View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2695_low_15 (Length: 296)

Name: NF2695_low_15
Description: NF2695
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2695_low_15
NF2695_low_15
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (92-295)||(50111318-50111522)
chr4 (127-280)||(50112808-50112962)
chr4 (90-169)||(50111277-50111356)
chr4 (125-193)||(23669906-23669974)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (1-218)||(32772832-32773049)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (112-295)||(21502878-21503058)
chr2 (90-212)||(21503020-21503138)
[»] scaffold0015 (8 HSPs)
scaffold0015 (90-295)||(207988-208190)
scaffold0015 (97-295)||(208152-208347)
scaffold0015 (90-295)||(208414-208616)
scaffold0015 (89-195)||(207921-208027)
scaffold0015 (93-195)||(208347-208449)
scaffold0015 (231-295)||(208578-208642)
scaffold0015 (197-267)||(212045-212116)
scaffold0015 (240-287)||(207150-207197)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (90-295)||(21961547-21961749)
chr8 (90-292)||(22011957-22012156)
chr8 (90-295)||(21960793-21960995)
chr8 (90-295)||(21960957-21961159)
chr8 (97-295)||(21961390-21961585)
chr8 (90-295)||(21961121-21961323)
chr8 (89-195)||(21961710-21961816)
chr8 (93-195)||(21961288-21961390)
chr8 (197-295)||(21960732-21960831)
chr8 (120-195)||(22013361-22013436)
chr8 (231-295)||(22011931-22011995)
chr8 (122-193)||(19735339-19735410)
chr8 (240-287)||(21962540-21962587)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (102-295)||(17424477-17424667)
[»] scaffold0314 (3 HSPs)
scaffold0314 (90-217)||(19664-19787)
scaffold0314 (149-275)||(19462-19585)
scaffold0314 (177-295)||(19587-19702)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (90-195)||(52071043-52071148)
chr1 (202-295)||(52071110-52071204)
chr1 (141-195)||(2363421-2363475)
chr1 (101-164)||(2363726-2363789)
chr1 (123-169)||(2363888-2363934)
[»] chr6 (12 HSPs)
chr6 (89-294)||(29907789-29907994)
chr6 (89-278)||(29906527-29906716)
chr6 (89-278)||(30117664-30117853)
chr6 (89-294)||(29907621-29907827)
chr6 (89-195)||(29906109-29906215)
chr6 (89-195)||(30118165-30118271)
chr6 (89-193)||(30120834-30120938)
chr6 (240-279)||(30120818-30120857)
chr6 (240-294)||(29906678-29906732)
chr6 (240-294)||(30117648-30117702)
chr6 (143-195)||(29906442-29906494)
chr6 (143-195)||(30117886-30117938)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (148-189)||(10022-10063)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 92 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50111522 - 50111318
Alignment:
Q  92 gcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaat 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50111522 gcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagttaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaat 50111423  T
Q  192 aatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaattt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50111422 aatgaatgtttatatcgagttttcatcctgaaagacgaagagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaattt 50111323  T
Q  291 aattt 295  Q
    |||||    
T  50111322 aattt 50111318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 127 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 50112962 - 50112808
Alignment:
Q  127 ttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaaga 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50112962 ttgattagtctgatcgtcaaagtatgatgattatagattaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgtttatatcgagttttcatcctggaaga 50112863  T
Q  226 cggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtct 280  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50112862 cgaagagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttataagctaagtct 50112808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50111356 - 50111277
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaat 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50111356 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtttgatagtcaaagtataatgattatagatcaaat 50111277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 125 - 193
Target Start/End: Original strand, 23669906 - 23669974
Alignment:
Q  125 atttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataa 193  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  23669906 atttgattagtctaatagtaatagtatgatgattatagagcaaataaacaagtaacttgaacaaaataa 23669974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32773049 - 32772832
Alignment:
Q  1 cacagtgtgtccatggtcgaaagcttaaacatggaaatttggtacaagatgaaataagttgatgatgaggagacacaaattcaggagaatagcttggttt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  32773049 cacagtgtgtccatggtcgaaagcttaaacatggaaatttgatacaagatgaaataagttgatgatgaggaggcacaaattcaggagaatagtttggttt 32772950  T
Q  101 gtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgt 200  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32772949 gtaagttaagtcttattaaatttaatttgatcagtctgatagtcaaagtatgatgattataaatcaaatgaacaaataaattgattaaaataatgaatgt 32772850  T
Q  201 ttatatcgagttttcatc 218  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  32772849 ttatatcgaattttcatc 32772832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Original strand, 21502878 - 21503058
Alignment:
Q  112 cttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgtttatatcgagt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  21502878 cttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaat----aatgtttatatcgagt 21502973  T
Q  212 tttca-tctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||| |||| |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21502974 tttcattctgaaagatgaatagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaattt 21503058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 212
Target Start/End: Original strand, 21503020 - 21503138
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21503020 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtacgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 21503119  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagtt 212  Q
    ||||||    |||||||||||||    
T  21503120 ataatg----tttatatcgagtt 21503138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 8)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 208190 - 207988
