View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2729_low_19 (Length: 542)

Name: NF2729_low_19
Description: NF2729
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2729_low_19
NF2729_low_19
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (245-411)||(41862236-41862402)
chr8 (245-413)||(32984075-32984243)
chr8 (245-412)||(25185915-25186082)
chr8 (245-413)||(9303572-9303740)
chr8 (245-413)||(33981661-33981829)
chr8 (245-412)||(43328723-43328890)
chr8 (245-411)||(24079901-24080067)
chr8 (245-412)||(5946063-5946230)
chr8 (244-411)||(35628792-35628959)
chr8 (245-415)||(9013700-9013869)
chr8 (245-411)||(10646139-10646305)
chr8 (245-413)||(17718720-17718888)
chr8 (245-413)||(33730639-33730807)
chr8 (245-420)||(2275929-2276103)
chr8 (246-413)||(13356118-13356285)
chr8 (245-411)||(40435153-40435319)
chr8 (245-411)||(41653911-41654077)
chr8 (245-410)||(37301326-37301491)
chr8 (245-409)||(32114265-32114429)
chr8 (245-413)||(37956437-37956605)
chr8 (245-392)||(2714565-2714712)
chr8 (245-412)||(45236564-45236731)
chr8 (245-407)||(31830959-31831121)
chr8 (245-411)||(37419956-37420122)
chr8 (245-413)||(41231962-41232130)
chr8 (245-412)||(6366002-6366169)
chr8 (245-411)||(9734271-9734435)
chr8 (245-388)||(29048426-29048569)
chr8 (246-392)||(45258527-45258673)
chr8 (245-410)||(41639930-41640095)
chr8 (245-413)||(45066590-45066758)
chr8 (245-392)||(13760667-13760814)
chr8 (245-410)||(22878407-22878572)
chr8 (245-411)||(25248055-25248215)
chr8 (245-392)||(44088462-44088609)
chr8 (285-413)||(12032986-12033114)
chr8 (245-397)||(42701303-42701456)
chr8 (298-414)||(31336163-31336279)
chr8 (295-417)||(41981534-41981656)
chr8 (278-411)||(3904126-3904258)
chr8 (245-336)||(39915887-39915978)
chr8 (245-412)||(4447294-4447450)
chr8 (250-331)||(41981454-41981535)
chr8 (253-415)||(3211229-3211380)
chr8 (245-411)||(10378325-10378480)
chr8 (245-325)||(117404-117484)
chr8 (245-411)||(31940331-31940485)
chr8 (245-325)||(40458847-40458927)
chr8 (245-325)||(4975482-4975562)
chr8 (245-325)||(27243214-27243294)
chr8 (245-325)||(27254789-27254869)
chr8 (245-397)||(41843269-41843410)
chr8 (253-325)||(32373801-32373873)
chr8 (245-336)||(3490463-3490554)
chr8 (253-415)||(33896839-33896990)
chr8 (245-411)||(9713705-9713857)
chr8 (245-411)||(2379156-2379311)
chr8 (245-325)||(9509475-9509555)
chr8 (245-325)||(38631668-38631748)
chr8 (245-325)||(40649906-40649986)
chr8 (245-290)||(33622575-33622620)
chr8 (245-337)||(31148954-31149045)
chr8 (245-336)||(26196381-26196471)
chr8 (342-402)||(40649840-40649900)
chr8 (342-388)||(41425452-41425497)
chr8 (342-411)||(117329-117398)
chr8 (352-413)||(26196315-26196376)
[»] chr3 (117 HSPs)
chr3 (245-413)||(47257809-47257977)
chr3 (245-411)||(37324557-37324723)
chr3 (245-418)||(47809589-47809763)
chr3 (245-411)||(51102378-51102544)
chr3 (246-414)||(39634569-39634736)
chr3 (245-413)||(40130957-40131125)
chr3 (245-413)||(42291858-42292026)
chr3 (245-412)||(29625826-29625993)
chr3 (245-411)||(24100299-24100464)
chr3 (245-410)||(51170034-51170199)
chr3 (245-413)||(32234396-32234563)
chr3 (245-415)||(49330053-49330223)
chr3 (245-411)||(52628970-52629135)
chr3 (245-414)||(38416721-38416890)
chr3 (245-397)||(37313415-37313567)
chr3 (245-413)||(41293317-41293484)
chr3 (246-413)||(7855112-7855279)
chr3 (245-416)||(20754388-20754559)
chr3 (245-411)||(28048392-28048558)
chr3 (246-415)||(43612043-43612212)
chr3 (245-414)||(44806700-44806869)
chr3 (245-410)||(55453245-55453410)
chr3 (245-413)||(53943586-53943753)
chr3 (245-412)||(27066977-27067144)
chr3 (245-412)||(35748310-35748477)
chr3 (245-416)||(40643816-40643987)
chr3 (245-411)||(22399113-22399278)
chr3 (245-411)||(41464368-41464534)
chr3 (245-410)||(43021730-43021896)
chr3 (245-411)||(44222845-44223011)
chr3 (246-412)||(48739232-48739398)
chr3 (245-413)||(51452749-51452916)
chr3 (245-412)||(2666016-2666183)
chr3 (245-412)||(40419851-40420018)
chr3 (245-412)||(40804509-40804676)
chr3 (245-416)||(43125847-43126017)
chr3 (252-414)||(46126010-46126171)
chr3 (245-413)||(35594137-35594305)
chr3 (249-409)||(48609743-48609903)
chr3 (245-411)||(46134372-46134538)
chr3 (245-413)||(7755305-7755472)
chr3 (245-409)||(43183928-43184092)
chr3 (245-380)||(39053410-39053545)
chr3 (245-389)||(52215092-52215236)
chr3 (245-413)||(52638858-52639026)
chr3 (245-421)||(18946919-18947096)
chr3 (245-386)||(24376589-24376730)
chr3 (245-378)||(53637857-53637990)
chr3 (245-381)||(36368955-36369091)
chr3 (261-392)||(46949406-46949536)
chr3 (245-411)||(51146215-51146381)
chr3 (246-392)||(53832503-53832649)
chr3 (245-413)||(41216471-41216639)
chr3 (245-392)||(41732544-41732691)
chr3 (245-411)||(5560025-5560198)
chr3 (245-409)||(47894822-47894986)
chr3 (245-413)||(54401203-54401360)
chr3 (246-375)||(37758946-37759075)
chr3 (292-413)||(52864553-52864673)
chr3 (245-415)||(42589846-42590005)
chr3 (296-413)||(33550465-33550582)
chr3 (245-414)||(31286790-31286948)
chr3 (246-337)||(54159062-54159153)
chr3 (245-413)||(25641662-25641819)
chr3 (245-380)||(34279752-34279876)
chr3 (245-412)||(54707219-54707375)
chr3 (245-411)||(38156632-38156787)
chr3 (245-411)||(47510940-47511095)
chr3 (246-325)||(39141201-39141280)
chr3 (245-416)||(48546835-48546995)
chr3 (245-414)||(49130594-49130752)
chr3 (245-414)||(51415985-51416143)
chr3 (248-380)||(17665555-17665676)
chr3 (278-360)||(47182049-47182131)
chr3 (245-413)||(53115463-53115620)
chr3 (249-413)||(55000176-55000329)
chr3 (245-411)||(37028739-37028894)
chr3 (245-325)||(41635875-41635955)
chr3 (245-325)||(45058899-45058979)
chr3 (245-411)||(55380001-55380156)
chr3 (245-412)||(25353570-25353726)
chr3 (245-314)||(44946015-44946084)
chr3 (245-411)||(24688130-24688285)
chr3 (245-325)||(40022090-40022170)
chr3 (245-325)||(51224113-51224192)
chr3 (245-336)||(30251565-30251656)
chr3 (245-328)||(41882063-41882146)
chr3 (245-410)||(51143833-51143987)
chr3 (253-336)||(42998853-42998936)
chr3 (245-328)||(50731986-50732069)
chr3 (245-328)||(50780787-50780870)
chr3 (259-336)||(40165681-40165758)
chr3 (245-337)||(47402813-47402904)
chr3 (245-328)||(21597220-21597303)
chr3 (245-328)||(28576184-28576267)
chr3 (245-328)||(48726070-48726153)
chr3 (342-415)||(48534003-48534076)
chr3 (264-325)||(52756146-52756207)
chr3 (245-337)||(2227998-2228090)
chr3 (324-412)||(30429226-30429314)
chr3 (245-336)||(177177-177268)
chr3 (352-410)||(48752226-48752284)
chr3 (342-415)||(41635796-41635869)
chr3 (245-337)||(8847721-8847813)
chr3 (245-305)||(48752101-48752161)
chr3 (342-413)||(39141123-39141193)
chr3 (245-336)||(43176802-43176893)
chr3 (360-411)||(50731914-50731965)
chr3 (360-411)||(50780891-50780942)
chr3 (259-337)||(41609097-41609175)
chr3 (352-402)||(52434291-52434341)
chr3 (245-305)||(52434155-52434216)
chr3 (352-412)||(177273-177333)
chr3 (245-281)||(37741451-37741487)
chr3 (359-415)||(40688431-40688487)
chr3 (342-414)||(44945932-44946004)
chr3 (351-411)||(52756067-52756127)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (245-416)||(31308017-31308188)
chr1 (245-413)||(17994949-17995117)
chr1 (245-417)||(21139406-21139578)
chr1 (245-412)||(38790196-38790363)
chr1 (245-411)||(3611152-3611318)
chr1 (241-411)||(26085398-26085568)
chr1 (245-411)||(45538169-45538335)
chr1 (245-413)||(5981186-5981354)
chr1 (245-413)||(44661986-44662154)
chr1 (245-411)||(26277193-26277359)
chr1 (245-413)||(31040725-31040893)
chr1 (245-411)||(25678259-25678425)
chr1 (245-411)||(33112818-33112983)
chr1 (245-402)||(4068692-4068849)
chr1 (245-413)||(6327546-6327713)
chr1 (245-413)||(24885517-24885685)
chr1 (245-413)||(38331857-38332025)
chr1 (245-409)||(43251727-43251891)
chr1 (245-411)||(25058704-25058870)
chr1 (245-407)||(26794320-26794482)
chr1 (245-411)||(37620192-37620358)
chr1 (245-414)||(26524886-26525055)
chr1 (245-418)||(33884104-33884277)
chr1 (245-418)||(33959975-33960148)
chr1 (245-413)||(23932507-23932675)
chr1 (245-413)||(23984771-23984939)
chr1 (245-397)||(46616565-46616717)
chr1 (245-412)||(39646584-39646751)
chr1 (245-420)||(49253966-49254141)
chr1 (245-412)||(50774233-50774400)
chr1 (245-411)||(5980084-5980250)
chr1 (245-411)||(24245025-24245191)
chr1 (245-411)||(49398988-49399154)
chr1 (245-410)||(3285418-3285582)
chr1 (245-415)||(35692659-35692830)
chr1 (245-412)||(41999831-41999998)
chr1 (262-413)||(42313359-42313510)
chr1 (245-411)||(46784439-46784605)
chr1 (245-411)||(47317331-47317497)
chr1 (245-411)||(47383732-47383898)
chr1 (245-411)||(47671602-47671768)
chr1 (264-411)||(2450529-2450676)
chr1 (245-392)||(42863881-42864028)
chr1 (245-367)||(23220973-23221095)
chr1 (245-367)||(25518830-25518952)
chr1 (245-411)||(35273612-35273778)
chr1 (245-411)||(36566346-36566512)
chr1 (244-392)||(28888596-28888744)
chr1 (245-381)||(31844392-31844528)
chr1 (245-411)||(46967041-46967207)
chr1 (245-411)||(51057087-51057253)
chr1 (245-413)||(36003146-36003317)
chr1 (270-411)||(51045596-51045737)
chr1 (261-419)||(47187137-47187295)
chr1 (245-413)||(48373520-48373679)
chr1 (245-335)||(51403083-51403173)
chr1 (266-388)||(45475866-45475987)
chr1 (245-411)||(27983603-27983753)
chr1 (245-411)||(2657319-2657474)
chr1 (245-411)||(41467632-41467787)
chr1 (245-414)||(33073227-33073385)
chr1 (245-337)||(31980009-31980101)
chr1 (245-348)||(2556909-2557012)
chr1 (283-414)||(4808699-4808830)
chr1 (245-413)||(10928083-10928240)
chr1 (279-413)||(47772170-47772304)
chr1 (245-411)||(4243490-4243645)
chr1 (245-325)||(26472254-26472334)
chr1 (245-410)||(6626025-6626179)
chr1 (245-413)||(4953068-4953225)
chr1 (280-412)||(4156438-4156577)
chr1 (245-325)||(32448664-32448744)
chr1 (245-325)||(42234856-42234936)
chr1 (245-414)||(29770686-29770844)
chr1 (245-336)||(52323954-52324045)
chr1 (245-321)||(13313253-13313329)
chr1 (245-325)||(44544121-44544201)
chr1 (245-320)||(24649802-24649877)
chr1 (245-402)||(34752323-34752469)
chr1 (253-336)||(38716311-38716394)
chr1 (245-325)||(13281637-13281717)
chr1 (245-325)||(30289985-30290065)
chr1 (245-325)||(44293530-44293610)
chr1 (245-325)||(46428328-46428408)
chr1 (253-336)||(2954879-2954962)
chr1 (245-415)||(26685872-26686031)
chr1 (246-336)||(27924722-27924812)
chr1 (245-339)||(33187356-33187450)
chr1 (245-310)||(7561632-7561697)
chr1 (318-411)||(13312531-13312624)
chr1 (245-392)||(51155608-51155744)
chr1 (245-325)||(35991674-35991754)
chr1 (245-411)||(41895164-41895319)
chr1 (245-336)||(10920216-10920307)
chr1 (246-336)||(1388490-1388580)
chr1 (350-407)||(39359502-39359559)
chr1 (245-337)||(39475846-39475937)
chr1 (260-336)||(52367914-52367990)
chr1 (245-288)||(4156188-4156231)
chr1 (253-336)||(48683394-48683477)
chr1 (246-336)||(5961331-5961421)
chr1 (248-319)||(39637919-39637986)
chr1 (356-411)||(33187450-33187505)
chr1 (272-380)||(24215806-24215903)
chr1 (342-414)||(42234942-42235013)
chr1 (326-398)||(47605498-47605569)
chr1 (354-413)||(2954969-2955028)
chr1 (348-411)||(7561528-7561591)
chr1 (342-392)||(30289929-30289979)
chr1 (341-386)||(46428278-46428323)
chr1 (359-420)||(52324058-52324119)
chr1 (245-281)||(10919313-10919349)
chr1 (342-402)||(26472188-26472248)
[»] scaffold0949 (1 HSPs)
scaffold0949 (245-411)||(1885-2051)
[»] chr4 (130 HSPs)
chr4 (249-411)||(26091258-26091420)
chr4 (245-413)||(34276563-34276731)
chr4 (245-412)||(2826681-2826847)
chr4 (245-411)||(23437608-23437774)
chr4 (245-413)||(45797495-45797663)
chr4 (245-415)||(2243474-2243644)
chr4 (245-411)||(9798481-9798647)
chr4 (245-411)||(21366609-21366775)
chr4 (245-411)||(47344672-47344838)
chr4 (245-411)||(51363023-51363188)
chr4 (245-412)||(39077561-39077728)
chr4 (245-411)||(31972336-31972502)
chr4 (245-411)||(44984777-44984943)
chr4 (248-414)||(53461813-53461979)
chr4 (245-411)||(53854430-53854595)
chr4 (245-410)||(6019944-6020109)
chr4 (245-410)||(32366661-32366826)
chr4 (245-418)||(55776061-55776233)
chr4 (245-418)||(55840239-55840411)
chr4 (245-413)||(237493-237661)
chr4 (245-409)||(397418-397582)
chr4 (245-405)||(33897501-33897661)
chr4 (245-412)||(42085223-42085390)
chr4 (245-411)||(27373092-27373257)
chr4 (245-411)||(29478376-29478542)
chr4 (249-411)||(54574940-54575102)
chr4 (246-392)||(54607979-54608125)
chr4 (245-414)||(3692207-3692376)
chr4 (246-415)||(19387684-19387853)
chr4 (245-411)||(41949398-41949566)
chr4 (245-413)||(42765840-42766007)
chr4 (245-412)||(43471694-43471861)
chr4 (245-411)||(18462013-18462179)
chr4 (245-411)||(31532135-31532301)
chr4 (241-411)||(54086421-54086590)
chr4 (245-414)||(22618511-22618678)
chr4 (245-414)||(29777254-29777423)
chr4 (245-414)||(47662099-47662268)
chr4 (245-389)||(146451-146595)
chr4 (245-409)||(41702461-41702625)
chr4 (245-392)||(3170642-3170789)
chr4 (245-408)||(6285323-6285486)
chr4 (245-392)||(22468789-22468936)
chr4 (245-412)||(55056258-55056425)
chr4 (245-411)||(41560344-41560510)
chr4 (245-407)||(50536628-50536790)
chr4 (245-411)||(49881059-49881229)
chr4 (246-411)||(55519844-55520009)
chr4 (245-417)||(31070068-31070239)
chr4 (245-412)||(31914214-31914380)
chr4 (245-411)||(23609103-23609269)
chr4 (245-411)||(42033191-42033357)
chr4 (245-414)||(50234016-50234185)
chr4 (245-397)||(50534647-50534799)
chr4 (248-392)||(54425001-54425145)
chr4 (246-414)||(38591685-38591849)
chr4 (245-416)||(50457805-50457976)
chr4 (245-411)||(407770-407934)
chr4 (245-411)||(41632007-41632172)
chr4 (245-411)||(42222307-42222473)
chr4 (245-413)||(14017374-14017540)
chr4 (269-413)||(48657858-48658002)
chr4 (246-410)||(53834055-53834219)
chr4 (269-416)||(52728302-52728448)
chr4 (245-411)||(48313573-48313737)
chr4 (245-411)||(56022998-56023164)
chr4 (247-415)||(48259508-48259674)
chr4 (245-413)||(48654830-48655004)
chr4 (245-407)||(35446522-35446683)
chr4 (245-411)||(39587781-39587945)
chr4 (285-413)||(36532828-36532956)
chr4 (245-413)||(1932779-1932947)
chr4 (245-411)||(54805614-54805784)
chr4 (245-411)||(9997931-9998086)
chr4 (245-411)||(45633779-45633934)
chr4 (245-413)||(4486579-4486736)
chr4 (316-417)||(35595774-35595875)
chr4 (245-411)||(49014114-49014269)
chr4 (246-409)||(51951699-51951861)
chr4 (245-380)||(5117469-5117593)
chr4 (245-411)||(34552335-34552490)
chr4 (245-313)||(42557598-42557666)
chr4 (277-368)||(52396774-52396866)
chr4 (245-413)||(37239088-37239245)
chr4 (245-413)||(43890944-43891101)
chr4 (245-413)||(54715051-54715208)
chr4 (245-416)||(20351837-20351997)
chr4 (248-325)||(31881389-31881466)
chr4 (245-325)||(15060364-15060444)
chr4 (245-325)||(22620609-22620689)
chr4 (245-325)||(46708816-46708896)
chr4 (245-415)||(47811922-47812081)
chr4 (245-336)||(14335165-14335256)
chr4 (245-414)||(34835193-34835351)
chr4 (245-409)||(33557944-33558097)
chr4 (245-380)||(27873579-27873703)
chr4 (309-410)||(35344868-35344968)
chr4 (245-325)||(3293098-3293178)
chr4 (245-325)||(11972204-11972284)
chr4 (292-392)||(42509359-42509459)
chr4 (249-411)||(52688369-52688520)
chr4 (245-325)||(54216329-54216409)
chr4 (245-325)||(54216811-54216891)
chr4 (246-337)||(27398666-27398757)
chr4 (245-336)||(27580135-27580226)
chr4 (245-336)||(38547665-38547756)
chr4 (241-328)||(43231514-43231601)
chr4 (245-341)||(1662318-1662414)
chr4 (342-410)||(33048994-33049062)
chr4 (244-336)||(46720040-46720132)
chr4 (245-413)||(6371247-6371404)
chr4 (252-380)||(52461386-52461503)
chr4 (245-411)||(33289719-33289873)
chr4 (342-415)||(48259700-48259772)
chr4 (343-419)||(3291797-3291873)
chr4 (253-336)||(573827-573910)
chr4 (344-414)||(42558300-42558370)
chr4 (245-335)||(49057933-49058023)
chr4 (262-336)||(27872612-27872686)
chr4 (342-411)||(15060289-15060358)
chr4 (246-314)||(18206608-18206676)
chr4 (359-418)||(1662254-1662313)
chr4 (245-280)||(17555617-17555652)
chr4 (342-377)||(51981513-51981548)
chr4 (266-325)||(51981554-51981613)
chr4 (342-380)||(22620695-22620733)
chr4 (342-412)||(46708740-46708810)
chr4 (327-381)||(49304602-49304655)
chr4 (342-414)||(31881311-31881383)
chr4 (352-412)||(38547600-38547660)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (245-418)||(5882522-5882695)
chr6 (245-414)||(26377201-26377370)
chr6 (245-412)||(11988973-11989140)
chr6 (245-411)||(28947103-28947269)
chr6 (10-229)||(7104706-7104915)
chr6 (10-229)||(8789715-8789924)
chr6 (245-417)||(18101489-18101661)
chr6 (245-413)||(34527860-34528028)
chr6 (245-416)||(959899-960070)
chr6 (245-407)||(14891383-14891545)
chr6 (245-411)||(33452572-33452738)
chr6 (245-410)||(19281056-19281221)
chr6 (245-412)||(24168107-24168274)
chr6 (245-411)||(8615256-8615422)
chr6 (245-411)||(22551061-22551227)
chr6 (245-414)||(19415530-19415699)
chr6 (245-413)||(2593850-2594018)
chr6 (245-409)||(2892204-2892368)
chr6 (245-413)||(7393584-7393752)
chr6 (245-405)||(16703382-16703542)
chr6 (245-414)||(22341785-22341956)
chr6 (245-392)||(7345131-7345278)
chr6 (245-417)||(599908-600080)
chr6 (245-397)||(1970727-1970879)
chr6 (245-411)||(24224070-24224236)
chr6 (245-412)||(10507907-10508074)
chr6 (245-414)||(30743445-30743614)
chr6 (246-413)||(5294799-5294966)
chr6 (246-413)||(5299351-5299518)
chr6 (245-358)||(30467656-30467769)
chr6 (412-500)||(7104907-7104995)
chr6 (412-500)||(8789635-8789723)
chr6 (261-413)||(23261927-23262079)
chr6 (245-411)||(28948845-28949000)
chr6 (245-412)||(15965449-15965605)
chr6 (248-411)||(4487546-4487698)
chr6 (245-411)||(1398569-1398724)
chr6 (245-402)||(13329397-13329543)
chr6 (245-311)||(929675-929741)
chr6 (245-411)||(7167598-7167753)
chr6 (245-321)||(1939583-1939659)
chr6 (245-325)||(3291024-3291104)
chr6 (246-325)||(3786766-3786845)
chr6 (246-327)||(375797-375878)
chr6 (342-413)||(3291110-3291181)
chr6 (342-411)||(3786851-3786920)
chr6 (342-411)||(18661836-18661905)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (245-421)||(4034607-4034783)
chr2 (245-415)||(34518382-34518552)
chr2 (245-412)||(14660461-14660628)
chr2 (245-411)||(746481-746647)
chr2 (245-411)||(10244582-10244748)
chr2 (245-411)||(23901794-23901960)
chr2 (245-414)||(17600851-17601020)
chr2 (245-413)||(6594456-6594624)
chr2 (245-412)||(40635233-40635400)
chr2 (245-415)||(7892684-7892854)
chr2 (245-411)||(11184987-11185153)
chr2 (245-411)||(27400418-27400584)
chr2 (245-411)||(38997116-38997282)
chr2 (245-411)||(45371005-45371171)
chr2 (245-414)||(27024430-27024599)
chr2 (245-413)||(1091949-1092117)
chr2 (245-413)||(2324887-2325055)
chr2 (245-417)||(13815212-13815384)
chr2 (245-412)||(27651033-27651200)
chr2 (249-415)||(6430492-6430658)
chr2 (245-411)||(26710360-26710526)
chr2 (245-408)||(10424610-10424773)
chr2 (245-411)||(4609641-4609807)
chr2 (245-411)||(5726144-5726310)
chr2 (245-411)||(32327376-32327542)
chr2 (245-415)||(32856432-32856602)
chr2 (245-411)||(2914138-2914304)
chr2 (245-411)||(40735479-40735645)
chr2 (245-411)||(11159637-11159802)
chr2 (245-410)||(12842118-12842278)
chr2 (246-411)||(14697537-14697702)
chr2 (245-381)||(8432946-8433082)
chr2 (245-377)||(32608395-32608527)
chr2 (245-413)||(33427645-33427813)
chr2 (245-394)||(15925095-15925244)
chr2 (245-411)||(37620867-37621036)
chr2 (245-411)||(32948461-32948626)
chr2 (263-417)||(37255331-37255485)
chr2 (245-413)||(40037158-40037325)
chr2 (266-381)||(9444726-9444841)
chr2 (281-413)||(25294886-25295018)
chr2 (246-377)||(41172474-41172605)
chr2 (249-354)||(42899934-42900039)
chr2 (245-411)||(28641292-28641447)
chr2 (10-131)||(32150692-32150812)
chr2 (245-411)||(35158050-35158205)
chr2 (245-410)||(39103062-39103216)
chr2 (245-411)||(29687056-29687211)
chr2 (245-325)||(39301272-39301352)
chr2 (304-411)||(447633-447740)
chr2 (245-414)||(21734897-21735055)
chr2 (245-409)||(145297-145450)
chr2 (278-392)||(1229675-1229789)
chr2 (245-413)||(27331313-27331474)
chr2 (246-413)||(13543622-13543778)
chr2 (245-309)||(12814629-12814693)
chr2 (245-411)||(19428426-19428581)
chr2 (246-325)||(3266312-3266391)
chr2 (246-325)||(27764937-27765016)
chr2 (245-411)||(4258505-4258659)
chr2 (245-321)||(12333574-12333650)
chr2 (245-325)||(40544151-40544231)
chr2 (245-336)||(44481843-44481934)
chr2 (245-325)||(12730076-12730156)
chr2 (304-396)||(12827137-12827228)
chr2 (301-373)||(28014856-28014928)
chr2 (245-325)||(34249280-34249360)
chr2 (245-325)||(43899045-43899125)
chr2 (246-325)||(28566773-28566852)
chr2 (245-336)||(35126795-35126886)
chr2 (245-411)||(43356114-43356266)
chr2 (245-325)||(2000412-2000492)
chr2 (261-414)||(3711664-3711806)
chr2 (245-325)||(8056641-8056721)
chr2 (245-414)||(2688726-2688884)
chr2 (246-339)||(30545837-30545930)
chr2 (342-411)||(12333497-12333564)
chr2 (342-411)||(43898971-43899039)
chr2 (342-414)||(34249366-34249438)
chr2 (342-377)||(8056727-8056762)
chr2 (261-336)||(38985342-38985416)
chr2 (342-376)||(27764897-27764931)
chr2 (316-361)||(17799296-17799341)
[»] chr7 (102 HSPs)
chr7 (245-412)||(35355905-35356072)
chr7 (245-411)||(25893917-25894083)
chr7 (245-411)||(27018133-27018299)
chr7 (245-411)||(33411277-33411443)
chr7 (245-413)||(49171360-49171528)
chr7 (245-411)||(22979647-22979813)
chr7 (245-411)||(23393051-23393217)
chr7 (245-410)||(33423276-33423441)
chr7 (245-413)||(33839713-33839881)
chr7 (249-413)||(36389377-36389541)
chr7 (245-413)||(46913126-46913296)
chr7 (245-415)||(17855445-17855615)
chr7 (245-411)||(20165814-20165980)
chr7 (245-415)||(40670580-40670750)
chr7 (245-411)||(45690097-45690263)
chr7 (245-411)||(47740331-47740497)
chr7 (245-398)||(10028505-10028658)
chr7 (248-412)||(35328068-35328232)
chr7 (245-413)||(47066975-47067143)
chr7 (245-411)||(33695821-33695987)
chr7 (245-411)||(48609677-48609843)
chr7 (245-413)||(2341659-2341828)
chr7 (245-418)||(26579710-26579883)
chr7 (245-418)||(31586865-31587038)
chr7 (245-413)||(33332806-33332973)
chr7 (245-413)||(45482675-45482843)
chr7 (245-412)||(37846015-37846182)
chr7 (253-411)||(29446863-29447020)
chr7 (240-413)||(5183823-5183996)
chr7 (245-405)||(15877567-15877727)
chr7 (249-412)||(31625725-31625887)
chr7 (245-392)||(43499502-43499649)
chr7 (245-411)||(19563464-19563630)
chr7 (245-387)||(33870262-33870404)
chr7 (244-413)||(35757018-35757187)
chr7 (245-418)||(41990852-41991024)
chr7 (246-412)||(10618316-10618475)
chr7 (245-416)||(31429470-31429641)
chr7 (246-384)||(33720063-33720201)
chr7 (273-413)||(35767519-35767659)
chr7 (245-411)||(5712185-5712351)
chr7 (245-411)||(45063357-45063521)
chr7 (280-412)||(30076526-30076658)
chr7 (295-414)||(41904272-41904391)
chr7 (290-413)||(44405410-44405533)
chr7 (245-413)||(35752032-35752189)
chr7 (245-416)||(24923019-24923179)
chr7 (274-411)||(28233936-28234073)
chr7 (246-387)||(44564356-44564497)
chr7 (245-414)||(7876325-7876483)
chr7 (245-412)||(24228558-24228714)
chr7 (245-412)||(46817420-46817576)
chr7 (245-412)||(48085875-48086031)
chr7 (245-325)||(498263-498343)
chr7 (245-325)||(26941607-26941687)
chr7 (245-325)||(36816920-36817000)
chr7 (245-411)||(43489235-43489390)
chr7 (245-412)||(37127954-37128110)
chr7 (246-320)||(29098769-29098843)
chr7 (245-413)||(46898014-46898171)
chr7 (245-325)||(29610652-29610732)
chr7 (245-329)||(29863032-29863116)
chr7 (245-325)||(32556681-32556761)
chr7 (245-325)||(39323633-39323713)
chr7 (246-314)||(39453561-39453629)
chr7 (245-325)||(39866682-39866762)
chr7 (245-415)||(44659861-44660019)
chr7 (245-325)||(45237608-45237688)
chr7 (245-325)||(47906834-47906914)
chr7 (245-325)||(2332036-2332116)
chr7 (260-336)||(7257413-7257489)
chr7 (245-325)||(21718134-21718214)
chr7 (245-325)||(25037583-25037663)
chr7 (245-325)||(26371066-26371146)
chr7 (260-410)||(33393360-33393499)
chr7 (245-336)||(16482847-16482938)
chr7 (244-392)||(45502835-45502972)
chr7 (248-325)||(33455116-33455193)
chr7 (245-325)||(35484653-35484734)
chr7 (245-412)||(44003369-44003525)
chr7 (253-336)||(15644010-15644093)
chr7 (253-336)||(47460836-47460919)
chr7 (245-337)||(38448511-38448603)
chr7 (245-325)||(41855076-41855156)
chr7 (245-325)||(46103138-46103217)
chr7 (276-351)||(26456157-26456232)
chr7 (245-296)||(35557747-35557798)
chr7 (245-288)||(30077048-30077091)
chr7 (343-413)||(39323712-39323781)
chr7 (249-290)||(35823311-35823352)
chr7 (342-406)||(26941537-26941601)
chr7 (268-336)||(37443666-37443734)
chr7 (341-409)||(39453484-39453552)
chr7 (342-410)||(46103223-46103291)
chr7 (342-417)||(26371152-26371227)
chr7 (342-377)||(29610738-29610773)
chr7 (342-380)||(21718220-21718258)
chr7 (346-392)||(42272180-42272226)
chr7 (342-411)||(2332122-2332191)
chr7 (342-411)||(36816845-36816914)
chr7 (353-413)||(39866762-39866822)
chr7 (342-414)||(45237530-45237602)
[»] chr5 (74 HSPs)
chr5 (245-411)||(2484292-2484458)
chr5 (245-411)||(5184988-5185154)
chr5 (245-411)||(24253398-24253564)
chr5 (245-410)||(15398483-15398648)
chr5 (245-409)||(6901815-6901979)
chr5 (245-412)||(7722065-7722232)
chr5 (245-411)||(31938913-31939079)
chr5 (245-412)||(3466680-3466847)
chr5 (245-412)||(35626054-35626221)
chr5 (245-411)||(43326379-43326545)
chr5 (245-421)||(39932595-39932771)
chr5 (246-392)||(27938914-27939060)
chr5 (245-389)||(18479690-18479834)
chr5 (245-412)||(43262182-43262349)
chr5 (245-411)||(12648813-12648979)
chr5 (245-411)||(15683807-15683973)
chr5 (245-414)||(38756484-38756654)
chr5 (245-411)||(40886028-40886193)
chr5 (245-410)||(27278474-27278643)
chr5 (245-412)||(739703-739870)
chr5 (245-392)||(5137731-5137878)
chr5 (245-411)||(27501055-27501221)
chr5 (245-412)||(25831537-25831703)
chr5 (245-392)||(40278877-40279024)
chr5 (246-419)||(890923-891095)
chr5 (266-415)||(29789291-29789440)
chr5 (245-413)||(28424793-28424959)
chr5 (246-409)||(40110251-40110413)
chr5 (246-380)||(763740-763874)
chr5 (249-411)||(13504742-13504904)
chr5 (271-411)||(34451292-34451432)
chr5 (245-410)||(9424593-9424747)
chr5 (245-406)||(42658667-42658817)
chr5 (245-393)||(4149710-4149848)
chr5 (245-413)||(23195246-23195403)
chr5 (245-411)||(31293989-31294155)
chr5 (245-413)||(33617601-33617758)
chr5 (245-415)||(38015510-38015669)
chr5 (245-411)||(27503395-27503550)
chr5 (245-418)||(13957686-13957848)
chr5 (245-339)||(5120041-5120134)
chr5 (245-413)||(5497289-5497446)
chr5 (245-327)||(40632515-40632597)
chr5 (253-413)||(40686923-40687071)
chr5 (244-325)||(14971993-14972074)
chr5 (245-325)||(6973079-6973159)
chr5 (245-411)||(9374502-9374657)
chr5 (245-337)||(12558093-12558184)
chr5 (245-411)||(19295746-19295901)
chr5 (245-325)||(36365520-36365600)
chr5 (245-325)||(42247857-42247937)
chr5 (245-413)||(38637908-38638065)
chr5 (245-317)||(9171108-9171180)
chr5 (245-411)||(2585478-2585633)
chr5 (253-320)||(3940411-3940478)
chr5 (245-336)||(36472348-36472439)
chr5 (342-414)||(612754-612827)
chr5 (260-325)||(3656643-3656708)
chr5 (246-393)||(6206901-6207037)
chr5 (245-329)||(1402576-1402660)
chr5 (245-321)||(33624018-33624094)
chr5 (245-336)||(27390613-27390704)
chr5 (263-325)||(38492647-38492709)
chr5 (245-289)||(9527131-9527175)
chr5 (245-316)||(15300957-15301028)
chr5 (245-336)||(18327237-18327328)
chr5 (245-336)||(24167848-24167939)
chr5 (262-321)||(36948568-36948626)
chr5 (342-411)||(3656568-3656637)
chr5 (342-410)||(33623940-33624008)
chr5 (255-314)||(612842-612900)
chr5 (342-413)||(6973165-6973236)
chr5 (342-388)||(36948513-36948558)
chr5 (342-380)||(38492715-38492753)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (245-422)||(75233-75410)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (245-412)||(176670-176837)
scaffold0007 (245-413)||(278022-278192)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (245-415)||(18850-19020)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (245-414)||(13759-13928)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (245-413)||(39554-39722)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (241-411)||(11133-11303)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (245-411)||(2432-2598)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (245-381)||(32577-32713)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (271-411)||(4596-4736)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (283-389)||(3133-3239)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (245-336)||(14760-14851)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (245-411)||(20477-20632)
[»] scaffold2003 (1 HSPs)
scaffold2003 (245-336)||(118-209)
[»] scaffold0721 (1 HSPs)
scaffold0721 (245-411)||(7106-7262)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (253-336)||(4618-4702)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (253-336)||(3416-3500)
[»] scaffold0271 (2 HSPs)
scaffold0271 (245-326)||(17922-18003)
scaffold0271 (342-377)||(18008-18043)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (246-314)||(19234-19302)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 41862236 - 41862402
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  41862236 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctta 41862335  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41862336 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctaattgtcacc 41862402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32984243 - 32984075
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  32984243 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 32984144  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  32984143 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32984075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 25185915 - 25186082
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  25185915 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 25186014  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25186015 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctaatcgtcacct 25186082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 9303740 - 9303572
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  9303740 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 9303641  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  9303640 tgtggctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 9303572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33981829 - 33981661
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33981829 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 33981730  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33981729 tgcggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 33981661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 43328723 - 43328890
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43328723 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 43328822  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43328823 tgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 43328890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24080067 - 24079901
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24080067 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24079968  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  24079967 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 24079901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 5946063 - 5946230
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  5946063 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 5946162  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5946163 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcataggtaccctagttgtcacct 5946230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 411
Target Start/End: Original strand, 35628792 - 35628959
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  35628792 actttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaagaataccacttaaaaatgtgctt 35628891  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||| ||||||||    
T  35628892 atgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttctatgagtaccctagttgtcacc 35628959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 9013700 - 9013869
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  9013700 ctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtactta 9013799  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  9013800 tgtggctaatgtgtattggttag-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 9013869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 10646139 - 10646305
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  10646139 ctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgttctta 10646238  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  10646239 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 10646305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17718888 - 17718720
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  17718888 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 17718789  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||    
T  17718788 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacctt 17718720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33730807 - 33730639
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33730807 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 33730708  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  33730707 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 33730639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 420
Target Start/End: Original strand, 2275929 - 2276103
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  2275929 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgctta 2276027  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattat 420  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  2276028 tgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccatcattcttccatgggtagactagttgtcaccttatattat 2276103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13356285 - 13356118
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  13356285 tttgaagaaaggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttat 13356186  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  13356185 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccatgggtactctagttgtcacctt 13356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40435319 - 40435153
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  40435319 ctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 40435220  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  40435219 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 40435153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 41653911 - 41654077
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41653911 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaaaataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 41654010  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  41654011 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 41654077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37301491 - 37301326
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  37301491 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggccaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 37301392  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  37301391 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcac 37301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 32114265 - 32114429
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  32114265 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 32114364  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32114365 tgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtca 32114429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 37956437 - 37956605
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  37956437 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 37956536  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||| | || |||| ||||||||||    
T  37956537 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattatttcatggataccctagttgtcacctt 37956605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 2714565 - 2714712
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2714565 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2714664  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  2714665 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 2714712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 45236731 - 45236564
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45236731 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45236632  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  45236631 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttttatgggtatcctagttgtcacct 45236564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 31831121 - 31830959
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31831121 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31831022  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||| |||| |||| ||||    
T  31831021 tgtggctaatgtgtattgatttgggtaaattacctaccattcttccatgggtaccctagttgt 31830959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 37419956 - 37420122
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||    
T  37419956 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgctta 37420055  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| ||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  37420056 tgtgactaatgtgtattgattaaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 37420122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 41231962 - 41232130
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41231962 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41232061  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | || |||| ||||||||||    
T  41232062 tgtgaccaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcctccatggataccctagttgtcacctt 41232130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 6366002 - 6366169
