View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2810_low_14 (Length: 472)

Name: NF2810_low_14
Description: NF2810
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2810_low_14
NF2810_low_14
[»] chr4 (87 HSPs)
chr4 (20-460)||(821196-821649)
chr4 (21-406)||(44054612-44054997)
chr4 (21-413)||(33738948-33739339)
chr4 (21-413)||(45460040-45460432)
chr4 (21-406)||(16521479-16521863)
chr4 (21-413)||(44345510-44345902)
chr4 (21-406)||(12900853-12901240)
chr4 (31-406)||(25120215-25120589)
chr4 (26-406)||(21960657-21961036)
chr4 (21-392)||(30233626-30233998)
chr4 (138-409)||(10642874-10643145)
chr4 (21-409)||(54119356-54119732)
chr4 (76-409)||(19999215-19999547)
chr4 (99-409)||(13245139-13245447)
chr4 (91-405)||(14994888-14995202)
chr4 (202-409)||(53706054-53706261)
chr4 (91-273)||(5683906-5684088)
chr4 (215-406)||(53909047-53909238)
chr4 (200-413)||(7133711-7133924)
chr4 (87-409)||(10487358-10487682)
chr4 (26-357)||(23271015-23271342)
chr4 (200-409)||(18167481-18167686)
chr4 (87-409)||(16329069-16329393)
chr4 (200-409)||(9294212-9294419)
chr4 (199-409)||(15288271-15288479)
chr4 (205-406)||(110171-110371)
chr4 (138-406)||(15273958-15274226)
chr4 (21-235)||(15273736-15273949)
chr4 (200-409)||(14950707-14950914)
chr4 (200-409)||(22355826-22356033)
chr4 (200-408)||(8373042-8373249)
chr4 (214-406)||(8873770-8873961)
chr4 (199-409)||(15295381-15295589)
chr4 (199-405)||(18246881-18247083)
chr4 (208-409)||(47356013-47356214)
chr4 (202-406)||(34393744-34393948)
chr4 (91-235)||(18247155-18247299)
chr4 (138-411)||(18495604-18495880)
chr4 (190-406)||(5684153-5684370)
chr4 (223-409)||(26338173-26338355)
chr4 (76-227)||(7133479-7133631)
chr4 (199-406)||(15212032-15212239)
chr4 (89-236)||(9294491-9294638)
chr4 (21-273)||(18294100-18294354)
chr4 (21-234)||(19698447-19698657)
chr4 (21-234)||(19709032-19709242)
chr4 (87-235)||(26679002-26679152)
chr4 (126-236)||(15212413-15212523)
chr4 (91-227)||(18167766-18167903)
chr4 (87-235)||(22355604-22355754)
chr4 (200-409)||(26678732-26678929)
chr4 (30-411)||(13810709-13811103)
chr4 (230-406)||(13049455-13049630)
chr4 (26-226)||(55377673-55377873)
chr4 (190-356)||(18294418-18294580)
chr4 (202-333)||(8044021-8044153)
chr4 (95-222)||(18251103-18251232)
chr4 (126-235)||(15212311-15212419)
chr4 (143-235)||(15288106-15288198)
chr4 (143-235)||(15295216-15295308)
chr4 (29-167)||(53705902-53706039)
chr4 (138-273)||(34394020-34394156)
chr4 (76-273)||(18109838-18110038)
chr4 (21-165)||(8873631-8873774)
chr4 (42-155)||(19019506-19019617)
chr4 (99-167)||(53908963-53909031)
chr4 (338-413)||(13751694-13751769)
chr4 (308-406)||(43282757-43282855)
chr4 (308-406)||(52266840-52266938)
chr4 (126-185)||(15212552-15212611)
chr4 (308-381)||(15852696-15852769)
chr4 (224-273)||(19019390-19019439)
chr4 (142-236)||(8373321-8373415)
chr4 (226-273)||(8373431-8373478)
chr4 (316-406)||(15043631-15043721)
chr4 (316-406)||(15110703-15110793)
chr4 (226-272)||(47356297-47356343)
chr4 (99-164)||(110391-110456)
chr4 (308-369)||(27959759-27959820)
chr4 (308-369)||(34197544-34197605)
chr4 (199-261)||(18110114-18110176)
chr4 (308-361)||(37958436-37958489)
chr4 (308-369)||(41167314-41167375)
chr4 (141-249)||(15043789-15043898)
chr4 (141-249)||(15110526-15110635)
chr4 (311-380)||(41257728-41257797)
chr4 (208-236)||(15212605-15212633)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (23-413)||(22407286-22407676)
chr1 (26-413)||(49966331-49966717)
chr1 (28-409)||(18506043-18506422)
chr1 (26-406)||(2422065-2422445)
chr1 (55-406)||(44036024-44036373)
chr1 (91-409)||(15862592-15862908)
chr1 (21-409)||(41210732-41211119)
chr1 (26-406)||(21716895-21717271)
chr1 (28-406)||(35053532-35053909)
chr1 (21-406)||(35523508-35523894)
chr1 (21-406)||(5675690-5676074)
chr1 (91-409)||(22250113-22250430)
chr1 (76-409)||(17147468-17147801)
chr1 (108-406)||(41218143-41218442)
chr1 (136-406)||(21858246-21858515)
chr1 (125-409)||(20894886-20895169)
chr1 (91-273)||(22353097-22353279)
chr1 (95-409)||(22365441-22365757)
chr1 (135-409)||(45050370-45050642)
chr1 (138-406)||(20826428-20826696)
chr1 (21-235)||(20826206-20826419)
chr1 (203-406)||(37845737-37845939)
chr1 (21-413)||(51657400-51657805)
chr1 (140-409)||(7641803-7642068)
chr1 (208-409)||(22352814-22353015)
chr1 (87-409)||(51451299-51451623)
chr1 (21-406)||(9785340-9785707)
chr1 (203-400)||(20444442-20444638)
chr1 (203-400)||(20530207-20530403)
chr1 (203-406)||(20526808-20527010)
chr1 (208-409)||(18060885-18061085)
chr1 (21-250)||(27330861-27331088)
chr1 (168-409)||(17003511-17003747)
chr1 (223-409)||(22034535-22034717)
chr1 (223-409)||(21651228-21651412)
chr1 (199-409)||(41393138-41393346)
chr1 (203-406)||(20930163-20930367)
chr1 (223-409)||(22029383-22029566)
chr1 (230-409)||(22226667-22226846)
chr1 (238-406)||(18602351-18602518)
chr1 (238-406)||(5073608-5073775)
chr1 (89-236)||(20956127-20956278)
chr1 (238-371)||(20121965-20122098)
chr1 (223-294)||(22031007-22031078)
chr1 (308-381)||(38034997-38035070)
chr1 (311-406)||(22836628-22836723)
chr1 (308-406)||(27673543-27673641)
chr1 (224-273)||(20253246-20253295)
chr1 (308-381)||(36357713-36357786)
chr1 (99-167)||(37845654-37845722)
chr1 (308-383)||(20956341-20956416)
chr1 (173-262)||(22836478-22836568)
chr1 (308-369)||(19601911-19601972)
chr1 (99-169)||(20930380-20930450)
chr1 (311-380)||(37235336-37235405)
chr1 (99-167)||(20444653-20444721)
chr1 (99-167)||(20527025-20527092)
chr1 (99-167)||(20530418-20530486)
chr1 (205-253)||(27673692-27673740)
chr1 (311-369)||(5471758-5471816)
chr1 (312-380)||(8539328-8539396)
chr1 (312-380)||(8604567-8604635)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (26-413)||(25121227-25121614)
chr8 (21-413)||(19994234-19994626)
chr8 (29-413)||(22322525-22322909)
chr8 (99-413)||(41245348-41245662)
chr8 (31-406)||(29758984-29759358)
chr8 (87-409)||(24718564-24718887)
chr8 (21-406)||(37610059-37610443)
chr8 (43-406)||(20648541-20648906)
chr8 (138-409)||(43374782-43375051)
chr8 (21-406)||(20480365-20480748)
chr8 (76-406)||(20655158-20655491)
chr8 (21-409)||(3432661-3433044)
chr8 (76-406)||(24386843-24387175)
chr8 (94-413)||(16416945-16417266)
chr8 (76-409)||(16874074-16874407)
chr8 (94-411)||(21679889-21680209)
chr8 (91-409)||(22007638-22007948)
chr8 (29-406)||(20568356-20568734)
chr8 (29-406)||(20574549-20574927)
chr8 (21-406)||(21696253-21696639)
chr8 (199-409)||(6775492-6775701)
chr8 (87-409)||(5236883-5237207)
chr8 (87-409)||(24662391-24662715)
chr8 (199-412)||(22908745-22908956)
chr8 (135-409)||(24547909-24548181)
chr8 (200-406)||(24930375-24930582)
chr8 (208-409)||(224430-224631)
chr8 (208-409)||(700843-701044)
chr8 (208-409)||(738053-738254)
chr8 (208-409)||(861948-862149)
chr8 (208-409)||(13663905-13664105)
chr8 (208-409)||(13723180-13723380)
chr8 (91-411)||(17730612-17730936)
chr8 (200-405)||(24107848-24108050)
chr8 (87-409)||(43684342-43684666)
chr8 (168-409)||(272435-272671)
chr8 (168-409)||(643178-643414)
chr8 (168-409)||(828984-829220)
chr8 (203-404)||(16195001-16195202)
chr8 (89-235)||(24107629-24107775)
chr8 (141-406)||(270429-270687)
chr8 (141-406)||(645233-645491)
chr8 (141-406)||(830968-831226)
chr8 (223-409)||(22089729-22089911)
chr8 (95-235)||(28836562-28836704)
chr8 (87-273)||(13663635-13663823)
chr8 (223-409)||(15320345-15320527)
chr8 (223-409)||(15500714-15500896)
chr8 (26-326)||(16042123-16042424)
chr8 (21-234)||(18611377-18611587)
chr8 (91-273)||(13722174-13722358)
chr8 (76-411)||(38532336-38532685)
chr8 (96-235)||(22908532-22908673)
chr8 (199-339)||(28836353-28836490)
chr8 (95-234)||(24930160-24930302)
chr8 (206-406)||(28543628-28543826)
chr8 (200-326)||(16040621-16040748)
chr8 (238-406)||(16675624-16675791)
chr8 (242-406)||(21853199-21853361)
chr8 (307-406)||(37605685-37605783)
chr8 (242-406)||(21845794-21845956)
chr8 (142-235)||(6775326-6775420)
chr8 (89-211)||(28556874-28556998)
chr8 (200-273)||(13722433-13722506)
chr8 (200-273)||(13722581-13722654)
chr8 (200-273)||(13722729-13722802)
chr8 (200-273)||(13722877-13722950)
chr8 (200-273)||(13723025-13723098)
chr8 (21-235)||(16040335-16040549)
chr8 (308-406)||(18768135-18768233)
chr8 (21-168)||(16406149-16406295)
chr8 (340-406)||(16203739-16203804)
chr8 (308-381)||(39448198-39448271)
chr8 (190-236)||(17151399-17151445)
chr8 (224-273)||(18618138-18618187)
chr8 (308-369)||(21199547-21199608)
chr8 (308-369)||(31195658-31195719)
chr8 (204-244)||(17151521-17151561)
chr8 (226-273)||(224301-224348)
chr8 (226-273)||(700714-700761)
chr8 (226-273)||(737924-737971)
chr8 (226-273)||(861819-861866)
chr8 (226-273)||(17151288-17151335)
chr8 (98-167)||(16194917-16194986)
chr8 (200-234)||(18618028-18618062)
chr8 (59-175)||(22144136-22144250)
chr8 (311-369)||(23148624-23148682)
chr8 (308-369)||(21192120-21192181)
chr8 (308-406)||(22737250-22737349)
chr8 (202-253)||(37654901-37654952)
chr8 (311-369)||(23835950-23836008)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (21-413)||(21392874-21393265)
chr5 (23-413)||(21652485-21652877)
chr5 (21-413)||(20710823-20711214)
chr5 (29-413)||(28258286-28258669)
chr5 (43-413)||(23510676-23511044)
chr5 (91-406)||(16534999-16535313)
chr5 (21-406)||(24184295-24184681)
chr5 (21-405)||(4863961-4864343)
chr5 (199-409)||(11582564-11582774)
chr5 (91-409)||(22884454-22884771)
chr5 (94-411)||(19404268-19404588)
chr5 (76-406)||(21649523-21649855)
chr5 (200-406)||(1169923-1170129)
chr5 (96-413)||(11338021-11338341)
chr5 (26-273)||(1169602-1169848)
chr5 (138-409)||(11341326-11341597)
chr5 (21-411)||(23453638-23454032)
chr5 (21-411)||(23465143-23465537)
chr5 (199-409)||(1221112-1221319)
chr5 (199-409)||(22367865-22368072)
chr5 (199-409)||(7424367-7424575)
chr5 (199-409)||(17473150-17473360)
chr5 (87-409)||(21234670-21234994)
chr5 (199-409)||(21074870-21075077)
chr5 (200-409)||(110364-110572)
chr5 (200-409)||(4201347-4201554)
chr5 (138-406)||(9731984-9732252)
chr5 (202-409)||(23513486-23513693)
chr5 (199-405)||(11044-11246)
chr5 (21-235)||(9731762-9731975)
chr5 (87-406)||(20615305-20615626)
chr5 (21-273)||(17472823-17473075)
chr5 (212-409)||(25192390-25192586)
chr5 (202-405)||(29192004-29192203)
chr5 (199-409)||(10779560-10779767)
chr5 (138-409)||(25425312-25425580)
chr5 (208-409)||(43445142-43445342)
chr5 (199-409)||(18779374-18779583)
chr5 (91-236)||(10779344-10779489)
chr5 (87-406)||(37051677-37051998)
chr5 (91-235)||(11318-11462)
chr5 (91-235)||(29191785-29191929)
chr5 (168-409)||(21933512-21933748)
chr5 (168-409)||(21939682-21939918)
chr5 (200-406)||(27185095-27185301)
chr5 (168-409)||(35580944-35581180)
chr5 (168-409)||(37010516-37010752)
chr5 (138-409)||(19498490-19498752)
chr5 (26-235)||(11582846-11583055)
chr5 (223-409)||(23327643-23327825)
chr5 (223-409)||(24595191-24595373)
chr5 (89-236)||(110145-110292)
chr5 (200-406)||(25901707-25901911)
chr5 (230-406)||(35792544-35792719)
chr5 (87-235)||(1220890-1221040)
chr5 (87-235)||(4201124-4201274)
chr5 (202-401)||(11212986-11213183)
chr5 (43-235)||(27184830-27185023)
chr5 (26-235)||(23513767-23513977)
chr5 (91-235)||(18779155-18779301)
chr5 (95-235)||(25425589-25425732)
chr5 (21-325)||(24474367-24474654)
chr5 (91-235)||(22367647-22367793)
chr5 (91-236)||(11341605-11341749)
chr5 (91-236)||(25901488-25901635)
chr5 (143-235)||(7424648-7424740)
chr5 (242-406)||(27008705-27008867)
chr5 (142-232)||(19498764-19498855)
chr5 (95-273)||(35792275-35792456)
chr5 (308-381)||(7727296-7727369)
chr5 (311-406)||(3672685-3672780)
chr5 (308-381)||(23492722-23492794)
chr5 (26-164)||(23505663-23505802)
chr5 (308-369)||(32967547-32967608)
chr5 (309-369)||(37189501-37189561)
chr5 (226-273)||(43445013-43445060)
chr5 (352-406)||(24470996-24471049)
chr5 (308-380)||(431149-431221)
chr5 (309-369)||(28888649-28888709)
chr5 (141-262)||(5452007-5452130)
chr5 (311-406)||(5452190-5452285)
chr5 (311-380)||(21615735-21615804)
chr5 (311-380)||(24226842-24226911)
chr5 (202-253)||(3672849-3672900)
chr5 (311-369)||(19860967-19861025)
[»] chr7 (83 HSPs)
chr7 (25-412)||(44863930-44864316)
chr7 (21-413)||(47288461-47288852)
chr7 (23-413)||(12544801-12545190)
chr7 (26-413)||(13867163-13867552)
chr7 (21-406)||(369580-369965)
chr7 (23-406)||(45453346-45453728)
chr7 (43-413)||(15823514-15823888)
chr7 (66-413)||(26071396-26071743)
chr7 (66-413)||(26095183-26095530)
chr7 (21-406)||(12753575-12753958)
chr7 (33-406)||(125520-125892)
chr7 (66-406)||(11285904-11286247)
chr7 (21-406)||(3893789-3894173)
chr7 (21-406)||(112381-112767)
chr7 (21-413)||(142313-142708)
chr7 (76-409)||(18981044-18981379)
chr7 (138-409)||(36051355-36051624)
chr7 (76-409)||(13757270-13757603)
chr7 (199-413)||(7291540-7291753)
chr7 (89-406)||(12249263-12249584)
chr7 (136-406)||(1937973-1938240)
chr7 (91-262)||(15851163-15851334)
chr7 (199-405)||(15952360-15952563)
chr7 (87-409)||(15442707-15443031)
chr7 (200-406)||(32495819-32496025)
chr7 (205-406)||(3058741-3058941)
chr7 (202-407)||(13038373-13038576)
chr7 (202-406)||(11582109-11582311)
chr7 (94-411)||(16571246-16571568)
chr7 (94-411)||(16594094-16594416)
chr7 (199-406)||(2027250-2027457)
chr7 (202-409)||(16210471-16210676)
chr7 (199-405)||(16417162-16417364)
chr7 (21-235)||(14252277-14252491)
chr7 (87-406)||(30263272-30263593)
chr7 (168-409)||(27102783-27103019)
chr7 (168-409)||(27110131-27110367)
chr7 (168-409)||(27175307-27175543)
chr7 (168-409)||(38784875-38785111)
chr7 (199-409)||(2191960-2192169)
chr7 (200-406)||(13912378-13912582)
chr7 (199-409)||(16480200-16480408)
chr7 (29-286)||(39047785-39048042)
chr7 (91-235)||(16417436-16417580)
chr7 (168-409)||(7821615-7821851)
chr7 (168-409)||(7828926-7829162)
chr7 (21-411)||(13273431-13273833)
chr7 (202-409)||(15926058-15926261)
chr7 (200-406)||(11514816-11515020)
chr7 (199-409)||(26010455-26010663)
chr7 (221-409)||(15525769-15525957)
chr7 (21-235)||(32495532-32495747)
chr7 (91-227)||(15952144-15952280)
chr7 (87-235)||(13912155-13912305)
chr7 (96-235)||(7291825-7291966)
chr7 (21-411)||(15629459-15629860)
chr7 (200-406)||(15761634-15761839)
chr7 (89-411)||(49048942-49049277)
chr7 (91-236)||(11515198-11515345)
chr7 (230-406)||(42057458-42057632)
chr7 (21-235)||(2027529-2027742)
chr7 (89-236)||(7285361-7285510)
chr7 (205-409)||(18255090-18255295)
chr7 (229-406)||(13571525-13571701)
chr7 (21-277)||(10861927-10862187)
chr7 (267-409)||(2436315-2436456)
chr7 (265-406)||(25293608-25293747)
chr7 (231-409)||(10988303-10988479)
chr7 (76-273)||(2191684-2191884)
chr7 (142-227)||(16480034-16480120)
chr7 (126-225)||(7285504-7285603)
chr7 (99-167)||(11582027-11582095)
chr7 (190-236)||(11515092-11515138)
chr7 (224-273)||(15761509-15761558)
chr7 (99-167)||(16210691-16210759)
chr7 (76-139)||(3048688-3048751)
chr7 (108-159)||(13038299-13038350)
chr7 (311-380)||(9058007-9058076)
chr7 (311-405)||(10862231-10862326)
chr7 (312-369)||(15913817-15913874)
chr7 (99-159)||(3058966-3059026)
chr7 (21-129)||(35093783-35093890)
chr7 (308-346)||(13376423-13376461)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (23-406)||(32897419-32897802)
chr6 (25-413)||(18431322-18431708)
chr6 (28-413)||(25645918-25646302)
chr6 (29-409)||(18569280-18569660)
chr6 (31-406)||(19984298-19984671)
chr6 (26-409)||(35016770-35017152)
chr6 (21-406)||(18775907-18776291)
chr6 (21-406)||(16105254-16105638)
chr6 (76-409)||(18087846-18088182)
chr6 (199-413)||(18004234-18004448)
chr6 (142-409)||(1658915-1659182)
chr6 (43-406)||(23151956-23152318)
chr6 (76-409)||(23976263-23976595)
chr6 (197-413)||(15736440-15736656)
chr6 (29-406)||(22430944-22431320)
chr6 (28-368)||(25745422-25745763)
chr6 (199-409)||(27655348-27655555)
chr6 (200-409)||(16827138-16827346)
chr6 (200-409)||(4989591-4989797)
chr6 (138-406)||(16230278-16230546)
chr6 (21-235)||(16230555-16230768)
chr6 (200-409)||(33315844-33316050)
chr6 (218-406)||(31627134-31627322)
chr6 (135-409)||(1651148-1651420)
chr6 (199-405)||(25174253-25174455)
chr6 (49-406)||(18397622-18397982)
chr6 (215-405)||(11214836-11215026)
chr6 (26-236)||(18824637-18824847)
chr6 (44-300)||(16084882-16085136)
chr6 (205-409)||(16239057-16239262)
chr6 (91-235)||(25174527-25174671)
chr6 (26-236)||(4989869-4990079)
chr6 (168-409)||(10487573-10487809)
chr6 (199-413)||(13622374-13622589)
chr6 (168-409)||(16377518-16377754)
chr6 (168-409)||(16384842-16385078)
chr6 (199-409)||(14627871-14628079)
chr6 (43-413)||(13015910-13016260)
chr6 (190-406)||(15861425-15861642)
chr6 (91-231)||(27655147-27655287)
chr6 (89-236)||(18840555-18840702)
chr6 (200-405)||(18825023-18825225)
chr6 (200-405)||(18843083-18843286)
chr6 (91-230)||(33315628-33315767)
chr6 (76-227)||(18004002-18004154)
chr6 (26-227)||(15736160-15736362)
chr6 (95-235)||(13622160-13622302)
chr6 (126-236)||(18824841-18824951)
chr6 (126-236)||(18840696-18840806)
chr6 (257-406)||(18128981-18129129)
chr6 (230-409)||(17343578-17343754)
chr6 (200-406)||(1554536-1554741)
chr6 (223-409)||(16557301-16557483)
chr6 (223-409)||(16650531-16650713)
chr6 (43-235)||(16826872-16827065)
chr6 (21-235)||(18582151-18582367)
chr6 (223-409)||(29870760-29870943)
chr6 (223-406)||(26088532-26088713)
chr6 (89-411)||(28195924-28196255)
chr6 (21-406)||(25368428-25368827)
chr6 (95-227)||(14627658-14627791)
chr6 (230-406)||(23993858-23994032)
chr6 (43-234)||(19628302-19628490)
chr6 (94-406)||(22866864-22867166)
chr6 (223-409)||(22226926-22227111)
chr6 (288-409)||(19609191-19609310)
chr6 (143-235)||(19609350-19609442)
chr6 (303-406)||(16084112-16084215)
chr6 (76-185)||(26088782-26088893)
chr6 (142-220)||(21776791-21776870)
chr6 (308-406)||(15738945-15739043)
chr6 (91-149)||(25903975-25904033)
chr6 (156-226)||(16301107-16301178)
chr6 (224-273)||(1554817-1554866)
chr6 (348-406)||(18741146-18741203)
chr6 (308-369)||(16889122-16889183)
chr6 (308-381)||(33323532-33323605)
chr6 (308-381)||(35137326-35137399)
chr6 (311-367)||(22846867-22846923)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (29-413)||(256001-256384)
scaffold0011 (29-398)||(262607-262975)
scaffold0011 (99-409)||(124454-124762)
scaffold0011 (99-409)||(75855-76163)
scaffold0011 (202-409)||(193303-193508)
scaffold0011 (99-166)||(193515-193582)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (24-406)||(71539-71921)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (29-413)||(6453-6837)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (21-413)||(25809-26200)
scaffold0037 (26-413)||(70486-70873)
scaffold0037 (94-267)||(93527-93701)
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (21-412)||(6147927-6148315)
chr3 (22-413)||(16183094-16183489)
chr3 (21-413)||(50113218-50113602)
chr3 (26-406)||(22145362-22145740)
chr3 (21-413)||(17099397-17099789)
chr3 (99-409)||(13816200-13816511)
chr3 (99-409)||(19571932-19572242)
chr3 (21-406)||(318695-319081)
chr3 (21-406)||(35122377-35122763)
chr3 (99-409)||(15860308-15860617)
chr3 (21-406)||(8630538-8630920)
chr3 (21-405)||(15469552-15469931)
chr3 (23-406)||(53899605-53899989)
chr3 (22-411)||(11198653-11199045)
chr3 (98-369)||(47786041-47786314)
chr3 (29-406)||(12350934-12351312)
chr3 (91-413)||(25057531-25057856)
chr3 (76-401)||(23491202-23491530)
chr3 (21-406)||(14297188-14297574)
chr3 (21-406)||(14302815-14303201)
chr3 (94-411)||(14294114-14294434)
chr3 (89-406)||(11062184-11062504)
chr3 (94-411)||(14299741-14300061)
chr3 (94-406)||(40938421-40938736)
chr3 (26-403)||(12562563-12562944)
chr3 (200-409)||(16819597-16819802)
chr3 (199-406)||(33340534-33340740)
chr3 (138-409)||(18909378-18909647)
chr3 (135-409)||(15574730-15575002)
chr3 (26-406)||(19945317-19945700)
chr3 (138-406)||(17957533-17957802)
chr3 (202-406)||(51159742-51159945)
chr3 (138-406)||(53769350-53769618)
chr3 (135-409)||(15613749-15614021)
chr3 (199-405)||(22273737-22273939)
chr3 (208-409)||(8269673-8269870)
chr3 (208-409)||(8276784-8276981)
chr3 (21-235)||(18909656-18909869)
chr3 (21-235)||(53769627-53769840)
chr3 (204-406)||(2048751-2048953)
chr3 (203-406)||(19230751-19230953)
chr3 (199-405)||(2450590-2450791)
chr3 (208-409)||(49230901-49231102)
chr3 (91-235)||(22274011-22274155)
chr3 (168-409)||(1468885-1469121)
chr3 (199-406)||(7852499-7852705)
chr3 (91-235)||(2450374-2450518)
chr3 (21-228)||(13837733-13837938)
chr3 (200-409)||(16745433-16745639)
chr3 (214-406)||(17913527-17913717)
chr3 (199-406)||(16259732-16259938)
chr3 (168-409)||(44228115-44228354)
chr3 (87-231)||(17957375-17957520)
chr3 (230-409)||(27839394-27839573)
chr3 (212-406)||(14522580-14522775)
chr3 (223-409)||(30152023-30152205)
chr3 (91-236)||(49231180-49231326)
chr3 (91-227)||(16819882-16820019)
chr3 (102-260)||(17937333-17937492)
chr3 (21-235)||(7852777-7852993)
chr3 (275-413)||(30205137-30205274)
chr3 (43-236)||(51159475-51159669)
chr3 (21-406)||(17138157-17138553)
chr3 (26-171)||(54423001-54423145)
chr3 (223-409)||(12265775-12265960)
chr3 (218-413)||(17523691-17523884)
chr3 (205-409)||(15939725-15939930)
chr3 (223-406)||(5227406-5227585)
chr3 (266-406)||(10737247-10737386)
chr3 (311-409)||(14846034-14846131)
chr3 (99-235)||(33340812-33340949)
chr3 (230-406)||(45859709-45859884)
chr3 (238-406)||(55315085-55315252)
chr3 (204-318)||(12031249-12031364)
chr3 (225-346)||(16935168-16935286)
chr3 (310-409)||(8305693-8305790)
chr3 (21-159)||(17523552-17523690)
chr3 (21-273)||(16260014-16260261)
chr3 (311-409)||(18905171-18905267)
chr3 (89-253)||(39654757-39654925)
chr3 (238-406)||(41268931-41269098)
chr3 (269-406)||(13976964-13977101)
chr3 (269-406)||(13956132-13956269)
chr3 (205-309)||(14843815-14843919)
chr3 (314-406)||(12951743-12951835)
chr3 (309-369)||(15874893-15874953)
chr3 (76-139)||(38167007-38167070)
chr3 (224-273)||(9303753-9303802)
chr3 (98-167)||(12031164-12031233)
chr3 (309-369)||(11330382-11330442)
chr3 (138-189)||(14522487-14522538)
chr3 (311-406)||(15516426-15516521)
chr3 (200-262)||(11883518-11883580)
chr3 (98-167)||(2048969-2049038)
chr3 (138-226)||(10737388-10737476)
chr3 (173-253)||(15516590-15516671)
chr3 (311-380)||(38812367-38812436)
chr3 (308-380)||(12490105-12490177)
chr3 (363-411)||(14287780-14287828)
chr3 (99-167)||(19230968-19231036)
chr3 (318-406)||(39654607-39654695)
chr3 (223-286)||(18897982-18898045)
chr3 (316-406)||(11883645-11883735)
chr3 (376-409)||(11813553-11813586)
chr3 (202-253)||(33370118-33370169)
chr3 (308-369)||(14060614-14060675)
chr3 (309-381)||(55442145-55442218)
chr3 (378-406)||(47786311-47786339)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (50-413)||(6232-6594)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (21-413)||(1925-2317)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (21-413)||(12826-13217)
scaffold0359 (21-262)||(161-400)
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (21-413)||(36891794-36892185)
chr2 (31-406)||(22273577-22273951)
chr2 (31-406)||(22282810-22283184)
chr2 (21-406)||(4449312-4449698)
chr2 (29-409)||(8942334-8942715)
chr2 (29-409)||(12637255-12637633)
chr2 (29-406)||(6878134-6878513)
chr2 (138-406)||(8886832-8887099)
chr2 (138-406)||(22862179-22862446)
chr2 (200-406)||(25600652-25600858)
chr2 (66-406)||(27260274-27260592)
chr2 (140-409)||(12726741-12727010)
chr2 (87-409)||(20013810-20014131)
chr2 (87-409)||(14907583-14907907)
chr2 (102-406)||(22581094-22581402)
chr2 (87-409)||(23818867-23819191)
chr2 (200-409)||(34822886-34823093)
chr2 (199-409)||(21275788-21275995)
chr2 (200-409)||(3800375-3800581)
chr2 (200-409)||(5889559-5889765)
chr2 (199-407)||(24966987-24967195)
chr2 (21-235)||(21275503-21275716)
chr2 (199-405)||(19888041-19888243)
chr2 (199-405)||(21140569-21140771)
chr2 (21-235)||(12643001-12643214)
chr2 (198-387)||(25877210-25877399)
chr2 (138-406)||(12643223-12643491)
chr2 (76-411)||(24572526-24572865)
chr2 (205-405)||(43644243-43644442)
chr2 (202-409)||(461426-461631)
chr2 (138-411)||(7320174-7320450)
chr2 (200-405)||(24827831-24828034)
chr2 (21-235)||(42179342-42179555)
chr2 (91-235)||(19887825-19887969)
chr2 (168-409)||(11232484-11232720)
chr2 (168-409)||(22514331-22514567)
chr2 (102-255)||(16900207-16900361)
chr2 (102-255)||(16993598-16993752)
chr2 (202-409)||(20628662-20628864)
chr2 (91-235)||(21140843-21140987)
chr2 (21-411)||(28972727-28973118)
chr2 (168-409)||(28776932-28777168)
chr2 (76-235)||(3800036-3800195)
chr2 (161-413)||(22691175-22691426)
chr2 (161-413)||(22695822-22696073)
chr2 (76-406)||(9653983-9654296)
chr2 (223-409)||(23773225-23773407)
chr2 (223-409)||(24686954-24687136)
chr2 (224-406)||(15632088-15632269)
chr2 (89-211)||(25211866-25211988)
chr2 (26-216)||(270035-270226)
chr2 (91-236)||(34823165-34823309)
chr2 (91-236)||(12727126-12727270)
chr2 (303-406)||(269878-269981)
chr2 (238-406)||(17397894-17398061)
chr2 (21-262)||(22787108-22787351)
chr2 (311-406)||(721162-721257)
chr2 (99-166)||(20628580-20628647)
chr2 (173-262)||(721317-721407)
chr2 (308-381)||(23822894-23822967)
chr2 (308-381)||(23824838-23824911)
chr2 (308-381)||(23831973-23832046)
chr2 (308-406)||(22787408-22787506)
chr2 (308-369)||(19670515-19670576)
chr2 (230-323)||(22693040-22693133)
chr2 (230-323)||(22697687-22697780)
chr2 (138-253)||(24088566-24088683)
chr2 (359-409)||(22692978-22693028)
chr2 (359-409)||(22697625-22697675)
chr2 (311-369)||(24088752-24088810)
chr2 (308-381)||(4663-4735)
chr2 (308-381)||(24295958-24296031)
chr2 (99-167)||(461646-461714)
chr2 (190-235)||(3800257-3800302)
chr2 (308-369)||(19658678-19658739)
chr2 (138-236)||(12727020-12727118)
chr2 (99-167)||(43644158-43644226)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (21-413)||(137897-138286)
scaffold0021 (21-413)||(87127-87504)
scaffold0021 (26-412)||(10351-10740)
scaffold0021 (358-413)||(77069-77124)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (31-406)||(32287-32660)
scaffold0184 (302-413)||(34037-34147)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (31-406)||(40184-40557)
scaffold0078 (199-413)||(38594-38807)
scaffold0078 (87-235)||(38372-38522)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (66-406)||(7485-7827)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (108-406)||(8125-8424)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (28-406)||(3318-3695)
scaffold0447 (28-82)||(8256-8309)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (28-406)||(5926-6303)
scaffold0383 (91-273)||(1336-1518)
scaffold0383 (200-406)||(1057-1262)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (65-406)||(7781-8123)
scaffold0195 (65-406)||(13170-13512)
scaffold0195 (138-406)||(20084-20351)
scaffold0195 (138-406)||(18000-18267)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (66-406)||(3352-3692)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (40-406)||(21351-21696)
scaffold0008 (205-406)||(129466-129668)
scaffold0008 (108-169)||(129390-129451)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (21-406)||(12891-13275)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (23-406)||(46819-47201)
scaffold0068 (23-406)||(60267-60649)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (21-383)||(44513-44875)
scaffold0034 (126-406)||(38903-39184)
scaffold0034 (95-409)||(78241-78558)
scaffold0034 (21-236)||(39178-39392)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (87-333)||(20446-20692)
scaffold0039 (379-409)||(20686-20716)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (21-406)||(52361-52743)
scaffold0018 (21-406)||(56313-56695)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (26-403)||(13283-13660)
scaffold0396 (230-409)||(16132-16311)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (21-406)||(236874-237261)
scaffold0009 (200-406)||(270813-271020)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (29-403)||(505-861)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (99-398)||(5770-6069)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (202-409)||(28574-28780)
scaffold0116 (26-273)||(28857-29104)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (91-406)||(27714-28028)
[»] scaffold0138 (6 HSPs)
scaffold0138 (21-409)||(14350-14735)
scaffold0138 (202-333)||(28261-28394)
scaffold0138 (202-333)||(40257-40390)
scaffold0138 (200-273)||(28472-28545)
scaffold0138 (200-273)||(40468-40541)
scaffold0138 (308-369)||(23801-23862)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (138-413)||(15064-15338)
scaffold0251 (21-235)||(14842-15055)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (166-413)||(14364-14613)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (142-413)||(32268-32541)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (200-413)||(95006-95219)
scaffold0044 (21-273)||(95294-95545)
scaffold0044 (242-406)||(66745-66907)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (76-406)||(54330-54653)
scaffold0032 (199-409)||(109344-109553)
scaffold0032 (95-148)||(14590-14645)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (190-409)||(18831-19050)
scaffold0234 (21-273)||(18510-18767)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (76-406)||(11062-11394)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (138-406)||(248741-249008)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (70-268)||(2925-3124)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (199-405)||(155618-155821)
scaffold0023 (91-235)||(155402-155546)
scaffold0023 (223-409)||(732-914)
scaffold0023 (267-409)||(35023-35163)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (87-409)||(2723-3045)
scaffold0124 (173-406)||(22940-23168)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (22-333)||(17485-17797)
scaffold0244 (21-333)||(23903-24216)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (190-406)||(145223-145438)
scaffold0025 (21-273)||(145502-145757)
scaffold0025 (203-406)||(147482-147685)
scaffold0025 (98-169)||(147698-147769)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (199-409)||(90147-90353)
scaffold0028 (200-409)||(129075-129281)
scaffold0028 (21-236)||(129353-129568)
scaffold0028 (99-235)||(89938-90075)
scaffold0028 (308-369)||(78410-78471)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (205-409)||(4530-4734)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (200-406)||(17340-17545)
scaffold0315 (91-235)||(17618-17764)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (205-409)||(27781-27983)
scaffold0162 (99-167)||(27696-27763)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (200-399)||(2395-2593)
scaffold0597 (76-231)||(2162-2319)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (87-409)||(25591-25915)
scaffold0141 (87-409)||(21336-21660)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (21-411)||(145616-146005)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (95-406)||(154-467)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (202-409)||(1873-2078)
scaffold1140 (99-166)||(2085-2152)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (202-409)||(6415-6620)
scaffold0218 (99-167)||(6332-6400)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (199-405)||(5874-6076)
scaffold0003 (204-406)||(217016-217218)
scaffold0003 (91-235)||(6148-6292)
scaffold0003 (99-167)||(216932-217000)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (204-409)||(2958-3163)
scaffold0761 (95-235)||(2740-2882)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (220-406)||(8771-8957)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (207-409)||(244-446)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (29-254)||(43051-43275)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (30-262)||(113652-113883)
scaffold0022 (21-406)||(108343-108739)
scaffold0022 (230-409)||(6441-6620)
scaffold0022 (308-381)||(106297-106370)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (200-406)||(41399-41605)
scaffold0132 (175-235)||(41677-41737)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (168-409)||(37977-38213)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (95-273)||(164-345)
scaffold1734 (202-286)||(1-86)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (203-406)||(40291-40487)
scaffold0106 (110-167)||(40502-40559)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (218-408)||(69456-69646)
scaffold0031 (218-406)||(30768-30957)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (89-411)||(6570-6906)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (42-273)||(23898-24128)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (76-235)||(1507-1666)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (200-406)||(1889-2095)
scaffold0610 (65-132)||(1817-1884)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (223-409)||(30041-30223)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (160-343)||(29942-30127)
scaffold0120 (21-169)||(18263-18410)
scaffold0120 (337-413)||(27260-27336)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (21-411)||(2540-2942)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (24-253)||(754-984)
[»] scaffold0269 (5 HSPs)
scaffold0269 (95-235)||(935-1077)
scaffold0269 (95-235)||(15191-15333)
scaffold0269 (296-406)||(771-880)
scaffold0269 (296-406)||(15027-15136)
scaffold0269 (21-130)||(12021-12129)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (230-409)||(106689-106867)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (173-406)||(6577-6805)
scaffold0750 (27-187)||(5515-5676)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (199-409)||(17353-17561)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (205-406)||(7673-7875)
scaffold0498 (99-169)||(7890-7960)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (223-406)||(11322-11504)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (203-406)||(4862-5067)
