View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2511_low_9 (Length: 239)

Name: NF2511_low_9
Description: NF2511
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2511_low_9
NF2511_low_9
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (5-160)||(6199-6354)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (5-160)||(31396-31551)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (5-160)||(41293-41448)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (5-160)||(35015273-35015428)
chr6 (10-160)||(19983412-19983562)
chr6 (10-153)||(32898781-32898924)
chr6 (5-139)||(23994928-23995062)
chr6 (5-81)||(18583380-18583456)
chr6 (15-127)||(25744331-25744443)
chr6 (8-86)||(15742339-15742417)
chr6 (5-86)||(18002612-18002693)
chr6 (5-86)||(26089793-26089874)
chr6 (10-105)||(13014822-13014917)
chr6 (10-131)||(22440948-22441068)
chr6 (10-153)||(31628259-31628402)
chr6 (10-145)||(18777145-18777280)
chr6 (10-145)||(18570278-18570413)
chr6 (10-131)||(18432656-18432777)
chr6 (10-131)||(16086030-16086151)
chr6 (10-81)||(16106579-16106650)
chr6 (162-206)||(10266864-10266908)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-154)||(567-716)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (5-160)||(24716978-24717133)
chr8 (5-160)||(41506925-41507080)
chr8 (5-152)||(39115267-39115414)
chr8 (10-127)||(22234916-22235033)
chr8 (10-153)||(41246649-41246792)
chr8 (10-127)||(19993167-19993284)
chr8 (5-145)||(274442-274582)
chr8 (5-145)||(641267-641407)
chr8 (5-145)||(827073-827213)
chr8 (5-145)||(16038997-16039137)
chr8 (10-145)||(20481604-20481739)
chr8 (10-118)||(37611694-37611802)
chr8 (10-141)||(20573305-20573436)
chr8 (83-160)||(29759926-29760003)
chr8 (6-144)||(20647938-20648076)
chr8 (10-144)||(20654018-20654152)
chr8 (5-51)||(24385868-24385914)
chr8 (6-70)||(20561740-20561804)
chr8 (10-153)||(39446878-39447021)
chr8 (151-206)||(4437411-4437466)
chr8 (10-144)||(21681002-21681137)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (5-160)||(126399-126554)
chr7 (5-152)||(32494162-32494309)
chr7 (5-152)||(111385-111531)
chr7 (5-154)||(1937128-1937265)
chr7 (14-153)||(39046740-39046879)
chr7 (7-139)||(42056407-42056539)
chr7 (5-139)||(2190302-2190436)
chr7 (10-153)||(11287408-11287551)
chr7 (5-139)||(2028926-2029060)
chr7 (5-145)||(3049582-3049722)
chr7 (10-153)||(35094808-35094950)
chr7 (10-145)||(3895024-3895159)
chr7 (10-141)||(12758990-12759121)
chr7 (10-153)||(15822544-15822687)
chr7 (10-131)||(47289795-47289915)
chr7 (10-153)||(12248233-12248377)
chr7 (10-86)||(44865288-44865364)
chr7 (10-153)||(7284173-7284315)
chr7 (10-80)||(143703-143773)
chr7 (10-152)||(26070377-26070519)
chr7 (10-152)||(26094164-26094306)
chr7 (10-153)||(13274778-13274922)
chr7 (36-141)||(45452305-45452410)
chr7 (10-81)||(12369953-12370024)
chr7 (10-151)||(49047786-49047928)
chr7 (168-209)||(47118258-47118299)
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (5-160)||(17956100-17956255)
chr3 (5-160)||(30152926-30153081)
chr3 (5-152)||(45581623-45581770)
chr3 (5-153)||(33341873-33342020)
chr3 (5-153)||(54685417-54685564)
chr3 (5-152)||(54038240-54038387)
chr3 (5-129)||(7853997-7854121)
chr3 (10-153)||(16996172-16996315)
chr3 (10-153)||(50112164-50112307)
chr3 (10-124)||(317621-317735)
chr3 (10-127)||(19570801-19570918)
chr3 (10-153)||(22144385-22144528)
chr3 (5-139)||(16261458-16261592)
chr3 (5-139)||(3992555-3992689)
chr3 (5-139)||(53771046-53771180)
chr3 (5-145)||(23492372-23492512)
chr3 (5-139)||(2844196-2844330)
chr3 (10-139)||(6154444-6154572)
chr3 (10-131)||(12349843-12349963)
chr3 (10-153)||(13817506-13817646)
chr3 (5-145)||(38167913-38168053)
chr3 (17-127)||(16182065-16182175)
chr3 (10-145)||(17100652-17100787)
chr3 (10-145)||(17101337-17101472)
chr3 (10-123)||(6146859-6146972)
chr3 (10-141)||(17523002-17523134)
chr3 (10-141)||(35123699-35123830)
chr3 (10-153)||(14295429-14295573)
chr3 (10-81)||(12349652-12349723)
chr3 (10-141)||(14298424-14298555)
chr3 (10-141)||(14304051-14304182)
chr3 (10-145)||(19260952-19261087)
chr3 (5-63)||(34439451-34439509)
chr3 (10-80)||(54424076-54424146)
chr3 (10-131)||(53898568-53898689)
chr3 (44-153)||(55440996-55441105)
chr3 (17-153)||(11329081-11329217)
chr3 (10-153)||(14301056-14301200)
chr3 (10-145)||(17139507-17139643)
chr3 (69-152)||(28558198-28558282)
chr3 (5-44)||(28558271-28558310)
chr3 (167-206)||(29924482-29924521)
chr3 (167-206)||(29973635-29973674)
chr3 (10-153)||(14528124-14528268)
chr3 (23-81)||(12560362-12560420)
chr3 (22-131)||(8631803-8631912)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (5-160)||(22367003-22367157)
chr1 (5-160)||(15861542-15861695)
chr1 (5-153)||(21860002-21860150)
chr1 (5-160)||(44035087-44035241)
chr1 (10-153)||(41212060-41212206)
chr1 (10-123)||(22403223-22403336)
chr1 (10-131)||(49967663-49967784)
chr1 (10-141)||(35522432-35522563)
chr1 (10-145)||(35054755-35054890)
chr1 (10-144)||(27329868-27330002)
chr1 (10-131)||(21718241-21718362)
chr1 (151-206)||(40368119-40368174)
chr1 (10-81)||(9784177-9784245)
chr1 (154-206)||(15883343-15883396)
chr1 (36-140)||(9784239-9784343)
chr1 (162-202)||(38339721-38339761)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (5-160)||(2031794-2031949)
chr5 (5-160)||(11342668-11342824)
chr5 (10-153)||(1168317-1168460)
chr5 (10-153)||(28261512-28261655)
chr5 (5-139)||(21204931-21205065)
chr5 (10-153)||(21397080-21397226)
chr5 (10-145)||(20712075-20712210)
chr5 (10-153)||(11584042-11584188)
chr5 (10-153)||(21646852-21646995)
chr5 (5-144)||(21650695-21650834)
chr5 (10-153)||(24475574-24475712)
chr5 (10-105)||(4865302-4865397)
chr5 (10-153)||(11337299-11337441)
chr5 (10-131)||(21906733-21906851)
chr5 (10-70)||(24183245-24183305)
chr5 (17-81)||(3673925-3673989)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (5-160)||(14951746-14951901)
chr4 (5-160)||(25119323-25119479)
chr4 (5-160)||(5682643-5682798)
chr4 (10-153)||(53704846-53704989)
chr4 (10-160)||(34395241-34395391)
chr4 (10-153)||(44055906-44056049)
chr4 (14-153)||(55376714-55376853)
chr4 (10-152)||(21959576-21959718)
chr4 (10-153)||(16732160-16732303)
chr4 (5-139)||(15272428-15272562)
chr4 (10-153)||(53907812-53907952)
chr4 (14-153)||(23270051-23270190)
chr4 (10-153)||(44346818-44346961)
chr4 (10-105)||(8872584-8872682)
chr4 (10-118)||(30457929-30458037)
chr4 (10-81)||(820029-820100)
chr4 (10-145)||(30232609-30232744)
chr4 (10-144)||(12837313-12837447)
chr4 (10-141)||(45458968-45459099)
chr4 (167-206)||(31444873-31444912)
chr4 (171-206)||(37312277-37312312)
chr4 (169-206)||(6488222-6488259)
chr4 (10-153)||(13809622-13809766)
chr4 (7-118)||(15044854-15044966)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (5-160)||(162294-162450)
scaffold0016 (5-160)||(166380-166528)
scaffold0016 (10-153)||(164206-164349)
[»] chr2 (24 HSPs)
chr2 (5-160)||(22274707-22274861)
chr2 (5-153)||(22283947-22284094)
chr2 (10-153)||(23836818-23836961)
chr2 (10-153)||(32465849-32465992)
chr2 (10-127)||(25876032-25876149)
chr2 (14-123)||(6879458-6879567)
chr2 (5-86)||(21274165-21274246)
chr2 (154-213)||(30110864-30110923)
chr2 (154-213)||(30122150-30122209)
chr2 (5-139)||(9653012-9653146)
chr2 (155-213)||(30077781-30077839)
chr2 (153-206)||(30018971-30019024)
chr2 (153-206)||(30041671-30041724)
chr2 (153-206)||(30046834-30046887)
chr2 (153-206)||(30137878-30137931)
chr2 (153-206)||(30235809-30235862)
chr2 (10-153)||(28974040-28974183)
chr2 (10-141)||(271173-271304)
chr2 (10-160)||(25602008-25602158)
chr2 (10-152)||(36890798-36890940)
chr2 (10-141)||(4448246-4448377)
chr2 (167-209)||(19000201-19000243)
chr2 (51-153)||(27261797-27261899)
chr2 (10-153)||(22579974-22580115)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (5-152)||(12636-12783)
scaffold0039 (37-152)||(19049-19164)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (5-145)||(79863-80003)
scaffold0034 (10-118)||(46191-46299)
scaffold0034 (10-118)||(40684-40792)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (33-160)||(30075-30202)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (10-153)||(70735-70878)
scaffold0001 (17-141)||(60809-60933)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (10-153)||(132363-132506)
scaffold0021 (10-145)||(88274-88409)
scaffold0021 (11-153)||(11678-11821)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (10-127)||(32220-32337)
scaffold0091 (10-127)||(41966-42083)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (10-153)||(38289-38432)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (10-153)||(254927-255070)
scaffold0011 (10-153)||(261533-261676)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (5-139)||(13502-13636)
scaffold0251 (5-139)||(21476-21610)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (5-139)||(14954-15088)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (5-152)||(1094-1242)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (5-145)||(17520-17660)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (10-153)||(5359-5502)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (10-127)||(14894-15008)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-152)||(15584-15729)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (10-153)||(22682-22825)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (5-139)||(55586-55720)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (5-145)||(6659-6799)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (10-153)||(6958-7104)
scaffold0673 (10-153)||(935-1078)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (10-153)||(85323-85466)
scaffold0014 (6-81)||(159362-159438)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (10-128)||(11821-11939)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (10-131)||(7582-7703)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (5-145)||(9623-9763)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (5-145)||(94974-95114)
scaffold0037 (10-145)||(24841-24976)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (10-153)||(689-832)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (10-153)||(1308-1451)
scaffold0359 (10-81)||(11767-11838)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (10-153)||(9928-10071)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (10-160)||(253102-253252)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (5-139)||(186642-186775)
scaffold0004 (5-139)||(193604-193737)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (17-145)||(10094-10222)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (17-153)||(109582-109718)
scaffold0035 (10-153)||(118076-118219)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (10-153)||(631-774)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (10-153)||(21503-21646)
scaffold0120 (10-153)||(31202-31345)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (10-160)||(5-155)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (10-131)||(157-278)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (10-142)||(146603-146735)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (10-153)||(8978-9121)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (5-145)||(144-284)
scaffold0303 (5-35)||(4563-4593)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (10-83)||(4346-4419)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-153)||(112658-112798)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (10-141)||(11681-11812)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (36-153)||(3291-3407)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (5-118)||(48173-48286)
scaffold0068 (5-118)||(61621-61734)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-118)||(4967-5075)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (10-81)||(25021-25092)
scaffold0158 (10-81)||(25274-25345)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (6-113)||(33693-33800)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (10-153)||(1372-1515)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (10-153)||(227-369)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (6-81)||(89578-89653)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (72-160)||(24372-24460)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (10-153)||(33840-33983)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (10-81)||(70676-70748)


Alignment Details
Target: scaffold0686 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 6199 - 6354
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  6199 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatga 6298  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  6299 tgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 6354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 31396 - 31551
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  31396 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 31495  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31496 tgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgtt 31551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41448 - 41293
