View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2519_low_30 (Length: 465)

Name: NF2519_low_30
Description: NF2519
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2519_low_30
NF2519_low_30
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (8-448)||(8340823-8341261)
chr7 (33-443)||(19586367-19586777)
chr7 (33-432)||(45554188-45554587)
chr7 (33-433)||(10416614-10417012)
chr7 (33-432)||(24539496-24539896)
chr7 (33-384)||(19800779-19801130)
chr7 (107-432)||(27989724-27990049)
chr7 (103-432)||(43984291-43984619)
chr7 (192-443)||(9534429-9534679)
chr7 (149-431)||(14946743-14947025)
chr7 (155-443)||(11625518-11625806)
chr7 (100-431)||(15374336-15374667)
chr7 (192-443)||(9544712-9544962)
chr7 (155-443)||(5380966-5381254)
chr7 (155-443)||(5390604-5390892)
chr7 (155-443)||(5927755-5928043)
chr7 (155-443)||(16131068-16131356)
chr7 (155-443)||(16141617-16141905)
chr7 (155-443)||(26304175-26304463)
chr7 (155-443)||(26362355-26362643)
chr7 (155-443)||(44897918-44898206)
chr7 (155-443)||(44908343-44908631)
chr7 (155-443)||(46497734-46498022)
chr7 (155-443)||(46508346-46508634)
chr7 (155-443)||(6535104-6535392)
chr7 (155-443)||(6545425-6545713)
chr7 (155-443)||(8501669-8501957)
chr7 (155-443)||(8512139-8512427)
chr7 (155-443)||(26307735-26308023)
chr7 (154-443)||(42621712-42622001)
chr7 (154-443)||(14247654-14247945)
chr7 (33-429)||(5614483-5614882)
chr7 (155-443)||(32099000-32099288)
chr7 (155-443)||(32109437-32109725)
chr7 (154-429)||(15987817-15988092)
chr7 (26-429)||(31825353-31825757)
chr7 (26-429)||(42596016-42596421)
chr7 (181-431)||(7018584-7018834)
chr7 (181-431)||(7033946-7034196)
chr7 (26-425)||(13284730-13285131)
chr7 (116-316)||(12574931-12575130)
chr7 (116-316)||(12516011-12516210)
chr7 (26-317)||(12826401-12826692)
chr7 (26-317)||(41028347-41028638)
chr7 (158-429)||(2991045-2991315)
chr7 (116-316)||(12492206-12492405)
chr7 (149-429)||(9007579-9007859)
chr7 (100-295)||(13130605-13130799)
chr7 (182-434)||(12770712-12770964)
chr7 (152-317)||(12088073-12088237)
chr7 (221-286)||(40703334-40703399)
chr7 (320-429)||(12492064-12492173)
chr7 (321-429)||(12515869-12515977)
chr7 (355-443)||(27989625-27989713)
chr7 (221-295)||(40703569-40703643)
chr7 (221-276)||(40703188-40703246)
chr7 (355-443)||(43984095-43984184)
chr7 (355-434)||(45554010-45554089)
chr7 (355-434)||(24539995-24540074)
chr7 (355-429)||(43984202-43984277)
chr7 (389-429)||(10416530-10416570)
chr7 (181-253)||(28392105-28392177)
chr7 (389-429)||(45554103-45554143)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (8-443)||(14801436-14801872)
chr3 (8-443)||(20293666-20294092)
chr3 (33-432)||(4781480-4781879)
chr3 (33-429)||(19827264-19827660)
chr3 (33-432)||(20743740-20744141)
chr3 (33-432)||(2487907-2488306)
chr3 (33-429)||(51977519-51977915)
chr3 (33-432)||(13118478-13118875)
chr3 (80-443)||(12386852-12387217)
chr3 (8-279)||(24773549-24773821)
chr3 (100-443)||(11090-11432)
chr3 (103-432)||(4372171-4372499)
chr3 (103-432)||(4381912-4382240)
chr3 (149-431)||(20492663-20492945)
chr3 (155-443)||(1684408-1684696)
chr3 (155-443)||(8973466-8973754)
chr3 (155-443)||(8984021-8984309)
chr3 (100-431)||(4023230-4023559)
chr3 (155-443)||(5654783-5655071)
chr3 (155-443)||(9537755-9538043)
chr3 (155-443)||(9548081-9548369)
chr3 (157-443)||(16334575-16334861)
chr3 (26-429)||(49386404-49386810)
chr3 (26-429)||(24872248-24872653)
chr3 (154-429)||(25433743-25434019)
chr3 (155-443)||(6422927-6423215)
chr3 (155-443)||(6433354-6433642)
chr3 (154-443)||(10507824-10508114)
chr3 (154-367)||(10002581-10002794)
chr3 (191-429)||(11459773-11460011)
chr3 (154-366)||(10507010-10507222)
chr3 (141-317)||(38817104-38817279)
chr3 (26-258)||(24814638-24814871)
chr3 (155-284)||(682966-683095)
chr3 (192-317)||(23503058-23503182)
chr3 (189-286)||(11043899-11043996)
chr3 (362-443)||(10011571-10011652)
chr3 (247-429)||(17734772-17734955)
chr3 (247-429)||(19036041-19036224)
chr3 (33-280)||(13430556-13430800)
chr3 (355-443)||(4371975-4372064)
chr3 (355-443)||(4381716-4381805)
chr3 (265-427)||(24794073-24794236)
chr3 (355-434)||(20744240-20744319)
chr3 (211-291)||(20649569-20649648)
chr3 (355-429)||(51977929-51978003)
chr3 (355-434)||(2488405-2488484)
chr3 (355-429)||(4372082-4372157)
chr3 (355-429)||(4381823-4381898)
chr3 (367-434)||(51978029-51978096)
chr3 (355-429)||(2488317-2488391)
chr3 (355-429)||(13118886-13118960)
chr3 (355-429)||(20744152-20744226)
chr3 (389-434)||(4782012-4782057)
chr3 (390-434)||(13119009-13119053)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (8-443)||(18705331-18705766)
chr6 (8-443)||(18711266-18711701)
chr6 (8-443)||(16321942-16322377)
chr6 (8-443)||(16334090-16334525)
chr6 (28-443)||(26169035-26169438)
chr6 (33-432)||(26019440-26019840)
chr6 (33-432)||(30656911-30657310)
chr6 (33-432)||(1597789-1598187)
chr6 (100-432)||(18202178-18202509)
chr6 (154-429)||(790176-790451)
chr6 (33-432)||(7753755-7754154)
chr6 (33-291)||(12988891-12989148)
chr6 (100-443)||(20968462-20968804)
chr6 (154-443)||(17826472-17826761)
chr6 (100-441)||(29541068-29541408)
chr6 (155-443)||(3286466-3286754)
chr6 (155-443)||(12455673-12455961)
chr6 (155-443)||(14792222-14792510)
chr6 (155-443)||(16898566-16898854)
chr6 (155-443)||(18160681-18160969)
chr6 (155-443)||(20912902-20913190)
chr6 (155-443)||(16909219-16909507)
chr6 (155-443)||(18170493-18170781)
chr6 (154-429)||(22222634-22222910)
chr6 (154-429)||(22248469-22248745)
chr6 (155-443)||(31358181-31358469)
chr6 (155-443)||(31367911-31368199)
chr6 (155-443)||(24921151-24921439)
chr6 (155-443)||(24930187-24930475)
chr6 (26-429)||(34765991-34766391)
chr6 (181-429)||(9034051-9034298)
chr6 (32-310)||(19363823-19364101)
chr6 (26-429)||(8562325-8562730)
chr6 (168-432)||(15504066-15504331)
chr6 (192-443)||(27786697-27786948)
chr6 (33-226)||(24502611-24502802)
chr6 (138-429)||(24692444-24692733)
chr6 (8-218)||(26169438-26169636)
chr6 (33-317)||(18335662-18335944)
chr6 (80-346)||(28093346-28093604)
chr6 (33-429)||(6314519-6314913)
chr6 (8-133)||(26169700-26169825)
chr6 (8-133)||(26169889-26170014)
chr6 (8-133)||(26170078-26170203)
chr6 (8-133)||(26170267-26170392)
chr6 (8-133)||(26170456-26170581)
chr6 (192-291)||(26045068-26045165)
chr6 (355-434)||(26019939-26020018)
chr6 (355-434)||(30657321-30657400)
chr6 (350-427)||(790460-790537)
chr6 (192-291)||(26140732-26140829)
chr6 (355-434)||(9033870-9033949)
chr6 (355-429)||(1597704-1597778)
chr6 (355-425)||(9033967-9034037)
chr6 (206-292)||(9760737-9760822)
chr6 (355-429)||(18202093-18202167)
chr6 (192-291)||(25537672-25537769)
chr6 (397-433)||(9760924-9760960)
chr6 (389-429)||(18333349-18333389)
chr6 (397-433)||(26044868-26044904)
chr6 (397-433)||(26140531-26140567)
chr6 (137-177)||(26170611-26170651)
chr6 (181-253)||(27741202-27741274)
chr6 (181-253)||(27750383-27750455)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (9-443)||(28450947-28451381)
chr2 (33-443)||(45191457-45191866)
chr2 (33-432)||(3604594-3604994)
chr2 (33-432)||(22678699-22679098)
chr2 (33-429)||(44637605-44638001)
chr2 (33-432)||(16901169-16901569)
chr2 (33-432)||(16994560-16994960)
chr2 (33-413)||(22671560-22671939)
chr2 (103-443)||(32935807-32936146)
chr2 (100-443)||(37862132-37862473)
chr2 (103-432)||(4468634-4468962)
chr2 (208-443)||(12571217-12571452)
chr2 (103-432)||(4459009-4459337)
chr2 (103-432)||(5345734-5346062)
chr2 (154-443)||(45015333-45015622)
chr2 (101-443)||(29423973-29424314)
chr2 (103-432)||(5335882-5336210)
chr2 (154-443)||(38929578-38929867)
chr2 (154-443)||(38956920-38957209)
chr2 (154-443)||(24695655-24695941)
chr2 (155-443)||(2997768-2998056)
chr2 (155-443)||(18651838-18652126)
chr2 (155-443)||(18663956-18664244)
chr2 (155-443)||(9501831-9502119)
chr2 (155-443)||(9513197-9513485)
chr2 (155-443)||(17489310-17489598)
chr2 (26-429)||(27158945-27159350)
chr2 (26-429)||(27169293-27169698)
chr2 (8-206)||(12580175-12580373)
chr2 (26-429)||(22907816-22908221)
chr2 (195-443)||(21109833-21110083)
chr2 (183-443)||(41026004-41026265)
chr2 (26-429)||(19342949-19343354)
chr2 (119-443)||(69209-69533)
chr2 (26-317)||(22902887-22903179)
chr2 (208-317)||(15474683-15474791)
chr2 (33-157)||(32877617-32877740)
chr2 (187-292)||(40408122-40408227)
chr2 (17-135)||(6875918-6876035)
chr2 (208-281)||(22146561-22146634)
chr2 (149-292)||(38461270-38461412)
chr2 (23-66)||(40407957-40408000)
chr2 (355-443)||(4458813-4458902)
chr2 (355-443)||(4468438-4468527)
chr2 (355-443)||(5336407-5336496)
chr2 (355-443)||(5346260-5346349)
chr2 (355-432)||(33432477-33432554)
chr2 (355-432)||(33432568-33432645)
chr2 (355-434)||(3605093-3605172)
chr2 (355-434)||(16901668-16901747)
chr2 (355-434)||(16995059-16995138)
chr2 (355-429)||(22679109-22679183)
chr2 (355-432)||(5336224-5336301)
chr2 (355-432)||(5346076-5346153)
chr2 (26-66)||(6880448-6880488)
chr2 (397-433)||(40408329-40408365)
chr2 (355-429)||(4458920-4458995)
chr2 (355-429)||(4468545-4468620)
chr2 (355-429)||(5346167-5346242)
chr2 (355-429)||(3605005-3605079)
chr2 (355-429)||(16901580-16901654)
chr2 (355-429)||(16994971-16995045)
chr2 (33-66)||(22146771-22146804)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (8-443)||(19390-19827)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (8-443)||(20807857-20808293)
chr5 (8-443)||(19781223-19781649)
chr5 (33-443)||(4037205-4037615)
chr5 (8-443)||(204668-205102)
chr5 (33-432)||(19886914-19887313)
chr5 (33-443)||(22172478-22172888)
chr5 (33-443)||(34129715-34130125)
chr5 (33-443)||(30942516-30942926)
chr5 (33-443)||(30951938-30952348)
chr5 (34-443)||(27273408-27273817)
chr5 (16-443)||(37298023-37298450)
chr5 (33-429)||(13570905-13571301)
chr5 (33-429)||(37818233-37818629)
chr5 (33-432)||(37646558-37646957)
chr5 (33-432)||(37537447-37537846)
chr5 (130-443)||(42089827-42090142)
chr5 (100-443)||(31917432-31917774)
chr5 (107-443)||(18208563-18208898)
chr5 (107-443)||(18217901-18218236)
chr5 (103-407)||(21682844-21683145)
chr5 (103-432)||(21754166-21754494)
chr5 (103-432)||(21763453-21763781)
chr5 (137-432)||(22245242-22245537)
chr5 (155-443)||(18390854-18391142)
chr5 (155-443)||(18361897-18362185)
chr5 (155-443)||(26191176-26191464)
chr5 (155-443)||(27412768-27413056)
chr5 (154-431)||(27578503-27578779)
chr5 (155-443)||(33939940-33940228)
chr5 (155-443)||(33950340-33950628)
chr5 (181-429)||(36317080-36317329)
chr5 (155-443)||(11410262-11410550)
chr5 (155-443)||(26201758-26202046)
chr5 (155-443)||(32071060-32071348)
chr5 (155-443)||(8764518-8764806)
chr5 (26-429)||(20948485-20948890)
chr5 (26-429)||(20958854-20959259)
chr5 (181-434)||(20897583-20897839)
chr5 (26-429)||(19547471-19547871)
chr5 (154-434)||(23376111-23376395)
chr5 (185-293)||(20904001-20904109)
chr5 (355-434)||(22245152-22245231)
chr5 (355-434)||(37537945-37538024)
chr5 (355-434)||(37647056-37647135)
chr5 (355-443)||(21754063-21754152)
chr5 (355-443)||(21763350-21763439)
chr5 (355-434)||(19887412-19887491)
chr5 (355-434)||(36316987-36317066)
chr5 (355-429)||(37537857-37537931)
chr5 (355-429)||(37646968-37647042)
chr5 (181-253)||(14806169-14806241)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (33-443)||(16630153-16630563)
chr4 (33-432)||(2830617-2831016)
chr4 (33-443)||(17827030-17827440)
chr4 (33-443)||(17836421-17836831)
chr4 (33-432)||(44889650-44890049)
chr4 (116-427)||(16210088-16210398)
chr4 (78-429)||(4837074-4837428)
chr4 (116-429)||(53945226-53945539)
chr4 (100-429)||(7845839-7846167)
chr4 (103-443)||(16250066-16250405)
chr4 (100-443)||(15670700-15671042)
chr4 (78-427)||(41526936-41527282)
chr4 (33-426)||(13401819-13402212)
chr4 (100-443)||(10422403-10422745)
chr4 (103-432)||(5292013-5292341)
chr4 (103-432)||(5301672-5302000)
chr4 (103-432)||(21846917-21847245)
chr4 (103-432)||(21856509-21856837)
chr4 (103-432)||(21902780-21903108)
chr4 (103-432)||(21912372-21912700)
chr4 (103-432)||(27679678-27680006)
chr4 (103-432)||(27689333-27689661)
chr4 (155-443)||(17984025-17984313)
chr4 (155-443)||(18104575-18104863)
chr4 (155-443)||(40922463-40922751)
chr4 (100-432)||(3486549-3486880)
chr4 (100-432)||(3495872-3496203)
chr4 (100-443)||(16253856-16254197)
chr4 (155-443)||(6692838-6693126)
chr4 (155-443)||(6703244-6703532)
chr4 (98-429)||(16059004-16059335)
chr4 (26-429)||(521219-521624)
chr4 (98-433)||(30652302-30652631)
chr4 (192-432)||(17162220-17162461)
chr4 (154-434)||(13792187-13792467)
chr4 (26-429)||(17420327-17420730)
chr4 (79-417)||(8841829-8842166)
chr4 (26-412)||(518713-519101)
chr4 (192-432)||(17144360-17144601)
chr4 (119-429)||(6404946-6405255)
chr4 (181-429)||(16397883-16398131)
chr4 (26-317)||(26459167-26459458)
chr4 (101-426)||(14599757-14600083)
chr4 (100-269)||(7842959-7843127)
chr4 (155-284)||(16081433-16081562)
chr4 (355-443)||(44889551-44889639)
chr4 (355-434)||(17162130-17162209)
chr4 (355-429)||(2830356-2830430)
chr4 (355-432)||(2830441-2830518)
chr4 (355-443)||(3486987-3487076)
chr4 (355-443)||(3496310-3496399)
chr4 (355-432)||(4837442-4837519)
chr4 (355-443)||(5292448-5292537)
chr4 (355-443)||(5302107-5302196)
chr4 (355-443)||(21846721-21846810)
chr4 (355-443)||(21856313-21856402)
chr4 (355-443)||(21902584-21902673)
chr4 (355-443)||(21912176-21912265)
chr4 (355-443)||(27680113-27680202)
chr4 (355-443)||(27689768-27689857)
chr4 (355-434)||(2830263-2830342)
chr4 (355-434)||(53945553-53945632)
chr4 (17-66)||(8847658-8847706)
chr4 (355-429)||(3486894-3486969)
chr4 (355-429)||(3496217-3496292)
chr4 (355-429)||(5292355-5292430)
chr4 (355-429)||(5302014-5302089)
chr4 (355-434)||(16210414-16210493)
chr4 (355-434)||(17144270-17144349)
chr4 (355-429)||(21846828-21846903)
chr4 (355-429)||(21856420-21856495)
chr4 (355-429)||(21902691-21902766)
chr4 (355-429)||(21912283-21912358)
chr4 (355-429)||(27680020-27680095)
chr4 (355-429)||(27689675-27689750)
chr4 (355-429)||(2830532-2830606)
chr4 (198-253)||(30626053-30626109)
chr4 (355-427)||(30652220-30652292)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (33-443)||(20315051-20315461)
chr1 (17-443)||(22961524-22961949)
chr1 (14-429)||(4951064-4951468)
chr1 (16-443)||(25038408-25038837)
chr1 (33-443)||(27066700-27067110)
chr1 (16-443)||(25043620-25044049)
chr1 (8-443)||(18095926-18096361)
chr1 (33-432)||(20316722-20317121)
chr1 (33-432)||(20327204-20327603)
chr1 (33-432)||(41542860-41543259)
chr1 (116-429)||(49336383-49336696)
chr1 (33-293)||(12420179-12420438)
chr1 (190-429)||(25822352-25822591)
chr1 (33-283)||(25868126-25868376)
chr1 (155-443)||(21459248-21459536)
chr1 (100-443)||(2117475-2117818)
chr1 (100-443)||(2369521-2369864)
chr1 (189-427)||(26192275-26192514)
chr1 (155-443)||(16155503-16155791)
chr1 (155-443)||(25020088-25020376)
chr1 (154-443)||(30548777-30549066)
chr1 (103-443)||(42034834-42035173)
chr1 (181-433)||(8540891-8541143)
chr1 (181-433)||(8606130-8606382)
chr1 (200-432)||(19747437-19747669)
chr1 (100-395)||(18384012-18384306)
chr1 (26-429)||(1973708-1974113)
chr1 (26-429)||(1988495-1988900)
chr1 (149-429)||(34823602-34823882)
chr1 (100-429)||(37012986-37013315)
chr1 (100-361)||(13965749-13966008)
chr1 (26-429)||(52948721-52949126)
chr1 (181-414)||(21793398-21793634)
chr1 (185-434)||(21820644-21820895)
chr1 (33-204)||(19735595-19735766)
chr1 (23-284)||(34000645-34000905)
chr1 (33-133)||(22401428-22401527)
chr1 (189-292)||(22957228-22957331)
chr1 (221-286)||(22892356-22892421)
chr1 (192-255)||(21904518-21904581)
chr1 (226-295)||(22892605-22892674)
chr1 (221-276)||(22892213-22892268)
chr1 (192-291)||(19867790-19867887)
chr1 (355-434)||(26192618-26192697)
chr1 (355-429)||(41543270-41543344)
chr1 (156-240)||(22959167-22959252)
chr1 (359-431)||(13965501-13965573)
chr1 (355-427)||(37012812-37012884)
chr1 (389-436)||(20317166-20317213)
chr1 (355-434)||(20317220-20317299)
chr1 (355-434)||(49336290-49336369)
chr1 (355-429)||(26192530-26192604)
chr1 (389-429)||(20327648-20327688)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (33-443)||(31998272-31998682)
chr8 (33-443)||(31990683-31991093)
chr8 (33-443)||(33773160-33773567)
chr8 (33-443)||(14893066-14893476)
chr8 (33-443)||(14880716-14881126)
chr8 (8-443)||(23014059-23014472)
chr8 (33-427)||(20529902-20530296)
chr8 (103-443)||(13675380-13675719)
chr8 (103-443)||(21986851-21987190)
chr8 (103-443)||(21996385-21996724)
chr8 (137-429)||(11429604-11429896)
chr8 (155-443)||(9324187-9324475)
chr8 (159-443)||(21334918-21335202)
chr8 (160-443)||(21201992-21202275)
chr8 (160-443)||(21212408-21212691)
chr8 (154-443)||(2689433-2689724)
chr8 (26-429)||(14438057-14438462)
chr8 (119-429)||(26361457-26361768)
chr8 (103-279)||(3988296-3988471)
chr8 (103-286)||(12900410-12900592)
chr8 (190-309)||(6760572-6760692)
chr8 (33-177)||(8668832-8668974)
chr8 (182-292)||(12840634-12840744)
chr8 (103-276)||(21461892-21462064)
chr8 (189-276)||(18537438-18537525)
chr8 (339-429)||(17269457-17269547)
chr8 (149-231)||(17269564-17269646)
chr8 (355-434)||(11429910-11429989)
chr8 (355-432)||(20530312-20530389)
chr8 (222-269)||(37817846-37817892)
chr8 (103-176)||(16582840-16582912)
chr8 (389-429)||(12840839-12840879)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (37-445)||(110810-111218)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (33-432)||(8768-9167)
scaffold0118 (355-429)||(8595-8669)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (39-432)||(49261-49653)
scaffold0058 (33-432)||(28051-28450)
scaffold0058 (389-443)||(28495-28549)
scaffold0058 (355-443)||(49664-49752)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (33-432)||(20092-20492)
scaffold0234 (355-443)||(20503-20590)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (33-326)||(394897-395190)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (157-443)||(1-288)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (8-357)||(8127-8477)
scaffold0034 (390-446)||(8054-8111)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (154-443)||(73886-74175)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (154-423)||(1-270)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (192-443)||(55041-55292)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (100-443)||(91984-92326)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (155-443)||(233149-233437)
scaffold0014 (26-429)||(147341-147745)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (155-443)||(7003-7291)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (100-443)||(1063-1405)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (100-443)||(8731-9073)
[»] scaffold0313 (3 HSPs)
scaffold0313 (26-429)||(6403-6803)
scaffold0313 (26-379)||(10235-10585)
scaffold0313 (224-429)||(20560-20766)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (100-429)||(112-440)
[»] scaffold0277 (1 HSPs)
scaffold0277 (181-443)||(18549-18812)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (159-443)||(309184-309468)
scaffold0005 (101-426)||(217295-217621)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (181-429)||(2491-2739)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (26-307)||(19725-20006)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (207-434)||(55269-55495)
scaffold0018 (207-434)||(59218-59444)
scaffold0018 (207-434)||(60646-60872)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (26-434)||(39598-40008)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (154-443)||(27934-28224)
[»] scaffold0591 (2 HSPs)
scaffold0591 (181-433)||(1578-1832)
scaffold0591 (103-276)||(1-173)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (181-434)||(6194-6448)
[»] scaffold0265 (1 HSPs)
scaffold0265 (185-434)||(11914-12165)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (154-434)||(16070-16354)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (33-184)||(1-151)
[»] scaffold0764 (1 HSPs)
scaffold0764 (225-429)||(1-206)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (103-266)||(30765-30926)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (182-414)||(918-1150)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (191-292)||(196586-196687)
scaffold0015 (156-240)||(189943-190028)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (188-269)||(67013-67094)
scaffold0057 (263-318)||(66292-66346)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (33-135)||(5-107)
[»] scaffold0713 (2 HSPs)
scaffold0713 (192-291)||(2000-2097)
scaffold0713 (397-433)||(2262-2298)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (181-253)||(1369-1441)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 346; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 8341261 - 8340823
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8341261 aaattattcagtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgtttaagttaacgacagattttagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 8341162  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8341161 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacaaatatttatagtggttccccc 8341062  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8341061 aatgtgggttattccactc--cacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 8340964  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8340963 acacttacaattctgtattctctaaatcttggcaggcttgcaccttgttgataagttaaccacttagacttttacaatttttgctcaaactaacacttta 8340864  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaatttatggg 448  Q
     ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8340863 gtacccctaaaattagatgagactttattacaatttgtggg 8340823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19586777 - 19586367
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19586777 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttatgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaggtaaatgtgtttgtg 19586678  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19586677 tgtgtt-gtatatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 19586579  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19586578 attcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcatgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 19586479  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  19586478 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 19586379  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  19586378 ttgttacaattt 19586367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 45554587 - 45554188
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45554587 attctcaagttcaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtttgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 45554488  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45554487 tgtgtt-gtgtgtgcaataagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtaggttagtccactcctcac 45554389  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45554388 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctcta 45554289  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45554288 agtctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagcccaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 45554189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 33 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 10417012 - 10416614
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10417012 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcaaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 10416913  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    |||   ||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10416912 tgt---tgtgtatgcagtaagtaaagaatgtagggaagagagactcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 10416816  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  10416815 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctatattctcta 10416716  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||    
T  10416715 agcctcagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgatatt 10416616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 24539496 - 24539896
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaa-cagtttaacaaagtaaatgtgtttgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  24539496 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattacaaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgt 24539594  T
Q  132 gtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24539595 gtgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaatagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctca 24539693  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||    
T  24539694 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctc 24539793  T
Q  330 taagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24539794 taagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 24539893  T
Q  430 ttt 432  Q
    |||    
T  24539894 ttt 24539896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 33 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19801130 - 19800779
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19801130 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagatcgttcttatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 19801031  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19801030 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaggagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 19800932  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19800931 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 19800832  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaa 384  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19800831 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaa 19800779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 107 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 27990049 - 27989724
Alignment:
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  27990049 agtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacc 27989951  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27989950 caatgtgcgttagtccactcctcacaatctcgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctg 27989851  T
Q  307 aacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactt 405  Q
    |||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||||    
T  27989850 aacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactt 27989751  T
Q  406 taatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||    
T  27989750 tagtacccctaaagctatatgagattt 27989724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 43984619 - 43984291
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  43984619 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 43984521  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  43984520 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttca 43984421  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  43984420 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 43984321  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  43984320 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 43984291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 9534429 - 9534679
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9534429 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 9534528  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgc 391  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  9534529 atct-tgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgc 9534627  T
Q  392 tcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9534628 tcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 9534679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 149 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14947025 - 14946743
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttc 248  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14947025 gtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttc 14946926  T
Q  249 cactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  14946925 cactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaaccttgtattctctaagcctcagcaggcttgc 14946826  T
Q  349 accttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  14946825 actttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttacacaaactaacactttagtatccctaaatctagatgagatt 14946743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 11625518 - 11625806
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  11625518 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 11625617  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  11625618 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 11625716  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11625717 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacttttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 11625806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 15374667 - 15374336
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||   |||||| || |||| |   |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||    
T  15374667 caaaaatagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtataatgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtg 15374569  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15374568 gttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgt 15374469  T
Q  300 tcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagct 398  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| | ||| ||    
T  15374468 tcacttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcacattgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttacacaaact 15374369  T
Q  399 aacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  15374368 aacactttagtatccctaaatctagatgagatt 15374336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 9544712 - 9544962
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9544712 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 9544811  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgc 391  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  9544812 atct-tgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgc 9544910  T
Q  392 tcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9544911 tcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 9544962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 5380966 - 5381254
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  5380966 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 5381065  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  5381066 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 5381164  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5381165 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5381254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 5390604 - 5390892
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  5390604 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 5390703  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  5390704 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 5390802  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5390803 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5390892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 5928043 - 5927755
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  5928043 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 5927944  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  5927943 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 5927845  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5927844 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5927755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 16131068 - 16131356
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16131068 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16131167  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  16131168 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16131266  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16131267 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16131356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 16141617 - 16141905
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16141617 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16141716  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  16141717 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16141815  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16141816 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16141905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26304463 - 26304175
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26304463 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 26304364  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  26304363 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 26304265  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26304264 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 26304175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 26362355 - 26362643
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26362355 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 26362454  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  26362455 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 26362553  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26362554 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 26362643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44898206 - 44897918
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  44898206 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 44898107  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  44898106 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 44898008  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  44898007 ttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 44897918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44908631 - 44908343
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  44908631 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 44908532  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  44908531 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 44908433  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  44908432 ttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 44908343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 46498022 - 46497734
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  46498022 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 46497923  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  46497922 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 46497824  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  46497823 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 46497734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 46508634 - 46508346
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  46508634 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 46508535  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  46508534 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 46508436  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  46508435 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 46508346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6535392 - 6535104
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6535392 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6535293  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  6535292 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 6535194  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6535193 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6535104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6545713 - 6545425
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6545713 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6545614  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  6545613 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 6545515  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6545514 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6545425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8501957 - 8501669
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8501957 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 8501858  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  8501857 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 8501759  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8501758 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 8501669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8512427 - 8512139
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8512427 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 8512328  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  8512327 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 8512229  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8512228 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 8512139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26308023 - 26307735
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26308023 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 26307924  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  26307923 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctaaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 26307825  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26307824 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 26307735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42622001 - 42621712
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||| | | | |||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42622001 taaagagtatagagaagaaggaaataacacatatagaattatagtggttcacccaacgtgtgctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 42621902  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||    
T  42621901 tggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcatctgaacaataacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttt 42621802  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  42621801 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 42621712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 14247654 - 14247945
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||| |||| |||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14247654 taaagagtgtagaaaagagagaaggaacacacaaatatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttttgagagtttccacta 14247753  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||   ||| ||| ||||||  || ||||||||||||||    
T  14247754 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacttgaacaattacaacacctgaattctctaagcatcagcaggcttgcacct 14247853  T
Q  353 tgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt-attacaattt 443  Q
    | |||||||  || ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  14247854 tcttgctaagatacccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagtaccactaaagttagatgagattttgattacaattt 14247945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 5614483 - 5614882
Alignment:
Q  33 attctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttg 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  5614483 attctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttg 5614582  T
Q  131 tgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    ||||| || ||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5614583 tgtgtgtt-gtgtttattgtaggtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctca 5614681  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttc 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||    
T  5614682 caatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactgtattctc 5614780  T
Q  330 taagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    | || ||| | |||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5614781 ttagcctcagtaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatga 5614880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32099288 - 32099000
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  32099288 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 32099189  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  32099188 aatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 32099090  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  32099089 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 32099000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32109725 - 32109437