scaffold0266 (108-169)||(4788-4849)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (230-409)||(51719-51897)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (258-405)||(4823-4970)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (89-403)||(2114-2442)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (281-398)||(58899-59016)
scaffold0051 (147-260)||(59561-59675)
scaffold0051 (238-285)||(59375-59422)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (138-235)||(1575-1672)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (202-333)||(34334-34466)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (230-409)||(1078-1263)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (223-393)||(5700-5867)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (302-409)||(9291-9397)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (323-409)||(14987-15073)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (207-406)||(20391-20600)
scaffold0150 (207-406)||(27220-27429)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (279-406)||(4092-4218)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (279-406)||(48932-49058)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (292-406)||(4534-4648)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (21-155)||(53462-53593)
scaffold0066 (200-262)||(53141-53203)
scaffold0066 (224-273)||(53279-53328)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (315-406)||(197482-197572)
scaffold0004 (95-150)||(330964-331021)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (265-401)||(4469-4603)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (308-381)||(4728-4801)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (308-381)||(7041-7114)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (309-406)||(7290-7387)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (308-381)||(71655-71728)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (308-380)||(3667-3739)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (370-409)||(991-1030)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (207-262)||(429-484)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (311-406)||(6021-6116)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (308-369)||(4759-4820)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (308-380)||(117977-118049)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (138-259)||(23663-23786)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (308-358)||(12936-12986)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (309-368)||(78206-78265)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (199-249)||(6400-6450)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (311-369)||(34203-34261)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (230-294)||(2696-2761)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 87)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 460
Target Start/End: Original strand, 821196 - 821649
Alignment:
Q  20 cgccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  821196 cgccagttgccacttgatacggttt--ggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgaccaagtgaagttg 821293  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  821294 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtga 821393  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821394 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 821493  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg---------------attgttgtcgcattatcgag 404  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||||||||    
T  821494 gcaaatgttgtgaagataatcaatataattggatgttgtcgtatatattgaggtgaaaattgtggaggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgag 821593  T
Q  405 tccttgtacgagtcctttattatannnnnnnggtaattcaatagccttattatttt 460  Q
    |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  821594 tccttgtacgagtcctttattatctttttttggtaattcaatagccttattatttt 821649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44054997 - 44054612
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  44054997 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttat 44054898  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||| ||    
T  44054897 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcacgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaagctaaatgtaat 44054798  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44054797 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 44054698  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44054697 caaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 44054612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 33739339 - 33738948
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  33739339 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatattt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 33739241  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  33739240 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaagctatatgtgat 33739141  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  33739140 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 33739041  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33739040 caaatgttttggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 33738948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 45460040 - 45460432
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45460040 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 45460138  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45460139 atgattaaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgagat 45460238  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  45460239 agttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatttaattgtgtacggacatgttttcttgataat 45460338  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45460339 gcaaatgttgtagagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgtcgtcgcattattgagtccttgtac 45460432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16521863 - 16521479
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16521863 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16521765  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16521764 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 16521665  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16521664 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 16521565  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16521564 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16521479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 44345902 - 44345510
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  44345902 gccggtggccccttgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 44345804  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44345803 atgaatgaatgattgttttggatatgttgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgttgaaactatatgtgat 44345704  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  44345703 agttgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgatttcttgataat 44345604  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44345603 gcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcccatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 44345510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 12900853 - 12901240
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||||||| | |||||||  |||| | ||||| ||| |||||||||    
T  12900853 gccgtttgccacttgacacggattttggtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttatgatttgttgtgaccattcatgtatgactaattgaagttgt 12900951  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 217  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12900952 ataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 12901051  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12901052 gatagttgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgata 12901151  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901152 atgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 12901240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Original strand, 25120215 - 25120589
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25120215 acttgatatgggttttgatcggcgatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaat 25120314  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25120315 gattataatggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 25120413  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25120414 tgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 25120513  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25120514 tggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 25120589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 21960657 - 21961036
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||    |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21960657 ttgccacttgacatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgatctatcatgactatttttatatgactaagtgaagttgtatgaa 21960755  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21960756 tgaatgattgtattggatacgatgtttatcttgagatgtgtatgctaccttacttagaatgtatggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 21960855  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21960856 atgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 21960955  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | |||||| || |||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21960956 gatgtggagatgatcaatataatcaagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 21961036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 392
Target Start/End: Original strand, 30233626 - 30233998
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||    
T  30233626 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtggttactcttatatgactaagtaaatttg 30233723  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| |    
T  30233724 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggcgaaactatatgag 30233823  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30233824 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttgatgtggtgatgatgaatcttataatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 30233923  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30233924 atgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatcgaggtgaaaattgtggattgttgt 30233998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10643145 - 10642874
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10643145 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataac 10643046  T
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  10643045 attgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagat 10642947  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10642946 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 10642874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 409
Target Start/End: Original strand, 54119356 - 54119732
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||| ||| |  | ||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  54119356 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatattt-cttgagccaattatcttgtgagttatggtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 54119454  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  54119455 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcttgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtga 54119553  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||          |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  54119554 tagttgatgtggaatgacattgttgat----------catgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 54119643  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54119644 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 54119732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19999547 - 19999215
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatc 174  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  19999547 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 19999448  T
Q  175 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    |||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19999447 ttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 19999349  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    |||||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19999348 ggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagg 19999252  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19999251 ttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19999215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13245447 - 13245139
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13245447 ttatataactaagtgaaaatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 13245349  T
Q  199 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  13245348 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattgtgt 13245249  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13245248 gtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtttcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 13245151  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  13245150 tatcgagtcctt 13245139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 14995202 - 14994888
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| |    
T  14995202 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatat 14995103  T
Q  188 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatga 286  Q
     | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  14995102 ga-gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatga 14995004  T
Q  287 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggat 386  Q
     ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14995003 tttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatctatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggat 14994907  T
Q  387 tgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14994906 tgttgtcgcattatcgagt 14994888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Original strand, 53706054 - 53706261
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||     
T  53706054 tggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgg 53706153  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  53706154 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattattattgcattatc 53706253  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  53706254 gagtcctt 53706261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 5683906 - 5684088
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5683906 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 215 - 406
Target Start/End: Original strand, 53909047 - 53909238
Alignment:
Q  215 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| || || |||||||||||||    
T  53909047 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttg 53909146  T
Q  315 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909147 ataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 53909238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 413
Target Start/End: Original strand, 7133711 - 7133924
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  7133711 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 7133810  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||    
T  7133811 ggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaaatgttgtcgcatta 7133910  T
Q  400 tcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||    
T  7133911 tcgagtccttgtac 7133924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10487682 - 10487358
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  10487682 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 10487583  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  10487582 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 10487484  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  10487483 tatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 10487385  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10487384 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 10487358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 357
Target Start/End: Original strand, 23271015 - 23271342
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23271015 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaa 23271111  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    || ||||| ||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23271112 tggatgatcgtattggatatgatggttgtcatgagatatgtatgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtt 23271210  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||| |||||| ||    
T  23271211 gatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatgatgaatactacgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgttaatgc-aa 23271309  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 357  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||    
T  23271310 tgttgtgaagataattaatataattgaatgttg 23271342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18167686 - 18167481
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  18167686 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgt 18167589  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  18167588 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 18167491  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  18167490 tcgagtcctt 18167481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 16329069 - 16329393
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  16329069 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 16329168  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16329169 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 16329267  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  16329268 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 16329366  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16329367 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 16329393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 9294419 - 9294212
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  9294419 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 9294320  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9294319 gagcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 9294222  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  9294221 tcgagtcctt 9294212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 15288271 - 15288479
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15288271 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 15288370  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  15288371 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcatt 15288468  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  15288469 atcgagtcctt 15288479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 205 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110171
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggca 110272  T
Q  305 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  110271 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 110173  T
Q  405 tc 406  Q
    ||    
T  110172 tc 110171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 15273958 - 15274226
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15273958 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15274056  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  15274057 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 15274155  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15274156 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 15274226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 15273736 - 15273949
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15273736 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 15273834  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15273835 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15273934  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  15273935 agttgatgttgaatg 15273949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 14950914 - 14950707
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||  || |    
T  14950914 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattttgtgt 14950815  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  14950814 gggcatgttttcttgataatgc-aatattgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 14950717  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  14950716 tcgagtcctt 14950707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 22355826 - 22356033
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  22355826 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 22355925  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||    
T  22355926 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataaccaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaactgttgtcgcatta 22356023  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  22356024 tcgagtcctt 22356033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 8373249 - 8373042
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  8373249 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 8373150  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  8373149 gggcatgttctcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 8373051  T
Q  400 tcgagtcct 408  Q
    |||||||||    
T  8373050 tcgagtcct 8373042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 214 - 406
Target Start/End: Original strand, 8873770 - 8873961
Alignment:
Q  214 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  8873770 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtatgggcatgttttctt 8873869  T
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8873870 gataatgcaaattttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 8873961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 15295381 - 15295589
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15295381 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 15295480  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  15295481 tgggcatgttttcttgagaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agtttgtgaattgttgtcgcatt 15295578  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  15295579 atcgagtcctt 15295589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18247083 - 18246881
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  18247083 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 18246986  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  || ||||||||||    
T  18246985 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgattttttgtcgcatt 18246888  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  18246887 atcgagt 18246881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 47356214 - 47356013
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||    
T  47356214 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggaatg 47356115  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47356114 ttttcttgataatgcaa-taatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 47356016  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  47356015 ctt 47356013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 202 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34393948 - 34393744
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  34393948 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 34393849  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
      |||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34393848 gacatgttttcttgataaagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattat 34393750  T
Q  401 cgagtc 406  Q
    ||||||    
T  34393749 cgagtc 34393744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18247299 - 18247155
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18247299 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 18247200  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18247199 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 18247155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 138 - 411
Target Start/End: Original strand, 18495604 - 18495880
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18495604 ttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgctctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatg 18495703  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  18495704 acattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgggtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtgaag 18495803  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  18495804 atgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggaaagatgtcgcattatcgagtctttgt 18495880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 406
Target Start/End: Original strand, 5684153 - 5684370
Alignment:
Q  190 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgag 287  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||     
T  5684153 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgat 5684252  T
Q  288 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 387  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  5684253 ttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggacaaaattgt-gatt 5684351  T
Q  388 gttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||||    
T  5684352 gttgtcgcattatcgagtc 5684370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26338355 - 26338173
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  26338355 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 26338259  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26338258 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 26338173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Original strand, 7133479 - 7133631
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 174  Q
    |||| |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7133479 cttacgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 7133578  T
Q  175 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7133579 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15212239 - 15212032
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| ||    
T  15212239 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgt 15212140  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||    
T  15212139 gtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatataatcggatgttgtcctatatattgtggataaaattgt-aattgttgtcgcat 15212041  T
Q  398 tatcgagtc 406  Q
    |||||||||    
T  15212040 tatcgagtc 15212032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9294638 - 9294491
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  9294638 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 9294539  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9294538 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatga 9294491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 18294100 - 18294354
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  18294100 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtataactaagtgaagttgt 18294198  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattg--gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||| ||||| ||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  18294199 atgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatcgtgaaactatatgt 18294298  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18294299 gatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19698447 - 19698657
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19698447 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19698544  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 218  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698545 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19698641  T
Q  219 atagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  19698642 atagttgatgttgaat 19698657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19709032 - 19709242
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  19709032 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 19709129  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 218  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19709130 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 19709226  T
Q  219 atagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  19709227 atagttgatgttgaat 19709242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26679152 - 26679002
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26679152 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 26679053  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26679052 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 26679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15212523 - 15212413
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212523 tgaatgattgtattagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 15212424  T
Q  226 atgttgaatga 236  Q
    |||||||||||    
T  15212423 atgttgaatga 15212413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18167903 - 18167766
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaa 189  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18167903 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgtattggatatgatgtttatcaagagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 18167804  T
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167803 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 22355604 - 22355754
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||    
T  22355604 ttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaa 22355703  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22355704 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 22355754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26678929 - 26678732
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| | | ||| ||||    
T  26678929 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattgtgtat 26678830  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||          |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  26678829 gggcatgt----------atgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcatta 26678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 411
Target Start/End: Original strand, 13810709 - 13811103
Alignment:
Q  30 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||| || | || ||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13810709 cacttgatacggtatt--gtcggaaatggttcttttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatggatga 13810806  T
Q  129 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| | | |||||||||||||||  ||| |||||| || | ||| ||| |  | ||||     
T  13810807 atgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttcttttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaattatctcaggtagtg 13810906  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||   ||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||| |||||||    
T  13810907 gatgttgaatgacgttgttgattgttgatgatcatgttgatgatgtaataaagaatcatatttgaattatgatttggttgtgtatggacatgatttcttg 13811006  T
Q  315 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||| ||||    
T  13811007 ataatggaattgttgtggaaataatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtaatgtcgcattatcgagtctttgt 13811103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Original strand, 13049455 - 13049630
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  13049455 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 13049553  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13049554 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 55377673 - 55377873
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  55377673 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttaagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtaaaat 55377771  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  55377772 tgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagataagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatacgtgatagtt 55377871  T
Q  225 ga 226  Q
    ||    
T  55377872 ga 55377873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 190 - 356
Target Start/End: Original strand, 18294418 - 18294580
Alignment:
Q  190 agaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagt 288  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||      |||||| |||||  ||||| |    
T  18294418 agaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgt-----ggtgatgatgaatgttatgatt 18294512  T
Q  289 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 356  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||    
T  18294513 taattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtt 18294580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 8044153 - 8044021
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  8044153 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 8044054  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8044053 gacatgttttcttgataatgcaaatgatgtgga 8044021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 95 - 222
Target Start/End: Original strand, 18251103 - 18251232
