View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2660_high_13 (Length: 488)

Name: NF2660_high_13
Description: NF2660
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2660_high_13
NF2660_high_13
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (13-217)||(13211305-13211509)
chr3 (13-220)||(6110064-6110271)
chr3 (13-220)||(10572592-10572799)
chr3 (13-220)||(15600884-15601091)
chr3 (13-220)||(15607429-15607636)
chr3 (13-214)||(10579355-10579556)
chr3 (13-220)||(13248607-13248814)
chr3 (13-218)||(16482483-16482688)
chr3 (13-214)||(17781118-17781319)
chr3 (13-218)||(18522665-18522870)
chr3 (13-220)||(15357586-15357793)
chr3 (13-220)||(8490488-8490702)
chr3 (13-218)||(18519980-18520182)
chr3 (13-214)||(19089745-19089946)
chr3 (13-218)||(17200184-17200389)
chr3 (13-201)||(15342219-15342407)
chr3 (13-218)||(13516813-13517018)
chr3 (59-220)||(18640792-18640953)
chr3 (13-214)||(32056900-32057101)
chr3 (13-214)||(1647521-1647726)
chr3 (28-220)||(29924971-29925163)
chr3 (28-220)||(29974124-29974316)
chr3 (32-218)||(16200128-16200313)
chr3 (32-218)||(16200434-16200619)
chr3 (13-213)||(24253388-24253589)
chr3 (13-114)||(17136465-17136566)
chr3 (156-218)||(18534758-18534820)
chr3 (256-313)||(6109971-6110028)
chr3 (256-313)||(13248514-13248571)
chr3 (256-312)||(8490396-8490452)
chr3 (256-315)||(13211208-13211267)
chr3 (256-312)||(18640989-18641045)
chr3 (256-312)||(17136137-17136193)
chr3 (262-312)||(10579603-10579653)
chr3 (256-313)||(15607672-15607730)
chr3 (256-313)||(15351237-15351294)
chr3 (256-313)||(15357829-15357886)
chr3 (256-313)||(17200427-17200484)
chr3 (173-218)||(18510924-18510969)
chr3 (256-312)||(16482727-16482782)
chr3 (256-312)||(18519885-18519941)
chr3 (262-313)||(10572840-10572891)
chr3 (256-315)||(13516716-13516775)
chr3 (256-313)||(15601127-15601185)
chr3 (256-313)||(17781358-17781415)
chr3 (256-313)||(19089985-19090042)
chr3 (256-312)||(1647768-1647824)
chr3 (256-312)||(32057144-32057200)
chr3 (256-313)||(18510828-18510885)
chr3 (256-313)||(18522569-18522626)
chr3 (256-313)||(18534662-18534719)
chr3 (256-312)||(29924879-29924935)
chr3 (256-312)||(29974032-29974088)
[»] scaffold0234 (4 HSPs)
scaffold0234 (13-220)||(2321-2528)
scaffold0234 (13-220)||(11212-11419)
scaffold0234 (256-313)||(2564-2621)
scaffold0234 (256-313)||(11455-11512)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (13-220)||(5707320-5707527)
chr4 (13-220)||(19926760-19926967)
chr4 (13-220)||(5713948-5714155)
chr4 (13-220)||(26970463-26970670)
chr4 (13-220)||(55612683-55612890)
chr4 (13-220)||(868597-868804)
chr4 (13-220)||(26963640-26963847)
chr4 (13-218)||(18262214-18262419)
chr4 (13-220)||(10621333-10621540)
chr4 (13-220)||(10628412-10628619)
chr4 (13-218)||(18269070-18269280)
chr4 (13-218)||(28393134-28393339)
chr4 (13-218)||(4426604-4426808)
chr4 (13-208)||(8845215-8845410)
chr4 (13-208)||(8858179-8858374)
chr4 (105-220)||(12357136-12357251)
chr4 (13-212)||(20311299-20311499)
chr4 (13-214)||(10677555-10677753)
chr4 (13-214)||(10891195-10891393)
chr4 (13-214)||(5668125-5668327)
chr4 (14-218)||(5616215-5616421)
chr4 (13-214)||(35223576-35223767)
chr4 (256-313)||(5713855-5713912)
chr4 (256-313)||(26963547-26963604)
chr4 (256-313)||(26970370-26970427)
chr4 (256-312)||(19927003-19927059)
chr4 (256-313)||(10621576-10621633)
chr4 (256-312)||(5707228-5707284)
chr4 (256-312)||(12357044-12357100)
chr4 (256-310)||(868507-868561)
chr4 (256-312)||(10628655-10628711)
chr4 (256-312)||(17142372-17142428)
chr4 (256-312)||(55612594-55612650)
chr4 (258-312)||(28393380-28393434)
chr4 (256-313)||(18268975-18269032)
chr4 (256-312)||(4426847-4426903)
chr4 (13-194)||(21454137-21454319)
chr4 (104-171)||(39074278-39074346)
chr4 (256-305)||(55992680-55992729)
chr4 (256-297)||(5668371-5668412)
chr4 (256-304)||(8845118-8845166)
chr4 (256-304)||(8858082-8858130)
chr4 (256-296)||(18262136-18262176)
chr4 (31-83)||(39074218-39074270)
chr4 (111-170)||(11161913-11161972)
chr4 (256-310)||(20311207-20311261)
chr4 (256-304)||(24699958-24700006)
[»] chr1 (26 HSPs)
chr1 (13-220)||(18252030-18252237)
chr1 (13-220)||(18532514-18532721)
chr1 (13-220)||(27131409-27131616)
chr1 (13-218)||(21171233-21171438)
chr1 (13-218)||(27310577-27310782)
chr1 (13-218)||(16359035-16359240)
chr1 (13-214)||(36816633-36816834)
chr1 (13-220)||(3855919-3856126)
chr1 (13-220)||(22657221-22657429)
chr1 (13-214)||(27277557-27277756)
chr1 (13-186)||(12006539-12006712)
chr1 (13-186)||(12014284-12014457)
chr1 (256-312)||(18251936-18251992)
chr1 (256-312)||(18532757-18532813)
chr1 (256-312)||(27310821-27310877)
chr1 (13-208)||(9917918-9918106)
chr1 (256-312)||(16359280-16359336)
chr1 (256-313)||(21171479-21171536)
chr1 (259-313)||(36816881-36816935)
chr1 (256-313)||(3856164-3856221)
chr1 (260-313)||(22657469-22657522)
chr1 (145-214)||(30720625-30720694)
chr1 (256-312)||(27131652-27131704)
chr1 (113-190)||(3403248-3403325)
chr1 (113-190)||(3443494-3443571)
chr1 (256-312)||(27277800-27277856)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (13-220)||(18288-18495)
scaffold0220 (256-312)||(18196-18252)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (13-220)||(29327784-29327991)
chr7 (13-220)||(11536062-11536269)
chr7 (13-220)||(11542980-11543187)
chr7 (13-218)||(15152445-15152650)
chr7 (13-218)||(15148144-15148349)
chr7 (13-218)||(18561009-18561214)
chr7 (13-218)||(12750828-12751033)
chr7 (17-214)||(12738542-12738739)
chr7 (13-218)||(18257842-18258047)
chr7 (341-488)||(23863108-23863255)
chr7 (32-214)||(13392157-13392338)
chr7 (13-198)||(2364917-2365101)
chr7 (256-313)||(11543223-11543280)
chr7 (256-312)||(2653275-2653331)
chr7 (256-312)||(12738443-12738499)
chr7 (30-214)||(39111819-39112002)
chr7 (256-313)||(11536305-11536362)
chr7 (256-313)||(12750732-12750789)
chr7 (256-313)||(15152349-15152406)
chr7 (28-187)||(7396221-7396381)
chr7 (257-313)||(29327689-29327745)
chr7 (256-312)||(15148049-15148105)
chr7 (342-431)||(23872073-23872160)
chr7 (257-313)||(13392029-13392085)
chr7 (103-146)||(3132748-3132791)
chr7 (105-170)||(10234179-10234244)
chr7 (256-312)||(18258087-18258143)
chr7 (188-220)||(2653207-2653239)
chr7 (256-312)||(18560913-18560969)
[»] chr6 (29 HSPs)
chr6 (13-220)||(27381252-27381459)
chr6 (13-220)||(27471635-27471842)
chr6 (13-218)||(17684469-17684674)
chr6 (13-220)||(29308890-29309097)
chr6 (13-220)||(29315850-29316057)
chr6 (13-218)||(16566320-16566525)
chr6 (13-220)||(17691440-17691647)
chr6 (13-218)||(188977-189182)
chr6 (13-218)||(11651725-11651930)
chr6 (13-218)||(25537159-25537364)
chr6 (13-218)||(13359269-13359474)
chr6 (13-181)||(20553587-20553755)
chr6 (256-310)||(17691683-17691737)
chr6 (13-182)||(17850495-17850663)
chr6 (256-313)||(27381495-27381552)
chr6 (256-313)||(27471878-27471935)
chr6 (256-313)||(29308797-29308854)
chr6 (256-313)||(29315757-29315814)
chr6 (28-201)||(8509941-8510115)
chr6 (256-313)||(17684712-17684769)
chr6 (258-312)||(11651630-11651684)
chr6 (256-313)||(25537405-25537462)
chr6 (13-197)||(27925772-27925961)
chr6 (158-213)||(31258065-31258120)
chr6 (256-313)||(13359512-13359569)
chr6 (256-304)||(16566563-16566611)
chr6 (256-312)||(189221-189280)
chr6 (256-298)||(16394484-16394526)
chr6 (139-204)||(22259925-22259990)
[»] scaffold0390 (4 HSPs)
scaffold0390 (13-220)||(6934-7141)
scaffold0390 (13-220)||(13950-14157)
scaffold0390 (256-313)||(7177-7234)
scaffold0390 (256-312)||(14193-14249)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (13-220)||(21940665-21940872)
chr8 (19-218)||(28554885-28555084)
chr8 (13-218)||(22171491-22171694)
chr8 (13-214)||(24642655-24642856)
chr8 (13-214)||(6094129-6094330)
chr8 (87-214)||(24636860-24636987)
chr8 (256-312)||(21940573-21940629)
chr8 (256-312)||(22070108-22070164)
chr8 (16-208)||(38232380-38232570)
chr8 (256-313)||(22171395-22171452)
chr8 (260-313)||(24642555-24642608)
chr8 (256-312)||(6094031-6094087)
chr8 (256-313)||(28554790-28554847)
chr8 (16-199)||(2375027-2375208)
chr8 (29-190)||(32872857-32873019)
chr8 (119-182)||(10920234-10920297)
chr8 (259-313)||(2374946-2375000)
chr8 (275-312)||(24636605-24636642)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (13-220)||(24695466-24695673)
chr5 (13-220)||(18569863-18570070)
chr5 (13-218)||(19714498-19714703)
chr5 (13-214)||(19707218-19707419)
chr5 (13-214)||(22547016-22547217)
chr5 (32-215)||(27347497-27347679)
chr5 (111-220)||(39537962-39538071)
chr5 (35-216)||(17285754-17285935)
chr5 (13-154)||(18807034-18807175)
chr5 (256-313)||(24695709-24695766)
chr5 (111-214)||(31886537-31886640)
chr5 (256-312)||(19714742-19714798)
chr5 (35-216)||(17298907-17299088)
chr5 (256-313)||(19707462-19707519)
chr5 (256-312)||(27347722-27347778)
chr5 (15-107)||(39538701-39538793)
chr5 (104-194)||(33477389-33477479)
chr5 (256-313)||(18570108-18570165)
chr5 (257-312)||(39537870-39537925)
chr5 (102-170)||(11479420-11479489)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (13-220)||(21330248-21330455)
chr2 (13-220)||(18796506-18796713)
chr2 (13-218)||(18619807-18620011)
chr2 (75-214)||(19692598-19692737)
chr2 (28-155)||(20977957-20978084)
chr2 (256-312)||(21330493-21330549)
chr2 (13-186)||(36270199-36270373)
chr2 (13-186)||(18822115-18822290)
chr2 (256-313)||(19692773-19692830)
chr2 (13-49)||(12098618-12098654)
chr2 (256-313)||(18796411-18796470)
[»] scaffold0433 (2 HSPs)
scaffold0433 (13-220)||(7107-7314)
scaffold0433 (256-313)||(7014-7071)
[»] scaffold0657 (2 HSPs)
scaffold0657 (13-220)||(993-1200)
scaffold0657 (256-312)||(901-957)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (13-220)||(25990-26197)
scaffold0186 (257-313)||(26231-26287)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (13-218)||(5531-5736)
scaffold0063 (256-313)||(5435-5492)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (37-218)||(230365-230545)
scaffold0008 (256-312)||(230584-230640)
[»] scaffold0176 (2 HSPs)
scaffold0176 (156-220)||(8446-8510)
scaffold0176 (256-313)||(8546-8603)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (256-313)||(23769-23826)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (256-313)||(16522-16579)
scaffold0326 (187-220)||(16615-16648)
[»] scaffold0705 (1 HSPs)
scaffold0705 (256-313)||(41-98)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (256-312)||(8944-9000)
[»] scaffold0565 (2 HSPs)
scaffold0565 (256-310)||(10202-10256)
scaffold0565 (170-201)||(10127-10158)
[»] scaffold0767 (1 HSPs)
scaffold0767 (276-312)||(1-37)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (260-313)||(5877-5930)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (119-191)||(92194-92267)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13211509 - 13211305
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211509 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 13211410  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211409 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13211310  T
Q  213 tgcct 217  Q
    |||||    
T  13211309 tgcct 13211305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6110271 - 6110064
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110271 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 6110172  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110171 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 6110072  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  6110071 tgccttgt 6110064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 10572592 - 10572799
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572592 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 10572691  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10572692 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10572791  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  10572792 tgccttgt 10572799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15600884 - 15601091
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600884 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 15600983  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15600984 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15601083  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  15601084 tgtcttgt 15601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15607429 - 15607636
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607429 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 15607528  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607529 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15607628  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  15607629 tgtcttgt 15607636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 10579355 - 10579556
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579355 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 10579454  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579455 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatttaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10579554  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  10579555 tg 10579556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13248814 - 13248607
