View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2672_high_1_N (Length: 385)

Name: NF2672_high_1_N
Description: NF2672
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2672_high_1_N
NF2672_high_1_N
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (1-373)||(16744003-16744377)
chr3 (39-362)||(13838905-13839232)
chr3 (112-373)||(17912483-17912744)
chr3 (39-373)||(14842487-14842824)
chr3 (39-373)||(2049810-2050147)
chr3 (39-373)||(12030073-12030410)
chr3 (86-373)||(15858996-15859287)
chr3 (112-277)||(2449238-2449404)
chr3 (102-374)||(51158008-51158282)
chr3 (1-174)||(19231982-19232159)
chr3 (119-373)||(15936634-15936890)
chr3 (119-370)||(15938476-15938729)
chr3 (39-158)||(19260749-19260869)
chr3 (112-244)||(13975722-13975853)
chr3 (112-244)||(45860937-45861068)
chr3 (112-244)||(13954890-13955021)
chr3 (124-369)||(15614838-15615085)
chr3 (1-73)||(15857125-15857198)
chr3 (146-373)||(16821139-16821369)
chr3 (1-70)||(3992873-3992943)
chr3 (1-70)||(55513193-55513263)
chr3 (264-373)||(47984650-47984759)
chr3 (264-373)||(48003224-48003333)
chr3 (124-244)||(55316351-55316471)
chr3 (1-70)||(2844514-2844584)
chr3 (264-373)||(47993937-47994046)
chr3 (264-373)||(48012510-48012619)
chr3 (124-244)||(41270207-41270327)
chr3 (16-70)||(17955861-17955916)
chr3 (10-70)||(45581954-45582016)
chr3 (1-70)||(54037986-54038056)
chr3 (1-70)||(7854305-7854375)
chr3 (128-169)||(14080715-14080756)
chr3 (1-50)||(12031852-12031901)
chr3 (256-373)||(12264932-12265049)
chr3 (1-50)||(17205024-17205073)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (112-373)||(22907214-22907476)
chr8 (39-374)||(16193643-16193980)
chr8 (1-373)||(16404862-16405235)
chr8 (39-362)||(24928716-24929043)
chr8 (39-373)||(43373392-43373731)
chr8 (112-277)||(5238184-5238350)
chr8 (112-277)||(24661248-24661414)
chr8 (112-277)||(43685643-43685809)
chr8 (112-362)||(17345581-17345832)
chr8 (124-369)||(6774258-6774505)
chr8 (124-369)||(24548986-24549233)
chr8 (146-244)||(21844594-21844692)
chr8 (146-244)||(21851987-21852085)
chr8 (1-70)||(274766-274836)
chr8 (1-70)||(641013-641083)
chr8 (1-70)||(826819-826889)
chr8 (1-70)||(24716724-24716794)
chr8 (124-244)||(30120854-30120974)
chr8 (124-244)||(16674392-16674512)
chr8 (262-356)||(23837214-23837308)
chr8 (128-169)||(23226076-23226117)
chr8 (187-373)||(222754-222943)
chr8 (187-373)||(736377-736566)
chr8 (187-373)||(860272-860461)
chr8 (1-70)||(39115598-39115668)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (112-373)||(26680201-26680463)
chr4 (1-373)||(54118130-54118507)
chr4 (39-244)||(122020-122226)
chr4 (39-373)||(13246430-13246769)
chr4 (39-373)||(15675009-15675352)
chr4 (112-277)||(10488659-10488825)
chr4 (112-277)||(16327926-16328092)
chr4 (139-373)||(31115629-31115865)
chr4 (39-309)||(10104170-10104449)
chr4 (112-244)||(13048221-13048353)
chr4 (39-174)||(33240901-33241043)
chr4 (146-373)||(10644219-10644449)
chr4 (275-373)||(111395-111493)
chr4 (1-70)||(25119069-25119139)
chr4 (124-373)||(47357654-47357906)
chr4 (128-309)||(40885570-40885753)
chr4 (1-70)||(5682390-5682460)
chr4 (262-356)||(41166083-41166177)
chr4 (328-373)||(10104449-10104494)
chr4 (262-349)||(15044851-15044938)
chr4 (262-374)||(52265645-52265758)
chr4 (262-326)||(13809647-13809711)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (112-373)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-70)||(41632-41702)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (112-373)||(7293017-7293279)
chr7 (1-373)||(3059966-3060341)
chr7 (39-371)||(16211768-16212103)
chr7 (39-373)||(13036938-13037277)
chr7 (39-368)||(11580661-11580997)
chr7 (39-373)||(36052667-36053003)
chr7 (112-277)||(11516324-11516490)
chr7 (112-277)||(15441564-15441730)
chr7 (112-277)||(30262129-30262295)
chr7 (112-373)||(47481031-47481294)
chr7 (119-373)||(18253842-18254098)
chr7 (113-373)||(13321014-13321278)
chr7 (112-244)||(25292338-25292470)
chr7 (147-373)||(16478985-16479213)
chr7 (146-244)||(13572808-13572906)
chr7 (1-70)||(32493908-32493978)
chr7 (124-244)||(10989541-10989661)
chr7 (47-240)||(295900-296094)
chr7 (146-236)||(13911046-13911136)
chr7 (6-70)||(1936884-1936949)
chr7 (146-243)||(2437590-2437687)
chr7 (1-70)||(126738-126808)
chr7 (112-154)||(14113989-14114031)
chr7 (112-154)||(14423639-14423681)
chr7 (1-70)||(111131-111201)
chr7 (1-50)||(13377872-13377921)
chr7 (1-50)||(13389698-13389747)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (1-373)||(41394222-41394597)
chr1 (39-373)||(20445679-20446019)
chr1 (51-373)||(20531444-20531770)
chr1 (39-373)||(20931345-20931682)
chr1 (39-373)||(37844374-37844714)
chr1 (39-373)||(20893551-20893889)
chr1 (39-373)||(20913037-20913367)
chr1 (112-277)||(51452589-51452755)
chr1 (146-369)||(2116258-2116484)
chr1 (162-373)||(22227809-22228022)
chr1 (162-373)||(22232506-22232719)
chr1 (146-244)||(45051554-45051652)
chr1 (1-70)||(21860334-21860404)
chr1 (1-70)||(44034833-44034903)
chr1 (146-244)||(18601140-18601238)
chr1 (124-244)||(5072388-5072508)
chr1 (1-50)||(27675139-27675188)
chr1 (1-50)||(41218749-41218798)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (1-373)||(19794591-19794967)
chr2 (1-373)||(43642843-43643220)
chr2 (39-373)||(36982364-36982704)
chr2 (1-373)||(20627200-20627576)
chr2 (39-368)||(462743-463075)
chr2 (45-373)||(8891242-8891574)
chr2 (112-277)||(19689401-19689567)
chr2 (112-277)||(23820168-23820334)
chr2 (112-277)||(14906440-14906606)
chr2 (39-373)||(24341309-24341652)
chr2 (112-277)||(20015108-20015274)
chr2 (112-373)||(25265390-25265653)
chr2 (112-244)||(17396653-17396784)
chr2 (162-373)||(7507894-7508107)
chr2 (39-132)||(22863171-22863267)
chr2 (1-70)||(22275045-22275115)
chr2 (1-70)||(22284278-22284348)
chr2 (1-69)||(15633538-15633607)
chr2 (124-373)||(19886661-19886913)
chr2 (1-54)||(19660217-19660270)
chr2 (1-50)||(43646237-43646286)
chr2 (296-356)||(9636761-9636821)
chr2 (296-340)||(24884718-24884762)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (39-373)||(1124-1462)
scaffold0266 (39-371)||(3508-3843)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (39-373)||(48598-48935)
scaffold0023 (146-244)||(36225-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (38-373)||(36836-37176)
scaffold0077 (1-50)||(15329-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (47-373)||(19206-19537)
scaffold0195 (112-373)||(21290-21553)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (39-362)||(171916-172242)
scaffold0001 (39-362)||(177619-177945)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (39-373)||(23506965-23507302)
chr5 (39-373)||(27182471-27182810)
chr5 (39-373)||(18530988-18531330)
chr5 (112-277)||(20623066-20623232)
chr5 (112-277)||(21233528-21233694)
chr5 (39-373)||(22053753-22054096)
chr5 (112-274)||(37052844-37053007)
chr5 (112-277)||(16536294-16536460)
chr5 (114-277)||(25900408-25900571)
chr5 (112-362)||(34939289-34939540)
chr5 (124-244)||(29188284-29188404)
chr5 (146-242)||(27009975-27010071)
chr5 (146-373)||(4200007-4200237)
chr5 (124-373)||(22366481-22366733)
chr5 (124-373)||(25426628-25426880)
chr5 (146-373)||(18778014-18778244)
chr5 (146-244)||(43443417-43443515)
chr5 (124-373)||(12374-12626)
chr5 (124-244)||(19500031-19500151)
chr5 (124-373)||(21073595-21073847)
chr5 (262-373)||(23493917-23494029)
chr5 (1-50)||(11584394-11584443)
chr5 (262-326)||(7728466-7728530)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (39-369)||(41733-42066)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (39-373)||(882-1218)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (39-362)||(23153458-23153786)
chr6 (83-369)||(14626089-14626377)
chr6 (112-373)||(35009439-35009702)
chr6 (112-362)||(1657748-1657999)
chr6 (112-362)||(15862484-15862734)
chr6 (124-369)||(1650105-1650352)
chr6 (39-107)||(23148266-23148335)
chr6 (1-70)||(19983154-19983224)
chr6 (1-70)||(35015019-35015089)
chr6 (152-373)||(25175563-25175787)
chr6 (270-373)||(27740838-27740941)
chr6 (112-195)||(27751605-27751688)
chr6 (124-373)||(27653983-27654235)
chr6 (263-356)||(18381821-18381914)
chr6 (1-70)||(18583640-18583710)
chr6 (112-309)||(29665937-29666137)
chr6 (1-50)||(21623511-21623560)
chr6 (286-373)||(22361926-22362014)
chr6 (262-326)||(25367374-25367438)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (39-373)||(12115-12450)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (39-367)||(272031-272362)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (39-362)||(247366-247694)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (39-373)||(128095-128431)
scaffold0008 (146-236)||(31697-31787)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (39-373)||(5990-6326)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (51-244)||(51121-51314)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (48-373)||(4996-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (39-373)||(26340-26678)
scaffold0162 (112-373)||(8180-8440)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (112-277)||(26892-27058)
scaffold0141 (119-277)||(22637-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (112-277)||(1582-1748)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (39-373)||(123087-123427)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (39-373)||(8878-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (50-373)||(8849-9180)
scaffold0025 (80-373)||(148721-149018)
scaffold0025 (39-132)||(146844-146938)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (39-244)||(89378-89586)
scaffold0028 (39-163)||(107708-107835)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (119-373)||(48187-48443)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (112-373)||(13506-13769)
scaffold0132 (1-70)||(42677-42744)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (119-373)||(107747-108003)
scaffold0026 (181-244)||(64585-64648)
scaffold0026 (127-169)||(89863-89905)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (112-373)||(41648-41911)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (112-373)||(534-797)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (119-244)||(5660-5785)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (112-373)||(34460-34724)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (146-369)||(9371-9596)
scaffold0215 (146-369)||(16269-16494)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (123-369)||(2966-3215)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (162-373)||(5254-5466)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (146-244)||(13347-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (146-244)||(167-265)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (275-373)||(9382-9480)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (162-373)||(3722-3936)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (147-373)||(42997-43226)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (146-244)||(14083-14181)