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18251103 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaagga 18251202  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatag 222  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18251203 atgtttgaatagtgaaattatatgtgatag 18251232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15212419 - 15212311
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15212419 tgaatgattgtaatagatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctaaga-acttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttg 15212321  T
Q  226 atgttgaatg 235  Q
    ||||||||||    
T  15212320 atgttgaatg 15212311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 15288106 - 15288198
Alignment:
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15288106 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatttgatagttgatgtttaatg 15288198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Original strand, 15295216 - 15295308
Alignment:
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15295216 tatgatgtatatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 15295308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 167
Target Start/End: Original strand, 53705902 - 53706039
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53705902 ccacttgatatggtttttagtcggaaatgttt-ctcgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 53706000  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53706001 atgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53706039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34394156 - 34394020
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34394156 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 34394058  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  34394057 acattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 18109838 - 18110038
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 172  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| || | || | |      
T  18109838 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatgagatattgttttccc 18109937  T
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  18109938 tattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 18110036  T
Q  272 tg 273  Q
    ||    
T  18110037 tg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 165
Target Start/End: Original strand, 8873631 - 8873774
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| || ||| |||| |||  |||||| | ||||||||||| |    
T  8873631 gccggtggccagttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaacggtggtgactatgtttatataactaagtgaagttat 8873729  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8873730 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtg 8873774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19019617 - 19019506
Alignment:
Q  42 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 141  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||     
T  19019617 ttttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattatcttatgagttgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgt-ttga 19019520  T
Q  142 atatgatgtttatc 155  Q
    || |||||||||||    
T  19019519 atgtgatgtttatc 19019506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 53908963 - 53909031
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53908963 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgta 53909031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 413
Target Start/End: Original strand, 13751694 - 13751769
Alignment:
Q  338 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13751694 atcaatataattgggagttgtgttatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 13751769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 43282757 - 43282855
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  43282757 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 43282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 52266840 - 52266938
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  52266840 tttcttgataatgcaattgttgtagagatgatcaatatatttggaagttatcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 52266938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 15212611 - 15212552
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaat 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  15212611 tgaatgattgtatgggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaat 15212552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 15852696 - 15852769
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  15852696 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 15852769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19019439 - 19019390
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19019439 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8373415 - 8373321
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || | || |||||||| |||| | | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373415 atatgatatttatcatgagatgttgttttctctcttacttggaatatga-gaatgctggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8373478 - 8373431
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8373478 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15043721 - 15043631
Alignment:
Q  316 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15043721 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15043631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 316 - 406
Target Start/End: Original strand, 15110703 - 15110793
Alignment:
Q  316 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  15110703 taatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 15110793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 226 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356297
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgat 47356297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 110456 - 110391
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 164  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| ||||    
T  110456 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27959820 - 27959759
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27959820 tttcttgataatgcaaacgtagtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 27959759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 34197544 - 34197605
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34197544 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaccaatatatttggaagttgtcctttatattg 34197605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 261
Target Start/End: Original strand, 18110114 - 18110176
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgt 261  Q
    ||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18110114 gaatggttaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgt 18110176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 361
Target Start/End: Original strand, 37958436 - 37958489
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  37958436 tttcttgataatgcaaatgttgtagagatgatcaatatatttggaagttgtcct 37958489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 41167314 - 41167375
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| | |||||| | |||||||    
T  41167314 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcatttatattg 41167375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15043898 - 15043789
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||| |||| | |  |||| ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  15043898 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15043799  T
Q  240 tgttgattat 249  Q
    || |||||||    
T  15043798 tgatgattat 15043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Original strand, 15110526 - 15110635
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||| |||||||| | |||| |||| | |||||||| |||| | |  |||| ||| | |||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    
T  15110526 gatatgatatttatcataagatgtttatgttctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatat 15110625  T
Q  240 tgttgattat 249  Q
    || |||||||    
T  15110626 tgatgattat 15110635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 41257728 - 41257797
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||| || || || ||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||||||||    
T  41257728 cttgataatgcaattgtggttgagatgatcaatataattggaagttatcctttatattgttgtgaaaatt 41257797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 208 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15212633 - 15212605
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15212633 aactatatgtgatagttgatgttgaatga 15212605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Original strand, 22407286 - 22407676
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  22407286 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttatat 22407385  T
Q  123 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22407386 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatag 22407485  T
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22407486 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 22407585  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407586 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatccagtccttgtac 22407676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 26 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 49966717 - 49966331
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49966717 ttgccacttgatacggtttttggtgcaaaatgttttcttgagtcaattaccttgtgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 49966618  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49966617 tga-tgattgtatttgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaatagttg 49966519  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49966518 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtttatggacatgttttcttgataatgcaaat 49966419  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966418 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 49966331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18506422 - 18506043
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18506422 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatggtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatg 18506324  T
Q  128 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18506323 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18506224  T
Q  228 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  18506223 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttacttgtgtgtgggcat-ttttcttgataatgctaatgt 18506125  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18506124 tgcggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18506043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 2422065 - 2422445
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  2422065 ttgccacttgacacggtctttggtcgcaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttctgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgac 2422163  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2422164 tgaatgattgtattgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttactcaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 2422263  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2422264 gatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 2422363  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2422364 tgtggtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaagttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 2422445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 55 - 406
Target Start/End: Original strand, 44036024 - 44036373
Alignment:
Q  55 atgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036024 atgttttcttgagtcaattaccttagaaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttat 44036123  T
Q  155 catgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44036124 catgagatgtgtatgctatcttact-agaatataaggaatg-ttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 44036221  T
Q  254 aatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggat 353  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |    
T  44036222 aatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggt 44036321  T
Q  354 gttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44036322 gttgtcctatacattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 44036373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 409
Target Start/End: Original strand, 15862592 - 15862908
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15862592 gattattcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatttttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 290  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15862692 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttg 15862791  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
     ||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  15862792 attgtgtgtgggcatgtttccttgataatgc-aatgttgtggagatattcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgtt 15862889  T
Q  391 gtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15862890 gtcgcattatcgagtcctt 15862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 21 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41211119 - 41210732
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  | || |||| || ||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  41211119 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtttt-ttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgattatgtttatataactaagtgaagttgt 41211021  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  41211020 atgaaggaatgattgttttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttgggatgtaagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtga 41210922  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||||||||    
T  41210921 tagttggcgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttgataat 41210822  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41210821 gcaaatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 41210732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21717271 - 21716895
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21717271 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgtttt-ttgagcgaattgtcttatgaattattgtgaatattcttatatgacgaagtgaagttgtatgaa 21717174  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  21717173 tgaatgattgtattggacatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagtt 21717074  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||||    
T  21717073 gatgttgaatgacattgttg---attgataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgtttttttgataatgcaaa 21716977  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21716976 tgttgtggagatgagcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 21716895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35053909 - 35053532
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35053909 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatg 35053811  T
Q  128 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  35053810 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagtt 35053711  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35053710 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 35053613  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35053612 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagtc 35053532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 35523508 - 35523894
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  35523508 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgagccaatttacttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 35523606  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||     
T  35523607 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaaccatatga 35523706  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  35523707 gataaatgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgcgtatggacatgttttcttgata 35523805  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35523806 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 35523894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 5675690 - 5676074
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5675690 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 5675788  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5675789 atgaatgaataattgtgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttaccttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 5675888  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||  |||  |||   |||||||||||||||||    
T  5675889 tagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatgaattgattgtatatagacatgttttcttgataat 5675988  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5675989 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5676074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 409
Target Start/End: Original strand, 22250113 - 22250430
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  22250113 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 22250211  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagt 288  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  22250212 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatt 22250310  T
Q  289 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 388  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  22250311 taattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtagtcctatatattgtggagaaaattgt-gattg 22250409  T
Q  389 ttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22250410 ttgtcgcattatcgagtcctt 22250430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17147801 - 17147468
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17147801 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 17147702  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  17147701 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 17147603  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17147602 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 17147505  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17147504 ttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 17147468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 108 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41218442 - 41218143
Alignment:
Q  108 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtga 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  41218442 taagtgaagttgtatgtatgaatgattgtattggatatgattttgatcatgagaggtgtaggctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtga 41218343  T
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg-ttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 305  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  41218342 aactatatgtgattgttgatgtagaataacaatgattgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgatttaattgtgtatgagcat 41218243  T
Q  306 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41218242 gttttcttgataatgcaaataatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagt 41218144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 136 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21858515 - 21858246
Alignment:
Q  136 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858515 tattggatatgatgtttagcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgttagaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 21858417  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  21858416 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggag 21858317  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21858316 gtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 21858246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 125 - 409
Target Start/End: Original strand, 20894886 - 20895169
Alignment:
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagt 223  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||  |||  ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20894886 atgaatgattgtgtttgatatgatatttatcatgagatgtgtaagctaccttacttaaaatgtaagaaatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagt 20894985  T
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  20894986 tgatgt-gaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 20895084  T
Q  324 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20895085 -tgttgtggagataatcaatataattgtgtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtggcattatcgagtcctt 20895169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22353279 - 22353097
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22353279 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22353179 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 22353097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 95 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22365757 - 22365441
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | |  |||||||| |||| | | |    
T  22365757 attcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctcttacttggaatatga-g 22365659  T
Q  192 aatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||| |||||| ||    
T  22365658 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgattt 22365560  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||    
T  22365559 aattgtgtatgaacatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgt 22365461  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22365460 tgtcgcattatcgagtcctt 22365441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 45050642 - 45050370
Alignment:
Q  135 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45050642 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 45050544  T
Q  234 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  45050543 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 45050445  T
Q  334 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45050444 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 45050370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 20826428 - 20826696
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20826428 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 20826526  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  20826527 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 20826625  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20826626 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 20826696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 20826206 - 20826419
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  20826206 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 20826304  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20826305 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 20826404  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  20826405 agttgatgttgaatg 20826419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845939
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||| ||  | ||| |    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaattatgaatggg 37845836  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37845837 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggaggtaaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 37845935  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  37845936 agtc 37845939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 51657400 - 51657805
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaat-gttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||   || ||||||||  ||||||| |  | |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  51657400 gccggttgccacttggtacggtatt--gtcggaaatagttcatttaagtcaattgtcttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttg 51657497  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatat 215  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||    
T  51657498 tatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgttctcttacttagaatgtaaccaatgcttgaaatggtgaaaatatat 51657597  T
Q  216 gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcat 305  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||         | ||||| ||  ||| |||||  |||    
T  51657598 gaggtggttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttaattgaattatgatttgattgtgtatggacat 51657697  T
Q  306 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||    
T  51657698 gatttcatgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgttgcattatcgagt 51657797  T
Q  406 ccttgtac 413  Q
    | ||||||    
T  51657798 ctttgtac 51657805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 409
Target Start/End: Original strand, 7641803 - 7642068
Alignment:
Q  140 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat-gctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 237  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7641803 ggatgtgatgattatcatgagatgtattttgctatcttacttggaatgtga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataac 7641900  T
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||     
T  7641901 attgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggtatgttttcttgataatac-aatgttgtggagatc 7641997  T
Q  338 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7641998 atcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 7642068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22353015 - 22352814
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  22353015 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 22352916  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22352915 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgttgtttgttgtcgcattatcgagtc 22352817  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  22352816 ctt 22352814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51451623 - 51451299
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  51451623 ttgtgattattcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 51451524  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| | |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| |    
T  51451523 aatatga-gaatgcatgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgc 51451425  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| |||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  51451424 tatgatttaattgtttatgggcatgttctcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 51451326  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  51451325 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 51451299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 9785340 - 9785707
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||   ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  9785340 gccggtggccacttgatatggtttttggtaaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgtagttgt 9785438  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9785439 atgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 9785528  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  9785529 tagttgatgttgaataacattgttga-------taatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgtgcatgctttcttgataat 9785621  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| |  | |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9785622 gcaaatgatgtggagaggaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9785707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444442
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20444539  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20444538 catgttttcttgataatgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20444442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530207
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20530304  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20530303 catgttttcttgataatgcaaatcatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattat-gattgttgtcgcattat 20530207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526808
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggg 20526911  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||| || | |||||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20526910 catgtcttcttgataatgtaaatcatgtggagatgaacaatataactgggtggtgtcctatatattgtggagaaagttgt-gattgttgtcgcattatcg 20526812  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  20526811 agtc 20526808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 18060885 - 18061085
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  18060885 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 18060984  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18060985 tttccttggtaatgc-aatgttgtggatataatcaatataattgggtgtagtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 18061082  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  18061083 ctt 18061085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 27330861 - 27331088
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27330861 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattacattataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 27330958  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||  |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  27330959 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgcta--ttgattagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 27331056  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattatt 250  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27331057 atagttaatgttgaatgacattgttgattatt 27331088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 17003747 - 17003511
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  17003747 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 17003650  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    || |||| ||||| |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17003649 tgggatgatgaattctatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 17003553  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17003552 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 17003511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22034717 - 22034535
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22034717 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22034621  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22034620 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22034535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 21651228 - 21651412
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||     
T  21651228 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgcatgggcatgttgtcttgataatgc- 21651326  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21651327 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 21651412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 41393346 - 41393138
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||  ||  || ||     
T  41393346 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaactgtgtg 41393247  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    |   ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  41393246 tagacatgtttccttgataatgc-aatgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatactgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 41393149  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  41393148 atcgagtcctt 41393138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20930367 - 20930163
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| || |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || | ||| |||||    
T  20930367 ggtgaaactatatgtgatagttgatgaatgaaggaccttattgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgattttaattgtgtatg 20930268  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20930267 agcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattat 20930169  T
Q  401 cgagtc 406  Q
    ||||||    
T  20930168 cgagtc 20930163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22029566 - 22029383
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22029566 ttgatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22029470  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22029469 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22029383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22226846 - 22226667
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  22226846 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 22226748  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22226747 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22226667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Original strand, 18602351 - 18602518
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  18602351 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 18602449  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18602450 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 18602518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Original strand, 5073608 - 5073775
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  5073608 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 5073706  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  5073707 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattggtgtcgcattatcgagtc 5073775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 20956127 - 20956278