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41448 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 41349  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41348 tgatacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgtt 41293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 35015273 - 35015428
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  35015273 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 35015372  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  35015373 tgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 35015428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 19983412 - 19983562
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19983412 tatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgata 19983511  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  19983512 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgtt 19983562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32898924 - 32898781
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  32898924 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32898825  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     ||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  32898824 aatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 32898781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23995062 - 23994928
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  23995062 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 23994963  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  23994962 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 23994928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 18583456 - 18583380
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  18583456 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg 18583380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744443
Alignment:
Q  15 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatga 114  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||     
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  115 cttgagtttgcat 127  Q
    |||| ||||||||    
T  25744431 cttgggtttgcat 25744443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 15742339 - 15742417
Alignment:
Q  8 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  15742339 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 15742417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 18002612 - 18002693
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt 86  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  18002612 taaattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 18002693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26089874 - 26089793
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  26089874 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 26089793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 13014822 - 13014917
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  13014822 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgat 13014917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22441068 - 22440948
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  22441068 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 22440969  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| | ||||||||||    
T  22440968 catggcttg-ggttgcatgatt 22440948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31628402 - 31628259
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  31628402 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 31628303  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  31628302 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatg 31628259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18777280 - 18777145
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  18777280 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18777181  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18777180 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 18777145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 18570413 - 18570278
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  || |||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  18570413 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 18570314  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| | || || ||||||||| |||||||||||||    
T  18570313 catggcctgggtatgcatgattcataatttgttgtt 18570278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18432777 - 18432656
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | || ||||| || |  || || || |||||||| ||     
T  18432777 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataatt 18432678  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  18432677 catggcttgggtttgcatgatt 18432656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16086151 - 16086030
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| | | |||||||| || |  ||||| || || ||||| ||     
T  16086151 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataatt 16086052  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16086051 catgacttgggtttgcatgatt 16086030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16106650 - 16106579
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | | ||||||||    
T  16106650 tatgcttaattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttg 16106579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10266908 - 10266864
Alignment:
Q  162 agttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10266908 agtttgttataatttgaaagtaacaaacatttatatatatacttt 10266864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 567 - 716
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  567 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatga 666  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatgg 154  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  667 tgatacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatgg 716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 24716978 - 24717133
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24716978 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatga 24717077  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||    
T  24717078 tgatacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgtt 24717133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 41506925 - 41507080
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41506925 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 41507024  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    | || |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  41507025 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 41507080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 39115414 - 39115267
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  39115414 taaattatgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 39115315  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  39115314 taattcatgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 22234916 - 22235033
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  22234916 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 22235015  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    ||||  ||| ||||||||    
T  22235016 catggattgggtttgcat 22235033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41246792 - 41246649
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  41246792 tatgcttaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 41246693  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  41246692 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 41246649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 19993167 - 19993284
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  19993167 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 19993266  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| || | ||||||||    
T  19993267 catggctagggtttgcat 19993284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 274582 - 274442
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||| ||| || || | ||||     
T  274582 taaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgc 274483  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  274482 taattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgtt 274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 641267 - 641407
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||| ||| || || | ||||     
T  641267 taaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgc 641366  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  641367 taattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgtt 641407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 827073 - 827213
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  |||| ||| || || | ||||     
T  827073 taaattatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgc 827172  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  827173 taattcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgtt 827213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 16038997 - 16039137
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  16038997 taaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 16039096  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | ||  ||| ||||  | ||||||||| |||||||||||||    
T  16039097 taatttatggcttggatatgcatgattcataatttgttgtt 16039137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20481739 - 20481604
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||| | ||     
T  20481739 tatgctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20481640  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  20481639 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 20481604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 37611802 - 37611694
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |  |||||||| ||     
T  37611802 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataatt 37611703  T
Q  110 catgacttg 118  Q
    |||| ||||    
T  37611702 catggcttg 37611694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 20573305 - 20573436
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  20573305 tatgctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 20573404  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  20573405 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 20573436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 29760003 - 29759926
Alignment:
Q  83 tgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  29760003 tgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgtt 29759926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 144
Target Start/End: Original strand, 20647938 - 20648076
Alignment:
Q  6 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgat 105  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||| || |  ||||| || |||||| |    
T  20647938 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgtt 20648037  T
Q  106 gatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
     || |||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  20648038 aatccatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 20648076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 20654018 - 20654152
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||| || |  ||||| || |||||| | ||     
T  20654018 tatgcttaattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatt 20654117  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
    |||  |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  20654118 cattgcttgggtttgcatgattcatgatttgttgt 20654152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Original strand, 24385868 - 24385914
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgt 51  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24385868 taaattatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaattgt 24385914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 20561740 - 20561804
Alignment:
Q  6 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaat 70  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20561740 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 39446878 - 39447021
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || ||||| || ||    
T  39446878 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 39446977  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  39446978 tcatggcttgggtatgcatga-ttatgatttgttgttgagaaatg 39447021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4437466 - 4437411
Alignment:
Q  151 atggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4437466 atggtttattaggtttgttacaatttaaaaatcacaaacatctatatttatacttt 4437411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21681137 - 21681002
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaa-ttatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| | |||||||  || |  || || || |||||||| ||    
T  21681137 tatgctcaattggttaaattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataat 21681038  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