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248814 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgttatcccacttctcaacaaagcttgactacgaatactttgagaatagtttccttatgttt 13248715  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248714 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13248615  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  13248614 tgccttgt 13248607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 16482483 - 16482688
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16482483 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgttt 16482582  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16482583 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16482682  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  16482683 tgcctt 16482688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 17781118 - 17781319
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781118 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 17781217  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17781218 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17781317  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  17781318 tg 17781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18522870 - 18522665
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18522870 atcatcagtctacctacataatagtctctatgcttaaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 18522771  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522770 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18522671  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  18522670 tgcctt 18522665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 15357586 - 15357793
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15357586 atcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 15357685  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357686 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 15357785  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  15357786 tgtcttgt 15357793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8490702 - 8490488
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataat-------agtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8490702 atcatcagtctacctacataatcgtctgtagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacagatactttgagaatagtttcct 8490603  T
Q  106 tatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490602 tatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaat 8490503  T
Q  206 aaagaaatgccttgt 220  Q
    |||||||||||||||    
T  8490502 aaagaaatgccttgt 8490488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18520182 - 18519980
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  18520182 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggat---ttaagaatagtttccttatgttt 18520086  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520085 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18519986  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  18519985 tgcctt 18519980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 19089745 - 19089946
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19089745 atcatcagtctacctacataatagtctctatgatttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttcattatgttt 19089844  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089845 aaaggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactaatctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 19089944  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  19089945 tg 19089946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 17200184 - 17200389
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17200184 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcacacatctcaataaagcttaactacggatactttaagaatagtttcattatgttt 17200283  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17200284 aaaggggtatcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17200383  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  17200384 tgcctt 17200389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Original strand, 15342219 - 15342407
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15342219 atcatcagtctacctacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 15342318  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15342319 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaacaaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 15342407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13517018 - 13516813
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13517018 atcatcagtctacccacataatagtctctgtgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatcgtttccttatgttt 13516919  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13516918 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccatgaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 13516819  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  13516818 tgcctt 13516813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 59 - 220
Target Start/End: Original strand, 18640792 - 18640953
Alignment:
Q  59 cacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgga 158  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18640792 cacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgga 18640891  T
Q  159 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640892 ctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 18640953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 32056900 - 32057101
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32056900 atcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagtttgactacggacactttaagaatagtttctttatgttt 32056999  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32057000 aacggggtcttacaataaagttatacttgatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 32057099  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  32057100 tg 32057101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 1647521 - 1647726
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1647521 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaattatatcccttttctcaataaagcttgattacggatactttaaaaatagtttccttatgttt 1647620  T
Q  113 aatggggtctcacaattaag----ttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 208  Q
    || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1647621 aacggggtctcacaattaagttaattatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 1647720  T
Q  209 gaaatg 214  Q
    ||||||    
T  1647721 gaaatg 1647726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29925163 - 29924971
Alignment:
Q  28 acataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 127  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29925163 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29925064  T
Q  128 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29925063 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29924971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29974316 - 29974124
Alignment:
Q  28 acataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 127  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29974316 acataatagcctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgactacatatattttaagaataatgtccttatatttaatggggtctcacaa 29974217  T
Q  128 ttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29974216 ttaaattatacttaataatccattaaacggactaactattttaggggctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 29974124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16200313 - 16200128
Alignment:
Q  32 aatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16200313 aatagtctccatgctttaatgatatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttaatggggtctcacaattaa 16200214  T
Q  132 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200213 gttatacataatgttccattaaacgaactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16200619 - 16200434
Alignment:
Q  32 aatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 131  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16200619 aatagtcttcatgctttaatgacatcccacttcacaataaatcttgactacgaatactttaagaataatgtccttatgtttattggagtctcacaattaa 16200520  T
Q  132 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  16200519 gttatacataatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaataaaa-caacgaagaaatgcctt 16200434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 213
Target Start/End: Original strand, 24253388 - 24253589
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||  ||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24253388 atcattagtctaccgacataatagtctctatgctttaatgttacctcactttacaataaattttgaccacatatactttaagaatagtgtccttatgttt 24253487  T
Q  113 aatgggg-tctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 211  Q
     |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24253488 gatggggatctcacgattaagtcatacttaatgttccatcaaacgaacgagctattctaaggactttattattttgaagtaaaacaaaatcaataaagaa 24253587  T
Q  212 at 213  Q
    ||    
T  24253588 at 24253589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 17136566 - 17136465
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17136566 atcatcagtctacccacataatagtctctatgttttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 17136467  T
Q  113 aa 114  Q
    ||    
T  17136466 aa 17136465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18534820 - 18534758
Alignment:
Q  156 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18534820 ggactaactattctatggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18534758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6110028 - 6109971
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6110028 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 6109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13248571 - 13248514
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13248571 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 13248514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8490452 - 8490396
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8490452 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 8490396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13211267 - 13211208
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaagt 315  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211267 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaagt 13211208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 18640989 - 18641045
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640989 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18641045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17136193 - 17136137
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17136193 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 17136137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 312
Target Start/End: Original strand, 10579603 - 10579653
Alignment:
Q  262 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10579603 acaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10579653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 15607672 - 15607730
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15607672 catgatacaaagccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaacaa 15607730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 15351237 - 15351294
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351237 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaacaa 15351294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 15357829 - 15357886
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15357829 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaacaa 15357886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 17200427 - 17200484
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17200427 catgctacaaagccaaacccaatcaacatagattggctattagggcttactccaacaa 17200484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18510969 - 18510924
Alignment:
Q  173 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510969 gactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 18510924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 16482727 - 16482782
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16482727 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgg-tattagggcttattctaaca 16482782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18519941 - 18519885
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18519941 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 18519885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 313
Target Start/End: Original strand, 10572840 - 10572891
Alignment:
Q  262 acaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10572840 acaaagtcaaacccaatcaatataggttggctattagggcttattccaacaa 10572891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13516775 - 13516716
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaagt 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13516775 catgatacacagccaaactcaatcaacatagattggctattagggcttactccaacaagt 13516716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 15601127 - 15601185
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaa-tatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15601127 catgatacaaatccaaacccaataaaatatagattggctattagggcttattccaacaa 15601185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 17781358 - 17781415
