View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2767_low_15 (Length: 464)

Name: NF2767_low_15
Description: NF2767
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2767_low_15
NF2767_low_15
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (9-446)||(54651454-54651891)
chr3 (35-371)||(12264641-12264977)
chr3 (17-371)||(25058811-25059164)
chr3 (9-361)||(18911075-18911427)
chr3 (9-371)||(15468162-15468524)
chr3 (9-371)||(22275281-22275641)
chr3 (20-371)||(5228385-5228734)
chr3 (62-371)||(12901965-12902274)
chr3 (66-371)||(49232508-49232813)
chr3 (23-371)||(11985999-11986358)
chr3 (92-369)||(44229059-44229336)
chr3 (63-369)||(1467615-1467921)
chr3 (17-273)||(18896875-18897130)
chr3 (63-336)||(12811948-12812221)
chr3 (9-371)||(14842392-14842752)
chr3 (103-371)||(15936551-15936818)
chr3 (9-342)||(15614935-15615262)
chr3 (62-371)||(15938352-15938660)
chr3 (17-371)||(16821211-16821560)
chr3 (23-273)||(55316389-55316634)
chr3 (28-273)||(41270245-41270485)
chr3 (50-273)||(13839063-13839286)
chr3 (9-136)||(23492696-23492823)
chr3 (33-342)||(2049911-2050219)
chr3 (9-273)||(13954711-13954983)
chr3 (50-342)||(12030019-12030309)
chr3 (9-273)||(45860975-45861247)
chr3 (15-136)||(53771365-53771486)
chr3 (9-273)||(2449060-2449332)
chr3 (15-136)||(16261777-16261898)
chr3 (15-137)||(8268561-8268683)
chr3 (15-137)||(8275661-8275783)
chr3 (33-273)||(17912326-17912576)
chr3 (183-371)||(15859028-15859215)
chr3 (183-342)||(51158022-51158180)
chr3 (62-136)||(14285289-14285363)
chr3 (50-136)||(38168237-38168323)
chr3 (33-136)||(30153265-30153369)
chr3 (27-136)||(33342204-33342315)
chr3 (83-136)||(51961010-51961063)
chr3 (33-136)||(19260677-19260781)
chr3 (62-136)||(19947026-19947100)
chr3 (62-137)||(11477053-11477128)
chr3 (62-136)||(16933827-16933901)
chr3 (326-371)||(18897138-18897183)
chr3 (104-136)||(15857163-15857195)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (58-371)||(54488-54802)
scaffold0066 (58-371)||(45102-45416)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (15-371)||(35790927-35791283)
chr5 (9-361)||(23514643-23514995)
chr5 (9-371)||(11211886-11212249)
chr5 (15-371)||(1219349-1219704)
chr5 (15-371)||(7425396-7425749)
chr5 (9-371)||(17471412-17471772)
chr5 (63-361)||(10777846-10778144)
chr5 (9-371)||(32950765-32951138)
chr5 (63-369)||(21932257-21932563)
chr5 (63-369)||(21938427-21938733)
chr5 (63-369)||(35582110-35582416)
chr5 (63-369)||(36989646-36989952)
chr5 (63-369)||(22882960-22883266)
chr5 (15-327)||(27009958-27010264)
chr5 (15-308)||(23328693-23328984)
chr5 (15-308)||(24616297-24616588)
chr5 (15-308)||(24712673-24712964)
chr5 (15-308)||(24745691-24745982)
chr5 (63-371)||(4199858-4200165)
chr5 (63-273)||(19500069-19500278)
chr5 (63-342)||(29188159-29188434)
chr5 (49-371)||(18530933-18531258)
chr5 (105-273)||(25426798-25426965)
chr5 (63-273)||(18777865-18778074)
chr5 (63-273)||(22366354-22366563)
chr5 (105-273)||(12544-12711)
chr5 (56-371)||(22053705-22054024)
chr5 (9-273)||(20623138-20623411)
chr5 (9-273)||(21233349-21233622)
chr5 (59-371)||(23507037-23507347)
chr5 (105-273)||(21073510-21073677)
chr5 (9-273)||(37052913-37053186)
chr5 (92-267)||(34939452-34939639)
chr5 (9-268)||(25900227-25900495)
chr5 (63-273)||(43443270-43443477)
chr5 (9-273)||(16536366-16536639)
chr5 (9-134)||(2032135-2032262)
chr5 (49-342)||(27182416-27182709)
chr5 (49-154)||(23981350-23981455)
chr5 (10-136)||(108634-108760)
chr5 (35-136)||(16105967-16106066)
chr5 (63-136)||(25005137-25005210)
chr5 (27-136)||(21651018-21651129)
chr5 (65-136)||(7529228-7529299)
chr5 (235-345)||(23981557-23981666)
chr5 (33-136)||(21205249-21205352)
chr5 (62-136)||(9730236-9730310)
chr5 (63-136)||(11343008-11343081)
chr5 (62-137)||(17909822-17909897)
[»] chr6 (38 HSPs)
chr6 (17-371)||(1556077-1556430)
chr6 (9-371)||(29665945-29666307)
chr6 (15-361)||(16231974-16232317)
chr6 (15-371)||(19610090-19610445)
chr6 (15-361)||(23977851-23978196)
chr6 (14-361)||(18086653-18086997)
chr6 (62-361)||(13620669-13620968)
chr6 (63-369)||(22225614-22225920)
chr6 (63-369)||(16376249-16376555)
chr6 (63-369)||(16383573-16383879)
chr6 (63-369)||(10488773-10489079)
chr6 (63-369)||(16556015-16556321)
chr6 (63-369)||(16632571-16632877)
chr6 (63-305)||(19299375-19299617)
chr6 (9-267)||(1657566-1657836)
chr6 (9-306)||(15862609-15862916)
chr6 (63-268)||(22251442-22251647)
chr6 (9-329)||(1649928-1650242)
chr6 (49-345)||(35009297-35009604)
chr6 (15-308)||(29869607-29869896)
chr6 (49-264)||(27751603-27751829)
chr6 (49-342)||(23153548-23153841)
chr6 (63-273)||(27653856-27654065)
chr6 (15-136)||(23995247-23995368)
chr6 (126-242)||(16825688-16825803)
chr6 (183-306)||(14626122-14626243)
chr6 (15-273)||(25175733-25175988)
chr6 (8-136)||(4991396-4991524)
chr6 (260-371)||(27740910-27741021)
chr6 (49-136)||(23148303-23148390)
chr6 (62-136)||(32276617-32276691)
chr6 (62-136)||(18823241-18823315)
chr6 (62-136)||(18839096-18839170)
chr6 (62-134)||(15742078-15742150)
chr6 (33-136)||(26090059-26090163)
chr6 (62-137)||(16299844-16299919)
chr6 (9-76)||(16240401-16240468)
chr6 (62-136)||(18002353-18002427)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (17-371)||(10170-10523)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (9-369)||(33980-34340)
scaffold0012 (58-342)||(247320-247604)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (15-371)||(12728464-12728819)
chr2 (15-371)||(34824547-34824902)
chr2 (15-361)||(8943928-8944273)
chr2 (15-361)||(12635697-12636042)
chr2 (15-361)||(12641471-12641816)
chr2 (9-371)||(16935665-16936027)
chr2 (9-371)||(17006325-17006687)
chr2 (15-361)||(3798432-3798777)
chr2 (9-361)||(42177791-42178143)
chr2 (62-371)||(23777920-23778229)
chr2 (63-369)||(11231214-11231520)
chr2 (62-369)||(21141969-21142276)
chr2 (63-369)||(22513061-22513367)
chr2 (63-369)||(24685657-24685963)
chr2 (63-369)||(28775683-28775989)
chr2 (28-345)||(25265227-25265555)
chr2 (15-308)||(23774272-23774563)
chr2 (103-364)||(7507756-7508027)
chr2 (62-308)||(5888505-5888750)
chr2 (49-371)||(24341254-24341580)
chr2 (105-273)||(19886576-19886743)
chr2 (57-342)||(462839-463122)
chr2 (9-273)||(14906261-14906534)
chr2 (9-273)||(23820240-23820513)
chr2 (9-273)||(17396474-17396746)
chr2 (9-273)||(19689222-19689495)
chr2 (9-160)||(20015304-20015453)
chr2 (50-342)||(8891343-8891635)
chr2 (50-371)||(36982310-36982632)
chr2 (15-136)||(21273860-21273980)
chr2 (183-371)||(20627317-20627504)
chr2 (50-136)||(22863235-22863321)
chr2 (9-136)||(25213372-25213499)
chr2 (54-135)||(32466177-32466257)
chr2 (27-136)||(9652717-9652828)
chr2 (62-136)||(33128372-33128446)
chr2 (183-371)||(19794708-19794895)
chr2 (183-273)||(43642961-43643051)
chr2 (62-137)||(28031092-28031167)
chr2 (83-136)||(17204659-17204712)
chr2 (104-136)||(19794629-19794661)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (17-371)||(15759945-15760298)
chr7 (15-361)||(18979852-18980195)
chr7 (15-361)||(13758452-13758797)
chr7 (15-361)||(15927650-15927993)
chr7 (9-371)||(15950614-15950975)
chr7 (9-361)||(14250721-14251072)
chr7 (9-371)||(13321086-13321460)
chr7 (63-369)||(7822802-7823108)
chr7 (63-369)||(7830113-7830419)
chr7 (63-369)||(27101513-27101819)
chr7 (63-369)||(27108861-27109167)
chr7 (63-369)||(27176507-27176813)
chr7 (63-369)||(38783605-38783911)
chr7 (62-362)||(48622541-48622840)
chr7 (15-327)||(13572793-13573099)
chr7 (62-371)||(18253718-18254026)
chr7 (62-371)||(47480902-47481222)
chr7 (33-342)||(16211867-16212175)
chr7 (35-273)||(2437627-2437862)
chr7 (62-308)||(10000245-10000490)
chr7 (92-308)||(16418633-16418848)
chr7 (63-273)||(10989579-10989788)
chr7 (63-371)||(13910897-13911205)
chr7 (9-273)||(7293185-7293458)
chr7 (9-273)||(30261950-30262223)
chr7 (105-329)||(16478879-16479099)
chr7 (9-273)||(15441385-15441658)
chr7 (50-342)||(13036884-13037176)
chr7 (33-339)||(36052768-36053075)
chr7 (9-273)||(11516396-11516668)
chr7 (15-136)||(42056099-42056220)
chr7 (23-160)||(14113823-14113959)
chr7 (33-136)||(25124450-25124554)
chr7 (50-342)||(11580607-11580901)
chr7 (23-179)||(14423474-14423629)
chr7 (74-188)||(15862174-15862288)
chr7 (15-136)||(2189996-2190117)
chr7 (9-273)||(25292160-25292432)
chr7 (33-136)||(15516689-15516793)
chr7 (49-136)||(15709469-15709556)
chr7 (48-136)||(2029244-2029332)
chr7 (49-136)||(36024452-36024540)
chr7 (62-136)||(371417-371491)
chr7 (50-136)||(3049905-3049991)
chr7 (183-342)||(3060067-3060225)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (9-371)||(17145479-17145841)
chr4 (15-361)||(20000805-20001150)
chr4 (9-361)||(7131887-7132239)
chr4 (15-371)||(15287076-15287429)
chr4 (9-371)||(18169042-18169402)
chr4 (15-371)||(15294185-15294538)
chr4 (92-371)||(18248290-18248569)
chr4 (62-371)||(19020558-19020867)
chr4 (62-319)||(22738393-22738650)
chr4 (15-273)||(47357824-47358077)
chr4 (15-308)||(22351895-22352184)
chr4 (227-371)||(8374580-8374724)
chr4 (15-308)||(26339155-26339446)
chr4 (49-371)||(15674954-15675280)
chr4 (126-229)||(8378365-8378468)
chr4 (49-371)||(10104115-10104441)
chr4 (105-371)||(10644291-10644554)
chr4 (9-273)||(26680369-26680642)
chr4 (33-342)||(121990-122298)
chr4 (15-136)||(14952085-14952203)
chr4 (9-273)||(16327747-16328020)
chr4 (229-371)||(40885604-40885745)
chr4 (15-136)||(15272122-15272243)
chr4 (9-160)||(16608920-16609069)
chr4 (15-136)||(15135818-15135939)
chr4 (49-342)||(13246531-13246824)
chr4 (9-273)||(10488731-10489004)
chr4 (9-137)||(14996444-14996572)
chr4 (62-180)||(9795490-9795607)
chr4 (54-135)||(55376444-55376525)
chr4 (229-371)||(31115701-31115842)
chr4 (49-249)||(33240893-33241098)
chr4 (104-273)||(54118168-54118338)
chr4 (49-133)||(31132628-31132712)
chr4 (62-137)||(32460561-32460636)
chr4 (66-136)||(14500074-14500144)
chr4 (63-137)||(40885418-40885492)
chr4 (62-136)||(8045272-8045346)
chr4 (101-141)||(7850309-7850349)
chr4 (66-136)||(16523146-16523216)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (9-361)||(13720750-13721102)
chr8 (9-371)||(16195302-16195665)
chr8 (20-371)||(22006092-22006442)
chr8 (9-371)||(13662087-13662449)
chr8 (15-361)||(16872880-16873225)
chr8 (63-369)||(271236-271542)
chr8 (63-369)||(644378-644684)
chr8 (63-369)||(830113-830419)
chr8 (63-369)||(22088670-22088976)
chr8 (63-369)||(15319035-15319341)
chr8 (63-369)||(15499404-15499710)
chr8 (17-267)||(17345744-17346005)
chr8 (15-273)||(16674222-16674474)
chr8 (63-342)||(6774133-6774408)
chr8 (93-342)||(24549083-24549328)
chr8 (9-273)||(22907035-22907308)
chr8 (63-371)||(30120794-30121102)
chr8 (33-371)||(43373320-43373659)
chr8 (107-327)||(21844490-21844707)
chr8 (9-273)||(5238256-5238529)
chr8 (9-273)||(24661069-24661342)
chr8 (9-273)||(43685715-43685988)
chr8 (105-327)||(21851881-21852100)
chr8 (37-273)||(24928648-24928885)
chr8 (9-136)||(41506612-41506741)
chr8 (49-135)||(7000465-7000551)
chr8 (33-136)||(24385580-24385684)
chr8 (33-329)||(16193571-16193865)
chr8 (177-339)||(16404973-16405134)
chr8 (62-137)||(21494314-21494389)
chr8 (62-137)||(16038744-16038819)
chr8 (62-136)||(3431134-3431208)
chr8 (62-136)||(22886654-22886728)
chr8 (62-137)||(2545264-2545339)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (9-361)||(1398-1749)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (9-371)||(153829-154191)
scaffold0023 (66-217)||(169788-169938)
scaffold0023 (63-268)||(36268-36472)
scaffold0023 (33-273)||(48767-49007)
scaffold0023 (103-136)||(61121-61154)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (9-361)||(1336-1688)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (10-371)||(46523461-46523820)
chr1 (35-371)||(18059608-18059942)
chr1 (17-306)||(22227947-22228233)
chr1 (17-306)||(22232644-22232930)
chr1 (63-361)||(17148649-17148948)
chr1 (63-369)||(17004712-17005018)
chr1 (63-369)||(38054967-38055273)
chr1 (63-305)||(19962375-19962617)
chr1 (15-308)||(22035583-22035874)
chr1 (15-308)||(7640763-7641054)
chr1 (9-329)||(45051537-45051851)
chr1 (13-273)||(5072215-5072470)
chr1 (9-342)||(2116356-2116683)
chr1 (141-273)||(18601068-18601200)
chr1 (38-342)||(20913131-20913434)
chr1 (33-371)||(20931417-20931754)
chr1 (49-342)||(20893496-20893788)
chr1 (50-273)||(37844320-37844544)
chr1 (50-345)||(20445777-20446073)
chr1 (59-273)||(51452661-51452886)
chr1 (50-345)||(20531542-20531837)
chr1 (63-136)||(15861285-15861358)
chr1 (104-342)||(41394323-41394559)
chr1 (61-118)||(18598849-18598905)
chr1 (241-345)||(22143408-22143511)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (9-371)||(2464-2825)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (9-369)||(7279-7638)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (17-273)||(3892-4147)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (9-371)||(5034-5395)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (23-371)||(55932-56291)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (63-369)||(31383-31689)
scaffold0107 (154-371)||(39718-39935)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (63-369)||(39177-39483)
scaffold0076 (152-305)||(43137-43288)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (9-364)||(3042-3395)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (105-371)||(29234-29500)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (92-362)||(53956-54225)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (9-217)||(10570-10778)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (62-362)||(3495-3799)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (15-308)||(6733-7022)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (192-371)||(1-180)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (15-273)||(205-458)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (35-342)||(20963-21266)
scaffold0139 (35-328)||(13909-14197)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (103-371)||(107819-108086)
scaffold0026 (28-327)||(64365-64663)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (62-345)||(41746-42039)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (83-345)||(13604-13877)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (9-342)||(787-1118)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (63-340)||(8051-8340)
scaffold0162 (23-157)||(12042-12176)
scaffold0162 (27-371)||(26261-26606)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (61-273)||(1176-1386)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (62-344)||(3288-3578)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (33-371)||(3436-3773)
scaffold0266 (33-371)||(1196-1534)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (92-308)||(7345-7560)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (15-308)||(23580-23869)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (62-342)||(9223-9499)
scaffold0215 (62-342)||(16121-16397)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (28-273)||(5915-6158)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (105-342)||(13242-13475)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (49-371)||(8921-9247)
scaffold0025 (33-136)||(146906-147010)
scaffold0025 (183-371)||(148793-148980)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (9-273)||(22709-22982)
scaffold0141 (9-273)||(26964-27237)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (33-266)||(12289-12523)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (9-273)||(5698-5970)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (9-273)||(36887-37160)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (33-371)||(8950-9287)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (15-136)||(13196-13317)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (9-273)||(1404-1676)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (63-371)||(31548-31856)
scaffold0008 (33-273)||(128023-128263)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (62-364)||(34331-34644)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (15-136)||(57303-57424)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (49-273)||(89323-89548)
scaffold0028 (49-136)||(107653-107740)
scaffold0028 (35-136)||(130880-130979)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (50-345)||(51054-51347)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (30-342)||(123011-123326)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (57-342)||(41830-42113)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (62-180)||(13225-13342)
scaffold0032 (9-136)||(107980-108107)
scaffold0032 (49-136)||(55904-55991)
scaffold0032 (235-345)||(104664-104773)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (183-371)||(19278-19465)
scaffold0195 (183-371)||(21362-21549)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (33-273)||(172074-172314)
scaffold0001 (33-273)||(177777-178017)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (55-135)||(25532-25612)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (15-118)||(154262-154362)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (92-209)||(12032-12149)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (33-343)||(36762-37076)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (49-135)||(339-425)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (183-371)||(48259-48446)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (33-136)||(6371-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (27-136)||(799-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (27-136)||(9803-9914)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (183-273)||(538-628)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (62-136)||(34266-34340)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (33-136)||(193325-193429)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (62-137)||(5548-5623)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (62-136)||(4304-4378)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (62-136)||(18026-18100)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (35-136)||(17142-17241)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (27-136)||(17225-17336)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (33-136)||(272330-272434)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (62-137)||(49710-49785)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (62-136)||(5434-5508)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (33-136)||(12346-12450)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (62-137)||(95297-95372)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (183-371)||(5065-5252)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (62-137)||(9370-9445)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (235-364)||(22463-22591)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (62-138)||(7053-7129)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (195-341)||(8111-8257)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 54651891 - 54651454
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54651891 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 54651792  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54651791 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 54651692  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54651691 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 54651592  T
Q  309 atactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattgactattttgataaaactgtttgctcccttttttaattt 408  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54651591 atactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattgactattttgataaaactgtttgctcccttttttaattt 54651492  T
Q  409 atttcataatttttcattaatatgttagagtagacatt 446  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54651491 atttcataatttttctttaatatgttagagtagacatt 54651454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 371
Target Start/End: Original strand, 12264641 - 12264977
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  12264641 agcttgaggaatcaatttggggtgacct-aggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 12264739  T
Q  135 atgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12264740 atgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 12264839  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggt-aaattttgatat 333  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  12264840 aattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattgatgaaattttgatat 12264939  T
Q  334 gttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12264940 gttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 12264977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25059164 - 25058811
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||    
T  25059164 aagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaaggggg 25059066  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25059065 ttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 25058966  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  25058965 gctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaa 25058866  T
Q  317 ttggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25058865 ttgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 25058811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18911427 - 18911075
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  18911427 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaag 18911329  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18911328 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 18911229  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911228 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 18911129  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  18911128 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 18911075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 15468162 - 15468524
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || || |||    
T  15468162 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaag 15468260  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15468261 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctct 15468360  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15468361 tgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaat 15468460  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15468461 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 15468524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22275641 - 22275281
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    |||||||| | || |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||    
T  22275641 gagaagaacaaggatttgaagggaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaatt 22275344  T
Q  309 atactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22275343 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 22275281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5228734 - 5228385
Alignment:
Q  20 ggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggttt 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  5228734 ggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggtta 5228636  T
Q  120 gtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgct 219  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5228635 gttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtt 5228537  T
Q  220 attttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattg 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5228536 atttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatgagattatacttaattg 5228437  T
Q  320 gtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     | || ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5228436 atgaaatttgatatgttttgattgaaatgaggtgtaattcatattccattga 5228385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Original strand, 12901965 - 12902274
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12901965 ttaggagttaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 12902064  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  12902065 tgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 12902164  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  12902165 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgattaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcat 12902264  T
Q  362 gttccattga 371  Q
     |||||||||    
T  12902265 attccattga 12902274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 66 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49232813 - 49232508
Alignment:
Q  66 gagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgta 165  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  49232813 gagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgta 49232714  T
Q  166 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaa 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||    
T  49232713 tgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaa 49232614  T
Q  266 attgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttc 365  Q
    ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||    
T  49232613 attacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattc 49232514  T
Q  366 cattga 371  Q
    ||||||    
T  49232513 cattga 49232508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 11985999 - 11986358
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  11985999 tttggagagaagagtttgaagaatcaaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtc 11986098  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc--atgttgtatgaaaatgggttgat--ga--------ataattgttgctaaattcgtgctcttgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||  ||        |||||||||| ||||||||||||||  |    
T  11986099 ttcatcataatcatgttcaattattgcaacttctcctttgttgtatg-aaatgggttgattggaatgaattgataattgttgttaaattcgtgctctaac 11986197  T
Q  211 tgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattat 310  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  11986198 tgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgtcaagttatgaaattgt 11986297  T
Q  311 actcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     ||||| | || ||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  11986298 gctcaaatagtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattga 11986358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 92 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44229336 - 44229059
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaataattgt 190  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  44229336 ttaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattga 44229238  T
Q  191 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataa 290  Q
    || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  44229237 tgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataa 44229138  T
Q  291 atgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 369  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44229137 atgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 44229059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 1467615 - 1467921
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1467615 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 1467714  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  1467715 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1467814  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  1467815 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 1467914  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  1467915 ttccatt 1467921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Original strand, 18896875 - 18897130
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  18896875 aagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaaggggg 18896973  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18896974 ttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgat 18897073  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| |||| ||||    
T  18897074 gctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12812221 - 12811948
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | |  |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  12812221 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatatt 12812122  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  12812121 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 12812022  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgtt 336  Q
    | |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | || |||||||||||    
T  12812021 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaatttatgcttaattgatgaaatttgatatgtt 12811948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 14842392 - 14842752
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  14842392 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgagggatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaag 14842490  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgct 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   ||||||| |||||  |||||||||| || || | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842491 gtaagggggttagtctttatcataatcatcttca--ctttgcaaattctcaaatgttgtatg-aattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 14842587  T
Q  206 cttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-a 304  Q
    |   |||||||| ||| ||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||||| ||||||||| |    
T  14842588 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttatgaa 14842685  T
Q  305 aattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  14842686 aattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 14842752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 371
Target Start/End: Original strand, 15936551 - 15936818
Alignment:
Q  103 ctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgt 202  Q
    |||||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15936551 ctaaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 15936650  T
Q  203 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttat 302  Q
    ||||   |||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| | |||| ||||| |||||| |    
T  15936651 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgt 15936748  T
Q  303 g-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  15936749 gaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 15936818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15615262 - 15614935
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  15615262 gagaagataagggttt-ggagagaataacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaagg 15615165  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||    
T  15615164 taagggggttagtctttatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctctt 15615068  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-at 307  Q
     ||||| || ||| ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| |||| ||    
T  15615067 actgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaatat 15614970  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
      | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  15614969 ggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 15614935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Original strand, 15938352 - 15938660
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || |||||   |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15938352 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcatagcctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 15938451  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   |||| ||| ||| ||  |   ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15938452 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 15938551  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
    ||||||| |||| | |||| | |||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| | ||||     
T  15938552 tgaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattct 15938649  T
Q  361 tgttccattga 371  Q
    ||||| |||||    
T  15938650 tgttcaattga 15938660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16821560 - 16821211
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||    