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  6366002 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 6366101  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  6366102 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattctttcatggataccctagttgtcacct 6366169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 9734271 - 9734435
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  9734271 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgctta 9734369  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9734370 tgtggctaatgtgtattggttggggt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9734435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29048569 - 29048426
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  29048569 ctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 29048470  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattctt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29048469 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctt 29048426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 45258527 - 45258673
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  45258527 tttgaagaatggtcggtaatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttat 45258626  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45258627 gtaactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 45258673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 41639930 - 41640095
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||    
T  41639930 ctttgaagaatgatgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatagataccgcttaaaaatatgttta 41640029  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||    
T  41640030 tgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcac 41640095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45066758 - 45066590
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45066758 ctttgaagaataatggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45066659  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  45066658 tgtggctaatgtgtattgattataataaattacccatcattcttccatgggtaccctaattctcacctt 45066590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13760814 - 13760667
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |  ||     
T  13760814 ctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttc 13760715  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  13760714 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat 13760667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 22878407 - 22878572
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  22878407 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccttccaatgaaaatgatcaattttttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 22878506  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  22878507 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccacaattcttctatgggtaccctagttgtcac 22878572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 25248055 - 25248215
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||    
T  25248055 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaa------aaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactttaaaatgtgctta 25248148  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || |||||||||||||    
T  25248149 tgttgctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatggataccctaattgtcacc 25248215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44088609 - 44088462
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| |   |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  44088609 ctttgaagaatgatgaataatttactcaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 44088510  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  44088509 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 44088462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 413
Target Start/End: Original strand, 12032986 - 12033114
Alignment:
Q  285 aatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaat 384  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12032986 aatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccat 12033085  T
Q  385 tcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  12033086 tcttccatgggtaccctagttgtcacctt 12033114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 42701456 - 42701303
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaata-tattt 343  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |      
T  42701456 ctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaaaaatgtgc 42701357  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||||| ||||    
T  42701356 ttgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccatccttccatgggta 42701303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 298 - 414
Target Start/End: Original strand, 31336163 - 31336279
Alignment:
Q  298 ttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  31336163 ttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgtttatatggctaatgtgtattggttggggcaaattacccaccattcttccatgggta 31336262  T
Q  398 tcctaattgtcacctta 414  Q
     |||| |||||||||||    
T  31336263 ccctagttgtcacctta 31336279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 417
Target Start/End: Original strand, 41981534 - 41981656
Alignment:
Q  295 ttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccatag 394  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  41981534 ttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgg 41981633  T
Q  395 gtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
     || |||| |||||||| |||||    
T  41981634 ataccctagttgtcaccatatat 41981656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 278 - 411
Target Start/End: Original strand, 3904126 - 3904258
Alignment:
Q  278 caatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  3904126 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatga-taccacttaaaaatgtgcttatgtggctattgtgtattggttagggtaaattac 3904224  T
Q  378 ccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| || |||||    
T  3904225 ccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 3904258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 39915978 - 39915887
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39915978 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaa 39915887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 4447450 - 4447294
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  4447450 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 4447362  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  4447361 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 4447294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 250 - 331
Target Start/End: Original strand, 41981454 - 41981535
Alignment:
Q  250 aagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccactt 331  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41981454 aagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt 41981535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Original strand, 3211229 - 3211380
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggcta 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||           | |  |||||||||||    
T  3211229 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggttaagatagttcatgaata-----------tgtgcttatgtggcta 3211317  T
Q  353 atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  3211318 atgtgtattcgttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcaccttat 3211380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 10378325 - 10378480
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  10378325 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 10378413  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10378414 tgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 10378480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 117484 - 117404
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  117484 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 117404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 31940331 - 31940485
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  31940331 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 31940419  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  31940420 tgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 31940485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40458927 - 40458847
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  40458927 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 40458847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4975562 - 4975482
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4975562 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 4975482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27243294 - 27243214
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27243294 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaata 27243214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27254869 - 27254789
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27254869 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggccaagatagttcatgaata 27254789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 41843269 - 41843410
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||           || |  |||    
T  41843269 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtccagatagttcatgaat-----------atgtgctta 41843357  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  41843358 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggta 41843410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 253 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32373873 - 32373801
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32373873 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 32373801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3490554 - 3490463
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||    
T  3490554 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggttaccacctaaaaa 3490463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 33896990 - 33896839
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggcta 352  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| |||||| ||            |    
T  33896990 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaagat-----------ga 33896902  T
Q  353 atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  33896901 atgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcaccttat 33896839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 9713705 - 9713857
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           || |  |||    
T  9713705 ctttgaagaatggtgggtaatttaccca---accaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 9713790  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  9713791 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9713857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 2379156 - 2379311
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||| |||| ||| ||||||||||           | |  |||    
T  2379156 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaata-----------tgtgctta 2379244  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||    
T  2379245 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctagttgtcacc 2379311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9509555 - 9509475
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  9509555 ctttaaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata 9509475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 38631668 - 38631748
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38631668 ctttgaaaaatggtggataatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattggtgtggtcaagatagttcatgaata 38631748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40649986 - 40649906
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  40649986 ctttaaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatgaata 40649906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 33622620 - 33622575
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgag 290  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622620 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgag 33622575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31149045 - 31148954
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31149045 ctttgaaaaatggtgggtaatttattcactaaccaatgaaaatgagctatttattgatggggttaagatagttcatg-ataccacttaaaaat 31148954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26196471 - 26196381
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||    
T  26196471 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataat-aacaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaa 26196381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40649900 - 40649840
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  40649900 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccatcattctttcatgggtagccta 40649840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41425497 - 41425452
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattctt 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  41425497 ttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattatccataattctt 41425452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 117398 - 117329
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  117398 ttatgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 117329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 26196376 - 26196315
Alignment:
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||   ||||||| ||||||||||    
T  26196376 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacctt 26196315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 117)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 47257809 - 47257977
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  47257809 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 47257908  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  47257909 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 47257977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 37324557 - 37324723
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37324557 ctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatattta 37324656  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  37324657 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 37324723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 47809763 - 47809589
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  47809763 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 47809664  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggtt-ggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  47809663 tgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatt 47809589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 51102544 - 51102378
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  51102544 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtattta 51102445  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  51102444 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccgttggtaccctagttgtcacc 51102378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 39634736 - 39634569
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  39634736 tttgaagaatggtgggtattttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 39634638  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  39634637 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 39634569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 40131125 - 40130957
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  40131125 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgtctgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 40131026  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40131025 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 40130957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 42291858 - 42292026
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| || |||    
T  42291858 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttgaaaatgtactta 42291957  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42291958 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 42292026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 29625993 - 29625826
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  29625993 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 29625894  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||    
T  29625893 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattatcacct 29625826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 24100299 - 24100464
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  24100299 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgctta 24100397  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24100398 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51170199 - 51170034
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  51170199 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 51170100  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||    
T  51170099 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcac 51170034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32234563 - 32234396
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  32234563 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgctta 32234465  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  32234464 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 32234396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 49330053 - 49330223
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  49330053 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 49330152  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  49330153 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 49330223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 52628970 - 52629135
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  52628970 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 52629069  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  52629070 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 52629135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38416890 - 38416721
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  38416890 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 38416791  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  38416790 cgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38416721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 37313415 - 37313567
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  37313415 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgttta 37313514  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  37313515 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 37313567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41293484 - 41293317
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||    
T  41293484 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataattcatgaataccactt-aaaatgtgctta 41293386  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  41293385 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctaattgtcacctt 41293317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7855279 - 7855112
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  ||||    
T  7855279 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcaaggataccacttaaaaatgtgcttat 7855180  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  7855179 gtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 7855112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20754559 - 20754388
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  20754559 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagagtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgttta 20754460  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  20754459 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattattccatgagtaccctagttgtcaccttata 20754388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28048558 - 28048392
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  28048558 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 28048459  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  28048458 tgtggctaatgtgtattaatttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28048392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 43612212 - 43612043
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  43612212 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 43612113  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  43612112 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 43612043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 44806700 - 44806869
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  44806700 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 44806799  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  44806800 tgtggctaatatgtattggttgaagtaaattatccacaattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 44806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 55453410 - 55453245
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  55453410 ctttgaagaatggtgggtaatttactcatcaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 55453311  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  55453310 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 55453245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 53943753 - 53943586
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  53943753 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatatactta 53943654  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  53943653 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctagttgtcacctt 53943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27067144 - 27066977
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  27067144 ctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgctta 27067045  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  27067044 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 27066977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35748477 - 35748310
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  35748477 ctttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 35748378  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  35748377 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacct 35748310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 40643816 - 40643987
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || |||||||| |  |||    
T  40643816 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggatatcatttaaaaatgtgctta 40643915  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  40643916 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccatata 40643987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 22399113 - 22399278
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |  |||    
T  22399113 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggaaaccactt-aaaatgtgctta 22399211  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  22399212 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22399278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 41464368 - 41464534
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41464368 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41464467  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  41464468 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccagcattcttccatgggtactctagttgtcacc 41464534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 43021730 - 43021896
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggg-tcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||    
T  43021730 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctt 43021829  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  43021830 atgtagctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcac 43021896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 44222845 - 44223011
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  44222845 ctttgaaaaatagtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 44222944  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  44222945 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44223011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 48739398 - 48739232
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  48739398 tttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 48739299  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  48739298 gtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 48739232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 51452916 - 51452749
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  51452916 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgctta 51452817  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  51452816 tgtagctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccat-ggtaccctaattgtcacctt 51452749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 2666016 - 2666183
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |  |||    
T  2666016 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaactgtgctta 2666115  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |||||||||    
T  2666116 tgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccactattctttcatgggtactctagttgtcacct 2666183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 40419851 - 40420018
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  40419851 ctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 40419950  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40419951 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40420018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40804676 - 40804509
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  40804676 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtaggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 40804577  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||    
T  40804576 tgtggctaatgtgtattagttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 40804509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 43125847 - 43126017
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43125847 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 43125946  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  43125947 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttataggta-cctagttgtcaccttata 43126017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 414
Target Start/End: Original strand, 46126010 - 46126171
Alignment:
Q  252 gaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggct 351  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||    
T  46126010 gaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgcttatgtggct 46126109  T
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  46126110 aatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacctta 46126171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 35594137 - 35594305
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  35594137 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgctta 35594236  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  35594237 tgtggctaatgtgtattagttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgttacctt 35594305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 249 - 409
Target Start/End: Original strand, 48609743 - 48609903
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  48609743 gaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 48609842  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  48609843 gctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 48609903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 46134372 - 46134538
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  46134372 ctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 46134471  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||||||||||    
T  46134472 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcaccattctttcatggataccctaattgtcacc 46134538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7755472 - 7755305
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||| |  |||    
T  7755472 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagattatggataccactt-aaaatgtgctta 7755374  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  7755373 tgtggctaatgtgtattgcttggggtaaataacccatcattcttccatgggtaccctacttgtcacctt 7755305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 43183928 - 43184092
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43183928 ctttgaagaatggtgagtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 43184027  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43184028 tgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccataggtaccctagttgtca 43184092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Original strand, 39053410 - 39053545
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  39053410 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 39053509  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39053510 tgtggctaatgtgtattcgttggggtaaattaccca 39053545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Original strand, 52215092 - 52215236
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  52215092 ctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaactaatgaacatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 52215191  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  52215192 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttc 52215236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 52638858 - 52639026
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||     
T  52638858 ctttaaagaatggtgggtaatttaccaacgaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttc 52638957  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||| ||||||||||    
T  52638958 tgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattattctatgggtaccctagttgtcacctt 52639026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 421
Target Start/End: Original strand, 18946919 - 18947096
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |  |||    
T  18946919 ctttgaagaatggtgcgtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccagttaaaaatgtgctta 18947018  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct-tatattatt 421  Q
    |||| |||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  18947019 tgtgactaatgtgtattggttgagacaaattacccaccattcttccatgggtaccctacttgtcacctatatattatt 18947096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 386
Target Start/End: Original strand, 24376589 - 24376730
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24376589 ctttgaagaatgatgggtaatttacgcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24376688  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattc 386  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  24376689 tgtggcttatgtgtatttgttggggtaaattacccaccattc 24376730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 378
Target Start/End: Original strand, 53637857 - 53637990
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  53637857 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaggataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 53637956  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacc 378  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53637957 tgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacc 53637990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Original strand, 36368955 - 36369091
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  36368955 ctttgaagaatggtcgataatttacccaccaactaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 36369054  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccac 381  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  36369055 tgtggctaatgtatattggttagggtaaattacccac 36369091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Original strand, 46949406 - 46949536
Alignment:
Q  261 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtat 360  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46949406 gtaatttacccaccgaccaatgaaaatgaacaatttgttggcgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtat 46949505  T
Q  361 tggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46949506 tggttgga-taaattacccaccattcttccat 46949536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 51146381 - 51146215
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  51146381 ctttgaagaatggtaggtaatttacacatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgctta 51146282  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  51146281 tgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgccacc 51146215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53832649 - 53832503
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||     ||||    
T  53832649 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagtttatggataccaattaaaaaggggcttat 53832550  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  53832549 gtggctaatatgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 53832503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 41216471 - 41216639
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41216471 ctttaaaggatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggttaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41216570  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  41216571 tgtggctaatgtgtattaattgggataaattacccactattcttccataggtactctagttgtcacctt 41216639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 41732544 - 41732691
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41732544 ctttgaaaaatggtggataatttatccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41732643  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  41732644 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccatccttccat 41732691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5560198 - 5560025
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaat-----gagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat 339  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5560198 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaattaaatgagcaatttgtttgtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatat 5560099  T
Q  340 atttatgtggc--taatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
      ||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  5560098 gcttatgtgactataatgtctattggttggggtaaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 5560025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47894986 - 47894822
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  47894986 ctttaaagaatggtggataatttacctaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 47894887  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||||| | |||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  47894886 tgtgactaatgtatattagttgaggtaaatcatccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 47894822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 54401203 - 54401360
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  54401203 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 54401291  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  54401292 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattgccacctt 54401360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 375
Target Start/End: Original strand, 37758946 - 37759075
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  37758946 tttgaagaatggtgaataatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatgaagtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtacttat 37759045  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaatt 375  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37759046 gtggctaatgtgtattggttggggtaaatt 37759075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 292 - 413
Target Start/End: Original strand, 52864553 - 52864673
Alignment:
Q  292 aatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttcca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52864553 aatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgtttatgtagctaatgtatattggtt-gagtaaattacccaccattcttcca 52864651  T
Q  392 taggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    | |||| |||| ||||||||||    
T  52864652 tgggtaccctagttgtcacctt 52864673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 42589846 - 42590005
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  42589846 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 42589934  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  42589935 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 42590005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 296 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33550582 - 33550465
Alignment:
Q  296 tgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccatagg 395  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||       
T  33550582 tgttggtggggttaagataattcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgaa 33550483  T
Q  396 tatcctaattgtcacctt 413  Q
    || |||| ||||||||||    
T  33550482 taccctagttgtcacctt 33550465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31286948 - 31286790
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  31286948 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 31286860  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||  ||| |||| |||||||||||    
T  31286859 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattactcatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctta 31286790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 54159153 - 54159062
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  54159153 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatagataccacttaaaaat 54159062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 25641662 - 25641819
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||           |||| || |  |||    
T  25641662 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgtgctta 25641750  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||    
T  25641751 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 25641819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 34279876 - 34279752
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  34279876 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 34279788  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34279787 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 34279752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 54707375 - 54707219
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  54707375 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 54707287  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| |||||    
T  54707286 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 54707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38156787 - 38156632
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  38156787 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 38156699  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  38156698 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 38156632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47511095 - 47510940
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  47511095 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 47511007  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  47511006 tgtggctaatgtgtattgattggagtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 47510940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39141280 - 39141201
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  39141280 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39141201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 48546995 - 48546835
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |         
T  48546995 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaa-atagttcatggataccacttaaaaatgt----- 48546903  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
        ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||| | || |||| |||||| ||||||    
T  48546902 ----gcttatgtgtattgattggggtaaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcatcttata 48546835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 49130594 - 49130752
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  49130594 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatgaggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 49130682  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||| |||||    
T  49130683 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtctcctta 49130752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 51415985 - 51416143
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||| ||           || |  |||    
T  51415985 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgtat-----------atgtgctta 51416073  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  51416074 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 51416143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 17665676 - 17665555
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           ||||  ||||||    
T  17665676 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgcttatgt 17665588  T
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17665587 ggttaatgtgtattggttggggtaaattaccca 17665555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 360
Target Start/End: Original strand, 47182049 - 47182131
Alignment:
Q  278 caatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtat 360  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  47182049 caatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtacttatgtggctaatgtgtat 47182131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 53115463 - 53115620
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||            
T  53115463 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaa-------- 53115554  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
       ||  ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  53115555 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattatccaccatttttccataggtaccctagttgtcacctt 53115620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 249 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 55000329 - 55000176
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||           || |  |||||||    
T  55000329 gaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtg 55000241  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  55000240 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 55000176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 37028739 - 37028894
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||           || | ||||    
T  37028739 ctttaaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggagtcaagatagttcatgaat-----------atgtgttta 37028827  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  37028828 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 37028894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41635955 - 41635875
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  41635955 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 41635875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 45058899 - 45058979
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  45058899 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 45058979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 55380001 - 55380156
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||            
T  55380001 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-------- 55380092  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  55380093 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 55380156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 25353570 - 25353726
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||            
T  25353570 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataataagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-------- 25353661  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
       ||  |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  25353662 ---ggtgaatgttcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 25353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44946084 - 44946015
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  44946084 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 44946015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 24688130 - 24688285
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||           | | ||||    
T  24688130 ctttgaaaaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgttta 24688218  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  24688219 tgtggctaatgtctactggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtaacctagttgtcacc 24688285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 40022090 - 40022170
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  40022090 ctttgaagaatgatggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 40022170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51224192 - 51224113
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  51224192 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaa-caataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 51224113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30251656 - 30251565
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  30251656 ctttgaaaaatggtgggtaatttactcaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 30251565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41882146 - 41882063
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  41882146 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 41882063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 51143833 - 51143987
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||            
T  51143833 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaatatagtttatggataccacctaaaaa-------- 51143924  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
       ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||| |||| |||||||    
T  51143925 ---ggtgaatgtttattggttggagtaaattacccaccattttttcatgggtaccctagttgtcac 51143987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 42998936 - 42998853
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  42998936 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgatcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 42998853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50732069 - 50731986
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  50732069 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50731986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Original strand, 50780787 - 50780870
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| || || ||| ||||||    
T  50780787 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcttaatgagcaatttgttggtggggtcaaggtagtttatggatacca 50780870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 336
Target Start/End: Original strand, 40165681 - 40165758
Alignment:
Q  259 tggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  40165681 tggtaatttacccaccaagcaatcataatgagtaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 40165758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 47402904 - 47402813
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  47402904 ctttaaagaatggtgggtaatttatccatcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtagggtcaagatagttcatg-ataccatttaaaaat 47402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21597303 - 21597220
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  21597303 ctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggatacca 21597220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28576267 - 28576184
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  28576267 ctttgaagtatgatgggtaatttacccatcaaccgatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 28576184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 48726153 - 48726070
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||||    
T  48726153 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaataagcaatttattggtagagtcaagacagttcatggatacca 48726070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48534076 - 48534003
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  48534076 ttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 48534003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 264 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52756207 - 52756146
Alignment:
Q  264 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  52756207 atttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 52756146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2228090 - 2227998
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| | |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| |||||    
T  2228090 ctttgaaaaatggtgggaaatttaccgatcaaccaatgaaaataagcaatttattggtgaggtcaagatagttcatagatatcacttcaaaat 2227998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 324 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30429314 - 30429226
Alignment:
Q  324 taccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  30429314 taccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatatgtattaattgggataaattatccaccattcttccgtaggtaccctagttgtcacct 30429226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 177177 - 177268
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||| || ||||||    
T  177177 ctttgaaaaatggtgggtaatttagtcaccaaccaatcataacgagtaatttattggtgggatcaagatactttatggatacaacctaaaaa 177268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 410
Target Start/End: Original strand, 48752226 - 48752284
Alignment:
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  48752226 aatgtttattggttgggataaattacccacaatttttccatagatatcctagttgtcac 48752284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 41635869 - 41635796
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||    
T  41635869 ttatgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtaatctagttgtcaccttat 41635796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 8847813 - 8847721
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||  |||||| ||| |||||||  ||||| |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  8847813 ctttgaagaatagtgtataatttacataccaactaataaaaatgaacaatttattggtgggatcaaaatagttcacgaataccacttaaaaat 8847721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 48752101 - 48752161
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg 305  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||    
T  48752101 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgtgcaatttattggtggg 48752161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39141193 - 39141123
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  39141193 ttatgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccatcattctttcat-ggtaacctagttatcacctt 39141123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43176893 - 43176802
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||  ||||| ||||||  ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  43176893 ctttgaaaaatggtggataatttatccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtgatgtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 43176802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 50731965 - 50731914
Alignment:
Q  360 ttggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  50731965 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50731914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 411
Target Start/End: Original strand, 50780891 - 50780942
Alignment:
Q  360 ttggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  50780891 ttggttggagtaaatttcccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 50780942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 259 - 337
Target Start/End: Original strand, 41609097 - 41609175
Alignment:
Q  259 tggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || |||| || || ||| |||||| |||| || |||||||    
T  41609097 tggtaatttacctaccaactaatgaaaatgagcaatttattagtggagttaaaatagttcatggatactacctaaaaat 41609175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 52434291 - 52434341
Alignment:
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  52434291 aatgtttattggttggagtaaattacccaccatttttctataggtacccta 52434341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 305
Target Start/End: Original strand, 52434155 - 52434216
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaattt-acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg 305  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  52434155 ctttgaaaaatggtgggtaattttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggg 52434216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Original strand, 177273 - 177333
Alignment:
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||   ||||||| |||||||||    
T  177273 aatgtttattggttggagcaaattacccaccatttttccatgaatatcctagttgtcacct 177333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Original strand, 37741451 - 37741487
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaat 281  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37741451 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 37741487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 415
Target Start/End: Original strand, 40688431 - 40688487
Alignment:
Q  359 attggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  40688431 attggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcaccttat 40688487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 44946004 - 44945932
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||  |||||| |||  ||| |||| |||||||||||    
T  44946004 ttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattattcatcattctttcatgcgtagcctagttgtcacctta 44945932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 351 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 52756127 - 52756067
Alignment:
Q  351 taatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  52756127 taatgtgtattggtttgggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 52756067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Original strand, 31308017 - 31308188
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31308017 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31308116  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  31308117 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttata 31308188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17995117 - 17994949
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  17995117 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 17995018  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  17995017 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacctt 17994949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21139578 - 21139406
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  21139578 ctttgaagtatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 21139479  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  21139478 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccatatat 21139406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 38790363 - 38790196
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||    
T  38790363 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatatgctta 38790264  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  38790263 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 38790196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 3611152 - 3611318
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  3611152 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 3611251  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  3611252 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 3611318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 241 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26085568 - 26085398
Alignment:
Q  241 attactttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatata 340  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  26085568 attaccttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtg 26085469  T
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  26085468 cttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26085398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 45538169 - 45538335
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45538169 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45538268  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  45538269 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45538335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 5981186 - 5981354
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  5981186 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 5981285  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  5981286 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 5981354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 44661986 - 44662154
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  44661986 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 44662085  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  44662086 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 44662154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 26277193 - 26277359
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  26277193 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatttgttta 26277292  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  26277293 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26277359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 31040725 - 31040893
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  31040725 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 31040824  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  31040825 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattattccatgggtaccctagttgtcacctt 31040893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25678425 - 25678259
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  25678425 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 25678326  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||    
T  25678325 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacc 25678259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33112983 - 33112818
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  33112983 ctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 33112884  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  33112883 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcat-ggtaccctagttgtcacc 33112818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4068849 - 4068692
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  4068849 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 4068750  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  4068749 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtacccta 4068692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6327713 - 6327546
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  6327713 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 6327614  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  6327613 t-tgactaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 6327546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 24885517 - 24885685
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24885517 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgttta 24885616  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  24885617 tgtggataatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 24885685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38332025 - 38331857
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  38332025 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgctta 38331926  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||||    
T  38331925 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacctt 38331857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 43251727 - 43251891
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43251727 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 43251826  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  43251827 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 43251891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 25058704 - 25058870
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  25058704 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 25058803  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  25058804 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25058870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Original strand, 26794320 - 26794482
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  26794320 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 26794419  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  26794420 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgt 26794482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37620358 - 37620192
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  37620358 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtcctta 37620259  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  37620258 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgtgtaccctagttgtcacc 37620192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26525055 - 26524886
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||  |||    
T  26525055 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagtttatagataccacttaaaaatatgctta 26524956  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  26524955 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccactattcttccatggataccctagttgtcacctta 26524886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 33884104 - 33884277
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |  |||    
T  33884104 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgctta 33884203  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33884204 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacctaatatt 33884277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 33960148 - 33959975
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| |  |||    
T  33960148 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccatttaaaaatgtgctta 33960049  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  33960048 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctaattgtcacctaatatt 33959975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23932675 - 23932507
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |  |||    
T  23932675 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggacaccacttaaaaatgtgctta 23932576  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23932575 tgtggctaatgtgtattgatcagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23932507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 23984771 - 23984939
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  23984771 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 23984870  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  23984871 tgtagctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 23984939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 46616565 - 46616717
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  46616565 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgttta 46616664  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  46616665 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggta 46616717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 39646584 - 39646751
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  39646584 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataggtcatggataccacttaaaaatgtgctta 39646683  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  39646684 tgtaactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39646751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 49254141 - 49253966
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  49254141 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgctta 49254042  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattat 420  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||| |||||||| |||||    
T  49254041 tatggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattatcaccttaaattat 49253966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 50774233 - 50774400
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  50774233 ctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 50774332  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  50774333 tgtgaccaatgtgtattggttgggataaattacccacctttcttccatgggtaccctagttgtcacct 50774400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 5980084 - 5980250
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    |||    
T  5980084 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaattagctta 5980183  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||    
T  5980184 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctagctgtcacc 5980250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24245191 - 24245025
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24245191 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24245092  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| || |||||    
T  24245091 tgtgactaatgtgtattagttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttatcacc 24245025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49399154 - 49398988
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||    
T  49399154 ctttgaagaatggtaggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggagttaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgttta 49399055  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  49399054 tgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtatcctagttgtcacc 49398988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 3285418 - 3285582
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||    
T  3285418 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgctta 3285516  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3285517 tgtggctaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcac 3285582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 35692830 - 35692659
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaattta-cccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | |||    
T  35692830 ctttgaagaatggtgggtaatttatcccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtgttt 35692731  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||    
T  35692730 atgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccgttcttccatggatactctagttgtcaccttat 35692659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 41999831 - 41999998
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41999831 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41999930  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  41999931 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 41999998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42313510 - 42313359
Alignment:
Q  262 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  42313510 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagaaatttattggtggagtcaagatagttcattaataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtatt 42313411  T
Q  362 ggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  42313410 ggttggggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 42313359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 46784439 - 46784605
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  46784439 ctttgaggaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggagaagtaaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 46784538  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  46784539 tgtgactaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctaattgtcacc 46784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 47317331 - 47317497
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  47317331 ctttgaagaatggtgggtaatttattcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgctta 47317430  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  47317431 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttctatgggtaccctagttgtcacc 47317497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47383898 - 47383732
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  47383898 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 47383799  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  47383798 tgtagctaatgtgtattgattgggataaattacccaccattctttcattggtaccctagttgtcacc 47383732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 47671602 - 47671768
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  47671602 ctttgaagaatggtggataatttaccgaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggaggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 47671701  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  47671702 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47671768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 264 - 411
Target Start/End: Original strand, 2450529 - 2450676
Alignment:
Q  264 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattgg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2450529 atttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggaatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattgg 2450628  T
Q  364 ttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2450629 ttggggtaaattacctatcattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2450676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 42863881 - 42864028
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||    
T  42863881 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagctatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgctta 42863980  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  42863981 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccat 42864028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23221095 - 23220973
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  23221095 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 23220996  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttgg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  23220995 tgtggctaatgtgtattggttgg 23220973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Original strand, 25518830 - 25518952
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  25518830 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 25518929  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttgg 367  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25518930 tgtggctaatgtgtattggttgg 25518952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 35273612 - 35273778
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  35273612 ctttgaagaatggtggataatttacccatcaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 35273711  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  35273712 tgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 35273778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 36566346 - 36566512
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || |||||| ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  36566346 ctttgaagaatagtgggtaatatattcaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 36566445  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  36566446 tgtggctaatgtgtattggttcgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 36566512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Original strand, 28888596 - 28888744
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  28888596 actttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgatcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttt 28888695  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||||||    
T  28888696 atgtggctaatgtgtattgattgagataaattatccaccattcttccat 28888744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Original strand, 31844392 - 31844528
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31844392 ctttgaggaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31844491  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccac 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31844492 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccac 31844528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 46967207 - 46967041
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  46967207 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 46967108  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  46967107 tgtggctaatatgtatttgttaggataaattacccatcattctttcatgggtaccctagttgtcacc 46967041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 51057087 - 51057253
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  51057087 ctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagatcatggataccacttaaaaatgtgctta 51057186  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  51057187 tgtggttaatgtgtattagttgaggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 51057253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 36003146 - 36003317
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  36003146 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttactggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 36003245  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttc---cataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||   |||||||| |||| ||||||||||    
T  36003246 tgtggctaatgtgtattggttcggataaattacccaccattcttctttcataggtaccctagttgtcacctt 36003317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 270 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 51045737 - 51045596
Alignment:
Q  270 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggag 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || | |    
T  51045737 ccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagatagtttatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattgattaggg 51045638  T
