View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2562_low_40 (Length: 309)

Name: NF2562_low_40
Description: NF2562
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2562_low_40
NF2562_low_40
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (1-293)||(26803369-26803661)
chr6 (49-293)||(27603671-27603915)
chr6 (1-293)||(27679873-27680165)
chr6 (1-293)||(31285482-31285774)
chr6 (3-293)||(28787163-28787453)
chr6 (3-293)||(28793284-28793574)
chr6 (3-293)||(27717466-27717756)
chr6 (20-285)||(27426587-27426852)
chr6 (5-293)||(26647406-26647694)
chr6 (5-293)||(26753374-26753662)
chr6 (2-287)||(27337068-27337353)
chr6 (2-287)||(27397808-27398093)
chr6 (44-293)||(27591988-27592237)
chr6 (1-293)||(26624194-26624486)
chr6 (1-293)||(26730171-26730463)
chr6 (53-293)||(26824794-26825034)
chr6 (2-293)||(26143792-26144083)
chr6 (2-293)||(25483983-25484274)
chr6 (1-259)||(27697587-27697845)
chr6 (3-293)||(27610087-27610377)
chr6 (44-293)||(27676587-27676836)
chr6 (2-293)||(25580646-25580937)
chr6 (8-282)||(26862510-26862784)
chr6 (2-258)||(26884994-26885250)
chr6 (3-191)||(28782026-28782214)
chr6 (2-256)||(26656889-26657143)
chr6 (2-256)||(26762860-26763114)
chr6 (2-293)||(25511816-25512106)
chr6 (2-293)||(26056846-26057137)
chr6 (2-293)||(26076816-26077107)
chr6 (3-293)||(25492286-25492576)
chr6 (11-293)||(27530271-27530550)
chr6 (2-293)||(25539467-25539758)
chr6 (114-293)||(27705221-27705400)
chr6 (1-112)||(27705552-27705663)
chr6 (49-192)||(27215423-27215566)
chr6 (44-167)||(28326444-28326567)
chr6 (44-167)||(28504080-28504203)
chr6 (222-294)||(27215596-27215668)
chr6 (99-247)||(28227973-28228121)
chr6 (44-263)||(28235531-28235750)
chr6 (105-259)||(26938056-26938210)
chr6 (44-246)||(28182084-28182286)
chr6 (61-247)||(28243778-28243964)
chr6 (58-167)||(26950723-26950832)
chr6 (112-164)||(26975985-26976037)
chr6 (101-181)||(29827009-29827089)
chr6 (222-269)||(28186538-28186585)
chr6 (133-167)||(25074922-25074956)
chr6 (112-162)||(26849746-26849796)
chr6 (53-163)||(28240329-28240439)
chr6 (49-162)||(28490654-28490767)
chr6 (49-162)||(29803064-29803177)
chr6 (112-160)||(27664305-27664353)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (24-293)||(3679-3948)
scaffold0277 (3-293)||(12642-12932)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (3-293)||(8412-8702)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (1-293)||(29272805-29273097)
chr8 (53-162)||(12589647-12589756)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (3-293)||(2506-2796)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (20-285)||(60511-60776)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (20-285)||(18074703-18074968)
chr4 (3-294)||(18698362-18698653)
chr4 (3-294)||(18730466-18730757)
chr4 (49-293)||(18723048-18723292)
chr4 (3-293)||(18654440-18654730)
chr4 (3-293)||(18678523-18678813)
chr4 (8-262)||(5089948-5090202)
chr4 (226-293)||(18688589-18688656)
[»] chr1 (4 HSPs)
chr1 (1-261)||(267339-267599)
chr1 (42-287)||(28163349-28163594)
chr1 (3-284)||(28126651-28126932)
chr1 (223-259)||(26137033-26137069)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (58-269)||(57285-57496)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (53-269)||(16691842-16692058)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (99-247)||(28471-28619)
scaffold0038 (44-263)||(35693-35912)
scaffold0038 (61-247)||(43940-44126)
scaffold0038 (53-163)||(40491-40601)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (99-167)||(17992308-17992376)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 26803369 - 26803661
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26803369 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 26803468  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26803469 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 26803568  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26803569 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataacaaagtaccttcaagttatgaagacatttt 26803661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27603915 - 27603671
Alignment:
Q  49 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcatta 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  27603915 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggggcaactacaggctttggcaggagaacctgattggtttgggcttggaagcagggtcatcatta 27603816  T
Q  149 ccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggat 248  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603815 ccactcgagacagacacttactaaccagtcatgatatagaaagaaagtatgcattagaagggttgtgtaggacagaagctcttgaattgttgaggtggat 27603716  T
Q  249 ggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  27603715 ggcttttaagaataacaaagtaccttcagtttatgaagacgtttt 27603671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 27679873 - 27680165
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  27679873 catgttagtgagggaattccagtcataaaggaaagattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaagcaactgcatgctt 27679972  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  27679973 tggctggaggacttgattggttcggatgtggaagcagagtcatcattaccactcgaaacaaagacttactaagcagtcatggcatagaaagtacacatgc 27680072  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  27680073 agtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgataaagttccttcaggttacgaagacatttt 27680165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 31285482 - 31285774
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  31285482 catgttagtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatatgaatcaactgcatgctt 31285581  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||| |||| ||| ||||    
T  31285582 tggctggaggacttgattggttcggccgtggaagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagtagtcatgggataaaaagtacacatgc 31285681  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  31285682 agtagaagggttgaatgggactgaagctcttgaattgttaaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttacgaagacatttt 31285774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Original strand, 28787163 - 28787453
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28787163 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttg 28787262  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||| ||| ||| ||    
T  28787263 gcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaag 28787362  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28787363 tgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 28787453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Original strand, 28793284 - 28793574
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28793284 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttg 28793383  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||  |||||||| ||| ||| ||    
