View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2566_high_3 (Length: 670)

Name: NF2566_high_3
Description: NF2566
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2566_high_3
NF2566_high_3
[»] chr3 (113 HSPs)
chr3 (1-542)||(25191313-25191854)
chr3 (1-350)||(22007-22357)
chr3 (1-347)||(47233596-47233944)
chr3 (1-350)||(5168762-5169117)
chr3 (1-349)||(52138734-52139084)
chr3 (55-347)||(35033136-35033428)
chr3 (1-349)||(28245371-28245721)
chr3 (1-350)||(53519520-53519865)
chr3 (1-350)||(54278954-54279304)
chr3 (1-350)||(51447714-51448057)
chr3 (98-350)||(48508268-48508520)
chr3 (7-248)||(33272122-33272370)
chr3 (9-348)||(54128320-54128662)
chr3 (68-347)||(38850123-38850403)
chr3 (26-350)||(43694768-43695083)
chr3 (182-350)||(12096702-12096870)
chr3 (219-350)||(53262295-53262426)
chr3 (55-347)||(45289091-45289385)
chr3 (55-213)||(38060421-38060579)
chr3 (72-312)||(48953454-48953697)
chr3 (1-239)||(45728080-45728324)
chr3 (203-350)||(52156081-52156228)
chr3 (31-347)||(54424959-54425289)
chr3 (65-349)||(19676079-19676362)
chr3 (234-350)||(311306-311422)
chr3 (7-270)||(3186709-3186973)
chr3 (219-347)||(49042090-49042219)
chr3 (209-347)||(38060858-38060996)
chr3 (1-347)||(48734147-48734481)
chr3 (81-312)||(39235154-39235384)
chr3 (7-350)||(49503565-49503896)
chr3 (1-346)||(26490251-26490596)
chr3 (243-350)||(47555329-47555436)
chr3 (240-350)||(2133609-2133719)
chr3 (69-350)||(42510013-42510292)
chr3 (65-348)||(50960636-50960915)
chr3 (52-347)||(54364976-54365271)
chr3 (1-142)||(36820166-36820307)
chr3 (226-347)||(48712075-48712196)
chr3 (219-347)||(15296061-15296189)
chr3 (7-134)||(27917512-27917639)
chr3 (248-347)||(40106620-40106719)
chr3 (7-337)||(19757839-19758158)
chr3 (265-347)||(31566161-31566243)
chr3 (55-345)||(39600683-39600973)
chr3 (265-350)||(40273202-40273287)
chr3 (258-350)||(7895877-7895969)
chr3 (67-283)||(38430850-38431066)
chr3 (7-337)||(19736936-19737255)
chr3 (266-348)||(31454224-31454306)
chr3 (233-350)||(29601060-29601177)
chr3 (263-348)||(45486848-45486933)
chr3 (259-350)||(48532151-48532243)
chr3 (259-350)||(52927845-52927936)
chr3 (262-344)||(32170602-32170684)
chr3 (248-350)||(39208791-39208893)
chr3 (224-347)||(54422837-54422966)
chr3 (233-347)||(36304134-36304248)
chr3 (257-350)||(45374474-45374567)
chr3 (1-61)||(38850028-38850088)
chr3 (282-350)||(45834597-45834665)
chr3 (55-134)||(3987037-3987116)
chr3 (276-347)||(7278675-7278746)
chr3 (248-347)||(14415260-14415358)
chr3 (263-350)||(20208196-20208283)
chr3 (55-173)||(21200540-21200656)
chr3 (68-345)||(30294125-30294403)
chr3 (252-347)||(30797822-30797917)
chr3 (258-349)||(33271908-33271999)
chr3 (69-268)||(52678929-52679124)
chr3 (8-86)||(33307087-33307165)
chr3 (149-270)||(19162664-19162785)
chr3 (279-344)||(41529975-41530040)
chr3 (235-308)||(41842562-41842635)
chr3 (219-344)||(49841770-49841895)
chr3 (270-350)||(27893294-27893374)
chr3 (90-134)||(38181042-38181086)
chr3 (272-347)||(24778609-24778684)
chr3 (248-347)||(40991614-40991713)
chr3 (269-348)||(46148232-46148311)
chr3 (292-346)||(21862742-21862796)
chr3 (258-336)||(24541343-24541421)
chr3 (249-347)||(31337560-31337658)
chr3 (235-337)||(40116348-40116450)
chr3 (66-172)||(41842686-41842792)
chr3 (234-347)||(11284157-11284270)
chr3 (219-312)||(17022707-17022800)
chr3 (31-107)||(31337766-31337842)
chr3 (299-348)||(39512777-39512826)
chr3 (294-350)||(344769-344825)
chr3 (266-350)||(3987535-3987619)
chr3 (294-350)||(31146928-31146984)
chr3 (43-106)||(31454467-31454531)
chr3 (264-324)||(37351606-37351666)
chr3 (233-289)||(37779045-37779101)
chr3 (65-133)||(44134044-44134112)
chr3 (274-345)||(659734-659805)
chr3 (274-349)||(31260965-31261039)
chr3 (45-134)||(31453151-31453242)
chr3 (248-347)||(42026536-42026635)
chr3 (295-350)||(50249607-50249662)
chr3 (294-348)||(37083291-37083345)
chr3 (274-344)||(46367390-46367460)
chr3 (271-349)||(50631879-50631957)
chr3 (294-347)||(52882662-52882715)
chr3 (55-107)||(344951-345003)
chr3 (7-100)||(2340961-2341056)
chr3 (66-134)||(11581445-11581513)
chr3 (274-350)||(30332557-30332633)
chr3 (266-350)||(31452958-31453042)
chr3 (219-283)||(40116532-40116596)
chr3 (268-348)||(40672366-40672446)
chr3 (237-281)||(44571599-44571643)
[»] chr7 (138 HSPs)
chr7 (1-350)||(43281610-43281959)
chr7 (32-350)||(29650349-29650669)
chr7 (7-350)||(12841272-12841617)
chr7 (1-350)||(45836479-45836828)
chr7 (1-347)||(34869354-34869702)
chr7 (1-350)||(11593894-11594245)
chr7 (1-349)||(37617878-37618229)
chr7 (2-350)||(39906369-39906717)
chr7 (7-350)||(33349803-33350148)
chr7 (5-350)||(44855171-44855516)
chr7 (7-349)||(49029216-49029559)
chr7 (1-340)||(35906208-35906549)
chr7 (1-350)||(38606939-38607277)
chr7 (1-345)||(46355858-46356204)
chr7 (1-350)||(36651928-36652277)
chr7 (1-288)||(13859067-13859356)
chr7 (56-350)||(2885719-2886013)
chr7 (32-350)||(6374833-6375153)
chr7 (66-350)||(31682599-31682883)
chr7 (1-346)||(35558994-35559342)
chr7 (1-270)||(31005157-31005428)
chr7 (5-350)||(43491246-43491593)
chr7 (68-350)||(22349623-22349905)
chr7 (1-213)||(33072888-33073100)
chr7 (104-350)||(32631615-32631849)
chr7 (64-350)||(36869234-36869527)
chr7 (123-350)||(24598185-24598411)
chr7 (75-350)||(15682184-15682459)
chr7 (182-347)||(40979928-40980093)
chr7 (182-350)||(38900074-38900241)
chr7 (119-348)||(7273154-7273383)
chr7 (1-288)||(23404352-23404640)
chr7 (222-348)||(27648937-27649063)
chr7 (138-345)||(31681022-31681226)
chr7 (7-347)||(36136704-36137046)
chr7 (208-347)||(48919255-48919394)
chr7 (210-348)||(21078062-21078200)
chr7 (187-350)||(9210701-9210864)
chr7 (5-172)||(7272977-7273146)
chr7 (252-350)||(28208325-28208423)
chr7 (55-169)||(46014359-46014472)
chr7 (237-346)||(34035155-34035264)
chr7 (68-344)||(28627936-28628212)
chr7 (5-107)||(32630533-32630636)
chr7 (241-348)||(33073105-33073212)
chr7 (233-350)||(36101774-36101891)
chr7 (188-344)||(45601599-45601755)
chr7 (233-350)||(27893560-27893677)
chr7 (1-130)||(36514424-36514553)
chr7 (248-347)||(33732017-33732114)
chr7 (219-355)||(44951309-44951445)
chr7 (219-346)||(14057632-14057759)
chr7 (219-346)||(14367660-14367787)
chr7 (274-345)||(24777170-24777241)
chr7 (269-348)||(31869101-31869180)
chr7 (2-307)||(8492276-8492580)
chr7 (237-350)||(42969870-42969983)
chr7 (219-350)||(42187595-42187726)
chr7 (240-348)||(47652722-47652830)
chr7 (185-348)||(1011167-1011329)
chr7 (68-350)||(12966025-12966301)
chr7 (14-172)||(19262609-19262766)
chr7 (7-61)||(36869577-36869631)
chr7 (187-304)||(35922376-35922492)
chr7 (228-347)||(8519046-8519165)
chr7 (259-346)||(24177628-24177714)
chr7 (66-350)||(26741891-26742177)
chr7 (227-347)||(40415169-40415295)
chr7 (292-350)||(31005432-31005490)
chr7 (56-142)||(40169640-40169726)
chr7 (9-134)||(43282347-43282477)
chr7 (209-346)||(34745891-34746028)
chr7 (55-304)||(47848664-47848912)
chr7 (222-349)||(28355322-28355450)
chr7 (294-350)||(29318792-29318848)
chr7 (219-310)||(36239833-36239924)
chr7 (219-350)||(38135210-38135341)
chr7 (283-350)||(40630652-40630719)
chr7 (274-348)||(7220965-7221039)
chr7 (31-172)||(25579252-25579394)
chr7 (263-349)||(25891086-25891172)
chr7 (55-133)||(27021906-27021984)
chr7 (233-347)||(37976403-37976517)
chr7 (262-347)||(20158671-20158756)
chr7 (233-350)||(33103094-33103211)
chr7 (243-344)||(47852265-47852366)
chr7 (285-345)||(6263479-6263539)
chr7 (55-131)||(7189442-7189518)
chr7 (266-350)||(14593953-14594037)
chr7 (266-350)||(16013476-16013560)
chr7 (294-350)||(28708610-28708666)
chr7 (294-350)||(29312218-29312274)
chr7 (277-349)||(31840442-31840514)
chr7 (185-288)||(1531420-1531523)
chr7 (72-135)||(14593772-14593835)
chr7 (233-347)||(28541943-28542058)
chr7 (252-347)||(30814125-30814220)
chr7 (236-307)||(31859046-31859117)
chr7 (51-133)||(5335906-5335988)
chr7 (266-348)||(19119423-19119505)
chr7 (292-350)||(30144982-30145040)
chr7 (54-108)||(45558351-45558405)
chr7 (54-172)||(48736074-48736192)
chr7 (294-351)||(5418303-5418360)
chr7 (265-350)||(33281087-33281171)
chr7 (65-142)||(42187470-42187547)
chr7 (266-347)||(45558531-45558611)
chr7 (278-350)||(1523856-1523928)
chr7 (294-350)||(20525049-20525105)
chr7 (219-310)||(44401164-44401253)
chr7 (72-135)||(16013295-16013358)
chr7 (9-133)||(28020906-28021032)
chr7 (117-176)||(33139206-33139265)
chr7 (248-347)||(34341395-34341494)
chr7 (251-322)||(34926547-34926618)
chr7 (302-348)||(21244282-21244328)
chr7 (219-301)||(21517426-21517508)
chr7 (262-312)||(26332908-26332958)
chr7 (7-61)||(27021994-27022048)
chr7 (276-354)||(28021146-28021224)
chr7 (7-61)||(39811897-39811951)
chr7 (264-350)||(48515370-48515456)
chr7 (269-350)||(4604751-4604832)
chr7 (66-135)||(30200175-30200244)
chr7 (273-346)||(34029677-34029750)
chr7 (65-130)||(38920794-38920859)
chr7 (274-347)||(40138948-40139021)
chr7 (247-344)||(40149016-40149112)
chr7 (292-349)||(41483714-41483771)
chr7 (66-134)||(18605359-18605427)
chr7 (66-134)||(18637563-18637631)
chr7 (66-134)||(18650997-18651065)
chr7 (7-55)||(24598440-24598488)
chr7 (30-126)||(27893769-27893865)
chr7 (67-135)||(36101977-36102045)
chr7 (266-347)||(38921086-38921169)
chr7 (294-350)||(47700053-47700108)
chr7 (278-350)||(48735898-48735970)
[»] chr1 (139 HSPs)
chr1 (1-349)||(696203-696554)
chr1 (1-350)||(4001452-4001803)
chr1 (1-350)||(1210679-1211030)
chr1 (1-350)||(30202127-30202478)
chr1 (1-349)||(34792347-34792697)
chr1 (1-350)||(8671854-8672203)
chr1 (1-347)||(49347393-49347741)
chr1 (7-350)||(22090034-22090381)
chr1 (1-349)||(9592668-9593018)
chr1 (9-350)||(51602000-51602341)
chr1 (1-350)||(15085868-15086207)
chr1 (1-350)||(32082753-32083093)
chr1 (7-348)||(51440764-51441107)
chr1 (7-323)||(8391712-8392030)
chr1 (55-350)||(38807668-38807963)
chr1 (55-350)||(4029112-4029407)
chr1 (83-350)||(25979228-25979495)
chr1 (1-304)||(32230997-32231302)
chr1 (1-346)||(43240380-43240729)
chr1 (147-350)||(37311752-37311955)
chr1 (180-347)||(52921195-52921362)
chr1 (128-350)||(39318193-39318413)
chr1 (7-345)||(37462878-37463213)
chr1 (185-349)||(4415469-4415633)
chr1 (7-312)||(9509258-9509565)
chr1 (66-349)||(32404525-32404807)
chr1 (31-344)||(39140484-39140794)
chr1 (10-347)||(18469082-18469419)
chr1 (95-346)||(52561590-52561841)
chr1 (229-347)||(46423216-46423331)
chr1 (219-348)||(32079176-32079303)
chr1 (229-350)||(4707218-4707338)
chr1 (7-309)||(9599432-9599736)
chr1 (55-347)||(2544589-2544875)
chr1 (227-350)||(10200303-10200426)
chr1 (219-350)||(41560383-41560514)
chr1 (237-350)||(24020264-24020377)
chr1 (233-349)||(43375596-43375712)
chr1 (7-350)||(27847797-27848146)
chr1 (65-350)||(48431396-48431688)
chr1 (258-349)||(44941774-44941865)
chr1 (279-349)||(3777258-3777328)
chr1 (257-347)||(21769711-21769801)
chr1 (219-308)||(16142019-16142108)
chr1 (257-350)||(28090691-28090784)
chr1 (258-347)||(42337749-42337838)
chr1 (222-350)||(19936617-19936745)
chr1 (258-350)||(44751677-44751769)
chr1 (274-349)||(29577461-29577536)
chr1 (219-349)||(52532614-52532744)
chr1 (232-349)||(6025772-6025889)
chr1 (274-347)||(28533676-28533749)
chr1 (246-347)||(40568410-40568511)
chr1 (219-346)||(29128937-29129065)
chr1 (262-348)||(8796406-8796492)
chr1 (248-350)||(34444539-34444641)
chr1 (269-350)||(51584948-51585029)
chr1 (55-347)||(36339804-36340095)
chr1 (219-350)||(3818853-3818984)
chr1 (262-349)||(50846759-50846846)
chr1 (248-350)||(6084158-6084260)
chr1 (261-346)||(22175341-22175426)
chr1 (262-347)||(25715326-25715411)
chr1 (249-350)||(31274398-31274499)
chr1 (219-348)||(36623884-36624012)
chr1 (264-349)||(38869081-38869166)
chr1 (55-135)||(1661420-1661500)
chr1 (274-350)||(5113952-5114028)
chr1 (234-344)||(15438800-15438906)
chr1 (275-347)||(38877343-38877415)
chr1 (294-350)||(43481795-43481851)
chr1 (262-350)||(50636278-50636366)
chr1 (295-350)||(37430417-37430472)
chr1 (220-299)||(44905404-44905483)
chr1 (31-350)||(52832011-52832330)
chr1 (259-345)||(1290033-1290119)
chr1 (292-350)||(4318842-4318900)
chr1 (7-129)||(14226047-14226169)
chr1 (122-308)||(27520246-27520428)
chr1 (292-350)||(41165509-41165567)
chr1 (19-134)||(43423671-43423788)
chr1 (233-350)||(5338881-5338998)
chr1 (219-288)||(7762496-7762565)
chr1 (233-310)||(48865744-48865821)
chr1 (262-347)||(50257767-50257852)
chr1 (10-108)||(52561850-52561950)
chr1 (274-350)||(1704836-1704912)
chr1 (274-350)||(10569068-10569144)
chr1 (47-135)||(13827929-13828017)
chr1 (1-134)||(18793201-18793336)
chr1 (238-342)||(19908040-19908144)
chr1 (262-330)||(29808053-29808121)
chr1 (68-172)||(35828725-35828829)
chr1 (295-350)||(2914120-2914175)
chr1 (227-350)||(11941577-11941700)
chr1 (55-142)||(40416361-40416448)
chr1 (185-283)||(8628150-8628248)
chr1 (265-351)||(16272818-16272903)
chr1 (300-350)||(38758017-38758067)
chr1 (263-349)||(45510831-45510917)
chr1 (262-343)||(27072491-27072572)
chr1 (278-347)||(33560858-33560927)
chr1 (294-346)||(4590533-4590585)
chr1 (294-350)||(7133299-7133355)
chr1 (250-350)||(12930308-12930408)
chr1 (269-345)||(15437130-15437206)
chr1 (294-350)||(26299297-26299353)
chr1 (274-350)||(32111986-32112062)
chr1 (295-347)||(43898439-43898491)
chr1 (260-336)||(48801625-48801700)
chr1 (266-349)||(14224286-14224368)
chr1 (67-134)||(27637846-27637913)
chr1 (264-335)||(30445304-30445375)
chr1 (248-347)||(35828562-35828661)
chr1 (262-353)||(52633166-52633257)
chr1 (295-350)||(52814291-52814346)
chr1 (219-312)||(8676897-8676993)
chr1 (274-344)||(16943364-16943434)
chr1 (266-324)||(28528556-28528614)
chr1 (233-343)||(29577147-29577256)
chr1 (65-131)||(37263331-37263397)
chr1 (65-134)||(52073675-52073745)
chr1 (66-135)||(10272260-10272329)
chr1 (219-304)||(11331247-11331332)
chr1 (219-304)||(11489268-11489353)
chr1 (317-350)||(22930645-22930678)
chr1 (265-330)||(26113456-26113521)
chr1 (294-351)||(42539208-42539265)
chr1 (293-346)||(44008806-44008859)
chr1 (262-347)||(50806864-50806949)
chr1 (65-133)||(4380013-4380081)
chr1 (68-172)||(5338727-5338831)
chr1 (296-348)||(8194721-8194773)
chr1 (299-347)||(12231592-12231640)
chr1 (63-171)||(13827746-13827854)
chr1 (55-131)||(51812515-51812591)
chr1 (233-281)||(51812677-51812725)
chr1 (294-346)||(52292268-52292320)
chr1 (235-307)||(52900682-52900754)
[»] chr2 (117 HSPs)
chr2 (1-350)||(38429818-38430168)
chr2 (1-350)||(45367622-45367972)
chr2 (1-350)||(41197224-41197576)
chr2 (1-350)||(3866006-3866357)
chr2 (1-347)||(11992108-11992454)
chr2 (5-350)||(12734639-12734985)
chr2 (1-347)||(41763043-41763389)
chr2 (1-346)||(3243654-3243999)
chr2 (1-354)||(36183385-36183740)
chr2 (7-345)||(8180720-8181060)
chr2 (1-347)||(38452686-38453037)
chr2 (55-350)||(25834671-25834963)
chr2 (8-347)||(18424378-18424716)
chr2 (55-351)||(2610578-2610874)
chr2 (1-350)||(4807526-4807880)
chr2 (86-350)||(451645-451909)
chr2 (1-321)||(23997551-23997858)
chr2 (119-350)||(7326157-7326388)
chr2 (122-350)||(39029638-39029872)
chr2 (136-348)||(28508749-28508961)
chr2 (72-348)||(24583630-24583907)
chr2 (182-350)||(35643065-35643233)
chr2 (179-347)||(31959635-31959803)
chr2 (223-350)||(30306190-30306317)
chr2 (1-350)||(6237750-6238102)
chr2 (245-350)||(3635320-3635425)
chr2 (236-350)||(227360-227474)
chr2 (185-346)||(45543074-45543234)
chr2 (65-350)||(12141544-12141829)
chr2 (233-350)||(9496034-9496151)
chr2 (219-347)||(9996623-9996754)
chr2 (1-141)||(16097192-16097338)
chr2 (226-350)||(38328367-38328489)
chr2 (55-347)||(38434941-38435234)
chr2 (219-350)||(12882042-12882173)
chr2 (55-350)||(43751944-43752239)
chr2 (269-350)||(15025698-15025779)
chr2 (189-350)||(43573127-43573287)
chr2 (233-344)||(19336896-19337007)
chr2 (222-348)||(30743686-30743812)
chr2 (65-346)||(18958907-18959192)
chr2 (63-135)||(43238305-43238377)
chr2 (259-350)||(9531597-9531688)
chr2 (63-350)||(44437718-44438005)
chr2 (263-349)||(12520060-12520146)
chr2 (274-347)||(12474927-12475000)
chr2 (277-350)||(17670680-17670753)
chr2 (263-348)||(19863432-19863517)
chr2 (263-348)||(19867764-19867849)
chr2 (263-348)||(19872665-19872750)
chr2 (193-350)||(33287549-33287706)
chr2 (220-350)||(35755242-35755376)
chr2 (193-345)||(13149460-13149612)
chr2 (250-346)||(39709202-39709298)
chr2 (219-331)||(41545559-41545671)
chr2 (219-350)||(8197538-8197669)
chr2 (219-350)||(8202298-8202429)
chr2 (7-350)||(9556366-9556710)
chr2 (276-350)||(43832309-43832383)
chr2 (209-350)||(12489799-12489940)
chr2 (274-347)||(17429259-17429332)
chr2 (277-350)||(17626284-17626357)
chr2 (7-134)||(23714474-23714600)
chr2 (7-134)||(24102146-24102272)
chr2 (1-135)||(9578915-9579049)
chr2 (233-344)||(45077895-45078008)
chr2 (226-350)||(6219126-6219250)
chr2 (222-347)||(11412865-11412992)
chr2 (266-312)||(19334187-19334233)
chr2 (269-350)||(15015149-15015230)
chr2 (262-343)||(33504421-33504502)
chr2 (264-345)||(34931631-34931712)
chr2 (262-350)||(3481351-3481439)
chr2 (1-134)||(4598775-4598912)
chr2 (260-348)||(13443907-13443995)
chr2 (233-309)||(36650610-36650686)
chr2 (270-350)||(42543440-42543520)
chr2 (55-102)||(227312-227359)
chr2 (2-61)||(2610463-2610522)
chr2 (7-101)||(19337096-19337191)
chr2 (267-350)||(42549834-42549917)
chr2 (276-350)||(25384680-25384754)
chr2 (285-347)||(36993755-36993816)
chr2 (269-346)||(624687-624764)
chr2 (271-340)||(4598569-4598638)
chr2 (266-347)||(5758995-5759076)
chr2 (301-350)||(8560803-8560852)
chr2 (294-347)||(10516749-10516802)
chr2 (294-347)||(16521007-16521060)
chr2 (249-354)||(17581643-17581748)
chr2 (266-350)||(12470894-12470978)
chr2 (294-350)||(15775842-15775898)
chr2 (264-348)||(28960210-28960294)
chr2 (232-348)||(32402667-32402783)
chr2 (274-350)||(33393319-33393394)
chr2 (191-352)||(37470124-37470289)
chr2 (249-344)||(186135-186230)
chr2 (55-172)||(3481134-3481248)
chr2 (295-350)||(14444899-14444954)
chr2 (273-346)||(887065-887139)
chr2 (233-271)||(4682253-4682291)
chr2 (275-349)||(14197205-14197279)
chr2 (266-347)||(33594272-33594354)
chr2 (233-287)||(36616856-36616910)
chr2 (57-135)||(38860165-38860243)
chr2 (52-129)||(6218954-6219031)
chr2 (55-108)||(11412711-11412764)
chr2 (317-350)||(14530532-14530565)
chr2 (274-323)||(19224990-19225039)
chr2 (8-49)||(24583906-24583947)
chr2 (294-347)||(32706472-32706525)
chr2 (294-343)||(45482989-45483038)
chr2 (281-345)||(522445-522509)
chr2 (68-108)||(786833-786873)
chr2 (252-324)||(3720438-3720510)
chr2 (280-324)||(9078792-9078836)
chr2 (78-134)||(41858744-41858800)
[»] chr4 (163 HSPs)
chr4 (1-347)||(27450180-27450521)
chr4 (1-350)||(436163-436514)
chr4 (7-347)||(48622543-48622883)
chr4 (1-347)||(31959814-31960162)
chr4 (1-350)||(48174090-48174441)
chr4 (7-350)||(52569512-52569857)
chr4 (1-350)||(33227143-33227494)
chr4 (1-348)||(1777016-1777363)
chr4 (9-350)||(4440797-4441138)
chr4 (1-349)||(33190846-33191196)
chr4 (1-348)||(56375224-56375573)
chr4 (1-350)||(53707728-53708079)
chr4 (10-350)||(39100533-39100872)
chr4 (84-348)||(32479057-32479321)
chr4 (9-348)||(27983142-27983476)
chr4 (1-350)||(37797786-37798136)
chr4 (1-350)||(43433852-43434209)
chr4 (1-347)||(23906297-23906649)
chr4 (7-352)||(28236125-28236469)
chr4 (1-312)||(37773486-37773798)
chr4 (13-350)||(46582823-46583160)
chr4 (1-349)||(47265193-47265550)
chr4 (89-350)||(8286455-8286724)
chr4 (55-346)||(26037506-26037797)
chr4 (1-321)||(50286905-50287217)
chr4 (56-340)||(39708424-39708708)
chr4 (57-344)||(20192025-20192311)
chr4 (193-350)||(21528416-21528573)
chr4 (1-348)||(51421666-51422013)
chr4 (160-350)||(21236953-21237143)
chr4 (193-350)||(6957726-6957883)
chr4 (31-344)||(1793424-1793741)
chr4 (193-350)||(12494791-12494948)
chr4 (1-283)||(41009414-41009698)
chr4 (7-350)||(45204837-45205190)
chr4 (36-300)||(20591353-20591613)
chr4 (1-330)||(20601669-20601994)
chr4 (183-347)||(51811280-51811442)
chr4 (1-350)||(1211389-1211738)
chr4 (193-342)||(7947065-7947214)
chr4 (149-297)||(50679588-50679736)
chr4 (1-109)||(12494684-12494794)
chr4 (5-304)||(16002865-16003165)
chr4 (183-346)||(4548140-4548303)
chr4 (99-350)||(20821001-20821255)
chr4 (237-350)||(19154860-19154973)
chr4 (242-350)||(19969358-19969466)
chr4 (185-350)||(35690391-35690556)
chr4 (233-350)||(55007914-55008031)
chr4 (219-347)||(28550455-28550583)
chr4 (219-350)||(31043226-31043357)
chr4 (1-133)||(31458962-31459098)
chr4 (123-348)||(28351617-28351842)
chr4 (259-350)||(883357-883448)
chr4 (219-350)||(31961263-31961394)
chr4 (265-350)||(19061932-19062017)
chr4 (272-348)||(49939733-49939809)
chr4 (186-272)||(50862764-50862851)
chr4 (187-346)||(53518325-53518483)
chr4 (248-350)||(2589255-2589357)
chr4 (7-172)||(25257756-25257921)
chr4 (233-350)||(25574992-25575109)
chr4 (233-350)||(56225236-56225353)
chr4 (262-350)||(13805262-13805350)
chr4 (222-350)||(31459151-31459279)
chr4 (238-350)||(34208266-34208378)
chr4 (262-349)||(12443292-12443379)
chr4 (271-350)||(32633403-32633482)
chr4 (55-142)||(41192826-41192913)
chr4 (283-350)||(50238612-50238679)
chr4 (283-350)||(50238698-50238765)
chr4 (266-344)||(13262413-13262491)
chr4 (209-351)||(26024846-26024988)
chr4 (66-135)||(35555859-35555928)
chr4 (219-344)||(37042667-37042792)
chr4 (266-351)||(50869876-50869961)
chr4 (17-134)||(51252674-51252791)
chr4 (262-350)||(6958236-6958323)
chr4 (270-350)||(7066496-7066575)
chr4 (294-350)||(30634103-30634159)
chr4 (262-350)||(51438642-51438730)
chr4 (233-345)||(55388213-55388325)
chr4 (219-350)||(37488245-37488376)
chr4 (55-142)||(44047553-44047640)
chr4 (295-350)||(45209202-45209257)
chr4 (276-347)||(47372915-47372986)
chr4 (55-134)||(54470197-54470276)
chr4 (248-350)||(5306479-5306581)
chr4 (65-347)||(46372024-46372306)
chr4 (188-350)||(53540413-53540575)
chr4 (7-135)||(10208978-10209104)
chr4 (1-87)||(35690238-35690326)
chr4 (297-350)||(46153940-46153993)
chr4 (294-350)||(1328611-1328667)
chr4 (262-350)||(29399001-29399089)
chr4 (266-350)||(35622673-35622757)
chr4 (295-347)||(38017319-38017371)
chr4 (266-350)||(42285700-42285784)
chr4 (268-348)||(44360289-44360369)
chr4 (299-351)||(56130404-56130456)
chr4 (233-348)||(41192229-41192344)
chr4 (295-350)||(44719358-44719413)
chr4 (189-276)||(55809061-55809148)
chr4 (65-131)||(2588991-2589056)
chr4 (294-348)||(15665330-15665384)
chr4 (72-134)||(26356626-26356688)
chr4 (246-288)||(41729509-41729551)
chr4 (75-165)||(42285882-42285972)
chr4 (196-350)||(42293262-42293416)
chr4 (17-108)||(49987378-49987471)
chr4 (264-350)||(54935348-54935434)
chr4 (269-346)||(3979124-3979201)
chr4 (248-345)||(22873601-22873698)
chr4 (266-347)||(31897428-31897509)
chr4 (18-135)||(50471479-50471596)
chr4 (294-350)||(4879106-4879162)
chr4 (43-104)||(10775665-10775728)
chr4 (294-350)||(15661869-15661925)
chr4 (262-350)||(20105515-20105603)
chr4 (65-133)||(30621418-30621486)
chr4 (274-350)||(32339768-32339844)
chr4 (1-133)||(33709853-33709992)
chr4 (248-340)||(34233031-34233123)
chr4 (219-283)||(41009283-41009347)
chr4 (66-134)||(42639233-42639301)
chr4 (295-347)||(49738550-49738602)
chr4 (294-342)||(50862860-50862908)
chr4 (262-345)||(1095642-1095725)
chr4 (295-346)||(4136744-4136795)
chr4 (274-345)||(34585691-34585762)
chr4 (264-347)||(36799657-36799740)
chr4 (55-134)||(44360077-44360155)
chr4 (43-169)||(50662365-50662492)
chr4 (65-135)||(17900480-17900550)
chr4 (227-309)||(36198977-36199059)
chr4 (14-131)||(45423566-45423681)
chr4 (72-169)||(50680746-50680844)
chr4 (294-348)||(50967027-50967081)
chr4 (65-131)||(55768717-55768783)
chr4 (65-131)||(55832973-55833039)
chr4 (26-108)||(56225027-56225109)
chr4 (317-350)||(3601416-3601449)
chr4 (274-347)||(8284348-8284421)
chr4 (266-350)||(10209237-10209319)
chr4 (266-350)||(10775468-10775550)
chr4 (235-288)||(26510558-26510611)
chr4 (55-172)||(28497480-28497596)
chr4 (55-108)||(36557268-36557321)
chr4 (65-142)||(49738809-49738886)
chr4 (294-350)||(7544528-7544584)
chr4 (1-61)||(25967555-25967615)
chr4 (295-347)||(28348287-28348339)
chr4 (233-309)||(28486089-28486165)
chr4 (219-307)||(30621241-30621329)
chr4 (284-348)||(30662042-30662106)
chr4 (266-350)||(35555647-35555731)
chr4 (266-350)||(36556757-36556841)
chr4 (274-350)||(40932921-40932997)
chr4 (266-350)||(45184130-45184214)
chr4 (295-347)||(46236719-46236771)
chr4 (295-347)||(50471757-50471809)
chr4 (262-350)||(54963648-54963735)
chr4 (233-329)||(55579200-55579295)
[»] chr5 (108 HSPs)
chr5 (1-347)||(3301778-3302126)
chr5 (1-350)||(4496316-4496669)
chr5 (7-350)||(28976856-28977199)
chr5 (32-340)||(38684932-38685242)
chr5 (1-348)||(24178444-24178793)
chr5 (7-350)||(12492381-12492729)
chr5 (1-347)||(16347380-16347726)
chr5 (1-348)||(1287578-1287937)
chr5 (1-350)||(1275199-1275549)
chr5 (1-345)||(2075475-2075822)
chr5 (1-350)||(10639231-10639587)
chr5 (15-350)||(14665658-14665997)
chr5 (68-346)||(20456776-20457054)
chr5 (154-349)||(13561384-13561579)
chr5 (123-350)||(2915493-2915719)
chr5 (55-349)||(34273017-34273297)
chr5 (160-350)||(14911267-14911457)
chr5 (1-350)||(26884686-26885037)
chr5 (196-350)||(29816513-29816667)
chr5 (209-347)||(16913882-16914021)
chr5 (238-348)||(5558314-5558424)
chr5 (226-350)||(2393038-2393161)
chr5 (7-316)||(32516498-32516806)
chr5 (55-300)||(14749297-14749542)
chr5 (245-350)||(30213755-30213860)
chr5 (14-138)||(31636129-31636253)
chr5 (185-348)||(28002-28165)
chr5 (1-307)||(36215434-36215730)
chr5 (105-343)||(38501422-38501660)
chr5 (219-350)||(28276392-28276523)
chr5 (257-348)||(18855799-18855890)
chr5 (227-350)||(39040918-39041041)
chr5 (228-350)||(418031-418153)
chr5 (31-142)||(15168756-15168869)
chr5 (248-350)||(32442123-32442224)
chr5 (43-135)||(33667194-33667286)
chr5 (233-347)||(43557833-43557947)
chr5 (276-349)||(408492-408565)
chr5 (233-350)||(14667939-14668056)
chr5 (219-335)||(9235201-9235316)
chr5 (266-345)||(3442873-3442952)
chr5 (219-349)||(11675683-11675814)
chr5 (228-347)||(31220546-31220664)
chr5 (262-344)||(7640510-7640592)
chr5 (248-350)||(20367076-20367178)
chr5 (55-172)||(79503-79620)
chr5 (227-348)||(2090575-2090696)
chr5 (239-348)||(36551320-36551429)
chr5 (236-301)||(42504293-42504358)
chr5 (72-347)||(1525651-1525923)
chr5 (262-350)||(6859578-6859666)
chr5 (188-348)||(7678601-7678760)
chr5 (9-134)||(10082952-10083079)
chr5 (1-125)||(11002645-11002769)
chr5 (274-350)||(28411885-28411961)
chr5 (294-350)||(42576239-42576295)
chr5 (275-342)||(2713146-2713213)
chr5 (248-343)||(8081967-8082059)
chr5 (269-344)||(11002424-11002499)
chr5 (55-173)||(42199278-42199394)
chr5 (16-98)||(418236-418318)
chr5 (262-348)||(2645187-2645273)
chr5 (274-348)||(38132545-38132619)
chr5 (270-347)||(9121078-9121155)
chr5 (55-108)||(14667753-14667806)
chr5 (66-135)||(28676596-28676665)
chr5 (233-330)||(30588615-30588712)
chr5 (262-350)||(21193649-21193737)
chr5 (69-133)||(37065533-37065597)
chr5 (266-349)||(5860035-5860118)
chr5 (67-349)||(7359259-7359539)
chr5 (274-349)||(32366187-32366262)
chr5 (219-285)||(2552936-2553002)
chr5 (65-135)||(2712944-2713014)
chr5 (285-347)||(9234106-9234168)
chr5 (233-283)||(17340500-17340550)
chr5 (65-142)||(18351112-18351190)
chr5 (222-350)||(14725675-14725803)
chr5 (248-353)||(23980127-23980232)
chr5 (294-347)||(27386569-27386622)
chr5 (273-350)||(27800036-27800113)
chr5 (275-348)||(42272687-42272760)
chr5 (248-312)||(18350937-18351001)
chr5 (72-132)||(21952364-21952424)
chr5 (32-133)||(31906626-31906729)
chr5 (274-350)||(41200343-41200419)
chr5 (262-349)||(9400708-9400795)
chr5 (7-62)||(28186955-28187010)
chr5 (267-342)||(28985285-28985360)
chr5 (233-348)||(38684648-38684763)
chr5 (248-323)||(41808105-41808180)
chr5 (228-350)||(41894229-41894358)
chr5 (219-309)||(6889147-6889237)
chr5 (294-347)||(3000968-3001021)
chr5 (289-350)||(4653476-4653537)
chr5 (299-348)||(5303681-5303730)
chr5 (65-134)||(6888993-6889062)
chr5 (274-349)||(9917458-9917530)
chr5 (233-346)||(12576861-12576974)
chr5 (274-347)||(28186782-28186855)
chr5 (222-271)||(36200886-36200935)
chr5 (299-347)||(7367172-7367220)
chr5 (234-338)||(15588399-15588503)
chr5 (295-351)||(36123178-36123234)
chr5 (266-349)||(37065677-37065761)
chr5 (294-330)||(39322096-39322132)
chr5 (188-288)||(43035104-43035204)
chr5 (68-172)||(43475243-43475347)
[»] chr8 (121 HSPs)
chr8 (1-350)||(42854001-42854352)
chr8 (7-350)||(36545087-36545434)
chr8 (2-349)||(36565239-36565588)
chr8 (7-350)||(40813262-40813609)
chr8 (33-350)||(11523720-11524040)
chr8 (1-346)||(36394949-36395298)
chr8 (67-344)||(12491141-12491418)
chr8 (1-299)||(39946791-39947091)
chr8 (1-348)||(18125109-18125454)
chr8 (42-344)||(8932679-8932982)
chr8 (139-350)||(42469724-42469935)
chr8 (1-330)||(2796489-2796818)
chr8 (96-350)||(21121177-21121430)
chr8 (1-347)||(45419173-45419517)
chr8 (13-347)||(8879446-8879776)
chr8 (192-350)||(14742079-14742234)
chr8 (1-227)||(18751996-18752221)
chr8 (85-304)||(26904950-26905168)
chr8 (166-350)||(2027631-2027815)
chr8 (80-350)||(37077768-37078034)
chr8 (123-343)||(12025847-12026058)
chr8 (226-350)||(15215409-15215533)
chr8 (219-348)||(25473402-25473531)
chr8 (235-347)||(44529395-44529507)
chr8 (238-350)||(44047529-44047641)
chr8 (219-346)||(25288918-25289045)
chr8 (219-346)||(25300253-25300380)
chr8 (233-350)||(490503-490620)
chr8 (219-347)||(29520803-29520931)
chr8 (1-75)||(12492116-12492190)
chr8 (36-153)||(12796894-12797011)
chr8 (188-350)||(35643605-35643765)
chr8 (219-348)||(45041315-45041443)
chr8 (219-350)||(30559847-30559983)
chr8 (74-350)||(32930970-32931245)
chr8 (32-312)||(43904700-43904984)
chr8 (1-350)||(32043524-32043872)
chr8 (188-347)||(2216411-2216568)
chr8 (7-158)||(6510617-6510768)
chr8 (8-106)||(25985462-25985560)
chr8 (295-349)||(39967497-39967551)
chr8 (55-348)||(39953263-39953556)
chr8 (233-350)||(42584527-42584643)
chr8 (274-350)||(27556299-27556375)
chr8 (269-353)||(30689939-30690023)
chr8 (219-347)||(35914601-35914729)
chr8 (262-350)||(41031417-41031505)
chr8 (262-350)||(41031523-41031611)
chr8 (258-350)||(8255528-8255622)
chr8 (187-350)||(28169514-28169676)
chr8 (275-349)||(1928585-1928659)
chr8 (275-349)||(10668495-10668569)
chr8 (233-350)||(21425214-21425331)
chr8 (248-349)||(23492217-23492318)
chr8 (268-353)||(36042401-36042486)
chr8 (6-107)||(13986433-13986536)
chr8 (219-346)||(14459049-14459177)
chr8 (237-350)||(31715992-31716107)
chr8 (274-350)||(32276894-32276970)
chr8 (274-350)||(32569707-32569783)
chr8 (262-346)||(36143538-36143622)
chr8 (266-349)||(30812814-30812897)
chr8 (264-346)||(18473973-18474055)
chr8 (266-350)||(7531641-7531725)
chr8 (295-347)||(12611727-12611779)
chr8 (295-343)||(26055651-26055699)
chr8 (285-349)||(35323993-35324057)
chr8 (194-346)||(35362651-35362803)
chr8 (230-350)||(41444336-41444456)
chr8 (269-349)||(43733410-43733490)
chr8 (248-344)||(44699649-44699745)
chr8 (63-142)||(2776434-2776513)
chr8 (262-349)||(10824187-10824274)
chr8 (266-341)||(16351578-16351653)
chr8 (232-347)||(26363655-26363768)
chr8 (248-351)||(30198262-30198365)
chr8 (7-142)||(30748399-30748534)
chr8 (31-98)||(33666748-33666814)
chr8 (7-135)||(44681251-44681381)
chr8 (300-350)||(1064955-1065005)
chr8 (18-165)||(7046285-7046434)
chr8 (19-142)||(9695583-9695708)
chr8 (65-107)||(25985839-25985881)
chr8 (265-343)||(39702154-39702232)
chr8 (268-351)||(41212064-41212149)
chr8 (252-345)||(2518400-2518493)
chr8 (297-350)||(16921451-16921504)
chr8 (274-347)||(35646930-35647003)
chr8 (67-172)||(36143367-36143472)
chr8 (266-351)||(38901815-38901900)
chr8 (69-121)||(7103274-7103326)
chr8 (5-61)||(15215559-15215615)
chr8 (29-102)||(30113442-30113517)
chr8 (306-350)||(32978115-32978159)
chr8 (234-345)||(16917352-16917462)
chr8 (219-270)||(25439479-25439530)
chr8 (194-321)||(38391919-38392046)
chr8 (294-349)||(39651026-39651081)
chr8 (274-344)||(1313773-1313843)
chr8 (295-349)||(11129951-11130004)
chr8 (233-312)||(12966347-12966428)
chr8 (248-350)||(14903744-14903846)
chr8 (252-330)||(16035744-16035822)
chr8 (7-101)||(13171895-13171991)
chr8 (5-79)||(25288840-25288916)
chr8 (5-79)||(25300175-25300251)
chr8 (237-346)||(36069774-36069883)
chr8 (1-54)||(37077699-37077752)
chr8 (65-126)||(41444547-41444608)
chr8 (296-348)||(4558207-4558259)
chr8 (219-347)||(4955345-4955473)
chr8 (294-350)||(12985919-12985975)
chr8 (295-347)||(16971772-16971824)
chr8 (264-312)||(30456329-30456377)
chr8 (71-107)||(30456452-30456488)
chr8 (188-312)||(30783077-30783201)
chr8 (298-350)||(35085134-35085186)
chr8 (294-350)||(40982893-40982949)
chr8 (263-351)||(42493426-42493514)
chr8 (188-283)||(45512558-45512654)
chr8 (65-133)||(45512709-45512777)
[»] chr6 (64 HSPs)
chr6 (1-350)||(5258145-5258498)
chr6 (1-350)||(28085310-28085661)
chr6 (1-347)||(35043441-35043789)
chr6 (1-312)||(21351872-21352183)
chr6 (7-346)||(608099-608442)
chr6 (1-347)||(9706710-9707052)
chr6 (7-344)||(30031196-30031535)
chr6 (7-350)||(32755859-32756206)
chr6 (1-350)||(20427633-20427984)
chr6 (7-307)||(5631758-5632064)
chr6 (1-350)||(14030740-14031080)
chr6 (42-350)||(12890559-12890860)
chr6 (9-213)||(10099993-10100197)
chr6 (76-349)||(30679417-30679680)
chr6 (188-350)||(34143762-34143924)
chr6 (188-350)||(34156378-34156540)
chr6 (67-304)||(33496963-33497198)
chr6 (1-348)||(9593709-9594060)
chr6 (228-350)||(3206456-3206578)
chr6 (238-350)||(31819004-31819116)
chr6 (236-347)||(34934830-34934941)
chr6 (130-308)||(5080905-5081083)
chr6 (7-278)||(28026896-28027167)
chr6 (119-242)||(7133800-7133923)
chr6 (119-242)||(7136723-7136846)
chr6 (71-347)||(2689646-2689915)
chr6 (187-347)||(5095956-5096116)
chr6 (266-350)||(30789071-30789155)
chr6 (219-350)||(10098893-10099022)
chr6 (188-350)||(34502-34664)
chr6 (262-350)||(4245869-4245957)
chr6 (227-349)||(5897619-5897741)
chr6 (1-98)||(5080789-5080888)
chr6 (219-347)||(31818685-31818813)
chr6 (1-87)||(6056032-6056118)
chr6 (219-312)||(24665965-24666058)
chr6 (185-312)||(6055806-6055933)
chr6 (226-345)||(7492550-7492669)
chr6 (261-347)||(12119642-12119729)
chr6 (274-347)||(1615223-1615296)
chr6 (73-142)||(24665818-24665887)
chr6 (262-350)||(579615-579703)
chr6 (55-135)||(33084048-33084128)
chr6 (276-348)||(12133901-12133973)
chr6 (10-102)||(5095816-5095910)
chr6 (274-349)||(9109507-9109582)
chr6 (248-350)||(6293389-6293491)
chr6 (1-111)||(9568594-9568708)
chr6 (233-306)||(14389202-14389275)
chr6 (275-344)||(21886314-21886383)
chr6 (294-347)||(33730194-33730247)
chr6 (270-350)||(38976-39056)
chr6 (188-348)||(8364679-8364839)
chr6 (66-133)||(2079341-2079408)
chr6 (296-355)||(6906819-6906878)
chr6 (52-135)||(14389380-14389462)
chr6 (274-344)||(21089606-21089676)
chr6 (317-350)||(3127273-3127306)
chr6 (317-350)||(4878294-4878327)
chr6 (65-106)||(6641650-6641691)
chr6 (68-128)||(8364575-8364635)
chr6 (250-350)||(9568884-9568983)
chr6 (15-98)||(21870322-21870403)
chr6 (294-350)||(30642998-30643054)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (26-350)||(945-1269)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (1-350)||(31402-31753)
scaffold0018 (65-135)||(44080-44150)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-347)||(82655-83000)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (179-347)||(16692-16860)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (1-350)||(4277-4620)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (79-350)||(86606-86877)
scaffold0045 (1-61)||(86895-86955)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (135-350)||(4706-4921)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (193-350)||(25529-25686)
scaffold0157 (7-109)||(25683-25787)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (107-350)||(11546-11787)
scaffold0113 (1-133)||(11810-11946)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (219-348)||(485-614)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (219-350)||(14737-14868)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (257-350)||(28886-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (188-350)||(58223-58385)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (205-345)||(7580-7720)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (219-350)||(1519-1647)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (219-346)||(160325-160452)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (259-345)||(16438-16524)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (262-348)||(6771-6857)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (297-350)||(19149-19202)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (227-283)||(39481-39537)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 454; Significance: 0; HSPs: 113)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 542
Target Start/End: Original strand, 25191313 - 25191854
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25191313 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaaattggaagaaaat 25191412  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  25191413 agacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccggttaaaagaggtagaggaa 25191512  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25191513 gaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 25191612  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgagataatttaatat 400  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191613 ccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtcgttgtctttgtcactaaccctaaaagcgcttgatagcgagataatttaatat 25191712  T
Q  401 tttattttaagtaaattgtactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagtacatagatagattctcgtacttaccctttgagcaaagacaaca 500  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191713 ttgattttaagtaaattttactatataagtacataaataattatcctaaaaaacagtacatagatagattctcgtacttaccctttgagcaaagacaaca 25191812  T
Q  501 acaacaaaaaagagttaccctttgagcacaacaaaattacaa 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25191813 acaacaaaaaagagttaccctttgagcacaccaaaattacaa 25191854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 22007 - 22357
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22007 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 22106  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
     ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  22107 -taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtagagg 22205  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22206 aagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttg 22305  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22306 atctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 22357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47233944 - 47233596
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233944 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 47233845  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| || || |    
T  47233844 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagatgttgaag 47233745  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  47233744 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttg 47233645  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47233644 attcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 5168762 - 5169117
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 94  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5168762 ttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagttggta 5168861  T
Q  95 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    |||||||  |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  |||||||||||||    
T  5168862 gaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggta 5168961  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 294  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5168962 gaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtca 5169061  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5169062 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 5169117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 52138734 - 52139084
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138734 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 52138833  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  |||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  52138834 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 52138933  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| | |||||    
T  52138934 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgttatttg 52139033  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52139034 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 35033136 - 35033428
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35033136 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccattgtaaga 35033235  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033236 agagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 35033335  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35033336 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 28245371 - 28245721
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28245371 ttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 28245470  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |    
T  28245471 atagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagatg 28245570  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||    
T  28245571 aagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaacactatgacgtcatttg 28245670  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28245671 atccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53519520 - 53519865
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctata------gtagaaaagttgg 92  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  53519520 ttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtagaaaagttgg 53519619  T
Q  93 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg 192  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  53519620 tagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagg 53519719  T
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||            | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  53519720 tagaggaagacctaagaaaaccatt------------aaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaacactatgacgt 53519807  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53519808 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 53519865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 54278954 - 54279304
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54278954 ttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 54279053  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||| | ||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |    
T  54279054 ataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaag 54279153  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  54279154 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 54279253  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |  |||||  ||||||| ||||||||||    
T  54279254 atcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttgt 54279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 51448057 - 51447714
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51448057 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 51447958  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||       ||    
T  51447957 taggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga-------ga 51447865  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  51447864 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 51447765  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||  || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51447764 ttcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51447714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508520
Alignment:
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48508520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33272370 - 33272122
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctata----gtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||     |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||    
T  33272370 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatatatagtagaaaagttggtagaaa 33272271  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| | | ||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  33272270 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 33272172  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 248  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33272171 aagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 54128320 - 54128662
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  54128320 gatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctt 54128419  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    || || ||| | |||||||||| |||||| ||||||   |  ||| | |||| |||||| ||||||   |  ||| |  ||||||||||||||||| |||    
T  54128420 aggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcagatcgaaagaggtagaggaagaccta 54128519  T
Q  207 agaaaaccattt-gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatg 305  Q
      ||||| |||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  54128520 gaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatg 54128619  T
Q  306 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  54128620 taggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 347
Target Start/End: Original strand, 38850123 - 38850403
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||| ||||| ||    
T  38850123 gtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaagaagagtagatcgaa 38850222  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaata 266  Q
    ||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  || |||||     
T  38850223 tggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatgaattgaattcaaatt 38850322  T
Q  267 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  ||| |||||||||||    
T  38850323 tggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43695083 - 43694768
Alignment:
Q  26 gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgta 124  Q
    ||||||||||||||| ||||||||     ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||    
T  43695083 gacatgataggattaggaatgacag----agagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgta 43694988  T
Q  125 gagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaa 224  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||  |||||||||| ||  |||    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||    
T  43694987 gagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaag--gaa----gttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaa 43694894  T
Q  225 ccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||   ||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| || | ||||||    
T  43694893 ccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgatagaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtg 43694794  T
Q  325 tgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||    
T  43694793 ggataaagctgggttgttgttgttgt 43694768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12096870 - 12096702
Alignment:
Q  182 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  12096870 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 12096771  T
Q  282 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12096770 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12096702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262426
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 53262426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 45289385 - 45289091
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaa 152  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||  ||||||   || ||||    
T  45289385 agagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaa 45289286  T
Q  153 gaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga 252  Q
    |||||| |||||| |||||| | |   || ||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||    
T  45289285 gaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaagatctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatga 45289186  T
Q  253 gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45289185 gttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 213
Target Start/End: Original strand, 38060421 - 38060579
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  38060421 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaaga 38060520  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaac 213  Q
    |||| |||| |||||||| |||  |||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38060521 agagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaac 38060579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 72 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa-gacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| |||||| ||||   || |||||||||| |||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  171 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga---tttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    || |||  | ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||| ||||||   | || ||||||||||||| |||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcatta-aaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatat 48953499  T
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    | ||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  48953498 gatttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 45728080 - 45728324
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt---agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||  ||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45728080 ttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagtagaaaagttggtagaa 45728179  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagag-aagacccgtagataccgttgtaagaagag--aagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    | |||  | ||||| ||| ||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||   | ||||||||||| |||  || |||||||||| ||    