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17781358 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 17781415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 19089985 - 19090042
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19089985 catgatataaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 19090042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 1647768 - 1647824
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  1647768 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagaccagctattagggcttactccaaca 1647824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 32057144 - 32057200
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32057144 catgatacaaagtcaaacccaatcaacatagattggctattagagcttactccaaca 32057200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18510885 - 18510828
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18510885 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaacaa 18510828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18522626 - 18522569
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18522626 catgatacaaaatcaaactcaatcaatatagattggatattagggcttactccaacaa 18522569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18534719 - 18534662
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  18534719 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattgactattagggcttactacaacaa 18534662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29924935 - 29924879
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29924935 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29924879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29974088 - 29974032
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  29974088 catgatacaatgtcaaactcaatcaatatagatcgactattagggcttactccaaca 29974032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 2321 - 2528
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2321 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 2420  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2421 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 2520  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  2521 tgccttgt 2528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11212 - 11419
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11212 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 11311  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11411  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  11412 tgccttgt 11419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 2564 - 2621
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2564 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 2621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 11455 - 11512
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11455 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 11512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5707527 - 5707320
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707527 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 5707428  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707427 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 5707328  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  5707327 tgccttgt 5707320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 19926760 - 19926967
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926760 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 19926859  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926860 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 19926959  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  19926960 tgccttgt 19926967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5714155 - 5713948
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714155 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 5714056  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714055 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatgggctaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 5713956  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  5713955 tgccttgt 5713948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26970670 - 26970463
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970670 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26970571  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970570 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26970471  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  26970470 tgccttgt 26970463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 55612890 - 55612683
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55612890 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagagtagtttccttatgttt 55612791  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55612790 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 55612691  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  55612690 tgccttgt 55612683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 868804 - 868597
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868804 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 868705  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  868704 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 868605  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  868604 tgtcttgt 868597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26963847 - 26963640
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963847 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26963748  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963747 aatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26963648  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  26963647 tgccttgt 26963640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18262419 - 18262214
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18262419 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18262320  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18262319 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacgaaacaaaatcaataaagaaa 18262220  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  18262219 tgcctt 18262214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 10621333 - 10621540
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621333 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 10621432  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621433 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10621532  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  10621533 tgccttgt 10621540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 10628412 - 10628619
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628412 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaataatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 10628511  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628512 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattccagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 10628611  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  10628612 tgccttgt 10628619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18269280 - 18269070
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18269280 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18269181  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-----aaaatcaataa 207  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||    
T  18269180 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaacaaaatcaataa 18269081  T
Q  208 agaaatgcctt 218  Q
    |||||||||||    
T  18269080 agaaatgcctt 18269070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 28393134 - 28393339
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28393134 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgttt 28393233  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28393234 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaa 28393333  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  28393334 tgcctt 28393339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 4426604 - 4426808
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4426604 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtt-ccttatgttt 4426702  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4426703 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 4426802  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  4426803 tgcctt 4426808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8845410 - 8845215
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8845410 atcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 8845311  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 208  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8845310 aacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8845215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8858374 - 8858179
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8858374 atcatcagcctacccacataatagtctctatgctttaatgatatccgacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 8858275  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 208  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8858274 aacgggatctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 8858179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12357251 - 12357136
Alignment:
Q  105 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357251 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 12357152  T
Q  205 taaagaaatgccttgt 220  Q
    ||||||||||||||||    
T  12357151 taaagaaatgccttgt 12357136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 20311499 - 20311299
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||| | || ||| |||||||||||    
T  20311499 atcatcaatctacccacaaaatagtctctatgctttaatgatatctcacttcacaataaagcttgacaacaaatactttaaaaacagtgtccttatgttt 20311400  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttata-cttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20311399 aatggggtctcacaattaagttataccttaatgctccattgaacatattaactattataagtactttattattttaaaacaaaacaaaatcaataaagaa 20311300  T
Q  212 a 212  Q
    |    
T  20311299 a 20311299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 10677555 - 10677753
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||    
T  10677555 atcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgttt 10677652  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10677653 aatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaa 10677751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 10891195 - 10891393
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||  ||||    
T  10891195 atcatcagtctacccacataatagtctatatactttaatgttatctcatttcacta--aagcttgactacggatactttaagaataatatcatttcgttt 10891292  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  10891293 aatggg-tctcgcgattaagtcatacttaatgctccattatacagactaattattttaggggctttattttattgaaacaaaagaaaatcaataaaaaaa 10891391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 5668125 - 5668327
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggata--ctttgagaatagtttccttatgt 110  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||  |||  |||| |||||| | |||||   |    
T  5668125 atcatcggtctatccacataatagtctctatgatttaatgttatctcttttcacaataaagcttgactacaaatatactttaagaataatgtcctttcat 5668224  T
Q  111 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 210  Q
    |||||||| |||||| ||||| | | |||||||| |||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5668225 ttaatggg-tctcacgattaaatcacacttaatgctccattaaatagactaattattctagagactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaaga 5668323  T
Q  211 aatg 214  Q
    ||||    
T  5668324 aatg 5668327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5616421 - 5616215
Alignment:
Q  14 tcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagc--ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtt 111  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| || |||  || ||| |  ||||| ||||||||||| |||||| | ||||   |||    
T  5616421 tcatcaatctacatacataatagtctcaatgctttattaatatcccaattcataataaaacctttgacaacggatactttaagaataatgtcctctagtt 5616322  T
Q  112 taatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaa 211  Q
    ||| ||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||  |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5616321 taacgggatctcatgatttagtcagacttaatgttccaagaaatagactaattattttaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatgaataaagaa 5616222  T
Q  212 atgcctt 218  Q
    |||||||    
T  5616221 atgcctt 5616215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35223767 - 35223576
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    ||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||  ||||    
T  35223767 atcatccgtctacccacataatagtctatatgctttaatgttatccttttttacaataaagcttgactacgaatactttaagaataatgtcctttcgttt 35223668  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
     | |          ||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35223667 tacg----------attaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattctagggactttattattttaaaacaaaacaaaatcaacaaagaaa 35223578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5713912 - 5713855
