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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
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Alignment Overview
Query: NF2651_low_3 (Length: 870)
Name: NF2651_low_3
Description: NF2651
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2651_low_3 |
 | |
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Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 695; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 695; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 846
Target Start/End: Original strand, 9241836 - 9242645
Alignment:
| Q |
34 |
tcactacagaacatattaaaaaactgactatccaatttatttcatagtggttcgcatcgggccacatatttaatctagttagactaaattaaattacgca |
133 |
Q |
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||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
9241836 |
tcactacagtacatattaaaaaaccgactatccaaattgtttcatagtggttcacatcgggccacatatttaatctagttagactaaattaaattacgca |
9241935 |
T |
|
| Q |
134 |
aaacacttgatttgtcaggattatgcaatccaaacatgtgcaaatttatgcacgtttttaaatcagccaaacatatgttgattttgtaattattttaaat |
233 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9241936 |
aaacacttgatttgtcaggattatgcaatccaaacatgtgcaaatttacccatgtttttaaatcagccaaacatatgttgattttgtaattattttaaat |
9242035 |
T |
|
| Q |
234 |
taatatttacattattgtttacaaattgtcctaacaatcatttaataccactcattactcttattgtttgcacaagcaactcaatttttgatgaacatca |
333 |
Q |
| |
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|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
9242036 |
taat---tacattattgtttacaaattgtcctaacaatcatttaataccactcgttactcttattgtttgcacaagcaactcaatttttgatgaacatca |
9242132 |
T |
|
| Q |
334 |
ctacatataccaatattgtcatgttacatgcctatctttttatttaattcacattcaaactagacatgatgtatagttcaatcaatagtttattgcatga |
433 |
Q |
| |
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|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
9242133 |
ctacatctaccaatattgtcatgttacatgcctatctttttatttaattcacattcaaactagacatgatgtatagttcaatcaatagtttattgcatga |
9242232 |
T |
|
| Q |
434 |
aaaggacatttgttgttagttacacattacattttcagctaaaatttgttgcattttgttaaccatgaaaattcctattctcattttatggaaaaataaa |
533 |
Q |
| |
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||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
9242233 |
aaatgacatttgttgttagttacacattacattttcagctaaaatttgttgcattttgttaaccatgaaaattcctattctcattttatggaaaaataaa |
9242332 |
T |
|
| Q |
534 |
ttggacctaatctcattttagagagtatattttctctaatttggtgaaaacttaggtaagtattacttgttacaacatcttccttaaatcaaatgaaaat |
633 |
Q |
| |
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||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
9242333 |
ttggatctaatctcattttagagagtatattttctctaatttggtgaaaacttaggtaagtattacttgttgcaacatcttccttaaatcaaatgaaaat |
9242432 |
T |
|
| Q |
634 |
atagtatacacaaaatgaaaaagaaatgaatgaacacatggatctatcataccaaaagtagcaaagcaaagttgaaggtatcgactataacgaacacctt |
733 |
Q |
| |
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| T |
9242433 |
atagtatccacaaaatgaaaaagaaatgaatgaatacgtggttgcatcataccaaaagtaacaaagcagagttgaaggtatcgactataacgaacaccat |
9242532 |
T |
|
| Q |
734 |
gcttggattcgtgaagatggacgagcaaccataaggtataaagctgccatatgaatgctattgtcaaacttattattccccatgtcctgcaatcaatcac |
833 |
Q |
| |
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|
| T |
9242533 |
ccttggattcgtgaagatggacgagcaaccataaggtataaagctgccatatgaatgctattgtcaaacttattattccccatgtcctgcaaccaatcac |
9242632 |
T |
|
| Q |
834 |
acacttgtctcat |
846 |
Q |
| |
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| T |
9242633 |
acatttgtttcat |
9242645 |
T |
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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 682 - 825
Target Start/End: Original strand, 9256928 - 9257074
Alignment:
| Q |
682 |
ataccaaaagtagcaaagcaaagttgaaggtatcgactataacgaacaccttgcttg---gattcgtgaagatggacgagcaaccataaggtataaagct |
778 |
Q |
| |
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||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
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|
| T |
9256928 |
ataccgaaagtggcgaagcaaagctgaaggtatcgactgtagcgaataccgttctcgacggattcgtgaagatggacgagcaaccataaggtgtaaagtt |
9257027 |
T |
|
| Q |
779 |
gccatatgaatgctattgtcaaacttattattccccatgtcctgcaa |
825 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9257028 |
gccatatgaatgctattgtcaagctcaatattccccatgtcctgcaa |
9257074 |
T |
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