scaffold0139 (146-241)||(21138-21233)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-70)||(80187-80257)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (124-244)||(1304-1424)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (162-373)||(54416-54630)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (1-71)||(162040-162111)
scaffold0016 (1-71)||(166126-166197)
scaffold0016 (1-50)||(116413-116462)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-70)||(5739-5809)
scaffold0686 (1-70)||(5945-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-70)||(31142-31212)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-71)||(314-385)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (112-195)||(3370-3453)
scaffold0361 (319-371)||(3210-3262)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (284-373)||(48514-48603)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (262-349)||(197390-197477)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (296-373)||(104793-104871)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (1-50)||(1721-1770)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (295-356)||(2471-2532)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (1-50)||(114-163)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (128-169)||(1546-1587)
scaffold0456 (128-169)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (128-169)||(8216-8257)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-50)||(19812-19861)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (119-237)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (128-169)||(70307-70348)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-50)||(35821-35870)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (285-349)||(2548-2612)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 16744003 - 16744377
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16744003 gagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgta 16744102  T
Q  100 tgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaga 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16744103 tgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaa 16744202  T
Q  200 ttccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaat 298  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744203 ttacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaat 16744302  T
Q  299 tgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16744303 tgatgttgttgatgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 136  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  137 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  237 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 13838933  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13838932 aatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 310  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgt 17912681  T
Q  311 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17912682 tgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||| |  |||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatga 14842786  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14842787 ataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||| |||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatga 2049848  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2049847 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
     ||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||  | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||| | ||||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatga 12030372  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12030373 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 373
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859287
Alignment:
Q  86 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 183  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  184 atgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagc 281  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||||||||     
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagt 15859195  T
Q  282 tatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15859196 tatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449404
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 2449404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 374
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  102 aattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagatt 201  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  202 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaatt 299  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaatt 51158207  T
Q  300 gatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 374  Q
    |||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  51158208 gatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19232159 - 19231982
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgt 98  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19232159 gagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgt 19232060  T
Q  99 atgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 174  Q
    |||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232059 atgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 119 - 373
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 316  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15936833  T
Q  317 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  15936834 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 370
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 316  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 15938675  T
Q  317 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatg 370  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| ||||||||||||||||||    
T  15938676 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 158
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  138 tccaactttgatgatatgttt 158  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955021
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15615085 - 15614838
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  15615085 tgctagatttgtgctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 15614986  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 321  Q
    || ||||| |||| || ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  15614985 gataagttgtgaatatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 15614886  T
Q  322 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15614885 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 15857125 - 15857198
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 73  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857125 gagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821139
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||     
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgct 16821270  T
Q  245 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 342  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  16821269 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 16821170  T
Q  343 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     |||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16821169 cttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3992943 - 3992873
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992943 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 55513263 - 55513193
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513263 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47984759 - 47984650
Alignment:
Q  264 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 363  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47984759 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47984660  T
Q  364 attgatgatg 373  Q
    ||||||||||    
T  47984659 attgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48003333 - 48003224
Alignment:
Q  264 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 363  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48003333 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48003234  T
Q  364 attgatgatg 373  Q
    ||||||||||    
T  48003233 attgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2844584 - 2844514
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844584 gagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47994046 - 47993937
Alignment:
Q  264 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 363  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  47994046 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 47993947  T
Q  364 attgatgatg 373  Q
    ||||||||||    
T  47993946 attgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48012619 - 48012510
Alignment:
Q  264 gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatgg 363  Q
    ||||| |||| |||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||| |||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||     
T  48012619 gttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatga 48012520  T
Q  364 attgatgatg 373  Q
    ||||||||||    
T  48012519 attgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  16 tagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  10 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 54037986 - 54038056
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037986 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 7854375 - 7854305
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854375 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12031901 - 12031852
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  12031901 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 12031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 373
Target Start/End: Original strand, 12264932 - 12265049
Alignment:
Q  256 tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat 355  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||| ||   ||||||||||||    
T  12264932 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaattatgacttgggtatacat 12265031  T
Q  356 attcatggattgatgatg 373  Q
    | | ||||||||||||||    
T  12265032 aattatggattgatgatg 12265049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 17205073 - 17205024
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17205073 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17205024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 310  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 22907413  T
Q  311 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907414 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 374