T  45728180 agtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagtcatgttaaaagagata 45728279  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 239  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  45728280 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 203 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52156228 - 52156081
Alignment:
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
    |||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  52156228 actaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcc 52156129  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  52156128 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 52156081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 128  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| || || || || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  129 gaagacccgtagataccgttgtaagaag-------agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 221  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||       || |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatcc 315  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || ||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccc 54424991  T
Q  316 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
     |||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54424990 cacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19676362 - 19676079
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | ||||| || | | | ||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||||    
T  19676362 ggggtagcacctatagtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatc 19676263  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 264  Q
    | || ||| |||  ||| | |||||||||| ||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19676262 agatagaggagagtcagatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaa 19676164  T
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| | | ||||||| || |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  19676163 tatgctgtatgatagagcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 311422 - 311306
Alignment:
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 333  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  311422 aagatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 311323  T
Q  334 ttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  311322 ttggttgttgttgttgt 311306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 3186709 - 3186973
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||| ||||||||| | |  |||| ||||| |||||||| |||||  || ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  3186709 tggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaataggc 3186808  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||||   ||||||  | ||||||||| |  |||||| || ||||| |  ||||| ||||||||| ||| || | |    
T  3186809 t-agatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaatacc 3186907  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 270  Q
    ||||||||| ||  || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3186908 taagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 49042090 - 49042219
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 317  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  49042090 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 49042189  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49042190 cttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |  |||| ||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaaat 48734382  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || ||||| || ||| | ||||||||||||||| | |||||  | || ||| |||||| |||||| |||||||  |   || | ||||||||||||||||    
T  48734381 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagaggaa 48734282  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    |  |            |||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||| | | | |||||    
T  48734281 ggcc------------ttgaaaaactattagagaagatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttgat 48734194  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  48734193 ccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 312
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  81 tagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacca 180  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||| |||||| |||||| | |  ||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  181 ggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 280  Q
    | | |||||||||||||||||| | || ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  281 acactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||| |||| | | | |||||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49503896 - 49503565
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggg--ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  49503896 tggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggc 49503797  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   ||  ||  || || |||||| ||||||  ||  | | ||| |||| ||||||||||| |    
T  49503796 ttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagacc 49503697  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||              ||||| ||||| |||||||||  ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||| || | |||| | | |||||||||||    
T  49503696 ta--------------gaaactattaggaaagatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatccat 49503611  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49503610 gtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 49503565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 26490251 - 26490596
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  |||| |||||  |||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26490251 ttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagagttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaat 26490350  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || ||||| || ||| |||||||||| | ||||||  | |||   || ||| |||||| |||||| || ||| |||| ||  ||| | |||| || ||||    
T  26490351 aggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattagatgaggcagtggaa 26490450  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    ||  ||  ||||| |   ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||| || |||   |||||| | |||| | | |||||||    
T  26490451 gatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatattatggcgtaatttgat 26490550  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||  |||| |||||||||    
T  26490551 ccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555329
Alignment:
Q  243 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  343 gttgttgt 350  Q
    ||||||||    
T  47555336 gttgttgt 47555329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 240 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2133719 - 2133609
Alignment:
Q  240 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 339  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  2133719 tagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggcttggtt 2133620  T
Q  340 gttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||    
T  2133619 gttgttgttgt 2133609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 69 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510013
Alignment:
Q  69 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaat 168  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||  |||||  |||||   || ||||| |||| |||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  169 ggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg 268  Q
    |||| | |  ||| | |  ||||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||| || | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttgt 42510013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50960915 - 50960636
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||     ||   || | |||||||| |||||    
T  50960915 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc----tatgttgtagaaagaagagtagatc 50960820  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 264  Q
    | |||||| |||  | | |  ||||||| ||||||||| |||  ||||   |  ||||||| ||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  50960819 agatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaa 50960720  T
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| | | ||||| || ||||   | ||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  50960719 tatggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54365271 - 54364976
Alignment:
Q  52 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga--agacccgtagataccgttg 149  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||  | ||| |||||| |  ||     
T  54365271 attagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctatta 54365173  T
Q  150 taagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaa 249  Q
    |||| |||| |||||||||| || | |  |||   |  ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | ||    
T  54365172 taaggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaa 54365073  T
Q  250 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  54365072 tgtgttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga-ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 36820307 - 36820166
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| |    
T  36820307 ttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagagagagttggggtagcacctatattagcaaagatggtggaaact 36820208  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    || ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  36820207 aggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagacccatagat 36820166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 226 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48712196 - 48712075
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    |||||| |||||||||||  |  ||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||||     
T  48712196 cattaggaaagatttagatattgatgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgg 48712097  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48712096 gataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 15296061 - 15296189
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||| ||||| || ||    
T  15296061 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccac 15296160  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15296161 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Original strand, 27917512 - 27917639
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||||||||||||| || |||  |||  ||||| |||||||  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  27917512 tggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaggaaataggctt 27917611  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  27917612 agatggtttggacatgtagaaagaagac 27917639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 19757839 - 19758158
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa---tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga 103  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||| |||||  | ||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19757839 tggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 19757938  T
Q  104 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 203  Q
     |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |||| |||||||||||||     
T  19757939 tttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggtagaggaagac 19758037  T
Q  204 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 303  Q
    |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  19758038 cta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatcca 19758125  T
Q  304 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19758126 tgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566161
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39600973 - 39600683
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||| | || |  ||     
T  39600973 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtggttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgagg 39600874  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| |||||| || ||| | |  ||| ||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||    
T  39600873 agagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagt 39600774  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    | ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||| || || | || |||| ||| |||||  ||||||| |||||    
T  39600773 tggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaaccaaccccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273202
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttgt 40273202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895877
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 7895877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 283
Target Start/End: Original strand, 38430850 - 38431066
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |   || | |||||||||||| |||| | ||||   || ||| |||||| ||||||     
T  38430850 ggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgtagagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcag 38430949  T
Q  167 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 266  Q
    |||||| |||  ||  | ||||||||||||||||||  ||  ||||| |   ||||||| |||    ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  38430950 atggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaaactattgtggaaggtttagaggttaatgagttggatccaaata 38431049  T
Q  267 tggtttttgatagaaca 283  Q
    |||||| ||||||||||    
T  38431050 tggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Original strand, 19736936 - 19737255
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa---tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga 103  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||||  | ||| |||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19736936 tggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 19737035  T
Q  104 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 203  Q
     |||| || |||   |||| |||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||   || | |||| |||| ||||||||     
T  19737036 tttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagttagatcaaaa-aggttgaggaagac 19737134  T
Q  204 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 303  Q
    |||            || |||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||| ||||  || ||||||||||    
T  19737135 cta------------gaaaaactattaggaaatatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacattatggtataatttgatcca 19737222  T
Q  304 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  19737223 tgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31454306 - 31454224
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31454306 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 29601060 - 29601177
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||  |    
T  29601060 aaagatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacgg 29601159  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  29601160 cttggttcttgttgttgt 29601177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45486933 - 45486848
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45486933 aatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532243
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca-tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48532243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927845
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttgt 52927845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Original strand, 32170602 - 32170684
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170602 aaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208893
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || | |||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  39208891 tgt 39208893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 54422966 - 54422837
Alignment:
Q  224 accattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat------catttgatccatgtagccgatccaa 317  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| || || |    
T  54422966 accattaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgacccca 54422867  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| ||| ||||||| || |||||||    
T  54422866 cttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Original strand, 36304134 - 36304248
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||| | ||||| || |    
T  36304134 aaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaagg 36304233  T
Q  333 cttggttgttgttgt 347  Q
    || ||||||||||||    
T  36304234 ctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45374567 - 45374474
Alignment:
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||| | | |||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45374567 gatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45374474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 38850028 - 38850088
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  38850028 ttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagaga 38850088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 282 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834597
Alignment:
Q  282 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45834597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 3987037 - 3987116
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  3987037 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 3987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 350
Target Start/End: Original strand, 20208196 - 20208283
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||  |||||||||    
T  20208196 aatatggcatttgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttgt 20208283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Original strand, 21200540 - 21200656
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | |  |||||     
T  21200540 agagagaattggggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaagg 21200637  T
Q  155 agagaagatcaaatggaga 173  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  21200638 agagtagatcacatggaga 21200656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30294403 - 30294125
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat---gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    ||||||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||||| |||   |||   |||||||||||||  |||||| ||   |||||||||| | ||     
T  30294403 gtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccgtaagaagagtaaatt 30294304  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 264  Q
    | ||  || |||  | ||| |||||||||||||||||| |||  | ||| ||  || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||     
T  30294303 agattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaatgagttggatctaag 30294204  T
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||  ||||| || ||||| || | |  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  30294203 tatgatttatgataaaacactatggca--atttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | || ||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 52679124 - 52678929
Alignment:
Q  69 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgtt-gtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||| ||||||||||||||||||  ||||||   ||| ||||||| |  |||||  |    
T  52679124 tagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgtagat---gttggtaagaaaaatagatcgga 52679028  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||    
T  52679027 tggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaac--taagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgaattcaaatat 52678930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 86
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  8 ggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaa 86  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| |||||  || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19162785 - 19162664
Alignment:
Q  149 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 248  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| | ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  19162785 gtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaagagttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagatta 19162686  T
Q  249 atgagttagatccaaatatggt 270  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  19162685 atgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 344
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  279 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41842635 - 41842562
Alignment:
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  41842635 agatctagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtag 41842562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 344
Target Start/End: Original strand, 49841770 - 49841895
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||| ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || ||    
T  49841770 gagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccac 49841869  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
     ||| | | ||| |||||||||||||    
T  49841870 atagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Original strand, 27893294 - 27893374
Alignment:
Q  270 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||| || ||||||    
T  27893294 tttttgaaagaacactatggcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttgt 27893374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38181086 - 38181042
Alignment:
Q  90 tggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38181086 tggtagaaattagacttagatgatttagacatgttgagagaagac 38181042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778609
Alignment:
Q  272 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 348
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148311
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21862796 - 21862742
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  21862796 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31337658 - 31337560
Alignment:
Q  249 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  31337658 atgagttggatagaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40116450 - 40116348
Alignment:
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 334  Q
    |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||| |   ||||||| ||||| |||    
T  40116450 agatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggct 40116351  T
Q  335 tgg 337  Q
    |||    
T  40116350 tgg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 41842792 - 41842686
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| |  |||||||||||||| | |||||| | || ||||  |||| ||||||    
T  41842792 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagtaatgagagtagatca 41842693  T
Q  166 aatggag 172  Q
    |||||||    
T  41842692 aatggag 41842686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Original strand, 11284157 - 11284270
Alignment:
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 333  Q
    ||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||| ||    
T  11284157 aagatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgcatcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggc 11284256  T
Q  334 ttggttgttgttgt 347  Q
    ||| ||||||||||    
T  11284257 ttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17022800 - 17022707
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| | ||||   |||||| || |||||||||||    
T  17022800 gagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcatttaattcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 31337842 - 31337766
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgg-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  31337842 gataggattaa-aatgacagcattagagagaaagttgggtagcacctatagtagaaaagatggttgaaactaggctta 31337766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 344825 - 344769
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  344825 atttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 344769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 3987535 - 3987619
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| |||||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3987535 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 3987619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146984
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 31146984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 31454531 - 31454467
Alignment:
Q  43 aatgacatcattagagagaatgggggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  31454531 aatgacaacattagagagagtgttggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 31454467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 324
Target Start/End: Original strand, 37351606 - 37351666
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  37351606 atatggtttttgttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 37351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Original strand, 37779045 - 37779101
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga 289  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  37779045 aaagatttagagattaatgagctagatccgaatatggtttatgatagaacattatga 37779101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44134112 - 44134044
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| ||||| |||| ||||||    
T  44134112 ggggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 659734 - 659805
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  659734 tgatagaacattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31261039 - 31260965
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31261039 tgatagaacactgtgacatcatttgattcatg-cgccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 31260965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  45 tgacatcattaga-gagaatgggggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattagaagagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42026635 - 42026536
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||| ||| ||||||| || || || ||||||||  ||||||| |||||||    
T  42026635 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249662
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 50249662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37083345 - 37083291
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||| ||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37083345 atttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 46367460 - 46367390
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||| | || ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  46367460 tgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 271 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 50631957 - 50631879
Alignment:
Q  271 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||| |||| | || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  50631957 ttttgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52882715 - 52882662
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  52882715 atttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 345003 - 344951
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  345003 agagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgttagaaaataggctta 344951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 2341056 - 2340961
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||  ||  |||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||    
T  2341056 tggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaaagatggtggaaaat 2340961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 11581445 - 11581513
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  |||||||||||||||    
T  11581445 gggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagac 11581513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332557
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||| | || || ||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttgt 30332557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31453042 - 31452958
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | || |||||| | || |||||| |||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||    
T  31453042 atggtttttgacataatactatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtttttgt 31452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40116596 - 40116532
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116596 gagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 40672446 - 40672366
Alignment:
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  40672446 ggtttttgataggtcattatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 281
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 138)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 43281610 - 43281959
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281610 ttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 43281709  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  43281710 aggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaa 43281809  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43281810 gacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 43281909  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  43281910 ccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 43281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650669
Alignment:
Q  32 ataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  330 atgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttgt 29650669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12841617 - 12841272
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12841617 tggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 12841518  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  12841517 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 12841418  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12841417 taagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 12841318  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12841317 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12841272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45836828 - 45836479
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45836828 ttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 45836729  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||   ||||||   ||||||||||    
T  45836728 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggttat--gaggtagagg 45836631  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
     ||| ||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  45836630 gagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttg 45836531  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  45836530 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 45836479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 34869354 - 34869702
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869354 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 34869453  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||  || |||||||||||||||||    
T  34869454 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagttaaaagaggtagagg 34869553  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  34869554 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 34869653  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34869654 atccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 11593894 - 11594245
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11593894 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 11593993  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  11593994 atacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 11594093  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  11594094 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 11594193  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11594194 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 11594245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 37617878 - 37618229
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37617878 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 37617977  T
Q  99 a-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    | ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  37617978 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 37618077  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||   ||||||    
T  37618078 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcattt 37618177  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  37618178 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37618229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39906717 - 39906369
Alignment:
Q  2 tgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906717 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 39906618  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||||    
T  39906617 taggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagt--caagttaaaagaggtagagga 39906520  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  39906519 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 39906420  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39906419 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39906369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 33350148 - 33349803
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33350148 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttgctagaaaataggc 33350049  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  33350048 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 33349949  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  |||||||||||  | |||||||||||||    
T  33349948 taggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaacactatagcgtcatttgatccat 33349849  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33349848 gtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 33349803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44855516 - 44855171
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855516 gctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 44855417  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||||||    
T  44855416 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaagtagaggaaga 44855317  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||| | | ||||| |||    
T  44855316 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aacactatggcgtaatttggtcc 44855219  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44855218 atgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44855171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 349
Target Start/End: Original strand, 49029216 - 49029559
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  49029216 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 49029315  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  49029316 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 49029415  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  49029416 taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 49029515  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| | || |||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  49029516 gtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 35906549 - 35906208
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906549 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 35906450  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||| |||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  35906449 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 35906350  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  35906349 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 35906250  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  35906249 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 38606939 - 38607277
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta-gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38606939 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacattaagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaaa 38607038  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  || |||| |||||| ||||||    
T  38607039 taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttagaagagggagagga 38607138  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| ||||||            ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  38607139 agacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttga 38607226  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||  | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  38607227 tccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttgt 38607277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 46356204 - 46355858
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46356204 ttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 46356105  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    ||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  46356104 ataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 46356005  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  46356004 aaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaacactatgccatcatttg 46355905  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46355904 atccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 36651928 - 36652277
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36651928 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagggtaggggtggcatccatagtagaaaagttggtagaaaat 36652027  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| | |  || |||||||||||||||||||    
T  36652028 aggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagttaaaagaggtagaggaa 36652127  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  36652128 gacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 36652227  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  36652228 ccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttgt 36652277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 13859356 - 13859067
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13859356 ttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 13859257  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  13859256 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagagg 13859157  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13859156 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatg 13859067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2886013 - 2885719
Alignment:
Q  56 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 155  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  2886013 gagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtacgaa 2885914  T
Q  156 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 255  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  2885913 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaatgagtt 2885814  T
Q  256 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2885813 ggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2885719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 350
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375153
Alignment:
Q  32 ataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 229  Q
    |||||| |||||| | || |||||||| | |||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  330 atgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | ||||||||||||| |||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttgt 6375153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 66 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31682883 - 31682599
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  31682883 gggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatca 31682784  T
Q  166 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 265  Q
    ||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  31682783 aatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccatat 31682684  T
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31682683 ttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31682599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35559342 - 35558994
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacct-atagtagaaaagttggtagaa 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||  ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35559342 ttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaaagttggtagaa 35559243  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  35559242 aataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 35559143  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || ||||||| |||  ||||||||    
T  35559142 gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacattatagcatcattt 35559043  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||| || |  | |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  35559042 gatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 31005157 - 31005428
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005157 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 31005256  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    ||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  31005257 ataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 31005356  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 270  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  31005357 aagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Original strand, 43491246 - 43491593
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||| ||||||| | ||   |||| ||||| |||||||| |||| |  ||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43491246 gctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaaaattggtagaaaatag 43491345  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  43491346 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaaga 43491445  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     ||| |||||  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||| ||||    
T  43491446 cctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgatgtaatttcatcc 43491545  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43491546 atgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43491593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349905
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |  | | |||||||||| ||||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| | |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 22349905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 33072888 - 33073100
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33072888 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 33072987  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  33072988 aggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 33073087  T
Q  201 gaactaagaaaac 213  Q
    || ||| ||||||    
T  33073088 gacctaggaaaac 33073100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 350
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631849
Alignment:
Q  104 cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaa 203  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||     
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  204 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 303  Q
    ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  304 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32631849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36869527 - 36869234
Alignment:
Q  64 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | ||   |||||||| ||||    
T  36869527 gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagat 36869428  T
Q  164 caaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 263  Q
    ||||||||| |||  || |||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  36869427 caaatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaa 36869328  T
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc-------catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || || ||| ||||||||||||||| | ||||||||||       ||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  36869327 atttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgt 36869234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 123 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598185
Alignment:
Q  123 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 222  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  223 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| |  | |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  323 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttgt 24598185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 350
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682459
Alignment:
Q  75 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaa 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||||||| || ||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  175 gaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttttt 274  Q
     |  || || ||||||||| ||| || | ||| |||||| ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttgt 15682459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  182 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  282 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Original strand, 38900074 - 38900241
Alignment:
Q  182 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| |||    
T  38900074 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgattgaa 38900173  T
Q  282 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38900174 cactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38900241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 119 - 348
Target Start/End: Original strand, 7273154 - 7273383
Alignment:
Q  119 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 218  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||| ||||   |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||      
T  7273154 catgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactataa 7273253  T
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||    
T  7273254 gagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccac 7273353  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7273354 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 23404352 - 23404640
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23404352 ttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagttgggagaaa 23404451  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| ||||||  | || | ||||||||  |||||| |||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |    
T  23404452 ataggcttaga-cagtttggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaag 23404550  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||| ||| |||||  ||   ||||||||||| ||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404551 aagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  322 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  138 tagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaaga 237  Q
    ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||  |||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||   || |||||||||||||||| ||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  338 ttgttgtt 345  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Original strand, 36136704 - 36137046
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||| ||||||||||| ||   |||||| ||| |||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36136704 tggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagtc 36136803  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| |  ||| | ||| ||||||||| |||  |||||   || ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||| ||||||||||| |    
T  36136804 ttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcagaagaagtagaggaagacc 36136903  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||  ||||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||    | |||||||  ||    
T  36136904 tagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattatagggtaatttgatttat 36137003  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
     || ||||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36137004 ttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 347
Target Start/End: Original strand, 48919255 - 48919394
Alignment:
Q  208 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 307  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  48919255 gaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttgatccatgta 48919354  T
Q  308 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    | ||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  48919355 gtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 348
Target Start/End: Original strand, 21078062 - 21078200
Alignment:
Q  210 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  21078062 aaaccgttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagc 21078161  T
Q  310 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||    | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21078162 cgacttcatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210701
Alignment:
Q  187 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 286  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||| ||  |||||||  |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  287 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || | | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttgt 9210701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 7272977 - 7273146
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||| |||||||||  ||  |||||||||| |||||||| | ||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7272977 gctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 7273076  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 172  Q
     |||||||| ||| | |||||| |||||||||| |||||| |||  ||| |||||| |||||| ||||||    
T  7273077 gcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggag 7273146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 252 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208325
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28208325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 46014472 - 46014359
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||    
T  46014472 agagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg-gttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcctaaga 46014374  T
Q  155 agagaagatcaaatg 169  Q
    |||| ||||||||||    
T  46014373 agagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| | |||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  337 gttgttgttg 346  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28628212 - 28627936
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||| || ||| | |||||| |||||| ||| ||||||   || ||||| |||| |||||  |    
T  28628212 gtagcacctagagtagaaatgatggtggaaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccga 28628113  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    ||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |    
T  28628112 tggaggatagtcaaatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgt 28628013  T
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  28628012 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Original strand, 32630533 - 32630636
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32630533 gctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 32630631  T
Q  103 actta 107  Q
     ||||    
T  32630632 gctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 241 - 348
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  241 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  341 ttgttgtt 348  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36101891 - 36101774
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    ||||||||| || | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||  || || |||||||| ||||| |    
T  36101891 aaagatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataagg 36101792  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36101791 cttggttgttgttgttgt 36101774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 344
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |   | |||||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27893677 - 27893560
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||| | || | ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  27893677 aaagatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataagg 27893578  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27893577 cttggttgttgttgttgt 27893560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 36514553 - 36514424
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||  || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  36514553 ttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaact 36514454  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagaga 130  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  36514453 agacttaggtggtttgggcatgtagagaga 36514424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 355
Target Start/End: Original strand, 44951309 - 44951445
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    ||    
T  44951309 gagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatac 44951408  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 355  Q
    ||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  44951409 ttagtggtataaggtttggttgttgttgttgtagtct 44951445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 14057632 - 14057759
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14057632 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14057731  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14057732 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 14367660 - 14367787
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14367660 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagccaaccccac 14367759  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  14367760 ttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869101
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492276
Alignment:
Q  2 tgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| | |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| || || || |||  || |||||||| |||||  ||||||   || |||  ||||| |||||| |||||| ||    || ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| | | |||||  |||  |  |||  |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  300 tccatgta 307  Q
    || |||||    
T  8492283 tcaatgta 8492276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 350
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969983
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  337 gttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||| ||||||    
T  42969970 gttattgatgttgt 42969983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 42187595 - 42187726
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 317  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||| || |    
T  42187595 gagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgtaatttgatccatgtagccgacccca 42187693  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  42187694 cttagtgggataaggctttgttgttgttgttgt 42187726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 240 - 348
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  240 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 339  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | | ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  340 gttgttgtt 348  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 1011167 - 1011329
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||  ||  ||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||     
T  1011167 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgagagaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacat 1011265  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1011266 tatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 350
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966301
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||  ||||| || ||| | ||||||||||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    || |||  |     || |||  |  |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||| | ||||| || |||  ||||||    
T  12966125 tgaagacta-----gtcaaatcac-tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| | ||||| | || |||| |||  |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12966301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19262766 - 19262609
Alignment:
Q  14 gtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgat 113  Q
    ||||||| ||| ||||||||||  |||  |||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| || |    
T  19262766 gtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaacttggcttaggtggt 19262667  T
Q  114 ttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 172  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||   || |||||||||| |||||| ||||||    
T  19262666 ttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36869631 - 36869577
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  36869631 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 36869577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 304
Target Start/End: Original strand, 35922376 - 35922492
Alignment:
Q  187 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 286  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  35922376 aagaggtagaggaagacttaaaaaaaac-tttgagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacatta 35922474  T
Q  287 tgacatcatttgatccat 304  Q
    |||| | |||||||||||    
T  35922475 tgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8519165 - 8519046
Alignment:
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 327  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |  | || |||||||| ||    
T  8519165 ttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgaga 8519066  T
Q  328 taatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| ||| | ||||||||||    
T  8519065 taaggctcgattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 24177714 - 24177628
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  24177714 tccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26742177 - 26741891
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| || |||  ||||||||||| | ||||  |||||   || ||||| |||| ||||||    
T  26742177 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagagaaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatca 26742078  T
Q  166 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga--aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaa 263  Q
     || ||||| |  ||| | |  ||||| |||||||||  ||  ||||| ||   |||  ||| ||||| ||| |||| ||  | |||||||| || | ||    
T  26742077 gatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaactattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaa 26741978  T
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || |||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26741977 atatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgcaaaaatgcttggttgttgttgttgt 26741891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 347
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc------aactt 320  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||||||||| ||       ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  321 agtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Original strand, 31005432 - 31005490
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31005432 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31005490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 142
Target Start/End: Original strand, 40169640 - 40169726
Alignment:
Q  56 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||    
T  40169640 gagagaattggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagat 40169726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Original strand, 43282347 - 43282477
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt-----agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga 103  Q
    |||| |||||||| || ||||||||| |||||  ||||||| ||||     ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||     
T  43282347 gatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagtcggtggaaactagg 43282446  T
Q  104 cttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||| ||| || | ||||||||||||||||    
T  43282447 cttaggtgaattgggcatgtagagagaagac 43282477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 346
Target Start/End: Original strand, 34745891 - 34746028
Alignment:
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| || ||| || || | |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| ||||| | |  |||||| |||||||    
T  34745891 aaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtag 34745990  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  34745991 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 304
Target Start/End: Original strand, 47848664 - 47848912
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||  ||| || | ||  ||||     
T  47848664 agagagagttggggtagcgcctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaagg 47848763  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| |||||| |||||| | |  | | | |  ||||| |||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||| |||| ||||| | | | ||||||     
T  47848764 agagtagatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagc 47848862  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||    
T  47848863 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 349
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag-ccgatccaactt 320  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||| |   |||||||||| |||| | || || ||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  321 agtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 29318848 - 29318792
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29318848 atttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29318792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36239924 - 36239833
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 310  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||    
T  36239924 gagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38135341 - 38135210
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||| || |||||||| | |||| | | ||||||||||| |||| || || ||    
T  38135341 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatctagctgaccccac 38135242  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || ||| || || ||||||||||| |||||||    
T  38135241 ttggtgggacaaggcttggttgttattgttgt 38135210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 350
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630719
Alignment:
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40630719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 7220965 - 7221039
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||    
T  7220965 tgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25579394 - 25579252
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgggg-gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  |||| |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||    
T  25579394 gataggattagaaatgaccacattagagagagtggggagtagcacccatagcagaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagag 25579295  T
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 172  Q
    |||||  |||||| | || |||||||||| |||| | ||||||    
T  25579294 aagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggag 25579252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 349
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891172
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 27021984 - 27021906
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| || ||| | |||||||||||||||    
T  27021984 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Original strand, 37976403 - 37976517
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||| ||||||||||||| | ||  |||||   ||||| |    
T  37976403 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaattagatccatgtagccaaccccgcttagcaagataagg 37976502  T
Q  333 cttggttgttgttgt 347  Q
     ||||||||||||||    
T  37976503 tttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158671
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 33103094 - 33103211
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    ||||| |||||| | ||||||||  |||  |||||||||| ||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |    
T  33103094 aaagacttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataagg 33103193  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| || |||||||||    
T  33103194 cttggctgatgttgttgt 33103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 344
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  243 aggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| |||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  343 gt 344  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 345
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7189518 - 7189442
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||| | |||||||||||||    
T  7189518 agagagagttggggtcgcacctatagtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaa 7189442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594037
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013560
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| |   || | | || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 16013560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 28708610 - 28708666
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28708610 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttgt 28708666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 29312218 - 29312274
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29312218 atttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 349
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840514
Alignment:
Q  277 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31840514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1531523 - 1531420
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |  |||  ||||| ||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||  |||||||||     
T  1531523 aaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagcaaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacat 1531424  T
Q  285 tatg 288  Q
    ||||    
T  1531423 tatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Original strand, 14593772 - 14593835
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  14593772 cacctatagtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 14593835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28542058 - 28541943
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataat 331  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||  || |||||||| ||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||  || |||||||  |||||     
T  28542058 aaagatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataag 28541959  T
Q  332 gcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||    
T  28541958 gcttggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 307
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  236 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 307  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 133
Target Start/End: Original strand, 5335906 - 5335988
Alignment:
Q  51 cattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||    
T  5335906 cattagagagagttggggtagcatctatagtaggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaaga 5335988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19119505 - 19119423
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   || ||||||||||||    
T  19119505 atggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Original strand, 30144982 - 30145040
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  30144982 tcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtttttgt 30145040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Original strand, 45558351 - 45558405
Alignment:
Q  54 tagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45558351 tagagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttag 45558405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 48736192 - 48736074
Alignment:
Q  54 tagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 153  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| || |||   ||||||||| ||||||| || |||   || || ||    
T  48736192 tagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttag 48736093  T
Q  154 aagagaagatcaaatggag 172  Q
     |||| |||||||||||||    
T  48736092 gagagtagatcaaatggag 48736074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 351
Target Start/End: Original strand, 5418303 - 5418360
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5418303 atttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 5418360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Original strand, 33281087 - 33281171
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33281087 tatggtttcagatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacca-cttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 33281171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Original strand, 42187470 - 42187547
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| || ||||||    
T  42187470 ggggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcctgtagat 42187547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558611
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || ||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagtg-gataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523928
Alignment:
Q  278 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |  |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttgt 1523928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525049
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttgt 20525049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44401253 - 44401164
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 310  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | || ||||||  || ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  44401253 gagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtta--tcaaaatatgttttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Original strand, 16013295 - 16013358
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||    
T  16013295 cacctatagtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacc 16013358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Original strand, 28020906 - 28021032
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||| | |||||||||  || | |||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | | |||    
T  28020906 gatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtagaaaagatggtggaaacttggctt 28021005  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    || || ||| | |||||||||||||||    
T  28021006 aggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 176
Target Start/End: Original strand, 33139206 - 33139265
Alignment:
Q  117 gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaaga 176  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | | || ||||||||||    
T  33139206 gacatgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaaga 33139265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||| | |||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926547
Alignment:
Q  251 gagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 322  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||||   ||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttag 34926547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  302 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21517508 - 21517426
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 301  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||| | ||| |||| |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  21517508 gagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaatttgatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 27022048 - 27021994
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27022048 tggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagaga 27021994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 354
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021224
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 354  Q
    |||||||| |||||  || ||||| |||||||||| |  | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttgtcgtc 28021224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 61
Target Start/End: Original strand, 39811897 - 39811951
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  39811897 tggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagaga 39811951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Original strand, 48515370 - 48515456
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| | | |||| || ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  48515370 atatggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttgt 48515456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 4604751 - 4604832
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  4604751 gtttatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttgt 4604832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 30200244 - 30200175
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||| | |||||| | ||||||||    
T  30200244 gggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagacc 30200175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  273 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 130
Target Start/End: Original strand, 38920794 - 38920859
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  || ||| | ||||||||||||    
T  38920794 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagaga 38920859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40139021 - 40138948
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||| |||| ||||    
T  40139021 tgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 40149112 - 40149016
Alignment:
Q  247 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||| || | |||||||||| | ||||||||| |||| |   |||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40149112 caatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtagccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 349
Target Start/End: Original strand, 41483714 - 41483771
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  41483714 tcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605359
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18605359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637631
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18637631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651065
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| || |||||| || |||   ||||||||||||||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagac 18651065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 7 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 24598488 - 24598440
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta 55  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24598488 tggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccatta 24598440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27893865 - 27893769
Alignment:
Q  30 tgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 126  Q
    |||||||||||  || ||||  |||||||||| | | |||| |||||||||||||| || |||| |||||||| ||||| || |||  |||||||||    
T  27893865 tgataggattagaaacgacaatattagagagagttgaggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 36102045 - 36101977
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||||||| ||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  36102045 ggtagcacctataatagaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacc 36101977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921086
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag--ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||  |||| || |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47700108 - 47700053
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  47700108 atttgatccatgtagccgaccca-cttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 47700053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48735970 - 48735898
Alignment:
Q  278 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||| | || |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  48735970 agaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttgt 48735898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 139)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 696203 - 696554
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696203 ttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 696302  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  696303 ataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 696402  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta-tgacatcattt 297  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  696403 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactattggcgtcattt 696502  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  696503 gatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 696554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4001803 - 4001452
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4001803 ttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 4001704  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  4001703 ataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 4001604  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4001603 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctatgacatcatttg 4001504  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4001503 atccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4001452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1210679 - 1211030
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210679 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 1210778  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  1210779 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 1210878  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  1210879 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 1210978  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1210979 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1211030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30202478 - 30202127
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30202478 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaggttggtagaaa 30202379  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||    
T  30202378 ataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaagttaaaagaggtagagg 30202279  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  30202278 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 30202179  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30202178 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30202127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 34792697 - 34792347
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792697 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 34792598  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
     ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  34792597 gtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 34792498  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  34792497 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttg 34792398  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  34792397 atccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 34792347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 8671854 - 8672203
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8671854 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 8671953  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  8671954 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 8672053  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | |||||||||    
T  8672054 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgat 8672153  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| ||||| | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8672154 ccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 8672203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49347741 - 49347393
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49347741 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagtagaaaagttggtagaaa 49347642  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  49347641 ataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 49347542  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  49347541 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 49347442  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49347441 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 22090034 - 22090381
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090034 tggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 22090133  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||    
T  22090134 gcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaaggggtagaggaaga 22090233  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22090234 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 22090333  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22090334 atgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 22090381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 9592668 - 9593018
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9592668 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaa 9592767  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  9592768 ataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 9592867  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||||||  | |||||||    
T  9592868 aagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttg 9592967  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9592968 atccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 9593018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Original strand, 51602000 - 51602341
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51602000 gatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 51602099  T
Q  109 atgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 208  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  51602100 atggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 51602199  T
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  51602200 aaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatggcgtcatttgatccatgtag 51602299  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51602300 ccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51602341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 15085868 - 15086207
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15085868 ttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 15085967  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||    
T  15085968 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggtagagg 15086067  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||||||            ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15086068 aagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttg 15086155  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15086156 atccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15086207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32083093 - 32082753
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32083093 ttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 32082994  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  32082993 ataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 32082894  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca-tcattt 297  Q
    |||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  32082893 aagacctaagaaaac------------cattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactacggcagtcattt 32082806  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| || || |||| ||| ||||||||||    
T  32082805 gatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttgt 32082753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 51441107 - 51440764
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51441107 tggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 51441008  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||| |    
T  51441007 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaagttaaaggaggtagaggaagacc 51440908  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| | | ||||||||| |||    
T  51440907 taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactacggcgtcatttgattcat 51440808  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  51440807 gtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 323
Target Start/End: Original strand, 8391712 - 8392030
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8391712 tggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggt 8391811  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  || |||||| |||||| | ||||| |    
T  8391812 ttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaaaggaggtatatgaagacc 8391911  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  8391912 taagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccat 8392011  T
Q  305 gtagccgatccaacttagt 323  Q
    |||||| | || |||||||    
T  8392012 gtagccaaccccacttagt 8392030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38807963 - 38807668
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  38807963 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaaga 38807864  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| ||| || |||||| |||  ||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38807863 agagtagaccagatggaggagagtcagatcaaaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagt 38807764  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38807763 tggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38807668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029407
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | ||||||||| |||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 4029407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 83 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979228
Alignment:
Q  83 gaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccagg 182  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| ||||||| |||  ||||    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  183 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 282  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25979228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 32231302 - 32230997
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32231302 ttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaa 32231203  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  32231202 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 32231103  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| | |||||||||||||||   | |||||    
T  32231102 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacactatggtgtaatttg 32231003  T
Q  299 atccat 304  Q
    ||||||    
T  32231002 atccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 9e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 43240729 - 43240380
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  43240729 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattgataga 43240630  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 196  Q
    |||||| |||||||  |||   ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||| |||   | ||||||| |||||||    
T  43240629 aaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaagttaaaaaaggtaga 43240530  T
Q  197 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 296  Q
    |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||    
T  43240529 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 43240430  T
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  43240429 tgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 147 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37311955 - 37311752
Alignment:
Q  147 ttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 246  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37311955 ttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggt 37311856  T
Q  247 caatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  37311855 caatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 37311756  T
Q  347 ttgt 350  Q
    ||||    
T  37311755 ttgt 37311752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 347
Target Start/End: Original strand, 52921195 - 52921362
Alignment:
Q  180 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  52921195 aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatag 52921294  T
Q  280 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52921295 aacactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 128 - 350
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318413
Alignment:
Q  128 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 227  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  328 taatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttgt 39318413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 37463213 - 37462878
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||    
T  37463213 tggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagacagtagaaaataggctt 37463114  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt-taaaagaggtagaggaagaact 205  Q
    || || ||| | |   || |||| ||||  |||||| |||| ||| |||||| |||||| |||||| |||  | | |  |||||||||||||||  | ||    
T  37463113 aggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaaaaagaggtagaggattacct 37463017  T
Q  206 aagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatg 305  Q
    |  ||||| ||  ||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||    
T  37463016 agaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacattatggcgtaatttgatccatg 37462918  T
Q  306 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37462917 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 185 - 349
Target Start/End: Original strand, 4415469 - 4415633
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||     
T  4415469 aaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgattttttatagaacat 4415568  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | | ||||||  | ||  |||||||||||||||||    
T  4415569 tatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttg 4415633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Original strand, 9509258 - 9509565
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  9509258 tggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtaaaaaataggc 9509357  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| |  ||| | ||||||||||||||||| ||| || |  | |||   |||| |||||| |||||| |||  ||  ||| |||||||||||||||| |    
T  9509358 ttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcatattagaagaggtagaggaagacc 9509457  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||| |||||||    
T  9509458 tagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaacattatggcgtaattcgatccat 9509557  T
Q  305 gtagccga 312  Q
    ||||||||    
T  9509558 gtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 32404807 - 32404525
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||  |    
T  32404807 gggtaacacctatagtaaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaa 32404708  T
Q  166 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 265  Q
     |||||| | |  ||  | | |||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||     
T  32404707 gatggaggatagtcatatcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaac 32404608  T
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  32404607 atggtttatgatataacataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 344
Target Start/End: Original strand, 39140484 - 39140794
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 128  Q
    |||||||||| |||||| | |||||  |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||| || ||| | ||||||||||    
T  39140484 gataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctatagtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagaga 39140583  T
Q  129 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 228  Q
    |||||||  || ||   || ||| |||||| |||||| |||||  |||  ||| ||| ||||||||||||||   |||| |||   ||  ||||||| ||    
T  39140584 gaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagtcagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactat 39140678  T
Q  229 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 328  Q
    ||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  39140679 taggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggat 39140778  T
Q  329 aatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||||||||    
T  39140779 aatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18469419 - 18469082
Alignment:
Q  10 atgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||  ||||     
T  18469419 atgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagagttggggtaacacctatagtagagaagatgatagaaaataggattagg 18469320  T
Q  110 tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaaga 209  Q
    |  ||| ||||| ||| ||||||||  ||||||   || ||| |||||| | |||| ||||||||||  | | | |||||||||||| |||||  ||  |    
T  18469319 tagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaaaagaggtagatgaagacttagaa 18469220  T
Q  210 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||  ||  |||||||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||| ||||   | ||||| | |||||||     
T  18469219 aaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacattatggtgtaatttggttcatgtaga 18469120  T
Q  310 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| || |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  18469119 cgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  95 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  |||||   |  ||| |||||| |||||| |||||| |||   || ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 294  Q
    ||||||||  ||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  | ||||||| |||| |   |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 229 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  229 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  329 aatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || ||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32079303 - 32079176
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| || ||    
T  32079303 gagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccac 32079206  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  32079205 ttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707218
Alignment:
Q  229 tagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgat 328  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  329 aatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttgt 4707218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 9599736 - 9599432
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9599736 tggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagtagaaaagatggtagaaaataggc 9599637  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| || ||  | ||| || | ||| |||| | ||||    | |||  ||||| |||||| |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| |    
T  9599636 ttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcagatcataagaggtagaggaagacc 9599537  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||  ||||| |   ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||  |||| | | |||||||||||    
T  9599536 tagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaacgttatggcgtaatttgatccat 9599437  T
Q  305 gtagc 309  Q
    |||||    
T  9599436 gtagc 9599432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 2544589 - 2544875
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| |  | |||||     
T  2544589 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaagg 2544688  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||    |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||     ||||||| ||  |||||||||    
T  2544689 agagtagatcagatggaggatagtca-aacactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatgagt 2544782  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    | || | ||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  2544783 tggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10200426 - 10200303
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 326  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||   | ||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  10200426 attagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttaatggg 10200327  T
Q  327 ataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10200326 ataatgcttggttgttgttgttgt 10200303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 41560383 - 41560514
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| | | |||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  41560383 gagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 41560482  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41560483 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41560514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 237 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020264
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||| ||| ||||| |||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  337 gttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttgt 24020264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43375712 - 43375596
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  43375712 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaag 43375613  T
Q  333 cttggttgttgttgttg 349  Q
     ||||||||||||||||    
T  43375612 attggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27848146 - 27847797
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||| ||| |||||||||||  |  | |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  |    
T  27848146 tggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtagaaaataagc 27848048  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  ||| | | |||||||||||||||| |    