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5713912 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 5713855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26963604 - 26963547
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26963604 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 26963547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26970427 - 26970370
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26970427 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 26970370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 19927003 - 19927059
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927003 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 19927059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 10621576 - 10621633
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621576 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 10621633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5707284 - 5707228
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707284 catgatacaaagccaaacacaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 5707228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12357100 - 12357044
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12357100 catgatacaaagccaaatccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 12357044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 868561 - 868507
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  868561 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggtttattccaa 868507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 10628655 - 10628711
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10628655 catgatacaaagtcaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 10628711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 17142372 - 17142428
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17142372 catgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggctttttccaaca 17142428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 55612650 - 55612594
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55612650 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggttattagggcttattctaaca 55612594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Original strand, 28393380 - 28393434
Alignment:
Q  258 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28393380 tgatacaaagtcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 28393434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18269032 - 18268975
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18269032 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaacaa 18268975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 4426847 - 4426903
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4426847 catgatacagagccaaacccaatcaatatagattggctattaggacttactccaaca 4426903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 21454137 - 21454319
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||| |||||  |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||  |||| ||| | |||| | || ||||  ||    
T  21454137 atcatcaatctactcacataataatctttatgcattattgttatctcatttcacaataaagtttgactatagatattttaaaaataatgtcattataatt 21454236  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatactt-aatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 194  Q
    ||||||||||||  ||||||| | | || ||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  21454237 aatggggtctcaatattaagtcacattttaatgttccattaatcaaactaactattctaagaactttattactttgaaacaaa 21454319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 171
Target Start/End: Original strand, 39074278 - 39074346
Alignment:
Q  104 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctag 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  39074278 cttatgtttaatggggtctcatgattaagtcatacttaatgttcaatttaaacggactaattattctag 39074346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 55992729 - 55992680
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttat 305  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  55992729 catgatacaaagtcaaacccaatcaatacaaattggctattagggcttat 55992680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 297
Target Start/End: Original strand, 5668371 - 5668412
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatta 297  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5668371 catgatacaaaaccaaacacaatcaatatagattggctatta 5668412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8845166 - 8845118
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8845166 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8845118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 8858130 - 8858082
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8858130 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattaggactta 8858082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18262176 - 18262136
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctatt 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18262176 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatt 18262136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 83
Target Start/End: Original strand, 39074218 - 39074270
Alignment:
Q  31 taatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacg 83  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||    
T  39074218 taatagtctccatgctttaatgatatctcacttcacaataaagtatgactacg 39074270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 11161913 - 11161972
Alignment:
Q  111 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  11161913 ttaatggagtctcacaattaagtcacactttgtgttccattaaactgattaactattcta 11161972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20311261 - 20311207
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  20311261 catgatacaaagccaaatccaatgaatacagattggctattacagcttactccaa 20311207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24700006 - 24699958
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 304  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24700006 catgatacaaaaccaaattcaatcaatatagattggttattcgggctta 24699958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 26)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18252237 - 18252030
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252237 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18252138  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252137 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18252038  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  18252037 tgccttgt 18252030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 18532514 - 18532721
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532514 atcatcagtctatctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18532613  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532614 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18532713  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  18532714 tgccttgt 18532721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 27131409 - 27131616
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131409 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacaaatactttgagaatagtttccttatgttt 27131508  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131509 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27131608  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  27131609 tgccttgt 27131616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 21171233 - 21171438
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21171233 atcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttc 21171332  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21171333 aacggggtctcacaattaagttatatttaatgttccatgaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21171432  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  21171433 tgcctt 21171438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 27310577 - 27310782
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  27310577 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactactgatactttaagaatagtttccttatgttc 27310676  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27310677 aacgtggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27310776  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  27310777 tgcctt 27310782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 16359035 - 16359240
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359035 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatattccatttctcaataaagcttgactagggttactttaagaatagtttccttatgttt 16359134  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359135 aacggggtctcacaattaagttattcttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16359234  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  16359235 tgcctt 16359240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 36816633 - 36816834
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  36816633 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatggtatcccacttctcaataaagcttgactatggatactttaagaataatgtccttatgttt 36816732  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816733 aacggagtctcacaattaatttatacttaatgttccattaaacagacgaactattctagggacttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 36816832  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  36816833 tg 36816834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 3855919 - 3856126
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  3855919 atcatcagtctacccacgtaatagtctccatgctttaataatatcccacttcacaataaagtttgactacaaatattttaagaataatgtccttatgttt 3856018  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3856019 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgggctaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaagaaa 3856118  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  3856119 tgccttgt 3856126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 22657221 - 22657429
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  22657221 atcatcagtctatccacatgatagtctctatgctttaatgatatctcatttcagaataaagcttgactagagacactttaagaattgtgtccttatgttt 22657320  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaac-aaaatcaataaagaa 211  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22657321 aaaggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaacagactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaaatcaataaagaa 22657420  T
Q  212 atgccttgt 220  Q
    ||| |||||    
T  22657421 atgtcttgt 22657429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 27277557 - 27277756
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||  | ||    
T  27277557 atcatcggtctacccacataatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcctgactacggatactttaagaataatgtcatttcggtt 27277656  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||  || |||| | ||||||| | ||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27277657 aaaagg-tctcgcgattaagtcacact-aatgctccgttaaatggactaattattctagggacgttattattttgaaacaaaacaaaaacaacaaagaaa 27277754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 12006539 - 12006712
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||   |||||| | |||||| | ||||||| |||| | |||| ||  || ||||||||||| ||  ||| | |||| | |||||||||||    
T  12006539 atcatcagtctatgcacataacaatctctaagttttaatgttatccctcttcacactaaggcttgactacgaatgttttaataataatgtccttatgttt 12006638  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 186  Q
     |||||||||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12006639 catggggtctcacgattaaggcacacttaatattccattaaatagactaactattctagggactttattatttt 12006712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Original strand, 12014284 - 12014457
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||| | |||| ||  ||||||| |||||||||  ||| ||||||   || ||||||||    
T  12014284 atcatcattctacccacataatggtctttacgctttaatcgtatccctcttcacactaaagcttaactacggatgttttaagaataacatcattatgttt 12014383  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 186  Q
    |||||| ||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  12014384 aatgggatctaacgattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttattatttt 12014457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18251992 - 18251936
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18251992 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18251936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 18532757 - 18532813
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532757 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18532813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 27310821 - 27310877
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27310821 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27310877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 208
Target Start/End: Original strand, 9917918 - 9918106
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||| |||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| |||    