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  39 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgct 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  139 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  239 ttgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 336  Q
    ||||||  ||| | |||| |||| ||  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||||||    
T  16193843 ttgtgctcaattggtgaattttgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaa 16193942  T
Q  337 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatgt 374  Q
    |||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16193943 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 16404862 - 16405235
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  16404862 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgta 16404960  T
Q  100 tgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtta 197  Q
    ||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  16404961 tgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 16405060  T
Q  198 gattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 295  Q
     ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| ||||||  |||||||||||| |    
T  16405061 aattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaaattgacatatgattcttgttc 16405157  T
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| ||| || |||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16405158 aattgatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  39 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 136  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  137 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  237 aattgtgc-aaatggatgaattt-gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    ||||||||  ||| | ||||||| |  | ||||| |||| |||||| ||||  |||||| ||||||| ||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttcgctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgatg 24929015  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  24929016 aatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||| ||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||| | | | || |||| |||||||| ||||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgat 43373691  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43373692 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238184
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 5238184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661414
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 24661414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685643
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 43685643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || ||||| || |||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattg 17345634  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  17345633 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 321  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 6774457  T
Q  322 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  6774458 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 321  Q
    || ||||| ||||||| ||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||| | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 24549034  T
Q  322 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24549033 gttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 21844594 - 21844692
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21844594 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 21851987 - 21852085
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21851987 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 274836 - 274766
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274836 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 641013 - 641083
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641013 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 826819 - 826889
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826819 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 24716724 - 24716794
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716724 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120854
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23837308 - 23837214
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 356  Q
    ||||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  23837308 atgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 23837214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Original strand, 222754 - 222943
Alignment:
Q  187 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 283  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  222754 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 222853  T
Q  284 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  222854 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Original strand, 736377 - 736566
Alignment:
Q  187 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 283  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  736377 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 736476  T
Q  284 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  736477 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Original strand, 860272 - 860461
Alignment:
Q  187 attgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat--gttgtagttgaattgagcta 283  Q
    ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  | |  ||||| ||| | ||||| |     
T  860272 attgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttg 860371  T
Q  284 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  860372 tgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 39115668 - 39115598
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115668 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 310  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 26680264  T
Q  311 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680263 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 54118130 - 54118507
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54118130 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgta 54118229  T
Q  100 tgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtta 197  Q
    ||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  54118230 tgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 54118329  T
Q  198 gattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 295  Q
     ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| |    
T  54118330 aattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttc 54118429  T
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  54118430 aattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  238 attgtgc 244  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| ||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13246470  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13246469 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  132 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 231  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  232 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 329  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgt 15675308  T
Q  330 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15675309 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488659
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 10488659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328092
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16328092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 139 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  139 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  239 ttgtgca-aatggatgaatttgac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaa 336  Q
    || |||  ||| | |||||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattttcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaa 31115666  T
Q  337 tcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31115665 tcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 309
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104449
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  132 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 231  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  232 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 10104449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  132 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 174  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10644449 - 10644219
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||  |||||||     
T  10644449 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgct 10644350  T
Q  245 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 342  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  10644349 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 10644250  T
Q  343 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  10644249 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 111493 - 111395
Alignment:
Q  275 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  111493 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 25119069 - 25119139
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119069 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 309
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885753
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 226  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  227 aagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
    |||||||| ||||| |||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40885670 aagttatg-aaattatgctcaattggtgaactttgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttgttg 40885753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 5682390 - 5682460
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682390 gagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 41166083 - 41166177
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 356  Q
    ||||||| ||||||||| |  | || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  41166083 atgttgttgttgaattgtggcaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcata 41166177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 10104449 - 10104494
Alignment:
Q  328 gttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10104449 gttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15044938 - 15044851
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 349  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | ||||||    
T  15044938 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggt 15044851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Original strand, 52265645 - 52265758