T  28793384 gcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattacgactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaagtacacatgaag 28793483  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |  | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28793484 tgaaagggctgtatgggacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 28793574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27717756 - 27717466
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27717756 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttg 27717657  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||| |   ||| ||    
T  27717656 gctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaag 27717557  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| ||||| |||||    
T  27717556 tagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagatttt 27717466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 27426852 - 27426587
Alignment:
Q  20 caattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattg 119  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  27426852 caatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattg 27426753  T
Q  120 gtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatggg 219  Q
    ||| || | ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  27426752 gttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtg 27426653  T
Q  220 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  27426652 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaa 27426587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 26647406 - 26647694
Alignment:
Q  5 tttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggc 104  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| || ||| | ||||||||    
T  26647406 tttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggc 26647505  T
Q  105 tggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagta 204  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26647506 tggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagta 26647605  T
Q  205 gaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26647606 agagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgtttt 26647694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 293
Target Start/End: Original strand, 26753374 - 26753662
Alignment:
Q  5 tttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggc 104  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| || ||| | ||||||||    
T  26753374 tttgtgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaaccaactggatcagctagaggctttggc 26753473  T
Q  105 tggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagta 204  Q
    |||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26753474 tggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgcagta 26753573  T
Q  205 gaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
       ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  26753574 agagggctatatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcgtttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaagacgtttt 26753662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27337353 - 27337068
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| | |||||    
T  27337353 atgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggcttt 27337254  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  27337253 ggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgca 27337154  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaaga 287  Q
    |||   ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  27337153 gtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaaga 27337068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27398093 - 27397808
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    |||||| |||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| | |||||    
T  27398093 atgtttctgagggaattccaatcattaaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgttgaccaactggatcagctagaggcttt 27397994  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  27397993 ggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactaacctgtcatgggatagaaagaacatatgca 27397894  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaaga 287  Q
    |||   ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  27397893 gtaagagggctatatgggaaggaagctcttgaattgttgaggtggacggcttttaagaataacaaagtaccgccaagttatgaaga 27397808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27592237 - 27591988
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  27592237 gaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagatgctttggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcat 27592138  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgagg 243  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||   | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592137 catcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgggacagaagctcttgaattgttgagg 27592038  T
Q  244 tggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27592037 tggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacatttt 27591988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 26624194 - 26624486
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||   ||||||  ||||||    
T  26624194 catgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctt 26624293  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | || |||||  ||| |||| ||| ||||    
T  26624294 tggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgc 26624393  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26624394 agtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacatttt 26624486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 26730171 - 26730463
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||   ||||||  ||||||    
T  26730171 catgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgtagacagtataaggcaactggatgctt 26730270  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||| | ||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| | || |||||  ||| |||| ||| ||||    
T  26730271 tggctggagggcttgattggttcggacgtggaagcagggtcataattaccactcgaaacaaacacctactaagcactcatgggataaaaagcacacatgc 26730370  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26730371 agtagaagggttgtatgggacagacggtcatgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaaagttccttcaggttatgaagacatttt 26730463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 53 - 293
Target Start/End: Original strand, 26824794 - 26825034
Alignment:
Q  53 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccac 152  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||| ||    