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||    
T  20956127 gtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaat 20956226  T
Q  186 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    || |  |||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20956227 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 371
Target Start/End: Original strand, 20121965 - 20122098
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  || |||||||  ||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  20121965 attgttgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgaggaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 20122063  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20122064 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgag 20122098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 223 - 294
Target Start/End: Original strand, 22031007 - 22031078
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  22031007 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttatttg 22031078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 38034997 - 38035070
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  38034997 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 38035070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 22836628 - 22836723
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||   || |||||||||||||||||    
T  22836628 cttggtaatgcaattgttgtggaaatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattatgaggtgatgtcgcattatcgagtc 22836723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27673641 - 27673543
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  27673641 tttcttgataatacaattgttttggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtggtgtcgcattatcgagtc 27673543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20253295 - 20253246
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20253295 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 36357713 - 36357786
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  36357713 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 36357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 37845654 - 37845722
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37845654 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 37845722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 383
Target Start/End: Original strand, 20956341 - 20956416
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 383  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  20956341 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtg 20956416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 262
Target Start/End: Original strand, 22836478 - 22836568
Alignment:
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  22836478 tcttacttagaatgtgagaaacacttgaaatggaaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgtt 22836568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19601972 - 19601911
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19601972 tttcttgacaatgcaaatgttgtggagatcatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19601911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20930450 - 20930380
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| || | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20930450 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatggttatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 20930380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 37235336 - 37235405
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| || ||||  |||||||||    
T  37235336 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttaaattgttgtgaaaatt 37235405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20444721 - 20444653
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20444721 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20444653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20527092 - 20527025
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20527092 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt-agtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20530486 - 20530418
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20530486 ttatataactaagtgaaattgtataaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 20530418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27673740 - 27673692
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27673740 tgaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatatggttgattattgat 27673692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 5471758 - 5471816
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5471758 cttgataatgcaattgtggtggaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 5471816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 380
Target Start/End: Original strand, 8539328 - 8539396
Alignment:
Q  312 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8539328 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8539396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 380
Target Start/End: Original strand, 8604567 - 8604635
Alignment:
Q  312 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||| || | |||||||  |||||||||    
T  8604567 ttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttatcatttatattgtcgtgaaaatt 8604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 26 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25121614 - 25121227
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  25121614 ttgccacttgatacggtttttggtcaaaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtataaa 25121515  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25121514 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgcatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagttg 25121415  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25121414 atgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 25121315  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25121314 gttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 25121227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 19994234 - 19994626
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  19994234 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaatcaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 19994332  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19994333 atgaatgaatgattgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 19994432  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19994433 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 19994532  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    | |||||   |||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19994533 gtaaatgaaatggagataatcaatatagttgtgtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtccttgtac 19994626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 413
Target Start/End: Original strand, 22322525 - 22322909
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22322525 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttttcttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 22322624  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22322625 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagaggtgtatgctatcttacctagtatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccacatgtgatagttgatg 22322724  T
Q  229 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22322725 ttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttaataatgc-aatgt 22322823  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22322824 tgtggaggtaatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattatggattattgtcgcattatcaagtccttgtac 22322909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 99 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41245662 - 41245348
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41245662 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgctt 41245563  T
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||||||||| ||  ||| |||    
T  41245562 gaatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatgaattgattgtgta 41245463  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41245462 tggacatgttttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatataattgggagtagtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 41245363  T
Q  399 atcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||    
T  41245362 atcgagtccttgtac 41245348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 29759358 - 29758984
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759358 acttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 29759259  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29759258 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatataaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 29759160  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  29759159 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 29759060  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | ||| |||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29759059 tggagatgaacaacataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 29758984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 24718564 - 24718887
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 185  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| ||||    
T  24718564 ttgtgattatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaat 24718663  T
Q  186 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactat 284  Q
     | | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24718664 atga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactat 24718762  T
Q  285 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 384  Q
    || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24718763 gatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtgg 24718862  T
Q  385 attgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  24718863 attgttgtcacattatcgagtcctt 24718887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37610443 - 37610059
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37610443 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcgtatatgactaagtgaagttgt 37610346  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37610345 atgaatgaataattgtgttagatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatcggtgaatctatatgtga 37610246  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  37610245 tagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataa 37610146  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37610145 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37610059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 43 - 406
Target Start/End: Original strand, 20648541 - 20648906
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattg-- 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | |||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||       
T  20648541 ttttggccggaaatgttt-cttgagccgattggcttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattttt 20648639  T
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20648640 gatatgatgtttatcatgagttgggtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacat 20648739  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  20648740 tgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgggtatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 20648839  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20648840 caatataattgggagttgttctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 20648906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Original strand, 43374782 - 43375051
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374782 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 43374881  T
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  43374882 attgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagata 43374979  T
Q  338 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43374980 atcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 43375051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20480748 - 20480365
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  20480748 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaactgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 20480650  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  20480649 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaatttgtgaaattatatgt 20480550  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || |||||  ||||| ||| ||| ||||   ||||||||||| |||    
T  20480549 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgttatgatttaattgtgtatagacatgttttctttata 20480452  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20480451 atgcaaatgttgtggagatgaacaatataattaggtgttgtcctatatattgtggtgaaaa-tgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20480365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Original strand, 20655158 - 20655491
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    |||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  || ||||| |||    
T  20655158 cttatgaattattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagttgggtatggtat 20655257  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20655258 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgat 20655357  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  20655358 gatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtgg 20655457  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20655458 tgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 20655491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 409
Target Start/End: Original strand, 3432661 - 3433044
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||  |||    
T  3432661 gccgtttgccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaa--tgt 3432757  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  3432758 atgaatgaatgattgtattggatatgatatttatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtg 3432855  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3432856 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataa 3432955  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3432956 tgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3433044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Original strand, 24386843 - 24387175
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  24386843 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgagaagtgtatgctat 24386942  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    ||||||||  |||||| ||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  24386943 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaat 24387042  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  24387043 gatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatacaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgg 24387142  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24387143 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24387175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 94 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 16417266 - 16416945
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  16417266 tattcttatatgactaagtgaaattgtatgattgaatgattgtatgagatatgatgcttatcgtgagatgtgcatgctaccttacttaggatgtaagaaa 16417167  T
Q  194 tacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttat 291  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||     
T  16417166 tgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaa 16417067  T
Q  292 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 391  Q
    ||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16417066 ttgtgcgtggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggataattg 16416967  T
Q  392 tcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  16416966 tcacattatcgagtctttgtac 16416945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Original strand, 16874074 - 16874407
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  16874074 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 16874173  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  16874174 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 16874272  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16874273 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 16874370  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16874371 ttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 16874407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21680209 - 21679889
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  21680209 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 21680111  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  21680110 aatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgattt 21680011  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
      ||| |||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  21680010 cattgtgtatggacatgttctcttgataatgcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcatctatattgtggtgaaaattgtggattgt 21679911  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  21679910 tgtcgcattatcgagtctttgt 21679889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 91 - 409
Target Start/End: Original strand, 22007638 - 22007948
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |  |    
T  22007638 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttaacatgagatgtgtatgctatcttacttggaatat-ga 22007736  T
Q  191 gaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagt 288  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  22007737 gaatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattg-------ttgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaattctatgatt 22007828  T
Q  289 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 388  Q
    || ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22007829 taattgtgtatgggaatgttttcttgataatgc-aatgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattg 22007927  T
Q  389 ttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22007928 ttgtcgcattatcgagtcctt 22007948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 406
Target Start/End: Original strand, 20568356 - 20568734
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20568356 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20568454  T
Q  129 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    || |||||||  |  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20568455 ataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20568553  T
Q  227 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20568554 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaat 20568653  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20568654 gttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20568734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 29 - 406
Target Start/End: Original strand, 20574549 - 20574927
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||   | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20574549 ccacttgacacggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattatcttatgaaatatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 20574647  T
Q  129 atgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    || |||||||  |  |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |   ||  |  |||||||| |||| ||| ||||||  |    
T  20574648 ataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggtgagactacatgagatagtaaa 20574746  T
Q  227 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||| |  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20574747 tgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatatggtgatgatgagtgttatgatttgattgtgtatggacatgctttcttgataatgcaaat 20574846  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574847 gttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 20574927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21696639 - 21696253
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || ||||||||  ||||||  |  | |||| |||||||| |||  |||||||||||||    
T  21696639 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttaagtcaattgtcttatgt-tcatcgtgactattcttacatggctaagtgaagttgt 21696543  T
Q  121 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||      
T  21696542 atgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatataa 21696443  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 316  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||  ||||| || |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  21696442 ggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgcgataatgaatcttatgatttgtttgtgtatgggcatattttcttgat 21696343  T
Q  317 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21696342 aatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaatactgtggattgatgttgcattatcgagtc 21696253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 6775492 - 6775701
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6775492 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 6775591  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||    
T  6775592 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgttgcatt 6775690  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  6775691 atcgagtcctt 6775701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 5237207 - 5236883
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  5237207 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 5237108  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  5237107 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 5237009  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  5237008 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 5236910  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5236909 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 5236883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 24662391 - 24662715
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  24662391 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 24662490  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  24662491 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 24662589  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  24662590 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 24662688  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  24662689 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 24662715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 412
Target Start/End: Original strand, 22908745 - 22908956
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |    
T  22908745 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttg--t 22908842  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  22908843 atgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcat 22908941  T
Q  398 tatcgagtccttgta 412  Q
    |||||||||||||||    
T  22908942 tatcgagtccttgta 22908956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24548181 - 24547909
Alignment:
Q  135 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24548181 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 24548083  T
Q  234 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  24548082 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 24547984  T
Q  334 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24547983 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 24547909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 24930375 - 24930582
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  24930375 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 24930474  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24930475 gggacatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcatt 24930574  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  24930575 atcgagtc 24930582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 224430 - 224631
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  224430 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 224529  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  224530 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 224628  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  224629 ctt 224631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 700843 - 701044
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  700843 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 700942  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  700943 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 701041  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  701042 ctt 701044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 738053 - 738254
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  738053 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 738152  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  738153 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 738251  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  738252 ctt 738254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 861948 - 862149
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  861948 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 862047  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  862048 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 862146  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  862147 ctt 862149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 13663905 - 13664105
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  13663905 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 13664003  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664004 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 13664102  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  13664103 ctt 13664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 13723180 - 13723380
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  13723180 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatg 13723278  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723279 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 13723377  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  13723378 ctt 13723380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 91 - 411
Target Start/End: Original strand, 17730612 - 17730936
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 187  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||    
T  17730612 gattattcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgt 17730711  T
Q  188 aaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatg 285  Q
    ||  |||  ||||| | || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||  ||||    
T  17730712 aagaaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatg 17730811  T
Q  286 agttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga 385  Q
    | ||  ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||     
T  17730812 atttgattgtgtatggacatgttttcttgttaatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtgg-gaaaattgtggg 17730910  T
Q  386 ttgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  17730911 gtgatgtcgcattatcgagtctttgt 17730936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 405
Target Start/End: Original strand, 24107848 - 24108050
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||     
T  24107848 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtac 24107947  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  24107948 gggcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgtgg--tgttgtcgcatta 24108044  T
Q  400 tcgagt 405  Q
    ||||||    
T  24108045 tcgagt 24108050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 43684666 - 43684342
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt--gtatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||   | ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  43684666 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 43684567  T
Q  183 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| |  ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  43684566 aatat-gagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 43684468  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  43684467 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 43684369  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  43684368 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 43684342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 272435 - 272671
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  272435 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 272532  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  272533 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 272629  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  272630 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 272671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 643414 - 643178
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  643414 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 643317  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  643316 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 643220  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  643219 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 643178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 829220 - 828984
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  829220 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 829123  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  829122 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 829026  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  829025 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 828984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 203 - 404
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195202
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| || | ||| | |||     
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatgg 16195100  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16195101 gcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 16195199  T
Q  402 gag 404  Q
    |||    
T  16195200 gag 16195202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 89 - 235
Target Start/End: Original strand, 24107629 - 24107775
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107629 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 24107728  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107729 aggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 24107775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 270687 - 270429
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  270687 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 270588  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    |||||||       |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  270587 tgttgat-------aatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaa 270495  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  270494 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 270429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 406
Target Start/End: Original strand, 645233 - 645491
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  645233 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 645332  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    ||||||       ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  645333 tgttga-------taatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgagatgaa 645425  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  645426 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 645491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 141 - 406
Target Start/End: Original strand, 830968 - 831226
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||  || ||   ||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  830968 gatatgatatttatcatgagatgtatatgttatcttacttatgatttaggaaacgtttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacat 831067  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    ||||||       ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || || |     
T  831068 tgttga-------taatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtagagatgaa 831160  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  831161 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 831226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 22089729 - 22089911
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  22089729 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 22089825  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22089826 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 22089911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28836704 - 28836562
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28836704 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 28836605  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28836604 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 28836562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 87 - 273
Target Start/End: Original strand, 13663635 - 13663823