T  27848047 ttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtagaggaagacc 27847948  T
Q  205 taag-aaaaccatttgagaaaccattagaaa----agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    |  | ||||  ||  ||||||| | ||  ||    |||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||| |||| | | |||| |    
T  27847947 tttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgccgtaatttta 27847848  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||    
T  27847847 tccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttgt 27847797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48431688 - 48431396
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || ||||  ||||  ||||    
T  48431688 ggggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatc 48431589  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtc-------aatgagttag 257  Q
    | |||||| | |  | | ||| |||||||||||||||| | || ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||| |        |||||||| |    
T  48431588 agatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgg 48431489  T
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  48431488 atccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 48431396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 258 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941774
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44941774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  279 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16142108 - 16142019
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16142108 gagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28090784 - 28090691
Alignment:
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28090784 gatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 28090691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Original strand, 19936617 - 19936745
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 321  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  |  ||||    
T  19936617 aaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactccgctta 19936716  T
Q  322 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  19936717 gtgggataagacttgattgttgttgttgt 19936745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751769
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577536
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29577536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52532744 - 52532614
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| || ||    
T  52532744 gagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccac 52532645  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  52532644 ttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 232 - 349
Target Start/End: Original strand, 6025772 - 6025889
Alignment:
Q  232 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 331  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | ||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6025772 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatgatggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataat 6025871  T
Q  332 gcttggttgttgttgttg 349  Q
     |||||||||| ||||||    
T  6025872 acttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533749
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  246 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  346 gt 347  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 29128937 - 29129065
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat-ccatgtagccgatccaa 317  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||   | || |||| |||||||||||| || |    
T  29128937 gagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgatcccatgtagccgacccca 29129036  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  29129037 cttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Original strand, 8796406 - 8796492
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8796406 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444641
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||   | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  34444639 tgt 34444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 51584948 - 51585029
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| || || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51584948 gtttttgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 51585029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36340095 - 36339804
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||   || |||||     
T  36340095 agagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaagg 36339996  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
     | |  ||||| |||||| | | | || | |  ||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  36339995 cgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatgagt 36339897  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    | ||   ||| ||||||  ||||| |||| |||||  | |||||||||||||||| ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36339896 tggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3818984 - 3818853
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| |  ||||||||||||||||||||    ||    
T  3818984 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcac 3818885  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  3818884 ttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 3818853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Original strand, 50846759 - 50846846
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  50846759 aaatatagtttatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084260
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  6084258 tgt 6084260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 261 - 346
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  261 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25715411 - 25715326
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  25715411 aaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274398
Alignment:
Q  249 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||| | | ||||||||  |||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  349 gt 350  Q
    ||    
T  31274399 gt 31274398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36624012 - 36623884
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| | |    |||||||||||| ||| || ||    
T  36624012 gagaaactattagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggc-tgtaatgatccatgtagtcgaccctac 36623914  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36623913 ttagtgggataaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 349
Target Start/End: Original strand, 38869081 - 38869166
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  38869081 atatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 1661420 - 1661500
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  1661420 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagacc 1661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5114028
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttgt 5114028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 234 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15438906 - 15438800
Alignment:
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 333  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||| ||    
T  15438906 aagatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggc 15438811  T
Q  334 ttggttgttgt 344  Q
    |||||||||||    
T  15438810 ttggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481795
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43481795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 50636278 - 50636366
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  50636278 aaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttgt 50636366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430417
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgt 37430417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905404
Alignment:
Q  220 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttga 44905404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 52832011 - 52832330
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagaga 130  Q
    ||||||||| | || |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||||| || || |||||| | |||| || ||| | |||||  |||||    
T  52832011 gataggattcaaaaagacatcattaaagagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagaga 52832110  T
Q  131 agacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatta 230  Q
    |||||  |||||   ||||||   |||| |||| | |||||| |||  |   ||| || ||||||||||| | |||  |||||||   ||||||  ||||    
T  52832111 agaccgatagatgttgttgtacagagagtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtatta 52832210  T
Q  231 gaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    ||||||||||||||||  || ||||  || ||||||| ||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||| |||  ||| ||| |||||  |||||    
T  52832211 gaaaagatttagaggttgataagttgaatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataa 52832310  T
Q  331 tgcttggttgttgttgttgt 350  Q
       |||||||||||||||||    
T  52832311 gatttggttgttgttgttgt 52832330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4318900 - 4318842
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  4318900 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 4318842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 14226169 - 14226047
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||| |||||| | |  |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  14226169 tggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagagttgcagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaaataggctt 14226070  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagag 129  Q
    || || ||| | |||||||||||    
T  14226069 aggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27520428 - 27520246
Alignment:
Q  122 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta--agaaaaccatttg 219  Q
    |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||      ||| || || || |||||||||| |||||||  ||  | ||||| ||  |    
T  27520428 gtagagagaagacatgtagatgtcgttgtaagaagagtagatca------gaaaaatcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataag 27520335  T
Q  220 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||| |||||||    
T  27520334 agaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatgatagaacattatgatgtaatttgattcatgtag 27520246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Original strand, 41165509 - 41165567
Alignment:
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  41165509 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 41165567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 43423671 - 43423788
Alignment:
Q  19 aagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta 116  Q
    |||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || |||     
T  43423671 aagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttg 43423770  T
Q  117 gacatgtagagagaagac 134  Q
    | ||||||||||||||||    
T  43423771 gccatgtagagagaagac 43423788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 5338881 - 5338998
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| |||| || ||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |    
T  5338881 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatgtgatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataagg 5338980  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    || |||||||||||||||    
T  5338981 ctcggttgttgttgttgt 5338998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 7762565 - 7762496
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762565 gagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 48865821 - 48865744
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 310  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||   | |||||||||||||||||    
T  48865821 aaagatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagcc 48865744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561850
Alignment:
Q  10 atgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| |||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  108 g 108  Q
    |    
T  52561850 g 52561850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 1704836 - 1704912
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1704836 tgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttgt 1704912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569068
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| | | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttgt 10569068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 13828017 - 13827929
Alignment:
Q  47 acatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || |||  ||||||||||||||||||    
T  13828017 acattattagagagatttggggcagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagacc 13827929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18793336 - 18793201
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| | ||| ||||||  ||||| |||||  |  ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||    
T  18793336 ttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaagatggtagaaa 18793237  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
     ||||||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  18793236 ctagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19908144 - 19908040
Alignment:
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    ||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||     
T  19908144 tttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttga 19908045  T
Q  338 ttgtt 342  Q
    |||||    
T  19908044 ttgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 330
Target Start/End: Original strand, 29808053 - 29808121
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||    
T  29808053 aaatatggtttttgataaaacactatggcgacatttgattcatgtagccgattccacttagtgggataa 29808121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35828829 - 35828725
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||   || ||||| ||||||||||| |    
T  35828829 gtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagagagaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcata 35828730  T
Q  168 tggag 172  Q
    |||||    
T  35828729 tggag 35828725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2914175 - 2914120
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2914175 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2914120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11941700 - 11941577
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 326  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||| ||||  | |||||||| ||||| |||| |||| | |  |||||||||||||| ||  |  |||||||| |    
T  11941700 attagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtattttgatccatgtagtcggcctcacttagtggg 11941601  T
Q  327 ataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||  |||||||||||||||||||    
T  11941600 atacggcttggttgttgttgttgt 11941577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 40416361 - 40416448
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  40416361 agagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagat 40416448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 283
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16272903 - 16272818
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  16272903 tatggtttatgatagaacaatatgacatattttgatccatgtaatcaatcc-acttagtgggataatgtctggatgttgttgttgtc 16272818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758017
Alignment:
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 38758017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45510917 - 45510831
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||  | | |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||||    
T  45510917 aatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgttg 45510831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |   ||||||| || || ||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33560927 - 33560858
Alignment:
Q  278 agaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  33560927 agaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4590585 - 4590533
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4590585 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7133355 - 7133299
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7133355 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 7133299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12930408 - 12930308
Alignment:
Q  250 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| | || ||||||    |||| | ||||||||||||||||    
T  12930408 tgagttggatccaaatatgatttatgatagaagattatgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T
Q  350 t 350  Q
    |    
T  12930308 t 12930308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 26299297 - 26299353
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  26299297 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttgt 26299353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32112062 - 32111986
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  32112062 tgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32111986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48801700 - 48801625
Alignment:
Q  260 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||    
T  48801700 ccaaatatggtttatgatagaacattac-acataatttgatccatgtagctgatcccacttagcgggaaaatgcttg 48801625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 14224286 - 14224368
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| || |||| |||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  14224286 atggtttttgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637846
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||| |||||    
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagac 27637846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 335
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 335  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35828661 - 35828562
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||  |||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||| |||| ||  ||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  35828661 aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggaaaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52633257 - 52633166
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 353  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| | | |   ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  52633257 aaatatggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcaacctcgcttagtgggatggtgtttggttgttgttgttgtcgt 52633166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814291
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttgt 52814291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8676993 - 8676897
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt---tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||| || | |||||||||  |   |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8676993 gagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggcataatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 344
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 324
Target Start/End: Original strand, 28528556 - 28528614
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  28528556 atggtttttgatagaccactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29577256 - 29577147
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||| | |||| |||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||    
T  29577256 aaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggttat-gatagaacattatggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtg 29577158  T
Q  333 cttggttgttg 343  Q
    |||||||||||    
T  29577157 cttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 37263331 - 37263397
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||   || ||| | |||||||||||||    
T  37263331 ggggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaa 37263397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 52073745 - 52073675
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | | ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52073745 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Original strand, 10272260 - 10272329
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  || ||| | |||||||||||||||||    
T  10272260 gggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacc 10272329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11331332 - 11331247
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11331332 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11489353 - 11489268
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||  | |||||||||||    
T  11489353 gagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgatccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Original strand, 22930645 - 22930678
Alignment:
Q  317 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22930645 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 22930678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26113521 - 26113456
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||    
T  26113521 tatggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataa 26113456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42539265 - 42539208
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| || || |||||||| |||||||||||    
T  42539265 atttgatccatgtagacgaccccacttagtgggaaaaggcttggttattgttgttgtc 42539208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 346
Target Start/End: Original strand, 44008806 - 44008859
Alignment:
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  44008806 catttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 347
Target Start/End: Original strand, 50806864 - 50806949
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||||| |||||| |||| || | ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  50806864 aaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Original strand, 4380013 - 4380081
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||   |||| || |||| ||||||||||||||||    
T  4380013 ggggtagcaactatagtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338831
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||| || ||| | |||| |||||||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  168 tggag 172  Q
    |||||    
T  5338827 tggag 5338831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8194773 - 8194721
Alignment:
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8194773 ttgatctatgtagccggtcctactttgtatgataatgtttggttgttgttgtt 8194721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 347
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 13827854 - 13827746
Alignment:
Q  63 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 162  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||  | || || ||| |||||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| |||    
T  13827854 tgggggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtaga 13827755  T
Q  163 tcaaatgga 171  Q
    ||| |||||    
T  13827754 tcatatgga 13827746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 131
Target Start/End: Original strand, 51812515 - 51812591
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    ||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||| ||||  |||||| | |||||||||||||    
T  51812515 agagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtgatttgggcatgtagagagaa 51812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 281
Target Start/End: Original strand, 51812677 - 51812725
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  51812677 aaagatctagatgttaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaa 51812725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 346
Target Start/End: Original strand, 52292268 - 52292320
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||| || | || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52292268 atttgatccatgtaaccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 235 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 52900754 - 52900682
Alignment:
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 307  Q
    |||||||||| | |||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||    
T  52900754 agatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 117)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 38429818 - 38430168
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429818 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 38429917  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||    
T  38429918 ataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaagtagagg 38430017  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38430018 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttg 38430117  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  38430118 atccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttgt 38430168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45367972 - 45367622
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggggg-tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45367972 ttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 45367873  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||    
T  45367872 taaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaaaagaggtagagga 45367773  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    |||   |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45367772 agactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgtcatttga 45367673  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  45367672 tccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttgt 45367622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41197576 - 41197224
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41197576 ttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaaagttggtagaaa 41197477  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga-ggtagag 197  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||    
T  41197476 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaaggtagag 41197377  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  41197376 aaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacattatggcgtcattt 41197277  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||| || ||||  || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41197276 gatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttgt 41197224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 3866006 - 3866357
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3866006 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaa 3866105  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  ||  ||||||||||||||||    
T  3866106 ataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaattaaaagaggtagagg 3866205  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    || | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3866206 aaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacatcatttg 3866305  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3866306 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 3866357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11992454 - 11992108
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11992454 ttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 11992355  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    |  |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||| |||  | |||||||||||||| |||||    
T  11992354 aagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaaaagaggtaaaggaa 11992255  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  11992254 gacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacattatggcgttatttgat 11992155  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11992154 ccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 350
Target Start/End: Original strand, 12734639 - 12734985
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12734639 gctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggc 12734738  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaaga-ggtagaggaagaa 203  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||     
T  12734739 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagagggtagagggagac 12734838  T
Q  204 ctaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca 303  Q
    ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||||    
T  12734839 ctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatcca 12734938  T
Q  304 tgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12734939 tgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12734985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41763389 - 41763043
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763389 ttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaa 41763290  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  41763289 taggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagga 41763190  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||   | | ||||||||    
T  41763189 agacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacacccgggcgtcatttga 41763091  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41763090 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 3243999 - 3243654
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  3243999 ttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtaaaaaagttgatggaaaat 3243900  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||  || ||||||||||| |||||||    
T  3243899 aggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggcagaggaa 3243800  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  3243799 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 3243700  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3243699 ccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 36183385 - 36183740
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36183385 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 36183484  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  36183485 ataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 36183584  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||    ||||||    
T  36183585 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatggtgccatttg 36183684  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtc 354  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36183685 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgtcgtcgtc 36183740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 345
Target Start/End: Original strand, 8180720 - 8181060
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8180720 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataagc 8180819  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||| ||||||||||||      
T  8180820 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagcggtagaggaagaca 8180919  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    |||||||||||||    
T  8180920 taggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatagtgtcatttgatccat 8181019  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  8181020 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38453037 - 38452686
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38453037 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctatagtagaaaagttggta 38452938  T
Q  95 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||| | |  || |||||||||||||    
T  38452937 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagata-gatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggta 38452839  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 294  Q
    |||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||   |||    
T  38452838 gaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacactatggtgtca 38452739  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38452738 ttcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Original strand, 25834671 - 25834963
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  25834671 agagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggatgccgttgtaaga 25834770  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25834771 agagtagatcaaatggaggagtt--aggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 25834867  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25834868 tggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25834963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 8 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18424716 - 18424378
Alignment:
Q  8 ggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18424716 ggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtgtagcatctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 18424617  T
Q  108 gatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaa 207  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||  ||     
T  18424616 gatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacatag 18424517  T
Q  208 gaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 307  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18424516 gaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgta 18424417  T
Q  308 gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
     |||  || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  18424416 -ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 55 - 351
Target Start/End: Original strand, 2610578 - 2610874
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  2610578 agagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaaga 2610677  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2610678 agagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagt 2610777  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    | ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2610778 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttgtc 2610874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 4807526 - 4807880
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 94  Q
    ||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807526 ttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggta 4807625  T
Q  95 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    |||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||    
T  4807626 gaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggta 4807724  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 294  Q
    || ||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |  |||||||||||||| | |||    
T  4807725 gatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgatagaacactatggcgtca 4807824  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4807825 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4807880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 86 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451645
Alignment:
Q  86 aagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtta 185  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  186 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 285  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  286 atgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttgt 451645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 23997551 - 23997858
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||  || |||| |||||||||||||   |||| ||||||||||    
T  23997551 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaaatttggtagaaa 23997647  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |    
T  23997648 atagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtggaag 23997747  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||    
T  23997748 aagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacactatggcgttatttg 23997835  T
Q  299 atccatgtagccgatccaactta 321  Q
    || |||||| |||| || |||||    
T  23997836 attcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7326388 - 7326157
Alignment:
Q  119 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| || |||  || |||||||||||||||||||||  || |||||| |||     
T  7326388 catgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacataggaaaactatta 7326289  T
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | || ||    
T  7326288 gagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccac 7326189  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7326188 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7326157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 122 - 350
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029872
Alignment:
Q  122 gtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgag 221  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcca------tgtagccgatcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  316 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 39029872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 348
Target Start/End: Original strand, 28508749 - 28508961
Alignment:
Q  136 cgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa 235  Q
    ||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||     
T  28508749 cgtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaag 28508848  T
Q  236 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  28508849 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 28508948  T
Q  336 ggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||    
T  28508949 ggttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 72 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 171  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  172 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatg-gt 270  Q
    | |||  || |||||||||| |||| |||||   || ||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  271 ttt-tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| |||||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 182 - 350
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643233
Alignment:
Q  182 gttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaa 281  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  282 cactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 35643233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 31959635 - 31959803
Alignment:
Q  179 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 278  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31959635 caggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgata 31959734  T
Q  279 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  31959735 gaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 223 - 350
Target Start/End: Original strand, 30306190 - 30306317
Alignment:
Q  223 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 322  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30306190 aaccattagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 30306289  T
Q  323 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  30306290 tgggataaggcttggttgttgttgttgt 30306317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6238102 - 6237750
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag-agagaatgggggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaa 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| || | | ||||| |||   ||||||||| |  |  || ||||||||||||    
T  6238102 ttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgggagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataagttggtagaa 6238003  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    || |  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |   ||| |||||||||| |||||| |||||| |||  || || |||||||||||||    
T  6238002 aacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaagaggtagag 6237903  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
     |||| |||  ||||| |   || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  || ||||    
T  6237902 taagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatgggatgattt 6237803  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| || ||| ||| || ||||| ||  | || ||||  |||||||||||||    
T  6237802 gatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttgt 6237750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635320
Alignment:
Q  245 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  345 tgttgt 350  Q
    ||||||    
T  3635325 tgttgt 3635320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 236 - 350
Target Start/End: Original strand, 227360 - 227474
Alignment:
Q  236 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  227360 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 227459  T
Q  336 ggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||    
T  227460 ggttgttgttgttgt 227474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 185 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| | |  ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 350
Target Start/End: Original strand, 12141544 - 12141829
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||| | || ||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| |||||    
T  12141544 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatc 12141643  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 264  Q
    | || ||| | |  ||  ||| |||||||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| || ||||||||    
T  12141644 agattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaa 12141743  T
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||| | || | |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  12141744 tatggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttgt 12141829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 9496034 - 9496151
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||||||| || || |    
T  9496034 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaagg 9496133  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9496134 cttggttgttgttgttgt 9496151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9996754 - 9996623
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9996754 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccac 9996655  T
Q  319 ttagt---gtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||    | ||||| ||||||||||||||||    
T  9996654 ttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 16097338 - 16097192
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaat------gggggtagcacctatagtagaaaagttggta 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||   |||| |||||  ||||||| | ||||||||| |      |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16097338 ttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggta 16097239  T
Q  95 gaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtaga 141  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16097238 gaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtaga 16097192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38328489 - 38328367
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||     
T  38328489 cattagaaaggatttagaggtcaatgaag--gatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgg 38328392  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  38328391 gataaggcttggttgttgttgttgt 38328367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 347
Target Start/End: Original strand, 38434941 - 38435234
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga-tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaag 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |  || ||| | |||||| |||||||||  |||||| |  | |||||    
T  38434941 agagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaag 38435040  T
Q  154 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 253  Q
     |||| |||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||| ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||| |    
T  38435041 gagagtagatcatatggaggatagtcagatcactagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtg 38435140  T
Q  254 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || |||| |||| |||||| |||| ||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  38435141 ttggatcgaaatttggtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12882173 - 12882042
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | ||||||||||||||||| | |  ||    
T  12882173 gagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcac 12882074  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12882073 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12882042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43752239 - 43751944
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||   || ||| |     
T  43752239 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtagtaggg 43752140  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| |||||| |||||| | |  ||| | |   |||| | ||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||    
T  43752139 agagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 43752040  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | || | ||| ||||| | |||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| |  |||||||  || || |||  ||||||||||||||    
T  43752039 tggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttgt 43751944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025779
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 15025779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 189 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573127
Alignment:
Q  189 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  || |||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  289 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43573127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19337007 - 19336896
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |    
T  19337007 aaagatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaag 19336908  T
Q  333 cttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||||    
T  19336907 cttggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 222 - 348
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||| || || ||| |  |||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  322 gtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 346
Target Start/End: Original strand, 18958907 - 18959192
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttaga----catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| |     |||| |||||||||||| | || |   || ||||| |||| |    
T  18958907 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagta 18959006  T
Q  161 gatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatc 260  Q
    ||||| |||||| | |  ||| | |  ||||| ||||||||| |||  ||||| |   ||||||| || || ||||| || ||| | |||||||| ||||    
T  18959007 gatcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatc 18959106  T
Q  261 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
     ||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18959107 aaaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 43238377 - 43238305
Alignment:
Q  63 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  43238377 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagacc 43238305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531597
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 9531597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44438005 - 44437718
Alignment:
Q  63 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaaga 162  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||| | ||  |||| ||   |||    
T  44438005 tgggggtaacccctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtataga 44437906  T
Q  163 tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcca 262  Q
    | | ||||||  ||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| || |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||||| ||   |    
T  44437905 tgagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaa 44437806  T
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |  ||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44437805 aacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 44437718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520060
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474927
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670753
Alignment:
Q  277 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17670753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863517
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867849
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 263 - 348
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872750
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287706
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
      |||||||| ||||||| |  | |||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttgt 33287706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35755376 - 35755242
Alignment:
Q  220 agaaaccattagaaaagatttagaggtcaatga----gttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcc 315  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |    ||| |||||||||||||||| |||||||||| | || | | |||||||||||| |||||| ||    
