View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2532_low_15 (Length: 400)

Name: NF2532_low_15
Description: NF2532
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2532_low_15
NF2532_low_15
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (1-393)||(39811811-39812204)
chr2 (2-356)||(32246654-32247012)
chr2 (2-276)||(44312563-44312839)
chr2 (2-356)||(19344290-19344649)
chr2 (2-356)||(19349148-19349507)
chr2 (16-310)||(11098843-11099139)
chr2 (16-310)||(14291372-14291669)
chr2 (16-310)||(9296317-9296614)
chr2 (21-310)||(25398386-25398675)
chr2 (21-310)||(25403524-25403813)
chr2 (132-310)||(3491751-3491930)
chr2 (132-217)||(8040060-8040147)
chr2 (310-390)||(11098711-11098790)
chr2 (135-308)||(13569331-13569506)
chr2 (132-214)||(40738844-40738926)
chr2 (162-310)||(25407653-25407802)
chr2 (132-226)||(21629944-21630040)
chr2 (132-226)||(28259178-28259274)
chr2 (132-226)||(10445444-10445541)
chr2 (132-226)||(17865203-17865300)
chr2 (132-226)||(20522220-20522317)
chr2 (132-226)||(34682334-34682431)
chr2 (310-390)||(9296186-9296265)
chr2 (310-390)||(14291722-14291801)
chr2 (133-226)||(34388859-34388955)
chr2 (132-226)||(14699008-14699104)
chr2 (133-226)||(10707252-10707348)
chr2 (135-226)||(8390150-8390244)
chr2 (132-217)||(31056044-31056131)
chr2 (132-226)||(33528621-33528718)
chr2 (132-226)||(39482931-39483028)
chr2 (132-226)||(23078471-23078567)
chr2 (132-226)||(42039670-42039766)
chr2 (132-217)||(16940219-16940306)
chr2 (132-217)||(17010884-17010971)
chr2 (132-216)||(33118136-33118222)
chr2 (132-272)||(36757718-36757859)
chr2 (310-373)||(25409860-25409922)
chr2 (122-195)||(2838063-2838136)
chr2 (135-195)||(1345574-1345635)
chr2 (136-195)||(35215586-35215646)
chr2 (136-195)||(35217963-35218023)
chr2 (153-215)||(27149306-27149369)
chr2 (135-215)||(2869705-2869787)
chr2 (136-192)||(45332181-45332238)
chr2 (136-195)||(23452237-23452297)
chr2 (136-195)||(36558864-36558924)
chr2 (136-195)||(36561141-36561201)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (2-393)||(15044556-15044948)
chr5 (2-393)||(43592148-43592541)
chr5 (2-393)||(1456985-1457377)
chr5 (2-393)||(27449683-27450076)
chr5 (2-393)||(43598593-43598986)
chr5 (2-393)||(43604085-43604478)
chr5 (2-393)||(43609577-43609970)
chr5 (2-393)||(27444839-27445232)
chr5 (1-356)||(28807435-28807791)
chr5 (1-332)||(37556506-37556840)
chr5 (1-332)||(37561328-37561662)
chr5 (2-309)||(30631277-30631586)
chr5 (55-310)||(31180138-31180394)
chr5 (1-356)||(2785244-2785602)
chr5 (1-356)||(33791185-33791543)
chr5 (1-356)||(31396849-31397209)
chr5 (1-356)||(31401706-31402066)
chr5 (21-310)||(24135740-24136028)
chr5 (21-310)||(38192064-38192353)
chr5 (21-310)||(38219289-38219578)
chr5 (1-356)||(33768048-33768411)
chr5 (110-310)||(35387640-35387842)
chr5 (310-390)||(30631640-30631719)
chr5 (310-390)||(31180447-31180526)
chr5 (132-226)||(9353333-9353429)
chr5 (132-226)||(36932351-36932447)
chr5 (132-226)||(10281751-10281848)
chr5 (132-226)||(15464532-15464628)
chr5 (310-390)||(24136080-24136159)
chr5 (133-226)||(11916972-11917068)
chr5 (132-226)||(14520230-14520326)
chr5 (132-217)||(17003970-17004057)
chr5 (132-226)||(3880299-3880396)
chr5 (135-226)||(12084176-12084269)
chr5 (132-226)||(19588746-19588843)
chr5 (132-214)||(28832259-28832343)
chr5 (310-390)||(35387893-35387972)
chr5 (132-214)||(42127423-42127507)
chr5 (136-195)||(4410241-4410301)
chr5 (132-211)||(31300612-31300693)
chr5 (136-195)||(15552464-15552524)
chr5 (136-195)||(31179371-31179431)
chr5 (136-195)||(31542953-31543013)
chr5 (136-195)||(31545299-31545359)
chr5 (310-390)||(38219629-38219708)
chr5 (136-189)||(27910675-27910729)
chr5 (136-195)||(3373137-3373197)
chr5 (136-195)||(10749919-10749979)
chr5 (136-195)||(15354575-15354635)
chr5 (132-214)||(24553520-24553603)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (1-390)||(14737403-14737793)
chr6 (1-381)||(28184371-28184757)
chr6 (1-390)||(14742263-14742652)
chr6 (2-393)||(22010520-22010912)
chr6 (2-393)||(11856841-11857236)
chr6 (1-356)||(28155431-28155787)
chr6 (2-338)||(6438370-6438707)
chr6 (1-356)||(6005286-6005644)
chr6 (1-356)||(16838613-16838971)
chr6 (1-356)||(33330303-33330663)
chr6 (132-356)||(33335800-33336026)
chr6 (31-310)||(5674685-5674966)
chr6 (310-390)||(5674554-5674633)
chr6 (132-226)||(5757479-5757575)
chr6 (132-226)||(21356036-21356132)
chr6 (132-216)||(10077176-10077262)
chr6 (132-226)||(5572241-5572338)
chr6 (132-215)||(31086485-31086570)
chr6 (132-216)||(4629954-4630040)
chr6 (132-226)||(31979513-31979610)
chr6 (1-177)||(5343349-5343527)
chr6 (144-226)||(21801344-21801429)
chr6 (154-214)||(22709041-22709102)
chr6 (132-226)||(22963700-22963796)
chr6 (132-226)||(23824597-23824693)
chr6 (153-226)||(18232867-18232942)
chr6 (132-214)||(5017482-5017566)
chr6 (15-77)||(30125944-30126008)
chr6 (132-195)||(31936587-31936651)
chr6 (136-195)||(12195515-12195575)
chr6 (123-195)||(5273203-5273276)
chr6 (281-330)||(5343628-5343677)
chr6 (237-310)||(22709116-22709188)
chr6 (136-195)||(4816231-4816291)
chr6 (136-195)||(19704567-19704627)
chr6 (136-195)||(20915356-20915416)
chr6 (136-195)||(26932562-26932622)
chr6 (136-195)||(29754709-29754769)
chr6 (136-195)||(33309110-33309170)
[»] chr7 (56 HSPs)
chr7 (1-393)||(31109406-31109799)
chr7 (2-385)||(12406201-12406585)
chr7 (2-393)||(12396781-12397173)
chr7 (2-393)||(24024150-24024543)
chr7 (1-353)||(19992181-19992535)
chr7 (2-356)||(21812098-21812454)
chr7 (2-221)||(4866599-4866820)
chr7 (15-310)||(20357463-20357761)
chr7 (15-310)||(2057842-2058147)
chr7 (95-356)||(24266060-24266326)
chr7 (95-330)||(24261208-24261447)
chr7 (110-310)||(1533359-1533563)
chr7 (95-330)||(16880034-16880273)
chr7 (95-330)||(16884890-16885129)
chr7 (21-310)||(21639701-21639988)
chr7 (110-310)||(18408742-18408943)
chr7 (21-310)||(21645899-21646186)
chr7 (110-310)||(18413619-18413819)
chr7 (312-390)||(4873310-4873387)
chr7 (310-390)||(20357331-20357410)
chr7 (310-390)||(1533228-1533307)
chr7 (310-390)||(2058202-2058281)
chr7 (133-216)||(21983285-21983370)
chr7 (132-226)||(29159803-29159900)
chr7 (132-226)||(46516310-46516407)
chr7 (132-226)||(49091661-49091758)
chr7 (132-226)||(44848685-44848781)
chr7 (132-226)||(2647696-2647793)
chr7 (132-226)||(33332450-33332547)
chr7 (132-214)||(9190021-9190105)
chr7 (132-214)||(20284089-20284173)
chr7 (132-272)||(2580390-2580531)
chr7 (132-226)||(55948-56044)
chr7 (132-215)||(35960816-35960901)
chr7 (132-214)||(9185178-9185262)
chr7 (132-211)||(47263678-47263757)
chr7 (132-215)||(2479337-2479421)
chr7 (132-226)||(4796667-4796764)
chr7 (135-195)||(28617258-28617319)
chr7 (310-390)||(21640039-21640118)
chr7 (310-373)||(21646237-21646299)
chr7 (133-216)||(21988909-21988992)
chr7 (310-390)||(18408993-18409072)
chr7 (136-195)||(31155911-31155971)
chr7 (136-195)||(1049296-1049356)
chr7 (136-195)||(2935497-2935557)
chr7 (136-195)||(3035953-3036013)
chr7 (132-195)||(5817303-5817366)
chr7 (136-195)||(7351652-7351712)
chr7 (132-179)||(8153466-8153514)
chr7 (136-195)||(9027194-9027254)
chr7 (310-390)||(18413869-18413948)
chr7 (136-195)||(22108295-22108355)
chr7 (136-195)||(22137306-22137366)
chr7 (136-195)||(40550055-40550115)
chr7 (136-195)||(40552333-40552393)
[»] chr4 (41 HSPs)
chr4 (2-393)||(9224230-9224622)
chr4 (2-393)||(9229017-9229409)
chr4 (2-389)||(51520326-51520715)
chr4 (2-356)||(45347677-45348033)
chr4 (2-338)||(45357174-45357512)
chr4 (2-390)||(3813893-3814281)
chr4 (2-356)||(5732531-5732888)
chr4 (1-338)||(18855595-18855933)
chr4 (2-262)||(56146664-56146927)
chr4 (16-310)||(24741825-24742121)
chr4 (16-308)||(29760527-29760821)
chr4 (304-393)||(18712589-18712677)
chr4 (132-214)||(28468542-28468625)
chr4 (310-390)||(24742174-24742253)
chr4 (310-390)||(29760874-29760954)
chr4 (132-226)||(10047379-10047476)
chr4 (132-310)||(31985552-31985730)
chr4 (132-226)||(39245994-39246091)
chr4 (132-226)||(36315230-36315326)
chr4 (132-226)||(36329439-36329535)
chr4 (132-226)||(16623293-16623390)
chr4 (132-226)||(5396672-5396768)
chr4 (132-217)||(38152449-38152536)
chr4 (132-226)||(3796519-3796616)
chr4 (133-216)||(5143260-5143345)
chr4 (132-214)||(5269204-5269288)
chr4 (133-216)||(5147678-5147763)
chr4 (133-226)||(3777550-3777645)
chr4 (132-217)||(24333809-24333896)
chr4 (137-217)||(6743425-6743507)
chr4 (136-226)||(16630680-16630773)
chr4 (136-195)||(16931789-16931849)
chr4 (136-195)||(16934143-16934203)
chr4 (136-195)||(22780373-22780433)
chr4 (136-195)||(44599838-44599898)
chr4 (153-226)||(39774305-39774380)
chr4 (132-216)||(54867184-54867269)
chr4 (136-195)||(6765117-6765177)
chr4 (136-195)||(7941596-7941656)
chr4 (136-195)||(18709164-18709224)
chr4 (136-195)||(22782738-22782798)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (2-393)||(34885-35277)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (1-390)||(25328105-25328494)
chr8 (2-393)||(7289749-7290142)
chr8 (1-356)||(39784684-39785040)
chr8 (2-310)||(6311167-6311477)
chr8 (16-310)||(36979262-36979558)
chr8 (16-309)||(33037724-33038019)
chr8 (1-356)||(35745260-35745618)
chr8 (16-310)||(30655525-30655827)
chr8 (2-310)||(4759991-4760301)
chr8 (15-310)||(18853083-18853382)
chr8 (16-310)||(18870477-18870772)
chr8 (95-356)||(10684122-10684388)
chr8 (55-310)||(10689058-10689315)
chr8 (110-310)||(1261871-1262073)
chr8 (110-310)||(31071146-31071349)
chr8 (110-214)||(26287879-26287985)
chr8 (110-214)||(26301136-26301242)
chr8 (110-214)||(26313130-26313236)
chr8 (310-393)||(6311532-6311614)
chr8 (310-390)||(18870345-18870424)
chr8 (298-390)||(25327979-25328070)
chr8 (310-390)||(30655880-30655959)
chr8 (310-390)||(10688924-10689003)
chr8 (310-390)||(18852951-18853030)
chr8 (132-217)||(26403240-26403327)
chr8 (132-226)||(4456028-4456124)
chr8 (97-226)||(7412305-7412437)
chr8 (310-390)||(33037592-33037671)
chr8 (310-391)||(4759857-4759938)
chr8 (132-226)||(19175755-19175851)
chr8 (132-226)||(23799577-23799674)
chr8 (132-214)||(4696609-4696693)
chr8 (135-226)||(6127224-6127318)
chr8 (134-195)||(9765852-9765914)
chr8 (132-226)||(5702483-5702580)
chr8 (310-390)||(36979611-36979689)
chr8 (310-390)||(1261741-1261820)
chr8 (132-214)||(19752407-19752491)
chr8 (136-195)||(43079877-43079937)
chr8 (136-195)||(43082248-43082308)
chr8 (132-198)||(6813683-6813750)
chr8 (162-195)||(18810982-18811015)
chr8 (310-371)||(31071035-31071095)
chr8 (136-195)||(44721118-44721178)
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (2-393)||(22173018-22173410)
chr3 (2-356)||(18656301-18656658)
chr3 (1-310)||(28503780-28504081)
chr3 (16-310)||(7167129-7167425)
chr3 (1-356)||(2676945-2677304)
chr3 (1-356)||(2672789-2673148)
chr3 (1-356)||(24967976-24968334)
chr3 (15-310)||(2671502-2671800)
chr3 (66-307)||(8738982-8739224)
chr3 (66-307)||(9091220-9091462)
chr3 (1-356)||(8512084-8512444)
chr3 (1-356)||(8516964-8517324)
chr3 (31-310)||(8477263-8477545)
chr3 (115-310)||(40372712-40372908)
chr3 (175-310)||(28501613-28501750)
chr3 (95-330)||(32475446-32475684)
chr3 (95-330)||(32480304-32480542)
chr3 (110-310)||(26928507-26928709)
chr3 (132-310)||(32143321-32143501)
chr3 (132-310)||(1305949-1306128)
chr3 (310-390)||(7167478-7167558)
chr3 (310-391)||(8738846-8738926)
chr3 (132-310)||(27452958-27453138)
chr3 (310-390)||(2671370-2671449)
chr3 (132-226)||(8370477-8370573)
chr3 (132-226)||(27974943-27975039)
chr3 (310-390)||(40372580-40372659)
chr3 (310-387)||(8477598-8477674)
chr3 (132-226)||(18552873-18552970)
chr3 (310-390)||(9091085-9091164)
chr3 (132-226)||(16264350-16264446)
chr3 (132-226)||(21711223-21711319)
chr3 (132-214)||(27986449-27986533)
chr3 (133-226)||(36029094-36029190)
chr3 (135-226)||(1736295-1736389)
chr3 (1-180)||(10207802-10207983)
chr3 (310-390)||(28501480-28501560)
chr3 (310-390)||(28503647-28503727)
chr3 (132-226)||(30709780-30709877)
chr3 (132-214)||(33386669-33386753)
chr3 (132-226)||(3715992-3716089)
chr3 (132-226)||(40592772-40592869)
chr3 (132-226)||(48438214-48438311)
chr3 (132-226)||(6794704-6794800)
chr3 (132-226)||(25795781-25795878)
chr3 (132-226)||(26298988-26299085)
chr3 (132-214)||(1417493-1417577)
chr3 (132-226)||(47923896-47923993)
chr3 (132-214)||(37466291-37466375)
chr3 (132-214)||(39039995-39040079)
chr3 (132-226)||(40844652-40844748)
chr3 (132-214)||(3328359-3328443)
chr3 (132-198)||(4386947-4387014)
chr3 (132-226)||(24695154-24695251)
chr3 (136-195)||(38210569-38210629)
chr3 (136-195)||(50494198-50494258)
chr3 (136-199)||(53894055-53894119)
chr3 (153-214)||(3323693-3323755)
chr3 (310-371)||(1306179-1306239)
chr3 (136-195)||(458483-458543)
chr3 (136-195)||(6063444-6063504)
chr3 (136-195)||(10621528-10621588)
chr3 (132-179)||(39153357-39153405)
[»] chr1 (41 HSPs)
chr1 (1-393)||(41398106-41398498)
chr1 (32-393)||(41390485-41390843)
chr1 (1-338)||(25444967-25445306)
chr1 (1-338)||(44023752-44024089)
chr1 (1-338)||(39445368-39445706)
chr1 (1-338)||(1054890-1055228)
chr1 (16-310)||(24787280-24787580)
chr1 (114-356)||(43988320-43988567)
chr1 (21-310)||(24202686-24202973)
chr1 (236-338)||(25439774-25439875)
chr1 (132-310)||(19358760-19358939)
chr1 (96-310)||(19361349-19361564)
chr1 (96-310)||(19379989-19380204)
chr1 (132-226)||(26644898-26644994)
chr1 (311-390)||(24787148-24787226)
chr1 (132-217)||(47703946-47704033)
chr1 (132-226)||(19072928-19073025)
chr1 (132-226)||(19120818-19120915)
chr1 (132-226)||(16124516-16124613)
chr1 (132-226)||(27104372-27104469)
chr1 (132-226)||(3281708-3281804)
chr1 (132-217)||(9476261-9476348)
chr1 (132-217)||(13598398-13598485)
chr1 (132-217)||(29651811-29651898)
chr1 (132-224)||(37069770-37069864)
chr1 (310-390)||(24202556-24202635)
chr1 (132-217)||(775672-775759)
chr1 (97-226)||(21536570-21536702)
chr1 (132-226)||(13604624-13604720)
chr1 (132-214)||(47098837-47098921)
chr1 (132-214)||(32889439-32889523)
chr1 (135-195)||(47102874-47102935)
chr1 (136-195)||(9459419-9459479)
chr1 (136-195)||(9463246-9463306)
chr1 (136-195)||(16226386-16226446)
chr1 (243-310)||(19366225-19366292)
chr1 (1-30)||(41386617-41386646)
chr1 (1-75)||(43988607-43988682)
chr1 (310-390)||(19366095-19366174)
chr1 (136-195)||(23786058-23786118)
chr1 (136-195)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (1-338)||(9521-9856)
scaffold0355 (218-393)||(3671-3845)
scaffold0355 (1-75)||(28-103)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-338)||(231-569)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-356)||(2109-2467)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-356)||(148814-149172)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (95-356)||(14167-14433)
