View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2513_low_5 (Length: 453)
Name: NF2513_low_5
Description: NF2513
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2513_low_5 |
 | |
|
| [»] chr3 (6 HSPs) |
| |
|
| [»] chr7 (9 HSPs) |
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| [»] chr4 (11 HSPs) |
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| [»] chr5 (6 HSPs) |
| |
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| [»] chr8 (6 HSPs) |
| |
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| [»] chr6 (4 HSPs) |
| |
|
| [»] chr2 (6 HSPs) |
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| [»] chr1 (6 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0182 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 35871918 - 35871551
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35871918 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactgttataattattaaattagatagatt |
35871819 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
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|
|
| T |
35871818 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagtttaagaataatgagtca |
35871719 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaata |
385 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35871718 |
aatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaagacaaata |
35871619 |
T |
|
| Q |
386 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35871618 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccataacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
35871551 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 48267821 - 48267453
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48267821 |
aatggagggtaaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactgttataattattagattagatagatt |
48267722 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48267721 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactacatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
48267622 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaa-tatagaacacaaat |
384 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
48267621 |
aatttaatttatggaaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaattatagaagacaaat |
48267522 |
T |
|
| Q |
385 |
atataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48267521 |
atataattgatataaacacttatacattcaaccttaacgtcatactttcaaatatataaaatccatata |
48267453 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 52351211 - 52350942
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52351211 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
52351112 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52351111 |
catatttaatttataggaatatctttgaggtaccatgtcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
52351012 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52351011 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
52350942 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 95 - 281
Target Start/End: Original strand, 5883522 - 5883704
Alignment:
| Q |
95 |
taaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagattagatagaat |
194 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || | | |||||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5883522 |
taaataataacaacaaatttattaagaaggaatgataagttttgtaacttaaaattgcttgcattctcataattattaga-tagatatattagatagaat |
5883620 |
T |
|
| Q |
195 |
aagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatga |
281 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
5883621 |
aagaaagggtgagaa---gttatactatattgaagaatatatttttagaggtggcacatatgcataattataacttcagaataatga |
5883704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 52351274 - 52351213
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
52351274 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
52351213 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 54944894 - 54944974
Alignment:
| Q |
95 |
taaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagat |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
54944894 |
taaataataacaacaaatttattaagaagggatgataagttttgtaacttaaaattgattgcattctcataattattagat |
54944974 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Original strand, 47232391 - 47232756
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47232391 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttcaaattacttccagtgttataattattagattagatagatt |
47232490 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47232491 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgagagaatgattttttagaggtgacacatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
47232590 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaata |
385 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
47232591 |
aatttaattt-tgggaatatctttaaggtaccatatcatcataatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaagac-aata |
47232688 |
T |
|
| Q |
386 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47232689 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
47232756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 175 - 453
Target Start/End: Original strand, 39065761 - 39066039
Alignment:
| Q |
175 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaaga |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39065761 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgatgcatatgcataatcatagcttaaga |
39065860 |
T |
|
| Q |
275 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39065861 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatttcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
39065960 |
T |
|
| Q |
375 |
gaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39065961 |
gaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaaccttatactttcaaatatataaaatccatata |
39066039 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 25418232 - 25418501
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25418232 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
25418331 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25418332 |
catatttaatttataggaatatctttgaggtaccatgtcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
25418431 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25418432 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
25418501 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 5767081 - 5767142
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5767081 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
5767142 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 39065698 - 39065759
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39065698 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
39065759 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5432892 - 5432831
Alignment:
| Q |
90 |
gaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaatta |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5432892 |
gaggataaataataactgcaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaatta |
5432831 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 25418169 - 25418230
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25418169 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
25418230 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Original strand, 47932092 - 47932172
Alignment:
| Q |
95 |
taaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagat |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
47932092 |
taaataataacaacaaatttattaagaagggatgataagttttgtaacttaaaattgattgcattctcataattattagat |
47932172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5432775 - 5432735
Alignment:
| Q |
236 |
tttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaat |
276 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5432775 |
tttttagaggtgacgcatgtgcataatcatagcttaagaat |
5432735 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 11)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 91 - 453
Target Start/End: Original strand, 34736386 - 34736750
Alignment:
| Q |
91 |
aggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagattagata |
190 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
34736386 |
aggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttgcattgttataattattagattagattaattagaca |
34736485 |
T |
|
| Q |
191 |
gaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggaga--atgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtcatat |
288 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
34736486 |
gaataagaaagggtgcgaaattattatactatatgggagagaatggttttttagaggtgacgcatatccataatcatagcttaagaataatgagtcaaat |
34736585 |
T |
|
| Q |
289 |
ttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaatatat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
34736586 |
ttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaagacaaatatat |
34736685 |
T |
|
| Q |
389 |
aattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34736686 |
aattgatataaaaacttatacattcaacattaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
34736750 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 175 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 46093791 - 46093513
Alignment:
| Q |
175 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaaga |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46093791 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaaga |
46093692 |
T |
|
| Q |
275 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
374 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46093691 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
46093592 |
T |
|
| Q |
375 |
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453 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46093591 |
gaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
46093513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 2503657 - 2503926
Alignment:
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184 |
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283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2503657 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
2503756 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2503757 |
catatttaatttataggaatatctttgaggtaccatgtcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
2503856 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2503857 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
2503926 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Original strand, 21631384 - 21631740
Alignment:
| Q |
86 |
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185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21631384 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataaattttgtaacttaaaattacttgcattgttataattattagattagataga-- |
21631481 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgatttt-ttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtc |
284 |
Q |
| |
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|| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21631482 |
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21631571 |
T |
|
| Q |
285 |
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384 |
Q |
| |
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| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| |
|
|
| T |
21631572 |
aaatttaatctatgagaagatctttaaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatataaaagactaat |
21631671 |
T |
|
| Q |
385 |
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453 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21631672 |
atataatggatataaacacttatacattcaaccttaacctaatactttcatatatataaaatccatata |
21631740 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21804415 - 21804059
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804415 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataaattttgtaacttaaaattacttgcattgttataattattagattagataga-- |
21804318 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgatttttt-agaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtc |
284 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21804317 |
-------atgagaaagggtaagaagttat---actatataggagaatgttttttttagaggtgacacatatgcataatcatagcttgagaataatgagtc |
21804228 |
T |
|
| Q |
285 |
atatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaat |
384 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |
|
|
| T |
21804227 |
aaatttaatctatgagaagatctttaaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacagtataaatatacaagacttat |
21804128 |
T |
|
| Q |
385 |
atataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21804127 |
atataatggatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcatatatataaaatccatata |
21804059 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 238 - 453
Target Start/End: Original strand, 53829258 - 53829476
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| Q |
238 |
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334 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53829258 |
tttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtcaaatttaatttaagggaatattatctttgaggtaccatatcatcacaatgcta |
53829357 |
T |
|
| Q |
335 |
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434 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53829358 |
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53829457 |
T |
|
| Q |
435 |
aatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53829458 |
aatatataaaatccatata |
53829476 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20037816 - 20037479
Alignment:
| Q |
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aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20037816 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaagaatgataggttttataacttaaaattacttgcattattataattattagattagataga-- |
20037719 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20037718 |
-------ataataaagggtgagaagttat---actatatgcgagaat--ttttttagaggtgacacatatgcataatcaaagcttaagaataatgagtca |
20037631 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaata |
385 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
20037630 |
aatttaattaataggaaagtcttagaggtaccatatcatcgcaattttagatcaagagtaattcaaacttactttacaatat-aatatagaagataaata |
20037532 |
T |
|
| Q |
386 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatata |
442 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20037531 |
tataattgacataaatactt----attcaaccttaacctcatactttcaaatatata |
20037479 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46093854 - 46093793
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
46093854 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
46093793 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 2503594 - 2503655
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2503594 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
2503655 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 43944773 - 43944693
Alignment:
| Q |
95 |
taaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagat |
175 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
43944773 |
taaataataacaacaaatttattaagaagggatgataagttttgtaacttaaaattgcttgcattctcataattattagat |
43944693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43944498 - 43944378
Alignment:
| Q |
176 |
tagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaa |
275 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||| | | ||| | || |
|
|
| T |
43944498 |
tagatatattagatagaataagaaagggtgagaa---gttatactatatttaagaatatatttttagaggtggcacatatgcataattaaaacttcataa |
43944402 |
T |
|
| Q |
276 |
taatgagtcatatttaatttatgg |
299 |
Q |
| |
|
|||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
43944401 |
taatgactcaattttagtttatgg |
43944378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 175 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36992534 - 36992256
Alignment:
| Q |
175 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaaga |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36992534 |
ttagatagattagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaaga |
36992435 |
T |
|
| Q |
275 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
374 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36992434 |
ataatgagtcatatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagattaagagtaactcaaacttactttacaatataaatata |
36992335 |
T |
|
| Q |
375 |
gaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36992334 |
gaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
36992256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 189 - 453
Target Start/End: Original strand, 21603796 - 21604060
Alignment:
| Q |
189 |
tagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtcatat |
288 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
21603796 |
tagaataaaaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtcaaat |
21603895 |
T |
|
| Q |
289 |
ttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaatatat |
388 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21603896 |
ttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaggagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaagacaaatatat |
21603995 |
T |
|
| Q |
389 |
aattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21603996 |
aattgatagaaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
21604060 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 262
Target Start/End: Original strand, 37300527 - 37300704
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37300527 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttgcatttttataattattagattagattgatt |
37300626 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatga-ttttttagaggtgacgcatatgcataat |
262 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37300627 |
agacagaataagaaagggtgcgaaattattatagtatatgggagaatgatttttttagaggtgacgcatatgcataat |
37300704 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 353 - 453
Target Start/End: Original strand, 37300745 - 37300845
Alignment:
| Q |
353 |
cttactttacaatataaatatagaacacaaatatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatat |
452 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37300745 |
cttactttacaatataaatattgaagacaaatatataattgatataaaaacttatacattcaacattaacctcatactttcaaatatataaaatccatat |
37300844 |
T |
|
| Q |
453 |
a |
453 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
37300845 |
a |
37300845 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 36992597 - 36992536
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36992597 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
36992536 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 290 - 322
Target Start/End: Original strand, 37300710 - 37300742
Alignment:
| Q |
290 |
taatttatgggaatatctttgaggtaccatatc |
322 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37300710 |
taatttatgggaatatctttgaggtatcatatc |
37300742 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28844400 - 28844131
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28844400 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcctaagaataatgagt |
28844301 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28844300 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
28844201 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28844200 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
28844131 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4139808 - 4139452
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
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4139711 |
T |
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284 |
Q |
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T |
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384 |
Q |
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4139521 |
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453 |
Q |
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4139452 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Original strand, 917566 - 917920
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
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| T |
917566 |
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T |
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285 |
Q |
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| T |
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T |
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385 |
Q |
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| T |
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917853 |
T |
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| Q |
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453 |
Q |
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| T |
917854 |
tataattgatataaacacttatacattcaa-cttaacctcatattttcaaatatataaaatccatata |
917920 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 86 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10187892 - 10187698
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
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| T |
10187892 |
aatggaggataaataataactataaatatattatgaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttgcattgttataattattagattaga------ |
10187799 |
T |
|
| Q |
186 |
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284 |
Q |
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| T |
10187798 |
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10187705 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28844463 - 28844402
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
28844463 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
28844402 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 12274441 - 12274374
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattactt |
154 |
Q |
| |
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| T |
12274441 |
aatggaggataa-taataactacaaatatattaagaaaggatgataaattttgtaatttaaaattactt |
12274374 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 13432110 - 13432379
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
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| T |
13432110 |
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13432209 |
T |
|
| Q |
284 |
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383 |
Q |
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| T |
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13432309 |
T |
|
| Q |
384 |
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453 |
Q |
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| T |
13432310 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
13432379 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 96 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18884115 - 18883769
Alignment:
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96 |
aaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagattagatagaata |
195 |
Q |
| |
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| T |
18884115 |
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18884025 |
T |
|
| Q |
196 |
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294 |
Q |
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| T |
18884024 |
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18883928 |
T |
|
| Q |
295 |
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393 |
Q |
| |
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| T |
18883927 |
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18883829 |
T |
|
| Q |
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453 |
Q |
| |
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| T |
18883828 |
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18883769 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 13432047 - 13432108
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13432047 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
13432108 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Original strand, 26720316 - 26720403
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagat |
175 |
Q |
| |
|
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|
| T |
26720316 |
aatggatgataaataataacaaca--tatattaagaagggatgataagttttgtaacttaaaattacttgcattcttataattattagat |
26720403 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 7572748 - 7573017
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7572748 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
7572847 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
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|
| T |
7572848 |
catatttaatttataggaatatctttgaggtaccatgtcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
