View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2640R-Insertion-2 (Length: 946)

Name: NF2640R-Insertion-2
Description: NF2640R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2640R-Insertion-2
NF2640R-Insertion-2
[»] chr7 (3 HSPs)
chr7 (9-940)||(44488261-44489196)
chr7 (351-779)||(44474252-44474680)
chr7 (467-569)||(44463886-44463988)
[»] scaffold0458 (2 HSPs)
scaffold0458 (370-800)||(12416-12846)
scaffold0458 (370-457)||(2718-2805)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (370-800)||(39450816-39451246)
chr1 (370-800)||(39460203-39460633)
chr1 (370-800)||(39471688-39472118)
chr1 (376-782)||(24060899-24061305)
chr1 (472-566)||(37165364-37165458)
chr1 (529-590)||(745235-745296)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (529-578)||(19476547-19476596)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (224-273)||(10485399-10485448)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 866; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 866; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 44489196 - 44488261
Alignment:
Q  9 aaaacaaggcgtatctgatgatgatcggagatggaatcaaccgaacaattatcaccggcaatcacagtgttggtgatggatggacaacttttaattcccc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44489196 aaaacaaggcgtatctgatgatgatcggagatggaatcaaccgaacaattatcaccggcaatcacagtgttggtgatggatggacaacttttaattcccc 44489097  T
Q  109 aacatttggtaagaaaacaatttttatttcattttcagaaactata----catcttttggttaggtctaattcaatccttacaaaatcagcttttacaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44489096 aacatttggtaagaaaacaatttttatttcattttcagaaactatatatacatcttttggttaggtctaattcaatccttacaaaatcagcttttacaat 44488997  T
Q  205 gaagatatattgtcttcatttataaacacattttcagactatatcttattggacgtgagacttttaacaaaaagtttactttaaactagcaatgcaattg 304  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44488996 gaagat----tgtcttcatttataaacacattttcagactatatcttattggacgtgagacttttaacaaaaagtttactttaaactagcagtgcaattg 44488901  T
Q  305 ttttcctcaccgagaaattttacgtaagtctactatatgtttttgtagctgtcgtagcaccaggatttgtagcagttaacataacatttcggaacacagc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44488900 ttttcctcaccgagaaattttacgtaagtctactatatgtttttgtagctgtcgtagcaccaggatttgtagcagttaacataacatttcggaacacagc 44488801  T
Q  405 cgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgttgcagctttgaagggtaccaagacactctctataca 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44488800 cgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgttgcagctttgaagggtaccaagacactctctatgca 44488701  T
Q  505 cattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaacgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatc 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44488700 cattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaacgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatc 44488601  T
Q  605 ctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaaaacacaggcatttccattcacaattgcactgttaa 704  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44488600 ctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaaaacacaggcatttccattcacaattgcactgttaa 44488501  T
Q  705 accagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaagagtattcaagaactgttgttatgcagtcttttttg 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44488500 accagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaagagtattcaagaactgttgttatgcagtcttttttg 44488401  T
Q  805 gaaaatttgattgaccaagctggttggtccatttggagtggtgattttgcactctctacgttgtattatgcagagtttgat-atagaggacctggtgcag 903  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44488400 gaaaatttgattgaccaagctggttggtccatttggagtggtgattttgcactctctacgttgtattatgcagagtttgataatagaggacctggtgcag 44488301  T
Q  904 acacttct-atagag-tacatggcca-ggtaccatgtgat 940  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44488300 acacttctaatagagttacatggccagggtaccatgtgat 44488261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 44474680 - 44474252
Alignment:
Q  351 agctgtcgtagcaccaggatttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagat 450  Q
    |||||| || |||| ||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||| ||  | ||||  || || |||    
T  44474680 agctgtggttgcacaaggattcttagcggttaacatgacatttcgcaacacggctggaccaagcaaacaccaagcagtcgcggtaagaaacggagctgat 44474581  T
Q  451 atgtccagtttctatcgttgcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaa 550  Q
     ||||||  |||||  | |||||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||  | ||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||     
T  44474580 ttgtccaccttctacagctgcagcttcgaaggctatcaagatactttgtacacacattccatgaggcaattttatcgcgaatgtgacatctatggaacag 44474481  T
Q  551 tagattttatatttggaaacgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttaca-tggacaattcaatcccatcaccgctcaag 649  Q
    | || || ||||||||||| || || |||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||  | || ||||||||||    
T  44474480 ttgacttcatatttggaaatgctgctgttgttttacaatcttgcaacatatatccccgacttccc-aacagtggacaattcaacgctataaccgctcaag 44474382  T
