View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2716_low_1 (Length: 564)

Name: NF2716_low_1
Description: NF2716
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2716_low_1
NF2716_low_1
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (18-547)||(39131945-39132480)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (22-461)||(26690345-26690781)
chr3 (22-461)||(26731656-26732092)
chr3 (22-461)||(26694506-26694942)
chr3 (22-464)||(26698512-26698951)
chr3 (22-464)||(26733675-26734114)
chr3 (193-464)||(26751004-26751275)
chr3 (22-485)||(26675300-26675760)
chr3 (148-464)||(26737023-26737339)
chr3 (148-464)||(26744034-26744350)
chr3 (22-464)||(26713664-26714103)
chr3 (337-485)||(47212387-47212535)
chr3 (202-488)||(47193355-47193641)
chr3 (142-254)||(47212192-47212304)
chr3 (22-123)||(26736900-26737001)
chr3 (22-123)||(26750836-26750937)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (25-531)||(21130263-21130775)
chr7 (21-531)||(18658421-18658937)
chr7 (21-531)||(21111299-21111815)
chr7 (21-267)||(21123131-21123377)
chr7 (22-476)||(21098492-21098943)
chr7 (22-476)||(21108111-21108562)
chr7 (337-440)||(29213149-29213252)
chr7 (180-253)||(29212992-29213065)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 18 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 39132480 - 39131945
Alignment:
Q  18 aatcccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattct 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39132480 aatcccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattct 39132381  T
Q  118 gaattactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggcttta 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39132380 gaattactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggcttta 39132281  T
Q  218 tatcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgc-aagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaag-- 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| | | || ||||| | |||||| | |||||| |||| ||||| |||      
T  39132280 tatcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtagataagctaggactc-tagctgttcctaaagcaatatcataccttttactccaatcaagca 39132182  T
Q  315 ----tgcatttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacatacc 410  Q
         |  || ||||| | ||| || ||||||||  | || | |||||||||| | || || | ||| || || || ||  ||||||| ||||||||  |    
T  39132181 tgttagttttagatgaaagattttcagctaaagagtcattcttcatgtactcatataccaaaattctatgcttaccttcaacacaatatccccacatttc 39132082  T
Q  411 aatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcattcaatctctttattgctgcttgt 510  Q
    ||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39132081 aattaagttcatgtgattgagccttccgatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcattcaatctctttattgctgcttgt 39131982  T
Q  511 ctttgatccggcaatgtacctaggtatacaacccctc 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39131981 ctttgatccggcaatgtacctaggtatacaacccctc 39131945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26690781 - 26690345
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||   |||||    
T  26690781 ccatagctataaacatctaccttggaagtgattggcaagttgaaaatccattcaggtgccatgtaacctcttgttcctctcatccttgagaaacttgaat 26690682  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    ||  |   | |||||| || | |   | ||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||    
T  26690681 tatca---agattgttcctttgtagtaacttagacaacccaaaatccgctaccttgggttggtaattggagtcaattagtatgttttgcggctttatgtc 26690585  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690584 acaatgcaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 26690485  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26690484 gatgacaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 26690385  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26690384 tgtggttaagccttccaatgacgctaacttcagcaagaaa 26690345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26732092 - 26731656
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||   |||||    
T  26732092 ccatagctataaacatctaccttggaagtgattggcaagttgaaaatccattcaggtgccatgtaacctcttgttcctctcatccttgagaaacttgaat 26731993  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    ||  |   | |||||| || | |   | ||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || | ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||    