Q  370 taaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||||||||    
T  51045637 taaattacccaccattcttctacgggtatcctagttgtcacc 51045596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 419
Target Start/End: Original strand, 47187137 - 47187295
Alignment:
Q  261 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtat 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  47187137 gtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtat 47187236  T
Q  361 tggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatta 419  Q
    |||||   |||||||| |||| |||||| ||| |||| | || |||||||||| |||||    
T  47187237 tggttatggtaaattatccaccattctttcatgggtaccgtagttgtcaccttttatta 47187295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 48373520 - 48373679
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |         
T  48373520 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcagtttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgt----- 48373614  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
        ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||    
T  48373615 ----gcttatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccttagttgtcacctt 48373679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51403173 - 51403083
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaa 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51403173 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaa 51403083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 266 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45475987 - 45475866
Alignment:
Q  266 ttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggtt 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  45475987 ttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttgatggataccacttacaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 45475888  T
Q  366 ggagtaaattacccacaattctt 388  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  45475887 gg-gtaaattacccaccattctt 45475866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27983753 - 27983603
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||                |||||| |||||||| |  |||    
T  27983753 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggg----------------ataccatttaaaaatgtgctta 27983670  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  27983669 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27983603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 2657319 - 2657474
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  2657319 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 2657407  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  2657408 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 2657474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41467787 - 41467632
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  41467787 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 41467699  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  41467698 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41467632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 33073227 - 33073385
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  33073227 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttataggtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 33073315  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  33073316 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 33073385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 31980101 - 31980009
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31980101 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgttagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaat 31980009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 2557012 - 2556909
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2557012 ctttgaagaatggtggataatttatccactaactaatgaaaatgagcaatctgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgttta 2556913  T
Q  345 tgtg 348  Q
    ||||    
T  2556912 tgtg 2556909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 414
Target Start/End: Original strand, 4808699 - 4808830
Alignment:
Q  283 aaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaca 382  Q
    |||||||  ||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  4808699 aaaatgaacaatttattgatagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacc 4808798  T
Q  383 attcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  4808799 attcttccatggataccctagttgtcacctta 4808830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 10928083 - 10928240
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  10928083 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 10928171  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  10928172 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 10928240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 279 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47772304 - 47772170
Alignment:
Q  279 aatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacc 378  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || ||  |||||| |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  47772304 aatgaaaataagcaatttgttggtagggtcaaaatagtttatatataccatttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtatattggttggagtaaattaca 47772205  T
Q  379 cacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  47772204 caccattcttccatgggtaccttaattgtcacctt 47772170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4243645 - 4243490
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||           || |  |||    
T  4243645 ctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaat-----------atgtgctta 4243557  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||    
T  4243556 tgtggctaatgtgtattggatggggtaaattacccataattctttcatgggtagtctagttgtcacc 4243490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26472334 - 26472254
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26472334 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 26472254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6626179 - 6626025
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  6626179 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 6626091  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  6626090 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 6626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 4953068 - 4953225
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           || |  |||    
T  4953068 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 4953156  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  4953157 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 4953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 280 - 412
Target Start/End: Original strand, 4156438 - 4156577
Alignment:
Q  280 atgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaaga-------taattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaa 372  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||       || || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4156438 atgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagactcaatatagtttatggataccacttaaaaatgtatttatgtggctaatgtgtattggttggggtaa 4156537  T
Q  373 attacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  4156538 attacccatcatttttccatgggtactctagttgtcacct 4156577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 32448664 - 32448744
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  32448664 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 32448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 42234856 - 42234936
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  42234856 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 42234936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 29770686 - 29770844
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  29770686 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 29770774  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||| |||| |||| ||| |||||||    
T  29770775 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtagcctagttgccacctta 29770844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 52323954 - 52324045
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52323954 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagataatttatgaataccacctaaaaa 52324045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 13313329 - 13313253
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatg 321  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13313329 ctttgaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatg 13313253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44544201 - 44544121
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  44544201 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 44544121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 24649877 - 24649802
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcat 320  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24649877 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagttatttattggtggggtcaagatagttcat 24649802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 34752469 - 34752323
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| || ||||| | |||||| |||||||||           || |  |||    
T  34752469 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaaataaaatgagcaatttatttgtgggcttaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 34752381  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  34752380 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtaaccta 34752323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38716394 - 38716311
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  38716394 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaa 38716311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13281717 - 13281637
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  13281717 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgacaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata 13281637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30290065 - 30289985
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30290065 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccagtgaatatgagcaatttattggtggagtcaagatagttcatgaata 30289985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 44293610 - 44293530
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  44293610 ctttgaagaatagtaggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 44293530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46428408 - 46428328
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46428408 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccagcaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaagatagttcatgaata 46428328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Original strand, 2954879 - 2954962
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  2954879 aatggtgggtaatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaa 2954962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 26685872 - 26686031
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||            
T  26685872 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaaa------- 26685964  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
     |||   ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  26685965 -gtg---aatgtttattggttgaggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcaccttat 26686031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27924812 - 27924722
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  27924812 tttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27924722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 33187356 - 33187450
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat 339  Q
    |||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||  |||||||||||||||||    
T  33187356 ctttaaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggttggatcaagatagtttatagataccacttaaaaatat 33187450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7561697 - 7561632
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa 310  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  7561697 ctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaa 7561632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13312624 - 13312531
Alignment:
Q  318 catgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  13312624 catggataccacttaaatatgtgcttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 13312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51155744 - 51155608
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||           || | ||||    
T  51155744 ctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggagtcaagatagttcatgaat-----------atgtgttta 51155656  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||    
T  51155655 tgtgactaatgtgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat 51155608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35991754 - 35991674
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  35991754 ctttgaagaattgtgggtaatttatccaccaacaattgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 35991674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41895319 - 41895164
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || ||| |||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  41895319 ctttaaagaattgtgggtaatttacccaccaaccaataacaattagcaatttatttgtgaggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 41895231  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  41895230 tgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 41895164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 10920216 - 10920307
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  10920216 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 10920307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 336
Target Start/End: Original strand, 1388490 - 1388580
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  1388490 tttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcatgatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 1388580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 350 - 407
Target Start/End: Original strand, 39359502 - 39359559
Alignment:
Q  350 ctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  39359502 ctaatgtgtattggttggggtaaattacccacaattattccatagatatcctgattgt 39359559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39475937 - 39475846
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  39475937 ctttgaaaaatgatgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggt-gggtcaagatagtttatggataccacctaaaaat 39475846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Original strand, 52367914 - 52367990
Alignment:
Q  260 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  52367914 ggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtagggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 52367990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4156231 - 4156188
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 288  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4156231 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 4156188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48683477 - 48683394
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  48683477 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 48683394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 246 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5961421 - 5961331
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  5961421 tttgaaaaatggtggataatttacccaccaacaaatcataatgagcaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaa 5961331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 319
Target Start/End: Original strand, 39637919 - 39637986
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattca 319  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39637919 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaa----taaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttca 39637986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 411
Target Start/End: Original strand, 33187450 - 33187505
Alignment:
Q  356 tgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  33187450 tgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 33187505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 380
Target Start/End: Original strand, 24215806 - 24215903
Alignment:
Q  272 accaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagta 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||||           ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  24215806 accaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaata-----------tatgtttatgtgactaatgtgtattggttggggta 24215894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Original strand, 42234942 - 42235013
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  42234942 ttatgtggttaatgtgtattggttgg-gtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 42235013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 398
Target Start/End: Original strand, 47605498 - 47605569
Alignment:
Q  326 ccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtat 398  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||||    
T  47605498 ccacttgaaaatatatttatgtggctaatatttattggttgga-tgaattatccaccatttttacataggtat 47605569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 413
Target Start/End: Original strand, 2954969 - 2955028
Alignment:
Q  354 tgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  2954969 tgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 2955028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 348 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7561591 - 7561528
Alignment:
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  7561591 ggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcttccatggataccctagttgtcacc 7561528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30289979 - 30289929
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||    
T  30289979 ttatgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattatccaccattcttccat 30289929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 341 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 46428323 - 46428278
Alignment:
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattc 386  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  46428323 tttatatggctaatgtgtattggttagagtaaattatccaccattc 46428278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 52324058 - 52324119
Alignment:
Q  359 attggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattat 420  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||    
T  52324058 attgattggagtaaattacccaccaatcttccatgggtaccctagttgtcaccaaatattat 52324119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10919349 - 10919313
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaat 281  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10919349 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaat 10919313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26472248 - 26472188
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||||    
T  26472248 ttatgtggctaatgtgtcttggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagccta 26472188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0949 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0949
Description:

Target: scaffold0949; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 1885 - 2051
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  1885 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 1984  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  1985 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 130)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 249 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26091420 - 26091258
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  26091420 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtg 26091321  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  26091320 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 26091258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 34276563 - 34276731
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  34276563 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 34276662  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  34276663 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34276731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2826847 - 2826681
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  2826847 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 2826748  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  2826747 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacct 2826681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 23437608 - 23437774
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  23437608 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 23437707  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23437708 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23437774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 45797495 - 45797663
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  45797495 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtactta 45797594  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45797595 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacctaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 45797663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 2243474 - 2243644
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2243474 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtcgggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtattta 2243573  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  2243574 tgtggcttatgtgtattagttggagtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcaccttat 2243644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 9798481 - 9798647
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  9798481 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 9798580  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9798581 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9798647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21366775 - 21366609
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  21366775 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 21366676  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  21366675 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 21366609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 47344672 - 47344838
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47344672 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgttta 47344771  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  47344772 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 47344838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 51363023 - 51363188
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  51363023 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 51363122  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  51363123 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 51363188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 39077561 - 39077728
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  39077561 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 39077660  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  39077661 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacct 39077728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31972502 - 31972336
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  31972502 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 31972403  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  31972402 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctaattgtcacc 31972336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 44984777 - 44984943
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  44984777 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 44984876  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  44984877 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 44984943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 248 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 53461979 - 53461813
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgt 347  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  53461979 tgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 53461880  T
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  53461879 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctta 53461813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 53854595 - 53854430
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  53854595 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 53854496  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  53854495 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcacc 53854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 6019944 - 6020109
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  6019944 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 6020043  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  6020044 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 6020109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 32366826 - 32366661
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  32366826 ctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 32366727  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  32366726 tgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 32366661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 55776061 - 55776233
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  55776061 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 55776159  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  55776160 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcaccttttatt 55776233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 55840239 - 55840411
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  55840239 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 55840337  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||||| ||||    
T  55840338 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataagtaccctagttgtcaccttttatt 55840411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 237493 - 237661
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  237493 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgtgctta 237592  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  237593 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 237661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 397418 - 397582
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  397418 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 397517  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  397518 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 397582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 33897661 - 33897501
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  33897661 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgatta 33897562  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaatt 405  Q
    | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  33897561 tatggctaatgtgtattaattggaataaattacccaccattcttctataggtaccctaatt 33897501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 42085223 - 42085390
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  42085223 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 42085322  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||    
T  42085323 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccatagttgtcacct 42085390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 27373092 - 27373257
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  27373092 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 27373191  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  27373192 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat-ggtactctaattgtcacc 27373257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 29478376 - 29478542
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  29478376 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 29478475  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29478476 tatggctaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 29478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 54575102 - 54574940
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  54575102 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttggtggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 54575003  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  54575002 gttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54574940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 54607979 - 54608125
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||    
T  54607979 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatatgcttat 54608078  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||    
T  54608079 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattcttccat 54608125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 3692376 - 3692207
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||  ||||||||||||||| | ||||    
T  3692376 ctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggattaagatagtttattgataccacttaaaaatgtgttta 3692277  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  3692276 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 3692207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19387853 - 19387684
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  19387853 tttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagattgttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 19387754  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  19387753 gtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 19387684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 41949398 - 41949566
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat--att 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   |     
T  41949398 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41949497  T
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  41949498 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtaccctagttgtcacc 41949566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 42766007 - 42765840
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |    
T  42766007 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctaa 42765909  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  42765908 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 42765840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43471861 - 43471694
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43471861 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgatta 43471762  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  43471761 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacct 43471694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18462179 - 18462013
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  18462179 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctta 18462080  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  18462079 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaatcacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 18462013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31532301 - 31532135
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31532301 ctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31532202  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  31532201 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 31532135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 241 - 411
Target Start/End: Original strand, 54086421 - 54086590
Alignment:
Q  241 attactttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatata 340  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||| |     
T  54086421 attactttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggataccgcttaaaaatgtg 54086519  T
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  54086520 cttatgtggctaatgtgcattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 54086590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22618678 - 22618511
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  22618678 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 22618580  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  22618579 tgtggctaatatgtattggttag-gtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 22618511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 29777423 - 29777254
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | | ||||||||||||||| |  |||    
T  29777423 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcgagatagtttacggataccacttaaaaatgtgctta 29777324  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  29777323 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtcacctta 29777254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 47662268 - 47662099
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||  |||    
T  47662268 ctttgaataatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttagtggtgtcaatatagttaatggataccacttaaaaatatgctta 47662169  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||||    
T  47662168 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctta 47662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 146595 - 146451
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  146595 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 146496  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  146495 tgtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttc 146451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41702625 - 41702461
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41702625 ctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41702526  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||    
T  41702525 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtca 41702461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 3170642 - 3170789
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  3170642 ctttgaagaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgctta 3170741  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3170742 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 3170789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 408
Target Start/End: Original strand, 6285323 - 6285486
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  6285323 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 6285422  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtc 408  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  6285423 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 6285486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22468936 - 22468789
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  22468936 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgttta 22468837  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  22468836 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccatttttccat 22468789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 55056425 - 55056258
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||    
T  55056425 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgctta 55056326  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||  |||||||||    
T  55056325 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtacccttgttgtcacct 55056258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 41560344 - 41560510
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  41560344 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 41560443  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||    
T  41560444 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagctgtcacc 41560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 50536790 - 50536628
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50536790 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccgatgaaaatgagaaatttgttggtggggtcaagatagttaatggataccacttaaaaatatgttta 50536691  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||    
T  50536690 tgtgactaatgtgtattagttggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgt 50536628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49881229 - 49881059
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  49881229 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 49881130  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggtt----ggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||    ||  |||||||||||| |||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  49881129 tgtggctaatgtgtattggttgggcgggataaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacc 49881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 411