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  32109725 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 32109626  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  32109625 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 32109527  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  32109526 ttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 32109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Original strand, 15987817 - 15988092
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15987817 taaagagtatagggaagagaggaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctacta 15987916  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  15987917 tgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatgt-tgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctaagcaggcttgcacct 15988015  T
Q  353 tgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    | ||||||| ||| ||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15988016 tcttgctaagttacccacttagaattttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 15988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31825757 - 31825353
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  31825757 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 31825658  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31825657 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 31825559  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaat-tctg 322  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  |||    
T  31825558 ctcctcacaattttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaataactg 31825460  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || | | ||| |||| |||| || ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||| |||||||  ||||| |||| |||||||||| |    
T  31825459 tattctcttagccacagcaagcttacacctttcttgctaagttaaccacttagac-tttacacctttctgctcaa-ataacattttagtacccctaaagc 31825362  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  31825361 tagatgaga 31825353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 42596421 - 42596016
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  |||||||||||||  || |||||    
T  42596421 aaaagttattctcaagttgaaaacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaat 42596322  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||| ||||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  42596321 gtgtctgtgtgtgtt-gtgtttgctgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtcagtcta 42596223  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||   |||    
T  42596222 ctcctcacagttttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacgtgaacaattacaacaactg 42596124  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||  | |||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  42596123 tattctcttagccttagtaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacattttaatacccctaaagc 42596025  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  42596024 tagatgaga 42596016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 431
Target Start/End: Original strand, 7018584 - 7018834
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7018584 cacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcc 7018683  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  7018684 tgcaccttacaatctttgttcacctcaacaattacaactctgcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaactatttagactttt 7018783  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    ||||  ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  7018784 acaaccttttctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgtgatt 7018834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 181 - 431
Target Start/End: Original strand, 7033946 - 7034196
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7033946 cacataaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaggtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcc 7034045  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||| |||  ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||    
T  7034046 tgcaccttacaatctttgttcacctcaacaattacaactctgcattctctaagcctcaacagtcttgcaccttattgctaagttaactatttagactttt 7034145  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    ||||  ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  7034146 acaaccttttctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgtgatt 7034196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 425
Target Start/End: Original strand, 13284730 - 13285131
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  || | | || |||||||||||| |||| |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  13284730 aaaagttattctcaagttgataacttgcaatggttaaggtaacagatagacttcagaacgttctgaagtcttagtataaaaacaatttaaataattaaat 13284829  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || || ||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  13284830 gtgtttgtgtgtgtt-gtatttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttataatggttcccccaatgtgggttagtcca 13284928  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    ||    
T  13284929 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaattg 13285027  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||| | | ||| ||||||| || ||||||  ||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  13285028 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgatcagttacccacttagac-tttacacctttatgctcaaggtaacactttagtacccctaaagc 13285126  T
Q  421 tagat 425  Q
    |||||    
T  13285127 tagat 13285131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 116 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12575130 - 12574931
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12575130 aagtaactgtgtttgtgtgtgtttttgtttgcagtaagtaaagagtatatggaatagagaataaaaacacagagatttataatggttcccccaatgtggg 12575031  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12575030 ttactccactcctcacgatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatct-tgttcacctgaacaattac 12574932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 116 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12516210 - 12516011
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  12516210 aagtaactgcgtttgtgtgtgtttgtgttttcagtaagtacagagtatagggaagagagaataaacacacacagatttatagtggttcccccaatgtggg 12516111  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12516110 ttactccactcctcacgatcttgtgagagttcccactatgatgtttaagataacctctcaaatcccgcactttacaatct-tgttcacctgaacaattac 12516012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Original strand, 12826401 - 12826692
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  12826401 aaaagttattctcaagttgaaaacttagaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 12826500  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||| || |||  |  | |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12826501 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaagagtaaagataaaagaagaagaacacatagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 12826599  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12826600 ctactcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcttgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaa 12826692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 41028638 - 41028347
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  41028638 aaaagttattctcaagttgaaaacttgaaatgatcaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 41028539  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || ||||||   ||||||||| | || ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41028538 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttaatgtaagtaaatattaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 41028440  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  41028439 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaa 41028347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 158 - 429
Target Start/End: Original strand, 2991045 - 2991315
Alignment:
Q  158 gagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgat 257  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2991045 gagtatagggaagagagaaagaacacactaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactactcacaatattgtgagaatttccactatgat 2991144  T
Q  258 gcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgtt 356  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||| ||| ||   |||||  ||||||| ||| |||||||||||| || ||    
T  2991145 tcttgagataacctctcaaatcctacactttacaacctttgttcacttgaacaattataacacctgta--ttctaagcctcagcaggcttgcacattctt 2991242  T
Q  357 gctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||| ||| ||||||| | ||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2991243 gctaagttacccacttagaattttagaatatttactcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 2991315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 116 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12492405 - 12492206
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12492405 aagtaattgtgtttgtgtgtgtttgtgttttcagtaagtacagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcctccaatgtggg 12492306  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  12492305 ttactccactcctcacgatcttgtgagagttcctactatgatgtttgagataacctttcaaattctgcactttacaatct-tgttcacctaaacaattac 12492207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9007859 - 9007579
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagagaagaga-gaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagttt 247  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9007859 gtaaataaagagtatagggaagagaagaataa-cacacaaagatttatagtggttcatccaatgtgggccagtccactcctcacaatcttgagagagttt 9007761  T
Q  248 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggctt 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||  |||||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  9007760 ccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcacatgacaacct-tgttcagttgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggctt 9007662  T
Q  347 gcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||| ||||  |  ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  9007661 gcaccttcttgttaagttacccacttagacttctacacctactgctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgaga 9007579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 100 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 13130799 - 13130605
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  13130799 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 13130701  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct 295  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13130700 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct 13130605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 182 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12770964 - 12770712
Alignment:
Q  182 acacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcct 281  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12770964 acacaaagagttatagtggttcacccgacatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatctt 12770865  T
Q  282 gcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaacttt 379  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   || |||| |||||| |||  ||  ||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||    
T  12770864 gcaccttacaacct-tgttcacctgaacagttacaacacctatattctctaagcctcaaca-acttacacttttcttgctaagttacccacttaaacttt 12770767  T
Q  380 tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||    
T  12770766 tacaccttttgctcaaactaacactttagtacccctatagctagatgagacttta 12770712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12088237 - 12088073
Alignment:
Q  152 agtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccac 251  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12088237 agtaaagagtaaagagaagataagaagaacacacaaaaatttatagcggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagattttccaa 12088138  T
Q  252 tatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12088137 taagatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaa 12088073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40703399 - 40703334
Alignment:
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40703399 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaattcctgcacc 40703334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 320 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12492173 - 12492064
Alignment:
Q  320 ctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa 419  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| || |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12492173 ctgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgctcaaactaacactttaatacccctaaag 12492074  T
Q  420 ctagatgaga 429  Q
    |||| |||||    
T  12492073 ctagttgaga 12492064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 12515977 - 12515869
Alignment:
Q  321 tgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| || |||| ||| |||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  12515977 tgtattctctaagcctcggcatgcttgcagcttctttctaagttacccacttagtcttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 12515878  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    ||| |||||    
T  12515877 tagttgaga 12515869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27989713 - 27989625
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  27989713 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagactttgttacaattt 27989625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40703643 - 40703569
Alignment:
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct 295  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  40703643 ccacccctcacaatcctgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaattcctgcaccgaacaatct 40703569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 40703246 - 40703188
Alignment:
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatga---tgcttgagataacctctcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  40703246 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgttgcttgagataacctctcaa 40703188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 43984184 - 43984095
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  43984184 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 43984095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 45554089 - 45554010
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  45554089 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 45554010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 24539995 - 24540074
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  24539995 ttgctaagttaccctcttagacttttgcacatttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 24540074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43984277 - 43984202
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  43984277 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 43984202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10416570 - 10416530
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10416570 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 10416530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28392177 - 28392105
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||    
T  28392177 cacacaagaagttatcctggttcccccaatgtgggttagtccagtccccacaatactgtgagattatccacta 28392105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45554143 - 45554103
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  45554143 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 45554103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 306; Significance: 1e-172; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 14801436 - 14801872
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14801436 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 14801535  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14801536 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgt--ttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacggaaattaatagtggttccccc 14801633  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14801634 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 14801733  T
Q  308 acacttac---aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacact 404  Q
    ||||||||   |||| |||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14801734 acacttacaataattatgtattgtgtaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacact 14801833  T
Q  405 ttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| || |||| |||||    
T  14801834 ttagtacccctaaagctagatgagagttgattataattt 14801872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20294092 - 20293666
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20294092 aaattatcctgtaacttcaaaagtaattcgcaagttgaaacttggaatggttaagttaatggcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 20293993  T
Q  108 gttt-aacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  20293992 gttttaacaaagtaaatgtgtttgtgt----------ttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcacc 20293903  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20293902 caacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 20293803  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | | |||||| ||| |||||    
T  20293802 aacacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttacaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaatctcttctcaagttaatacttt 20293703  T
Q  407 aatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | ||||||| || |||||||||| || ||||||||||    
T  20293702 agtacccctgaagctagatgagacttgattacaattt 20293666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 4781480 - 4781879
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   || | || |||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4781480 attctcaagttgaaacttgaaatggctaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtttgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 4781579  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4781580 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 4781678  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4781679 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacaattctgtattctcta 4781778  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  4781779 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 4781878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 19827264 - 19827660
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  19827264 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaacagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaatatggtaaatgtgtttgtg 19827363  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  19827364 tgtgtt-gtgtatgcaataattaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccactcctcac 19827462  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19827463 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 19827562  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19827563 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgaga 19827660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 20743740 - 20744141
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaat--ggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttg 130  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||   || | || |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20743740 attcttaagttgaaacttggaatatggttaagttaaaagcagacttcagaaagttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttg 20743839  T
Q  131 tgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctc 229  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20743840 tgtgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagaaaatcaacacacagacaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctc 20743938  T
Q  230 acaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttc 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20743939 acaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattttc 20744038  T
Q  330 taagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20744039 taagcctcagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 20744138  T
Q  430 ttt 432  Q
    |||    
T  20744139 ttt 20744141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 2487907 - 2488306
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2487907 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaatagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 2488005  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2488006 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcac 2488104  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||    
T  2488105 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctct 2488204  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  2488205 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagat 2488304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 51977519 - 51977915
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  51977519 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttatgatgtctgagtgcaaaaacaatttaatgaagtaaatgtgtttgtg 51977618  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattt-atagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  51977619 tgtgtt-gtgtatgcagtaaataaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagttcactcctcac 51977717  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  51977718 aatctagtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatttgtgttcacctgaacacctacaactctgtattctcta 51977817  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51977818 agcctcagcaggcttgcaccttgttgcggagttaaccatttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 51977915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 13118478 - 13118875
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13118478 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcataacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 13118577  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcaca 232  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13118578 tgt-gttgtgtatgcagtaagtaaagagtatag-gaagagagaatcaacata-gcaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcaca 13118674  T
Q  233 atcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||    
T  13118675 atcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacgttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcta 13118774  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13118775 agcctcagcaggcttgcacccggttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaaactagatgagatt 13118874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 80 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12387217 - 12386852
Alignment:
Q  80 aacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatca 179  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  12387217 aacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttactaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaattaaagagtatagggaagagagaataa 12387118  T
Q  180 tcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 279  Q
      ||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12387117 aaacacagagatttatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaatc 12387018  T
Q  280 ctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactt 378  Q
    || ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12387017 ctacaccttacaatttttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagccttagcagtcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagactt 12386918  T
Q  379 ttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga-ttttattacaattt 443  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  12386917 ttacaacctcggctcaggctaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgattacaattt 12386852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24773821 - 24773549
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgc-aaaaac 106  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  24773821 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaaattaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgccaaaaac 24773722  T
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24773721 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcaataaataaagagtataggaaagagagaatcaacacacaaaaatttatagtggttcccc 24773622  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 279  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24773621 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaaatc 24773549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 11090 - 11432
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| || |||| | |  ||| |||| |||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  11090 caaaaacaatttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaaaagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 11188  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11189 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgt 11288  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  11289 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaacctttgctcaagcta 11388  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11389 acactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 11432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4372499 - 4372171
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  4372499 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 4372401  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  4372400 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttca 4372301  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  4372300 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 4372201  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4372200 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 4372171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4382240 - 4381912
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  4382240 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 4382142  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  4382141 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttca 4382042  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  4382041 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 4381942  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4381941 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 4381912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 149 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20492945 - 20492663
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttc 248  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  | |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20492945 gtaattaaagagtataggaaagagagaaagaacacacagagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttc 20492846  T
Q  249 cactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgc 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  20492845 cactatgatgcttgagaaaacctctcaaatcctgcaccttacaaactttattcacctgaacaattacaaccttgtattctctaagcctcagcaggcttgc 20492746  T
Q  349 accttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20492745 accttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttactcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagatt 20492663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 1684408 - 1684696
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  1684408 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 1684507  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||     
T  1684508 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcggcaggcttgcaccttc 1684606  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  1684607 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 1684696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8973754 - 8973466
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8973754 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 8973655  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  8973654 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 8973556  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8973555 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 8973466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 8984309 - 8984021
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8984309 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 8984210  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  8984209 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 8984111  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8984110 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 8984021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 431
Target Start/End: Original strand, 4023230 - 4023559
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| || |||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||||    
T  4023230 caaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagatttatagtg 4023328  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4023329 gttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgatatttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgt 4023427  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||    
T  4023428 tcacctgaataattacaaccctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaacta 4023527  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  4023528 acactttagtacccctaaagttagatgagatt 4023559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 5654783 - 5655071
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  5654783 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 5654882  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  5654883 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 5654981  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5654982 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5655071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9538043 - 9537755
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9538043 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 9537944  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  9537943 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 9537845  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9537844 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 9537755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9548369 - 9548081
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9548369 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 9548270  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  9548269 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 9548171  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9548170 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 9548081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 157 - 443
Target Start/End: Original strand, 16334575 - 16334861
Alignment:
Q  157 agagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatga 256  Q
    |||||||||||||||  |||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16334575 agagtatagagaagaaggaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaaga 16334674  T
Q  257 tgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgtt 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  16334675 tgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttctt 16334773  T
Q  357 gctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16334774 gctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16334861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 49386404 - 49386810
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  49386404 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 49386503  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||| ||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49386504 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaggtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 49386602  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  49386603 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 49386701  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| ||| |||| |||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  49386702 tattctcttagcctcagcaagcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttttacacctttatgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 49386801  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  49386802 tagatgaga 49386810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 24872248 - 24872653
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  24872248 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 24872347  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24872348 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 24872446  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  24872447 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 24872545  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  24872546 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 24872644  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  24872645 tagatgaga 24872653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25434019 - 25433743
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25434019 taaagagtatagagaagaaggaaagagcacacagagaattaaagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 25433920  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    |||||| |||||| ||| |||||||||||||     
T  25433919 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaattgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccc 25433820  T
Q  353 tgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25433819 tgttgctaagttacccacttaaacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 25433743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6423215 - 6422927
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6423215 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6423116  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  6423115 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcagcttacaatct-tgttcaccagaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 6423017  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6423016 ttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6422927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6433642 - 6433354
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6433642 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtaggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6433543  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||     
T  6433542 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggattgcaccttc 6433444  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6433443 ttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6433354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 10507824 - 10508114
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||   |||||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10507824 taaagagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccacta 10507923  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||  ||||  ||||||||    
T  10507924 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcctcaacaggtctgcacctt 10508023  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga-ttttattacaattt 443  Q
     || |||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||  ||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  10508024 cttactaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaattaacactttagtaagcctaaagttagatgagactttgattacaattt 10508114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 154 - 367
Target Start/End: Original strand, 10002581 - 10002794
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10002581 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 10002680  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  10002681 tggtacttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 10002780  T
Q  354 gttgctaaattaac 367  Q
    |||||||| |||||    
T  10002781 gttgctaagttaac 10002794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 191 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11460011 - 11459773
Alignment:
Q  191 tttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11460011 tttatagtggttcacccattgtgggttagtccacttctcacaatcttatgagagttttcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcatcctac 11459912  T
Q  291 aatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaattttt 389  Q
    ||| | ||||||||| |||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||    
T  11459911 aatat-tgttcacctaaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccgcttacacttttacacttttt 11459813  T
Q  390 gctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  11459812 gctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgaga 11459773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 154 - 366
Target Start/End: Original strand, 10507010 - 10507222
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||   |||||||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10507010 taaagagtataagaaagagagaaagaacacacaaagatttataatggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagtgtttccacta 10507109  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| |||  ||||  ||||||||    
T  10507110 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcctcaacaggtctgcacctt 10507209  T
Q  354 gttgctaaattaa 366  Q
     || |||||||||    
T  10507210 cttactaaattaa 10507222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 141 - 317
Target Start/End: Original strand, 38817104 - 38817279
Alignment:
Q  141 tgtttgcagtaagtaaa-gagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgt 239  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |   | |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38817104 tgtttgctgtaagtaaaagagtaaagagaagagaaag--aacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccacttctcacaatcttgt 38817201  T
Q  240 gagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38817202 gagagtttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaa 38817279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24814871 - 24814638
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| | || | |||||||||| || | |||  |||||||||||||  || |||||    
T  24814871 aaaagttattctcaagttgaaaacttgaaatggttaagttaacagacagacttcaaaacgttctgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaat 24814772  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||| ||||||||||  |  | ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24814771 gtgtttgtgtgtgtg-gtgtttactgtaagtaaagagtaaagagaagagaagaagaacacacatgaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 24814673  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatg 258  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24814672 ctactcacaatcttgtgagattttccactatgatg 24814638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Original strand, 682966 - 683095
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  682966 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 683065  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  683066 gatgcttgagataacctctcaagtcctgca 683095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 317
Target Start/End: Original strand, 23503058 - 23503182
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  23503058 ttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttaagataccctatcaaattttgcaccttaca 23503157  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  23503158 atct-tgttcatctgaacaattacaa 23503182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Original strand, 11043899 - 11043996
Alignment:
Q  189 aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacc 286  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11043899 aatttataatggttcacccaatatgggctaatccactcctcacaatcttatgagaattttcactataatgcttgagataacctctcaactcctgcacc 11043996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 362 - 443
Target Start/End: Original strand, 10011571 - 10011652