T  26731992 tatca---agattgttcctttgtagtaacttagacaacccaaaatccgctaccttgggttggtaatcagagtcaattagtatgttttgcggctttatgtc 26731896  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731895 acaatgcaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 26731796  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26731795 gatgacaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 26731696  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26731695 tgtggttaagccttccaatgacgctaacttcagcaagaaa 26731656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 22 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26694942 - 26694506
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||||| |||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||||||   |||||    
T  26694942 ccatagctataaacatctaccttggaagtgattggcaagttgaaaatccattcaggtcccatgtaacctcttgttcctctcatccttgagaaacttgaat 26694843  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    ||  |   | |||||| || | |   | ||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || || || ||||  ||||| ||||| |||||||| ||    
T  26694842 tatca---aaattgttcctttgtactaacttagacaacccaaaatccgctaccttgggttggtaattggagtcaattagtatgttttgcggctttatgtc 26694746  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26694745 acaatgcaaaatccactccaaacattcttcatgtaaataggcaagacactttgcagttccgagagcaattttgtacctcttaccccaattaagcgcattt 26694646  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26694645 gatgacaaattatcagttaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 26694546  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaa 461  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  26694545 tgtggttaagccttccaatgacgctaagttcagcaagaaa 26694506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 22 - 464
Target Start/End: Original strand, 26698512 - 26698951
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| | ||||| | |||||    
T  26698512 ccatagctataaacatccacttttgaagtaatttgcatgttgaaaacccattcaggtgccatgtaacctcttgtccctcgaatcctcgagaaatttgaat 26698611  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    ||  |  | ||||    |||||    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  || |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  26698612 tatcaaggtcattc---ctattcaatagcttagacaaaccaaaatctgctaccttaggttgataatccgagtcaacaagtatgttttgtggctttatatc 26698708  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||    
T  26698709 gcaatgcaaaatccactccaaacactcttcgtgtaaataagcaagaccctttgcagttcccatagcaatgttataccttttaccccaatcaagttcactt 26698808  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  26698809 gatgagagattatcagctaaagtaccattttccatgtactcataaaccaacaatctgtgttttccctcggcacaataaccccacattcctatcaaattca 26698908  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactc 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26698909 tgtgattaagccttccaatgatgctaacttcagcaagaaactc 26698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 464
Target Start/End: Original strand, 26733675 - 26734114
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| | ||||| | |||||    
T  26733675 ccatagctataaacatccacttttgaagtaatttgcatgttgaaaacccattcaggtgccatgtaacctcttgtccctcgaatcctcgagaaatttgaat 26733774  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    ||  |  | ||||    |||||    ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  || |||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  26733775 tatcaaggtcattc---ctattcaatagcttagacaaaccaaaatctgctaccttaggttgataatccgagtcaacaagtatgttttgtggctttatatc 26733871  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||| |||| || ||    
T  26733872 gcaatgcaaaatccactccaaacactcttcgtgtaaataagcaagaccctttgcagttcccatagcaatgttataccttttaccccaatcaagttcactt 26733971  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  26733972 gatgagagattatcagctaaagtaccattttccatgtactcataaaccaacaatctgtgttttccctcggcacaataaccccacattcctatcaaattca 26734071  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactc 464  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26734072 tgtgattaagccttccaatgatgctaacttcaacaagaaactc 26734114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 193 - 464
Target Start/End: Original strand, 26751004 - 26751275
Alignment:
Q  193 tcaagaagtatattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattt 292  Q
    |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| |    
T  26751004 tcaacaagtatgttttgcggttttatatcgcaatgcaaaatccactccaaacattcttcgtgtaaatacgcaagtccctttgcagttcccatagcaatgt 26751103  T
Q  293 tatacctcttaccccaattaagtgcatttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgc 392  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||| ||    
T  26751104 tatacctcttaccccaatcaagttcatttgatgagagattatcagctaaagtacccttttccatgtactcataaaccaacaatctatgctttccctcagc 26751203  T
