 ccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaac---catggttttccatcg 293  Q
    ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  27217221 ccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaacgtccatggttttccatcg 27217318  T
Q  294 ttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctga 393  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  27217319 ttggcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttaagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaaaaaagtgcggttcatctgg 27217418  T
Q  394 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  || |||||| |||||||||||    
T  27217419 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctaggcataagtttgagcaccccct 27217481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 12700450 - 12700031
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||   |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||       ||||| |||||| |||||    
T  12700450 tccggaaaacagatgtgctttccggattatatattttggaatacatcagtcatggctggaggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaa 12700351  T
Q  136 acgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctca 232  Q
    |   ||  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||    
T  12700350 aaa-gtggtaaaacgagttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttttca 12700252  T
Q  233 cacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactttta 332  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  12700251 cac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtctttcatagataagggtctcgttgaaaactttca 12700154  T
Q  333 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |    
T  12700153 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgatgcaacgaagcgcggttcatttgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggtctacc 12700054  T
Q  433 tgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  12700053 tgggcgtaagtttgagcaccccc 12700031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3517487 - 3517072
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||| |||||| |||||    
T  3517487 tccggaaaacagatgtgctttctggattatatattccggaatgcatcagtcatgaccggtggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaa 3517388  T
Q  136 acgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcaca 234  Q
    ||| | |  | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  3517387 acgtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccac---tctctataaatagccttccaaaccccaccatttctcaca 3517291  T
Q  235 caccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagg 334  Q
    |  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3517290 c--catcctctcccaccctctccccctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgacctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagg 3517193  T
Q  335 gtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctg 434  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||| |||  |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3517192 gtttgtattaacggtcaatgaggatggaaccacgctgcaacgaaacgcggtttatctgagggttacgtgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctg 3517093  T
Q  435 agcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
     ||||||||| ||||| ||||    
T  3517092 ggcgtaagtttgagcatcccc 3517072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 151 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 44755191 - 44754886
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaact---ccaccatttctcacacaccatcctctcc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44755191 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccttataaatagccttccaaattaccccaccatttctcacac--catcctctcc 44755094  T
Q  248 caccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacg 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44755093 caccctctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcttttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacg 44754994  T
Q  348 gtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcga 447  Q
    |||||||||||||| || | ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||    
T  44754993 gtcaatgaggatggaactgcgctgcaacgaagcgcggttcatctaagggtcatgtaggtcagtgtggttcttagcttggtctgtctgagcataagtttga 44754894  T
Q  448 gcaccccc 455  Q
    | ||||||    
T  44754893 gtaccccc 44754886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Original strand, 49851932 - 49852384
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt-catggccggtggtc 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||     
T  49851932 cgttcaccattattgtattaatccgaaaaatatattccgaaaaacaaaggtacattctggattttattttgcggaatgcatcagttcatggccggtggtt 49852031  T
Q  100 tgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc-tc 197  Q
    ||||||||| |       ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  49852032 tgcaccacatgtttttgtcggtggtcaagtcaaaat--gtgttttaccacgtttttttactacatttatgaactcccaaccgtttttgactcaccccctc 49852129  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    |||||| |||   |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  49852130 cctataaataaccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctccttctcttcttccttctacaaccatggtttttcaacgttgc 49852227  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  49852228 cctttcatagataagggtctcattgaaaactttcagggattgtatgaacggtcactaaggatggaaccgcgctgcaatgaagtgcggttcatttgggggt 49852327  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||| | ||||||| |||||||||    
T  49852328 catgtgggtcagtgtggttcttaacttggtctatctgggtgtaagtttgagcacccc 49852384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 42882518 - 42882129
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  42882518 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaggtgtccatttcggattttattttccggaatgcatcagtcatggtcagtggtctgcat 42882419  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtca-aaaaacgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||||||       ||||| |||||| | ||||||| |||||         |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42882418 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaagaaaaacgtgtttt---------ttgactgtgtttatggcctcccagccgtttttgacccaccactccctata 42882328  T
Q  204 tatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttc 303  Q
     ||||  || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42882327 aatagcatttcaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctattcttccttctacaaccatggtcttccatcattggcctttc 42882230  T
Q  304 atagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtg 403  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42882229 atagataatggccttgttgaaaactttatgggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatccgagggtcatgtg 42882130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 151 - 455
Target Start/End: Original strand, 41723847 - 41724137
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccac 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||              ||||||||||||    
T  41723847 tttttgactgcatttatggtctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagtcttccaaaccccacc--------------atcctctcccac 41723932  T
Q  251 cctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtc 350  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41723933 cctctcctcctcttcttcctactacaaccatggttttccatcgttggcctttcttagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtc 41724032  T
Q  351 aatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagca 450  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  41724033 aatgaggatggaaccgcactgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtggatcggtgtgattcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagca 41724132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Original strand, 22858924 - 22859329
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||| |||||    
T  22858924 tccggaaaacagatgtgcattccggattgtatattccggaatgcactagtcatggccggtggtctgcaccacacattttcgtcggtggtcaagtaaaaaa 22859023  T
Q  136 acgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctca 232  Q
    |  |||  ||  |||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||               |||||||  |||||||||||||    
T  22859024 aa-cgtggtaaaacgcatttttttactgcatttatggcctcccaaccatttttgacccaccccc--------------ttccaaatcccaccatttctca 22859108  T
Q  233 cacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactttta 332  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  22859109 ca--ccatcctctcccactctctcctcctcttcttccttctacaatcatggtttttcatcgttggcgtttcatagataagggtctcgttgaaaactttca 22859206  T
Q  333 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22859207 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgttacaacgaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtc 22859306  T
Q  433 tgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||  |||||| | ||||||||||    
T  22859307 tggtcgtaagcttgagcaccccc 22859329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 48964830 - 48964595
Alignment:
Q  66 atattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatt 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||| |||||| |||||||| | |  | | | ||||| |||||||||    
T  48964830 atattccagaatgcatcagtcatggtcggtggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaacgtggtaaaacgcattttttgactgcatt 48964731  T
Q  165 tatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  48964730 tatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctc--acaccatcctctcccaccctctcctcctctt 48964633  T
Q  265 cttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48964632 cttctttctacaaccatggatttccatcgttggccttt 48964595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 455
Target Start/End: Original strand, 37952710 - 37952870
Alignment:
Q  295 tggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgag 394  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  37952710 tggcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacaatcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaaacgcggttcatctaag 37952809  T
Q  395 ggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  37952810 ggtcgtgtgggtcagtgtggttcttagcttgccctgtctgggcgtaagtttgaccaccccc 37952870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 301 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 48963967 - 48963813
Alignment:
Q  301 ttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcat 400  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  | |||||| ||||||||||    
T  48963967 ttcatagataaaggtctcgtttaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcacagttcatttgagggtcat 48963868  T
Q  401 gtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| || ||||||||||    
T  48963867 gtgggtcagtgtggttcttagcttgacctgtttgggcgtaaatttgagcaccccc 48963813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 37952510 - 37952707
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37952510 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccggattatatattttggaatgcatcagtcatggtcggtggtctgcac 37952609  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||||||        ||||  ||||| |||||| | | |  | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37952610 cacacgtttttgttggtg-gcaagt-aaaaaaagtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 37952707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 110
Target Start/End: Original strand, 41723740 - 41723845
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723740 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccggattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 41723839  T
Q  105 cacacg 110  Q
    ||||||    
T  41723840 cacacg 41723845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11952314 - 11952166
Alignment:
Q  22 tccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggt 121  Q
    |||| |||| |||||||| |||||| | || ||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||    
T  11952314 tccggaaaacatattccggaaaacaaaggtacattccgaattttattttccaggttgcatcagtcatggccggtggtctgcacaacacatttttgtcagt 11952215  T
Q  122 gatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatg 168  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  11952214 ggtcaagtcaagaaaacgcgttttaccacgttttttgactacatttatg 11952166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6603685 - 6603613
Alignment:
Q  233 cacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6603685 cacaccattctctctcaccctctc---ctccttttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttttataga 6603613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7562705 - 7562618
Alignment:
Q  220 ccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttc-cttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||| ||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7562705 ccaccatttctcacaca--aacctctcccaccgtctcctcctcttctcctcttctacaacgatgtgtttccatcgttggcctttcataga 7562618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 358
Target Start/End: Original strand, 43253151 - 43253289
Alignment:
Q  218 ctccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttc-tacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggca 316  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| ||||| || | || | ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| |   ||     
T  43253151 ctccaccatttctcacacaac---ctctcccaccctctcctcctcttccttctacgtacaaccatgtgtttccatcgttgaactttcatagaaagatgcc 43253247  T
Q  317 tcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgagga 358  Q
    || ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  43253248 tctttgaaaattttcagggactgtatgaacgatcaatgagga 43253289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44757482 - 44757430
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattc 57  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  44757482 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccagaaatcagatgtgcattc 44757430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Original strand, 50891057 - 50891105
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  50891057 ctcctcttccttctacaacgatgtgttttcatcgttggcctttcataga 50891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 386
