View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2664_low_4 (Length: 519)

Name: NF2664_low_4
Description: NF2664
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2664_low_4
NF2664_low_4
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (16-501)||(37919115-37919600)
chr7 (16-501)||(11277336-11277822)
chr7 (16-501)||(47876554-47877039)
chr7 (16-501)||(235521-236008)
chr7 (16-488)||(29967546-29968018)
chr7 (26-498)||(17720225-17720688)
chr7 (16-463)||(31177427-31177874)
chr7 (16-501)||(4938212-4938697)
chr7 (16-168)||(38890137-38890289)
chr7 (271-387)||(18530336-18530452)
chr7 (326-398)||(37254639-37254711)
chr7 (43-150)||(37254356-37254463)
chr7 (272-408)||(25619286-25619422)
chr7 (99-179)||(34359403-34359483)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (16-501)||(13395959-13396444)
chr8 (16-501)||(41665453-41665938)
chr8 (16-501)||(32266135-32266620)
chr8 (16-501)||(7923957-7924442)
chr8 (26-495)||(9922182-9922651)
chr8 (16-370)||(32567480-32567833)
chr8 (16-501)||(171674-172159)
chr8 (24-501)||(8299382-8299859)
chr8 (16-413)||(20496655-20497052)
chr8 (70-438)||(5181294-5181663)
chr8 (271-408)||(2170166-2170303)
chr8 (271-411)||(43270276-43270416)
chr8 (326-477)||(13200004-13200155)
chr8 (271-477)||(2529712-2529918)
chr8 (54-148)||(34137400-34137494)
chr8 (271-399)||(37433958-37434086)
chr8 (323-477)||(34137071-34137225)
chr8 (28-144)||(12257892-12258008)
chr8 (28-144)||(12265284-12265400)
chr8 (271-399)||(17699308-17699436)
chr8 (326-408)||(20824177-20824259)
chr8 (70-132)||(29733403-29733465)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (16-501)||(34332899-34333384)
chr3 (16-501)||(40930612-40931097)
chr3 (16-501)||(2363848-2364333)
chr3 (34-501)||(19920313-19920780)
chr3 (16-501)||(7312347-7312832)
chr3 (16-501)||(10323655-10324140)
chr3 (54-498)||(7031927-7032371)
chr3 (16-128)||(15827282-15827394)
chr3 (20-128)||(10312953-10313061)
chr3 (332-462)||(26771112-26771242)
chr3 (16-96)||(926692-926772)
chr3 (326-399)||(35214557-35214630)
chr3 (271-426)||(36801234-36801389)
chr3 (13-144)||(15312150-15312281)
chr3 (271-408)||(7031194-7031331)
chr3 (326-399)||(33496428-33496501)
chr3 (59-143)||(963605-963689)
chr3 (43-143)||(48570481-48570581)
chr3 (326-399)||(11203700-11203773)
chr3 (30-143)||(30695785-30695898)
chr3 (252-312)||(17098149-17098209)
[»] chr4 (24 HSPs)
chr4 (16-501)||(19754834-19755323)
chr4 (16-501)||(19784483-19784972)
chr4 (18-485)||(15739794-15740261)
chr4 (16-501)||(47685979-47686464)
chr4 (16-501)||(7403483-7403969)
chr4 (16-501)||(23642675-23643160)
chr4 (16-501)||(13270975-13271460)
chr4 (16-413)||(159863-160260)
chr4 (16-501)||(47418376-47418860)
chr4 (16-364)||(20788501-20788849)
chr4 (298-485)||(1828640-1828827)
chr4 (16-118)||(8890594-8890696)
chr4 (44-201)||(17402070-17402227)
chr4 (70-150)||(11587633-11587713)
chr4 (16-128)||(16427120-16427232)
chr4 (16-107)||(43019511-43019603)
chr4 (30-399)||(12697398-12697767)
chr4 (252-426)||(8360907-8361081)
chr4 (30-399)||(4548405-4548774)
chr4 (326-434)||(20002599-20002707)
chr4 (54-149)||(23163068-23163162)
chr4 (70-143)||(2822479-2822552)
chr4 (60-201)||(19740424-19740565)
chr4 (43-143)||(48311688-48311788)
[»] chr5 (28 HSPs)
chr5 (16-501)||(23237954-23238440)
chr5 (16-501)||(8227597-8228082)
chr5 (26-501)||(35983875-35984349)
chr5 (26-501)||(28535759-28536234)
chr5 (16-501)||(27117245-27117730)
chr5 (16-501)||(12824769-12825255)
chr5 (16-501)||(30732398-30732884)
chr5 (16-501)||(42513291-42513776)
chr5 (16-499)||(12820035-12820519)
chr5 (16-499)||(42927702-42928185)
chr5 (16-489)||(19255218-19255692)
chr5 (16-413)||(3418354-3418751)
chr5 (16-349)||(25824582-25824915)
chr5 (26-200)||(31641338-31641512)
chr5 (70-293)||(32228429-32228652)
chr5 (74-399)||(18359277-18359601)
chr5 (271-408)||(25857601-25857738)
chr5 (26-146)||(26072474-26072594)
chr5 (266-426)||(33385533-33385693)
chr5 (448-494)||(31641515-31641561)
chr5 (16-73)||(12032460-12032517)
chr5 (367-462)||(27795405-27795500)
chr5 (344-426)||(10776663-10776745)
chr5 (72-150)||(29142427-29142505)
chr5 (271-408)||(8300359-8300496)
chr5 (125-174)||(17106673-17106722)
chr5 (78-150)||(27166387-27166459)
chr5 (75-143)||(33169288-33169356)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (16-501)||(24767508-24767993)
chr6 (18-416)||(21167798-21168196)
chr6 (16-501)||(12733696-12734181)
chr6 (16-501)||(18651318-18651803)
chr6 (26-387)||(5734439-5734800)
chr6 (294-501)||(2553486-2553693)
chr6 (16-209)||(18789255-18789448)
chr6 (54-462)||(14373114-14373522)
chr6 (43-187)||(15959212-15959356)
chr6 (28-287)||(32536478-32536737)
chr6 (30-399)||(17606520-17606889)
chr6 (271-399)||(21630295-21630423)
chr6 (43-117)||(11462013-11462087)
chr6 (30-143)||(10929746-10929859)
chr6 (271-408)||(17573832-17573969)
chr6 (271-408)||(17579258-17579395)
chr6 (59-143)||(13937314-13937398)
chr6 (326-434)||(20883184-20883292)
chr6 (326-408)||(11462294-11462375)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (16-501)||(11289-11774)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (16-501)||(11909189-11909675)
chr1 (16-501)||(51052050-51052536)
chr1 (16-380)||(4841970-4842339)
chr1 (18-386)||(6259390-6259758)
chr1 (16-501)||(35540620-35541105)
chr1 (13-501)||(6050170-6050659)
chr1 (16-306)||(26059462-26059752)
chr1 (16-270)||(12813519-12813773)
chr1 (16-304)||(13351885-13352173)
chr1 (16-133)||(24547518-24547635)
chr1 (54-150)||(47623500-47623596)
chr1 (326-408)||(37191387-37191469)
chr1 (30-399)||(43387952-43388321)
chr1 (368-462)||(47623200-47623292)
chr1 (43-117)||(37297967-37298041)
chr1 (271-408)||(16917986-16918123)
chr1 (252-295)||(23635013-23635056)
chr1 (59-144)||(6478133-6478218)
chr1 (252-292)||(23713699-23713739)
chr1 (43-143)||(37192369-37192469)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (16-501)||(105927-106412)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (16-501)||(4551747-4552225)
chr2 (16-501)||(41206577-41207072)
chr2 (43-501)||(15917251-15917710)
chr2 (43-462)||(17765085-17765504)
chr2 (16-84)||(40914380-40914448)
chr2 (326-477)||(12645417-12645568)
chr2 (271-408)||(11000127-11000264)
chr2 (54-150)||(28252330-28252426)
chr2 (367-462)||(28252642-28252737)
chr2 (43-143)||(33516226-33516326)
chr2 (43-143)||(40176268-40176368)
chr2 (326-408)||(14439634-14439715)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (255-501)||(3062-3308)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (16-209)||(5788-5981)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (26-144)||(6450-6568)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 37919115 - 37919600
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  37919115 attacaaccaaatcagtcaatacacggacataaaagcgggttcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 37919214  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37919215 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcatccatttcattccacaacaccgaaacacgaa 37919314  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37919315 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgtcatcttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgacccc 37919414  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37919415 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaataaatgattaacatcttcaacgttcccacaactagaa 37919514  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37919515 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 37919600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11277822 - 11277336
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11277822 attacaaccaaatcagtcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 11277723  T
Q  116 aaataagtt-gatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  11277722 aaagaagtttgatttcactttatctagtatttgtggcaaaatactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaa 11277623  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  11277622 agcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgaatgagaatcgactc 11277523  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11277522 ccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaatttacacaagactaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccaga 11277423  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  11277422 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattatttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagc 11277336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 47876554 - 47877039
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  47876554 attacaaccaaatgagtcaatacccagacataaaagtaggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 47876653  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  47876654 aaagaagttgatttcactttttctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 47876753  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||    
T  47876754 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccatcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaataatctgaagttgattaagagtcgacccc 47876853  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  47876854 taccactcctagccatgcccgcatcaattgtcataatgcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccgcatccagaa 47876953  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  47876954 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctctcagaagtcgccaagc 47877039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 236008 - 235521
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  236008 attacaaccaaatcagtcaatacccagacgtgaaagcagactcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccac 235909  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  235908 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcatatcatttcgttcattccacaacaccgaaacacaaa 235809  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  235808 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaatttgattgagagtcgacccc 235709  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  235708 taccactccgagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcgcaaccagaa 235609  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaat--tattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  235608 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaatgattttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 235521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 16 - 488
Target Start/End: Original strand, 29967546 - 29968018
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  29967546 attacaaccaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcctttaaccaccac 29967645  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| | |||| ||    
T  29967646 aaagaggttgatttcacattatctagcatttgtggcagcgtactttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccacagcacccagacacaaa 29967745  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||| || |||||    
T  29967746 gcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgtcctctcgaacaacctgcgtaattgataaattgcaaaagatgatctaaggttgaatgagaatctactcc 29967845  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29967846 caccactcctagccatgctcgcaccattggccataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaa 29967945  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctca 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  29967946 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctca 29968018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 498
Target Start/End: Original strand, 17720225 - 17720688
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17720225 aatcagtcaatacccaaacaagaaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttg 17720324  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||         |||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  17720325 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaagcctatcat---------tccacaacaccgaaacaacaagcagccaaat 17720415  T
Q  226 caagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcct 325  Q
    ||| || ||||| || |  |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  17720416 caaatgaaagaaggaacatcgccctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactcca 17720515  T
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||    
T  17720516 agccatgcttgcaccaatggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcttcattcccacaactagaaacacacatcc 17720615  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgcca 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  17720616 gcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgcca 17720688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31177874 - 31177427
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||    
T  31177874 attacaaacaaatcaatcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactaacctttagccaccac 31177775  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| | ||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  31177774 aacgaagttaacttcactttatctagcaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 31177675  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  31177674 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgcccactcgaacaacctgcataatgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 31177575  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  31177574 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 31177475  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaatta 463  Q
    ||||| |||||| |||||| |  || ||||| ||| |||| |||||||    
T  31177474 acacataaccgctcctccacatatagaatgccacgatttgtcaaatta 31177427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 4938697 - 4938212
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  4938697 attacaaacaaatcaatcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccac 4938598  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| | || ||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||    
T  4938597 aacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgtactttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaa 4938498  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4938497 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 4938398  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  4938397 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 4938298  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  4938297 acgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 4938212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38890289 - 38890137
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||    
T  38890289 attacaatcaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcaaccaccactgatgagtgccaaaattaaatacaacattactaacctttaaccaccac 38890190  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatt 168  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  38890189 aaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaaagtactttgtctatt 38890137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 387
Target Start/End: Original strand, 18530336 - 18530452
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  18530336 aataaattgcacaaaatgatctgatatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaa 18530435  T
Q  371 gacaaaaacaaatgatt 387  Q
    |||||||||||||||||    
T  18530436 gacaaaaacaaatgatt 18530452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Original strand, 37254639 - 37254711
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaa 398  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37254639 agccatgcccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaa 37254711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 150
