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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2700_high_88 (Length: 211)

Name: NF2700_high_88
Description: NF2700
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2700_high_88
NF2700_high_88
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (1-196)||(25885158-25885353)
chr1 (5-196)||(23396707-23396898)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (5-196)||(5252839-5253030)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (5-196)||(38694096-38694287)
chr7 (13-196)||(4475536-4475719)
chr7 (5-196)||(9118088-9118279)
chr7 (5-196)||(39665256-39665447)
chr7 (5-196)||(28620021-28620212)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (5-196)||(3996776-3996967)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (5-196)||(41321088-41321279)
chr2 (5-196)||(13855422-13855613)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (5-196)||(6643723-6643914)
[»] scaffold0416 (1 HSPs)
scaffold0416 (5-196)||(5895-6086)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (5-196)||(11146502-11146693)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (5-196)||(7548272-7548463)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25885353 - 25885158
Alignment:
Q  1 atttcaaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagtttta 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25885353 atttcaaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcaacaaaagttatggacacaaaactgagtttta 25885254  T
Q  101 ccgattcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25885253 ccgattcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaattagtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 25885158  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 23396707 - 23396898
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23396707 caaatttattttatttcatgccaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga 23396806  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23396807 ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagaaaaacttatattagtagttgcatttggttat 23396898  T

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Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5253030 - 5252839
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5253030 caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttcgaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgaattttaccga 5252931  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5252930 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatcctcaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat 5252839  T

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Target: chr7 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 38694096 - 38694287
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  38694096 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga 38694195  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38694196 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagccaaacttatattagtagttgcatttggttat 38694287  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 4475536 - 4475719
Alignment:
Q  13 ttttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccgattcaattg 112  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4475536 ttttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgagttttaccgattcaattg 4475635  T
Q  113 ttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4475636 ttgagaattgatacgtctttattatccaaaaatttgtatattattattcaagacaaacttatattagttgttgcatttggttat 4475719  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 9118088 - 9118279
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  9118088 caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaagacttagttttaccga 9118187  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9118188 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagtcaaacttatcttagtagttgcatttggttat 9118279  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39665447 - 39665256
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  39665447 caaatttattttatttcatgccaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttactga 39665348  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39665347 ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttagttat 39665256  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 28620021 - 28620212
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  28620021 caaatttattttatttcatgccaggacgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcaacaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga 28620120  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28620121 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagccaaacttatattagtagttgcatttggttat 28620212  T

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Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 3996776 - 3996967
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3996776 caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga 3996875  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3996876 ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat 3996967  T

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Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 41321088 - 41321279
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41321088 caaatttattttatttcatgccaagttgatcatcatctttatgataaatttttgatttggaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgagttttaccga 41321187  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41321188 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattattcacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat 41321279  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13855613 - 13855422
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  13855613 caaatttattttatttcatgtcaggtatatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatagacacaaaaatgagttttaccga 13855514  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13855513 ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattacgcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat 13855422  T

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Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6643914 - 6643723
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6643914 caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttgaaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga 6643815  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6643814 ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat 6643723  T

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Target: scaffold0416 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0416
Description:

Target: scaffold0416; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 5895 - 6086
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  5895 caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga 5994  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5995 ttcaattgttgagaattgatatgtctttattatccacgaatttgtatattattactcaagcaaaaattatattagtagttgcatttggttat 6086  T

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Target: chr6 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 11146502 - 11146693
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  11146502 caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttactga 11146601  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11146602 ttcaattgttgagaattgacacgtctttatcatccataaatttgtatattattactcaaaacaaacttatattagtagttgcatttggttat 11146693  T

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Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7548463 - 7548272
Alignment:
Q  5 caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  7548463 caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatcttggtgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga 7548364  T
Q  105 ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat 196  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  7548363 ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatactattactcaagccaaccttatattagtagttgcatttggttat 7548272  T

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