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Alignment Overview

Query: NF2719_high_11 (Length: 276)

Name: NF2719_high_11
Description: NF2719
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2719_high_11
NF2719_high_11
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (1-261)||(21434384-21434645)
chr1 (84-261)||(27355680-27355857)
chr1 (63-258)||(7635603-7635798)
chr1 (11-261)||(16056720-16056972)
chr1 (77-261)||(13430944-13431128)
chr1 (11-261)||(16060886-16061138)
chr1 (11-244)||(11666921-11667153)
chr1 (63-261)||(27331749-27331938)
chr1 (41-248)||(34065109-34065318)
chr1 (147-261)||(16055623-16055737)
chr1 (87-261)||(45941371-45941543)
chr1 (11-230)||(16062132-16062353)
chr1 (87-261)||(28111011-28111183)
chr1 (1-261)||(1950362-1950623)
chr1 (77-261)||(34732347-34732529)
chr1 (86-261)||(23021919-23022092)
chr1 (87-261)||(21107288-21107459)
chr1 (91-255)||(2794189-2794350)
chr1 (153-261)||(6071014-6071122)
chr1 (153-261)||(21018528-21018635)
chr1 (86-261)||(49498493-49498665)
chr1 (87-261)||(20398808-20398980)
chr1 (87-261)||(37183860-37184032)
chr1 (143-261)||(49853130-49853246)
chr1 (87-243)||(21111155-21111309)
chr1 (153-259)||(41058363-41058468)
chr1 (131-261)||(45960784-45960913)
chr1 (44-181)||(30938514-30938651)
chr1 (153-261)||(3796887-3796994)
chr1 (87-261)||(31204793-31204965)
chr1 (164-261)||(673144-673241)
chr1 (153-261)||(29643282-29643389)
chr1 (1-52)||(41058193-41058244)
chr1 (163-261)||(905756-905853)
chr1 (1-51)||(49853029-49853079)
chr1 (1-37)||(2405706-2405742)
chr1 (1-37)||(21018358-21018394)
chr1 (1-37)||(45941613-45941649)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (41-261)||(21915075-21915296)
chr5 (36-239)||(31575390-31575595)
chr5 (1-261)||(42062875-42063136)
chr5 (1-261)||(22936843-22937106)
chr5 (1-261)||(4099427-4099685)
chr5 (87-261)||(41876761-41876933)
chr5 (87-261)||(26752698-26752870)
chr5 (55-261)||(31863668-31863873)
chr5 (67-261)||(18239472-18239665)
chr5 (87-261)||(18952647-18952818)
chr5 (24-261)||(34831718-34831953)
chr5 (87-261)||(17664506-17664676)
chr5 (87-261)||(7625056-7625228)
chr5 (87-261)||(21332677-21332848)
chr5 (87-261)||(21335695-21335866)
chr5 (163-259)||(2837259-2837355)
chr5 (97-261)||(18765647-18765811)
chr5 (153-261)||(26895665-26895772)
chr5 (87-261)||(41306524-41306695)
chr5 (153-240)||(37215019-37215106)
chr5 (87-261)||(22131183-22131355)
chr5 (87-261)||(33552076-33552246)
chr5 (87-261)||(40583203-40583374)
chr5 (163-243)||(7270987-7271067)
chr5 (153-261)||(12058553-12058660)
chr5 (153-261)||(34133044-34133151)
chr5 (153-261)||(34143275-34143382)
chr5 (153-261)||(39192282-39192389)
chr5 (87-261)||(20055728-20055899)
chr5 (172-261)||(14375888-14375976)
chr5 (153-261)||(12087912-12088019)
chr5 (153-261)||(14016199-14016307)
chr5 (1-52)||(7271196-7271247)
chr5 (210-261)||(30066296-30066346)
chr5 (1-52)||(33552301-33552352)
chr5 (163-261)||(43491709-43491807)
chr5 (1-37)||(28787228-28787264)
chr5 (1-37)||(30066504-30066540)
chr5 (1-37)||(39192525-39192561)
chr5 (1-37)||(41876655-41876691)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (1-261)||(18562446-18562707)
chr7 (11-256)||(5796497-5796742)
chr7 (1-261)||(7227468-7227728)
chr7 (1-261)||(48645415-48645674)
chr7 (1-261)||(13809430-13809691)
chr7 (87-261)||(16165689-16165861)
chr7 (67-261)||(5242132-5242326)
chr7 (153-261)||(2441344-2441452)
chr7 (87-261)||(23224907-23225079)
chr7 (87-261)||(8276926-8277098)
chr7 (87-261)||(20594204-20594375)
chr7 (153-261)||(4596075-4596182)
chr7 (1-261)||(9864641-9864900)
chr7 (5-259)||(45290397-45290651)
chr7 (153-261)||(13449842-13449950)
chr7 (153-261)||(13842581-13842688)
chr7 (163-261)||(4546810-4546907)
chr7 (91-261)||(26557440-26557607)
chr7 (5-259)||(45286986-45287240)
chr7 (87-243)||(11919867-11920021)
chr7 (87-261)||(6603399-6603571)
chr7 (91-261)||(17730755-17730922)
chr7 (87-261)||(9132762-9132933)
chr7 (87-261)||(14683446-14683617)
chr7 (87-259)||(37415425-37415596)
chr7 (163-261)||(4542738-4542835)
chr7 (205-261)||(11398143-11398199)
chr7 (163-257)||(9271541-9271634)
chr7 (153-261)||(10469085-10469192)
chr7 (1-52)||(4595905-4595956)
chr7 (1-52)||(26557666-26557717)
chr7 (1-52)||(35961265-35961316)
chr7 (153-261)||(3068043-3068150)
chr7 (1-37)||(4542979-4543015)
chr7 (1-37)||(4547051-4547087)
chr7 (1-37)||(17730996-17731032)
chr7 (153-261)||(26136194-26136301)
[»] chr3 (69 HSPs)
chr3 (55-259)||(22993647-22993852)
chr3 (1-259)||(17545896-17546154)
chr3 (77-261)||(18542589-18542774)
chr3 (7-260)||(19304593-19304843)
chr3 (5-261)||(18641670-18641928)
chr3 (5-261)||(18644666-18644924)
chr3 (1-261)||(54461053-54461315)
chr3 (88-261)||(3292943-3293115)
chr3 (1-261)||(52199952-52200211)
chr3 (1-261)||(35412548-35412810)
chr3 (87-261)||(2775520-2775692)
chr3 (87-261)||(2778763-2778935)
chr3 (87-261)||(7486609-7486781)
chr3 (87-261)||(45896419-45896591)
chr3 (5-261)||(538865-539122)
chr3 (16-261)||(55031908-55032156)
chr3 (87-261)||(25584715-25584887)
chr3 (87-261)||(29343858-29344030)
chr3 (87-261)||(43809618-43809790)
chr3 (10-261)||(19301412-19301660)
chr3 (1-261)||(10106495-10106754)
chr3 (1-261)||(10884896-10885156)
chr3 (87-261)||(16243912-16244083)
chr3 (87-261)||(32287307-32287479)
chr3 (86-259)||(31549212-31549383)
chr3 (153-261)||(49742967-49743075)
chr3 (16-261)||(55034768-55035016)
chr3 (87-261)||(2873603-2873774)
chr3 (87-261)||(16184671-16184843)
chr3 (87-259)||(6434762-6434931)
chr3 (1-247)||(30219902-30220147)
chr3 (87-259)||(53815869-53816038)
chr3 (87-261)||(10881519-10881690)
chr3 (87-261)||(43926874-43927045)
chr3 (9-261)||(22783638-22783891)
chr3 (9-261)||(22788002-22788255)
chr3 (153-261)||(20728695-20728802)
chr3 (153-261)||(35751479-35751587)
chr3 (163-261)||(3840555-3840653)
chr3 (91-261)||(24125538-24125705)
chr3 (91-261)||(24128815-24128982)
chr3 (163-261)||(30690775-30690872)
chr3 (87-261)||(50461532-50461704)
chr3 (87-261)||(54723780-54723952)
chr3 (119-252)||(28008086-28008218)
chr3 (97-253)||(282184-282339)
chr3 (1-259)||(8461383-8461640)
chr3 (153-261)||(17040070-17040177)
chr3 (153-261)||(23298663-23298771)
chr3 (87-261)||(9392773-9392944)
chr3 (87-261)||(11784804-11784976)
chr3 (153-261)||(47051534-47051642)
chr3 (153-258)||(27091936-27092040)
chr3 (153-261)||(11190565-11190673)
chr3 (153-261)||(12561282-12561389)
chr3 (153-261)||(22416882-22416989)
chr3 (187-259)||(28265918-28265989)
chr3 (153-261)||(32367177-32367284)
chr3 (153-261)||(47054964-47055072)
chr3 (153-261)||(46884980-46885087)
chr3 (153-261)||(48064083-48064190)
chr3 (1-52)||(20728525-20728576)
chr3 (1-37)||(2775765-2775801)
chr3 (1-37)||(2779007-2779043)
chr3 (1-37)||(25584957-25584993)
chr3 (1-37)||(43927115-43927151)
chr3 (1-37)||(45896661-45896697)
chr3 (1-37)||(49742797-49742833)
chr3 (153-261)||(54720010-54720117)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (41-261)||(22172322-22172543)
chr4 (63-261)||(37739730-37739928)
chr4 (1-261)||(12238218-12238478)
chr4 (97-258)||(5677416-5677575)
chr4 (1-261)||(8877409-8877670)
chr4 (1-261)||(33408224-33408486)
chr4 (87-260)||(40616805-40616976)
chr4 (87-261)||(5670530-5670702)
chr4 (87-261)||(5672848-5673020)
chr4 (87-261)||(27014216-27014388)
chr4 (87-261)||(40903080-40903252)
chr4 (153-261)||(44809016-44809124)
chr4 (73-261)||(53094460-53094647)
chr4 (87-261)||(24150625-24150797)
chr4 (91-261)||(40794955-40795123)
chr4 (87-261)||(52006528-52006699)
chr4 (87-261)||(56195480-56195652)
chr4 (108-261)||(8874778-8874930)
chr4 (16-259)||(18911454-18911696)
chr4 (1-261)||(15432032-15432291)
chr4 (87-261)||(34017778-34017950)
chr4 (87-261)||(39501601-39501773)
chr4 (3-259)||(5681383-5681637)
chr4 (5-229)||(5706376-5706603)
chr4 (153-261)||(34319978-34320086)
chr4 (1-261)||(3797719-3797976)
chr4 (145-256)||(33493748-33493859)
chr4 (87-261)||(24044138-24044309)
chr4 (87-261)||(44164736-44164907)
chr4 (87-261)||(48415526-48415698)
chr4 (87-261)||(52530932-52531104)
chr4 (87-243)||(19820698-19820852)
chr4 (153-261)||(38283550-38283657)
chr4 (210-261)||(48014170-48014221)
chr4 (87-261)||(27677052-27677223)
chr4 (87-261)||(46955475-46955647)
chr4 (164-261)||(15812209-15812306)
chr4 (153-261)||(56198806-56198914)
chr4 (131-261)||(12782858-12782986)
chr4 (152-261)||(19859582-19859690)
chr4 (153-261)||(15164146-15164254)
chr4 (153-261)||(15405142-15405250)
chr4 (162-261)||(15446806-15446904)
chr4 (1-261)||(37103124-37103384)
chr4 (87-261)||(15429853-15430024)
chr4 (87-261)||(15436467-15436638)
chr4 (87-261)||(33926925-33927097)
chr4 (153-261)||(48637458-48637566)
chr4 (153-261)||(29324778-29324886)
chr4 (153-261)||(49270636-49270740)
chr4 (153-261)||(3719077-3719184)
chr4 (153-261)||(19864574-19864681)
chr4 (55-181)||(48014030-48014157)
chr4 (153-261)||(18673143-18673250)
chr4 (153-229)||(35509949-35510025)
chr4 (1-52)||(3720530-3720581)
chr4 (1-52)||(15429747-15429798)
chr4 (1-52)||(15436361-15436412)
chr4 (66-261)||(30392522-30392714)
chr4 (1-52)||(40795182-40795233)
chr4 (1-52)||(44164962-44165013)
chr4 (1-52)||(52006422-52006473)
chr4 (1-37)||(12786307-12786343)
chr4 (1-37)||(15445257-15445293)
chr4 (1-37)||(27676946-27676982)
chr4 (205-261)||(27679338-27679393)
chr4 (1-37)||(38283380-38283416)
chr4 (1-37)||(48415416-48415452)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (11-258)||(9895-10142)
[»] chr2 (49 HSPs)
chr2 (6-258)||(34682639-34682888)
chr2 (1-261)||(5105662-5105921)
chr2 (87-261)||(30274766-30274938)
chr2 (1-259)||(25820756-25821013)
chr2 (1-261)||(25138841-25139101)
chr2 (87-261)||(9185422-9185594)
chr2 (87-261)||(11347893-11348065)
chr2 (87-261)||(24235031-24235203)
chr2 (87-261)||(31427539-31427711)
chr2 (87-261)||(31585938-31586110)
chr2 (1-261)||(13971805-13972063)
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chr2 (91-261)||(22021003-22021171)
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chr2 (87-261)||(43207888-43208059)
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chr2 (91-259)||(45500900-45501065)
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chr2 (87-261)||(40781408-40781579)
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chr2 (153-261)||(45453809-45453917)
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chr2 (153-261)||(1386484-1386591)
chr2 (153-261)||(37937281-37937388)
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chr2 (91-261)||(25874111-25874284)
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[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (44-261)||(48357-48572)
[»] chr6 (40 HSPs)
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chr6 (187-259)||(24371232-24371304)
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chr6 (87-261)||(14281517-14281689)
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chr6 (87-261)||(23384749-23384920)
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chr6 (153-261)||(26896320-26896427)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (1-261)||(4868203-4868463)
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chr8 (1-261)||(43681777-43682039)
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chr8 (153-259)||(14421697-14421803)
chr8 (87-261)||(25231031-25231203)
chr8 (67-261)||(30784869-30785062)
chr8 (1-261)||(5538682-5538942)
chr8 (87-261)||(5980310-5980481)
chr8 (87-261)||(12582959-12583130)
chr8 (87-261)||(21279766-21279937)
chr8 (119-261)||(23643770-23643911)
chr8 (9-261)||(5613636-5613889)
chr8 (153-245)||(12516514-12516606)
chr8 (153-261)||(18824455-18824563)
chr8 (153-261)||(18825948-18826056)
chr8 (87-261)||(36710633-36710805)
chr8 (119-243)||(17930949-17931072)
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chr8 (96-261)||(2560503-2560666)
chr8 (87-261)||(16953727-16953899)
chr8 (91-259)||(10663852-10664017)
chr8 (153-261)||(38248460-38248567)
chr8 (153-261)||(10498275-10498382)
chr8 (153-261)||(13196808-13196915)
chr8 (1-52)||(12583188-12583239)
chr8 (205-261)||(8911598-8911654)
chr8 (1-37)||(20887727-20887763)
chr8 (1-37)||(23597390-23597426)
chr8 (153-261)||(31284625-31284732)
chr8 (153-261)||(44027154-44027261)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
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scaffold0334 (163-261)||(19302-19400)
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[»] scaffold0015 (1 HSPs)
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[»] scaffold0080 (1 HSPs)
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[»] scaffold0009 (1 HSPs)
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[»] scaffold0007 (2 HSPs)
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[»] scaffold0270 (1 HSPs)
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[»] scaffold1755 (1 HSPs)
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[»] scaffold0002 (1 HSPs)
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[»] scaffold0066 (1 HSPs)
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[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (153-261)||(31048-31155)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
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[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (87-229)||(864-1004)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (153-261)||(3066-3173)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (153-261)||(19234-19341)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 21434384 - 21434645
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  21434384 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatgagactaggtcattcgaatcctatgagttctcctaattg 21434483  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  21434484 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcacgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttctcagatt 21434583  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21434584 acagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 21434645  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 84 - 261
Target Start/End: Original strand, 27355680 - 27355857
Alignment:
Q  84 tgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaag 183  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  27355680 tgagtttccctaattggtacactgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaataggcctaatcaatcccttgacttagg 27355779  T
Q  184 acactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27355780 accctcttctcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaagaacgttaacctaat 27355857  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 7635798 - 7635603
Alignment:
Q  63 gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagcca 162  Q
    ||||||||| ||| ||| || | | ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |   |||||||||||| ||     
T  7635798 gactaggtctttcgaattctctaaattcccataattggtacactgcacctacttcctatgaatatttctctagtttcacgatgattaactaaaataaccc 7635699  T
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7635698 taatcaataccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacct 7635603  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 16056720 - 16056972
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagaga--tg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  ||||||||||  || ||||||||| ||| ||| || ||| ||||||| |||| |||||||    
T  16056720 aaaattaaataacagaaaataaagatt-gtttggaaaagttatggagagagatgagactaggtctttcgaatactttgatttcccctaattgatacacta 16056818  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccc 207  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| || |   ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||    
T  16056819 cacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccc 16056918  T
Q  208 tgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  16056919 taattccttaggtgatctaatatactttaaaggtttgaataacgttaacctaat 16056972  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 77 - 261
Target Start/End: Original strand, 13430944 - 13431128
Alignment:
Q  77 aatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttg 176  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||  ||||||| ||||||| ||| || |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13430944 aatcctctgagttcccctaattggtacactgcacttagttctcatgaatatttctctagttttacgatggttaacttaaatagccctaatcaatcccttg 13431043  T
Q  177 acttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13431044 acttaggactctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaat 13431128  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Original strand, 16060886 - 16061138
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagaga--tg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||   |||||||||  || ||||||||| ||| |||| | ||| || |||| |||||||||||     
T  16060886 aaaattaaataacagaaaataaagatt-gtttggaaaagtaatggagagagatgagactaggtctttcgaatcatttgattttccctaattggtacactg 16060984  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccc 207  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| || |   ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||||    
T  16060985 cacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctcttctcatattacaatccc 16061084  T
Q  208 tgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  16061085 taattccttaggtgatctaatatactttataggtttgaagaacattaacctaat 16061138  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Original strand, 11666921 - 11667153
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatggact-aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactaca 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   | ||||||  | | ||| ||| |||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||    
T  11666921 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgattagaaaatatagacaaagatgggatcatgtctttcgaatcctctgatttccc-taattggtatactgca 11667019  T
Q  110 cctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctg 209  Q
    |||||||| || ||||   |||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| ||||     
T  11667020 cctatttcttacgaatgaatctctaatttcacaatggttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggatcctcttctcagattacagccccta 11667118  T
Q  210 attccttaggtgatctaatattatttgaaggtttt 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11667119 attccttaggtggtctaatattatttgaaggtttt 11667153  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Original strand, 27331749 - 27331938
Alignment:
Q  63 gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagcca 162  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||     
T  27331749 gactaggtctttcgaatcctctgagtttccctaattggtacaatgcacctatttcctatgaatatttctctagtttcacgatggttaactaaaatagccc 27331848  T
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||          ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27331849 taataaatcccttgacttaggaacctcttctca---------gcctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaacaacgttaacctaat 27331938  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 41 - 248
Target Start/End: Original strand, 34065109 - 34065318
Alignment:
Q  41 ttggaaaatatatggagaga--tg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactt 137  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||    
T  34065109 ttggaaaagatatggagagagatgagactaggtctttcgaatcctctgagttttcctaattggtacaatgcatctatttcctatgaatacttatctagtt 34065208  T
Q  138 tcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttga 237  Q
    |||| |  |||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||| | |||||    
T  34065209 tcacgatggttaaccaaa-tagccctaatcaatctcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataatctttga 34065307  T
Q  238 aggttttaaga 248  Q
    |||||||||||    
T  34065308 aggttttaaga 34065318  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 261
Target Start/End: Original strand, 16055623 - 16055737
Alignment:
Q  147 ttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaa 246  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  16055623 ttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaa 16055722  T
Q  247 gaacgttaacctaat 261  Q
    ||| |||||||||||    
T  16055723 gaatgttaacctaat 16055737  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45941543 - 45941371
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  45941543 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 45941446  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    || |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45941445 cttttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 45941371  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 16062132 - 16062353
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatgga--gagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||  ||||||  |||||| ||||||||| ||| |||| | ||| || || | ||||||||||||    
T  16062132 aaaattaaataatagaaaataaagatt-gtttgaaaaagttatggaaagagatgagactaggtctttcgaatcatttgattttccataattggtacacta 16062230  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccc 207  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| || |   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  || ||||||||| |||||| ||||    
T  16062231 cacctatttctcatgaatatttctctagttttacgatgattaactaaaatagccataattaatcccttaacttagaaccctcttctcagattacaatccc 16062330  T
Q  208 tgattccttaggtgatctaatat 230  Q
    | ||||||||  |||||||||||    
T  16062331 taattccttaaatgatctaatat 16062353  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28111183 - 28111011
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||| |||     
T  28111183 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 28111086  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28111085 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaat 28111011  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 1950362 - 1950623
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaa-tatatgga-gagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||| |||| | |  |||||||| |    
T  1950362 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaaatatatataagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaa 1950461  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || |||||||||     
T  1950462 ttggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaa 1950559  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  1950560 actacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaat 1950623  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 261
Target Start/End: Original strand, 34732347 - 34732529
Alignment:
Q  77 aatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttg 176  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||| || ||||  ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  34732347 aatcctctgagttcccctaattggtatactgcaattatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac-aaaatagcccta-tcaatcccttg 34732444  T
Q  177 acttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||  ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34732445 acttaggaccctcttctcaaagtacatcccctaatttgttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 34732529  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Original strand, 23021919 - 23022092
Alignment:
Q  86 agttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagac 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  |  |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||    
T  23021919 agttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgatattctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 23022016  T
Q  186 actcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||||| | |  |||| |||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23022017 cctcttcttagaccacagcccctaattccttaggtgatcaaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 23022092  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 21107288 - 21107459
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  21107288 gttcacctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacc 21107385  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21107386 ctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 21107459  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 2794350 - 2794189
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  2794350 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctct 2794253  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaa 255  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  2794252 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaa 2794189  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 6071014 - 6071122
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  6071014 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgt 6071113  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  6071114 taacctaat 6071122  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 21018528 - 21018635
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  21018528 aaaatagtcctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 21018626  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  21018627 taacctaat 21018635  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 261
Target Start/End: Original strand, 49498493 - 49498665
Alignment:
Q  86 agttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagac 185  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || | || || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||    
T  49498493 agttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttatagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac 49498590  T
Q  186 actcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  49498591 cctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 49498665  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20398980 - 20398808
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||     
T  20398980 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 20398883  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20398882 ctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaagcacgttaacctaat 20398808  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 37183860 - 37184032
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  37183860 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 37183957  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  37183958 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaat 37184032  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 261
Target Start/End: Original strand, 49853130 - 49853246
Alignment:
Q  143 acagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtt 242  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |    
T  49853130 acagttaac-aaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-t 49853227  T
Q  243 ttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  49853228 ttaagcacgttaacctaat 49853246  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 21111155 - 21111309
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||     
T  21111155 gttctcctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttaacttaggacc 21111252  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  21111253 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 21111309  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Original strand, 41058363 - 41058468
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  41058363 aaaatagtcataatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtagtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 41058461  T
Q  253 taaccta 259  Q
    |||||||    
T  41058462 taaccta 41058468  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Original strand, 45960784 - 45960913
Alignment:
Q  131 tctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatat 230  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  45960784 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataa 45960882  T
Q  231 tatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  45960883 ttctcgaaggtttaaagcacgttaacctaat 45960913  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 181
Target Start/End: Original strand, 30938514 - 30938651
Alignment:
Q  44 gaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcact 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||| ||| ||   ||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||| || |||| ||||||     
T  30938514 gaaaatatatggagagatgagatcagatcattcgaatcctctgatttattctgtttgatatact-cacctattttctatgaatatttatctagtttcacg 30938612  T
Q  143 acagttaactaaaatagccataatcaatcccttgactta 181  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30938613 atggttaactaaaatagtcataatcaatcccttgactta 30938651  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 3796887 - 3796994
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  3796887 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 3796985  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  3796986 taacctaat 3796994  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31204965 - 31204793
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |||     
T  31204965 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctaattccacgatagttaac-aaaatatccctaatcaatcccttgagttaggacc 31204868  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||  |||||||||||||    
T  31204867 ctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacgttaacctaat 31204793  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 261
Target Start/End: Original strand, 673144 - 673241
Alignment:
Q  164 aatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||||||| | ||||  |||| |||  ||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  673144 aatcaatcccttgagttaataccctcttctcaaactacaacccctaattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtacgttaacataat 673241  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 29643282 - 29643389
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||  | || |||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| | ||    
T  29643282 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcatgt 29643380  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  29643381 taacctaat 29643389  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 41058193 - 41058244
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  41058193 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 41058244  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Original strand, 905756 - 905853
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  905756 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctatggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 905853  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 49853029 - 49853079
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||    
T  49853029 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggtttgaaaatat 49853079  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 2405742 - 2405706
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2405742 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 2405706  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 21018358 - 21018394
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21018358 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 21018394  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 45941649 - 45941613
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45941649 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 45941613  T

