View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2560_high_3 (Length: 386)

Name: NF2560_high_3
Description: NF2560
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2560_high_3
NF2560_high_3
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (178-374)||(26704351-26704547)
chr6 (173-374)||(30691845-30692046)
chr6 (178-374)||(2837544-2837740)
chr6 (178-374)||(6086611-6086807)
chr6 (172-374)||(26946888-26947090)
chr6 (183-370)||(3955782-3955969)
chr6 (178-374)||(3347535-3347731)
chr6 (183-374)||(17261085-17261276)
chr6 (173-374)||(9459557-9459758)
chr6 (178-374)||(21893454-21893650)
chr6 (175-374)||(20726787-20726982)
chr6 (178-374)||(11167239-11167435)
chr6 (178-374)||(18613537-18613733)
chr6 (183-374)||(34887304-34887495)
chr6 (178-371)||(16307023-16307216)
chr6 (189-374)||(1153603-1153788)
chr6 (182-374)||(30698941-30699133)
chr6 (183-374)||(28199520-28199712)
chr6 (178-365)||(35198283-35198469)
chr6 (178-342)||(52835-52999)
chr6 (249-374)||(33464399-33464524)
chr6 (272-374)||(53001-53103)
chr6 (183-257)||(33463705-33463779)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (171-374)||(14422695-14422898)
chr8 (178-374)||(18594536-18594732)
chr8 (178-374)||(39206585-39206781)
chr8 (178-371)||(10836770-10836963)
chr8 (177-374)||(29938059-29938256)
chr8 (178-374)||(22260642-22260838)
chr8 (183-374)||(2042536-2042727)
chr8 (183-374)||(13110408-13110599)
chr8 (177-371)||(35118046-35118240)
chr8 (178-374)||(7774763-7774959)
chr8 (178-374)||(24113178-24113374)
chr8 (183-374)||(144398-144589)
chr8 (173-374)||(4035841-4036042)
chr8 (178-374)||(33278399-33278595)
chr8 (175-374)||(38167167-38167366)
chr8 (184-374)||(34679469-34679659)
chr8 (178-374)||(6144285-6144481)
chr8 (178-374)||(39218776-39218972)
chr8 (170-374)||(44804956-44805160)
chr8 (183-374)||(7791415-7791606)
chr8 (183-374)||(34842377-34842568)
chr8 (187-374)||(34998908-34999095)
chr8 (183-371)||(41575517-41575705)
chr8 (178-371)||(7811994-7812187)
chr8 (185-371)||(36491163-36491349)
chr8 (177-374)||(5320562-5320759)
chr8 (178-335)||(40117903-40118060)
chr8 (183-374)||(28639282-28639475)
chr8 (178-318)||(26783801-26783941)
chr8 (178-342)||(33287069-33287233)
chr8 (174-370)||(8021714-8021902)
chr8 (182-371)||(42571597-42571783)
chr8 (183-374)||(66191-66383)
chr8 (258-374)||(9807339-9807455)
chr8 (178-330)||(2322068-2322220)
chr8 (184-307)||(5005171-5005294)
chr8 (183-330)||(39220260-39220407)
chr8 (183-266)||(9806877-9806960)
[»] chr3 (40 HSPs)
chr3 (171-370)||(25999375-25999574)
chr3 (178-374)||(37698141-37698337)
chr3 (178-371)||(42307906-42308099)
chr3 (171-371)||(15520143-15520343)
chr3 (183-371)||(38856092-38856280)
chr3 (175-374)||(25494283-25494482)
chr3 (184-374)||(21581042-21581232)
chr3 (178-374)||(22174988-22175184)
chr3 (173-374)||(8042596-8042797)
chr3 (178-374)||(29445482-29445678)
chr3 (178-374)||(50528923-50529119)
chr3 (183-374)||(32244119-32244310)
chr3 (178-374)||(20842346-20842542)
chr3 (178-374)||(46452160-46452356)
chr3 (173-371)||(12117659-12117857)
chr3 (178-374)||(15520630-15520826)
chr3 (178-374)||(54870172-54870368)
chr3 (183-374)||(20699148-20699339)
chr3 (184-374)||(35226447-35226637)
chr3 (178-374)||(38933940-38934135)
chr3 (178-374)||(54534326-54534520)
chr3 (184-371)||(44609334-44609521)
chr3 (188-374)||(42104969-42105155)
chr3 (178-374)||(24835697-24835893)
chr3 (183-374)||(32359258-32359449)
chr3 (185-374)||(2895186-2895379)
chr3 (184-368)||(26122814-26122998)
chr3 (178-376)||(34700335-34700533)
chr3 (184-374)||(53028225-53028407)
chr3 (229-373)||(16354391-16354535)
chr3 (205-374)||(44688782-44688950)
chr3 (183-335)||(35643216-35643368)
chr3 (184-374)||(48925001-48925189)
chr3 (184-318)||(50529827-50529961)
chr3 (211-374)||(12915934-12916096)
chr3 (173-312)||(49128038-49128177)
chr3 (298-374)||(24366143-24366219)
chr3 (305-382)||(13696914-13696991)
chr3 (338-371)||(50528883-50528916)
chr3 (185-226)||(24366093-24366134)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (169-370)||(9008073-9008274)
chr5 (178-374)||(27679181-27679377)
chr5 (183-374)||(24105683-24105874)
chr5 (178-374)||(1579036-1579232)
chr5 (178-374)||(1605583-1605779)
chr5 (178-374)||(33491208-33491404)
chr5 (181-374)||(16737459-16737652)
chr5 (183-374)||(16069358-16069549)
chr5 (184-374)||(3386498-3386688)
chr5 (178-371)||(27420858-27421051)
chr5 (178-374)||(20992158-20992354)
chr5 (178-382)||(4120937-4121141)
chr5 (183-374)||(31883149-31883340)
chr5 (178-374)||(19358526-19358722)
chr5 (183-374)||(3921586-3921777)
chr5 (175-370)||(5202969-5203164)
chr5 (185-374)||(1165613-1165802)
chr5 (178-374)||(8374351-8374546)
chr5 (178-371)||(33991140-33991333)
chr5 (173-371)||(35782659-35782857)
chr5 (184-370)||(38598466-38598652)
chr5 (177-374)||(31410475-31410672)
chr5 (215-371)||(26602957-26603113)
chr5 (223-374)||(27025001-27025152)
chr5 (184-313)||(20992354-20992487)
chr5 (186-319)||(33284642-33284775)
chr5 (328-374)||(35420436-35420482)
chr5 (229-314)||(31638196-31638281)
chr5 (244-297)||(41818552-41818605)
chr5 (178-330)||(25634582-25634732)
chr5 (229-312)||(19516044-19516127)
chr5 (177-209)||(26603109-26603141)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (178-382)||(1168500-1168704)
chr1 (184-374)||(29078519-29078709)
chr1 (178-374)||(25897371-25897567)
chr1 (178-374)||(39260358-39260554)
chr1 (172-374)||(20089462-20089664)
chr1 (178-374)||(26580282-26580478)
chr1 (178-374)||(52753159-52753355)
chr1 (178-374)||(33510481-33510677)
chr1 (183-382)||(8079713-8079912)
chr1 (183-374)||(26663260-26663451)
chr1 (178-374)||(29288146-29288340)
chr1 (178-374)||(16052093-16052289)
chr1 (184-372)||(38829072-38829260)
chr1 (170-374)||(970536-970742)
chr1 (183-374)||(43905656-43905847)
chr1 (178-374)||(1940759-1940955)
chr1 (178-370)||(41928511-41928703)
chr1 (178-374)||(52696788-52696984)
chr1 (183-374)||(19715173-19715364)
chr1 (184-374)||(12682823-12683013)
chr1 (168-374)||(42370807-42371013)
chr1 (178-374)||(1170456-1170652)
chr1 (184-370)||(40092494-40092680)
chr1 (178-374)||(32671576-32671772)
chr1 (183-374)||(5215387-5215578)
chr1 (183-374)||(8120871-8121062)
chr1 (183-374)||(46760968-46761159)
chr1 (178-374)||(2347653-2347850)
chr1 (178-374)||(17591688-17591881)
chr1 (197-374)||(17587517-17587694)
chr1 (183-368)||(49146174-49146359)
chr1 (177-374)||(51359229-51359425)
chr1 (170-370)||(15203101-15203301)
chr1 (183-374)||(2473724-2473915)
chr1 (184-371)||(13996738-13996925)
chr1 (183-374)||(46409437-46409630)
chr1 (181-374)||(15717785-15717977)
chr1 (183-374)||(7145209-7145400)
chr1 (175-371)||(23498454-23498650)
chr1 (183-374)||(6765461-6765652)
chr1 (184-347)||(29695678-29695842)
chr1 (178-374)||(15554164-15554352)
chr1 (215-374)||(40149497-40149656)
chr1 (184-310)||(52086270-52086396)
chr1 (183-374)||(38171834-38172012)
chr1 (194-329)||(23322897-23323032)
chr1 (107-160)||(20279752-20279805)
chr1 (178-330)||(5217840-5217991)
chr1 (98-171)||(33308905-33308978)
chr1 (170-225)||(5675094-5675149)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (173-374)||(33359092-33359293)
chr7 (178-374)||(30181026-30181222)
chr7 (185-374)||(12101180-12101369)
chr7 (185-374)||(42964998-42965187)
chr7 (183-371)||(7164187-7164375)
chr7 (178-374)||(24792334-24792530)
chr7 (173-371)||(22649699-22649897)
chr7 (173-374)||(42204147-42204349)
chr7 (178-374)||(43067975-43068171)
chr7 (183-374)||(3511326-3511517)
chr7 (183-374)||(4477323-4477514)
chr7 (183-374)||(5280863-5281054)
chr7 (183-374)||(20346491-20346682)
chr7 (172-374)||(25748479-25748681)
chr7 (183-374)||(1803029-1803220)
chr7 (184-374)||(933289-933479)
chr7 (173-374)||(15655905-15656106)
chr7 (177-374)||(43156710-43156907)
chr7 (178-370)||(32041540-32041732)
chr7 (178-374)||(33846531-33846722)
chr7 (181-374)||(38866545-38866738)
chr7 (173-369)||(4347266-4347462)
chr7 (178-374)||(6394749-6394945)
chr7 (172-374)||(12097592-12097794)
chr7 (178-374)||(36890832-36891027)
chr7 (183-374)||(42673468-42673655)
chr7 (183-374)||(9452593-9452784)
chr7 (183-367)||(8630669-8630853)
chr7 (183-371)||(46134309-46134497)
chr7 (183-374)||(46891341-46891533)
chr7 (183-374)||(17753603-17753794)
chr7 (236-374)||(48865689-48865827)
chr7 (172-374)||(16894509-16894701)
chr7 (185-374)||(43021582-43021767)
chr7 (178-325)||(19828268-19828415)
chr7 (183-330)||(37005857-37006004)
chr7 (173-330)||(43405013-43405170)
chr7 (178-275)||(37704978-37705075)
chr7 (178-330)||(15655458-15655610)
chr7 (176-323)||(36849590-36849737)
chr7 (185-269)||(27691433-27691517)
chr7 (175-330)||(30075277-30075429)
chr7 (247-314)||(20163886-20163953)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (178-374)||(36702-36898)
[»] chr4 (64 HSPs)
chr4 (178-374)||(54189542-54189738)
chr4 (178-374)||(15241028-15241224)
chr4 (176-374)||(19913630-19913828)
chr4 (167-372)||(38055143-38055348)
chr4 (178-370)||(23776463-23776655)
chr4 (178-374)||(50055101-50055297)
chr4 (183-371)||(1756767-1756955)
chr4 (178-374)||(14987789-14987985)
chr4 (178-374)||(53717464-53717660)
chr4 (183-374)||(16700783-16700974)
chr4 (183-374)||(20877049-20877240)
chr4 (183-374)||(52139205-52139396)
chr4 (183-374)||(54412630-54412821)
chr4 (184-374)||(28032712-28032902)
chr4 (183-374)||(19164973-19165163)
chr4 (178-374)||(27488648-27488844)
chr4 (178-374)||(50353798-50353994)
chr4 (183-374)||(1617086-1617277)
chr4 (183-382)||(11639570-11639769)
chr4 (183-374)||(43289960-43290151)
chr4 (172-374)||(31969672-31969874)
chr4 (189-374)||(37968757-37968942)
chr4 (178-374)||(2481408-2481604)
chr4 (178-374)||(6611360-6611556)
chr4 (178-374)||(44784917-44785113)
chr4 (178-374)||(45424534-45424730)
chr4 (191-374)||(8591092-8591275)
chr4 (183-374)||(40428720-40428911)
chr4 (184-382)||(23704201-23704399)
chr4 (184-374)||(48909849-48910039)
chr4 (173-374)||(8932178-8932379)
chr4 (183-374)||(30423565-30423755)
chr4 (183-374)||(35490773-35490964)
chr4 (178-374)||(6688627-6688817)
chr4 (178-374)||(15669180-15669376)
chr4 (178-374)||(37464718-37464914)
chr4 (183-374)||(47632036-47632228)
chr4 (183-374)||(53875659-53875850)
chr4 (178-374)||(53353052-53353256)
chr4 (177-374)||(33703837-33704034)
chr4 (185-374)||(27583632-27583821)
chr4 (178-374)||(27536104-27536296)
chr4 (185-371)||(40680041-40680227)
chr4 (184-374)||(44379187-44379377)
chr4 (183-374)||(30171582-30171773)
chr4 (183-374)||(44375847-44376038)
chr4 (184-352)||(28360433-28360602)
chr4 (178-382)||(55344817-55345021)
chr4 (190-370)||(38071327-38071504)
chr4 (178-330)||(50053440-50053592)
chr4 (178-374)||(16703822-16704014)
chr4 (258-374)||(23269046-23269162)
chr4 (183-266)||(23265865-23265948)
chr4 (247-329)||(51780763-51780845)
chr4 (178-330)||(44548185-44548338)
chr4 (299-374)||(53408137-53408213)
chr4 (218-330)||(17493370-17493482)
chr4 (323-374)||(23261886-23261937)
chr4 (283-374)||(9595902-9595982)
chr4 (337-374)||(50055301-50055338)
chr4 (268-325)||(55344724-55344781)
chr4 (320-374)||(48748197-48748251)
chr4 (92-153)||(30477486-30477546)
chr4 (178-226)||(9595983-9596030)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (178-374)||(22963-23159)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (175-371)||(3873259-3873455)
chr2 (175-374)||(31517227-31517426)
chr2 (184-374)||(33906059-33906249)
chr2 (178-371)||(26323201-26323394)
chr2 (178-374)||(18806896-18807092)
chr2 (178-371)||(4232157-4232350)
chr2 (178-366)||(1108277-1108464)
chr2 (178-374)||(2178781-2178977)
chr2 (183-374)||(28329851-28330040)
chr2 (178-374)||(39635449-39635645)
chr2 (183-374)||(4016041-4016232)
chr2 (185-374)||(16066306-16066495)
chr2 (183-374)||(42937721-42937913)
chr2 (189-374)||(5733407-5733592)
chr2 (178-374)||(6174840-6175036)
chr2 (183-372)||(16588790-16588979)
chr2 (183-374)||(1482915-1483105)
chr2 (195-374)||(19383947-19384126)
chr2 (173-371)||(19901153-19901350)
chr2 (183-374)||(850999-851190)
chr2 (183-330)||(30420223-30420370)
chr2 (18-171)||(32688711-32688864)
chr2 (178-374)||(30270691-30270887)
chr2 (195-371)||(429830-430006)
chr2 (185-374)||(44947561-44947743)
chr2 (178-330)||(42446625-42446777)
chr2 (229-323)||(22101210-22101304)
chr2 (239-330)||(3585348-3585439)
chr2 (65-171)||(15691952-15692053)
chr2 (54-148)||(32008102-32008196)
chr2 (81-153)||(10068353-10068425)
chr2 (184-314)||(12517256-12517385)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (178-374)||(18-214)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (183-382)||(3712-3911)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (183-374)||(307-498)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (183-374)||(145257-145448)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (178-374)||(10235-10431)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (183-374)||(18-210)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26704547 - 26704351
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704547 ggccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 26704448  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26704447 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26704351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 30691845 - 30692046
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691845 attagggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 30691944  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30691945 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 30692044  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  30692045 tt 30692046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 2837544 - 2837740
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837544 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 2837643  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2837644 tagtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2837740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6086807 - 6086611
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086807 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6086708  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6086707 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6086611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26947090 - 26946888
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26947090 gattagggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 26946991  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26946990 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26946891  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  26946890 ctt 26946888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3955969 - 3955782
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955969 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 3955870  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3955869 tcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 3955782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3347731 - 3347535
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3347731 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatca 3347632  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3347631 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3347535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17261276 - 17261085
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17261276 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatattt 17261177  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17261176 tcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcctt 17261085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 9459557 - 9459758
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9459557 attagggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagct 9459656  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9459657 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtatcctcc 9459756  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  9459757 tt 9459758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 21893454 - 21893650
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21893454 ggccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatca 21893553  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21893554 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 21893650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Original strand, 20726787 - 20726982