Q  393 acaatacccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactc 464  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26751204 acaataaccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgctaacttcggcaagaaactc 26751275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 26675300 - 26675760
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||||||||||||||| || || || || ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |||||||   |||||    
T  26675300 ccataactataaacatctaccttggaagtgattggcaagttgaaaatccattcaggtgccatgtaacctcttgttcctctcatccttgagaaacttgaat 26675399  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    || ||   | |||||| |||| |   ||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| | || | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26675400 tatta---agattgttcctatgtaatagcttagacaacccaaaatctactattttgggtcggtaatcagagtcaataagtatgttttgaggctttatatc 26675496  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcattt 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26675497 acaatgcaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagagcctttgcggttcctagagcaatgttatacctcttaccccaatcaagtgcattt 26675596  T
Q  322 gatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattca 421  Q
    |||||||  || || ||||||||||| ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  26675597 gatgagaggttttcagctaaagaacccttttctacgaactctaaaaccaacaatctgtgttttccggctaaacaataccccaacatgccaattaagttca 26675696  T
Q  422 tgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttc 485  Q
    | ||||| ||| ||||||| ||| | ||||| ||||| || |||| ||| ||||| || |||||    
T  26675697 tatggttgagcattccaattatgttcacttccgcaaggaattctctttcaccttggtttgcttc 26675760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 148 - 464
Target Start/End: Original strand, 26737023 - 26737339
Alignment:
Q  148 agcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactccaaacatt 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| |||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  26737023 agcttagacaaaccaaaatctgcaaccttaggtcgataatcagagtcaacaagtatgttttgcggctttatatcgcaatgcaaaatccactccaaacact 26737122  T
Q  248 cttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcatttgatgagaaattatccgctaaagaacc 347  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||   ||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  26737123 cttcatgtaaataagcaagacattttgcagttcctatagcaataccatatctctttccccaatcaagttcatttgatgagagattatcagctaaagtacc 26737222  T
Q  348 tttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgctt 447  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26737223 attttccatgtactcataaaccaacaatttatgttttccctcagcacaataaccccacattccaattaaattcatgtggttaagccttccaatgatgcta 26737322  T
Q  448 acttcagcaagaaactc 464  Q
    ||||| |||||||||||    
T  26737323 acttctgcaagaaactc 26737339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 148 - 464
Target Start/End: Original strand, 26744034 - 26744350
Alignment:
Q  148 agcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactccaaacatt 247  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||| || | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26744034 agcttggacaaaccaaaatccgctaccttcggttggtaatcagagtcaacaagtatgttttgcggctttatatcacaatgcaaaatccactccaaacatt 26744133  T
Q  248 cttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcatttgatgagaaattatccgctaaagaacc 347  Q
    |||| |||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  26744134 cttcgtgtaaataagcaaggccctttgcagttcccatagcaatgttataccttttactccaatcaagtttatttgatgaaagattatcggctaaagtacc 26744233  T
Q  348 tttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgctt 447  Q
     ||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26744234 gttttccatgcactcgtaaaccaacaatctatgttttccctcagcacaatagccccacataccaattaagttcatgtggttaagccttccaatgatgctt 26744333  T
Q  448 acttcagcaagaaactc 464  Q
    |||||||||||||||||    
T  26744334 acttcagcaagaaactc 26744350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 464
Target Start/End: Original strand, 26713664 - 26714103
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  26713664 ccatagctataaacatccacttttgaagtgatttgcatgttgaaaacccattcaggtgccatgtaacctcgtgtccctcgaatccttgagaagtttgaat 26713763  T
Q  122 tactattgacattg--tttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttata 219  Q
    ||  ||   ||||   |||| ||     ||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||| |||| | | | |||| |||||| ||||| |||||||||    
T  26713764 tatcatgctcattccttttcaat-----agcttagacaaaccaaaatctgcaaccttaggtcgataatcatagtcaacaagtatgttttgcggctttata 26713858  T