7572947 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7572948 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
7573017 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 16667343 - 16667612
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16667343 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggaaaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
16667442 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16667443 |
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16667542 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16667543 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
16667612 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 43565680 - 43565325
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43565680 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataaattttgtaactgaaaattacttgcattgtgtcaattataagattagataga-- |
43565583 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
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| T |
43565582 |
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43565493 |
T |
|
| Q |
286 |
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385 |
Q |
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| T |
43565492 |
aatttaatttatgggaaaatctttaagctaccatatcatcataatgctagatcaagagtaactcaaacctactttacaatataaatatagaagacaaata |
43565393 |
T |
|
| Q |
386 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43565392 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
43565325 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 86 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29456888 - 29456533
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| || | || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
29456888 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaagatgataaattttgtaactgaaaattacttgcattgtttcaattataagattagataga-- |
29456791 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29456790 |
-------ataagaaagggtgagaagttatg---ctatatgggagaatatttttttagaggtgacgcatatggataatcatagcttaagaataatgagtca |
29456701 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaata |
385 |
Q |
| |
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|
| T |
29456700 |
aatttaatttatgggaaaatctttaaggtaccatatcatcataatactagatcaagagtaactcaaacttactttataatataaatatagaagacaaata |
29456601 |
T |
|
| Q |
386 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29456600 |
tataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
29456533 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 7572685 - 7572746
Alignment:
| Q |
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aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7572685 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
7572746 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 16667280 - 16667341
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16667280 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
16667341 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13787714 - 13787445
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
13787714 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
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T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13787614 |
catatttaatttataggaatatctttgaggtaccatgtcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
13787515 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
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| T |
13787514 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
13787445 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 184 - 453
Target Start/End: Original strand, 25806428 - 25806697
Alignment:
| Q |
184 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
283 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25806428 |
ttagatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagt |
25806527 |
T |
|
| Q |
284 |
catatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaaa |
383 |
Q |
| |
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|
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| T |
25806528 |
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25806627 |
T |
|
| Q |
384 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25806628 |
tatataattgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
25806697 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 96 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39625006 - 39624658
Alignment:
| Q |
96 |
aaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagattagatagaata |
195 |
Q |
| |
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|
|
| T |
39625006 |
aaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaactacttgcattattataattgttagattagataga---------ata |
39624916 |
T |
|
| Q |
196 |
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292 |
Q |
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| T |
39624915 |
agaaagggtgagaaattat---actatatgtgagaatatttttttagaggtgagatgcatatacataatcataagcttaagaataatgagtcaaatttaa |
39624819 |
T |
|
| Q |
293 |
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391 |
Q |
| |
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| T |
39624818 |
tttatgggaaggtcttaaaggtaccatgtcatcacaaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttaaaatataa-tatagaagacaaatatataat |
39624720 |
T |
|
| Q |
392 |
tgatataaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
453 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39624719 |
tgatagaaacacttatacattcaaccttaacctcatactttcaaatatataaaatccatata |
39624658 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 86 - 382
Target Start/End: Original strand, 22911252 - 22911541
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagatt |
185 |
Q |
| |
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| T |
22911252 |
aatggaggataaataataactataaatatattaagaaaggatgataagttttgcacctgaaaattacttgcattgttataattattatattaaatagatt |
22911351 |
T |
|
| Q |
186 |
agatagaataagaaagggtgagaaattattatactatatgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
285 |
Q |
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| T |
22911352 |
agatagaataagaaagggcgagaagttat---attatatgggagaatgtttttttagaggtgaagcatatgcataatcatagcttaagaataatgagtca |
22911448 |
T |
|
| Q |
286 |
tatttaatttatgggaatatctttgaggtaccatatcatcacaatgctagatcaagagtaactcaaacttactttacaatataaatatagaacacaa |
382 |
Q |
| |
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| T |
22911449 |
aatttaatttatgggaagatctttgaggtatcatatcatcacaatgctatattaagagtaactcaa----actttacaatataaatatagaagacaa |
22911541 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13787777 - 13787716
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
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| T |
13787777 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
13787716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 147
Target Start/End: Original strand, 25806365 - 25806426
Alignment:
| Q |
86 |
aatggaggataaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
147 |
Q |
| |
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| T |
25806365 |
aatggaggataaataataactacagatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaa |
25806426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0182 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:
Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 281
Target Start/End: Original strand, 7978 - 8161
Alignment:
| Q |
95 |
taaataataactacaaatatattaagaaaggatgataagttttgtaacttaaaattacttccactattataattattagattagatagattagatagaat |
194 |
Q |
| |
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| T |
7978 |
taaataataacaacaaatttattaaaaaaggatgataagttttgtcacttaaaattgctttcattctcataattattaga-tagatatattagatagaat |
8076 |
T |
|
| Q |
195 |
aagaaagggtgagaaattattatactata-tgggagaatgattttttagaggtgacgcatatgcataatcatagcttaagaataatga |
281 |
Q |
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| T |
8077 |
aagaaagggtgagaa---gttatactatattttaagaatatatttttagaggtgacacatatgcataattataacttcagaataatga |
8161 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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