View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2503_low_2 (Length: 616)

Name: NF2503_low_2
Description: NF2503
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2503_low_2
NF2503_low_2
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (14-606)||(26223902-26224493)
chr7 (14-606)||(26204264-26204856)
chr7 (114-558)||(26260299-26260743)
chr7 (33-583)||(26302211-26302761)
chr7 (14-550)||(19102723-19103259)
chr7 (14-558)||(26251275-26251819)
chr7 (14-558)||(26297875-26298419)
chr7 (18-550)||(26155623-26156158)
chr7 (14-550)||(26191700-26192236)
chr7 (14-558)||(26242827-26243371)
chr7 (118-571)||(26088196-26088649)
chr7 (118-571)||(26111984-26112437)
chr7 (14-571)||(26179497-26180054)
chr7 (14-515)||(26278169-26278667)
chr7 (114-545)||(26207851-26208282)
chr7 (123-545)||(26227412-26227834)
chr7 (14-550)||(26129002-26129541)
chr7 (26-372)||(26186862-26187207)
chr7 (415-550)||(26186677-26186812)
chr7 (174-221)||(41562683-41562730)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (34-558)||(44903680-44904204)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (406-455)||(5995044-5995093)
chr5 (155-281)||(17572404-17572530)
chr5 (414-466)||(17572660-17572712)
chr5 (414-466)||(17620000-17620052)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (128-469)||(16908519-16908863)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (412-469)||(14869802-14869859)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (185-281)||(12613700-12613796)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 545; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 545; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26224493 - 26223902
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224493 tcatcctcatcacttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 26224394  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26224393 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagcagcttctcattgtaaaattgttcagcaaatattggccatgtt 26224294  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224293 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 26224194  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224193 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctc-aaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 26224095  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224094 aacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 26223995  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttccgtgtatcctttatcatcgcctttg 606  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223994 aacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttctgtgtatcctttatcatcgtctttg 26223902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 26204856 - 26204264
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204856 tcatcctcatttctttgctcacttggccatttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 26204757  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26204756 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagcagcttctcattgtaaaattgttcagcaaatattggccatgtt 26204657  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204656 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 26204557  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204556 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 26204457  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26204456 aacaacccaaatgaaattatgaccagaattttcaagaccatgagctatttcagcaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 26204357  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttccgtgtatcctttatcatcgcctttg 606  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26204356 aacacagactcgttttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttccgtgtatcctttatcatcgtctttg 26204264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 114 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26260743 - 26260299
Alignment:
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  26260743 ccaaaacttgttcacttttgatccaactgaaactccaatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacattggccatgca 26260644  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26260643 atcattggcaaacccgagttcaagctttcaagaattgagttccatccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatataaggagctgtg 26260544  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||  ||||   | ||  ||   || ||||  ||    
T  26260543 gtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttgctcaaaatcatgaagaaaactgtctttgacttcgcctccgtcttttttcct 26260444  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26260443 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctatttcaacaacctgagcataagaaagcctagtcaagcttccaaaacttacatac 26260344  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattct 558  Q
    |||||||| |||||    ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  26260343 aacacagaatcattagggttagagttaagccaatttaacaattct 26260299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 33 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 26302761 - 26302211
Alignment:
Q  33 ctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaagccaaaactggttcactttt 132  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||  | ||||| ||||||||||| | | ||||| ||| ||| |||  |||||||| |||| |||||    
T  26302761 ctcttggccatttcccatcaaaatctcaacggcctttgcaatctcttcccttctcacaattgcctctacactaattctattccaaaactcgttctctttt 26302662  T
Q  133 gatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaaccagaat 232  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26302661 gatccaacagaaactccaatcttcaaaacatcaacaagaaacttctcgttgttaaattgctcagcaaaaatgggccatgtgatcattggcaaaccagcat 26302562  T