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 360  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  52265645 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggcttgggtgttcataattca 52265744  T
Q  361 tggattgatgatgt 374  Q
    ||  ||||||||||    
T  52265745 tgatttgatgatgt 52265758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Original strand, 13809647 - 13809711
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 326  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13809647 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgt 13809711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 310  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 37265  T
Q  311 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37266 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 41702 - 41632
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41702 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgcaaa-tggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 310  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttga 7293080  T
Q  311 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293079 tgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3060341 - 3059966
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3060341 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttata 3060242  T
Q  100 tgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaga 199  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||||||| | |    
T  3060241 tgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaa 3060142  T
Q  200 ttccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 296  Q
    || |||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| ||  ||||||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||    
T  3060141 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatgg-tgaattttgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttca 3060043  T
Q  297 attgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  3060042 attgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | ||||||||||  |||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 16211804  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 371  Q
     |||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  16211803 ttcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |  ||  |||| |||||||| ||||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttgat 13037237  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13037238 gaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 368
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattt 133  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| ||||||||||     
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  134 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 233  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  234 gaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttg 331  Q
    |||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttg 11580960  T
Q  332 atgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 368  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11580961 atgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||   ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtt---gttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgat 36052707  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36052706 gaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516324
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 11516324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441730
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 15441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262295
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 30262295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 308  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  309 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | |  |||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 373
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 316  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 18254041  T
Q  317 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  || |||| |||||||||||||||||||||    
T  18254042 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  113 tggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--a 210  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  211 aatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttg-tagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 307  Q
    | |||||| |||||  |||||||| |||||||||  ||| | |||| ||||  | |||| | ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatg-aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttat 13321080  T
Q  308 tgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||| | || ||||||| ||||||||||    
T  13321079 tgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 373
Target Start/End: Original strand, 16478985 - 16479213
Alignment:
Q  147 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  16478985 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 16479084  T
Q  246 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 344  Q
    ||| | |||| ||||  | ||| |  || | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |    
T  16479085 aattggtgaattttgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgct 16479184  T
Q  345 tgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16479185 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13572906 - 13572808
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13572906 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 32493908 - 32493978
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493908 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989541
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 240
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296094
Alignment:
Q  47 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaact 144  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||| ||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  145 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 240  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 13911046 - 13911136
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 70
Target Start/End: Original strand, 1936884 - 1936949
Alignment:
Q  6 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 70  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936884 aaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2437687 - 2437590
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 243  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||    
T  2437687 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 126808 - 126738
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126808 gagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 154
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 154
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatat 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 111131 - 111201
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111131 gagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13377921 - 13377872
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13377921 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13377872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 13389747 - 13389698
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13389747 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13389698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41394597 - 41394222
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41394597 gagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgta 41394498  T
Q  100 tgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttaga 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |      
T  41394497 tgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaag 41394398  T
Q  200 ttccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaa 297  Q
    || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | |||   ||||| | |||||||||  |||    
T  41394397 ttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaa 41394298  T
Q  298 ttgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394297 ttgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  39 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 134  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  135 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  235 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 332  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20445720  T
Q  333 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20445719 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 51 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531444
Alignment:
Q  51 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttga 148  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  149 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaa 247  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaa 20531571  T
Q  248 tggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttg 346  Q
    | | |||| ||||  | ||||| ||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531570 ttggtgaattttgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttg 20531471  T
Q  347 ggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  20531470 ggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  |  |||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattttgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 20931383  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || ||   |||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  20931382 ataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta-tg 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  235 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 332  Q
    ||||||||||  |||  ||||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 37844673  T
Q  333 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||| |||| | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  37844674 tgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||  |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 20893849  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  20893850 gaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||      |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| ||||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgtt-aatt------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatga 20913075  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20913074 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452589