Target Start/End: Original strand, 37254356 - 37254463
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    ||||||| || |||| |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||   |  |||||| ||||||||||||    
T  37254356 acataaatgcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaac 37254455  T
Q  143 atttgtgg 150  Q
    | ||||||    
T  37254456 aattgtgg 37254463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 408
Target Start/End: Original strand, 25619286 - 25619422
Alignment:
Q  272 ataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaag 371  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || |||||| |||||||| | ||||| |||||||  ||| ||  |||||    
T  25619286 ataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctacaccttcaacaccaagccattcccgcaccttaggccacaatgcaccgaaaattggacaag 25619385  T
Q  372 acaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25619386 acaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccaca 25619422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34359483 - 34359403
Alignment:
Q  99 tagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatca 179  Q
    |||| |||||||||||| || ||| ||| || ||||| |||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  34359483 tagcttttaaccaccaccaagaagatgaatttactttgtctaacatatgtggtaaagagctttgtctatttctaaatatca 34359403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 406; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 406; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 13395959 - 13396444
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  13395959 attacaaccaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccac 13396058  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13396059 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaataccgaaacacaaa 13396158  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13396159 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcgacccc 13396258  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13396259 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaa 13396358  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13396359 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagc 13396444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 41665938 - 41665453
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  41665938 attacaaccaaatcaatcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 41665839  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  41665838 aaagaagttgatttcactttatctaaaatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 41665739  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41665738 gcaaccaaatcaagtggaagaaagatcgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcagacaatgatctgaagttgattgagattcaacccc 41665639  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41665638 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaa 41665539  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||    
T  41665538 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaactgatctcttaggaatcgccaagc 41665453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 32266135 - 32266620
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  32266135 attacaaccaaatcagtcaatacccggacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacatttctagtctttaaccaccac 32266234  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    | | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32266235 agagaagttgatttcacattatctagcatttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaa 32266334  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32266335 gcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcc 32266434  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32266435 caccactcctagccatgctcgcaccattggccacaatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaa 32266534  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  32266535 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagc 32266620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 7923957 - 7924442
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  7923957 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 7924056  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7924057 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 7924156  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7924157 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgttgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 7924256  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  7924257 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 7924356  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  7924357 acgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 7924442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 495
Target Start/End: Original strand, 9922182 - 9922651
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  9922182 aatcagtcaatacccaaacaagaaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttg 9922281  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||  |||||    
T  9922282 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaagcctttcattccgttcattccacaacaccgaaacaacaagcagccaaat 9922381  T
Q  226 caagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcct 325  Q
    ||| || ||||| || || |||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  9922382 caaatgaaagaaggaacgtcgccctctcgaacatcctgcataattaataaattgcactaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactcca 9922481  T
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  9922482 agccatgctcgcaccaatggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatcc 9922581  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcg 495  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  9922582 gcgcctccagaggtaaaatgccacggtttgccaaattatcttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcg 9922651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32567833 - 32567480
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32567833 attacaaccaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtatcaaaactaaatacaacattgctagc-tttaaccaccac 32567735  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  32567734 aaagaagttgatttcacattatctagcatttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacacccaaacacaaa 32567635  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32567634 gcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcc 32567535  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
     |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32567534 caccactcctagccatgctggcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 32567480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 171674 - 172159
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| |||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||    
T  171674 attacaatcaaatcagtcaacacccaaacataaaagcgggcttgaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccatcac 171773  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  171774 aaagaagttgatttcactttatctagcaatagtggcaaagtactctgtctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 171873  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  171874 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaattatctgaagttgattgagagtcgacccc 171973  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||| ||||||    
T  171974 taccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcgtcaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattaccacagccagaa 172073  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||||  || ||||| |||||||||||    
T  172074 acacataaccgctcctccatagatagaatgtcacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagc 172159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 24 - 501
Target Start/End: Original strand, 8299382 - 8299859
Alignment:
Q  24 caaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  ||||    
T  8299382 caaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccacaacgaagt 8299481  T
Q  124 tgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaa 223  Q
    | ||||||||||||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  8299482 taatttcactttatctagcaattgaggcacagtactatgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaagcaaccaa 8299581  T
Q  224 atcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactc 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8299582 atcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacctaccactc 8299681  T
Q  324 ctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaa 423  Q
    ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |||||| ||    
T  8299682 ctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaggacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagcaacacataa 8299781  T
Q  424 ccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
     ||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  8299782 tcgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 8299859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Original strand, 20496655 - 20497052
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20496655 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 20496754  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  20496755 aacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaa 20496854  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20496855 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 20496954  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccag 413  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  20496955 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 20497052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 438
Target Start/End: Original strand, 5181294 - 5181663
Alignment:
Q  70 atgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctattt 169  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||    
T  5181294 atgagtactaaagctaaatacaacattactaacttttaaccaccacaaataagatgattttactttatctaacatatgtggtaaagaactttctctattt 5181393  T
Q  170 ctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaat 269  Q
    ||||| |||||||||||   ||| |||||||| ||| ||||||   | |  ||||||||||  || || || || |||  |||| | |||||||||||||    
T  5181394 ctaaatatcatatcatttcgttcgttccacaaaacctaaacacattgaagccaaatcaagtaaaaaaaggatcgtcgcgatctcgagcaacctgcgtaat 5181493  T
Q  270 taataaa-ttgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacac 368  Q
    ||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||| |||||| || |||| |||||||   |    
T  5181494 taataaatttgcaaaaaatggtttgtagttgtctgagagtcgacccctaccacaccgagccatgcctacaccaatggccacaaggcaccaaaagttgggc 5181593  T
Q  369 aagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaagg 438  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||| | ||| || | ||  | |||||||||||||||||||||    
T  5181594 aagacaaaaacatatgattctcatcttcaacttgcccgcatctagtgatacacaaccgcgcctccaaagg 5181663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Original strand, 2170166 - 2170303
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  2170166 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaa 2170265  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  2170266 gacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccaca 2170303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 43270276 - 43270416
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||| | ||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  43270276 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccatagaccacaatgcaccaaaaattggacaa 43270375  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaacc 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  43270376 gacaaaaacaaatgattcacatcttcaacctgcccacaacc 43270416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 477
Target Start/End: Original strand, 13200004 - 13200155
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||   ||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||| |||| |||||| ||||    
T  13200004 agccaagcccgcaccataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacatatgagtcacatcttcaacatgcccacacccagtaacacaaaacc 13200103  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaa 477  Q
    | ||||||| ||||| ||| |  || | ||||||||| | ||||||||||||    
T  13200104 gagcctccataggtagaattctgcgctctgccaaattgtattttgtaggtaa 13200155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 477
Target Start/End: Original strand, 2529712 - 2529918
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |   |||| || |||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||  |  ||| ||   |||    
T  2529712 aataaattgcataaaatgatctgaaatagcaagagaatctactccttcgacaccaagccaagcccgcaccataggccacaatgtgccgaaaattgggcaa 2529811  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttg 470  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||| ||||||||| ||| ||| | ||| | | ||||||| | |||||    
T  2529812 gacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaaccgagcctccaaaagtagaattccacgatctaccaaattgtattttg 2529911  T
Q  471 taggtaa 477  Q
    |||||||    
T  2529912 taggtaa 2529918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 34137494 - 34137400
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgt 148  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  34137494 ggctcgaccaccaattatgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaatgaagatgattttactttgtctaacatttgt 34137400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 399
Target Start/End: Original strand, 37433958 - 37434086
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || |  ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  37433958 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatcgaccccttcgacacaaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaa 37434057  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  37434058 gacaaaaataaatgattcacatcttcaac 37434086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 34137225 - 34137071
Alignment:
Q  323 cctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacaca 422  Q
    ||||||||  ||| ||||| |||||| || |||| |||| ||   |||||||||||||| ||||| |||| || ||||  ||||||||||| | ||||||    
T  34137225 cctagccactccctcaccaatggccacaaggcaccaaaatttgggcaagacaaaaacaagtgattcacattttgaacgcacccacaaccagtagcacaca 34137126  T
Q  423 accgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaa 477  Q
    ||||| |||||| ||| |  || |  |||||||||||||| | ||| ||||||||    
T  34137125 accgcccctccacaggaatgataccgcggtttgccaaattttctttcgtaggtaa 34137071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12258008 - 12257892
Alignment:
Q  28 tcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgat 127  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||||||| | || || || ||||| || ||||||||||  |||  ||||    
T  12258008 tcagtcgatactcatacataagagcgggttcgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccacatgtaatatgat 12257909  T
Q  128 ttcactttatctaacat 144  Q
    || ||||||||||||||    
T  12257908 tttactttatctaacat 12257892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 12265400 - 12265284
Alignment:
Q  28 tcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgat 127  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| || | |||||||| | |||||||||||||||| | || || || ||||| || ||||||||||  |||  ||||    
T  12265400 tcagtcgatactcatacataagagcgggttcgaccaccagttatgagtaccaaaactagaaacaacgttactagctttcaaccaccacatgtaatatgat 12265301  T
Q  128 ttcactttatctaacat 144  Q
    || ||||||||||||||    
T  12265300 tttactttatctaacat 12265284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 399