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  13663635 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaa 13663734  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||| |  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13663735 tgtgagaaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13663823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 15320345 - 15320527
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15320345 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15320441  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15320442 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15320527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 15500714 - 15500896
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  15500714 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 15500810  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15500811 aatgttgtggagataatcaatacaattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 15500896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Original strand, 16042123 - 16042424
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16042123 ttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 16042220  T
Q  126 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgata 221  Q
    ||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||| || | | || |||||| |||| | ||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16042221 tgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatgaa--atgcttgaattggtgaaactatatgtgata 16042318  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  16042319 gttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgagaatg 16042418  T
Q  321 caaatg 326  Q
    ||||||    
T  16042419 caaatg 16042424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18611587 - 18611377
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  18611587 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttg- 18611490  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 218  Q
       ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18611489 ---aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaatggtgaaactatatgtg 18611393  T
Q  219 atagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||||||||    
T  18611392 atagttgatgttgaat 18611377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Original strand, 13722174 - 13722358
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||     
T  13722174 gattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtg 13722273  T
Q  189 aagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |  ||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722274 agaaatgcttgaattagtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38532685 - 38532336
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 172  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |     
T  38532685 cttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttc 38532586  T
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtg 270  Q
    ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  38532585 tcttacttataatgtaataaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtg 38532486  T
Q  271 atggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcct 361  Q
    ||  |||||         ||||| | ||  ||| |||||   ||| ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  38532485 ataatgaatcttatttgaactataacttgattgtgtatggatatgatttcttgataatataattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcct 38532386  T
Q  362 atatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
     ||||||| |||  |||||||| | || ||||||||||||||||| ||||    
T  38532385 ttatattgtggtagaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtctttgt 38532336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908673
Alignment:
Q  96 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 22908631  T
Q  194 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22908632 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatggtgaatg 22908673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 199 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28836490 - 28836353
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  28836490 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 28836393  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28836392 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataat 28836353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 234
Target Start/End: Original strand, 24930160 - 24930302
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24930160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 24930259  T
Q  193 atacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930260 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 24930302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28543826 - 28543628
Alignment:
Q  206 gaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 305  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| |||    
T  28543826 gaaactatatggaataattaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgaacat 28543729  T
Q  306 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28543728 gttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatgtggaagttgtcctctatattgtggtgataattgtgaattgatgtcgcattatcgagt 28543629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 326
Target Start/End: Original strand, 16040621 - 16040748
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  16040621 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 16040720  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatg 326  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16040721 tggacatgttttcttgagaatgcaaatg 16040748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Original strand, 16675624 - 16675791
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  16675624 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 16675722  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16675723 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16675791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Original strand, 21853199 - 21853361
Alignment:
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 341  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21853199 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 21853297  T
Q  342 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  21853298 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgctgtcgcattatcgagtc 21853361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37605783 - 37605685
Alignment:
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37605783 ttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 37605685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Original strand, 21845794 - 21845956
Alignment:
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 341  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| || ||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||    
T  21845794 ttgattgttgataatcaatttgttgtgtgatgatggatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgttgataatca 21845892  T
Q  342 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21845893 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 21845956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 6775326 - 6775420
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6775326 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 6775420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28556998 - 28556874
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28556998 gtgactattcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgtgtatgatatcttacttagaatg 28556900  T
Q  187 taaagaatacttg-aatggtgaaact 211  Q
    |||  ||| |||| ||||||||||||    
T  28556899 taagaaatgcttgaaatggtgaaact 28556874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Original strand, 13722433 - 13722506
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722433 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Original strand, 13722581 - 13722654
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722581 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Original strand, 13722729 - 13722802
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722729 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Original strand, 13722877 - 13722950
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13722877 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13722950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Original strand, 13723025 - 13723098
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  13723025 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtttatgtatgatg 13723098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 16040335 - 16040549
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||| |   ||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  16040335 gccgtttgccacttgacacggtctt-ggtcggaaatgttt-cttaaactaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 16040432  T
Q  121 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| | | || |||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  16040433 atgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttgttttccatattacttggaatatga--aatgcttgaattggtgaaactatatg 16040530  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16040531 tgatagttgatgttgaatg 16040549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 18768135 - 18768233
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || || |||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  18768135 tttcttgataatgcaattgttgtggagatgataaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 18768233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 16406149 - 16406295
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||||  |||||  | || |||| |  |||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  16406149 gccggtggccacatgatatggtttttggtcgaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgaggtgactatgtttgtatgactaagtgaagttgt 16406247  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtat 168  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16406248 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtat 16406295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 340 - 406
Target Start/End: Original strand, 16203739 - 16203804
Alignment:
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16203739 caatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 16203804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 39448198 - 39448271
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  39448198 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 39448271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Original strand, 17151399 - 17151445
Alignment:
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151399 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18618187 - 18618138
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18618187 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 21199547 - 21199608
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  21199547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 21199608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 31195658 - 31195719
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  31195658 tttcttgataatgcaaatgttgcggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 31195719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 204 - 244
Target Start/End: Original strand, 17151521 - 17151561
Alignment:
Q  204 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17151521 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 17151561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224348
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 224348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700761
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 700761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737971
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 737971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861866
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 861866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 17151288 - 17151335
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17151288 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Original strand, 16194917 - 16194986
Alignment:
Q  98 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  16194917 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 16194986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18618062 - 18618028
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18618062 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 18618028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 22144250 - 22144136
Alignment:
Q  59 tttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatca 156  Q
    |||||||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22144250 tttcttgagtcatttgtcttatgatttatggtgaatattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatca 22144155  T
Q  157 tgaaatgtgtatgctatct 175  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  22144154 tgagatatgtatgctatct 22144136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23148682 - 23148624
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23148682 cttgataatgcaaatgttgttgaggtgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 23148624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 21192120 - 21192181
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  21192120 tttcttgataatacaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 21192181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 22737250 - 22737349
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||    
T  22737250 tttcttggtaatgcatttgtggtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatatggtggtgaaaattgttgaggtgatgtcacattatcgagtc 22737349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 253
Target Start/End: Original strand, 37654901 - 37654952
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37654901 tggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 37654952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23836008 - 23835950
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  23836008 cttgataatgcaattgttgaggaaatgatcaatatatttggaagttttcctttatattg 23835950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 21393265 - 21392874
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||| || ||||||| |||||    
T  21393265 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaattgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattattgtgactattcttataagactaagtgacgttgt 21393167  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21393166 atgaaagaatgattgtatgagatatgttgtttatcatgaaatgtgtatgcgatcttacttagaatgtaaggagtacttgaatggtgaaactatatgtgat 21393067  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21393066 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatg 21392967  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21392966 caaatgttgtggagataatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatggagtccttgtac 21392874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Original strand, 21652485 - 21652877
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||| |||| |||| || |||  |||| |||||| | |||  ||||||||||    
T  21652485 cggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttc-cttgaaccaattatcttaagaattgtggtggctatttttatataactaaaagaagttgtat 21652583  T
Q  123 gaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||    
T  21652584 gaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatacgtga 21652683  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21652684 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgaacatgttttcttgataat 21652783  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21652784 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 21652877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 20711214 - 20710823
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||||    
T  20711214 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgcccattcttatatgactaagtgaagttgt 20711116  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20711115 atgattgaatgattgtgttggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 20711017  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20711016 ataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataa 20710918  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20710917 tgcgaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 20710823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 29 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 28258669 - 28258286
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||   |||| ||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28258669 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtattataaactgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 28258572  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28258571 atgattgtgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttgagatgtaaggaatgattgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 28258472  T
Q  229 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 326  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28258471 ttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatg 28258373  T
Q  327 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28258372 ttgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtcgtcgcattatcgagtccttgtac 28258286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 23511044 - 23510676
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 142  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23511044 ttttgatcggagaggttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattgga 23510945  T
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacatt 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  23510944 tatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatattac-tagaatgtaaggaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatgattgaatagcatt 23510846  T
Q  241 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 340  Q
    ||||||||||||| |||||||| |  |||| || ||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23510845 gttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgatttaattgcatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatc 23510749  T
Q  341 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23510748 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 23510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 91 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16535313 - 16534999
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16535313 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 290  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  16535213 aaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttg 16535114  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
     |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16535113 attgtatatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgtt 16535015  T
Q  391 gtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||| ||||    
T  16535014 gtcgcattatcaagtc 16534999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 24184295 - 24184681
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24184295 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgctt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 24184392  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||     
T  24184393 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 24184492  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  24184493 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgata 24184592  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24184593 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgtattgttgtcgcattatcgagtc 24184681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4864343 - 4863961
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||  |||||  |||| | ||||| |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  4864343 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgtt--cttgaaccaattgtcttaaggatggtggtgactatg-ttatataactaagtgaagttgt 4864247  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  4864246 atgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 4864147  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4864146 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataa 4864047  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4864046 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattattgagt 4863961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11582774 - 11582564
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  11582774 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 11582675  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582674 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 11582575  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  11582574 atcgagtcctt 11582564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 91 - 409
Target Start/End: Original strand, 22884454 - 22884771
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| |  |    
T  22884454 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttggaatat-ga 22884552  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagt 288  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatt 22884651  T
Q  289 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 388  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||    
T  22884652 tatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattg 22884750  T
Q  389 ttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22884751 ttgtcgcattatcgagtcctt 22884771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19404588 - 19404268
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  19404588 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaga 19404490  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  19404489 aatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgattt 19404390  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19404389 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgtggtggagatgaacaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgt 19404290  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  19404289 tgtcgcattatcgagtctttgt 19404268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21649855 - 21649523
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  21649855 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 21649756  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    ||||||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21649755 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaat 21649656  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  21649655 gatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtgg 21649556  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21649555 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 21649523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 1169923 - 1170129
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1169923 aatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtat 1170022  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  1170023 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattttggattgttgtcgcgtta 1170122  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  1170123 tcgagtc 1170129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 96 - 413
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338341
Alignment:
Q  96 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtgtatgctatcttacttagaaggtaagaaa 11338120  T
Q  194 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttat 291  Q
    | |||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||      
T  11338121 tgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatttga 11338220  T
Q  292 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 391  Q
    ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11338221 ttatgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatgga-attgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatg 11338319  T
Q  392 tcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  11338320 tcgcattatcgagtctttgtac 11338341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Original strand, 1169602 - 1169848
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1169602 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgttatgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 1169700  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169701 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgtcatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 1169800  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1169801 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11341597 - 11341326
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11341597 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 11341498  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11341497 acattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggaga 11341399  T
Q  336 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11341398 taatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 11341326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23454032 - 23453638
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23454032 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23453936  T
Q  119 gtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata 214  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| ||||||||    
T  23453935 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23453836  T
Q  215 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 313  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||    
T  23453835 tgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttctt 23453736  T
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23453735 gataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23453638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23465537 - 23465143
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttg--agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagtt 118  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| || ||||  |||||||   ||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23465537 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggtt-cttgtaagtcaataggcttatgatttattgagattattcttatatgactaagtgaagtt 23465441  T
Q  119 gtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactata 214  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| ||||||  |||  ||||| |||| ||||||||    
T  23465440 gtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttaggatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactata 23465341  T
Q  215 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 313  Q
    || | |||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||    
T  23465340 tgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttctt 23465241  T
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23465240 gataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattattgagtccttgt 23465143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 1221112 - 1221319
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  1221112 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 1221209  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  1221210 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaagttgtgaattgttgtcgcatt 1221308  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  1221309 atcgagtcctt 1221319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 22367865 - 22368072
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  22367865 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 22367962  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  22367963 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 22368061  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  22368062 atcgagtcctt 22368072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7424575 - 7424367
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7424575 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 7424476  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  7424475 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 7424378  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  7424377 atcgagtcctt 7424367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 17473150 - 17473360
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  17473150 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 17473249  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17473250 taagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 17473349  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  17473350 atcgagtcctt 17473360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 21234670 - 21234994
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21234670 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 21234769  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21234770 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 21234868  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  21234869 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 21234967  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21234968 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 21234994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 21074870 - 21075077
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21074870 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21074967  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  21074968 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21075066  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  21075067 atcgagtcctt 21075077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 110364 - 110572
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  110364 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 110463  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  110464 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctgtatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 110562  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  110563 tcgagtcctt 110572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 4201347 - 4201554
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  4201347 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 4201446  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||    
T  4201447 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gattgttgtcgcatta 4201544  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  4201545 tcgagtcctt 4201554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 9731984 - 9732252
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9731984 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 9732082  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  9732083 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 9732181  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9732182 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 9732252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23513693 - 23513486
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||| || ||    
T  23513693 tggtaaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgatctatttgtgtgtg 23513594  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23513593 ggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggatataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattat 23513495  T
Q  401 cgagtcctt 409  Q
    |||||||||    
T  23513494 cgagtcctt 23513486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11246 - 11044
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  11246 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 11149  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  11148 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 11051  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  11050 atcgagt 11044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 9731762 - 9731975
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9731762 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 9731860  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9731861 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 9731960  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  9731961 agttgatgttgaatg 9731975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 87 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20615626 - 20615305
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||||| |||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  20615626 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgttgtttttccctattacttgg 20615527  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  20615526 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgatacatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 20615428  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  20615427 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 20615329  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  20615328 t-gattgttgtcgcattatcgagtc 20615305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 17472823 - 17473075
