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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2716_low_2 (Length: 539)

Name: NF2716_low_2
Description: NF2716
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2716_low_2
NF2716_low_2
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (23-533)||(18790439-18790945)
chr1 (23-317)||(52732895-52733192)
chr1 (345-520)||(52732711-52732886)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (23-533)||(18076948-18077455)
chr8 (23-524)||(28939984-28940489)
chr8 (23-524)||(44525703-44526203)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (42-533)||(33683124-33683618)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (23-533)||(19211417-19211924)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (23-533)||(54531786-54532293)
[»] chr3 (4 HSPs)
chr3 (35-524)||(7590951-7591441)
chr3 (23-334)||(34901227-34901539)
chr3 (385-489)||(34901543-34901646)
chr3 (481-521)||(34903115-34903155)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 18790945 - 18790439
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18790945 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctgcaattgcaggtcaccactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccat 18790846  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||| |         || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18790845 ctaagttaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtcccccctttt---tttttattatttaaaaaaccaaataagttact 18790749  T
Q  223 accattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcac 322  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18790748 acctttaattattattttccttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaacaatagtgctcatggcac 18790649  T
Q  323 tggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 422  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18790648 tggtaaaaacta-ttttttctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 18790550  T
Q  423 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18790549 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaattttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttggat 18790450  T
Q  523 atattcttgga 533  Q
    || || |||||    
T  18790449 attttgttgga 18790439  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 52733192 - 52732895
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52733192 aggtctctcacggtgggaggggaggaaaaatctgcaattgcaggtcaccactagttttaatagttttatattatttttgctatttatatttttgatccac 52733093  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcc---tcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagtt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||| |||||||   |         ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52733092 ctaaattaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattgacatgtccctcttttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagtt 52732993  T
Q  220 actaccattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcat 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52732992 actacctttaattattattttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctacatctctttcgagcaccatcatcacaacaatagtgctcat 52732895  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 345 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 52732886 - 52732711
Alignment:
Q  345 atattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaacaaccac 444  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52732886 atattcatccttattactacatgaccagcatcaccatcccacaagttaccaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaacaaccac 52732787  T
Q  445 cgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgg 520  Q
    |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52732786 cgcaacaagtcaattttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgg 52732711  T

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Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Original strand, 18076948 - 18077455
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  18076948 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctgcaattgtatgtcaccattagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccat 18077047  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||| |         || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18077048 ctaagttaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtccccctttttt--tttttattatttaaaaaaccaaataagttact 18077145  T
Q  223 accattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcac 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18077146 acctttaattattattttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaacaatagtgctcatggcac 18077245  T
Q  323 tggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 422  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077246 tggtaaaaacta-ttttttctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 18077344  T
Q  423 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggt 522  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  18077345 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaattttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttattttccatgactgaggttggat 18077444  T
Q  523 atattcttgga 533  Q
    || || |||||    
T  18077445 attttgttgga 18077455  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 23 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 28940489 - 28939984
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28940489 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctgcaattgcaggtcaccactagctttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 28940390  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnn--gttattattatttaaaaaacaaaataagtta 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||        ||||| |||||||||||||| |          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28940389 ctaagttaattataaatattccactcgagtttttttgtttacgaaattggcatgtccccccttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagtta 28940290  T
Q  221 ctaccattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggc 320  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28940289 ctacttttaattattcttttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctcttttcagcactatcatcacaaaaatagtgctcatggc 28940190  T
Q  321 actggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaa 420  Q
    || |||||||||||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28940189 acgggtaaaaacta-ttttttctgatattcatccttcttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaa 28940091  T
Q  421 tattcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaa---nnnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggt 517  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28940090 tattcattaaacaacaacaactaccgcaacaagtcaatttttttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgattgaggt 28939991  T
Q  518 tgggtat 524  Q
    |||||||    
T  28939990 tgggtat 28939984  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 44526203 - 44525703
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  44526203 aggtctcttacggtgggaggtgagaaaaaacctgcaattgcaggttaccactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccat 44526104  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttact 222  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||       |||||| |||||| |||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44526103 ttaagttaattataaatattccactcgagtttttttatttacgaaattgacatgtccctttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagttact 44526004  T
Q  223 accattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcac 322  Q
    ||  || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44526003 acttttgattattcttttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttccaacaccatcatcacaacaatagtgctcatggcac 44525904  T
Q  323 tggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 422  Q
     |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44525903 gggtaaaaactatttttttctgatattcatccttgttactacatgaccaacatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 44525804  T
Q  423 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggt 522  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44525803 ttcattaaccaacaacaaccatcacaacaagtcaa-tttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttattttccatgactgaggttgggt 44525705  T
Q  523 at 524  Q
    ||    
T  44525704 at 44525703  T

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Target: chr5 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 42 - 533
Target Start/End: Original strand, 33683124 - 33683618
Alignment:
Q  42 gggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccacctaagttaattataaatat 141  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33683124 gggagaaaatacctgcaattgcaggtcaccattagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccacctaagttaattataaatat 33683223  T
Q  142 ttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcc----tcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttactaccattaattattat 237  Q
    | ||||||||       |||||  ||||||||||||||    |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33683224 tccactcgagtttttttatttatgaaattggcatgtccctttttttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagttactaccattaattattat 33683323  T
Q  238 tttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcactggtaaaaactannn 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       
T  33683324 tttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaacaatagtgctcatggcactggtaaaaacta-tt 33683422  T
Q  338 nnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaa 437  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33683423 ttttctgatattcatccttgttactacatgaccaacatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaa 33683522  T
Q  438 caaccaccgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggtatattcttgga 533  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33683523 caaccaccgcaacaagtcaattttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggtattttgttgga 33683618  T