Target Start/End: Original strand, 17699308 - 17699436
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||  || || ||||||| |||| ||  ||||    
T  17699308 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggtcacaatgcaccaaaaattggacaa 17699407  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17699408 gacaaaaataaatgattcacatcttcaac 17699436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 408
Target Start/End: Original strand, 20824177 - 20824259
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  20824177 agccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 20824259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29733465 - 29733403
Alignment:
Q  70 atgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcac 132  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || |||||||||||| || ||||||||||    
T  29733465 atgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacaaagaatttgatttcac 29733403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 382; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 34333384 - 34332899
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  34333384 attacaaccaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgttagcctttaaccaccac 34333285  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  34333284 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaaatactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 34333185  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  34333184 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatttgaagttgattgagagtcgacccc 34333085  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34333084 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaa 34332985  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||    
T  34332984 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaatcgatctctcagaagttgccaagc 34332899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 40931097 - 40930612
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||    
T  40931097 attacatccaaatcagtcaatacccaaacatgcaagcgggctcgaccaccactgttgagtaccgaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccac 40930998  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40930997 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacactgaaacacaaa 40930898  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||  |||||||| || |||||||| || | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  40930897 gcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcaccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatccgaagttgattgagagtcgacccc 40930798  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  40930797 taccactccaagccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgaacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcgacgttcccacaaccagaa 40930698  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40930697 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaaggccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatccctcaaaagtcgccaagc 40930612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 2363848 - 2364333
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2363848 attacaaacaaatcagtcaatacctagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 2363947  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2363948 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 2364047  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  2364048 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 2364147  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  2364148 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 2364247  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  2364248 acgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 2364333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 34 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19920780 - 19920313
Alignment:
Q  34 aatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcact 133  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19920780 aatacccagacataagagcgggctcgaccaccactgatgggtgccaaaactaaatacaacatttctagcttttaaccaccacaacgcagttgatttcact 19920681  T
Q  134 ttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtgga 233  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  19920680 ttatctaacaattgtggcactgtactttggctatttcgaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgagacacaaagcaaccaaatcaagtgga 19920581  T
Q  234 agaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgc 333  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||| |||  |    
T  19920580 agaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattgataaattgctcaaaatgatctgaagatgatcgagagtcgacacctaccacgcctaaccaatc 19920481  T
Q  334 ccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctcc 433  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  19920480 ccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgagaagcatcttcgacattcccacatccagaaacacataaccgctcctcc 19920381  T
Q  434 aaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    | || || |||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  19920380 acagatagaatgcctcgatttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 19920313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 7312347 - 7312832
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  7312347 attacaaacaagtcagtcaaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgacgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccacca 7312446  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  7312447 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaa 7312546  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  7312547 agcaaccaaatcaagtgcaagaaagatcgtcgccctctcgaacaacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 7312646  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  7312647 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcgg-cttaatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccaga 7312745  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| | |||| |||||| ||  | ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  7312746 aacacaaagccgctcctccacagacagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 7312832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 10324140 - 10323655
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||    
T  10324140 attacaaacaaatcactcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagccttgagccaccac 10324041  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| | || ||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||    
T  10324040 aacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaa 10323941  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  10323940 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatcagaagttgattgagagtcgacacc 10323841  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  10323840 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 10323741  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| | |||  || || ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  10323740 acgcataaccgctcatccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 10323655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 498
Target Start/End: Original strand, 7031927 - 7032371
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcag 153  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||   ||| || |||||||||||| ||| |||| | || ||||||| ||| || ||||     
T  7031927 ggctcgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacattacattatgagctttcaaccaccacaaagaagatgatataaccttatctagcatatgaggcaa 7032026  T
Q  154 agtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctc 253  Q
    ||  ||||||| ||| ||||||||| |  |||||   |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  7032027 agagctttgtcgattactaaaaatcttggcattccgctcattccacaacacagaaacacaaagtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgccgccctctc 7032126  T
Q  254 aaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatg 353  Q
     | || ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||   | |||||| |    
T  7032127 gagcaccctgcataattaataaattgcaacaaatcatcagaagtagattgagagtcgacccccaccactccgagccatgcccgcaccgcagaccataaag 7032226  T
Q  354 cactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtt 453  Q
    | || |||||    ||   ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||  ||    
T  7032227 cgctgaaagtcgggcacaccaagaacaaatgagtaacatcttcgacggccccgcaacctgagacacacgaccgcgcatccaaaggtaaaagaccacaatt 7032326  T
Q  454 tgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgcca 498  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  7032327 cgccagattgttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgcca 7032371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 15827282 - 15827394
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | || || || |||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  15827282 attacaaccaaatcagtcaatacccagacatgaaagcgggttcgatcatcaatgatgagtaccaaaactaaatacagcattgcaagcttttaaccaccac 15827381  T
Q  116 aaataagttgatt 128  Q
    ||| |||||||||    
T  15827382 aaagaagttgatt 15827394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 128
Target Start/End: Original strand, 10312953 - 10313061
Alignment:
Q  20 caaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |  || |||||||||||||||     
T  10312953 caaccaaatcagtcaatacccagacatgaaagcgggttcgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacaacgttacacgcttttaaccaccacaaag 10313052  T
Q  120 aagttgatt 128  Q
    |||||||||    
T  10313053 aagttgatt 10313061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 332 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 26771242 - 26771112
Alignment:
Q  332 gcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcct 431  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||    
T  26771242 gccctcaccaatggccataaggcactaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgcccacaaccagtgacacacaactgcacct 26771143  T
Q  432 ccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaatt 462  Q
    ||||||| |  || | |||||||||||||||    
T  26771142 ccaaaggaatgataccacggtttgccaaatt 26771112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Original strand, 926692 - 926772
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacatt 96  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  926692 attacatccaaatcagtcaatacccagacatgaaagcgggctcgaccaccaatgatgagtaccataactaaatacaacatt 926772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35214630 - 35214557
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  35214630 agccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaagaacaaatgattcacatcttcaac 35214557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36801389 - 36801234
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  36801389 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaa 36801290  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccg 426  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  36801289 gacaaaaataaatgatttacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccg 36801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 15312150 - 15312281
Alignment:
Q  13 aatattacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccac 112  Q
    ||||||||||   |||||||| |||| || |||||| ||  || | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  15312150 aatattacaaaacaatcagtcgatacccatacataagagtgggttcgaccaccaaagatgagtaccgaaactaaatacaacattactagctttcaaccac 15312249  T
Q  113 cacaaataagttgatttcactttatctaacat 144  Q
    |||||  ||  |||||| | ||||||||||||    
T  15312250 cacaaggaatatgattttagtttatctaacat 15312281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 7031331 - 7031194
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||   ||||    
T  7031331 aataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaa 7031232  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  7031231 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 7031194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 399
Target Start/End: Original strand, 33496428 - 33496501
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  33496428 agccaagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 33496501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 963689 - 963605
Alignment:
Q  59 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaaca 143  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  963689 gaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaaca 963605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 48570581 - 48570481
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||| || |||||  |||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    
T  48570581 acatacaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaaataaagaccacattattagctttcaaccaccacagggaatttgattttactttatctaac 48570482  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  48570481 a 48570481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 399
Target Start/End: Original strand, 11203700 - 11203773
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||| || |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  11203700 agccaagcccgcaccaaaggccacaatgaaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 11203773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30695898 - 30695785
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  ||||| || || |||||||||||   | |||||||    
T  30695898 agtcaatgcacatacatagaagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctggctttcaaccaccacaaggtatttgattt 30695799  T
Q  130 cactttatctaaca 143  Q
     |||||||||||||    
T  30695798 tactttatctaaca 30695785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17098209 - 17098149
Alignment:
Q  252 tcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgac 312  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |   ||||||||||||    
T  17098209 tcaaaccacctgcgtaatgaataaattgcaagaaatggtctgaaataacttgagattcgac 17098149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 24)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 19754834 - 19755323
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  19754834 attacaacgaaatcagtcaataccgagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccac 19754933  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19754934 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtaccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaa 19755032  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19755033 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccc 19755132  T
Q  316 --taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccag 413  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19755133 tataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccag 19755232  T
Q  414 aaacacacaaccgcgcctccaaagg---taaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19755233 aaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagc 19755323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 19784972 - 19784483
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  19784972 attacaacgaaatcagtcaataccgagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtacaaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccac 19784873  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  19784872 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtaccttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttc-ttccacaacaccgaaacacaaa 19784774  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19784773 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaacaatgatctgaagttgattgagattcgacccc 19784674  T
