View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2748_low_19 (Length: 535)

Name: NF2748_low_19
Description: NF2748
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2748_low_19
NF2748_low_19
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (16-520)||(6361506-6362010)
chr8 (20-326)||(6330367-6330673)
chr8 (20-306)||(6319925-6320211)
chr8 (20-329)||(6422729-6423038)
chr8 (20-326)||(6350815-6351121)
chr8 (26-430)||(7469852-7470258)
chr8 (26-430)||(7457450-7457856)
chr8 (41-328)||(6273024-6273311)
chr8 (45-326)||(6287277-6287558)
chr8 (74-342)||(6408690-6408958)
chr8 (65-342)||(6389441-6389718)
chr8 (84-330)||(6368471-6368717)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (248-325)||(36746300-36746377)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 369; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 6362010 - 6361506
Alignment:
Q  16 aataacacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  6362010 aataacacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggagagagaattgaaggt 6361911  T
Q  116 gaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacg 215  Q
    ||    |||||||| ||||||||||||  |||  | || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  6361910 gatctctggacttctgattcacagccaaaagagtcctttaagaggtttggaaagaagttggctgaaattgagcaaaaactcattcaaaggaacaatgatg 6361811  T
Q  216 agtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgt 315  Q
    || || |||| || ||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6361810 agacactgaggaatcgtaacggaccagtgaagatgccttacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcccaacagtgt 6361711  T
Q  316 ctctatctaaaaaacgttgtggttgttgcgttgtcgctattaataaaagaggaggaggaatccaattccctcgccccctatgtatatcgtcatgttatgt 415  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6361710 ctctatctaaaaaacgtcgtggttgttgcgttgtcgctattaataaaagaggaggaggaatccaattccctcgccccctatgtatatcgtcatgttatgt 6361611  T
Q  416 tattatgtacgtttgtttttaattctgtaatgtgttttatcaataaaaactaccatgtttgattgttataatgtatttcatcaataaaagttactatgtt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6361610 tattatgtacgtttgtttttaattctgtaatgtgttttatcaataaaaactatcatgtttgattgttataatgtatttcatcaataaaagttactatgtt 6361511  T
Q  516 tctat 520  Q
    |||||    
T  6361510 tctat 6361506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6330673 - 6330367
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| | || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330673 acaccaaaaaatgataccctcactgaccttacgatcttagaggtcttatcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 6330574  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6330573 tttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttggctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgatgagtc 6330474  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||     
T  6330473 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 6330374  T
Q  320 atctaaa 326  Q
    |||||||    
T  6330373 atctaaa 6330367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 6320211 - 6319925
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6320211 acaccaaaaaatgataccctaactgaccttacaatcatagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggtgagg 6320112  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6320111 cttggacttttgattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttggctgaaattgaggcaaagctcatcaaaaggaacaatgatgagtc 6320012  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6320011 attgagaaaccgatacgggcctgtgaagatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgactggcagaggcattcc 6319925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6423038 - 6422729
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||      
T  6423038 acacccaagagtgatacccttacagaccttaccattattgaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggggagagaatcgaaggtgatc 6422939  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     ||||||||| ||| ||||||||  ||| || | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||  |||||||||    
T  6422938 tttggacttctgatgcacagccaaaagaggcctacaagaagtttgcaaggaagttggctgaaattgaggaaaagctagttaaaaggaacgctgacgagtc 6422839  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctct 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||     
T  6422838 attgagaaaccgatacgggcctgtgaagatgccatacactctgctttatccttctagtgaagaaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtttcc 6422739  T
Q  320 atctaaaaaa 329  Q
    ||||| ||||    
T  6422738 atctagaaaa 6422729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 20 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6351121 - 6350815
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||      
T  6351121 acaccaaagaatgatacacttactgacttgaccattatagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggagatagaattgaaggtgaca 6351022  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    || |||| | ||||||||||||| ||| |    
T  6351021 attggacttcagattcacaaccaaaagaagccttcaagaggtttggaaagaagttggctgaaattgaacagaaactcactcaaaggaacaatgatgagac 6350922  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctct 319  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||     
T  6350921 attgagaaatcggtacggaccagtgaagatgccatatactctactttatccttctagtgaggaaggattgacttgccgaggcattcctaatagtatctcc 6350822  T
Q  320 atctaaa 326  Q
    |||||||    
T  6350821 atctaaa 6350815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7470258 - 7469852
Alignment:
Q  26 aagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttgga 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    ||||    
T  7470258 aagaatgatacccttactaacttgaccatcttagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgaacaataccttggagagagaattgaaggtgatctctgga 7470159  T
Q  126 cttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgag 225  Q
    |||| ||||||||||||  | | || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  7470158 cttctgattcacagccaaaacaggcctacaagaagtttggaaagaagttgtctgaaattgagaaaaacctcattcaaaggaacaatgatgagacactgag 7470059  T
Q  226 aaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaa 325  Q
     || ||| | || |||||||| ||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470058 gaatcgaaatggacctgtgaagatgtcatatacactgctttatcctactagtgaggaaggattgacttccagaggcattcccaacagtgtctctatctaa 7469959  T
Q  326 aaaa---cgttgtggttgttgcgttgtcgctattaataaaagaggaggaggaatccaattccctcgcc-ccctatgtatatcgtcatgttatgttattat 421  Q