     |||| |||| || ||||||||| || |||||||||    
T  21681037 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgt 21681002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 126554 - 126399
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  126554 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatga 126455  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  126454 tgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 126399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 32494162 - 32494309
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  32494162 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatga 32494261  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32494262 taattcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaat 32494309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 111385 - 111531
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  111385 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 111484  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  111485 taattcatggcttgggtatgcatgattca-aatttgttgttgagaaat 111531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 1937128 - 1937265
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1937128 taaattatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaattatgat------------caatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatga 1937215  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatgg 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  1937216 tgatacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatgg 1937265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046879
Alignment:
Q  14 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  114 acttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||||||| |||  | || ||||||| |||||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatg 39046879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Original strand, 42056407 - 42056539
Alignment:
Q  7 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |  ||| |     
T  42056407 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgcta 42056506  T
Q  107 atacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  42056507 attcatggcttgggtatgcatgattcataattt 42056539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 2190302 - 2190436
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| || |||| ||| || || | ||||     
T  2190302 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgc 2190401  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  2190402 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 2190436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11287551 - 11287408
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  11287551 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11287452  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  11287451 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 11287408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2029060 - 2028926
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| | |||| ||| || || | ||||     
T  2029060 taaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgc 2028961  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || ||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  2028960 taattcatgacttgggtatgcatgattcataattt 2028926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3049722 - 3049582
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  3049722 taaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgt 3049623  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3049622 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 3049582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35094950 - 35094808
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |      
T  35094950 tatgctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaat-gttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaat 35094852  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| |||||||    
T  35094851 catggcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatg 35094808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3895159 - 3895024
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  3895159 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 3895060  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3895059 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 3895024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 12759121 - 12758990
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||     
T  12759121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataatt 12759022  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  12759021 catggcttgggtttgcaggatttatgatttgt 12758990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 15822544 - 15822687
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  15822544 tatgctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 15822643  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||    
T  15822644 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatg 15822687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 47289915 - 47289795
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||| |||| |||||| ||  ||||||| ||     
T  47289915 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataatt 47289816  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| | ||||||||||    
T  47289815 catggcttgtg-ttgcatgatt 47289795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 12248233 - 12248377
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||| || | ||| || || | |||||| ||    
T  12248233 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataat 12248332  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  12248333 gcatgacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 12248377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 44865364 - 44865288
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  44865364 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgtt 44865288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 7284173 - 7284315
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || ||||| || ||     
T  7284173 tatgcttaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataatt 7284272  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  7284273 catggcttgagtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 7284315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 143773 - 143703
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgtt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||    
T  143773 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgtt 143703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 26070377 - 26070519
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || | |||||| ||     
T  26070377 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26070476  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    |||| |||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  26070477 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 26070519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 26094164 - 26094306
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || | |||||| ||     
T  26094164 tatgcttaattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 26094263  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    |||| |||| || ||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  26094264 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaat 26094306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13274922 - 13274778
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || |||||||||||    
T  13274922 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgat 13274823  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||  || ||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  13274822 tcatggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatg 13274778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 141
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452410
Alignment:
Q  36 gttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttata 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||| |||| ||| |||||||| ||     
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  136 atttgt 141  Q
    ||||||    
T  45452405 atttgt 45452410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 12369953 - 12370024
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||| || ||| | ||||||||    
T  12369953 tatgctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttg 12370024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 151
Target Start/End: Original strand, 49047786 - 49047928
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || ||| |||| ||    
T  49047786 tatgctcaattggttgaattatgttatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataat 49047885  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaa 151  Q
     |||| |||| || ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  49047886 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaa 49047928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47118299 - 47118258
Alignment:
Q  168 ttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatactttgaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  47118299 ttataatttgaaagtcacaattatctatacttatactttgaa 47118258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 17956100 - 17956255
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17956100 taaattatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 17956199  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  17956200 tgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 17956255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30153081 - 30152926
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30153081 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 30152982  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  30152981 tgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 30152926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45581770 - 45581623
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  45581770 taaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 45581671  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45581670 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaat 45581623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 33342020 - 33341873
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  33342020 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 33341921  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    | || |||| |||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  33341920 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 33341873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Original strand, 54685417 - 54685564
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  54685417 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 54685516  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    | || |||| ||||  ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  54685517 taattcatggcttggatttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 54685564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 54038240 - 54038387
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  54038240 taaattatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatga 54038339  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54038340 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaat 54038387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 7854121 - 7853997
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  7854121 taaattatgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 7854022  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatga 129  Q
    | || |||| |||| ||||||||||    
T  7854021 taattcatggcttgggtttgcatga 7853997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 16996172 - 16996315
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  16996172 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 16996271  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  16996272 catggcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 16996315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 50112164 - 50112307
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  50112164 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 50112263  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  50112264 catggcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatg 50112307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 124
Target Start/End: Original strand, 317621 - 317735
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  317621 tatgctaaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 317720  T
Q  110 catgacttgagtttg 124  Q
    |||| ||||||||||    
T  317721 catggcttgagtttg 317735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 19570801 - 19570918