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Target: chr2 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 19211924 - 19211417
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19211924 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctgcaattgcaggtcaccactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccac 19211825  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||| |         ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19211824 ctaagttaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtccccctttttt--ttattattatttaaaaaaccaaataagttact 19211727  T
Q  223 accattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcac 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  19211726 acctttaattattattttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcaaaacaatagtgctcatggcac 19211627  T
Q  323 tggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 422  Q
    ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19211626 tggtaaaaacta-ttttttctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccat-ccacaagttactaccaccaccatcatcgatatcatcaata 19211529  T
Q  423 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaa-nnnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttggg 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  19211528 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaatttttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagttttattttccatgactgaggttgga 19211429  T
Q  522 tatattcttgga 533  Q
    ||| || |||||    
T  19211428 tattttgttgga 19211417  T

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Target: chr4 (Bit Score: 302; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 23 - 533
Target Start/End: Original strand, 54531786 - 54532293
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  54531786 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctgcaattgcaagtcaccattagttttaatagttttatattatttttgttatttatacttttgacccac 54531885  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnngttattattatttaaaaaacaaaataagttact 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||| |         ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54531886 ctaagttaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtccccctttttt--ttattattatttaaaaaaccaaataagttact 54531983  T
Q  223 accattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcac 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  54531984 acctttaattattattttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcaaaacaatagtgctcatggcac 54532083  T
Q  323 tggtaaaaactannnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaata 422  Q
    ||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54532084 tggtaaaaactatttttta-tgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccat-ccacaagttactaccaccaccatcatcgatatcatcaata 54532181  T
Q  423 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaa-nnnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttggg 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  54532182 ttcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaatttttttttatttaaataaccatttataaattaaaagagttttattttccatgactgaggttgga 54532281  T
Q  522 tatattcttgga 533  Q
    ||| || |||||    
T  54532282 tattttgttgga 54532293  T

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Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 35 - 524
Target Start/End: Original strand, 7590951 - 7591441
Alignment:
Q  35 gtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccacctaagttaatta 134  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7590951 gtgggaggggagaaaaaacctgcaattacaggtcaccactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccacctaagctaatta 7591050  T
Q  135 taaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnn-gttattattatttaaaaaacaaaataagttactaccattaatta 233  Q
    |||||||| ||||||||       |||||| |||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7591051 taaatattccactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtcccctttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagttactacctttaatta 7591150  T
Q  234 ttattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggcactggtaaaaact 333  Q
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T  7591151 ttcttttctttcttctttattctctccttgttctgatttccctgcatctcttttcagcaccatcatcacaacaatagtgcccatggcacgggtaaaaact 7591250  T
Q  334 annnnnnnctgatattcatccttgttactacatgaccagcatcaccatcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaaca 433  Q
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T  7591251 a-ttttttctgatagtcatccttgttactacatgaccaacatcaccttcccacaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaaca 7591349  T
Q  434 acaacaaccaccgcaacaagtcaa-nnnnnnnnatttaaataaccatttataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttgggtat 524  Q
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T  7591350 acaacaaccaccgcaacaagtcaatttttatttatttaaataaccatttataaattaaaagagttttatttcccatgattgaggttgggtat 7591441  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 23 - 334
Target Start/End: Original strand, 34901227 - 34901539
Alignment:
Q  23 aggtctctcatggtggaaggggagaaaaaacctgcaattataggtcatcactagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgatccac 122  Q
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T  34901227 aggtctctcacggtgggaggggagaaaaaacctacaattgcaggtcaccattagttttaatagttttatattatttttgctatttatacttttgacccac 34901326  T
Q  123 ctaagttaattataaatatttcactcgagnnnnnnnatttacaaaattggcatgtcctcnnnnnnnn-gttattattatttaaaaaacaaaataagttac 221  Q
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T  34901327 ctaagttaattataaatatttcactcgagtttttttatttacgaaattggcatgtcccctttttttttgttattattatttaaaaaacaaaataagttac 34901426  T
Q  222 taccattaattattattttctttcttctttattttctccttgttctgatttccctgcatctctttcgagcaccatcatcacaataatagtgctcatggca 321  Q
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T  34901427 tatctttaattattattttctttcttctttattctttccttgttctgatttctctgcatctctttcgagcaccatcatcacaacaatagtgctcatggca 34901526  T
Q  322 ctggtaaaaacta 334  Q
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T  34901527 ctggtaaaaacta 34901539  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 385 - 489
Target Start/End: Original strand, 34901543 - 34901646
Alignment:
Q  385 acaagttactaccaccaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaannnnnnnnatttaaataaccatttata 484  Q
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T  34901543 acaagttactaccatcaccatcatcggtatcatcaatattcattaaacaacaacaaccaccgcaacaagtcaa-tttttttatttaaataaccatttata 34901641  T
Q  485 aatta 489  Q
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T  34901642 aatta 34901646  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 481 - 521
Target Start/End: Original strand, 34903115 - 34903155
Alignment:
Q  481 tataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttggg 521  Q
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T  34903115 tataaattaaaagagctttatttcccatgactgaggttggg 34903155  T

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