scaffold0197 (1-356)||(19023-19381)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (21-310)||(17869-18157)
scaffold0188 (110-310)||(23962-24164)
scaffold0188 (310-390)||(17739-17818)
scaffold0188 (310-390)||(23832-23911)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (95-200)||(181980-182088)
scaffold0009 (267-356)||(176835-176925)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (132-226)||(8420-8516)
scaffold0140 (136-195)||(22343-22403)
scaffold0140 (136-195)||(24618-24678)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (2-164)||(300-463)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (133-226)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (132-226)||(43962-44058)
scaffold0087 (97-226)||(36833-36965)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (132-217)||(5683-5770)
scaffold0006 (132-217)||(2492-2579)
scaffold0006 (132-226)||(133281-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (132-226)||(10729-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (132-214)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (135-226)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (136-195)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (162-195)||(11500-11533)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-30)||(34136-34165)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (136-195)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39812204 - 39811811
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39812204 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaag 39812105  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812104 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 39812005  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812004 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 39811905  T
Q  300 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39811904 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttctc-aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 39811811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Original strand, 32246654 - 32247012
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246654 taatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 32246753  T
Q  101 taagcggtaaaagaa---agaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    |||||   |||| ||   |||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246754 taagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 32246853  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246854 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacac 32246953  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  32246954 tatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctca 32247012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 44312839 - 44312563
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  44312839 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 44312741  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312740 ataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 44312641  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312640 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Original strand, 19344290 - 19344649
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  19344290 taatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 19344385  T
Q  99 gataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19344386 gataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 19344485  T
Q  196 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctca 293  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19344486 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 19344584  T
Q  294 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| |||||||||    
T  19344585 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctca 19344649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Original strand, 19349148 - 19349507
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  |||    
T  19349148 taatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caa 19349243  T
Q  99 gataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19349244 gataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatcca 19349343  T
Q  196 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctca 293  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19349344 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctca 19349442  T
Q  294 cactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| |||||||||    
T  19349443 cactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctca 19349507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11099139 - 11098843
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |   |||    
T  11099139 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaa 11099043  T
Q  113 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11099042 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 11098943  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11098942 caaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 11098844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 14291372 - 14291669
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||    
T  14291372 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaa 14291469  T
Q  113 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291470 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 14291569  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14291570 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 14291668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9296614 - 9296317
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| ||||    |||    
T  9296614 aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagc-aagaaa 9296517  T
Q  113 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9296516 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 9296417  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  9296416 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 9296318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398675
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    |||| ||||    
T  25398386 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagc-aagaaaggaaga 25398481  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25398482 acaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 25398581  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25398582 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403813
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    |||| ||||    
T  25403524 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagc-aagaaaggaaga 25403619  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  25403620 acaaacacaccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 25403719  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25403720 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491930
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 3491850  T
Q  230 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3491851 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098711
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 11098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 308
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569506
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagactcta 231  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 13569430  T
Q  232 gccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 308  Q
    || |  ||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||||| |  |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  13569431 gcttataag-tttacacaagaacaagacctaatttctaccctttgtttgtcacccactctcacaatatgaatcctaa 13569506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 162 - 310
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  162 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacc 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  260 ctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630040
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445444
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865300
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522317
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682334
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296186
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaatagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 9296186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291801
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttggttccctcctttg 14291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699008
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390150
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaaga 8390150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528621
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483028
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078471
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaaga 23078471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039670
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 33118136 - 33118222
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33118136 aagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757718
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||       
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaa 36757760  T
Q  230 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 272  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  36757759 aagctttcaagc-ttacacaagaacaaaacctaatttctaccc 36757718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 373
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccc 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2838136 - 2838063
Alignment:
Q  122 aaacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838136 aaacaccaagaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  153 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 192
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 192  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 15044556 - 15044948
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044556 taatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 15044655  T
Q  101 taagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 200  Q
    |||||   ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044656 taagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatg 15044755  T
Q  201 agaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044756 agaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatg 15044855  T
Q  301 aaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044856 aaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 15044948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 43592148 - 43592541
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  43592148 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 43592247  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592248 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 43592347  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  43592348 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 43592447  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592448 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43592541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1457377 - 1456985
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1457377 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 1457278  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457277 ataagaaagaaaggaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 1457179  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  1457178 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaata 1457079  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457078 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 1456985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 27449683 - 27450076
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27449683 taatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 27449782  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449783 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 27449882  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  27449883 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 27449982  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449983 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 27450076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 43598593 - 43598986
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  43598593 taatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 43598692  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598693 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 43598792  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  43598793 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 43598892  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598893 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43598986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 43604085 - 43604478
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  43604085 taatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 43604184  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604185 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 43604284  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  43604285 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 43604384  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604385 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43604478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 43609577 - 43609970
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  43609577 taatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 43609676  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609677 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 43609776  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  43609777 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 43609876  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609877 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43609970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 27444839 - 27445232