T  26824794 ttcttctgattctcgatgacattgacaaactggagcaactagatgctttggctggaggatttgattggttcggtaatggcagcagagtcatcattacaac 26824893  T
Q  153 tcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggct 252  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26824894 tcgagacaaacaattacttaccaatcatgagatagaattaatgtatgaagtagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttaaggtggatggct 26824993  T
Q  253 tttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26824994 tttaaaaataacaaagtaccgtcaagttatgaacacatttt 26825034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 26143792 - 26144083
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  26143792 atgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 26143891  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||  ||   ||| ||| |||||    
T  26143892 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 26143991  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26143992 gtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagaaatttt 26144083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 25483983 - 25484274
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  25483983 atgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 25484082  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||  ||   ||| ||| |||||    
T  25484083 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 25484182  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25484183 gtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 25484274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27697845 - 27697587
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| |||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||| ||||    
T  27697845 catgttagtgacggaattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgttgacaaactggatcagctacaggctt 27697746  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttact-gaccagtcatgatatagaaagaacatatg 199  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  ||||||| ||| ||||    
T  27697745 tggctggaggactcgattggtttggtcctggaagcagagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagacca-tcatgggatagaaaaaacgtatg 27697647  T
Q  200 cagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 259  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27697646 cagtaaaagggttgaatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 27697587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27610377 - 27610087
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27610377 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttg 27610278  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || || ||| ||||||  ||| |||| |   ||  ||    
T  27610277 gctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattgccactcgagacaaacacttgctaacctgtcatgggataaaaagtatgcataaag 27610178  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| ||||| |||||    
T  27610177 tggaagggctgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagatttt 27610087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27676836 - 27676587
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| | |||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  27676836 gaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggctttggctggaagactcgattggtttggtcctggaagcagagtcat 27676737  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgagg 243  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||   | ||||||  ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27676736 catcaccacccgagataaacacttactagactgtcatgggatagaaaaaacatatgcagtagaagagttgaatgagacagaagctcttgaattgttgagg 27676637  T
Q  244 tggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27676636 tggaaggcttttaaaaatgagaaagttccttcaagttatgaagacatttt 27676587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 25580646 - 25580937
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  25580646 atgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 25580745  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||  ||   ||| ||| |||||    
T  25580746 ggctggaggacttgattggttcggtcatggaagcagtgtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatgggattacaagtacacatgca 25580845  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  25580846 gtagaagaattgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaatttatgaagagatttt 25580937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 282
Target Start/End: Original strand, 26862510 - 26862784
Alignment:
Q  8 gtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctgg 107  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| || ||| | || || |||||    
T  26862510 gtgagggaattccacttataaaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggaacagctagaggcattagctgg 26862609  T
Q  108 aggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagag 207  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  | ||||  ||||||||||||||||| ||| |     
T  26862610 aggacttgattggtttggtcatggaagtagagtcatcattaccactcgagataaacacttactaacatgccatgggatagaaagaacatatgcggtaaac 26862709  T
Q  208 gggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttat 282  Q
    ||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||    
T  26862710 gggctacatgagacagaagcttttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatggtgaagttccttcgagttat 26862784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 2 - 258
Target Start/End: Original strand, 26884994 - 26885250
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||| | |||||    
T  26884994 atgttagtgagggaattccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaaatggagcagctagaggcttt 26885093  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  | |||    |||| |||||||||| |    
T  26885094 ggctggaggacttgattggtttggtcgtggaagcagggtcatcattaccactcgtgataaacacttactaacgtgccatagggtagatagaacatatgaa 26885193  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaa 258  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26885194 gtagaagggatatatgggaaagaagcttttgaattgttgaggtggctggcctttaaa 26885250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Original strand, 28782026 - 28782214
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28782026 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 28782125  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaag 191  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||    
T  28782126 gcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggatagaaag 28782214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 26656889 - 26657143
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  26656889 atgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 26656988  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || | | |||| |  ||||||| |||||||||     