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Target: chr5 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21915296 - 21915075
Alignment:
Q  41 ttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttc 139  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  21915296 ttggaaaagatagagagagatgtgactaggtctttcgaatcctttgagttcccctaattggtacactacacctatttcttatgaatatttctctaatttc 21915197  T
Q  140 actacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaag 239  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21915196 acgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaag 21915097  T
Q  240 gttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  21915096 gtttgaagaacgttaacctaat 21915075  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 36 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 31575595 - 31575390
Alignment:
Q  36 tttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctcta 134  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||    
T  31575595 tttgtttggaaaagatatggagagatgagactaggtctttcgaatcctatgacttcccctatttggtacactgcagctatttcatatgaatatttctcta 31575496  T
Q  135 ctttcactacagttaactaaaatagccataatcaatccc-ttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattat 233  Q
     |||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |    
T  31575495 gtttcacgatggttaactaaaatagctctaatcaatccctttgacttgggactctcttctcaaattacagtctctaattccctaggtaatctaatattct 31575396  T
Q  234 ttgaag 239  Q
    ||||||    
T  31575395 ttgaag 31575390  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42063136 - 42062875
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |||| | |  ||| |||| ||    
T  42063136 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtcttttgaatcatctatgtttccctaat 42063037  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||    
T  42063036 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcata 42062939  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42062938 ttacagtccctaattccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 42062875  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 22936843 - 22937106
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaag-taaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctg 95  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    ||||||||     
T  22936843 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccccta 22936942  T
Q  96 attggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctca 195  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||    
T  22936943 attggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatccctttagttaggaccctcttctca 22937040  T
Q  196 tattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22937041 gattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 22937106  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 4099427 - 4099685
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||   || ||||| ||||||||| ||| |||| | |  |||||||| ||||    
T  4099427 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagaaagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattg 4099526  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  4099527 gtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttgcacgatagttagc-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaact 4099624  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  4099625 acagcccctaattctttaggtggtctaataatatttgaa-gatttaagcacgttaacctaat 4099685  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 41876761 - 41876933
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  41876761 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaataattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 41876858  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41876859 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 41876933  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 26752698 - 26752870
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  26752698 gttcccctaattggtatactgcacct-tttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 26752795  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26752796 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 26752870  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31863873 - 31863668
Alignment:
Q  55 gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaacta 153  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| | |  |||||||| |||| || ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |    
T  31863873 gagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-a 31863776  T
Q  154 aaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgtt 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| | || || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  31863775 aaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtt 31863676  T
Q  254 aacctaat 261  Q
    ||||||||    
T  31863675 aacctaat 31863668  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 18239472 - 18239665
Alignment:
Q  67 aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataat 166  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |  ||||  ||||||| |||||| | | ||||| ||||||||| ||||    
T  18239472 aggtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtgtactgcacctatttctttcgaatgattctctagtttcacgataattaac-aaaatagccctaat 18239570  T
Q  167 caatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||| | || |  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18239571 caatcccttgacttaggacccccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 18239665  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18952818 - 18952647
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  18952818 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 18952721  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18952720 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 18952647  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34831953 - 34831718
Alignment:
Q  24 agaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatg 122  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||   |||||||| || |||||| ||| |||| | ||||||||||| ||||||| | | |||||||| | ||||    
T  34831953 agaaaatatagatttggttagaaaatatgaagagagatgagattaggtctttcgaatcttctgagttcccctaattggtataatgcacctatt-cttatg 34831855  T
Q  123 aatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtga 222  Q
    |||| || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||     
T  34831854 aataattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtgg 34831756  T
Q  223 tctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34831755 tctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 34831718  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17664676 - 17664506
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||| ||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  17664676 gttcccctaattggtatactgcacctatt--ctatgtatgattcactagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 17664580  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| | ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17664579 ctcttctaagattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 17664506  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7625228 - 7625056
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  7625228 gttcccctaattggtatactacacctatttg-tattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggact 7625131  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  7625130 ctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaat 7625056  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 21332677 - 21332848
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | |||||| |||||||| | |||||||| | ||||||||  ||     
T  21332677 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaa-taaaatagtcctaatcaattcattgacttagaacc 21332774  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21332775 ctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 21332848  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 21335695 - 21335866
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||| ||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||  ||     
T  21335695 gttcccctaatttgtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaacc 21335792  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     |||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21335793 gtcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 21335866  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2837355 - 2837259
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2837355 taatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaaccta 2837259  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 261
Target Start/End: Original strand, 18765647 - 18765811
Alignment:
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||   | ||||| | |     
T  18765647 ttggtaaactgcacctatttcctatgcatacttctctagttttacgatggttaactaaaatagttataatcaatcccttgagttagatccctcttgttag 18765746  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     |||||   ||| |||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18765747 cttacaactcctaattccttaagtggtctaacattcttcgaaggttttaagagcgttaacctaat 18765811  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 26895665 - 26895772
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  26895665 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 26895763  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  26895764 taacctaat 26895772  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 41306524 - 41306695
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  41306524 gttcccctaattggtatactgcacctatttt-tatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 41306621  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  41306622 ctcttttcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 41306695  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37215106 - 37215019
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaagg 240  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  37215106 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22131355 - 22131183
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||  || | ||||||| ||||||  | ||||||||| ||||| ||| |||     
T  22131355 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtatgaatgattctctagttctacgatagttaac-aaaatattcctaatcaatctcttgagttaggacc 22131258  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||   ||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22131257 ctcttctcaaactacaacacctaattccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgttaacctaat 22131183  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33552246 - 33552076
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  33552246 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctaattccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 33552149  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||| ||| ||| ||| | |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  33552148 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaagtggtct-ataatctttgaagg-tttaagcacattaacctaat 33552076  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40583374 - 40583203
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  |||| || || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  40583374 gttctcctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctataattccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgacc 40583277  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| | | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  40583276 ctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaat 40583203  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7271067 - 7270987
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||||||    
T  7271067 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttt 7270987  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 12058553 - 12058660
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  12058553 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 12058651  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  12058652 taacctaat 12058660  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 34133044 - 34133151
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  34133044 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 34133142  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  34133143 taacctaat 34133151  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 34143275 - 34143382
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  34143275 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 34143373  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  34143374 taacctaat 34143382  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39192389 - 39192282
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||  |||| |||||||||||| | ||||| | ||| |||| |||||| || |    
T  39192389 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtataataatctttcaagg-tttaagcacat 39192291  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  39192290 taacctaat 39192282  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20055899 - 20055728
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||  | ||||||||||| ||| ||| |||     
T  20055899 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaataatcctaatcaatcccgtgagttaggacc 20055802  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     |||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  20055801 gtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-ttaaagcacgttaacctaat 20055728  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Original strand, 14375888 - 14375976
Alignment:
Q  172 ccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||| ||| ||| |||| |||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14375888 ccttgagttaggaccctctactcaaactacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 14375976  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12088019 - 12087912
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  12088019 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 12087921  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  12087920 taacctaat 12087912  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 14016199 - 14016307
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| ||| |||||||| | ||||| |  | |||||||| ||| || |    
T  14016199 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagcactt 14016298  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  14016299 taacctaat 14016307  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 7271247 - 7271196
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||    
T  7271247 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatttagtttgaaaatata 7271196  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30066346 - 30066296
Alignment:
Q  210 attccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30066346 attccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaat 30066296  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 33552352 - 33552301
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  33552352 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggtttgaaaatata 33552301  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43491807 - 43491709
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||| | || |  |||| |||||||||||| | ||||| | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  43491807 taatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactagaccccctaattccttaggtggtttaataatctttgaagattttatgcacgttaacctaat 43491709  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 28787228 - 28787264
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28787228 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 28787264  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 30066540 - 30066504
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  30066540 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 30066504  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 39192561 - 39192525
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  39192561 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 39192525  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 41876655 - 41876691
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41876655 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 41876691  T

