View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2655_high_15 (Length: 396)

Name: NF2655_high_15
Description: NF2655
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2655_high_15
NF2655_high_15
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-383)||(2307188-2307570)
chr6 (1-383)||(2339869-2340251)
chr6 (1-380)||(2351325-2351704)
chr6 (1-347)||(2362989-2363335)
chr6 (1-346)||(2261272-2261617)
chr6 (1-350)||(2368732-2369081)
chr6 (1-350)||(2357671-2358020)
chr6 (1-120)||(14711331-14711450)
chr6 (1-372)||(2297100-2297471)
chr6 (1-110)||(14753402-14753511)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (1-377)||(5804233-5804609)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-361)||(4305673-4306033)
[»] scaffold0408 (1 HSPs)
scaffold0408 (1-109)||(553-661)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 359; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2307570 - 2307188
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2307570 ccttctaccacttccaaatggcaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 2307471  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2307470 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 2307371  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  2307370 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttgactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatctgactcacatac 2307271  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggactgttcaatagcaaacatagtg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2307270 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggattgttcaatagcaaacatagtg 2307188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 2340251 - 2339869
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2340251 ccttctaccacttccaaatggtaatagttcaaaatgattacctctaacatcaacagctttatgagtggtaaaaaacctttctggtttgaactctaatgga 2340152  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||||||||| | ||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||    
T  2340151 tctggccaaacactaggatctgtttgaatcttccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacttgataaccacctaaattacaattctttgaga 2340052  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    ||||||| ||||| || |||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||     
T  2340051 attcacgtggtccggagagaggacccggtggatacaatcttagtgtttctttgactatagcttgaaggtatatcaatttatttatatcaaactcgcttaa 2339952  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggactgttcaatagcaaacatagtg 383  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  2339951 acatctctctttgccaacttgagcatcaagttcttcttttgccttttccattacaagaggattattcaaaagcaaacatagtg 2339869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 2351704 - 2351325
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2351704 ccttctaccacttccaaatggtagtagttcaaaatgattacctctaacatcaacaactttatgagtggtaagaaacctttctggtttgaactctaatgga 2351605  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||| ||||| | ||||||| || | |||| |||||||||||   ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  2351604 tctgaccaaacactaggatcagtttgaatcttccaaagatttagcattaaccgagttccttttctaacatggtaaccaccaatagtgcaattctctgaga 2351505  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    ||||||||||| | |  |||||| | |||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||   |||||||||||  ||||    
T  2351504 attcacgaggtgcggcgagaggacctggtggatgcaatcttagggtttcttttactatagcttgaaggtataccaacttaccaatatccgactcgtttac 2351405  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggactgttcaatagcaaacata 380  Q
    |   || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||    
T  2351404 aagcctttctttgccaacgtgagtgtcaagttcttcttttgcttttttcaatacaagaggatttttcaatagtaaacata 2351325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 2363335 - 2362989
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||| || || ||||||||  ||||||||    
T  2363335 ccttctaccacctccaaatggtaatagctcaaaatgattacctctaaaatcaatatctttatgcgttgtaagaaacctctccggtttgaatactaatgga 2363236  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||    |||||||| ||||| ||| | |||| ||| || |||||| |||||||||| ||||    
T  2363235 tctgaccaaacattaggatcagtgtgaatcttccaaagattcaaaattaatcgtgttccatttcttacatcatatccacctaaattacaattctctgaga 2363136  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    ||||||||||  | || | |||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||   ||| || | |||||| ||||  |||||    
T  2363135 attcacgaggcacagataaagggccaggtggatataatcttagtgtttctttgactatggcttgaaggtacaccaacttgtctatatctgactttcttac 2363036  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgcttttt 347  Q
    ||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  2363035 acacctctcttttccaacttgagcatcaagttcttcttttgcttttt 2362989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Original strand, 2261272 - 2261617
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | ||||||    |||| |  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2261272 ccttctaccacttccaaatggtaacaactcaaaatgttgacccttggcatcaacatttttgtgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 2261371  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||||||||||| | ||||| || | |||  |||||||||||||||| | || |||||| ||| | | | |||| || ||||| |||||||  || | ||    
T  2261372 tctggccaaatacttggatcggtttgaattttccaaagatttgtgataagtctagttccttttttgatacgatagccacctaacgtacaatcttctgtga 2261471  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||| | || ||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||||||| || || ||  |||     
T  2261472 attcacgaggtgctgagagaggacctggaggatacaatcttagggtttctttgactattgcttgaagatataccaacttatttatgtctgagtcatttat 2261571  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttt 346  Q
      |||| ||||  |||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  2261572 gaatctttcttctccaatttgattgttgagttcttcttttgctttt 2261617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2369081 - 2368732
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |  ||||||||||| || ||||||    
T  2369081 ccttctaccacctccaaatggtaatagctcaaaatgatgacctctaacatcaacgtctttatgggtagtaagaaaccgctctggtttgaattccaatgga 2368982  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    | || ||||||||| ||||| |||| |||| | | ||||||    ||||| || ||||| ||| | |||| ||| ||  ||||| | |||||||| ||||    