T  26656989 ggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgcc 26657088  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggctttta 256  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26657089 gtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggctttta 26657143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 26762860 - 26763114
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  26762860 atgttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 26762959  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| || || | | |||| |  ||||||| |||||||||     
T  26762960 ggcaggaggacttgattggttcggttgtggaagcagagtcatcattaccactagagataaacacttgctaaactgtcacgggatagaaataacatatgcc 26763059  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggctttta 256  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26763060 gtaaaagggctatatgggacagaagcacttgaattgttgagatggatggctttta 26763114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 25511816 - 25512106
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  25511816 atgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagaggcttt 25511915  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  || ||||||  ||   ||| ||| |||||    
T  25511916 ggctggaggacttgactggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacacttactagcctgtcatg-gattacaagtacacatgca 25512014  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||   ||||||||| | |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25512015 gtagaagggttgaatgagatagaagctcttattttgttgaggcgaatggcttttaaacatgacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 25512106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 26056846 - 26057137
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  26056846 atgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgcttt 26056945  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||  ||  |||||  |    ||| ||| |||||    
T  26056946 ggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgca 26057045  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  | |  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26057046 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatatttt 26057137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 26076816 - 26077107
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||| ||| | |||||    
T  26076816 atgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgttgacaaactggagcagctagacgcttt 26076915  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||  ||  |||||  |    ||| ||| |||||    
T  26076916 ggctggaggacttgattggttcggtcttggaagcagagtcatcattaccactcgtgataaacgcttactagcctatcatgtgaatacaagtacacatgca 26077015  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  | |  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26077016 gtagaagggttgaatgagacagaagctcttgaattattgagccgaaatgcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaagatatttt 26077107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 25492576 - 25492286
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||  || |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| | | ||||    
T  25492576 tgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgttgacagactggagcagctagaggatttg 25492477  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||| ||||| ||||||||| || | ||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||| |   ||||||    
T  25492476 gctgaaggacttgattggttcggtcgtggaagcggagttatcattaccactcgagacaaacacatactaaccagtcatgggatagaaagtatgcatgcag 25492377  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||| | |||| |||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25492376 tagaagagttgcatggggaagaagctcttgaattgcttatgtggatggcttttaaaaatgacagagttccttcaatttatgaagacatttt 25492286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27530550 - 27530271
Alignment:
Q  11 aggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggagg 110  Q
    |||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| || ||| | || |||||||||||    
T  27530550 agggaattccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactggatcagctagaggccttggctggagg 27530451  T
Q  111 acctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagagggg 210  Q
    || ||||||||| || | ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |  | |||||  |||||||| ||| |||||||||| |||    
T  27530450 acttgattggttcggtcctgggagtagagtcatcattactactcgaaacaaacacttactaaagattcatgggatagaaagtacacatgcagtagaaggg 27530351  T
Q  211 ttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||   || ||||||||| |||||||||||||    
T  27530350 ttgaatgcgacagaagctctcgaattgttgaggtggatggctttcaaagaaaat---gttccttcaagtcatgaagacatttt 27530271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 293
Target Start/End: Original strand, 25539467 - 25539758
Alignment:
Q  2 atgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgcttt 101  Q
    ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||| | |||||    
T  25539467 atgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggcttt 25539566  T
Q  102 ggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgca 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |  || ||||||  ||   ||| ||| ||| |    
T  25539567 ggctggaggacttgattggttcggtcctggaagcagagtcatcattaccactcgtgatacacatttattagcctgtcatgggattacaagtacacatgta 25539666  T
Q  202 gtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25539667 gtaaaagggttgaatgagacagaagctcttgaattgttgaggcgaatggcgtttaaaaatgacaaagttccttcgagttatgaagagatttt 25539758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 27705400 - 27705221
Alignment:
Q  114 tgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttg 213  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||  ||  ||||   ||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  27705400 tgattggtttggccctggaagcagagttatcatcaccactcgaaataaacacttactagcctctcataggatagaaaaaacatatccagtagaagggttg 27705301  T
Q  214 tatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||    
T  27705300 aatgggatagatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaacgttccttcaggttatgaagacatttt 27705221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27705663 - 27705552
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  27705663 catgtttgtgaggggattccattcataaaggaaaggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgataggaagcaactgcatgctt 27705564  T
Q  101 tggctggaggac 112  Q
    ||||||| ||||    
T  27705563 tggctgggggac 27705552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 192
Target Start/End: Original strand, 27215423 - 27215566
Alignment:
Q  49 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcatta 148  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| || ||||||||||    
T  27215423 aagattcttttgattcttgatgatgttgacaaactagagcagctagaggctttggctggaggacttgattggtttggtggtggaagtagagtcatcatta 27215522  T