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  27444839 taatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 27444938  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444939 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 27445038  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  27445039 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 27445138  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445139 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 27445232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28807791 - 28807435
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataaac 96  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||| |  ||| ||||||||    
T  28807791 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaac 28807694  T
Q  97 aagataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807693 aagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 28807594  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 294  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807593 aatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcac 28807496  T
Q  295 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28807495 actatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctca 28807435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37556840 - 37556506
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  37556840 ataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 37556742  T
Q  99 gataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556741 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 37556642  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556641 tatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37556543  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 332  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37556542 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt 37556506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37561662 - 37561328
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  37561662 ataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 37561564  T
Q  99 gataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561563 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 37561464  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561463 tatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 37561365  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttt 332  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  37561364 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttt 37561328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 2 - 309
Target Start/End: Original strand, 30631277 - 30631586
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | ||||  |||||||||||||||    
T  30631277 taatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaag 30631375  T
Q  100 ataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||||   |||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631376 ataag---taagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 30631472  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  30631473 atgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 30631572  T
Q  296 ctatgaaccctaaa 309  Q
     |||||||||||||    
T  30631573 atatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  55 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagc 31180236  T
Q  154 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatg 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  31180237 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag 31180336  T
Q  252 aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180337 -acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 2785244 - 2785602
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  2785244 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 2785339  T
Q  98 agataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785340 agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 2785438  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  2785439 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctc 2785537  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  2785538 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 2785602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 33791185 - 33791543
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||  ||    
T  33791185 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--ca 33791280  T
Q  98 agataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33791281 agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatcc 33791379  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  33791380 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctc 33791478  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33791479 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 33791543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31397209 - 31396849
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  31397209 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcc-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 31397114  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaagaaca-aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||||| || |||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397113 agataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 31397014  T
Q  196 atatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactct 291  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||    
T  31397013 atatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcct 31396915  T
Q  292 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  31396914 cacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 31396849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31402066 - 31401706
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  31402066 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 31401971  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31401970 agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 31401872  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactc 290  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  31401871 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctaga-tctaccctttggcattttcccatcc 31401773  T
Q  291 tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  31401772 tcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 31401706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 24135740 - 24136028
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaa 119  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||| | | |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||    
T  24135740 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaa 24135835  T
Q  120 caaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| |    
T  24135836 caaacacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagg 24135935  T
Q  218 gttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24135936 gttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192353
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    |||| ||||    
T  38192064 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagc-aagaaaggaaga 38192159  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  38192160 acaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 38192259  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38192260 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219578
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||    |||| ||||    
T  38219289 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagc--aaacaagataagc-aagaaaggaaga 38219384  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  38219385 acaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 38219484  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38219485 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 33768048 - 33768411
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  ||| |||||  ||    
T  33768048 ataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--ca 33768143  T
Q  98 agataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
     ||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33768144 ggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatcc 33768242  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctacccttt--ggtattttccc-act 289  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| ||     
T  33768243 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttcggttattttccctacc 33768341  T
Q  290 c--tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |   |||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33768342 cctccacactatgaaccaataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 33768411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Original strand, 35387640 - 35387842
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  35387640 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagt 35387739  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||| ||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35387740 gttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 35387838  T
Q  307 aaaa 310  Q
    ||||    
T  35387839 aaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631719
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 30631719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180526
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 31180526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136159
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24136159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880396
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387972
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttcc-aacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 35387972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 31300693 - 31300612
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  31300693 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219708
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 38219708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 189  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24553603 - 24553520
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  24553603 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14737793 - 14737403
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa--gagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  14737793 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaaca 14737695  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737694 agataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 14737595  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737594 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 14737495  T
Q  298 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737494 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 14737403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 28184371 - 28184757
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaa--tggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 97  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184371 ataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaaca 28184470  T
Q  98 agataagcggtaaaa-gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28184471 agataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaa 28184570  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184571 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 28184670  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg--tttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttc 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  28184671 tatgaaccctaaaacccaaggtgattactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttgttc 28184757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14742652 - 14742263
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  14742652 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaa 14742554  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742553 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaata 14742454  T
Q  199 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742453 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 14742354  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14742353 tgaaccctaaaacccaaagtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggttccctcctttg 14742263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22010912 - 22010520
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22010912 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 22010814  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010813 ataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 22010714  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  22010713 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaata 22010614  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010613 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 22010520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 11856841 - 11857236
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  11856841 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 11856939  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    | ||||| |||||| ||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856940 acaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaa 11857039  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11857040 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 11857139  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857140 atatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 11857236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28155787 - 28155431
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  28155787 ataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaa 28155689  T
Q  99 gataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155688 gataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 28155589  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155588 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacac 28155490  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28155489 tatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctca 28155431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Original strand, 6438370 - 6438707
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  6438370 taatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 6438467  T