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  19570801 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 19570900  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19570901 catggcttgagtttgcat 19570918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 22144385 - 22144528
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||| || |||||||| |||    
T  22144385 tatgctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataata 22144484  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||    
T  22144485 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatg 22144528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16261592 - 16261458
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  16261592 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 16261493  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  16261492 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 16261458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3992689 - 3992555
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  3992689 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 3992590  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  3992589 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 3992555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53771180 - 53771046
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  53771180 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 53771081  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  53771080 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 53771046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23492512 - 23492372
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  23492512 taaattatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 23492413  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||| |||||||||    
T  23492412 taattcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgtt 23492372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2844330 - 2844196
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  2844330 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 2844231  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  2844230 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 2844196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 139
Target Start/End: Original strand, 6154444 - 6154572
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||     
T  6154444 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataatt 6154543  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    |||| |||| | |||||||||| |||||||    
T  6154544 catggcttg-ggttgcatgattcataattt 6154572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 12349843 - 12349963
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  12349843 tatgctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 12349942  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| | ||||||||||    
T  12349943 catggcttg-ggttgcatgatt 12349963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13817646 - 13817506
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  13817646 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 13817550  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  13817549 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 13817506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 38168053 - 38167913
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  38168053 taaattatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgt 38167954  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  38167953 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 38167913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182175
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgact 116  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||| || |||| ||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  117 tgagtttgcat 127  Q
    || ||||||||    
T  16182165 tgggtttgcat 16182175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17100787 - 17100652
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  17100787 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17100688  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  17100687 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 17100652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17101472 - 17101337
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||| ||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  17101472 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 17101373  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  17101372 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 17101337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 6146859 - 6146972
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||| |||| |||||| || ||||| || ||     
T  6146859 tatgctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataatt 6146958  T
Q  110 catgacttgagttt 123  Q
    |||| |||| ||||    
T  6146959 catggcttgggttt 6146972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 17523002 - 17523134
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtc-atatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||| || | |||| || || |||||||| ||    
T  17523002 tatgctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataat 17523101  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
     |||| |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17523102 tcatggcttgggtttgcatgatttatgatttgt 17523134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35123830 - 35123699
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  35123830 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 35123731  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    ||||  ||| |||||||||||| || ||||||    
T  35123730 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgt 35123699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14295573 - 14295429
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| |  | ||| || || |||||||| ||    
T  14295573 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataat 14295474  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  14295473 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 14295429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 12349652 - 12349723
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  12349652 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 12349723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14298555 - 14298424
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  |  |  ||||| || |||||||| ||     
T  14298555 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14298456  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  14298455 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 14298424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14304182 - 14304051
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  |  |  ||||| || |||||||| ||     
T  14304182 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataatt 14304083  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  14304082 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 14304051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 19260952 - 19261087
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| | | || || |  ||| | ||     
T  19260952 tatgctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaatt 19261051  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19261052 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 19261087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439509
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcat 63  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcat 34439509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 54424146 - 54424076
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgtt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  54424146 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgtt 54424076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 53898568 - 53898689
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| || |  ||||| || ||| |||| ||     
T  53898568 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataatt 53898667  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||| ||||    
T  53898668 catggcttgggtttgcaagatt 53898689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441105
Alignment:
Q  44 tgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttg 143  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| | ||| || || |||||||| || ||||||||| || ||||| ||| || |||| |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  144 ttcagaaatg 153  Q
    || |||||||    
T  55441096 ttgagaaatg 55441105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329217
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgact 116  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || |||||||| || |||| ||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  117 tgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || || ||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatg 11329217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14301200 - 14301056
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| |  | ||| || || |||||||| ||    
T  14301200 tatgctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattat 14301101  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  14301100 tcatgtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatg 14301056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 17139643 - 17139507
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || |||||||| ||    
T  17139643 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataat 17139544  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
     |||| |||| || ||||||||| || ||||||||||    
T  17139543 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtt 17139507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558198
Alignment:
Q  69 atggttgttg-ttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaat 28558198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 28558310 - 28558271
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 44  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558310 taaatgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 206
Target Start/End: Original strand, 29924482 - 29924521
Alignment:
Q  167 gttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29924482 gttataatttgaaagtcacaaacatctataattatacttt 29924521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 206
Target Start/End: Original strand, 29973635 - 29973674
Alignment:
Q  167 gttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29973635 gttataatttgaaagtcacaaacatctataattatacttt 29973674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 14528124 - 14528268
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || |||||| | ||    
T  14528124 tatgctcaattggttgaatcatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaat 14528223  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||| || || |||||| || |||||||||| |||||||    
T  14528224 tcatggcttgggtatgaatgattcatgatttgttgttgagaaatg 14528268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 81
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560420
Alignment:
Q  23 tgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttg 12560420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631803
Alignment:
Q  22 gtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagt 121  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||| |  ||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||| |||| ||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  122 ttgcatgatt 131  Q
    ||||||||||    
T  8631812 ttgcatgatt 8631803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22367157 - 22367003
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22367157 taaattatgctcaattggtgaat-atgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 22367059  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  22367058 tgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 22367003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 15861542 - 15861695
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  15861542 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgtt--tgtttagtcatattgttgatga 15861639  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  15861640 tgatgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 15861695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21860150 - 21860002
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21860150 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 21860051  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21860050 tgatacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatg 21860002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 44035087 - 44035241
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  44035087 taaattatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatga 44035186  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  44035187 tgata-atggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgtt 44035241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41212206 - 41212060