T  35755376 agaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttggatccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccc 35755277  T
Q  316 aacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35755276 tacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 35755242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 345
Target Start/End: Original strand, 13149460 - 13149612
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    ||||||||||  || |||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||| |||  |||||||||| ||||||||    
T  13149460 tagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacat 13149559  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||| || |||||  |||||||||||||    
T  13149560 aatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  250 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 331
Target Start/End: Original strand, 41545559 - 41545671
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||  ||    
T  41545559 gagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaacactatgacttaatttgatttatttagccgatctcac 41545658  T
Q  319 ttagtgtgataat 331  Q
    ||| || ||||||    
T  41545659 ttaatgagataat 41545671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8197669 - 8197538
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8197669 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8197570  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8197569 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8197538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8202429 - 8202298
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||| | | |||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| || ||    
T  8202429 gagaaactattaagaaagatctaaagattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctac 8202330  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8202329 ttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 8202298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9556710 - 9556366
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||| ||||||||| | |||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |    
T  9556710 tggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat-ggtggaaaataggc 9556612  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| || | |||| |||||| | |  ||   ||  ||||| | ||||||| |    
T  9556611 ttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactagaggcaaaggaagacc 9556512  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    |   ||||| ||  || |||| ||||  |||||| ||| | | |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||| || |   | ||||||| |||    
T  9556511 ttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggtgtaatttgatacat 9556412  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9556411 gtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttgt 9556366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 43832309 - 43832383
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  43832309 atagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttgt 43832383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12489940 - 12489799
Alignment:
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||||||| |||||| || | || |||||| |||||||    
T  12489940 aaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttgattcatgtag 12489841  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12489840 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12489799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429332
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 350
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626357
Alignment:
Q  277 tagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 17626357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 23714600 - 23714474
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  23714600 tggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg-tagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagactt 23714502  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23714501 atgtagtttaggcatgtagagagaagac 23714474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 24102272 - 24102146
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  24102272 tggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagttggg-tagcacatatagtagaaaagatggtggaaactagactt 24102174  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |  |  ||||| ||||||||||||||||    
T  24102173 atgtagtttaggcatgtagagagaagac 24102146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 9579049 - 9578915
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||   ||||||||| | |||||  ||| |||||||| |||| || |  |||||    
T  9579049 ttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgacaatgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatgtaaaat 9578950  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  9578949 agacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 9578915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 344
Target Start/End: Original strand, 45077895 - 45078008
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgag--ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||||||||||| | ||||||  || |||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  45077895 aaagatttagagattaatgagagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataa 45077994  T
Q  331 tgcttggttgttgt 344  Q
     |||||||||||||    
T  45077995 agcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 6219126 - 6219250
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    |||||| |||||||||||| | | |||||| || | ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| | || || ||||      
T  6219126 cattaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttg 6219225  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||    
T  6219226 gataaggcttggttgttattgttgt 6219250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 347
Target Start/End: Original strand, 11412865 - 11412992
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag---aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||| ||||   | ||||||||||||||||||| |  ||    
T  11412865 aaactattaggaaagatt-agagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcac 11412963  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  11412964 ttagtaggataaggcttggttgttgttgt 11412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334187
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 19334187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 350
Target Start/End: Original strand, 15015149 - 15015230
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||   || |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  15015149 gtttttgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttgt 15015230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 343
Target Start/End: Original strand, 33504421 - 33504502
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33504421 aaatatggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 345
Target Start/End: Original strand, 34931631 - 34931712
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||||| || || ||||||||||||||    
T  34931631 atatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481439
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||||||  || || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttgt 3481439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 4598912 - 4598775
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg----ggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| | ||||||  |||||||||||  |    ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4598912 ttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtaga 4598813  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    || ||||||| | || ||| ||||| |||| |||||||    
T  4598812 aactagactttggtggtttggacatatagaaagaagac 4598775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13443995 - 13443907
Alignment:
Q  260 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||| ||| ||||||||    
T  13443995 ccaaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 36650610 - 36650686
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  36650610 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagc 36650686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Original strand, 42543440 - 42543520
Alignment:
Q  270 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42543440 tttttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42543520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 102
Target Start/End: Original strand, 227312 - 227359
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  227312 agagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatag 227359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 61
Target Start/End: Original strand, 2610463 - 2610522
Alignment:
Q  2 tgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2610463 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagaga 2610522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19337191 - 19337096
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactg-gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 101  Q
    |||||| |||||||||||  | || ||||||||||  ||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  19337191 tggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagagttggggtagcacctatagtagtaaagatggtggaaaata 19337096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42549917 - 42549834
Alignment:
Q  267 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42549917 tggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 42549834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 350
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384754
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |  |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 25384754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Original strand, 36993755 - 36993816
Alignment:
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36993755 tatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 624764 - 624687
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||| |||||  ||  |||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  624764 gtttttgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4598638 - 4598569
Alignment:
Q  271 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| | |||||| | ||||| |||||||||    
T  4598638 ttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5759076 - 5758995
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| || ||||| || || |||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5759076 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560803
Alignment:
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 8560803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10516802 - 10516749
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10516802 atttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 354
Target Start/End: Original strand, 17581643 - 17581748
Alignment:
Q  249 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||  || | || |||||| |||||| |||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  349 gtcgtc 354  Q
    ||||||    
T  17581743 gtcgtc 17581748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12470978 - 12470894
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| | ||||||| | || |||| | ||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  12470978 atggtttttgatatatcactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttgt 12470894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775842
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttgt 15775842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28960294 - 28960210
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   || |||||| ||||||| |||  | | |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28960294 atatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgtagtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 232 - 348
Target Start/End: Original strand, 32402667 - 32402783
Alignment:
Q  232 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 331  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||     
T  32402667 aaaagatctagagattaatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataag 32402766  T
Q  332 gcttggttgttgttgtt 348  Q
     ||||| ||||||||||    
T  32402767 acttggctgttgttgtt 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 33393319 - 33393394
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  33393319 tgatagaaca-tatgtcatagtttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttgt 33393394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470124
Alignment:
Q  191 ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 290  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||  ||||||| ||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  291 atcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg----cttggttgttgttgttgtcg 352  Q
     |  |||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggctctctcggttgttgttgttgtcg 37470124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  249 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||  ||| ||| ||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 3481134 - 3481248
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || | |||     
T  3481134 agagggaattggggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaagg 3481230  T
Q  155 agagaagatcaaatggag 172  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  3481231 agagtagatcagatggag 3481248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Original strand, 14444899 - 14444954
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14444899 tttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14444954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 273 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 887139 - 887065
Alignment:
Q  273 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat-gcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || |||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  887139 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4682291 - 4682253
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 271  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4682291 aaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14197279 - 14197205
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| |  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14197279 gatagagcattatgacatcgtttgattcatgtacccgacctcacttactggggtaatgcttggttgttgttgttg 14197205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33594354 - 33594272
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgat-ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||| || ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33594354 atggttttggatagaacactatgatgtcgtttgactcatgtagtcgatccccacttaatgtgataaagctttgttgttgttgt 33594272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 287
Target Start/End: Original strand, 36616856 - 36616910
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  36616856 aaagatctagagattaatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactat 36616910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 135
Target Start/End: Original strand, 38860165 - 38860243
Alignment:
Q  57 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| ||||||||    
T  38860165 agagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagacc 38860243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 129
Target Start/End: Original strand, 6218954 - 6219031
Alignment:
Q  52 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||| | || || ||||| ||||| || ||| |||||||||||||    
T  6218954 attagatagagttggggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagag 6219031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Original strand, 11412711 - 11412764
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  11412711 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttag 11412764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Original strand, 14530532 - 14530565
Alignment:
Q  317 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14530532 acttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 14530565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 323
Target Start/End: Original strand, 19224990 - 19225039
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 323  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19224990 tgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagt 19225039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 24583947 - 24583906
Alignment:
Q  8 ggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgaca 49  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  24583947 ggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgaca 24583906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||  |||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 345
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  281 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 108
Target Start/End: Original strand, 786833 - 786873
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  786833 gtagcacctatagtagaaaagatggcagaaactagacttag 786873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720438
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtg 3720438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 324
Target Start/End: Original strand, 9078792 - 9078836
Alignment:
Q  280 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9078792 aacattatgacatcatatgatccatgtagccgagcccacttagtg 9078836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 134
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  78 tagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||||||| |||| |||| | | |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 163)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27450521 - 27450180
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450521 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 27450426  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  27450425 aggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaaaagaggtaaaggaa 27450326  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27450325 gacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacactatggcgtcatttgat 27450227  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  27450226 ccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 436163 - 436514
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436163 ttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 436262  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  436263 ataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 436362  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  436363 aagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttg 436462  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  436463 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 436514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 48622883 - 48622543
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48622883 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacccatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 48622784  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  48622783 agatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 48622684  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
     |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  48622683 ggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttaatccatgt 48622584  T
Q  307 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48622583 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31960162 - 31959814
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31960162 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 31960063  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  31960062 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 31959963  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  31959962 aagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 31959863  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31959862 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48174441 - 48174090
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48174441 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaa 48174342  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  48174341 ataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 48174242  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||| |||| | |||||||    
T  48174241 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaacattatggcgtcatttg 48174142  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  48174141 atccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 48174090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 52569857 - 52569512
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52569857 tggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 52569758  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |    
T  52569757 ttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacc 52569658  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  52569657 tacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 52569558  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  52569557 gtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 52569512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 33227143 - 33227494
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227143 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 33227242  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || ||||||||||||||| |    
T  33227243 ataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagatg 33227342  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33227343 aagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttg 33227442  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  33227443 atccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttgt 33227494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1777363 - 1777016
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1777363 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagtggaaatagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaat 1777264  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||    
T  1777263 aggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 1777164  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | |||||||||    
T  1777163 gacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacagtatggcgtcatttgat 1777064  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  1777063 ccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 350
Target Start/End: Original strand, 4440797 - 4441138
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4440797 gatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 4440896  T
Q  109 atgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 208  Q
    ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4440897 atggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 4440996  T
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  4440997 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 4441096  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||| || || ||||||||    
T  4441097 ccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttgt 4441138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33191196 - 33190846
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33191196 ttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 33191097  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33191096 atagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaagttaaaagaggtagagg 33190997  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33190996 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttg 33190897  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    | |||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  33190896 acccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttg 33190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 56375224 - 56375573
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56375224 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaa 56375323  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    | || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  56375324 acaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 56375423  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  56375424 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttg 56375523  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  56375524 atccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 53707728 - 53708079
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707728 ttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 53707827  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| | |  || |||||||||||||||||    
T  53707828 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaagttaaaagaggtagagg 53707927  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  53707928 aagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttg 53708027  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||| |||    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  53708028 atccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 53708079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39100872 - 39100533
Alignment:
Q  10 atgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttaga 109  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  39100872 atgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagaagaaaagttgatagaaaataggcttaga 39100773  T
Q  110 tgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaaga 209  Q
    || |||  |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39100772 tggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctagga 39100674  T
Q  210 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||| | | || | |||||||||||    
T  39100673 aaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacattatggcgtaatataatccatgtagc 39100574  T
Q  310 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39100573 cgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 39100533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 84 - 348
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  84 aaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggt 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  184 taaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  284 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 348
Target Start/End: Original strand, 27983142 - 27983476
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||        |||    
T  27983142 gatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagg-------ctt 27983234  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  27983235 agatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacata 27983334  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27983335 agaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 27983434  T
Q  307 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||| | ||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  27983435 agccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 37797786 - 37798136
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797786 ttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 37797885  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||||||  ||||||    
T  37797886 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttagagg 37797984  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  37797985 aagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcatttg 37798084  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  37798085 atcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttgt 37798136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 43433852 - 43434209
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--------tgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 92  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43433852 ttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 43433951  T
Q  93 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg 192  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  43433952 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 43434051  T
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| || | |  |||||||||||| | | |    
T  43434052 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtaggatagaacactacggcgt 43434151  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  43434152 catttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 43434209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23906649 - 23906297
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--------tgggggtagcacctatagtagaaaagttgg 92  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23906649 ttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagtttg 23906550  T
Q  93 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg 192  Q
    |||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || ||||||| |||    
T  23906549 tagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttaaaaaagg 23906452  T
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    || | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |    
T  23906451 taaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 23906352  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23906351 catttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 352
Target Start/End: Original strand, 28236125 - 28236469
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28236125 tggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtggaaaataggctt 28236224  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  |||||||||| | |||| || |||||||  |||||||||||| |||    
T  28236225 agatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaagttaaaa-tggtagaggaagaccta 28236323  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
     |||||| ||| |||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| | ||||   | |||||||| ||||    
T  28236324 ggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatctatgt 28236423  T
Q  307 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcg 352  Q
    |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28236424 agccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtcg 28236469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37773798 - 37773486
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37773798 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaaggggtagcacctatagtagaaaagtcggtagaaaa 37773699  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||  ||  |||||||||||||| ||    
T  37773698 taggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaatttaaaagaggtagatga 37773599  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    | | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  37773598 atacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacactatgacataatttga 37773499  T
Q  300 tccatgtagccga 312  Q
    || || |||||||    
T  37773498 tctatatagccga 37773486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 46583160 - 46582823
Alignment:
Q  13 agtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt--agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat 110  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46583160 agtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 46583061  T
Q  111 gatttagacatgtagagagaagaccc-gtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaaga 209  Q
    |  || | ||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  46583060 gggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatga 46582963  T
Q  210 aaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  46582962 aaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaccctatggcgtcatttgatccatgtagc 46582863  T
Q  310 cgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  46582862 cta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttgt 46582823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47265550 - 47265193
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  47265550 ttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaaggtagtagaaa 47265451  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagac-------ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagag 191  Q
    ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||       |||||||| |||| |||||||||| |||  |||||||| |||  |  ||||||||||    
T  47265450 ataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggagattctagttaaaagag 47265351  T
Q  192 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 291  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||        
T  47265350 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatgatagaacactatagtg 47265251  T
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    | ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  47265250 taatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 89 - 350
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286724
Alignment:
Q  89 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  189 ga--------ggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgataga 280  Q
    ||        |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  281 acactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 8286724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 55 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 26037797 - 26037506
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatg-tagagagaagacccgtagataccgttgtaag 153  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  26037797 agagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaag 26037699  T
Q  154 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 253  Q
    ||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26037698 aagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatgag 26037599  T
Q  254 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  26037598 ttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 321
Target Start/End: Original strand, 50286905 - 50287217
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50286905 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga---gggg----acctatagtagaaaagttggtagaaaat 50286997  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||    
T  50286998 agacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaagaa 50287097  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || ||| |||||| ||| ||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || | | |||||||||||||||    ||||||||    
T  50287098 gacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaacactatg-ggccatttgat 50287196  T
Q  301 ccatgtagccgatccaactta 321  Q
    |||||||| ||| || |||||    
T  50287197 ccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 56 - 340
Target Start/End: Original strand, 39708424 - 39708708
Alignment:
Q  56 gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaa 155  Q
    |||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||   |||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  39708424 gagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatgccgtcgtaagaa 39708523  T
Q  156 gagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtt 255  Q
    ||| |||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39708524 gagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 39708623  T
Q  256 agatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||  ||||||||    
T  39708624 ggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 344
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  57 agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaag 156  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  157 agaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtta 256  Q
    || | ||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||     
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||| | ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528573
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 21528573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || || ||||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtgttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaaat 51421765  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || ||||| || ||| | ||| || |||||||||| ||||||   ||  || |||||| |||||||||||||      ||| | ||||||||||||||||    
T  51421766 aggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagaggaa 51421865  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    ||  ||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | |||||||    
T  51421866 gatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 51421965  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51421966 ccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 21236953 - 21237143
Alignment:
Q  160 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 259  Q
    ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  21236953 agatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 21237052  T
Q  260 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  21237053 ccaaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttgt 21237143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957883
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 6957883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 344
Target Start/End: Original strand, 1793424 - 1793741
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 128  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  1793424 gataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagaga 1793523  T
Q  129 gaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccat 228  Q
    ||||||  || |||  ||| ||||||| || |||||| |||||| ||    |  | ||||||||||||| |||| ||   ||||| ||  ||||||||||    
T  1793524 gaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggagtcgta--tcaaaagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccat 1793621  T
Q  229 ta----gaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtg 324  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  1793622 taattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagcactatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtg 1793721  T
Q  325 tgataatgcttggttgttgt 344  Q
     ||||| |||| ||||||||    
T  1793722 agataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494948
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12494948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41009698 - 41009414
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggt-agaa 97  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41009698 ttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaaaaa 41009599  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||  || ||| | || ||||||| |  |||||| |||||| |||  ||||| ||||| |||||||    
T  41009598 aatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagtggtagag 41009499  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    ||||| ||  |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009498 gaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45205190 - 45204837
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaat-gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga 103  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||  |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45205190 tggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaaaagatggtagaaaataga 45205091  T
Q  104 ctt--agatgatttagacatgtagagagaagacccgtag-------ataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggta 194  Q
    |||  || || |||   || |||||||||||||| ||||       ||   |||||| |||||| |||||| |||||| ||| | || | |||||||||     
T  45205090 cttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggagagc-agatcaaaagaggtg 45204992  T
Q  195 gaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatca 294  Q
    |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| || | | | |    
T  45204991 gaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta-ggcgtaa 45204893  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45204892 tttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45204837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20591613 - 20591353
Alignment:
Q  36 gattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  20591613 gattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaaga 20591514  T
Q  134 cccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaa 233  Q
    | | |||||  ||| |||||||||| | |||| |||||| |||  || ||    ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||  |||||||||    
T  20591513 ctcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt----agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaa 20591419  T
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20591418 aggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatgg-ttatgatagaacacaatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20601994 - 20601669
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||| | ||||||   ||||||||| ||| ||||||||| || |||  ||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20601994 ttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagttggtagaaa 20601895  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    ||||  ||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || | |||||| |||  ||||| |||||||||||| |    
T  20601894 ataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaag 20601795  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||  |||||| ||  ||||||||||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||    
T  20601794 aagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaa-----gtcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatgacgtaatttg 20601701  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    || |||||| | || || |||||||| |||||    
T  20601700 attcatgtaactgaacccacttagtgggataa 20601669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 183 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  183 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 282  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1211738 - 1211389
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  1211738 ttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccattcgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagttggtaggaaat 1211639  T
Q  101 aga--cttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    | |  |||| ||| ||| |  ||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||| |||||| |||  | | | ||||||| ||||||    
T  1211638 atatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaaagagatagagg 1211539  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat-cattt 297  Q
    ||||  || || ||| ||  || |||  ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  || |||||| | ||||||||||| | | |  ||||    
T  1211538 aagacataggagaactataagataaattattagaaaa-aattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaaggcgtaaattt 1211442  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  1211441 gattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttgt 1211389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 193 - 342
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| |||||||||||||| |  |    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 149 - 297
Target Start/End: Original strand, 50679588 - 50679736
Alignment:
Q  149 gtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 248  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||  || |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50679588 gtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtca 50679687  T
Q  249 atgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  50679688 atgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 12494684 - 12494794
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494684 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 12494783  T
Q  99 atagacttaga 109  Q
    |||| ||||||    
T  12494784 ataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 16002865 - 16003165
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcat--tagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||   ||||||||| |||||||| |||  ||||| || || || | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  16002865 gctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgatagaaaatag 16002964  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| || | |||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| | | |||| |||||  | |   | || ||||||  |||||||| |    
T  16002965 tcttagatggttga-acatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaatagaggaata 16003063  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     |  | ||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||| | |||| ||||    
T  16003064 ccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaatttaatcc 16003163  T
Q  303 at 304  Q
    ||    
T  16003164 at 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 346
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  183 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaac 282  Q
    |||||| ||| |||||| || ||| |||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821001
Alignment:
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || |  ||| || || |||| | |||||| |||| ||| | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata----gaacactatgacatca 294  Q
    |||| ||| |||||| ||  ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    |||||||||  ||| |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaac-attagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||| | |||||| ||||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttgt 20821001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154860
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  337 gttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttgt 19154860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 350
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969466
Alignment:
Q  242 gaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  342 tgttgttgt 350  Q
    |||||||||    
T  19969458 tgttgttgt 19969466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 350
Target Start/End: Original strand, 35690391 - 35690556
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||     
T  35690391 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacat 35690490  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  35690491 tatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttgt 35690556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 55007914 - 55008031
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  55007914 aaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 55008013  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  55008014 cttggttgttgttgttgt 55008031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28550583 - 28550455
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||||| ||||||| || || ||    
T  28550583 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgaccccac 28550484  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  28550483 ttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 31043226 - 31043357
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||| || || ||    
T  31043226 gagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcataatttgatccttgcagctgaccccac 31043325  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  31043326 ttagtgcaataaagcttagttattgttgttgt 31043357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 31458962 - 31459098
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatggg----ggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  | |    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31458962 ttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatagtagaaaagatggtaga 31459061  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||    
T  31459062 aaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 348
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  123 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 222  Q
    ||||||||||||| |||||  | || ||||| |||| |||||| |||||| | |  ||| ||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||  ||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  223 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 322  Q
    ||| ||||  |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| |  ||||||  ||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  323 tgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    || | ||| |||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 259 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883357
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| || |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttgt 883357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31961394 - 31961263
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   | | |||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||    
T  31961394 gagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgacctcac 31961295  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961294 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31961263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 265 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061932