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Target: chr7 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 18562446 - 18562707
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| || |||||||||  |||||||| ||| | ||| || ||||||| |||||| |||| ||||    
T  18562446 ttgattgcataaaaattaatgacagaaaataaagatttgattagaaaatatagagagagatgagaccatgtctttaaaatcctctgagtttccctaattg 18562545  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
     |||| | |||||| ||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  18562546 atacattgcacctacttcttatgaatacttctctagttttacgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttctcatatt 18562645  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18562646 acagtccctaattccttaggtgagctaatattattcgaaggttttaagaacgttaacctaat 18562707  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5796742 - 5796497
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactaca 109  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| | |||| || |||||||| |||||||||| |||    
T  5796742 aaaagtaaataacagaaaataaag-tttgtttagaaaagatatggagagatgagactaagtctttcgagtcctttgggttcccctaattggtacacaaca 5796644  T
Q  110 cctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctg 209  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| |||||  |    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| || ||     
T  5796643 cctatttcttaagaataattctctagtttcatgatgactaactaaaatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctcta 5796544  T
Q  210 attccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaac 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5796543 attccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaac 5796497  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7227728 - 7227468
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt-aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatggact-aggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    ||||||||  | ||||| ||| |||||| || ||||||||||||    
T  7227728 ttgattgcataaaatttaaataacagaaagtaaagattttattagaaaatatggaaagagatgggatcaggtctttcgaatcctctg-gttcccctgatt 7227630  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| |||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||  ||    
T  7227629 ggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac-aaaataaccataatcaatcccttgacttaggaccctattctccaat 7227531  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | || ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7227530 tacagcctctaattccttatatgatctaatattctttgaaggttttacgaacgttaacttaat 7227468  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48645674 - 48645415
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||| |    |||||||| |||    
T  48645674 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactagatctttcgaatcatcgatgttcccctaatt 48645575  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |     
T  48645574 ggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatggttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 48645477  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48645476 tacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaat 48645415  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 13809430 - 13809691
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt--aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| || |||||||||  |||||||| ||  | ||| ||| |||||| ||| ||||| | ||    
T  13809430 ttgattgcataaaattttaaataacagaaagtaaatttttgattagaaaatatagagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctga-ttcccttaat 13809528  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||||  || ||||  ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13809529 tggtatactgcacctatttattacgaatgattctctagtttcacgatggttaac-aaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccctcttctcata 13809627  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||  | || |||||||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13809628 ttacaacctctaattccttatgtggcctaatactctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 13809691  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16165861 - 16165689
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| |||  ||||||| ||  || | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  16165861 gttcccctaattggtatactgcacctatttg-tattaatgattctctaattcaacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 16165764  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165763 ctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 16165689  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 5242132 - 5242326
Alignment:
Q  67 aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataat 166  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||||     
T  5242132 aggtctttcgaatcttctgagttcccttaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcactatggttaac-aaaatatccataac 5242230  T
Q  167 caatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtttt-aagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  5242231 caatcccttgacttaggaccctattctcagactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagattttaaagaacgttaacttaat 5242326  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 2441344 - 2441452
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2441344 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgt 2441443  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  2441444 taacctaat 2441452  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 23224907 - 23225079
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  23224907 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 23225004  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23225005 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 23225079  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8277098 - 8276926
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  8277098 gttcccctaattggtataatgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 8277001  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | || || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8277000 ctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 8276926  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20594375 - 20594204
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  20594375 gttcccctaattggtatactgcacgtatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacc 20594278  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  20594277 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 20594204  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 4596075 - 4596182
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  4596075 aaaatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 4596173  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  4596174 taacctaat 4596182  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 9864641 - 9864900
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||| |||||||| | |  ||  |||| ||||    
T  9864641 ttgattgcataaaattaaataacagaaaagaaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgtatccctaattg 9864740  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| |||||||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |    
T  9864741 gtatactacacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaact 9864838  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||  || | |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  9864839 acaacccataattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacttaat 9864900  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 45290397 - 45290651
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||  ||| | |||||||| || |||||| ||| |||| | |  |||||||| ||||||    
T  45290397 ttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagagttggaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggt 45290496  T
Q  102 acactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattac 201  Q
    | ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||||||| | |||    
T  45290497 atactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactac 45290594  T
Q  202 agtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45290595 agcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 45290651  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 13449842 - 13449950
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | || || || | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13449842 aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgt 13449941  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  13449942 taacctaat 13449950  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13842688 - 13842581
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| |||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  13842688 aaaatagccctaatcaatcccttgaattaggaccctctcctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgt 13842590  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  13842589 taacctaat 13842581  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4546907 - 4546810
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4546907 taatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 4546810  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26557607 - 26557440
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||  || ||||    
T  26557607 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacatagaaccctct 26557510  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26557509 tctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 26557440  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 259
Target Start/End: Original strand, 45286986 - 45287240
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||  ||| | |||||||| || |||||| ||| |||| | |  ||| |||| ||||||    
T  45286986 ttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagagttggaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggt 45287085  T
Q  102 acactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattac 201  Q
    | ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||||||| | |||    
T  45287086 atactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactac 45287183  T
Q  202 agtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45287184 agcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 45287240  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Original strand, 11919867 - 11920021
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | || |||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  11919867 gttcccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgataggtaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 11919964  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  11919965 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6603571 - 6603399
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  6603571 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 6603474  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  6603473 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaat 6603399  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 17730922 - 17730755
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  17730922 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttaacttaggaccctct 17730825  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | || || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17730824 tctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 17730755  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 9132762 - 9132933
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  9132762 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttatgaatgattcactagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 9132859  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9132860 ctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 9132933  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 14683446 - 14683617
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  14683446 gttcccctaattggtatactgcatctatt-cttatgaatgattcactagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 14683543  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||   ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14683544 ctcttctaggattacagcccctaattccataggtggtctaatagttattgaagg-tttaagcacgttaacctaat 14683617  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 37415425 - 37415596
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| |||  ||     
T  37415425 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatctcttgagttagaacc 37415522  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattcc--ttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||  ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37415523 ctcttctcaaactacagcccctaattccccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 37415596  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4542835 - 4542738
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4542835 taatcaatcccttgacctagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 4542738  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 11398143 - 11398199
Alignment:
Q  205 ccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11398143 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 11398199  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 257
Target Start/End: Original strand, 9271541 - 9271634
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacc 257  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
T  9271541 taatcaatcccttgagttaggtccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacc 9271634  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10469192 - 10469085
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  10469192 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 10469094  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  10469093 taacctaat 10469085  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 4595905 - 4595956
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  4595905 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 4595956  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 26557717 - 26557666
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  26557717 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggtttgaaaatata 26557666  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 35961316 - 35961265
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  35961316 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 35961265  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 3068043 - 3068150
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||| || |    
T  3068043 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaagcacat 3068141  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  3068142 taacctaat 3068150  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 4543015 - 4542979
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4543015 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 4542979  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 4547087 - 4547051
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  4547087 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 4547051  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 17731032 - 17730996
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17731032 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 17730996  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 26136194 - 26136301
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||||||    ||| || |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  26136194 aaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 26136292  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  26136293 taacctaat 26136301  T