T  16821560 aagggttttgaagggaataacttgaagaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttcaaaggtaaggggg 16821463  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||| |||||||||||||||||    
T  16821462 ttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctcttgctgtgat 16821366  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatga-aattatactca 315  Q
    | ||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||| |||||  ||| | || |    
T  16821365 gttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaa 16821268  T
Q  316 attggtaaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| ||||| |  || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  16821267 attggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattga 16821211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 55316634 - 55316389
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||   || ||||||||| || || ||||||| |||||| ||     
T  55316634 tttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagtt 55316538  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatt 222  Q
     | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  55316537 attatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatg 55316440  T
Q  223 ttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  55316439 tttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 55316389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41270485 - 41270245
Alignment:
Q  28 agagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcat 127  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||   || ||||||||| || || |||||||||||||| ||  | ||    
T  41270485 agagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattat 41270389  T
Q  128 cataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttctt 227  Q
    || ||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  41270388 cacaatcatgt--aatttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgt 41270291  T
Q  228 gtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
     |||||||||||||| || ||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  41270290 atgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatg 41270245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13839286 - 13839063
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||  || ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||     
T  13839286 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtagggattactcttcatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtga 13839187  T
Q  150 aattt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataatt 248  Q
    ||||| |  ||||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  13839186 aattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 13839088  T
Q  249 gcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    | |||||||  ||||||||| ||||    
T  13839087 gtatgattgatggtgaaattacatg 13839063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23492823 - 23492696
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23492823 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaatttggg-taagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaag 23492725  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23492724 gtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2050219 - 2049911
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2050219 agagcttgaagaatcaagattggagtgagtttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 2050120  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| || ||||||  ||||||||| ||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| | ||| ||  | |||    
T  2050119 atcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgc 2050021  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttga 330  Q
     ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| | ||| ||| || || ||||| | |||||||||| |||||||     
T  2050020 ctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaacatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 2049923  T
Q  331 tatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||||    
T  2049922 taagttgttgtt 2049911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 13954711 - 13954983
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  13954711 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-tgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 13954808  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  13954809 taagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttgaaaggaatgaatggataattgttgctaa 13954907  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  13954908 attcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatg 13954983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 12030019 - 12030309
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||  || | |||||||||||  ||| ||| ||     
T  12030019 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtga 12030118  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 249  Q
    ||||||  |||||||||||   | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  12030119 aatttcaaatgttgtatgacttttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 12030217  T
Q  250 catgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa-ttatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
     | |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| || || |||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  12030218 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaagtgataagttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 12030309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 45861247 - 45860975
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  45861247 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-tgagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 45861150  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  45861149 taagggggttagtctttaccataatcatattcattctttgcaatttttcatgaattgtatg-aaatgggttgaaaggaatgaatggataattgttgctaa 45861051  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  45861050 attcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatg 45860975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 53771486 - 53771365
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  53771486 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 53771387  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  53771386 ggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 2449060 - 2449332
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |  |||  |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  2449060 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccatt--gggaaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 2449156  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  2449157 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 2449255  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  2449256 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 2449332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16261898 - 16261777
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |||||| | ||||||||||||||    
T  16261898 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttggaattaatctttatctaaggtaaggg 16261799  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  16261798 ggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268561 - 8268683
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaa-tcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8268561 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagg 8268659  T
Q  114 gggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||    
T  8268660 gggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275661 - 8275783
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaa-tcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8275661 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagg 8275759  T
Q  114 gggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||| ||  | ||||||||||||    
T  8275760 gggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 17912326 - 17912576
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaaa-ttggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||   || | || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17912326 agagcttgaagaatcaaggttggagtgagcttaggagctaaattgaagcctgaggtgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 17912425  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcat--gttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgct 219  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| |    
T  17912426 atcatgttcatttattgcaattt-tcattatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgat 17912522  T
Q  220 attttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    || ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17912523 atgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 17912576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 15859028 - 15859215
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  15859028 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 15859125  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||    
T  15859126 atgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattga 15859215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Original strand, 51158022 - 51158180
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  51158022 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 51158119  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  51158120 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 51158180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14285363 - 14285289
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285363 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 38168323 - 38168237
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38168323 attggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 30153369 - 30153265
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||   ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  30153369 agagcttgaagaatcaagattggggtgagcttaggagctaaagagaagtctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtttttatcata 30153270  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  30153269 atcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33342315 - 33342204
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  33342315 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagagggttagtctt 33342216  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  33342215 tatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Original strand, 51961010 - 51961063
Alignment:
Q  83 aagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51961010 aagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 19260677 - 19260781
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||| ||||||||   ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  19260677 agagcttgaagaatcaagattggagtgagattaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 19260776  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  19260777 atcat 19260781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 19947100 - 19947026
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19947100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 11477053 - 11477128
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11477053 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 11477128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 16933827 - 16933901
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16933827 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 371
Target Start/End: Original strand, 18897138 - 18897183
Alignment:
Q  326 tttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18897138 tttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 18897183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Original strand, 15857163 - 15857195
Alignment:
Q  104 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15857163 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15857195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 58 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 54802 - 54488
Alignment:
Q  58 gagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54802 gagcttaggagcttaattgaagcttaagtttggattaaccattatctaaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 54703  T
Q  158 at-gttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgatt 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54702 attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgatt 54603  T
Q  257 gtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaa 356  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54602 gtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtga 54503  T
Q  357 ttcatgttccattga 371  Q
    |||||||||||||||    
T  54502 ttcatgttccattga 54488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 58 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45416 - 45102
Alignment:
Q  58 gagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45416 gagcttaggagcttaattgaagcctaagtttggattaaccattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctc 45317  T
Q  158 at-gttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgatt 256  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45316 attgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgcccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgatt 45217  T
Q  257 gtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaa 356  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45216 gtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttgaaattgtactcaattggtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtga 45117  T
Q  357 ttcatgttccattga 371  Q
    |||||||||||||||    
T  45116 ttcatgttccattga 45102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 35790927 - 35791283
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35790927 aaaaaggttttggagagaagagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 35791025  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35791026 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 35791125  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35791126 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagattatactt 35791225  T
Q  315 aattggt-aaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35791226 aattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 35791283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23514995 - 23514643
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  23514995 gagaagaacaagggttttgaagagaataacttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaag 23514897  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23514896 gtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 23514797  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23514796 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 23514697  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  23514696 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 23514643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 11211886 - 11212249
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaa-ttggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaa 106  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  11211886 gagaagaacaagggttttgaagggaatagcttgaagaatcaaaattggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaa 11211984  T
Q  107 ggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctc 206  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11211985 ggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctc 11212084  T
Q  207 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11212085 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatgaaa 11212184  T
Q  307 ttatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11212185 ttatactcaagtagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 11212249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 1219349 - 1219704
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1219349 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 1219447  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1219448 ggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 1219547  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1219548 atgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgctt 1219647  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  1219648 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatatttcattga 1219704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7425749 - 7425396
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7425749 aaaagggttttggaaagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 7425653  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7425652 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtg 7425553  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7425552 atgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 7425453  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7425452 cattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 7425396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 17471412 - 17471772
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    |||||||| | || |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||    
T  17471412 gagaagaacaaggatttgaagggaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatgaaatt 17471709  T
Q  309 atactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17471710 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattga 17471772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 361
Target Start/End: Original strand, 10777846 - 10778144
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  |||  || |||||||| || |||||||||||| | ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10777846 taggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10777945  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  10777946 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 10778045  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  10778046 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 10778144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32951138 - 32950765
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||  |||||||| || |||||    
T  32951138 gagaagataagggttt-ggagagaagagcttgaagaatcaaattggggtaagcttaggagctaaattgaagtctaagtttgaattaatcattatttaagg 32951040  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat--gttgtatgaaaatgggttgat------gaat----aattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||      ||||    |||||||| |||    
T  32951039 taagggggttagtcttcatcataaccatgttcaattattgcaacttctcctttgttgtatgaaa-tgggttgattggaatgaattgataattgttgttaa 32950941  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgt-t 295  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| ||      
T  32950940 attcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggtca 32950841  T
Q  296 aagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32950840 aagttatgaaattgtgctcaaatggtgaattttactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattga 32950765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 21932257 - 21932563
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21932257 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 21932356  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  21932357 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 21932456  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  21932457 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 21932556  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  21932557 ttccatt 21932563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 21938427 - 21938733
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  21938427 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 21938526  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  21938527 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 21938626  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  21938627 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 21938726  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  21938727 ttccatt 21938733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35582416 - 35582110
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  35582416 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 35582317  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  35582316 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 35582217  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  35582216 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 35582117  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  35582116 ttccatt 35582110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 36989646 - 36989952
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36989646 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgtt 36989745  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  36989746 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 36989845  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  36989846 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 36989945  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  36989946 ttccatt 36989952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 22882960 - 22883266
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||| | || ||| |||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22882960 taggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagataagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 22883059  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || ||| |    
T  22883060 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggat 22883159  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  22883160 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 22883259  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  22883260 ttccatt 22883266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27010264 - 27009958
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27010264 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 27010168  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  27010167 ggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 27010070  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatact 313  Q
    ||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| |||| |   || |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  27010069 atgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtt--taaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtact 27009972  T
Q  314 caattggtaaattt 327  Q
    |||||||| |||||    
T  27009971 caattggtgaattt 27009958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23328984 - 23328693
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23328984 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 23328886  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  23328885 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 23328786  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23328785 ttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23328693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24616588 - 24616297
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24616588 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 24616490  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  24616489 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 24616390  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | ||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24616389 ttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24616297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24712964 - 24712673
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24712964 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 24712866  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  24712865 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 24712766  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | ||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24712765 ttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24712673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24745982 - 24745691
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  24745982 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 24745884  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  24745883 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 24745784  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | ||||||||| || || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24745783 ttgct-gtttcttatacttgaattgataattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 24745691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 371
Target Start/End: Original strand, 4199858 - 4200165
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| |   | |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  4199858 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgtt 4199956  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  4199957 gtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 4200056  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
    |||||| |||| | || | |||| | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |  ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  4200057 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattca 4200154  T
Q  361 tgttccattga 371  Q
    ||||| |||||    
T  4200155 tgttcaattga 4200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19500278 - 19500069
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  19500278 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 19500180  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| |||    
T  19500179 gtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 19500080  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  19500079 gaaattacatg 19500069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Original strand, 29188159 - 29188434
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | || ||||||||||   | ||||||| |||||||||||    
T  29188159 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattattataatcatgt---aattttgcattttctcatgtt 29188255  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29188256 gtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 29188355  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||  | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  29188356 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 29188434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Original strand, 18530933 - 18531258
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaat-tttt 147  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||   ||||    
T  18530933 aattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcatttt 18531032  T
Q  148 gcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgat-gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgat 244  Q
    ||||||| |||  ||| |||||||  |    | || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||    
T  18531033 gcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 18531132  T
Q  245 aattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttg 343  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  18531133 aattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttg 18531230  T
Q  344 aaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || |||||| | |||||||||| |||||    
T  18531231 aattgagatatgattcatgttcaattga 18531258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25426965 - 25426798
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  25426965 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 25426867  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  25426866 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 25426798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Original strand, 18777865 - 18778074
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||| | | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  18777865 taggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 18777963  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| |||    
T  18777964 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 18778063  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  18778064 gaaattacatg 18778074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Original strand, 22366354 - 22366563
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||| | |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  22366354 taggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 22366452  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| |||    
T  22366453 gtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 22366552  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  22366553 gaaattacatg 22366563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12544
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 12613  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  12612 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 12544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 371
Target Start/End: Original strand, 22053705 - 22054024
Alignment:
Q  56 gtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttttgcaatt 153  Q
    ||||||||||||||| || |||||   |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||    
T  22053705 gtgagcttaggagctaaagtgaagtctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatt 22053804  T
Q  154 tctca--tgttgtatgaaaatgggttgat-gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgc 250  Q
    | |||  ||| |||||||  |    | || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | || |||||||||||||| |||     
T  22053805 tttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgt 22053904  T
Q  251 atgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatga 349  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||    
T  22053905 atgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattga 22054002  T
Q  350 gatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | |||||||||| |||||    
T  22054003 gatatgattcatgttcaattga 22054024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20623411 - 20623138
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  20623411 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 20623314  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  20623313 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 20623215  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  20623214 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 20623138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 21233349 - 21233622
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  21233349 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 21233446  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  21233447 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 21233545  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  21233546 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 21233622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23507347 - 23507037
Alignment:
Q  59 agcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca 158  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || ||| |   |||||  |    
T  23507347 agcttaggagttaaagtgaagcataagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaa 23507248  T
Q  159 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgt 258  Q
    |||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23507247 tgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgt 23507149  T
Q  259 gggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaat 357  Q
     ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| | ||    
T  23507148 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgat 23507051  T