Q  650 gacgcactgatccaaaccaaaacacaggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaactta 749  Q
    | || || |||||||| ||||||||||| | ||| || || |||   ||| | ||| |  |||| ||||| |||||     || |||| |||||||| ||    
T  44474381 gccgaacggatccaaatcaaaacacaggaacttctatacataatgcaactataaaagctactgatgatttggctccgttgattggtacagtgaaaacata 44474282  T
Q  750 ccttgggaggccatggaaagagtattcaag 779  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44474281 ccttggtaggccatggaaagagtactcaag 44474252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 467 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 44463988 - 44463886
Alignment:
Q  467 gttgcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttgg 566  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  44463988 gttgcagtttcgaagggtaccaagacacgttatacacacattcactaagacaattctacagagaatgtgacatttatggaacagtagatttcatattcgg 44463889  T
Q  567 aaa 569  Q
    |||    
T  44463888 aaa 44463886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12846 - 12416
Alignment:
Q  370 tttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgtt 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  12846 tttgtggcagttaacataacatttcgcaacaccgctggaccaagcaaacaccaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtccaccttctatagtt 12747  T
Q  470 gcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaa 569  Q
    | |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || || |||||||||||    
T  12746 gtagctttgaagggtatcaggacacattgtatacacattctctaaggcagttttatcgagaatgcgatatatacggaacagttgacttcatatttggaaa 12647  T
Q  570 cgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaa 669  Q
     |  ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  12646 tggtgcagttgttttgcaaaattgtaacatttatcctcgccttccgctaagtggacaattcaattccatcacagctcaaggtcgaactgatccaaatcaa 12547  T
Q  670 aacacaggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaag 769  Q
    ||||| || | ||| || || |||   ||| ||||| |||| || ||||| ||||| |  ||| | |||||  |||| ||||||||||| || |||||||    
T  12546 aacactggaacttctatacaaaatgcaactattaaagcagcagatgatttggctccgaaagttggaactgtacaaacataccttgggagaccgtggaaag 12447  T
Q  770 agtattcaagaactgttgttatgcagtcttt 800  Q
    | ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  12446 aatattcgaggacagtttttatgcaatcttt 12416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 2805 - 2718
Alignment:
Q  370 tttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtcca 457  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  2805 tttgtggcagttaacataacatttcgcaacaccgctggaccaagcaaacaccaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtcca 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 39450816 - 39451246
Alignment:
Q  370 tttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgtt 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  39450816 tttgtggcagttaacataacatttcgcaacaccgctggaccaagcaaacaccaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtccaccttctatagtt 39450915  T
Q  470 gcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaa 569  Q
    | |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || || |||||||||||    
T  39450916 gtagctttgaagggtatcaggacacattgtatacacattctctaaggcagttttatcgagaatgcgatatatacggaacagttgacttcatatttggaaa 39451015  T
Q  570 cgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaa 669  Q
     |  ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  39451016 tggtgcagttgttttgcaaaattgtaacatttatcctcgccttccgctaagtggacaattcaattccatcacagctcaaggtcgaactgatccaaatcaa 39451115  T
Q  670 aacacaggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaag 769  Q
    ||||| || | ||| || || |||   ||| ||||| |||| || ||||| ||||| |  ||| | |||||  |||| ||||||||||| || |||||||    
T  39451116 aacactggaacttctatacaaaatgcaactattaaagcagcagatgatttggctccgaaagttggaactgtacaaacataccttgggagaccgtggaaag 39451215  T
Q  770 agtattcaagaactgttgttatgcagtcttt 800  Q
    | ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  39451216 aatattcgaggacagtttttatgcaatcttt 39451246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 39460203 - 39460633
Alignment:
Q  370 tttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgtt 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  39460203 tttgtggcagttaacataacatttcgcaacaccgctggaccaagcaaacaccaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtccaccttctatagtt 39460302  T
Q  470 gcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaa 569  Q
    | |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || || |||||||||||    
T  39460303 gtagctttgaagggtatcaggacacattgtatacacattctctaaggcagttttatcgagaatgcgatatatacggaacagttgacttcatatttggaaa 39460402  T
Q  570 cgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaa 669  Q
     |  ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  39460403 tggtgcagttgttttgcaaaattgtaacatttatcctcgccttccgctaagtggacaattcaattccatcacagctcaaggtcgaactgatccaaatcaa 39460502  T
Q  670 aacacaggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaag 769  Q