T  9917918 atcatcaacctaccgacatagtattctctatgcttcaatgctatcccacttaacaataaagcttaactatagatattttaagaataatgtccttatattt 9918017  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 208  Q
    |||||  ||||   || |||||||||||||||||| |||||||  |||||       || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9918018 aatgga-tctcgtgatcaagttatacttaatgttcgattaaacaaactaa------aagtgactttattattttgtaacaaaacaaaatcaataaa 9918106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 16359280 - 16359336
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16359280 catgatacaaatcctaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 16359336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 21171479 - 21171536
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21171479 catgatacaaagccaaactcaatccatatagattggctattagagcttactccaacaa 21171536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Original strand, 36816881 - 36816935
Alignment:
Q  259 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  36816881 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattgaatattagggcttaatccgacaa 36816935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 3856164 - 3856221
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  3856164 catgatacaaagtcaaacccaatcaagatggattggctattagggcctactccaacaa 3856221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Original strand, 22657469 - 22657522
Alignment:
Q  260 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22657469 atacaaagccaaactcaatcaatatatattggctattaaggcttactccaacaa 22657522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 214
Target Start/End: Original strand, 30720625 - 30720694
Alignment:
Q  145 ttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  30720625 ttccattaaacgaactaattattccaggaactttattattttaaaacaaaataaaaccaataaaaaaatg 30720694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 27131652 - 27131704
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27131652 catgatacaaagccaaacccaac----atagattggctattagggcttattccaaca 27131704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3403325 - 3403248
Alignment:
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 190  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3403325 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3403248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 3443494 - 3443571
Alignment:
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 190  Q
    |||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  3443494 aatgtggtctcacatttaagtcacacttaatattccattaatcagactaactattttatagactttattactttgaaa 3443571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 27277800 - 27277856
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||| |||||  ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27277800 catgatacaaagtcaaacataattaacatagattggctattagggcttactccaaca 27277856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18495 - 18288
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18495 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 18396  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18395 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18296  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  18295 tgccttgt 18288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18252 - 18196
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18252 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29327991 - 29327784
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327991 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29327892  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29327891 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29327792  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  29327791 tgccttgt 29327784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11536062 - 11536269
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11536062 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 11536161  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11536162 aatggggtctcacaattaagttgtacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11536261  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  11536262 tgccttgt 11536269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 11542980 - 11543187
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11542980 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaataggttccttatgttt 11543079  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543080 aatggggtctgacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 11543179  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||| ||||    
T  11543180 tgcattgt 11543187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15152650 - 15152445
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15152650 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccgtatgttt 15152551  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15152550 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaa 15152451  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  15152450 tgcctt 15152445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15148349 - 15148144
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15148349 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgttt 15148250  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15148249 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaatcaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaactcaataaagaaa 15148150  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  15148149 tgcctt 15148144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18561214 - 18561009
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18561214 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacctctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttcctaatgttt 18561115  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18561114 aacggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18561015  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  18561014 tgcctt 18561009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12751033 - 12750828
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12751033 atcatcagtctatccacataatagtctctatgctttaatgatatccaacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttctttatgttt 12750934  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12750933 aacgaggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 12750834  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  12750833 tgcctt 12750828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 12738739 - 12738542
Alignment:
Q  17 tcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  12738739 tcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaagaatagtttccttatgtttaaca 12738640  T
Q  117 gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12738639 aggtctcacaattaagttataattaatgtttcattaaacaaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaataaaatcaataaagaaatg 12738542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 18257842 - 18258047
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||||  ||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  18257842 atcatcaatctatccacataatagtctttatgcattattgttatcctacttaacaaaaaaacttgactacggatactttaagaataatgtccttgtgttt 18257941  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18257942 aatggggtctcacaattaagtcatacttaatgttccattaaacagactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18258041  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  18258042 tgcctt 18258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 341 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23863255 - 23863108
Alignment:
Q  341 gtttcgaaacaccttagacatttttagacacatcttgtacacatccaagagtgttaaggacatgttgaatcatatcaacaataaattagttagtgttact 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23863255 gtttcgaaacaccttagacatttttagagacatcttgtacacatccaagagtgttaaggacatgttgaatcatatcaacaataaattagttagtggtaag 23863156  T
Q  441 agcctttaaccccttatgtaattgtacaggggttcgatcttcgatttt 488  Q
    || ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23863155 agacttgaatcccttatgtaagtggacaggggttcgatcttcgatttt 23863108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 13392338 - 13392157
Alignment:
Q  32 aatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 131  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |  ||| ||| |||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||   ||||||||| |||||| |||||    
T  13392338 aatagtctctatgttttaatgttatcccttttcacaataaagtttgactattgatactttaagaataatgtcctttcatttaatggg-tctcacgattaa 13392240  T
Q  132 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
    || | |||||||| |||||||| | |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13392239 gtcacacttaatgctccattaagcagactaattgttctaggaactttattattttgaaacaaaacaaagtcaacaaagaaatg 13392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2365101 - 2364917
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || | ||||||||| ||| ||| |||||| | || ||  ||||    
T  2365101 atcatcagtcgacccacatgatagtctctatgttttaatgttatctcatttcacaataagg-ttgactacgaatattttaagaataatgtcatttagttt 2365003  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaa 198  Q
    |||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2365002 aatgggttctcacgattaagccacacttaatgttccattagaaagactaattattctagagactttattattttgaaacataacaa 2364917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 11543223 - 11543280
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11543223 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 11543280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 2653275 - 2653331
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653275 catgatacaaagccaatcccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 2653331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12738499 - 12738443
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12738499 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 12738443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 39112002 - 39111819
Alignment:
Q  30 ataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaatt 129  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| ||  ||| ||| |||||| ||||  | ||| |||   |||||| ||||||||||||| |  ||||    |||    
T  39112002 ataatagtctctatattttaatgttatttcgtttcacaataaagctggactgtgaatatttttgaaatagtgtccttatgtttaaagatgtcttgtgatt 39111903  T
Q  130 aagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39111902 aagtcgtacttaatgtttcattaaacggactcgctattctagggactttatt-ttttgaaataaaacaaaattaataaagaaatg 39111819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 11536305 - 11536362
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11536305 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagagtggctattagggcttattccaacaa 11536362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12750789 - 12750732
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12750789 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattagctattagggcttactccaacaa 12750732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15152406 - 15152349
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15152406 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 15152349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7396381 - 7396221
Alignment:
Q  28 acataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||  | ||| ||  || ||||||||||  ||  ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||  |    
T  7396381 acataatagtctctatgctttaatatcatcgtatttcacactaaggcttgactacatatgttttaagaataattttcttatgtttaatagggtctcaaga 7396282  T
Q  128 ttaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttg 187  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  7396281 ttaagtcatacttaatgttccatttaaatgaactaactattctagcgacatttttattttg 7396221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29327745 - 29327689
Alignment:
Q  257 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29327745 atgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 29327689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15148105 - 15148049
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15148105 catgatacaaaaccaaacccaattaatatagattggctattagggcttactccaaca 15148049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 23872160 - 23872073
Alignment:
Q  342 tttcgaaacaccttagacatttttagacacatcttgtacacatccaagagtgttaaggacatgttgaatcatatcaacaataaattagtt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  23872160 tttcaaaacaccttagacatttctaaacacatctcgtacacatctaagagtgttaaagacatgttaaa--gaatcaacaataaattagtt 23872073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 13392085 - 13392029
Alignment:
Q  257 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  13392085 atgatacaaagtcaaacacaatcaatatagattggatattagggcttactccaacaa 13392029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3132791 - 3132748
Alignment:
Q  103 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgtt 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3132791 ccttatgtttaatggggtctcacaattaagttacacttaatgtt 3132748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10234244 - 10234179
Alignment:
Q  105 ttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 170  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10234244 ttatgtttaatggaatctcatgattaagttatatttaatggttcattaaacggactaactattcta 10234179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 18258087 - 18258143
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18258087 catgatacaaggccaaaaccaatcaatctagattggctatcagggcttactccaaca 18258143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 220
Target Start/End: Original strand, 2653207 - 2653239
Alignment:
Q  188 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2653207 aaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 2653239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18560969 - 18560913
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18560969 catgatacaaagccaagcccaatcaacatagattgcctttaagggcttactccaaca 18560913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 27381252 - 27381459
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27381252 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgttt 27381351  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381352 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27381451  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  27381452 tgccttgt 27381459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 27471635 - 27471842
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27471635 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactatggatactttgagaatagtttccatatgttt 27471734  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471735 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 27471834  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  27471835 tgccttgt 27471842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 17684469 - 17684674
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684469 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 17684568  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684569 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 17684668  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  17684669 tgcctt 17684674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29309097 - 29308890
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29309097 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29308998  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308997 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29308898  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  29308897 tgccttgt 29308890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29316057 - 29315850
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29316057 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 29315958  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315957 aatgggctctcacaattaagttatacttaatgttccattaaatggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 29315858  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  29315857 tgccttgt 29315850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 16566320 - 16566525
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16566320 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 16566419  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16566420 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 16566519  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  16566520 tgcctt 16566525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 17691440 - 17691647
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17691440 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcactaaagcttgactacggatactttaagaatagtttccttatgttt 17691539  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17691540 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaagaaaacaaaatcaataaagaaa 17691639  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  17691640 tgccttgt 17691647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 188977 - 189182
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  188977 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacaaatactttaagaatagtttccttatgttt 189076  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189077 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 189176  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  189177 tgcctt 189182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 11651930 - 11651725
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  11651930 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactactgatacttttagaatagtttccttattttt 11651831  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11651830 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaatcaaaatcaataaagaaa 11651731  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  11651730 tgcctt 11651725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 25537159 - 25537364
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25537159 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgttt 25537258  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25537259 aacggggtctcacaataaagttatacttaatgttccattaaacggactaattattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 25537358  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  25537359 tgcctt 25537364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 13359269 - 13359474
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| | || || ||| ||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | |  ||||||||    
T  13359269 atcatcagtctatccatataatagtctctacgctttaatgttgtcccatttcacaataaaggttgactacggatactttaaaaataatgtttttatgttt 13359368  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  13359369 aatggagtttcacgattaagttatacttaatgctccattaagcgaactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaataaataaataaa 13359468  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  13359469 tgcctt 13359474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 181
Target Start/End: Original strand, 20553587 - 20553755
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||  || ||||||||| |||| |||||| | | ||||| |||    
T  20553587 atcatcagtctaccaacataaaaatctttatgctttaattttatctcacttcacaataaaaattcactacggatgctttaagaataatattcttatattt 20553686  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatt 181  Q
    |||||| |||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20553687 aatgggatctcacgattaagtcgtacttaatatttcattaaacggactagctatcctagagactttatt 20553755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Original strand, 17691683 - 17691737
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17691683 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 17691737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 182
Target Start/End: Original strand, 17850495 - 17850663
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| |||| ||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| | |||    
T  17850495 atcatcagtctacccatataatagtctatatacttgaatgttatttgacttcacaa-aaagcttgactatggataatttaagaatagtgtccttgttttt 17850593  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 182  Q
    ||| || | ||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  17850594 aattggatatcacaattaagtcttacataatgttccaacaaacaaactagctattatagggactttatta 17850663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 27381495 - 27381552
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27381495 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 27381552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 27471878 - 27471935
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471878 catgaaacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 27471935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29308854 - 29308797
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29308854 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 29308797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29315814 - 29315757
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29315814 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 29315757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8510115 - 8509941
Alignment:
Q  28 acataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatgggg-tctcaca 126  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||| |||||  ||||||| | ||||   |||| || |||||||||| ||||| |    
T  8510115 acataatagtctttatgttttaatgctatctcatttcataataaagcttaactacatatactttaataatatcatcctcatatttaatgggggtctcata 8510016  T
Q  127 attaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaat 201  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  8510015 attaagtcgtacataatgttccatcaaatagactaattattctatagactttattattttaaaacaaaataaaat 8509941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 17684712 - 17684769
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17684712 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctattagggcttattccaacaa 17684769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11651684 - 11651630
Alignment:
Q  258 tgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11651684 tgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 11651630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 25537405 - 25537462
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25537405 catgatacaaagccaaactcagtcaatatagattggctattagggcttaatccaacaa 25537462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27925961 - 27925772
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| | ||||| |||| |||  ||||||  || |||| |||||||  |||||||| |||||| ||| |||  ||||    
T  27925961 atcatcagtttatccacataatagtctttgtgcttcaatgctataccacttccaaataaagtttgactagagatactttaagaataattttctttagttt 27925862  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagt--tatactta---atgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaca 197  Q
    ||||| ||||||| |||||||   | |||||   ||||||| ||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27925861 aatggagtctcacgattaagtcacacacttaattatgttccgttaaacatactagttattctaaggactttattattttgaaacaaaaca 27925772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 213
Target Start/End: Original strand, 31258065 - 31258120
Alignment:
Q  158 actaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaat 213  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31258065 actaattattttagagactttattattttgaaacaaaacaaaagcaataaagaaat 31258120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 13359512 - 13359569
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  13359512 catgatacaaagtcaaacccaatgaatatagattggctattaggacttactcccacaa 13359569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 304
Target Start/End: Original strand, 16566563 - 16566611
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggctta 304  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16566563 catgatacaaagtcaaactcaatcaacatagattggctattagggctta 16566611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 189221 - 189280
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaata---tagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  189221 catgatacaaagccaaacccaatcaatatactagattgattattagggcttactccaaca 189280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 298
Target Start/End: Original strand, 16394484 - 16394526
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattag 298  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16394484 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattgtctattag 16394526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 22259925 - 22259990
Alignment:
Q  139 ttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaa 204  Q
    ||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22259925 ttaatgttatattaaatggactagttattttagggagtttattattttgcaacataacaaaatcaa 22259990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 4)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7141
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6934 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 7033  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7034 aatagggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 7133  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  7134 tgccttgt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 13950 - 14157
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13950 atcatcagtctacctacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttccttatgttt 14049  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14050 aatggggtctcacagttaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattgtagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 14149  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  14150 tgccttgt 14157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 7177 - 7234
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7177 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 7234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 14193 - 14249
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14193 catgatacaaaaccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 14249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21940872 - 21940665
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940872 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 21940773  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940772 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21940673  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||| ||||    