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||| ||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  17472823 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaagtgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 17472921  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  17472922 atgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtga 17473021  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17473022 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 212 - 409
Target Start/End: Original strand, 25192390 - 25192586
Alignment:
Q  212 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  25192390 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttc 25192489  T
Q  312 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25192490 ttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcattatcgagtcctt 25192586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 405
Target Start/End: Original strand, 29192004 - 29192203
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||     
T  29192004 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgg 29192101  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||    
T  29192102 gcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatc 29192199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 10779560 - 10779767
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||  ||     
T  10779560 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgatttattt--gtg 10779657  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  10779658 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttatcatatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 10779756  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  10779757 atcgagtcctt 10779767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25425580 - 25425312
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||||| |||| | |  | || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25425580 ttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatg 25425481  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25425480 acattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggaga 25425385  T
Q  336 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25425384 taatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 25425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 43445142 - 43445342
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  43445142 aactatatgtgatagttgatgttgaatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatga-ttatttgtgtatgggcatg 43445240  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43445241 ttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 43445339  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  43445340 ctt 43445342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 18779374 - 18779583
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18779374 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgt 18779473  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||    
T  18779474 atggacatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattggttgtcgtcatatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcat 18779571  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  18779572 tatcgagtcctt 18779583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 10779344 - 10779489
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10779344 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 10779443  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779444 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 10779489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 87 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 37051998 - 37051677
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta-tcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| ||| |||||| |||| || |  |  | |||||| |    
T  37051998 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgttgttttttcctattacttgg 37051899  T
Q  183 aatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||| | ||||||||||||||||    
T  37051898 aatatga-gaatgcttggaatggtgaaactatatgatatagctgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatac 37051800  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  37051799 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 37051701  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  37051700 t-gattgttgtcgcattatcgagtc 37051677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11462 - 11318
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11462 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 11363  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11362 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 11318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 29191785 - 29191929
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29191785 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 29191884  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29191885 gaacgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 29191929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 21933512 - 21933748
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  21933512 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 21933609  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21933610 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 21933706  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21933707 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21933748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 21939682 - 21939918
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  21939682 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 21939779  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21939780 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 21939876  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21939877 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 21939918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 27185095 - 27185301
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  27185095 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattgtgta 27185194  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27185195 tagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggtgagaattgt-gattgttgtcgcatt 27185293  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  27185294 atcgagtc 27185301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35581180 - 35580944
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  35581180 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatg 35581083  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35581082 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35580986  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35580985 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 35580944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 37010516 - 37010752
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  37010516 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 37010613  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37010614 tgtgatgacgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 37010710  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37010711 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37010752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19498752 - 19498490
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaata-cttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  | || || ||||||||||||||||||  ||||||||||      |    
T  19498752 ttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaattatctggaatggtgaaactatatgatatagttgatg------g 19498659  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaa 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  19498658 acattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggaga 19498563  T
Q  336 taatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498562 tgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 19498490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11583055 - 11582846
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  11583055 ttgccacttgatacggtttttgtt-ggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 11582957  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582956 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 11582857  T
Q  225 gatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||    
T  11582856 gatgttgaatg 11582846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23327825 - 23327643
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||  |||||||||||||||||||     
T  23327825 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtggacatgttttcttgataatgc- 23327729  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23327728 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23327643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 24595373 - 24595191
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  24595373 ttgattttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 24595277  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24595276 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24595191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 110145 - 110292
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  110145 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgatcgtattggatatgatgtttaccatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 110244  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110245 aggaatgcttgaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatga 110292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 25901707 - 25901911
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  25901707 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgt 25901806  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  25901807 gggcatgttttcttagtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 25901904  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  25901905 tcgagtc 25901911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Original strand, 35792544 - 35792719
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35792544 tgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 35792643  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35792644 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 35792719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 1220890 - 1221040
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1220890 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 1220989  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1220990 tgtaaggaatgcttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1221040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 4201124 - 4201274
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4201124 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 4201223  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4201224 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 4201274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 202 - 401
Target Start/End: Original strand, 11212986 - 11213183
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||  |     
T  11212986 tggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattgtgtgcgg 11213085  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |  || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11213086 gcatgttttcttgataatgcaaatgatgttgtgatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtgttgaaaattgt-gattg-tgtcgcattatc 11213183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 27184830 - 27185023
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  27184830 tttttgtcggaaatgttt-ctttagtcaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 27184928  T
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27184929 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 27185023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23513977 - 23513767
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||| ||| | |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23513977 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttgtgagttgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23513879  T
Q  126 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 223  Q
    ||| ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23513878 tgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagatatgtgtgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagt 23513779  T
Q  224 tgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||    
T  23513778 tgatgttgaatg 23513767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 18779155 - 18779301
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18779155 gattactcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgta 18779254  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18779255 aggaatggttgaatggtgaaactatatgtggaagttgatgttgaatg 18779301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25425732 - 25425589
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25425732 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagg 25425633  T
Q  192 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25425632 aatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25425589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24474654 - 24474367
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||   ||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  24474654 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtattaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 24474556  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||          ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24474555 atgaatgaatgat----------atgatatttatcattagatgtatatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtga 24474466  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24474465 tagttgttgttgaataacattgttgat-------aatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 24474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 22367647 - 22367793
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||    
T  22367647 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 22367746  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367747 aggaatgtttagatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22367793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11341749 - 11341605
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  11341749 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 11341651  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  11341650 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Original strand, 25901488 - 25901635
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| |    
T  25901488 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatat 25901587  T
Q  188 aaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
     | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901588 ga-gaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7424740 - 7424648
Alignment:
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7424740 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 7424648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27008867 - 27008705
Alignment:
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 341  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| |||  ||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  27008867 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtatatgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtggtggagataatca 27008769  T
Q  342 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27008768 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 27008705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19498855 - 19498764
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttga 232  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19498855 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgacagttgatgttga 19498764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 273
Target Start/End: Original strand, 35792275 - 35792456
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | |      
T  35792275 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatgat- 35792373  T
Q  192 aatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  35792374 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 7727369 - 7727296
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7727369 tttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7727296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3672780 - 3672685
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || | |||||||||||||||    
T  3672780 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatacttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgatgtgatatcgcattatcgagtc 3672685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23492794 - 23492722
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23492794 tttcttgataatg-aaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23492722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23505802 - 23505663
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23505802 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 23505704  T
Q  126 tgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgt 164  Q
    ||| | ||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23505703 tgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgt 23505663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 32967547 - 32967608
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  32967547 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 32967608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 37189501 - 37189561
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  37189501 ttcttgatgatgcaaatgttgtggaaatgatcaatatatttggaggttgtcctttatattg 37189561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 273
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445060
Alignment:
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 43445060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 352 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24471049 - 24470996
Alignment:
Q  352 atgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24471049 atgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 24470996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 431221 - 431149
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| | |||||  |||||||||    
T  431221 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttgtattgttgtgaaaatt 431149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28888709 - 28888649
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  28888709 ttcttgataatgcaaatgtagtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 28888649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 262
Target Start/End: Original strand, 5452007 - 5452130
Alignment:
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaca 238  Q
    |||||||| |||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||   | ||||||||||||||||| |    
T  5452007 gatatgatatttatcatgtgatgttgtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatacaaggtagttgatgttgaatgata 5452106  T
Q  239 ttgttgattattgataatcatgtt 262  Q
     |||||||||||||| || |||||    
T  5452107 ctgttgattattgatgattatgtt 5452130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 5452190 - 5452285
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||||| |||| |||| || ||||||||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  5452190 cttggtaatgcaattgttctggagatgatcaatatgtttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 5452285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 21615804 - 21615735
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  21615804 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 21615735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 24226842 - 24226911
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  24226842 cttgataatgcaattgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtcgtgaaaatt 24226911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3672900 - 3672849
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  3672900 tggtgaaactatatgatttagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 3672849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19861025 - 19860967
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19861025 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19860967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 83)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 25 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 44864316 - 44863930
Alignment:
Q  25 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  44864316 gttgccacttggtatgatttttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatgactaagtgacgttgtatga 44864218  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44864217 aagaatgattgtatgcgatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatacttgaatggtgaaagtatatgtgatagtt 44864118  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44864117 gatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 44864018  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 412  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44864017 tgctgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 44863930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 47288852 - 47288461
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||   ||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  47288852 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgttttaagaattgtggtgaccatttttatataaataagtgaagttgt 47288754  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  47288753 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaaccatatgtgat 47288654  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  47288653 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 47288554  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47288553 caaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatattttgaggtgaaaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 47288461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 23 - 413
Target Start/End: Original strand, 12544801 - 12545190
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12544801 cggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaggtgaagttgtat 12544899  T
Q  123 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 221  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  12544900 tattgaatgattgtatcggatatgatgtttatcatgaggtgtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatttgata 12544998  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||     
T  12544999 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgg 12545098  T
Q  322 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545099 aaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 12545190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 26 - 413
Target Start/End: Original strand, 13867163 - 13867552
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||| || | || || |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  13867163 ttgccgcttgatatgatttttggccggaaatgattcttttaagccaattgtcttatgaattatcgtgattattcttatatgaccaa-tgaagttgtatga 13867261  T
Q  125 atgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 222  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13867262 atgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgcaatcttacttagaatgtaaggaattcttgaatgatgaaactatatgtgatag 13867361  T
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13867362 ttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgca 13867461  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13867462 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaagtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13867552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 369965 - 369580
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  369965 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 369867  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  369866 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 369767  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  369766 tagttgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataat 369667  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369666 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 369580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Original strand, 45453346 - 45453728
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45453346 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaa---tgttcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgaccattcttatatgactaagtaaagttgtat 45453442  T
Q  123 gaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 221  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| ||||||| |||    
T  45453443 gaatgagtgattatatttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatattatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatgggaaaattatatgtaata 45453542  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45453543 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgc 45453642  T
Q  322 aaatgttgtggaaataatcaatataatt-ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||| |||||| || | |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45453643 aaatgatgtggagatgaacaatataattgggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 45453728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Original strand, 15823514 - 15823888
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||   || ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||    
T  15823514 ttttggtcggaaatgttttcttgagctaattgttttgtgaattgttgtgactattcttgtatgactaagtgaagtcgtatgagtgaatgattgtataaga 15823613  T
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgt 242  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  15823614 tatgatgtttctcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgt 15823713  T
Q  243 tgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtga----atactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataa 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15823714 tgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaatatatactatgatttatttgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataa 15823813  T
Q  339 tcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15823814 tcaatataattgggtgttgtcctttatattgaggtgaagattgttaattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 15823888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 66 - 413
Target Start/End: Original strand, 26071396 - 26071743
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26071396 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26071495  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26071496 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga- 26071594  T
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26071595 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctata 26071694  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071695 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 66 - 413
Target Start/End: Original strand, 26095183 - 26095530
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  26095183 agtcaattaccttatgaattattgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtg 26095282  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  26095283 tatgctatcttgattagaatgtaagaaatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga- 26095381  T
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  26095382 tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggcgtggtcctata 26095481  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26095482 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12753958 - 12753575
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12753958 gccgtttgccacttgatatgatttt-ggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgatttgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 12753861  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12753860 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatcttacttagaatgtaaataatgcttgaaatggtgaaactatatgtga 12753761  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| | || |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  12753760 tagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtggagatgagtactataatttgtttgtgtatggacatgttttcttgataat 12753661  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12753660 gcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgtggtg-aaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 12753575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 33 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 125892 - 125520
Alignment:
Q  33 ttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 132  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  125892 ttgatatgggttttgatcggagatgttttattgagtcaattacctcatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatga 125793  T
Q  133 ttgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 231  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  125792 ttgtatttgatatgatgttaatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttg 125694  T
Q  232 aatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  125693 aatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaatcgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaaggatgtg 125594  T
Q  332 gaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  125593 gagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 125520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 66 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11286247 - 11285904
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11286247 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 11286148  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11286147 tatgttatcttacttagaatataaggaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 11286048  T
Q  265 --tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtccta 362  Q
      ||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||     
T  11286047 tgtgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttctcctt 11285948  T
Q  363 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11285947 tatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 11285904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3894173 - 3893789
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  3894173 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 3894075  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3894074 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtacgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaagtggtgaaactatatgt 3893975  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||| || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3893974 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgata 3893877  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||| |||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3893876 atgtaaatgttgtggagatgaacaatataaatgggtgttgtcatatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 3893789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 112381 - 112767
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  112381 gccggtggccacttgatatggtttttgttcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 112479  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 217  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  112480 acgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgatttggtgaaactatatgt 112579  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  112580 gatagttgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgata 112679  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | ||||||| |||||| || | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112680 aagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgatgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 112767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 142708 - 142313
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  142708 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaactgaggttactattcttgtatgactaagtgaagttgt 142610  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 217  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  142609 atgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgggtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgt 142510  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  142509 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgat 142410  T
Q  317 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142409 aatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 142313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Original strand, 18981044 - 18981379