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||    
T  20726787 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataactta 20726882  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726883 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20726982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 11167239 - 11167435
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167239 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 11167338  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11167339 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 11167435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 18613537 - 18613733
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18613537 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 18613636  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613637 tagttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18613733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34887495 - 34887304
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34887495 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 34887396  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  34887395 tcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgtgacctcctt 34887304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16307216 - 16307023
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16307216 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatca 16307117  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16307116 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 16307023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153788
Alignment:
Q  189 gattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 288  Q
    |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  289 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacctcctt 1153788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 182 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30699133 - 30698941
Alignment:
Q  182 tcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30699133 tcgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 30699034  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30699033 tttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 30698941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28199712 - 28199520
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatc---tactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199712 cgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 28199614  T
Q  280 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28199613 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 28199520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 365
Target Start/End: Original strand, 35198283 - 35198469
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35198283 ggccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataag-ctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35198381  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35198382 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgt 35198469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Original strand, 52835 - 52999
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52835 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 52934  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52935 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 374
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464524
Alignment:
Q  249 ttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaagg 348  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  349 agcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacctcctt 33464524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53103
Alignment:
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 53100  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  53101 ctt 53103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 257
Target Start/End: Original strand, 33463705 - 33463779
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33463705 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 171 - 374
Target Start/End: Original strand, 14422695 - 14422898
Alignment:
Q  171 tgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422695 tgattatggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 14422794  T
Q  271 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14422795 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 14422894  T
Q  371 cctt 374  Q
    ||||    
T  14422895 cctt 14422898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 18594536 - 18594732
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594536 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 18594635  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594636 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18594732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 39206585 - 39206781
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206585 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 39206684  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206685 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39206781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10836963 - 10836770
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10836963 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 10836864  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10836863 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 10836770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 29938059 - 29938256
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29938059 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatc 29938158  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938159 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29938256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22260838 - 22260642
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22260838 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcc 22260739  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22260738 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22260642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042536
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2042536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 13110408 - 13110599
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13110408 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 13110507  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13110508 taataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcctt 13110599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 177 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35118240 - 35118046
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118240 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 35118141  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35118140 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 35118046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 7774763 - 7774959
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7774763 ggcctcgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 7774862  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7774863 tagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7774959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24113374 - 24113178
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24113374 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatca 24113275  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24113274 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24113178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 144398 - 144589
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  144398 cgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagtt 144497  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144498 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 144589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 4035841 - 4036042
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4035841 attaaggccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagct 4035940  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035941 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 4036040  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  4036041 tt 4036042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 33278399 - 33278595
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33278399 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33278498  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33278499 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33278595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38167366 - 38167167
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  38167366 tatggccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagttta 38167267  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38167266 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 38167167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679469
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 34679469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6144481 - 6144285
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144481 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6144382  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6144381 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6144285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 39218776 - 39218972
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39218776 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatca 39218875  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39218876 tagcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgtgacctcctt 39218972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 170 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44805160 - 44804956
Alignment:
Q  170 ttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 269  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44805160 ttgattatggcctcatttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaata 44805061  T
Q  270 gcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805060 gcttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 44804961  T
Q  370 tcctt 374  Q
    |||||    
T  44804960 tcctt 44804956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 7791415 - 7791606
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7791415 cgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7791514  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791515 tcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7791606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34842568 - 34842377
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34842568 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 34842469  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34842468 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgtgacctcctt 34842377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 187 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34999095 - 34998908
Alignment:
Q  187 tggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34999095 tggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttagtttcat 34998996  T
Q  287 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34998995 aagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatttaatctcctt 34998908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 41575517 - 41575705
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41575517 cgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagtt 41575616  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41575617 tcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 41575705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Original strand, 7811994 - 7812187
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7811994 ggccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 7812093  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7812094 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7812187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 371
Target Start/End: Original strand, 36491163 - 36491349
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36491163 tttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtttc 36491262  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36491263 ataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 36491349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 5320562 - 5320759
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  5320562 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatc 5320661  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5320662 atagtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 5320759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 178 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40118060 - 40117903
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40118060 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 40117961  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40117960 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 28639282 - 28639475
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctata----agtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 278  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  28639282 cgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatcat 28639381  T
Q  279 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  28639382 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacctcctt 28639475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26783941 - 26783801
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26783941 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 26783842  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783841 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 178 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33287233 - 33287069
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33287233 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33287134  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33287133 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagctta 33287069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 8021714 - 8021902
Alignment:
Q  174 ttatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 273  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8021714 ttatggtcccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagttt 8021813  T
Q  274 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8021814 atcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacct 8021902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 182 - 371
Target Start/End: Original strand, 42571597 - 42571783
Alignment:
Q  182 tcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42571597 tcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagt 42571695  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42571696 ttcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacctc 42571783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 66383 - 66191
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  66383 cgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagtt 66284  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctct-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  66283 tcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcctt 66191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807455
Alignment:
Q  258 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 357  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  358 atttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||| |||||||||    
T  9807439 atttatgaaacctcctt 9807455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2322220 - 2322068