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 51452589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2116484 - 2116258
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  2116484 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 2116385  T
Q  245 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattga-gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 342  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||   | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2116384 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattg 2116285  T
Q  343 tttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2116284 cttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227809
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 259  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22227923  T
Q  260 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 359  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22227922 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22227823  T
Q  360 atggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||||||    
T  22227822 atggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232506
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-tttg 259  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattttg 22232620  T
Q  260 acatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattc 359  Q
      | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||    
T  22232619 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 22232520  T
Q  360 atggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||||||    
T  22232519 atggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 45051652 - 45051554
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45051652 tgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 21860404 - 21860334
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860404 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 44034833 - 44034903
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034833 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 18601140 - 18601238
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  18601140 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27675188 - 27675139
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675188 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 41218798 - 41218749
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218798 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 19794591 - 19794967
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  19794591 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgta 19794689  T
Q  100 tgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtta 197  Q
    ||||||||   || |||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  19794690 tgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtga 19794789  T
Q  198 gattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 295  Q
     ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |    
T  19794790 aattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttc 19794889  T
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| ||   | |||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794890 aattgatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 43642843 - 43643220
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642843 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgta 43642942  T
Q  100 tgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtta 197  Q
    ||||||||   ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  43642943 tgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtga 43643042  T
Q  198 gattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacat-gttgtagttgaattgagctatgattcttgtgc 295  Q
     ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||  ||| | |||||||  | | |||||  || | ||||| |||||||||||| |    
T  43643043 aattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttc 43643142  T
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||| | ||| || |||| |||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43643143 aattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 134  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  135 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  235 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 332  Q
    ||||||||||  ||| | |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttga 36982663  T
Q  333 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36982664 tgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 373
Target Start/End: Original strand, 20627200 - 20627576
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgt 98  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20627200 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgt 20627299  T
Q  99 atgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttag 198  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |     
T  20627300 atgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaa 20627399  T
Q  199 attccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgca 296  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | | |||||||| ||    
T  20627400 attacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttca 20627499  T
Q  297 attgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||| || | | || |||| | |||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  20627500 attgattttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  238 attgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    ||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||| ||  ||||||    
T  462875 attgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattga 368  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891242
Alignment:
Q  45 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaa 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  143 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 242  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  243 gc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 340  Q
    ||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  8891374 gctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatgaatcat 8891275  T
Q  341 cgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  8891274 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689567
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 19689567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820168
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 23820168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906606
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 14906606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  132 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 231  Q
    |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  232 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 329  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||   ||    
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgt 24341608  T
Q  330 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24341609 tgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015108
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20015108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 25265589  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25265590 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaatttg 259  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttg 7507992  T
Q  260 ac-atgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 357  Q
     | | ||||| ||| ||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |||||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  7507993 gctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  358 tcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863171
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatt 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaatt 22863171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22275115 - 22275045
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275115 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 22284348 - 22284278
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284348 gagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15633607 - 15633538
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 69  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633607 gagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 19660270 - 19660217
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 54  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660270 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43646286 - 43646237
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  43646286 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 43646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9636821 - 9636761
Alignment:
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 356  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  9636821 aattgatgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagtttgggtattcata 9636761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24884762 - 24884718
Alignment:
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcat 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  24884762 aattgatgttgttgttgctaatagatattgttgttgatgattcat 24884718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  137 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  237 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    ||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||| |||| |||||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgatg 1163  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||| || | |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  1162 aataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 39 - 371
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  238 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||| ||    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagga 3807  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 371  Q
    || || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3808 ataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  | | | |||| ||||  | ||||| | |  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | |  |||| |||||||| ||||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattttgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatga 48636  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48635 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36225
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 373