Q  233 tcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattccatatgat 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  26302561 tcaagctttcgagaattgagttccaacaacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatattagaagctgcggtgcccaattccatatgat 26302462  T
Q  333 atagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaacaacccaaatgaaatta 432  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||| |||||||||||| | |||| | |||| | || ||  || |||||||| ||| ||    
T  26302461 atagccttttttgctttctttcatcctttcctcaaatacttgcaggaaaccttcttcatcctcatttctatcatattttcgtacgacccaaataaaacta 26302362  T
Q  433 tgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcattttcct 532  Q
    ||||||||||||||||| || || || | ||| |||| |||  |||||| | ||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26302361 tgacctgaattttcaagcccgtgtgcaatttctacaagctgagcatgaggatgccaaacaaggctgccaaaacttacatacaatacagactcattttgct 26302262  T
Q  533 tagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaatgttcttttccg 583  Q
    | || |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||    
T  26302261 ttgagttaagccaatttaccaattctgtttcttttccaaagttcttctccg 26302211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 550
Target Start/End: Original strand, 19102723 - 19103259
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||||| |  ||||      
T  19102723 tcatcctcatttctttgctctcttggccacttcccatcaaaatctccacagccttcactatctctccccttttcaccactatcccttcactagggctatt 19102822  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| |||| ||| ||||||| ||| ||  |||| || |||||||||||||| || || | ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  19102823 ccataacttgtttacttttgctcctactccgacccctatcttcaaaacatcgacgagcaacttttcattgtaaaactgctcagcaaaaattggccatgtg 19102922  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19102923 atcattggcaaacccgaattcaagctttcgagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagttgcg 19103022  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||  | |||||  |||||| | || ||||  ||    
T  19103023 gtgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatccttgcctcaaaatcttgtagaaaactgttttcactctcatctctctcatttttcct 19103122  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || | ||| |||||||| ||||    ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19103123 tacaacccagataaaattatgacctgaattttcaagaccgtgtgcgatttctacaatctgatcattttcaagcctagttagacttccaaaacttacatac 19103222  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaattta 550  Q
    || ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  19103223 aatacagactcattttgctttgagttaagccaattta 19103259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26251819 - 26251275
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |  | || || ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||     
T  26251819 tcatcctcatttctttgctctcttggcaacttcccatcaaaatcttaacagccattgcaatttcttcccttctcaccacttcctcttcactaatattaat 26251720  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| ||||  ||  |||||| ||| || | ||| || ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||     
T  26251719 ccataacttattttcttttgctcctactgggacccctatcttcaaaacatcaactagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaacactggccacgtg 26251620  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26251619 atcattggcaaaccagcatttaagctttcaagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagttgtg 26251520  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |  || |||||||||| || | ||||||||||| | || | |    
T  26251519 gtgcccaattccagatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaatttttgcaaaaaaccttctccatcctcatctttatcatctttttt 26251420  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26251419 tataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgaggaagcctagtaaggctgccaaaacttacatac 26251320  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattct 558  Q
    || || |||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||    
T  26251319 aatactgactcattttgcttcgagttaagccaattaagcaattct 26251275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26298419 - 26297875
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| || ||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||  |||    
T  26298419 tcatcctcatttctttgctctcttggccgcttcccatcaaaatcttcacagtcttctctatctcttcccttctcaccactttctctacactaatgtcaag 26298320  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| |||| |||  |||||| ||| || | ||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||     
T  26298319 ccataacttgttttcttttgctccgactgggacccctatctttaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagcaaaaataggccatgtg 26298220  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |    
T  26298219 atcattggcaaaccagcattcaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctgttgcagggtggtccaatatcagaagttgcg 26298120  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||| || | |||||| |||| |    | |    
T  26298119 gtgcccagtcccatatgatatagcccttgctgctttctttaatcctttcctcaaattcttgcagaaaaccttctccatcctcatctgtatcatccctttt 26298020  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||| |||  ||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26298019 tataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgaacaatttctacaagctgagcataaggaagcctagtaaagctgccaaaacttacatac 26297920  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattct 558  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26297919 aatacagattcattttccttcgaattaagccaatttagcaattct 26297875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26156158 - 26155623
Alignment:
Q  18 cctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaat---gctaagc 114  Q