Alignment:
Q  362 attaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  10011571 attaaccacttagacttttacaactcttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 10011652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17734955 - 17734772
Alignment:
Q  247 tccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||   ||||||| ||| || |||  ||||||    
T  17734955 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaacct-tgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcaccaggct 17734857  T
Q  346 tgca-ccttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    | ||   || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  17734856 tacatatttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgaga 17734772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19036224 - 19036041
Alignment:
Q  247 tccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggct 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||   ||||||| ||| || |||  ||||||    
T  19036224 tccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaacct-tgttcgcctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcatcaggct 19036126  T
Q  346 tgca-ccttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    | ||   || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  19036125 tacatttttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgaga 19036041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 280
Target Start/End: Original strand, 13430556 - 13430800
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat--gtgtttg 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | || | || ||||||| || | |||||||||| ||| |||  || || ||  |||||||    
T  13430556 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-actgacttcaaaatgttctgaagtgttagtgcaaaaagagtataattaattatatatgtgtttg 13430654  T
Q  131 tgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    | ||| || |||||| | |||||||| |||||||  |||||||  |  |  |||||||||||||||||||||    ||||||||| || || |||| |||    
T  13430655 tatgtatt-gtgtttaccgtaagtaa-gagtataaggaagagaagaaga--acacaaaaatttatagtggttaattcaatgtgggctaatctactcttca 13430750  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||||||||||| | | ||||||||||    
T  13430751 caatcttgtgagaattttcaatctgatgcttgagacaccatctcaaatcc 13430800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4372064 - 4371975
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  4372064 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 4371975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4381805 - 4381716
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  4381805 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 4381716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 24794236 - 24794073
Alignment:
Q  265 ataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaa 362  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||| || |||  ||||||| |||| || |||||||     
T  24794236 ataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactgtattatcttagcctcatcaggcttacacctttcttgctaag 24794138  T
Q  363 ttaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    ||| ||||||| || ||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||    
T  24794137 ttacccacttagac-tttacacctttcagctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatga 24794073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 20744240 - 20744319
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  20744240 ttgctaatttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 20744319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Original strand, 20649569 - 20649648
Alignment:
Q  211 gtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  20649569 gtgggttagtgcactccttacaat--tgtgagagtttccactatgatgtttgagacaaccttctcaactcatgcaccttaca 20649648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 51977929 - 51978003
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51977929 ttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 51978003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 2488405 - 2488484
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  2488405 ttgctaagttaccctcttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 2488484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4372157 - 4372082
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  4372157 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 4372082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4381898 - 4381823
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  4381898 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 4381823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 434
Target Start/End: Original strand, 51978029 - 51978096
Alignment:
Q  367 ccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  51978029 ccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 51978096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 2488317 - 2488391
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2488317 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 2488391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 13118886 - 13118960
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13118886 ttgctaagttacccacttagactttttcttcttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 13118960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 20744152 - 20744226
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20744152 ttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 20744226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 434
Target Start/End: Original strand, 4782012 - 4782057
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4782012 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 4782057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 434
Target Start/End: Original strand, 13119009 - 13119053
Alignment:
Q  390 gctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  13119009 gctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 13119053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 18705331 - 18705766
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  18705331 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatagttaagttaatgacagacttcagaacgttctgacgtctgattgcaaaaata 18705430  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18705431 gattaacaaagtaaatgtatttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttccccc 18705530  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18705531 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctga 18705630  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18705631 acacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggattacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatcttagctcaagctaacacttta 18705730  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||||| |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  18705731 gtaccccaaaagttagatgagacttgattacaattt 18705766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 18711266 - 18711701
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  18711266 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatagttaagttaatgacagacttcagaacgttctgacgtctgattgcaaaaata 18711365  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18711366 gattaacaaagtaaatgtatttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagaaatttatagtggttccccc 18711465  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18711466 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctgtgttcacctga 18711565  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18711566 acacttacaattctgtattctctaagcctcagcaggtttacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatcttagctcaagctaacacttta 18711665  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||||| |||  ||||||||| || ||||||||||    
T  18711666 gtaccccaaaagttagatgagacttgattacaattt 18711701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16322377 - 16321942
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  16322377 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaata 16322278  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||    
T  16322277 gtttaacaaagtgaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttccccc 16322178  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  16322177 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctga 16322078  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16322077 acaattacaattatgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatatttgctcaagctaacacttta 16321978  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  16321977 gtactcctaaagctagatgtgacttcattacaattt 16321942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16334525 - 16334090
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||| |    
T  16334525 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaata 16334426  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||    
T  16334425 gtttaacaaagtgaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtataaggaagagagaataaacacacagagatttatggtggttccccc 16334326  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  16334325 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgtaccttacaatctttgttcacctga 16334226  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||| |||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16334225 acaattacaattatgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatatttgctcaagctaacacttta 16334126  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     ||| |||||| ||||||| || || ||||||||||    
T  16334125 gtactcctaaagctagatgtgacttcattacaattt 16334090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26169438 - 26169035
Alignment:
Q  28 aagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgt 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26169438 aagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgt 26169339  T
Q  128 ttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcc 227  Q
    ||||||          || || |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26169338 ttgtgt----------tttcaataagtaaagagtatagggaagagagaataa--acacagagatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcc 26169251  T
Q  228 tcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattt 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  26169250 tcacaatcttgtgagagtctccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccgtgttctcctgaacacttacaattctgtattc 26169151  T
Q  328 tctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  26169150 tctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagtacccctaaagctagatga 26169051  T
Q  428 gattttattacaattt 443  Q
    || || ||||||||||    
T  26169050 gacttgattacaattt 26169035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 26019440 - 26019840
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatga-catattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26019440 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgt 26019539  T
Q  132 gtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaa-tttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    |||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26019540 gtgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacggagagtttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctca 26019638  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26019639 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacaattctgtattctct 26019738  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26019739 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagat 26019838  T
Q  431 tt 432  Q
    ||    
T  26019839 tt 26019840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 30656911 - 30657310
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  30656911 attctcaagttgaaacttggaatagttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaaaatttaataaaataaatgtgtttgtg 30657010  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30657011 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcac 30657109  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  30657110 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaaccctgtattctcta 30657209  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30657210 agcctcagcacgcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 30657309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 1598187 - 1597789
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1598187 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgt-tttgtg 1598090  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1598089 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacaccgagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 1597991  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||    
T  1597990 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaaccctgcaccttacaatccttgttcacatgaacaattacaacatctgtattctct 1597891  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1597890 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagat 1597791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 100 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18202509 - 18202178
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||  |||||||||| | |||||| | | ||||||||    
T  18202509 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtataggtaagagagaataaacacacagagaattatagtg 18202411  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  18202410 gtttccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgt 18202311  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||    
T  18202310 tcacctgaacaattacaactctgtattttctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaatttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaacta 18202211  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  18202210 acactttagtacccctaaagttagatgagattt 18202178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Original strand, 790176 - 790451
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  790176 taaagagtatagggaagagagaaaggacacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaattttgtgagagtttccacta 790275  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||    
T  790276 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaactt 790375  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  790376 gttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 790451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 7753755 - 7754154
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  7753755 attctcaagttgaaacttggaattgttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagcttaataaaataaatgtgtttgtg 7753854  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaa-aaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7753855 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacaacaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 7753953  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||    | |  | ||    ||||||||| ||||    
T  7753954 aatcttgtgtgagtttcctctatgatgttttagataacctctcaaatcctgcactttacaattttttttttttttattatttttttttctgtattctcta 7754053  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7754054 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttactaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 7754153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 291
Target Start/End: Original strand, 12988891 - 12989148
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||| ||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12988891 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaatgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 12988989  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12988990 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 12989088  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12989089 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 12989148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20968804 - 20968462
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |||| |    ||| ||||||||||||||||||  |||  |  ||||| | | ||||||||    
T  20968804 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatattataattaaagagtatagagaagaaggaaagaatacacagagaattatagtg 20968706  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20968705 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgt 20968606  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  20968605 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgtttctaagttaaccatttagacttttacaacctttgctcaaacta 20968506  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  20968505 acactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 20968462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17826761 - 17826472
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17826761 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 17826662  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  17826661 tgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattataactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 17826562  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  17826561 gttgctaaatgaaccacttagaattttacaaccttcgctcaaactaacactttagtacccataaagctagatgagactttgttacaattt 17826472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 29541408 - 29541068
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||| | | | ||||||||    
T  29541408 caaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacatagagaattatagtg 29541310  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29541309 gttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgt 29541210  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||| || |||    
T  29541209 tcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttagaacctttgcttaaacta 29541110  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaat 441  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||    
T  29541109 acactttagtacccctaaagttagataagactttgttacaat 29541068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 3286754 - 3286466
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  3286754 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 3286655  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  3286654 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 3286556  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  3286555 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 3286466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12455961 - 12455673
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  12455961 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 12455862  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  12455861 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 12455763  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  12455762 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 12455673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 14792510 - 14792222
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  14792510 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 14792411  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  14792410 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 14792312  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  14792311 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 14792222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16898854 - 16898566
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16898854 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16898755  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  16898754 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16898656  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16898655 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16898566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18160969 - 18160681
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18160969 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18160870  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18160869 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18160771  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18160770 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18160681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20913190 - 20912902
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  20913190 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 20913091  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  20913090 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 20912992  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  20912991 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 20912902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16909507 - 16909219
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16909507 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16909408  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  16909407 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgtttacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 16909309  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16909308 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16909219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18170781 - 18170493
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18170781 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18170682  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18170681 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18170583  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18170582 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18170493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Original strand, 22222634 - 22222910
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||  |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22222634 taaagagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 22222733  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22222734 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaa--ctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 22222831  T
Q  351 cttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
     || ||||||| ||| |||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22222832 tttcttgctaagttacccacatagacttttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 22222910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 429
Target Start/End: Original strand, 22248469 - 22248745
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||  |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22248469 taaagagtatagggaagagaagaagaacgcacaaagatttatagtggttcccccaatgtgagttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 22248568  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  22248569 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaa--ctgtattctctaagcctcagcaggcttgcac 22248666  T
Q  351 cttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
     || ||||||| ||| |||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22248667 tttcttgctaagttacccacatagacttttacaacttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 22248745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31358469 - 31358181
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  31358469 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 31358370  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  31358369 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 31358271  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  31358270 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaaggtagatgagactttgttacaattt 31358181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31368199 - 31367911
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  31368199 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 31368100  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  31368099 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 31368001  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  31368000 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaaggtagatgagactttgttacaattt 31367911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 24921151 - 24921439
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    |||||||||||||| || ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  24921151 aaagagtatagagaggaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 24921250  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  24921251 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 24921349  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  24921350 ttgctaagttagccacttagacttttacaacatttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 24921439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 24930187 - 24930475
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    |||||||||||||| || ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  24930187 aaagagtatagagaggaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 24930286  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  24930287 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 24930385  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  24930386 ttgctaagttagccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 24930475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34766391 - 34765991
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  34766391 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 34766292  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34766291 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaaga-agaa----cacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 34766198  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  34766197 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 34766099  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  34766098 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 34766000  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  34765999 tagatgaga 34765991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 181 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 9034298 - 9034051
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9034298 cacacataaatttatagtggttcacccaatgtgagttagtccactccacacaatcttgtgggagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcc 9034199  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
    ||||  ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  9034198 tgcaatttacaatct-tgttcgcccgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagactttt 9034100  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  9034099 acaacctttgctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgaga 9034051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19364101 - 19363823
Alignment:
Q  32 aattctcaagttg-aaacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgttt 129  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| | || | |||||||||| || | |||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  19364101 aattttcaagttgtaaacttggaatggttaagttattagacagacttcataacgttctgaagtgttagtgtaaaaacagtttaaataaataaatgtgttt 19364002  T
Q  130 gtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctc 229  Q
    |||||| || |||||| | | |||||||||||||||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  19364001 gtgtgtgtt-gtgtttactgaaagtaaagagtatagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcgcccaatgtgggttagtccacttctc 19363903  T
Q  230 acaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaaca 310  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  19363902 acaatattgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatct-tgttcgcctgaaca 19363823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 8562325 - 8562730
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaatga-catattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  | || | || | ||| |||||| || | |||  |||||||||||||  || |||||    
T  8562325 aaaagttattctcaagttgaaaacttggagtggttaagttaacaaacagacttcaaaacattctgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaat 8562424  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  8562425 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttattgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatattggttcccccaatgtgggttagtcca 8562523  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  8562524 ctcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 8562622  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| ||||||||  ||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  8562623 tattctcttagcctcagcaggcttatacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 8562721  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    || ||||||    
T  8562722 tatatgaga 8562730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 168 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 15504331 - 15504066
Alignment:
Q  168 aagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagata 267  Q
    |||||||||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15504331 aagagagaaggaacacacaaagatttatagaggttcacctaatatgggctagtccacttcccacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagata 15504232  T
Q  268 acctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattc-tgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaa 366  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  | | |||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| |||     
T  15504231 accactcaaatcttgcaccttacaatctttgttcagctgaacaattacaacacatatattctctaagcctcagcaggcttccaccttcttgctaagttat 15504132  T
Q  367 ccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  15504131 ccacttagacttttacaaactttccttaaactaacactttagtacccttaaagctagatgagattt 15504066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 27786697 - 27786948
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||| |||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27786697 ttatagtgattcatccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatacttgagataacctctcaactcttgcaccttaca 27786796  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttg 390  Q
    || | |||||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||  ||||    
T  27786797 atat-tgttcacctgaacacttacaacgattgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt-ttgctaagttacccacttagactttcacaacatttg 27786894  T
Q  391 ctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt-attacaattt 443  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  27786895 ctcaaactaacaatttagtacccctaaagctatatgagattttgattacaattt 27786948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 226
Target Start/End: Original strand, 24502611 - 24502802
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24502611 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 24502710  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactc 226  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24502711 tgt-gttgtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacaca-gagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactc 24502802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 138 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24692733 - 24692444
Alignment:
Q  138 ttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagaga-gaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatct 236  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24692733 ttgtgtttaccgtaagtaaagagtaaagagaagagaagaa----cacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcaactcctcacaatct 24692638  T
Q  237 tgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtc 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||| | ||| || |    
T  24692637 tgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactgtactctcttagcc 24692539  T
Q  336 tcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || |||||||| |||| || ||||||| ||| | ||||| |  ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  24692538 tcagcaggcttacacctttcttgctaagttacctacttaga-atttacacctttctgctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgaga 24692444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26169636 - 26169438
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26169636 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26169537  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||          |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  26169536 gtttaacaaagtaaatgtgttt----------gtgttttcaataagtaaagagtatagggaagagagaataa--acacagagatttatagtggttccccc 26169449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18335944 - 18335662
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttg 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||| | || ||||||||||||  | | |||  ||||||| |||||  || ||||||||||||    
T  18335944 attctcaagttgaaaacttggaataattaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaaatgttagtataaaaacaatttaaataattaaatgtgtttg 18335845  T
Q  131 tgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    ||||| || ||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  18335844 tgtgtgtt-gtgtttattgtaagtaaagagta-agagaagagaaaaagaacacacagaaatttatagaggttcaaccaatgtgggttagtccactcctca 18335747  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||||||||| ||||||    
T  18335746 caatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataatttctcaaatcctacaccttacaacc--ttttcacctgaacaattacaa 18335662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 28093604 - 28093346
Alignment:
Q  80 aacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatca 179  Q
    |||||||||| || | ||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||  |||||||  |  |    
T  28093604 aacgttctgaagtgttagtgcaataatagtttaaataagtaaatgtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaa-agtataaggaagagaagaaga 28093507  T
Q  180 tcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 279  Q
      ||||| |||||||||||||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    |||||||||    
T  28093506 agacacataaatttatagtggttcacctaacatgggctaatccactcctcacaatcttgtgagaattttcactgtgatgcttgagat----tctcaaatc 28093411  T
Q  280 ctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggctt 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28093410 ctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaactacaa-cctgtattctctaagtctcggcaggctt 28093346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 6314519 - 6314913
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaac-agtttaacaaagtaaatgtgtttgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  | || ||||||||| || || | ||||||||||| | |||||  || ||||| |||||||    
T  6314519 attctcaagttgaaacttggaattgttaagttaaatactgacttcagaacgttcagaagtgttagtgcaaaaaccactttaaataaataaatatgtttgt 6314618  T
Q  132 gtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    |||| || |||||  | ||||||||| ||||||  |||||||  |  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  6314619 gtgtgtt-gtgttaactgtaagtaaa-agtataaggaagagaataaaaacacacaaaaatttatagtagttcacccaatgtgggataatctactcctcac 6314716  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg-aacacttacaattctgtattttct 330  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| | ||||| | || |||| ||||||  ||||||| ||     
T  6314717 aatcttgtgagaaattccattatgatgcttgagataccctctcaaatcctgcaccaaacaattt-tgttcccttggaacaattacaaaactgtattctcg 6314815  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgca-ccttgtt-gctaaattaaccacttaaacttttacaatttt-tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    ||| ||| |||||||| || ||||||| ||||| | |  |||| | ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6314816 aagcctcagcaggcttacaaccttgtttgctaagtca--cact-agacttt-acaactttctgctcaacctaacactttaatacccttaaagctagatga 6314911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26169825 - 26169700
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26169825 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26169726  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26169725 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 26169700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26170014 - 26169889
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26170014 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26169915  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26169914 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 26169889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26170203 - 26170078
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26170203 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26170104  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26170103 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 26170078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26170392 - 26170267
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26170392 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26170293  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26170292 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 26170267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 26170581 - 26170456
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26170581 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 26170482  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26170481 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 26170456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26045165 - 26045068
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  26045165 ttatagtggttcacctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgaga-tgttcactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 26045069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 26019939 - 26020018
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  26019939 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 26020018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 30657321 - 30657400
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  30657321 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 30657400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 350 - 427
Target Start/End: Original strand, 790460 - 790537
Alignment:
Q  350 ccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  790460 ccttcttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatga 790537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26140829 - 26140732
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  26140829 ttatagtggttcatctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgaga-tgttcactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 26140733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 9033949 - 9033870
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9033949 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagacttta 9033870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1597778 - 1597704
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1597778 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 1597704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 9034037 - 9033967
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagat 425  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  9034037 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagat 9033967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 292
Target Start/End: Original strand, 9760737 - 9760822
Alignment:
Q  206 ccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagttt-ccactatgatgcttgagataacct-ctcaaatcctgcaccttacaa 292  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||   |||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  9760737 ccaacgtgggctagtccactcctcacaat---gtgagagttttccactacgatgcttgagacaacattctcaactcctgcaccttacaa 9760822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18202167 - 18202093
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||   || | ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18202167 ttgctaagttacccacttagacttttacttcttcttctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 18202093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25537769 - 25537672
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||  |||||||| |||  |||||||||||||||| |||| ||| || || ||||||||||    
T  25537769 ttatagtggttcatccaatgtgggttagttcactcctcccaa--ttgtgaga-tttttactatgatgcttgagacaaccttctgaactcatgcaccttac 25537673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 433