Q  316 --taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccag 413  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19784673 tataccactcctagccatgcccgcaccattgaccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgctcccacatccag 19784574  T
Q  414 aaacacacaaccgcgcctccaaagg---taaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19784573 aaacacacaaccgcgcctccaaaggtaataaaatgtcacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctctcaggagtcgccaagc 19784483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 485
Target Start/End: Original strand, 15739794 - 15740261
Alignment:
Q  18 tacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  15739794 tacaaccaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaa 15739893  T
Q  118 ataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15739894 agaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaagccgattattcatttcattccacaacaccgaaacacaaagc 15739993  T
Q  218 aatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactccta 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15739994 aaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgaccccta 15740093  T
Q  318 ccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaac 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  15740094 ccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcaccaaaagttagacaagacaaaaacaaatgattaacatctttaacattcccacacccagaaac 15740193  T
Q  418 acacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctc 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15740194 acacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggcttgtcaaattattttttgtaggtaaccgatctc 15740261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 47686464 - 47685979
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  47686464 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 47686365  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47686364 aaagaagttgatttcactttgtctagcatttgtggcaaagtacttagtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacactgaaacacaaa 47686265  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  47686264 gcaaccaaatcaagtgaaagaaagaccgtcaccctcttgaacaacctgcataattaataaattgcaccaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 47686165  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  47686164 taccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaacgagaaacatcttcgacattcccacatccagaa 47686065  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||| |||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  47686064 acacataaccgctcctccacagataaaatgccacggtttgccaaattatgttttgtaggtaaccgatctctcaaaagtcgccaagc 47685979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 7403483 - 7403969
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| || || |||| |||||||| | |||| || |||| |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  7403483 attacaaccaaatcagtcaatacccaaacatgaatgcgggctcgaccaccaattatgaatatcaaagctaaatacaacattgcgagtttttaaccaccac 7403582  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaa-catttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| || ||||||||||||||| |    
T  7403583 aaagaatatgatttcactttatctaggcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcttgtcattccgttcaatcgacaacaccgaaacacaa 7403682  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  7403683 agcaaccaaatcaagtggaaaaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccc 7403782  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  7403783 ctaccactccgagccatgcccacaccaatggccataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccaga 7403882  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  7403883 gacacacaaccgcgcctccaaacgtaaaatgccacggtttgccaaattcttttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 7403969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 23643160 - 23642675
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23643160 attacaaacaaatcagtcaatacctagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 23643061  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23643060 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacggtactttatctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 23642961  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23642960 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 23642861  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  23642860 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 23642761  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  23642760 acgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 23642675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 13271460 - 13270975
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  13271460 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagatggctcgaccaccactgatgagtgccaaaaataaatacaacattactagcctttaaccaccac 13271361  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||||| ||   |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  13271360 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgtgtcactttactttttctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 13271261  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  13271260 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 13271161  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  13271160 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaataaattagtaacatcttcgacaatcccacatccagta 13271061  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  13271060 actcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 13270975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 160260 - 159863
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  160260 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgtttgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 160161  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  160160 aacgaagttaatttcactttatctagtaattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcatttcattccacaacaccgaaacacaaa 160061  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  160060 acaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 159961  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccag 413  Q
    ||||||| ||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  159960 taccacttctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 159863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 47418376 - 47418860
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  47418376 attacaaacaaatcaatcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttagccaccac 47418475  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| | ||||||||||| | || ||| ||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||  |||| ||    
T  47418476 aacgaagttaacttcactttatcgagcaattgaggcactgtactttgactatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaccaccgtgacacaaa 47418575  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  47418576 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcatattgtataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 47418675  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    || |||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| || | |    
T  47418676 ta-cactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcctgca 47418774  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||  || || ||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  47418775 acgcataaccgctcctccccagatagaatgccacgagttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 47418860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20788849 - 20788501
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgct-agcatttaaccacca 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| || | |||||||| |  ||||||||||| ||||| || |||||  | ||| |||||||||||    
T  20788849 attacaaccaaattagtcaatacccaaacataacagcgggttcgaccaccaattctgagtaccaaagctaaacacaacatttatgagcttttaaccacca 20788750  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||| ||| |||| | || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  20788749 caaagaagatgatataaccttatctagcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcatgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaa 20788650  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    || || ||||||||||| || ||||| ||  ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20788649 agtaaccaaatcaagtgaaa-aaagatcgttgccctctcgaacaacctacataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgaccc 20788551  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagtt 364  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  20788550 cgaccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaggcgctaaaagtt 20788501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 298 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 1828827 - 1828640
Alignment:
Q  298 tgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttca 397  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1828827 tgattgagaatcgacccctaccactcctagccatgctcgcaccaatggtcataaagcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcaacatcttca 1828728  T
Q  398 acgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctc 485  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1828727 acattcccacacccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattagtttttgtaggtaacctatctc 1828640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 118
Target Start/End: Original strand, 8890594 - 8890696
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||    
T  8890594 attacaaccaaatcagtcaatacccagacatgaaagcaggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccac 8890693  T
Q  116 aaa 118  Q
    |||    
T  8890694 aaa 8890696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 17402227 - 17402070
Alignment:
Q  44 cataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaaca 143  Q
    ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||   || ||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17402227 cataaaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaagtgaactacaacattactagcctttaactaccacaaagaagatgattttactttatctaaca 17402128  T
Q  144 tttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaa 201  Q
    | ||||| | ||  |||| ||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||    
T  17402127 tatgtggtaaagagctttttctgtttctaaatagcctatcattccgttcattccacaa 17402070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 70 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 11587713 - 11587633
Alignment:
Q  70 atgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtgg 150  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11587713 atgagtaccaaagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 11587633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 128
Target Start/End: Original strand, 16427120 - 16427232
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||  | || |  || ||||| ||||||    
T  16427120 attacaaccaaatcagttaatacctagacatgaaagcgggttcgaccaccaatgatgagtaccaaaactaaatacatctttacatgcttttaatcaccac 16427219  T
Q  116 aaataagttgatt 128  Q
    ||| |||||||||    
T  16427220 aaagaagttgatt 16427232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 43019511 - 43019603
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcattta 107  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  43019511 attacaaacaaatcagtcaaatacccagacataaaagcggactcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaatattactagccttta 43019603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Original strand, 12697398 - 12697767
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||||   | |||||||    
T  12697398 agtcaatgcccatacatagaagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattt 12697497  T
Q  130 cactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaag 229  Q
     ||||||||||||| | |||| | || |||||| | |||   ||| | | ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||   | || ||||||||     
T  12697498 tactttatctaacaatagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaa 12697597  T
Q  230 tggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagcc 329  Q
    || || || ||  | |||  | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||| ||||| ||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  12697598 tgaaataatgattgacgcgatttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatcggagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagcc 12697697  T
Q  330 atgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12697698 aagcccgcaccaaaggccataatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 12697767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 252 - 426
Target Start/End: Original strand, 8360907 - 8361081
Alignment:
Q  252 tcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataa 351  Q
    |||||| |||||| || | ||||||||| | ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  8360907 tcaaaccacctgcatattcaataaattgaacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaa 8361006  T
Q  352 tgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccg 426  Q
    ||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  8361007 tgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccg 8361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 4548774 - 4548405
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  ||||| || || |||||||||||   | |||||||    
T  4548774 agtcaatgcccatacatagaagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctggctttcaaccaccacaagatatttgattt 4548675  T
Q  130 cactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaag 229  Q
     ||||||||||||| | |||| | || |||||| | |||   ||| | | ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||   | || ||||||||     
T  4548674 tactttatctaacaatagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaa 4548575  T
Q  230 tggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagcc 329  Q
    || || || || || |||  | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  4548574 tgaaataatgatcgacgcgatttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaaatgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagcc 4548475  T
Q  330 atgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    | |||| |||||  ||||| ||||||| |||| ||   ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  4548474 aagcccacaccagaggccacaatgcaccaaaaattgggcaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 4548405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Original strand, 20002599 - 20002707
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||  |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||    
T  20002599 agccatgcccgcaccataggccacaatgcaccgaaaaatggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaacc 20002698  T
Q  426 gcgcctcca 434  Q
    | |||||||    
T  20002699 gagcctcca 20002707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23163162 - 23163068
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtg 149  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  23163162 ggctcgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtct-acatttgtg 23163068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 70 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2822552 - 2822479
Alignment:
Q  70 atgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaaca 143  Q
    ||||||||||||| |||| |  ||||| ||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  2822552 atgagtaccaaaagtaaagaacacattactagctttcaaccaccacagagaatttgatttcactttatctaaca 2822479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19740565 - 19740424