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaa---tggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  41212206 tatgctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 41212107  T
Q  107 atacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  41212106 attcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 41212060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 22403223 - 22403336
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  22403223 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 22403322  T
Q  110 catgacttgagttt 123  Q
    |||| |||| ||||    
T  22403323 catggcttgggttt 22403336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 49967784 - 49967663
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  49967784 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 49967685  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||  |||  ||||||||||||    
T  49967684 cattgcttcggtttgcatgatt 49967663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 35522432 - 35522563
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  35522432 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataatt 35522531  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  35522532 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 35522563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35054890 - 35054755
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  35054890 tatgctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 35054791  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  35054790 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 35054755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 27329868 - 27330002
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  27329868 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 27329967  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  27329968 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgt 27330002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21718362 - 21718241
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  21718362 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 21718263  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  21718262 catggcttgggtttgcatgatt 21718241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 206
Target Start/End: Original strand, 40368119 - 40368174
Alignment:
Q  151 atggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40368119 atggtttgttgggtttgttataatttgaaagtcacaaacatctatacctatacttt 40368174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 9784177 - 9784245
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  9784177 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 9784245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 154 - 206
Target Start/End: Original strand, 15883343 - 15883396
Alignment:
Q  154 gtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatct-atatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  15883343 gtttgttaagtttattataatttgaaattcacaaacatctaatattaatacttt 15883396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 140
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784343
Alignment:
Q  36 gttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttata 135  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||| |||| | |||||||||| ||     
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  136 atttg 140  Q
    |||||    
T  9784339 atttg 9784343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38339761 - 38339721
Alignment:
Q  162 agttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttata 202  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38339761 agtttgttataatttgaaagtcacaaatatctatacttata 38339721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2031949 - 2031794
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2031949 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatga 2031850  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    | || |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  2031849 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 2031794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11342824 - 11342668
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg-atgtttagtcatatttttgatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  11342824 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatg 11342725  T
Q  104 atgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  11342724 atgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 11342668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 1168317 - 1168460
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  1168317 tatgctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 1168416  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1168417 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 1168460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28261655 - 28261512
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||     
T  28261655 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataatt 28261556  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  28261555 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 28261512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21205065 - 21204931
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||| || || || ||      
T  21205065 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattc 21204966  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  21204965 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 21204931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21397226 - 21397080
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttg---ttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   ||| |||| |||||| || ||||||||     
T  21397226 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgata 21397127  T
Q  107 atacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || |||| |||| |||||||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  21397126 attcatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatg 21397080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20712210 - 20712075
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||| | ||     
T  20712210 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaatt 20712111  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  20712110 catggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 20712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11584188 - 11584042
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  11584188 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgata 11584089  T
Q  107 atacatgacttgag-tttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || |||| |||| | ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  11584088 attcatggcttgggttttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 11584042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 21646852 - 21646995
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||  | |||||||| ||     
T  21646852 tatgttcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatgttgatgataatt 21646951  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| ||||| || |||  |  ||||||||| |||||||    
T  21646952 catggcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatg 21646995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 21650834 - 21650695
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  21650834 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 21650735  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
    | || ||||  ||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  21650734 taattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgt 21650695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 24475712 - 24475574
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  24475712 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 24475618  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  24475617 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 24475574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4865397 - 4865302
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | | |||||| |||| || ||||||||    
T  4865397 tatgctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgat 4865302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 11337299 - 11337441
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| |  |||||||| ||     
T  11337299 tatgctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataatt 11337398  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || | |||||||| |||||||    
T  11337399 catggcttgagtttacatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 11337441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 21906851 - 21906733
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||| ||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  21906851 tatgttcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 21906755  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  21906754 catggcttgggtttgcatgatt 21906733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 70
Target Start/End: Original strand, 24183245 - 24183305
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaat 70  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  24183245 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaat 24183305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673925
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 3673925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14951901 - 14951746
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||    
T  14951901 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatga 14951802  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  14951801 tgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 14951746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 25119323 - 25119479
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  25119323 taaattatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataa 25119422  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataa-tttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  25119423 tgatacatggcttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgtt 25119479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 5682643 - 5682798
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | |||| ||||||| |||||||    
T  5682643 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatga 5682742  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  5682743 tgatatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 5682798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 53704846 - 53704989
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  53704846 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 53704945  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  53704946 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 53704989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 34395391 - 34395241
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  34395391 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataatt 34395292  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  34395291 catggcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 34395241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44056049 - 44055906
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  |||||| ||| || |||||||| ||     
T  44056049 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataatt 44055950  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  44055949 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 44055906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 55376714 - 55376853
Alignment:
Q  14 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatg 113  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| | | || || |||||||| || ||||    
T  55376714 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataattcatg 55376813  T
Q  114 acttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  55376814 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 55376853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 21959576 - 21959718
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  21959576 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 21959675  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    |||| |||| | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||    
T  21959676 catggcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16732303 - 16732160
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  16732303 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 16732204  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  16732203 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 16732160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 15272428 - 15272562