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Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 69)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 55 - 259
Target Start/End: Original strand, 22993647 - 22993852
Alignment:
Q  55 gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaacta 153  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||    
T  22993647 gagagatgagactaggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttactatgaatacttctctagttttacgatggttaacta 22993746  T
Q  154 aaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgtt 253  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22993747 aaatatccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttttagaacgtt 22993846  T
Q  254 aaccta 259  Q
    ||||||    
T  22993847 aaccta 22993852  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17546154 - 17545896
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||   |||||||| ||  || || ||| |||| | || |||||||| ||||    
T  17546154 ttgattgcataaaactaaataatagaaaataaatatttgattagaaaatatggagagagatgagatcagatctttcgaatcttctg-gttcccctaattg 17546056  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  17546055 gtatactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagatt 17545956  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17545955 acaatccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaaccta 17545896  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18542774 - 18542589
Alignment:
Q  77 aatcctatgagttcccctgattggtacactacacc-tatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatccctt 175  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  18542774 aatcctctgagttcccctatttggttcactgcaccctatttcctatgaatactcctctagcttcacgatggttaactaaaatagtcctaatcaatccctt 18542675  T
Q  176 gacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18542674 gacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 18542589  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 7 - 260
Target Start/End: Original strand, 19304593 - 19304843
Alignment:
Q  7 gcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacac 105  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  19304593 gcataaaattaaataatagaaaataaatatttgtttggaaaatatatg-agagatgagactaggtctttcaaatcctctgagttcccctgcttggtacac 19304691  T
Q  106 tacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtc 205  Q
    | |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |    
T  19304692 tgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccctgagttacgaccctcttctcaaactacaacc 19304789  T
Q  206 cctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaa 260  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19304790 cctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaa 19304843  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 18641670 - 18641928
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattgg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |||||    
T  18641670 ttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattgg 18641769  T
Q  101 tacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatta 200  Q
    || ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18641770 tatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagatta 18641867  T
Q  201 cagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18641868 cagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 18641928  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 18644666 - 18644924
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattgg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |||||    
T  18644666 ttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattgg 18644765  T
Q  101 tacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatta 200  Q
    || ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  18644766 tatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagatta 18644863  T
Q  201 cagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18644864 cagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 18644924  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54461315 - 54461053
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaa--atatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||  |    
T  54461315 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaactatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccccaaa 54461216  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    | |||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  54461215 tgggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataattcatcccttgagttaggaccctcttctcat 54461118  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54461117 attacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 54461053  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 261
Target Start/End: Original strand, 3292943 - 3293115
Alignment:
Q  88 ttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacac 187  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||| |||||||  |||| || |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  3292943 ttcccctaattggtatattgcacctatttcttatgaatgattctatagtttcacgatggttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaagaccc 3293041  T
Q  188 tcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3293042 acttctccgattacaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 3293115  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 52200211 - 52199952
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatga-gttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| ||    
T  52200211 ttgattgcaataaaaataaataacagaaaataaagatatgtttgaaaaatatatggagagatgagactaggtctttcgaatcat-tgatgttcccctaat 52200113  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | | ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  52200112 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgataattaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaa 52200015  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  52200014 ctacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 52199952  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35412810 - 35412548
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataac-agaaagtaaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    ||||| || |    
T  35412810 ttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaggatagttttggaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcctctaa 35412711  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||     
T  35412710 ttggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcag 35412613  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35412612 attacagtccctaattccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 35412548  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2775692 - 2775520
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  2775692 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggacc 2775595  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775594 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 2775520  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2778935 - 2778763
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  2778935 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggacc 2778838  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778837 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 2778763  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7486781 - 7486609
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  7486781 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 7486684  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7486683 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 7486609  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45896591 - 45896419
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  45896591 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 45896494  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45896493 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 45896419  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 539122 - 538865
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggt 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||    ||||||| |||| | |||||||| || |||||| ||| |||| |||  ||| |||| ||||||    
T  539122 ttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagtataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatatatgtttccctaattggt 539023  T
Q  102 acactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattac 201  Q
    | |||||||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||    
T  539022 atactacacctatt-cttataaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactac 538925  T
Q  202 agtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  538924 agcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttttaagaacgttaacctaat 538865  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 55031908 - 55032156
Alignment:
Q  16 taaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctat 114  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |    |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  55031908 taaatatcagaaaataaagatatgtttggaaaatatacggagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctat 55032007  T
Q  115 t---tcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgat 211  Q
    |   || |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||||||| | ||||  |||||||    
T  55032008 tcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacatcccctgat 55032106  T
Q  212 tccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||| |||| || | ||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  55032107 tccttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacgttaacctaat 55032156  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25584887 - 25584715
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  25584887 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 25584790  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25584789 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 25584715  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 29343858 - 29344030
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  29343858 gttcccctaattggtatattgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 29343955  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29343956 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 29344030  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43809790 - 43809618
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| | | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  43809790 gttcccctaattggtatactgcacctact-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 43809693  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43809692 ctcttctcaaactacaccccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 43809618  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 261
Target Start/End: Original strand, 19301412 - 19301660
Alignment:
Q  10 taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactac 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |  ||| |||||| |    
T  19301412 taaaattaaataacagaaaataaagatttgtttgaaaaatatatg-agagatgagactaggtctttcgaatcctctgagttcccgtatttgctacactgc 19301510  T
Q  109 acctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccct 208  Q
    ||||||| | |||||||  || |||| ||  || | ||||||| |||||||   |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  ||||    
T  19301511 acctatt-cttatgaatgattttctagttctacgatagttaac-aaaatagttctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccct 19301608  T
Q  209 gattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||| |||||||| | ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19301609 aatttcttaggtggtttaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 19301660  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 10106495 - 10106754
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |||| | |  ||| || | ||    
T  10106495 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtcttttgaatcatctatgtttcc-taat 10106593  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  10106594 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaa 10106691  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  10106692 ctacagcccctaattccttaggtggtctaataatatttgaagg-tgtaagcacgttaacctaat 10106754  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10885156 - 10884896
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatgga-gagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||| | |  |||||||| ||    
T  10885156 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatataagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaat 10885057  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  || ||||||||| |    
T  10885056 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaa 10884959  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | || ||||| |||||  |||||||||||||    
T  10884958 ctacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaat 10884896  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16244083 - 16243912
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||     
T  16244083 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagacc 16243986  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  16243985 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 16243912  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 32287307 - 32287479
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| | |     
T  32287307 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagggcc 32287404  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | || | ||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  32287405 ctcttctcaaactataatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtatgttaacctaat 32287479  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31549383 - 31549212
Alignment:
Q  86 agttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagac 185  Q
    |||| |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  31549383 agtttccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaataattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggac 31549286  T
Q  186 actcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
     ||||||| | | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  31549285 cctcttctaaaactacagaccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgttaaccta 31549212  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 49742967 - 49743075
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  49742967 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgt 49743066  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  49743067 taacctaat 49743075  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 261
Target Start/End: Original strand, 55034768 - 55035016
Alignment:
Q  16 taaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctat 114  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||| |    |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  55034768 taaatatcagaaaataaagatatgtttggaaaatacatggagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctat 55034867  T
Q  115 t---tcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgat 211  Q
    |   || |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  |  ||||||||| | ||||  |||| ||    
T  55034868 tcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaatcctcttctcaaactacatcccctaat 55034966  T
Q  212 tccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||| | || || | ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  55034967 tccttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacgttaacctaat 55035016  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2873774 - 2873603
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  2873774 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctaattccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 2873677  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2873676 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 2873603  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 16184671 - 16184843
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  16184671 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 16184768  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     | |||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16184769 tttttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 16184843  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Original strand, 6434762 - 6434931
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||     
T  6434762 gttcccctaattggtatactgcacctatttt-tatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagatagaacc 6434859  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6434860 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 6434931  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 30219902 - 30220147
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt-aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || || |||||  | ||||||| ||  | ||| ||| |||| | | ||||||||| |||    
T  30219902 ttgattgcataaaatttaaataactgaaagtaaaggtttgattagagaatatgag-agagatgagatcatgtctttcgaatcatctaagttcccctaatt 30220000  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||  ||| |||||||| | |||||||  ||||||| |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  | ||    
T  30220001 ggtcaactgcacctatt-cttatgaatgattctctagtttcacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcatagat 30220098  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaag 247  Q
    |  |  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  30220099 tgtaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagcttttaag 30220147  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 53816038 - 53815869
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||     
T  53816038 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 53815941  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  53815940 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 53815869  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10881690 - 10881519
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||     
T  10881690 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagttctaatcaatcctttgacttaagacc 10881593  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  10881592 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 10881519  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43927045 - 43926874
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  43927045 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 43926948  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43926947 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 43926874  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22783891 - 22783638
Alignment:
Q  9 ataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||||      
T  22783891 ataaaattaaataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacat 22783793  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattaca--gtc 205  Q
    ||| |||| | |||||||  ||||||| |||||| | ||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  | |    
T  22783792 cacatatt-cttatgaatgattctctagtttcacgatagttaac-ataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcc 22783695  T
Q  206 cctgattccttaggtgatctaatattattt-gaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22783694 cctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaat 22783638  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22788255 - 22788002
Alignment:
Q  9 ataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||||      
T  22788255 ataaaattaaataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacat 22788157  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattaca--gtc 205  Q
    ||| |||| | |||||||  ||||||| |||||| | ||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  | |    
T  22788156 cacatatt-cttatgaatgattctctagtttcacgatagttaac-ataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcc 22788059  T
Q  206 cctgattccttaggtgatctaatattattt-gaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22788058 cctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaat 22788002  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 20728695 - 20728802
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| || |    
T  20728695 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacat 20728793  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  20728794 taacctaat 20728802  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 35751587 - 35751479
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  35751587 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgt 35751488  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  35751487 taacctaat 35751479  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3840653 - 3840555
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| |||  || ||||||||| | ||||  |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3840653 taatcaatcccttgagttagtaccctcttctcaaactacaacccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 3840555  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24125705 - 24125538
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  24125705 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctct 24125608  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24125607 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 24125538  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24128982 - 24128815
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  24128982 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctct 24128885  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  24128884 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 24128815  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30690872 - 30690775
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30690872 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 30690775  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 50461532 - 50461704
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  50461532 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 50461629  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| || ||||||||||    
T  50461630 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaat 50461704  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54723952 - 54723780
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||| | ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||     
T  54723952 gttcccataattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 54723855  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  54723854 ctcttctcaaactacagcccctatttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaat 54723780  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 252
Target Start/End: Original strand, 28008086 - 28008218
Alignment:
Q  119 tatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttag 218  Q
    |||||||  ||||||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  28008086 tatgaattattctctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 28008184  T
Q  219 gtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||| ||||||| | |||||| ||| |||| ||||    
T  28008185 gtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt 28008218  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Original strand, 282184 - 282339
Alignment:
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| ||| ||||||| || |||||||| | ||||| ||| || |  ||||| ||||||||   |||||||||  ||||||||  || |||||||||     
T  282184 ttggtaaactgcacctatgtcttatgaatattcctctagttttacgatggttaattaaaatagttctaatcaatca-ttgacttagaaccctcttctcag 282282  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgtt 253  Q
    |||||| |  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  282283 attacaattactaattccttaggtgatctaatattcttcgaaggttttaagaacgtt 282339  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 8461383 - 8461640
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||| |||  |||||||| || |||||| ||| |||| | |  ||| |||| |||    
T  8461383 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagataaagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccctaatt 8461482  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | | |||||  |||| || || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  |  ||||||||| |     
T  8461483 ggtatactgcacctatt-cttgtgaatgattctatagttccatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgatttagtatcctcttctcaaac 8461580  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8461581 tacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaaaacgttaaccta 8461640  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 17040070 - 17040177
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  17040070 aaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 17040168  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  17040169 taacctaat 17040177  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 23298663 - 23298771
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||| |    
T  23298663 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaagaatctttcaaggttttaagaacat 23298762  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  23298763 taacctaat 23298771  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9392944 - 9392773
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  9392944 gttcccctaattggtatactacacctata-cttatgaatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 9392847  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | |  || |||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9392846 ctcttctcaaactctagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaactaat 9392773  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11784976 - 11784804
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||     
T  11784976 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttatgaatgattcactagttccacgatagttaac-aaaatagccctaataaatcccttgagttaggacc 11784879  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11784878 ctcttatcggattacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaagcacgttaatctaat 11784804  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47051642 - 47051534
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  47051642 aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 47051543  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  47051542 taacctaat 47051534  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27092040 - 27091936
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| ||| |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  27092040 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggac-ctcttctcaaactacatcccctaatttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 27091942  T
Q  253 taacct 258  Q
    ||||||    
T  27091941 taacct 27091936  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11190673 - 11190565
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||   ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| | ||||    
T  11190673 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaacctacaacccctaattccttaggtggtctaataattcttgaaggttttatgcacgt 11190574  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  11190573 taacctaat 11190565  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 12561282 - 12561389
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  12561282 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 12561380  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  12561381 taacctaat 12561389  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 22416882 - 22416989
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  22416882 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 22416980  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  22416981 taacctaat 22416989  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28265989 - 28265918
Alignment:
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28265989 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 28265918  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 32367177 - 32367284
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  32367177 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 32367275  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  32367276 taacctaat 32367284  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 47055072 - 47054964
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | || || |||| ||||| |||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  47055072 aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 47054973  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  47054972 taacctaat 47054964  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 46885087 - 46884980
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||  ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  46885087 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttgggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtgttctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 46884989  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  46884988 taacctaat 46884980  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 48064083 - 48064190
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| ||||    
T  48064083 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaagcacgt 48064181  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  48064182 taacctaat 48064190  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 20728525 - 20728576
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  20728525 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 20728576  T