    ||||| || | ||| || || |||   ||| ||||| |||| || ||||| ||||| |  ||| | |||||  |||| ||||||||||| || |||||||    
T  39460503 aacactggaacttctatacaaaatgcaactattaaagcagcagatgatttggctccgaaagttggaactgtacaaacataccttgggagaccgtggaaag 39460602  T
Q  770 agtattcaagaactgttgttatgcagtcttt 800  Q
    | ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  39460603 aatattcgaggacagtttttatgcaatcttt 39460633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 370 - 800
Target Start/End: Original strand, 39471688 - 39472118
Alignment:
Q  370 tttgtagcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgtt 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||  ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  39471688 tttgtggcagttaacataacatttcgcaacaccgctggaccaagcaaacaccaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtccaccttctatagtt 39471787  T
Q  470 gcagctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaa 569  Q
    | |||||||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || || |||||||||||    
T  39471788 gtagctttgaagggtatcaggacacattgtatacacattctctaaggcagttttatcgagaatgcgatatatacggaacagttgacttcatatttggaaa 39471887  T
Q  570 cgccgcagttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaa 669  Q
     |  ||||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||    
T  39471888 tggtgcagttgttttgcaaaattgtaacatttatcctcgccttccgctaagtggacaattcaattccatcacagctcaaggtcgaactgatccaaatcaa 39471987  T
Q  670 aacacaggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaag 769  Q
    ||||| || | ||| || || |||   ||| ||||| |||| || ||||| ||||| |  ||| | |||||  |||| ||||| ||||| || |||||||    
T  39471988 aacactggaacttctatacaaaatgcaactattaaagcagcagatgatttggctccgaaagttggaactgtacaaacatacctagggagaccgtggaaag 39472087  T
Q  770 agtattcaagaactgttgttatgcagtcttt 800  Q
    | ||||| || || ||| ||||||| |||||    
T  39472088 aatattcgaggacagtttttatgcaatcttt 39472118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 376 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 24061305 - 24060899
Alignment:
Q  376 gcagttaacataacatttcggaacacagccgggccaagcaaattccaagcagttgcaatgagaagtggggcagatatgtccagtttctatcgttgcagct 475  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||   |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  24061305 gcagttaacataacatttcgcaacaccgctggagcagcaaaaaatcaagcagttgcactaagaagtggagcagatatgtccaccttctatagttgtagct 24061206  T
Q  476 ttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaacgccgc 575  Q
    |||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| || || |||||| | || || ||||||||||| |  ||    
T  24061205 ttgaagggtatcaggacacattgtatacacattctctaaggcagttttatcgagaatgcgatatatacggaacagttgacttcatatttggaaatggtgc 24061106  T
Q  576 agttgttttgcaaaactgcaatatatatcctcgtcttcccttacatggacaattcaatcccatcaccgctcaaggacgcactgatccaaaccaaaacaca 675  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||     
T  24061105 agttgttttgcaaaattgtaacatttatcctcgccttccgctaagtggacaattcaattccatcacagctcaaggtcgaactgatccaaatcaaaacact 24061006  T
Q  676 ggcatttccattcacaattgcactgttaaaccagctgaagatttagctccaagtgttagtactgtgaaaacttaccttgggaggccatggaaagagtatt 775  Q
    || | ||| || || |||   ||| |||||||||| || ||||| ||||| |  |||   ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  24061005 ggaacttctatacaaaatgcaactattaaaccagcagatgatttggctcctaacgttgcaactgttaaaacatacctagggagaccatggaaagaatatt 24060906  T
Q  776 caagaac 782  Q
    |||||||    
T  24060905 caagaac 24060899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 472 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 37165458 - 37165364
Alignment:
Q  472 agctttgaagggtaccaagacactctctatacacattcactaaggcaattttataaagaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttgg 566  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||||| ||  | ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37165458 agctttgaaggttaccaagacacactatacgcacattcccttcgacaattctacaaaaactgcgacatttatggaacagtagatttcatatttgg 37165364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 529 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 745296 - 745235
Alignment:
Q  529 gaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaacgccgcagttgttttgcaaaa 590  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||    
T  745296 gaatgcaacatttatggcacggtagattttatatttggaaatgctgcagtagtttttcaaaa 745235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 578
Target Start/End: Original strand, 19476547 - 19476596
Alignment:
Q  529 gaatgcgacatttatggaacaatagattttatatttggaaacgccgcagt 578  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19476547 gaatgcgacatttacgggacaatagatttcatatttggtaacgccgcagt 19476596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10485448 - 10485399
Alignment:
Q  224 ttataaacacattttcagactatatcttattggacgtgagacttttaaca 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||    
T  10485448 ttataaacacattttcagactatatctcatccaatgtgagacttttaaca 10485399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University