Q  100 ataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438468 ataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 6438567  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438568 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 6438665  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438666 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 6438707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 6005286 - 6005644
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  6005286 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 6005381  T
Q  98 agataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005382 agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 6005480  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  6005481 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctc 6005579  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  6005580 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 6005644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 16838613 - 16838971
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  16838613 ataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 16838708  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838709 agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatcc 16838807  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  16838808 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctc 16838906  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  16838907 acactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 16838971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33330663 - 33330303
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaac 96  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||| |    
T  33330663 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-c 33330567  T
Q  97 aagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 193  Q
    ||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330566 aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 33330468  T
Q  194 caatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactct 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  33330467 caatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcct 33330369  T
Q  292 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33330368 cacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 33330303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 132 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33336026 - 33335800
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactct 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  33336026 aagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatct 33335927  T
Q  231 agcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt 329  Q
    ||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33335926 agcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgt 33335828  T
Q  330 t-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    | ||| || |||| |||| |||||||||    
T  33335827 tgttttcccaacctaagaaacactctca 33335800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5674966 - 5674685
Alignment:
Q  31 caacaacaacaaaac-agccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acac 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||    
T  5674966 caacaacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca-aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacac 5674871  T
Q  128 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 225  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  5674870 caaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 5674771  T
Q  226 -actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5674770 aacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674554
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 5674554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572241
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979610
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 5343349 - 5343527
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagattccaaagcataaac 96  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||| |||||| ||||| |  ||| |||||  |    
T  5343349 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--c 5343444  T
Q  97 aagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 177  Q
    ||||||| || |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343445 aagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  144 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 214
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709102
Alignment:
Q  154 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963796
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824597
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  153 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 30126008 - 30125944
Alignment:
Q  15 caaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa 77  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30126008 caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 195
Target Start/End: Original strand, 5273203 - 5273276
Alignment:
Q  123 aacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273203 aacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 330
Target Start/End: Original strand, 5343628 - 5343677
Alignment:
Q  281 tttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5343628 tttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtt 5343677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 310
Target Start/End: Original strand, 22709116 - 22709188
Alignment:
Q  237 caagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  22709116 caagctt-acacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22709188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31109799 - 31109406
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109799 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 31109700  T
Q  101 taagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||| |   ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109699 taaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatat 31109600  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109599 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactat 31109500  T
Q  300 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccat-tggttccctcctttgcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31109499 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgcta 31109406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 385
Target Start/End: Original strand, 12406201 - 12406585
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12406201 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 12406299  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12406300 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatat 12406399  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  12406400 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaata 12406499  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctc 385  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12406500 tgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 12406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Original strand, 12396781 - 12397173
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  12396781 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 12396879  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12396880 ataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatat 12396979  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||    
T  12396980 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaata 12397079  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397080 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 12397173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 24024543 - 24024150
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccc-taactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||||    
T  24024543 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaag 24024445  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaa-caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    ||||||   ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024444 ataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 24024345  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24024344 atgagaaagtgttacaaaatgttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacg 24024245  T
Q  298 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024244 atgaaccctaaaacccacggtgattacaatgttttt-ccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 24024150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 353
Target Start/End: Original strand, 19992181 - 19992535
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  19992181 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 19992278  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992279 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 19992378  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992379 tatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 19992477  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactc 353  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  19992478 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactc 19992535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21812454 - 21812098
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattcca-aagcataaacaag 99  Q
    ||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||    
T  21812454 taatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagttaacaagcataaacaag 21812357  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21812356 ataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaat 21812257  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaa-gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812256 atgtgaa-gtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcaca 21812159  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21812158 ctatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactctca 21812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Original strand, 4866599 - 4866820
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccacacaaga-gattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  4866599 taatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaa 4866697  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866698 gataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 4866797  T
Q  199 tgagaaagtgttacaaaaggtta 221  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  4866798 tgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20357761 - 20357463
Alignment:
Q  15 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   |||    
T  20357761 caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaa 20357664  T
Q  112 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 211  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20357663 aggaagaacaaaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 20357564  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20357563 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 20357464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Original strand, 2057842 - 2058147
Alignment:
Q  15 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaa----caagataagcgg 107  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||||||||      
T  2057842 caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaa 2057941  T
Q  108 taaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 206  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2057942 taaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaag 2058041  T
Q  207 tgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaac 303  Q
    ||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| |||||||    
T  2058042 tgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaac 2058140  T
Q  304 cctaaaa 310  Q
    |||||||    
T  2058141 cctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 95 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24266326 - 24266060
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266326 acaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24266227  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  24266226 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaac 24266128  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  24266127 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 24266060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 24261447 - 24261208
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261447 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 24261348  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  24261347 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaac 24261249  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  24261248 ctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgtt 24261208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1533563 - 1533359
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1533563 aaagaaagaacaaacacaccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagt 1533464  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacc 304  Q
    |||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1533463 gttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaacc 1533365  T
Q  305 ctaaaa 310  Q
    ||||||    
T  1533364 ctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 16880034 - 16880273
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880034 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 16880133  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||      
T  16880134 tccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaac 16880232  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  16880233 ctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgtt 16880273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 16884890 - 16885129
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16884890 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 16884989  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||      
T  16884990 tccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaac 16885088  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  16885089 ctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgtt 16885129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21639988