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Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 2775801 - 2775765
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2775801 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 2775765  T

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Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 2779043 - 2779007
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2779043 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 2779007  T

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Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 25584993 - 25584957
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25584993 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 25584957  T

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Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 43927151 - 43927115
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  43927151 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagatt 43927115  T

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Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 45896697 - 45896661
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45896697 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 45896661  T

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Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 49742797 - 49742833
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  49742797 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 49742833  T

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Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 54720117 - 54720010
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| ||||    
T  54720117 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaagcacgt 54720019  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  54720018 taacctaat 54720010  T

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Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 261
Target Start/End: Original strand, 22172322 - 22172543
Alignment:
Q  41 ttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttc 139  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||  |||| |||||  ||||||| ||||| |||| ||||||| |||     
T  22172322 ttggaaaagatatagagagatgagactaggtcttttgaatcctctgagttttcctatttggcacactgtacctattccctataaatatttctctaattta 22172421  T
Q  140 actacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaag 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  22172422 acgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatattcttcgaag 22172521  T
Q  240 gttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  22172522 gttttaagaacgttaacctaat 22172543  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 261
Target Start/End: Original strand, 37739730 - 37739928
Alignment:
Q  63 gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagcca 162  Q
    ||||||||| ||| |||| |  ||||||| || ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |  |||| |||||||||||     
T  37739730 gactaggtctttcgaatcatcagagttcctctaattggtacactgcacctatgtcttatgaatatttctctagtttcacgatggttagctaaaatagccc 37739829  T
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37739830 taatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattactgtccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacattaacctaat 37739928  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12238478 - 12238218
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |||    
T  12238478 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaatt 12238379  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||    
T  12238378 ggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagat 12238281  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12238280 tacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaacctaat 12238218  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 97 - 258
Target Start/End: Original strand, 5677416 - 5677575
Alignment:
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||  | |||||| |  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||     
T  5677416 ttggtacactgtacctatttctcatgaatacttct--agtttcacgatggctaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcag 5677513  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5677514 attacagtccctaattccttaagtgatctaatattctttgaaggttttaaggacgttaacct 5677575  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 8877409 - 8877670
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt--aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||| ||  ||||| |||||||| | | |||||||||  |    
T  8877409 ttgattgcataaaattttaaagaacggaaagtaaagatttgattagaaaatatgag-agagatgagatcaggtctttcaaatcatctaagttcccctatt 8877507  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    | ||| ||| |||||||||| |||||||   |||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |    
T  8877508 tagtatactgcacctatttcttatgaatgactctctagtttcacgatggttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctccga 8877606  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||  |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8877607 tcacaacccctaatttcttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaatgttaacttaat 8877670  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 33408224 - 33408486
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagag--atg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||    |||||||||||||||||||  ||| |  |||||| ||| |||||| | ||||||||| |    
T  33408224 ttgattgcataaaattaaataaacataaaataaagatagttttggaaaatatatggagagtgatgagtttaggtctttcgaatcctctaagttcccctaa 33408323  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    | |||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  33408324 tcggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatggttaa-taaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaa 33408421  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | || |  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  33408422 actataacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaat 33408486  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 260
Target Start/End: Original strand, 40616805 - 40616976
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||||| ||| |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  40616805 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgcttttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 40616902  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaa 260  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40616903 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaa 40616976  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5670702 - 5670530
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | | ||||| ||| |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  5670702 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 5670605  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5670604 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 5670530  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5673020 - 5672848
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | | ||||| ||| |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  5673020 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 5672923  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5672922 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 5672848  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27014388 - 27014216
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||     
T  27014388 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagacc 27014291  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27014290 ctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaat 27014216  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 40903080 - 40903252
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  40903080 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggact 40903177  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40903178 ctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 40903252  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 44809016 - 44809124
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44809016 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgt 44809115  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  44809116 taacctaat 44809124  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 53094647 - 53094460
Alignment:
Q  73 ttcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| |||||| |   ||||| ||||||| | ||||||||||    
T  53094647 ttcaaatcctctaagttcccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatgattaac-aaaataggcctaatcaatcc 53094549  T
Q  173 cttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||| | |||||||||| ||||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  53094548 cttgacttaggaccctcttctcatagtacaacccctaactccttaggtggtctaatactctttgaatgttttatgaacgttaacttaat 53094460  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24150797 - 24150625
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  24150797 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 24150700  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150699 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 24150625  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40795123 - 40794955
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| | ||||| | | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  40795123 ccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctagttacacgatagttaac-agaatagtcctgatcaattccttgacttaagaccctct 40795026  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40795025 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 40794955  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 52006528 - 52006699
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  52006528 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaagacc 52006625  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  52006626 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtcaacctaat 52006699  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 56195652 - 56195480
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  56195652 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 56195555  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56195554 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 56195480  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 261
Target Start/End: Original strand, 8874778 - 8874930
Alignment:
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccc 207  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||  ||||||| |||    
T  8874778 cacctatttcttatgaatgattctctagtttcaagatggttaac-aaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattacagcccc 8874876  T
Q  208 tgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8874877 taattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacattaacttaat 8874930  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18911696 - 18911454
Alignment:
Q  16 taaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacaccta 113  Q
    ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |||| | |  |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  18911696 taaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcaccta 18911597  T
Q  114 tttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattc 213  Q
    || | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  18911596 tt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattc 18911499  T
Q  214 cttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||    
T  18911498 cttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccta 18911454  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15432291 - 15432032
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |||    
T  15432291 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatttgtttggaaaataataagagagatgagactaggtctttcgagtcatcgatgttcccctaatt 15432192  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| |  ||| | ||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |     
T  15432191 ggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagtaccacgatagttaac-aaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 15432094  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  15432093 tacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaatctaat 15432032  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 34017778 - 34017950
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||  || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||     
T  34017778 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctggttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttagaacc 34017875  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34017876 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 34017950  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39501773 - 39501601
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||| |||     
T  39501773 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggacc 39501676  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501675 ctcttatcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 39501601  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5681637 - 5681383
Alignment:
Q  3 gattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggt 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||| |    |||||| | ||||||    
T  5681637 gattgcataaaattaaataacataaaataaagatagttttggaaaagataaggagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggt 5681538  T
Q  102 acactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattac 201  Q
    | |||  | ||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||    
T  5681537 atactgaaactatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactac 5681440  T
Q  202 agtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||    
T  5681439 agcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccta 5681383  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5706603 - 5706376
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattgg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |||||    
T  5706603 ttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattgg 5706504  T
Q  101 tacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatta 200  Q
    || ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |||  || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  5706503 tatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagatta 5706405  T
Q  201 cagtccctgattccttaggtgatctaata 229  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5706404 cagtccctaattccttaggtgagctaata 5706376  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 34319978 - 34320086
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | || || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  34319978 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgt 34320077  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  34320078 taacctaat 34320086  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 3797719 - 3797976
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaa-agatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||  |||||||| |||  |||||||| ||  ||||| ||| |||| | |  |||||||| |||    
T  3797719 ttgattgcataaaattaaataacagaaaataacatagtt--ttggaaaagatagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 3797816  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | ||| |||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  3797817 ggtatactgcacctatt-cttattaatgattcactagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcacac 3797914  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  3797915 tacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 3797976  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 256
Target Start/End: Original strand, 33493748 - 33493859
Alignment:
Q  145 agttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtttt 244  Q
    ||||||||||||||| | || | ||| |||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  33493748 agttaactaaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaatgttta 33493847  T
Q  245 aagaacgttaac 256  Q
    ||||||||||||    
T  33493848 aagaacgttaac 33493859  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 24044138 - 24044309
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  24044138 gttcccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaca 24044235  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | ||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  24044236 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttaaagg-tttaaacacgttaacctaat 24044309  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 44164907 - 44164736
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| | |||||||  || | || || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  44164907 gttcccctaattggtatactacacatatt-cttatgaatgattttatagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggacc 44164810  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  44164809 ctcttctcaaactacaatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcaggttaacctaat 44164736  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 48415526 - 48415698
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | | |||     
T  48415526 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggact 48415623  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | |||||  ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48415624 ctcttctcaaactacagctcctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 48415698  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 52530932 - 52531104
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  52530932 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctaattccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 52531029  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52531030 ctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagagtgttaacctaat 52531104  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19820852 - 19820698
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  19820852 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacc 19820755  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19820754 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 19820698  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 38283550 - 38283657
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||    
T  38283550 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt-agcacgt 38283648  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  38283649 taacctaat 38283657  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 261
Target Start/End: Original strand, 48014170 - 48014221
Alignment:
Q  210 attccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48014170 attccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 48014221  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 27677052 - 27677223
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  ||     
T  27677052 gttcctctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccaccatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaacc 27677149  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27677150 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 27677223  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 46955475 - 46955647
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| |||  ||||||| ||  || | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||     
T  46955475 gttcccctaattggtatactgcacctatttg-tattaatgattctctaattcaacgatagttaac-aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggacc 46955572  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46955573 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgttaacctaat 46955647  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 261
Target Start/End: Original strand, 15812209 - 15812306
Alignment:
Q  164 aatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15812209 aatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaat 15812306  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 56198914 - 56198806
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  | ||||  ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||    
T  56198914 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctctaactacaacccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcatgt 56198815  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  56198814 taacctaat 56198806  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12782986 - 12782858
Alignment:
Q  131 tctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatat 230  Q
    |||| ||||| || ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||  |||| |||||||||||| |||||||     
T  12782986 tctagtttcattagagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacccttttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataa 12782888  T
Q  231 tatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12782887 tctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 12782858  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 261
Target Start/End: Original strand, 19859582 - 19859690
Alignment:
Q  152 taaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacg 251  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |    
T  19859582 taaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatg 19859680  T
Q  252 ttaacctaat 261  Q
    ||||||||||    
T  19859681 ttaacctaat 19859690  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15164254 - 15164146
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |  |    
T  15164254 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagat 15164155  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  15164154 taacctaat 15164146  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 15405142 - 15405250
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  15405142 aaaatagccctaatcaatccattgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 15405241  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  15405242 taacctaat 15405250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 261
Target Start/End: Original strand, 15446806 - 15446904
Alignment:
Q  162 ataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| || |||| | || ||||| |||||| |||||||||||||    
T  15446806 ataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaagg-tttaagcacgttaacctaat 15446904  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 37103124 - 37103384
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatgga-gagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||    |||||||||||||  | |||||| ||||| ||| ||| |||| | |  ||| |||| ||    
T  37103124 ttgattgcaataaaagtaaataatagaaaataaagatagttttggaaaatatatataagagatgagactaagtctttcgaatcatctatgtttccctaat 37103223  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||  || ||||||||| |    
T  37103224 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccctcttctcaaa 37103321  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| ||||||| |||| ||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||||    
T  37103322 ctacagcccctaattcctttggtggtctaataatcttcgaaggttt-aagcacgttaacctaat 37103384  T

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Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 15429853 - 15430024
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  |||     
T  15429853 gttcccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatccatcccttgacttgggacc 15429950  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15429951 cacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 15430024  T