Alignment:
Q  60 accaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtact 159  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || | |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||| || |  ||||  ||    
T  19740565 accaccaattatgagtaccaaaagtaaaaacaacattactagctttcagccaccacaaggaatatgattttactttatctaacatatgcgatagagagct 19740466  T
Q  160 ttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaa 201  Q
    |||| ||||||| ||||   ||||||||   |||||||||||    
T  19740465 ttgtttatttctgaaaactctatcattccgctcattccacaa 19740424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 48311688 - 48311788
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || | ||| |||| |  | ||||||| ||||||||||||    
T  48311688 acatacaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaagtaaagaccacattactagctttcagccatcacagagtatttgattttactttatctaac 48311787  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  48311788 a 48311788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 28)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 23237954 - 23238440
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  23237954 attacaaccaaatcagtcaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattgctagcctttaaccaccac 23238053  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23238054 aaagaagttgatttcacattatctagcatctgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccaaaacacaaa 23238153  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgact-c 314  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |    
T  23238154 gcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatcagacgttgaatgagaatcgactcc 23238253  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23238254 ccaccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccaga 23238353  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  23238354 aacacacaaccgcgcctccaaagctaaaatgccacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagc 23238440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 8227597 - 8228082
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8227597 attacaaccaaatcagtcaataaccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 8227696  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||    
T  8227697 aaagaggttgatttcacattatcaagcatttatggcaacgtactttgtttatttctaaaaatcatatcattcctttcattccacatcacccaaacacaaa 8227796  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  8227797 gcaaccaaattaagtggaagaaagaccgacgccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaggttgaatgagaatcgactcc 8227896  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8227897 caccactcctagccatgctcgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttctcacatccagaa 8227996  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  8227997 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgtcacggtttgccaaattacttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagc 8228082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 26 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 35984349 - 35983875
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  35984349 aatcagtcaatacccaaacaagaaagtgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttg 35984250  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  35984249 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaa-tcctatcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaagcagccaaat 35984151  T
Q  226 caagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcct 325  Q
    ||| || |||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  35984150 caaatgaaagaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcataaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccctaccactcca 35984051  T
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  35984050 agtcatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgattgacaacttctacattcccacaaccaaaaacacacaacc 35983951  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  35983950 gcgcctccaaaggtaaaatgtcatggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgattcctcagaagtcgccaagc 35983875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 28536234 - 28535759
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||| | ||||    
T  28536234 aatcagtcaatacccaaacaagaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaaaacaacattacaagcctttaaccaccacaaagacgttg 28536135  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||    
T  28536134 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaacttcgtctatttctaaaaatcctatcatttcgttcattccacaacaccgaaacaacaagtagccaaat 28536035  T
Q  226 caagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcct 325  Q
    ||| || ||||| || || |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||     
T  28536034 caaatgaaagaaggaacgtcgccctctcgaacaaccagcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccctaccactcca 28535935  T
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| |     
T  28535934 agccatgcccgcaccattggccataaggcactaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgatcgacatcttctacattcccacaaccagaaacacacatct 28535835  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  28535834 gcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 28535759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27117730 - 27117245
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  27117730 attacaatcaaatcagtcaacacccaaacataaaagcaggctcgaccaccactgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 27117631  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27117630 aaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaaagtactctgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 27117531  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27117530 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccgacataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 27117431  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  27117430 taccactcctaaccaatcccacaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacagccagaa 27117331  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||  || ||||| |||||||||||    
T  27117330 acacataaccgctcctccatagatagaatgccacggtttaccaaattaagttttgtgggtaaccggtccctcagaagtcgccaagc 27117245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 12824769 - 12825255
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  12824769 attacaaacaaatcagtcaaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccacca 12824868  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  12824869 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggtacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccggaacacaa 12824968  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  12824969 agcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 12825068  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  12825069 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccaga 12825168  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12825169 aacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 12825255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 30732884 - 30732398
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  30732884 attacaaacaaatcagtcaaatacccagacataaaagcaggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccacca 30732785  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  30732784 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaa 30732685  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  30732684 agcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 30732585  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  30732584 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggctataatgcaccaaaagttgtacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccaga 30732485  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  30732484 aacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 30732398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 42513291 - 42513776
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  42513291 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 42513390  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  42513391 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 42513490  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42513491 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 42513590  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  42513591 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaaaaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 42513690  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  42513691 acgcataaccgctcctccacagatagaatgtcacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 42513776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 16 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 12820519 - 12820035
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaat-acacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||    
T  12820519 attacaaacaaatcagtcaaacacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattaccagcctttaaccacca 12820420  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  12820419 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaa 12820320  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  12820319 agcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 12820220  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| ||  ||||||| |||||    
T  12820219 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagagacatcttcgacaatcccacatccaga 12820120  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaa 499  Q
    |||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  12820119 aacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcataagtcgccaa 12820035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 16 - 499
Target Start/End: Original strand, 42927702 - 42928185
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||  |||| |||||||| | ||||||| |||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  42927702 attacaaccaaatcagtcaatccccaaacataaaagtgggctcgaccaccaattatgagtatcaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccac 42927801  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||  | ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  42927802 aaagaagatgatttaactttatctagcatttgtggcaaagagctttgtcaatttctaagaatattgtcattccgttcattccacaaaaccgaaacacaaa 42927901  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  42927902 gcaaccaaatcaagtggaaaaatgaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 42928001  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||     
T  42928002 taccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacatgacaagaacaaatgattgacatcttcaacgttcccgcatccagag 42928101  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaa 499  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| || ||||||    
T  42928102 acacacaaccgcacctccaagggtaaaatgccacagtttgtcaaattattttttgtagttaaccgatccctcagaagccgccaa 42928185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 16 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19255692 - 19255218
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| |||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||   ||  ||||||||||||    
T  19255692 attacaaccaagtcagtcaatgcccaaacatgaaagcgggctcgaccaccaaatatgagtaccaaaactaaatacaacattatgaggttttaaccaccac 19255593  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  19255592 aaagaagatgatttgactttatctaacatatgtggcaaagagctttttctatttctaaaaatattgtcattccgttcattccacaacaccgaaacacaaa 19255493  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||| || || || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  19255492 gcaaccaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtttgagaatcgacccc 19255393  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||      
T  19255392 taccactccgagccatgcccgcaccaatgtccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgcccgcatccagtg 19255293  T
Q  416 acacacaaccgcgc-ctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcag 489  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19255292 acacacaaccgcgcgctccaagggaataatgccacaatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcag 19255218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 413
Target Start/End: Original strand, 3418354 - 3418751
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3418354 attacaaacaaatcagtcaatacctagacttaaaagagggctcgatcaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 3418453  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3418454 aacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaa 3418553  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3418554 gcaaccaaatcaaatggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 3418653  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccag 413  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||||    
T  3418654 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccag 3418751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 25824582 - 25824915
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  25824582 attacatccaaatcagtcaataaccagacatgaaagcgggctcgaccaccaccgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccac 25824681  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  25824682 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgaggcaaagaacattgtctatttctaaaaatcctatcattctgttcattccacaacaccgaaacacaaa 25824781  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||  |||||||| || |||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25824782 gcagccaaatcaaatgaaagaaagaacgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 25824881  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccat 349  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25824882 taccactccaagccatgcccgcaccattggccat 25824915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 200
Target Start/End: Original strand, 31641338 - 31641512
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||  ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  ||||||    
T  31641338 aatcagtcaatacccaaacaagaaagcgggctcgaccaccactggtgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaacgaagttg 31641437  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccaca 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  31641438 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcctatcattccgttcattccaca 31641512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 70 - 293
Target Start/End: Original strand, 32228429 - 32228652
Alignment:
Q  70 atgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctattt 169  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || || ||||  |||||| |||||    
T  32228429 atgagtaccaaaactaaaaacaacattactagctttcaaccaccacaaaaaatatgattttactttatctaacatatgcggtagagagctttgtttattt 32228528  T
Q  170 ctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaat 269  Q
    || ||||   ||||||||   ||| ||||||| | | ||||||  || |  ||||| |  ||||| || || || |||  ||||||||||||||| ||||    
T  32228529 ctgaaaactttatcattccgctcagtccacaaaatccaaacacacaggagccaaattagatggaaaaaggaacgtcgcgctctcaaacaacctgcataat 32228628  T
Q  270 taataaattgcaaaaaatgatctg 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  32228629 taataaattgcaagaaatgatctg 32228652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18359601 - 18359277
Alignment:
Q  74 gtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaa 173  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||| | |||| | || |||||| |  || | ||    