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||  |||  |||||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  2322220 ggccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatca 2322121  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2322120 caatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaattttaagctta 2322068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 184 - 307
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005294
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  284 cataagctgcttatgccatatttt 307  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Original strand, 39220260 - 39220407
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  ||  |||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   | ||    
T  39220260 cgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaatt 39220359  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  39220360 tcataagctgctcatactatattttaataagctcaaattttgagctta 39220407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Original strand, 9806877 - 9806960
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806877 cgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 40)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 171 - 370
Target Start/End: Original strand, 25999375 - 25999574
Alignment:
Q  171 tgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999375 tgattatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 25999474  T
Q  271 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999475 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 25999574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37698337 - 37698141
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698337 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 37698238  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698237 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 37698141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42308099 - 42307906
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42308099 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 42308000  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42307999 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 42307906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 171 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15520343 - 15520143
Alignment:
Q  171 tgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag 270  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15520343 tgattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataa 15520244  T
Q  271 cttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15520243 cttatcatcgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 15520144  T
Q  371 c 371  Q
    |    
T  15520143 c 15520143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 38856092 - 38856280
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856092 cgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 38856191  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856192 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 38856280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25494482 - 25494283
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25494482 tatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 25494383  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25494382 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 25494283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581232
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcctt 21581232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22175184 - 22174988
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22175184 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 22175085  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175084 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22174988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 8042596 - 8042797
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  8042596 attaaggccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtt 8042695  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8042696 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 8042795  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  8042796 tt 8042797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 29445482 - 29445678
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445482 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 29445581  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29445582 tagtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29445678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 50528923 - 50529119
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50528923 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 50529022  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50529023 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 50529119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 32244119 - 32244310
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32244119 cgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 32244218  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32244219 tcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 32244310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20842542 - 20842346
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20842542 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatca 20842443  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20842442 tagtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 20842346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46452356 - 46452160
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46452356 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 46452257  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46452256 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 46452160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 173 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12117857 - 12117659
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12117857 attaaggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtt 12117758  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117757 tatcatagtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 12117659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 15520630 - 15520826
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15520630 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 15520729  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15520730 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacctcctt 15520826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54870368 - 54870172
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870368 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54870269  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54870268 tcgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 54870172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 20699148 - 20699339
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20699148 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcatagtt 20699247  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20699248 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacctcctt 20699339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 35226447 - 35226637
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  35226447 gtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcatagttt 35226546  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226547 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 35226637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 38933940 - 38934135
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38933940 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 38934038  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38934039 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38934135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54534520 - 54534326
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54534520 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54534421  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54534420 tggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 54534326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609334
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 44609334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 188 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42105155 - 42104969
Alignment:
Q  188 ggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcata 287  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42105155 ggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcata 42105056  T
Q  288 agctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42105055 agctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42104969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24835893 - 24835697
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||  | | |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24835893 ggccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatta 24835794  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24835793 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaactcctt 24835697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 32359258 - 32359449
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32359258 cgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 32359357  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32359358 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 32359449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Original strand, 2895186 - 2895379
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2895186 tttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcatagtttc 2895285  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagct----tatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  2895286 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatatatgaatttatataacctcctt 2895379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 184 - 368
Target Start/End: Original strand, 26122814 - 26122998
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26122814 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 26122913  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  26122914 cataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaac 26122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 178 - 376
Target Start/End: Original strand, 34700335 - 34700533
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34700335 ggccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatca 34700434  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttg 376  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34700435 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacctcctttg 34700533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 53028225 - 53028407
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53028225 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcatatttt 53028316  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53028317 cataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53028407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 229 - 373
Target Start/End: Original strand, 16354391 - 16354535
Alignment:
Q  229 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagct 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16354391 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagct 16354490  T
Q  329 taccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 373  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16354491 tatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcct 16354535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 205 - 374
Target Start/End: Original strand, 44688782 - 44688950
Alignment:
Q  205 gcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatat 304  Q
    ||||| ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44688782 gcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catat 44688880  T
Q  305 tttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  44688881 tttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacctcctt 44688950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 335
Target Start/End: Original strand, 35643216 - 35643368
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643216 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 35643315  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643316 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctc 35643368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925001
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||||||||| | |||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 48925001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 184 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 211 - 374
Target Start/End: Original strand, 12915934 - 12916096
Alignment:
Q  211 gtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaat 310  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  12915934 gtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatatttaaat 12916032  T
Q  311 aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12916033 aagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaaccccctt 12916096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 312
Target Start/End: Original strand, 49128038 - 49128177
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  49128038 attaaggccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataact 49128137  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 312  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128138 tatcgtaatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366219
Alignment:
Q  298 gccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24366219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 305 - 382
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696991
Alignment:
Q  305 tttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacctcctttgattctc 13696991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 50528916 - 50528883
Alignment:
Q  338 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528916 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 50528883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 226
Target Start/End: Original strand, 24366093 - 24366134
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactc 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24366093 tttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactc 24366134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 169 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9008274 - 9008073
Alignment:
Q  169 cttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 268  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008274 cttgattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaat 9008175  T
Q  269 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9008174 agcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 9008075  T
Q  369 ct 370  Q
    ||    
T  9008074 ct 9008073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27679377 - 27679181
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27679377 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 27679278  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27679277 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 27679181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24105874 - 24105683
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105874 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 24105775  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24105774 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24105683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 1579036 - 1579232
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1579036 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1579135  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1579136 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1579232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1605779 - 1605583