Q  358 tcatgttccattga 371  Q
    || ||||| |||||    
T  23507050 tcttgttcaattga 23507037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Original strand, 21073510 - 21073677
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgc 21073608  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  21073609 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 21073677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37053186 - 37052913
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  37053186 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 37053089  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| | ||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  37053088 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-agatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 37052990  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  37052989 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 37052913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 92 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 34939639 - 34939452
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------a 179  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||          |    
T  34939639 ttaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaa 34939540  T
Q  180 tgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaat 267  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34939539 tggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaat 34939452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 268
Target Start/End: Original strand, 25900227 - 25900495
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||| ||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  25900227 gagaagataagggttt-ggagagaaggacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 25900324  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg--atga--------ataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||  ||||        ||||||||||||||    
T  25900325 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaacggataattgttgctaa 25900423  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaatt 268  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  25900424 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaatt 25900495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Original strand, 43443270 - 43443477
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||   |||  ||||||||||    
T  43443270 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt---gcatattctcatgtt 43443366  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  43443367 atatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 43443466  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  43443467 gaaattacatg 43443477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16536639 - 16536366
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||     
T  16536639 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaga 16536542  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  16536541 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 16536443  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  16536442 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatg 16536366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 2032262 - 2032135
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaa 106  Q
    |||||||||| || || | |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  2032262 gagaagaaaaagggttagaagaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaa 2032163  T
Q  107 ggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||    
T  2032162 ggtaagggggttagttttcatcataatc 2032135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Original strand, 27182416 - 27182709
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |     
T  27182416 aattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgta 27182515  T
Q  149 caatttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataat 247  Q
     | ||||  ||||||||||||   | |  | ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | |||||||| ||||||||||    
T  27182516 aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataat 27182615  T
Q  248 tgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||| | ||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  27182616 tgtatgattgttgatgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 27182709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 154
Target Start/End: Original strand, 23981350 - 23981455
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| || |||    
T  23981350 aattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcttcatcttaggtaagggggttagtcttcatcaaaatcataatcacttattg 23981449  T
Q  149 caattt 154  Q
    ||||||    
T  23981450 caattt 23981455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 108634 - 108760
Alignment:
Q  10 agaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggt 109  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||  |  |||||||||||||| | || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||    
T  108634 agaaaaaaggggttttggagagaagagctcgaggaatcaagatttggtgagcttaggaggtaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggt 108733  T
Q  110 aagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  108734 aagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106066 - 16105967
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16106066 agcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 16105969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25005210 - 25005137
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25005210 taggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 25005137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21651129 - 21651018
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  | ||    
T  21651129 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttaatatt 21651030  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  21651029 tatcataatcat 21651018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 7529299 - 7529228
Alignment:
Q  65 ggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7529299 ggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcat 7529228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 23981557 - 23981666
Alignment:
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattgg-taaattttgatat 333  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||| ||||||    
T  23981557 aattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgtt-caaagtatgtataaatgttaacttatg-aattatgctcaaatggttgaattatgatat 23981654  T
Q  334 gttgttgttgaa 345  Q
    ||||||||||||    
T  23981655 gttgttgttgaa 23981666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 21205352 - 21205249
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||| ||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  21205352 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaagataa-gggattagtctttatcata 21205254  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  21205253 atcat 21205249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 9730236 - 9730310
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9730236 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343081 - 11343008
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||    
T  11343081 taggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 17909897 - 17909822
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17909897 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatg 17909822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 38)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1556430 - 1556077
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1556430 aagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaaggggg 1556332  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1556331 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 1556232  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1556231 gctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaa 1556132  T
Q  317 ttggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1556131 ttgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattga 1556077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29666307 - 29665945
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||||      
T  29666307 gagaagataagggttt-ggagagaagagcttgaagaatcaaattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatcattatctaaca 29666209  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
     ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatgaaat 29666009  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  29666008 tgtactcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattga 29665945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16232317 - 16231974
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16232317 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 16232221  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232220 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 16232121  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16232120 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 16232021  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  16232020 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 16231974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19610445 - 19610090
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19610445 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 19610347  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19610346 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtg 19610247  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  19610246 atgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttataaaattatactt 19610147  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19610146 cattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtagttcatattccattga 19610090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23978196 - 23977851
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23978196 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 23978098  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
     ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  23978097 cgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 23977998  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23977997 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 23977898  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  23977897 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 23977851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 361
Target Start/End: Original strand, 18086653 - 18086997
Alignment:
Q  14 gaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  18086653 gaaaagggttttggagagaagagctttagaaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagg 18086749  T
Q  114 gggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 213  Q
    ||||| ||  | |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18086750 gggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgt 18086849  T
Q  214 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatact 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18086850 gatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatact 18086949  T
Q  314 caattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
     ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  18086950 taattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 18086997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 62 - 361
Target Start/End: Original strand, 13620669 - 13620968
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||   ||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13620669 ttaggagctaaagtgaagcctgagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 13620768  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  13620769 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 13620868  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  13620869 tgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 13620968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 22225614 - 22225920
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22225614 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 22225713  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||    
T  22225714 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22225813  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||     
T  22225814 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgaaatgttttgattgaaatgagatgtgattcata 22225913  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  22225914 ttccatt 22225920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 16376249 - 16376555
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16376249 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 16376348  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  16376349 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16376448  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  16376449 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16376548  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  16376549 ttccatt 16376555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 16383573 - 16383879
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16383573 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 16383672  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  16383673 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16383772  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  16383773 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16383872  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  16383873 ttccatt 16383879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 10489079 - 10488773
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  10489079 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 10488980  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  10488979 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 10488880  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  10488879 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 10488780  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  10488779 ttccatt 10488773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 16556015 - 16556321
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16556015 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 16556114  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  16556115 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16556214  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  16556215 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16556314  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  16556315 ttccatt 16556321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 16632571 - 16632877
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16632571 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 16632670  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  16632671 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 16632770  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  16632771 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 16632870  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  16632871 ttccatt 16632877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 19299617 - 19299375
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  19299617 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 19299518  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  19299517 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 19299418  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 305  Q
    | |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19299417 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19299375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 1657566 - 1657836
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  1657566 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaag 1657664  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgcta 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| |||||||||||||    
T  1657665 gtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgcta 1657764  T
Q  196 aattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaat 267  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1657765 aattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaat 1657836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15862916 - 15862609
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  15862916 gagaagaacaagagttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggaggtgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaag 15862818  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgcta 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| ||||||||| |||    
T  15862817 gtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttacta 15862718  T
Q  196 aattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgtt 295  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |   || |||||||||||||     
T  15862717 aattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgtt--caattatgtataaatgtg 15862620  T
Q  296 aagttatgaaa 306  Q
    |||||||||||    
T  15862619 aagttatgaaa 15862609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Original strand, 22251442 - 22251647
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22251442 taggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 22251541  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || |||||    
T  22251542 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22251641  T
Q  263 gaaatt 268  Q
    ||||||    
T  22251642 gaaatt 22251647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Original strand, 1649928 - 1650242
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  1649928 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaagg 1650025  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  1650026 taagggggttagtctttatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctctt 1650122  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaat 307  Q
     |||||||| ||  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| ||||||  |||| |||||| || ||||    
T  1650123 actgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaagaatgataagttgtgaaaat 1650220  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttg 329  Q
    | | |||||||||| |||||||    
T  1650221 tgtgctcaattggtgaattttg 1650242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 345
Target Start/End: Original strand, 35009297 - 35009604
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||||||||   || ||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  35009297 aattggggtgaatctaagagctaaagtgaagccaaagtttggattaatcattatctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattg 35009396  T
Q  149 caatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa 236  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||  | ||||||||    
T  35009397 caatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaagaaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaa 35009496  T
Q  237 ttgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgt 335  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  35009497 ttgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgt 35009594  T
Q  336 tgttgttgaa 345  Q
    ||||||||||    
T  35009595 tgttgttgaa 35009604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 29869607 - 29869896
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  29869607 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaaggg 29869703  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  || || |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  29869704 ggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 29869803  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  29869804 ttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataagtgtcaagttgtgaaatt 29869896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27751829 - 27751603
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  27751829 aattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattg 27751730  T
Q  149 caatttctcatgt-tgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 237  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||          ||| |||| ||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  27751729 caatttctcatttgtgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 27751630  T
Q  238 tgatgataattgcatgattgtgggtga 264  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  27751629 tgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23153841 - 23153548
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |     
T  23153841 aattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgta 23153742  T
Q  149 caatttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataat 247  Q
     | ||||  ||||||||||||   | |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  23153741 aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 23153642  T
Q  248 tgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  23153641 tgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 23153548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Original strand, 27653856 - 27654065
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || ||||| |||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  27653856 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgtt 27653954  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| |||  |  | |||||||||||||| || ||| || ||||| |||    
T  27653955 gtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 27654054  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  27654055 gaaattacatg 27654065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23995368 - 23995247
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  23995368 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 23995269  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  23995268 ggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 242
Target Start/End: Original strand, 16825688 - 16825803
Alignment:
Q  126 atcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 225  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||     
T  16825688 atcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgttt 16825786  T
Q  226 ttgtgcatgaattgatg 242  Q
     | ||||||||||||||    
T  16825787 gtatgcatgaattgatg 16825803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 306
Target Start/End: Original strand, 14626122 - 14626243
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  14626122 ataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 14626219  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatgaaa 306  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14626220 atgtaaaaatgataagttatgaaa 14626243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25175988 - 25175733
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgg-gttaatcatcatctaaggtaagg 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||| |  ||||||   |||||||| |||||||||||  | || | | |||||| | || |||||||||    
T  25175988 aaaagggttttgtagagaagagctttcggaatcaagt--gggtgac--taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagg 25175893  T
Q  114 gggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaattt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctg 212  Q
    ||||| ||  | | |||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25175892 gggttagtgattaccataatcatgtataatttt-gcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 25175794  T
Q  213 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    || || ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  25175793 tgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 25175733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991524 - 4991396
Alignment:
Q  8 tgagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggt-taatcatcatcta 105  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||| || |    
T  4991524 tgagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaat--aattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaa 4991427  T
Q  106 aggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4991426 aggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 260 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740910
Alignment:
Q  260 ggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattc 359  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| || || ||||||||| |||||| | ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagtcgttgttgaattgagatatgattc 27740922  T
Q  360 atgttccattga 371  Q
    |||||| |||||    
T  27740921 atgttcaattga 27740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 23148390 - 23148303
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23148390 aattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 23148303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 32276617 - 32276691
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32276617 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 18823241 - 18823315
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || |||||   |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18823241 ttaggagctaaagtgaagtttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 18839096 - 18839170
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| |||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18839096 ttagaagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 134
Target Start/End: Original strand, 15742078 - 15742150
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15742078 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 26090163 - 26090059
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| || ||||||  |||||| | || | ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26090163 agagcttgaagaatcaagattggagtgaggttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcata 26090064  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  26090063 atcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 16299844 - 16299919
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  16299844 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcttaatcatg 16299919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 16240468 - 16240401
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattg 76  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  16240468 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattg 16240401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 18002353 - 18002427
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || |||||   |||||| | |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18002353 ttaggagctaaagtgaaggctaagtttagattaatcataacctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 10170 - 10523
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10170 aagggttttagagaggaaagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttatgagctaaagtgaagcctaagttggggttaatcatcatctaaggtaaggggg 10268  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10269 tttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 10368  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaa 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  10369 gatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatgaaattatacttaa 10468  T
Q  317 ttggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10469 ttgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 10523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 33980 - 34340
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33980 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggcgtaagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaag 34078  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat-gttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34079 gtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtgctc 34177  T
Q  207 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 306  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34178 ttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaag 34277  T
Q  307 ttatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 369  Q
    ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  34278 ttatacttaattgatgaatttggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccatt 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 58 - 342
Target Start/End: Original strand, 247320 - 247604
Alignment:
Q  58 gagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc 157  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||      
T  247320 gagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaa 247419  T
Q  158 atgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgatt 256  Q
    ||||||||||||   | |  | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  247420 atgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgatt 247519  T
Q  257 gtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    | |||||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  247520 gagggtgaaatttcatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgctaagttgttgtt 247604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12728819 - 12728464
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12728819 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 12728721  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728720 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 12728621  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12728620 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattctt 12728521  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12728520 aattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattga 12728464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34824902 - 34824547
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  34824902 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 34824804  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34824803 ggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 34824704  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  34824703 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattctt 34824604  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34824603 aattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtgattcatattccattga 34824547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8944273 - 8943928
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8944273 aaaagggttttggagagtagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 8944175  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8944174 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtg 8944075  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8944074 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 8943975  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  8943974 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 8943928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 12635697 - 12636042
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  12635697 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 12635795  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12635796 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtg 12635895  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12635896 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 12635995  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  12635996 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 12636042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 12641471 - 12641816
