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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2700_low_92 (Length: 211)
Name: NF2700_low_92
Description: NF2700
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2700_low_92 |
 | |
|
| [»] scaffold0416 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25885353 - 25885158
Alignment:
| Q |
1 |
atttcaaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagtttta |
100 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25885353 |
atttcaaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcaacaaaagttatggacacaaaactgagtttta |
25885254 |
T |
|
| Q |
101 |
ccgattcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25885253 |
ccgattcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaattagtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
25885158 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 23396707 - 23396898
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23396707 |
caaatttattttatttcatgccaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga |
23396806 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23396807 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagaaaaacttatattagtagttgcatttggttat |
23396898 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5253030 - 5252839
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5253030 |
caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttcgaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgaattttaccga |
5252931 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5252930 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatcctcaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
5252839 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 38694096 - 38694287
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
38694096 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga |
38694195 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38694196 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagccaaacttatattagtagttgcatttggttat |
38694287 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 4475536 - 4475719
Alignment:
| Q |
13 |
ttttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccgattcaattg |
112 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4475536 |
ttttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgagttttaccgattcaattg |
4475635 |
T |
|
| Q |
113 |
ttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4475636 |
ttgagaattgatacgtctttattatccaaaaatttgtatattattattcaagacaaacttatattagttgttgcatttggttat |
4475719 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 9118088 - 9118279
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
9118088 |
caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaagacttagttttaccga |
9118187 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9118188 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagtcaaacttatcttagtagttgcatttggttat |
9118279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39665447 - 39665256
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
39665447 |
caaatttattttatttcatgccaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttactga |
39665348 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
39665347 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttagttat |
39665256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 28620021 - 28620212
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
28620021 |
caaatttattttatttcatgccaggacgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcaacaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga |
28620120 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28620121 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagccaaacttatattagtagttgcatttggttat |
28620212 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 3996776 - 3996967
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3996776 |
caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga |
3996875 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3996876 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
3996967 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 41321088 - 41321279
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41321088 |
caaatttattttatttcatgccaagttgatcatcatctttatgataaatttttgatttggaatcagcaaaagtcatggacacaaaactgagttttaccga |
41321187 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41321188 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattattcacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
41321279 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13855613 - 13855422
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13855613 |
caaatttattttatttcatgtcaggtatatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatagacacaaaaatgagttttaccga |
13855514 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13855513 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattacgcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
13855422 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6643914 - 6643723
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6643914 |
caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttgaaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttaccga |
6643815 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6643814 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
6643723 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0416 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0416
Description:
Target: scaffold0416; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 5895 - 6086
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
5895 |
caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatctttatgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga |
5994 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5995 |
ttcaattgttgagaattgatatgtctttattatccacgaatttgtatattattactcaagcaaaaattatattagtagttgcatttggttat |
6086 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 11146502 - 11146693
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| || |
|
|
| T |
11146502 |
caaatttattttatttcatgtcaggtttatcatcatctttatgatgaatttttgatttggaatcaccaaaagtcatggacacaaaaatgagttttactga |
11146601 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11146602 |
ttcaattgttgagaattgacacgtctttatcatccataaatttgtatattattactcaaaacaaacttatattagtagttgcatttggttat |
11146693 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7548463 - 7548272
Alignment:
| Q |
5 |
caaatttattttatttcatgtcaggttgatcatcatctttatgatgaattttttatttggaatcagcaaaagttatggacacaaaactgagttttaccga |
104 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7548463 |
caaatttattttatttcatgccaggttgatcatcatcttggtgatgaattttcaatttggaatcagcaaaaatcatggacacaaaacttagttttaccga |
7548364 |
T |
|
| Q |
105 |
ttcaattgttgagaattgatacatctttattatccacaaatttgtatattattactcaagacaaatttatattagtagttgcatttggttat |
196 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7548363 |
ttcaattgttgagaattgatacgtctttattatccacaaatttgtatactattactcaagccaaccttatattagtagttgcatttggttat |
7548272 |
T |
|
Back To:
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