    ||||   | | || ||||||  ||||| ||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  7469958 aaaatgtcatcgtcgttgttttgttgttgctttaaataatcgatgagaaggaatccaattccctcacctccctatg--tatggtcatgttgtgttattat 7469861  T
Q  422 gtacgtttg 430  Q
    ||| |||||    
T  7469860 gtatgtttg 7469852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 7457856 - 7457450
Alignment:
Q  26 aagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttgga 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    ||||    
T  7457856 aagaatgatacccttactaacttgaccatcttagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgaacaataccttggagagagaattgaaggtgatctctgga 7457757  T
Q  126 cttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgag 225  Q
    |||| |||||||| |||  | | || | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  7457756 cttctgattcacaaccaaaacaggcctacaagaagtttggaaagaagttggctgaaatcgagaaaaacctcattcaaaggaacaatgatgagacactgag 7457657  T
Q  226 aaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaa 325  Q
     || ||| | || |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7457656 gaatcgaaatggacctgtgaagatgccatatacactgctttatcctactagtgaggaaggattgacttccagaggcattcccaacagtgtctccatctaa 7457557  T
Q  326 aaaa---cgttgtggttgttgcgttgtcgctattaataaaagaggaggaggaatccaattccctcgcc-ccctatgtatatcgtcatgttatgttattat 421  Q
    ||||   | | || ||||||| ||||| ||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  7457556 aaaatgtcatcgtcgttgttgtgttgttgctttaaataatcgatgagaaggaatccaattccctcacctccctatg--tatggtcatgttgtgttattat 7457459  T
Q  422 gtacgtttg 430  Q
    ||| |||||    
T  7457458 gtatgtttg 7457450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6273311 - 6273024
Alignment:
Q  41 actgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagc 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| |    
T  6273311 actgacttgaccattatagaggtcttgtcaagacatgcttctgatgaacaataccttggacagagaattgaaggtgatctttggacttctgattcacaac 6273212  T
Q  141 cattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcc 240  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||||   ||| |||| | ||||||||||||| ||| |  | || || ||||| || ||    
T  6273211 cattagaggctttcaagagattcggaacaaagttggctgaaattgaacaaaaactcactcaaaggaacaatgatgagactctaaggaatcgatatggacc 6273112  T
Q  241 tgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaaaaa 328  Q
     ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||    
T  6273111 agtgaagatgccgtatactttgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcctaacagtatctccatctaaaaa 6273024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6287558 - 6287277
Alignment:
Q  45 acttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccatt 144  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| |||      
T  6287558 acttgactgttatagaagtcttgtcaagacatgcttctgatgaacaataccttggacagagaattgaaggtgataattggacttctgattcacaaccaaa 6287459  T
Q  145 agaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||| |||| | |||||||||| || ||| || |||| || || || || || |||    
T  6287458 agaggctttcaagaggtttggaaagaagctggctgaaattgagaaaaaactcactcaaaggaacaacgatgagacactgaggaatcgttatggaccagtg 6287359  T
Q  245 aatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaaa 326  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  6287358 aagatgccatatactttgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcccaatagtatctccatctaaa 6287277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 74 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6408958 - 6408690
Alignment:
Q  74 catgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagt 173  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  6408958 catgtttctgatgagcaatacattggacacagaatcgaaggtgatctttggacttacgattcagagccagtagaggccttcaagaagtttggaaagaagt 6408859  T
Q  174 tgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttc 273  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  6408858 tggctgaaattgagcaaaagctcattgaaaggaacaacgatgaatcattgagaaacaggaatgggcctgtgaagatgccatacactgtgctctatccttc 6408759  T
Q  274 tagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaaaaaacgttgtggttgtt 342  Q
     ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  6408758 aagtgagccaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtctccatctagaaaatgtcatggttgtt 6408690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6389718 - 6389441
Alignment:
Q  65 ttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttg 164  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||| |||||    
T  6389718 ttgtcaacacatgtttctgatgagcaatacattggacacagaatcgaaggtgatctttggacttacgattcagagccagtagaggccttcaagaagtttg 6389619  T
Q  165 gaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgct 264  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  6389618 gaaagaagttggctgaaattgagcaaaagctcattgaaaggaacaacgatgaatcattgagaaacaggaatgggccagtgaagatgccatacactgtgct 6389519  T
Q  265 ttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaaaaaacgttgtggttgtt 342  Q
     |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||  ||||||||    
T  6389518 ctatccttcaagtgagccaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtctccatctagaaaatgtcatggttgtt 6389441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6368717 - 6368471
Alignment:
Q  84 atgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaat 183  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||   ||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||| | ||||| || ||| |||  ||||||    
T  6368717 atgaggaataccttggacaaagaactgaaggtgatctttggacttctgatccaaagccagtagaagcctacaaaaagtttgcaaagaaattgattgaaat 6368618  T
Q  184 tgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaa 283  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    |    
T  6368617 tgaggaagagttcattcaaaggaacaataatgagtcattgaaaaacaggtatgggcctgtgaagtttccatacactcttctttatccttccagtggacca 6368518  T
Q  284 ggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaaaaaac 330  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6368517 ggattgactggcagagggattcccaacagtgtctccatctaaaaaac 6368471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 325
Target Start/End: Original strand, 36746300 - 36746377
Alignment:
Q  248 atgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggtattcccaacagtgtctctatctaa 325  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||| | ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  36746300 atgccctacactttgcttttacctaccagtggagaaggcttgacttgcagaggaattcccaatagtgtttctatctaa 36746377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University