Target Start/End: Original strand, 9760924 - 9760960
Alignment:
Q  397 ctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9760924 ctaacactttaatacccttaaagctagatgagatttt 9760960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18333389 - 18333349
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18333389 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 18333349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26044904 - 26044868
Alignment:
Q  397 ctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26044904 ctaacattttaatacccttaaaactagatgagatttt 26044868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26140567 - 26140531
Alignment:
Q  397 ctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26140567 ctaacattttaatacccttaaaactagatgagatttt 26140531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26170651 - 26170611
Alignment:
Q  137 tttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaat 177  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26170651 tttgtgttttcaataagtaaagagtatagggaagagagaat 26170611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Original strand, 27741202 - 27741274
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||    
T  27741202 cacacaagaagttatcctggttcccccaatgtgggttagtccagtccccacaatactgtgagattatccacta 27741274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Original strand, 27750383 - 27750455
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||    
T  27750383 cacacaagaagttatcctggttcccccaatgtgggttagtccagtccccacaatactgtgagattatccacta 27750455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 28451381 - 28450947
Alignment:
Q  9 aattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacag 108  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  28451381 aattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaatttggaatggttaagttaataataaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacaa 28451282  T
Q  109 tttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccca 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28451281 tttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttggagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttccccca 28451182  T
Q  209 atgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaa 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28451181 atgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacatgaa 28451082  T
Q  309 cacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaa 408  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||      
T  28451081 cacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttgg 28450982  T
Q  409 tacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||| |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  28450981 tacccttaaagctagatgagatttgtttacaattt 28450947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45191866 - 45191457
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45191866 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-atagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 45191768  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45191767 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 45191669  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45191668 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 45191569  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  45191568 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 45191469  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  45191468 ttgttacaattt 45191457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 3604594 - 3604994
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatatttt-agaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3604594 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagactttcagaacgttctgatgtctcagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgt 3604693  T
Q  132 gtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctca 230  Q
    |||| || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3604694 gtgtgtt-gtgtatgcagtaagtgaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctca 3604792  T
Q  231 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  3604793 caatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcccgcaccttacaatatgcgttcacctgaacacttacaactttgtattctct 3604892  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  3604893 aagcctcagcaagcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaattcagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgagat 3604992  T
Q  431 tt 432  Q
    ||    
T  3604993 tt 3604994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 22678699 - 22679098
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22678699 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagtatacttcagaacgttatgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtgaatgtgtttgtg 22678798  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22678799 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttccctcaatgtgggttagtccactcctcac 22678897  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22678898 aatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctcta 22678997  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  22678998 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccttaaagctagatgagatt 22679097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 44637605 - 44638001
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44637605 attctcaagttgaagcttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtttgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 44637704  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattta-tagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44637705 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaaaacatagagattttgtagtggttcccccaatgtgggttagcccactcctcac 44637803  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  44637804 aatcttgtgagagtttccactttgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttaccatctgtgatcacctgaacacttacaacactgtattctcta 44637903  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44637904 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttaacacccctaaagctagatgaga 44638001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 16901169 - 16901569
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16901169 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 16901268  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16901269 tgtgtt-gtgtatgtagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 16901367  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||    
T  16901368 aatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctct 16901467  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||     |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16901468 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaaacgcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagat 16901567  T
Q  431 tt 432  Q
    ||    
T  16901568 tt 16901569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 16994560 - 16994960
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16994560 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 16994659  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16994660 tgtgtt-gtgtatgtagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 16994758  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||    
T  16994759 aatcttgtgagagtttccactatgatggttgagataacctctcaaatcctgcactttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctct 16994858  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||     |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16994859 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaaacgcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagat 16994958  T
Q  431 tt 432  Q
    ||    
T  16994959 tt 16994960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 413
Target Start/End: Original strand, 22671560 - 22671939
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||| || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22671560 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagtatacttcagaacgttatgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtgaatgtgtttgtg 22671659  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22671660 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtcgttcccc-aatgtgggttagtccactcctcac 22671757  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  22671758 aatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctcta 22671857  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaataccc 413  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||    
T  22671858 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtaccc 22671939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Original strand, 32935807 - 32936146
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||  ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  32935807 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatatggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 32935905  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32935906 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 32936004  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  32936005 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 32936104  T
Q  403 ctttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  32936105 ctttaggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 32936146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 37862132 - 37862473
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||| |  |||||||    
T  37862132 caaaaactgtttaataaagtaaa-gtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaagtatagtg 37862229  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37862230 gttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatcattgt 37862329  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  37862330 tcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcaacaggcttgcacctttttgctaagttaaccactaaaacttttacaacctttgctcaaacta 37862429  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  37862430 acactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 37862473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4468962 - 4468634
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  4468962 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 4468864  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  4468863 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 4468764  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  4468763 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 4468664  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4468663 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 4468634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 208 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 12571452 - 12571217
Alignment:
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  12571452 aatgtgggttagtccactactcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctatgttcacctaa 12571353  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12571352 acacttacaattatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacacttta 12571253  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  12571252 gtacccctaaagctagatgagacttgattacaattt 12571217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 4459337 - 4459009
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  4459337 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 4459239  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  4459238 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 4459139  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  4459138 cctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 4459039  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4459038 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 4459009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 5345734 - 5346062
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  5345734 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 5345832  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  5345833 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttca 5345932  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  5345933 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 5346032  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5346033 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 5346062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 45015622 - 45015333
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015622 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 45015523  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  45015522 tggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcttcagcaggcttgcacctt 45015423  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  45015422 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 45015333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 29424314 - 29423973
Alignment:
Q  101 aaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtgg 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||  | |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||    
T  29424314 aaaaactgtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgct-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaagagcacacagataattatagtgg 29424216  T
Q  201 ttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgtt 300  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  29424215 ttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcatgcaccttacaatctttgtt 29424116  T
Q  301 cacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaa 400  Q
    |||||||||| |||||| |||||| | |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  29424115 cacctgaacaattacaactctgtactctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaaactaa 29424016  T
Q  401 cactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  29424015 cactttagtacccctaaagttagatgagactttgttacaattt 29423973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 5335882 - 5336210
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  5335882 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 5335980  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  5335981 cacccaatgtgggctagtctactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatcttcgttca 5336080  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  5336081 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 5336180  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5336181 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 5336210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 38929578 - 38929867
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38929578 taaagagtatagagaagaaggaaaaaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 38929677  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  38929678 tggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactttgtattctctaagcctcaacaggcttgcacctt 38929777  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  38929778 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagatgagactttgttacaattt 38929867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 38956920 - 38957209
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  ||   | |||||| | | ||||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38956920 taaagagtatagagaagaaggagagaacacacagagaattatagtggttcatccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 38957019  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  38957020 tggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 38957119  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  38957120 gttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagatgagactttgttacaattt 38957209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 24695655 - 24695941
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  24695655 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactc---acaatcttgtgagagtttccacta 24695751  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24695752 tggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 24695851  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  24695852 gttgctaagttaaccacttagacttttacaaactttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 24695941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 2997768 - 2998056
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  2997768 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 2997867  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  2997868 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 2997966  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  2997967 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 2998056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18652126 - 18651838
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18652126 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18652027  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18652026 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18651928  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18651927 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18664244 - 18663956
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18664244 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18664145  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18664144 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18664046  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18664045 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18663956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 9501831 - 9502119
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9501831 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 9501930  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  9501931 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 9502029  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9502030 ttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 9502119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 9513197 - 9513485
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9513197 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 9513296  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  9513297 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 9513395  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9513396 ttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 9513485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 17489598 - 17489310
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  17489598 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 17489499  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  17489498 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctatattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 17489400  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  17489399 ttgctaagttaaccacttagacttttacaaccttttctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 17489310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 27158945 - 27159350
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| ||| ||| ||| |  || |||||    
T  27158945 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtgtaaacacaatttgaataattaaat 27159044  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27159045 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 27159143  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaatt-ctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  27159144 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 27159242  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg-ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttt-tgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  27159243 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt-acacctttcttctcaaactaacactttagtacccctaaagc 27159341  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  27159342 tagatgaga 27159350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 27169293 - 27169698
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| ||| ||| ||| |  || |||||    
T  27169293 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtgtaaacacaatttgaataattaaat 27169392  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  27169393 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 27169491  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaatt-ctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  27169492 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 27169590  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg-ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttt-tgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  27169591 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt-acacctttcttctcaaactaacactttagtacccctaaagc 27169689  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  27169690 tagatgaga 27169698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12580373 - 12580175
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12580373 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttcaaacttggaatggttaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 12580274  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12580273 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccc 12580175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 22907816 - 22908221
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaatga-catattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  | || | || |||||||| ||| || | |||  |||||||||||||  || |||||    
T  22907816 aaaagttattctcaagttgaaaacttggaatgattaagttaacaaacagacttcagaacgttatgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaat 22907915  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22907916 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaagagtaaagagaggagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 22908014  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||||    ||    
T  22908015 ctcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgattaattacaacaattg 22908113  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  22908114 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 22908212  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  22908213 tagatgaga 22908221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 195 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21110083 - 21109833
Alignment:
Q  195 tagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatc 294  Q
    ||||||||| ||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21110083 tagtggttcacccaatgtggactagtccactcctcgcaatcttgtgagagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatc 21109984  T
Q  295 tgtgttcacctgaacacttacaattc-tgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctc 393  Q
    | |||||| ||||||| ||||||  | | |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  21109983 tttgttcaactgaacaattacaacacatatattctctaagtctcagcaggcttgcaccttcttgttaagttacccacttagacttttacaaactttgctc 21109884  T
Q  394 aagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt-attacaattt 443  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  21109883 aaactaacactttagtacccctaaagctatatgagattttgattacaattt 21109833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 443
Target Start/End: Original strand, 41026004 - 41026265
Alignment:
Q  183 cacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctg 282  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41026004 cacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcttcacaatcttgcgagagtttccatcatgatgcttgagacaacctctcaaatcctg 41026103  T
Q  283 caccttacaatctgtgttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttt 379  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||   ||||  |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  41026104 caccttacaatctttgttcacctaaacaattatatcaat--tgtattctctaagcctcatcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttt 41026201  T
Q  380 tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  41026202 tacaatctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttgattacaattt 41026265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19343354 - 19342949
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| | || | |||||||||| || | |||  |||||||| ||||  || |||||    
T  19343354 aaaagttattctcaagttgaaaacttgaaatggttaagttaaccgacagacttcataacgttctgaagtgttagtataaaaacagattaaataattaaat 19343255  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    ||| |||||||| || |||||| |  |||| |||||||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19343254 gtgattgtgtgtgtt-gtgtttactataagcaaagagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 19343156  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  19343155 ctcctcacaatcttgtgagatttttgactatgatgatttagataacttctcaaatcctacaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 19343057  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  19343056 tattctctaagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttaatacccctaaagc 19342958  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  19342957 tagatgaga 19342949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 119 - 443
Target Start/End: Original strand, 69209 - 69533
Alignment:
Q  119 taaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtta 218  Q
    ||||||||||||||||| || |||| | | |||| |||||||| ||  |||||||  |  | |||||| | |||||||||||||   ||||||| || ||    
T  69209 taaatgtgtttgtgtgtgtt-gtgtatactgtaaataaagagtgtatggaagagaagaagaacacacagagatttatagtggtttatccaatgttggcta 69307  T
Q  219 ttccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa- 317  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||     
T  69308 gtccactcctcacaatcttgtgagaatttcaactatgatgtttgagataacctctcaaatcatgcaccttaaaatat-tattcacctgaacaattacaac 69406  T
Q  318 ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaa 417  Q
      ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||| | |||||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  69407 aactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttactaagttacccacttagaattttacaccctttgctcaaactaacactttagtacccctaa 69506  T
Q  418 aactagatgaga-ttttattacaattt 443  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||    
T  69507 agctagatgagactttgattacaattt 69533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 22903179 - 22902887
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaa-cagtttaacaaagtaaa 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| | || |||||| ||| | || | |||  ||||| ||||||||  || ||||    
T  22903179 aaaagttattctcaagttgaaaacttgaaatggttaagttaacagacagacttcagaacgatctaaagtgttagtataaaaaacagtttaaataattaaa 22903080  T
Q  123 tgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcc 222  Q
    ||||||||||||| || |||||    ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22903079 tgtgtttgtgtgtgtt-gtgttgattgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcc 22902981  T
Q  223 actcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  22902980 actcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatacacattacaacct-tgttcacctgaacaattacaa 22902887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 317
Target Start/End: Original strand, 15474683 - 15474791
Alignment:
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15474683 aatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcatgcaccttacaatct-tgttcacctga 15474781  T
Q  308 acacttacaa 317  Q
    ||| ||||||    
T  15474782 acaattacaa 15474791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32877740 - 32877617
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32877740 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcgaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 32877641  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaa 157  Q
    |||  |||||| |||||||||||||    
T  32877640 tgt-gttgtgtatgcagtaagtaaa 32877617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 187 - 292
Target Start/End: Original strand, 40408122 - 40408227
Alignment:
Q  187 aaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacc 286  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40408122 aaaatttatagtggtttattcaatgtggtctagtccactcctcacaatcttgtgagattttccattatgatgtttgagataacctctcaactcctgcacc 40408221  T
Q  287 ttacaa 292  Q
    ||||||    
T  40408222 ttacaa 40408227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 135
Target Start/End: Original strand, 6875918 - 6876035
Alignment:
Q  17 tgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaa 116  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |   | || ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||    
T  6875918 tgtaacttaaaaa-taattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaagaagtgacttcagaactttctgaagtataagtgtaaaaacagtttaataa 6876016  T
Q  117 agtaaatgtgtttgtgtgt 135  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6876017 agtaaatgtgtttatgtgt 6876035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 208 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22146634 - 22146561
Alignment:
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcct 281  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22146634 aatgtaggttaatccacttctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataatctctcaactcct 22146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 149 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 38461412 - 38461270
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagaga-agagagaatc-atcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||| |||| ||| ||||||  |||||||||  || ||||||||||||||   ||||||||||    
T  38461412 gtaagtaaagagtatagagataga-agaatagaacacacaagaatt-atattggttcatccaatgtggactaatccactcctcacaac--tgtgagagtt 38461317  T
Q  247 tccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttacaa 292  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  38461316 tccactatgatgcttgagacaaccttctcaactcttgcaccttacaa 38461270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 66
Target Start/End: Original strand, 40407957 - 40408000
Alignment:
Q  23 ttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40407957 ttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaa 40408000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4458902 - 4458813
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  4458902 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 4458813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 4468527 - 4468438
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  4468527 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 4468438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 5336407 - 5336496
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5336407 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5336496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 5346260 - 5346349
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5346260 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5346349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 33432477 - 33432554
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33432477 ttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 33432554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 33432568 - 33432645
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  33432568 ttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 33432645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 3605093 - 3605172
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  3605093 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 3605172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 16901668 - 16901747
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16901668 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 16901747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 16995059 - 16995138
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16995059 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 16995138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 22679109 - 22679183
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22679109 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 22679183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 5336224 - 5336301
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5336224 ttgctaagttacccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 5336301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 5346076 - 5346153
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5346076 ttgctaagttacccacttagacttttacaaactcatctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 5346153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Original strand, 6880448 - 6880488
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaa 66  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6880448 aaaaataattctcaagttgaaacttggaatgattaagttaa 6880488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 433
Target Start/End: Original strand, 40408329 - 40408365
Alignment:
Q  397 ctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40408329 ctaacactttaatacccttaaaactagatgagatttt 40408365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4458995 - 4458920
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  4458995 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 4458920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4468620 - 4468545
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  4468620 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 4468545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 5346167 - 5346242
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  5346167 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 5346242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 3605005 - 3605079
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3605005 ttgctaagttatctacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 3605079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 16901580 - 16901654
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16901580 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 16901654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 16994971 - 16995045
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16994971 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 16995045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 22146804 - 22146771
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaa 66  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22146804 attctcaagttgaaacttggaatggtcaagttaa 22146771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19827 - 19390
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19827 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaatttggaatggttaagttaataacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaaca 19728  T
Q  108 gttt-aacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||    
T  19727 gttttaacaaagtgaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccc 19628  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19627 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcctgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctg 19528  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19527 aacaattacaattatgtattctctaagcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacacttt 19428  T
Q  407 aataccc-ctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | ||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  19427 agtacccgctaaagctagatgagacttgattacaattt 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20808293 - 20807857
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||| ||| |||| | ||||||||||    
T  20808293 aaattatcctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggagtggttaagttaataatagacttcagaacgttttgatgtctgactgcaaaaaca 20808194  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattt-atagtggttcccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |    
T  20808193 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaatgagtatagggaagagagaatgaacacacataaattttatagtggttcctc 20808094  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20808093 gaatgtgggttagtccactcctcacactcttgtgagagtttccaccatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctgtattcacctg 20807994  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20807993 aacacttacaattctatattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgttcaagctaacacttt 20807894  T
Q  407 aatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  20807893 agtacccctaaagctagatgagacttgattacaattt 20807857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 19781649 - 19781223
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgc-aaaaac 106  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  19781649 aaattatcctgtaacataaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatagttaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgccaaaaac 19781550  T
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19781549 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt----------ttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccc 19781460  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19781459 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctg 19781360  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  19781359 aacacttacaattttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagactttcacaatctttgcttaagctaacacttt 19781260  T
Q  407 aatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | ||| | ||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  19781259 agtactcataaagttagatgagacttgattacaattt 19781223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 4037205 - 4037615
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  4037205 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaattaaaagtgtttgtg 4037304  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4037305 tgtgtt-gtgtatacagtaaataaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 4037403  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4037404 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 4037503  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  4037504 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 4037603  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  4037604 ttgttacaattt 4037615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 204668 - 205102
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtg-caaaaac 106  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  204668 aaattatcatgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatagttaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtgacaaaaac 204767  T
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  204768 agtttaaaaaagtaaatgtgtttgtgt--cattgtgtttgcagtaagtaaagagtataaggaagagggaatcaatacacagaagtttatagtggttcccc 204865  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||| |||     
T  204866 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgttgcttgagataatctcttaattcttgcaccttacaatctttgttctcctt 204965  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  204966 aacatttacaattttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagaattttacaatctttgctcaagctaacacttt 205065  T
Q  407 aatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | |||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  205066 agtacccctaaagctagatgagacttgattacaattt 205102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 19886914 - 19887313
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19886914 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgcctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 19887013  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19887014 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 19887112  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  19887113 aatcttgtgagagtttcctctatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 19887212  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19887213 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 19887312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 22172478 - 22172888