    |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| | |   ||||  |    
T  26156158 cctcattgctttgctctcttggtcacttcccatcaaaatctctacagccttcgctatctcttccctcttcaccactacgtcttcactactagtgctagtc 26156059  T
Q  115 caaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtta 214  Q
    || ||||  ||  |||||| |||||| | |||  | |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |    
T  26156058 cataacttattttcttttgctccaactgggaccgctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgatcaccaaacattggccatgtaa 26155959  T
Q  215 tcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtgg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26155958 tcattggcaaaccagaattcaagctttcgagagttgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtgg 26155859  T
Q  315 ggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctcta 414  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||   | |||||  |||||  | |||||||  ||     
T  26155858 tgcccaattccatatgatatatccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatcgctctcctttttcctt 26155759  T
Q  415 acaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacataca 514  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || | ||| ||||||||  ||| |  ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26155758 acaacccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaacttacataca 26155659  T
Q  515 acacagactcattttccttagaattaagccaattta 550  Q
    | || |||||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  26155658 atacggactcattttgctttgtgttaagccaattta 26155623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26192236 - 26191700
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||   ||||| ||| ||| |||      
T  26192236 tcatcctcatttctttgctctcttgtccacttcccatcaaaatctcaacagcctttgcaatctcttcccttctaaccatcgcctctacacaaatactatc 26192137  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    |||  ||| |||  |||||| ||||||   ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |      
T  26192136 ccatgacttgttttcttttgctccaactcggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcggcaaacattggccacgcg 26192037  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26192036 atcattggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaattccacctgttgcagggtgatccaatatctgaagctgtg 26191937  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   || ||||  | |||||  |||||  |||| ||||  ||    
T  26191936 gtgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttccctcaaaatcttgtaggaaactgttttcactctcatccatatcatttttcct 26191837  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||| |||  ||||||  |||||||| |  |||||||| ||||||||     
T  26191836 tacaacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgagttagcctagttaaacttccaaagcttacataa 26191737  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaattta 550  Q
    |  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26191736 agtacagactcattttgctttgagttaagccaattta 26191700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 14 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 26243371 - 26242827
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| | | ||| |   |||| | |     
T  26243371 tcatcctcatttctttgctctcttggccacttcccatcaaaatctcaacagcctttgtaatctcttcccttctcaccatttcatctactgtaatgttcat 26243272  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| |||| ||| ||||||| |||  | | ||| || ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | ||| |||||| ||     
T  26243271 ccagaacttgtttacttttgctcctgctgggacccctatctttaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcagaagacactggccacgta 26243172  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  26243171 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcttgttgctgggtgatccaatatcagaagttgcg 26243072  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| || | ||| ||||||| | || | |    
T  26243071 gtgcccagtcccatatgatatagcccttgttgctttctttcatcctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcctcaactttatcatctttttt 26242972  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||| |||  |||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  26242971 tataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgagcaatttctacaagctgagcatgaggaaacctagtctggctgccaaaacttacatac 26242872  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattct 558  Q
    || ||||||||||||| |||    ||||||||||||| |||||||    
T  26242871 aatacagactcattttgcttcaggttaagccaatttagcaattct 26242827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 118 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26088649 - 26088196
Alignment:
Q  118 aactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatca 217  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  26088649 aactcgtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgctcagcaaatattggccatgcgatca 26088550  T
Q  218 ttggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggc 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26088549 ttggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgtggtgc 26088450  T
Q  318 ccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaaca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||   | |||||  |||||  | || | ||  || |||    
T  26088449 ccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttccttaca 26088350  T
Q  418 acccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaaca 517  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || | ||| ||||||||  ||| |  ||||||| | || |||||||||||||||||||| |    
T  26088349 acccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacatacaata 26088250  T
Q  518 cagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaa 571  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||  ||||||||||    