T  18359601 gtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaagtatgtgattttactttatctaacaatagtggtatagaactttgacggttccgaa 18359502  T
Q  174 aaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaat 273  Q
    | | | | ||||||  ||||||||| || ||| ||||||   | |  |||||||| || |||||||| || ||   | |||| | ||||||||| |||||    
T  18359501 ataacctgtcattccgttcattccataaaacccaaacacactgaagccaaatcaaatgaaagaaagatcgacgagatttcaagccacctgcgtatttaat 18359402  T
Q  274 aaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagac 373  Q
    |||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||  ||| |   |||||||    
T  18359401 aaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctac-ccttcgacaccaagccatgcccgccccataggccacaatgcaccgaaaatcggacaagac 18359303  T
Q  374 aaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||    
T  18359302 aaaaacatatgattcacatcttcaac 18359277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 25857738 - 25857601
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| |||||| | ||||    
T  25857738 aataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcaaacaa 25857639  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  25857638 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 25857601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Original strand, 26072474 - 26072594
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||| || | |||||||| | ||||||| | |||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||  ||   |    
T  26072474 aatcagtcaatacccatacataagagcgggttcgaccaccaattatgagtatcgaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaggaataag 26072573  T
Q  126 atttcactttatctaacattt 146  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  26072574 attttactttatctaacattt 26072594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 33385693 - 33385533
Alignment:
Q  266 taattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagtta 365  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || |||| | | || || ||||| |||| |||||  ||||| ||||||| |||| ||     
T  33385693 taatcaataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctactcattcgacaccaagccaagcccacaccaaaggccacaatgcaccaaaaattg 33385594  T
Q  366 cacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccg 426  Q
     |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  33385593 gacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccacatcccgatacacaaaaccg 33385533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 448 - 494
Target Start/End: Original strand, 31641515 - 31641561
Alignment:
Q  448 acggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtc 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  31641515 acggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagtagtc 31641561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 12032517 - 12032460
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatga 73  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  12032517 attacaaacaaatcaatcaatacccagacataaaagtgggctcgaccaccactgatga 12032460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 462
Target Start/End: Original strand, 27795405 - 27795500
Alignment:
Q  367 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaatt 462  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||| || |  ||||| | ||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  27795405 acaagacaaaaacaaatgagacacatcttcaacatgcccacagcccgtgacacatagcctagcctccaacggtaaaatgccacgatttgccaaatt 27795500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Original strand, 10776663 - 10776745
Alignment:
Q  344 ggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccg 426  Q
    ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| || || ||||| |||||    
T  10776663 ggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaacttgcccacatcccgatacacaaaaccg 10776745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 150
Target Start/End: Original strand, 29142427 - 29142505
Alignment:
Q  72 gagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtgg 150  Q
    |||||||| | ||||| || |||||  |||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29142427 gagtaccagagctaaaaacaacattattagcttttaaccaccacaaagatgatgattttactttgtctaacatttgtgg 29142505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8300496 - 8300359
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||| ||  ||||| || |||| ||||||   ||||    
T  8300496 aataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcatcagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaa 8300397  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  8300396 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 8300359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17106722 - 17106673
Alignment:
Q  125 gatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaa 174  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  17106722 gatttaactttatctaacagttgtggtagagaactttgtttatttctaaa 17106673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 27166459 - 27166387
Alignment:
Q  78 caaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtgg 150  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  27166459 caaaactaaagataacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaacatatgtgg 27166387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 143
Target Start/End: Original strand, 33169288 - 33169356
Alignment:
Q  75 taccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaaca 143  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  33169288 taccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaaca 33169356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 24767993 - 24767508
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| | || |||||||| | |||| |||| |||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||    
T  24767993 attacaaccaaatcagtcaatacccaaacatgagagcggactcgaccaccaattatgaatacccaaactaaatacagcattacaagcttttaaccaccac 24767894  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24767893 aaagaagatgatttcactttatctagcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaattatgtcattacgttcattccacaacaccgaaacacaaa 24767794  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| |||||||||||||| |||||  | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24767793 gcaaccaaatcaagtggaaaaaagaatgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 24767694  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24767693 taccactccgagccatgcccgcaccaatggtcataaggcactaaaagttggacaagacaaaaacaaattattaacatcttcaacgttcccgcaaccaaaa 24767594  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  24767593 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctaagaagtcgtcaagc 24767508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 18 - 416
Target Start/End: Original strand, 21167798 - 21168196
Alignment:
Q  18 tacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  21167798 tacaaccaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaa 21167897  T
Q  118 ataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagc 217  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21167898 agaagttggtttcactttatctagcatttgtggcaaagtactttgtctattcctaaaaatcctatcattcttttcattctacaacaccgaaacacaaagc 21167997  T
Q  218 aatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactccta 317  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  21167998 aaccaaatcaagtggaagaaagaccgtctccctctcgaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgaccccca 21168097  T
Q  318 ccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaa 416  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21168098 ccactcctagccatgctcgcatcaatggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacatatgattaacatcttcaacattcccacacccagaaa 21168196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 12733696 - 12734181
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12733696 attacaatcaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccgctgttgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 12733795  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12733796 aaagaagttgatttcactttatctagcaattgtggcaacgtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 12733895  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12733896 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 12733995  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||||    
T  12733996 taccactcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacattcccacatctagaa 12734095  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  12734096 acacataaccgctcctccagagatagaatgccacgggttaccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 12734181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 18651803 - 18651318
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| || | |||||||| |  ||||||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||||||    
T  18651803 attacaaccaaattagtcaatacccaaacataacagcgggttcgaccaccaattctgagtaccaaaactaaacacaacattatgagcttttaaccaccac 18651704  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||| |||| | || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18651703 aaagaagatgatataaccttatctagcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaattttgtcattccgttcattccacaacactgaaacacaaa 18651604  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    | || ||||||||||| || ||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18651603 gtaaccaaatcaagtgaaaaaaagatcgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaacaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 18651504  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaa-aacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||||||  || | ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  18651503 gaccactcctagccatgctcgcaccaatggcaataaggcgctaaaagttggac-acacaaagaacaagtgattgacatcttcaacggtcccgcatccaga 18651405  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  18651404 gacacacaaccgcgcatccaaaggtaaaatcccacggttttccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 18651318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 5734800 - 5734439
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    ||||||||||| | || |||  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5734800 aatcagtcaatgcccaaacaagaaagcggactcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattacaagcctttaaccaccacaaagaagttg 5734701  T
Q  126 atttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaat 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||    
T  5734700 atttcactttatctagcatttgtggcaaagaactttgtctatttctaaaaatcttatcattccgttcattccacaccaccgaaacaacaagtaaccaaat 5734601  T
Q  226 caagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcct 325  Q
    ||| || ||||| || ||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||     
T  5734600 caaatgaaagaaggaacgttgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcacaaaatgatctgaagttgattgagagtcaacccttaccactcca 5734501  T
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 387  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734500 agccatgctcgcaccaatgatcataaagcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgatt 5734439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 294 - 501
Target Start/End: Original strand, 2553486 - 2553693
Alignment:
Q  294 aagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatc 393  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2553486 aagttgattgagaatcgacccctatcactcctagccatgcccgcaccattggtcataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatc 2553585  T
Q  394 ttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagt 493  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||    
T  2553586 ttcaacgttcccacatccagaaacacacaactgcgcctccaaaggtaaaatgccacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccgatctttcaaaagt 2553685  T
Q  494 cgccaagc 501  Q
    ||||||||    
T  2553686 cgccaagc 2553693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18789448 - 18789255
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  18789448 attacaaccaaattagtcaatacctggacataaaagcgggcttgaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccac 18789349  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaa 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18789348 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaattagtttttctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacaccgaaa 18789255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 14373522 - 14373114
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcag 153  Q
    |||| |||||||| | |||| ||||| | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||  |     
T  14373522 ggctcgaccaccaattatgaataccatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgataa 14373423  T
Q  154 agtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctc 253  Q
    || ||| ||  | ||||||||||  |||||||||   |||||||| || ||| ||| ||   | |  |||||||| |||||||| || || ||   | ||    
T  14373422 agaactctgcatgtttctaaaaactatatcattccgctcattccataaaacccaaaaacactgaagccaaatcaaatggaagaatgatcgacgtgatttc 14373323  T
Q  254 aaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatg 353  Q
    |||| ||| || || | ||||||||||||||||||||  |   | || ||||| || || ||||| || || ||||   |||||||||  | |||||| |    
T  14373322 aaactaccagcatactgaataaattgcaaaaaatgattcgtcatagactgagaatcaacgcctacaacccccagccgctcccgcaccaaagaccataagg 14373223  T
Q  354 cactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtt 453  Q
    ||| ||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||  | ||||| ||||||    
T  14373222 caccaaaaaatggacaagacaaaaacaaatgatttacatcttcatcatgcccataaccggaaacacacaaccgcccctccatagaaataatgccacggtt 14373123  T
Q  454 tgccaaatt 462  Q
    |||||||||    
T  14373122 tgccaaatt 14373114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15959356 - 15959212
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    |||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  15959356 acataaaagtgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaaaacaacattactaacttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaac 15959257  T
Q  143 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattc 187  Q
    |||||||| | || ||| ||  | |||||||||||  ||||||||    
T  15959256 atttgtggtaaagaactctgcttgtttctaaaaattctatcattc 15959212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Original strand, 32536478 - 32536737
Alignment:
Q  28 tcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgat 127  Q
    ||||||||| | || |||||||||   ||| |||||||| | || ||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32536478 tcagtcaatgctcatacataaaagtgagctcgaccaccaattattagtaccaaaactaaaaacaacattaatagcttttaaccaccaaaaagaagatgat 32536577  T
Q  128 ttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatca 227  Q
    || ||||| |||||||||||||| | ||  || || || |||||||||||  ||||||||   |||||| | |  ||| ||||||   | | ||||||||    
T  32536578 tttactttgtctaacatttgtggtaaagagctgtgcctgtttctaaaaattctatcattccgatcattcgataggacccaaacacactgaagtcaaatca 32536677  T
Q  228 agtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaat 287  Q
    | || || ||||| |   ||  | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32536678 aatgaaaaaaagatctttgcaattttaaacaacctgcgtaatgaataaattgcaaaaaat 32536737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 17606889 - 17606520
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||||   | |||||||    
T  17606889 agtcaatgctcatacatagaagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattt 17606790  T
Q  130 cactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaag 229  Q