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  38 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||| |    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  135 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  235 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 332  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttga 37135  T
Q  333 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37136 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 15329 - 15378
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15329 gagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19206
Alignment:
Q  47 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 143  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  144 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  244 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 341  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||||||||||||     
T  19337 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatgaatcatt 19238  T
Q  342 gtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19237 gcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattg 21354  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21353 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 171943  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||    
T  171942 atcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatga 177646  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||    
T  177645 atcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatga 23507003  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23507002 ataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 27182770  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  27182771 gaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 132  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  133 tgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 232  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  233 tgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 329  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  330 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623066
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 20623066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233694
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 21233694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 131  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  132 ttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 231  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  232 atgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagt 329  Q
     ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| ||    
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 22054052  T
Q  330 tgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22054053 tgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 112 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052844
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttga 274  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttga 37052844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536294
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 16536294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 114 - 277
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900571
Alignment:
Q  114 ggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 213  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  214 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttgttgttgaatt 25900571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 112 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||  | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 34939342  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  34939341 ctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 27010071 - 27009975
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  27010071 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Original strand, 4200007 - 4200237
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||| |||     
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T
Q  245 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 342  Q
    |||| | |||||||  |  ||||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  4200107 aaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattg 4200206  T
Q  343 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  4200207 cttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||| ||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 373
Target Start/End: Original strand, 18778014 - 18778244
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||     
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T
Q  245 aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcg 342  Q
    |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||  || | ||| || |  ||||||||| || |    
T  18778114 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattg 18778213  T
Q  343 tttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18778214 cttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 43443417 - 43443515
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500031
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatt--tgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |   | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23494029 - 23493917
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attca 360  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| | |||||| | ||| |||||    
T  23494029 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattca 23493930  T
Q  361 tggattgatgatg 373  Q
    ||  |||||||||    
T  23493929 tgatttgatgatg 23493917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 11584443 - 11584394
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584443 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7728530 - 7728466
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 326  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  7728530 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 7728466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 39 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||| | | | || |||| | |||||||| ||||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatga 41767  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  41766 atcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| | |||| ||||  ||||| |  |||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatga 1180  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1181 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||| ||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  236 aaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    |||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||| || | | || |||| |||||||| ||||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttgat 23153487  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||    
T  23153486 gaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626377
Alignment:
Q  83 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 182  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  183 tatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaat--tgtgcaaatggatgaatt-tgacatgttgtagttgaattga 279  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||  | ||||| ||| | ||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtgcaattgg-tgaattatgctaagttgttgttaacttga 14626287  T
Q  280 gctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    | | |||||||||  ||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  14626288 gatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 35009638  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  35009639 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 362
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattg 1657946  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  1657947 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggat-gaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||  | ||| | | ||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| |||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattttgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattg 15862537  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
     || |||| |||||||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  15862536 ctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 369
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650352
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||| ||| ||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagat 321  Q
    || ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgat 1650304  T
Q  322 gttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  1650305 gttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 107  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 19983154 - 19983224
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983154 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 35015019 - 35015089
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015019 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25175787 - 25175563
Alignment:
Q  152 tatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatgg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| |    
T  25175787 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattg 25175688  T
Q  251 atgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttggg 348  Q
     |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || | |||||    
T  25175687 gtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 25175588  T
Q  349 tatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  25175587 tatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27740941 - 27740838
Alignment:
Q  270 gttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||   |||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27740941 gttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgat 27740842  T
Q  370 gatg 373  Q
    ||||    
T  27740841 gatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 195  Q
    |||||| | ||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataga 320  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| | | ||||||| |  ||| || | ||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  321 tgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |  ||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 356
Target Start/End: Original strand, 18381821 - 18381914
Alignment:
Q  263 tgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 356  Q
    |||||| ||||||||| | || || || ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  18381821 tgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 18381914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 18583710 - 18583640
