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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2641_low_10 (Length: 342)

Name: NF2641_low_10
Description: NF2641
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2641_low_10
NF2641_low_10
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (6-330)||(2038795-2039119)
chr2 (155-330)||(29963196-29963367)
chr2 (19-151)||(29963022-29963154)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (16-330)||(34613-34927)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (16-192)||(3897264-3897442)
chr8 (16-248)||(5537056-5537287)
chr8 (23-192)||(44668811-44668978)
chr8 (221-259)||(3897471-3897509)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (16-273)||(18153242-18153498)
chr1 (23-194)||(18901891-18902061)
chr1 (221-259)||(18901826-18901864)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (16-275)||(11283352-11283610)
chr7 (16-198)||(36017868-36018050)
chr7 (16-197)||(12528686-12528866)
chr7 (112-257)||(16483903-16484048)
chr7 (30-196)||(21268190-21268355)
chr7 (58-275)||(48187372-48187588)
chr7 (25-252)||(16421520-16421744)
chr7 (223-289)||(16931632-16931698)
chr7 (223-289)||(16937015-16937081)
chr7 (223-289)||(16955553-16955619)
chr7 (30-80)||(16484019-16484069)
chr7 (23-106)||(28384086-28384167)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (16-275)||(3224581-3224840)
chr3 (16-187)||(11034887-11035057)
chr3 (23-201)||(1311393-1311570)
chr3 (20-80)||(1311453-1311513)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (23-275)||(15418765-15419016)
chr4 (16-196)||(28654401-28654580)
chr4 (30-275)||(15425782-15426026)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (16-275)||(7403-7657)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (23-275)||(24540488-24540739)
chr6 (25-252)||(3509705-3509929)
chr6 (173-275)||(15277737-15277839)
chr6 (31-89)||(15277912-15277970)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (25-252)||(10232-10456)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 6 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2039119 - 2038795
Alignment:
Q  6 agcaccacagaataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaa 105  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2039119 agcaccacacaataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcataacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaa 2039020  T
Q  106 cggcatcaccaaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  2039019 cggcaccaccaaaataattatcacaacacagttatatatacatatacatgtacggaagcacgtggagtgatgtccttacctttacaaaaacaatccttaa 2038920  T
Q  206 actcctcaaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactc 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2038919 actcctcaaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactc 2038820  T
Q  306 aaggcttagattctactaaagaata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2038819 aaggcttagattctactaaagaata 2038795  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 330
Target Start/End: Original strand, 29963196 - 29963367
Alignment:
Q  155 gtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaatt 254  Q
    |||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29963196 gtacggaagcgcgtggagtgatatccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaagcagcggtctttgttc-actacatctataccttcacaatt 29963294  T
Q  255 aaatatttactagcttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactcaaggcttagattctactaaagaata 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  29963295 aaatatttactagcttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactcaa---ttagattctactaaagaata 29963367  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 29963022 - 29963154
Alignment:
Q  19 aataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29963022 aataacacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaactgcaccaccaaa 29963121  T
Q  119 ataattatcacaacacggttatatatacatata 151  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  29963122 ataattatcacaacacaattatatatatatata 29963154  T

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Target: scaffold0172 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 16 - 330
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34927
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  34613 aataataacacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaatagcaccacc 34712  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaag 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34713 aaaataattatcacaacacagttatatatacatatacacgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaa 34812  T
Q  216 gagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactcaaggcttaga 315  Q
     | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34813 caacggtttttgttccactacatccatactttcacaattaaatgtttactaggttagttttaaatctcagttacgccctaattatcactcaaggcttaga 34912  T
Q  316 ttctactaaagaata 330  Q
    |||||||||||||||    
T  34913 ttctactaaagaata 34927  T

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Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 3897264 - 3897442
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||  || ||||    
T  3897264 aataataacacatgatattcatgccaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatatgtaacacatagtcattcatttcaaaacaacaccacc 3897363  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggt--tatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaa 192  Q
    |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  3897364 aaaataattatcacaacacaattatatatatacatatacacgtacggaaacacgtggagtgatacccttacctttacaa 3897442  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 248
Target Start/End: Original strand, 5537056 - 5537287
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||      
T  5537056 aataataacacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccactatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccatt 5537154  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaag 215  Q
    |  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||  |||||||| |||||| ||  |||||| | | || |    
T  5537155 atgataattatcactacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgctgttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccagg 5537254  T
Q  216 gagcagtctttgttccactacatccataccttc 248  Q
     | || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  5537255 aatcattctttgttccactacgtctataccttc 5537287  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44668978 - 44668811
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataa 122  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | |||| ||| ||||  || ||| |  ||||    
T  44668978 acacataatattcatgccaaaacaacaacaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacataa-cattcacttc-aaacaacaacactatgataa 44668881  T
Q  123 ttatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaa 192  Q
    | ||||||||||   |||||  ||| ||||| |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||    
T  44668880 tcatcacaacacaaatatattcacacatacacgtacggaagcgcgtagagtgatgcccttacctttacaa 44668811  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Original strand, 3897471 - 3897509
Alignment:
Q  221 gtctttgttccactacatccataccttcacaattaaata 259  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3897471 gtctttgttccacaacatcaataccttcacaattaaata 3897509  T