Target Start/End: Original strand, 34551273 - 34551327
Alignment:
Q  332 agggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggtt 386  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||    
T  34551273 agggattgtatgaacggtcaatgaggatggcaacgcactgcaaagaagtgtggtt 34551327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30516431 - 30516386
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcat 305  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||    
T  30516431 ctcctcttccttctacaacaatgtgtttccatcgttggtctttcat 30516386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33801696 - 33801668
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33801696 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 33801668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 34551198 - 34551246
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| || |||||||||||||||    
T  34551198 tcctcctcttccttctacaacaatgtgttttcaccgttggcctttcata 34551246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25529041 - 25528587
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25529041 cgttcaccattatcgcatgaatccggaaaatgtattccggaaaacagatgtgcattctagattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 25528942  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac-gcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||||| |       ||||| ||| |||||||||  |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25528941 gcaccacatgtttttgtcggtggtcaggtcaaaaaaatgcgttttatcatgttttttgactgcatttatggcctcacaaccgtttttgacccacccctcc 25528842  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25528841 ctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctattcttccttctacaaccatggttttccatcattggc 25528744  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25528743 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggttaatgaggacggaaccgcgctgcaacgaagtgcagttcatctgagggtc 25528644  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  25528643 atgtgggtcagtgtgattcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 25528587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 33951143 - 33951593
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33951143 caccattatctcattaatccgaaaaatatattccagaaaacagatgtgctttccagattatatattccggaatgcatcagtcatgaccggtggtctgcac 33951242  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33951243 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaa-cgtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgttgttgacccacccatcccta 33951341  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33951342 taaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctactcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtctt 33951439  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33951440 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctacaacgaagcgcagttcatctgagggtcatg 33951539  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  33951540 tgggtcagtgtggttcttagcttgacctgtctgggtgtaagtttgagcaccccc 33951593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14816588 - 14816136
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14816588 cgttcaccattatcgcattaatccgaaaaacatattccgaaaaacaaatgtgtttaccagattttatattccgaaatgtatcagtcatgaccggtggtct 14816489  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||| ||||||       ||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14816488 gcaacacacgtttttgtcggtggtcgggtcaaaaaatgtgttttaccacgttttttgactgcatttatggtctcccaaccgtttttgacccaccc-tccc 14816390  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14816389 tatacatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccattgttagcc 14816292  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14816291 tttcatagataagggcctcgtggaaaactttcagggtttatatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcttctaagggtca 14816192  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  14816191 tgtgggtcagtgtagttcttaacttggcctgtttgggtgtaagtttgagcaccccc 14816136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15263584 - 15263132
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||    
T  15263584 cgttcaccattatcgcattaatccgaaaaacatattccgaaaaacaaatgtgtttaccagattttatattccgaaatgtatcagtcatgaccggtggtct 15263485  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||| ||||||       ||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15263484 gcaacacacgtttttgtcggtggtcgggtcaaaaaatgtgttttaccacgttttttgactgcatttatggtctcccaaccgtttttgacccaccc-tccc 15263386  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15263385 tatacatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccattgttagcc 15263288  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  15263287 tttcatagataagggcctcgtggaaaactttcagggtttatatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcttctaagggtca 15263188  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || | ||||||| ||||||||||    
T  15263187 tgtgggtcagtgtagttcttaacttggcctgtttgggtgtaagtttgagcaccccc 15263132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 27 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 34847730 - 34847302
Alignment:
Q  27 aaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatca 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||    
T  34847730 aaaatatattccgaaaaacagatgtgttttccggattatatattctggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtca 34847631  T
Q  127 agtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccacc 224  Q
    ||| |||||| |  | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  34847630 agtaaaaaaaacatggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaactgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccacc 34847531  T
Q  225 atttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaa 324  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34847530 atttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttctttcttctacaaccatagttttccatcgttggcctttcatagataagggcctcgttgaa 34847433  T
Q  325 aacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagctt 424  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34847432 aactttcaggatttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaatgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtaagtgtggttcttagctt 34847333  T
Q  425 agcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34847332 ggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 34847302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 46255071 - 46255515
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46255071 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccgaattttatattccggaatgcatcagtcatggtcggtggtct 46255170  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    |||||||||        ||||| |||||| |||||||| | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46255171 gcaccacacatttttgtcggtggtcaagtaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 46255270  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| |||   |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46255271 tataaataaccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcatcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 46255368  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||| |||| |||||||||||||          
T  46255369 tttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggttaatgaggatggaaccacgcttcaacgaagcgcggttcatctga------ 46255462  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  46255463 ---gggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 46255515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 44866259 - 44866697
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44866259 caccattatcgcattaatctggaaaatatattccagaaaacaggtgtgcattccggattttaaattccagaatgcatcagtcatggtcggtggtctgcat 44866358  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       || ||||||||| |||||||  ||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  44866359 cacacgtttttgtcgttgatcaagt-aaaaaacatgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctccgaaccatttttgacccaccccttccta 44866457  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  || ||||| |||||              |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44866458 taaatagcctttcaaaccccacc--------------atcctctcccaccctctcctcctattcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 44866543  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  44866544 tcatagataaggacctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgctacgaagtgcggttcatctgagggtcatg 44866643  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  44866644 tgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctggacgtaagtttgagcaccccc 44866697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 36312014 - 36311559
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  36312014 cgttcaccattatcgcattaatccgaaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccgaaatgcatcagtcatagccgctggtct 36311915  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacg--cgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc 195  Q
     |||| |||          ||| |||||| ||||||    |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36311914 acaccgcacatttttgtaagtggtcaagtaaaaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttg-cccatccc 36311816  T
Q  196 tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgtt 295  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  36311815 tccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacgaccatggtttcccatcgtt 36311718  T
Q  296 ggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagg 395  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  || | ||||||| |||| ||||||||||||| |    
T  36311717 ggcctttcatagataaaggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggttaatgaggatgaaactgcgctgcaacgaagcgcggttcatctga-g 36311619  T
Q  396 gtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  36311618 gtcatgtggatcagtgtggttcttagcttgacctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 36311559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 455
Target Start/End: Original strand, 35794705 - 35795115
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaa 135  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||    
T  35794705 tccggaaaacatatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccagtggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaa 35794804  T
Q  136 acgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctca 232  Q
    |   ||  ||  |||   |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||    
T  35794805 aat-gtgataaaacgcattttttgactgcacttatggcctcccaactgtttttgatccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctca 35794903  T
Q  233 cacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactttta 332  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  35794904 ca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggtctcgttgaaaattttca 35795001  T
Q  333 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtc 432  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| ||||         ||||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  35795002 aggtttgtatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgttgcaacgaagtacggttcacctga---------gggtcagtgtgattcttagcttggcctatc 35795092  T
Q  433 tgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || ||||||||| ||||||||||    
T  35795093 tgggcgtaagtttgagcaccccc 35795115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 43458388 - 43458679
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  43458388 cgttcaccattatcgcattaatccgcaaaatatatttcagaaaacagatgagcattccggattttatattccataatgcatcagtcatggtcggtggtct 43458487  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||| |||       ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43458488 gcaccatacgtttttgtcggtagtcaagtaaaaaaaacgcgttttaccacgtttttttactgcatttatgacctcccaaccgttttagacccacccctcc 43458587  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatc 292  Q
    ||||| ||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43458588 ctataaatagccttccaaagcccaccatttct--cacaccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatagttttccatc 43458679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 315 - 455
Target Start/End: Original strand, 43458676 - 43458816
Alignment:
Q  315 catcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtgg 414  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43458676 catcattgaaaactttcagggtttgtatgaacggtaaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaggtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtgg 43458775  T
Q  415 ttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  43458776 ttcttagcttagcctgtctgggtgtaagtttgagcaccccc 43458816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34847800 - 34847734
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattc 71  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  34847800 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaaacagatgtgttttccggattatatattc 34847734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31267888 - 31267714
Alignment:
Q  212 tccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaacca---tggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    |||||||  |||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |   || |||| |||| |||| | ||||||||    
T  31267888 tccaaacctcaccatttctcacac--catcatctcacattctctcctcctcctcttccttctacaacaacaatgttttttcatccttggacattcataga 31267791  T
Q  309 taagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggtt 386  Q
     |  ||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  31267790 aagaggcctctttgaaaa-tttcagggattgtatgaacggtcaatggtgatggcaacgcactgcaaagaagtgcggtt 31267714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 18501700 - 18501748
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18501700 tcctcctcttccttctacaaaaatgtgtttccatcgttggtctttcata 18501748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Original strand, 36311851 - 36311879