T  26088249 cggactcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaa 26088196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 118 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26112437 - 26111984
Alignment:
Q  118 aactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatca 217  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||    
T  26112437 aactcgtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttttcattgtaaaattgctcagcaaatattggccatgcgatca 26112338  T
Q  218 ttggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggc 317  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26112337 ttggcaaaccagcattcaagctttcaagaatcgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcaggatgatccaatatcagaagttgtggtgc 26112238  T
Q  318 ccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaaca 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||   | |||||  |||||  | || | ||  || |||    
T  26112237 ccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaagtgttttcactctcatccctctcatatttccttaca 26112138  T
Q  418 acccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaaca 517  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || || || || | ||| ||||||||  ||| |  ||||||| | || |||||||||||||||||||| |    
T  26112137 acccagataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctaattagacttccaaaacttacatacaata 26112038  T
Q  518 cagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaa 571  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||| | | ||||  ||||||||||    
T  26112037 cggactcattttcctttgagttaagccaatttagccactcttcctcttttccaa 26111984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26180054 - 26179497
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| || || ||||||||||||  |||| ||  |||| |||     
T  26180054 tcatcctcatttctttgctctcttggtcacttcccatcaaaatctttacagccttaactatatcttctcttctcaccactttctctacattaatgttaat 26179955  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| || | |||  |||||| ||| || | ||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||     
T  26179954 ccataaattgttttcttttgctcctactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcgttgtaaaattgctcagcaaacaccggccacgtg 26179855  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26179854 atcattggcaaacccgagttcacactttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatctaatatcagaagttgtg 26179755  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||||||| || | ||||||||||| | || | |    
T  26179754 atgcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcaacctttcctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcttcatctttatcatatttttt 26179655  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     | |||||| || ||||| |||||||| |||||||| || || || | ||| |||| |||  |||| | || ||||  |||||| ||||||||||||||     
T  26179654 tataacccagataaaattttgacctgagttttcaagcccgtgcgcaatttctacaagctgagcatgcggaaacctaacaaggctaccaaaacttacatat 26179555  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagccaatttaccaattcttgatcttttccaa 571  Q
    || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26179554 aatacagactcattttgctttgagttaagccaatttagccattcttcctcttttccaa 26179497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26278667 - 26278169
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaag 113  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| | | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||      
T  26278667 tcatcctcatttctttgctctcttggctaattcccatcaaaatctctacagccttcactatctcttcccttctcaccatttcctctacactaatgttagt 26278568  T
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    ||| |||| ||| ||||||| |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||||| |||||| ||     
T  26278567 ccataacttgtttacttttgctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattcctcggcaaacactggccacgtg 26278468  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  26278467 atcattggcaaaccagcatttacgctttcaagagttgagttccaaccacaatgagtcacaatccctccgattgcagggtattccaatatcagcagttgtg 26278368  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| || | ||||||||||  ||||   |    
T  26278367 gtgcccaatcccatatgatgtagcccttgttgctttctttcatccttttctcaaattcttgcaggaaaccttctccatcctcatctttattatttt---t 26278271  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||||||||| || || || | ||| |||| |||  |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26278270 tataacccagataaaattatgacctgaattttcaagcccgtgtgcaatttctacaagctgagcatgaggaagcctaataaggctgccaaagcttacatac 26278171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 26208282 - 26207851
Alignment:
Q  114 ccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtt 213  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  26208282 ccaaaatttgttcacttttgatccaactgaaactccaatcttcaaaacatcaacaagcaatttctcattgtaaaattgctcagcaaacattggccatgca 26208183  T
Q  214 atcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtg 313  Q
    ||||| || ||||||  | | | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  26208182 atcatgggtaaaccaacactaaggctttcaagaattgaattccaaccacaatgagtcactatccctcctgttgcagggtggcctaatatgagaagctgtg 26208083  T
Q  314 gggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctct 413  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   |||||||| ||||||||  | |||  ||| ||||  ||    
T  26208082 gtgcccaattccatatgatatatccctttttgttttctttcatcctttgcttaaaatcttcaagaaaaccatcttcacctccttctccatcttttttcct 26207983  T
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatac 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||  ||||||  || || || | ||||||||||||||  |||    