Target Start/End: Original strand, 55519844 - 55520009
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  55519844 tttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaattttttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 55519943  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  55519944 gtggctaatgtgtattggttgtggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 55520009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 31070239 - 31070068
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  | |    
T  31070239 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggagtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctca 31070141  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  31070140 tgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatat 31070068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 31914214 - 31914380
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31914214 ctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaactgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31914313  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  31914314 tg-ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 31914380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 23609103 - 23609269
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |  |||    
T  23609103 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaatcaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcacggataccacttaaaaatgtgctta 23609202  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23609203 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctatttgtcacc 23609269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 42033191 - 42033357
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  42033191 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaattaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 42033290  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| |||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  42033291 tgtagctaatgtatattggttgagataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 42033357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 50234016 - 50234185
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  50234016 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgagaaatttgttggtgggatcaagatagttaatggataccacttaaaaatgtgctta 50234115  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||| |||||||||||    
T  50234116 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctagttgtcacctta 50234185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 50534647 - 50534799
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  50534647 ctttgaagaatggtgggtaacttacccaccaatcaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 50534746  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50534747 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 50534799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Original strand, 54425001 - 54425145
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgt 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  ||||||    
T  54425001 tgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgt 54425100  T
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  54425101 gactaatgtctattggttggggtaaattacccacgattcttccat 54425145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Original strand, 38591685 - 38591849
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    ||| |  ||||    
T  38591685 tttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccatt----aatgtgcttat 38591780  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  38591781 gtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 38591849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 50457976 - 50457805
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  50457976 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 50457877  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| |||||| ||||||    
T  50457876 tgttgctaatgtgtattggttgaggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcatcttata 50457805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 407770 - 407934
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  407770 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggata-cacttaaaaatgtgctta 407868  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  407869 tgtggctaatgtgtattggttggggt-aattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 407934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 41632172 - 41632007
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||| || |||    
T  41632172 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggg-tcaagatagttcatggatatcgcttaaaaatgtactta 41632074  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  41632073 tatggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtatcctagttgtcacc 41632007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 42222307 - 42222473
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  42222307 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcattgataccacttaaaaatgtgctta 42222406  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||  || |||| |||| ||||||||    
T  42222407 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacacaccattcttttatgggtaccctagttgtcacc 42222473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14017540 - 14017374
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | | ||||    
T  14017540 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaag--tgtgttta 14017443  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  14017442 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctgccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 14017374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 413
Target Start/End: Original strand, 48657858 - 48658002
Alignment:
Q  269 cccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgga 368  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||     
T  48657858 cccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggg 48657957  T
Q  369 gtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  48657958 gtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 48658002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 53834219 - 53834055
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  53834219 tttgaagaatggtgggtaatttacccaacaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgcggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 53834120  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||    
T  53834119 gtgactaatgtatattgattgaagtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcac 53834055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 52728448 - 52728302
Alignment:
Q  269 cccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgga 368  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||      
T  52728448 cccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgcgtattggttgag 52728349  T
Q  369 gtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  52728348 gtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccctata 52728302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 48313573 - 48313737
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||    
T  48313573 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatatgctta 48313670  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| |||||| | |||||||| | ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  48313671 tgtagctaatatatattggttagggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 48313737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 56023164 - 56022998
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  56023164 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 56023065  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| || ||| |||| |||| ||||||||    
T  56023064 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 56022998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48259674 - 48259508
Alignment:
Q  247 ttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatg 346  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||    
T  48259674 ttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaattagttggtggagtcaagatagttcatgaataccactt-aaaatgtgcttatg 48259576  T
Q  347 tggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  48259575 tggctaatatgtattgattagggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctacttatcaccttat 48259508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 48654830 - 48655004
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||||||||||||| || |||    
T  48654830 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttgatagataccacttaaaaatgtactta 48654929  T
Q  345 tgtggcta------atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||      ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  48654930 tgtggctaatgtgtatgtgtattggttggggtaaattacctaccattcttccatggctaccctaattgtcacctt 48655004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Original strand, 35446522 - 35446683
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||    
T  35446522 cttttaagaatggtgggtaatttacc-accgaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgctta 35446620  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  35446621 tttggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgt 35446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 39587945 - 39587781
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  39587945 ctttgaagaatgatgggtaatttacctaccaaccaatgaatatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 39587846  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | |  ||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  39587845 tataactaatgtatattggttagggtaaattacccaccattcttccat-ggta-cctaattgtcacc 39587781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 36532956 - 36532828
Alignment:
Q  285 aatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaat 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  36532956 aatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccaccat 36532857  T
Q  385 tcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36532856 tcttccatgggtatcctagttgtcacctt 36532828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 1932779 - 1932947
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  1932779 ctttgaagaatagtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttagtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 1932878  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||  ||| || ||| |||| |||| || |||||||    
T  1932879 tgtggctaatgtatattggttgggataaattatccatcattttttcatgggtaccctagttatcacctt 1932947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 54805784 - 54805614
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa----tata 340  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||| |||||  ||||||||||||||    | ||    
T  54805784 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttggtgggattaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgttta 54805685  T
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||| |||||| |||| ||||  |||||||    
T  54805684 tttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattactcatcattgttccatgggtaccctagatgtcacc 54805614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9998086 - 9997931
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||           || |  |||    
T  9998086 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagtaatttattggtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 9997998  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  9997997 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 9997931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45633934 - 45633779
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  45633934 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 45633846  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  45633845 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 45633779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 4486736 - 4486579
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||           || |  |||    
T  4486736 ctttgaagaacggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat-----------atgtgctta 4486648  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  4486647 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatagatagtctagttgtcacctt 4486579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 316 - 417
Target Start/End: Original strand, 35595774 - 35595875
Alignment:
Q  316 ttcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  35595774 ttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccatat 35595873  T
Q  416 at 417  Q
    ||    
T  35595874 at 35595875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 49014114 - 49014269
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||           | || |||    
T  49014114 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtactta 49014202  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  49014203 tgtggctaatgtgtattgattgaggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 49014269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 409
Target Start/End: Original strand, 51951699 - 51951861
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| |  ||||    
T  51951699 tttgaagaatgatgagtaatttatccaccaatcaatgaaaatgaacaatttgttaatggagtcaagatagttcatggatatcagttaaaaatgtgcttat 51951798  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  51951799 gtggctaatgtatattggtt-gtgtaaattacccaccattcttccatggataccctaattgtca 51951861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5117593 - 5117469
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  5117593 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 5117505  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5117504 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 5117469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 34552335 - 34552490
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  34552335 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggtgtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 34552423  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  34552424 tgcggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 34552490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 313
Target Start/End: Original strand, 42557598 - 42557666
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 313  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42557598 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagat 42557666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 368
Target Start/End: Original strand, 52396774 - 52396866
Alignment:
Q  277 ccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaa-gataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttgga 368  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  52396774 ccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtggctaatgtgtattggttgga 52396866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37239245 - 37239088
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  37239245 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 37239157  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||    
T  37239156 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctt 37239088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 43890944 - 43891101
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||           || |  |||    
T  43890944 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggagtcaatatagttcatgaat-----------atgtgctta 43891032  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || | || ||||||||||    
T  43891033 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccatagttgtcacctt 43891101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 54715051 - 54715208
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||           || |  |||    
T  54715051 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaacatagttcatgaat-----------atgtgctta 54715139  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||    
T  54715140 tgtggctaatgtgtattagttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacctt 54715208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 20351997 - 20351837
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           || |  |||    
T  20351997 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 20351909  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||    
T  20351908 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcaccttata 20351837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31881466 - 31881389
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31881466 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 31881389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15060444 - 15060364
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  15060444 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 15060364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 22620609 - 22620689
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22620609 ctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 22620689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 46708896 - 46708816
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  46708896 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 46708816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 47811922 - 47812081
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  47811922 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaatatgagcaatttattgattgagtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 47812010  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | || |||||||||||||||||    
T  47812011 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatggataccctaattgtcaccttat 47812081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14335256 - 14335165
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  14335256 ctttgaaaaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggtcaagatagttcatagataccacctaaaaa 14335165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 34835193 - 34835351
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||            
T  34835193 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaa-------- 34835284  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34835285 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctta 34835351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 33558097 - 33557944
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||           || ||||||    
T  33558097 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaggaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaat-----------atgtattta 33558009  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   || |||||||||||    
T  33558008 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgaatagcctaattgtca 33557944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27873703 - 27873579
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||           || |  |||    
T  27873703 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaatcaatgaaaatgagtaatttatttgtggggttaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 27873615  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27873614 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 27873579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 309 - 410
Target Start/End: Original strand, 35344868 - 35344968
Alignment:
Q  309 aagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtc 408  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  35344868 aagatagttcatggataccacttgaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtttg-gtaaattatccaccattcttccataggtatcctagttgtc 35344966  T
Q  409 ac 410  Q
    ||    
T  35344967 ac 35344968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3293178 - 3293098
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  3293178 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 3293098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11972284 - 11972204
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  11972284 ctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 11972204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 392
Target Start/End: Original strand, 42509359 - 42509459
Alignment:
Q  292 aatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttcca 391  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| |||| |||||||||    
T  42509359 aatttattggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtgactaatgtgtattggttaggataaattatccaccattcttcca 42509458  T
Q  392 t 392  Q
    |    
T  42509459 t 42509459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 249 - 411
Target Start/End: Original strand, 52688369 - 52688520
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||||           ||||  |||||||    
T  52688369 gaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcatgaat-----------atatgcttatgtg 52688457  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  52688458 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 52688520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 54216329 - 54216409
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  54216329 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 54216409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 54216891 - 54216811
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54216891 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgaacaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 54216811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27398757 - 27398666
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  27398757 tttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaat 27398666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 27580135 - 27580226
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  27580135 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27580226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38547756 - 38547665
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  38547756 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 38547665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 241 - 328
Target Start/End: Original strand, 43231514 - 43231601
Alignment:
Q  241 attactttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacca 328  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  43231514 attactttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaataaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggatacca 43231601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1662414 - 1662318
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatat 341  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||    
T  1662414 ctttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaagatat 1662318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Original strand, 33048994 - 33049062
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  33048994 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33049062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Original strand, 46720040 - 46720132
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  46720040 actttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattgatggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 46720132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6371404 - 6371247
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |  |||||| ||||||            
T  6371404 ctttgaaaaatagtgggtaatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttagggttaccacctaaaaa-------- 6371313  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||||||||    
T  6371312 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccattttttcataggtaccctagttgtcacctt 6371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 380
Target Start/End: Original strand, 52461386 - 52461503
Alignment:
Q  252 gaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggct 351  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  ||||||||||    
T  52461386 gaatggtgtgtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgtggct 52461474  T
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52461475 aatgtgtattggttggggtaaattaccca 52461503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 33289719 - 33289873
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||            |  |||    
T  33289719 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtaggatcaagatagttcatgaatac-----------gtgctta 33289807  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| ||| |||||||||    
T  33289808 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcct-attgtcacc 33289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 48259772 - 48259700
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  48259772 ttatgtggctaatatgtattgattggggtaaattacccaccattcttccat-ggtaccctagttgtcaccttat 48259700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 343 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 3291873 - 3291797
Alignment:
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatta 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| | || |||||||||||||||| ||||    
T  3291873 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctaattgtcaccttaaatta 3291797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Original strand, 573827 - 573910
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  573827 aatggtgggtaatttacctaccaaccaatcataatgaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 573910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 414
Target Start/End: Original strand, 42558300 - 42558370
Alignment:
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  42558300 atgtggctaatgtgtattgattagggtaaattatccaccattcttccatgggtatcttagttgtcacctta 42558370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 49058023 - 49057933
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaa 335  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||| || ||| |||||  |||||| ||||||    
T  49058023 ctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattgatgaggttaaaatagttcatagataccatttaaaa 49057933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 336
Target Start/End: Original strand, 27872612 - 27872686
Alignment:
Q  262 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  27872612 taatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtgggatcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27872686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15060358 - 15060289
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  15060358 ttatgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 15060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18206676 - 18206608
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata 314  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  18206676 tttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 18206608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 1662313 - 1662254
Alignment:
Q  359 attggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  1662313 attggttggggtaaattactcatcattcttccataggtaccctagttgtcaccttttatt 1662254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17555652 - 17555617
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaa 280  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17555652 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaa 17555617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51981548 - 51981513
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51981548 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 51981513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 51981613 - 51981554
Alignment:
Q  266 ttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||| ||||||||||    
T  51981613 ttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttatttgtgggattaagatagttcatgaata 51981554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 380
Target Start/End: Original strand, 22620695 - 22620733
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22620695 ttatgtggctaatgtatattggttggggtaaattaccca 22620733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46708810 - 46708740
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| ||| | || |||| |||||||||    
T  46708810 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaatcacccatcattctttcattgatagcctagttgtcacct 46708740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 381
Target Start/End: Original strand, 49304602 - 49304655
Alignment:
Q  327 cacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccac 381  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  49304602 cacttaaaaatgtatttatgtggctgatgtttattggtt-gaataaattacccac 49304655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31881383 - 31881311
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||  |||||| ||| |||| |||| ||| |||||||    
T  31881383 ttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattattcatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 31881311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 38547660 - 38547600
Alignment:
Q  352 aatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||| |||||||||    
T  38547660 aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttctatgggtaccctagttgtcacct 38547600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 5882522 - 5882695
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  5882522 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 5882621  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||    
T  5882622 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttttatt 5882695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 26377370 - 26377201
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  26377370 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 26377271  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  26377270 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 26377201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 11989140 - 11988973
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  11989140 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 11989041  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  11989040 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 11988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 28947103 - 28947269
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  28947103 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgttta 28947202  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  28947203 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 28947269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 7104706 - 7104915
Alignment:
Q  10 ataatactcaaactcacttttttcagttaacggacacttacttaccatttttcatcctcnnnnnnnaggtgtgacattcaataattttttggtaacaata 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104706 ataatactcgaactcacttttttcagttaacggacactt-----------ttcatcctctttttttaggtgtgacattcaataattttttggtaacaata 7104794  T
Q  110 tttgttttggtaacaagacattcaagtactttgttttcttccct-nnnnnnnnnnngtactttgttttctcatcaagttgaaagtcttattactactact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7104795 tttgttttggtaacaagacattcaagtactttgttttcttccctaaaaaaaaaaaagtactttgttttctcatcaagttgaaagtcttattactactact 7104894  T
Q  209 agctgttttgcattatattat 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  7104895 agctgttttgcattatattat 7104915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8789924 - 8789715
Alignment:
Q  10 ataatactcaaactcacttttttcagttaacggacacttacttaccatttttcatcctcnnnnnnnaggtgtgacattcaataattttttggtaacaata 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8789924 ataatactcgaactcacttttttcagttaacggacactt-----------ttcatcctctttttttaggtgtgacattcaataattttttggtaacaata 8789836  T
Q  110 tttgttttggtaacaagacattcaagtactttgttttcttccct-nnnnnnnnnnngtactttgttttctcatcaagttgaaagtcttattactactact 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8789835 tttgttttggtaacaagacattcaagtactttgttttcttccctaaaaaaaaaaaagtactttgttttctcatcaagttgaaagtcttattactactact 8789736  T
Q  209 agctgttttgcattatattat 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  8789735 agctgttttgcattatattat 8789715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18101661 - 18101489
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  18101661 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 18101562  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  18101561 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtatcctagttgtcaccatatat 18101489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34528028 - 34527860
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  34528028 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 34527929  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  34527928 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 34527860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 960070 - 959899
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||    
T  960070 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatggaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatagataccacttaaaaatgtgttta 959971  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  959970 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatata 959899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14891545 - 14891383
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  14891545 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 14891446  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  14891445 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgt 14891383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33452738 - 33452572
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  33452738 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaataatttgttgttggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtactta 33452639  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  33452638 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 33452572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19281221 - 19281056
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  19281221 ctttgaagaatggtgggtaatttgcccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatatgctta 19281122  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19281121 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcataggtagcctagttgtcac 19281056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 24168107 - 24168274
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24168107 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24168206  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  24168207 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 24168274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 8615256 - 8615422
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  8615256 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 8615355  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  8615356 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcacc 8615422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22551227 - 22551061
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  |||    
T  22551227 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacctaaaaatgtgctta 22551128  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  22551127 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 22551061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 19415699 - 19415530
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  19415699 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagctcatggataccacttaaaaatgtgctta 19415600  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  19415599 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 19415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2594018 - 2593850
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2594018 ctttgaagaattgtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2593919  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2593918 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattatccaccattcttccataggtaccctagttgtcacctt 2593850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 2892204 - 2892368
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2892204 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2892303  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| || |||| |||| ||||||    
T  2892304 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttctatgggtaccctagttgtca 2892368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7393752 - 7393584
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  7393752 ctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 7393653  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  7393652 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccataattgtcacctt 7393584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 405
Target Start/End: Original strand, 16703382 - 16703542