Q  149 ccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaaga 192  Q
    | |||||| ||| ||| ||||| |||  |||||  |||||||||    
T  27215523 cgactcgaaacagacagttactaacctatcatgggatagaaaga 27215566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Original strand, 28326444 - 28326567
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| | || | |||||||||||||| ||||||||| || | ||| || || || ||    
T  28326444 gaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgat 28326543  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacattt 167  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  28326544 cgttaccactcgagacaaacattt 28326567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 167
Target Start/End: Original strand, 28504080 - 28504203
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||  || ||||| | || | |||||||||||||| ||||||||| || | ||| || || || ||    
T  28504080 gaaagaaggttctgttgattctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggacttgattggttcggtcctggcagtagagtgat 28504179  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacattt 167  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  28504180 cgttaccactcgagacaaacattt 28504203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 294
Target Start/End: Original strand, 27215596 - 27215668
Alignment:
Q  222 agaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacattttt 294  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  27215596 agaagctcataaattgttgaggttgatggcatttaaaaatggtgaagttccttcaagttatgaaggcattttt 27215668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 28227973 - 28228121
Alignment:
Q  99 tttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||  || |||||| |||||    
T  28227973 tttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagagcatat 28228072  T
Q  199 gcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtgga 247  Q
    | | ||||   |||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28228073 gaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgaggtgga 28228121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 28235531 - 28235750
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| | || | |||||| |||| |  |||||||||||| | |||||| |  || ||    
T  28235531 gaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgat 28235630  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgagg 243  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||  || |||||||| || | | ||||   |||  ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  28235631 cattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 28235730  T
Q  244 tggatggcttttaaaaataa 263  Q
    |||| |||||| ||| ||||    
T  28235731 tggaaggctttaaaatataa 28235750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 259
Target Start/End: Original strand, 26938056 - 26938210
Alignment:
Q  105 tggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagta 204  Q
    ||||| |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||  || ||||||| ||||| ||||    
T  26938056 tggagaacctaattggcttggtcatggaagcaaagtcattgttaccactcgagacaaacatttgctatcatgtcatgggattgaaagaatatatgtagta 26938155  T
Q  205 gaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 259  Q
    || || ||  | | |  ||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  26938156 gatggcttaaaggaggaagaagctcttgaactatttaggtggatggctttcaaaa 26938210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 246
Target Start/End: Original strand, 28182084 - 28182286
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  || ||||| | || | |||||||||||||  |||||||||||| | ||| || |  || ||    
T  28182084 gaaagaaggttctattgattctagatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttggctggaggaattgattggtttggtcctggtagtaaagtgat 28182183  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgagg 243  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||     ||||||  || |||||| |||||| | ||||   |||  ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28182184 cattaccactcgagacgaacaattgctagtaggtcatgggattgaaagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgagg 28182283  T
Q  244 tgg 246  Q
    |||    
T  28182284 tgg 28182286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 28243778 - 28243964
Alignment:
Q  61 attctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagaca 160  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||| | || | ||| |||||||||| ||||||||| || | ||| || || || ||| |||||||||||||||    
T  28243778 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 28243877  T
Q  161 aacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtgga 247  Q
     |||||| || |  |||||||  || |||||| |||||| | ||     |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28243878 gacatttgctaaaaagtcatgggattgaaagagcatatgaattacctaagttaaatgagaccgaagctcttgaattgttgaggtgga 28243964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Original strand, 26950723 - 26950832
Alignment:
Q  58 ttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgag 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | || | ||||  |||||  |||| |||| |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  26950723 ttgattctcgatgatgttgacaaaataaagcaattgcaggttttgattggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgtg 26950822  T
Q  158 acaaacattt 167  Q
    ||||||||||    
T  26950823 acaaacattt 26950832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 164
Target Start/End: Original strand, 26975985 - 26976037
Alignment:
Q  112 cctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaaca 164  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26975985 cctggttggcttggtcatggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaaca 26976037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 181
Target Start/End: Original strand, 29827009 - 29827089
Alignment:
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatg 181  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||  || |||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||    
T  29827009 tggcgggaggacttgattggtttggtcctggcagcatagtgatcattaccactcgagaccaacatttgctaacaagtcatg 29827089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 269
Target Start/End: Original strand, 28186538 - 28186585
Alignment:
Q  222 agaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagt 269  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  28186538 agaagctcttgaattgttgacgtggaaggctttaaaaaataacaaagt 28186585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 167
Target Start/End: Original strand, 25074922 - 25074956
Alignment:
Q  133 agcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25074922 agcagagtcatcattaccactcgagacaaacattt 25074956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 162
Target Start/End: Original strand, 26849746 - 26849796
Alignment:
Q  112 cctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaa 162  Q
    |||| |||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26849746 cctggttggcttggtcatggtagcagagtcatcattaccactcgagacaaa 26849796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Original strand, 28240329 - 28240439
Alignment:
Q  53 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccac 152  Q
    ||||||||||||| ||| || | || ||  || ||||||| || | |||||||||||| | |||||||||  | | ||  ||||| ||||||||||||||    
T  28240329 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 28240428  T
Q  153 tcgagacaaac 163  Q
    |||||||||||    
T  28240429 tcgagacaaac 28240439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 28490767 - 28490654
Alignment:
Q  49 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcatta 148  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| || | ||  | |||||| || | | ||||||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  28490767 aagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatcatta 28490668  T
Q  149 ccactcgagacaaa 162  Q
    | ||||| ||||||    
T  28490667 cgactcgggacaaa 28490654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29803177 - 29803064
Alignment:
Q  49 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcatta 148  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| || | ||  | |||||| || | | ||||||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  29803177 aagattcttttgcttctagatgatgttgacaatttggagcaattagaggccattgctggaagatccgtttggtttggtccaggaagtagagtcatcatta 29803078  T
Q  149 ccactcgagacaaa 162  Q
    | ||||| ||||||    
T  29803077 cgactcgggacaaa 29803064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27664353 - 27664305
Alignment:
Q  112 cctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagaca 160  Q
    |||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27664353 cctggttggttcggtcaaggaagcagagtcatcattaccactcgagaca 27664305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3948 - 3679
Alignment:
Q  24 tataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggttt 123  Q
    |||||||||||| |||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  3948 tataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacaggctttggcaggagaacctgattggttt 3849  T
Q  124 ggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacag 223  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||  |||||||| ||  ||| |||  | ||| ||||||||||||    
T  3848 ggccttggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaagaagtcatgggatagaaagtacgcatgaagtgaaagggctgtatgggacag 3749  T
Q  224 aagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3748 aagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 3679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 12932 - 12642
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12932 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttg 12833  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||| |||| ||  ||| ||    
T  12832 gcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaag 12733  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12732 tgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 12642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Original strand, 8412 - 8702
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8412 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgttgacgatatgaagcaactacatgctttg 8511  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||| |||| ||  ||| ||    
T  8512 gcaggaggacctgattggttcggccgtggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacacttactaagaagtcatgggataaaaagtacgcatgaag 8611  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8612 tgaaagggctgtatggaacagaagctcttgagttgttgagatggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaagttatgaagacgtttt 8702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 29273097 - 29272805
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  29273097 catgttagtgaggggattccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgttgataatttgaagcaactacatgctt 29272998  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || || ||  ||||||  ||| |||| |   |||     
T  29272997 tggctggaggacatgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattactactcgagacaaacacttgctaacttgtcatgggataaaaagtatgcatga 29272898  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  29272897 agtagaagggctgtatgggacaaaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaagaataacaaagtaccttcaatttatgaagacgtttt 29272805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 162
Target Start/End: Original strand, 12589647 - 12589756
Alignment:
Q  53 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccac 152  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| || |||||||| || | ||  | |||||| || ||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  12589647 ttcttttgcttctagacgatgttgacaatttggagcaattagaggccgttgctggaagatctgtttggtttggacaaggcagcagagtcatcattacgac 12589746  T
Q  153 tcgagacaaa 162  Q
    ||||||||||    
T  12589747 tcgagacaaa 12589756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 2796 - 2506
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2796 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgttgacaatatgaagcaactacatgctttg 2697  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  ||| |||| |   ||| ||    
T  2696 gctggaggacctgattggttcggccgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggataaaaagtatgcatgaag 2597  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||| ||||| |||||    
T  2596 tagaagggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagtgacaatgttccttcaggttacgaagagatttt 2506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Original strand, 60511 - 60776
Alignment:
Q  20 caattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattg 119  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  60511 caatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattg 60610  T
Q  120 gtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatggg 219  Q
    ||| || | ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  60611 gttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtg 60710  T
Q  220 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  60711 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaa 60776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 285
Target Start/End: Original strand, 18074703 - 18074968
Alignment:
Q  20 caattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattg 119  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  18074703 caatcataaaggaaaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgacgttgacaatatgaagcaactgaatgctttggctggaggagttgattg 18074802  T
Q  120 gtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatggg 219  Q