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  15272428 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 15272527  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  15272528 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 15272562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 53907812 - 53907952
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||| || |||||||| ||     
T  53907812 tatgcccaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaattgttgttgttga---ttagtcatgttgttgatgataatt 53907908  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  53907909 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 53907952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 153
Target Start/End: Original strand, 23270051 - 23270190
Alignment:
Q  14 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| || ||||    
T  23270051 ctcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 23270150  T
Q  114 acttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||    
T  23270151 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatg 23270190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44346961 - 44346818
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||| || |  |||||||| ||     
T  44346961 tatgctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataatt 44346862  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  44346861 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 44346818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 8872584 - 8872682
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt---tagtcatatttttgatgat 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||   ||||||| || ||||||||    
T  8872584 tatgctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgat 8872682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 30458037 - 30457929
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| |  |||||||| ||     
T  30458037 tatgctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataatt 30457938  T
Q  110 catgacttg 118  Q
    |||| ||||    
T  30457937 catggcttg 30457929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 820029 - 820100
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  820029 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttg 820100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 30232609 - 30232744
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  30232609 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 30232708  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    |||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  30232709 catggcttgggtatgcattattcataatttgttgtt 30232744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 12837313 - 12837447
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  12837313 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 12837412  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgt 144  Q
    |||| |||| || ||||||||| || |||||||||    
T  12837413 catggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgt 12837447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 45458968 - 45459099
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||||| | |||| | |||||||| || |  ||||| || |||| ||| ||     
T  45458968 tatgttcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatc 45459067  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  45459068 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 45459099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 31444912 - 31444873
Alignment:
Q  167 gttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31444912 gttataatttgaaagtcgcaaacatttatatttatacttt 31444873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 206
Target Start/End: Original strand, 37312277 - 37312312
Alignment:
Q  171 taatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37312277 taatttgaaagtcataaacatctatatttatacttt 37312312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 169 - 206
Target Start/End: Original strand, 6488222 - 6488259
Alignment:
Q  169 tataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6488222 tataatttgaaagtaacaaacatttatatttatacttt 6488259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 13809622 - 13809766
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    ||||||||||| || |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | | | || || |||||||| ||    
T  13809622 tatgctcaattagttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataat 13809721  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| ||||  | ||||||||| || ||| |||||| |||||||    
T  13809722 tcatggcttggatatgcatgattcatgattggttgttgagaaatg 13809766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 15044966 - 15044854
Alignment:
Q  7 aattatgctcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgat 105  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||  ||||| | |||||||| || | ||| || || ||||||||    
T  15044966 aattatgctcaaattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgat 15044867  T
Q  106 gatacatgacttg 118  Q
    ||| |||| ||||    
T  15044866 gattcatggcttg 15044854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 162294 - 162450
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg-atgtttagtcatatttttgatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  162294 taaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatg 162393  T
Q  104 atgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  162394 atgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 162450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 166380 - 166528
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||   ||||| |||||||    
T  166380 taaattatgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg----tta---atattgttgatga 166472  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||    
T  166473 tgatacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgtt 166528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 164349 - 164206
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||     
T  164349 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaatt 164250  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  164249 catggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 164206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 24)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22274861 - 22274707
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22274861 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatga 22274762  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||| || | |||||||| |||||||| |||||    
T  22274761 tgatagatggcttg-ggttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgtt 22274707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22284094 - 22283947
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22284094 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatga 22283995  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||| |||||||    
T  22283994 tgatacatggcttg-ggttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatg 22283947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 23836818 - 23836961
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  23836818 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcattttgttgatgataatt 23836917  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||||||| |||||||| |||  | |||||||||| |||||||    
T  23836918 catgacttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatg 23836961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32465992 - 32465849
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  32465992 tatgctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32465893  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  32465892 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 32465849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 25876032 - 25876149
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||     
T  25876032 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataatt 25876131  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  25876132 catggcttgggtttgcat 25876149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 6879567 - 6879458
Alignment:
Q  14 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||    
T  6879567 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataatacatg 6879468  T
Q  114 acttgagttt 123  Q
     |||| ||||    
T  6879467 tcttgggttt 6879458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 86
Target Start/End: Original strand, 21274165 - 21274246
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtt 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  21274165 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgtt 21274246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30110923 - 30110864
Alignment:
Q  154 gtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatactttgaactaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30110923 gtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttttaactaa 30110864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 30122209 - 30122150
Alignment:
Q  154 gtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatactttgaactaa 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30122209 gtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttttaactaa 30122150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 9653012 - 9653146
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||| || |||| ||| || || | ||||     
T  9653012 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgc 9653111  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  9653112 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 9653146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 213
Target Start/End: Original strand, 30077781 - 30077839
Alignment:
Q  155 tttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatactttgaactaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30077781 tttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttttaactaa 30077839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Original strand, 30018971 - 30019024
Alignment:
Q  153 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30018971 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 30019024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30041724 - 30041671
Alignment:
Q  153 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30041724 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 30041671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30046887 - 30046834
Alignment:
Q  153 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30046887 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 30046834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30137931 - 30137878
Alignment:
Q  153 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30137931 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 30137878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 30235862 - 30235809
Alignment:
Q  153 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235862 ggtttgttaagttggttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatacttt 30235809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 28974183 - 28974040
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  28974183 tatgctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 28974084  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||| | |||||||    
T  28974083 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatg 28974040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 271304 - 271173
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  271304 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 271205  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||  |||| |||||||||||| || ||||||    
T  271204 catagcttgggtttgcatgattcatgatttgt 271173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25602158 - 25602008
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||| ||||||   || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || || ||||| |      
T  25602158 tatgctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaat 25602059  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||| |||  |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  25602058 catggcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 25602008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 36890798 - 36890940
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || | ||| || || | |||||| ||     
T  36890798 tatgcttaattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattatt 36890897  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    |||| |||| || |||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  36890898 catggcttgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaat 36890940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 4448246 - 4448377
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  4448246 tatgttcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 4448345  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    |||| |||| |||||||||||| || ||||||    