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22172478 attctcaagttgaaacttggaatgggtaagttaacagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaggtaaatgtgtttgtg 22172577  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22172578 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 22172676  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22172677 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 22172776  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||  |    
T  22172777 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaggct 22172876  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  22172877 ttgttacaattt 22172888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 34129715 - 34130125
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34129715 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagaattcagaacgttctgatgtctaagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtctgtg 34129814  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  34129815 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagaatatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcgtcac 34129913  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  34129914 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatttttgttcacctgaacaactacaattatgtattctcta 34130013  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |    
T  34130014 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtactcctaaagctagaggagact 34130113  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  34130114 ttgttacaattt 34130125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 30942516 - 30942926
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30942516 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 30942614  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30942615 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 30942713  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  30942714 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctcta 30942813  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagat 430  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||     
T  30942814 agcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagac 30942913  T
Q  431 tttattacaattt 443  Q
    ||| |||||||||    
T  30942914 tttgttacaattt 30942926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 30951938 - 30952348
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30951938 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 30952036  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  30952037 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 30952135  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  30952136 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctcta 30952235  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagat 430  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||     
T  30952236 agcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagac 30952335  T
Q  431 tttattacaattt 443  Q
    ||| |||||||||    
T  30952336 tttgttacaattt 30952348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 443
Target Start/End: Original strand, 27273408 - 27273817
Alignment:
Q  34 ttctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27273408 ttctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcataacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaattaaaagtgtttgtgt 27273507  T
Q  134 gtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcaca 232  Q
    || || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27273508 gtgtt-gtgtatacagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacaaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcata 27273606  T
Q  233 atcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaa 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  27273607 atcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattttgtattctctaa 27273706  T
Q  333 gtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||    
T  27273707 gcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtatccctaaagctagatgagactt 27273806  T
Q  433 tattacaattt 443  Q
    | |||||||||    
T  27273807 ttttacaattt 27273817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 443
Target Start/End: Original strand, 37298023 - 37298450
Alignment:
Q  16 ctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaaca 115  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  37298023 ctgtaacttaaaaactgattctcaagttaaaacttggaatggttaagttaaaggcagacttcagaacgttttgatgtctgagtgcaaaaacagtttaata 37298122  T
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgg 214  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37298123 aagtaaatgtgtttgtgtgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtacagggaagagagaataaacacacgaagaatttatagtggttcccccaatgtgg 37298221  T
Q  215 gttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactta 314  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  37298222 gttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataaactctcaaatcatgcaccttacaaactttgttcacctgaacagtta 37298321  T
Q  315 caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccc 414  Q
     ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37298322 taattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttattgataagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccc 37298421  T
Q  415 taaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  37298422 taaagctagatgagactttgttacaattt 37298450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Original strand, 13570905 - 13571301
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  13570905 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaacagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaatatggtaaatgtgtttgtg 13571004  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13571005 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactccttac 13571103  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  13571104 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttataatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 13571203  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13571204 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 13571301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 33 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37818629 - 37818233
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  37818629 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaacagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaatatgataaatgtgtttgtg 37818530  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37818529 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 37818431  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37818430 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagagaacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 37818331  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  37818330 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagtacgcctaaagctagatgaga 37818233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 37646558 - 37646957
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37646558 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 37646656  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37646657 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 37646755  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  37646756 aatcttttgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctct 37646855  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  ||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  37646856 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagcttaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagat 37646955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 37537447 - 37537846
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37537447 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 37537545  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    | | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  37537546 tttgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacatagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 37537644  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||    
T  37537645 aatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacattccttgttcacctgaacaattacaacatctgtattctct 37537744  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  37537745 aagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagat 37537844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 130 - 443
Target Start/End: Original strand, 42089827 - 42090142
Alignment:
Q  130 gtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca---ctc 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||    
T  42089827 gtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccgatgtgggttagtccagcactc 42089926  T
Q  227 ctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtatt 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42089927 ctcacaatcttgtgagagtttccact-tgatgcttgagataacctcttaaatcctgcactttacagtctttgttcacctgaacacttacaattatgtatt 42090025  T
Q  327 ttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatg 426  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  42090026 ctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagtaccccaaaagctagatg 42090125  T
Q  427 agattttattacaattt 443  Q
    ||| || ||||||||||    
T  42090126 agacttgattacaattt 42090142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 31917774 - 31917432
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  31917774 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 31917676  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  31917675 gttcacccaacgtgggctagtccaatcctcacaatcttgtgagagttgccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaaactttgt 31917576  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  31917575 tcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaccta 31917476  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  31917475 acactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 31917432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 107 - 443
Target Start/End: Original strand, 18208563 - 18208898
Alignment:
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  18208563 agtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacc 18208661  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18208662 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttcacctg 18208760  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18208761 aacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacacttt 18208860  T
Q  407 aatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  18208861 aggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 18208898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 107 - 443
Target Start/End: Original strand, 18217901 - 18218236
Alignment:
Q  107 agtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccc 206  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||    
T  18217901 agtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggttcacc 18217999  T
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18218000 caatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttcacctg 18218098  T
Q  307 aacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18218099 aacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacacttt 18218198  T
Q  407 aatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  18218199 aggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 18218236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21683145 - 21682844
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  21683145 aaacagtttaataaagtaa-tgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 21683048  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21683047 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 21682949  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21682948 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 21682849  T
Q  403 cttta 407  Q
    |||||    
T  21682848 cttta 21682844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21754494 - 21754166
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21754494 aaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21754396  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21754395 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21754296  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21754295 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21754196  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21754195 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21754166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21763781 - 21763453
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21763781 aaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21763683  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21763682 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21763583  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21763582 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21763483  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21763482 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21763453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 137 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 22245537 - 22245242
Alignment:
Q  137 tttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatct 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  22245537 tttgtgtttgcagtaagtaaatagtatagggaagagagaataaacacacacaaatttatagtggttcccccaatgcgggttagtcaattcctcacaatct 22245438  T
Q  237 tgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtct 336  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||    
T  22245437 tatgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgctcacctgaacacttacacctctgtattctctaagcct 22245338  T
Q  337 cggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||    
T  22245337 cagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcgactcaaaccaacactttagtacctctaaagctacatgagattt 22245242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18391142 - 18390854
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18391142 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18391043  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18391042 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18390944  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18390943 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18390854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 18362185 - 18361897
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18362185 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18362086  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18362085 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctaaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18361987  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18361986 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18361897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 26191176 - 26191464
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26191176 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 26191275  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  26191276 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 26191374  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26191375 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 26191464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27413056 - 27412768
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27413056 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacctaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaa 27412957  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  27412956 gatgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 27412858  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  27412857 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 27412768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 154 - 431
Target Start/End: Original strand, 27578503 - 27578779
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  | | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27578503 taaagagtatagagaagagagaaagaacgcacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 27578602  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  27578603 agatgcttgagataacctcttaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaaccctgtattctctaagcctcagcagacttgcacctt 27578702  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    ||| |||| ||| ||||||| |||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  27578703 gttactaagttatccacttagacttttac-acatttactcaaactaacactttagtacccctaaaattaaatgagatt 27578779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33940228 - 33939940
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  33940228 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 33940129  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  33940128 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 33940030  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  33940029 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 33939940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33950628 - 33950340
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  33950628 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 33950529  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  33950528 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 33950430  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  33950429 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 33950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 181 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 36317329 - 36317080
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36317329 cacacaaagatttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 36317230  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaact 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||    
T  36317229 tgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacgccaa--ctgtattctctaagcctcagcaggcttgcatcttcttgctaagttacccacttagact 36317132  T
Q  378 tttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36317131 tttacaacttctgctcaaactatcactttagtacccctaaagctagatgaga 36317080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 11410262 - 11410550
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  11410262 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 11410361  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  11410362 gatgcttgagatgacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 11410460  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  11410461 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 11410550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 26201758 - 26202046
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  26201758 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 26201857  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  26201858 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 26201956  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  26201957 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttacaattt 26202046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 32071348 - 32071060
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  32071348 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 32071249  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  32071248 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 32071150  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  32071149 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttaaaattt 32071060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 8764518 - 8764806
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  8764518 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatatgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 8764617  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  8764618 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 8764716  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  8764717 ttgctaagttaatcacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttagaacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 8764806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20948890 - 20948485
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  20948890 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 20948791  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| | |||| |||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20948790 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaaaagaaaagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 20948692  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  20948691 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 20948593  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  20948592 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 20948494  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  20948493 tagatgaga 20948485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20959259 - 20958854
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  20959259 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 20959160  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| | |||| |||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20959159 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaaaagaaaagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 20959061  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  20959060 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 20958962  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  20958961 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 20958863  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  20958862 tagatgaga 20958854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20897839 - 20897583
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  20897839 cacacaaaaagttatactggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctcaaatct 20897740  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaac-acttac-aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaact 377  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || || |||| |||  |||||| |||    
T  20897739 tgcaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttactaagttacacacttagact 20897640  T
Q  378 tttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||    
T  20897639 tttacaccttttgctcaaactaacactttagtacccctataggtagatgagacttta 20897583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 19547471 - 19547871
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||   || |||||||| ||| || | |||  |||||||||||||  || |||||    
T  19547471 aaaagttattctcaagttgaaaacttagaatgattaagttaacagacagtcttcagaacgttttgaagtgttagtataaaaacagtttaaataattaaat 19547570  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || ||||||   ||||||||| |||| | ||||||||  |     | | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19547571 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttattgtaagtaaatagtaaatagaagagaaga-----agaaagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtcca 19547664  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||||||   ||     
T  19547665 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctacactttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaacta 19547763  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  19547764 tattctcttagtctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 19547862  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  19547863 tagatgaga 19547871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 434
Target Start/End: Original strand, 23376111 - 23376395
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||  |  | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23376111 taaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccccta 23376210  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||   ||||||| ||||||  ||  ||||||||| |||    
T  23376211 tgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatct-tgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctcct 23376309  T
Q  353 tgttgctaaat----taaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    | ||||||| |    || ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23376310 tcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttggtactcctaaatctagatgagacttta 23376395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 293
Target Start/End: Original strand, 20904001 - 20904109
Alignment:
Q  185 caaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20904001 caaaaagttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttcaactatgatgcttgagataacctctcaaatccttca 20904100  T
Q  285 ccttacaat 293  Q
    |||||||||    
T  20904101 ccttacaat 20904109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 22245231 - 22245152
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  22245231 ttgctaagttacccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagatttta 22245152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 37537945 - 37538024
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  37537945 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 37538024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 37647056 - 37647135
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  37647056 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 37647135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21754152 - 21754063
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  21754152 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttacaattt 21754063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21763439 - 21763350
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  21763439 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactatgttacaattt 21763350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 19887412 - 19887491
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||    
T  19887412 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacctctaaagctagatgagacttta 19887491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 36317066 - 36316987
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36317066 ttgctaagttacccacttagacttttacaccttcagctcagactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 36316987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 37537857 - 37537931
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37537857 ttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 37537931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 37646968 - 37647042
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37646968 ttgctaagttacccacttagactttttctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 37647042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14806241 - 14806169
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||    
T  14806241 cacacaagaagttatcctggttcccccaatgtgggttaatccagtccccacaatgctgtgagattatccacta 14806169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16630563 - 16630153
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16630563 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 16630464  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16630463 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 16630365  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16630364 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 16630265  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  16630264 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 16630165  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  16630164 ttgttacaattt 16630153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2831016 - 2830617
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2831016 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcaaaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 2830917  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2830916 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 2830818  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  2830817 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctcta 2830718  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2830717 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 2830618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 17827030 - 17827440
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17827030 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 17827128  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17827129 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 17827227  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17827228 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctcta 17827327  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagat 430  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||     
T  17827328 agcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagac 17827427  T
Q  431 tttattacaattt 443  Q
    ||| |||||||||    
T  17827428 tttgttacaattt 17827440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 17836421 - 17836831
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17836421 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 17836519  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17836520 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 17836618  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17836619 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcctgtattctcta 17836718  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagat 430  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||     
T  17836719 agcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagac 17836818  T
Q  431 tttattacaattt 443  Q
    ||| |||||||||    
T  17836819 tttgttacaattt 17836831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 44890049 - 44889650
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44890049 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctaagtgcaaaaacagtttaataaaataaatgtgtttgtg 44889950  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  44889949 tgtgtt-gtgtatgcactaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtagttcccccaatgggtgttagtccactcctcac 44889851  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44889850 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcaactgaacacttacaactctgtattctcta 44889751  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  44889750 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctaaatgagatt 44889651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 116 - 427
Target Start/End: Original strand, 16210088 - 16210398
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16210088 aagtaactgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacaaagagatttatagtggttcccc-aatgtggg 16210186  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16210187 ttagtccactcctctaaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 16210286  T
Q  316 aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccct 415  Q
    |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  16210287 acctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttatacttttacaatctttactcagactaacactttagtacccct 16210386  T
Q  416 aaaactagatga 427  Q
    ||| ||||||||    
T  16210387 aaagctagatga 16210398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 78 - 429
Target Start/End: Original strand, 4837074 - 4837428
Alignment:
Q  78 agaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtct-ttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaa 176  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4837074 agaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacaatttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgtgttgtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaa 4837173  T
Q  177 tcatcacacaaaaattt-atagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctca 275  Q
    |||  ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  4837174 tcaatacacagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctattatgatgtttgagataacctctca 4837273  T
Q  276 aatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaa 374  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||   | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  4837274 aatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcaacagcaggcttgcaccttgtttctaagttaaccacttag 4837373  T
Q  375 acttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4837374 acttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 4837428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 116 - 429
Target Start/End: Original strand, 53945226 - 53945539
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  53945226 aagtaactgtgtttgtgtgtttttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacgcacagagatttatagtggttcccccaatgtggg 53945325  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  53945326 ttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaattcgtgctcacctaaacacttac 53945425  T
Q  316 aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccct 415  Q
    |  ||| |||| |||||| ||| |||| |||||| | |||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  53945426 acctctttattctctaagcctcagcagacttgcatcatgtttctaagttgaccacttagacttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccct 53945525  T
Q  416 aaaactagatgaga 429  Q
    ||| ||||||||||    
T  53945526 aaagctagatgaga 53945539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 429
Target Start/End: Original strand, 7845839 - 7846167
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||||||    
T  7845839 caaaaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatgctgtaattaaagagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtg 7845937  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  7845938 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttatgagagtttcccctatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatttatgt 7846037  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  7846038 tcacctgaatacttacaattctgtattttctaagcctcagcaggattgcaccttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaacta 7846137  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7846138 acactttagtacccctaaagctagatgaga 7846167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16250405 - 16250066
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  16250405 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 16250307  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16250306 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 16250208  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  16250207 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 16250108  T
Q  403 ctttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  16250107 ctttaggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 16250066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 15671042 - 15670700
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  15671042 caaaaacagtttaataaagtaattgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaaataaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 15670944  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15670943 gttcaccctatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgt 15670844  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  15670843 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgcttagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaaacta 15670744  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  15670743 acactttagtacccctaaagctatatgagactttgttacaattt 15670700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 78 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 41527282 - 41526936
Alignment:
Q  78 agaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaat 177  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |     
T  41527282 agaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgtt-gtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagaagaa 41527184  T
Q  178 catcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaa 277  Q
     | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  41527183 gaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgg-ttagtccacttctcacaatcttg--agagtttccactatgatgctaaagataacctctcaaa 41527087  T
Q  278 tcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaac 376  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||    
T  41527086 tcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacagttacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagac 41526987  T
Q  377 ttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  41526986 ttttacaatctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatga 41526936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 426
Target Start/End: Original strand, 13401819 - 13402212
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   || | || | |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13401819 attctcaagttgaaacttggaatgattaagttaaaagcagacttcaaaacgttctgatgtctgagtgcaaaaatagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 13401918  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcaca 232  Q
    ||| || |||| | | |||| |||| ||||||| ||||| |  |  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  13401919 tgtgtt-gtgtatactgtaaataaaaagtatagggaagataagaagaacacacaaaaatttatagtggttcaccaaatgtgggttagtccactcctcaca 13402017  T
Q  233 atcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca-attctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    ||||||| ||||    
T  13402018 atcttgtgagagtttccactacgatgcttgagataacctctcaaattccgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaccaactgtattctcta 13402117  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatg 426  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  13402118 agcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccttaaagctagatg 13402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 10422745 - 10422403
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||||    
T  10422745 caaaaactatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaatgaaagagcacacaaagaattatagtg 10422647  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  10422646 gttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccattatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgt 10422547  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||    
T  10422546 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgctcaaacta 10422447  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||    
T  10422446 acactttagtacccctagagctagatgagactttgttacaattt 10422403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 5292013 - 5292341
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  5292013 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 5292111  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  5292112 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 5292211  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  5292212 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 5292311  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5292312 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 5292341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 5301672 - 5302000
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  5301672 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 5301770  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  5301771 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 5301870  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  5301871 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 5301970  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  5301971 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 5302000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21847245 - 21846917