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 19061932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939733
Alignment:
Q  272 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 272
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  186 aaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttga-gaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggttt 272  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 187 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 53518483 - 53518325
Alignment:
Q  187 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 286  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||| ||  || |||| | ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  53518483 aagaggtagaggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacacta 53518384  T
Q  287 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    || | | |||||||||||| || ||| || |||||||| ||||   || |||||||||||    
T  53518383 tggcgtaatttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 2589255 - 2589357
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||  | || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2589255 aatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  2589355 tgt 2589357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25257921 - 25257756
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| | || ||||| ||||||||  |||||||    
T  25257921 tggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttgaggtaacacctacaatataaaagatggtagaagctagactt 25257822  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggag 172  Q
    || || |||   ||||||||||||||||| ||  || | |||||||| |||| |||||| ||||||    
T  25257821 aggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggag 25257756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 25574992 - 25575109
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||   | |||||||||||||||| || || | |||||| ||||| |    
T  25574992 aaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataagg 25575091  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25575092 cttggttgttgttgttgt 25575109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 56225236 - 56225353
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||| ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  56225236 aaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttatagaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataagg 56225335  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
     | |||||||||||||||    
T  56225336 atcggttgttgttgttgt 56225353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 13805350 - 13805262
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  13805350 aaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgt 13805262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Original strand, 31459151 - 31459279
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactta 321  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| | |||| ||||| |||| |   | |||||||||||| |||| || |||||    
T  31459151 aaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccactta 31459250  T
Q  322 gtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  31459251 gtgggataaggcttggttgttgtcgttgt 31459279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208266
Alignment:
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||||  ||| ||  |||| || ||||| ||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  338 ttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttgt 34208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |  | ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633403
Alignment:
Q  271 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 32633403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 41192826 - 41192913
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  41192826 agagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatggtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagat 41192913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238612
Alignment:
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 283 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238698
Alignment:
Q  283 actatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 50238698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 344
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024846
Alignment:
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| || |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| ||||   | |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgctgtc 26024846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 35555928 - 35555859
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||||||    
T  35555928 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacc 35555859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 37042792 - 37042667
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | | |||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||| || ||    
T  37042792 gagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacccgac 37042693  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||    
T  37042692 ttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869876
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 50869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 51252791 - 51252674
Alignment:
Q  17 gtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta 116  Q
    |||||||| |||  ||||||||||  ||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || | |     
T  51252791 gtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagagttggggtagcacctctagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatg 51252692  T
Q  117 gacatgtagagagaagac 134  Q
    | ||||||||||||||||    
T  51252691 ggcatgtagagagaagac 51252674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958236
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttgt 6958236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066496
Alignment:
Q  270 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 7066496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634103
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30634103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 51438642 - 51438730
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | ||| |||| |||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  51438642 aaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 51438730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 233 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 55388325 - 55388213
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | ||   | ||||||||||||| | ||| || |||||||| ||||| |    
T  55388325 aaagatttggagattaatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataagg 55388226  T
Q  333 cttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||||||    
T  55388225 cttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 37488245 - 37488376
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||   || ||    
T  37488245 gagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgtaatttgatccatgtagccagccccac 37488344  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37488345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 37488376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 44047640 - 44047553
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  44047640 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagagttaagacctgtagat 44047553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45209257 - 45209202
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45209257 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 45209202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 347
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 54470197 - 54470276
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  || ||| | ||||||||||||||||    
T  54470197 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 54470276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 5306479 - 5306581
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | | ||||||||||| ||||  | || |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5306479 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 5306578  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  5306579 tgt 5306581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 347
Target Start/End: Original strand, 46372024 - 46372306
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatc 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| || |||   ||||||||||||||||  || ||| | ||  ||||||||| |||||    
T  46372024 ggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgtactaagaagagcagatc 46372123  T
Q  165 aaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa 264  Q
    | || |||  || |||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   | |    
T  46372124 agatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaaga 46372223  T
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
     |||||||||||||||||||  |  | || |||||| |||||||| || || |||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  46372224 catggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540575
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  || |||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| ||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| | || ||| |||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttgt 53540575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Original strand, 10208978 - 10209104
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||||||||| ||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||    
T  10208978 tggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag--ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaactt 10209075  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    || || ||| | ||||||| |||||||||    
T  10209076 agttggtttgggcatgtagcgagaagacc 10209104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 35690238 - 35690326
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatta--gagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 87  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||||||| | |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  35690238 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 35690326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153993
Alignment:
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 46153993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328611
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1328611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 29399001 - 29399089
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| | | ||||||| |||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29399001 aaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 29399089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35622757 - 35622673
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||| || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  35622757 atggtttttgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttgt 35622673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42285784 - 42285700
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||||||||| | || |||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  42285784 atggtttttgatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttgt 42285700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Original strand, 44360289 - 44360369
Alignment:
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||| || ||||||||    
T  44360289 ggtttttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 351
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130456
Alignment:
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgtc 56130456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Original strand, 41192229 - 41192344
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||  ||||||||| | || ||||||| |||| | || || ||||||||||||||| || || ||||  ||||| |    
T  41192229 aaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataagg 41192328  T
Q  333 cttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  41192329 cttggttgttgttgtt 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44719413 - 44719358
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  44719413 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 44719358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  189 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttga 276  Q
    |||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Original strand, 2588991 - 2589056
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  2588991 ggggtagtacctatagt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaa 2589056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 348
Target Start/End: Original strand, 15665330 - 15665384
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15665330 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356688
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||  ||||||||||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagac 26356688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729509
Alignment:
Q  246 tcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatg 41729509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285882
Alignment:
Q  75 ctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||| |||||||||| || ||| | || || ||||||| ||||||    
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatca 42285882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42293416 - 42293262
Alignment:
Q  196 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 295  Q
    |||| ||||||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||||||  | ||||||| | ||||||| || || || |||||    
T  42293416 aggatgaactaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatagacatatggtatatgatagagcattacgatatcat 42293317  T
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || ||| |||||||||  || ||||||||  |||| || ||||||||||||||||    
T  42293316 ttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttgt 42293262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 49987378 - 49987471
Alignment:
Q  17 gtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| |  ||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  49987378 gtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttag 49987471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 350
Target Start/End: Original strand, 54935348 - 54935434
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | || |||| ||| || |  ||||||||||| |||||||    
T  54935348 atatggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttgt 54935434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 346
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |  | || ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||| | ||||||||||| || |||||||||| ||| || | |||| |||||||||||| | || | |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31897509 - 31897428
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  31897509 atggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 135
Target Start/End: Original strand, 50471479 - 50471596
Alignment:
Q  18 taagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttag 117  Q
    ||||||| ||| | |||||||||   |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| |||| |||  |||  || ||| |    
T  50471479 taagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagactcggggtagcactaatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaagtggtttgg 50471578  T
Q  118 acatgtagagagaagacc 135  Q
     |||||||||||||||||    
T  50471579 gcatgtagagagaagacc 50471596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879106
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttgt 4879106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10775728 - 10775665
Alignment:
Q  43 aatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10775728 aatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagtagaaaagatggtagaaactagac 10775665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15661925 - 15661869
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  15661925 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttgt 15661869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105515
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||  || || ||||||| |||||||||||    
T  20105603 aaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgttgt 20105515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30621486 - 30621418
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||    
T  30621486 ggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaaga 30621418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339844
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| | |||| | || |||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32339844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 33709853 - 33709992
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggat-----taagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggt 93  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||     ||  |||| || |||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  33709853 ttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagatggt 33709952  T
Q  94 agaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
     |||| |||  |||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  33709953 ggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaaga 33709992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 34233123 - 34233031
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |  | | |||||||||||||||||||  | ||| |||| || ||||||||||||    
T  34233123 aatgagttagatcaaaataaggtttatgatagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41009347 - 41009283
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009347 gagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 42639301 - 42639233
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  42639301 gggttgcacctatagtagaaaagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 42639233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49738602 - 49738550
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49738602 tttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 342
Target Start/End: Original strand, 50862860 - 50862908
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50862860 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 345
Target Start/End: Original strand, 1095642 - 1095725
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||| ||||| |||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1095642 aaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 345
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 36799740 - 36799657
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    
T  36799740 atatggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 44360077 - 44360155
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  44360077 agagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagac 44360155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 169
Target Start/End: Original strand, 50662365 - 50662492
Alignment:
Q  43 aatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat-gatttagacatgtagagagaagacccgtaga 141  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| | | ||| | ||||||||||||||||  |||||    
T  50662365 aatgacagcattagagagagtttgggcaacacctatagtagaaaagatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtaga 50662464  T
Q  142 taccgttgtaagaagagaagatcaaatg 169  Q
    | |  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  50662465 ttctattgtaaggagagtagatctaatg 50662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Original strand, 17900480 - 17900550
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |  || ||| | || ||||||||||||||    
T  17900480 ggggtagcacctatagtagaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagacc 17900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 309
Target Start/End: Original strand, 36198977 - 36199059
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| ||||||   | ||||||||||||||    
T  36198977 attagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatccatgtagc 36199059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 131
Target Start/End: Original strand, 45423566 - 45423681
Alignment:
Q  14 gtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgat 113  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  || |    
T  45423566 gtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattatagag--ttgaggtagcacctataatagaaaagatggtagaaacttgacttacgtggt 45423663  T
Q  114 ttagacatgtagagagaa 131  Q
    || |||||||||| ||||    
T  45423664 tttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 50680746 - 50680844
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta-gacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatg 169  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||| |||| ||||| |||| ||||| ||||    
T  50680746 cacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagagagaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatg 50680844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50967081 - 50967027
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  50967081 atttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55768783 - 55768717
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55768783 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 55833039 - 55832973
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  55833039 ggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 108
Target Start/End: Original strand, 56225027 - 56225109
Alignment:
Q  26 gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | | ||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  56225027 gacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaagttgggataatacctatagtataaaagatggtagaaaataggcttag 56225109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3601449 - 3601416
Alignment:
Q  317 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3601449 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3601416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Original strand, 8284348 - 8284421
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||    
T  8284348 tgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Original strand, 10209237 - 10209319
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||  || | || |||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||    
T  10209237 atggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgattcaagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttgt 10209319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10775550 - 10775468
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||  |||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10775550 atggtttttgatagaacact--gacattgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 10775468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 288
Target Start/End: Original strand, 26510558 - 26510611
Alignment:
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510558 agatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 28497480 - 28497596
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| | || ||||| || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  ||||||   || |||||     
T  28497480 agagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagg 28497578  T
Q  155 agagaagatcaaatggag 172  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  28497579 agagtagatcagatggag 28497596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 36557321 - 36557268
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557321 agagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag 36557268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 49738886 - 49738809
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | | ||||| ||||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  49738886 ggggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagacccatagat 49738809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7544584 - 7544528
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  7544584 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgtcgttattgt 7544528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 25967615 - 25967555
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  25967615 ttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagaga 25967555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 309
Target Start/End: Original strand, 28486089 - 28486165
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||   || ||||| |||| | | ||||||||||||||||    
T  28486089 aaagatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagc 28486165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 30621329 - 30621241
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta 307  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||| | |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | ||||||||||||    
T  30621329 gagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 284 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30662106 - 30662042
Alignment:
Q  284 ctatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30662106 ctatgacatcatttaatccaagtggctgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 30662042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35555731 - 35555647
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| ||| |||| | || |||||| |||||||||||  | | |||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  35555731 atggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttgt 35555647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36556841 - 36556757
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |  |||||| | |||| |||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  36556841 atggtttttgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttgt 36556757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40932997 - 40932921
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| |  | |||||| ||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  40932997 tgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttgt 40932921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 45184214 - 45184130
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||| | ||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  45184214 atggtttataataaaacattatgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgttattgt 45184130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 46236719 - 46236771
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||| ||||||||    
T  46236719 tttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963735
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | |||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttgt 54963735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 329
Target Start/End: Original strand, 55579200 - 55579295
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    ||||||||| ||||  ||||||| |||  ||| | ||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  55579200 aaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattatgatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 108)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 3301778 - 3302126
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3301778 ttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaaagttggtagaaa 3301877  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  3301878 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 3301977  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  3301978 aagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactacggcgtcatttg 3302077  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3302078 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 4496316 - 4496669
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacat--gataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4496316 ttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagctggtaga 4496415  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 196  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  4496416 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 4496515  T
Q  197 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 296  Q
    |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  4496516 ggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatt 4496615  T
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4496616 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 4496669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28977199 - 28976856
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28977199 tggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt 28977100  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    ||||| |||   ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||    
T  28977099 agatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 28977000  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
     |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  28976999 ggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgattcatgt 28976900  T
Q  307 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28976899 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28976856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 340
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  32 ataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 229  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  330 atgcttggttg 340  Q
    | |||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 24178444 - 24178793
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178444 ttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 24178543  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  24178544 ataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 24178643  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||||    
T  24178644 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcatcatttg 24178743  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24178744 atctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 12492729 - 12492381
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcaccta---tagtagaaaagttggtagaaaata 101  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  12492729 tggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactatagtagaaaagttggtagaaaata 12492630  T
Q  102 gacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaag 201  Q
    | |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  12492629 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 12492530  T
Q  202 aactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 301  Q
    | ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||     
T  12492529 acctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatg 12492430  T
Q  302 catgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  12492429 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 12492381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16347726 - 16347380
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347726 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 16347627  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16347626 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 16347527  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||  || | |||||||    
T  16347526 aagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac--tggcgtcatttg 16347429  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  16347428 atccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1287937 - 1287578
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------------tgggggtagcacctatagtagaaaag 88  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||    
T  1287937 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 1287838  T
Q  89 ttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaa 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||    
T  1287837 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 1287738  T
Q  189 gaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatg 288  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||||||    
T  1287737 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagtacactatg 1287638  T
Q  289 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
     | ||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||    
T  1287637 gcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 1275199 - 1275549
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg-ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1275199 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 1275298  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||| || |||||||||    
T  1275299 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaacaggggtagagga 1275398  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| |||  ||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  1275399 agacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaacattatgacgtcatttga 1275498  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| || | ||||||||||||||    
T  1275499 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttgt 1275549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2075822 - 2075475
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |    
T  2075822 ttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagtagaaaagttggtagaca 2075723  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  2075722 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 2075623  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaa-gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    |||| ||| || ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||| | ||||||    
T  2075622 aagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaatactatggcgtcattt 2075523  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||| ||||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  2075522 gattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 10639231 - 10639587
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatag-------tagaaaagttg 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||       |||||||||||    
T  10639231 ttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagactatagtagaaaagttg 10639330  T
Q  92 gtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagag 191  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||| ||||||||| ||   || ||||||||||    
T  10639331 gtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggagt--caagttaaaagag 10639428  T
Q  192 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 291  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |     
T  10639429 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 10639528  T
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10639529 tcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttgt 10639587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 350
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665997
Alignment:
Q  15 tggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  109 atgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  | | | |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaactct--ggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  309 ccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14665997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 68 - 346
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  168 tggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatat 267  Q
    ||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    | | | |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 154 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561384
Alignment:
Q  154 aagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 253  Q
    ||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  254 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 13561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 123 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915493
Alignment:
Q  123 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 222  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  223 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttag 322  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  323 tgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttgt 2915493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 349
Target Start/End: Original strand, 34273017 - 34273297
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||  ||| ||||||    
T  34273017 agagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaaga 34273116  T
Q  155 agagaaga-tcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 253  Q
    |||| ||| ||||               ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34273117 agaggagagtcaa---------------gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgag 34273201  T
Q  254 ttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    || ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |  |||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  34273202 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 350
Target Start/End: Original strand, 14911267 - 14911457
Alignment:
Q  160 agatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagat 259  Q
    |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14911267 agatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggat 14911366  T
Q  260 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| | |||||||||||| ||||    
T  14911367 ccaaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgttcttgt 14911457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26885037 - 26884686
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtag-aaaagttggtagaa 97  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||| ||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26885037 ttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggtagaa 26884938  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    ||||| |||||  | ||| |||||||||||| ||||   ||||||   || |||||||||| |||||| |||||| |||  | ||| |||||||||||||    
T  26884937 aataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagag 26884838  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaacactatgacatcatt 296  Q
    || || ||| |||||| |   || |||| ||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||   |||    
T  26884837 gatgagctaggaaaactaa--gaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgcaatt 26884740  T
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  26884739 tgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttgt 26884686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 196 - 350
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816667
Alignment:
Q  196 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 295  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 29816667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  209 aaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  309 ccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 238 - 348
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  338 ttgttgttgtt 348  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Original strand, 2393038 - 2393161
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  2393038 cattagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatgg 2393137  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||    
T  2393138 gataaagctt-gttgttgttgttgt 2393161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 316
Target Start/End: Original strand, 32516498 - 32516806
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||  |||  ||||||| ||||||||||| | || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32516498 tggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagagttggagtaacacttatagtagaaaagatggtggaaaataggctt 32516597  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    || || ||||||| |||| ||| || ||  |||||| | || ||| | |||| |||||  ||| || | || ||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  32516598 aggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattacaagaggtagaggaagaccta 32516697  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
    | ||||| ||  ||||||| ||||||  |||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||||| || |    
T  32516698 a-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatcgatat 32516796  T
Q  307 agccgatcca 316  Q
    | ||||||||    
T  32516797 aaccgatcca 32516806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 300
Target Start/End: Original strand, 14749297 - 14749542
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||     
T  14749297 agagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtggattctgttgtaagg 14749396  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||  ||  | |  | ||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| || |  || ||| ||||| | || ||||    
T  14749397 agagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatcaagaaggatctagagattaacgagt 14749496  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    | |||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14749497 tggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213860
Alignment:
Q  245 gtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  345 tgttgt 350  Q
    ||||||    
T  30213855 tgttgt 30213860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636129
Alignment:
Q  14 gtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgat 113  Q
    ||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggt 31636154  T
Q  114 ttagacatgtagagagaagacccgt 138  Q
    || | ||||||||||||||||||||    
T  31636153 ttgggcatgtagagagaagacccgt 31636129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 185 - 348
Target Start/End: Original strand, 28002 - 28165
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  28002 aaaagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacac 28101  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| || || | |||||  |||||  ||||||| ||||||||    
T  28102 tatggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 307
Target Start/End: Original strand, 36215434 - 36215730
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||| ||||||  |||| ||| || |||||| ||||| |||||||  ||||||  ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  36215434 ttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagtagaaaagttggtaggaa 36215531  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||  |||||||| ||| | || ||||| |||| || |||| ||  ||||| |||||||| |||||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||     
T  36215532 atatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag- 36215630  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
             |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||  || ||||||||||||||||  | |||||    
T  36215631 ---------gaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaacactatgatgtgatttg 36215721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38501660 - 38501422
Alignment:
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||||| |||  | | | ||||||| | || ||||| |    
T  38501660 ttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatggatgaagacc 38501561  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || || ||| ||   |||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||    | || ||||| ||    
T  38501560 taggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaatatgatcgat 38501461  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||    
T  38501460 gtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 28276392 - 28276523
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||   | ||||||||||||||||| |  | ||    
T  28276392 gagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactccac 28276491  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  28276492 ttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 28276523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 348
Target Start/End: Original strand, 18855799 - 18855890
Alignment:
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18855799 gatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 350
Target Start/End: Original strand, 39040918 - 39041041
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  39040918 attagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggg 39041017  T
Q  327 ataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||  |||| ||||||| |||||    
T  39041018 ataagacttgattgttgtagttgt 39041041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 418153 - 418031
Alignment:
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 327  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||    
T  418153 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtggga 418054  T
Q  328 taatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||  |||||  ||||||||||||    
T  418053 tatggcttgaatgttgttgttgt 418031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 15168756 - 15168869
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattagagagaat--gggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||| ||||    
T  15168756 gataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T
Q  129 gaagacccgtagat 142  Q
     | |||| ||||||    
T  15168856 aatgacctgtagat 15168869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442123
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  32442125 tgt 32442123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 43 - 135
Target Start/End: Original strand, 33667194 - 33667286
Alignment:
Q  43 aatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||| |||||  |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  33667194 aatgacaacattaacgagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 33667286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43557947 - 43557833
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||| ||| | | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  43557947 aaagatttggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagg 43557848  T
Q  333 cttggttgttgttgt 347  Q
    | |||||||||||||    
T  43557847 cctggttgttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408492
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 408492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 14667939 - 14668056
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||| |||| || |||||||| |||||      
T  14667939 aaagatctagagattaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaga 14668038  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  14668039 cttggttgtagttgttgt 14668056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 335
Target Start/End: Original strand, 9235201 - 9235316
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  9235201 gagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccga-cccac 9235299  T
Q  319 ttagtgtgataatgctt 335  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  9235300 ttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 349
Target Start/End: Original strand, 11675683 - 11675814
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaa 317  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| || |    
T  11675683 gagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgtagtttaatccatgtagccgacccca 11675782  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  11675783 cttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 347
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 327  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | | |||||  ||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  328 taatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| | ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 20367076 - 20367178
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||||| | || |||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  20367076 aatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataaggcttggttgttgttgt 20367175  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  20367176 tgt 20367178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 172
Target Start/End: Original strand, 79503 - 79620
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | | |||| || ||| |||||||||||||||||||  ||||| | || |||||     
T  79503 agagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaagg 79602  T
Q  155 agagaagatcaaatggag 172  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  79603 agagtcgatcaaatggag 79620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 348
Target Start/End: Original strand, 2090575 - 2090696
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 326  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| | | |||||||||||||| |||| || | | |||| |    
T  2090575 attaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccattgagtggg 2090674  T
Q  327 ataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  2090675 ataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 348
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551429
Alignment:
Q  239 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 338  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |  |||| || || |  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  339 tgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||    