Q  220 tcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcat 319  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||   ||| ||||| ||||||| |||| |||    
T  26713859 tcgcaatgcaaaatccactccaaacactcttcatgtaaataagcaagacattttgcagttcctatagcaataccatatctctttccccaatcaagttcat 26713958  T
Q  320 ttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaatt 419  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26713959 ttgataagagattatcagctaaagtaccattttccatgtactcataaaccaacaatttatgttttccctcagcacaataaccccacattccaatcaaatt 26714058  T
Q  420 catgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactc 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26714059 catgtggttaagccttccaatgatgctaacttctgcaagaaactc 26714103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 337 - 485
Target Start/End: Original strand, 47212387 - 47212535
Alignment:
Q  337 gctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttc 436  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| | || | || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47212387 gctaaagaaccattatccatgaactcatacacaagcattctatgttttccctctgcacaataaccccacatttcaatcaaattcatgtggttaagctttc 47212486  T
Q  437 caatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttc 485  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  47212487 caatgctgcttacttctgcgagaaactcttcttcgccttgatttgcttc 47212535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 47193641 - 47193355
Alignment:
Q  202 atattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacactttgcagttccgagagcaattttatacctct 301  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| || | ||  || || ||||| | ||| |  ||| ||||||    
T  47193641 atattttgaggtttcacatcacaatgtaaaacccattccaaacactcttcatgtaaataagccaaacctttagctgttccaacagctacattaaacctct 47193542  T
Q  302 taccccaattaagtgcatttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaataccc 401  Q
    ||  ||||| ||||| ||| ||  | | ||| |||||||||||||| | ||| || |||||| | || || |  || ||||| || ||  ||||||| ||    
T  47193541 tattccaatcaagtgaattagaacatagattctccgctaaagaaccatgttctatatactcatagaccaaaagcctatgtttcccttcaacacaatatcc 47193442  T
Q  402 ccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcatt 488  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| | | | |||||  |||||| |||||| ||||| ||  |||| || |||| |||||||||    
T  47193441 ccacatatcaattaaattcatatggttcaacataccaattgtgcttatttcagctagaaattcagcttctccctgatgagcttcatt 47193355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 47212192 - 47212304
Alignment:
Q  142 tttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactcca 241  Q
    |||||||  || ||||| ||||| ||||  | ||| |||||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  47212192 tttctcaatttcgacaaaccaaaatctgaaatctttggttgataattagaatccaaaagaatgttttgtggcttcacatcacaatgcaaaatccactcca 47212291  T
Q  242 aacattcttcatg 254  Q
    |||| ||||||||    
T  47212292 aacactcttcatg 47212304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 26736900 - 26737001
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |||| |||| ||||||| | |||||    
T  26736900 ccatagctataaacatccacttttgaagtgatttgcatgttgaaaacccattcaggtgccatgtaacctcgtgtccctcgaatccttgagaagtttgaat 26736999  T
Q  122 ta 123  Q
    ||    
T  26737000 ta 26737001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 123
Target Start/End: Original strand, 26750836 - 26750937
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||| | ||||| | |||||    
T  26750836 ccatagctataaacgtccactttagaagtgatttgcatgttgaaaacccattcaggtgccatgtaacctcttgtccctcgaatcctcgagaaatttgaat 26750935  T
Q  122 ta 123  Q
    ||    
T  26750936 ta 26750937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 531
Target Start/End: Original strand, 21130263 - 21130775
Alignment:
Q  25 taactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaattac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  21130263 taactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaatccactcaggtgccatatatcctcgtgttcctctaatcattgagaatcctgaactat 21130362  T
Q  125 tattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcaca 224  Q
    ||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21130363 tatcgagattgtttcgattttgtagcttagacaatccaaaatcggctaacttgggctgaaagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcaca 21130462  T
Q  225 atgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgc-aagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagt------gc 317  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || | | || ||||| | |||||| | |||||| |||  ||||| ||||      |     