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  208190 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgataatcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaaataaattgactcaa 208091  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    ||    |||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  208090 at----aatgtttatatcgagttttcatccttgaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccatagatagcttggtttgtaagctaagtcttactaaat 207995  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    |||||||    
T  207994 ttaattt 207988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 208347 - 208152
Alignment:
Q  97 gtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatga 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |    
T  208347 gtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgatagtcaaactgtgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactcaaat----a 208252  T
Q  197 atgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  208251 atgtttatatcgagttttcatccttgaaaatgaaaattcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaattt 208152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 208616 - 208414
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  208616 tagcttggtttctaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtattatagtcaaagtatgatgattatatatcaaatgaacaagtaaattgactgaa 208517  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    ||||||     |||||| ||||||||||| | ||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  208516 ataatgc----ttatattgagttttcatccttgaagatgaaaagtcaaactttgaccaaaaccataggtaacttggtttgtaagccaagtcttactaaat 208421  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    | |||||    
T  208420 taaattt 208414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 208027 - 207921
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208027 atagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 207928  T
Q  189 aataatg 195  Q
    |||||||    
T  207927 aataatg 207921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 208449 - 208347
Alignment:
Q  93 cttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaata 192  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  208449 cttggtttgtaagccaagtcttactaaattaaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattaactgaaata 208350  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  208349 atg 208347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 208642 - 208578
Alignment:
Q  231 agtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  208642 agtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttctaagctaagtcttactaaatttaattt 208578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 212116 - 212045
Alignment:
Q  197 atgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggttt 267  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  212116 atgtttatatcgagttttcatcctggaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggttt 212045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 207197 - 207150
Alignment:
Q  240 ttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaa 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  207197 ttgaccaaaatcataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaa 207150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Original strand, 21961547 - 21961749
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  21961547 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgataatcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaaataaattgactcaa 21961646  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    ||    |||||||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21961647 at----aatgtttatatcgagttttcatccttgaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccatagatagcttggtttgtaagctaagtcttactaaat 21961742  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    |||||||    
T  21961743 ttaattt 21961749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Original strand, 22011957 - 22012156
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22011957 tagcttggtttgtaagctaagtcttgctaaatttaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattacagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 22012056  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    ||    |||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22012057 at----aatgtttatatcgagttttcatcctggaagatgaaaagttacactttgacgaaaaccattggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaat 22012152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Original strand, 21960793 - 21960995
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||    
T  21960793 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattatcgatcaaatgaacaaattaattgactgaa 21960892  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttca-tctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    |     ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21960893 a----caatgtttatatcgagttttcattcttgaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttctaagctaagtcttactaaat 21960988  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    |||||||    
T  21960989 ttaattt 21960995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Original strand, 21960957 - 21961159
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||    
T  21960957 tagcttggtttctaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattatcgatcaaatgaacaacttaattgactgaa 21961056  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttca-tctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    |     ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21961057 a----aaatgtttatatcgagttttcattctggaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttctaagctaagtcttactaaat 21961152  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    |||||||    
T  21961153 ttaattt 21961159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 295
Target Start/End: Original strand, 21961390 - 21961585
Alignment:
Q  97 gtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatga 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |    
T  21961390 gtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtatgatagtcaaactgtgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactcaaat----a 21961485  T
Q  197 atgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| | | | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21961486 atgtttatatcgagttttcatccttgaaaatgaaaattcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaattt 21961585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Original strand, 21961121 - 21961323