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Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18153498 - 18153242
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||      
T  18153498 aataataacacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccatt 18153400  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaag 215  Q
    |  ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||    
T  18153399 atgataattatcaccacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttcaccacaaccgtcgttaaactcctcaag 18153300  T
Q  216 gagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagt 273  Q
       ||||||||| ||  |||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153299 cgacagtctttgctctcctatctctacaccttcacaattaaatatttactagcttagt 18153242  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18902061 - 18901891
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataa 122  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| |||||| | |||||| || |||| ||||||||  || ||| | |||||    
T  18902061 acacataatattcatgcaaaaacaacaacaccaagataactatcacatcaccaatatatagcacata-tcattcacttcaaaacaacaacactataataa 18901963  T
Q  123 ttatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaaca 194  Q
    | ||||||||||   |||||  ||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18901962 tcatcacaacacaaatatattcacaaatacacgtacggaagcgcgtggaatgatacccttacctttgcaaca 18901891  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18901864 - 18901826
Alignment:
Q  221 gtctttgttccactacatccataccttcacaattaaata 259  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  18901864 gtctttgttccactacctctataccttcacaattaaata 18901826  T

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Target: chr7 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Original strand, 11283352 - 11283610
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||      
T  11283352 aataataacacataatattcataccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttctaaacaacatcatt 11283450  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaag 215  Q
    |  ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||   || |||  || ||||||||||||||    
T  11283451 atgataattatcacaacacaattatacacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttcgtaataaccgtcgttaaactcctcaag 11283550  T
Q  216 gagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
      |  ||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11283551 cggtggtctttgttctcctacctctgtaccttcacaattaaatatttactcacttagttt 11283610  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 36018050 - 36017868
Alignment:
Q  16 aataataacacatga-tattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcac 114  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||     
T  36018050 aataataacacataaatattcatatcaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccaa 36017952  T
Q  115 caaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaa 198  Q
     |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  36017951 tatgataattatcacaacacaattatatacacatatacacgtacggaagcacgtggagtgatgcccttacctttgcaataacaa 36017868  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 197
Target Start/End: Original strand, 12528686 - 12528866
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||||||  || ||      
T  12528686 aataataacacataatattcatacaaaagcaa-accaccaagataattatcacaacatcattatataacacataatcattcatttcaaaacaacaccatt 12528784  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaaca 197  Q
    |  | |||||||| |||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  12528785 atgacaattatcataacacaattatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttacctttgcaataaca 12528866  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16484048 - 16483903
Alignment:
Q  112 caccaaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcct 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  16484048 caccaagataattatcacaacacaaatatatacacatatacacgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttcgcaacaaccgtcgttaaactcct 16483949  T
Q  212 caaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaa 257  Q
    || | ||| ||||||| ||  | || || |||||||||| ||||||    
T  16483948 cacgcagcggtctttgctctcccacctctataccttcacgattaaa 16483903  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 21268190 - 21268355
Alignment:
Q  30 atattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataattatcac 129  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| | ||||||   || |||||||||||  || ||| | |||||| |||||    
T  21268190 atattcatgcaaaaacaacatcaccaagataattatcacatcaccaatatatagcacatagcact-catttcaaaacaacaacactataataatcatcac 21268288  T
Q  130 aacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaac 196  Q
    |||||   |||||| ||| ||||| |||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||    
T  21268289 aacacaaatatatacacacatacacgtacggaagcgcgtgaagtgatgcccttacctttgcaacaac 21268355  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 58 - 275
Target Start/End: Original strand, 48187372 - 48187588
Alignment:
Q  58 ataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgta 157  Q
    |||||||||||| ||| |||||| | ||||||  | |||| ||||||||  || ||| |  ||||| ||||||||||   |||||  ||| ||||| |||    
T  48187372 ataattatcacatcaccaatatatagcacatag-cattcacttcaaaacaacaacactatgataatcatcacaacacaaatatattcacacatacacgta 48187470  T
Q  158 cggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaa 257  Q
     |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||  ||| | | |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  48187471 tggaagcgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaacggtcctcatgctccataagcaacggtctttgttctactacctctataccttcacaattaaa 48187570  T
Q  258 tatttactagcttagttt 275  Q
    || ||| || ||||||||    
T  48187571 tacttaataacttagttt 48187588  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16421744 - 16421520
Alignment:
Q  25 acatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataatt 124  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||  || ||| |  |||||     
T  16421744 acataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacat-agcattcacttcaaaacaacaacactatgataatc 16421646  T
Q  125 atcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtct 224  Q
    ||||||||||    |||   ||| ||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | | || | | || |||    
T  16421645 atcacaacac--aaatagtcacacatacacgtacggacgtgcgtggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccatgaaacattct 16421548  T
Q  225 ttgttccactacatccataccttcacaa 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  16421547 ttgttccactacgtctataccttcacaa 16421520  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 16931632 - 16931698
Alignment:
Q  223 ctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttac 289  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16931632 ctttgttccactacctctataccttcacatttaaatatttactagtttagttttaaatttcacttac 16931698  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 16937015 - 16937081
Alignment:
Q  223 ctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttac 289  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16937015 ctttgttccactacctctataccttcacatttaaatatttactagtttagttttaaatttcacttac 16937081  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 289
Target Start/End: Original strand, 16955553 - 16955619
Alignment:
Q  223 ctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttttaaatctcagttac 289  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16955553 ctttgttccattacctctataccttcacatttaaatatttactagtttagttttaaatttcacttac 16955619  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16484069 - 16484019
Alignment:
Q  30 atattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatata 80  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16484069 atattcatgccgaaacaaaaccaccaagataattatcacaacacaaatata 16484019  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 23 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28384167 - 28384086
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaac 106  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||| || |||||| |||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  28384167 acacataatgttcatgccaaaacaacaccacc-aagtaattaccacaccacgaatatataacacataa-cattcatttcaaaac 28384086  T