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21639701 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21639794  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||     
T  21639795 acaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaag 21639894  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21639895 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Original strand, 18408742 - 18408943
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18408742 aaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagt 18408840  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| |   || | | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18408841 gttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 18408939  T
Q  307 aaaa 310  Q
    ||||    
T  18408940 aaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21646186
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaaga 118  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||| ||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21645899 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaaaca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21645992  T
Q  119 acaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||     
T  21645993 acaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaag 21646092  T
Q  217 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21646093 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Original strand, 18413619 - 18413819
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18413619 aaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 18413716  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18413717 gttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 18413815  T
Q  307 aaaa 310  Q
    ||||    
T  18413816 aaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 390
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873387
Alignment:
Q  312 ccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 4873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357331
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 20357331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533228
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 1533228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058281
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 2058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159900
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516310
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091758
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647696
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332450
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 272
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580531
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactc 229  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   |||||||||       
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaaa 2580489  T
Q  230 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 272  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  2580490 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctaccc 2580531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56044
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 215
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4796764 - 4796667
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4796764 aagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640118
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 21640118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 373
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccc 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409072
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18409072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817303
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatcca 5817303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413948
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18413948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 41)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9224622 - 9224230
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9224622 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 9224524  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224523 ataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 9224424  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9224423 gagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacacta 9224324  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224323 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 9224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 9229409 - 9229017
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  9229409 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 9229311  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229310 ataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 9229211  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9229210 gagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacacta 9229111  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229110 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 9229017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 2 - 389
Target Start/End: Original strand, 51520326 - 51520715
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  51520326 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaag 51520425  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520426 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 51520525  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  51520526 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaata 51520625  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctccttt 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520626 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctccttt 51520715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45348033 - 45347677
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45348033 taatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaaga 45347934  T
Q  101 taagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347933 taagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 45347834  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347833 gagaaagtgttacaaaaggttacaagacctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 45347734  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45347733 tgaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagagacactctca 45347677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 45357512 - 45357174
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45357512 taatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaaga 45357413  T
Q  101 taagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357412 taagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 45357313  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357312 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 45357213  T
Q  300 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357212 gaaccctaaaccccaaggtgattacaatgtttttcccaa 45357174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 390
Target Start/End: Original strand, 3813893 - 3814281
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  3813893 taatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 3813991  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||||||    |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813992 gataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 3814090  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814091 atgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacact 3814189  T
Q  298 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3814190 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccctcctttg 3814281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Original strand, 5732531 - 5732888
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  ||||||    
T  5732531 taatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaag 5732628  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732629 ataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 5732728  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732729 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcac 5732827  T
Q  295 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  5732828 actataaacccttaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctca 5732888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 18855595 - 18855933
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  18855595 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 18855692  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855693 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 18855792  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855793 tatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 18855890  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855891 ctatgaacccacaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 18855933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 56146927 - 56146664
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  56146927 taatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaag 56146828  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146827 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 56146728  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146727 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 24741825 - 24742121
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||    
T  24741825 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaa 24741921  T
Q  113 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24741922 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 24742021  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24742022 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 24742120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 29760527 - 29760821
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaag 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||   ||| |    
T  29760527 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 29760624  T
Q  114 aaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29760625 aa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 29760723  T
Q  213 aaaaggttacaagactc--tagccttcaagctttacacatgaa-caaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 308  Q
    ||| ||||||||||  |  |||||| ||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29760724 aaagggttacaagaaacaatagcctgcaagctt-acacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 304 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712589
Alignment:
Q  304 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 18712589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742253
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24742253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760954
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 29760954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047476
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985552
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 228  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 31985632  T
Q  229 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31985631 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgt-gtttcccactctcacaatgtgaaccctaaaa 31985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246091
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315230
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329439
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623293
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396672
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaaga 5396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  137 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630680
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774305
Alignment:
Q  153 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaaga 226  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaaga 39774305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 216
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 216  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 35277 - 34885
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  35277 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaag 35179  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35178 ataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 35079  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35078 gagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacacta 34979  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34978 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg-ttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 34885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25328494 - 25328105
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaaga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  25328494 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaaccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgaga 25328395  T
Q  101 taagcggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328394 taaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 25328295  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  25328294 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacat 25328195  T
Q  300 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328194 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 7290142 - 7289749
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  7290142 taatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaag 7290043  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290042 ataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 7289943  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  7289942 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaata 7289843  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289842 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 7289749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39785040 - 39784684
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39785040 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaag 39784941  T
