View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2710_low_3 (Length: 476)
Name: NF2710_low_3
Description: NF2710
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2710_low_3 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Original strand, 32672620 - 32673071
Alignment:
| Q |
12 |
ataagaatacagataaacttgttaatagaataaaacatagaacaccaaacgtgcaccaatgatgcacacagaacattatgcatatcattcattcattata |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
32672620 |
ataagaatacagataaacttgttaatagaataaaacatagaacaccaaacgtgcaccaatgatgcacacagaacattatgcatctcattcattcattata |
32672719 |
T |
|
| Q |
112 |
ctgaatactcatgtgttactgaaaccaaatagataaatacacaaattgttattttcgacaatgtaaatacacaaattgttgattgaaaatgtaggatata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32672720 |
ctgaatactcatgtgttactgaaaccaaatagataaatacacaaattgttattttcgacaatgtaaatacacaaattgttgattgaaaatgtaggatata |
32672819 |
T |
|
| Q |
212 |
tatttcaaaatgatttacgaaattgtatgagtttaatcaaattcgtccctggatttgtatatgaccagaattacattaaattgtaaatatcgacaatgaa |
311 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32672820 |
tatttcaaaatgatttatgaaattgtaagagtttaatcaaattcgtccctggatttgtatatgaccagaattacattaaattgtaaatatcgacaatgaa |
32672919 |
T |
|
| Q |
312 |
tttgaaattaaataaataatgttaatgatccatttgataacagattcacacacatatagacgaactcgcatgaaaattgactatgcatcataaacagtac |
411 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32672920 |
tttgaaa-taaataaataatgttaatgatccatttgataacagattcacacac--atagacgaactcgcatgaaaattgactatgcatcataaacagtac |
32673016 |
T |
|
| Q |
412 |
aacacaatttaaacatgcacaaaataaaatgtaaacttttaaagaacatattctt |
466 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32673017 |
aacacaatttaaacatgcacaaaataaaatgtaaaattttaaagaacatattctt |
32673071 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University