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Target: chr3 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3224840 - 3224581
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacac--aaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatca 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||| | ||||||| | |||||||| ||||  || ||    
T  3224840 aataataacacataatattcatgtcaaaacaacaacaccaagataattatcacaacaccaatatatatagcacataa-cattcatttc-aaacaacagca 3224743  T
Q  114 ccaaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctca 213  Q
      |   |||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||   || ||   || ||||||||||||    
T  3224742 atatgctaattatcacaacacaaatatataatcatatacatgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttaccttcgtaataatcgtcgttaaactcctca 3224643  T
Q  214 aggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
    ||  |  ||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3224642 agcggtggtctttgctctcctacctctataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 3224581  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 11034887 - 11035057
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||      
T  11034887 aataataacaaataatattcataccaaagcaa-atcaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaacatcatt 11034985  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctt 187  Q
    |  ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | | || | |||||||||||||||    
T  11034986 atgataattatcacaacacaattatatacacatatacatgtacggaaacgcgtgaagtgatgcccttacctt 11035057  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 23 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1311570 - 1311393
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataa 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |  |||| ||||||||  || ||| | |||||    
T  1311570 acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacatagt-attcacttcaaaacaacaacactataataa 1311472  T
Q  123 ttatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatcc 201  Q
    | ||||||||||   |||||  ||| ||||| |||||||||| | |||| |||| | ||||| ||| | | ||||||||    
T  1311471 tcatcacaacacaaatatattcacacatacacgtacggaagcgcgtggagtgatactcttacatttgctagaacaatcc 1311393  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 20 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1311513 - 1311453
Alignment:
Q  20 ataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatata 80  Q
    |||||||||  ||||||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  1311513 ataacacatagtattcacttcaaaacaacaacactataataatcatcacaacacaaatata 1311453  T

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Target: chr4 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15419016 - 15418765
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataa 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||  | |||| ||||||||  || ||| |  ||||    
T  15419016 acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataaaacatag-cattcacttcaaaacaacaacactatgataa 15418918  T
Q  123 ttatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagt 222  Q
    | ||||||||||   |||||  ||| ||| | ||||||||||   |||| |||||||||||||||   || |||  || ||||||||||||||  || ||    
T  15418917 tcatcacaacacaaatatattcacacatatacgtacggaagcgtgtggagtgatgcccttaccttcgtaataaccgtcgttaaactcctcaagcggcggt 15418818  T
Q  223 ctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418817 ctttgctctcctacctctataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 15418765  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 196
Target Start/End: Original strand, 28654401 - 28654580
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||||||| ||  ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |  ||      
T  28654401 aataataactcagaatattcattccaaagcaa-accaccaagataattatcacaacaccaatatataacacataatcattcatttcaaaacaaccccatt 28654499  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaac 196  Q
    |  |||||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28654500 atgataattatcacaacagaattatatacacatatacacgtacggaaacgcgtggagtgatgcccttacctttacaacaac 28654580  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15426026 - 15425782
Alignment:
Q  30 atattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataattatcac 129  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |  |||||  | |||| ||||||||  ||  || |  ||||| |||||    
T  15426026 atattcatgccaaaacaacaccaccaagctaattatcacatcaccaatatatagaacatag-cattcacttcaaaacaacaatactatgataatcatcac 15425928  T
Q  130 aacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtctttgtt 229  Q
    |||||   |||||  ||| ||| | ||||||||||   |||| |||||||||||||||   || |||  || ||||||||||||||  || ||||||| |    
T  15425927 aacacaaatatattcacacatatacgtacggaagcgtgtggagtgatgcccttaccttcgtaataaccgtcgttaaactcctcaagcggcggtctttgct 15425828  T
Q  230 ccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
    |  |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15425827 ctcctacctctataccttcacaattaaatattttctagcttagttt 15425782  T