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1605779 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1605680  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1605679 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1605583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33491404 - 33491208
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491404 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33491305  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33491304 tagtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33491208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 181 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16737652 - 16737459
Alignment:
Q  181 ctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 280  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737652 ctcgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 16737553  T
Q  281 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16737552 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16737459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 16069358 - 16069549
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069358 cgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16069457  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16069458 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16069549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386498
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacctcctt 3386498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Original strand, 27420858 - 27421051
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  27420858 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatca 27420957  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27420958 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 27421051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20992354 - 20992158
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20992354 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatca 20992255  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20992254 tagtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 20992158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Original strand, 4120937 - 4121141
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  4120937 ggccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatca 4121036  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4121037 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 4121136  T
Q  378 ttctc 382  Q
    |||||    
T  4121137 ttctc 4121141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 31883149 - 31883340
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31883149 cgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 31883248  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31883249 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 31883340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 19358526 - 19358722
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19358526 ggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 19358625  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19358626 tagtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 19358722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 3921586 - 3921777
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921586 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 3921685  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3921686 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3921777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 370
Target Start/End: Original strand, 5202969 - 5203164
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5202969 tatggccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttta 5203068  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5203069 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtcacct 5203164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165613
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1165613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8374546 - 8374351
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8374546 ggccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 8374447  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8374446 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacctcctt 8374351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Original strand, 33991140 - 33991333
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991140 ggccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33991239  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33991240 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 33991333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 173 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35782857 - 35782659
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782857 attaaggccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 35782758  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctg-gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35782757 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctt-acaaggagcttatgaatttatgtaacctc 35782659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 184 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38598652 - 38598466
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38598652 gtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagttt 38598553  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38598552 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38598466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 31410475 - 31410672
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31410475 tggccgcgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatc 31410574  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  31410575 atagttttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtgacctcctt 31410672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 215 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602957
Alignment:
Q  215 gcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 314  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  315 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
     ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26602957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 223 - 374
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025152
Alignment:
Q  223 actcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 322  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  323 tcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacctcctt 27025152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 184 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20992487 - 20992354
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgt----gggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20992487 gtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcata 20992388  T
Q  280 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992387 gtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 186 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  186 ttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttca 285  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  286 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 319  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420436
Alignment:
Q  328 ttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 35420436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 314
Target Start/End: Original strand, 31638196 - 31638281
Alignment:
Q  229 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 314  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31638196 ataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatattttaataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  244 ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttat 297  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Original strand, 25634582 - 25634732
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | | | |||||||||   |||||   ||| |||   ||||||||||||||   |||||||||||| |    
T  25634582 ggccccgtttagattggcttattttaagcttatgagagtttatctactaacataagctctttcaaatacgtttgggtaaataat--aaaatagcttataa 25634679  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
     | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||    
T  25634680 caatttcataagccgcttataccatattttaataaaccataattttgagctta 25634732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19516127 - 19516044
Alignment:
Q  229 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataa 312  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||  ||||||||||||||||   | |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  19516127 ataagtctttttaacggcgtttggacaaagtaataaaaatagcttatatcaatttcataaactgcttatgtaatattttaataa 19516044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 177 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26603141 - 26603109
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagctta 209  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26603141 tggccccgtttggattggcttattttgagctta 26603109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Original strand, 1168500 - 1168704
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168500 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 1168599  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  1168600 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttga 1168699  T
Q  378 ttctc 382  Q
    |||||    
T  1168700 ttctc 1168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078709
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 29078709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 25897371 - 25897567
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897371 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 25897470  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25897471 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 25897567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39260554 - 39260358
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260554 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 39260455  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39260454 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 39260358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Original strand, 20089462 - 20089664
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20089462 gattaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagc 20089561  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20089562 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 20089661  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  20089662 ctt 20089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26580478 - 26580282
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26580478 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatca 26580379  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26580378 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26580282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52753355 - 52753159
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753355 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 52753256  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52753255 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 52753159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 33510481 - 33510677
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33510481 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 33510580  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33510581 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33510677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 8079912 - 8079713
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8079912 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 8079813  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 382  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8079812 tcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctttgattctc 8079713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 26663260 - 26663451
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663260 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 26663359  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663360 tcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 26663451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 29288146 - 29288340
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29288146 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 29288245  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29288246 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaa--tatgtaacctcctt 29288340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 16052093 - 16052289
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052093 ggccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 16052192  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16052193 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16052289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 184 - 372
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829260
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 38829260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 170 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 970742 - 970536
Alignment:
Q  170 ttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 269  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970742 ttgattgtggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 970643  T
Q  270 gcttatcata--gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 367  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  970642 gattatcatatagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 970543  T
Q  368 cctcctt 374  Q
     ||||||    
T  970542 tctcctt 970536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 43905656 - 43905847
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43905656 cgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 43905755  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43905756 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacctcctt 43905847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1940955 - 1940759
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940955 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 1940856  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1940855 tagtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1940759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 41928703 - 41928511
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41928703 ggccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 41928604  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928603 tagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 41928511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 52696788 - 52696984
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  52696788 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 52696887  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52696888 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 52696984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19715364 - 19715173
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19715364 cgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattgtt 19715265  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19715264 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19715173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 12682823 - 12683013
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12682823 gtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 12682922  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12682923 cataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 12683013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 168 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42371013 - 42370807