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12641471 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcatctaaggtaaggg 12641569  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  12641570 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 12641669  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12641670 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 12641769  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  12641770 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 12641816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16936027 - 16935665
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  16936027 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaag 16935929  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  16935928 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctct 16935829  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16935828 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 16935729  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||  |||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16935728 tatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 16935665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17006687 - 17006325
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||    
T  17006687 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagaaagagtttgggttaatcttcttctaag 17006589  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  17006588 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgctct 17006489  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17006488 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 17006389  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||  |||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  17006388 tatactttattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 17006325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 3798432 - 3798777
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  3798432 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttatgagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 3798530  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  3798531 ggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 3798630  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3798631 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 3798730  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  3798731 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 3798777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 42177791 - 42178143
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  42177791 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaag 42177889  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42177890 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 42177989  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42177990 tgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 42178089  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  42178090 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 42178143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Original strand, 23777920 - 23778229
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  || ||||  || ||||| | ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23777920 ttaggagctaaagtgaagctcaaatttgaattgatcataacctaaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 23778019  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||||||     
T  23778020 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgga 23778119  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  23778120 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgatttgattgaaatgagatgtaattcat 23778219  T
Q  362 gttccattga 371  Q
     |||||||||    
T  23778220 attccattga 23778229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 11231214 - 11231520
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  11231214 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 11231313  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  11231314 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 11231413  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  11231414 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 11231513  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  11231514 ttccatt 11231520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21142276 - 21141969
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg- 160  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||  ||| || |||||||||     
T  21142276 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaaaattttca-tttctcatgg 21142178  T
Q  161 ttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||    
T  21142177 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtgg 21142078  T
Q  261 gtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21142077 atgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaattatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattca 21141978  T
Q  361 tgttccatt 369  Q
    |||||||||    
T  21141977 tgttccatt 21141969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 22513061 - 22513367
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22513061 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 22513160  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  22513161 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 22513260  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  22513261 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 22513360  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  22513361 ttccatt 22513367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 24685657 - 24685963
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  24685657 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 24685756  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  24685757 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 24685856  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||| |||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  24685857 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatgtgttttgattgaaaagagatgtgattcata 24685956  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  24685957 ttccatt 24685963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 28775683 - 28775989
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  28775683 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 28775782  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  28775783 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 28775882  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  28775883 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 28775982  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  28775983 ttccatt 28775989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 345
Target Start/End: Original strand, 25265227 - 25265555
Alignment:
Q  28 agagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcat 127  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25265227 agagaagagcttgaagaatcaaattggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaatgtaagggggttagtcttcat 25265326  T
Q  128 cataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtga 215  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  25265327 cataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttga 25265426  T
Q  216 tgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactc 314  Q
    || ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||    
T  25265427 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctc 25265524  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25265525 aattggtgaattttgctatgttgttgttgaa 25265555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 23774563 - 23774272
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  23774563 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 23774465  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||||||||| |||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  23774464 ggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 23774365  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23774364 ttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23774272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 364
Target Start/End: Original strand, 7507756 - 7508027
Alignment:
Q  103 ctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat--gttgtatgaaaatgggttga----------tgaataattgt 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||          ||||||||| |    
T  7507756 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatgaataattat 7507855  T
Q  191 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataa 290  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaa 7507953  T
Q  291 atgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgtt 364  Q
    ||  ||||||||| ||||| |  ||||||||| ||||| | || ||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  7507954 ataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaatttggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgtt 7508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 62 - 308
Target Start/End: Original strand, 5888505 - 5888750
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||  |||||||||    
T  5888505 ttaggagctaaagtgaagcttaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgt 5888604  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || ||||  || ||| | |||||||||||||| || | ||| ||||||     
T  5888605 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtgga 5888703  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5888704 tgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 5888750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Original strand, 24341254 - 24341580
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  24341254 aattggagtgagcttaggagctaaaatgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttt 24341353  T
Q  147 tgcaatttctc--atgttgtatgaaaatgggttga-tgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 243  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||  |    | | || |||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  24341354 tgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 24341453  T
Q  244 taattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||||||| |||||||||  ||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  24341454 taattgtatgattgttggtgaaattatatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 24341551  T
Q  343 gaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  24341552 gaattgagatatgattcatgttcaattga 24341580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 273
Target Start/End: Original strand, 19886576 - 19886743
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  19886576 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 19886674  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  19886675 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 19886743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 463122 - 462839
Alignment:
Q  57 tgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttct 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||     
T  463122 tgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttca 463023  T
Q  157 catgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgatt 256  Q
     ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  463022 aatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagatt 462924  T
Q  257 gtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    || ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  462923 gttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 462839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 14906261 - 14906534
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  14906261 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 14906358  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  14906359 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 14906457  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  14906458 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 14906534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23820513 - 23820240
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  23820513 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 23820416  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  23820415 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 23820317  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  23820316 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 23820240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 17396474 - 17396746
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  17396474 gagaagataagggttt-gaagagaagaacttgaagaatccaattggg-tgagcttaggagctaaattaaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 17396571  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  17396572 taagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgacatgaatgaatggataattgttgctaa 17396670  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17396671 attcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatg 17396746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 19689222 - 19689495
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  19689222 gagaagataagggtttcg-agagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaagg 19689319  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  19689320 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 19689418  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  19689419 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 19689495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20015453 - 20015304
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   | |||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  20015453 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaaaa-cttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 20015356  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||    
T  20015355 taagggggttagtctttatcatgatcatgttcattctttgcaatttttcatg 20015304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8891635 - 8891343
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |      
T  8891635 attggagtgagcttaggaactaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 8891536  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataatt 248  Q
    | ||||  ||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  8891535 attttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 8891436  T
Q  249 gcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    | |||||||| || |||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  8891435 gtatgattgttggcgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 8891343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 371
Target Start/End: Original strand, 36982310 - 36982632
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||| |  ||| || | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||     
T  36982310 attggagtgagctgaggagctaaattgaagcctaagttggtattagtctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatca-tttttgt 36982408  T
Q  150 aatttctca--tgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataa 246  Q
    || || |||  |||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||    
T  36982409 aaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataa 36982508  T
Q  247 ttgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    ||| | |||||  ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  36982509 ttgtaagattgctggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgccaagttgttgttgaa 36982606  T
Q  346 atgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| | | |||| ||||| |||||    
T  36982607 ttgagttatgattcctgttcaattga 36982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 21273860 - 21273980
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||| ||    
T  21273860 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaa-gg 21273958  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  21273959 ggttagtctttatcataatcat 21273980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 20627317 - 20627504
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  20627317 ataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-tccaaa-t 20627414  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| ||| || || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| |||||| ||||| |||||    
T  20627415 atgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattga 20627504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22863321 - 22863235
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22863321 attggggtgagcttaggagctaaattgcagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22863235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213499 - 25213372
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggt-taatcatcatctaa 106  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||| || ||    
T  25213499 gagaagaacaagggttttgaagagaatagattgaggaat--aattggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaa 25213402  T
Q  107 ggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25213401 ggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32466257 - 32466177
Alignment:
Q  54 gggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32466257 gggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaa-ggggttagtcttcatcataatca 32466177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 9652717 - 9652828
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| |  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9652717 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaaacctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 9652816  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  9652817 tatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33128446 - 33128372
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33128446 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 19794708 - 19794895
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    |||||||| | |||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  19794708 ataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 19794805  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||    
T  19794806 aggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattga 19794895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 43642961 - 43643051
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  43642961 ataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 43643051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 28031092 - 28031167
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28031092 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttgaattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatg 28031167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 83 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 17204712 - 17204659
Alignment:
Q  83 aagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||| |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17204712 aagtttggattaatcataacctaaagtaagggggttagtcttcatcataatcat 17204659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Original strand, 19794629 - 19794661
Alignment:
Q  104 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19794629 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19794661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 371
Target Start/End: Original strand, 15759945 - 15760298
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  15759945 aagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgtgttaatcttcttctaaggtaaggggg 15760043  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15760044 ttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgat 15760143  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15760144 gctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaa 15760243  T
Q  317 ttggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15760244 ttgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattccattga 15760298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 18979852 - 18980195
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18979852 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 18979948  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979949 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 18980048  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18980049 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 18980148  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  18980149 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 18980195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13758797 - 13758452
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13758797 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 13758699  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  13758698 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 13758599  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13758598 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 13758499  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  13758498 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 13758452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15927993 - 15927650
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15927993 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 15927897  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15927896 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtg 15927797  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15927796 atgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 15927697  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  15927696 aattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 15927650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 15950614 - 15950975
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| ||  || ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || |||    
T  15950614 gagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaag 15950711  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15950712 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 15950811  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950812 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 15950911  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15950912 tatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 15950975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 14250721 - 14251072
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||||    
T  14250721 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgagtta-tcttcttctaag 14250818  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14250819 gtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctct 14250918  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14250919 tgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 14251018  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  14251019 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 14251072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13321460 - 13321086
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||  | |||||| |||||||| ||||||||    
T  13321460 gagaagataagggttt-ggagagaagagcttgaagaatcaaattggggtaagcttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattatctaagg 13321362  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttga----------tgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||          || ||||||||||||||    
T  13321361 taagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataagtggataattgttgctaa 13321262  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgtta 296  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |    
T  13321261 attcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtca 13321162  T
Q  297 agttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttg-ttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  13321161 agttatgaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattga 13321086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7823108 - 7822802
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  7823108 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 7823009  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  7823008 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 7822909  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  7822908 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 7822809  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  7822808 ttccatt 7822802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 7830419 - 7830113
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  7830419 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 7830320  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  7830319 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 7830220  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  7830219 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 7830120  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  7830119 ttccatt 7830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 27101513 - 27101819
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27101513 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 27101612  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  27101613 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27101712  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  27101713 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27101812  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  27101813 ttccatt 27101819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 27108861 - 27109167
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27108861 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 27108960  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  27108961 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27109060  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  27109061 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27109160  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  27109161 ttccatt 27109167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27176813 - 27176507
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  27176813 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 27176714  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  27176713 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 27176614  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  27176613 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 27176514  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  27176513 ttccatt 27176507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 38783605 - 38783911
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  38783605 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 38783704  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  38783705 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 38783804  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  38783805 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 38783904  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  38783905 ttccatt 38783911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 362
Target Start/End: Original strand, 48622541 - 48622840
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||    
T  48622541 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgt 48622640  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  48622641 tttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 48622740  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggt-aaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||    
T  48622741 tgaaattacatg-ttcaaagcatgcataattgttaagttgtgaaattataaccaatttgtgaatttttgatgtgttgttg-agaaataagatgtgattca 48622838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13573099 - 13572793
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13573099 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 13573003  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  13573002 ggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 13572905  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatact 313  Q
    ||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  13572904 atgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtt--taaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 13572807  T
Q  314 caattggtaaattt 327  Q
    |||||||| |||||    
T  13572806 caattggtgaattt 13572793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Original strand, 18253718 - 18254026
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  || ||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18253718 ttaggagctaaagtgaagctcaaatttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 18253817  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18253818 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 18253917  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
    ||||||| |||| | |||| | |||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| | ||||     
T  18253918 tgaaattacatg-ttcaaa-tgtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattct 18254015  T
Q  361 tgttccattga 371  Q
    ||||| |||||    
T  18254016 tgttcaattga 18254026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Original strand, 47480902 - 47481222
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--t 159  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  |    
T  47480902 ttaggaggtaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatattcatttattgcaatttctcattt 47481001  T
Q  160 gttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 249  Q
    |||||||||| ||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  47481002 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 47481101  T
Q  250 catgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatg 348  Q
     ||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  47481102 tatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 47481199  T
Q  349 agatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || | | |||| ||||| |||||    
T  47481200 agttatgattcttgttcaattga 47481222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16212175 - 16211867
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16212175 agagtttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcata 16212076  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| || ||||||  ||||||||||||  | | || ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||    
T  16212075 atcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggacaattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgc 16211977  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttga 330  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||     
T  16211976 atgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 16211879  T
Q  331 tatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||||    
T  16211878 taagttgttgtt 16211867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2437862 - 2437627
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  2437862 agcttgaggaatcaa-ttggggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 2437765  T
Q  135 atgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||    
T  2437764 atgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatg 2437666  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  2437665 aattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 2437627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 62 - 308
Target Start/End: Original strand, 10000245 - 10000490
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||    
T  10000245 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgt 10000344  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | || || |  |||||| | |||||||||||||| || | ||| ||||||     