T  4448346 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgt 4448377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Original strand, 19000201 - 19000243
Alignment:
Q  167 gttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatactttgaa 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19000201 gttataatttgaaagtcacaaacatctatatttatattttgaa 19000243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 51 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 27261899 - 27261797
Alignment:
Q  51 tgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaa 150  Q
    ||||| ||||||| |||||| | | |||||| || | |||||| || |||||||| || |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  27261899 tgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaagaa 27261800  T
Q  151 atg 153  Q
    |||    
T  27261799 atg 27261797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 22579974 - 22580115
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || || |  || || || |||||||| ||    
T  22579974 tatgctcaattggttgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataat 22580070  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||| || ||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  22580071 tcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgtggagaaatg 22580115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 12636 - 12783
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  12636 taaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 12735  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12736 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaat 12783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 152
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19164
Alignment:
Q  37 ttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||| || ||||||||| ||||    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  137 tttgttgttcagaaat 152  Q
    ||||||||| ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaat 19164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 80003 - 79863
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  80003 taaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatga 79904  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  79903 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 79863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 46299 - 46191
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |  | ||| ||||| ||| |||||||     
T  46299 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgatt 46200  T
Q  110 catgacttg 118  Q
    |||| ||||    
T  46199 catggcttg 46191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 40792 - 40684
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || | ||| ||||| ||| |||||||     
T  40792 tatgctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgatt 40693  T
Q  110 catgacttg 118  Q
    |||| ||||    
T  40692 catggcttg 40684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30202 - 30075
Alignment:
Q  33 atggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgattt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||     
T  30202 atggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc 30103  T
Q  133 ataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    || |||||||||| |||||||| |||||    
T  30102 atgatttgttgttgagaaatggattgtt 30075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 70735 - 70878
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  70735 tatgctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 70834  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  70835 catgacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 70878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 60933 - 60809
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgact 116  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||||||    
T  60933 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 60834  T
Q  117 tgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    || |||||||||||| || ||||||    
T  60833 tgggtttgcatgattcatgatttgt 60809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 132363 - 132506
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  132363 tatgctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 132462  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  132463 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 132506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 88409 - 88274
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| || |||| ||| || || | |||| | ||     
T  88409 tatgatcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaatt 88310  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| || ||||||||  |||||||||||||    
T  88309 cttggcttgggtatgcatgatccataatttgttgtt 88274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11821 - 11678
Alignment:
Q  11 atgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | ||| |  || |||||||| ||     
T  11821 atgctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataatt 11722  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||  | ||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  11721 catggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 11678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 32337 - 32220
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  32337 tatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 32238  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  32237 catggcttgggtttgcat 32220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Original strand, 41966 - 42083
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  41966 tatgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 42065  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  42066 catggcttgggtttgcat 42083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 38432 - 38289
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  38432 tatgctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 38333  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  38332 cataacttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 38289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 254927 - 255070
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  254927 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 255026  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  255027 catggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 255070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 261533 - 261676
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  261533 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 261632  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  261633 catggcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 261676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13636
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  13502 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 13601  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  13602 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 21476 - 21610
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  21476 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 21575  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  21576 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 21610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15088 - 14954
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  15088 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 14989  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  14988 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 14954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 152
Target Start/End: Original strand, 1094 - 1242
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  |||     
T  1094 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgc 1193  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataa-tttgttgttcagaaat 152  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  1194 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaat 1242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 17520 - 17660
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  17520 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 17619  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||    
T  17620 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgtt 17660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 5359 - 5502
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  5359 tatgctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 5458  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||  ||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  5459 catggtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 5502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15008 - 14894
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||     
T  15008 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataatt 14912  T
Q  110 catgacttgagtttgcat 127  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  14911 catggcttgggtttgcat 14894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Original strand, 15584 - 15729
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaa---tggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||| || | |||| |     
T  15584 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgcta 15683  T
Q  107 atacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaat 152  Q
    || |||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  15684 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaat 15729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22825 - 22682
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||     
T  22825 tatgctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataatt 22726  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  22725 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatg 22682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 55720 - 55586
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  55720 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 55621  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  55620 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 55586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 6659 - 6799
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| | | |||||| |||| ||| || || | ||||     
T  6659 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 6758  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  6759 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 6799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 6958 - 7104
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaa---tggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | |||||||||| ||||||||||| || ||||||||     
T  6958 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgata 7057  T
Q  107 atacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || |||| |||| |||||||| |||  |  ||||||||| |||||||    
T  7058 attcatggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatg 7104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 935 - 1078
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  935 tatgctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 1034  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  1035 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatg 1078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 85466 - 85323
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  85466 tatgcttaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 85367  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    ||||  ||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  85366 catggtttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 85323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159362
Alignment:
Q  6 aaattatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||   |||| || |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 159362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 128
Target Start/End: Original strand, 11821 - 11939
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  11821 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 11920  T
Q  110 catgacttgagtttgcatg 128  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11921 catggcttgagtttgcatg 11939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7703 - 7582
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| |||||| || |||||||| ||     
T  7703 tatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 7604  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  7603 catggcttgggtttgcatgatt 7582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 9623 - 9763
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| |  || | ||||     
T  9623 taaattatgctcaattagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgc 9722  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  9723 taattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 9763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 95114 - 94974