Alignment:
Q  168 tcttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaa 267  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42371013 tctttattttggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaa 42370914  T
Q  268 tagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 367  Q
     | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42370913 aaacttatcatagtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 42370814  T
Q  368 cctcctt 374  Q
    |||||||    
T  42370813 cctcctt 42370807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1170652 - 1170456
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1170652 ggccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 1170553  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1170552 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 1170456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 370
Target Start/End: Original strand, 40092494 - 40092680
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40092494 gtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcatagttt 40092593  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40092594 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 40092680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 32671576 - 32671772
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32671576 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 32671675  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32671676 tagtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccccctt 32671772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 5215387 - 5215578
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5215387 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcatagtt 5215486  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215487 tcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 5215578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 8120871 - 8121062
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8120871 cgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 8120970  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8120971 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 8121062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 46760968 - 46761159
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46760968 cgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 46761067  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46761068 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacttcctt 46761159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 2347653 - 2347850
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2347653 ggccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 2347752  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2347753 tagtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 2347850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 17591688 - 17591881
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17591688 ggccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 17591784  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591785 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 17591881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587517
Alignment:
Q  197 tattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgctta 296  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  297 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 17587517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Original strand, 49146174 - 49146359
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146174 cgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 49146273  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49146274 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 49146359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51359425 - 51359229
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51359425 tggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatc 51359327  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51359326 atagtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctcctt 51359229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 170 - 370
Target Start/End: Original strand, 15203101 - 15203301
Alignment:
Q  170 ttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 269  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15203101 ttgactatggccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaata 15203200  T
Q  270 gcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203201 gcttatcatagtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 15203300  T
Q  370 t 370  Q
    |    
T  15203301 t 15203301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 2473724 - 2473915
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2473724 cgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 2473823  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2473824 tcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgttacctcctt 2473915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 184 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13996925 - 13996738
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996925 gtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataatggttt 13996826  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13996825 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacctc 13996738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 46409437 - 46409630
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46409437 cgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 46409536  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggc--ttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46409537 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 46409630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 374
Target Start/End: Original strand, 15717785 - 15717977
Alignment:
Q  181 ctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 280  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||| |||||| |   ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15717785 ctcgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatag 15717883  T
Q  281 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15717884 tttcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacctcctt 15717977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 7145209 - 7145400
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttatttt-gagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7145209 cgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcatagt 7145307  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7145308 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 7145400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 175 - 371
Target Start/End: Original strand, 23498454 - 23498650
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  23498454 tatggccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttca 23498553  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23498554 tcatagtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 23498650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 6765461 - 6765652
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6765461 cgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatattt 6765560  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6765561 tcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaatctcctt 6765652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 184 - 347
Target Start/End: Original strand, 29695678 - 29695842
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29695678 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatcatagtt 29695777  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaag 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29695778 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaag 29695842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15554352 - 15554164
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        
T  15554352 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcat---- 15554257  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
        ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15554256 ----ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 15554164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 215 - 374
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149656
Alignment:
Q  215 gcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 314  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  315 ctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 40149656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Original strand, 52086270 - 52086396
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||    
T  52086270 gtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcataattt 52086369  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaat 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086370 cataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 38171834 - 38172012
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||| |||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  38171834 cgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagtt 38171933  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||              |||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38171934 tcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 38172012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23323032 - 23322897
Alignment:
Q  194 gcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgc 293  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||   ||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  23323032 gcttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgc 23322933  T
Q  294 ttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 329  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||    
T  23322932 ttatgtcatactttaataagcgcaaattttaagctt 23322897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20279805 - 20279752
Alignment:
Q  107 tattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgattatgagtag 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20279805 tattcatgtgtaatttcttaatcttgttgtcatgtctcttttgattatgagtag 20279752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 5217991 - 5217840
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||   |||||   ||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  5217991 ggcctcgtttggattggcttattttaagcttatgagagcttatctactaacataagctctttcaaatacatttgggtaaataa-taaaaatagcttatac 5217893  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
     | |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||| ||||||    
T  5217892 caatttcataagccgcttataccatatttttataagccataattttgagctta 5217840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33308978 - 33308905
Alignment:
Q  98 ttcatcatctattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgattatgagtagttagatttctt 171  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  33308978 ttcatcatctattcatgtataatttcttaatcttgttgccatgcgcattttggttatgaatagctagatttctt 33308905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 225
Target Start/End: Original strand, 5675094 - 5675149
Alignment:
Q  170 ttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctact 225  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||    
T  5675094 ttgattaaggccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctact 5675149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33359293 - 33359092
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359293 attatggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 33359194  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359193 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 33359094  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  33359093 tt 33359092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30181222 - 30181026
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30181222 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 30181123  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  30181122 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaaccccctt 30181026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12101369 - 12101180
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101369 tttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 12101270  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12101269 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 12101180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42965187 - 42964998
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965187 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 42965088  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42965087 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42964998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 7164187 - 7164375
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164187 cgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 7164286  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7164287 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 7164375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24792530 - 24792334
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792530 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 24792431  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792430 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 24792334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 173 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22649897 - 22649699
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22649897 attatggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtt 22649798  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22649797 tatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 22649699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 42204147 - 42204349
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42204147 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagc 42204246  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42204247 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctc 42204346  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  42204347 ctt 42204349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43068171 - 43067975
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068171 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 43068072  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43068071 tagtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43067975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 3511326 - 3511517
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3511326 cgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatagtt 3511425  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3511426 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 3511517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4477514 - 4477323
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4477514 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggtt 4477415  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4477414 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 4477323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 5280863 - 5281054
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5280863 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 5280962  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5280963 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 5281054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 20346491 - 20346682
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20346491 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 20346590  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20346591 tcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacctcctt 20346682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Original strand, 25748479 - 25748681