T  10000345 tgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttgttatgttg-ttgtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtgga 10000443  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10000444 tgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 10000490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16418848 - 16418633
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgtt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  16418848 ttaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcat 16418749  T
Q  192 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaa 291  Q
    |  ||||||||||||||| | || ||||  || ||| | |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  16418748 gtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaa 16418650  T
Q  292 tgttaagttatgaaatt 308  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  16418649 tgtcaagttgtgaaatt 16418633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10989788 - 10989579
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| | || |||||| ||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  10989788 taggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcatattctcatgtt 10989690  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  10989689 gtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 10989590  T
Q  263 gaaattgcatg 273  Q
    |||||| ||||    
T  10989589 gaaattacatg 10989579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 371
Target Start/End: Original strand, 13910897 - 13911205
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || ||||||||||||||  |  | |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  13910897 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgtt 13910995  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||    
T  13910996 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggt 13911095  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaattt-tgat-atgttgttgttgaaatgagatgtaattc 359  Q
    |||||| |||| | || | |||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |  | | |||||||||||  |||||||| ||||    
T  13911096 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattc 13911193  T
Q  360 atgttccattga 371  Q
    |||||| |||||    
T  13911194 atgttcaattga 13911205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 7293458 - 7293185
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  7293458 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 7293361  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  7293360 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 7293262  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||| || ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  7293261 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatg 7293185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 30261950 - 30262223
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  30261950 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 30262047  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  30262048 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 30262146  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  30262147 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 30262223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 329
Target Start/End: Original strand, 16478879 - 16479099
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||| |   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || || ||||||||    
T  16478879 aaggtaagggggttagtgattatcataatcattt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgc 16478975  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 303  Q
    |||| ||| |||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  16478976 tcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 16479073  T
Q  304 aaattatactcaattggtaaattttg 329  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||    
T  16479074 aaattgtgctcaattggtgaattttg 16479099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 15441385 - 15441658
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  15441385 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 15441482  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  15441483 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 15441581  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  15441582 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 15441658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 13036884 - 13037176
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| |      
T  13036884 attggagtaagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaa 13036983  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataatt 248  Q
    | ||||  ||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  13036984 attttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 13037083  T
Q  249 gcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    | |||||||| | |||||||||||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13037084 gtatgattgttgatgaaattgcatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 13037176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 36053075 - 36052768
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  36053075 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 36052976  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtg 230  Q
    |||||  ||| ||| || ||||||  ||||||||||||  |  || | ||| |||||||||||||||||  | |||   |||||||| ||  ||  | ||    
T  36052975 atcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttatactccaactgtgatgatacgtttgtatg 36052876  T
Q  231 catgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttg 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  36052875 catgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 36052778  T
Q  330 atatgttgtt 339  Q
     || ||||||    
T  36052777 ctaagttgtt 36052768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11516668 - 11516396
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |  |||  |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  11516668 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccatt--gggaaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 11516572  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  11516571 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 11516473  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  11516472 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 11516396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 42056099 - 42056220
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  42056099 aaaagggttttggagagaagagcttgagtaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 42056198  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  42056199 ggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 160
Target Start/End: Original strand, 14113823 - 14113959
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14113823 tttgaagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtc 14113921  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg 160  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  14113922 tttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 14113959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25124554 - 25124450
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25124554 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagtttagattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcata 25124455  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  25124454 atcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 342
Target Start/End: Original strand, 11580607 - 11580901
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  || |||||||     
T  11580607 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttaatctaaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatc-atttttgt 11580705  T
Q  150 aa--tttctcatgttgtatgaa--aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgata 245  Q
    ||  ||||  ||||||||||||    | |  | ||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||  ||| ||  | |||||||||||||||||    
T  11580706 aaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgata 11580805  T
Q  246 attgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  11580806 attgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 11580901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 179
Target Start/End: Original strand, 14423474 - 14423629
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  14423474 tttgaagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttagaagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtc 14423572  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttga 179  Q
    || |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||    
T  14423573 tt-atcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttga 14423629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15862288 - 15862174
Alignment:
Q  74 ttgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatg 173  Q
    |||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15862288 ttgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatg 15862189  T
Q  174 ggttgatgaataatt 188  Q
    |||||||||| ||||    
T  15862188 ggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 2189996 - 2190117
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| | || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||     
T  2189996 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagttaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggc 2190095  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| || || |||||||||||    
T  2190096 ggttagtttttatcataatcat 2190117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 25292160 - 25292432
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||| ||||| ||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||     
T  25292160 gagaagataagggttt-gaagagaagaacttgaggaatcaatt--gggtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaga 25292256  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||| |  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  25292257 taagggggttagtctttatcataatcaagttcattctttgcaatttttcaagatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 25292355  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||| ||||||   || ||||| ||| ||  | || |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  25292356 atttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatg 25292432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516689 - 15516793
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15516689 agagcttgaagaatcaagattggggtaagtctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcata 15516788  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  15516789 atcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15709556 - 15709469
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  15709556 aattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagaggattagtcttcatcataatcat 15709469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 48 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 2029332 - 2029244
Alignment:
Q  48 aaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  2029332 aaattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttggaattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36024540 - 36024452
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaag-ggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36024540 aattggagtgagcttatgagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcat 36024452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 371491 - 371417
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  371491 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 3049991 - 3049905
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  3049991 attggagtgaacttaagagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3060225 - 3060067
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  3060225 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 3060128  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||||||    
T  3060127 atgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattttgttaagttgttgtt 3060067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 17145479 - 17145841
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| || ||||||    
T  17145479 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagtaagagtttgtgttaatcttcttctaag 17145577  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  17145578 gtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctct 17145677  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17145678 tactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaat 17145777  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17145778 tatactcaattagtgaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 17145841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20001150 - 20000805
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  20001150 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 20001052  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  20001051 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 20000952  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20000951 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 20000852  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  20000851 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 20000805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 7131887 - 7132239
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  7131887 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttggattaatcttcttctaag 7131985  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7131986 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 7132085  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7132086 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 7132185  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  7132186 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 7132239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 15287076 - 15287429
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15287076 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 15287172  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15287173 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtg 15287272  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287273 atgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 15287372  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15287373 cattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 15287429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18169402 - 18169042
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || || |||    
T  18169402 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttc-aag 18169306  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18169305 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 18169206  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18169205 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 18169106  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18169105 tatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 18169042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 371
Target Start/End: Original strand, 15294185 - 15294538
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15294185 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatgaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 15294281  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15294282 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtg 15294381  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294382 atgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatgaaattatactc 15294481  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15294482 cattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 15294538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 92 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18248569 - 18248290
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgtt 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18248569 ttaatcatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgat 18248470  T
Q  192 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaa 291  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18248469 gttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaa 18248370  T
Q  292 tgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18248369 tgttaagatatgaaattatactcaattagtgaattttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 18248290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 62 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19020867 - 19020558
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| |  ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19020867 ttaggagctaaggtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgt 19020768  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  19020767 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 19020668  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | | || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  19020667 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatccttaatggatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcat 19020568  T
Q  362 gttccattga 371  Q
     |||||||||    
T  19020567 attccattga 19020558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 62 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22738650 - 22738393
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  22738650 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaatttttgcattttctcatgt 22738551  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  22738550 tgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 22738451  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattg 319  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  22738450 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtgaaattatgcttaattg 22738393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 47358077 - 47357824
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||    
T  47358077 aaaagggttttggagagaagagcttaaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtt-gggttaatcttcttctaaggtaaggg 47357980  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47357979 ggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 47357883  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||| ||| ||  | |||||| ||||||| || ||| || ||||| ||||||||| ||||    
T  47357882 atgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg 47357824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 22351895 - 22352184
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22351895 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 22351991  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||| |||||||| | ||    
T  22351992 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttgttatg 22352091  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22352092 ttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22352184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8374724 - 8374580
Alignment:
Q  227 tgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaatt 326  Q
    |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8374724 tgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattagtgaatt 8374625  T
Q  327 ttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8374624 ttaatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 8374580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 26339446 - 26339155
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26339446 aaaaggattttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 26339348  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  26339347 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 26339248  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | |||  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26339247 ttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatctatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 26339155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Original strand, 15674954 - 15675280
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  15674954 aattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttt 15675053  T
Q  147 tgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgat-gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 243  Q
    |||||||| |||  ||| |||||||  |    | || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  15675054 tgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 15675153  T
Q  244 taattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  15675154 taattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 15675251  T
Q  343 gaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  15675252 gaattgagatatgattcatgttcaattga 15675280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8378468 - 8378365
Alignment:
Q  126 atcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 225  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8378468 atcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 8378369  T
Q  226 ttgt 229  Q
    ||||    
T  8378368 ttgt 8378365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Original strand, 10104115 - 10104441
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  10104115 aattggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttt 10104214  T
Q  147 tgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgat-gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 243  Q
    | |||||| |||  ||| |||||||  |    | || | |||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  10104215 tacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 10104314  T
Q  244 taattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  10104315 taattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 10104412  T
Q  343 gaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  10104413 gaattgagatatgattcatgttcaattga 10104441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10644554 - 10644291
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  10644554 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 10644458  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10644457 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 10644360  T
Q  305 -aattatactcaattggtaaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
      ||| | || ||||||| ||||| |  || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  10644359 gtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattga 10644291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 26680642 - 26680369
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  26680642 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 26680545  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  |||||||  |||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  26680544 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-gaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 26680446  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  26680445 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 26680369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 122298 - 121990
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||   ||||| || |||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  122298 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaagagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggggattagtctttatcata 122199  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | |||    
T  122198 atcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgc 122100  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttga 330  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||     
T  122099 atgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgc 122002  T
Q  331 tatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||||    
T  122001 taagttgttgtt 121990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952203 - 14952085
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14952203 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 14952107  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  14952106 ggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 16327747 - 16328020
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  16327747 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggcctaatcttcatataagg 16327844  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  16327845 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 16327943  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  16327944 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 16328020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 371
Target Start/End: Original strand, 40885604 - 40885745
Alignment:
Q  229 tgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaatttt 328  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||    
T  40885604 tgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgtt-caaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattatgctcaattggtgaacttt 40885702  T
Q  329 gatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | || ||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  40885703 gctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattga 40885745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 15272122 - 15272243
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  15272122 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 15272221  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  15272222 ggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 16608920 - 16609069
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  16608920 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 16609017  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg 160  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  16609018 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatg 16609069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 15135818 - 15135939
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  15135818 aaaaaggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 15135917  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  15135918 ggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13246824 - 13246531
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |     
T  13246824 aattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgta 13246725  T
Q  149 caatttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataat 247  Q
     | ||||  ||||||||||||   | |  | ||| |||||||||| ||||||||||||    |||||||| ||| ||  | |||||||||| ||||||||    
T  13246724 aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtgctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataat 13246625  T
Q  248 tgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  13246624 tgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 13246531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10489004 - 10488731
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  10489004 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 10488907  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    ||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||| ||||          ||| ||||||||||||||    
T  10488906 taaggtggttggtctttatcttaatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgagttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 10488808  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  10488807 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 10488731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996572 - 14996444
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | ||||    
T  14996572 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagtttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttttaag 14996474  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  14996473 gtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9795607 - 9795490
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9795607 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgt 9795508  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgat 180  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  9795507 tgtatg-aaatgggttgat 9795490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 55376444 - 55376525
Alignment:
Q  54 gggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55376444 gggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttgatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 55376525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31115842 - 31115701
Alignment:
Q  229 tgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattt 327  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |  | |||||| |||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  31115842 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcc--attatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattatgctcaattggtgaattt 31115745  T
Q  328 tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |  || |||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  31115744 tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattga 31115701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33241098 - 33240893
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttt 146  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||  |||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  33241098 aattggagtgagcttaggagttaaagcgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttt 33240999  T
Q  147 tgcaatttctc--atgttgtatgaaaatgggttga-tgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 243  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||  |    | | || ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  33240998 tgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 33240899  T
Q  244 taattg 249  Q
    | ||||    
T  33240898 tgattg 33240893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 104 - 273
Target Start/End: Original strand, 54118168 - 54118338
Alignment:
Q  104 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgt 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||| || | ||||  ||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  54118168 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 54118267  T
Q  203 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  54118268 gctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 54118338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 31132712 - 31132628
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataat 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| || || |||  |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31132712 aattggagtgagcttaggagctaaagtggagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagggggttagtcttcatcataat 31132628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 32460561 - 32460636
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  32460561 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 32460636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 14500074 - 14500144
Alignment:
Q  66 gagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14500074 gagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttaggcttcatcataatcat 14500144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 137
Target Start/End: Original strand, 40885418 - 40885492
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  40885418 taggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagaattcatcataatcatg 40885492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 8045346 - 8045272
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || |||||   |||||||  |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8045346 ttaggagctaaagtgaagtctaagtttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 7850349 - 7850309
Alignment:
Q  101 atctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca 141  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7850349 atctaaggtaagggggttagtcttcaccataatcatgttca 7850309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16523216 - 16523146
Alignment:
Q  66 gagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16523216 gagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 13720750 - 13721102
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  13720750 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaag 13720848  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13720849 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 13720948  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13720949 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 13721048  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  13721049 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 13721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16195665 - 16195302
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16195665 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgagaaatcaaat-ggggtaagattaggagttgaattgaagcaagagtttgggttaatcatcttctaag 16195567  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    |||||||||||  |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||     
T  16195566 gtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttctcg 16195467  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16195466 tgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgagat 16195367  T
Q  308 tatactcaattggt-aaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16195366 tatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattga 16195302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Original strand, 22006092 - 22006442
Alignment:
Q  20 ggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggttt 119  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||     
T  22006092 ggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttcaaaggtaagggggtta 22006190  T
Q  120 gtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgct 219  Q
    ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006191 gttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgct 22006290  T
Q  220 attttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattg 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22006291 attttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattg 22006390  T
Q  320 gtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22006391 atgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 22006442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 13662087 - 13662449
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  13662087 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaag 13662185  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13662186 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctct 13662285  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13662286 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 13662385  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13662386 tatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 13662449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 16872880 - 16873225
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  16872880 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaaggtaaggg 16872978  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||     
T  16872979 ggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgta 16873078  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactc 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16873079 atgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactt 16873178  T
Q  315 aattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| | || ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  16873179 aattgatgaaatttgatatgttttggttgaaatgagatgtaaatcat 16873225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 271236 - 271542
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  271236 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 271335  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  271336 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 271435  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  271436 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 271535  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  271536 ttccatt 271542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 644684 - 644378
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  644684 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 644585  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  644584 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 644485  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  644484 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 644385  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  644384 ttccatt 644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 830419 - 830113
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  830419 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 830320  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  830319 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 830220  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  830219 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 830120  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  830119 ttccatt 830113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 22088670 - 22088976
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  22088670 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 22088769  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || | |||    
T  22088770 gtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggt 22088869  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  22088870 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 22088969  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  22088970 ttccatt 22088976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 15319035 - 15319341
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15319035 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 15319134  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  15319135 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 15319234  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||    
T  15319235 gaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatg 15319334  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  15319335 ttccatt 15319341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 15499404 - 15499710
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15499404 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 15499503  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  15499504 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 15499603  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||    
T  15499604 gaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcatg 15499703  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  15499704 ttccatt 15499710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17346005 - 17345744
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  17346005 aagggttttggagagaataacttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcttaggtaaggggg 17345907  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||          ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17345906 ttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgcgaaattcgtgc 17345807  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaat 267  Q
    |||  |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17345806 tctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaat 17345744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Original strand, 16674222 - 16674474
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| || | ||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || |||||||||||||    
T  16674222 aaaagggttttggagaggagagttttaggaatcaagt--gggtga-cttatgagctgaattgaagcaagagtt-gagttaatcttcttctaaggtaaggg 16674317  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16674318 ggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtg 16674415  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||| ||| || || |||||||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  16674416 atgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 342
Target Start/End: Original strand, 6774133 - 6774408
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||    
T  6774133 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgtt 6774229  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
     |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6774230 atatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 6774329  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  6774330 gaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 6774408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24549328 - 24549083
Alignment:
Q  93 taatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttg 192  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  24549328 taatcaacttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatg 24549232  T
Q  193 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaat 292  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||    
T  24549231 ctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaat 24549134  T
Q  293 gttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    | |||||| || ||||  | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 24549083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 22907035 - 22907308
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  22907035 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 22907132  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  22907133 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 22907231  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  22907232 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 22907308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30121102 - 30120794
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||| ||  ||| | | |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||||| |   |||||||||    
T  30121102 taggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgtt 30121003  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||| ||| || ||| |||||||| |||    
T  30121002 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggt 30120903  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattca 360  Q
    |||||| |||| | || | |||| | ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| |  || ||||||||| |  |||||||| |||||    
T  30120902 gaaattacatg-ttcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattca 30120805  T
Q  361 tgttccattga 371  Q
    ||||| |||||    
T  30120804 tgttcaattga 30120794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Original strand, 43373320 - 43373659
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  43373320 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 43373419  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtg 230  Q
    |||||  ||| ||| || ||||||  ||||||||||||  |  || | ||| ||||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||  ||  | ||    
T  43373420 atcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatg 43373519  T
Q  231 catgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttg 329  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  43373520 catgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 43373617  T
Q  330 atatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  43373618 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 43373659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 107 - 327
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844707
Alignment:
Q  107 ggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctc 206  Q
    |||||||||||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21844587  T
Q  207 ttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa- 305  Q
    ||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| ||||| |||||||||||     
T  21844588 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--taaatatgtaaaaatgataagttatgaat 21844685  T
Q  306 attatactcaattggtaaattt 327  Q
    ||| | |||||||||| |||||    
T  21844686 attgtgctcaattggtgaattt 21844707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5238529 - 5238256
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  5238529 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 5238432  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  5238431 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 5238333  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  5238332 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 5238256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 24661069 - 24661342
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  24661069 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 24661166  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  24661167 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 24661265  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  24661266 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 24661342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43685988 - 43685715
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  43685988 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 43685891  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  43685890 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 43685792  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  43685791 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 43685715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Original strand, 21851881 - 21852100
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  21851881 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 21851978  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 304  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||  ||| |   || |||||| ||||| ||||||||||    
T  21851979 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtt--taaatatgtaaaaatgataagttatga 21852076  T
Q  305 a-attatactcaattggtaaattt 327  Q
    | ||| | |||||||||| |||||    
T  21852077 atattgtgctcaattggtgaattt 21852100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 273
Target Start/End: Original strand, 24928648 - 24928885
Alignment:
Q  37 cttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  24928648 cttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggattaatctttatctaaggtaatggggttagtctttatcataatca 24928747  T
Q  136 tgttcaatttttgcaattt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    |  ||| ||| || ||||| |  ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||| ||  | ||||||    
T  24928748 tcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatg 24928846  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  24928847 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 24928885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 41506612 - 41506741
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaa 106  Q
    |||||||||| || || | |||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||    
T  41506612 gagaagaaaaagggttagaagaggagaacttgaagaatcaagaattggggtgagcttaagagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaa 41506711  T
Q  107 ggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41506712 ggtaagggggttagttttcatcataatcat 41506741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 7000465 - 7000551
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  7000465 aattggggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaagtaagggggttagttttcatcataatca 7000551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 24385580 - 24385684
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24385580 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcata 24385679  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  24385680 atcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 16193571 - 16193865
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || || ||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  16193571 agagcttaaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattcatctttatctaaggtaagggg-ttagtctttatcata 16193669  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||  |  | ||||  || |||||||||  | | || ||| || |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||    
T  16193670 atcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgctt-atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgc 16193768  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttg 329  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  16193769 atgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 16193865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 339
Target Start/End: Original strand, 16404973 - 16405134
Alignment:
Q  177 tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctg 276  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |     
T  16404973 tgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-tt 16405071  T
Q  277 caaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgtt 339  Q
    |||| || | | |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||    
T  16405072 caaa-taggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgtt 16405134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 21494314 - 21494389
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21494314 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 21494389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 16038744 - 16038819
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038744 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 16038819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 3431134 - 3431208
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3431134 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttggattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 22886728 - 22886654
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22886728 ttaggagctaaagtgaagcttaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2545339 - 2545264
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  || ||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2545339 ttaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatg 2545264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 1398 - 1749
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    |||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  1398 gagaagaaaaagggtttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaagg 1496  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  1497 taagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcactt 1596  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1597 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 1696  T
Q  309 atactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  1697 atacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 1749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 153829 - 154191
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  153829 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcttcttctaag 153927  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  153928 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 154027  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154028 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 154127  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  154128 tatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgaatcatattccattga 154191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 217
Target Start/End: Original strand, 169788 - 169938
Alignment:
Q  66 gagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgta 165  Q
    ||||| |||||||||||  ||| | | |||||||| || || ||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  169788 gagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagggggttagtgattatcataatcatgtataatttt-gcattttctcatgttgta 169886  T
Q  166 tgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  169887 tgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 169938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36472 - 36268
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||| | || ||||||||||||||  |  | |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  36472 taggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgtt 36374  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||  | || ||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  36373 gtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 36274  T
Q  263 gaaatt 268  Q
    ||||||    
T  36273 gaaatt 36268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49007 - 48767
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||  |||||| | || | ||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  49007 agagattgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtaaagcctaagtttagattgagcattacctaaggtaagggggttagtctttatcata 48908  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||    
T  48907 atcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgc 48809  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  48808 atgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 48767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 136
Target Start/End: Original strand, 61121 - 61154
Alignment:
Q  103 ctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  61121 ctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1688
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  1336 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagattaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaag 1434  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1435 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 1534  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1535 tgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 1634  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  1635 tatacttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaaatcat 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46523820 - 46523461
Alignment:
Q  10 agaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggt 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  46523820 agaacaaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagataaattaaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggt 46523722  T
Q  110 aagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttg 209  Q
    ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46523721 aagggggttagttattatcataatcatgttccatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 46523623  T
Q  210 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 309  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46523622 ttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatta 46523523  T
Q  310 tactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||  |||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46523522 tacttcattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattga 46523461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 371
Target Start/End: Original strand, 18059608 - 18059942
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  18059608 agcttgaggaatcaa-ttggggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 18059705  T
Q  135 atgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    ||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18059706 atgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 18059805  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatg 334  Q
    |||||||||| || | ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||    
T  18059806 aattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatg 18059905  T
Q  335 ttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18059906 ttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 18059942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22228233 - 22227947
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| || ||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  22228233 aagggttttgaagggaataacttgaagaatcaa-ttggggtaagcttaagagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaaggggg 22228135  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22228134 ttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 22228035  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22228034 gttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22232930 - 22232644
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  22232930 aagggttttgaagtgaatatcttgatgaatcaa-ttggggtaagtttatgagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaaggggg 22232832  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22232831 ttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 22232732  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaa 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232731 gttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 63 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17148948 - 17148649
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggttt-gtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||| | || |||||||||||| || ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17148948 taggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggtaaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgt 17148849  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||    
T  17148848 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 17148749  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcat 361  Q
    ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||    
T  17148748 tgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaatgagatgtaaatcat 17148649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17005018 - 17004712
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17005018 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 17004919  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  17004918 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 17004819  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  17004818 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 17004719  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  17004718 ttccatt 17004712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Original strand, 38054967 - 38055273
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||    
T  38054967 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgtt 38055066  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  38055067 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgcttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 38055166  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||||     
T  38055167 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaaagagatgtgattcata 38055266  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  38055267 ttccatt 38055273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 305
Target Start/End: Original strand, 19962375 - 19962617
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  19962375 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 19962474  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  19962475 gtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 19962574  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 305  Q
    | |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19962575 ggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 19962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 22035874 - 22035583
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22035874 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 22035776  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  22035775 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 22035676  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22035675 ttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 22035583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 7640763 - 7641054
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7640763 aaaagggttttggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 7640861  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  7640862 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 7640961  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | | |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  7640962 ttgct-gtttcttatacttgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 7641054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45051851 - 45051537
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  45051851 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaagg 45051754  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  45051753 taagggggttagtctttatcataatcatgt---gattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttctt 45051657  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaat 307  Q
     |||||||| ||  ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  45051656 actgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 45051559  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttg 329  Q
    | | |||||||||| |||||||    
T  45051558 tgtgctcaattggtgaattttg 45051537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 273
Target Start/End: Original strand, 5072215 - 5072470
Alignment:
Q  13 agaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaag 112  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||| || || ||||||||    
T  5072215 agaaaaagggtttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaag 5072311  T
Q  113 ggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctg 212  Q
    |||||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5072312 ggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 5072409  T
Q  213 tgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5072410 tgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 5072470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2116683 - 2116356
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||| ||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||| |||||    
T  2116683 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttatgagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatttaagg 2116586  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctctt 208  Q
    ||| |||||| ||  | |||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||    
T  2116585 taaaggggttagtgattatcataatcatgt---aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctttt 2116489  T
Q  209 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaat 307  Q
     |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
T  2116488 actgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaat 2116391  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
      | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  2116390 ggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 2116356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 141 - 273
Target Start/End: Original strand, 18601068 - 18601200
Alignment:
Q  141 aatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 240  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18601068 aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 18601167  T
Q  241 tgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    || || ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  18601168 tgttagttgtatgattgttggtgaaattacatg 18601200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20913434 - 20913131
Alignment:
Q  38 ttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  20913434 ttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcgtaatcat 20913335  T
Q  137 gttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