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36311851 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 36311879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 46255230 - 46255202
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46255230 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 46255202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 20092084 - 20092535
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20092084 cgtttaccattatcgcattaatccggaaaatatatttcggaaaacagatgtgcgtttcggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 20092183  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||| ||||       ||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20092184 gcaccccacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacacattttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgaccaacccctcc 20092283  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20092284 ctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacaca--atcctctcccaccctctc---ctcttcttccgtctacaaccatggttttccatcgttggc 20092378  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20092379 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtc 20092478  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  | |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  20092479 atgtgggtaagtgtggttcttagcttgtcatgtccgggcgtaagtttgagcaccccc 20092535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 11076438 - 11076889
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11076438 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattccggaacacaggtgtgcatttcggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcat 11076537  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       || || |||||| ||||||  |||  ||  |||   ||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11076538 cacacgtttttgtcgatggtcaagtaaaaaaaaacgtggtaaaacgcgtttttttactacatttattgcctcccaactgtttttgacccacccctcccta 11076637  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  ||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11076638 taaatagccttccaaacctcaccatttttcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggcctt 11076735  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11076736 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggccaatgaggatggaaccgtgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtcatg 11076835  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11076836 tgggtcagtgtggttcttaacttggcctgtctgagcgtaagtttgagcaccccc 11076889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43098459 - 43098005
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||   | |||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43098459 cgtttaccattatcgcattaatccggaaaatatattctagacaacatatgtgctttccggattttatcttccggaatgcatcagtcatggccggtggtct 43098360  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt-caaaaaacgcgttttaccac-gtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43098359 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtgttttaccacattttttgactgcatttatggcttcccaaccgtctttgacccacccctcc 43098260  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  43098259 ctatagatagccttccaaaccccaccatttct--cacaccatcctctcccaccctctcctcatcttcttccttctacaaccatgattttccatcgtttgc 43098162  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43098161 ctttcatagataagggtctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacgatcaatgaggatggaactgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtc 43098062  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||| ||||||||||    
T  43098061 atgtgggtcagtgtggttcttagcttgacctttttgggcgtaagtttgagcaccccc 43098005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39318523 - 39318075
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39318523 caccattatcgcattaatccgaaaaatattttctggaaaacaggtgggcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcat 39318424  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    |||| |       ||||| |||||| |||||||| | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39318423 cacaagtttttgtcggtgttcaagtaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaacagtttttgacccacccctcc-tata 39318325  T
Q  204 tatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttc 303  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  39318324 aatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaacaatggtttttcatcgttggcctttc 39318227  T
Q  304 atagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtg 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  39318226 atagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggacggaaccgcgctgcaacaaaatgcggttcatctgagagtcatgtg 39318127  T
Q  404 ggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39318126 ggtcagtgtggttcttagcttgacctgtctggacgtaagtttgagcaccccc 39318075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 42131828 - 42131381
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42131828 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattctggaaaacagatgtgctttccggattatatattccagaatgcatcagtcatggctggtggtctgcac 42131729  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    || ||        ||||| |||||| |||||| || | |  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42131728 catacatttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaacacattttttgactgcatttatggcctcccaaacatttttgacccacccctccctat 42131629  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42131628 aaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccc---catcatcttcttccttctacaaccatggttttccaccgttggccttt 42131534  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||  ||||||||||||||||||| |    
T  42131533 catagataagtgcatcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacggagcacggttcatctgagggtcatat 42131434  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42131433 ggatcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 42131381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 8239916 - 8239466
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8239916 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaataggtgtgcattccggattttatattttggaatgcatcagtcatgcccggtggtctgcat 8239817  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    |||||        ||||| |||||| |||||| || | |  |  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  8239816 cacacttttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaatacgttttttgactgcatttatggcctccgaaccgtttttgacccacccctccctgt 8239717  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  |||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8239716 aaatagccttccaaaccccacaatttctcacac--cattctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcattggccttt 8239619  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8239618 catagataagggtctcattgaaaactttaagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcctctaagggtcatgt 8239519  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8239518 gggtcaatgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 8239466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 39260222 - 39259781
Alignment:
Q  3 ttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39260222 ttcaccattattgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgcatcccggattttatattccggaatgcattagtcatggctggtggtctgc 39260123  T
Q  103 accacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||||       ||||| |||||| |||||| || | |  | | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39260122 accacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaacgcatttttgactgcatttatagcctcccaaccgtttttgacccacctctcctta 39260023  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||| || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39260022 taaatagtctttcaaaccccaccatttctcacac--catcctctcc----------tcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtctt 39259935  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  39259934 tcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatttgagggtcatg 39259835  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  39259834 tgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggtgtaagtttgagcaccccc 39259781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 8 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 35683940 - 35683493
Alignment:
Q  8 cattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccac 107  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35683940 cattatcgcattaatccggaaaatatattccataaagcaggtgtgcattccggattttatattccgggatgcatcagtcatgggcggtggtctgcatcac 35683841  T
Q  108 acgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatat 204  Q
    |||       ||||| |||||| ||||||  | |  ||  |||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||     
T  35683840 acgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaa-catggtaaaacgcattttttgaccgcatttatggcctcccagccgtttttgactcacccctccttataa 35683742  T
Q  205 atagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttca 304  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35683741 atagccttccaaaccccaccatttctcacata--atcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcttttca 35683644  T
Q  305 tagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgg 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35683643 tagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaatcgcgctgcaacgaagtgtggttcatctgagggtcctgtgg 35683544  T
Q  405 gtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  35683543 gtcagtgtggttcttaccttggcctgtctaggcgtaagtttgagcaccccc 35683493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13546173 - 13545732
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| || ||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13546173 cgttcaccattatcgcattaattcggaaaatatatttcggaaaattgatttgcattccggattttatattccggaatgcattagtcatggctggtggtct 13546074  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||| ||||||       ||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13546073 gcatcacacgtttttgtcggtggtcaggtcaaaaaatgcattttaccatgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgactcacccctccc 13545974  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  ||| |||| |||||||              |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13545973 tataaatagccttctaaaccccaccat--------------cctctcccacactctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgtaggtc 13545888  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13545887 tttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggttaatgatgatggaaccgcgttgcaacgaagtgcagttcatctgagggtca 13545788  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13545787 tgtgggtcagtgtggttcttagcttgacctgtttgggcgtaagtttgagcaccccc 13545732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 13678300 - 13678741
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| || ||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13678300 cgttcaccattatcgcattaattcggaaaatatatttcggaaaattgatttgcattccggattttatattccggaatgcattagtcatggctggtggtct 13678399  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||| ||||||       ||||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13678400 gcatcacacgtttttgtcggtggtcaggtcaaaaaatgcattttaccatgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgactcacccctccc 13678499  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  ||| |||| |||||              |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13678500 tataaatagccttctaaaccccacc--------------atcctctcccacactctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgtaggtc 13678585  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13678586 tttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggttaatgatgatggaaccgcgttgcaacgaagtgcagttcatctgagggtca 13678685  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  13678686 tgtgggtcagtgtggttcttagcttgacctgtttgggcgtaagtttgagcaccccc 13678741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 32947230 - 32947628
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||    
T  32947230 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattctggaatgcatcagttatggccagtggtct 32947329  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||||||||| || | |  | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32947330 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 32947429  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||     
T  32947430 ctataaatagccttccaaaccccaccatttatcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttctaccttctacaactgtggttttccatcgttggt 32947527  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32947528 ctttcatatataaggatctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaaaatggaaccgcgctgcaatgaagtgcggttcatatgagggtc 32947627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40105177 - 40104728
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  40105177 caccattatcgcattgatccggaaaatatattctagaaaacaggtgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggtcggtggtcagcat 40105078  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttt-ttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||||||       ||||| ||| || |||||| | | |  | | | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40105077 cacacgtttttgtcggtggtcaggtaaaaaaaagtggtaaaacgcatttgttcactgcatttatagcctcccaaccatttttgacccacccatccctata 40104978  T
Q  204 tatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttc 303  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40104977 aatagccttccaaaccccaccatttctcacact--atcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttc 40104880  T
Q  304 atagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtg 403  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||    
T  40104879 atagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacgttcaatgaggatggaaacgtactgcaacgaaatgtggttcatctgaaggtcatgtg 40104780  T
Q  404 ggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
     ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  40104779 agtcagtgtggttcttagcttgacatgtatgagcgtaagtttgagcatcccc 40104728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 455
Target Start/End: Original strand, 6347520 - 6347971
Alignment:
Q  2 gttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatca--gtcatggccggtggtc 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  6347520 gttcaccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacaaaggtgcatttcagattttattttctggaatgcaacaatgtcatggccagtggtc 6347619  T
Q  100 tgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtca--aaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccct 196  Q
    ||||||||||        || || ||| || |  ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||     |||||    
T  6347620 tgcaccacacatttttgtcgatggtcaggtaataaaaaacgtgttttatcacgttttttgactgcatttatggtctcccaaccgtttttg-----cccct 6347714  T
Q  197 ccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttg 296  Q
    ||||||| |||   |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  6347715 ccctataaataaccttccaaaccccacaatttctcaca--ccatcctctctcaccctctcctcctcttcttccttctaaaaccatcgtttttcatcgttg 6347812  T
Q  297 gcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgaggg 396  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6347813 gcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgtggatggaacagtgctgcaacgaagtgcggttcatctgaggg 6347912  T
Q  397 tcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  6347913 tcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctatctgggcgtaagtttcagcaccccc 6347971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 32338034 - 32338490
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||    
T  32338034 cgttcaccattatcgtattaatccggaaaatatattccggaaaacaaaggtgcattccggattttattttctggaatgcatcagtgtcatggc-ggtggt 32338132  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgtttt--accacg--tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccaccc 194  Q
     ||||||||| |       | |||  |||||||||||||| |  |   |||| |  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32338133 ttgcaccacatgtttttgtcagtgggcaagtcaaaaaacgtggatggaaccatggttttttgactacatttatgacctcctaaccgtttttgacccaccc 32338232  T
Q  195 -ctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcg 293  Q
     ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32338233 tctccctataaatagtcttccaaatcccaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcctcttctttcttctacaaccatggttttccatcg 32338330  T
Q  294 ttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctga 393  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||||||||| ||     
T  32338331 ttggtctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacga---gcggttcatttgg 32338427  T
Q  394 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||| |||||||||||    
T  32338428 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggtttgtctgggcataagtttgagcaccccct 32338490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31700961 - 31700524
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31700961 cgttcatcattatcgcattaatccagaaaatagattccggaaatctgatgtgcgttccagattttatattgttgaatgtatcagtcatggccggtagtct 31700862  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||||||||||       ||||| |||||||||||     |||||||||| |||||  || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  31700861 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaa-----gttttaccacatttttataccgcatttatggcctat-aaccgtttttgacccacccctccc 31700768  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31700767 tataaatagccttccaagccccaccatttctcacac--catcctctcc----------tcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcattggtc 31700680  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  31700679 tttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtgtgaacggacaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatcttagggtca 31700580  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  31700579 tgtgggtcagtgcagttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccccc 31700524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 68 - 404
Target Start/End: Original strand, 37098604 - 37098940
Alignment:
Q  68 attccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaa-aaacgcgttttaccacgttttt-gactgcattt 165  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       || |  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  37098604 attccataatgcatcagtcatggccgttggtctgcaccacacggttttgtcgatagtcaagtcaaataaatgcgttttaccacattttttgactgcattt 37098703  T
Q  166 atggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctc 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||| ||    
T  37098704 atggcatcccaaccgtttttgacccacctctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccagcctcccctcctcttc 37098801  T
Q  266 ttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtacc 365  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  37098802 ttccttctacaatcatggttttccatcgttgacctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaact 37098901  T
Q  366 gtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgg 404  Q
    | | | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37098902 gcgttacaacgaagtgcggttcatctgaaggtcatgtgg 37098940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 586325 - 585873
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |  | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||  |    
T  586325 cgttcatcattatcgtattaatccggaaaatatattccagaaaacaaagctacattccggattttattttccggaatgcatcagtgtcatggctggttct 586226  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc-- 195  Q
     || |||||| |       ||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  586225 ttgtaccacatgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaactaattttaccacgctttttgactacaattatgatctcccaaccgtttttgacccaccccct 586126  T
Q  196 --tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcg 293  Q
      ||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  586125 cctccctgtaaatacccttccaaaccccaccgtttctcacac--catcctctcccatcctct--------tcttccttctacaaccatggttttccatcg 586036  T
Q  294 ttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctga 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  586035 ttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacgatcaatgaggatgaaaccgcactgcaacgaagtgcggttcatctaa 585936  T
Q  394 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  585935 gggtcatgtaggtcaatgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 585873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Original strand, 627598 - 628050
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    |||||| |||||| | |||||| || ||||||||||||  |||||| |  | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||||  |||  |    
T  627598 cgttcatcattatcgtattaattcggaaaatatattcctgaaaacaaagctacattccggattttattttccggaatgcatcagtgtcatggttggttct 627697  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc-- 195  Q
     || |||||| |       ||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||      
T  627698 ttgtaccacatgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaactaattttaccacgctttttgactacaattatgatctcccaaccgtttttgacccaccccct 627797  T
Q  196 --tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcg 293  Q
      ||||| || |||   |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  627798 cctccctgtaaatacccttccaaaccccaccgtttctcacac--catcctctcccatcctct--------tcttccttctacaaccatggttttccatcg 627887  T
Q  294 ttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctga 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  627888 ttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacgatcaatgaggatgaaaccgcactgcaacgaagtgcggttcatctaa 627987  T
Q  394 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  627988 gggtcatgtaggtcaatgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 628050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 298 - 456
Target Start/End: Original strand, 28249245 - 28249403
Alignment:
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  28249245 cctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgtggatggaaccgtgctgcaacgaagtgcggttcatctaggggt 28249344  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28249345 cgtgtgggtcagtgtggttcttaacttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 28249403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 23143816 - 23143609
Alignment:
Q  245 tcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatga 344  Q
    |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23143816 tcccaccctctcctcgttttcttccttctacaaccatgattttccatcgtgggcctttcatagataaggatctcgttgaaaactttcagggtttgtatga 23143717  T
Q  345 acggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagtt 444  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||| | |||||||    
T  23143716 acgggcaatgagaatggaaccgcgctgcagcaaagtgcggttcatctaggggttatgtgggtcagtgtgattcctaacttggcctgtctgggtgtaagtt 23143617  T
Q  445 cgagcacc 452  Q
     |||||||    
T  23143616 tgagcacc 23143609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23144035 - 23143826
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||| || ||| | |  |||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23144035 cgttcaccattatcgtatttatccggaaaatatattccggaacacaaaggcacattccggattttatattttggaacgcatcagtcatggccggtggtct 23143936  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccac-gtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| |||||| || ||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23143935 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagttaagaaaacacattttaccacattttttaactgcatttatgacctcccaaccgtttctgacccacccctcc 23143836  T
Q  199 ctatatatag 208  Q
    ||||| ||||    
T  23143835 ctataaatag 23143826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 382
Target Start/End: Original strand, 28286366 - 28286485
Alignment:
Q  261 tcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatg 360  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||| | |  |||  | ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28286366 tcctcttccttctacaacaatgtgattccatcgttggtctttcataaaaagaggctactttggaaactt--agggattgtatgaacggtcaataaggatg 28286463  T
Q  361 gtaccgtgctgcaaagaagtgc 382  Q
    | | || |||||||||||||||    
T  28286464 gcaacgcgctgcaaagaagtgc 28286485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 37098557 - 37098605
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagat 49  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  37098557 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatatttcggaaaacagat 37098605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 16795439 - 16795389
Alignment:
Q  329 tttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaag 379  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||    
T  16795439 tttagggattgtatgaacggtcaatgaggatggtgtcacgctgcaaagaag 16795389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 308
Target Start/End: Original strand, 42191248 - 42191298
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  42191248 tcctcttcttccttctacaacgatgtgttttcatcgttggcctttcataga 42191298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32947390 - 32947362
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32947390 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 32947362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Original strand, 39318368 - 39318396
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39318368 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 39318396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 16395528 - 16395979
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16395528 caccattatcgcatcaatccgaaaaatatattctggaaaacaaatgtgctttccggattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 16395627  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       || || |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16395628 cacacgtttttgtcgttggtcaagtaaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 16395727  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16395728 taaatagccttccaaacgccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttcattctacaactatggttttccatcgttggcctt 16395825  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16395826 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaacgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatg 16395925  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16395926 tgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgagcgtaagtttcagcaccccc 16395979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 8 - 455
Target Start/End: Original strand, 303969 - 304415
Alignment:
Q  8 cattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccac 107  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  303969 cattatcgcaataatccggaaaatatattccggaaaacaagtgtgcattctggattttatattccggaatgcatcagtcatggc-ggtggtctgcaccac 304067  T
Q  108 acgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatat 204  Q
    |||       ||||| || ||||||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  304068 acgtttttgtcggtggtctagtcaaaaaaa-cgtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataa 304166  T
Q  205 atagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttca 304  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  304167 atagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgtcctttca 304264  T
Q  305 tagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgg 404  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  304265 tagacaagggcctcgttgaaaacttccagggtttgtatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgttgcaacgaagcgcggtttatctaagggtcatgtgg 304364  T
Q  405 gtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  304365 gtcggtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 304415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 9304888 - 9304435