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  16703382 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgctta 16703481  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaatt 405  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16703482 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacgcatcattcttccatgggtatcctaatt 16703542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22341956 - 22341785
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccacca--accaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatt 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |    
T  22341956 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaacacaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgct 22341857  T
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  22341856 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctta 22341785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7345278 - 7345131
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  7345278 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 7345179  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7345178 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 7345131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Original strand, 599908 - 600080
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  599908 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 600007  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  600008 tgtgactaatttgtattggttgggataaattatccaccattctttcatgggtaccctagttgtcaccatatat 600080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 1970727 - 1970879
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  1970727 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgctta 1970826  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggta 397  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  1970827 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggta 1970879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24224236 - 24224070
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24224236 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24224137  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| || |||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  24224136 tgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacctactattctttcatgagtatcctagttgtcacc 24224070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10508074 - 10507907
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  10508074 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgataatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 10507975  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| || | || |||| |||||||||    
T  10507974 cgtggctaatgtgtattggttggggtaaactacccaccattcttcgatggctaccctagttgtcacct 10507907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 30743614 - 30743445
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  30743614 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgagatcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgctta 30743515  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || |||||| ||| | || ||||||| ||||||||    
T  30743514 tgtggctaatatgtattggttgggataaattacctaccattctttcatggataccctaattatcacctta 30743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5294966 - 5294799
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  5294966 tttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 5294867  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  5294866 gtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5294799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5299518 - 5299351
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  5299518 tttgaagaatagtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 5299419  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| ||||||| ||||| |||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  5299418 gtgactaatgtatattgattgaggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 5299351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 30467769 - 30467656
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |  |||    
T  30467769 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaacaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaacatgtgctta 30467670  T
Q  345 tgtggctaatgtgt 358  Q
    ||||||||||||||    
T  30467669 tgtggctaatgtgt 30467656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 500
Target Start/End: Original strand, 7104907 - 7104995
Alignment:
Q  412 ttatattattcgtttatgaagtgtttgtttattgttgctgatttcaatattgttttcctttgttttgcttcaaccatggttttctcttc 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7104907 ttatattattcgttcatgaagtgtttgtttattgttgctgatttcaatattgttttcctttgttttgcttcaaccatgggtttatcttc 7104995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 412 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 8789723 - 8789635
Alignment:
Q  412 ttatattattcgtttatgaagtgtttgtttattgttgctgatttcaatattgttttcctttgttttgcttcaaccatggttttctcttc 500  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8789723 ttatattattcgttcatgaagtgtttgtttattgttgctgatttcaatattgttttcctttgttttgcttcaaccatgggtttatcttc 8789635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 261 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23262079 - 23261927
Alignment:
Q  261 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtat 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |  ||||| || |||| |||||    
T  23262079 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggggttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgaggttaatatgtat 23261980  T
Q  361 tggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23261979 tggttggggtaaattatccaccgttctttcataggtaccctagttgtcacctt 23261927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28949000 - 28948845
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||           ||||  |||    
T  28949000 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat-----------atatgctta 28948912  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  28948911 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28948845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 15965449 - 15965605
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||           || | ||||    
T  15965449 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatacttcatgaat-----------atgtgttta 15965537  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  15965538 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 15965605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 411
Target Start/End: Original strand, 4487546 - 4487698
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || || | ||||    
T  4487546 tgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtactcatgt 4487634  T
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  4487635 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 4487698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 1398569 - 1398724
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| || ||||||           || |  |||    
T  1398569 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagatagttgatgaat-----------atgtgctta 1398657  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  1398658 tgtggctaatatgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcataggtagcctagttgtcacc 1398724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Original strand, 13329397 - 13329543
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||           |||| || |  |||    
T  13329397 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttca-----------taaatatgtgctta 13329485  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatccta 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||    
T  13329486 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagccta 13329543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 311
Target Start/End: Original strand, 929675 - 929741
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaag 311  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  929675 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaag 929741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 7167598 - 7167753
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||            
T  7167598 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-------- 7167689  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  7167690 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 7167753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 1939659 - 1939583
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatg 321  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1939659 ctttgaagaatggtggataatttacctataaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatg 1939583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 3291024 - 3291104
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3291024 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggttaagatagttcataaata 3291104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Original strand, 3786766 - 3786845
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  3786766 tttgaagaatggtggataatttacctaccaatcaatgaaaatgaagaatttatttgtggggtcaatatagttcatgaata 3786845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 375878 - 375797
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacc 327  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  375878 tttgaaaaatggtgggtaatttacctaccaactaatcataatgcgcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatacc 375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 3291110 - 3291181
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||    
T  3291110 ttatgtggctaatatgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatggatagcctaattgtcacctt 3291181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Original strand, 3786851 - 3786920
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  3786851 ttatgtggctaatgtgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3786920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Original strand, 18661836 - 18661905
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  18661836 ttatgtggctaatatgtattggttgggataaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 18661905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 421
Target Start/End: Original strand, 4034607 - 4034783
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  4034607 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 4034706  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4034707 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttatattatt 4034783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 34518382 - 34518552
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  34518382 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 34518481  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  34518482 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccactattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 34518552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 14660461 - 14660628
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  14660461 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 14660560  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  14660561 tgtggctaatgtgtattggttggtgtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacct 14660628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 746481 - 746647
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  746481 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 746580  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  746581 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 746647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10244748 - 10244582
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  10244748 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 10244649  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10244648 tgtagctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcacc 10244582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 23901794 - 23901960
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  23901794 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 23901893  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23901894 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 17600851 - 17601020
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  17600851 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 17600950  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17600951 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 17601020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6594624 - 6594456
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  6594624 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 6594525  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  6594524 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 6594456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 40635233 - 40635400
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  40635233 ctttgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 40635332  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  40635333 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 40635400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7892854 - 7892684
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  7892854 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 7892755  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  7892754 tgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatagataccctagttgtcaccttat 7892684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 11184987 - 11185153
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  11184987 ctttgaagaatggtaggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 11185086  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  11185087 tatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11185153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 27400418 - 27400584
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  27400418 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtactta 27400517  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  27400518 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 27400584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 38997116 - 38997282
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  38997116 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 38997215  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  38997216 tgtggctaatgtctattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 38997282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 45371005 - 45371171
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45371005 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggcggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45371104  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  45371105 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 27024430 - 27024599
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  27024430 ctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgatta 27024529  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  27024530 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccattattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 27024599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 1092117 - 1091949
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  1092117 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 1092018  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  1092017 tgtggctaatatgtattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 1091949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2325055 - 2324887
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2325055 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2324956  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||||||||    
T  2324955 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgaataccctagttgtcacctt 2324887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13815384 - 13815212
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  13815384 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 13815285  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||| |||| |||| |||||||| |||||    
T  13815284 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcaccatatat 13815212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27651200 - 27651033
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  27651200 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgcccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 27651101  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27651100 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 27651033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 249 - 415
Target Start/End: Original strand, 6430492 - 6430658
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  6430492 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 6430591  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || | |||||||    
T  6430592 gctaatatgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttattaccttat 6430658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 26710360 - 26710526
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  26710360 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcattttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 26710459  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  26710460 tgtggctgatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 26710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 408
Target Start/End: Original strand, 10424610 - 10424773
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  10424610 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 10424709  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtc 408  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||    
T  10424710 tgtggctaatatgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtc 10424773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 4609641 - 4609807
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  4609641 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaataagtaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 4609740  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4609741 tgtgcctaatgtgtattggttggggtaaattatccaacattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4609807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 5726144 - 5726310
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| | ||||    
T  5726144 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggttaccacttaaaaatgtgttta 5726243  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  5726244 tatggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 5726310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 32327376 - 32327542
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  32327376 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccagccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 32327475  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32327476 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattatccatcattcttccataggtaccctagttgtcacc 32327542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 32856602 - 32856432
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||| |  |||    
T  32856602 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttagtgggatcaagatagttcatggataccacttacaaatgtgctta 32856503  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32856502 tgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcaccttat 32856432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2914304 - 2914138
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2914304 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2914205  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  2914204 tgtggctgatgtgtatcggttgaggtaaattacccaccattcttccatggatatcctagttgtcacc 2914138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 40735479 - 40735645
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||    
T  40735479 ctttgaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtactta 40735578  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40735579 tgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattcttccatgagtaccctaattgtcacc 40735645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 11159637 - 11159802
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||    
T  11159637 ctttgaaaaatggt-ggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatgccacttaaaaatgtgttta 11159735  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  11159736 tgtggctattgtgtattggatggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 11159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 12842118 - 12842278
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||||| | ||||    
T  12842118 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggagtcaagatagttcttggataccaattaaaaatgtgttta 12842217  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||     |||||||| ||||||||||||    
T  12842218 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccat-----cataggtaccctaattgtcac 12842278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 246 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14697702 - 14697537
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  14697702 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgtgatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 14697603  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||    
T  14697602 gtagctaatgtgtattggtcggggtaaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacc 14697537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8433082 - 8432946
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  8433082 ctttgaagaatggtggataatttacctgccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccactttaaaatatactta 8432983  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccac 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8432982 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccac 8432946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 377
Target Start/End: Original strand, 32608395 - 32608527
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  32608395 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggtgtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgctta 32608494  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32608495 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 32608527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33427813 - 33427645
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  33427813 ctttgaataatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 33427714  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |||| |||| || |||||||    
T  33427713 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacacaccattctttcatgggtaccctagttatcacctt 33427645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Original strand, 15925095 - 15925244
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  15925095 ctttcaagaatggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagtaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 15925194  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccatag 394  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||||    
T  15925195 tgtagctaatgtgtattggttgaggtaaattatccatcattctttcatag 15925244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37621036 - 37620867
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtgggg---tcaagataattcatgaataccacttaaaaatatat 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| |      
T  37621036 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtactcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgc 37620937  T
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||    
T  37620936 ttatgtggcttatgtgtattggtttggataaattatccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacc 37620867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 32948461 - 32948626
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  32948461 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaga-agttcatggataccacttaaaaatgtgctta 32948559  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| || ||||  ||| ||||||||    
T  32948560 tgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattcttctatgggtactctagttgtcacc 32948626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 263 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37255485 - 37255331
Alignment:
Q  263 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattg 362  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  37255485 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggttaatgtgtattg 37255386  T
Q  363 gttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||    
T  37255385 gttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacctaatat 37255331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 40037158 - 40037325
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  40037158 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 40037257  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| || ||| |||| |||| ||||||||||    
T  40037258 tgtggttaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcatt-tttcatgggtaccctagttgtcacctt 40037325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 266 - 381
Target Start/End: Original strand, 9444726 - 9444841
Alignment:
Q  266 ttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  9444726 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgctggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggtt 9444825  T
Q  366 ggagtaaattacccac 381  Q
    || |||||||||||||    
T  9444826 ggggtaaattacccac 9444841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 413
Target Start/End: Original strand, 25294886 - 25295018
Alignment:
Q  281 tgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25294886 tgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattaccca 25294985  T
Q  381 caattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
      ||||||||||  ||| |||| ||||| ||||    
T  25294986 tcattcttccatgagtaccctagttgtcccctt 25295018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 246 - 377
Target Start/End: Original strand, 41172474 - 41172605
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    |||||||||||||| |  ||||    
T  41172474 tttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcaaaggtaccacttaaaaatgtgcttat 41172573  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41172574 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 41172605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 249 - 354
Target Start/End: Original strand, 42899934 - 42900039
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    |||||||    
T  42899934 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgcgcttatgtg 42900033  T
Q  349 gctaat 354  Q
    ||||||    
T  42900034 gctaat 42900039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28641447 - 28641292
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           |||| ||||    
T  28641447 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgttta 28641359  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  28641358 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccattattctttcatgggtagcctagttgtcacc 28641292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Original strand, 32150692 - 32150812
Alignment:
Q  10 ataatactcaaactcacttttttcagttaacggacacttacttaccatttttcatcctcnnnnnnnaggtgtgacattcaataattttttggtaacaata 109  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32150692 ataaaactcaaactct-ttttttcagttaacggacacttacttaccatttttcttcctcttttttttagtctgacagtcaataattttttggtaacaata 32150790  T
Q  110 tttgttttggtaacaagacatt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  32150791 tttgttttggtaacaagacatt 32150812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 35158205 - 35158050
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  35158205 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 35158117  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  35158116 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 35158050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 39103062 - 39103216
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||           || |  |||    
T  39103062 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaat-----------atgtgctta 39103150  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  39103151 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 39103216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 29687056 - 29687211
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  29687056 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 29687144  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  29687145 tgtggctaatgtgtattggttatggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 29687211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39301352 - 39301272
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  39301352 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39301272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 447740 - 447633
Alignment:
Q  304 gggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaa 403  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||     
T  447740 gggtcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcatccatgggtaccctag 447641  T
Q  404 ttgtcacc 411  Q
    ||||||||    
T  447640 ttgtcacc 447633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 21735055 - 21734897
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  21735055 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattgggggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 21734967  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  21734966 tgtggctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctta 21734897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 145297 - 145450
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||            |  |||    
T  145297 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaatac-----------gtgctta 145385  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  145386 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 392
Target Start/End: Original strand, 1229675 - 1229789
Alignment:
Q  278 caatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||| |||||||| | ||||||||||  ||||||||    
T  1229675 caatgaaaatgaacaatttgttgatggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatctggctaatatatattggttgggataaattac 1229774  T
Q  378 ccacaattcttccat 392  Q
    |||| ||||||||||    
T  1229775 ccaccattcttccat 1229789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 27331313 - 27331474
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||       || | || |  |||    
T  27331313 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaa-------tatatatgtgctta 27331405  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  27331406 tgtggctaatatgtattagttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacctt 27331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 13543778 - 13543622
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  ||||    
T  13543778 tttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttat 13543690  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  13543689 gtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 13543622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Original strand, 12814629 - 12814693
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtca 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12814629 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtca 12814693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19428581 - 19428426
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  19428581 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccgaccaatgaaaatgagcaatttacttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 19428493  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  19428492 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 19428426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Original strand, 3266312 - 3266391
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  3266312 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata 3266391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27765016 - 27764937
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  27765016 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata 27764937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 4258505 - 4258659
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  4258505 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggg-tcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 4258592  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | ||| |||| |||| ||||||||    
T  4258593 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattcgttcatgggtagcctagttgtcacc 4258659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 12333650 - 12333574
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatg 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  12333650 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatg 12333574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 40544231 - 40544151
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  40544231 ctttgaagaatggtggatagtttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 40544151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 44481843 - 44481934
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  44481843 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 44481934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 12730076 - 12730156
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12730076 ctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcataaata 12730156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 396
Target Start/End: Original strand, 12827137 - 12827228
Alignment:
Q  304 gggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggt 396  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  12827137 gggttaagatagttcatga-taccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccatttttccacaggt 12827228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28014928 - 28014856
Alignment:
Q  301 gtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaa 373  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28014928 gtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaa 28014856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 34249280 - 34249360
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  34249280 ctttgaagaatggtgagtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata 34249360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43899125 - 43899045
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  43899125 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata 43899045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28566852 - 28566773
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  28566852 tttgaagaatggtggataatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttctggggtcaagatagttcatgaata 28566773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 35126795 - 35126886
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  35126795 ctttgaaaaacggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 35126886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 43356114 - 43356266
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  43356114 ctttgaagaatggtgggtaa---acccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 43356199  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | || |||| ||||||||    
T  43356200 tgtggctaatttgtattggtttgagtaaattacccatgattctttcatggttagcctagttgtcacc 43356266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2000492 - 2000412
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  2000492 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaatagttcataaata 2000412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 261 - 414
Target Start/End: Original strand, 3711664 - 3711806
Alignment:
Q  261 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtat 360  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  ||||| |||||||||||||    
T  3711664 gtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgcttatgcggctaatgtgtat 3711752  T
Q  361 tggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| |||||||    
T  3711753 tggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacctta 3711806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 8056641 - 8056721
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||| || |||||| ||||||||||    
T  8056641 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaactatttatttgtggagtgaagatagttcatgaata 8056721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2688884 - 2688726
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||           | |  |||    
T  2688884 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccgattaatgaaaattagcaatttatttgtagggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctta 2688796  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| | || |||| |||||||||||    