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Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 15436467 - 15436638
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||  |||     
T  15436467 gttcccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatccatcccttgacttgggacc 15436564  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | ||||||| | ||| | |||| |||||||||||| ||||||  | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15436565 cacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 15436638  T

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Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33927097 - 33926925
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  33927097 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccataatcaatcccttgagttaggacc 33927000  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| | | ||||| |||| |||||| ||||| ||||||| |  |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  33926999 ctcttctaaaactacagcccctaattcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaagcacgttaacctaat 33926925  T

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Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 48637566 - 48637458
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaat-attatttgaaggttttaagaacg 251  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||||| |||    
T  48637566 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaatctttgaagg-tttaagcacg 48637468  T
Q  252 ttaacctaat 261  Q
    ||||||||||    
T  48637467 ttaacctaat 48637458  T

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Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29324886 - 29324778
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  | |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  29324886 aaaatagccctaatcaatcccttgagttatgaccattttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 29324787  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  29324786 taacctaat 29324778  T

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Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49270740 - 49270636
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||    
T  49270740 aaaatagtcctaatcaatcc-ttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccctaggtggtctaataat---tgaaggttttaagaatgt 49270645  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  49270644 taacctaat 49270636  T

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Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3719184 - 3719077
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||  ||||    
T  3719184 aaaatagtcctaatcaatcccttggcttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa-gatttaaacacgt 3719086  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  3719085 taacctaat 3719077  T

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Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 19864574 - 19864681
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||| |||||| | ||    
T  19864574 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgt 19864672  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  19864673 taacctaat 19864681  T

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Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 181
Target Start/End: Original strand, 48014030 - 48014157
Alignment:
Q  55 gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaacta 153  Q
    |||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||| || |||||||| ||||||| ||| || |  ||||||||    
T  48014030 gagagatgagacttggtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtactccgcatctatgtcttatgaatatttctctagttttacgaatgttaacta 48014129  T
Q  154 aaatagccataatcaatcccttgactta 181  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  48014130 aaatagccccaataaatcctttgactta 48014157  T

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Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 18673143 - 18673250
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    ||| || |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  18673143 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 18673241  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  18673242 taacctaat 18673250  T

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Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 35510025 - 35509949
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaata 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  35510025 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaata 35509949  T

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Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 3720581 - 3720530
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||    
T  3720581 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattttgtttgaaaatata 3720530  T

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Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 15429747 - 15429798
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  15429747 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagattcgttttgaaaatata 15429798  T

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Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 15436361 - 15436412
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  15436361 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagattcgttttgaaaatata 15436412  T

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Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30392714 - 30392522
Alignment:
Q  66 taggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataa 165  Q
    |||||| ||| |||| |||  |||||||| ||||||| | | |||||||||  |||||||  ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||  | |||    
T  30392714 taggtctttccaatcatatatgttcccctaattggtatattgcacctatttt-tatgaatgattcgctagttccacgatagttaac-aaaataatcctaa 30392617  T
Q  166 tcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30392616 tcaatcccttgaattaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctaaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 30392522  T

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Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 40795233 - 40795182
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | |||||||    
T  40795233 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatttggttaggaaatata 40795182  T

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Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 44165013 - 44164962
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  44165013 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagattcggtttgaaaatata 44164962  T

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Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 52006422 - 52006473
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || |||||||||    
T  52006422 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagattcggttagaaaatata 52006473  T

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Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 12786343 - 12786307
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  12786343 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 12786307  T

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Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 15445257 - 15445293
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15445257 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagatt 15445293  T

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Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 27676946 - 27676982
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27676946 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 27676982  T

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Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 27679338 - 27679393
Alignment:
Q  205 ccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27679338 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 27679393  T

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Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 38283380 - 38283416
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  38283380 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 38283416  T

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Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 48415416 - 48415452
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  48415416 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 48415452  T

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Target: scaffold0233 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10142 - 9895
Alignment:
Q  11 aaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactaca 109  Q
    |||| ||||||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||| ||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10142 aaaagtaaataacataaattaaatatt-gtttggaaaagataaggagagatgagactatgtcttttgaatcctctgagttcccctaattggtacactgca 10044  T
Q  110 cctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctg 209  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||     
T  10043 cctatttccttcgaatatttctctaatttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattagagtcccta 9944  T
Q  210 attccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9943 attccttatgtgttataatattatttgaaggttttaagaaagttaacct 9895  T

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Target: chr2 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 49)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34682888 - 34682639
Alignment:
Q  6 tgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtaca 104  Q
    ||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||| || ||||| |||  |||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||||    
T  34682888 tgcataaaagtaaataacataaattaaag--ttgtttagaaaagatagagagaaatgagactatgtctttcgaatcctctgagtttccctaattggtaca 34682791  T
Q  105 ctacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagt 204  Q
    || ||| |||||||||||| || ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  34682790 ctgcacgtatttcctatgagtatttctctagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcagattacagt 34682691  T
Q  205 ccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  34682690 ccctaattcctaaggtgatctaatattctttg--ggttttaagaacgttaacct 34682639  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5105921 - 5105662
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||   |||||||| ||  ||||| |||||||  | |  |||||||| ||||    
T  5105921 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatttggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcaaattatctatgttcccctaattg 5105822  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |    
T  5105821 gtatactgcacctatt-catatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaact 5105724  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5105723 acagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 5105662  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 30274766 - 30274938
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  30274766 gttctcctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaagacc 30274863  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30274864 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 30274938  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 25820756 - 25821013
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |    |||||||| |||    
T  25820756 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaatt 25820855  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    | || ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |     
T  25820856 gatatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 25820953  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||    
T  25820954 tacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccta 25821013  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 25138841 - 25139101
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||  ||||| ||| |||  |     || |||| |||    
T  25138841 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatttgtttggaaaatataagagagagatgagatcaggtctttcgaattatcgatatttccctaatt 25138940  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||| | ||||||   || || | || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |     
T  25138941 ggtatactgcacctatt-cttatgaacgattttcaagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 25139038  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25139039 tacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 25139101  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 9185422 - 9185594
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  9185422 gttcccctaattggtatactgcacatatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 9185519  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185520 ctcttctcaaactacagtctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 9185594  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 11347893 - 11348065
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  11347893 gttcccctaattggtatactgcatctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 11347990  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347991 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 11348065  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24235203 - 24235031
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||  ||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  24235203 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgatttcctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 24235106  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24235105 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 24235031  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 31427539 - 31427711
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  31427539 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctaattccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 31427636  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31427637 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 31427711  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 31585938 - 31586110
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  31585938 gttcccctaattggtatactgcatctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 31586035  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586036 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 31586110  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 13971805 - 13972063
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatggact-aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||| || ||||||||   ||||||||   | ||||| ||| |||| | |  |||||||| ||||    
T  13971805 ttgattgcataaaattaaataacataaaatgtagatttggttagaaaatatgaagagagatgatatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattg 13971904  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |    
T  13971905 gtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttaacttaggacactcttctcaaaat 13972002  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13972003 aaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 13972063  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 97 - 258
Target Start/End: Original strand, 35521367 - 35521528
Alignment:
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||  | |  ||||||||||||||   |||||||  | |||||||| ||| |||||||||     
T  35521367 ttggtatactacacctatttcctgtaaatatttctctagtttttcgatggttaactaaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcag 35521466  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  35521467 attacaatccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagagcgctaacct 35521528  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45457205 - 45457097
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||||||||    
T  45457205 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaagaacgt 45457106  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  45457105 taacctaat 45457097  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 26366130 - 26365869
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||  |||  | |  |||||||| ||    
T  26366130 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtcttttgaattatctatgttcccctaat 26366031  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| | |  ||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  26366030 tggtatagtgtacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaa 26365933  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  26365932 ctacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaat 26365869  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 25959686 - 25959858
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  25959686 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 25959783  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25959784 ctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgttaacctaat 25959858  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 37279674 - 37279846
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||      
T  37279674 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatc 37279771  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37279772 ctcttctcaaactacagcccctaattccttacgtggtctaataatctttgaaggttttaagaatgttaacctaat 37279846  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30926737 - 30926472
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt--aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatggact-aggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||||  |||||||| | | ||||| ||| |||||| || ||| |||| ||    
T  30926737 ttgattgcataaaattttaaataatagaaagtaaagatttgattagaaaatatagagagagatgaaatcaggtctttcgaatcctctg-gtttccctaat 30926639  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    || || ||| ||||||||| ||| ||||  || |||| |||||| |  |||| | ||||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |    
T  30926638 tgatatactgcacctattttctacgaatgattttctagtttcacgatggttagc-aaaatagtcctaatcaatccattgacttaggaccctcttctcaga 30926540  T
Q  198 ttacagtccctgattcc----ttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||  |||| |||||    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  30926539 tgacaacccctaattccttaattaggtggtctaatactctttgaaggttttatgaacgttaacttaat 30926472  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 9188650 - 9188822
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  9188650 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagtcaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 9188747  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188748 ctcttctcaaactacaacccctaattacttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 9188822  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24238401 - 24238303
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24238401 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagaacgttaacctaat 24238303  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 36808420 - 36808611
Alignment:
Q  67 aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataat 166  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |||||||   ||||    
T  36808420 aggtctttcaaatcctttaagttcccctaattggtacactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagttctaat 36808517  T
Q  167 caatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| | | ||||| |||| |||| ||||||| ||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||||    
T  36808518 caatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacagaccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaag-tttaagcacgttaacctaat 36808611  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 9966367 - 9966534
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||     
T  9966367 gttcccctaattggtatattgcacctatt-cttatgaattattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcataatcaaacccttgagttaggacc 9966464  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaac 256  Q
    ||||||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  9966465 ctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaac 9966534  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29440598 - 29440437
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  29440598 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctct 29440501  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaa 255  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  29440500 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaa 29440437  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 22021171 - 22021003
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  22021171 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctct 22021074  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22021073 tctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgttaacctaat 22021003  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 42368709 - 42368880
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  42368709 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 42368806  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42368807 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 42368880  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 43207888 - 43208059
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| | | |||     
T  43207888 gttcccctaattggtatactgcatctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagt-aggacc 43207984  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43207985 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgttaacctaat 43208059  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Original strand, 45493158 - 45493323
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||  || | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  45493158 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttctacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctct 45493255  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45493256 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 45493323  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Original strand, 45500900 - 45501065
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| ||  || | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  45500900 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttctacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctct 45500997  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  45500998 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 45501065  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8888764 - 8888572
Alignment:
Q  66 taggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataa 165  Q
    |||||| |||||||| | |  |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| |||||||   |||    
T  8888764 taggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagttctaa 8888667  T
Q  166 tcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  8888666 tcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 8888572  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40781579 - 40781408
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  40781579 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 40781482  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  40781481 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttgacctaat 40781408  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5666561 - 5666454
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  5666561 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 5666463  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  5666462 taacctaat 5666454  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6826815 - 6826708
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  6826815 aaaatagtcctaatcaaacccttgacttaggattctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatttttgaagg-tttaagcacgt 6826717  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  6826716 taacctaat 6826708  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 33310710 - 33310602
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| | ||    
T  33310710 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcaagt 33310611  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  33310610 taacctaat 33310602  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 38015562 - 38015454
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| || |    
T  38015562 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacct 38015463  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  38015462 taacctaat 38015454  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16179203 - 16179063
Alignment:
Q  119 tatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttag 218  Q
    |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| |||||||   ||||||  |||| |||||||||    
T  16179203 tatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacatcccctaattccttag 16179105  T
Q  219 gtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16179104 gtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 16179063  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 43723807 - 43723636
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| |||     
T  43723807 gttcccctaattggtatattgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcctttaacttaggacc 43723710  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| ||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  43723709 ctcgtctcaaactatagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgctaacctaat 43723636  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45453917 - 45453809
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  45453917 aaaatagcactaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 45453818  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  45453817 taacctaat 45453809  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25870817 - 25870720
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25870817 taatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 25870720  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27266832 - 27266726
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  27266832 aaaatagtcctaataaattccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgt 27266733  T
Q  253 taaccta 259  Q
    |||||||    
T  27266732 taaccta 27266726  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 1386484 - 1386591
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  1386484 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 1386582  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  1386583 taacctaat 1386591  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 37937281 - 37937388
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||  |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||| ||||    
T  37937281 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccccaattccttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaagcacgt 37937379  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  37937380 taacctaat 37937388  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3875394 - 3875253
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| ||||   ||| |||| ||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||    
T  3875394 gttcccctaattggtatactgcacatattctttattaataattcactagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaca 3875296  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaata 229  Q
    |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  3875295 ctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaata 3875253  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25874284 - 25874111
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  25874284 ccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtct 25874187  T
Q  191 tctcatattacagtccctga------ttccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||  |||| |      ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25874186 tctcaaactacatcccctaaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 25874111  T

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Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5666730 - 5666694
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  5666730 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 5666694  T

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Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 6826984 - 6826948
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6826984 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 6826948  T

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Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 31585832 - 31585868
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  31585832 ttgattgcataaaattaaataacaaaaaataaagatt 31585868  T

