View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2728R-Insertion-2 (Length: 940)
Name: NF2728R-Insertion-2
Description: NF2728R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2728R-Insertion-2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 791; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 791; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 856
Target Start/End: Original strand, 16484993 - 16485842
Alignment:
| Q |
9 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaataagacactattgtctatggtcaagt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16484993 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaaaaagacactattgtctatggtcaagt |
16485092 |
T |
|
| Q |
109 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485093 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
16485192 |
T |
|
| Q |
209 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485193 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcaaggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
16485292 |
T |
|
| Q |
309 |
agatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaa |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16485293 |
agatcacgttcttcttactaaacgcatgatgaagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcttcgtctcgccaaa |
16485392 |
T |
|
| Q |
409 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485393 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttcgggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
16485492 |
T |
|
| Q |
509 |
cgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
608 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485493 |
cgaaatattccgatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
16485592 |
T |
|
| Q |
609 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgctgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
708 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485593 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgttgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
16485692 |
T |
|
| Q |
709 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
808 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16485693 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgaggcggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
16485792 |
T |
|
| Q |
809 |
cattgactctttgga--gagatttcaattatgaattggggtcattttaaa |
856 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
16485793 |
cattgactctttggaagaagatttcaattatgaaattgggtcattttaaa |
16485842 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 680; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 856
Target Start/End: Original strand, 9459015 - 9459858
Alignment:
| Q |
9 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaataagacactattgtctatggtcaagt |
108 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459015 |
caaaccagtaacagaaccaatgttccgtcatcaaaccaacatcattattctcctccgaacctc------ctcaaaaagacactattgtctatggtcaagt |
9459108 |
T |
|
| Q |
109 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459109 |
aaaaaagacccagacttagaatcagcactatcgcgaaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatcctccgttaccctaacaaccaaa |
9459208 |
T |
|
| Q |
209 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459209 |
tcccaattcaaactcttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcaaggtaaagcccttaactggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
9459308 |
T |
|
| Q |
309 |
agatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaa |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9459309 |
agatcacgttcttcttactaaacgcatgatggagcttgttcatgaagaacaatccttgaaagattcccttgaatctgtttttgttccacgtctcgccaaa |
9459408 |
T |
|
| Q |
409 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459409 |
ttgctcatgctttctttgaataattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttaggctttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
9459508 |
T |
|
| Q |
509 |
cgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
608 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459509 |
caaaatatccggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
9459608 |
T |
|
| Q |
609 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgctgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
708 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459609 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgttgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
9459708 |
T |
|
| Q |
709 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
808 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9459709 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaaaaggaatgtaggtttggttcatgagttgttgt |
9459808 |
T |
|
| Q |
809 |
cattgactctttgga--gagatttcaattatgaattggggtcattttaaa |
856 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9459809 |
cattgactctttggaagaagatttcaattatgaaattgggtcattttaaa |
9459858 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 265 - 856
Target Start/End: Original strand, 9470506 - 9471099
Alignment:
| Q |
265 |
cttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatcaagatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcatgaagaacaatccc |
364 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9470506 |
cttaactggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatcaagatcacgttcttcttactaaacgcatgatggagcttgttcatgaagaacaatcct |
9470605 |
T |
|
| Q |
365 |
ttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaattgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaa |
464 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9470606 |
tgaaagattctcttgaatctgtttttgttccacgtctcgccaaattgctcatgttttctttgaataattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaa |
9470705 |
T |
|
| Q |
465 |
gaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtggcgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatg |
564 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
9470706 |
aaatagtttaggctttcctgatgattatttgattgggattgtgatgaaatatccggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggataagttctatg |
9470805 |
T |
|
| Q |
565 |
gtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctgaagttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgctgtttgc |
664 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9470806 |
gtggttgagttgatgaaatggaaccctgatttttctgtttctgaagttgcggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtattgtttgc |
9470905 |
T |
|
| Q |
665 |
cttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgagttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaa |
764 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9470906 |
cttctagttgggtgaaatcgttggaaaaatttcgcgaatttgagttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaa |
9471005 |
T |
|
| Q |
765 |
ggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgtcattgactctttgga--gagatttcaattatgaattggggtcattttaaa |
856 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
9471006 |
ggaaatggagaaaaggaatgtgggtttggttcatgagttgttgtcattgactctttggaagaagatttcaattatgaaattgggtcattttaaa |
9471099 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 9470346 - 9470502
Alignment:
| Q |
17 |
taacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaataagacactattgtctatggtcaagtaaaaa-ag |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
9470346 |
taacagaaccaatgttccgtcatcaaaccaacatcattattctccaccgaacctc------ctcaaaaagacactattgtctatggtcatgtaaaaacag |
9470439 |
T |
|
| Q |
116 |
acccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaa |
178 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9470440 |
acccaaacttagaatcagcactatcgcgaaacaaacattggataattaacaaccaaatcaaaa |
9470502 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 791; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 791; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 856
Target Start/End: Original strand, 44599444 - 44600293
Alignment:
| Q |
9 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaataagacactattgtctatggtcaagt |
108 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44599444 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaaaaagacactattgtctatggtcaagt |
44599543 |
T |
|
| Q |
109 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44599544 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
44599643 |
T |
|
| Q |
209 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
308 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44599644 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcaaggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
44599743 |
T |
|
| Q |
309 |
agatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaa |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44599744 |
agatcacgttcttcttactaaacgcatgatgaagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcttcgtctcgccaaa |
44599843 |
T |
|
| Q |
409 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44599844 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttcgggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
44599943 |
T |
|
| Q |
509 |
cgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
608 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44599944 |
cgaaatattccgatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
44600043 |
T |
|
| Q |
609 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgctgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
708 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44600044 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgttgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
44600143 |
T |
|
| Q |
709 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
808 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44600144 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgaggcggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
44600243 |
T |
|
| Q |
809 |
cattgactctttgga--gagatttcaattatgaattggggtcattttaaa |
856 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
44600244 |
cattgactctttggaagaagatttcaattatgaaattgggtcattttaaa |
44600293 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 664; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 856
Target Start/End: Original strand, 5722424 - 5723266
Alignment:
| Q |
9 |
caaactagtaacagaaccaatgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctcagaaccacttccttctcaataagacactattgtctatggtcaagt |
108 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5722424 |
caaaccagtaacagaacca-tgttccatcatcaaaccaacatcattattctcctccgaacctc------ctcaaaaagacactattgtctatggtcaagt |
5722516 |
T |
|
| Q |
109 |
aaaaaagacccatacttagaatcagcactatcacgcaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaa |
208 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5722517 |
aaaaaagacccagacttagaatcagcattatcgcgaaacaaacgttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatcctccgttaccctaacaaccaaa |
5722616 |
T |
|
| Q |
209 |
tcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
308 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5722617 |
tcccaattcaaactcttcagaagaaattcaaaaccctagatcttcaaggtaaagcccttaactggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatca |
5722716 |
T |
|
| Q |
309 |
agatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcatgaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaa |
408 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5722717 |
agatcacgttcttcttactaaacgcatgatggagcttgttcatgaagaacaatccttgaaagattctcttgaatctgtttttgttccacgtctcgccaaa |
5722816 |
T |
|
| Q |
409 |
ttgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5722817 |
ttgctcatgctttctttgaataattgtttgaatgttatgaagatcaatgaaattaagaatagtttaggctttcctgatgattatttgattgggattgtgg |
5722916 |
T |
|
| Q |
509 |
cgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
608 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5722917 |
cgaaatatccggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggaggagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttctga |
5723016 |
T |
|
| Q |
609 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgctgtttgccttctagttgggtgaaatcgttggagaaatttcgcgaatttgag |
708 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5723017 |
agttgaggctttggcgatgaagaacggggttgaggtgaatttttcgtgttgtttgccttctagttgggtgaaatcattggagaaatttcatgaatttgag |
5723116 |
T |
|
| Q |
709 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaagaggaatttgggtttggttcatgagttgttgt |
808 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5723117 |
ttggttccttatgtttcgccttattctgatccgagggggttggtggaagggtctaaggaaatggagaaaaggaatgtgggtttggttcatgagttgttgt |
5723216 |
T |
|
| Q |
809 |
cattgactctttgga--gagatttcaattatgaattggggtcattttaaa |
856 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
5723217 |
cattgactctttggaagaagatttcaattatgaaattgggtcattttaaa |
5723266 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 1884949 - 1884496
Alignment:
| Q |
152 |
gttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaatcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatct |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1884949 |
gttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatcctccgttaccctaacaaccaaattccaattcaaacccttcagaagaaattcaaaacgctagatct |
1884850 |
T |
|
| Q |
252 |
tcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatcaagatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcat |
351 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
1884849 |
tcaaggtaaagcctttaattggatttccaaatacccttcttacttccagtttcagaaagatcatgttcttctcactaaacgaatgattgaacttgttcat |
1884750 |
T |
|
| Q |
352 |
gaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaattgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaaga |
451 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1884749 |
gaagaacaatcccttaaagattccctggaatctgttttcgttcaacgtctcgccaaattgttcatgctttctttgaataattgtttgaatgctatgaaga |
1884650 |
T |
|
| Q |
452 |
tcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtggcgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggag |
551 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1884649 |
tcaatgaaattaagaatagtttagggtttcctgatgattatttgattcagattgtggcgaaatatccggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggag |
1884550 |
T |
|
| Q |
552 |
gagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttc |
605 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1884549 |
gagaagttctacggtcgttgagttgatgaaatagaaccctgattttgctgtttc |
1884496 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 152 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 5564813 - 5564360
Alignment:
| Q |
152 |
gttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatccttcgttaccctaacaaccaaatcccaatcctaacccttcagaagaaattcaaaaccctagatct |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5564813 |
gttggataattaacaaccaaatcaaaaacattatcctccgttaccctaacaaccaaattccaattcaaaccctttagaagaaagtcaaaacgctagatct |
5564714 |
T |
|
| Q |
252 |
tcatggtaaagctcttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcatcaagatcacgttcttcttactaaacgcgtgatggagcttgttcat |
351 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
5564713 |
tcaaggtaaagcccttaattggatttccaaatacccttcttgcttccagtttcagaaagatcacattcttctcactaaatgcatgatggaacttgttcat |
5564614 |
T |
|
| Q |
352 |
gaagaacaatcccttaaagattcccttgagtctgttttcgttcgtcgtctcgccaaattgctcatgctttctttgaacaattgtttgaatgttatgaaga |
451 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| |
|
|
| T |
5564613 |
gaagaacagtcctttaaagattcccttgaacctgttttcgttcaacatctcgccaaattgctcatgctttctttgaataattgttttagtgctatcaaga |
5564514 |
T |
|
| Q |
452 |
tcaatgaaattaagaatagtttagggcttcctgatgattatttgattgggattgtggcgaaatattcggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggag |
551 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5564513 |
tcaatgaaattaagaatagtttagggtttcctgatgattatttgattgggattgtggcaaaatatccggatttgtttcgaattaggaatgagagtgggag |
5564414 |
T |
|
| Q |
552 |
gagaagttctatggtggttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttc |
605 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5564413 |
gagaagttctatggtcgttgagttgatgaaatggaaccctgattttgctgtttc |
5564360 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University