      |||  |||||||| || |||  |||||||||||  | | || | | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||    
T  20913334 cctca--ttttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgctt-acggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatg 20913238  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatat 333  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | || | |||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||  |     
T  20913237 aattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaa 20913140  T
Q  334 gttgttgtt 342  Q
    |||||||||    
T  20913139 gttgttgtt 20913131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20931754 - 20931417
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  20931754 agagcttgaataatcaagattggagtgagcttagcagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagcctttatcata 20931655  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 229  Q
    |||||  |||  |||||||| || |||  |||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |    
T  20931654 atcatcctca--ttttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtat 20931558  T
Q  230 gcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaatttt 328  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | || | |||||| ||||| ||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||    
T  20931557 gcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcata-tatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgctaaattggtgaatttt 20931460  T
Q  329 gatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | ||  |||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  20931459 gctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 20931417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 342
Target Start/End: Original strand, 20893496 - 20893788
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  20893496 aattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatca--ttttg 20893593  T
Q  149 caa-tttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataa 246  Q
     || ||||  ||||||||||||   | |  | ||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  20893594 taattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataa 20893693  T
Q  247 ttgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||| |||||||| | ||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  20893694 ttgtatgattgttgttgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 20893788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 273
Target Start/End: Original strand, 37844320 - 37844544
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||     
T  37844320 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatttttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtga 37844419  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataatt 248  Q
    | ||||  ||||||||||||   | |  | ||| |||||||||||||||||| |||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  37844420 attttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 37844519  T
Q  249 gcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||    
T  37844520 gtatgattgttggtgaaattacatg 37844544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20446073 - 20445777
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||     
T  20446073 attggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtga 20445974  T
Q  150 aattt-ctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataat 247  Q
    ||||| |  ||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  20445973 aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataat 20445874  T
Q  248 tgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    || |||||||| ||||||||| |||| |   ||||| | | ||||| |||||  || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20445873 tgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaa 20445777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 51452886 - 51452661
Alignment:
Q  59 agcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca 158  Q
    |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||    
T  51452886 agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatgttcattctttgcaatttttca 51452787  T
Q  159 tg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataa 246  Q
    ||  ||||||| ||||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||    || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||    
T  51452786 tgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataa 51452688  T
Q  247 ttgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  51452687 ttgtatgattgttggttaaattacatg 51452661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20531837 - 20531542
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||   || ||||| |||||||||||  ||| ||| ||     
T  20531837 attggagtgagcttaggagataaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtga 20531738  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataatt 248  Q
    | ||||  ||||||||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  20531737 attttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataatt 20531638  T
Q  249 gcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    | |||||||| ||||||||| |||| |   ||||| | | ||||| |||||  || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  20531637 gtatgattgttggtgaaattacatgtt--caagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaa 20531542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861285 - 15861358
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15861285 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41394559 - 41394323
Alignment:
Q  104 taaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtg 203  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  | | || ||| || ||||||||||||||||||    
T  41394559 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtg 41394461  T
Q  204 ctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg 303  Q
    |||   || ||||| ||| ||  | ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  41394460 ctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtg 41394363  T
Q  304 -aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
     ||||| | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  41394362 aaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 41394323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 118
Target Start/End: Original strand, 18598849 - 18598905
Alignment:
Q  61 cttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtt 118  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18598849 cttaggagctgaattgaagcaagagtt-gggttaatcttcttctaaggtaagggggtt 18598905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 241 - 345
Target Start/End: Original strand, 22143408 - 22143511
Alignment:
Q  241 tgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattgg-taaattttgatatgttgtt 339  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||| || |||||||||    
T  22143408 tgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgtt-caaagtatgtataaatgttaacttatg-aattatgctcaaatggttgaattatgctatgttgtt 22143505  T
Q  340 gttgaa 345  Q
    ||||||    
T  22143506 gttgaa 22143511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2825 - 2464
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    |||||||| | || |||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  2825 gagaagaacaaggatttgaagggaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaa-tttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    |||||||||| ||  | ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatgaaat 2528  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| ||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2527 tatacttaattgatgaaatttgatatgtttttattgaaatgagatgtaattcatattccattga 2464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 369
Target Start/End: Original strand, 7279 - 7638
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | || ||||||||| || || |||    
T  7279 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaag 7376  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  7377 gtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctct 7476  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaat 307  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7477 tgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatgaaat 7576  T
Q  308 tatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccatt 369  Q
    ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7577 tatactcaattagtgaatcttgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttccatt 7638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4147 - 3892
Alignment:
Q  17 aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggggg 116  Q
    |||||||||| ||  || ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  4147 aagggttttgaaggcaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggt 4049  T
Q  117 tttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgat 216  Q
    || ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4048 ttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgat 3949  T
Q  217 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  3948 gctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 3892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 5034 - 5395
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||  || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||    
T  5034 gagaagaacaagggtttttaagggaatagcttgaagaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaag 5132  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  5133 gtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctct 5232  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaa 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  5233 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaaaa 5330  T
Q  307 ttatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || |  ||||||||| ||||||| |  ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  5331 ttgtgttcaattggtgaattttgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 5395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 23 - 371
Target Start/End: Original strand, 55932 - 56291
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  55932 tttggagagaagagcttgaagaatcaaattggggtgaacttaggagataaattaaagcctaagtttggattaatcattatctacggtcagggggttagtc 56031  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggt---tg--atgaata----attgttgctaaattcgtgctcttgct 211  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||||| ||| |   ||  |||||||    ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  56032 ttcatcataatcatgttcaattattgcaacttctcccttgttgtatgaaattggttgattggaatgaatagataattgttgttaaattcgtgctctaact 56131  T
Q  212 gtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattata 311  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  56132 gtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgtcaagttatgaaattgtg 56231  T
Q  312 ctcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  56232 ctcaaatggtgaattttgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattga 56291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31689 - 31383
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  31689 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 31590  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  31589 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 31490  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  31489 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 31390  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  31389 ttccatt 31383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 154 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39718
Alignment:
Q  154 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || | ||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  254 attgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatg 353  Q
     |||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattattcttaattgatgaaatttgatatgttttttttgaaatgagatg 39736  T
Q  354 taattcatgttccattga 371  Q
    | |||||| || ||||||    
T  39735 ttattcatatttcattga 39718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39483 - 39177
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  39483 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgtt 39384  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| || |||||    
T  39383 gtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggt 39284  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | || ||||||||| | |  |||||| ||||||| ||||||     
T  39283 gaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatgcttaattgatgaaatttgatatgctttgattgaaaagagatgtgattcata 39184  T
Q  363 ttccatt 369  Q
    |||||||    
T  39183 ttccatt 39177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 152 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 43288 - 43137
Alignment:
Q  152 tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgca 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |    
T  43288 tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgta 43189  T
Q  252 tgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa 305  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43188 tgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgaa 43137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3042
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  3395 gagaagaacaagggttttgaagggaatagcttgaagaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaag 3297  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    |||||||||||  |  | |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  3296 gtaagggggttaattattatcataattatgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctct 3198  T
Q  208 tgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaa 306  Q
    |||||||||| ||| ||  | | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || |||    
T  3197 tgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 3100  T
Q  307 ttatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgtt 364  Q
    || | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  3099 ttgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgtt 3042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 105 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29500 - 29234
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  29500 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 29401  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||   ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29400 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T
Q  305 aattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| || ||||| | || ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  29300 aattatgcttaattgatgaaatttgatatgttttgattgaaatgagatgtgattcatattccattga 29234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 92 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 54225 - 53956
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgtt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  54225 ttaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgat 54126  T
Q  192 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaa 291  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||     
T  54125 gctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataat 54027  T
Q  292 tgttaagttatgaaattatactcaattggt-aaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatg 362  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||||||    
T  54026 tgttaagttgtgaaattatacccaattggtgaatttttgatgtgttgttg-agaaataagatgtgattcatg 53956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Original strand, 10570 - 10778
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || |||    
T  10570 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaa-ttgtggtaagattaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaag 10668  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctct 207  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10669 gtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctct 10768  T
Q  208 tgctgtgatg 217  Q
    || |||||||    
T  10769 tgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3799 - 3495
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt-----catcataatcatgttcaatttttgcaatttct 156  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||     |||||||||||  |  |||||||||| |||||    
T  3799 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaatggggtttgttttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttct 3700  T
Q  157 catgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgatt 256  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  3699 catgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatgattatggtatgatt 3600  T
Q  257 gtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggt-aaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgta 355  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||  ||||| ||||||     
T  3599 gtgggtgaaattacatg-ttcaaagcatgtataattgttaagttgtgaaattatacccaattggtgaatttttgatgtgttgttg-agaaataagatgtg 3502  T
Q  356 attcatg 362  Q
    |||||||    
T  3501 attcatg 3495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7022 - 6733
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7022 aaaagggttttggagagaagagctttacgaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 6926  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||| | ||    
T  6925 ggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgttatg 6826  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     ||||  |||||| | |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6825 ttgct-gtttcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 6733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 192 - 371
Target Start/End: Original strand, 1 - 180
Alignment:
Q  192 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaa 291  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaa 100  T
Q  292 tgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  101 tgttaagttatgaaattatacttaattgatgaaatttgatatgttttaattgaaatgagatgtaattcatattacattga 180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 458 - 205
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  458 aaaagggttttggagaggagagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcgagagtttggattaatcttcttctaaggtaaggg 360  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||    
T  359 ggttagttattatcaaaatcatgt---aattttgca-ttgctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtg 264  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  263 atgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatg 205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 101; Significance: 7e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 342
Target Start/End: Original strand, 20963 - 21266
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  20963 agcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 21060  T
Q  135 atgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | | |||     
T  21061 atgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccatt 21159  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaattttgatat 333  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| | |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||   |||||||||| ||||||  ||     
T  21160 aattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattttcctaa 21257  T
Q  334 gttgttgtt 342  Q
    |||||||||    
T  21258 gttgttgtt 21266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 328
Target Start/End: Original strand, 13909 - 14197
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| || |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  13909 agcttgaggaatcaa-ttggggtaagct-aggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatc 14006  T
Q  135 atgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatg 234  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |   | ||||||    
T  14007 atgtacaatttt-gcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgctgtgatgttatgtctgtatgcatg 14104  T
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaatttt 328  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| ||  || |||||| ||||| ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  14105 aattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttg--aaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaattggtgaatttt 14197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 103 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 108086 - 107819
Alignment:
Q  103 ctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgt 202  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  108086 ctaaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgt 107987  T
Q  203 gctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttat 302  Q
    ||||   |||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| | || | ||||| |||||| |    
T  107986 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tgtgcaaaaatgataagttgt 107889  T
Q  303 -gaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
      ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  107888 aaaaattgtgctcaattggtgaattttgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 107819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 327
Target Start/End: Original strand, 64365 - 64663
Alignment:
Q  28 agagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcat 127  Q
    |||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  | ||    
T  64365 agagaagagcttaaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattat 64461  T
Q  128 cataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttctt 227  Q
    || ||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  |    
T  64462 cacaatcatgt--aatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttat 64559  T
Q  228 gtgcatga-----attgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggt 321  Q
     |||||||     ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  64560 atgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--taaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggt 64657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 62 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 42039 - 41746
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca-tg 160  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||    
T  42039 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcatttatttcaatttctcattg 41940  T
Q  161 ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgc 250  Q
    ||||||||| ||||||||          ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||     
T  41939 ttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 41840  T
Q  251 atgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41839 atgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattttgctatgttgttgttgaa 41746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 13877 - 13604
Alignment:
Q  83 aagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttg-- 178  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||      
T  13877 aagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgtttatttattgcaatttctcatttgttgtatgaatatgggttgaa 13778  T
Q  179 --------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgc 270  Q
            ||| |||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  13777 ttgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 13678  T
Q  271 atgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
    ||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  13677 atgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattttgctatgttgttgttgaa 13604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 787 - 1118
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| || ||||||    
T  787 gagaagaacaaggattttgaagggaatagcttgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaatcaagagttggggttaatcttcttctaag 885  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc--atgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgct 205  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   ||| ||| |||||  |||||||||| || || | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  886 gtaagggggttagtctttatcataatcatcttca--ctttacaaattctcaaatgttgtatg-aattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgct 982  T
Q  206 cttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-a 304  Q
    |   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||  |||||| || |    
T  983 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaataataagttgtgaa 1080  T
Q  305 aattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||| | |||||||| | ||||||| || |||||||||    
T  1081 aattgtgctcaattgatgaattttgctaagttgttgtt 1118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 340
Target Start/End: Original strand, 8051 - 8340
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggttt-gtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctca--t 159  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |    
T  8051 taggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 8150  T
Q  160 gttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 249  Q
    |||||||||| ||||||||          ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||||||||||| |||||||||    
T  8151 gttgtatgaatatgggttgaattgaataaatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattg 8250  T
Q  250 catgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttg 340  Q
     |||||||| ||||||||| || | |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8251 tatgattgttggtgaaattacaggtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctatgttgttg 8340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12042
Alignment:
Q  23 tttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtc 122  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  12176 tttggagtgaagagcgtgaagaatcaaattggggtaagcttaggagctaaattgaagccaaagtttggattaatcattatctaagataagggggttagtc 12077  T
Q  123 ttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctc 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12076 ttcatcataatcatgttcaattattgcaacttctc 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 371
Target Start/End: Original strand, 26261 - 26606
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26261 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagatgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 26360  T
Q  125 catcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 224  Q
     |||||||||||| ||| ||| |  | ||||  ||||||||||||  |    | ||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||    
T  26361 tatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt 26460  T
Q  225 cttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaa 323  Q
      | ||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||| | |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |    
T  26461 tgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgttctcaattggtga 26558  T
Q  324 attttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| | | |||| ||||| |||||    
T  26559 attttgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattga 26606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 61 - 273
Target Start/End: Original strand, 1176 - 1386
Alignment:
Q  61 cttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg 160  Q
    |||||||||| |||||||||||   || ||||||||| || || |||||| ||||||| ||  | |||| ||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  1176 cttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatgt--aatttttgcatttactcatg 1273  T
Q  161 ttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgg 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||| |||||||| |    
T  1274 ttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttg 1373  T
Q  261 gtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||| ||||    
T  1374 gtgaaattacatg 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3578 - 3288
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat-g 160  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |    
T  3578 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttgaattaatcatcatctaaggtaaggggttat-tcttcctcataatcatgttcatttattgcaatttctccttg 3480  T
Q  161 ttgtatgaaaatgggttgat---------gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgca 251  Q
    || | ||||| |||||||||         | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||  | |||||||||| |||||| ||| |    
T  3479 ttatgtgaaa-tgggttgattgaataaatggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgta 3381  T
Q  252 tgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttga 344  Q
    ||||||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||||||||    
T  3380 tgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatatcaagttatgaaattgtactcaaatggtgaattttgctaagttgttgttga 3288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Original strand, 3436 - 3773
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||    
T  3436 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttgtcata 3535  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    ||||| |||| ||| |  | ||||  | ||||||||||  | | || ||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||    
T  3536 atcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgatt-atagataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgc 3634  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttga 330  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||     
T  3635 atgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattttgc 3732  T
Q  331 tatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  3733 taagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 3773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1534 - 1196
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  | |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1534 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgtgattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 1435  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaattt-ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtg 230  Q
    |||||  ||| ||| || ||||| |  ||||||||||||  |   || ||| ||||||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||    
T  1434 atcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatg 1336  T
Q  231 catgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttg 329  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||    
T  1335 catgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttg 1238  T
Q  330 atatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  1237 ctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 1196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7560 - 7345
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgtt 191  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  7560 ttaaacatcatctaaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcat 7461  T
Q  192 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaa 291  Q
    |  ||||||||||||||| | || ||||  || ||| | |||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||    
T  7460 gtcaaattcgtgctcttgttatgttgct-gttgcttatacatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaa 7362  T
Q  292 tgttaagttatgaaatt 308  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  7361 tgtcaagttgtgaaatt 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 23580 - 23869
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  23580 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaaggg 23676  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtg 214  Q
    |||| ||  | |||||| |||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||  ||||||||||||| | | ||    
T  23677 ggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctctggttatg 23776  T
Q  215 atgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaatt 308  Q
     || |  |||||| | |||| ||||||||| || | ||| |||||| ||||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23777 ttg-ttgtttcttatacatggattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatggttcaatgtatgtataaatgtcaagttgtgaaatt 23869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 342