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Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 40781685 - 40781649
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  40781685 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 40781649  T

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Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 42368601 - 42368637
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  42368601 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 42368637  T

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Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 43207780 - 43207816
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43207780 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 43207816  T

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Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 43723913 - 43723877
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43723913 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 43723877  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 261
Target Start/End: Original strand, 48357 - 48572
Alignment:
Q  44 gaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcact 142  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    |  || ||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||     
T  48357 gaaaatatatggagagatgagactaggtcattcaaatcctctgattta---tttttagtatactgcacctatttcctataaatatttctctagtttcacg 48453  T
Q  143 acagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtt 242  Q
    |  || ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48454 atggtcaactaaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagattacggtccctaattccttaggtgatccaatattctttgaaggtt 48553  T
Q  243 ttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| ||| |||||| ||||    
T  48554 ttatgaatgttaacataat 48572  T

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Target: chr6 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 261
Target Start/End: Original strand, 11192557 - 11192747
Alignment:
Q  66 taggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataa 165  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||| |||| || ||| || |   ||||||||||||||| |||    
T  11192557 taggtctttcgaatcctctgaggtcccctaattggtacaatgcacctatttctcatgaatatttctatagttttacgatgattaactaaaatagccctaa 11192656  T
Q  166 tcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
         ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11192657 -----cccttgacttaagactctcttctcagactacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 11192747  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 261
Target Start/End: Original strand, 13021206 - 13021423
Alignment:
Q  45 aaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcacta 143  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||| ||  |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||| || |    
T  13021206 aaaatatagagagagatgagagtaggtcttttgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatttctcatgaatatttctctagttttacga 13021305  T
Q  144 cagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| || |||| |||    
T  13021306 tgattaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatattcttagaagattt 13021405  T
Q  244 taagaacgttaacctaat 261  Q
     |||||| ||||||||||    
T  13021406 gaagaacattaacctaat 13021423  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23008275 - 23008019
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    |||||||| ||  | ||| ||| |||||| |||||| || | ||||    
T  23008275 ttgattccataaaagtaaataacataaaataaagatttgtttggaaaataagaagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattg 23008176  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    || ||| ||||||||| | | |||||  |||| || |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  23008175 gtccacaacacctatt-cttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagatt 23008078  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||| | || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23008077 acagcctctaattccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacct 23008019  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 23780089 - 23780345
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    |||||||| ||  | ||| ||| |||||| |||||| || | ||||    
T  23780089 ttgattccataaaagtaaataacataaaataaagatttgtttggaaaataagaagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattg 23780188  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    || ||| ||||||||| | | |||||  |||| || |||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||    
T  23780189 gtccacaacacctatt-cttgtgaatgattctttagtttcacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagatt 23780286  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacct 258  Q
    |||| | || |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  23780287 acagcctctaattccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaacgttaacct 23780345  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2846441 - 2846257
Alignment:
Q  77 aatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttg 176  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| || ||||  ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2846441 aatcctctaagtccccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac-aaaatagccataatcaatcccttg 2846343  T
Q  177 acttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtttt-aagaacgttaacctaat 261  Q
    || || ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2846342 acataggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacgttaacttaat 2846257  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11247978 - 11247717
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaatt-aaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagaga--tg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||  || ||  || |  ||| |||||| || |||||||| |    
T  11247978 ttgattgcataaaatttaaataacagaaagtaaagatttgattagaaaatatagagagagagatgagatcagttttttcgaatcctctg-gttcccctaa 11247880  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    || ||| ||||||| |||||| || ||||  ||||||| |||||  |  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||  || ||||| |||     
T  11247879 tttgtatactacacttatttcttacgaatgattctctagtttcatgatggttaac-aaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactctcttatcag 11247781  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11247780 attacag-ccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 11247717  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 261
Target Start/End: Original strand, 12988082 - 12988294
Alignment:
Q  50 atatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagtt 148  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  |||||| | ||||||| | ||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||||| ||| || |   ||    
T  12988082 atatagagagatgtgactaggtcttttgaatcctctaagttcccgtaattggtacactgcacctattcctcatgaatatttctctagttttacgatgatt 12988181  T
Q  149 aactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaaga 248  Q
    |||  | |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||    
T  12988182 aacatacatagctctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaaga 12988281  T
Q  249 acgttaacctaat 261  Q
    ||| |||||||||    
T  12988282 acgctaacctaat 12988294  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 97 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28848960 - 28848798
Alignment:
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    ||||||||||| || |||| |  ||| ||||||||||| ||| || |  |||||||||||||| | | || |||||||||||||| | | |||||||||     
T  28848960 ttggtacactaaacttattcctcatggatacttctctagttttacgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaa 28848861  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28848860 attacagtccctaattccttaggtgatctgatattctttgaaggttttgagaacgttaaccta 28848798  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 3596693 - 3596950
Alignment:
Q  5 ttgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggt 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  ||| | |||||||| || |||||| ||| |||| | |  |||||||| ||||||    
T  3596693 ttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatatagttggaaagaataagagagagatgagattaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggt 3596792  T
Q  102 acactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattac 201  Q
    | ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |||    
T  3596793 atactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactac 3596890  T
Q  202 agtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3596891 agcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaat 3596950  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Original strand, 1125775 - 1125904
Alignment:
Q  131 tctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatat 230  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||     
T  1125775 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataa 1125873  T
Q  231 tatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125874 tctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 1125904  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 5738081 - 5738253
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  5738081 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 5738178  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5738179 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 5738253  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20185871 - 20185700
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  20185871 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggacc 20185774  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20185773 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaat 20185700  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 22150120 - 22150291
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  22150120 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggacc 22150217  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22150218 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgttaacctaat 22150291  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 9839391 - 9839563
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  9839391 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaagtagccctaatcaatcccttgacttaggacc 9839488  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||| |||||| |||||||||| ||||    
T  9839489 ctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgttaacttaat 9839563  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30655571 - 30655399
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||| |||| | |||||||  ||||||| || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  30655571 gttcccctaattggtatactgcacttatt-cttatgaatgattctctagttccataatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgaattaggacc 30655474  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655473 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 30655399  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 24371432 - 24371315
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| ||||| | |    
T  24371432 ttgattgcataaaagtaaataacagaaaataaagatttgtttggaaaatatatggagagatgagactaggtatttcgaatcctctgagtttccctgttcg 24371333  T
Q  100 gtacactacacctatttc 117  Q
    | ||||| ||||||||||    
T  24371332 gcacactgcacctatttc 24371315  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2379357 - 2379185
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  2379357 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 2379260  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |  | |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2379259 ctcttctcaaactacagcctgtaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 2379185  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 26942432 - 26942603
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  26942432 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cctatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 26942529  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26942530 ctcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 26942603  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6513382 - 6513211
Alignment:
Q  88 ttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacac 187  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |    
T  6513382 ttcccctaattgatatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggactc 6513285  T
Q  188 tcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6513284 tcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaat 6513211  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 17106520 - 17106778
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  | ||| ||| |||| | |  |||||||| ||||    
T  17106520 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattg 17106619  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| | | ||| |||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |    
T  17106620 gtatattgcacatatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaact 17106717  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17106718 acaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 17106778  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24371304 - 24371232
Alignment:
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24371304 ctcttatcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaaccta 24371232  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 9954090 - 9953919
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  9954090 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaataattttctaattccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacc 9953993  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9953992 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 9953919  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11402380 - 11402212
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  11402380 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgtttttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctct 11402283  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| ||| || |  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11402282 tcttatactatatcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 11402212  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13005316 - 13005144
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  13005316 gttcccctaattggtatacttcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgacc 13005219  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13005218 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagtacgttaacctaat 13005144  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 14281517 - 14281689
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||| | ||| |||||||| | |||||||  ||||||  |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||| |||     
T  14281517 gttcccctaattgggatactgcacctatt-cttatgaatgattctcttgtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggacc 14281614  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14281615 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacctaat 14281689  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 22561160 - 22561332
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||  |||||| | ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  22561160 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacc 22561257  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22561258 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaat 22561332  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 23384749 - 23384920
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  23384749 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgtttttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgatttaggacc 23384846  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23384847 ctcttctcaaactacagcccctaattccttagttgttctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 23384920  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 28111827 - 28111934
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  28111827 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagtacgt 28111925  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  28111926 taacctaat 28111934  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5260021 - 5259892
Alignment:
Q  128 ttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaa 227  Q
    ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||   ||||  || |||||||| |||||    
T  5260021 ttctctagtttcacgatggttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtctaa 5259926  T
Q  228 tattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    || | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5259925 tactctttgaaggttttaagaacgttaacttaat 5259892  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7128362 - 7128255
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||    
T  7128362 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacatttgaagg-tttaagcacgt 7128264  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  7128263 taacctaat 7128255  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 10290035 - 10289928
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | |||||||||| || ||||| |||  |||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| || |    
T  10290035 aaaatagtcctaatcaatcctttaacttaggaccttcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacat 10289937  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  10289936 taacctaat 10289928  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 28230657 - 28230550
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  28230657 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 28230559  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  28230558 taacctaat 28230550  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 28107784 - 28107958
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  28107784 gttcccctaattggtatactacagctatt-cttatgaatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 28107881  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatc---taatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| ||| |||| ||| ||   ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28107882 ctcttctcaaactacaacccctaatttcttacgtggtctaataatattctttgaagg-tttaagtacgttaacctaat 28107958  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 10290205 - 10290155
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatat 51  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  10290205 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatttagttagaaaatat 10290155  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 11729231 - 11729267
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11729231 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 11729267  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19476129 - 19475960
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | | |||||   |||||| ||| || | ||||||| ||||||| | |||||| |||||||| ||| |||     
T  19476129 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaac-aaaatagtcctaatcagtcccttgagttaggacc 19476032  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||  |||||||||||    
T  19476031 ctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaa-cacgttaaccta 19475960  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20185974 - 20185926
Alignment:
Q  4 attgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  20185974 attgcataaaattaaataacataaaataaagattgggtttgaaaatata 20185926  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 22150017 - 22150065
Alignment:
Q  4 attgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  22150017 attgcataaaattaaataacataaaataaagattgggtttgaaaatata 22150065  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 52
Target Start/End: Original strand, 23842693 - 23842741
Alignment:
Q  4 attgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  23842693 attgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 23842741  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 26896320 - 26896427
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||    |||||| |||| ||| |||||||| ||| |||   |||||||| |||||| || |    
T  26896320 aaaatagccataatcaatccattgagtttagaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctcataacctttgaagg-tttaagcacat 26896418  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  26896419 taacctaat 26896427  T