Q  100 ataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784940 ataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 39784841  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784840 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 39784743  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  39784742 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagagactctctca 39784684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 310
Target Start/End: Original strand, 6311167 - 6311477
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6311167 taatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaag 6311266  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311267 ataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 6311365  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacact 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||      
T  6311366 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaag 6311464  T
Q  298 atgaaccctaaaa 310  Q
    |||||||||||||    
T  6311465 atgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 36979262 - 36979558
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||    
T  36979262 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaa 36979358  T
Q  113 gaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36979359 ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtta 36979458  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36979459 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 36979557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 33038019 - 33037724
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaa--aacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaa 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||    
T  33038019 aaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa 33037922  T
Q  112 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 211  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037921 agaa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgtta 33037823  T
Q  212 caaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33037822 caaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 35745260 - 35745618
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  35745260 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 35745355  T
Q  98 agataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745356 agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 35745454  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  35745455 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctc 35745553  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  35745554 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 35745618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 30655525 - 30655827
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcggtaaa 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||    
T  30655525 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa 30655623  T
Q  112 ---agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
       ||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  30655624 ggaagaacaaaaaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagt 30655723  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 305  Q
    |||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  30655724 gttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccc 30655822  T
Q  306 taaaa 310  Q
    |||||    
T  30655823 taaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4760301 - 4759991
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4760301 taatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaa 4760204  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    |||||||    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760203 gataagc-aagaaaggaagaacaaaacatcaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaata 4760105  T
Q  199 tga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||    
T  4760104 tgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcaca 4760006  T
Q  296 ctatgaaccctaaaa 310  Q
     ||||||||||||||    
T  4760005 atatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18853382 - 18853083
Alignment:
Q  15 caaatggtctccaagccaacaacaacaaaaca-gcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaa 111  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   |||    
T  18853382 caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa 18853284  T
Q  112 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtt 210  Q
     ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18853283 ggaa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgtt 18853185  T
Q  211 acaaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 307  Q
    |||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18853184 acaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaacccta 18853086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18870772 - 18870477
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaag 113  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| |    
T  18870772 aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaagg 18870676  T
Q  114 aaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 212  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18870675 aa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttac 18870577  T
Q  213 aaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 309  Q
    |||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18870576 aaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaa 18870478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10684388 - 10684122
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684388 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 10684289  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  10684288 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaac 10684190  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  10684189 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 10684122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 55 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10689315 - 10689058
Alignment:
Q  55 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttca 151  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10689315 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttca 10689220  T
Q  152 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  10689219 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacac 10689121  T
Q  249 atgaacaaaccctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    | |||||| ||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689120 aagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1262073 - 1261871
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1262073 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 1261974  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1261973 gttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 1261875  T
Q  307 aaaa 310  Q
    ||||    
T  1261874 aaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31071349 - 31071146
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 206  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31071349 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31071250  T
Q  207 tgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 305  Q
    ||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31071249 tgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 31071151  T
Q  306 taaaa 310  Q
    |||||    
T  31071150 taaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Original strand, 26287879 - 26287985
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26287879 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26287978  T
Q  208 gttacaa 214  Q
    |||||||    
T  26287979 gttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Original strand, 26301136 - 26301242
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26301136 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26301235  T
Q  208 gttacaa 214  Q
    |||||||    
T  26301236 gttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 214
Target Start/End: Original strand, 26313130 - 26313236
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26313130 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26313229  T
Q  208 gttacaa 214  Q
    |||||||    
T  26313230 gttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 310 - 393
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311614
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgcta 6311614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870345
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 18870345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 298 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327979
Alignment:
Q  298 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25327979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655959
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 30655959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688924
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 10688924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852951
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 18852951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412437
Alignment:
Q  97 aagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  195 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037592
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacgaagacactcaaccctttggttccctcctttg 33037592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759857
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttggttacctcctttgc 4759857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799577
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  134 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702483
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979689
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgttttccc--aacctaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttcccttctttg 36979689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261741
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 1261741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  162 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaac 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | | |||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 2 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22173410 - 22173018
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  22173410 taatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataag 22173312  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173311 ataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 22173212  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||    
T  22173211 gagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaata 22173112  T
Q  299 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173111 tgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctactttgcta 22173018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 2 - 356
Target Start/End: Original strand, 18656301 - 18656658
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  ||||||    
T  18656301 taatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaag 18656398  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656399 ataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 18656498  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656499 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcac 18656597  T
Q  295 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18656598 actataaacccttaatcccaaggtgattacaatgtttttccc-aacctaagaaacactctca 18656658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28504081 - 28503780
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  28504081 ataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaa 28503984  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    ||          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28503983 ga----------aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaata 28503894  T
Q  199 tgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  28503893 tgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaa 28503794  T
Q  297 tatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||||||||||    
T  28503793 tatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Original strand, 7167129 - 7167425
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaag 113  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    ||||    
T  7167129 aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaag 7167226  T
Q  114 aaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 212  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7167227 gaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 7167326  T
Q  213 aaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167327 aaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2677304 - 2676945
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||    
T  2677304 ataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-ca 2677208  T
Q  98 agataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| |  | |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677207 agataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 2677109  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  2677108 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctc 2677010  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  2677009 acactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 2676945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2673148 - 2672789
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||    
T  2673148 ataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-ca 2673052  T
Q  98 agataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| |  | |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673051 agataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 2672953  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  2672952 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctc 2672854  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  2672853 acactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 2672789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 24967976 - 24968334