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748479 gattttggccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 25748578  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25748579 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 25748678  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  25748679 ctt 25748681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803220
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 1803220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 933289 - 933479
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  933289 gtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 933388  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933389 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 933479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Original strand, 15655905 - 15656106
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15655905 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagct 15656004  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15656005 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcc 15656104  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  15656105 tt 15656106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 43156710 - 43156907
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43156710 tggcctcatttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 43156809  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43156810 atagtttcataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacctcctt 43156907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 32041540 - 32041732
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32041540 ggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 32041639  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32041640 tagtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacct 32041732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33846722 - 33846531
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846722 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 33846623  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33846622 tagtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33846531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 181 - 374
Target Start/End: Original strand, 38866545 - 38866738
Alignment:
Q  181 ctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 280  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38866545 ctcgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 38866644  T
Q  281 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38866645 tttcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 38866738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 173 - 369
Target Start/End: Original strand, 4347266 - 4347462
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347266 attaaggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 4347365  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4347366 taccatagtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4347462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 6394749 - 6394945
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6394749 ggccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 6394848  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6394849 tggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 6394945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12097794 - 12097592
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||  |||||||||  || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12097794 gattagggccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataga 12097695  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097694 ttatcatagtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 12097595  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  12097594 ctt 12097592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36891027 - 36890832
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36891027 ggccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 36890929  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36890928 tagtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36890832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 42673468 - 42673655
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||    
T  42673468 cgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagtt 42673563  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42673564 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42673655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 9452593 - 9452784
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9452593 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtt 9452692  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9452693 tcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 9452784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 8630669 - 8630853
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8630669 cgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 8630768  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8630769 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 8630853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46134497 - 46134309
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  46134497 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattatagtt 46134398  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46134397 tcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacctc 46134309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 46891533 - 46891341
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtcttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46891533 cgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcatagt 46891434  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46891433 tttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacctcctt 46891341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 17753603 - 17753794
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17753603 cgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacatagtt 17753702  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17753703 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 17753794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 374
Target Start/End: Original strand, 48865689 - 48865827
Alignment:
Q  236 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48865689 tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacatc 48865788  T
Q  336 tggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865789 aggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 48865827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16894701 - 16894509
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||          |||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  16894701 gattaaggccccgtttggattggcttattttgag----------cttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagt 16894612  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16894611 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaacatc 16894512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43021767 - 43021582
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43021767 tttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattatagtttc 43021668  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| ||||||    |  | ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43021667 ataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43021582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 178 - 325
Target Start/End: Original strand, 19828268 - 19828415
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19828268 ggccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatca 19828367  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 325  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828368 tagtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 37006004 - 37005857
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||    
T  37006004 cgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaatt 37005905  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  37005904 tcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttttagctta 37005857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Original strand, 43405013 - 43405170
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  43405013 attaaggccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagct 43405112  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    |||| || ||||||||| || || | | ||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  43405113 tatcgtaatttcataagttgtttctactatattttaataagcccaattttttagctta 43405170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Original strand, 37704978 - 37705075
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 275  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704978 ggccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 37705075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15655610 - 15655458
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||| | | |||| ||| |||| ||||||   |||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  15655610 ggccgcgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttacca 15655511  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
     | ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  15655510 caattttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaattttgagctta 15655458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 176 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 36849737 - 36849590
Alignment:
Q  176 atggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 275  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||   |||||| ||||| || ||||||   ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||    
T  36849737 atggccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttat 36849638  T
Q  276 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 323  Q
    || | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  36849637 cacaatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaatttt 36849590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691433
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 269  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaata 27691433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30075429 - 30075277
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||||   ||||| | ||| | |   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  30075429 tatggccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaataa-taaaaatagctta 30075331  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    | ||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  30075330 t-ata-tttcataaaccgcttataccatattttaataagccataattttgagctta 30075277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 314
Target Start/End: Original strand, 20163886 - 20163953
Alignment:
Q  247 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 314  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163886 gtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 36702 - 36898
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36702 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 36801  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36802 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 36898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 64)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 54189542 - 54189738
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189542 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 54189641  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54189642 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 54189738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15241224 - 15241028
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15241224 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatca 15241125  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15241124 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 15241028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 176 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19913828 - 19913630
Alignment:
Q  176 atggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttat 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19913828 atggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttat 19913729  T
Q  276 catagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913728 catagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19913630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 167 - 372
Target Start/End: Original strand, 38055143 - 38055348
Alignment:
Q  167 ttcttgattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 266  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055143 ttcttgaatatggccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 38055242  T
Q  267 atagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 366  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055243 atattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 38055342  T
Q  367 acctcc 372  Q
    ||||||    
T  38055343 acctcc 38055348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23776655 - 23776463
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776655 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23776556  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23776555 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaacct 23776463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50055297 - 50055101
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50055297 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatca 50055198  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055197 tggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1756955 - 1756767
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1756955 cgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 1756856  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1756855 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 1756767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 14987789 - 14987985
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14987789 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 14987888  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14987889 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 14987985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 53717660 - 53717464
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717660 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 53717561  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53717560 tagtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53717464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 16700783 - 16700974
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16700783 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 16700882  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16700883 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcctt 16700974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 20877049 - 20877240
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20877049 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 20877148  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  20877149 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacctcctt 20877240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 52139205 - 52139396
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139205 cgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 52139304  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52139305 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctcctt 52139396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 54412630 - 54412821
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54412630 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 54412729  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54412730 tcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcctt 54412821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28032902 - 28032712