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21847245 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21847147  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21847146 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21847047  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21847046 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21846947  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21846946 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21846917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21856837 - 21856509
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21856837 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21856739  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21856738 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21856639  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21856638 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21856539  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21856538 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21856509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21903108 - 21902780
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21903108 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21903010  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21903009 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21902910  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21902909 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21902810  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21902809 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21902780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 21912700 - 21912372
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21912700 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 21912602  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  21912601 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 21912502  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  21912501 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 21912402  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21912401 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 21912372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 27679678 - 27680006
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  27679678 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 27679776  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27679777 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 27679876  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  27679877 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 27679976  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27679977 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 27680006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 103 - 432
Target Start/End: Original strand, 27689333 - 27689661
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  27689333 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 27689431  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  27689432 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgttca 27689531  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||    
T  27689532 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaactaaca 27689631  T
Q  403 ctttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27689632 ctttagtacccctaaagctagatgagattt 27689661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 17984025 - 17984313
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  17984025 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 17984124  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  17984125 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 17984223  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  17984224 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 17984313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 18104575 - 18104863
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  18104575 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 18104674  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  18104675 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 18104773  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18104774 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18104863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 40922751 - 40922463
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  40922751 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 40922652  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  40922651 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 40922553  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40922552 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 40922463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 432
Target Start/End: Original strand, 3486549 - 3486880
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| |  |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  3486549 caaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtg-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtg 3486647  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  3486648 gttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgt 3486747  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||    
T  3486748 tcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaacta 3486847  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3486848 acactttagtacccctaaagctagatgagattt 3486880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 432
Target Start/End: Original strand, 3495872 - 3496203
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| |  |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  3495872 caaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtg-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaatagcacacagagaattatagtg 3495970  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  3495971 gttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccatacaatctttgt 3496070  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||    
T  3496071 tcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcatctcaaacta 3496170  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3496171 acactttagtacccctaaagctagatgagattt 3496203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16254197 - 16253856
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||| ||||| |   |  ||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  16254197 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtttgtata--ctataattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 16254100  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  16254099 gttcacccaacgtgggctagtctactcctcacaattttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgt 16254000  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  16253999 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaacta 16253900  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | |||||| ||||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  16253899 atactttagtacccctcaagctagatgagactttgttacaattt 16253856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6693126 - 6692838
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6693126 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6693027  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  6693026 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 6692928  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6692927 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6692838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 6703532 - 6703244
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  6703532 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 6703433  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  6703432 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 6703334  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  6703333 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 6703244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16059335 - 16059004
Alignment:
Q  98 tgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatag 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||| ||| | || |||||||||||  ||||||||||  | |||||||| ||||||||    
T  16059335 tgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtgtatgtg-gtgtatgctgaaattaaagagtataaggaagagagaaagaacacacaaagatttatag 16059237  T
Q  198 tggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16059236 tggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatcttt 16059137  T
Q  298 gttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctca 394  Q
    ||||||||||||| |||   |||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||| ||| | | ||| |||||||||| || ||||||    
T  16059136 gttcacctgaacaattacgccaa--ctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttctttctaagttacctatttagacttttacaacttctgctca 16059039  T
Q  395 agctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    | ||| ||||||| |||| |||||  |||||||||    
T  16059038 aactatcactttagtacctctaaagttagatgaga 16059004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 521219 - 521624
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  521219 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 521318  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  521319 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 521417  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  521418 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 521516  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  521517 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 521615  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  521616 tagatgaga 521624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 30652631 - 30652302
Alignment:
Q  98 tgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatag 197  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  |||| | | | || |||||||||||| ||||||||||  | ||| |||| ||||||||    
T  30652631 tgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtttttgtgtgtgtg-gtgtatactgaaattaaagagtatagggaagagagaaagaacactcaaagatttatag 30652533  T
Q  198 tggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgt 297  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||| |    
T  30652532 tggttcccccaatgttggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaat------ccttgcaatcttt 30652439  T
Q  298 gttcacctgaacactta---caattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctca 394  Q
    ||||||||||||| |||   |||  ||||||| ||||||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30652438 gttcacctgaacaattacgccaa--ctgtattctctaagcatcagcaggcttgtaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaatttctgctca 30652341  T
Q  395 agctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30652340 aactaacactttaatacccctaaagctagatgagatttt 30652302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17162461 - 17162220
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17162461 ttatagtggttcacccaatgtgggatagtccactcctcataatcttctgagagtttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttaca 17162362  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttg 390  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |    
T  17162361 atctttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgaaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcag 17162262  T
Q  391 ctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17162261 ctcaaactaacactttagtacccctaaaactatatgagattt 17162220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 154 - 434
Target Start/End: Original strand, 13792187 - 13792467
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||  |  | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13792187 taaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 13792286  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattc-tgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  13792287 tgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattacaaaaaatgtattctctaagcctcagcaggcttgcacct 13792385  T
Q  353 tgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    | || |||| ||| ||||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13792386 tctttctaagttacccacttagacttttataacttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagacttta 13792467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 17420327 - 17420730
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  17420327 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 17420426  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  |  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17420427 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaaaa--acacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 17420523  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaatt-ctg 322  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  17420524 ctcctcacagttttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 17420622  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg-ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttt-tgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  17420623 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt-acacctttctactcaaactaacactttagtacccctaaagc 17420721  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  17420722 tagatgaga 17420730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 79 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 8842166 - 8841829
Alignment:
Q  79 gaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatc 178  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||     
T  8842166 gaacgttctgaagtctgagtgtaaaat-agtttaataaagtaaatgtgtttgtgcgtgat-gtgtttgcattaagtatagagtatagggaagagaagatg 8842069  T
Q  179 atcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaat 278  Q
    | |||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8842068 aacacacggaaatttatagtggttcacccactatgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatgatgcttgagataacctctcaaat 8841969  T
Q  279 cctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaac 376  Q
     |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| ||    
T  8841968 tctgcactttacaatct-tgttcacctgaacaattacaacaactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac 8841870  T
Q  377 ttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaa 417  Q
    |||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8841869 ttttacaccttctgctcaaactaacactttagtacccctaa 8841829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 412
Target Start/End: Original strand, 518713 - 519101
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  518713 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 518812  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  518813 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 518911  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  518912 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 519010  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacc 412  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  519011 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacc 519101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 17144601 - 17144360
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17144601 ttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactacgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttaca 17144502  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttg 390  Q
    |||  |||||||| ||||| ||||||   ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  |  |    
T  17144501 atccttgttcaccggaacaattacaacaactgtattctctaaacctcagcaggcttgcaccttattgctaaggtaaccacttagacttttacaaactcag 17144402  T
Q  391 ctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  17144401 ctcaaactaacactttagttcccctaaagctagatgagattt 17144360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 429
Target Start/End: Original strand, 6404946 - 6405255
Alignment:
Q  119 taaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtta 218  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||| | || |||| ||||||| |||||||  |  | |||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||    
T  6404946 taaatgtgtttgtgtgtgta-gtgtatgctgaaattaaatagtatagggaagagaagaaaaacacacaaagatttatagtggttcaaacaatatgggcta 6405044  T
Q  219 ttccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa- 317  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||     
T  6405045 gtccactcctcacaatcttgtgagagtttccaatatgatgcttgagataacctctcaaatatttcaccttacaatct-tgttcacctgaaaaattacaac 6405143  T
Q  318 ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaa 417  Q
       |||||| |||||| ||| |||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6405144 aattgtattctctaagcctcagcaatcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttacaacttctgctcaaaataacactttaatacccctaa 6405243  T
Q  418 aactagatgaga 429  Q
    | ||||||||||    
T  6405244 agctagatgaga 6405255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16398131 - 16397883
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16398131 cacacagaaatttatagtggttcatccaatgtggtttagtccactcctcacgatcttgtgagagttttcactatgatgtttgaggtaacctctcaaatcc 16398032  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca--attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactt 378  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  | | |||||| |||||| ||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  16398031 tgcactttacaatct-tgttcacctgaacaattacatcaat-tgtattctctaagcctcagcaggcttacacctttttgctaagttacccacttagactt 16397934  T
Q  379 ttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||  |||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16397933 ttacaacctttgttcaaactaatactttagtacccctaaagctagttgaga 16397883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 26459458 - 26459167
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||  |||| | || ||||| |||||| || | |||  ||||||| | |||  || |||||    
T  26459458 aaaagttattctcaggttgataacttggcatggttaagttaacagacagacttcagaacattctgaagtgttagtataaaaacaatctaaataattaaat 26459359  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||  || |||||| | ||||||| | |||| ||||||||||  |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26459358 gtgtttgtgtgggtt-gtgtttactgtaagtacatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtcca 26459260  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa 317  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  26459259 ctcctcacagttttgtgagattttccactatgatgtttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaa 26459167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 426
Target Start/End: Original strand, 14599757 - 14600083
Alignment:
Q  101 aaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtgg 200  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |  |||| | | | || |||||||||||  ||||| ||||  | |||||||| |||||||||||    
T  14599757 aaaaacaatttgataaagtaaatgtgtttgtgtgtgta-gtgtatactgaaattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtgg 14599855  T
Q  201 ttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgtt 300  Q
    ||| || |||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||    
T  14599856 ttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgtt 14599955  T
Q  301 cacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaac--ttttacaatttttgctcaagct 398  Q
    |||||||||| ||| ||   |||||| |||||| | |  | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||  ||| ||||| ||    
T  14599956 cacctgaacaattataaccatgtattctctaagccacaactggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttttacaacctttactcaaact 14600055  T
Q  399 aacactttaatacccctaaaactagatg 426  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  14600056 aacactttagtacctctaaagctagatg 14600083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 269
Target Start/End: Original strand, 7842959 - 7843127
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||  | |||||||| | ||||||||    
T  7842959 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatgctgtaattaaagagtatagagaagagggaaagaacacacaaagagttatagtg 7843057  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 269  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7843058 gttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 7843127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Original strand, 16081433 - 16081562
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16081433 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16081532  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16081533 gatgcttgagataacctctcaagtcctgca 16081562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 44889639 - 44889551
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  44889639 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagttagatgagactttgttacaattt 44889551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17162209 - 17162130
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17162209 ttgctaagttatccacttagacttttacaaactcggctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatttta 17162130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2830430 - 2830356
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2830430 ttgctaagttatccacttaaacttttgctccttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 2830356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 2830518 - 2830441
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2830518 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 2830441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 3486987 - 3487076
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  3486987 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 3487076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 3496310 - 3496399
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  3496310 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 3496399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 4837442 - 4837519
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4837442 ttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 4837519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 5292448 - 5292537
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5292448 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5292537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 5302107 - 5302196
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  5302107 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 5302196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21846810 - 21846721
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21846810 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21846721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21856402 - 21856313
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21856402 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21856313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21902673 - 21902584
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21902673 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21902584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21912265 - 21912176
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21912265 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21912176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 27680113 - 27680202
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  27680113 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 27680202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 27689768 - 27689857
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  27689768 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 27689857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 2830342 - 2830263
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  2830342 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 2830263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 53945553 - 53945632
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  53945553 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttaatacccctaaagatagatgagacttta 53945632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 8847706 - 8847658
Alignment:
Q  17 tgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaa 66  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8847706 tgtaaattaaaaa-taattctcaagttgaaacttgaaatggttaagttaa 8847658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 3486894 - 3486969
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  3486894 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 3486969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 3496217 - 3496292
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  3496217 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 3496292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 5292355 - 5292430
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  5292355 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 5292430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 5302014 - 5302089
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  5302014 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 5302089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 16210414 - 16210493
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||  |  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  16210414 ttgctaagttacctacttaaacttttgtacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 16210493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 17144349 - 17144270
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| | ||||| ||||||||||  |  |||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  17144349 ttgctaagttacctacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatgagatttta 17144270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21846903 - 21846828
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  21846903 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 21846828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21856495 - 21856420
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  21856495 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 21856420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21902766 - 21902691
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  21902766 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 21902691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21912358 - 21912283
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  21912358 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 21912283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 27680020 - 27680095
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  27680020 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 27680095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 27689675 - 27689750
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||    
T  27689675 ttgctaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgaga 27689750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2830606 - 2830532
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2830606 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 2830532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 253
Target Start/End: Original strand, 30626053 - 30626109
Alignment:
Q  198 tggttcccccaatgtgggttattccactcctcac-aatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  30626053 tggttcccccaacgtgggttagtccagtcctcacaaaacttgtgagattttccacta 30626109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30652292 - 30652220
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||  |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30652292 ttgctaagttacccacttagacttttacaccttcagctcagactaacactttagtacccctaaagctagatga 30652220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20315461 - 20315051
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || ||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20315461 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaaacagacttcagaacgttcagatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 20315362  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20315361 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 20315263  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20315262 aatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 20315163  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  20315162 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 20315063  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  20315062 ttgttacaattt 20315051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 17 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 22961949 - 22961524
Alignment:
Q  17 tgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaa 116  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||    
T  22961949 tgtaacttaaaaagcaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaataacaaacttcagaacgttctaatgtctgagtgcaaaa-cagtttaacaa 22961851  T
Q  117 agtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22961850 agtaaatgtgtttgtgtgtgtttatgtctgcagtacgtaaagagtataaggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccccaatgtgggt 22961751  T
Q  217 tattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22961750 tagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctaaacacttacc 22961651  T
Q  317 attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaataccccta 416  Q
    | ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22961650 actctatattctctaagcctcagcaggcttgcacctagttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagtaccccta 22961551  T
Q  417 aaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    || |||||||||| || || |||||||    
T  22961550 aagctagatgagacttgataacaattt 22961524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4951468 - 4951064
Alignment:
Q  14 ttctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaa 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||    
T  4951468 ttctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaactttgaatggttaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgagtacaaaaacagtt-aa 4951370  T
Q  114 caaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||          |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  4951369 caaagtaaatgtgtttgtgt----------ttgcggtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacataaatttatagtggttcccctaatgtg 4951280  T
Q  214 ggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactt 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4951279 ggttagtccactcctcacaatcttgtgaaagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatctgagttcacctgaacactt 4951180  T
Q  314 acaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaataccc 413  Q
    |||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  4951179 acaattttgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaatctttgctcaagctaacactttagtaccc 4951080  T
Q  414 ctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||| ||||||||||    
T  4951079 ctaaagctagatgaga 4951064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 443
Target Start/End: Original strand, 25038408 - 25038837
Alignment:
Q  16 ctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaa--aaacagtttaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  25038408 ctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaatttagaatgattaagttaataacaggcttcagaacgttctgatgtctgagtgcaagaaaacagtttaa 25038507  T
Q  114 caaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtg 213  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25038508 caagttaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaggtaaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtg 25038607  T
Q  214 ggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactt 313  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25038608 tgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactt 25038707  T
Q  314 acaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaataccc 413  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  ||||| |||||||| || |||||    
T  25038708 acaattctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaaacttaactcaaactaacactatagtaccc 25038807  T
Q  414 ctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  25038808 gtaaagctagatgagatttgtttacaattt 25038837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 27067110 - 27066700
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   || | || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27067110 attctcaagttgaaacttggaatgattaagttaacagcagacttcagaacattctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 27067011  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27067010 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 27066912  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  27066911 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctcta 27066812  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  27066811 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 27066712  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  27066711 ttgttacaattt 27066700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 443
Target Start/End: Original strand, 25043620 - 25044049
Alignment:
Q  16 ctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaa--aaacagtttaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||   || |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||    
T  25043620 ctgtaacttaaaaagtaattctcaagttgaaatttagaatgattaagttaataacaggcttcagaacgttctgatgtctgagtgcaagaaaacagtttaa 25043719  T
Q  114 caaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtg 213  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25043720 caagttaaatgtgtttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaggtaaagagtatatggaagagagaatcaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtg 25043819  T
Q  214 ggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacactt 313  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25043820 tgttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctgtgttcacctgaacactt 25043919  T
Q  314 acaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaataccc 413  Q
    |||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||  ||||| |||||||| || |||||    
T  25043920 acaattttgtgttctctaagcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagatttttacaaacttaactcaaactaacactatagtaccc 25044019  T
Q  414 ctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||| |||||||||||||  |||||||||    
T  25044020 gtaaagctagatgagatttgtttacaattt 25044049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 18095926 - 18096361
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||| |||| | ||||||||||    
T  18095926 aaattatcttgtaacttaaaaagtaattctcaagt-gaaacttggaatggttaagttaataacagacttcaaaacgttctgatgtctgattgcaaaaaca 18096024  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||    
T  18096025 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtgtttatgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagatttatagtggttcaccc 18096124  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18096125 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttagaatctttgttcacctga 18096224  T
Q  308 acacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttt 406  Q
    ||| ||||| |   |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||||| |    
T  18096225 acaattacacaacttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactat 18096324  T
Q  407 aatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    | |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  18096325 agtacccctaaagctagatgagatttgtttacaattt 18096361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 20316722 - 20317121
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20316722 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaaatagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 20316821  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20316822 tgtatt-gtgtatgcagtaagtaaggagtatagggaagaaagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 20316920  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  20316921 aatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctaaacaattacaattctgtattctcta 20317020  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20317021 tgcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaaactagatgagatt 20317120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 20327204 - 20327603
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20327204 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaaagaaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacaatttaataaagtaaatgtgtttgtg 20327303  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20327304 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaggagtatagggaagaaagaatcaacacatagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 20327402  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  20327403 aatcttgtgagagttcccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctcta 20327502  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
     | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20327503 tgcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 20327602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 41542860 - 41543259
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || | |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41542860 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcataacgttctgatgtctgattgcaaaatcagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 41542959  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattt-atagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    | | || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41542960 tttgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacatagattttataatggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 41543058  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||    
T  41543059 aatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacccctcaaatcctgcaccttacaatctatgttcacatgaacacttactactatgtattctcta 41543158  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41543159 agcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatt 41543258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 116 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 49336696 - 49336383
Alignment:
Q  116 aagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtggg 215  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  49336696 aagtaattgtgtttgtgtgtgttcgtgtttggagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaatgtggg 49336597  T
Q  216 ttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttac 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49336596 ttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgtaccttacaatctgtgctcacctgaacacttac 49336497  T
Q  316 aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccct 415  Q
    |  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  49336496 acctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccatgttgctaagttgaccacttagacttttacaatatttgctcaaactaacactttagtatccct 49336397  T
Q  416 aaaactagatgaga 429  Q
    ||| ||||||||||    
T  49336396 aaagctagatgaga 49336383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12420438 - 12420179
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12420438 attctcaagttgaaatttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 12420340  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12420339 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 12420241  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420240 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaat 12420179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 190 - 429
Target Start/End: Original strand, 25822352 - 25822591
Alignment:
Q  190 atttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctta 289  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25822352 atttatagtggttcctccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctctaatcttgcacctta 25822451  T