T  2368981 tttgaccaaatatttggatcagtgtgaatctttctaagattcaaaattaaccgtgttccttttcttacatcatatccatctaaattgcaattctctgaga 2368882  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    ||||||||||| | || | |||  | | ||||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||   ||| || | ||| || | ||| |||||    
T  2368881 attcacgaggtgccgataaagggccagctggatataatcttagggtttctttgacaatggcttgaagatacaccaacttgtctatgtctgtctctcttac 2368782  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttcca 350  Q
    ||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  2368781 acacctctcttttccaacttgagtatcaagttcttcttttgctttttcca 2368732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2358020 - 2357671
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||| | ||  || | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2358020 ccttctaccacttccaaatggtaacaactcaaagtgacaccctcgaacatcaacatctttataagtgttaagaaatctttctggtttaaactttaatgga 2357921  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    || | ||||| |||| | || || |  ||  |||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||   ||||||| || |  |    
T  2357920 tccgaccaaacattatggtctgtttggattttccaaagatttaagattagtcgagttccttttatgacatcataaccacctatgttacaattttcggtaa 2357821  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    | ||||||||| | || |||||| |   ||||||||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||   ||| || |||||||||||||   ||||    
T  2357820 actcacgaggtgcagagagaggaccaactggatataatcttagggtttctttgattatcgcttgaaggtacaccaacttgtttatatccgactttgttac 2357721  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttcca 350  Q
    |||| | ||| | ||||  ||   ||| |||||| |||||||||||||||    
T  2357720 acatttatctcttccaacgtggaagtcaagttctgcttttgctttttcca 2357671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 14711331 - 14711450
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  14711331 ccttcttccacttccaaatggtaaaagctcaaaatgattacctctaacatcaacatctttatgagttgtaagaaatctctcaggtttgaactccaatgga 14711430  T
Q  101 tctggccaaatattaggatc 120  Q
    || ||||||| | |||||||    
T  14711431 tccggccaaacactaggatc 14711450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2297471 - 2297100
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||| |||||||||||||| || | | |||||||   ||||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||    
T  2297471 ccttcttccacttccaaatggcaacaactcaaaattttgacccccaagatcaacatctttgttagtggtaagaaacctttcaggtttaaattctaatgga 2297372  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||| |||||   |||  ||  | | |||| |||| |||||||  || ||||||||||||||| | | ||| || || ||||  || ||||  || | ||    
T  2297371 tctgaccaaaccctagagtctctatgaatcttccatagatttggcatcaatcgagttccctttttgatatggtatccacctattgtgcaatcttctgtga 2297272  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    |||| ||||||   ||||  ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||| |||||| | ||| |||   |||||||| | ||| ||||| |||||    
T  2297271 attcgcgaggtgacgaaaatggagctggtggatagaatcttagtgtctctttaattatagcatcaagatatactaatttattaacatctgactctcttac 2297172  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggactgttcaatag 372  Q
    |||  | ||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| | ||||||||    
T  2297171 acaattttcttttccaatttgtgtgttaagttcttcttttgcttttttcagtacatgaggatttttcaatag 2297100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 14753402 - 14753511
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  14753402 ccttcttccacttccaaatggtaaaaactcaaaatgatgacccttaacatcaacatctttatgagttgtaagaaatctcccaggcttgaactccaatgga 14753501  T
Q  101 tctggccaaa 110  Q
    || |||||||    
T  14753502 tccggccaaa 14753511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 377
Target Start/End: Original strand, 5804233 - 5804609
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||    
T  5804233 ccttctaccacttccaaatggttgtagttcaaaatgattacccctaacatcaatatctttatgagttgtaagaaacctttctggcttaaaatctaatgga 5804332  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    | |||||||| | || |||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  5804333 tttggccaaacactaagatctgtttggatcttccaaagatttgtgattaatcgagttccttttgtaacatgataaccacctaaagtgcaattctctgaga 5804432  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    |||||||||||||    |||||||| | |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||  | ||    
T  5804433 attcacgaggtccgcctagaggagcagatggatacaatctcagtgtttccttgactatagcttgaaggtataccaacttaattatatctgactcattcac 5804532  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagaggactgttcaatagcaaac 377  Q
    | |||||||| | ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||    
T  5804533 aaatctctctctaccaacatgagtgtcaagttcttcttttgctttttccatggcaataggatttttcaatagcaaac 5804609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4306033 - 4305673
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||     
T  4306033 ccttctaccacttccaaatggtaataactcaaaatgatgacccttaacatcaacacctttatgagtagtaagaaaccgttctggtttgaactctaaaggt 4305934  T
Q  101 tctggccaaatattaggatccgtgttaatcctccaaagatttgtgattaatcgagttccctttataacatgataacctcctaaagtacaattctccgaga 200  Q
    |||  |||||  |||||||| || |  ||| |||| |||||  |||||| || |||||| ||| | |||| |||||| |||||| |  | ||||| | ||    
T  4305933 tctaaccaaaccttaggatcagtatggatcttccatagattcatgattagtctagttccttttttgacatcataaccacctaaatttgagttctctgtga 4305834  T
Q  201 attcacgaggtcctgaaagaggagcgggtggatataatcgtagtgtttctttaactatagcttgaaggtatgtcaatttatttatatccgactcccttac 300  Q
    | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||||  ||| || | ||||||||||||  ||||    
T  4305833 actcacgtggtcctgagagaggggcgggtggacataaccttagggtttctttgactatcgcttgaaggtataccaacttgtctatatccgactcttttac 4305734  T
Q  301 acatctctctttgccaatttgagcgtcgagttcttcttttgctttttccattacaagagga 361  Q
    ||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  4305733 acacctctctttgccaacttggatgtcaagttcttcttgtgctttttctattacaagagga 4305673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0408 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0408
Description:

Target: scaffold0408; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 661 - 553
Alignment:
Q  1 ccttctaccacttccaaatggtaatagcacaaaattactacccctaacatcaacatctttatgagtggtaagaaatctttctggtttgaactctaatgga 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | | |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||| ||||||    
T  661 ccttcttccacttccaaatggtaaaaactcaaaatgatgacccttaacatcaacatctttatgagttgtaagaaatctcccaggcttgaactccaatgga 562  T
Q  101 tctggccaa 109  Q
    || ||||||    
T  561 tccggccaa 553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University