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18981044 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18981143  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18981144 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtga 18981243  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18981244 tggtgaatactatgatttatttgtatgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgag 18981342  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18981343 ttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18981379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 36051624 - 36051355
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 237  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051624 ttggatatgatgtttatcatgagatatatatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 36051525  T
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 337  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  36051524 attgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttacttaataatgc-aatg-tgtggagata 36051427  T
Q  338 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051426 atcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtagaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 36051355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13757603 - 13757270
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    |||||||||  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13757603 cttatgaattattgtgaccattcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatgtatgctat 13757504  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
     |||||| |||| | | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  13757503 attacttggaatatga-gaatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgtt 13757405  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13757404 gatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagg 13757307  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13757306 ttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 13757270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 7291753 - 7291540
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  7291753 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 7291654  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  7291653 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 7291555  T
Q  399 atcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||    
T  7291554 atcgagtccttgtac 7291540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 89 - 406
Target Start/End: Original strand, 12249263 - 12249584
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||    
T  12249263 gtgactattctcatatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgtgtatgttatcttacttaggatg 12249362  T
Q  187 taaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactat 284  Q
    |||  ||| |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  12249363 taagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctat 12249462  T
Q  285 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 384  Q
    || ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  12249463 gatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggtagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtga 12249562  T
Q  385 attgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  12249563 attgatgtcgcattatcgagtc 12249584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 406
Target Start/End: Original strand, 1937973 - 1938240
Alignment:
Q  136 tattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937973 tattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 1938070  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  1938071 gacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaattatgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggag 1938170  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  1938171 atgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaat--tgaattgttgtcgcattatcgagtc 1938240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 91 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15851334 - 15851163
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15851334 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Original strand, 15952360 - 15952563
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  15952360 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 15952457  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15952458 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 15952556  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  15952557 atcgagt 15952563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 15442707 - 15443031
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  15442707 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 15442806  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  15442807 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 15442905  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  15442906 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 15443004  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15443005 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 15443031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 32495819 - 32496025
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  32495819 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 32495918  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  32495919 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 32496017  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  32496018 atcgagtc 32496025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 205 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058741
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagca 3058842  T
Q  305 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3058841 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtattgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 3058743  T
Q  405 tc 406  Q
    ||    
T  3058742 tc 3058741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 202 - 407
Target Start/End: Original strand, 13038373 - 13038576
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  13038373 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 13038472  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  13038473 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataatcgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatt 13038570  T
Q  402 gagtcc 407  Q
    ||||||    
T  13038571 gagtcc 13038576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 406
Target Start/End: Original strand, 11582109 - 11582311
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  11582109 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 11582208  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  11582209 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacattatc 11582306  T
Q  402 gagtc 406  Q
    |||||    
T  11582307 gagtc 11582311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Original strand, 16571246 - 16571568
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16571246 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 16571344  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||  |||||  ||||| ||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 16571444  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 387  Q
      ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16571445 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggatt 16571544  T
Q  388 gttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    | |||| |||||||||||| ||||    
T  16571545 gatgtctcattatcgagtctttgt 16571568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16594416 - 16594094
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16594416 tattcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 16594318  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||  |||||  ||||| ||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 16594218  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 387  Q
      ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16594217 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgttgagatgatcaatatatatatgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggatt 16594118  T
Q  388 gttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    | |||| |||||||||||| ||||    
T  16594117 gatgtctcattatcgagtctttgt 16594094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2027457 - 2027250
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  2027457 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 2027358  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||||    
T  2027357 tgggcgtgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaatttgtgattgttgtcgcatt 2027258  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  2027257 atcgagtc 2027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16210676 - 16210471
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||     
T  16210676 tggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgtgtgg 16210577  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16210576 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattaggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatc 16210479  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  16210478 gagtcctt 16210471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 16417364 - 16417162
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||     
T  16417364 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtg 16417267  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  16417266 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 16417169  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  16417168 atcgagt 16417162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 14252277 - 14252491
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||    
T  14252277 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatatttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgt 14252376  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14252377 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 14252476  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  14252477 agttgatgttgaatg 14252491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 87 - 406
Target Start/End: Original strand, 30263272 - 30263593
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  30263272 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 30263371  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  30263372 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 30263470  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||    
T  30263471 tatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattg 30263568  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | ||||||||||||||||||||||    
T  30263569 agaattgttgtcgcattatcgagtc 30263593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 27102783 - 27103019
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27102783 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27102880  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27102881 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27102977  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27102978 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27103019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 27110131 - 27110367
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27110131 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27110228  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27110229 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27110325  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27110326 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27110367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27175543 - 27175307
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27175543 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 27175446  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27175445 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 27175349  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27175348 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 27175307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 38784875 - 38785111
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38784875 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 38784972  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38784973 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 38785069  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38785070 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 38785111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 2191960 - 2192169
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  2191960 gaatagtgaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttatttttgta 2192059  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||    
T  2192060 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgctgtcgcatt 2192158  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  2192159 atcgagtcctt 2192169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 13912378 - 13912582
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  13912378 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 13912477  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  13912478 gggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 13912575  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  13912576 tcgagtc 13912582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 16480200 - 16480408
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  || |||  ||    
T  16480200 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattgtata 16480299  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  16480300 tgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatt 16480397  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  16480398 atcgagtcctt 16480408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 286
Target Start/End: Original strand, 39047785 - 39048042
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| |  |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  39047785 ccacttgatacaatttttagtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgcggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 39047883  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39047884 atgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctattatacttataaagtaagaaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgat 39047983  T
Q  228 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 286  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  39047984 gttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 39048042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16417580 - 16417436
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16417580 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 16417481  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16417480 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 16417436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7821851 - 7821615
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  7821851 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatg 7821754  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7821753 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 7821657  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7821656 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7821615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 7829162 - 7828926
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||    
T  7829162 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgatatt-atgttgatg 7829065  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7829064 tgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 7828968  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  7828967 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 7828926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13273833 - 13273431
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||| |||||||   ||| ||||||   |||||||||  | |||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  13273833 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcgaaaatgttcctttgtgtcaatctgcttatgaattatcgtgactattcttatatgactaagtaaagttgt 13273736  T
Q  121 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  13273735 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 13273636  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
     | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||  |||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||    
T  13273635 agttagttgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgttgttgttgtgataatgaatcttgtttgaattatgaattgattgtgtatggacatg 13273536  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||    
T  13273535 atttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaagttgtgaagtaatgtcgcattatcgagtc 13273436  T
Q  407 cttgt 411  Q
     ||||    
T  13273435 tttgt 13273431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15926261 - 15926058
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||  |    
T  15926261 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt--g 15926165  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattat 400  Q
     |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  15926164 ggcatgttt-cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattat 15926067  T
Q  401 cgagtcctt 409  Q
    |||||||||    
T  15926066 cgagtcctt 15926058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11515020 - 11514816
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  11515020 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgt 11514921  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||    
T  11514920 gggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgaggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatta 11514823  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  11514822 tcgagtc 11514816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 26010455 - 26010663
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || ||     
T  26010455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctttgatgtaactgtgtg 26010554  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  26010555 tggacatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 26010652  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  26010653 atcgagtcctt 26010663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 221 - 409
Target Start/End: Original strand, 15525769 - 15525957
Alignment:
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15525769 agttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattatgtgaatgatgaatactatgatctatttgtgtgtgtgcatgttttcttgataat 15525868  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15525869 gcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaatcgttgtcgcattatcgagtcctt 15525957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 32495532 - 32495747
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||| |  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32495532 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagcaaattgtcttgtgagttattgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgt 32495630  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  32495631 atgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtg 32495730  T
Q  219 atagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  32495731 atagttgatgttgaatg 32495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Original strand, 15952144 - 15952280
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  15952144 gattattcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 15952243  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952244 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 15952280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 13912155 - 13912305
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13912155 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 13912254  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13912255 tgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 13912305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291825
Alignment:
Q  96 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaa 7291867  T
Q  194 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7291866 tgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 7291825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 15629860 - 15629459
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||   |||||||||    ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15629860 gccgtttgccacttgatacggtat--ggtcggaaatgttcctttgagtcaaccgacttatgatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaagtggt 15629763  T
Q  121 atgaatgaatgat-tgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| || | ||||||||||     
T  15629762 atgaatgaatgatatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatgataaaactatatga 15629663  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  | |  |||||         | || || ||  ||| |||||  ||||     
T  15629662 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttaagttaatgaatcttatttgaattaagaattgattgtgtatggacatga 15629563  T
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 407  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||     
T  15629562 tttcttgataatacaattgttgtggaaatgatcaatatatttgaaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgacgtcgcattatcgagtct 15629463  T
Q  408 ttgt 411  Q
    ||||    
T  15629462 ttgt 15629459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 15761634 - 15761839
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  15761634 aatggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 15761733  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  15761734 tggacatgttttcttgataatgcaaatgatgaggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcatt 15761831  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  15761832 atcgagtc 15761839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 411
Target Start/End: Original strand, 49048942 - 49049277
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  49048942 gtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaat 49049041  T
Q  186 gtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 279  Q
    ||||  ||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||        
T  49049042 gtaagaaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgttaatta-tgatgatcatgttgatgatgtgatgatgaatctta 49049140  T
Q  280 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 374  Q
         | ||||| ||  ||| ||||   |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||| ||||||| ||||    
T  49049141 tttgaaatatgacttgattgtgtatagacatgatttcttgataatgcaattgtggtggagatgatcaacatatttgaaagttgtcctttatattgtggtg 49049240  T
Q  375 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49049241 gaaattgtgagttgatgtcgcattatcgagtctttgt 49049277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11515345 - 11515198
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  11515345 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgta 11515246  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515245 aggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Original strand, 42057458 - 42057632
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42057458 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 42057556  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42057557 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 42057632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2027742 - 2027529
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  2027742 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcaaaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 2027644  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||||||||||||    
T  2027643 atgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtatactattttacttagaatgt-aagaaatgttgagttggtgaaactatatgtga 2027545  T
Q  220 tagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  2027544 tagttgatgttgaatg 2027529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 7285361 - 7285510
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7285361 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagatatgtatgctatcttacttagaatg 7285460  T
Q  187 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7285461 taaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 7285510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 409
Target Start/End: Original strand, 18255090 - 18255295
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 303  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || |||||||||| |  ||||||  | || ||    
T  18255090 tgaaactataagtgataattgaagttgaatgtctttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactataatctatttgtatgtgggc 18255189  T
Q  304 atgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18255190 atgttttgcttgataatgtaa-tgttgtggggataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcg 18255288  T
Q  403 agtcctt 409  Q
    |||||||    
T  18255289 agtcctt 18255295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 229 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13571701 - 13571525
Alignment:
Q  229 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| |||    
T  13571701 ttgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtttgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgt 13571603  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13571602 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcttatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13571525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 277
Target Start/End: Original strand, 10861927 - 10862187
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  10861927 gccgtttgccacttgatacggtacttg-tcggaaatgttcctttgagtcaattatcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgt 10862025  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
     |||||||||| || ||||  | ||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  10862026 gtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 10862125  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgatta-ttgataatcatgttaatg-tgtgatggtga 277  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||    
T  10862126 a-atagttgatgttgaatgatattgttgattatttgatgattatgttgatgatgtgatggtga 10862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2436456 - 2436315
Alignment:
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||| ||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2436456 tgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtgtggacatttttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 2436358  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2436357 ttgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 2436315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 406
Target Start/End: Original strand, 25293608 - 25293747
Alignment:
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25293608 tgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctata 25293706  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25293707 tattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 25293747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10988479 - 10988303
Alignment:
Q  231 gaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10988479 gaatgatattattgattgttgataatcaagttgttggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttc-cttggtaatgcaa-tgttg 10988382  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10988381 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtcctt 10988303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 76 - 273
Target Start/End: Original strand, 2191684 - 2191884
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgcta 172  Q
    ||||||||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||| |||| || | || | |      
T  2191684 cttatgaattgtggtgaccattcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgttttccc 2191783  T
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  2191784 tattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatga 2191882  T
Q  272 tg 273  Q
    ||    
T  2191883 tg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 227
Target Start/End: Original strand, 16480034 - 16480120
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480034 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgctcgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 225
Target Start/End: Original strand, 7285504 - 7285603
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7285504 tgaatgattgtattgaatatgatgtt-atcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagtt 7285602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 11582027 - 11582095
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11582027 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattggatataatgtttatcatgaaatgtgta 11582095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11515138 - 11515092
Alignment:
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11515138 agaatccttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Original strand, 15761509 - 15761558
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15761509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16210759 - 16210691
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16210759 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatatttatcatgagatgtgta 16210691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 3048751 - 3048688
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 139  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3048751 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatt 3048688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 159
Target Start/End: Original strand, 13038299 - 13038350
Alignment:
Q  108 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  13038299 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtttatcatga 13038350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 9058007 - 9058076
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  9058007 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 9058076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 405
Target Start/End: Original strand, 10862231 - 10862326
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt-gtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||   || ||||||||||||||||    
T  10862231 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatgtatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtgaggtgatgtcgcattatcgagt 10862326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 15913817 - 15913874
Alignment:
Q  312 ttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  15913817 ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcatttatattg 15913874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3059026 - 3058966
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatga 159  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  3059026 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatga 3058966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 35093890 - 35093783
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  35093890 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 35093792  T
Q  121 atgaatgaa 129  Q
    |||||||||    
T  35093791 atgaatgaa 35093783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 13376461 - 13376423
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatata 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13376461 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatata 13376423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 32897802 - 32897419
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  32897802 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttatgattattcttatatgactaagtgaagttatat 32897703  T
Q  123 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||| |||     
T  32897702 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaatggtgaaactaaatgtaataa 32897603  T
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32897602 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgta 32897503  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32897502 aatgttgtggagatgatcaataaaattgagagttgtcctatatattgtggtgaaaattgggaattgttgtcgcattatcgagtc 32897419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 25 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 18431708 - 18431322
Alignment:
Q  25 gttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||| |||||  |||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  18431708 gttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgaattattgtgactattcttatatcactaagtgaggttgtatga 18431610  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431609 aagaatgattgcattaaatatgatgtt-atcatgagatgtgtatgctatcttacttggaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18431511  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18431510 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaa 18431411  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18431410 tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 18431322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 413