Target Start/End: Original strand, 9223 - 9499
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || |||||||    
T  9223 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgt 9319  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9320 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 9419  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||  | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  9420 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 9499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 342
Target Start/End: Original strand, 16121 - 16397
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || |||||||    
T  16121 ttaggagctaaagtgaagcctaagttaagattaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgt 16217  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtggg 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16218 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgg 16317  T
Q  262 tgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||  | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  16318 tgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 16397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 273
Target Start/End: Original strand, 5915 - 6158
Alignment:
Q  28 agagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcat 127  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || | || |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||   |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5915 agagaatagcttgaggaatcaa-ttagagtaagcttaggagctgaattgaagcaagagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttat 6013  T
Q  128 cataatcatgttcaatttttgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttc 225  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| ||||||  |||||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||     
T  6014 cataatcattttcacttt--gcaaattctcaaatgttgtatgaat-tgtgattatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgttt 6110  T
Q  226 ttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  6111 gtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 6158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 342
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13475
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 204  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  13242 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgt--aattttt-cattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgc 13338  T
Q  205 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg- 303  Q
    ||||  ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| ||     
T  13339 tcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtga 13436  T
Q  304 aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||||  | |||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  13437 aaatggtgctcaattggtgaattttgctaagttattgtt 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9247 - 8921
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttca--atttt 146  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  |||  |||||    
T  9247 aattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgaggttaatcataatctaaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttt 9148  T
Q  147 tgcaatttctca--tgttgtatgaaaatgggttgat-gaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 243  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| |  |    | || | ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  9147 tgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatga 9048  T
Q  244 taattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||| ||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  9047 taattgtatgattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 8950  T
Q  343 gaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||| |||||| | ||| |||||| |||||    
T  8949 gaattgagatatgattaatgttcaattga 8921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 147010 - 146906
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  147010 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 146911  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  146910 atcat 146906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 148980 - 148793
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    |||||||||| |||||| ||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  148980 ataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 148883  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  148882 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 148793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22982 - 22709
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  22982 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 22885  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  22884 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatgaataattgttgctaa 22786  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  22785 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 22709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27237 - 26964
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  27237 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattgggaa-agcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 27140  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  27139 taagggggttagtctttatcataatcatgttccttctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 27041  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  27040 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 26964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12523 - 12289
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaaa--ttggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcat 130  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || ||||||   |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12523 agagcttgaagaatcaaaaattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttaggattaatctctatctaaggtaagggggttagtctttatcat 12424  T
Q  131 aatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtg 230  Q
    |||||| || ||||||   | ||||  ||| ||||||||| |  | | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | ||    
T  12423 aatcatctt-aattttgtaactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatg 12325  T
Q  231 catgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaa 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12324 catgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaa 12289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5970 - 5698
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  5970 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaggaatcaatt--gggtaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 5874  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||| |||||| |||||  ||||||| |||||| |||          ||||||||||||||||||    
T  5873 taagggggttagtctttaccataatcatgttcattctttacaatttttcatgatttgtatg-aaatggattgaaacgaatgaatgaataattgttgctaa 5775  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  5774 attcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatg 5698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 36887 - 37160
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  36887 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatccaattggg-taagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 36984  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  || |||||| |||||  ||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  36985 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattccttacaatttttcatgatttgtatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 37083  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  37084 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 37160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9287 - 8950
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9287 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 9188  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaa--tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 229  Q
    ||||| ||||  ||||||||  ||||  | |||||| |||  | | || ||| | ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||  | |    
T  9187 atcatcttca--ttttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgctt-atggaaaattgttgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtat 9091  T
Q  230 gcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaatttt 328  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |   || |||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||||||    
T  9090 gcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgtt--caattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttt 8993  T
Q  329 gatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    | || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  8992 gttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 8950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 13196 - 13317
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  13196 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 13295  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  13296 ggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 273
Target Start/End: Original strand, 1404 - 1676
Alignment:
Q  9 gagaagaaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaagg 108  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||   || |||  |||||||||||| |||||||||  | ||||||  ||||| ||||||||||    
T  1404 gagaagataagggttt-ggagagaagaacttgaagaatcc--tttgggaaagcttaggagctaaattgaagcctaggtttggtctaatcttcatctaagg 1500  T
Q  109 taagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg--ttgtatgaaaatgggttg----------atgaataattgttgctaa 196  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||          ||| ||||||||||||||    
T  1501 taagggggttagtctttatcataatcatgttcattctttgcaatttttcatgatttggatg-aaatgggttgaaatgaatgaatggataattgttgctaa 1599  T
Q  197 attcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  1600 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatg 1676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 371
Target Start/End: Original strand, 31548 - 31856
Alignment:
Q  63 taggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgtt 162  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| | | |||||| | || || ||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||    
T  31548 taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttt-gcatattctcatgtt 31646  T
Q  163 gtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggt 262  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||    |||||||||||||| || ||| |||||||| |||    
T  31647 gtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggt 31746  T
Q  263 gaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattggtaaattt-tgat-atgttgttgttgaaatgagatgtaattc 359  Q
    |||||| |||  | || | |||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |  | | |||||||||||  |||||||| ||||    
T  31747 gaaattacat-attcata-tatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattc 31844  T
Q  360 atgttccattga 371  Q
    |||||| |||||    
T  31845 atgttcaattga 31856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Original strand, 128023 - 128263
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| | || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  128023 agagcttgaagaatcaagattggagtgagattaggagataaaatgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 128122  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaa--tttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgt 229  Q
    ||||| ||||  ||||||||  ||||  | ||||||||||  | | || ||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||| ||  | |    
T  128123 atcatcttca--ttttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtat 128219  T
Q  230 gcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  128220 gcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg 128263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 364
Target Start/End: Original strand, 34331 - 34644
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcat-- 159  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||  || ||||| | |||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| || ||||||||||||||      
T  34331 ttaggagctaaagtgaagctcaagcttgaattgatcattacctaaggtaagagggttagttattatcataatcatgttcatttattgcaatttctcattt 34430  T
Q  160 gttgtatgaaaatgggttga----------tgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 249  Q
    |||||||||| |||||||||          || |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  34431 gttgtatgaatatgggttgaattgaatgaatggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 34530  T
Q  250 catgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatg 348  Q
     |||||||| ||||||||| |||| |   || | |||| |||| | ||||| || ||||| | |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  34531 tatgattgttggtgaaattacatgtt--caattgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattttgctaagttgttgttgaattg 34628  T
Q  349 agatgtaattcatgtt 364  Q
    |||| | |||||||||    
T  34629 agatatgattcatgtt 34644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 136
Target Start/End: Original strand, 57303 - 57424
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| |||| || ||||||  ||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  57303 aaaagggttttggagagaagagcttgaggaatcaagattgggtgagcttagtagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaaggg 57402  T
Q  115 ggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||| ||||| |||||||||||    
T  57403 ggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Original strand, 89323 - 89548
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttg 148  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||| |     
T  89323 aattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgta 89422  T
Q  149 caatttctcatgttgtatgaaaatgggt-tgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataat 247  Q
     | ||||  ||||| ||||||  |  |  | ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  89423 aattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataat 89522  T
Q  248 tgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||    
T  89523 tgtatgattgttggtgaaattacatg 89548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Original strand, 107653 - 107740
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  107653 aattggagtgagcttaggagttaaattgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtcttcatcatgatcat 107740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 130979 - 130880
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||  |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  130979 agcttgaggaatcaa-ttggggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatc 130882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 345
Target Start/End: Original strand, 51054 - 51347
Alignment:
Q  50 attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgc 149  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | |||| |||||||| | || ||||| |||||||||||  ||| ||| |      
T  51054 attggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttatcttaggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaa 51153  T
Q  150 aatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg 249  Q
    | ||||  ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  51154 attttcaaatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattg 51252  T
Q  250 catgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaa 345  Q
     | |||||| ||||||||| |||| | |||| || ||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||| || ||||| |||| ||||    
T  51253 taagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-taggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattatgttatgtggttgatgaa 51347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 342
Target Start/End: Original strand, 123011 - 123326
Alignment:
Q  30 agaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcat 127  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| | | |||||||||||||||| |||||||     
T  123011 agaagaacttgaagaatcaagaattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctttacctaaggtaagggggttagtcttcac 123110  T
Q  128 cataatcatgttcaatttttgcaa--tttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctatttt 224  Q
    |||||||||  | |||||||| ||  || |  ||||||||||||   | |  | ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||    
T  123111 cataatcatcat-aatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtt 123209  T
Q  225 cttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaa 323  Q
      | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| || | | ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |    
T  123210 tgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-taggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtga 123307  T
Q  324 attttgatatgttgttgtt 342  Q
    |||||| || |||||||||    
T  123308 attttgctaagttgttgtt 123326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42113 - 41830
Alignment:
Q  57 tgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttct 156  Q
    |||||||||||| | ||||||||   ||||| || |||||  | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |  | ||||     
T  42113 tgagcttaggaggtaaattgaagtctaagttgggattaatatttatctaaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttca 42014  T
Q  157 catgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattg-catgat 255  Q
     ||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42013 aatgttgtatgaattttgctt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcat-at 41916  T
Q  256 tgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgtt 342  Q
    ||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||| || || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  41915 tgttggtgaaattacatgct-caaa-tatgtaaaaatgataatttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgtt 41830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 180
Target Start/End: Original strand, 13225 - 13342
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgt 161  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13225 ttaggagctaaagtgaagctcaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 13324  T
Q  162 tgtatgaaaatgggttgat 180  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  13325 tgtatg-aaatgggttgat 13342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 136
Target Start/End: Original strand, 107980 - 108107
Alignment:
Q  9 gagaagaa-aagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaag 107  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |  |||||| |||||||||    
T  107980 gagaagaacaagggttttgaagagaatagcgtgaggaatcaa-ttggggtaagcttaggagctgaattgaagcctaagttggaattaatcttcatctaag 108078  T
Q  108 gtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  108079 gtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 55991 - 55904
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||  || || || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  55991 aattggagagagcttaggagctaaattgaagcctaaattgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 345
Target Start/End: Original strand, 104664 - 104773
Alignment:
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaattgg-taaattttgatat 333  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||| || |||    
T  104664 aattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggtt-caaagtatgtataaatgctaacttatg-aattatgctcaaatggttgaattatgttat 104761  T
Q  334 gttgttgttgaa 345  Q
    ||||||||||||    
T  104762 gttgttgttgaa 104773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19465 - 19278
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  19465 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 19368  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||    
T  19367 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattga 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21549 - 21362
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  21549 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 21452  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||    
T  21451 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattga 21362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 172314 - 172074
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  172314 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 172215  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||| ||| |  | | ||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||| ||| ||  | ||     
T  172214 atcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtat-aaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgg 172116  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  172115 atgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatg 172074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 178017 - 177777
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  178017 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 177918  T
Q  132 atcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgc 231  Q
    |||||  ||| ||| |  | ||||  ||||||||| ||| |  | | ||| |||| ||||||||||| |||||||   |||||||| ||| ||  | ||     
T  177917 atcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtat-aaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgg 177819  T
Q  232 atgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  177818 atgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatg 177777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25612 - 25532
Alignment:
Q  55 ggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25612 ggtgagcttaggagctaaattgaagcctaagtttgggttaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Original strand, 154262 - 154362
Alignment:
Q  15 aaaagggttttggagagaagagcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaaggg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  154262 aaaagggttttggagagaagagctttaggaatcaagt--gggtga-cttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaaggg 154358  T
Q  115 ggtt 118  Q
    ||||    
T  154359 ggtt 154362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 209
Target Start/End: Original strand, 12032 - 12149
Alignment:
Q  92 ttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatg-ttgtatgaaaatgggttgatgaataattgt 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12032 ttaaacatcatctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttca-tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattga 12130  T
Q  191 tgctaaattcgtgctcttg 209  Q
    || ||||||||||||||||    
T  12131 tgttaaattcgtgctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Original strand, 36762 - 37076
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaat---tgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatc 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    ||||||  ||||| || |||||| | || ||||||||||||||| ||||| |||    
T  36762 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaagaagtgaagcctaagttgggattaatctttatttaaggtaagggggttagtctttatc 36861  T
Q  129 ataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaa-aatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttctt 227  Q
    ||||||||  ||| ||| || ||||||  ||||||||||||   | |  | ||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||| ||  |    
T  36862 ataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgt 36961  T
Q  228 gtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaatt 326  Q
     ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||| || ||||| | || ||||||| ||||    
T  36962 atgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctaaattggtgaatt 37059  T
Q  327 ttgatatgttgttgttg 343  Q
    ||| || ||||| ||||    
T  37060 ttgctaagttgtggttg 37076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 425 - 339
Alignment:
Q  49 aattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatca 135  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  425 aattggggtggtcttaggagctaaattgaagcctaagtttggattaatccttatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatca 339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48446 - 48259
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |    
T  48446 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-t 48349  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
     |||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |  |||||| | |||| ||||| |||||    
T  48348 gtgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattga 48259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 6371 - 6475
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6371 agagcttgaagaatcaagattggagtgagcttaggagctaaattgaagcctaagttgggattattccttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 6470  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  6471 atcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 799 - 910
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  799 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 898  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  899 tatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 9803 - 9914
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9803 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatcttcatctaaggtaagggggttagtctt 9902  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  9903 tatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 273
Target Start/End: Original strand, 538 - 628
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  538 ataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatg 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 34266 - 34340
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34266 ttaggagctaaaatgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 193325 - 193429
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||  ||||| || |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  193325 agagcttgaagaattaagattggagtgagcttaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatcttcatttaaggtaagggggttagtctttatcata 193424  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  193425 atcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 5623 - 5548
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5623 ttaggagctaaaatgaagcccaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatg 5548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4378
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4304 ttaggagctaaagtgaagcaaaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 18100 - 18026
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||| | || ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18100 ttaggagttaaagtgaagcctaagtttggattaatcattatctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 17142 - 17241
Alignment:
Q  35 agcttgatgaatcaaattggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatc 134  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||| ||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17142 agcttgaggaatcaa-ttggggtgacct-aggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggtaagggggttagtcttcatcataatc 17239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 136
Target Start/End: Original strand, 17225 - 17336
Alignment:
Q  27 gagagaagagcttgatgaatcaa--attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtctt 124  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||  ||||| |||| |||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  17225 gagagaagaacttgaagaattaaggattggagtgaacttaggagctaaattgaagcctaagttgggattaatctccatctaaggtaagcgggttagtctt 17324  T
Q  125 catcataatcat 136  Q
     |||||||||||    
T  17325 tatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 272434 - 272330
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||||||  ||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  272434 agagcttaaagaatcaagattggagtgagctcaggagctaaagtgaagcctaagttgggattaatctttatctaaggtaagggggttagtctttatcata 272335  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  272334 atcat 272330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 49710 - 49785
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  49710 ttaggagctaaagtgaagcctaagtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 49785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 5434 - 5508
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcat 136  Q
    ||||||||| || ||||||  ||| |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5434 ttaggagctaaagtgaagcctaagattggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 136
Target Start/End: Original strand, 12346 - 12450
Alignment:
Q  33 agagcttgatgaatcaa-attggggtgagcttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcata 131  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||   ||||| || | |||| | |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  12346 agagcttgaagaatcaagattggattgagcttaggagctaaattgaagtctaagttgggatgaatctttatctaaggtaagggggttagtttttatcata 12445  T
Q  132 atcat 136  Q
    |||||    
T  12446 atcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 95372 - 95297
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  | |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  95372 ttaggagctaaagtgaagcctaggtttggattaatcattacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 95297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 5065 - 5252
Alignment:
Q  183 ataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||| | ||| ||  | ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | |||| | |||| |    
T  5065 ataattgttgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatg-ttcaaa-t 5162  T
Q  283 atgtataaatgttaagttatg-aaattatactcaattggtaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 371  Q
    ||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||||||| |||||||  | |||||||||  |||||| | | |||| ||||| |||||    
T  5163 atgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattttgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattga 5252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 137
Target Start/End: Original strand, 9370 - 9445
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatg 137  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  9370 ttaggagctaaagtgaagcccaagtttgaattgatcataacctaaggtaagggggttagtcttcttcataatcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 364
Target Start/End: Original strand, 22463 - 22591
Alignment:
Q  235 aattgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatgttaagttatgaaattatactcaa-ttggtaaattttgatat 333  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| |||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||| ||  | |||| || |||    
T  22463 aattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgtt-caaaatatgtataaatgctaacttatgaa-ttatgctcaaattattgaattgtgctat 22560  T
Q  334 gttgttgttgaaatgagatgtaattcatgtt 364  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  22561 gttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtt 22591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Original strand, 7053 - 7129
Alignment:
Q  62 ttaggagcttaattgaagcaaaagtttgggttaatcatcatctaaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||| || ||||||  || ||||  |||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  7053 ttaggagctaaagtgaagcttaaatttgaattaatcataacctaaggtaagggggttagtgttcttcataatcatgt 7129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8111
Alignment:
Q  195 aaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaa-ttgatgataattgcatgattgtgggtgaaattgcatgctgcaaagtatgtataaatg 293  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||| ||  | |||||||| ||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatg-ttcaaagtatgtataagtg 8159  T
Q  294 ttaagttatgaaattatactcaatt-ggtaaattttgatatgttgttgt 341  Q
     ||| ||||| | |||| ||||||| ||| |||| || |||||||||||    
T  8158 ctaacttatg-atttatgctcaattgggtgaattatgctatgttgttgt 8111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University