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | | || ||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9304888 cgttcgccattatcgcattaatccggaaaacatattccggaaaataaaggtacattccgtattttattttccggaatgtatcagtcatgaccggtggtct 9304789  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt-caaaaaacgcgttttaccac-gtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9304788 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaggtaaaaaaaacgcgttttaccacattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 9304689  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| |||   |||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  9304688 ctataaataaccttccaaaccccaccttttct--cacaccatcctctcccaccctctcctcctctccttccttctacaaccatggtttttcatcgttggt 9304591  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||    | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9304590 ctttcatagataaaggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacagtcaatgatgatgaaacc-acatacaacgaagtgcggttcatctaagggtc 9304492  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9304491 acgtgggtcagtgtggttcttaacttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 9304435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 31722810 - 31722372
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31722810 cacccttatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccagattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 31722711  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||       ||||| |||||| |||||| || | |  |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31722710 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtggtaaaatgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttt-gacccacccctccctat 31722612  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31722611 aaatagtcttccaacc-ccaccatttctcacac--catcctctcc----------tcctcttcttccttctacaaccatggttttccaccgttggccttt 31722525  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31722524 catagatgtgggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaacctcgctgcaacgaagcgcggttcatttgagggtcatgt 31722425  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||| |||||||| |    |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31722424 gggtcagtgtgattcttagcatgatatgtctgtgcgtaagtttgagcaccccc 31722372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 151 - 455
Target Start/End: Original strand, 11975342 - 11975644
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccac 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11975342 tttttgactgcatttatggtctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagcctttcaagccccaccatttctcaca--ccatcctctcccac 11975439  T
Q  251 cctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtc 350  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  11975440 cctctccacctcttcttccttctacaaccatggttttacatcgttggactttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtattaaaggtc 11975539  T
Q  351 aatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagca 450  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  11975540 aatgaggatggaaccgcgctacaacgaagcgcagttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagca 11975639  T
Q  451 ccccc 455  Q
    |||||    
T  11975640 ccccc 11975644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 394
Target Start/End: Original strand, 439244 - 439622
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||| |||  |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  439244 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattatggaaaacatatgtgctttctggattatatattccggaatgcatcggtcatggccggtggtcttcac 439343  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439344 cacacgtttttgtcggtgttcaagtaaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatgacctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 439443  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||              |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  439444 taaatagccttccaaaccccacc--------------atcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 439529  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgag 394  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  439530 tcatagacaagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatgaaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgag 439622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 343
Target Start/End: Original strand, 31271559 - 31271896
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31271559 caccattatcacattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtggattccagattttatattccggaatgcatcagtcatgaccggtggtctgcac 31271658  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtc-aaaaaacgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||||||       | ||| ||||||| |||||| | | |  |   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31271659 cacacgtttttgtctgtggtcaagtctaaaaaatgtggtaaaatgcattttttactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccaccc-tccctata 31271757  T
Q  204 tatagttttccaaactcc-accatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
     ||||  |||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31271758 aatagccttccaaacccccaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 31271855  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatg 343  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31271856 catagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatg 31271896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 389
Target Start/End: Original strand, 31318788 - 31319111
Alignment:
Q  65 tatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtc-aaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||       || || ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  31318788 tatattccagaatgcatcagtcataggtggtggtctgcaccacacgtttttgtcgatggtcaagtttaaaaaacacgttttaccacgttttttgattgca 31318887  T
Q  163 tttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctc 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  31318888 tttatggcctcccaatcgtttttgacccaccc-tccctataaatagccttccaaaccccacaatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctc 31318984  T
Q  263 ctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggt 362  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  31318985 ttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgacctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcaggatttgtatgaacggtcaatgcggatgga 31319084  T
Q  363 accgtgctgcaaagaagtgcggttcat 389  Q
    |||| |||| ||  ||| |||||||||    
T  31319085 accgcgctgtaacaaagcgcggttcat 31319111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 381 - 453
Target Start/End: Original strand, 31319133 - 31319205
Alignment:
Q  381 gcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31319133 gcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctgggcgtaagtttgagcaccc 31319205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 384 - 455
Target Start/End: Original strand, 439640 - 439711
Alignment:
Q  384 gttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  439640 gttcatctgaaggtcatgtgggttagtgtggttcttagcttgccctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 439711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3513473 - 3513425
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3513473 ctcctcttccttctacaacgatgtgtttccatcgttggcctttcataga 3513425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 455
Target Start/End: Original strand, 31271894 - 31271950
Alignment:
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31271894 atgtgggtcagtgtcattcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 31271950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 109
Target Start/End: Original strand, 11975243 - 11975298
Alignment:
Q  54 attccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacac 109  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11975243 attccggattatatattccggaatgcatcagtcatggctggtggtttgcaccacac 11975298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 31318758 - 31318795
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattcc 38  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31318758 cgttaaccattatcgcattaatccgaaaaatatattcc 31318795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 439401 - 439373
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  439401 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 439373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16395685 - 16395657
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16395685 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 16395657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 17523018 - 17523066
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  17523018 tcctccacttccttctacaacaatgggtttctatcgttggtctttcata 17523066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 19630521 - 19630569
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||||||    
T  19630521 tcctcctcttccttctacaacaatgtgttttcatcgttgacctttcata 19630569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 38208537 - 38208990
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38208537 cgttcaccattattgcattaatccggaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccggattttatatttcggaatgcatcagtcatggccggtggtct 38208636  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacg-cgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccc 199  Q
    ||| || |||       ||||| |||||| ||||||   |||  ||  |||| |||     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38208637 gcatcatacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaaaacgtggtaaaacgtgttttttgacatttatggcctcccaaacgtttttgacccacccctccc 38208736  T
Q  200 tatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcc 299  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38208737 tatatatagccttcgaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccactctctcctcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtc 38208834  T
Q  300 tttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38208835 tttcatagataagggtctcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaataaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtca 38208934  T
Q  400 tgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||    
T  38208935 tgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgcttgggcgtaagtttgagcaccccc 38208990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1209844 - 1209394
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1209844 cgttcaccattatcgcattaatccgaaaaatatattccggaaa-cagatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcaaggccggtggtct 1209746  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    |||||||| |       ||||   |||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  1209745 gcaccacaagtttttgtcggt---caagtcaaaaaaacgtattttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacctctgc 1209649  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||  ||||  |||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1209648 ctatcaatagccttccaaacccaaccatttctcacac--catcctctcccaccctatcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 1209551  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  1209550 ctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtaaatgaggatggaaccgcgctgcaacaaagtgcggttcatttgtgggtc 1209451  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  1209450 atgtgggtcagtgtggttcttaacttggtctgtctgggcataagtttgagcaccccc 1209394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38703512 - 38703063
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38703512 caccattatcgcattaatccagaaaatatattccggaaaacatatgtgctttccagattatatattccggaatgcatcagtcatgggcggtggtctgcac 38703413  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa-cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||       ||||| | |||| |||||| || | |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  38703412 cacacgtttttgtcggtggtaaagtaaaaaaaacgtggtaaaacacgttttttgactgcatttatggcctccc--ccgtttttgactcacccctccctat 38703315  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38703314 aaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcattggccttt 38703217  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  38703216 catagataagggtctcgttgaaaactttcaggatttgtatgaacggttaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgaaggtcatgt 38703117  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  38703116 gggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 38703063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 17137631 - 17137181
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||| | ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137631 caccattatcgcaataaatcgaaaaatatattctggaaaacaggtgtgcatttcggattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 17137532  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    ||||||       ||||| ||||||||| |||||| | |  | | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17137531 cacacgtttttgtcggtggtcaagtcaagaaaacgtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 17137432  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | ||||   ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17137431 aaatagccgtccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctatcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtcttt 17137334  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  17137333 catagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttatatgaacagtcaatgaggatggaaccgcgttgcaacgaagcgcagttcatctgagggtcatgt 17137234  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||| ||||||||||    
T  17137233 gggtcagtgtggttcttagcttggcctgcctaggcataagtttgagcaccccc 17137181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 8 - 455
Target Start/End: Original strand, 6404327 - 6404773
Alignment:
Q  8 cattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccac 107  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404327 cattatcgcattaatccggtaaacatattccagaaaacagatgtgcattccggattgtatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccac 6404426  T
Q  108 acgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatat 206  Q
    |||       ||  | || ||| |||||||  | |  | | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6404427 acgtttttgtcgagggtcgagtaaaaaaacatggtaaaacgcgtttttttactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaat 6404526  T