     ||||||||||||| | |||| | || |||||| | |||   ||| | | ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||   | || ||||||||     
T  17606789 tactttatctaacaatagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattctgttctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaa 17606690  T
Q  230 tggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagcc 329  Q
    || || || || || |||  | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  17606689 tgaaataatgatcgacgcgatttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagcc 17606590  T
Q  330 atgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    | ||||||||||  | ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  17606589 aagcccgcaccaaagaccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 17606520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 21630423 - 21630295
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| |||| ||  ||||    
T  21630423 aataaattgcacacaatgatctgaaatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccaaaggccacaaagcaccaaaaattggacaa 21630324  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  21630323 gacaaaaataaatgattcacatcttcaac 21630295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Original strand, 11462013 - 11462087
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaa 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  11462013 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaa 11462087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 30 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 10929859 - 10929746
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  |||||||| || |||||||||||   | |||||||    
T  10929859 agtcaatgcccatacatagaagcaggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctagctttcaaccaccacaaggtatttgattt 10929760  T
Q  130 cactttatctaaca 143  Q
     |||||||||||||    
T  10929759 tactttatctaaca 10929746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17573969 - 17573832
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||   ||||    
T  17573969 aataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaa 17573870  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  17573869 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 17573832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17579395 - 17579258
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||   ||||    
T  17579395 aataaattgcacaaagtgatctgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaggcaccaaaagtcggacaa 17579296  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  17579295 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 17579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 143
Target Start/End: Original strand, 13937314 - 13937398
Alignment:
Q  59 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaaca 143  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||  ||  |||||| |||||||||||||    
T  13937314 gaccaccaattatgaataccaaaactaaaaactacattactagctttcatccaccacaaggaacatgattttactttatctaaca 13937398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20883292 - 20883184
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||| || |  ||||| ||||    
T  20883292 agccatgtccgcaccataggccacaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcatatcttcaacatgcccacatcccgtgacacaaaacc 20883193  T
Q  426 gcgcctcca 434  Q
    | |||||||    
T  20883192 gagcctcca 20883184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 408
Target Start/End: Original strand, 11462294 - 11462375
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  11462294 agccatgcccgcaccataggc-acaatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccaca 11462375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11774 - 11289
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  11774 attacaatcaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgacaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 11675  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||    
T  11674 aaagaagttgatttcactttatctagaaattgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcttttcattccacagcatcgaaacacaaa 11575  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11574 gcagtcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccctctcgaacaaccggcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgattgagagtcgacccc 11475  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  11474 taccactcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgctccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgaaaaacattttcgacattcccacatccagaa 11375  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||| |||||| |||||| || || ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || || |||||||||||    
T  11374 acacataaccgctcctccacagatagaatgccacggtttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctgagaagtcgccaagc 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 11909675 - 11909189
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11909675 attacaaacaaatcagtcaaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccacca 11909576  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11909575 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaa 11909476  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  11909475 agcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcaccctctcaaacaacctgcataataaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 11909376  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  11909375 ctaccacgcctaaccaatcctgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccaga 11909276  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| | |||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  11909275 aacacatagccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 11909189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 51052050 - 51052536
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  51052050 attacaaacaaatcagttaaatacccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagtctttaaccacca 51052149  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  51052150 caacgaagttgatttcactttatctagcaattgtggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaa 51052249  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  51052250 agcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 51052349  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  51052350 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacatcttcgacaatcccacatccaga 51052449  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  51052450 aacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 51052536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 380
Target Start/End: Original strand, 4841970 - 4842339
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  4841970 attacaaccaaatcagtcaatatccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgatgaataccaaaactaaatacaggattgctagcctttaaccaccac 4842069  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggca-----gagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaac 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4842070 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtcgcaaggaggagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaac 4842169  T
Q  211 acgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcg 310  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4842170 acaaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaatgaataaattgctgacaatgatctgaagttgattgagattcg 4842269  T
Q  311 actcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaaca 380  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4842270 acccctaccactcctagccatgcccgcaccataggccataatgcattaaaagttacacaagacaaaaaca 4842339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 386
Target Start/End: Original strand, 6259390 - 6259758
Alignment:
Q  18 tacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6259390 tacaaccatatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccagtgttgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttagccaccacaa 6259489  T
Q  118 ataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagc 217  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6259490 agaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagtactttgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaagc 6259589  T
Q  218 aatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactccta 317  Q
    || |||||||| ||||| |||||||| | || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6259590 aaccaaatcaaatggaaaaaagaccgtctccctctcgaacaacctacgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagaatcgaccccta 6259689  T
Q  318 ccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 386  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6259690 ccactcctagccatgctcgcaccaatggccataaagcaccaaaagttacacaagacaaaaacaaatgat 6259758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 35540620 - 35541105
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  35540620 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgtgtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 35540719  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35540720 aacgaagttaatttcactttatctagtaattgaggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacagcaccgaaacacaaa 35540819  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  35540820 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 35540919  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  35540920 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 35541019  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || || ||  |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  35541020 acgcataatcgttcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattatgttttgtgggtaaccgatccctcagtagtcgccaagc 35541105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 501
Target Start/End: Original strand, 6050170 - 6050659
Alignment:
Q  13 aatattacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccac 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  6050170 aatattacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccac 6050269  T
Q  113 cacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacac 212  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||  | ||  |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6050270 cacaacgaagttaatttcactttatctagaaatttaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacac 6050369  T
Q  213 gaagcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatct-gaagttgattgagattcga 311  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  6050370 aaagcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatcttgaagttgattgagagtcga 6050469  T
Q  312 ctcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaacc 411  Q
    | ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| ||    
T  6050470 cacctaccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatcc 6050569  T
Q  412 agaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || ||| || |||||| |||||| || || ||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  6050570 agcaacgcagaaccgctcctccacagatagaatgccacaatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 6050659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 16 - 306
Target Start/End: Original strand, 26059462 - 26059752
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26059462 attacaactaaatcagtcaatagccagacataaaagcgggctcgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 26059561  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  26059562 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaagtacattgtctatttctaaaaatcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 26059661  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgaga 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26059662 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcaccctctcgaacaacctgcataattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgaga 26059752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12813773 - 12813519
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12813773 attacaaccaaatcagtcaatacccaaacataaaagcgggctcgaccaccactgatgaatactaaaactaaatacaacattgctagcctttaaccaccac 12813674  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12813673 aaagaagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaattcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 12813574  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaatt 270  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12813573 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccttctcaaacaacctgcgtaatt 12813519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Original strand, 13351885 - 13352173
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  13351885 attacaaccaagtcagtcaatgcccaaacatgaaagcgggctcaaccaccaattatgagtaccaaagctaaatacaacattacgagcttttaaccaccac 13351984  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||  | |||| ||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||| || ||||||| ||    
T  13351985 aaagaaaattatttaactttgtctagcatttgtggcaaagagctttgtctatttctaaaaatcctatcattccatacactccacaaaactgaaacacaaa 13352084  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattga 304  Q
    |||| ||||| ||||| || || || || |||  |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13352085 gcaaccaaataaagtgaaaaaatgaacgtcgctctctcgaacaacctgcataattaataaattacaaaaaatgatctgaagttgattga 13352173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 24547635 - 24547518
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||| ||    
T  24547635 attacaatcaaatcagtcaatacccagacatgaaagcaggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaatacagcattacaagcttttaaccactac 24547536  T
Q  116 aaataagttgatttcact 133  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24547535 aaagaagttgatttcact 24547518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47623596 - 47623500
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtgg 150  Q
    |||| |||||||| | ||||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47623596 ggctcgaccaccaattatgagtatcatagctaaaaacaacattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 47623500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 37191469 - 37191387
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  37191469 agccattcccgcaccataggccataatgcaccgaaaattggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccaca 37191387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 399
Target Start/End: Original strand, 43387952 - 43388321
Alignment:
Q  30 agtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgattt 129  Q
    ||||||| | || ||||| |||| |||| ||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||  |||||| | || |||||||||||   | |||||||    
T  43387952 agtcaatgcccatacatagaagcgggctcgaccaccaactatgtgtaccaaaaataaagactatgttgctaactttcaaccaccacaaggtatttgattt 43388051  T
Q  130 cactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaag 229  Q
     ||||||||||||| | |||| | || |||||| | |||   ||| | | ||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||   | || ||||||||     
T  43388052 tactttatctaacaatagtggtatagaactttgacgattctgaaataacctatcattccattctttccataaaaccgagacacattgaaaccaaatcaaa 43388151  T
Q  230 tggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagcc 329  Q
    || || || || || |||  | |||||| |||||| || | ||||||||||| ||| |||| |||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||    
T  43388152 tgaaataatgatcgacgcgatttcaaaccacctgcatattcaataaattgcacaaagtgatatgagatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagcc 43388251  T
Q  330 atgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaac 399  Q