T  2688795 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatggatagcctagttgtcacctta 2688726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 339
Target Start/End: Original strand, 30545837 - 30545930
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat 339  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||| || |||| |  |||||||||    
T  30545837 tttgaagaatggtggataatttacctaccaaacaataaaaatgagcaacttattggtggggtcaagatagttcgtggatacaatctaaaaatat 30545930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12333564 - 12333497
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  12333564 ttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccatcattctttcat-ggtagcctagttgtcacc 12333497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43899039 - 43898971
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  43899039 ttatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 43898971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Original strand, 34249366 - 34249438
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  34249366 ttatgtgactaatgtgtattgattgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctta 34249438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 377
Target Start/End: Original strand, 8056727 - 8056762
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8056727 ttatgtagctaatgtgtattggttggagtaaattac 8056762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 38985416 - 38985342
Alignment:
Q  261 gtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |   ||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  38985416 gtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgat-atgtcaagatagttcatggataccacctaaaaa 38985342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 27764931 - 27764897
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaatta 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27764931 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaatta 27764897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17799341 - 17799296
Alignment:
Q  316 ttcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtatt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  17799341 ttcatgaataccacttaaaaatatgaatatgtggctaatgtttatt 17799296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 102)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 35355905 - 35356072
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  35355905 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 35356004  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  35356005 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 35356072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 25894083 - 25893917
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  25894083 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 25893984  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  25893983 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 25893917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 27018133 - 27018299
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  27018133 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgtggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 27018232  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27018233 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 27018299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 33411277 - 33411443
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  33411277 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 33411376  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  33411377 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 33411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 49171528 - 49171360
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  49171528 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 49171429  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  49171428 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 49171360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22979813 - 22979647
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  22979813 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 22979714  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  22979713 tgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacc 22979647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23393217 - 23393051
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  23393217 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 23393118  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  23393117 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 23393051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33423441 - 33423276
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33423441 ctttgaagaatgatgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 33423342  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  33423341 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33423276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33839881 - 33839713
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33839881 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 33839782  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | || ||||||||||    
T  33839781 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccttagttgtcacctt 33839713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 413
Target Start/End: Original strand, 36389377 - 36389541
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||||||    
T  36389377 gaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttatgtg 36389476  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  36389477 gctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 36389541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 46913126 - 46913296
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatat--t 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |  |    
T  46913126 ctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtgct 46913225  T
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  46913226 tatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 46913296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 17855445 - 17855615
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||    
T  17855445 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgctta 17855544  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  17855545 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 17855615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20165980 - 20165814
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  20165980 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtactta 20165881  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  20165880 tgtggctaatgtgtataggttgaggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 20165814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 40670580 - 40670750
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  40670580 ctttgaagaatggtggataatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 40670679  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| | || ||||||||||||    
T  40670680 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccttagttgtcaccttat 40670750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45690263 - 45690097
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45690263 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45690164  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  45690163 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 45690097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 47740497 - 47740331
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  47740497 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgctta 47740398  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  47740397 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 47740331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Original strand, 10028505 - 10028658
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| | ||||    
T  10028505 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgttta 10028604  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtat 398  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10028605 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccactattcttccatgggtat 10028658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 35328232 - 35328068
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgt 347  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||    
T  35328232 tgaagaatggtgggtaaattacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgt 35328133  T
Q  348 ggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  35328132 ggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacct 35328068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47067143 - 47066975
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  47067143 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 47067044  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  47067043 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 47066975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 33695987 - 33695821
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  33695987 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 33695888  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  33695887 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 33695821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48609843 - 48609677
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  48609843 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagataattcatgtataccacttaaaaatgtgctta 48609744  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  48609743 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatacaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 48609677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 2341828 - 2341659
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |  |||    
T  2341828 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatacaacttaaaaatgtgctta 2341729  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat-aggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  2341728 tgtgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggggtaccctagttgtcacctt 2341659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 26579883 - 26579710
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  26579883 ctttgaagaatggtgggtaatttacccacaaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatgtataccacttaaaaatgtgttta 26579784  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||||||||| ||||    
T  26579783 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcaccttgtatt 26579710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 31586865 - 31587038
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  31586865 ctttgaagaatggtggataatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 31586964  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||    
T  31586965 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataagtaccctagttctcaccttctatt 31587038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 33332806 - 33332973
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  33332806 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatatgctta 33332904  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    || ||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  33332905 tgcggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccaccattctttcatgggtaccctagttgtcacctt 33332973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 45482675 - 45482843
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  |||    
T  45482675 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatatgctta 45482774  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  45482775 tgtgactgatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 45482843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 37846182 - 37846015
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  37846182 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtgggatcaagataatttatggataccacttaaaaatgtgctta 37846083  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  37846082 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacct 37846015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 411
Target Start/End: Original strand, 29446863 - 29447020
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggcta 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  29446863 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgcttatgtgacta 29446962  T
Q  353 atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  29446963 atgtgtattggttggagt-aattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 29447020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 240 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 5183996 - 5183823
Alignment:
Q  240 aattactttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat 339  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |    
T  5183996 aattgctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataacacttaaaaatgt 5183897  T
Q  340 atttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
      |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| || |||||||    
T  5183896 gcttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgagtaccctagttatcacctt 5183823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 405
Target Start/End: Original strand, 15877567 - 15877727
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  15877567 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaacaaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 15877666  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaatt 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  15877667 tgtggctaatatgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctaatt 15877727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 412
Target Start/End: Original strand, 31625725 - 31625887
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  31625725 gaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 31625824  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31625825 actaatgtatattggttggagtaaatta-ccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacct 31625887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 43499502 - 43499649
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||    
T  43499502 ctttaaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatactta 43499601  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43499602 tgtggccaatgtatattagttggggtaaattacccaccattcttccat 43499649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 19563464 - 19563630
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |  |||    
T  19563464 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaatgaaaatgaacaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaatatcacttaaaaatgtgctta 19563563  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19563564 tgtggctaatgtgtattggttaaggtaaattacccaccattcttccatgggtactctaattgtcacc 19563630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 387
Target Start/End: Original strand, 33870262 - 33870404
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||    
T  33870262 ctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgtaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccatttaaaaatgtgctta 33870361  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattct 387  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  33870362 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattct 33870404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 244 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35757187 - 35757018
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||    
T  35757187 actttgaagaatggtggataatttatccaccaaccaacgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatgtgctt 35757089  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggtt-ggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  35757088 atgtggctaatgtgtattggttgggggtaaattactcaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 35757018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 41991024 - 41990852
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  |||    
T  41991024 ctttgaagaatggtggataatttacacaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgctta 41990925  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  41990924 tgtggctaatgtgtattggtttggataaattactcaccattcttccatgggta-cctaattatcaccttttatt 41990852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 246 - 412
Target Start/End: Original strand, 10618316 - 10618475
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10618316 tttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgg-------atagttcatgaataccacttaaaaatatgtttat 10618408  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  10618409 gtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttatcacct 10618475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 31429641 - 31429470
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  31429641 ctttgaagaatggtgggtgatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagtacatggataccacttaaaaatgtgttta 31429542  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||    
T  31429541 tgtgactaatgtgtattggttgaagtaaattactcatcattctttcatgggtaccctagttgtcaccatata 31429470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 246 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 33720201 - 33720063
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  33720201 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtacttat 33720102  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaat 384  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  33720101 gtggctaatgtgtattggttagggtaaattacacacaat 33720063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 273 - 413
Target Start/End: Original strand, 35767519 - 35767659
Alignment:
Q  273 ccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaa 372  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35767519 ccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatatggctaatgtgtattggttggggtaa 35767618  T
Q  373 attacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  35767619 attacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 35767659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 5712185 - 5712351
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  5712185 ctttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattagtggggtcaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgctta 5712284  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||| |||| |||| ||||||||    
T  5712285 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattttttcatgggtaccctagttgtcacc 5712351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45063521 - 45063357
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  45063521 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttgatggagtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 45063422  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| |||||| ||| ||||  ||| ||||||||    
T  45063421 tgtggctaatgtgtat--gttgaggtaaattatccaccattctttcattggtactctagttgtcacc 45063357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 280 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30076658 - 30076526
Alignment:
Q  280 atgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccc 379  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  30076658 atgaaaatgatcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattagttggcgtaaattaccc 30076559  T
Q  380 acaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  30076558 atcattcttccatggataccctagttgtcacct 30076526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 295 - 414
Target Start/End: Original strand, 41904272 - 41904391
Alignment:
Q  295 ttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccatag 394  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||     
T  41904272 ttgttggtgaggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataa 41904371  T
Q  395 gtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  41904372 gtatcctagttgtcacctta 41904391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 290 - 413
Target Start/End: Original strand, 44405410 - 44405533
Alignment:
Q  290 gtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttc 389  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||    
T  44405410 gtaatttattggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgtttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacctaccattcttc 44405509  T
Q  390 cataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||    
T  44405510 catgggtattctagttgtcacctt 44405533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 35752189 - 35752032
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  35752189 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 35752101  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  35752100 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 35752032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24923179 - 24923019
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||           || |  |||    
T  24923179 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataattcatgaat-----------atgtgctta 24923091  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttata 416  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  24923090 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccatccttctttcatgggtagcctagttgtcaccttata 24923019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 274 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28234073 - 28233936
Alignment:
Q  274 caaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaa 373  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  28234073 caactaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaa 28233974  T
Q  374 ttacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     |||||||  ||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  28233973 ctacccacctttctttcatgggtaccctagttgtcacc 28233936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 246 - 387
Target Start/End: Original strand, 44564356 - 44564497
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||  ||||    
T  44564356 tttgaagaatggtggataatttacccaccaatcaataaaaataagcaatttattagtggtgtcaagatagttcatagataccacttaaaaatatgcttat 44564455  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattct 387  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  44564456 gtgactaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattct 44564497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 7876483 - 7876325
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           || || |||    
T  7876483 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtactta 7876395  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  7876394 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcattggtagcctagttgtcacctta 7876325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 24228558 - 24228714
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           ||||  |||    
T  24228558 ctttgaagaatggtgggtaatttaccaaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgctta 24228646  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  24228647 tgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattgtcacct 24228714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 46817576 - 46817420
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  46817576 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 46817488  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| |||||    
T  46817487 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacct 46817420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 48085875 - 48086031
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||           || |  |||    
T  48085875 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 48085963  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| ||||||| ||||||    
T  48085964 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctaattatcacct 48086031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 498343 - 498263
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  498343 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 498263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26941687 - 26941607
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  26941687 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 26941607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36817000 - 36816920
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36817000 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 36816920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 43489235 - 43489390
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  43489235 ctttgaataatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 43489323  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| ||||  ||| ||||||||    
T  43489324 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagtctagttgtcacc 43489390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 37127954 - 37128110
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||           |||| || |  |||    
T  37127954 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttca-----------taaatatgtgctta 37128042  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||    
T  37128043 tgtagctaatgtgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacct 37128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Original strand, 29098769 - 29098843
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcat 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29098769 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcat 29098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 46898171 - 46898014
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||           | |  |||    
T  46898171 ctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaataaatatgagcaatttattgatggggtcaaaatagttcatgaata-----------tgtgctta 46898083  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  46898082 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacctt 46898014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 29610652 - 29610732
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  29610652 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgaata 29610732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Original strand, 29863032 - 29863116
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccac 329  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||| |||||||    
T  29863032 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaataatttattggtggaatcaaaatagttcatggataccac 29863116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32556761 - 32556681
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||    
T  32556761 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggacaagatagttcatgaata 32556681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 39323633 - 39323713
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  39323633 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39323713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39453629 - 39453561
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  39453629 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagata 39453561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 39866682 - 39866762
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  39866682 ctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 39866762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Original strand, 44659861 - 44660019
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||           ||||  |||    
T  44659861 ctttgaagaatggt-ggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgctta 44659948  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||  || |||| |||| ||| ||||||||    
T  44659949 tgtggctaatgtgtatcggttggagtaaattatccatcattcttttatgggtagcctagttgccaccttat 44660019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45237688 - 45237608
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  45237688 ctttgaagaatgataggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgaggtcaagataattcatgaata 45237608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 47906914 - 47906834
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||    
T  47906914 ctttgaagaatggtgggtaatttacctaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaagatagttcatgaata 47906834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 2332036 - 2332116
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2332036 ctttgaaaaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaata 2332116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 336
Target Start/End: Original strand, 7257413 - 7257489
Alignment:
Q  260 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  7257413 ggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaa 7257489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 21718134 - 21718214
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  21718134 ctttgaataacggtgggtaatttacccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 21718214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25037663 - 25037583
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25037663 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaattaaaatgatcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaata 25037583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 26371066 - 26371146
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  26371066 ctttgaagaatggtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata 26371146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 410
Target Start/End: Original strand, 33393360 - 33393499
Alignment:
Q  260 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgta 359  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||           || ||||||  |    
T  33393360 ggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-----------ggttaatgttca 33393448  T
Q  360 ttggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||    
T  33393449 ttggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcac 33393499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16482938 - 16482847
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||    
T  16482938 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgataatgagcaatttattggtggggtcaagatggtttatggataccacctaaaaa 16482847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45502972 - 45502835
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||           |||||| ||||||||||  ||    
T  45502972 actttgaagaatggtgagtaatttacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttagttgggtcaag-----------ataccatttaaaaatatgctt 45502884  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||  |||||||||    
T  45502883 atgtagctaatgtatattggttgaggtaaattacccaccgttcttccat 45502835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 33455116 - 33455193
Alignment:
Q  248 tgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  33455116 tgaagaatggtggataatttacccaccaaccaataaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 33455193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 35484653 - 35484734
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaa-tttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  35484653 ctttgaagaatggtgggtaaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaata 35484734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44003525 - 44003369
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||            
T  44003525 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaactaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaa-------- 44003434  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||    
T  44003433 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacct 44003369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15644093 - 15644010
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||    
T  15644093 aatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaaaatagtttatggataccacctaaaaa 15644010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47460919 - 47460836
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  47460919 aatggtggataatttacccaccaaccaattataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 47460836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 38448603 - 38448511
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  38448603 ctttgaaaaattgtggataatttacccaccaatcaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaatatcacctaaaaat 38448511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 41855076 - 41855156
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  41855076 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaatgaatgtgagcaatttattggtggagtcaagatagttcataaata 41855156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 46103138 - 46103217
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  46103138 ctttgaaaaatggtgggtaatttacc-accaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaata 46103217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 276 - 351
Target Start/End: Original strand, 26456157 - 26456232
Alignment:
Q  276 accaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggct 351  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||    
T  26456157 accaatgaaaatgagcaatttattggtgggatcaagatagttcatgaatacttcttaaaaatagagttatatggct 26456232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 296
Target Start/End: Original strand, 35557747 - 35557798
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaattt 296  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35557747 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaattt 35557798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30077091 - 30077048
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 288  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30077091 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatg 30077048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 413
Target Start/End: Original strand, 39323712 - 39323781
Alignment:
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||| |||| ||||||||||    
T  39323712 tatgtggctaatgtgtattggttgg-gtaaattacccatcattctttcatgagtagcctagttgtcacctt 39323781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 249 - 290
Target Start/End: Original strand, 35823311 - 35823352
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgag 290  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35823311 gaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgag 35823352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26941601 - 26941537
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattg 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  |||||| ||| |||| ||||||||    
T  26941601 ttatgtggctaatgtgtattggttagggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctaattg 26941537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37443734 - 37443666
Alignment:
Q  268 acccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||    
T  37443734 acccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatagataccacctaaaaa 37443666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 39453552 - 39453484
Alignment:
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||    
T  39453552 tttatgtgactaatgtgtaatggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtca 39453484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Original strand, 46103223 - 46103291
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||| ||||  ||| |||||||    
T  46103223 ttatgtggctaatgtgtattagttggagtaaattactcatcattctttcatgggtagtctagttgtcac 46103291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 417
Target Start/End: Original strand, 26371152 - 26371227
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatat 417  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| ||| |||| |||||    
T  26371152 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccaccatatat 26371227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 377
Target Start/End: Original strand, 29610738 - 29610773
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29610738 ttatgtggctaatgtgtattgattggagtaaattac 29610773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 380
Target Start/End: Original strand, 21718220 - 21718258
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21718220 ttatgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccca 21718258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 392
Target Start/End: Original strand, 42272180 - 42272226
Alignment:
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||    
T  42272180 gtggctaatgtgtattgattgaggtaaattacccataattcttccat 42272226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Original strand, 2332122 - 2332191
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||| |||| || | ||||||||    
T  2332122 ttatgtggttactgtgtattggttggggtaaattatccaccatttttccatgggtacccaagttgtcacc 2332191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36816914 - 36816845