T  36551420 tgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42504358 - 42504293
Alignment:
Q  236 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatc 301  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  42504358 gatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatc 42504293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 347
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgga 171  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  || | |  || || |||| |||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  172 gaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 271  Q
    | |||  ||| | |  |||||||| || ||| |||  ||||| |   ||||||| ||||| || |||  |||| | |||||||| ||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  272 tttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||| ||||| | |  |||||| ||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga-cca--ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 6859578 - 6859666
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  6859578 aaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggataaggcttggtagttgttgttgt 6859666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 7678601 - 7678760
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  7678601 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata-aacattat 7678699  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||  |  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7678700 gaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10083079 - 10082952
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||| | |||||| ||||  || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10083079 gatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 10082980  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |  || ||| | ||||||||||||||||    
T  10082979 aagtggtttcggcatgtagagagaagac 10082952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11002769 - 11002645
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||   ||||| ||||  ||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |    
T  11002769 ttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagagttcgggtagcacctacagtagaaaacatggtagaaact 11002670  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtag 125  Q
    |||||||| || ||| | |||||||    
T  11002669 agacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411961
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28411961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 42576239 - 42576295
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  42576239 atttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 42576295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 342
Target Start/End: Original strand, 2713146 - 2713213
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2713146 gatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8082059 - 8081967
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||     |||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8082059 aatgagttagatccgaatatggttta----agaacattatgacatgatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 11002499 - 11002424
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11002499 gtttttgatagaacactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 173
Target Start/End: Original strand, 42199278 - 42199394
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||     
T  42199278 agagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgtagtaagg 42199375  T
Q  155 agagaagatcaaatggaga 173  Q
    |||| |||||| |||||||    
T  42199376 agagtagatcacatggaga 42199394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418236
Alignment:
Q  16 ggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaa 418236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Original strand, 2645187 - 2645273
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2645187 aaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 348
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132619
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 9121155 - 9121078
Alignment:
Q  270 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9121155 tttttgacagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 108
Target Start/End: Original strand, 14667753 - 14667806
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14667753 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttag 14667806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 135
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676665
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacc 28676665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 330
Target Start/End: Original strand, 30588615 - 30588712
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  30588615 aaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttataatagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21193737 - 21193649
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |||| || || |||||  |||| |||||||| ||||||||||    
T  21193737 aaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttgt 21193649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 133
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  69 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 5860035 - 5860118
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||| ||||||| || |||| | | |||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5860035 atggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 7359539 - 7359259
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 166  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| || ||| | |||||||||||||||   |||||| | || ||||| |||| ||||||     
T  7359539 ggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagagagaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcag 7359441  T
Q  167 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt-agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 265  Q
    |||||| | |  ||  | |  ||||| |||||||   |||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| || ||||| | ||| |||| |||| ||||    
T  7359440 atggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactatttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaat 7359342  T
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| | |||||||||||||||| || || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  7359341 atggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 7359259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366262
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 285
Target Start/End: Original strand, 2552936 - 2553002
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacact 285  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552936 gagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Original strand, 2712944 - 2713014
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  2712944 ggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 2713014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 347
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234168
Alignment:
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 17340550 - 17340500
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340550 aaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 18351190 - 18351112
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagaca-tgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||| | || ||||||||||||||| ||||||    
T  18351190 ggggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagat 18351112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 350
Target Start/End: Original strand, 14725675 - 14725803
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca-actt 320  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||| ||| || | ||||| ||||    
T  14725675 aaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaacaatacgacataattcgatctatgcagtc-atccacactt 14725773  T
Q  321 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | ||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14725774 aatatgataagactttgttgttgttgttgt 14725803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 353
Target Start/End: Original strand, 23980127 - 23980232
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||  |||||||||  | | || |||||||| ||||||  ||| || |||||||    
T  23980127 aatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatatttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataatatttgatttttgttgt 23980226  T
Q  348 tgtcgt 353  Q
    ||||||    
T  23980227 tgtcgt 23980232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 27386569 - 27386622
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27386569 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 350
Target Start/End: Original strand, 27800036 - 27800113
Alignment:
Q  273 ttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27800036 ttgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtttttgt 27800113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 348
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18351001 - 18350937
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    |||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  18351001 aatgagttggatagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 132
Target Start/End: Original strand, 21952364 - 21952424
Alignment:
Q  72 cacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaag 132  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  21952364 cacctatagtagaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaag 21952424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Original strand, 31906626 - 31906729
Alignment:
Q  32 ataggattaagaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagag 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||| || | ||  |||||| | ||||||||||||| | |||||  |||||||  |||||||||||||| ||    
T  31906626 ataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcggaaatattcttagatagtttagacatgtagatag 31906725  T
Q  130 aaga 133  Q
    ||||    
T  31906726 aaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41200419 - 41200343
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| || | | ||||||||||||    
T  41200419 tgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttgt 41200343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400795
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||| | |||||||||||| |||||||| || | |||||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttg 9400795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28187010 - 28186955
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa 62  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  28187010 tggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagagaa 28186955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 342
Target Start/End: Original strand, 28985285 - 28985360
Alignment:
Q  267 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgtt 342  Q
    |||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  28985285 tggtttgtgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Original strand, 38684648 - 38684763
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | ||| |||| |||  |||||||||  ||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||  || || ||||||||  |||| |    
T  38684648 aaagatctagagattaattagttggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaag 38684747  T
Q  333 cttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  38684748 cttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 323
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808180
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagt 323  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagt 41808180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Original strand, 41894229 - 41894358
Alignment:
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt-------ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaactt 320  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||       || ||||| |||| ||||   | ||||||||||||||||| | || ||||    
T  41894229 ttaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactt 41894328  T
Q  321 agtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  41894329 agtgggataagactttgttgttgttgttgt 41894358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 309
Target Start/End: Original strand, 6889147 - 6889237
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagc 309  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||||||    
T  6889147 gagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagc 6889237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||  |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 350
Target Start/End: Original strand, 4653476 - 4653537
Alignment:
Q  289 acatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||| |||||| |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4653476 acataatttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttgt 4653537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 348
Target Start/End: Original strand, 5303681 - 5303730
Alignment:
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  5303681 atccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 134
Target Start/End: Original strand, 6888993 - 6889062
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagac 134  Q
    |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||||    
T  6888993 ggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttggacatgtagagagaagac 6889062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9917530 - 9917458
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||   |||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9917530 tgatagaacagtataacatcgtttga---atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 12576974 - 12576861
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | ||||||||  ||  ||||||||| | ||||||| || ||||   |||||| || ||||||||||| || | |||||| ||||| |    
T  12576974 aaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattatggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaag 12576875  T
Q  333 cttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||||||    
T  12576874 cttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 28186855 - 28186782
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||| |||||| || ||| | || ||||| ||||||||||||||||    
T  28186855 tgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 271
Target Start/End: Original strand, 36200886 - 36200935
Alignment:
Q  222 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtt 271  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36200886 aaactattataaaagatatagaggttaatgagttggatccaaatatggtt 36200935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 15588503 - 15588399
Alignment:
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 333  Q
    |||||||||||   |||||||| |||  ||| ||||| | ||| |||||| |||| | || ||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  15588503 aagatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatggcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggc 15588404  T
Q  334 ttggt 338  Q
    |||||    
T  15588403 ttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36123234 - 36123178
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  36123234 tttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgtc 36123178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Original strand, 37065677 - 37065761
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||    
T  37065677 atggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagcttagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39322132 - 39322096
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39322132 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 39322096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 288
Target Start/End: Original strand, 43035104 - 43035204
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||  |  ||||||| || | ||||||||| | |||||||||| |||    
T  43035104 agaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgagaaactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattat 43035203  T
Q  288 g 288  Q
    |    
T  43035204 g 43035204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 172
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475347
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||| || ||| |  ||  |||||||||||| ||||||   || ||||| |||| |||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  168 tggag 172  Q
    |||||    
T  43475343 tggag 43475347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 121)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42854352 - 42854001
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||   |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  42854352 ttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagagaagttggtagaaa 42854253  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  42854252 ataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagg 42854153  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  42854152 aagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatggcgtcatttg 42854053  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||| |||||||||||    
T  42854052 atccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttgt 42854001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 36545087 - 36545434
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545087 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 36545186  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||| |||||||||||    
T  36545187 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtcaagttaaaagacgtagaggaaga 36545286  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36545287 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatcc 36545386  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36545387 atgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 36545434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36565588 - 36565239
Alignment:
Q  2 tgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565588 tgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 36565489  T
Q  100 tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagga 199  Q
    ||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||    
T  36565488 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 36565389  T
Q  200 agaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttga 299  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | | ||||||    
T  36565388 agacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttga 36565289  T
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  36565288 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 36565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 40813262 - 40813609
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40813262 tggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 40813361  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
      ||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||    
T  40813362 gtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 40813461  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40813462 cctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgatagaacactatgacatcatttgatcc 40813561  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  40813562 atgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttgt 40813609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523720
Alignment:
Q  33 taggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt-agatgatttagacatgtagagag 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| | |||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 229  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  330 atgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttgt 11523720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 36395298 - 36394949
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36395298 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 36395199  T
Q  99 atagactt-agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    |||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| | |  || ||||||||||||| ||    
T  36395198 ataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaagttaaaagaggtatag 36395099  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta---tgacatca 294  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||   || |||      
T  36395098 gaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaacactattgtggcat-- 36395001  T
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  36395000 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 67 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  167 atggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaata 266  Q
    ||| || |||  || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  267 tggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 39946791 - 39947091
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39946791 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 39946890  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||    
T  39946891 ataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaagttagaagaggtagagg 39946990  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    | || |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||||| | |||||||    
T  39946991 acgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttg 39947090  T
Q  299 a 299  Q
    |    
T  39947091 a 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Original strand, 18125109 - 18125454
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18125109 ttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 18125208  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||| |    
T  18125209 aggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-aaagaggtagaggga 18125307  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||   | |||||||    
T  18125308 gacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatactatggtgt-atttgat 18125406  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    | |||||| | | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18125407 caatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 42 - 344
Target Start/End: Original strand, 8932679 - 8932982
Alignment:
Q  42 gaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgt-ag 140  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| |     
T  8932679 gaatgacaccattagagagagtgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatccgttaa 8932778  T
Q  141 ataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagattt 240  Q
    || || |||||||||||| | ||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8932779 atgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagattt 8932878  T
Q  241 agaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttg 340  Q
    | |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||    
T  8932879 aaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagcttggttg 8932978  T
Q  341 ttgt 344  Q
    ||||    
T  8932979 ttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 139 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469724
Alignment:
Q  139 agataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagat 238  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  239 ttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggt 338  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  339 tgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttgt 42469724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 330
Target Start/End: Original strand, 2796489 - 2796818
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactg--gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2796489 ttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatagtagaaaagttggtaga 2796588  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 196  Q
    |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||    | |||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  2796589 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga----ctgtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtaga 2796684  T
Q  197 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 296  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||    
T  2796685 ggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgatagaacagtatggcgtaatt 2796784  T
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  2796785 tgattcatgtagacgaccccacttagtgggataa 2796818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 350
Target Start/End: Original strand, 21121177 - 21121430
Alignment:
Q  96 aaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtag 195  Q
    |||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  21121177 aaaataggtttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtag 21121276  T
Q  196 aggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcat 295  Q
    ||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  21121277 agggagacctaagaaatctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 21121376  T
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  21121377 ttgat-catgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 21121430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 45419173 - 45419517
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||   |||| ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  45419173 ttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagagaattggggtagcacctatagtagaaaagatggtataaaat 45419272  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||| |||||| |||||  |  | ||| |||||| |||||| |||||| |||  ||| |   ||||||||||||||    
T  45419273 agacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctgaagaggtagaggaa 45419370  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||| |    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||   | |||||||    
T  45419371 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacattatggtgtaatttgat 45419470  T
Q  301 ccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45419471 ccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8879776 - 8879446
Alignment:
Q  13 agtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8879776 agtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagat 8879677  T
Q  111 gatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaa 210  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||    | |||| ||||||||||  ||||| |||||| ||   | |||  |||||| | |||| |||  || |||    
T  8879676 gatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtccaaagagcttgagggagacgtaggaa 8879581  T
Q  211 aaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagcc 310  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| | |||| ||||||||||||    
T  8879580 aactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac--tgacgtaatttaatccatgtagcc 8879483  T
Q  311 gatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||  | ||||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  8879482 gactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742079
Alignment:
Q  192 gtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgaca 291  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |     
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  292 tcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 14742079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18752221 - 18751996
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752221 ttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 18752122  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||| || |   || ||||||||||||||||||    
T  18752121 ag-cttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaaaagaggtagaggaa 18752023  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaacca 227  Q
     | |||| ||||||||| | |||||||    
T  18752022 tacctaaaaaaaccattagcgaaacca 18751996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  85 aaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggtt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||| |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  285 tatgacatcatttgatccat 304  Q
    |||| | | |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 350
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027815
Alignment:
Q  166 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 265  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 2027815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 80 - 350
Target Start/End: Original strand, 37077768 - 37078034
Alignment:
Q  80 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaacc 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |    
T  37077768 gtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 37077865  T
Q  180 aggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatag 279  Q
     ||| |||| ||||||| ||||| ||| |||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    |||||    
T  37077866 gggtcaaaataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatag 37077965  T
Q  280 aacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||  |||| | |||||||||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  37077966 aacac--tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttgt 37078034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  123 tagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgaga 222  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||             
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaac--------- 12025937  T
Q  223 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatga---catcatttgatccatgtagccgatccaact 319  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025938 ---cattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  320 tagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    |||||  |||| | ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 15215533 - 15215409
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||      
T  15215533 cattagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtag 15215434  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15215433 gataaggcttggttgttgttgttgt 15215409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25473531 - 25473402
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  25473531 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 25473432  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25473431 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 235 - 347
Target Start/End: Original strand, 44529395 - 44529507
Alignment:
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  44529395 agatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 44529494  T
Q  335 tggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||    
T  44529495 tggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047529
Alignment:
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  338 ttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttgt 44047529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 25288918 - 25289045
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| || |||| || || ||    
T  25288918 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctgaccccac 25289017  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
     |||||  |||| |||||||||||||||    
T  25289018 ctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 25300253 - 25300380
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || || ||    
T  25300253 gagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctgaccccac 25300352  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
     |||||  | || ||||||| |||||||    
T  25300353 ctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 490503 - 490620
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  490503 aaagatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagg 490602  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||    
T  490603 cttgtttgttgttgttgt 490620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 29520803 - 29520931
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||  |||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |     
T  29520803 gagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcccaccccat 29520902  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29520903 ttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 12492190 - 12492116
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacc 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12492190 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagagaatgggggtagcacc 12492116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796894
Alignment:
Q  36 gattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagagtggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaagact 12796912  T
Q  136 cgtagataccgttgtaag 153  Q
    ||| ||| |||| |||||    
T  12796911 cgttgattccgtcgtaag 12796894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35643765 - 35643605
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||  ||||  |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||      
T  35643765 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacact-- 35643668  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | |||  |||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35643667 gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttgt 35643605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45041443 - 45041315
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||  || |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  45041443 gagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 45041345  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45041344 ttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 30559847 - 30559983
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta-----gccgat 313  Q
    ||||||| || || |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     |||||     
T  30559847 gagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtaatgtagccgac 30559946  T
Q  314 ccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30559947 cccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 30559983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 350
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931245
Alignment:
Q  74 cctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaga 173  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| |||||| |||||||||| |||| | |  ||||| | || ||||| |||  |||||| ||||||     
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatctatagattctgtagtaaggagactagatcagatggagg 32931069  T
Q  174 agaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttt 273  Q
    | |  ||  | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| || | ||||||||| |     
T  32931070 atagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgta 32931168  T
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  32931169 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttgt 32931245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43904984 - 43904700
Alignment:
Q  32 ataggattaagaatgacatcattagagaga-atgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga---cttagatgatttagacatgtagag 127  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||  || || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||     ||||| || ||| |||||||||||    
T  43904984 ataggataaaaaatgacaacattagagaggtattggcgtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagag 43904885  T
Q  128 agaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaacca 227  Q
    ||||||||  |||||   || |||||||||  |||||| |||||| | |  ||  ||| |||||||| ||||||| |||  || || ||  |||||||      
T  43904884 agaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatcagatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacgg 43904785  T
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    |||  | |||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||    
T  43904784 ttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 32043524 - 32043872
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||||| |||||||||||  |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32043524 ttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtagaaa 32043623  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
     ||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| || |||   || ||||| |||  |||||| ||||||  |   ||  | |  |||||||| ||    
T  32043624 ctagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagggg 32043723  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||| || |  || ||| || || |||||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| |  | ||||    
T  32043724 aagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtttg 32043821  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    || |||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  32043822 attcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttgt 32043872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 347
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| |||  ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactatta-agaagatttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
        | ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6510768 - 6510617
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||| |||||||||||| ||   |||| |||||  ||||||| ||||  |||||  | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||    
T  6510768 tggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcgtagcacctataatagaaaagttggtagaaaacaaattt 6510669  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagag 158  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  6510668 agatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagag 6510617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985560
Alignment:
Q  8 ggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    ||||| ||||||||||  |||| ||||| ||||  || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 25985560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39967551 - 39967497
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39967551 tttgatccatgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39953556 - 39953263
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaaga 154  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||  ||||  | |||   || |||||     
T  39953556 agagagagttgggatagcacctatatgagaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaagg 39953457  T
Q  155 agagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagt 254  Q
    |||| |||||| ||| ||  ||| ||| | |  |||||||| || ||| ||| |||||| |   ||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||    
T  39953456 agagtagatcagatgaaggcgaatcagatcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagt 39953357  T
Q  255 tagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||   ||| |||||||||||| | ||||||||   |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39953356 tagagaaaaacatggtttttgatgggacactatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 42584527 - 42584643
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| || |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||| || |||||||| |||||      
T  42584527 aaagatctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat-cttgtagccgaccccacttagtgggataaga 42584625  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||| |||||||||||||    
T  42584626 cttgattgttgttgttgt 42584643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27556375 - 27556299
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  27556375 tgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttgt 27556299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 353
Target Start/End: Original strand, 30689939 - 30690023
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 353  Q
    |||| ||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  30689939 gtttatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttgtcgt 30690023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35914729 - 35914601
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||  || | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||| || || ||    
T  35914729 gagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccac 35914630  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  35914629 ttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031417
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031523
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| | | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 41031523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255528
Alignment:
Q  258 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| | | |||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 8255528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 350
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169676
Alignment:
Q  187 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 286  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  287 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||   | |||| |||||| || || | || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagtg-gataaggcttggttgatgttgttgt 28169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928585
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1928585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668495
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10668495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 350
Target Start/End: Original strand, 21425214 - 21425331
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg 332  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| || || ||||||||  |||  |    
T  21425214 aaagatatagagattaatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatgg 21425313  T
Q  333 cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  21425314 cttggttattgttgttgt 21425331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 23492217 - 23492318
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| |||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23492217 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T
Q  348 tg 349  Q
    ||    
T  23492317 tg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 353
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042486
Alignment:
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgt 353  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||| || || ||   ||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttgtcgt 36042486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Original strand, 13986433 - 13986536
Alignment:
Q  6 ctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagag--aatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataga 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||| |||||||||||||| ||||  | | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  13986433 ctggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaaatatggtagaaaataga 13986532  T
Q  104 ctta 107  Q
    ||||    
T  13986533 ctta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Original strand, 14459049 - 14459177
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaa 317  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||   | |||||||||||||||||||  || |    
T  14459049 gagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccca 14459148  T
Q  318 cttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  14459149 ctttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 350
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716107
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatcca--acttagtgtgataatgct 334  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||    |||  |||||||| ||||| |||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  335 tggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttgt 31716107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276970
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 32276970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 274 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569707
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| || | |||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 32569707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 346
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || || ||||  || || |||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 30812897 - 30812814
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  30812897 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7531725 - 7531641
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||| |  |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7531725 atggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgttcttgt 7531641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611779
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 343
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 349
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324057
Alignment:
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35324057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 35362803 - 35362651
Alignment:
Q  194 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 293  Q
    ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| ||  | |||||||| ||   ||||||||| | |||||||||| |||| | |     
T  35362803 agaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagttggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgta 35362704  T
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  35362703 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41444456 - 41444336
Alignment:
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgata 329  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||  || | |||||| |||||||||| | || ||||| ||  |||    
T  41444456 agaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacattacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaata 41444357  T
Q  330 atgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  41444356 atgcttggtcgttgttgttgt 41444336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 349
Target Start/End: Original strand, 43733410 - 43733490
Alignment:
Q  269 gtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||| |||||||||||||| | || ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||    
T  43733410 gttttggatagaacactatggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 344
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2776513 - 2776434
Alignment:
Q  63 tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  2776513 tgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagacccgtagat 2776434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10824274 - 10824187
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||| ||  | ||||  || || ||||||||||||||||||    
T  10824274 aaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgttg 10824187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 266 - 341
Target Start/End: Original strand, 16351578 - 16351653
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgt 341  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||||||||    
T  16351578 atggtttttaatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 232 - 347
Target Start/End: Original strand, 26363655 - 26363768
Alignment:
Q  232 aaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataat 331  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |    | ||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||||     
T  26363655 aaaatatttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataag 26363752  T
Q  332 gcttggttgttgttgt 347  Q
     |||||||||||||||    
T  26363753 acttggttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 30198365 - 30198262
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||||||| | ||||   |  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30198365 aatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattatggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T
Q  348 tgtc 351  Q
    ||||    
T  30198265 tgtc 30198262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Original strand, 30748399 - 30748534
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||  ||||||||||| |||| |||   || |||    
T  30748399 tggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagagttgtggtcgcaccagtagtagaaaagatggtggaatcaaggctt 30748498  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    || || ||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  30748499 aggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagat 30748534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666748
Alignment:
Q  31 gataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgacataag-agagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaa 33666748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44681381 - 44681251
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||| ||||||||||| |||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||  |  | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |    
T  44681381 tggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaaataagc 44681282  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  44681281 ttagaaggtttggaaatctagagagaagacc 44681251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 350
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065005
Alignment:
Q  300 tccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 1065005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  18 taagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgg--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattt 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||  |||||||||| || ||||||||| |||| |||  | | ||||| || |||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  116 agacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
     | ||||||||||||| || ||||| | | || ||||| |||| ||||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 142
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695708
Alignment:
Q  19 aagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgattta 116  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||| || |||     
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  117 gacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    | |||||||||||||| || ||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaagtcctgtagat 9695708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 25985881 - 25985839
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25985881 ggggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta 25985839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 343
Target Start/End: Original strand, 39702154 - 39702232
Alignment:
Q  265 tatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttg 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||    
T  39702154 tatggtttttgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 351
Target Start/End: Original strand, 41212064 - 41212149
Alignment:
Q  268 ggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgta--gccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    ||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||| ||  ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  41212064 ggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttgtc 41212149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2518493 - 2518400
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| || || |||||||  ||||| | ||||||||||||    
T  2518493 agtttgatcgaaatatgatttctgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921504
Alignment:
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 16921504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35647003 - 35646930
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| || ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  35647003 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 172
Target Start/End: Original strand, 36143367 - 36143472
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaa 166  Q
    |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||||||  ||||| | || ||| | |||| |||||||    
T  36143367 ggtagcacctatagcagaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaa 36143466  T
Q  167 atggag 172  Q
    ||||||    
T  36143467 atggag 36143472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901815
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||| || || |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttgtc 38901815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 121
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103326
Alignment:
Q  69 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacat 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttaggtgttttagacat 7103326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15215615 - 15215559
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  15215615 gctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagaga 15215559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 29 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 30113517 - 30113442
Alignment:
Q  29 atgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30113517 atgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaaagatggtagaaaatag 30113442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 350
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978159
Alignment:
Q  306 tagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 32978159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 345
Target Start/End: Original strand, 16917352 - 16917462
Alignment:
Q  234 aagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgc 333  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| | ||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||  |    
T  16917352 aagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacatt-tgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagac 16917450  T
Q  334 ttggttgttgtt 345  Q
    |||||| |||||    
T  16917451 ttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 270
Target Start/End: Original strand, 25439479 - 25439530
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 270  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  25439479 gagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  194 agaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatc 293  Q
    ||||||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |||||| || || | |||||||  |||| ||||||||| | |||||||| | |||| | |     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaactta 321  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 39651081 - 39651026
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39651081 atttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39651026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 344
Target Start/End: Original strand, 1313773 - 1313843
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| |||| | | |||| ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1313773 tgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11130004 - 11129951
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  11130004 tttgatccatgtagccta-ccaacttaatgagataatacttggttgttgttgttg 11129951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12966428 - 12966347
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgat--agaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12966428 aaagatttagagattaatgagttgaattcaaatatggtttatgatagagagcattatgacataatttgatccatatagccga 12966347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Original strand, 14903744 - 14903846
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||| | | ||||||||||||||||  | || |||||||| |  ||  |||||||||||||||    
T  14903744 aatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgtaatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgt 14903843  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  14903844 tgt 14903846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  252 agttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataa 330  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||||||| || || |||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13171991 - 13171895
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata 101  Q
    |||||| || |||||||| |||  ||||||||||  |||||||  ||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13171991 tggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtagaaaagatggtggaaaata 13171895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 25288840 - 25288916
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctata 79  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25288840 gctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 79
Target Start/End: Original strand, 25300175 - 25300251
Alignment:
Q  5 gctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga--atgggggtagcacctata 79  Q
    ||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| ||| |||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  25300175 gctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 346
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  237 atttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttg 336  Q
    |||||||| | |||||||| | |  ||||||||||| |||||||||| || | | | ||||||||||| ||||| | || ||||| ||  ||||||||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  337 gttgttgttg 346  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 37077699 - 37077752
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcatt 54  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  37077699 ttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccatt 37077752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 41444608 - 41444547
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtaga 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| || ||| ||||||||||    
T  41444608 ggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 296 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 4955345 - 4955473
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||| | |||||||  |||||| |||||  ||    
T  4955345 gagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtagtcgatctcac 4955444  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4955445 ttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985975
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttgt 12985975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  295 tttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30456377 - 30456329
Alignment:
Q  264 atatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||    
T  30456377 atattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 30456488 - 30456452
Alignment:
Q  71 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactta 107  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30456488 gcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactta 30456452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30783201 - 30783077
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| |||| |||    
T  30783201 agaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataaaacattat 30783102  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||    
T  30783101 gaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085134
Alignment:
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttgt 35085134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982893
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttgt 40982893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 263 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 42493514 - 42493426
Alignment:
Q  263 aatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtc 351  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| | || | |||||  || || |||||||||||| |||||||    
T  42493514 aatatggtatttaatagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttgtc 42493426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 45512654 - 45512558
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaa-tatggtttttgatagaaca 283  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  45512654 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 65 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 45512777 - 45512709
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||||    
T  45512777 ggggtagcacctatagtagaaaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaaga 45512709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 64)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5258498 - 5258145
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5258498 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 5258399  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtaga 196  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  5258398 aaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaagaggtaga 5258299  T
Q  197 ggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatt 296  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||    
T  5258298 gaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatggcgtcatt 5258199  T
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5258198 tgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttgt 5258145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 28085310 - 28085661
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085310 ttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 28085409  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||    
T  28085410 ataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaagttaaaagaggtagagg 28085509  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||   |||||||    
T  28085510 aagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggtgtcatttg 28085609  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28085610 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35043789 - 35043441
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagag--agaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  35043789 ttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaaagttggttgaaa 35043690  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||  |||||||||||| ||||| |    
T  35043689 ataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaaaagaagtagatg 35043590  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35043589 aagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttg 35043490  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  35043489 atcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21352183 - 21351872
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21352183 ttgcgctagataagtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaat 21352084  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  21352083 aggcttagatgatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaa 21351984  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  21351983 gacctaagaaaaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgat 21351884  T
Q  301 ccatgtagccga 312  Q
    ||||||||||||    
T  21351883 ccatgtagccga 21351872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 346
Target Start/End: Original strand, 608099 - 608442
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  608099 tggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagtgagggtatcacctatagtagaaaagttgatagaaaataggctt 608198  T
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaag----a 202  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| ||||||||||| || ||||    |    
T  608199 agatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaaaagaggttgatgaagaccta 608298  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  608299 attaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaatactatgacgtcatttgatcc 608398  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  608399 atgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 9706710 - 9707052
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9706710 ttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaaagttggtagaaa 9706809  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| |||      ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  9706810 ataggcttagatggttt------gtagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtacggg 9706903  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||  ||||| |||||||| || ||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9706904 aagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcatcatttg 9707003  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9707004 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 344
Target Start/End: Original strand, 30031196 - 30031535
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagag--aatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30031196 tggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 30031295  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |    
T  30031296 ttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagagggagacc 30031395  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  30031396 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccat 30031495  T
Q  305 gtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||| |  |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30031496 gtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 350
Target Start/End: Original strand, 32755859 - 32756206
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32755859 tggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 32755958  T
Q  103 acttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaaga 202  Q
     |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||||||||| ||||||||||||| |||  || |||||||||||||||| ||||    
T  32755959 gcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagaaaga 32756058  T
Q  203 actaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatcc 302  Q
     ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32756059 cctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 32756158  T
Q  303 atgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||  ||||| ||||||||||||    
T  32756159 atgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttgt 32756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 20427984 - 20427633
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20427984 ttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 20427885  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| |||  || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||  ||  ||||||| ||||||| ||||    
T  20427884 ataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttacaagaggttgagg 20427785  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||     
T  20427784 aagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaa-atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatactatggcgacattta 20427686  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatg-cttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20427685 atcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttgt 20427633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 307
Target Start/End: Original strand, 5631758 - 5632064
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa------tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5631758 tggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtagaaaagttggtagaaaat 5631857  T
Q  101 agacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaa 200  Q
    |  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| || ||||||||||||| |||  ||| |||||||||  | |||||    
T  5631858 atgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagattaaaagagacaaaggaa 5631957  T
Q  201 gaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgat 300  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5631958 gacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacactatgacgtcatttgat 5632057  T
Q  301 ccatgta 307  Q
    |||||||    
T  5632058 ccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 14030740 - 14031080
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggt-aagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 97  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14030740 ttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagat 14030839  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    ||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||||||||| | | |||  | | |||||||||||||||    
T  14030840 aataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcggattaaaagaggtagag 14030939  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
    ||||| ||||||            ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  14030940 gaagacctaaga------------aaaacattagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaatactataacgtcattt 14031027  T
Q  298 gatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| || |||| || | |||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  14031028 gatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttgt 14031080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 42 - 350
Target Start/End: Original strand, 12890559 - 12890860
Alignment:
Q  42 gaatgacatcattag--agagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgta 139  Q
    |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||         ||| ||    
T  12890559 gaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgta---------cccata 12890649  T
Q  140 gataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatt 239  Q
    ||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  12890650 gatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatt 12890749  T
Q  240 tagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggtt 339  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  12890750 tagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 12890849  T
Q  340 gttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||    
T  12890850 gttgttgttgt 12890860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 10100197 - 10099993
Alignment:
Q  9 gatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttag 108  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  10100197 gatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagagtgggggtcgcacatatagtagaaaagttggtagaaaataagcttag 10100098  T
Q  109 atgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaag 208  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  10100097 atggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaaaagaggtagaggaagacctagg 10099998  T
Q  209 aaaac 213  Q
    |||||    
T  10099997 aaaac 10099993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 349
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  76 tatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaag 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  176 aaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttg 275  Q
    |  || |||| |||||||| ||||||          || ||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaag----------actattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143762
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34143762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156378
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | ||||||||||||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttgt 34156378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 304
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  67 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-tagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatca 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  | || |||||||||||||||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  166 aatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaat 265  Q
    |||| || ||   || ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  33497062 aatgaaggagt--caagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9594060 - 9593709
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--------ggggtagcacctatagtagaaaagttgg 92  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||  |        |||||||||||  ||||||||||| |||    
T  9594060 ttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattagtagaaaagatgg 9593961  T
Q  93 tagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagagg 192  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||||| |||||| |||||| |||  ||  |   ||||||    
T  9593960 tagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaaat--caagagg 9593863  T
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| |||  ||||  ||  ||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||   |    
T  9593862 tagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgatagaacattatg--gt 9593765  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
     ||||||||||| |||| || |  ||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  9593764 aatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 228 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206456
Alignment:
Q  228 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtga 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  328 taatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||  ||||||| ||||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttgt 3206456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 350
Target Start/End: Original strand, 31819004 - 31819116
Alignment:
Q  238 tttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttgg 337  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  31819004 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgg 31819103  T
Q  338 ttgttgttgttgt 350  Q
    |||| ||||||||    
T  31819104 ttgtggttgttgt 31819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34934941 - 34934830
Alignment:
Q  236 gatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgctt 335  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  34934941 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 34934842  T
Q  336 ggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||    
T  34934841 ggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 308
Target Start/End: Original strand, 5080905 - 5081083
Alignment:
Q  130 aagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccatt 229  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| | ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||| ||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||    
T  5080905 aagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcatt 5081004  T
Q  230 agaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtag 308  Q
      |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5081005 caaaattatttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28027167 - 28026896
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattaga--gagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  28027167 tggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatgggg-tagcacctatagtagaaaatgtggtagaaaataggc 28027069  T
Q  105 ttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaac 204  Q
    || | || ||| |||||||||||| || ||| |||||| | || ||| |||||| | |||| |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||| |    
T  28027068 ttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcagattagaagaggtagaggaagacc 28026970  T
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 278  Q
    ||| ||||| ||  || |||||||||  ||||||||| |||| ||||| ||  || |||||||||||| |||||    
T  28026969 taaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 242
Target Start/End: Original strand, 7133800 - 7133923
Alignment:
Q  119 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7133800 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7133899  T
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttag 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7133900 gagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 242
Target Start/End: Original strand, 7136723 - 7136846
Alignment:
Q  119 catgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccattt 218  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||     
T  7136723 catgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatta 7136822  T
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttag 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  7136823 gagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 71 - 347
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  71 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatgg 170  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||| |||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  171 agaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggt 270  Q
    || |||  || || |||||||||      ||| |||  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||  || || ||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  271 ttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || | |||||| |||||||| | ||||||| ||| ||  ||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 347
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  187 aagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacacta 286  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |   |||||||  |||| |||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  287 tgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    || | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 266 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789071
Alignment:
Q  266 atggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgttcttgt 30789071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10099022 - 10098893
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||  ||| || ||    
T  10099022 gagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccccac 10098925  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  10098924 ttagtgggataagacttgattgttgttgttgt 10098893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34502
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||  |||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | | |||||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgt 34502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4245957 - 4245869
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4245957 aaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttgt 4245869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 349
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtg 326  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||| ||||||||| | || ||||| | |||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  327 ataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||| ||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 5080789 - 5080888
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagaga--gaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||||||||| | |||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5080789 ttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaaagttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 219 - 347
Target Start/End: Original strand, 31818685 - 31818813
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| ||| | |||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||| || ||    
T  31818685 gagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagtatggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccac 31818784  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| | || || ||||||||||||||||    
T  31818785 ttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 6056118 - 6056032
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaa 87  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  6056118 ttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagagttggggtaacacctatagtagaaaa 6056032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 312
Target Start/End: Original strand, 24665965 - 24666058
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||    
T  24665965 gagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6055933 - 6055806
Alignment:
Q  185 aaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacac 284  Q
    |||| ||||||||||||| |||  |||||  |  ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | | ||||||||     
T  6055933 aaaaaaggtagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacat 6055834  T
Q  285 tatgacatcatttgatccatgtagccga 312  Q
    || ||| | ||||||| |||||||||||    
T  6055833 tacgacgtaatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 345
Target Start/End: Original strand, 7492550 - 7492669
Alignment:
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  | | |||||  ||| |||||||| || ||||||||     
T  7492550 cattaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtgg 7492649  T
Q  326 gataatgcttggttgttgtt 345  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  7492650 gataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119642
Alignment:
Q  261 caaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615223
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24665887
Alignment:
Q  73 acctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagat 142  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagat 24665887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Original strand, 579615 - 579703
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||  ||| | |||| | | |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  579615 aaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttgt 579703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Original strand, 33084048 - 33084128
Alignment:
Q  55 agagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||    
T  33084048 agagagagttggggtagcacctatggtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagacc 33084128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12133973 - 12133901
Alignment:
Q  276 atagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12133973 atagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgtt 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095910
Alignment:
Q  10 atgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg--ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 102  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||  |||||||| || ||  ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaatag 5095910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9109582 - 9109507
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||||| |||||||  |  |||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9109582 tgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttg 9109507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6293491 - 6293389
Alignment:
Q  248 aatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    ||||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||| || | |||| || |||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||  |||||    
T  6293491 aatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgt 6293392  T
Q  348 tgt 350  Q
    |||    
T  6293391 tgt 6293389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 9568594 - 9568708
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagag----agaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||    ||  | | |||||||| ||||||||||||| || | ||    
T  9568594 ttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagatgatgga 9568693  T
Q  97 aaatagacttagatg 111  Q
    |||| ||||||||||    
T  9568694 aaatggacttagatg 9568708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14389275 - 14389202
Alignment:
Q  233 aaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | | | |||||||||||||    
T  14389275 aaagatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 344
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  275 gatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 347
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 350
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39056
Alignment:
Q  270 tttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||  | ||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttgt 39056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 348
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||| ||||| |||| ||||| ||  ||||||| ||||  |||||||||||  | ||| |||| ||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| || || ||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 133
Target Start/End: Original strand, 2079341 - 2079408
Alignment:
Q  66 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||  || |||||  ||||||||||||||    
T  2079341 gggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaaga 2079408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6906878 - 6906819
Alignment:
Q  296 ttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgtcgtct 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||    
T  6906878 ttgatccatgtagccgacccaacttagtgcgataagactttgatgttgttgtcgtcgtct 6906819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 14389462 - 14389380
Alignment:
Q  52 attagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | |||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  14389462 attagagagagttgaggtagcacctatcgtagaaaagatggt-ggaaacaaacttaggtggtttggacatgtagagagaagacc 14389380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 344
Target Start/End: Original strand, 21089606 - 21089676
Alignment:
Q  274 tgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgt 344  Q
    |||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| |  || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21089606 tgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3127306 - 3127273
Alignment:
Q  317 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3127306 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 3127273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4878327 - 4878294
Alignment:
Q  317 acttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4878327 acttagtgtgataaggcttggttgttgttgttgt 4878294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6641691 - 6641650
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagactt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6641691 ggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt 6641650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  68 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagaga 128  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||| | ||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 350
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568983
Alignment:
Q  250 tgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttg 349  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||| | | ||||||||||| ||||| | || ||||| || ||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 15 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 21870403 - 21870322
Alignment:
Q  15 tggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||  |||| ||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21870403 tggtatgactagacatgatagaattagaaatgtcaatattagagag--ttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaa 21870322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 294 - 350
Target Start/End: Original strand, 30642998 - 30643054
Alignment:
Q  294 atttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  30642998 atttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttgt 30643054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 26 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1269 - 945
Alignment:
Q  26 gacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtag 125  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  1269 gacaggataggattatgaatgacaccattagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtag 1170  T
Q  126 agagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaac 225  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||    
T  1169 agagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 1070  T
Q  226 cattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgt 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || | ||||||     
T  1069 cattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccatttagtgg 970  T
Q  326 gataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  969 gataaggcttggttgttgttgttgt 945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Original strand, 31402 - 31753
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31402 ttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 31501  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||||||    
T  31502 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagagg 31601  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||| |||  |||||||    
T  31602 aagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactgtgaagtcatttg 31701  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31702 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 31753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 44150 - 44080
Alignment:
Q  65 ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacc 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  44150 ggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacc 44080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 175; Significance: 7e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 7e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Original strand, 82655 - 83000
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 98  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82655 ttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 82754  T
Q  99 atagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagagg 198  Q
    || | |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | || |||||||| | | ||||||||||| |||    |||||| |||||||||||    
T  82755 atgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaagagaggtagagg 82852  T
Q  199 aagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttg 298  Q
    |||| ||| |||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  82853 aagacctaggaaaactata-gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacactatgacgtcatttg 82951  T
Q  299 atccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  82952 atccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Original strand, 16692 - 16860
Alignment:
Q  179 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16692 caggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 16791  T
Q  279 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgt 347  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16792 gaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4620 - 4277
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaatg---ggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 97  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  |   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4620 ttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtagaaaagttggtaaaa 4521  T
Q  98 aatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagag 197  Q
    ||||| |||||||  ||| | |||||||| ||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||       
T  4520 aataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagttaaaagaggta--- 4424  T
Q  198 gaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcattt 297  Q
           || |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||    
T  4423 -------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaacactatgacgttattt 4331  T
Q  298 gatccatgtagccga-tccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||| |||  || | ||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  4330 gatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttgt 4277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 79 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 86877 - 86606
Alignment:
Q  79 agtagaaaagttggtagaaaatagacttagatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaac 178  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||      
T  86877 agtagaaaagttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagt 86778  T
Q  179 caggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgata 278  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||  || ||||||||| |||||| |||||||||||| |   ||| |||||||||||| | | |||||    
T  86777 caggttaaaagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgata 86678  T
Q  279 gaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||   | |||||||| ||||   |||| |||||||||||||    
T  86677 gaacactatgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttgt 86606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 86955 - 86895
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagaga 61  Q
    |||||||||||||||||||||||  || | |||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  86955 ttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagaga 86895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Original strand, 4706 - 4921
Alignment:
Q  135 ccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaa 234  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| |||   || |||||||||||||| ||||   || |||||||||  ||||||||||||||||    
T  4706 ccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaa 4805  T
Q  235 agatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgct 334  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| || |||| ||| ||||| |||    
T  4806 ggatttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgct 4905  T
Q  335 tggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  4906 tggttgttgttgttgt 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 193 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25529
Alignment:
Q  193 tagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacat 292  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  293 catttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 25529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 25787 - 25683
Alignment:
Q  7 tggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagac 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25787 tggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc 25688  T
Q  105 ttaga 109  Q
    |||||    
T  25687 ttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 81; Significance: 9e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 107 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11546
Alignment:
Q  107 agatgatttagacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggagaagaaccaggttaaaagaggtagaggaagaacta 206  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||| |||||||||| ||| | |||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  207 agaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgt 306  Q
     |||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  307 agccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    |||||| || |||||||  ||||| | ||||||| |||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttgt 11546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11946 - 11810
Alignment:
Q  1 ttgcgctggatgagtggtaagactggacatgataggattaagaatgacatcattagagagaa----tgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11946 ttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 11847  T
Q  97 aaatagacttagatgatttagacatgtagagagaaga 133  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11846 aaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Original strand, 485 - 614
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||    
T  485 gagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccac 584  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  585 ttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Original strand, 14737 - 14868
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||| | || ||    
T  14737 gagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccac 14836  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
     ||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14837 gtagtgggataaatcttggttgttgttgttgt 14868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28886
Alignment:
Q  257 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgt 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58223
Alignment:
Q  188 agaggtagaggaagaactaagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactat 287  Q
    ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||||||  |||| ||| | || ||| |||||||||| || | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  288 gacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    | | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttgt 58223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 46; Significance: 7e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 345
Target Start/End: Original strand, 7580 - 7720
Alignment:
Q  205 taagaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccat 304  Q
    ||||||||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||| | | |||||||||||    
T  7580 taagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagttggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccat 7679  T
Q  305 gtagccgatc-caacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    | |||| ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7680 gcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1647 - 1519
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |   |||| |  ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||| || || ||    
T  1647 gagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgatcaatgtagctgaccccac 1551  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||| |  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1550 ttattaagataaagcttggttgttgttgttgt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 160452 - 160325
Alignment:
Q  219 gagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaac 318  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||  ||||||||| | || ||    
T  160452 gagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtagccaaccccac 160353  T
Q  319 ttagtgtgataatgcttggttgttgttg 346  Q
    |||||| || || |||||||||||||||    
T  160352 ttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  259 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgtt 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||  ||||| |||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  262 aaatatggtttttgatagaacactatgacatcatttgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgtt 348  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 350
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19202
Alignment:
Q  297 tgatccatgtagccgatccaacttagtgtgataatgcttggttgttgttgttgt 350  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttgt 19202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39537
Alignment:
Q  227 attagaaaagatttagaggtcaatgagttagatccaaatatggtttttgatagaaca 283  Q
    ||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaaca 39537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University