View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2635_low_1 (Length: 554)

Name: NF2635_low_1
Description: NF2635
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2635_low_1
NF2635_low_1
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (13-539)||(12541383-12541908)
chr5 (68-514)||(28386060-28386509)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (71-529)||(13440908-13441378)
chr2 (66-391)||(13462230-13462567)
chr2 (71-529)||(13449071-13449541)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (66-534)||(3416532-3417012)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (71-214)||(48959176-48959319)
chr4 (70-214)||(48963318-48963462)
chr4 (71-211)||(48966367-48966507)
chr4 (254-323)||(48959055-48959124)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (71-214)||(12482462-12482605)
chr6 (71-210)||(12589194-12589333)
chr6 (254-330)||(12482657-12482733)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (78-214)||(12640495-12640631)
chr8 (254-331)||(12640683-12640760)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 478; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 12541908 - 12541383
Alignment:
Q  13 aatataaaacaccaaagcagatatggttgatagagatagacnnnnnnnntatatcagaaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcactt 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541908 aatataaaacaccaaagaagatatggttgatagagatagacaaaaaaa-tatatcagaaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcactt 12541810  T
Q  113 cattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgtttgcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctcc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12541809 cattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgtttgcatcacatggccaacaagtcacaatcatcaccactccctcc 12541710  T
Q  213 aatgttgatacccttaccaaatctctcccatccatcctcacccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatcta 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541709 aatgttgaaacccttaccaaatctctcccatccatcctcacccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatcta 12541610  T
Q  313 tgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcacaatggtgcaatgctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctga 412  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541609 tgtcctccaccactgaccccattacctcttggaaaattcacaatggtgcaatgctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctga 12541510  T
Q  413 ttgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgacttggctcgtaagctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541509 ttgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgacttggctcgtaagctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtc 12541410  T
Q  513 tccctcatggaatcccttagaaaaaac 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12541409 tccctcatggaatcccttagaaaaaac 12541383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 68 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 28386509 - 28386060
Alignment:
Q  68 agaaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttg 167  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28386509 agaaatgaatggtgttgaagttgaaagaccattgaaacttcacttcattccgtatccagcatctggacatatgatgccactttgtgatatagcaactttg 28386410  T
Q  168 tttgcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaatgttgatacccttaccaaatctctcccat---ccatcctcacccttcacactg 264  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||| ||| ||||| |||   ||  ||||  ||||||||| |    
T  28386409 tttgcatcacgtggccaacatgtcacaatcatcaccactccctccaatgcccaatcccttactaaaactctctcatctgccgccctccgccttcacaccg 28386310  T
Q  265 tcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcacaatggtgcaat 364  Q
    | || |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||| |||||    
T  28386309 ttgaattcccctatcaacaagtcgacctccctaaaggcgttgagtctatgacctccaccactgaccctatcaccacttggaagatccataatggcgcaat 28386210  T
Q  365 gctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctgattgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgacttggctcgtaag 464  Q
    ||||||| ||| | |  |||  ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  | | |||||||| |||||||||||| |  |||    
T  28386209 gctcctcaatgaagcggttggggatttcgttgagaagaatccaccggattgtattattgctgactccgcattctcatgggctaatgacttggcccacaag 28386110  T
Q  465 ctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtctc 514  Q
    || ||| | || ||| | || || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  28386109 cttcaaatcccgaatctaacgtttaatggatcgtctctctttgctgtctc 28386060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 71 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 13441378 - 13440908
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13441378 aatggaaggtgttgaagtggaacgaccactgaaaattcacttcattccatatctagcatctggacatatgatccctctttgtgacatagcaactatgttt 13441279  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaatgttgatacccttaccaaatctctcccatc------------catcctcacccttc 258  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |  |||| |||||||||||| ||||            | |||||  | | |    