Q  207 agttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||  |||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6404527 agcattccaaaccccactatttctcaca--ccatcctctcccactctctcctcctcttcttccttctacagccatggttttccatcgttggcctttcata 6404624  T
Q  307 gataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggt 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  6404625 gataagggcctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgaagatggaactgcgctgcaatgaagtgcgattcatctgaagatcatgtgggt 6404724  T
Q  407 cagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6404725 caatgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 6404773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 452
Target Start/End: Original strand, 45117280 - 45117734
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||    
T  45117280 cgttcaccattattgcattaatttggaaaacatattccggaaaacagatgtgtattccggagtttatattctgaaatgcatcagttatggccggtggtct 45117379  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaa--cgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||        | || ||| || ||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45117380 gcaccacacgttttttttg-tggtcaggtaaaaaaaaacacgttttaccacgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttt-gacccacccctc 45117477  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    |||||| |||   |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45117478 cctataaataaccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctcttctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcattgg 45117575  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggttt----gtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctga 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  45117576 cctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtacgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatttga 45117675  T
Q  394 gggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacc 452  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||    
T  45117676 gggtcatgtggatcagtgcggttcttagcttgccctgcttgggcgtaagtttgagcacc 45117734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 151 - 455
Target Start/End: Original strand, 15912067 - 15912369
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15912067 tttttgactgcatttatggcctcccaacggtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccac 15912164  T
Q  251 cctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtc 350  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15912165 cctctcctccttttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtc 15912264  T
Q  351 aatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagca 450  Q
    ||||||||||| || | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||    
T  15912265 aatgaggatggaactgcgctgcaacaaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcataagtttgagca 15912364  T
Q  451 ccccc 455  Q
    |||||    
T  15912365 ccccc 15912369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 75 - 455
Target Start/End: Original strand, 44760324 - 44760705
Alignment:
Q  75 aatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcc 171  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||    
T  44760324 aatgcatctgtcatagccggtggtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtgaaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcc 44760423  T
Q  172 tcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttcctt 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  44760424 tcccaaccgtttttgacacacccctccctataaatagtcttccaaaccccaccatttctcacat--catcctctcccaccctctcctcgtcttcttcctt 44760521  T
Q  272 ctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  44760522 ctacaaccatggttttccatcgttggtctttcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctg 44760621  T
Q  372 caaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  44760622 cagcaaattgcagttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcagcccc 44760705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 5 - 374
Target Start/End: Original strand, 17309169 - 17309538
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309169 caccattatcgcattaatccgaaaaatatattccggaaaccagatgtgctttccggattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 17309268  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    |||| |       ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17309269 cacatgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaa-cgtggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccactccttccta 17309367  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17309368 taaatagccttccaaaccctaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggtctt 17309465  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaa 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17309466 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaa 17309538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 451
Target Start/End: Original strand, 45234447 - 45234883
Alignment:
Q  9 attattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccaca 108  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| |||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45234447 attatcgcattaatccagaaaataaattctggaaaacaaatgtgctttccggattatatattccggaatgcatcaatcatggctggtggtctgcaccaca 45234546  T
Q  109 cgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgttttt-gacccacccctccctatatat 206  Q
    ||       ||||| |||||| |||||| | | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |      ||||||| ||    
T  45234547 cgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaagtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaactgttttttgacac------ccctataaat 45234640  T
Q  207 agttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45234641 agtcttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctccttttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggcctttcata 45234738  T
Q  307 gataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggt 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  45234739 gataagggcttcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccacgctgcaacaaagcgcggttcatctgagggtcatgtgagt 45234838  T
Q  407 cagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcac 451  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  45234839 cagtgtggttcttagcttggcctgtctaggcgtaagtttgagcac 45234883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 455
Target Start/End: Original strand, 13278920 - 13279345
Alignment:
Q  4 tcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgca 103  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13278920 tcacaattatcgcattcatccgaaaaataaattccggaaaacacatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcaaggccggtggtctgca 13279019  T
Q  104 ccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccac-gtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctat 202  Q
    |||||||       ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13279020 ccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaaaaaacgctttttaccacattttttgactgcatttatggcctcccaatcgtttttgacccacccctccctat 13279119  T
Q  203 atatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 302  Q
    | || |  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13279120 aaattgccttccaaaccccaccatttct--cacaccatcctctcc----------tcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggccttt 13279207  T
Q  303 catagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| ||         ||||| ||||||||||    | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13279208 catagat--gggcctcgttgaaaactttcag---------gaacgatcaatgagga----atcgtgctgcaacgatgtgcggttcatctgagggtcatgt 13279292  T
Q  403 gggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  |||||||| ||||||||||    
T  13279293 gggtcagtgtggttcttagcttggcctacctggccgtaagtttgagcaccccc 13279345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 1115322 - 1115760
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  1115322 cgttcaccattatcgtattaattcggaaaatatattctggaaaacaaaggtgcattccagattttattttccggaatgcatcagtgtcatggccggtggt 1115421  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccaccc-ct 196  Q
     ||||||||| |       ||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1115422 ttgcaccacatgtttttgtcggtggttaagtcaaaaaacgagttttaccacattttttgactacatttatgacctcccaaccgtttttgacccacccact 1115521  T
Q  197 ccctatata--tagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgt 294  Q
    |||||||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||||                    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1115522 ccctatataaatagtcttctaaaccccaccatttctcacac--------------------catcctcttcttccttctacatccatggttttccatcgc 1115601  T
Q  295 tggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgag 394  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1115602 tgacctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatagaaccgcgctgcaacgaagtgcgattcatctgag 1115701  T
Q  395 ggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  1115702 ggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctaggcgtaagtttgagcaccc 1115760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 197 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7941263 - 7941008
Alignment:
Q  197 ccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttg 296  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941263 ccctataaatagcattccaaactccaccacttctcacac--catcctctcccaccctctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttg 7941166  T
Q  297 gcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgaggg 396  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  7941165 gcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttaagggcttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgcgattcatctggggg 7941066  T
Q  397 tcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||    
T  7941065 tcatatgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctgggcgtaagtttgagcacccc 7941008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 151 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31993858 - 31993557
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccc-tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctccca 249  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||| | ||||||||||| ||||  || ||||||  |    
T  31993858 tttttgactacatttattacctctcaacggtttttgacccaccccctccttataaatagccttccaacccccaccatttcttacac--cagcctctctta 31993761  T
Q  250 ccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggt 349  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31993760 ccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttggcctttcatggataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggt 31993661  T
Q  350 caatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagc 449  Q
    ||||||  |||| |||| ||||||   ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||| || |    
T  31993660 caatgaaaatggaaccgcgctgcaccaaagtgcggttcatatg-gggtcatgtgagtcagtgtggttcttagcttggcctatatgggcgtaagtttgaac 31993562  T
Q  450 acccc 454  Q
    |||||    
T  31993561 acccc 31993557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30490606 - 30490374
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30490606 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccggaaaacagatgtgctttccagattatatatttcggaatgcatcagtcatggccggtggtccgcac 30490507  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagt--caaaaaacgcgttttaccac-gtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| | ||||   |||||||| | |  ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30490506 cacacgtttttgtcggtggttaagtaaaaaaaaacggggtaaaccgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgatccacccctcccta 30490407  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacac 235  Q
    || ||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  30490406 taaatagccttccaaac-ccaccatttctcacac 30490374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 395
Target Start/End: Original strand, 16414907 - 16415105
Alignment:
Q  193 ccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatc 292  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||| | | ||||||||||||||  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16414907 ccctccctataaataggcttcaaaagttctccatttctcacaca--aacctctcccaccc-ctc-tcctcctcttccttctacaaccatgtgtttccatc 16415002  T
Q  293 gttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctg 392  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| ||| ||| ||| | || |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16415003 gttggcctttcatagaaagaggcatctttggaaattttcaaggattgtatgaacggtcaatggggatggaaccgcgctgcaaagaagggcggttcatctg 16415102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 340 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 30490362 - 30490249
Alignment:
Q  340 tatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgt 439  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||    
T  30490362 tatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcctggcctacctgggcgt 30490263  T
Q  440 aagttcgagcaccc 453  Q
    ||||| ||||||||    
T  30490262 aagtttgagcaccc 30490249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 258 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 16251866 - 16251722
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgagg 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||| ||| | || |||||||||||||||||| |     
T  16251866 tcctcctcttccttctacaatcatgtgtttccatcgttggcctttcatagaaagaggcatctttggaaattttcaaggattgtatgaacggtcaatggga 16251767  T
Q  358 atggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgt 402  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16251766 atggaaccgcgctgcaaagaagtgcggttcatctaggggtcatgt 16251722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 381
Target Start/End: Original strand, 18965409 - 18965530
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| |  ||| || ||| ||| ||| |||| ||||||||||  |||||| ||||    
T  18965409 ctcctcttccttctacaaccatgtgtttccatcgttggtttttcatagaaagaggcctctttggaaattttcagggattgtatgaacaatcaatggggat 18965508  T