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Target: chr8 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 4868463 - 4868203
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataac-agaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |||| |||   |||||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||  ||  | || || ||    
T  4868463 ttgattgcataaaagtaaataaatagaaattaaatattat-ttggaaaagatatatagagatgagactaggtctttcgaatcctccgatgttccatgttt 4868365  T
Q  99 ggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatat 198  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||| || || |||||| |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||    
T  4868364 ggtatactgcacctatttcctattaatactcctatagtttcacgatggttaactaaa-tagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggat 4868266  T
Q  199 tacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4868265 tacagttcataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttcacctaat 4868203  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 18721189 - 18721450
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatgga-gagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  | |||||| ||||||||| ||| |||| | |  |||||||| ||    
T  18721189 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagtgttggaaaatatatataagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaat 18721288  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  18721289 tggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgactctcttctcata 18721386  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||| |||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18721387 ctacagcccctaatttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 18721450  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 22173833 - 22174092
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||| ||| |||| |    |||||||| ||||    
T  22173833 ttgattgcataaaattaaataacaggaaataaagattcggttagaaaatatgaagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattg 22173932  T
Q  100 gtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatatt 199  Q
    ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||| ||  ||   ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | |    
T  22173933 gtatactacacctatttg-tattaattattctctaattcaacgttagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaact 22174030  T
Q  200 acagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22174031 acaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 22174092  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 43681777 - 43682039
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataac-agaaagtaaagatttgcttggaaaatatat--ggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||||| |    
T  43681777 ttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaagatagttttgaaaaatatatatggagagatgagactaggtctttcgagtcttcaaggttcccctaa 43681876  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| ||||||| |||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  43681877 ttggtatactacacttatt-cttatgaatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcat 43681974  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  43681975 attacagtccctaattccgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaacctaat 43682039  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 25591476 - 25591648
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  25591476 gttcccctaattggtatactgcacctatttt-tatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagact 25591573  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25591574 ctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 25591648  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 261
Target Start/End: Original strand, 25594655 - 25594826
Alignment:
Q  88 ttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacac 187  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  25594655 ttcccctaattagtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactc 25594752  T
Q  188 tcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||||| | ||||| || | ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25594753 tcttctcaaactacagcccataattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 25594826  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 45155176 - 45155438
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagaga--tg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctga 96  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||| ||| |||||||  || ||  ||||| ||| |||| | |  |||||||| |    
T  45155176 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagataaggagagagctgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaa 45155275  T
Q  97 ttggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcat 196  Q
    |||||| | | |||||||| | |||||||  ||||||| |||| | | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  45155276 ttggtatattgcacctatt-cttatgaatgattctctagtttcgcgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaa 45155373  T
Q  197 attacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | || |  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  45155374 actaaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgttaacctaat 45155438  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14421803 - 14421697
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  14421803 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacgt 14421704  T
Q  253 taaccta 259  Q
    |||||||    
T  14421703 taaccta 14421697  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25231203 - 25231031
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  25231203 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacc 25231106  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | || || | || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25231105 ctcttctcaaactaaagcctctaattccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagtatgttaacctaat 25231031  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30785062 - 30784869
Alignment:
Q  67 aggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataat 166  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||| | |  ||||||||| || ||||  ||||||| |||||| | ||||||| |||||| || ||||    
T  30785062 aggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtatattgtacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatagttaac-aaaataaccctaat 30784964  T
Q  167 caatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||||| | ||| || ||| ||||||||  ||||||||| || |||||||||||||| |||  || | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  30784963 caatccatggacgtaggaccctcttctcggattacagtctctaattccttaggtgatttaaagttctctgaaggttttacgaacgttaacctaat 30784869  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 5538682 - 5538942
Alignment:
Q  1 ttgattgca-taaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatga-gttcccctgat 97  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| | ||| |||||||  ||    
T  5538682 ttgattgcaataaaagtaaataacagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagagatgagactaggtcttttgaatcat-tgatgttccccaaat 5538780  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| ||| |||||| ||| |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||  || ||||||||| |    
T  5538781 tggtatactgcaccta-ttcttatgaatgattctctagttgcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaaccctcttctcaaa 5538878  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
     ||||  |||| ||||| |||||| | || |  | ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  5538879 ctacaacccctaattccgtaggtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaat 5538942  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 5980310 - 5980481
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| | |||| ||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||     
T  5980310 gttcccttaattggtatactacacctatt-cttatggatgattttctagttccacaatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggacc 5980407  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | |||||||| | ||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5980408 ctcttctcaaactacagtccgtaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 5980481  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12583130 - 12582959
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  12583130 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttgac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacc 12583033  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12583032 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctaat 12582959  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 21279766 - 21279937
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  21279766 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttacatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagact 21279863  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  21279864 ctcttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaat 21279937  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23643911 - 23643770
Alignment:
Q  119 tatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttag 218  Q
    |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||    
T  23643911 tatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatctcttgagttatgaccctcttctcagattacagcctctaattccttag 23643813  T
Q  219 gtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23643812 gtggtctaataatctttaaaggttttaagcacgttaacctaat 23643770  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Original strand, 5613636 - 5613889
Alignment:
Q  9 ataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatggagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgattggtacacta 107  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||| ||| |||||| ||  ||||||| ||||| ||||      
T  5613636 ataaaattaaataacataaaataaagattggattagaaaatatggagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacat 5613734  T
Q  108 cacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattaca--gtc 205  Q
    ||| |||| | |||||||  ||||||| |||||| | ||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |  | |    
T  5613735 cacatatt-cttatgaatgattctctagtttcacgatagttaac-ataatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcc 5613832  T
Q  206 cctgattccttaggtgatctaatattattt-gaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5613833 cctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaacgttaacttaat 5613889  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 245
Target Start/End: Original strand, 12516514 - 12516606
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtttta 245  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12516514 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagattacaatccctaattccttagttgatctaatattctttgaaggtttta 12516606  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 18824455 - 18824563
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  18824455 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 18824554  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  18824555 taacctaat 18824563  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 18825948 - 18826056
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  18825948 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgt 18826047  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  18826048 taacctaat 18826056  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 36710633 - 36710805
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||| |||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||     
T  36710633 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cgtattaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggacc 36710730  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  36710731 ctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaat 36710805  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17931072 - 17930949
Alignment:
Q  119 tatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttag 218  Q
    |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  17931072 tatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttacgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttag 17930974  T
Q  219 gtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  17930973 gtggtctaataatctttgaaggttt 17930949  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 243
Target Start/End: Original strand, 33883351 - 33883501
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  33883351 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctct 33883448  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  33883449 tctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2560666 - 2560503
Alignment:
Q  96 attggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgactt-aagacactcttctc 194  Q
    ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  2560666 attggtatactgcacctatt-cttatgaatgattatctagttccacgatagttaac-aaaatagccataatcaatcacttgagtttaagactctcttctc 2560569  T
Q  195 atattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | ||||||  || | |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  2560568 agattacac-ccataattccttaggtggtctaataatctttgaaggctttaagcacgttaaactaat 2560503  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16953899 - 16953727
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  16953899 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 16953802  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||| |  | |||||||| ||| || ||||||||||    
T  16953801 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggcggtctaataattctcgaaggtttaaagcacattaacctaat 16953727  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10664017 - 10663852
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||| ||  |  | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || ||||    
T  10664017 ccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattctctagttctatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctct 10663920  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||| | ||||| || | |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10663919 tctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacattaaccta 10663852  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 38248460 - 38248567
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| || ||||    
T  38248460 aaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggacattcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagtttt-agtacgt 38248558  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  38248559 taacctaat 38248567  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 10498275 - 10498382
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  10498275 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagtacgt 10498373  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  10498374 taacctaat 10498382  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 13196915 - 13196808
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||  | ||||  |||| ||| |||||||  ||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  13196915 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcgaactacaacccctaatttcttaggtagtctaataatctttgaagg-tttgagcacgt 13196817  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  13196816 taacctaat 13196808  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 12583239 - 12583188
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  12583239 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcgattagaaaatata 12583188  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8911654 - 8911598
Alignment:
Q  205 ccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8911654 ccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgttaacataat 8911598  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 20887763 - 20887727
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20887763 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 20887727  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 23597426 - 23597390
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23597426 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 23597390  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31284732 - 31284625
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| ||||    
T  31284732 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacatcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaagcacgt 31284634  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  31284633 taacctaat 31284625  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 44027154 - 44027261
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||    
T  44027154 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaaacacgt 44027252  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  44027253 taacctaat 44027261  T

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Target: scaffold1208 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 138
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| ||| || | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||     
T  310 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttttacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaagact 213  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 138  T

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Target: scaffold0962 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 3190 - 3451
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataa-cagaaagtaaagatttgcttggaaaatatatg-gagagatg-gactaggtcattcaaatcctatgagttcccctgat 97  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||| | || |    |||||| | ||    
T  3190 ttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagagatgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccataat 3289  T
Q  98 tggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcata 197  Q
    ||||| | | |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  3290 tggtataatgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcata 3387  T
Q  198 ttacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3388 ttacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgtttacctaat 3451  T

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Target: scaffold0381 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Original strand, 5395 - 5567
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| |||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| |||||||     
T  5395 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagacc 5492  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5493 ctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaacgttagcctaat 5567  T

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Target: scaffold1063 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 2556 - 2448
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  2556 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcatactacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagcacgt 2457  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  2456 taacctaat 2448  T

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Target: scaffold0412 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 84
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  256 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 159  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158 ctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 84  T

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Target: scaffold0250 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19521 - 19349
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    ||||| || ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||  ||     
T  19521 gttcctctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgagttagaact 19424  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19423 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggttttaagaacgttaacctaat 19349  T

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Target: scaffold0427 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Original strand, 3789 - 3957
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  3789 ccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctct 3886  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3887 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaat 3957  T

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Target: scaffold0757 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5413 - 5306
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  5413 aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgt 5315  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  5314 taacctaat 5306  T

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Target: scaffold0757; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 5583 - 5532
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  5583 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 5532  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 293148 - 292979
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||  ||     
T  293148 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaacc 293051  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaaccta 259  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  293050 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaaccta 292979  T

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Target: scaffold0520 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Original strand, 8220 - 8387
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  8220 ccctaattggtatactacacctatt-cttatgaatgattttctatttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcgatcccttgacttaggaccctct 8317  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8318 tctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 8387  T

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Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 261
Target Start/End: Original strand, 1549 - 1716
Alignment:
Q  91 ccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactct 190  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  1549 ccctaattggtaaactgcacctatt-cttatgaatgattgtctagttacacaatagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccgtct 1646  T
Q  191 tctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||| | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | ||| || | |||||| |||||||||||||    
T  1647 tctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaag-tttaagcacgttaacctaat 1716  T

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Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 8110 - 8146
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatt 37  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8110 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagatt 8146  T

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Target: scaffold0334 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19400 - 19302
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19400 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaat 19302  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 62642 - 62471
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  62642 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacc 62545  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  62544 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 62471  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 198272 - 198101
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||| || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| |||     
T  198272 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaataattttctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggacc 198175  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | || || | || |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  198174 ctcttctcaaactatagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 198101  T

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Target: scaffold0080 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 27234 - 27063
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| || ||||| | |||||||  ||||||| || ||  | ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||     
T  27234 gttcccctaattggtatactgcatctatt-cttatgaatgattctctagttccatgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatccattgacttaagacc 27137  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27136 ctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 27063  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 241625 - 241471
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||||||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||     
T  241625 gttcccctaattggtatactgcacctatttt-tatgaatgattctctagttccacgatagttaac-aaaatagtcgtaatcaatcccttgagttaggacc 241528  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    ||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  241527 ctcttctcaaactgcaggccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 241471  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 248643 - 248489
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | ||||| |  || |||| || ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||     
T  248643 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgagtgattttctagttccacgacagttaac-aaaatagtcataatcaatcccttgacttaggacc 248546  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttt 243  Q
    |||||| || | ||||  |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  248545 ctcttcacaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 248489  T

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Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 248749 - 248698
Alignment:
Q  1 ttgattgcataaaattaaataacagaaagtaaagatttgcttggaaaatata 52  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||    
T  248749 ttgattgcataaaattaaataacataaaataaagattcggttagaaaatata 248698  T

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Target: scaffold0270 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 124 - 232
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||    
T  124 aaaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggcggtctaataatctttcaaggtttttagaacgt 223  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  224 taacctaat 232  T

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Target: scaffold0045 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 89831 - 89723
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||| |  | |||||||| ||| ||||    
T  89831 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagcacgt 89732  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||| ||||    
T  89731 taacttaat 89723  T

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Target: scaffold1755 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 172 - 75
Alignment:
Q  163 taatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  172 taatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacttcagtccctaattgcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 75  T

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Target: scaffold0002 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 245
Target Start/End: Original strand, 118451 - 118598
Alignment:
Q  96 attggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctca 195  Q
    |||||| |||| |||||||| | |||||||  ||| ||| |||||  | ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  118451 attggtccactgcacctatt-cttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaac-aaaatagcactaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcg 118548  T
Q  196 tattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggtttta 245  Q
      ||||||||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  118549 ggttacagtctataattccttagatgatctaatattctttgaaggtttta 118598  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Original strand, 57629 - 57758
Alignment:
Q  131 tctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatat 230  Q
    |||| |||||| | ||||||| ||||||| | ||||| |||| |||| ||| | | ||||||||| | ||||  |||||||| |||||||| |||||||     
T  57629 tctagtttcacgatagttaac-aaaatagtcctaatctatccattgagttagggccctcttctcaaactacatcccctgattgcttaggtggtctaatac 57727  T
Q  231 tatttgaaggttttaagaacgttaacctaat 261  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  57728 tctttgaaggttttacgaacgttaacttaat 57758  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31155 - 31048
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||    |||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||    
T  31155 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 31057  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  31056 taacctaat 31048  T

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Target: scaffold0807 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 2134 - 2241
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||   ||||||| || | ||| |||||||| ||||||| | || ||||| |||||| ||||    
T  2134 aaaatagccctaatcaatcccttgagttgggactctcttctaggattacagcccgtaatttcttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgt 2232  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  2233 taacctaat 2241  T

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Target: scaffold2073 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 864 - 1004
Alignment:
Q  87 gttcccctgattggtacactacacctatttcctatgaatacttctctactttcactacagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaagaca 186  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||||  || |||| || ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||||||||  ||| |||     
T  864 gttcccctaattggtatactgcacctatt-cttatgaatgattatctagttccacgatagttaac-aaaatagtcctaatcaatcccttgggttaggacc 961  T
Q  187 ctcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaata 229  Q
    ||||| ||| | ||||  |||| |||||||||||| |||||||    
T  962 ctcttttcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaata 1004  T

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Target: scaffold0321 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Original strand, 3066 - 3173
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| |||||||  | |||||  |||| |||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||| | ||    
T  3066 aaaatagtcctaatcaatccattgagttaggaccctcttctagtgttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaagg-tttaagcatgt 3164  T
Q  253 taacctaat 261  Q
    |||||||||    
T  3165 taacctaat 3173  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19341 - 19234
Alignment:
Q  153 aaaatagccataatcaatcccttgacttaagacactcttctcatattacagtccctgattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgt 252  Q
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T  19341 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagagttacaacccctaattccttagatggtctaataacctttgaagg-tttaagcacgt 19243  T
Q  253 taacctaat 261  Q
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T  19242 taacctaat 19234  T

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