Q  290 caatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaattttt 389  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25822452 caatatgtgctcacctgaacacttgcacctctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgataagttaaccacttagactcttacaattttt 25822551  T
Q  390 gctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25822552 gctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 25822591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25868376 - 25868126
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25868376 attctcaagttgaaacttagaattgttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 25868277  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25868276 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaaaagtatagggaagagagaatcaacacacacagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 25868178  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgc 283  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25868177 aatcttgtaagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgc 25868126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21459536 - 21459248
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  21459536 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 21459437  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  21459436 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 21459338  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21459337 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21459248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 2117818 - 2117475
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||   |||||| || |||| | |  ||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  2117818 caaaaacagtttaataaagtaaaagtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 2117720  T
Q  200 gttcccccaatgtgggt-tattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtg 298  Q
    |||| |||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  2117719 gttcacccaatgtggggctagtccacttctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacctttcaatccttg 2117620  T
Q  299 ttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagct 398  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||    
T  2117619 ttcacctgaaaaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttactcaaact 2117520  T
Q  399 aacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  2117519 aacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 2117475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 2369521 - 2369864
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||   |||||| || |||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||    
T  2369521 caaaaactgattaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagagagaaagaacacacagagatttatagtg 2369619  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||    
T  2369620 gttcacctaatgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgctttagataacctctaaaatcatgcaccttacaatttttgt 2369719  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| | |    
T  2369720 tcacgtgaacaattacaaatatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaacaa 2369819  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgaga-ttttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||    
T  2369820 acactttagtacccctaaagttagatgagactttgattacaattt 2369864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 189 - 427
Target Start/End: Original strand, 26192275 - 26192514
Alignment:
Q  189 aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26192275 aatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 26192374  T
Q  289 acaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaattt 387  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  26192375 acaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccctgttgctaagttaaccacttagacttttacaaact 26192474  T
Q  388 ttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
      |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  26192475 cagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatga 26192514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 16155791 - 16155503
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16155791 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 16155692  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||| |||||||||||     
T  16155691 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcatgtattctctaagcctcagcaagcttgcaccttc 16155593  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  16155592 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 16155503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 25020376 - 25020088
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  25020376 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcctgtgagagtttccactaa 25020277  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  25020276 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 25020178  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||  |||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  25020177 ttgctaagttaacctcttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacttctaaaagctatatgagactttgttacaattt 25020088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 30548777 - 30549066
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30548777 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtaagagtttccacta 30548876  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||    
T  30548877 tggtgcttgagataacctctcaagtcctgcacataacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctaagcagacttgcacctt 30548976  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  30548977 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgtttcaattt 30549066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 42035173 - 42034834
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagag-aatcatcacacaaaaatttatagtggt 201  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||| |||| |||| ||  | |||||| | | ||||||| ||    
T  42035173 aaactgtttaagaaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtataaagaa-agaggaaagaacacacagagaattatagtagt 42035076  T
Q  202 tcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttc 301  Q
    || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  42035075 tcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctttcaagtcctgcaccttacaatctttgttc 42034976  T
Q  302 acctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaac 401  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||  || |||||| |||||    
T  42034975 accagaacaattacaattctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttgcaaccttcgctcaaactaac 42034876  T
Q  402 actttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  42034875 actttagtacccctaaagctagatgagactttgttgcaattt 42034834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8541143 - 8540891
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8541143 cacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcc 8541044  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  8541043 tgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgttt 8540944  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    ||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8540943 acaaccttttctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatttt 8540891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 181 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 8606382 - 8606130
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8606382 cacacagagatttatagaggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaagattgtgagagtttccactacgatgcttgagataacatctcaaatcc 8606283  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||    
T  8606282 tgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcatcagcagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacgttt 8606183  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    ||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8606182 acaaccttttctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagatttt 8606130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 200 - 432
Target Start/End: Original strand, 19747437 - 19747669
Alignment:
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19747437 gttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataatctctcaaatcctgcactttacaatttgtgt 19747536  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||    
T  19747537 tcacctgaacacttacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaggttaaccacttagacttttacaaactcaactcaaacta 19747636  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    |||||||| || | ||||| |||||||||||||    
T  19747637 acactttagtatctctaaagctagatgagattt 19747669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 18384306 - 18384012
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||| ||||||  ||||||||||  | |||||| | ||||||||||    
T  18384306 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaatagtataaggaagagagaaagaacacacacatatttatagtg 18384208  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18384207 gttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttctactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgt 18384108  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaa 395  Q
    |||| | |||| |||||| | |||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  18384107 tcacataaacaattacaactttgtattctctaagcctgagcaggcttgcaccatgttgctaagttaaccacttagacttttacaacatttgctcaa 18384012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 1973708 - 1974113
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |   | |||||    
T  1973708 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaatgattaaat 1973807  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1973808 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 1973906  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  1973907 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 1974005  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  1974006 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 1974104  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  1974105 tagatgaga 1974113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 1988495 - 1988900
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |   | |||||    
T  1988495 aaaagttattctcaagttgataacttgaaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaatgattaaat 1988594  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  1988595 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 1988693  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  1988694 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 1988792  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  1988793 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 1988891  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  1988892 tagatgaga 1988900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 149 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34823882 - 34823602
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttc 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  34823882 gtaagtaaagagtatagagaagagaagaagaacacacaaaaatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccatttctcacaatcttatgagagtttc 34823783  T
Q  249 cactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttg 347  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||   ||||||| |||||| |||  |||||||     
T  34823782 tactatgatgtttgagataaccgctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaatgacaacaactgtattctctaagcctcaacaggctta 34823684  T
Q  348 caccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34823683 caccttcttgctaagttatccacttagacttttacacattatgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 34823602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37013315 - 37012986
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattt---ata 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  |  ||||||   |||   |||    
T  37013315 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaagga--acacaatttttttttata 37013219  T
Q  197 gtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctg 296  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  37013218 gtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactacgatgttatagataacctctcaaatcctgcactttacaatct- 37013120  T
Q  297 tgttcacctgaacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaa 395  Q
    ||||||| |||||| |||||    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  37013119 tgttcacttgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgttaagttacccacttagacttttacaacctttgctcaa 37013020  T
Q  396 gctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  37013019 actaacactttagtacccctaaagctagttgaga 37012986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13966008 - 13965749
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||   |||||| || |||| | |  ||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  13966008 caaaaactgtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacaaagatttatagtg 13965910  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13965909 gttcagccaatgtgggttagtccactcc-cacaatcttgagagagtttccactatgataattgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgt 13965811  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaa 361  Q
    ||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13965810 tcacctgaacaattacaaccatgtattctctaagcctcagcaggtttgcaccttgttgctaa 13965749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Original strand, 52948721 - 52949126
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaaa-cttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  52948721 aaaagttattctcaagttgaaaactttgaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 52948820  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || || ||| |  || ||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52948821 gtgtttgtgtgtgtt-gtttttactttatgtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtcca 52948919  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    ||    
T  52948920 ctcctcacagttttgtgagattttccattatgatgcttgagataacttctcaaattctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaattg 52949018  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||| ||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  52949019 tattctcttagcctcagcagacttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 52949117  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  52949118 tagatgaga 52949126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21793634 - 21793398
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21793634 cacacaaaaagttatagtggttcacccaatgtggtttagtccactcctcacaatcttgtgggagtttccactatgatgctttagataacctctcaaatcc 21793535  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaac-acttac-aattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaact 377  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||| |||  |||||| |||    
T  21793534 tacaccttacaatctttgttcacctgaacaatttacaaaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttattaagttacacacttagact 21793435  T
Q  378 tttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccc 414  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21793434 tttacaccttttgctcaaactaacactttagtacccc 21793398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 434
Target Start/End: Original strand, 21820644 - 21820895
Alignment:
Q  185 caaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21820644 caaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctcaaatcctgca 21820743  T
Q  285 ccttacaatctgtgttcacctgaac-acttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaactttta 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||||||| |||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||  |||||  |||||||    
T  21820744 ccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacacttctactttta 21820843  T
Q  382 caatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||    
T  21820844 caccttttg-tcaaactaacactttagtacccctaatgttagatgagacttta 21820895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 204
Target Start/End: Original strand, 19735595 - 19735766
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19735595 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcattcttcagaacgttttgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 19735694  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacaca-aaaatttatagtggttcc 204  Q
    |||  |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||    
T  19735695 tgt-gttgtgtatgtagtaattaaagagtatagggaagagagaatcaacacacatagattttatagtggttcc 19735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 34000905 - 34000645
Alignment:
Q  23 ttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaa-gtaa 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| | || |||| ||||||| || | ||| |||||||| |  |  ||| ||||    
T  34000905 ttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaaaagttaagttaaaaacagacttcagaaagttctgaagtgttagtacaaaaacaataaactaaatgtaa 34000806  T
Q  122 atgtgtttgtgtgtct-ttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttatt 220  Q
    ||    |||||||| | ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||  |  | ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  34000805 ataa--ttgtgtgtatgttgcgtttcctataagtaaagagtatagagaagagaagaagaacacac-ataatttatagtggttcacccaatgtgggttagt 34000709  T
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| || |||||||    
T  34000708 ctactcgtcacaatcttgtaagagtttccactatgttgtttgatataacatcttaattcctgca 34000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22401527 - 22401428
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22401527 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 22401429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22957331 - 22957228
Alignment:
Q  189 aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 288  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| | ||||| ||||||||| ||    
T  22957331 aatttatagtggttcatccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttgcactatggtatttgagataccttctcagatcctgcacttt 22957232  T
Q  289 acaa 292  Q
    ||||    
T  22957231 acaa 22957228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 221 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22892421 - 22892356
Alignment:
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22892421 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaattcctgcacc 22892356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 255
Target Start/End: Original strand, 21904518 - 21904581
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 255  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21904518 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 21904581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22892674 - 22892605
Alignment:
Q  226 cctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct 295  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  22892674 cctcacaatcttgtaagaatttccactatgatgcttgagataacttctcaattcctgcaccgaacaatct 22892605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22892268 - 22892213
Alignment:
Q  221 ccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  22892268 ccactcctcacaatcttgtgagaatttccaccatgatgcttaagataacttctcaa 22892213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 19867790 - 19867887
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| |||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  19867790 ttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcacaa--ctgtgaga-ttttcactttaatgcttgagacaaccttctcaactcctgcaccttac 19867886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 26192618 - 26192697
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  26192618 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 26192697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 41543270 - 41543344
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41543270 ttgctaagttacccacttagacttttactccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 41543344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22959252 - 22959167
Alignment:
Q  156 aagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtg 240  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||| | |||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22959252 aagagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttataatggttcatccaatatgggttagtccactcctcacaatcttgtg 22959167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13965573 - 13965501
Alignment:
Q  359 taaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  13965573 taaactaaccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttagaacccctaaagttagatgagatt 13965501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 355 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37012884 - 37012812
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37012884 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatga 37012812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 436
Target Start/End: Original strand, 20317166 - 20317213
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttatt 436  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20317166 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttatt 20317213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 20317220 - 20317299
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||    
T  20317220 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaaggtagatgagacttta 20317299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 49336369 - 49336290
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||| ||  ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49336369 ttgctaagttacccatttagacttttgcacctttagctcaaactaacattttagtacccctaaaactagatgagacttta 49336290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Original strand, 26192530 - 26192604
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26192530 ttgctaagttacccacttaaatttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 26192604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Original strand, 20327648 - 20327688
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20327648 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 20327688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 31998272 - 31998682
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31998272 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaaccagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 31998371  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31998372 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 31998470  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31998471 aatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacatgaacaattacaattctgtattctcta 31998570  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  31998571 agcctcggcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 31998670  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  31998671 ttgttacaattt 31998682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 31990683 - 31991093
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31990683 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacaatttaataaagtaaatgtgtttgtg 31990782  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  31990783 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtctactcctcac 31990881  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31990882 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcatcttacaatctctgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 31990981  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  31990982 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 31991081  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || | |||||||    
T  31991082 ttgtaacaattt 31991093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 33773160 - 33773567
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33773160 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaa-cagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 33773258  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33773259 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtataaggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 33773357  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  33773358 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctcta 33773457  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |    
T  33773458 agcctcagc--tcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgggact 33773555  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || |||||||||    
T  33773556 ttgttacaattt 33773567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 14893066 - 14893476
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || | || |||| ||||||| || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  14893066 attctcaagttgaaacttggaatggttaagtcaacagcagacttcagaatgttctgatgtttgagtgcaaaaacagtttaataagataaatgtgtttgtg 14893165  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14893166 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 14893264  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  14893265 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctacaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaatactgtattctcta 14893364  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  14893365 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 14893464  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || ||| |||||    
T  14893465 ttgttataattt 14893476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 33 - 443
Target Start/End: Original strand, 14880716 - 14881126
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||   || | || |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||     
T  14880716 attctcaagttgaaacttggaatgaataagtcaacagcagacttcagaatgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataagataaatgtgtttgtc 14880815  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14880816 tgtgtt-gtgtatgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 14880914  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  14880915 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaattctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattatgtattctcta 14881014  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  14881015 agcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttaaacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagact 14881114  T
Q  432 ttattacaattt 443  Q
    || ||| |||||    
T  14881115 ttgttataattt 14881126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 8 - 443
Target Start/End: Original strand, 23014059 - 23014472
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23014059 aaattatcctataacttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggtaaagttaatgacagacttcagaacgttctgatgtctgggtgcaaaaaca 23014158  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||            ||||||||||    
T  23014159 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgt----------ttgcaataagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacac------------tggttccccc 23014236  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23014237 aacgtgggttagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 23014336  T
Q  308 acacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacacttta 407  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||  ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||  |  || ||| |||||||||||    
T  23014337 acacttacaattctgtattctttaagcctcaacaggcttgcaccttgctgttaagttaaccacttagacttttacaaactcagcacaaactaacacttta 23014436  T
Q  408 atacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
     |||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23014437 gtacttctaaagctagatgaaatttgattacaattt 23014472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 33 - 427
Target Start/End: Original strand, 20529902 - 20530296
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   || | || |||| ||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20529902 attctcaagttgaaacttgaaatagttaagttaaaagcagacttcagaaagttctgatgtctgaatgaaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 20530001  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20530002 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtataagaaaaagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 20530100  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20530101 aatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacctatcaaatcctgcaccttacaatctttgttctcctgaacaattacaattctgtattctcta 20530200  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatga 427  Q
    || |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20530201 agcctcaacaggcttacaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacattttagtacccctaaagctagatga 20530296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 13675719 - 13675380
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  13675719 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 13675621  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13675620 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 13675522  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  13675521 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 13675422  T
Q  403 ctttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  13675421 ctttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 13675380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Original strand, 21986851 - 21987190
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  21986851 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 21986949  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21986950 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 21987048  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21987049 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 21987148  T
Q  403 ctttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  21987149 ctttaggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 21987190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 103 - 443
Target Start/End: Original strand, 21996385 - 21996724
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  21996385 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 21996483  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttca 302  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21996484 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatct-tgttca 21996582  T
Q  303 cctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaaca 402  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21996583 cctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaaca 21996682  T
Q  403 ctttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||  ||| ||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  21996683 ctttaggacctctaaaagttagatgagactttgttacaattt 21996724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 137 - 429
Target Start/End: Original strand, 11429604 - 11429896
Alignment:
Q  137 tttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatct 236  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  11429604 tttgtgtttgcaataagtaaagagtatagggaagagagaataaacacacagagatttatagtggttcccccaaggtgggttagtccactcctcacaatct 11429703  T
Q  237 tgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtct 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||  |||||||| |||||| ||    
T  11429704 tgtgagagtttccactatgatgcttgagataaccactcaaatcctgcaccttacaatttgtgctcacctgaacagttgcacatctgtattctctaagcct 11429803  T
Q  337 cggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11429804 cagcaagcttgcaccatgttgctaagttgaccacttagacttttacaatttttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 11429896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 9324187 - 9324475
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  9324187 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 9324286  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  9324287 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 9324385  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  9324386 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 9324475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 159 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 21335202 - 21334918
Alignment:
Q  159 agtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatg 258  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21335202 agtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatg 21335103  T
Q  259 cttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgc 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  21335102 cttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgc 21335004  T
Q  359 taaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21335003 taagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21334918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 443
Target Start/End: Original strand, 21201992 - 21202275
Alignment:
Q  160 gtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgc 259  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21201992 gtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgc 21202091  T
Q  260 ttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgct 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21202092 ttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgct 21202190  T
Q  360 aaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21202191 aagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21202275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 160 - 443
Target Start/End: Original strand, 21212408 - 21212691
Alignment:
Q  160 gtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgc 259  Q
    |||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21212408 gtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgc 21212507  T
Q  260 ttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgct 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21212508 ttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgct 21212606  T
Q  360 aaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21212607 aagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 21212691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 2689433 - 2689724
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2689433 taaagagtatagtgaagagagaaagaacacacaaagatttatagtggctcgcccaatgtgggctagtccacttctcacaatcttgtgaaagtttccacta 2689532  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattc-tgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  | |||||| |||||  ||| |||  |||||||||    
T  2689533 ttatgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaacacatgtattctctaatcctcagcatacttgcacct 2689632  T
Q  353 tgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt-attacaattt 443  Q
    | ||||| | ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2689633 tcttgctcagttacccacttagacttttacaaactttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattttgattacaattt 2689724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14438462 - 14438057
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||||||| |||||  || |||||    
T  14438462 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagtttacagacagacttcagaacgttctgaagtgttagtataaaaacaatttaaataattaaat 14438363  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| |||||||| |  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14438362 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagaaaagaggaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 14438264  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || ||||||   |||    
T  14438263 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgctttagatatcttctcaaatccttcaccttacaacct-tgttcacctgatcaattacaacaactg 14438165  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  14438164 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttatgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 14438066  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  14438065 tagatgaga 14438057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 119 - 429
Target Start/End: Original strand, 26361457 - 26361768
Alignment:
Q  119 taaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggtta 218  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26361457 taaatgtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggtta 26361555  T
Q  219 ttccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa- 317  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||     
T  26361556 gtccactcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttaagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgagcaattacaac 26361654  T
Q  318 ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaata-cccc 414  Q
      ||||||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| ||||||||||| || ||||    
T  26361655 aactgtattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaactaacactttagtaccccc 26361753  T
Q  415 taaaactagatgaga 429  Q
    |||| ||||||||||    
T  26361754 taaagctagatgaga 26361768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3988471 - 3988296
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  3988471 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 3988373  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 279  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3988372 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatc 3988296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 12900410 - 12900592
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  12900410 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 12900508  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacc 286  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12900509 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcacc 12900592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 6760692 - 6760572
Alignment:
Q  190 atttatagtggttc-ccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcacctt 288  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  6760692 atttatagtggttcgccccaatgtgggttagtccactccttacaatcttgtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcatgcacttt 6760593  T
Q  289 acaatctgtgttcacctgaac 309  Q
    ||||| |||| ||||||||||    
T  6760592 acaatttgtgctcacctgaac 6760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8668974 - 8668832
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | || |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8668974 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaa-acagacttcagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 8668876  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaat 177  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8668875 tgt-gttgtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaat 8668832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 292
Target Start/End: Original strand, 12840634 - 12840744
Alignment:
Q  182 acacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcct 281  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12840634 acacacaaatttatagtggttcacccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaatttccattatgatgcttgagataccctctcaaatcct 12840733  T
Q  282 gcaccttacaa 292  Q
    | |||||||||    
T  12840734 gtaccttacaa 12840744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21462064 - 21461892
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||   |||||| || |||| |||  ||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||    
T  21462064 aaacagtttaataaagtcaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatgctataattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggtt 21461966  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 276  Q
    | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21461965 cacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaa 21461892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18537525 - 18537438
Alignment:
Q  189 aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 276  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18537525 aatttatagtggttcatccaatgtgggttaatccactcctcacaatcttgtgagaatttccactataatgcttgaaataacctctcaa 18537438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 339 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17269547 - 17269457
Alignment:
Q  339 gcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17269547 gcaggtttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactaagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 17269457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 149 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17269646 - 17269564
Alignment:
Q  149 gtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||  | ||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  17269646 gtaattaaagagtctagggaagagagaaagaacacacagcgatttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcac 17269564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 434
Target Start/End: Original strand, 11429910 - 11429989
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||    
T  11429910 ttgctaagttacccacttagacttttgcacctttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagacttta 11429989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 355 - 432
Target Start/End: Original strand, 20530312 - 20530389
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| |   || ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  20530312 ttgctaagttacccacttaaatttttgctccttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagattt 20530389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37817892 - 37817846
Alignment:
Q  222 cactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37817892 cactcctcacaatcttctgagattttc-actatgatgcttgagataac 37817846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16582912 - 16582840
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaa 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16582912 aaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgt-gttgtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaa 16582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 429
Target Start/End: Original strand, 12840839 - 12840879
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12840839 tgctcaacctaacactttaatacccttaaagctagatgaga 12840879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 37 - 445
Target Start/End: Original strand, 110810 - 111218
Alignment:
Q  37 tcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtc 136  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||   || | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||     
T  110810 tcaagttgaaacttggaatggtaaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaattaagtaaatgtgtttgtgtgtg 110909  T
Q  137 tttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatc 235  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  110910 tt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatatggaagagagaataaacacaaagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatc 111008  T
Q  236 ttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtc 335  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  111009 ttgtgagatttttcactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccatacaatctttgttcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcc 111108  T
Q  336 tcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttat 435  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  111109 tcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttataacctttgctcaaactaacactatagtacccctaaagctagatgagactttgt 111208  T
Q  436 tacaatttat 445  Q
    ||||||||||    
T  111209 tacaatttat 111218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 9167 - 8768
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  9167 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtg 9068  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9067 tgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 8969  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8968 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcatgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattctcta 8869  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||  |   ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  8868 agcctcagcaagcttgcaccttattgctaagttaaccatttagtcttttacaaactcatctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagatt 8769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 355 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8669 - 8595
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||| ||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8669 ttgctaagttaccctcttagacttttgcacatttagctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgaga 8595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 39 - 432
Target Start/End: Original strand, 49261 - 49653
Alignment:
Q  39 aagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  49261 aagttgaaacttggaatggttaagttaaaatcagactttagaacgttctgatgtctgattgcaaaaacactttaataaagtaaatgtgtttgtgtgtgtt 49360  T
Q  139 tgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatctt 237  Q
     |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  49361 -gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagaaaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccacaccttacagtctt 49459  T
Q  238 gtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||    
T  49460 gtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacatacaactctatattttctaagcctc 49559  T
Q  338 ggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattt 432  Q
     |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  49560 agcagacttgcaccttgttgct-aattaaccacttagacttttacaaactcaactcaaactaacaatttagtacccctaaagctagatgggattt 49653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 28051 - 28450
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||   || | || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  28051 attctcaggttgaaacttggaatgattaagttaaaagcaaacttcagaacattctgatgtccgactgcaaaaacagtttaataaagtaaatgaatttgtg 28150  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28151 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtaaagggaagagaaaatcaacacacatagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 28249  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttcta 331  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28250 agtcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtattttcta 28349  T
Q  332 agtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatt 431  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||||||  |   ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  28350 agcctcagcaggcttgcaccttgttggttagttaactacttagacttttacaaactcaactcaaactaacactttagtaccccgaaagctagatgagatt 28449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 443
Target Start/End: Original strand, 28495 - 28549
Alignment:
Q  389 tgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||    
T  28495 tgctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagactttgttacaattt 28549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 49664 - 49752
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |   || |||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||    
T  49664 ttgctaagttacccacttagacttttgctccttctgcttaaactaacactttagtacccctaaagatagatgagactttgttacaattt 49752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 33 - 432
Target Start/End: Original strand, 20092 - 20492
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||   || | || |||||||||| | || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20092 attctcaagttgaaacatggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctaatgtattagtgcaaatacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 20191  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaattt-atagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20192 tgtgtt-gtgtatgcaatatgtaaagagtatagggaagagagaatcaacacgcagagattttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 20290  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttct 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||| |||    
T  20291 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaacaactgtattctct 20390  T
Q  331 aagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagat 430  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20391 aagcctcagcaggcttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaaactcagctcaaactaacactttagtacccctaaagctatatgagat 20490  T
Q  431 tt 432  Q
    ||    
T  20491 tt 20492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 355 - 443
Target Start/End: Original strand, 20503 - 20590
Alignment:
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  20503 ttgctaagttacccacttatacttttacaacctttgctcaaactaacactt-aatacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 20590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 33 - 326
Target Start/End: Original strand, 394897 - 395190
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  394897 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcaaacttcagaacgttctgatgtctgagtgcaaaaatagtttaataaagtaaatatgtttgtg 394996  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcac 231  Q
    ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  394997 tgtgtt-gtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacacacaaagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcac 395095  T
Q  232 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtatt 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  395096 aatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctggaccttacaatatgtgttcacctgaacacttacaactctgtatt 395190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 157 - 443
Target Start/End: Original strand, 1 - 288
Alignment:
Q  157 agagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 255  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agagtatagggaagagagaatcaacacacagagaatttatagtggttcccccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatg 100  T
Q  256 atgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  101 atgcttgagataacctctcaaatcttgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaattttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgt 200  T
Q  356 tgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  201 tgctaagttaaccacttagtcttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8127
Alignment:
Q  8 aaattattctgtaatttaaaaagtaattctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaaca 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||| || | ||||||||||||    
T  8477 aaattatcctgtaacttaaaaagtgattctcaagtggaaacttgaaatggttaagttaataacagacttcaaaacgttctgatgtttgagtgcaaaaaca 8378  T
Q  108 gtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttccccc 207  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||||||| |||    
T  8377 gtttaacaaagtaaatgtatttgtgtgtgtttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacaaatagagatttatagtggttcaccc 8278  T
Q  208 aatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||    
T  8277 aatgtgggttagtccactcctcacaatcttatgagagtttccattatgatgtttgagataacctctcaaatctggcaccttacaatccttgttcacttga 8178  T
Q  308 acacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttg 357  Q
    ||| ||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8177 acaattacacaacatgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttgttg 8127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 8111 - 8054
Alignment:
Q  390 gctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga-ttttattacaatttatg 446  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8111 gctcaagctaacactttagtagccctaaagctagatgagactttgattacaatttatg 8054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 73886 - 74175
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73886 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 73985  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  73986 tggtgcttgagataatctctcaagtcctgaaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 74085  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  74086 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 74175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 154 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 1
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  270 taaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 171  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  170 tggtgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacctt 71  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactag 423  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  70 gttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaaactaacactttagtacccctaaagctag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 192 - 443
Target Start/End: Original strand, 55041 - 55292
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttaca 291  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55041 ttatagtggttcacccaacgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttaca 55140  T
Q  292 atctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgc 391  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  55141 atctttgttcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagcagacttgcaccttgttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgc 55240  T
Q  392 tcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  55241 tcaaactaatactttaatacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 55292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 91984 - 92326
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | |  ||| ||||||||| ||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  91984 caaaagcagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaagagtaaagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 92082  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  92083 gttcacccaacgtgagctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatggtgcttgagataacctatcaagtcctgcaccttacaatctttgt 92182  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  92183 tcacctgaacaattacaattctgtattctctaagcctcagtaggcttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaacta 92282  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  92283 acactttagtacctctaaatctagatgagactttgttacaattt 92326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 158; Significance: 7e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 233149 - 233437
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  233149 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 233248  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  233249 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 233347  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  233348 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 233437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 147745 - 147341
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttgaa-acttggaatggttaagttaa-tgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||| |  |  | ||||||||||||||| || ||    ||||||| |||||| |||||||||    
T  147745 aaaagtaattctcaagttgtttacttggaatagttaagttaactttctgactttagaacgttctgaagtttataaacaaaaactgtttaataaagtaaat 147646  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    ||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  147645 gtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaagaaagagcacacaaagaattatagtggttcatccaatgtcggttagtcca 147547  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgt 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||    
T  147546 ctcctcacaatcttctgagagttattactatgatgtttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatctttgttcaactgaacaattacaattatgt 147447  T
Q  324 attttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactag 423  Q
    ||| |||||| ||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  147446 attctctaagcctcagcatgcttgcaccttcctgctaagttaactacttagacttttacaacctttgcttaaactaacactttagtacccctaaagctag 147347  T
Q  424 atgaga 429  Q
    ||||||    
T  147346 atgaga 147341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 155 - 443
Target Start/End: Original strand, 7003 - 7291
Alignment:
Q  155 aaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactat 254  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  7003 aaagagtatagagaagaaagaaagaacacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaa 7102  T
Q  255 gatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttg 354  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     
T  7103 gatgcttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttctcctgaacaattacactcctgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttc 7201  T
Q  355 ttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  7202 ttgctaagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 7291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Original strand, 1063 - 1405
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||| |||||||||||||   ||  | |||| | | | ||||||||    
T  1063 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaatagtatagagaagaagcaaagaacacatagagaattatagtg 1161  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||    
T  1162 gttcacccaacgtgggatagtccactcctaacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctgaagtcctgcatcttacaatctttgt 1261  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||    
T  1262 tcacctgaacaattacaactctgtattatataagcctcaacagccttgcaccttgttgctacgttaaccacttagacttttacaaccttttctcaaacta 1361  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  1362 acactttagtacccctaaagctagatgagactttgttacaattt 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 9073 - 8731
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||  |||  | |||||| | | ||||||||    
T  9073 caaaaacagtttaataaagtaaatgtgcaagtgtgtgtt-gtgtatactataattaaagagaatagagaagaaggaaagaacacacagagaattatagtg 8975  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  8974 gttcacccaacgtggactagtccactcctcacaatcttgtgagagttttcactatggtgtttgagataacctctcaagtcctgcacctcacaatctttgt 8875  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| |||    
T  8874 tcacctgaacaattacaactctgtattctctaagcctcagaagacttgcaccttgttgctaagttaactacttagacttttacaacctttgctcaaacta 8775  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgagattttattacaattt 443  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  8774 acactttagtacccctcaagctagatgagattttgttacaattt 8731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6803 - 6403
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  6803 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 6704  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  6703 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaaga-agaa----cacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 6610  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  6609 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 6511  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttt-tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  6510 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 6412  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  6411 tagatgaga 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 26 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 10585 - 10235
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  10585 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacaaacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 10486  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10485 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagagaaga-agaa----cacacataaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 10392  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  10391 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 10293  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttt 379  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  10292 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagacttt 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 224 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20766 - 20560
Alignment:
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctg 322  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   |||    
T  20766 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactg 20668  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttt-tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  20667 tattctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagc 20569  T
Q  421 tagatgaga 429  Q
    |||||||||    
T  20568 tagatgaga 20560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 429
Target Start/End: Original strand, 112 - 440
Alignment:
Q  100 caaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtg 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| ||||||||||||||||||  |||  | |||||| | | |||| |||    
T  112 caaaaacaatttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagagaagaaggaaagaacacacagagaattattgtg 210  T
Q  200 gttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgt 299  Q
    |||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||    
T  211 gttcacccaacgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaagtcctgcatcttacaatatttgt 310  T
Q  300 tcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagcta 399  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||  || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||    
T  311 tcacctaaacaattacaactctgtattctctaaggttcagctggcttgcaccttgtttctaagttaaccacttagacatttacaacctttgctcaaacta 410  T
Q  400 acactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  411 acactttagtacccctaaagctagaagaga 440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 181 - 443
Target Start/End: Original strand, 18549 - 18812
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  18549 cacacaaagagttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatgcttgagataacctctcaagtcc 18648  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaactttt 380  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18649 cgcaccttacaatccttgttcacctgaacaattacaatcttgtattctctaagcctcagcaggcttgcaccttcttgctaagttaaccacttagactttt 18748  T
Q  381 acaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  18749 acaacctttgctcaacctaacactttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 18812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 159 - 443
Target Start/End: Original strand, 309184 - 309468
Alignment:
Q  159 agtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatg 258  Q
    |||||| |||||| ||||  | ||||||||   |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  309184 agtatatagaagaaagaaagaacacacaaagcgttatagtggttcacccaatgtgggctagtccactccccacaatcctgtgagagtttccactaagatg 309283  T
Q  259 cttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgc 358  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  309284 cttgagataacctctcaagtcctgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaatcctgtattctctaagcctcaacaggcttgcaccttcttgc 309382  T
Q  359 taaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaa-ctagatgagattttattacaattt 443  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  309383 taagttaaccacttagacttttacaacctttgctcaacctaacattttaggacctctaaaagctagatgagactttgttacaattt 309468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 217621 - 217295
Alignment:
Q  101 aaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtgg 200  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |  |||| | | | || |||||||||||  ||||| ||||  | |||||||| |||||||||||    
T  217621 aaaaacaatttgataaagtaaatgtgtttgtgtgtgta-gtgtatactgaaattaaagagtataaggaagaaagaaagaacacacaaatatttatagtgg 217523  T
Q  201 ttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgtt 300  Q
    ||| || |||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||    
T  217522 ttcacctaatgtgggctggtccactcctcacaatcctatgagagtttcaactatgatacttgagataacctcttaaatcctgcatcttacaacctttgtt 217423  T
Q  301 cacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaac--ttttacaatttttgctcaagct 398  Q
    |||||||||| ||| ||   |||||| |||||| | |  | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||  ||| ||||| ||    
T  217422 cacctgaacaattataaccatgtattctctaagccacaactggcttgcaccttcttgctaagttacccacttagacttttttacaacctttactcaaact 217323  T
Q  399 aacactttaatacccctaaaactagatg 426  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  217322 aacactttagtacctctaaagctagatg 217295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 429
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2739
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||   ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2491 cacacaaagatttatagtggttcattcaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 2590  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttt 379  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||    
T  2591 tgcaccttacaatgt-tgttcaactgaacaattacatcaactgtattctctaagcctcagcaggattgcaccttcttgctaagtgacccacttagacttt 2689  T
Q  380 tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgaga 429  Q
    ||||  || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  2690 tacatcttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagctagacgaga 2739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20006 - 19725
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttga-aacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||  ||| ||| ||| |  || |||||    
T  20006 aaaagttattctcaagttgataacttggaatggttaagttaacagacagacttcagaacgttctgaagtattagtataaacacaatttgaataattaaat 19907  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||  |  | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19906 gtgtttgtgtgtgtt-gtgtttactgtaagtaaatagtaaagaaaagagaagaagaacacacagaaatttatagtggttcacccaatgtgggttagtcca 19808  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctga 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19807 ctcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctga 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 207 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 55495 - 55269
Alignment:
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  55495 caatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctg 55399  T
Q  307 aacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacact 404  Q
    |||| ||||| |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  55398 aacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacact 55299  T
Q  405 ttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  55298 ttagtacccctaaaactagatgagacttta 55269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 207 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 59444 - 59218
Alignment:
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  59444 caatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctg 59348  T
Q  307 aacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacact 404  Q
    |||| ||||| |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  59347 aacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacact 59248  T
Q  405 ttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  59247 ttagtacccctaaaactagatgagacttta 59218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 207 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 60872 - 60646
Alignment:
Q  207 caatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  60872 caatgtgggttagtccactcctcacaat---gtgagagtttccactatgatgtttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctacgttcacctg 60776  T
Q  307 aacacttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacact 404  Q
    |||| ||||| |  ||||||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  60775 aacaattacacaacctgtattctctaagcctcagcaggcttgcacttttcttgctaagttacccacttagacttttacacattttgctcaaactaacact 60676  T
Q  405 ttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  60675 ttagtacccctaaaactagatgagacttta 60646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 26 - 434
Target Start/End: Original strand, 39598 - 40008
Alignment:
Q  26 aaaagtaattctcaagttg-aaacttggaatggttaagttaat-gacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaat 123  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||| | || | ||||||||||  | | |||| |||||||||||||  || |||||    
T  39598 aaaagttattctcgagttgtaaacttagaatggttaagttaacagacagacttcataacgttctgaaatgttagtgtaaaaacagtttaaataattaaat 39697  T
Q  124 gtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattcca 223  Q
    |||||||||||| |||||| || | | || ||||||||| |||||||||| ||  | ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  39698 gtgtttgtgtgt-tttgtgattactgaaaataaagagtaaagagaagagaaaaagaacacgcagaaacttatagtggttcacccaatgtgggttagtccc 39796  T
Q  224 ctcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaat-tctg 322  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||     
T  39797 cttctcacaatcttgtgagtttttccacgatgatgcttgagataacttctcaaatcacgcaccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaataacta 39895  T
Q  323 tattttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttttaca-atttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaac 420  Q
    |||| |||||| |||  || |||| |||| || ||||||| ||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  39896 tattctctaagcctcaacatgcttacacctttcttgctaagttacccacttagac-tttacacctttctgctcaaaccaacactttaatacccctaaagc 39994  T
Q  421 tagatgagatttta 434  Q
    ||||||||| ||||    
T  39995 tagatgagacttta 40008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 154 - 443
Target Start/End: Original strand, 27934 - 28224
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||  ||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||  ||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27934 taaagagtataaggaagagagaaataacacacaaagatttatagtgcttcatccaatttgggctagtccactcctcgcaatcttgtcagagtttccacta 28033  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacctt 353  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||  | ||||||  ||||||| | |||| ||| | ||||| |||||||    
T  28034 tgatgcttgacataacccttcaaatcctgcatcttacaatctttgttcacctgagtaattacaaccctgtattctttaagcctcagtaggctcgcacctt 28133  T
Q  354 gttgctaaattaaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt-attacaattt 443  Q
     ||||||| ||| ||||||| | ||||||||  ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28134 cttgctaagttacccacttagaattttacaagctttgctcaaactagcactttactacgcctaaagctagatgagattttgattacaattt 28224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1578
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1832 cacacaaagatttatagtggttcactgaatgtgggctagtcaactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcc 1733  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaattc-tgtattttctaagtctcggcaggcttgcaccttgttgctaaattaaccacttaaac-tt 378  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||   | |||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||||| ||| || | || || ||    
T  1732 tgcaccttgcaatctttgttcacttgaacaattacagcacatgtattctctaagcttcagcaggcttgcaccttcttgctaagttacccgcgtagacttt 1633  T
Q  379 ttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    ||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  1632 ttacaacctttactcaaactaacactttagtacccctaaagctaaatgagatttt 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 173 - 1
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| | | |||||||||||    
T  173 aaacattttaataaagtaaatgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagagaattatagtggtt 75  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 276  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  74 cacccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 181 - 434
Target Start/End: Original strand, 6194 - 6448
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcc 280  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6194 cacacaaagagttatagtggttcatccaatgtgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactataatgcttgagataacctctcaaatcc 6293  T
Q  281 tgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaactt 378  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||||| || ||  ||| |||||||| |||  || ||||||| ||| ||||||| ||||    
T  6294 tacaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacacctgtattctcaaaacctcagcaggcttacacttttcttgctaagttacccacttagactt 6392  T
Q  379 ttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  6393 ttacaccttttgctcagactaacactttagtacccctaaagctaaatgagacttta 6448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0265 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0265
Description:

Target: scaffold0265; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 12165 - 11914
Alignment:
Q  185 caaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgca 284  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12165 caaaaagttatagtggtacacccaatgtgggttagtccactcctcccaatcttgtgaaagtttccactatgatacttgagataacctctcaaatcctgca 12066  T
Q  285 ccttacaatctgtgttcacctgaac-acttaca-attctgtattttctaagtctcggcaggcttgcac-cttgttgctaaattaaccacttaaactttta 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |  ||||||| |||||| |||  |||||||||||  || ||||||| |||  |||||  |||||||    
T  12065 ccttacaatctttgttcacctgaacaatttacacaacctgtattctctaagcctcaccaggcttgcacttttcttgctaagttacacacttctactttta 11966  T
Q  382 caatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    ||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||||    
T  11965 caccttttg-tcaaactaacactttagtacccctaatgttagatgagacttta 11914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 16354 - 16070
Alignment:
Q  154 taaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    |||||||||||| |||||||  |  | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16354 taaagagtatagggaagagaagaagaacacacaaagatttatagtggttaacccaatatgggctagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccccta 16255  T
Q  254 tgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggcttgcacct 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||   ||||||| ||||||  ||  ||||||||| |||    
T  16254 tgatgcttgagataacctctcaattcctgcaccttacaatct-tgttcagctgaacaagtacaacaactgtattctctaagcgtcaacaggcttgctcct 16156  T
Q  353 tgttgctaaat----taaccacttaaacttttacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttta 434  Q
    | ||||||| |    || ||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  16155 tcttgctaagttacgtacccacttagacttttacaacctttactcaaactaacactttggtactcctaaatctagatgagacttta 16070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 1
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  151 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaaaagcagacttcagaacgttctgacgtctgagtgcaaaaacagtttaataaagtaaatgtgtttgtg 52  T
Q  133 tgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcaca 184  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  51 tgt-gttgtgtatgcagtaagtaaagagtatagggaagagagaatcaacaca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0764 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0764
Description:

Target: scaffold0764; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 225 - 429
Target Start/End: Original strand, 1 - 206
Alignment:
Q  225 tcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgt 323  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||   ||||    
T  1 tcctcacaatcttgtgagattttccactatgatgcttgagataacttctcaaatcctgcaccttacaacct-tgttcacctgaacaattacaacaactgt 99  T
Q  324 attttctaagtctcggcaggcttgcacc-ttgttgctaaattaaccacttaaacttt-tacaatttttgctcaagctaacactttaatacccctaaaact 421  Q
    ||| ||| || ||| |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  100 attctcttagcctcagcaggcttacacctttcttgctaagttacccacttagactttatac-ctttctgctcaaactaacactttagtacccctaaagct 198  T
Q  422 agatgaga 429  Q
    ||||||||    
T  199 agatgaga 206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 266
Target Start/End: Original strand, 30765 - 30926
Alignment:
Q  103 aaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtgtgtctttgtgtttgcagtaagtaaagagtatagagaagagagaatcatcacacaaaaatttatagtggtt 202  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || |||| | | |||| |||||||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  30765 aaacagtttaataaagtaa-tgtgtaagtgtgtgtt-gtgtatactgtaattaaagagtatagggaagagagaaagaacacacagaaatttatagtggtt 30862  T
Q  203 cccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagat 266  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30863 cacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagat 30926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1150 - 918
Alignment:
Q  182 acacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcct 281  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||| || || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1150 acacagaaatttatagtggttcactcaacgtaggctaatccattcctcacaatcttgtgagaatttccactatgatgcttgagataccctctcaactcct 1051  T
Q  282 gcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaa-ttctgtattttctaagtctcggcaggctt-gcaccttgttgctaaattaaccacttaaacttt 379  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||   || |||| | |||| |||  ||||||| |||| || |||||||||   ||||||| |||||    
T  1050 gcgccttacaatct-tgttcacctgaacaattacaacaactatattctgtaagcctcaacaggcttagcactttcttgctaaat--cccacttagacttt 954  T
Q  380 tacaatttt-tgctcaagctaacactttaatacccc 414  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  953 tacacttttctgctcaaactaacactttagtacccc 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 292
Target Start/End: Original strand, 196586 - 196687
Alignment:
Q  191 tttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacctctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| | ||||| ||||| ||| ||||    
T  196586 tttatagtggttcacccaatgtgggttagtccactcctcacaatcttgtgagagtttacactatggtatttgagataccttctcagatccttcactttac 196685  T
Q  291 aa 292  Q
    ||    
T  196686 aa 196687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 240
Target Start/End: Original strand, 189943 - 190028
Alignment:
Q  156 aagagtatagagaagagagaatcatcacacaaa-aatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtg 240  Q
    ||||||||| |||||||| ||  | |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  189943 aagagtataaagaagagaaaaataacacacagagaatttatagtggttcacccaatatgggttagtccactcctcgcaatcttgtg 190028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 67094 - 67013
Alignment:
Q  188 aaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataac 269  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  67094 aaatatatagtggttcactcaatgtgggttagtacactcctcacaatcttgtgagaattttcactatgatgcttcagataac 67013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 66346 - 66292
Alignment:
Q  263 agataacctctcaaatcctgcaccttacaatctgtgttcacctgaacacttacaat 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  66346 agataacctctcaaattctgcaccttacaatct-tgttcacttaaacaattacaat 66292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 107 - 5
Alignment:
Q  33 attctcaagttgaaacttggaatggttaagttaatgacatattttagaacgttctgacgtctaagtgcaaaaacagtttaacaaagtaaatgtgtttgtg 132  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||   || | || | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  107 attctcaaattgaaatttggaatggttaagtaaaaagcagacttcaaaacgttatgatgtcttagtgcaaaaacagtttaataaaataaatgtgtttgtg 8  T
Q  133 tgt 135  Q
    |||    
T  7 tgt 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 291
Target Start/End: Original strand, 2000 - 2097
Alignment:
Q  192 ttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccactatgatgcttgagataacc-tctcaaatcctgcaccttac 290  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| | | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  2000 ttatagtggttcatctaatgtgggttattccactcctcacaa--ctgtgaga-tgttcactatgatccttgagacaaccttctcaactcatgcaccttac 2096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 397 - 433
Target Start/End: Original strand, 2262 - 2298
Alignment:
Q  397 ctaacactttaatacccctaaaactagatgagatttt 433  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2262 ctaacattttaatacccttaaaactagatgagatttt 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Original strand, 1369 - 1441
Alignment:
Q  181 cacacaaaaatttatagtggttcccccaatgtgggttattccactcctcacaatcttgtgagagtttccacta 253  Q
    ||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||||||| | |||||||    
T  1369 cacacaagaagttatcctggttcccccaatgtgggttagtccagtccccacaatactgtgagattatccacta 1441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University