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  24967976 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 24968071  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  24968072 agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatcc 24968170  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  24968171 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccctttggtactttcccatcctc 24968269  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  24968270 acactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 24968334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2671800 - 2671502
Alignment:
Q  15 caaatggtctccaagccaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaa 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    ||    
T  2671800 caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaa 2671703  T
Q  112 agaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtt 210  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2671702 aggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt 2671603  T
Q  211 acaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 308  Q
    ||||| |||||||||  ||  |||  | ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2671602 acaaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaa 2671504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8739224 - 8738982
Alignment:
Q  66 aaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 164  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739224 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 8739127  T
Q  165 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  8739126 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 8739028  T
Q  262 agattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 307  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8739027 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 9091462 - 9091220
Alignment:
Q  66 aaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 164  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091462 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 9091365  T
Q  165 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccct 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  9091364 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 9091266  T
Q  262 agattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 307  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9091265 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 8512084 - 8512444
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  8512084 ataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--ca 8512179  T
Q  98 agataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 193  Q
    ||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512180 agataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8512279  T
Q  194 caatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactct 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||    
T  8512280 caatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacct 8512378  T
Q  292 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  8512379 cacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 8512444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Original strand, 8516964 - 8517324
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  8516964 ataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--ca 8517059  T
Q  98 agataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 193  Q
    ||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517060 agataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 8517159  T
Q  194 caatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactct 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||    
T  8517160 caatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacct 8517258  T
Q  292 cacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  8517259 cacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 8517324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 310
Target Start/End: Original strand, 8477263 - 8477545
Alignment:
Q  31 caacaacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acac 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||| |||| | | |||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||    
T  8477263 caacaacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca-aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacac 8477358  T
Q  128 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  8477359 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 8477458  T
Q  226 -actctagccttcaagctttacac-atgaacaaaccctagattctaccctttggtattt-tcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     ||  |||| | ||||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8477459 aacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 115 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372712
Alignment:
Q  115 aagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttaca 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttaca 40372809  T
Q  214 aaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    || ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40372808 aagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  175 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  273 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 32475446 - 32475684
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475446 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 32475545  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||      
T  32475546 tccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaac 32475643  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  32475644 ctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgtt 32475684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 95 - 330
Target Start/End: Original strand, 32480304 - 32480542
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480304 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 32480403  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||      
T  32480404 tccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaac 32480501  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 330  Q
    ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  32480502 ctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgtt 32480542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26928709 - 26928507
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  26928709 aaagaaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagt 26928611  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 305  Q
    |||||||| |||||||||  |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  26928610 gttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 26928512  T
Q  306 taaaa 310  Q
    |||||    
T  26928511 taaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143501
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 228  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 32143420  T
Q  229 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  32143421 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306128
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |       
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 1306048  T
Q  230 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||  | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1306049 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 1306128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167558
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 7167558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738846
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 8738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453138
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 228  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 27453057  T
Q  229 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  27453058 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 27453138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671370
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 2671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372580
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 40372580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 387
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477674
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcct 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552873
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091085
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaa-cccaagagatactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 9091085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711319
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 10207802 - 10207983
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||| ||    
T  10207802 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-ca 10207898  T
Q  98 agataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 180  Q
    |||||| |  | |||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207899 agataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501480
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccc-attggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcctttg 28501480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503647
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccc-attggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcctttg 28503647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3715992
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592772
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438311
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794704
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795878
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaaga 25795878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299085
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923896
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844748
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 198  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695154
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 24695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 199
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  153 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaac 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | | |||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttccc-aacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 179
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 179  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 41)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 393
Target Start/End: Original strand, 41398106 - 41398498
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagc---caacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataa 94  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  41398106 ataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataa 41398205  T
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    ||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398206 acaagataag------aaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 41398299  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398300 aatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcac 41398399  T
Q  295 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41398400 actatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 41398498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 32 - 393
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390843
Alignment:
Q  32 aacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacacc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||      ||| |||||||||||| |    
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacatc 41390578  T
Q  129 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390579 gagaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 41390678  T
Q  229 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390679 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg 41390778  T
Q  329 tttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41390779 tttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgcta 41390843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25445306 - 25444967
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| || |||||||    
T  25445306 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaa 25445209  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445208 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 25445109  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445108 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcaca 25445010  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445009 ctatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 25444967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 44024089 - 44023752
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  44024089 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 44023992  T
Q  99 gataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 197  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023991 gataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat 44023892  T
Q  198 atgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacac 296  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023891 atgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacac 44023794  T
Q  297 tatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44023793 tatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 44023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 39445368 - 39445706
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  39445368 ataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 39445465  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445466 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 39445565  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445566 tatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 39445663  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445664 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 39445706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1055228 - 1054890