    ||| || | ||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||| |    
T  18074803 gttcggtcctggaagccgagtcatcatcaccacccgagataaacacttactagcctgtcatgagatagaaaaaacatatgcagtaaaagggttgaatgtg 18074902  T
Q  220 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  18074903 acagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaatgacaaagttccttcaagttatgaa 18074968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18698653 - 18698362
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  18698653 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttg 18698554  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||  |   ||| ||    
T  18698553 gctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaag 18698454  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacattttt 294  Q
    || | ||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18698453 taaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagattttt 18698362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18730757 - 18730466
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||    
T  18730757 tgttagtgagggaattccctatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttggaacaactgcatgctttg 18730658  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||||  || ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||  |   ||| ||    
T  18730657 gctggaggacgtgattggttcggctgtggaagcatagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaaccaatcatgagatagaaattatccatgaag 18730558  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacattttt 294  Q
    || | ||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18730557 taaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaattacaaagttccttcaagttatgaagagattttt 18730466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18723292 - 18723048
Alignment:
Q  49 aagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcatta 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||    
T  18723292 aagattcttttgattctcgatgatgttgacaatttgaaacaactgcatgctttggctggaggacctgattggttcggctctggaagcagagttatcatta 18723193  T
Q  149 ccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggat 248  Q
    |||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||  ||||||  |   ||| |||| | ||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||    
T  18723192 ccactcgtaacaaacaattactaaccaatcatgaggtagaaattatgcatgaagtaaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggat 18723093  T
Q  249 ggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18723092 ggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 18723048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18654730 - 18654440
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||| |||||||||    
T  18654730 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtggacaatttggaaccactgcatgctttg 18654631  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||| |||||||  |   ||| ||    
T  18654630 gctggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaag 18654531  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    || | ||| ||| |  |  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18654530 taaaagggatgtctacggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaatttacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 18654440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18678813 - 18678523
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |||| ||||| |||||||||    
T  18678813 tgttagtgagggaattccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgtgcacaatttggaacaactgcatgctttg 18678714  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    || ||||||| ||||||||| ||   ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||| | || |||||| |||||||  |   ||| ||    
T  18678713 gccggaggacgtgattggttcggttgtggaagcagagttatcattaccactcgtaacaaacacttactaagcaatcatgagatagaaattatgcatgaag 18678614  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    || | ||| ||| | ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18678613 taaaagggatgtctagggaaaatgctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttacaaagttccttcaagttatgaagagatttt 18678523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 5090202 - 5089948
Alignment:
Q  8 gtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctgg 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||| ||    ||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |  || | |||||||| | |||||| ||    
T  5090202 gtgagggaattccaatcataaagaaaaggctacaaagaaagaaagttcttttgattctcgatgatattgacaaactgaaacaactacaggttttggccgg 5090103  T
Q  108 aggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagag 207  Q
    || ||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |   ||||||  || || | |||||| | ||||||     
T  5090102 agaacctgattggtttggtcttggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacacttgctaaaatgtcatgggattgatataacatacgaagtagat 5090003  T
Q  208 gggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaata 262  Q
    || ||  ||| ||  ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  5090002 ggtttaaatgagaacgaagctcttcaattattaaggtggaaggcttttaaaaata 5089948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 226 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18688656 - 18688589
Alignment:
Q  226 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaagacatttt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18688656 gctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaagttataaagttccttcaagttatgaagagatttt 18688589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 4)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 267599 - 267339
Alignment:
Q  1 catgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctt 100  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| | |||||||    
T  267599 catgttagtgagggcattccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgttaacgatataaaacaattgcatgctt 267500  T
Q  101 tggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  |||||||| ||  |||     
T  267499 tggctggaggacttgattggttcggctatggaagcagagtcgtcgttaccactcgagacaagcaattactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatga 267400  T
Q  201 agtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaat 261  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267399 agtagaagggttgtatgggaccgaagctcttgaattgttgagttggatggcttttaaaaat 267339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 42 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 28163594 - 28163349
Alignment:
Q  42 tagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtc 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||  | ||||||||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||    
T  28163594 tagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctggaggctttggctggaggactcgattggttcggtcgtggaagcagggtc 28163495  T