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28032902 gtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtat 28032803  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28032802 cataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 28032712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19165163 - 19164973
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtcttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19165163 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 19165064  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165063 ttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccctc-ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19164973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27488844 - 27488648
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488844 ggccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 27488745  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27488744 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 27488648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 50353798 - 50353994
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50353798 ggccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatga 50353897  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50353898 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50353994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 1617086 - 1617277
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1617086 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtt 1617185  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1617186 tcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 1617277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 11639769 - 11639570
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11639769 cgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 11639670  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11639669 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctc 11639570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43290151 - 43289960
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290151 cgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 43290052  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43290051 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 43289960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 172 - 374
Target Start/End: Original strand, 31969672 - 31969874
Alignment:
Q  172 gattatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagc 271  Q
    |||||||| | |||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  31969672 gattatggtcccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagt 31969771  T
Q  272 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31969772 ttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 31969871  T
Q  372 ctt 374  Q
    |||    
T  31969872 ctt 31969874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37968942 - 37968757
Alignment:
Q  189 gattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 288  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37968942 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 37968843  T
Q  289 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37968842 gctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtgacctcctt 37968757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2481604 - 2481408
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2481604 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatca 2481505  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2481504 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2481408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6611556 - 6611360
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611556 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6611457  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6611456 tagtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 6611360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44785113 - 44784917
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44785113 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatca 44785014  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44785013 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacctcctt 44784917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45424730 - 45424534
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45424730 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 45424631  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424630 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 45424534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 191 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8591275 - 8591092
Alignment:
Q  191 ttggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagc 290  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591275 ttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagc 8591176  T
Q  291 tgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591175 tgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 8591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40428911 - 40428720
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428911 cgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 40428812  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428811 tcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 40428720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 23704399 - 23704201
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23704399 gtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 23704300  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23704299 cataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcatttgattctc 23704201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Original strand, 48909849 - 48910039
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909849 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagttt 48909948  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48909949 cataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48910039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 173 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8932379 - 8932178
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8932379 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagct 8932280  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8932279 taacgtagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacctcc 8932180  T
Q  373 tt 374  Q
    ||    
T  8932179 tt 8932178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30423755 - 30423565
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30423755 cgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30423656  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30423655 tcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacctcctt 30423565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35490964 - 35490773
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35490964 cgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtt 35490865  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35490864 tcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaaccacctt 35490773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6688817 - 6688627
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688817 ggccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 6688718  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6688717 tagttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 6688627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 15669180 - 15669376
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669180 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 15669279  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15669280 tagtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 15669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 37464718 - 37464914
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37464718 ggccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatca 37464817  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37464818 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 37464914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 47632036 - 47632228
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 281  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47632036 cgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctcatagt 47632135  T
Q  282 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47632136 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 47632228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 53875659 - 53875850
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53875659 cgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 53875758  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53875759 ttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 53875850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 53353052 - 53353256
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgt----gggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353052 ggccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctt 53353151  T
Q  274 atcatagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53353152 atcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacc 53353251  T
Q  370 tcctt 374  Q
    |||||    
T  53353252 tcctt 53353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Original strand, 33703837 - 33704034
Alignment:
Q  177 tggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33703837 tggcctcgttttaattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatc 33703936  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703937 atagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583632
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 27583632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27536296 - 27536104
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27536296 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggct----tactcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 27536201  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27536200 tagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 27536104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680041
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacctc 40680041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44379377 - 44379187
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44379377 gtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 44379278  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44379277 cataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 44379187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 30171582 - 30171773
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  | | |||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30171582 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagtt 30171681  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30171682 tcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacctcctt 30171773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 44375847 - 44376038
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44375847 cgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 44375946  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44375947 tcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacctcctt 44376038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 184 - 352
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  284 cataagctgcttatgcca-tattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagct 352  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 178 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 55345021 - 55344817
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55345021 ggccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 55344922  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgc 377  Q
    || || ||| || || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  55344921 tatttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttga 55344822  T
Q  378 ttctc 382  Q
    |||||    
T  55344821 ttctc 55344817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38071504 - 38071327
Alignment:
Q  190 attggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataag 289  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38071504 attgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataag 38071405  T
Q  290 ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38071404 ctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacct 38071327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Original strand, 50053440 - 50053592
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50053440 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatca 50053539  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053540 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 16703822 - 16704014
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||||||||||||||| ||||    ||||||| |||  |||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  16703822 ggcctcgtttggattgactta----gagcttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatca 16703917  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16703918 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaaccccctt 16704014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 258 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269046
Alignment:
Q  258 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatga 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  358 atttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23269062 atttatgtaatctcctt 23269046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23265948 - 23265865
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265948 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780763
Alignment:
Q  247 gtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctt 329  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaattttaagctt 51780763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 44548338 - 44548185
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggc-ttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatc 276  Q
    |||| |||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  44548338 ggccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatc 44548239  T
Q  277 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    | | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  44548238 acaattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaattttaagctta 44548185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408213
Alignment:
Q  299 ccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct-ctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 53408213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 330
Target Start/End: Original strand, 17493370 - 17493482
Alignment:
Q  218 tatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccta 317  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  17493370 tatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataagctgcttataccatgttttaataagctca 17493469  T
Q  318 aattttcagctta 330  Q
    |||||| ||||||    
T  17493470 aattttgagctta 17493482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23261937 - 23261886
Alignment:
Q  323 tcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261937 tcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 23261886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595902
Alignment:
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaact-----------ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 9595902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 374
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055338
Alignment:
Q  337 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 50055338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 55344781 - 55344724