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  36816914 ttatgtggctaatatgtattggttggggtaaattatccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 36816845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 353 - 413
Target Start/End: Original strand, 39866762 - 39866822
Alignment:
Q  353 atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||    
T  39866762 atgtgtattggttggggtaaattatccaccattctttcatgggtagtctaattgccacctt 39866822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 45237602 - 45237530
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||  || |||| | || |||||||||||    
T  45237602 ttatgtggttaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttttatgggtagcttagttgtcacctta 45237530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 74)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2484458 - 2484292
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| | ||||    
T  2484458 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggatactacttaaaaatgtgttta 2484359  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2484358 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 2484292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 5184988 - 5185154
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  5184988 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 5185087  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5185088 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattactcaccattcttccatgggtatcctagttgtcacc 5185154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 24253398 - 24253564
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  24253398 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 24253497  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  24253498 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 24253564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15398648 - 15398483
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  15398648 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 15398549  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  15398548 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtactctagttgtcac 15398483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 6901815 - 6901979
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  6901815 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 6901914  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  6901915 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtca 6901979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 7722065 - 7722232
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  7722065 ctttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 7722164  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7722165 tgtggctaatgtgtattggtttgggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacct 7722232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 31938913 - 31939079
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  31938913 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 31939012  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31939013 tatgactaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctaattgtcacc 31939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 3466847 - 3466680
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||    
T  3466847 ctttgaagaatggtgggtaatttacccactaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatatgctta 3466748  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||||||    
T  3466747 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttttatgggtaccctagttgtcacct 3466680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 35626054 - 35626221
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  35626054 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 35626153  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  35626154 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtactctagttgtcacct 35626221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43326545 - 43326379
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |   ||    
T  43326545 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgccta 43326446  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  43326445 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttggcacc 43326379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 421
Target Start/End: Original strand, 39932595 - 39932771
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  39932595 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 39932694  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattatt 421  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||| ||||    
T  39932695 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattaccaaccattcttccatgggtactctagttgtcacctaataatatt 39932771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 27938914 - 27939060
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  27938914 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttat 27939013  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  27939014 gtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccat 27939060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 18479834 - 18479690
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  18479834 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaaaatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 18479735  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttc 389  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18479734 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttc 18479690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 43262349 - 43262182
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  43262349 ctttgaagaatggtgggtaattaacctaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 43262250  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  43262249 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacct 43262182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 12648813 - 12648979
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  12648813 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggttaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 12648912  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  12648913 tgtggctaatgtgtattgattggggtaaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 12648979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 15683807 - 15683973
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  15683807 ctttgaagaatgatgtgtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 15683906  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  15683907 tatggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccataagtaccctagttgtcacc 15683973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 38756654 - 38756484
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  38756654 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaataaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 38756555  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattctt-ccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  38756554 tgtggctaatgtgtattagttgagataaattacccacaattcttcccataggtaccctagttgtcacctta 38756484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40886193 - 40886028
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||    
T  40886193 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgctta 40886095  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||    
T  40886094 tgtggctaatgtgtattggttagggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttttcacc 40886028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27278643 - 27278474
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata----attcatgaataccacttaaaaatata 340  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||| |     
T  27278643 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagataattcatggataccacttaaaaatgtg 27278544  T
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27278543 cttacgtggctaatgtatattggttggggtaaattacccaccattcttccataggtaccctagttgtcac 27278474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 739870 - 739703
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  739870 ctttgaagaatggtgagtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 739771  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  739770 tgtggttaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttctatgggtaccctagttgtcacct 739703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 5137731 - 5137878
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  5137731 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgttta 5137830  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||    
T  5137831 tgtggctaatatgtattgatttgagtaaattatccaccattcttccat 5137878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27501221 - 27501055
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  27501221 ctttgaagaatggtggataatttatccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 27501122  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  27501121 tgtggctaatgtgtattgtttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacc 27501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 25831537 - 25831703
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |  |||    
T  25831537 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaataagcaatttgttggtggggtcaa-atagttcatggataccaattaaaaatgtgctta 25831635  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||    
T  25831636 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattctttcatgggtaccttatttgtcacct 25831703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40279024 - 40278877
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  40279024 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaacataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 40278925  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccat 392  Q
    |||||||||||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||    
T  40278924 tgtggctaatgtgtattgattgagataaattacccatcattcttccat 40278877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 246 - 419
Target Start/End: Original strand, 890923 - 891095
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |  ||||    
T  890923 tttgaagaatggtggataatttatccaccaactaatgaaaatgagcaatttgttggtcgagtcaagatagttcatggataccactt-aaaatgtgcttat 891021  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatta 419  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  891022 gtggctaatgtgtattggttagggtaaattacctaccattcttccatgggtatcctaattgtcacctaatatta 891095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 266 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 29789440 - 29789291
Alignment:
Q  266 ttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggtt 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  29789440 ttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtatattggtt 29789341  T
Q  366 ggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  29789340 gggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 29789291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28424959 - 28424793
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||| || || ||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||    
T  28424959 ctttgaaggatagtgggtaatttatccatcaaccaatgaaaatgc--aatttgttggtggggtcaagatagttcatgaataccacttaaaaatgtgctta 28424862  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||| ||||||||||    
T  28424861 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttccatggatactctagttgtcacctt 28424793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 409
Target Start/End: Original strand, 40110251 - 40110413
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |  ||||    
T  40110251 tttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggt-gggtcaagatagttcatagataccacttaaaaatgtgcttat 40110349  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtca 409  Q
    |||| |||||| |||| ||| | |||||||| | || ||||||||||  |||||||||||||||    
T  40110350 gtggttaatgtatattagttagggtaaattatctaccattcttccatgagtatcctaattgtca 40110413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 246 - 380
Target Start/End: Original strand, 763740 - 763874
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||    
T  763740 tttgaagaatggtgggtaatttactcaccaaccaataaaaatgagtaatttgttggtggagttaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtacttat 763839  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  763840 gtggctaatatgtattagttggggtaaattaccca 763874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13504904 - 13504742
Alignment:
Q  249 gaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtg 348  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  13504904 gaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtg 13504805  T
Q  349 gctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     ||||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  13504804 actaatatgtattagttgggataaattatccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 13504742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 34451292 - 34451432
Alignment:
Q  271 caccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagt 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  34451292 caccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtggggtcaatatagttcatggataccacttaaaaatgtgcttatgtggctaatatgtattggttggggt 34451391  T
Q  371 aaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||| |||||||||| | || |||| ||||||||    
T  34451392 aaattacccaccattcttccatggataccctagttgtcacc 34451432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9424747 - 9424593
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||           ||||  |||    
T  9424747 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgctta 9424659  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||    
T  9424658 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcac 9424593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42658817 - 42658667
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           ||||  |||    
T  42658817 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atatgctta 42658729  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattg 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||    
T  42658728 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctaattg 42658667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Original strand, 4149710 - 4149848
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||          | ||| ||||||||||||||| |  |||    
T  4149710 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaataaaaatgagcaatttgttggtgggg----------ttatggataccacttaaaaatgtgctta 4149799  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccata 393  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  4149800 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccata 4149848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23195403 - 23195246
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  23195403 ctttaaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 23195315  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  23195314 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccgtcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 23195246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31294155 - 31293989
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | || | ||||||||||||||||||||||  |||    
T  31294155 ctttaaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaaattattggtagggtccgggtagtccatgaataccacttaaaaatatgctta 31294056  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     |||  | |||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  31294055 cgtgattgatggttattggttggagtaaattacccaccattcttacatgggtaccctagttgtcacc 31293989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 33617601 - 33617758
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  33617601 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgagcaatttattggtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 33617689  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33617690 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcaccattcttccatgagtaccctagttgtcacctt 33617758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 38015669 - 38015510
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  38015669 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaactaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 38015581  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  38015580 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccaccttat 38015510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 27503395 - 27503550
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           || |  |||    
T  27503395 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgctta 27503483  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  27503484 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 27503550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 418
Target Start/End: Original strand, 13957686 - 13957848
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||           ||    |||    
T  13957686 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaat-----------atgcgctta 13957774  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatatt 418  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  13957775 tgtgactaatgtgtattggttgaggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcaccttatatt 13957848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Original strand, 5120041 - 5120134
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatat 339  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5120041 ctttgatgaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaccaatttattggtagggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaatat 5120134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 5497289 - 5497446
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||| ||| |||||||||           || |  |||    
T  5497289 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaaaatagttcatgaat-----------atgtgctta 5497377  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||||    
T  5497378 tgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacctt 5497446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 327
Target Start/End: Original strand, 40632515 - 40632597
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatacc 327  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  40632515 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatacc 40632597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 253 - 413
Target Start/End: Original strand, 40686923 - 40687071
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggcta 352  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||         |||   |    
T  40686923 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccatctaaaaa---------gtg---a 40687010  T
Q  353 atgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  40687011 atgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccataggtaccctaattgtcacctt 40687071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 244 - 325
Target Start/End: Original strand, 14971993 - 14972074
Alignment:
Q  244 actttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  14971993 actttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata 14972074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Original strand, 6973079 - 6973159
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6973079 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 6973159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9374657 - 9374502
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||           || | ||||    
T  9374657 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttatggggtcaagatagttcatgaat-----------atgtgttta 9374569  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  9374568 ggtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 9374502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12558184 - 12558093
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaat 337  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12558184 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattgatgtggtcaagatagttcatg-ataccacttaaaaat 12558093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 19295746 - 19295901
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||| ||           || |  |||    
T  19295746 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggttaagatagttcatgtat-----------atgtgctta 19295834  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  19295835 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 19295901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 36365600 - 36365520
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  36365600 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgaacaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 36365520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 42247937 - 42247857
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||    
T  42247937 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagtttatgaata 42247857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 38638065 - 38637908
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||            
T  38638065 ctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccaactaaaaa-------- 38637974  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
       ||  ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  38637973 ---ggtgaatgtttattagttggggtaaattacccacaatttttccatgggtaccctagttgtcacctt 38637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 9171180 - 9171108
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataatt 317  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  9171180 ctttgaagaatggtgggtaatttatccaccaacaaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagataatt 9171108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 2585478 - 2585633
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||  ||||||            
T  2585478 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccatctaaaaa-------- 2585569  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     || |  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | || |||||||||||||    
T  2585570 -gttg--aatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatggataccctaattgtcacc 2585633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3940478 - 3940411
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcat 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3940478 aatggtgggtaatttacccaccaacaaatgaaaatgagcaatttattggtgcggtcaagataattcat 3940411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36472439 - 36472348
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  36472439 ctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccactttaaaa 36472348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 612827 - 612754
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttgg-agtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  612827 ttatgtggctaatgtgtattggttgggagtaaattactcagtattcttccatgggtatcctagttgtcacctta 612754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3656708 - 3656643
Alignment:
Q  260 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  3656708 ggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttttggggtcaagatagttcatgaata 3656643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 393
Target Start/End: Original strand, 6206901 - 6207037
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttat 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||||           || |  ||||    
T  6206901 tttgaagaatagtgggtaatttacccaccaaccaattaaaatgagcaatttatttggggggtcaaaatagttcatgaat-----------atgtgcttat 6206989  T
Q  346 gtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccata 393  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  6206990 gtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattctttcata 6207037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1402660 - 1402576
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccac 329  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||    
T  1402660 ctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataatgagtaatttattggtgggatcaagatagtttatggataccac 1402576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 33624094 - 33624018
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatg 321  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  33624094 ctttgaataatggtagataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttatttgtgggatcaaaataattcatg 33624018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 27390613 - 27390704
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  27390613 ctttgaaaaatggtggatagtttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 27390704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 325
Target Start/End: Original strand, 38492647 - 38492709
Alignment:
Q  263 aatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata 325  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  38492647 aatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata 38492709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9527175 - 9527131
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9527175 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatga 9527131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 15301028 - 15300957
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataat 316  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||    
T  15301028 ctttgaagaatgattggtaatttacacatcaaccaatgaaaatgagcaatttatcggtggagtcaagttaat 15300957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18327328 - 18327237
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| | |||| | ||||| ||||||| ||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  18327328 ctttgaaaaatggtggataatttacccaccaaccaattataatgcgcaatttattggtggagtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 18327237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24167939 - 24167848
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  24167939 ctttgaaaaatggtgggtaatttatccaccaaccaatcataataaacaatttattggtggggtcaagatagtttatggataccacctaaaaa 24167848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 262 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 36948626 - 36948568
Alignment:
Q  262 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatg 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||    
T  36948626 taatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttattggtagggt-aagatagttcatg 36948568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3656637 - 3656568
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  3656637 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattctttcatgggtagcctagttgccacc 3656568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33624008 - 33623940
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcac 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| ||| || | || ||||||||||||    
T  33624008 ttatgtggctaatgtgtatcggttggggtaaattatccaccatttttcaatggataccctaattgtcac 33623940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 612900 - 612842
Alignment:
Q  255 tggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata 314  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  612900 tggtgggtaatttaaccaccaacca-tgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 612842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 413
Target Start/End: Original strand, 6973165 - 6973236
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||| ||||||    
T  6973165 ttatgtgactaatatgtattggttggggtaaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgacacctt 6973236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36948558 - 36948513
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattctt 388  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  36948558 ttatgtggctaatgtgtattggtagg-gtaaattacccaccattctt 36948513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 342 - 380
Target Start/End: Original strand, 38492715 - 38492753
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattaccca 380  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38492715 ttatgtgactaatgtgtattggttggggtaaattaccca 38492753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 75410 - 75233
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  75410 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatgcataccacttaaaaatgtgttta 75311  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttatattattc 422  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  75310 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattattcaccattcttccattggtaacctagttgtcaccttttatgattc 75233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 176670 - 176837
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||    
T  176670 ctttgaagaatggtgggtaatttaccgaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttgaaaatgtactta 176769  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacct 412  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  176770 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattacccaccattcttctatgggtatcctagttgtcacct 176837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 278022 - 278192
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaata--ccacttaaaaatatatt 342  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||| | ||    
T  278022 ctttgaagaatggtgggtaaattactcaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccccacttaaaaatgtgtt 278121  T
Q  343 tatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  278122 tatgtggctaatgtgtattggttgggataaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 278192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 19020 - 18850
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  19020 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagataattcatggataccacttaaaaatgtgctta 18921  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcaccttat 415  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  18920 tgtgactaatgtgtattagttggaataaattatccacaattcttccatgggtaccctagttgtcaccttat 18850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13759
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  13928 ctttgaagaatggtggataatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 13829  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctta 414  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  13828 tgtggctaatgtgtattggttgaggtaaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacctta 13759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 39722 - 39554
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  39722 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 39623  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacctt 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  39622 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccatcattcttccatgggtaccctagttgtcacctt 39554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 241 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11303 - 11133
Alignment:
Q  241 attactttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatata 340  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |     
T  11303 attacctttaagaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtggggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtg 11204  T
Q  341 tttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  11203 cttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattatccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 11133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2598 - 2432
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||    
T  2598 ctttgaagaatggtgggtaaattatccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtagggtcaagatagttcatggataccacttaaaaatgtgctta 2499  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||| |||| || |||||    
T  2498 tgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcatcattcttccatgggtaccctagttatcacc 2432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 381
Target Start/End: Original strand, 32577 - 32713
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||||    
T  32577 ctttgaagaatggtgggtaattaacccaccaaccaatgaaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggataccatttaaaaatgtgttta 32676  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccac 381  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32677 tgtggttaatgtgtattggttggggtaaattacccac 32713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4736 - 4596
Alignment:
Q  271 caccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagt 370  Q
    ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||  |    
T  4736 caccaactaataaaaatgaacaatttgttggtggggtaaagatagtttatggataccacttaaaaatgtgcttatgtagctaatgtgtattggttgggat 4637  T
Q  371 aaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  4636 aaattacccaccattcttccatgggtaccctagttgtcacc 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 389
Target Start/End: Original strand, 3133 - 3239
Alignment:
Q  283 aaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatatttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccaca 382  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  3133 aaaatgagcaatttgttggtgggatcaagatagttcatggatatcacttaaaaatgtgcttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattactcacc 3232  T
Q  383 attcttc 389  Q
    |||||||    
T  3233 attcttc 3239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 14760 - 14851
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  14760 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagatagtttatgaataccacctaaaaa 14851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20632 - 20477
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattta 344  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||            
T  20632 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccatcaaccaatcataatgagcaatttattggtggggtcaagataatttatggataccacctaaaaa-------- 20541  T
Q  345 tgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
       ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  20540 ---ggtgaatgtttattggttggggtaaattacccaccatttttccatgggtaccctagttgtcacc 20477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2003 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold2003
Description:

Target: scaffold2003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 336
Target Start/End: Original strand, 118 - 209
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  118 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatcataatgagcaatttattggtggagtcaagatagtttatgaataccacctaaaaa 209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0721 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0721
Description:

Target: scaffold0721; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 7106 - 7262
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaatatattt 343  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||           | |  ||    
T  7106 ctttgaagaatggtgggtaatttacccaccaatcaatgaaaaatgagcaatttatttgtggggtcaagatagttcatgaata-----------tgtgctt 7194  T
Q  344 atgtggctaatgtgtattggttggagtaaattacccacaattcttccataggtatcctaattgtcacc 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  7195 atgtggccaatgtgtattggttgggataaattacccatcattctttcatgggtagcctagttgtcacc 7262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4702 - 4618
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  4702 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 4618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 336
Target Start/End: Original strand, 3416 - 3500
Alignment:
Q  253 aatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaa-tgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaataccacttaaaaa 336  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  3416 aatggtgggtaatttatccaccaaccaatgaaaaatgagtaatttattggtgaggtcaagatagttcatggataccatttaaaaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0271
Description:

Target: scaffold0271; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 17922 - 18003
Alignment:
Q  245 ctttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagataattcatgaatac 326  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||| ||| || ||||||||    
T  17922 ctttgaaaaatggtgggtaatttacccaccaaccaatgaatatgatcaatttattgatggagtcaaaatattttatgaatac 18003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0271; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 377
Target Start/End: Original strand, 18008 - 18043
Alignment:
Q  342 ttatgtggctaatgtgtattggttggagtaaattac 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18008 ttatgtggctaatgtgtattggttggggtaaattac 18043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Original strand, 19234 - 19302
Alignment:
Q  246 tttgaagaatggttggtaatttacccaccaaccaatgaaaatgagtaatttgttggtggggtcaagata 314  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19234 tttgaagaacggtgggtaatttacctctcaatcaatgaaaatgaacaatttattggtggggtcaagata 19302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University