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || | ||||     
T  95114 taaattatgctcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgc 95015  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || ||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  95014 taattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtt 94974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 24841 - 24976
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | |||| | ||     
T  24841 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaatt 24940  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| || | ||||||| |||||||||||||    
T  24941 cttggcttgggtattcatgattcataatttgttgtt 24976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 689 - 832
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  689 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 788  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  789 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1451 - 1308
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  1451 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcatt 1352  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1351 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Original strand, 11767 - 11838
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||    
T  11767 tatgctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttg 11838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10071 - 9928
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  10071 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattatt 9972  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||  |||||||    
T  9971 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatg 9928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Original strand, 253102 - 253252
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||     
T  253102 tatgctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataatt 253201  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    || | |||| |||||||||||| || |||| ||| | |||||||| |||||    
T  253202 caaggcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgtt 253252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 186642 - 186775
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  186642 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 186740  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  186741 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 186775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 193604 - 193737
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  193604 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 193702  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataattt 139  Q
    | || |||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  193703 taattcatggcttgggtatgcatgattcataattt 193737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 10094 - 10222
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgact 116  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| || || | |||| | || |||| ||    
T  10094 aattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggct 10193  T
Q  117 tgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||    
T  10194 tgggtatgcatgattcataatttgttgtt 10222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 153
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109718
Alignment:
Q  17 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgact 116  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| || |||| ||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  117 tgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    || | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 109718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 118076 - 118219
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  118076 tatgttcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 118175  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| | |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  118176 catggcttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 118219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 631 - 774
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |  | |||||| || |||||||| ||     
T  631 tatgctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataatt 730  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||||    
T  731 catggcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21646 - 21503
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| || | | | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  21646 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 21547  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  21546 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatg 21503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 31345 - 31202
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||| |||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  31345 tatgctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 31246  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31245 catggcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatg 31202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 5
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  155 tatgctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataatt 56  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||| |||| ||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||    
T  55 catggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgtt 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 278 - 157
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  278 tatgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 179  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatt 131  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  178 catggcttgggtttgcatgatt 157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 146735 - 146603
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||| ||| || || |  ||| | ||     
T  146735 tatgctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaatt 146636  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgtt 142  Q
    |||| |||| || ||||||||| ||||||||||    
T  146635 catggcttgggtatgcatgattcataatttgtt 146603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8978
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||| ||||||  |||| | | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  9121 tatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 9022  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  9021 catggcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatg 8978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 144 - 284
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| ||||||| ||||||   |||||||| |||| ||| || || | ||||     
T  144 taaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatgatcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgc 243  T
Q  105 tgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgtt 145  Q
    | || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  244 taattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgtt 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 35
Target Start/End: Original strand, 4563 - 4593
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatg 35  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4563 taaattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4419 - 4346
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgat 83  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||    
T  4419 tatgttcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttgatgat 4346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 112658 - 112798
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| |||| |||||   | ||| |||| ||     
T  112658 tatgctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtca---tgttgttgataatt 112754  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  112755 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 112798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 11681 - 11812
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||   |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  11681 tatgcttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 11780  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgt 141  Q
    ||||||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  11781 catgacttgggtttgcataattcatgatttgt 11812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3291
Alignment:
Q  36 gttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttata 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||     
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  136 atttgttgttcagaaatg 153  Q
    | |||||||| |||||||    
T  3307 a-ttgttgttgagaaatg 3291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48173
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| || ||| |||| || ||| || |||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
Q  105 tgatacatgacttg 118  Q
    | || |||| ||||    
T  48186 taattcatggcttg 48173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61621
Alignment:
Q  5 taaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatga 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| || ||| |||| || ||| || |||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
Q  105 tgatacatgacttg 118  Q
    | || |||| ||||    
T  61634 taattcatggcttg 61621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5075 - 4967
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | |||||| || |||||||| ||     
T  5075 tatgcttaattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataatt 4976  T
Q  110 catgacttg 118  Q
    |||| ||||    
T  4975 catggcttg 4967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 25021
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  25092 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttg 25021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 25345 - 25274
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  25345 tatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 33800 - 33693
Alignment:
Q  6 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgat 105  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||| || | ||| ||||| ||| ||||    
T  33800 aaattatgtttaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgat 33701  T
Q  106 gatacatg 113  Q
    ||| ||||    
T  33700 gattcatg 33693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1515 - 1372
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||||||||| |||||||||    ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||| || || |  ||||| || |||||||| |      
T  1515 tatgctcaattgttgaattatgttatgtgattgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaat 1416  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1415 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatg 1372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 227 - 369
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgata 109  Q
    |||||| |||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||| || |||||| | |||||||| || |  ||||| || |||||||| ||     
T  227 tatgcttaattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 326  T
Q  110 catgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
    |||  |||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  327 catagcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatg 369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 81
Target Start/End: Original strand, 89578 - 89653
Alignment:
Q  6 aaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttg 89653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 160
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24460
Alignment:
Q  72 gttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgatacatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatggtttgtt 160  Q
    |||||||||| || |  ||||| || |||||||| || |||| |||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgtt 24460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 153
Target Start/End: Original strand, 33840 - 33983
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttgatgtttagtcatatttttgatgatgat 108  Q
    |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||| || | ||| || || ||||| || ||    
T  33840 tatgctaaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataat 33939  T
Q  109 acatgacttgagtttgcatgatttataatttgttgttcagaaatg 153  Q
     |||| |||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  33940 tcatggcttgggtatgcatga-ttatgatttgttgttgagaaatg 33983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 70748 - 70676
Alignment:
Q  10 tatgctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcattatcaatggttgttgttg 81  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  70748 tatgcttaattggttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University