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Target: scaffold0655 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 7657 - 7403
Alignment:
Q  16 aataataacacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcacc 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |    ||||||||||   | ||||    
T  7657 aataagaacacataatattcatggcaaaacaaaaccaccaagataattattacaacaccaatacataacacataacc----atttcaaaac---aacacc 7565  T
Q  116 aaaataattatcacaacacggtta--tatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctca 213  Q
    |  ||||||||||||||||   ||  |||||| | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |    
T  7564 atgataattatcacaacacaaatagatatataaacatacatgtacggaagcgcgtggagtgatgcccttaccttcgtaacaacattccttaaactcctta 7465  T
Q  214 aggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
    ||  |  ||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  7464 agcggtggtctttgctctcctacctctataccttcacaattaaatgtttgctaacttagttt 7403  T

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Target: chr6 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24540739 - 24540488
Alignment:
Q  23 acacatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataa 122  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || |||||  | |||| ||||||||  || ||  |  ||||    
T  24540739 acacataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataaaacatag-cattcacttcaaaacaacaacaatatgataa 24540641  T
Q  123 ttatcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagt 222  Q
    | ||||||||||   |||||  ||| ||| | ||||||||||   |||| |||| ||||||||||   || |||  || ||||||||||||||  || ||    
T  24540640 tcatcacaacacaaatatattcacacataaacgtacggaagcgtgtggagtgatacccttaccttcgtaataaccgtcgttaaactcctcaagcggcggt 24540541  T
Q  223 ctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 275  Q
    ||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24540540 ctttgctctcctacctctataccttcacaattaaatatttactagcttagttt 24540488  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 3509929 - 3509705
Alignment:
Q  25 acatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataatt 124  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | | |||| ||||||||  || ||| |   |||      
T  3509929 acataatattcatgccaaaacaacaacaccaaggtaattatcacatcaccaatatatagcacat-agcattcacttcaaaacaacaacactatggtaacc 3509831  T
Q  125 atcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtct 224  Q
    ||||||||||    ||||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||| | | || | |||| |||    
T  3509830 atcacaacac--aaatattcacacatacacatacggaagcgcatggaatgatgcccttacctttgcaccaagaactcttaaaattcccatgaagcattct 3509733  T
Q  225 ttgttccactacatccataccttcacaa 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  3509732 ttgttccactacgtctataccttcacaa 3509705  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15277839 - 15277737
Alignment:
Q  173 tgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtctttgttccactacatccataccttcacaattaaatatttactagcttag 272  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||  || | || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||    
T  15277839 tgatgcccttaccttcataacaacaatccttaaactcctcaagcagcggtcttcgctctcctccctctataccttcacagttaaatgtttgctaactcag 15277740  T
Q  273 ttt 275  Q
    |||    
T  15277739 ttt 15277737  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15277970 - 15277912
Alignment:
Q  31 tattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacata 89  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  15277970 tatttatgttaaaacaacaccaccaagataattatcataccaccaatatataacacata 15277912  T

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Target: scaffold0003 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 10456 - 10232
Alignment:
Q  25 acatgatattcatgtcaaaacaacaccaccaaaataattatcacaacacaaatataaaacacataatccttcatttcaaaacggcatcaccaaaataatt 124  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||  || ||| |  |||||     
T  10456 acataatattcatgccaaaacaacaccaccaagataattatcacatcaccaatatataacacat-agcattcacttcaaaacaacaacactatgataatc 10358  T
Q  125 atcacaacacggttatatatacatatacatgtacggaagcacatggaatgatgcccttacctttacaacaacaatccttaaactcctcaaggagcagtct 224  Q
    ||||||||||    |||   ||| ||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||| | | || | | || |||    
T  10357 atcacaacac--aaatagtcacacatacacgtacggacgtgcgtggagtgatgcccttacctttgcaacaagaactcttaaaattcccatgaaacattct 10260  T
Q  225 ttgttccactacatccataccttcacaa 252  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  10259 ttgttccactacgtctataccttcacaa 10232  T

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