Q  142 atcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttga 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| |   || | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28163494 atcattaccactcgagacaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtatgcattcggtagaagggttgtatgggacggaagcgcttgaattgttga 28163395  T
Q  242 ggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatgaaga 287  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28163394 cgtggatggcttttaaaaataacaaagttccttcaagttatgaaga 28163349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28126932 - 28126651
Alignment:
Q  3 tgtttgtgaggggattccaattataaaggaaagactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttg 102  Q
    |||| ||||||| ||| |||| |||||  |||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||| ||| | ||||||    
T  28126932 tgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtcgacaaactggagcagctagaggctttg 28126833  T
Q  103 gctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcag 202  Q
    |||||||||| ||||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |||||||| ||  |||| |    
T  28126832 gctggaggacttgattggttcggtcgtggaagcaaagtcatcattaccactcgagagaaacacttactaacctgtcatgggatagaaagtacgcatgcgg 28126733  T
Q  203 tagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaaataataaagtaccttcaagttatga 284  Q
    || | ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  28126732 taaaagggttgtatgtaacaaaagcacttgaattgttgaggtggatggcttttaaacataacaaagttccttcaagttatga 28126651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 259
Target Start/End: Original strand, 26137033 - 26137069
Alignment:
Q  223 gaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaaaa 259  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26137033 gaagctcttgaattgtttaggtggatggcttttaaaa 26137069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 58 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 57496 - 57285
Alignment:
Q  58 ttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgag 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |  || ||||||||||||||||    
T  57496 ttgattctcgatgatgttcacgagctgaagcaattacaggttttggctggaggacttgattggtttggtcctggtagtaaagtgatcattaccactcgag 57397  T
Q  158 acaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggcttttaa 257  Q
    || |||| || ||  |  ||||||  || |||||| |||||| | ||||   |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  57396 acgaacaattgctagcaggtcatgggattgaaagagcatatgaaatagataagttaaatgagaaagaagctcttgaattgttgaggtggaatgctttcaa 57297  T
Q  258 aaataataaagt 269  Q
    |||||| |||||    
T  57296 aaataacaaagt 57285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 269
Target Start/End: Original strand, 16691842 - 16692058
Alignment:
Q  53 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||     ||||| | || | | ||| |||||  || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||    
T  16691842 ttcttttgattctcgatgatgttgatgagcaaaagcaattgcaagttatggttggagagcccgattggtttggtcctggaagtagagtcatcattaccac 16691941  T
Q  153 tcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtggatggct 252  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| || |||| ||||| ||| || || ||  ||||   ||||||||| ||| | |||||||||| | ||    
T  16691942 tcgagacaaacacttactaacaagtcatggtattgatagaatatatgaagtggatggtttaaatggagaagaagctctagaactattgaggtggaagact 16692041  T
Q  253 tttaaaaataataaagt 269  Q
    ||||||||||| |||||    
T  16692042 tttaaaaataacaaagt 16692058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 28471 - 28619
Alignment:
Q  99 tttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatat 198  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |  || ||||||||||||||| ||||||| || ||  | |||||||  || |||||| |||||    
T  28471 tttggctggaggacttgattggtttggtcctggaagtaaagtgatcattaccactcgaaacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagagcatat 28570  T
Q  199 gcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtgga 247  Q
    | | ||||   |||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28571 gaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgatgaggtgga 28619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 263
Target Start/End: Original strand, 35693 - 35912
Alignment:
Q  44 gaaataagattcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcat 143  Q
    |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  |  ||||| | || | |||||| |||| |  |||||||||||| | |||||| |  || ||    
T  35693 gaaagaaggttctgttgattctagatgatgttcacgaactaaagcaattgcaggttttggcgggagaaattgattggtttggtcctggaagtaaagtgat 35792  T
Q  144 cattaccactcgagacaaacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgagg 243  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||  | |||||||  || |||||||| || | | ||||   |||  ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  35793 cattaccactcgagacaaacaattgctagcaagtcatgggattgaaagaacgtacgaaatagataagttaaatgagaacgaagctcttgaattgttgagg 35892  T
Q  244 tggatggcttttaaaaataa 263  Q
    |||| |||||| ||| ||||    
T  35893 tggaaggctttaaaatataa 35912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 247
Target Start/End: Original strand, 43940 - 44126
Alignment:
Q  61 attctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagaca 160  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||| | || | ||| |||||||||| ||||||||| || | ||| || || || ||| |||||||||||||||    
T  43940 attctcgatgatgttcacgaactgaagcaattgcaggttttagctggaggacttgattggttcggtcctggtagtagagtgatcgttaccactcgagaca 44039  T
Q  161 aacatttactgaccagtcatgatatagaaagaacatatgcagtagaggggttgtatgggacagaagctcttgaattgttgaggtgga 247  Q
     |||||| || |  |||||||  || |||||| |||||| | ||     |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44040 gacatttgctaaaaagtcatgggattgaaagagcatatgaattacctaagttaaatgagaccgaagctcttgaattgttgaggtgga 44126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 163
Target Start/End: Original strand, 40491 - 40601
Alignment:
Q  53 ttcttttgattctcgatgatgttgacgatatggagcaactacatgctttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccac 152  Q
    ||||||||||||| ||| || | || ||  || ||||||| || | |||||||||||| | |||||||||  | | ||  ||||| ||||||||||||||    
T  40491 ttcttttgattctagataatatggatgaactgaagcaactgcagggtttggctggagggcttgattggttcagtcctgacagcagagtcatcattaccac 40590  T
Q  153 tcgagacaaac 163  Q
    |||||||||||    
T  40591 tcgagacaaac 40601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17992376 - 17992308
Alignment:
Q  99 tttggctggaggacctgattggtttggccatggaagcagggtcatcattaccactcgagacaaacattt 167  Q
    ||||| |||||  |||| |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992376 tttggttggagagcctggttggcttggtcgtggcagcagagtcatcattaccactcgagacaaacattt 17992308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University