Q  360 ggtaccgtgctgcaaagaagtg 381  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  18965509 ggaaccgcgctgcaaagaagtg 18965530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 31993990 - 31993882
Alignment:
Q  2 gttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggtc 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||      
T  31993990 gttcaccattattgtattaatccggaaaatatattccggaacacaaaggtacattccggattttattttccggaatacatcagtggcatggccggtggct 31993891  T
Q  100 tgcaccaca 108  Q
    |||||||||    
T  31993890 tgcaccaca 31993882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 308
Target Start/End: Original strand, 32980661 - 32980752
Alignment:
Q  211 ttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||   || |||||||||   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32980661 ttccaaacttcaccatttctcacacaacatc---tcacaccctctc---ctcctcttccttctacaacaatgtttttccatcgttggtctttcataga 32980752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7942657 - 7942573
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt 85  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| || ||| | || |||||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  7942657 cgttcaccattatcgtattagtccggaaaatatattccggaacacaaaggtacattccggattttattttccggaatgcatcagt 7942573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 354
Target Start/End: Original strand, 45536838 - 45536932
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatg 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |  ||| || ||||||| ||| |||| || |||||| ||||||||    
T  45536838 ctcctcctccttctacaaccatggttttccatcaccgacctttcatagaaacaggcctctttgaaaattttcagggattttatgaatggtcaatg 45536932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31715547 - 31715499
Alignment:
Q  260 ctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||    
T  31715547 ctcctcttccttctacaacgatgtgtttctatcgttggcctttcataga 31715499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15912075 - 15912047
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15912075 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 15912047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44760411 - 44760383
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44760411 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 44760383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 455
Target Start/End: Original strand, 39586776 - 39587230
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39586776 cgttcaccattatcgcattaatcaggaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccggatttta-attctggaatgcatcagtcatggccggtgatct 39586874  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaac--gcgttttaccacgtttttg-actgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctc 197  Q
    ||||||||||       | ||| |||| | ||||||   || ||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586875 gcaccacacgtttttgtcagtggtcaaataaaaaaaaatgcattttatcacgtttttttattgcatttattgcctcccaaccgtttttgacccacccctc 39586974  T
Q  198 cctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 297  Q
    || ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586975 ccaataaatagccttccaaactccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctccacttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgg 39587072  T
Q  298 cctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggt 397  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39587073 cctttcatagataaaggcatcgttgaaaactttcagggtttgtatgaatggtcaatgaggatggaaccgcgctgcaacgaagtgtggttcatctgagggt 39587172  T
Q  398 catgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  39587173 catgtggatcagtgtggttcttagcttggcatgtctggacgtaagtttgagcaccccc 39587230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 41182110 - 41182559
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41182110 caccattatcgcattaatctgaaaaatatattccggaaaacagatgtgctttctggattatatattccggaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 41182209  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||  | |  ||  |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  41182210 cacacgtttttttcggtggtcaagtaaaaaaaa-catggtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacctaccc-tcccta 41182307  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41182308 taaatagccttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccgccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 41182405  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  41182406 tcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcactgcaacgaagcacggttcatctgagggtcatg 41182505  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||||||| ||||||||||    
T  41182506 tgggtcagtgtggttcttagcttggcatgtctaggtgtaagtttgagcaccccc 41182559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 36 - 453
Target Start/End: Original strand, 32530044 - 32530462
Alignment:
Q  36 tccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattcc-agaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt--caa 132  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||   ||    
T  32530044 tccggaaaacacatgtgcatttcggattttatattccgaaaatgcatcagacatggccgatggtctgcaccacacgtttttgtcgatgatcaagtaaaaa 32530143  T
Q  133 aaaacgcgttttaccacgtttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctca 232  Q
    ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||      
T  32530144 aaaacgctttttaccttttttttgactgcatttatgacctcccaactgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaacaccaccatttct-- 32530241  T
Q  233 cacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactttta 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  32530242 cacaccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggtttttcatcgttgacctttcatagataagggcctcgttgaaaactttca 32530341  T
Q  333 gggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtc 432  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  32530342 gggtttgtataaacggtcaatgaggatagaaccgcgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttgacttgtc 32530441  T
Q  433 tgagcgtaagttcgagcaccc 453  Q
    | || ||||||| ||||||||    
T  32530442 taagtgtaagtttgagcaccc 32530462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 454
Target Start/End: Original strand, 47647129 - 47647575
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  | || |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  47647129 caccattatcgcattaatccggaaaatatattccgaaaaatagatgtgtttaccggattatatatttcggaatgcatcagttatggccggtggtctgcat 47647228  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||       ||||| |||||| ||||||   ||  ||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47647229 cacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaat-gtggtacaacgcgttttttgactgcatttatggcc--ccaaccgtttttgacccacccctcccta 47647325  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || |||   ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47647326 taaataaccttccaaattccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttccttttacaaccatggttttccatcgtttgcctt 47647423  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47647424 tcatagataaggacctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccacgctgcaacgaagtgcggttcatctgagggtcatg 47647523  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||   ||||||||| |||||||||    
T  47647524 tgggtcagtgtgattcttagctt-ggctgtcaaggcgtaagtttgagcacccc 47647575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 49166024 - 49165581
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |||| | |||| ||||||    
T  49166024 cgttcaccattatcgcattaatccggaaaatatatttcggaaaacagatgtgcattccgaattttatattccggagtgcat-agtcttagccgatggtct 49165926  T
Q  101 gcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcc 198  Q
    ||||||||||       ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49165925 gcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtcaagaaaaagcgttttaccacgttttttgactgcatttatgacctcccaaccgtttttgacccacctctcc 49165826  T
Q  199 ctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggc 298  Q
    ||||| ||||  |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49165825 ctataaatagccttccgaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcatcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgac 49165728  T
Q  299 ctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtc 398  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||| ||||           ||||| ||    
T  49165727 ctttcgtagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacgatcaatgatgatggaaccacgctgcaacgaag-----------tgaggttc 49165639  T
Q  399 atgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    | |||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49165638 acgtggattagtgttgttcttagcttggcctgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 49165581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 74 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41193606 - 41193224
Alignment:
Q  74 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagt-caaaaaacgcgttttaccacg-tttttgactgcatttatggcc 171  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||       ||||| ||||||  |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||    
T  41193606 gaatgcatcagtcataaccggtagtctgcaccacacgtttttgtcggtggtcaagtaaaaaaaacgtgtttcaccacgttttttgactgcatttatgacc 41193507  T
Q  172 tcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttcctt 271  Q
    ||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41193506 tcctaaccgtttttgactcaagcctccctataaatagccttccaaaccccaccatttct--cacaccatcctctcccaccctctcctcctcttcttcctt 41193409  T
Q  272 ctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  41193408 ctacaaccatggttttccatcgttggcctttcattgataagcgcgtcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcactg 41193309  T
Q  372 caaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41193308 caacgatgtgcagttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtgcttcttagcttgacctgtctgtgcgtaagtttgagcaccccct 41193224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10509146 - 10508744
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10509146 caccattatcgcattaatccggaaaatatattcaggaaaacagatgtgctttccggattatatattctggaatgcatcattcatgtccggtggtctgcac 10509047  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    ||||||        |||| | |||| ||||||  |||  ||  | |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10509046 cacacgtttttgttggtggtaaagtaaaaaaaaacgtggtaaaatgcattttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 10508947  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
    || ||||  || ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10508946 taaatagcctttcaaaccccaccatttctcacac--catcctctcccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcattggcctt 10508849  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  10508848 tcatagataagggcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggccaatgaggatggaaccgcgttgcaacgaagcgcggttcatcttagggtcatg 10508749  T
Q  402 tgggt 406  Q
    |||||    
T  10508748 tgggt 10508744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 47013622 - 47013241
Alignment:
Q  74 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg--tttttgactgcatttatggcc 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||| |||||||| | |  | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  47013622 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacgtttttttcggtggtcaagtaaaaaaacgtggtaaaacacgtttttttgactgcatttatggcc 47013523  T
Q  172 tcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttcctt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  47013522 tcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaacccaccatttct--cacaccatcctctcccaccctctcctcctcttcttcctt 47013425  T
Q  272 ctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctg 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||    
T  47013424 ctaaaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataaaggtctcgttgaaatttttcagggtttgtatgaacaatcaatgaggatggaaccgcgctg 47013325  T
Q  372 caaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47013324 caacaaatcgcggttcatctgagggttatgtgggtcagtgtggttcatagcttggcatgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 47013241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 26502117 - 26501677
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| |||||  |||| | || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26502117 caccattatcgcattaatttgcaaaatatattccggaaaacaaatgtgatttccgggttatatattccggaatgcatcaatcatggccggtggtctgcac 26502018  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctata 203  Q
    ||||||       | ||| |||||| |||||||| | |  | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26502017 cacacgtttttgtcagtggtcaagtaaaaaaacgtggtaaaacgcgttttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccaccccttcctata 26501918  T
Q  204 tatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttc 303  Q
     ||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||          ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26501917 aatagccttccaaaccccaccatttctcacac--catcctctcc----------tcctctttttccttctacaaccatggttttccatcgttggcttttc 26501830  T
Q  304 atagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtg 403  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26501829 atagataagggtctcgttgaaaactttaagggtttgtatgaatggtcaatgaggatggaaccgcgctgaaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtg 26501730  T
Q  404 ggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
     ||||||||||||||| |||  |||||  ||   ||||||| |||||||||||    
T  26501729 agtcagtgtggttctttgctgggcctgcttggttgtaagtttgagcaccccct 26501677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 171 - 455
Target Start/End: Original strand, 6936803 - 6937084
Alignment:
Q  171 ctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttcct 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6936803 ctcccaaccgtttttaacccacccctccctataaatagtcttccaaaccccaccatttctcaca--ccatcctctcccaccctctcctcctcttcttcct 6936900  T