T  21940672 tgcattgt 21940665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 28555084 - 28554885
Alignment:
Q  19 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28555084 agtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaacaaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgtttaatggg 28554985  T
Q  119 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28554984 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattttaggtattttattattttgaaactaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 28554885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22171694 - 22171491
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22171694 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttc--tatgttt 22171597  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22171596 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacagactaactattctagggactttattattttgaaataaaacaaaatcaataaggaaa 22171497  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  22171496 tgcctt 22171491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24642856 - 24642655
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24642856 atcatcagtctacccacataatagtctctatactttaatgatatctcacttctcaataaagcttgactacgaatactttaagaatagtttccttatgttt 24642757  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642756 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaacaattctagggactttatgattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 24642657  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  24642656 tg 24642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 6094330 - 6094129
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6094330 atcatcactctacccatataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttaaaaatagtttccttatgttt 6094231  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6094230 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 6094131  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  6094130 tg 6094129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 87 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24636987 - 24636860
Alignment:
Q  87 actttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattatttt 186  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24636987 actttaagaatagtttccttatgtttaacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaaaggactaactattctagggactttattatttt 24636888  T
Q  187 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24636887 gaaacaaaacaaaatcaagaaagaaatg 24636860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21940629 - 21940573
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21940629 catgatacaaagccaaaaccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21940573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22070164 - 22070108
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22070164 catgatacaaaaccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 22070108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 208
Target Start/End: Original strand, 38232380 - 38232570
Alignment:
Q  16 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaat 115  Q
    ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||||||||  ||||||| |||||| | |  ||| |||||||    
T  38232380 atcagtctacccacaaaatagtttttatgctttaagactatctcactttacaataaagtttgactacaaatactttaagaatactatt-ttacgtttaat 38232478  T
Q  116 ggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaa 208  Q
    || || |||  |||||||||||| |||   |  ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38232479 ggagtgtcatgattaagttatacctaaaaatttattaaacagactaactattctagaga-tttattattttgaaataaaacaaaatcaataaa 38232570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22171452 - 22171395
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22171452 catgatacaaaatcaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 22171395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24642608 - 24642555
Alignment:
Q  260 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24642608 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 24642555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6094087 - 6094031
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6094087 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 6094031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28554847 - 28554790
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28554847 catgatacaaagccaaacccaatcaacaaagattggctattagggcttactccaacaa 28554790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2375208 - 2375027
Alignment:
Q  16 atcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaat 115  Q
    |||| |||||| || |||||||   ||| |||||||| ||||||||| | ||| ||| | |||||||  ||||||| | |||| | | | ||||||||||    
T  2375208 atcaatctacccacttaatagttcatatactttaatgttatctcact-cgcaataaatcgtgactacatatactttaaaaataatattcgtatgtttaat 2375110  T
Q  116 ggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaa 199  Q
    ||| | |||  ||||||| ||  | ||||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2375109 gggtt-tcatgattaagtcatcataaatgttccattaaattgactaattattatagggagtttattattttgaaacaaaacaaa 2375027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Original strand, 32872857 - 32873019
Alignment:
Q  29 cataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaat 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||| ||| |||||  ||| ||| | | || | ||  | | || |||| | |||||||||    
T  32872857 cataatagtctctatgctttgatgttatcccacttcacaataaatcttaactacaaatattttaatagtattgtcactcttttcaatgagatctcacaat 32872956  T
Q  129 taagttatacttaatgttccat-taaacggactaactattctagggactttattattttgaaa 190  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |||  ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  32872957 taagtcatacttaatgttctatataaatggatgaactattataaggactttattattttgaaa 32873019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 10920297 - 10920234
Alignment:
Q  119 gtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttatta 182  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  10920297 gtctcacgattaactcatacttaatgttccattaaacagactaattattctaggaattttatta 10920234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2375000 - 2374946
Alignment:
Q  259 gatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||    
T  2375000 gatacaaagccaaatccaatcaatacatatttattattagggcttattccaacaa 2374946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24636642 - 24636605
Alignment:
Q  275 caatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24636642 caatcaatatagattggctattatggcttactccaaca 24636605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 24695466 - 24695673
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24695466 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgttt 24695565  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695566 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 24695665  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    ||||||||    
T  24695666 tgccttgt 24695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 18569863 - 18570070
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18569863 atcatcagtctaccaacataatagtctttatgctttaatgatattccacttctcaataaagcttgactacggatactttaagagtagtttccttatgttt 18569962  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18569963 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttcaattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 18570062  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  18570063 tgtcttgt 18570070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Original strand, 19714498 - 19714703
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19714498 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgttt 19714597  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19714598 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaa 19714697  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  19714698 tgcctt 19714703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 19707218 - 19707419
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19707218 atcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcctacttctcaataaagcttgacttcggatattttaagaatagattccttatgttt 19707317  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19707318 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaactgactaactattctagggactttattactttgaaataaaacaaaatcaataaagaaa 19707417  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  19707418 tg 19707419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 214
Target Start/End: Original strand, 22547016 - 22547217
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || ||||||| | |||| | ||| ||| |||    
T  22547016 atcatcggtctatccacataatagtctctatattttaatgttatctcacttcacaataaagtttgactgcgaatactttaaaaataatgtccatatattt 22547115  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||    
T  22547116 aatgagatctcacgattaagttatacttaatgttccattaaaccgactaactattatagcggttttattattttaaaataaaacaaaatgaataaataaa 22547215  T
Q  213 tg 214  Q
    ||    
T  22547216 tg 22547217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 215
Target Start/End: Original strand, 27347497 - 27347679
Alignment:
Q  32 aatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaa 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |  ||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | |||||  |||||||||| |||||| |||||    
T  27347497 aatagtctctatgctttaatgttatcccttttcacaataaagcttgactacatatactttaagaataatgtcctttcgtttaatggg-tctcacgattaa 27347595  T
Q  132 gttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgc 215  Q
    || | |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27347596 gtcacacttaatgctccattaaacagattaattattctaaggactttattattttgaatcaaaacaaaatcaacaaagaaatgc 27347679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 111 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 39538071 - 39537962
Alignment:
Q  111 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 210  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39538071 ttaatgaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacgaaccaactattctaaggacttaaccattttgaaacaaaacaaaatcattaaaga 39537972  T
Q  211 aatgccttgt 220  Q
    |||| |||||    
T  39537971 aatggcttgt 39537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 17285754 - 17285935
Alignment:
Q  35 agtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 134  Q
    ||||| |||||||||||  |||| || ||| ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17285754 agtctatatgctttaatactatcccaattcacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17285853  T
Q  135 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 216  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17285854 acacttaatgttccattaaacagactaactattctctggagattattattttgaaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17285935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Original strand, 18807034 - 18807175
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcc-ttatgtt 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| || |||||||||  |||||||| |||||| | ||| |||| ||    
T  18807034 atcatcagtctacccgcataatagtctctatgctttattgttatcttacttcacaataacgcttgactatagatactttaagaataatgtccattat-tt 18807132  T
Q  112 taatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaa 154  Q
    |||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18807133 taatggtgtctcacgattaagtcacacttaatgttccattaaa 18807175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 24695709 - 24695766
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24695709 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 24695766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 31886640 - 31886537
Alignment:
Q  111 ttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaaga 210  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31886640 ttaatggagtctcacgattaagtcgtacttgatgttcaattaaatgaactaattattctaaggactttattaatttgaaacaaaacaaaatcactaaaga 31886541  T
Q  211 aatg 214  Q
    ||||    
T  31886540 aatg 31886537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 19714742 - 19714798
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19714742 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 19714798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Original strand, 17298907 - 17299088
Alignment:
Q  35 agtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagtt 134  Q
    ||||| |||||||||||  |||| |||||  ||| |||| | ||||| | ||||||| |||||| | || ||  ||||| | |||| |||| |||||||     
T  17298907 agtctatatgctttaatactatcccacttaacaataaagatcgactatgaatactttaagaataatgtcatttagtttactagggtttcacgattaagtc 17299006  T
Q  135 atacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcc 216  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17299007 gcacttaatgttccattaatcggactaactattctctggatattattatttataaacataacaaaatcaataaataaatgcc 17299088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 19707462 - 19707519
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19707462 catgatacaaagccaaactcaatcaatatagattggctattagggcttactccaacaa 19707519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 27347722 - 27347778