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  1055228 ataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 1055131  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1055130 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaa 1055031  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055030 tatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 1054933  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1054932 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 1054890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 16 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24787580 - 24787280
Alignment:
Q  16 aaatggtctccaagc--caacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggta 109  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   |    
T  24787580 aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaaga 24787483  T
Q  110 aaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787482 aaaggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgt 24787383  T
Q  210 tacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 307  Q
    |||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  24787382 tacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaacccta 24787283  T
Q  308 aaa 310  Q
    |||    
T  24787282 aaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43988567 - 43988320
Alignment:
Q  114 aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 212  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  43988567 aaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttac 43988468  T
Q  213 aaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  |    
T  43988467 aaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccata 43988369  T
Q  309 aacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  43988368 atcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 43988320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202686
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccct-aactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaagaa 119  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  ||||||||| | ||||||  |||||||||||||    |||| |||||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacac--cacaagagaatacaaagc--aaacaagataagc-aagaaaggaagaa 24202879  T
Q  120 caaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  24202878 caaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagg 24202779  T
Q  218 gttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202778 gttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439774
Alignment:
Q  236 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcc 25439777  T
Q  336 caa 338  Q
    |||    
T  25439776 caa 25439774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358760
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 229  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19358840  T
Q  230 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19358839 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361349
Alignment:
Q  96 caagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  195 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19361367  T
Q  293 acactatgaaccctaaaa 310  Q
     || ||||||||||||||    
T  19361366 tcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379989
Alignment:
Q  96 caagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    ||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  195 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19380007  T
Q  293 acactatgaaccctaaaa 310  Q
     || ||||||||||||||    
T  19380006 tcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787148
Alignment:
Q  311 cccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaa-cccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124516
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104372
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281804
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 224
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 224  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202556
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 24202556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 21536702 - 21536570
Alignment:
Q  97 aagataagcggtaaaagaaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 193  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536702 aagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21536604  T
Q  194 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    || ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  21536603 cactataatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21536570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604624
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 32889439 - 32889523
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32889439 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 243 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19366292 - 19366225
Alignment:
Q  243 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  19366292 ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19366225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 41386617 - 41386646
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41386617 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 43988682 - 43988607
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac 75  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||    
T  43988682 ataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcacaaccacac 43988607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366095
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaa-cccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19366095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9856 - 9521
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaag 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||    
T  9856 ataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaac-aagcataaacaag 9758  T
Q  100 ataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 199  Q
    ||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9757 ataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 9659  T
Q  200 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9658 gagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactat 9560  T
Q  300 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9559 gaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 218 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3671
Alignment:
Q  218 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  318 tgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgcta 393  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3746 tgattacaatgttttt-cctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 3671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 103 - 28
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacac 75  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  103 ataatcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 338
Target Start/End: Original strand, 231 - 569
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||    
T  231 ataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaa 328  T
Q  99 gataagcggtaaaag-aaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 196  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  329 gataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaa 428  T
Q  197 tatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcaca 295  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  429 tatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcaca 526  T
Q  296 ctatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaa 338  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  527 ctatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttcccaa 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2467 - 2109
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  2467 ataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 2372  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2371 agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatcc 2273  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  2272 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctc 2174  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  2173 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 149172 - 148814
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  149172 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 149077  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  149076 agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatcc 148978  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  148977 aatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctc 148879  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  148878 acactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 148814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14433 - 14167
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14433 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 14334  T
Q  192 tccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccact 289  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  14333 tccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaac 14235  T
Q  290 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  14234 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 14167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19381 - 19023
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaaca 97  Q
    |||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||    
T  19381 ataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--ca 19286  T
Q  98 agataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 194  Q
    |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19285 agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatac 19187  T
Q  195 aatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctc 292  Q
    |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||    
T  19186 aatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggtaatttcccaacctc 19088  T
Q  293 acactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  19087 acactatgaacccataattccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctca 19023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17869
Alignment:
Q  21 gtctccaagccaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaagaaag 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |    
T  18157 gtctccaagc-aacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-g 18064  T
Q  118 aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 215  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18063 aacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 17964  T
Q  216 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 310  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17963 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 110 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24164 - 23962
Alignment:
Q  110 aaagaaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 207  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24164 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 24065  T
Q  208 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 306  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24064 gttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 23966  T
Q  307 aaaa 310  Q
    ||||    
T  23965 aaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17739
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 17739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23832
Alignment:
Q  310 acccaaggtgattacaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaaaaaagacactcaacccattggttccctcctttg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttccc-aacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 23832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 95 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 182088 - 181980
Alignment:
Q  95 acaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 191  Q
    ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182088 acaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 181989  T
Q  192 tccaatatg 200  Q
    |||||||||    
T  181988 tccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 176925 - 176835
Alignment:
Q  267 ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt-tttcccaaacccaagagacactctca 356  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  176925 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctca 176835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 300
Alignment:
Q  2 taatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaa--cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaaca 97  Q
    ||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||   |||||| |||||    
T  463 taatctatgagcaaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaaca 366  T
Q  98 agataagcggta-aaagaaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 164  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  365 agataagc--tagaaagaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 133 - 226
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  133 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36965 - 36833
Alignment:
Q  97 aagataagcggtaaaagaaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 193  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| |    
T  36965 aagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacc 36867  T
Q  194 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36866 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 217
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 217  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133281
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10826
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 214
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  132 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 214  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 226
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17360
Alignment:
Q  135 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 226  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 195
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  162 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Complemental strand, 34165 - 34136
Alignment:
Q  1 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34165 ataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  136 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 195  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University