    | ||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43388252 aagcccgcaccaaaggccacaatgcaccaaaaattggacaagacaaaaataaatgattcacatcttcaac 43388321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 368 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 47623292 - 47623200
Alignment:
Q  368 caagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaatt 462  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  47623292 caagacagaaacaagtgattcacatcttcatcatgcccacaaccagaaa--cacaaccgcccctccataggaataatgtcacggtttgccaaatt 47623200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 37298041 - 37297967
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaa 117  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  37298041 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgtgtaccaaaattaaagactacattactagctttcaaccaccacaa 37297967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16918123 - 16917986
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  | |  ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||||||||  ||||| || |||| ||||||   ||||    
T  16918123 aataaattgcacaaagtgatctgacatagtatgagaatcgaccccttcgacaccaagccaagcccgcaccagaggccacaaagcaccaaaagtcggacaa 16918024  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  16918023 gacaaaaataaatgattcacatcttcaacctgcccaca 16917986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23635056 - 23635013
Alignment:
Q  252 tcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaa 295  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23635056 tcaaactacctgcataattaataaattgcaagaaatgatctgaa 23635013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 6478133 - 6478218
Alignment:
Q  59 gaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacat 144  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||  |||| |||| |||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||    
T  6478133 gaccaccaattatgagtatcaaaactaaaaacaacattattagcttttagccaccacaaggaatatgattttactttatctaacat 6478218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23713739 - 23713699
Alignment:
Q  252 tcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatct 292  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23713739 tcaaactacctgcataattaataaattgcaagaaatgatct 23713699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37192469 - 37192369
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    |||||||||| |||| |||||||||   || ||||||| | |||| |||||||| ||||| || |||||||||||   |  |||||| ||||||||||||    
T  37192469 acataaaagcgggctcgaccaccacatgtgtgtaccaacattaaagactacattactagctttcaaccaccacaaggtatgtgattttactttatctaac 37192370  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  37192369 a 37192369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 106412 - 105927
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  106412 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagagggctcgaccaccactgatgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccaccac 106313  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  106312 aacgaagttaatttcactttatctagcaattgaggcacaatactttgtctatttctaaaaagcctatcattcctttcattccacaacaccgaaacacaaa 106213  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcc 315  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  106212 gcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataatgaataaattgcacaaagtgatctgaagttgattgagagtcgacacc 106113  T
Q  316 taccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaa 415  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| |    
T  106112 taccactcctaaccaatgccgcaccatcggccataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagtaacatcttcgacaatcccacatccagca 106013  T
Q  416 acacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    || || |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  106012 acgcataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcattagtcgccaagc 105927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 4551747 - 4552225
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaa-tacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccacca 114  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||        ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  4551747 attacaaacaaatcagtcaaatacccagacataaaagcgggctcgacc--------tgagtgccaaaactaaatacaacattactagcctttaaccacca 4551838  T
Q  115 caaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacga 214  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  4551839 caacgaagttgatttcactttatctagtaattgtggcacagtactttgtctatttctaaaaagcctatcatttctttcattccacaacaccgaaacacaa 4551938  T
Q  215 agcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactc 314  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  4551939 agcaaccaaatcaagtggaagaaagaccgtcgccctctcgaacaacctgcataattaataaattgctcaaaatgatctgaagttgatcgagagtcgacac 4552038  T
Q  315 ctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccaga 414  Q
    ||||||| |||| |||  |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  4552039 ctaccacgcctaaccaatcccgcaccatcggtcataatgcaccaaaagttgcacaagacaaaaacaaatgagaaacattttcgacaatcccacatccaga 4552138  T
Q  415 aacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    |||||| |||||| |||||| || || ||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  4552139 aacacataaccgctcctccacagatagaatgccacgatttgccaaattaagttttgtaggtaaccgatccctcagaagtcgccaagc 4552225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 501
Target Start/End: Original strand, 41206577 - 41207072
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||  || | ||||| ||   |||||||||||| |||||||| ||||| | ||  |||||||||||     
T  41206577 attacagccaagtcagtcaatgcacaaacatgaaagggggttcgaccatcaaatatgagtaccaaagctaaatacaacattacgagattttaaccaccat 41206676  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaa 215  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| |||||||||| ||    
T  41206677 aaagaagatgatttgactttatctaacatgtgtggtaaagagctttgtctatttctaaaaatcatttcatttcgttcattcctcaaaaccgaaacacaaa 41206776  T
Q  216 gcaatcaaatcaagtggaagaaagaccgccgc---ct-------tctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgag 305  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |||   ||       |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41206777 gcaatcaaatcaagtggaaaaatgatcgtcgcaatctcgaacaatctcgaacaacttgcgtagttaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgtctgag 41206876  T
Q  306 attcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttccc 405  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  41206877 agtcaacccctaccactccgagccatgcccgcatcaatggccataaggcaccaaaagttggacaagacaagaacaaatgattgacatcttcaacgtgccc 41206976  T
Q  406 acaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
     || ||||  |||||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||    
T  41206977 gcatccagtgacacacaaccgcgcctccaagggaataatgccacgatttgccaaattattttttgtaggtaaccgatccctcagaagccgccaagc 41207072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 43 - 501
Target Start/End: Original strand, 15917251 - 15917710
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    |||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  15917251 acataaaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaactaaagacaacattactagctttcaaccaccacaaagaatatgattttactttatctaac 15917350  T
Q  143 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagacc 242  Q
    || ||||| | ||  ||||||||||| ||||| |   | ||||||  |||||||||||| ||| ||||||   | | ||||| ||||||||| ||||| |    
T  15917351 atatgtggtatagagctttgtctattcctaaatagtctgtcattccgttcattccacaaaacccaaacacattgaagtcaaaccaagtggaaaaaagatc 15917450  T
Q  243 gccgcc-ttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcacca 341  Q
    | |||  || || | | |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| | |  |||||  |||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  15917451 gtcgcgattttcgagccacctgcataatgaataaattgcaaaaaatggtctgaaatagcctgagaaccgacccctacaacactgagccatgcctgcacca 15917550  T
Q  342 ttggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaa 441  Q
     |||||| || || | |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||| | |||||||| |     
T  15917551 atggccacaacgcgccaaaagttggacaagacaaaaacatatgattcacatcttcaacatgcccacaaccagtgacacacaaccgcacttccaaaggaat 15917650  T
Q  442 aatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||    
T  15917651 aataccacgatttgccaaattaacttttgtaggtaaacgatccctcagcagtccccaagc 15917710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17765504 - 17765085
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    |||||||||  |||| ||||||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||    
T  17765504 acataaaagtgggctcgaccaccaactatgagtaccaaaactaaaaacaacattactagcttttaacccccacaaagaagatgattttactttgtctaac 17765405  T
Q  143 atttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaacacgaagcaatcaaatcaagtggaagaaagacc 242  Q
    | |||||| | ||  || ||  | |||||||||||  || |||||   |||||||| || ||| ||||||   | |  |||||||| || || ||||| |    
T  17765404 aattgtggtaaagagctctgcatgtttctaaaaattctaacattccgatcattccataagacccaaacacactgaagccaaatcaaatgaaaaaaagatc 17765305  T
Q  243 gccgccttctcaaacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccat 342  Q
      ||   | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |   |||||  || || ||| | || |   | ||  ||| |||||     
T  17765304 ttcgtgatttcaagcaacctgcgtaatgaataagttgcaaaaaatggtctgaaatatgttgaggatcaaccccttcaacccaatgtcaatccctcaccaa 17765205  T
Q  343 tggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaa 442  Q
    || |||||| |||| |||| ||   |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |      
T  17765204 tgaccataaggcaccaaaaattgggcaagacaaaaacaagtgattcacatcttccacgtgaccacaaccagtgacacacaaccgcgcctccaaaggaatg 17765105  T
Q  443 atgcaacggtttgccaaatt 462  Q
    || | |||||||||||||||    
T  17765104 ataccacggtttgccaaatt 17765085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40914448 - 40914380
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaact 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40914448 attacaaacaaatcagtcaatacccagacataaaagcaggcccgaccaccactgatgagtgccaaaact 40914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 326 - 477
Target Start/End: Original strand, 12645417 - 12645568
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaacc 425  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||   |||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || | |||||| ||||    
T  12645417 agccaagcccgcaccataggccacaatgcgccaaaaattgggcaagacaaaaacaaatgagtcacatcttcaacatgcccacaccctgtaacacaaaacc 12645516  T
Q  426 gcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaattattttttgtaggtaa 477  Q
    | ||||||||||||| ||| |  || | || |||||| | ||||||||||||    
T  12645517 gagcctccaaaggtagaattctgcgatctgtcaaattgtattttgtaggtaa 12645568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11000264 - 11000127
Alignment:
Q  271 aataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaa 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  | |  ||||| || || ||| | || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||  ||||    
T  11000264 aataaattgcacaaaatgatctgagatagcatgagaatctaccccttcgacaccaagccatgcccgcaccataggccacaatgcaccaaaaattggacaa 11000165  T
Q  371 gacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  11000164 gataagaacaaatgattcacatcttcaacatgcccaca 11000127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 150
Target Start/End: Original strand, 28252330 - 28252426
Alignment:
Q  54 ggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaacatttgtgg 150  Q
    |||| |||||||| | |||||||||| | ||||| || | ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28252330 ggctcgaccaccaattatgagtaccatagctaaaaacaatattactagcttttaaccaccacaaagaagatgattttactttgtctaacatttgtgg 28252426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 367 - 462
Target Start/End: Original strand, 28252642 - 28252737
Alignment:
Q  367 acaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggtttgccaaatt 462  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||||||| |||||||| |||||| |||||| | | | ||||| | |||||||||||||    
T  28252642 acaagacaaaaacaaatgattcacatcttcatcatgaccacaaccggaaacacataaccgcccctccatatgaataatgccatggtttgccaaatt 28252737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 33516326 - 33516226
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||| |||| || || || ||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    
T  33516326 acatacaagcgggctcgaccaccaattatgagtaccaaaagtaaagaccacgttactagctttcaaccaccacatggaatttgattttactttatctaac 33516227  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  33516226 a 33516226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 143
Target Start/End: Original strand, 40176268 - 40176368
Alignment:
Q  43 acataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttgatttcactttatctaac 142  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||||   || ||||||| ||||||||||||    
T  40176268 acatacaagcgggctcgaccaccaattatgagttccaaaagtaaagaccacattactagctttcaaccaccacatggaatttgattttactttatctaac 40176367  T
Q  143 a 143  Q
    |    
T  40176368 a 40176368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 408
Target Start/End: Original strand, 14439634 - 14439715
Alignment:
Q  326 agccatgcccgcaccattggccataatgcactaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccaca 408  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||  |||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  14439634 agccaagcccgcaccataggccacaatgcatcaaaaattggacaagacaaaa-caaatgattcacatcttcaacctacccaca 14439715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 255 - 501
Target Start/End: Original strand, 3062 - 3308
Alignment:
Q  255 aacaacctgcgtaattaataaattgcaaaaaatgatctgaagttgattgagattcgactcctaccactcctagccatgcccgcaccattggccataatgc 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3062 aacaacctgcgtaattgataaattgcaaaaaatgatctgagatagaatgagagtcgactcccaccactcctaaccatgctcgcaccattggccataatgc 3161  T
Q  355 actaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacaaccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgcaacggttt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3162 actaaaagttacacaagacaaaaacaaatgattaacatcttcaacgttcccacatccagaaacacacaaccgcgcctccaaaggtaaaatgccatggttt 3261  T
Q  455 gccaaattattttttgtaggtaaccaatctctcaggagtcgccaagc 501  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  3262 gccaaattgcttttcgtaggtaaccgatctctcaaaagtctccaagc 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5981 - 5788
Alignment:
Q  16 attacaaccaaatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccac 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  5981 attacaaccaaattagtcaatacctggacataaaagcgggcttgaccaccagtgatgagtaccaaaactaaatacagcattgctagcctttaaccaccac 5882  T
Q  116 aaataagttgatttcactttatctaacatttgtggcagagtactttgtctatttctaaaaatcatatcattcatttcattccacaacaccgaaa 209  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5881 aaagaagttgatttcactttatctagcatttgtggcaaattagtttatctatttctaaaaatcttatcattcctttcattccacaacaccgaaa 5788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6568 - 6450
Alignment:
Q  26 aatcagtcaatacacagacataaaagcaggcttgaccaccactgatgagtaccaaaactaaatactacattgctagcatttaaccaccacaaataagttg 125  Q
    |||||| |||||| || ||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  ||   |    
T  6568 aatcagccaatacccacacagacaagcagatttgaccaccaattttgagtaccaaaactaaatacaacattactagctttcaaccaccacaatgaataag 6469  T
Q  126 atttcactttatctaacat 144  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6468 attttactttatctaacat 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University