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583710 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665937
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt-- 209  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||      
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  210 aaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgt 307  Q
    || |||| | |||||  |||||||| ||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatg-aaattgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgttgt 29665939  T
Q  308 tg 309  Q
    ||    
T  29665938 tg 29665937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 21623560 - 21623511
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21623560 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 21623511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 373
Target Start/End: Original strand, 22361926 - 22362014
Alignment:
Q  286 attcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 373  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  22361926 attcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgaattgatgatg 22362014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 326
Target Start/End: Original strand, 25367374 - 25367438
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgt 326  Q
    ||||||| ||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  25367374 atgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgt 25367438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaatttgtg 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  137 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  237 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    |||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| ||  ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  || |||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattttgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcatg 12154  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12153 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  || |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||| |||| | |||| ||||  | ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| | | || |||| |||||||| ||||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattttgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatga 272063  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattg 367  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| ||||    
T  272062 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 362
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  236 aaattgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgat 333  Q
    ||||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||||||| |   || |||| |||||||| ||||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgat 247665  T
Q  334 gaatcatcgtttgggtatacatattcatg 362  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  247666 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  238 attgtg--caaatggatgaatttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    ||||||  ||| |||   | ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattttgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatga 128393  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  128394 ataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 236
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||| ||||||| | |||| ||||   |||| |  |||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattttgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatga 6288  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6289 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 244
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  51 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatg 150  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  151 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 48 - 373
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  48 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaacttt 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  147 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 245  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||      
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  246 aatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtt 344  Q
    ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  |||||||||||| | |    
T  5196 aattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgct 5295  T
Q  345 tgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  5296 tgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaatttgtg 136  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||| |||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  137 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  237 aattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatg 334  Q
    |||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  | |||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||  ||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatg 26639  T
Q  335 aatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  26640 aatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8440
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  |||||   ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgtt---gttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 8376  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     || |||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  8377 ttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26892
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 26892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 119 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22637
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 22637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 112 - 277
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1748
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttgtagttgaatt 277  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttgttgttgaatt 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttg 134  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||| |    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  135 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 234  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  235 aaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttga 332  Q
    ||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| |||  ||| || |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| |||||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttga 123386  T
Q  333 tgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| || | |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  123387 tgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatttgtgc 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  138 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  238 attgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatga 335  Q
    |||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatga 8916  T
Q  336 atcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    || || | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8915 ataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8849
Alignment:
Q  50 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaatttgtgctccaac 143  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  144 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 243  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  244 c-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatc 341  Q
    |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| ||| |  |||| |||||||| |||||||||||||     
T  8980 ctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttgttgatgaatcatt 8881  T
Q  342 gtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8880 gcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148721
Alignment:
Q  80 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 177  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  178 aagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaa 275  Q
    || |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| |     
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaat 148819  T
Q  276 ttgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    ||||| | |||||||||| ||||||||||| | | || |||| || ||||| ||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  148818 ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146844
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaatt 132  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaatt 146844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 39 - 244
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||| ||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 235  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  236 aaattgtgc 244  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  39 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaatttgt 135  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||| ||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  136 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 163  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 119 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 316  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaa 48244  T
Q  317 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||  ||||||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48243 ttgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| |||||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttg 13570  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     || |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  13569 ttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 42744 - 42677
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42744 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaa 316  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||  ||| | |||| ||||| | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| | |||| |||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaa 107804  T
Q  317 tagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  107803 ttgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 244
Target Start/End: Original strand, 64585 - 64648
Alignment:
Q  181 tgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  64585 tgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  127 taaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 308  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||  ||||||| ||||||||  | |  ||  | ||| ||||||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattgg-tgaattttgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  309 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 309  Q
    ||| | | ||||||  |||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | |||   |||  ||| || ||||||||||||  |||||||||| | |    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattttgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatgg 733  T
Q  310 atgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  734 ctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 218  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  219 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 211  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  212 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgtt 308  Q
     | |||| ||||  |||||| |||||||||| |  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttatt 34659  T
Q  309 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    | || || | |||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34660 gttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9596
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 9470  T
Q  245 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 343  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  9471 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 9570  T
Q  344 ttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  9571 ttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 369
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16494
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc- 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 16368  T
Q  245 aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 343  Q
     ||| | |||| ||||  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||  ||| ||||||| | | || |||| |||||||||||||||||||||| |     
T  16369 caattggtgaattttgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgc 16468  T
Q  344 ttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16469 ttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 123 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  123 ttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 222  Q
    |||||||||| ||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  223 tgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaa-tttgacatgttgtagttgaattgagctatgattcttg-tgcaattgatgttgttgatgctaatag 319  Q
    || |||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||  | ||||| ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||| ||| || || | |    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttg 3016  T
Q  320 atgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgat 369  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  3015 atgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg--caaatggatgaa-ttt 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattgg-tgaatttt 5352  T
Q  259 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 358  Q
    |    ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||  || |||||| || | |||||| | ||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  359 catggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 13347 - 13445
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13347 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 265 - 167
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||    
T  265 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9382
Alignment:
Q  275 attgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | | || |||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9480 attgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg-caaatggatgaa-ttt 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| |||||||| | ||| | |||| |||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaatttt 3837  T
Q  259 gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatatt 358  Q
    |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||| |  ||||||||| ||   |||||| | ||||||    
T  3836 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatatt 3737  T
Q  359 catggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||||    
T  3736 catggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 147 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 42997
Alignment:
Q  147 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-a 245  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| ||||||| |    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgcta 43127  T
Q  246 aatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgt 343  Q
    ||| | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||| ||| ||| ||||||| |  ||| || | ||| || |  ||||||||| || |     
T  43126 aattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 43027  T
Q  344 ttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43026 ttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 244
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 241
Target Start/End: Original strand, 21138 - 21233
Alignment:
Q  146 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattg 241  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  21138 tgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 80257 - 80187
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80257 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 244
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  124 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 223  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  224 gagaagttatgaaaattgtgc 244  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54630 - 54416
Alignment:
Q  162 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa--tatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgca-aatggatgaattt 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||| ||  |||||| |||||  ||||||||||| |||| |  ||| | |||||||    
T  54630 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaa-ttgtactcaattggtgaattt 54532  T
Q  259 -gacatgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatat 357  Q
     || ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||| |  |||  |||||||| || | ||||||||   ||||||||||||||    
T  54531 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgttgttgctattaactgatgttgttgtgggtgaatcatgagttgggtatacatat 54432  T
Q  358 tcatggattgatgatg 373  Q
    | ||||||||||||||    
T  54431 ttatggattgatgatg 54416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 162040 - 162111
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 71  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162040 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 166126 - 166197
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 71  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166126 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 116413 - 116462
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  116413 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 116462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 5739 - 5809
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5739 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 5945 - 6015
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5945 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 31142 - 31212
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 70  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31142 gagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 314 - 385
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 71  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  314 gagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  112 atggatgattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 195  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3262 - 3210
Alignment:
Q  319 gatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatga 371  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  3262 gatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48603 - 48514
Alignment:
Q  284 tgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacatattcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||| || |||||||| | |||| |||| |||||| |  ||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48603 tgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 349
Target Start/End: Original strand, 197390 - 197477
Alignment:
Q  262 atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 349  Q
    ||||||| ||||||||| | |  ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  197390 atgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 197477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Original strand, 104793 - 104871
Alignment:
Q  296 aattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacat-attcatggattgatgatg 373  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  104793 aattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatg 104871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1721
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1770 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2471
Alignment:
Q  295 caattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggtatacata 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||| | |||||||| ||||    
T  2532 caattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgggtattcata 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 114
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  163 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 19812 - 19861
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19812 gagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 237
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  119 attgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 216  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  217 tagaaatgagaagttatgaaa 237  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 169
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  128 aaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 169  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 35870 - 35821
Alignment:
Q  1 gagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 50  Q
    |||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  35870 gagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 35821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 2612 - 2548
Alignment:
Q  285 gattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgttgtagttgatgaatcatcgtttgggt 349  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2612 gattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggt 2548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University