T  21130463 atgcaaaatccattccaaacattcttcatgtagatatgctaaaactc-tagctgttcctaaagcaatatcataccttttagtccaatcaagtgtgttggt 21130561  T
Q  318 atttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaa 417  Q
     || ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | || || | ||| || || || ||  ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  21130562 tttggatgaaagattttccgctaaagaaccattttccatgtactcatataccaaaattctatgcttaccttcaacacaatatccccacatttcaatcaaa 21130661  T
Q  418 ttcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcattcaatctctttattgctgcttgtctttgat 517  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21130662 ttcatgtggttaagcttttcaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttctccttgtttagcttcattcaatctctttattgctgcatctctttgat 21130761  T
Q  518 ccggcaatgtacct 531  Q
    ||||||||||||||    
T  21130762 ccggcaatgtacct 21130775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 531
Target Start/End: Original strand, 18658421 - 18658937
Alignment:
Q  21 cccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 120  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658421 cccataaccataaacatccactttagatgttattggcaaattgaaaatccactcaggggccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 18658520  T
Q  121 ttactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatat 220  Q
    ||| |||| | | ||||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18658521 ttattattaagactgtttcgggttttcagcttagataatccaaaatctgctaacttagggtgaaagttagaatcaagaagtatgttttgaggctttatat 18658620  T
Q  221 cacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacacttt-gcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagt---- 315  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| || ||||| | |||||| | |||||| |||| ||| | ||||        
T  18658621 cacaatgcaaaatccattccaaacattcttcatgtagataagctaga-actttagctgttcctaaagcaatatcataccttttactccagtcaagtgtgt 18658719  T
Q  316 --gcatttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaat 413  Q
      |  || ||||| | ||| || |||||||| || ||||||||||||||| | || || | ||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||    
T  18658720 tagttttagatgaaagattttcagctaaagatccattttccatgtactcatataccaaaagtctatgcttaccttcagcacaatatccccacatatcaat 18658819  T
Q  414 caaattcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcattcaatctctttattgctgcttgtctt 513  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18658820 caagttcatgtggttaagccgtccaatgatgcttacttcagcaagaaattctccttctccttgtttagcttcatttaatctctttattgctgcatgtctt 18658919  T
Q  514 tgatccggcaatgtacct 531  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  18658920 tgatctggcaatgtacct 18658937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 21 - 531
Target Start/End: Original strand, 21111299 - 21111815
Alignment:
Q  21 cccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111299 cccataactataaacatccactttagatgttattggtgaattggaaatccattcaggggccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 21111398  T
Q  121 ttactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatat 220  Q
    ||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111399 ttattattaagattgtttctgcttttcagcttagacaatccaaaatctgctaacttgggctgaaagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatat 21111498  T
Q  221 cacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaagacact-ttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagt---- 315  Q
    ||||||| || ||||| || | |||||||||||||| ||| |||||| ||| | || ||||| | |||||| | |||||| |||| ||||| ||||        
T  21111499 cacaatgcaatatccattcgagacattcttcatgtagataagcaaga-actctagctgttcctaaagcaatatcataccttttactccaatcaagtgtgt 21111597  T
Q  316 --gcatttgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaat 413  Q
      |  || ||||| | ||| || |||||||| || ||||||||||||||| | || || | ||| || || || || |||||||| ||||||||  | ||    
T  21111598 tagttttagatgaaagattttcagctaaagatccattttccatgtactcatataccaaaagtctatgcttaccttcagcacaatatccccacatttctat 21111697  T
Q  414 caaattcatgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttgattagcttcattcaatctctttattgctgcttgtctt 513  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  21111698 caagttcatgtggttaagccgtccaatgatacttacttcggcaagaaattctccttctccttgtttagcttcatttaatctctttattgctacatgtctt 21111797  T
Q  514 tgatccggcaatgtacct 531  Q
    | ||| ||||||||||||    
T  21111798 tcatctggcaatgtacct 21111815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 267
Target Start/End: Original strand, 21123131 - 21123377
Alignment:
Q  21 cccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21123131 cccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattggaaatccattcaggggccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaa 21123230  T
Q  121 ttactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatat 220  Q
    ||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21123231 ttattattaagattgtttctgcttttcagcttagacaatccaaaatctgctaacttgggttgaaagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatat 21123330  T
Q  221 cacaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgcaaga 267  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  21123331 cacaatgcaaaatccactccatacattcttcatgtagataagcaaga 21123377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21098943 - 21098492
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |    |||||    
T  21098943 ccatagctataaacatctactttagatgttattggcaaattgaaaatccattctggggccatataccctcttgttcctctaatcatagatacacttgaat 21098844  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    |    |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21098843 tg---ttgagattgtttctgttttgcagcttagacaatccaaaatccgctaacttgggttcgaagttagaatcaagaagtatattttgcggctttatatc 21098747  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgc-aagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcatt 320  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || | || |  ||   | ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||  |||    
T  21098746 acaatgtaaaatccattccaaacattcttcatgtagatatgctaaaactc-ttcctattgataaagcaattttgtaccttttactccaatcaagtttatt 21098648  T
Q  321 tgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattc 420  Q
     |  || || || || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||    
T  21098647 agccgataagttttcggctaaagaaccattttccatgtactcgtaaaccaatagtctatattttccctcagcgcaatatccccacatttcgatcaaattc 21098548  T
Q  421 atgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttg 476  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21098547 atgtgattaagccttccaatgattcctacttcagctagaaattcaccttcaccttg 21098492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21108562 - 21108111
Alignment:
Q  22 ccataactataaacatccactttagatgttattggtaaattgaaaacccattcaggagccatatatcctcttgttcctctaatcattgagaattctgaat 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||    
T  21108562 ccataactataaacatccaccttagatgttattggcaaattgaaaatccattcaggtgccatataccctcttgttcctctaatcattgagatgcatgaat 21108463  T
Q  122 tactattgacattgtttctatttctcagcttagacaatccaaagtctgctaacttgggttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatc 221  Q
    || ||  |   ||||| || |||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21108462 tattaagg---ttgttcctgttttgcagctttgacaatccaaaatcggctaacttgggctggaagttagaatcaagaagtatgttttgtggctttatatc 21108366  T
Q  222 acaatgtaaaatccactccaaacattcttcatgtaaatatgc-aagacactttgcagttccgagagcaattttatacctcttaccccaattaagtgcatt 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||  ||   | | ||||||| ||||| |||| ||||| ||||  |||    
T  21108365 acaatgcaaaatccactccaaacattcttcatgtagatatgctaaaactc-ttgctattgataaaacaattttgtaccttttactccaatcaagtttatt 21108267  T
Q  321 tgatgagaaattatccgctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattc 420  Q
     |  || || || || ||||||||||| ||||||||||||||  |||| || | ||| | ||||||||| || ||||| ||||||||  | |||||||||    
T  21108266 agccgataagttttcggctaaagaaccattttccatgtactcgtaaaccaatagtctatattttccctcagcgcaatatccccacatttcgatcaaattc 21108167  T
Q  421 atgtggttaagccttccaatgatgcttacttcagcaagaaactctccttccccttg 476  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  21108166 atgtgattaagccttccaatgattcctacttcagctagaaattcaccttctccttg 21108111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 337 - 440
Target Start/End: Original strand, 29213149 - 29213252
Alignment:
Q  337 gctaaagaacctttttccatgtactcaaaaactaacaatctgtgttttccctctgcacaatacccccacataccaatcaaattcatgtggttaagccttc 436  Q
    ||||||||||| || | |||| ||||| | || |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29213149 gctaaagaaccattatacatgaactcatagacaaacattctatgtattccctctgcacaataaccccacaattcaatcaaattcatgtggttaagctttc 29213248  T
Q  437 caat 440  Q
    ||||    
T  29213249 caat 29213252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 253
Target Start/End: Original strand, 29212992 - 29213065
Alignment:
Q  180 ttgatagttagaatcaagaagtatattttgaggctttatatcacaatgtaaaatccactccaaacattcttcat 253  Q
    |||||| |||||||| | ||| || ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29212992 ttgataattagaatccaaaagaatgttttgtggcttcacatcacaatgcaaaatccactccaaacactcttcat 29213065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University