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27347722 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatagattggctattagggcttactccaaca 27347778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39538793 - 39538701
Alignment:
Q  15 catcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttcctta 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  39538793 catcagtctacccacataatagtcttcatgctttaatgatatcccacttcacaataaagcttaactatggatattttaagaatagtgtcctta 39538701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 194
Target Start/End: Original strand, 33477389 - 33477479
Alignment:
Q  104 cttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaa 194  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||  | | |||||||| |||||||| | | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  33477389 cttatgattaatgaggtctcacgattagatcacacttaatgatccattaatcagcctaactattgtaaggactttattattttgaaacaaa 33477479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 18570108 - 18570165
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18570108 catgatacaaagccaaacccaattaatatagattagctattagagcttactcgaacaa 18570165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 39537925 - 39537870
Alignment:
Q  257 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39537925 atgatacaaagctaaactcagtcaacatagattggctattagggcttaatccaaca 39537870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 11479489 - 11479420
Alignment:
Q  102 tccttatgtttaatg-gggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattcta 170  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||  ||||| |||||||    
T  11479489 tccttatgtttaatgagggtctcacaatcaagtcacacttaatatttcattaaacacactaattattcta 11479420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 21330248 - 21330455
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330248 atcatcagtccacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 21330347  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330348 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 21330447  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  21330448 tgtcttgt 21330455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18796713 - 18796506
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||     
T  18796713 atcatcagtctacccacataatagtctcaatgctttaatgatataccacttcacaataaagcttgactacagataatttaagaataatatccttatgtta 18796614  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||    
T  18796613 aaagaggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttgttattttgaaacaaaacaaaataaacaaataaa 18796514  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    | ||||||    
T  18796513 ttccttgt 18796506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 18620011 - 18619807
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  18620011 atcatcggcctacccacataatagtctatatgctttaatattatcccttttcacaataaagtttgaccacagatactttaagaataatatccttttgttt 18619912  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||| ||||| |||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18619911 aatggg-tctcataattaagtcacacttaatgctccattaaacagactaattattatagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaacaaagaaa 18619813  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    | ||||    
T  18619812 ttcctt 18619807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 19692598 - 19692737
Alignment:
Q  75 ttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctaggga 174  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19692598 ttgactaaggatactttaagaataatttcctttagtttaatgagatctcatgattaagtcaggcttaatgttccattaaacagactaattattctaggga 19692697  T
Q  175 ctttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19692698 cttcattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatg 19692737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20978084 - 20977957
Alignment:
Q  28 acataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |    
T  20978084 acataatagtctctatgctttagtgatatctcacttcacattaaagcttgactacggatgttttaagaataatttccttatttttaatgggatctcatga 20977985  T
Q  128 ttaagttatacttaatgttccattaaac 155  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20977984 ttaaattattcttaatgttccattaaac 20977957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 21330493 - 21330549
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21330493 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 21330549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 36270373 - 36270199
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||| |||| | |||| ||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| || || |||||    
T  36270373 atcatcagtctacccacacaatagtctttatactttaatgttatccctcttcacactaaagcttgattacggatgttttaagaatagtgtcattgtgttt 36270274  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 186  Q
    ||||  ||||||| ||||||| | ||||||  || || ||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36270273 aatgatgtctcacgattaagtcacacttaacatttcatttaagtaaactaactattctagggactttattatttt 36270199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18822290 - 18822115
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||  |  ||||||||| |||  ||  ||| |||||||| ||||| |||||    
T  18822290 atcatcagtctattgacataataatctatctgctttaatgatatcccacttcaaactaaagcttgattacatatgttttaagaatagtgtccttgtgttt 18822191  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaa-tgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattatttt 186  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | |||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  18822190 aatggtgtctcacgattaagccacacttaatttttccatttaaacgaactaacaattctatagactttattatttt 18822115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 19692773 - 19692830
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19692773 catgatacaaaaccaaacctaataaatacagattggctattaaggcttactccaacaa 19692830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 49
Target Start/End: Original strand, 12098618 - 12098654
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgcttta 49  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12098618 atcatcagtctacatacataatagtctctatgtttta 12098654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18796470 - 18796411
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaa--tatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  18796470 catgatacaaagccaaacgcaatcaatatatagattttctgttagggcttaatccaacaa 18796411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0433
Description:

Target: scaffold0433; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7314 - 7107
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  7314 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatacttttagaatagtttcattatgttt 7215  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7214 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttctattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 7115  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    | ||||||    
T  7114 taccttgt 7107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0433; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7071 - 7014
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7071 catgatgcaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 7014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0657
Description:

Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1200 - 993
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1200 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacagatactttgagaatagtttctttatgttt 1101  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgtttcattaaacggactaactattttagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 1001  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  1000 tgtcttgt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0657; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 957 - 901
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 220
Target Start/End: Original strand, 25990 - 26197
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25990 atcatcagtctacctacataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 26089  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090 aatggggtctcacaattaagttatatttaatgttccattaaatggactaactattctaaggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 26189  T
Q  213 tgccttgt 220  Q
    || |||||    
T  26190 tgtcttgt 26197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 313
Target Start/End: Original strand, 26231 - 26287
Alignment:
Q  257 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26231 atgatacaaagccaaacccaatcaatatagattgactattagggcttattccaacaa 26287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 5736 - 5531
Alignment:
Q  13 atcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgttt 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5736 atcatcagtctacccacataatagtctttatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacatatactttaagaataatttccttatgttt 5637  T
Q  113 aatggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  5636 aacggggtctcacaattaagttatacttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaaataaatcaataaagaaa 5537  T
Q  213 tgcctt 218  Q
    ||||||    
T  5536 tgcctt 5531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5492 - 5435
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5492 catgatacaaagccaaacccaaacaatatagattggctattagggcttacttcaacaa 5435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 37 - 218
Target Start/End: Original strand, 230365 - 230545
Alignment:
Q  37 tctctatgctttaatgatatctcacttctcaacaaagcttgactacggatactttgagaatagtttccttatgtttaatggggtctcacaattaagttat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  230365 tctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaatcttgactacaaatactttaagaatggtttccttatgtttaa-ggggtctcacaattaagttat 230463  T
Q  137 acttaatgttccattaaacggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  230464 acttaatgttccattaaacggactaactattataagaactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgcctt 230545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 230584 - 230640
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  230584 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattattgcttactccaaca 230640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 156 - 220
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8510
Alignment:
Q  156 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8446 ggactaactattctagggactttattattttgaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgtcttgt 8510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 8546 - 8603
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8546 catgatacaaagccgaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 8603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 23769 - 23826
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23769 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 23826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16579 - 16522
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16579 catgatataaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 16522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16648 - 16615
Alignment:
Q  187 gaaacaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16648 gaancaaaacaaaatcaataaagaaatgccttgt 16615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0705 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0705
Description:

Target: scaffold0705; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 256 - 313
Target Start/End: Original strand, 41 - 98
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 catgatacaaagccaaaatcaatcattatagattggctattagggcttattccaacaa 98  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9000 - 8944
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9000 catgatacaaagccaaacccattcaacatagattggctatttgggcttattccaaca 8944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 256 - 310
Target Start/End: Original strand, 10202 - 10256
Alignment:
Q  256 catgatacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaa 310  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10202 catgatacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattagagcttactccaa 10256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 201
Target Start/End: Original strand, 10127 - 10158
Alignment:
Q  170 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10127 agggactttattattttgaaacaaaacaaaat 10158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 1 - 37
Alignment:
Q  276 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatcaatatagattggctattagggcttattccaaca 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5930 - 5877
Alignment:
Q  260 atacaaagccaaacccaatcaatatagattggctattagggcttattccaacaa 313  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  5930 atacaaagtcaaactcaatcaatatagattggctattatgacttactccaacaa 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 92267 - 92194
Alignment:
Q  119 gtctcacaattaagttatacttaatgttcca-ttaaacggactaactattctagggactttattattttgaaac 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  92267 gtctcacgattaagttatacttaatgttccatttaaaataactagatattctagagactttattactttaaaac 92194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University