T  13441278 gcatcccgtggccaacaagtcacaatcatcaccactccctccaacgctcaatccctaaccaaatctctctcatccgcggcttccttcttcctccgcttcc 13441179  T
Q  259 acactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcacaatgg 358  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||  |||    
T  13441178 acaccgtcgactttccctcccaacaagtcgacctccctgaaggcattgaatctatgtcttccaccactgactctatgacctcttggaagatccaccgtgg 13441079  T
Q  359 tgcaatgctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctgattgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgacttggct 458  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||||  | | |||  ||||||| |||||||||||  |||||||  | ||| |||||| ||||||||||||     
T  13441078 cgcaatgctcctccatggatccattgaggatttcatggagaaagatccaccagattgtatcatctccgactccgcatacccatgggctaatgacttggcg 13440979  T
Q  459 cgtaagctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtctccctcatggaatccct 529  Q
    | |||||| ||  | || ||  |||||||||||||||  || |||||| | ||||| ||| ||||||||||    
T  13440978 cataagcttcagatcccaaacctcacattcaatggattgtcactttttaccgtctctctcgtggaatccct 13440908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 13462567 - 13462230
Alignment:
Q  66 tcagaaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactt 165  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||| | ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  13462567 tcagcaatggaaggtgtagaagttgaacaaccactgaaactgcacttcattccatatctagcatctggacatatgatccctctttttgacatagcaatta 13462468  T
Q  166 tgtttgcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaatgttgatacccttaccaaatctctc------------ccatccatcctcac 253  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||  |  |||||||||||||||||            || ||| ||||       
T  13462467 tgtttgcatcccgtggccaacacgtcacagtcatcaccactccctccaacgtccaatcccttaccaaatctctctcatccgccgctccctccctccttcg 13462368  T
Q  254 ccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcac 353  Q
    | |||||||  |||| ||||||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||     
T  13462367 ctttcacaccatcgaattcccctcccaacaagttggccttcctgatggcattgaatctatgtcttccaccaccgactccaccacatcttggaagatccat 13462268  T
Q  354 aatggtgcaatgctcctccatggacccattgatgattt 391  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13462267 catggcgcaatgctcctccatggacccattgaggattt 13462230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 71 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 13449541 - 13449071
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13449541 aatggaaggtgttgaagttgaacaaccattgaaagtttacttcattccatttcttgcatctggacatatgatccctctttttgacatagcaactatgttt 13449442  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaatgttgatacccttaccaaatctctcccatcc----atcc-tca--cc-----cttc 258  Q
    ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |   |  ||||||||||||||||| |||||     ||| |||  ||     ||||    
T  13449441 gcatcccgtggccagcaagtaacagtcatcaccactcccgccaacgcaaaatcccttaccaaatctctctcatccgacgctccttcattccttcgtcttc 13449342  T
Q  259 acactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcacaatgg 358  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| || || || ||||||| |||| |||||||||| || | |||    
T  13449341 acaccgttgacttcccctcccaacaagtcggcctccctgaaggtattgaatctatgtcttcaactacggaccccaccaccacttggaagatccatactgg 13449242  T
Q  359 tgcaatgctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctgattgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgacttggct 458  Q
     || ||||||||  | | ||| ||||  |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||  |||||||  | ||| |||||| ||||||||||||     
T  13449241 cgcgatgctccttaaagaacctattggggatttcattgagaatgatccaccggattgtatcatctccgactccacgtacccatgggttaatgacttggcc 13449142  T
Q  459 cgtaagctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtctccctcatggaatccct 529  Q
      |||| | ||  | || ||  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13449141 gataagtttcagatcccaaacatcacattcaatggattgtgcctttttgctgtctccctcgtggaaaccct 13449071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 66 - 534
Target Start/End: Original strand, 3416532 - 3417012
Alignment:
Q  66 tcagaaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactt 165  Q
    |||| ||||| |||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  3416532 tcagcaatggtaggtgttgaagtagaacgaccactgaaaattcacttcattccttatcttgcatctagccatatgatccctctttctgatatagcagcta 3416631  T
Q  166 tgtttgcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaatgttgatacccttaccaaatctct------------cccatccatcctcac 253  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||   |    ||||| ||||||||             || | | |||||      
T  3416632 tgtttgcatcccatggccaacatgtcacaatcatcaccactccctccaatgccaaatttcttacaaaatctctttcttatgccgctcccttcttcctccg 3416731  T
Q  254 ccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccccatcacctcttggaagattcac 353  Q
    ||||||||| |||||||| ||||   ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||  ||    
T  3416732 ccttcacaccgtcgactttccctttcaacaaatggacctccctgaaggcattgaatctatatcctccaccaccgacctcgtcaccacttggaagatcaac 3416831  T