Alignment:
Q  268 tagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 325  Q
    |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344781 tagcttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Original strand, 48748197 - 48748251
Alignment:
Q  320 ttttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48748197 ttttcagcataccctccgtcttaataaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 48748251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 153
Target Start/End: Original strand, 30477486 - 30477546
Alignment:
Q  92 aacctcttcatcatctattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgatta 153  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30477486 aacctcttcattgtctattcat-tgtaatttcataatcttgttgtcatctctcttttgatta 30477546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 9596030 - 9595983
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactc 226  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  9596030 ggccccgtttggattggctta-tttgagtttatgtgggcttatctactc 9595983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23159 - 22963
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 23060  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23059 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 22963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 175 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3873455 - 3873259
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3873455 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagctta 3873356  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3873355 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacctc 3873259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 175 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31517426 - 31517227
Alignment:
Q  175 tatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517426 tatggccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 31517327  T
Q  275 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517326 tcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 31517227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 184 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33906249 - 33906059
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906249 gtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 33906150  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33906149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 33906059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26323394 - 26323201
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26323394 ggccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatca 26323295  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26323294 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 26323201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18807092 - 18806896
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18807092 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 18806993  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18806992 tagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18806896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 178 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4232350 - 4232157
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232350 ggccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 4232251  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4232250 tagtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacctc 4232157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 366
Target Start/End: Original strand, 1108277 - 1108464
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1108277 ggccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 1108375  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 366  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108376 tagtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2178977 - 2178781
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| || ||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2178977 ggccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatca 2178878  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2178877 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 2178781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28330040 - 28329851
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28330040 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 28329941  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28329940 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacc--ctagcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacctcctt 28329851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 39635449 - 39635645
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39635449 ggccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatca 39635548  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  39635549 tagtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacctcctt 39635645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 4016041 - 4016232
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  4016041 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatagtt 4016140  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4016141 tcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 4016232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066306
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 16066306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 42937721 - 42937913
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42937721 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 42937820  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42937821 tcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 42937913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 189 - 374
Target Start/End: Original strand, 5733407 - 5733592
Alignment:
Q  189 gattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataa 288  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5733407 gattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcatagtttcataa 5733506  T
Q  289 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5733507 gctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacctcctt 5733592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6175036 - 6174840
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6175036 ggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 6174937  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  6174936 tagtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttacgtgacctcctt 6174840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 183 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16588979 - 16588790
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16588979 cgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagtt 16588880  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcc 372  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16588879 tcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacctcc 16588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1483105 - 1482915
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1483105 cgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgtt 1483007  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1483006 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacatcctt 1482915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19384126 - 19383947
Alignment:
Q  195 cttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 294  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  19384126 cttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgtt 19384027  T
Q  295 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19384026 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 19383947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 173 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19901350 - 19901153
Alignment:
Q  173 attatggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagct 272  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19901350 attaaggccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagct 19901252  T
Q  273 tatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19901251 tatcatagtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 19901153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Original strand, 850999 - 851190
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  850999 cgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataatt 851098  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851099 ttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 851190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 183 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 30420370 - 30420223
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30420370 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataggt 30420271  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420270 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 30420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 32688864 - 32688711
Alignment:
Q  18 cacagaaaagggtcagaagttcattctcaaatgtagtggaggctagagaaacaacttggaaagaagattccaccaacctcttcatcatctattcatgtgt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32688864 cacagaaaagggtcagaaattcattctcaaatgtagtgaaggatagaaaaacaacttggaaacaagattccaccaacctcttcatcatctgttcatgtgt 32688765  T
Q  118 aatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgattatgagtagttagatttctt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32688764 aatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgattatgagtagttagatttctt 32688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30270887 - 30270691
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  30270887 ggccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatca 30270788  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30270787 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaatctcctt 30270691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 429830 - 430006
Alignment:
Q  195 cttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgct 294  Q
    ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  429830 cttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgct 429929  T
Q  295 tatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  429930 tatgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctc 430006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44947743 - 44947561
Alignment:
Q  185 tttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| | | |||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44947743 tttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatcatagtttc 44947644  T
Q  285 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  44947643 ataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacctcctt 44947561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42446777 - 42446625
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||    
T  42446777 ggccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatca 42446678  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  42446677 caatttcataagctgcttatgccatattttaataagatcaaattttaagctta 42446625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 229 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22101304 - 22101210
Alignment:
Q  229 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 323  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22101304 ataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcacaatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaatttt 22101210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 330
Target Start/End: Original strand, 3585348 - 3585439
Alignment:
Q  239 ttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 330  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  3585348 ttaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattatgagctta 3585439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15692053 - 15691952
Alignment:
Q  65 gaaacaacttggaaagaagattccaccaacctcttcatcatctattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgattatgagtagttag 164  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  15692053 gaaacaacttggaaacaagatttcatcaaccacttcatcatctatt-----gtaatttcttaatctagttgtcatgtctcttttaattatgagtagctag 15691959  T
Q  165 atttctt 171  Q
    | |||||    
T  15691958 aattctt 15691952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Original strand, 32008102 - 32008196
Alignment:
Q  54 tggaggctagagaaacaacttggaaagaagattccaccaacctcttcatcatctattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctctttt 148  Q
    |||||||||| ||| || |||||||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||    
T  32008102 tggaggctagggaatcaccttggaaacaagatttcatcaacctctttatcatatatccatgtgtaattttttaatcttgttgtcgtgtctctttt 32008196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 10068425 - 10068353
Alignment:
Q  81 aagattccaccaacctcttcatcatctattcatgtgtaatttcttaatcttgtagccatgtctcttttgatta 153  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10068425 aagattccatcaacttcttcatcatccattcatgtgtaaattcctaatcttgtttccatgtctcttttaatta 10068353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12517385 - 12517256
Alignment:
Q  184 gtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 283  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||   |||||  ||  |||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||| || |||    
T  12517385 gtttggattggctta-tttaagcttatgtgagcttatctactaaaataagctttcctaaaagtgtttggataccttaattaaaagagcttatcctaattt 12517287  T
Q  284 cataagctgcttatgccatattttaataagc 314  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  12517286 cataagcagcttaagcaatattttaacaagc 12517256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 18
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| |||||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 ggccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 115  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  114 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 183 - 382
Target Start/End: Original strand, 3712 - 3911
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3712 cgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 3811  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctttgcttctc 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3812 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcttttgattctc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 498 - 307
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  498 cgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 399  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  398 tcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 145448 - 145257
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 282  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  145448 cgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 145349  T
Q  283 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145348 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacctcctt 145257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 178 - 374
Target Start/End: Original strand, 10235 - 10431
Alignment:
Q  178 ggcctcgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10235 ggccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 10334  T
Q  278 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10335 tagtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 10431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 183 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 18
Alignment:
Q  183 cgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatc---tactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 279  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210 cgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 112  T
Q  280 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111 gtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacctcctt 18  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University