T  26207982 aacaacccaaatgaaattatgaccggaattttccagaccatgagctatttctacaatctgagcatgagggagtcttgtcaagcttccaaaacttatgtac 26207883  T
Q  514 aacacagactcattttccttagaattaagcca 545  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  26207882 aacacagaatcatttggctttgaattaagcca 26207851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 123 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 26227834 - 26227412
Alignment:
Q  123 gttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggc 222  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26227834 gttcacttttgatccaaccgaaactactatcttcaaaacaaaaacaagaagcttctcattgtaaaactgctccgcaaacattggccatgtaataattggc 26227735  T
Q  223 aaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaat 322  Q
    |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26227734 aaactaacactcaagctttcaagaattgagttccaaccacaatgagtcactacccctgctgttgcagggtgacctaatatgagaagttgtggtgcccaat 26227635  T
Q  323 tccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatc-agaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaacaaccc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||  |  | |||  ||| ||||  ||||||||||    
T  26227634 tccatatgatatatccctttttgttttctttcatcctttgcttaaaatc-atcaagaaacccgtcttcgtctccttctccatcttttttcctaacaaccc 26227536  T
Q  422 aaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaacacaga 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||   |||||| || || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  26227535 aaatgaaattatgacctgaattttcaagaccatgagctatttctacaatctgggaatgagagagtcttgtcaagcttccaaaacttacatacaacacaga 26227436  T
Q  522 ctcattttccttagaattaagcca 545  Q
     |||||   ||| |||||||||||    
T  26227435 atcattcggctttgaattaagcca 26227412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26129541 - 26129002
Alignment:
Q  14 tcatcctcatcgcttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcac---caatgct 110  Q
    ||||||||||  |||| | |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||   || ||||    
T  26129541 tcatcctcatttctttgctctcttggccgcttcccatcaaaatctctacagccttcgctatctcttcccttttcaccactacgtctttactttcagtgct 26129442  T
Q  111 aagccaaaactggttcacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccat 210  Q
    |  ||  | || |||  |||||| ||| || |  || || ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  26129441 agtccgcatcttgttttcttttgctcctactgaaacccctatcttcaaaacatcaacgagcaacttttcattgtaaaattgatcgccaaaccttggccat 26129342  T
Q  211 gttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagct 310  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||    
T  26129341 gtaatcattggcaaaccagcatttaagctttcgagagttgagttccaaccacaatgagtcacaattcctcctatggcagggtgatccaatataaggagct 26129242  T
Q  311 gtggggcccaattccatatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttc 410  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   || |||   | |||||  |||||  | |||||||     
T  26129241 gtggtgcccaattccatatgatatagcccttttttctttctttcatcctttcctcaaaatcttgaaggaaattgttttcactctcatcgctctccttttt 26129142  T
Q  411 tctaacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttaca 510  Q
     || |||||||| || |||||||||||||||||||| || || || || | ||| ||||||||  ||| |  ||||||||| || |||||||||||||||    
T  26129141 ccttacaacccatataaaattatgacctgaattttcgagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttagacttccaaaacttaca 26129042  T
Q  511 tacaacacagactcattttccttagaattaagccaattta 550  Q
    ||||  || |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  26129041 tacagtacggactcattttgctttgagttaagccaattta 26129002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26187207 - 26186862
Alignment:
Q  26 cttttccctcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaagccaaaactggtt 125  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||| ||| |||| ||| | | |||| |||    
T  26187207 cttttctctcttggccacttcccatcaaaatcttcacagccttaactatctcttcccttctcaccatttcatctacactaatgttaatctagaacttgtt 26187108  T
Q  126 cacttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaa 225  Q
      |||||| ||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  26187107 ttcttttgctcctacttggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacttctcattgtaaaattgctcctcagacattggccatgtgatcattggcaaa 26187008  T
Q  226 ccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattcc 325  Q
    || || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26187007 cccgagttcacgctttccagaattgagttccaacaacagtgagtcacaatccctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggtgcccaattcc 26186908  T
Q  326 atatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatct 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26186907 atatgatatatccctttttgctttctttcattc-tttctcaaaatct 26186862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 26186812 - 26186677
Alignment:
Q  415 acaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacataca 514  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || || | ||| ||||||||  ||| |  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  26186812 acaacccagataaaattatgatctgaattttcaagaccgtgtgcaatttctacaatctgagcattatcaagcctagttacacttccaaaacttaaataca 26186713  T
Q  515 acacagactcattttccttagaattaagccaattta 550  Q
      || |||||| ||| ||| || |||||||||||||    
T  26186712 gtacggactcaatttgctttgagttaagccaattta 26186677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41562730 - 41562683
Alignment:
Q  174 cttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattgg 221  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41562730 cttctcattaaagaattgttcagcaaacattggccaagttatcattgg 41562683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 34 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 44904204 - 44903680
Alignment:
Q  34 tcttgaccacttcccatcaatatctcaacagccttcactatctcctcccttctcaccactacctcttcaccaatgctaagccaaaactggttcacttttg 133  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||  | ||||| |||||||| |||| | ||||| ||  || ||||  ||| |||| |||  ||||||    
T  44904204 tcttgaccatttcccaacaaaatctccgcagcctttgcaatctcttcccttctaaccattgcctctacagtaaagctattccataacttgttttcttttg 44904105  T
Q  134 atccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaaccagaatt 233  Q
     |||||| | ||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |    
T  44904104 ctccaactgggacccctatcttcaaaacatcaacaagcaacctctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgtgatcattggcaaaccaacact 44904005  T
Q  234 caagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattccatatgata 333  Q
     | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  44904004 aatgctttcaagagttgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatgagaagctgcggtgcccaattccatatgata 44903905  T
Q  334 tagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatccttttctctaacaacccaaatgaaattat 433  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||| |||||||| ||    || ||| |||| ||||  || |||||||| || |||||||    
T  44903904 tagcccttgttgctttctttcaccctttcctcaaaatcttgcaggaaaccttcctcgttctcgtctctatcatttttccttacaacccagataaaattat 44903805  T
Q  434 gacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaatctgttcatgagaaagcctagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcattttcctt 533  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || | ||| |||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44903804 gacctgacttttcaagcccatgtgcaatttctacaagctgagcatgaaaaagcttagtaaggcttccaaaacttacatacaacacagactcattttgctt 44903705  T
Q  534 agaattaagccaatttaccaattct 558  Q
     || ||||||||||||| |||||||    
T  44903704 tgagttaagccaatttagcaattct 44903680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 406 - 455
Target Start/End: Original strand, 5995044 - 5995093
Alignment:
Q  406 ttttctctaacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatg 455  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5995044 ttttttctaacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtgcatg 5995093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Original strand, 17572404 - 17572530
Alignment:
Q  155 tcaaaacatcaacaagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagtt 254  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||||  ||||| ||||||||  ||||  ||    
T  17572404 tcaacacatcaacaaccaacttctcattaaaaaaatgttcagcaaacaaaggccaagtcaccataggcaaaccaacattcatgctttcaactattgtatt 17572503  T
Q  255 ccaaccacagtgagtcacaattcctcc 281  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  17572504 ccaaccacaatgactcaccattcctcc 17572530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Original strand, 17572660 - 17572712
Alignment:
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaa 466  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  17572660 aacaacccaaatgaaatcatggcttgaagtttcaagtgcatgagctatttcaa 17572712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 414 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17620052 - 17620000
Alignment:
Q  414 aacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  17620052 aacaacccaaatgaaattatggcttgaagcttcaagtgcatgagctatttcaa 17620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 469
Target Start/End: Original strand, 16908519 - 16908863
Alignment:
Q  128 cttttgatccaaccgcgactccaatcttcaaaacatcaac-aagaagcttctcattgtaaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaac 226  Q
    |||||| |||||| || || ||||||||||| |||||||| || || || ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||   || ||| ||||    
T  16908519 cttttgctccaactgccacaccaatcttcaacacatcaaccaacaatct-ctcattgaaaaactgttcagcaaacaatggccaagtagccaatggtaaac 16908617  T
Q  227 cagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcctgttgcagggtgatccaatatcagaagctgtggggcccaattcca 326  Q
    | | ||| |  ||||| | ||| | |||||| ||||| ||||||||||   ||||   ||||   || || | ||||||||||||||| ||||||  |||    
T  16908618 ctgcatttacactttccataatagtgttccacccacaatgagtcacaacagctccaactgcaccatgctctagtatcagaagctgtggtgcccaacccca 16908717  T
Q  327 tatgatatagccctttttgctttctttcatccttttctcaaaatctatcagaaaaccttcttcaccatcatctttatcct---tttctctaacaacccaa 423  Q
    ||| | |||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||  ||| |||||| || ||||| || ||   ||| |   |||  ||||||||||||    
T  16908718 tatcaaatagcctttgtttctttctttcattctcttctcaaactcactcaaaaaaccatcatcaccgtcttcggcatcttcgattttcctaacaacccaa 16908817  T
Q  424 atgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaa 469  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16908818 atgaaatcatggccagaatcttcaagtgcatgagctatttcaacaa 16908863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000009; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 412 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14869859 - 14869802
Alignment:
Q  412 ctaacaacccaaatgaaattatgacctgaattttcaagtccatgagctacttcaacaa 469  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14869859 ctaacaacccaaatgaaatcatggccagaatgttcaagtgcatgagctatttcaacaa 14869802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12613796 - 12613700
Alignment:
Q  185 aaaattgttcagcaaacattggccatgttatcattggcaaaccagaattcaagctttcaagaattgagttccaaccacagtgagtcacaattcctcc 281  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| || | ||| ||||| |||  |||||| |||||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12613796 aaaattgttcagcaaataaaggccaagtcaccataggcaacccaacattcaaactttcaactactgtgttccaaccacaatgagtcacaattcctcc 12613700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University