Q  271 tctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgct 370  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  6936901 tatacaaccatgtttttccgtcgttggcctttcatagataagggcctcattgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgaggat-gaaccgcgct 6936999  T
Q  371 gcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6937000 gcaacgaagtgcggttcatctaagggccatgtgggtcagtgtggttcttagcttggtttgtctgggcgtaagtttgagcaccccc 6937084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 151 - 452
Target Start/End: Original strand, 40940122 - 40940408
Alignment:
Q  151 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccac 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||                   
T  40940122 tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttctcacac--------------- 40940206  T
Q  251 cctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtc 350  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40940207 cctctcctcctcttcttccttctacaaccatgattttccatcgttggcctttcatagataagggtctggttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtc 40940306  T
Q  351 aatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagca 450  Q
    | ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  40940307 agtgaggatggaaccgcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttgacctgtctgggcgtaagtttgagca 40940406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 131 - 455
Target Start/End: Original strand, 53816284 - 53816594
Alignment:
Q  131 aaaaaacgcgttttaccacgtt-tttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctccctatatatagttttccaaactccaccatttc 229  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||    
T  53816284 aaaaaccgtgttttaccacgttctttgactgcatttatggtcttccaaccgtttttaacccacccctccctataaatagccttccaaaccccaccatttc 53816383  T
Q  230 tcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaactt 329  Q
    ||||||               ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53816384 tcacac---------------cctttcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcctcgttgaaaactt 53816468  T
Q  330 ttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcct 429  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  53816469 tcagggtttatatgaacggtcaatgaagatggaaccgcgctgcaatgaagagcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagtttggcct 53816568  T
Q  430 gtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  53816569 gcctgggcgtaagtttgagcaccccc 53816594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 31765118 - 31764675
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggt 98  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| || |||||| | || |||||| |||| ||| |||| || |||||||||  |||||||||||||    
T  31765118 cgttcaccagtatcgtattaatccgcaaaatatatttcggaaaacaaaggtacattccggattgtattttccggactgcatcagtgtcatggccggtggt 31765019  T
Q  99 ctgcaccacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgtt-tttgactgcatttatggcctcccaaccgttttt-gacccacccc 195  Q
    |||||||||| |       ||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||     
T  31765018 ctgcaccacaagtttttgtcggtgttcaagttaagaaaacgtgttttaccaggttgtttgactacatttatgacctcccaaccgttttttgacccaccc- 31764920  T
Q  196 tccctatatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgtt 295  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| |||||||               ||||| ||||||||| |  || ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31764919 tccatataaatagctttccaaaccccaccata--------------ctctcacaccctctccttatcttcttcattctaaaactatggttttccatcgtt 31764834  T
Q  296 ggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagg 395  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31764833 ggcctttcatagataagggtctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcactgcaaagaagtgcggttcatctgggg 31764734  T
Q  396 gtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31764733 gtcatgtgggtcagtgtggttctttgcttggtctgtctgggcgtaagtttgagcacccc 31764675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 214 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 36402541 - 36402302
Alignment:
Q  214 caaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagg 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36402541 caaaccccaccatttctcacac--catcctctcccactctctcctcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataaga 36402444  T
Q  314 gcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtg 413  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402443 gcctcgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaacttcgctgcaacgaagcgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtg 36402344  T
Q  414 gttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    ||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||||    
T  36402343 gttcttagcttggcttgcctgagcttaagtttgagcaccccc 36402302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 234 - 455
Target Start/End: Original strand, 39353568 - 39353789
Alignment:
Q  234 acaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttag 333  Q
    |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39353568 acaccatcctcttccaccctctcctcgtcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttgacctttcatagataagggcgtcgttgaaaactttcag 39353667  T
Q  334 ggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtct 433  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39353668 ggtttgtatgaacggtcaatgaggctggaaccgcgctgcaactaagtgcggttcatttgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttggcctgtct 39353767  T
Q  434 gagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
    | ||||||||| ||||||||||    
T  39353768 gggcgtaagtttgagcaccccc 39353789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 455
Target Start/End: Original strand, 149536 - 149957
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 104  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||  || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149536 caccattatcgcattaatccggaaaatatatttcggaaaacatatgtgtttttcggattttatgttccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcac 149635  T
Q  105 cacacgnnnnnnncggtgatcaagtcaaaaaacgcgttttaccacg---tttttgactgcatttatggcctcccaaccgtttttgacccacccctcccta 201  Q
    || |||       ||||| |||||| ||||||  |||  ||  |||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  149636 catacgtttttttcggtggtcaagtaaaaaaaaacgtagtaaaacgcattttttgactgcatttatggcctcccaactgtttttgacccaccccttccta 149735  T
Q  202 tatatagttttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctt 301  Q
     | ||||  |||||||| ||| |||              |||||||||||||||| ||||         ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  149736 aaaatagccttccaaaccccatcat--------------cctctcccaccctctcctcct---------tctacaaccatggattttcatcgttggcctt 149812  T
Q  302 tcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatg 401  Q
    || ||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||||            
T  149813 tcgtagataagggcctcattgaaacctttcagggattgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgtgttgcaacaaagcgcggttcatctga-------- 149904  T
Q  402 tgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccc 455  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  149905 -gggtcagtgtggttcttagcttggcctgtctgggcgaaagtttgagcaccccc 149957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 211 - 399
Target Start/End: Original strand, 227777 - 227964
Alignment:
Q  211 ttccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagata 310  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227777 ttccaaaccccaccatttttcaca--ccatcctctcccactctctcctcctcttcttccttatacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagata 227874  T
Q  311 a-gggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtca 399  Q
    | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  227875 aggggccttgttgaaaactttcagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcgttgcaacgaagtgcggttcatctgtgggtca 227964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 36402640 - 36402547
Alignment:
Q  3 ttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtg 96  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36402640 ttcaccattatcgcattaattcagaaaatatattccggaaaacagatgtgcattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggccggtg 36402547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 101
Target Start/End: Original strand, 40937427 - 40937523
Alignment:
Q  5 caccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctg 101  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  40937427 caccattatcgcattaattcggaaaatatattccggaaaacagatgcgaattccggattttatattccggaatgcatcagtcatggtcgatggtctg 40937523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 110
Target Start/End: Original strand, 53814920 - 53814956
Alignment:
Q  74 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53814920 gaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacg 53814956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 109
Target Start/End: Original strand, 6936744 - 6936784
Alignment:
Q  69 ttccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacac 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6936744 ttccggaatgcatcagtcatggtcggtggtctgcaccacac 6936784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 6936690 - 6936747
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattcc 58  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  6936690 cgttcacctttatcgcattaatccggaaaatatgtttcggaaaacagatgtgctttcc 6936747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 308
Target Start/End: Original strand, 9332585 - 9332618
Alignment:
Q  275 caaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9332585 caaccatagttttccatcgttggcctttcataga 9332618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 155
Target Start/End: Original strand, 26501962 - 26501990
Alignment:
Q  127 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26501962 agtcaaaaaacgcgttttaccacgttttt 26501990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 53814881 - 53814917
Alignment:
Q  1 cgttcaccattattgcattaatccgaaaaatatattc 37  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  53814881 cgttcaccattatcgcattaatccgaaaaacatattc 53814917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 17 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 47350 - 46908
Alignment:
Q  17 attaatccgaaaaatatattccgaaaaacagatgtgcattccagattttatattccagaatgcatcagt--catggccggtggtctgcaccacacgnnnn 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | || || ||| |||| ||| |||| || ||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |        
T  47350 attaatccggaaaatatattccggaaaacaaaggtacactccggattatattttccggactgcattagtgtcatggccggtggtttgcaccacatgtttt 47251  T
Q  115 nnncggtgatcaagtcaa-aaaacgcgttttaccacgttttt-gactgcatttatggcctcccaaccgttttt-gacccacccctccctatatatagttt 211  Q
       ||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |    
T  47250 tgtcggtggtcaagtcaagaaaacgtgttttaccacattttttgactacatttatgacctcccaaccgttttttgacccaccc-tccctataaatagcct 47152  T
Q  212 tccaaactccaccatttctcacacaccatcctctcccaccctctcatcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataa 311  Q
    ||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  47151 tccaaaccccaccatttctcacaa--catcctcttccaccctctcctcctcttcttccttctacaaccatggttttccatctttgacctttcatagataa 47054  T
Q  312 gggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatgaggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatct-gagggtcatgtgggtcagt 410  Q
    |||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||    
T  47053 gggtctcgttgaaaactttcaaggtttgtatgaacggtcaatgaggatggaaccgcactgcaaagaagtgcggttcatttggggggtcatatgggtcagt 46954  T
Q  411 gtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcaccccct 456  Q
    |||||||||||||| |  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  46953 gtggttcttagcttggtttgtctgggcgtaagtttgagcaccccct 46908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 256 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14834 - 14636
Alignment:
Q  256 catcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcatcgttgaaaacttttagggtttgtatgaacggtcaatga 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14834 catcctcttcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcatagataagggcctcattgaaaacttttagggtttgtatgaacgatcaatga 14735  T
Q  356 ggatggtaccgtgctgcaaagaagtgcggttcatctgagggtcatgtgggtcagtgtggttcttagcttagcctgtctgagcgtaagttcgagcacccc 454  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||    
T  14734 ggatgaaaccgtactgcaacgaagtgcggttcatctaggggtcatgtaggtcagtgtggttcttagcttggcctgtttgggcgtaagtttgagcacccc 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1301 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1301
Description:

Target: scaffold1301; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 110
Target Start/End: Original strand, 1874 - 1924
Alignment:
Q  60 gattttatattccagaatgcatcagtcatggccggtggtctgcaccacacg 110  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1874 gattttattttccggaatgcatcagtcatgaccggtggtctgcaccacacg 1924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 181433 - 181481
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||    
T  181433 tcctcctcttccttctacaataatgtgtttccatcgttggcctttcata 181481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 306
Target Start/End: Original strand, 11614 - 11662
Alignment:
Q  258 tcctcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcata 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||    
T  11614 tcctcctcttccttctacaacaatgtgtttccatcgttaacctttcata 11662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 264 - 308
Target Start/End: Original strand, 17525 - 17569
Alignment:
Q  264 tcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcataga 308  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17525 tcttccttctacaacgatgtgtatccatcgttggcctttcataga 17569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 245980 - 245936
Alignment:
Q  261 tcctcttccttctacaaccatggttttccatcgttggcctttcat 305  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  245980 tcctcttccttctacaacaatgttttttcatcgttggtctttcat 245936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University