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21961121 tagcttggtttctaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtattatagtcaaagtatgatgattatatatcaaatgaacaagtaaattgactgaa 21961220  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaat 288  Q
    ||||||     |||||| ||||||||||| | ||||| | | ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  21961221 ataatgc----ttatattgagttttcatccttgaagatgaaaagtcaaactttgaccaaaaccataggtaacttggtttgtaagccaagtcttactaaat 21961316  T
Q  289 ttaattt 295  Q
    | |||||    
T  21961317 taaattt 21961323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Original strand, 21961710 - 21961816
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961710 atagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 21961809  T
Q  189 aataatg 195  Q
    |||||||    
T  21961810 aataatg 21961816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 195
Target Start/End: Original strand, 21961288 - 21961390
Alignment:
Q  93 cttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaata 192  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21961288 cttggtttgtaagccaagtcttactaaattaaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattaactgaaata 21961387  T
Q  193 atg 195  Q
    |||    
T  21961388 atg 21961390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 197 - 295
Target Start/End: Original strand, 21960732 - 21960831
Alignment:
Q  197 atgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21960732 atgtttatatcgagttttcatcctggaagatgaaaagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaattt 21960831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Original strand, 22013361 - 22013436
Alignment:
Q  120 atttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatg 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22013361 atttaatttgattagtatgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaatagactaaaataatg 22013436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 295
Target Start/End: Original strand, 22011931 - 22011995
Alignment:
Q  231 agtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22011931 agtcacactttgaccaaaaccataagtagcttggtttgtaagctaagtcttgctaaatttaattt 22011995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19735410 - 19735339
Alignment:
Q  122 ttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataa 193  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19735410 ttaatttgattagtgtaatagtcaaagtaagatgattatagatctaatgaacaagtaatttgactaaaataa 19735339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 287
Target Start/End: Original strand, 21962540 - 21962587
Alignment:
Q  240 ttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaa 287  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21962540 ttgaccaaaatcataggtagcttggtttgtaagctaagtcttactaaa 21962587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 295
Target Start/End: Original strand, 17424477 - 17424667
Alignment:
Q  102 taagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgtt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||    
T  17424477 taagctaagtcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaaatatgataattatagatcaaatgaactagtaaattgactaaaat----aatgtt 17424572  T
Q  202 tatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  17424573 tatatcgagttttcatcctgaaagacgaagagtcacactttgaccaaaaccatagatagtttggtctgtaaactaaatcttactaaatttaattt 17424667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0314
Description:

Target: scaffold0314; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 217
Target Start/End: Original strand, 19664 - 19787
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19664 tagcttggtttgtaagctaagtcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaaatatgatgattatagatcaaatgaacaattaaattgactaaa 19763  T
Q  190 ataatgaatgtttatatcgagttttcat 217  Q
    ||    ||||||||||||||||||||||    
T  19764 at----aatgtttatatcgagttttcat 19787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 149 - 275
Target Start/End: Original strand, 19462 - 19585
Alignment:
Q  149 tatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcacaatttgaccaa 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  19462 tatgatgataatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaat----aatgtttatatcgagttttcatcctggaagacgaaaagtcacactttgaccaa 19557  T
Q  248 aaccataggtagcttggtttgtaagcta 275  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19558 aacaataggtagcttggtttgtaagcta 19585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0314; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 19587 - 19702
Alignment:
Q  177 taaattgactaaaataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagcta 275  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19587 taaattgactaaaataatg----tttatatcgagttttcatcctggaagacgaaaagtcacactttgaccaaaacaataggtagcttggtttgtaagcta 19682  T
Q  276 agtctttctaaatttaattt 295  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  19683 agtcttactaaatttaattt 19702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 52071148 - 52071043
Alignment:
Q  90 tagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52071148 tagcttggtttgtaagctaagttttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 52071049  T
Q  190 ataatg 195  Q
    ||||||    
T  52071048 ataatg 52071043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 52071204 - 52071110
Alignment:
Q  202 tatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcacaatttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaattt 295  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  52071204 tatatcgagttttcatcctggaagacgaaaagtcacactttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagttttactaaatttaattt 52071110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 195
Target Start/End: Original strand, 2363421 - 2363475
Alignment:
Q  141 agtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatg 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2363421 agtcaaagtatgatgataatagatcaaatgaaacagtaacttgactaaaataatg 2363475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 2363726 - 2363789
Alignment:
Q  101 gtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagat 164  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  2363726 gtaagctaagtataactaaatttaatttgattagtataattgtcaaagtatgatgataatagat 2363789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Original strand, 2363888 - 2363934
Alignment:
Q  123 taatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaat 169  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2363888 taatttgattagtatgattgtcaaagtatgatgataatagatcaaat 2363934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 12)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29907994 - 29907789
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||| |   |||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||| ||||||||    
T  29907994 atagcttggtttgtaagctaagtcgtactatagataattagattagtgtataagtcaaagtatgatgaatatataatcaatgaacaagtaacttgactaa 29907895  T
Q  189 aataatgaatgtttatatcgagttttcat-ctggaagacggagagtcaca---atttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttct 284  Q
    |||    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  ||||||     ||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  29907894 aat----aatgtttaaatcgagttttcatcctggaagacgaaaggtcacaccttgttgaccacaaccttagatagcttggtgtgtaagttaagtcttact 29907799  T
Q  285 aaatttaatt 294  Q
    | | ||||||    
T  29907798 atagttaatt 29907789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29906716 - 29906527
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||   ||||||| || ||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||    
T  29906716 atagcttgggttgtaagctaagtcttactatagttaattagactagtctataagtcaaactaggatgaatatataaccgatgaacaagtaacttgactaa 29906617  T
Q  189 aataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcaca---atttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagt 278  Q
    |||    | |||||| |||||||||||||| ||||||| | |  ||||||     |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  29906616 aat----attgtttaaatcgagttttcatcttggaagatgaaaggtcacaccttgttgaccaaaaccgtagatagtttggtttgtaagctaagt 29906527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 278
Target Start/End: Original strand, 30117664 - 30117853
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||||||   ||||||| || ||||| |||| | |  |||||||||||| ||||||||    
T  30117664 atagcttgggttgtaagctaagtcttactatagttaattagactagtctataagtcaaactaggatgaatatataaccgatgaacaagtaacttgactaa 30117763  T
Q  189 aataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcaca---atttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagt 278  Q
    |||    | |||||| |||||||||||||| ||||||| | |  ||||||     |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30117764 aat----attgtttaaatcgagttttcatcttggaagatgaaaggtcacaccttgttgaccaaaaccgtagatagtttggtttgtaagctaagt 30117853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29907827 - 29907621
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctg-atagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgacta 187  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||| || |||| |  | |||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||| |||||||    
T  29907827 atagcttggtgtgtaagttaagtcttactatagttaattagagtagtgtataaagtcaaagtaggatgaatatataaccaatgaacaagtaatttgacta 29907728  T
Q  188 aaataatgaatgtttatatcgagttttcatc-tggaagacggagagtcaca---atttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttc 283  Q
    ||||    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| |  | ||||     ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  29907727 aaat----aatgtttaaatcgagttttcagcatggaagacgaaaggccacaccttgttgaccacaaccgtagatagcttgggttgtaagctaagtcttac 29907632  T
Q  284 taaatttaatt 294  Q
    || | ||||||    
T  29907631 tatagttaatt 29907621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29906215 - 29906109
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||| |   |||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  29906215 atagcttggtttgtaagttaactcttactatagataattagactagtgtataagtcaaagtaggatgaatatataaccaatgaacaagtaacttgactaa 29906116  T
Q  189 aataatg 195  Q
    |||||||    
T  29906115 aataatg 29906109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Original strand, 30118165 - 30118271
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||| || |||| |   |||||||||| ||||| |||| | | ||||||||||||| ||||||||    
T  30118165 atagcttggtttgtaagttaactcttactatagataattagactagtgtataagtcaaagtaggatgaatatataaccaatgaacaagtaacttgactaa 30118264  T
Q  189 aataatg 195  Q
    |||||||    
T  30118265 aataatg 30118271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 193
Target Start/End: Original strand, 30120834 - 30120938
Alignment:
Q  89 atagcttggtttgtaagctaaatcttactaaatttaatttgattagtctgatagtcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaa 188  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||| || |||| |   |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||| |||    
T  30120834 atagcttggtttgtaagctaagtcgtactatagataattagactagtgtataagtcaaagtatgatgaatatataaccaatgaacaagtaacttgagtaa 30120933  T
Q  189 aataa 193  Q
    |||||    
T  30120934 aataa 30120938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 279
Target Start/End: Original strand, 30120818 - 30120857
Alignment:
Q  240 ttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtc 279  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30120818 ttgaccaaaaccatagatagcttggtttgtaagctaagtc 30120857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29906732 - 29906678
Alignment:
Q  240 ttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaatt 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  29906732 ttgaccaaaaccgtagatagcttgggttgtaagctaagtcttactatagttaatt 29906678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 240 - 294
Target Start/End: Original strand, 30117648 - 30117702
Alignment:
Q  240 ttgaccaaaaccataggtagcttggtttgtaagctaagtctttctaaatttaatt 294  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  30117648 ttgaccaaaaccgtagatagcttgggttgtaagctaagtcttactatagttaatt 30117702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29906494 - 29906442
Alignment:
Q  143 tcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatg 195  Q
    |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  29906494 tcaaagtatgatgaatatataacctatgaacaagtaacttgactaaaataatg 29906442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Original strand, 30117886 - 30117938
Alignment:
Q  143 tcaaagtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaaataatg 195  Q
    |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30117886 tcaaagtatgatgaatatataacctatgaacaagtaacttgactaaaataatg 30117938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10063 - 10022
Alignment:
Q  148 gtatgatgattatagatcaaatgaacaagtaaattgactaaa 189  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  10063 gtatgatgattatagatctaatgaacatgtaatttgactaaa 10022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University