Q  354 aatggtgcaatgctcctccatggacccattgatgattttgttgtgaataatccacctgattgtatcattgccgactcttcttactcatggggtaatgact 453  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||   ||  ||||||| |||||||||||  |||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  3416832 aatggcgcaatgctcctccatcgacccattgaggatttcattaaaaacgatccaccagattgtatcatctccgactctgcatacccatgggttaatgact 3416931  T
Q  454 tggctcgtaagctacaagtacccaatttcacattcaatggatcctctctttttgctgtctccctcatggaatcccttagaa 534  Q
    |||| |  ||||| ||| | || |||||||||| |||||  |  ||  ||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  3416932 tggcccagaagcttcaaatccctaatttcacatacaatgttttgtccgtttttccagtcttgctcatggaatcccttagaa 3417012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48959319 - 48959176
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||  | ||||| ||||||||| |||||    
T  48959319 aatggaaggtgttgaagttgatagacctatgaaacttcacttcattccatatccagcacctgggcatatgatccccatgtgtgacatagcaactctgttt 48959220  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaa 214  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48959219 gcatcccatggccaacaagtgacaatcatcaccactccctccaa 48959176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 70 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 48963462 - 48963318
Alignment:
Q  70 aaatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgtt 169  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| ||| |  |||| |||||| || ||||    
T  48963462 aaatggagggcgttgaagttgaacgaccattgaaacttcacttcattccatatcttgcacctggtcatatgattcctttgggtgacatagcagctctgtt 48963363  T
Q  170 tgcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaa 214  Q
    ||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48963362 tgcgtcccgtggccaacaagtcacaatcatcaccactccctccaa 48963318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 48966507 - 48966367
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||    
T  48966507 aatggaaggtgttgaaattaaacgaccactgaaacttcacttcattccatatctagcaccaggccatatgatccctatgtgtgacatagcaactatcttt 48966408  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctc 211  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  48966407 gcatctcatggccaacaagtcaccatcatcacaactccctc 48966367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 48959124 - 48959055
Alignment:
Q  254 ccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccacc 323  Q
    |||||||  |||| |||| |||||| ||||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  48959124 ccttcaccttgtcaactttccctcccaacaagttggcctccctgacggcgttgaatctatgtcctccacc 48959055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 214
Target Start/End: Original strand, 12482462 - 12482605
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | ||  | || |||||| |||||    
T  12482462 aatggaaggtgttgaagttgaacgaccattgaaacttcacttcattccatttccagcacctgggcatatgatccctatgtgcaagattgcaactctgttt 12482561  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaa 214  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  12482562 gcatcacgtggccatcatgtcacaatcatcaccactccttccaa 12482605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 210
Target Start/End: Original strand, 12589194 - 12589333
Alignment:
Q  71 aatggaaggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgttt 170  Q
    |||| |||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||    
T  12589194 aatgaaaggcgttgaaattgaacaaccattaaaacttcacttcattccatatctatcacctgggcatatgatccctctatgtgacattgcaaccctgttt 12589293  T
Q  171 gcatcacatggccaccaagtcacaatcatcaccactccct 210  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12589294 gcatcccgtggccaacaagtcacaatcaccaccactccct 12589333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 330
Target Start/End: Original strand, 12482657 - 12482733
Alignment:
Q  254 ccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgacc 330  Q
    ||||||||| |||||||| |||| | || |||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  12482657 ccttcacaccgtcgactttcccttccaagaagtcggcctcgctaacggcatagaatctttgtcctccaccgctgacc 12482733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 214
Target Start/End: Original strand, 12640495 - 12640631
Alignment:
Q  78 ggtgttgaagttgatcgaccattaaaaattcacttcattccatatttagcatctggacatatgatccctctttgtgatatagcaactttgtttgcatcac 177  Q
    ||||||| |||||| || ||||| ||| ||| | |  |||||| | ||||| |||| |||||||| ||| |  |||| |||||| ||||||||||||| |    
T  12640495 ggtgttggagttgaacggccattgaaacttctcatacttccatttctagcacctggtcatatgattcctttgggtgacatagcagctttgtttgcatccc 12640594  T
Q  178 atggccaccaagtcacaatcatcaccactccctccaa 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12640595 atggccaacaagtcacgatcatcaccactccctccaa 12640631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 331
Target Start/End: Original strand, 12640683 - 12640760
Alignment:
Q  254 ccttcacactgtcgacttcccctccgaacaagtcgacctccctaaaggcattgaatctatgtcctccaccactgaccc 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  | ||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  12640683 ccttcacaccgtcgacttcccctcccaacaagtcgatcttcccgacggcgttgaatcattgtcctccaccactaaccc 12640760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University