Target Start/End: Original strand, 25645918 - 25646302
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  25645918 gccacttgatatggtgtttggtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatcttactaagtgaagttgtatgaatg 25646016  T
Q  128 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25646017 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgataattgat 25646116  T
Q  228 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25646117 gttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgt 25646216  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25646217 tgtggagataatcaataaaattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcattatcaagtccttgtac 25646302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 29 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18569660 - 18569280
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18569660 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatcttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 18569563  T
Q  129 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18569562 atgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttg 18569463  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18569462 atgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaat 18569363  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18569362 gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 18569280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Original strand, 19984298 - 19984671
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19984298 acttgatatgggttttgatcggagatgttttcttgagtaaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 19984397  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19984398 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgt 19984496  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19984497 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatg 19984596  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  19984597 tggaaatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgaattatctagtc 19984671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 409
Target Start/End: Original strand, 35016770 - 35017152
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| || |||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35016770 ttgccacatgatttggatttttgttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 35016868  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  35016869 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgttatcttacttggaatatga-gaatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagtt 35016967  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35016968 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa 35017067  T
Q  324 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35017068 atgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 35017152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18776291 - 18775907
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18776291 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttttatgactaagtgaagttgt 18776193  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18776192 atgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgtatatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 18776093  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18776092 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgata 18775995  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18775994 atgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18775907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16105638 - 16105254
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16105638 gccgtttgccacttgatatggattt-ggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttattgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 16105541  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    | |||   | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16105540 acgaaaagaagattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtaat 16105441  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16105440 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataat 16105341  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16105340 gcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgtcgcgttatcgagtc 16105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Original strand, 18087846 - 18088182
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||| ||    
T  18087846 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtgtatgccat 18087945  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18087946 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtga 18088045  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18088046 tggtgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgag 18088144  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||  | |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18088145 gttgagattgtgaattgttgttgcattatcgagtcctt 18088182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 199 - 413
Target Start/End: Original strand, 18004234 - 18004448
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18004234 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 18004333  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18004334 tggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtggaaattgtggattgttgtcgcatt 18004433  T
Q  399 atcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||    
T  18004434 atcgagtccttgtac 18004448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 142 - 409
Target Start/End: Original strand, 1658915 - 1659182
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 241  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1658915 atatgatgtttatcatgagatgtgtatggtatcttacttagaatgcaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg 1659014  T
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 340  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1659015 ttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatc 1659113  T
Q  341 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1659114 aatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcacattatcgagtcctt 1659182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23152318 - 23151956
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 142  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23152318 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgattgtgttgga 23152220  T
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 241  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||  |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23152219 taagatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacctaggatgtaagaaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattg 23152120  T
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 341  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||    
T  23152119 ttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattcaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaaca 23152020  T
Q  342 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23152019 gtataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattatcgagtc 23151956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 76 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23976595 - 23976263
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatc 174  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | ||    
T  23976595 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctc 23976496  T
Q  175 ttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    |||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23976495 ttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgat 23976397  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||||||  || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23976396 gctgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgtttgcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagg 23976300  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |  | |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23976299 ttgagattgtgaattgttgccgcattatcgagtcctt 23976263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 197 - 413
Target Start/End: Original strand, 15736440 - 15736656
Alignment:
Q  197 ttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 296  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  15736440 ttgaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtg 15736539  T
Q  297 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 396  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  15736540 tatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgca 15736639  T
Q  397 ttatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| |||||    
T  15736640 ttatcgagtccgtgtac 15736656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22431320 - 22430944
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22431320 ccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggagactatttttatatgactaagtgaagttgtatgattga 22431223  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    |||||||||| || ||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22431222 atgattgtatggggtatgatgcttatcataagatgcgtatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgat 22431123  T
Q  228 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatg 326  Q
    || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22431122 gtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaaatg 22431023  T
Q  327 ttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22431022 atgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtttaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 368
Target Start/End: Original strand, 25745422 - 25745763
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||  ||||| |||||| |||| ||   |||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25745422 gccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaatggtggtgactacgtttatataactaagtgaagttgtatgaacg 25745520  T
Q  128 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  25745521 aatgattgtgtaggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttatgatgtaggaaatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttga 25745620  T
Q  227 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25745621 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaat 25745720  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 368  Q
    | |||| | || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25745721 gatgtgtagatgaacaatataattgggtgttgtcctatttatt 25745763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 27655348 - 27655555
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  27655348 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 27655445  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  27655446 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 27655544  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  27655545 atcgagtcctt 27655555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 16827138 - 16827346
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  16827138 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 16827237  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16827238 gggcatgttttcttgataatacaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 16827336  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  16827337 tcgagtcctt 16827346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4989797 - 4989591
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  4989797 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgatttattt--gtgt 4989700  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||    
T  4989699 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgttaattgttgtcgcatta 4989601  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  4989600 tcgagtcctt 4989591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16230546 - 16230278
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16230546 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 16230448  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  16230447 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 16230349  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16230348 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 16230278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16230768 - 16230555
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16230768 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 16230670  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16230669 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 16230570  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  16230569 agttgatgttgaatg 16230555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 33315844 - 33316050
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  33315844 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 33315941  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  33315942 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 33316040  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  33316041 tcgagtcctt 33316050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 218 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31627322 - 31627134
Alignment:
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||    
T  31627322 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgatttgtttgtgtatggacatgttttcttgata 31627223  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31627222 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggggattgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtc 31627134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Original strand, 1651148 - 1651420
Alignment:
Q  135 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1651148 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 1651246  T
Q  234 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  || ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  1651247 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatataattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 1651345  T
Q  334 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1651346 gatgatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1651420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 25174455 - 25174253
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  25174455 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 25174358  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  25174357 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgagtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 25174260  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  25174259 atcgagt 25174253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18397982 - 18397622
Alignment:
Q  49 tcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatat 145  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||   | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||    
T  18397982 tcggaaatggtttctttaagtcaattgtcttatgaagtatcgtgagtattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatat 18397883  T
Q  146 gatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 245  Q
    |||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||  |  ||||| ||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18397882 gatgat-atcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtgagacatgttgaaatggggaagctacatgagatagtgaatgttgaatgacattgttga 18397784  T
Q  246 ttattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaata 344  Q
     ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18397783 gtattgatgatcatattgatgtggtgatgatgagtattatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgaaaatgttgtggggataatcaata 18397684  T
Q  345 taattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18397683 taattgggagttgccctatatattgtggtgaaaattgtagattgttgtcgcattatcgagtc 18397622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 215 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11215026 - 11214836
Alignment:
Q  215 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||    
T  11215026 tgtgatagttgttgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggcatgttttctt 11214927  T
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11214926 gataatgcaa-tgttgtggaaataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatagagt 11214836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Original strand, 18824637 - 18824847
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    |||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  18824637 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctattgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 18824735  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824736 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 18824835  T
Q  225 gatgttgaatga 236  Q
    ||||||||||||    
T  18824836 gatgttgaatga 18824847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16085136 - 16084882
Alignment:
Q  44 tttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggat 143  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||   |||||| |  ||||||| ||| |||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||    
T  16085136 tttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgttttatgagttcttgtgatcatttttatatgactaagt--agttgtatgaatagaagattgtattggat 16085040  T
Q  144 atgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtt 243  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16085039 atgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaagggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgtt 16084940  T
Q  244 gattattgataatcatg-ttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| || ||| ||| |||||    
T  16084939 gattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatttaattgtgtatg 16084882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 205 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239057
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||| || || ||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgatctatttgtgtgtgggc 16239163  T
Q  304 atgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga-ttgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16239162 atgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataatttggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttgttgtcgcattatcg 16239064  T
Q  403 agtcctt 409  Q
    |||||||    
T  16239063 agtcctt 16239057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25174671 - 25174527
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  25174671 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 25174572  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174571 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 25174527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4990079 - 4989869
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  4990079 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtttga 4989981  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989980 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 4989881  T
Q  225 gatgttgaatga 236  Q
    ||||||||||||    
T  4989880 gatgttgaatga 4989869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10487809 - 10487573
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10487809 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 10487712  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10487711 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 10487615  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10487614 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 10487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 199 - 413
Target Start/End: Original strand, 13622374 - 13622589
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||    
T  13622374 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgatttatttgtgta 13622473  T
Q  299 tgagcatgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||    
T  13622474 tggacatgtttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggttgcat 13622573  T
Q  398 tatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||| |||||    
T  13622574 tatcgagtccgtgtac 13622589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 16377518 - 16377754
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16377518 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 16377615  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16377616 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 16377712  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16377713 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16377754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 16384842 - 16385078
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16384842 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 16384939  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16384940 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 16385036  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16385037 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 16385078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 14627871 - 14628079
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  || ||| |||    
T  14627871 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattgtgta 14627970  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  14627971 tgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcatt 14628068  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  14628069 atcgagtcctt 14628079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 413
Target Start/End: Original strand, 13015910 - 13016260
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgga 142  Q
    |||||||||||||||||| ||| |  |||||  ||||||||| ||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13015910 ttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttatgaattgttatgat-attcctatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggg 13016007  T
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt- 240  Q
                      ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||     
T  13016008 ------------------atgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaaccacatgtggtaattgatgttgagtgacattt 13016089  T
Q  241 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatc 340  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |  || |||| |||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  13016090 gttgatt-ttgagaatcatgttgacatgagatgatgaatactatgaattaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggaggtaatc 13016187  T
Q  341 aatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13016188 aatataattggatatagacctatatattgaggtgaaaattatggattgtagtcgcattatcgagtccttgtac 13016260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 190 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15861642 - 15861425
Alignment:
Q  190 agaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg--acattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatg 285  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15861642 agaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatataacattgttgattgttgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatg 15861543  T
Q  286 agttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgga 385  Q
    | ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  15861542 atttatttgtgtgtgagcatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-ga 15861446  T
Q  386 ttgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15861445 ttgttgtcgcattatcgagtc 15861425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 231
Target Start/End: Original strand, 27655147 - 27655287
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27655147 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 27655246  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655247 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 27655287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Original strand, 18840555 - 18840702
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840555 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 18840654  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840655 aggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18840702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 405
Target Start/End: Original strand, 18825023 - 18825225
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18825023 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 18825122  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||    
T  18825123 gggcatg-tttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaataatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgttgtcgcatta 18825219  T
Q  400 tcgagt 405  Q
    ||||||    
T  18825220 tcgagt 18825225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 405
Target Start/End: Original strand, 18843083 - 18843286
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18843083 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 18843182  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | || ||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| | |||| |||||||||    
T  18843183 gagcatgttttcttgataatgc-aatgatgtggagatgaacattataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gtttgtcgtcgcatta 18843280  T
Q  400 tcgagt 405  Q
    ||||||    
T  18843281 tcgagt 18843286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 91 - 230
Target Start/End: Original strand, 33315628 - 33315767
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33315628 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 33315727  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 230  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33315728 gaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtt 33315767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 227
Target Start/End: Original strand, 18004002 - 18004154
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatc 174  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  18004002 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatc 18004101  T
Q  175 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004102 ttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18004154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 15736160 - 15736362
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15736160 ttgccacttgatacggcttttagtcggaaatgtttttttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtaaagttgtatgaa 15736259  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736260 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtaaaactatatgtgatagtt 15736359  T
Q  225 gat 227  Q
    |||    
T  15736360 gat 15736362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 13622160 - 13622302
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13622160 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagga 13622259  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622260 atgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 13622302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 18824841 - 18824951
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18824841 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18824940  T
Q  226 atgttgaatga 236  Q
    |||||||||||    
T  18824941 atgttgaatga 18824951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 18840696 - 18840806
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18840696 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 18840795  T
Q  226 atgttgaatga 236  Q
    |||||||||||    
T  18840796 atgttgaatga 18840806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18129129 - 18128981
Alignment:
Q  257 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgtt 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||    
T  18129129 catgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgtttccttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgtt 18129030  T
Q  357 gtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18129029 gtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18128981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Original strand, 17343578 - 17343754
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17343578 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgtttgcttgataatgcaa-tgttg 17343674  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17343675 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgtattgttgtcgcattatcgagtcctt 17343754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1554741 - 1554536
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||    
T  1554741 aatggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgta 1554642  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||||    
T  1554641 tggacatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggag-aaattgt-gattgttgtcgcatt 1554544  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  1554543 atcgagtc 1554536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 16557301 - 16557483
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16557301 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16557397  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16557398 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16557483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 16650531 - 16650713
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  16650531 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 16650627  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16650628 aatgttgtggagataatcaatatacttgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgtattatcgagtcctt 16650713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 43 - 235
Target Start/End: Original strand, 16826872 - 16827065
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |    
T  16826872 tttttgtcggaaatgttt-ctttagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttg 16826970  T
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16826971 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 16827065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18582367 - 18582151
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-tcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| | ||||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  18582367 gccgtttgccacttgatatggtttttg-tcggaaaagtttcttttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 18582269  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 217  Q
    | |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18582268 tgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 18582169  T
Q  218 gatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18582168 gatagttgatgttgaatg 18582151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 29870760 - 29870943
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  29870760 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 29870856  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29870857 aatgttgtggagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 29870943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 223 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26088713 - 26088532
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||| ||||||     
T  26088713 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgctttcttggtaatgc- 26088615  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | |||||||| |||||||||||||    
T  26088614 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgttgcattatcgagtc 26088532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 411
Target Start/End: Original strand, 28195924 - 28196255
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||| |||  |||| |||||||||||||||   ||| ||||| | |||||||||| ||    
T  28195924 gtgactattcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctcttacttaggat 28196023  T
Q  186 gtaaagaatacttgaa--tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat--- 279  Q
    ||||  ||| ||||||  |||| ||||||||||   ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  | | |       
T  28196024 gtaagaaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaataatattgttgattattgataatcatgttgatgatgtgattcttatttga 28196123  T
Q  280 actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaat 379  Q
    | ||| | ||  ||| |||||  |||| |||||||||||||||| || |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  28196124 attataacttgattgtgtatggacatgatttcttgataatgcaattggtgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaat 28196223  T
Q  380 tgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28196224 tgtggagtgttgtcgcattatcgagtctttgt 28196255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 25368428 - 25368827
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||   ||||||| |  | |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  25368428 gccgtttgccacttgatacggtattta-tcggaaatgttcctttgagtcaatcgacttatgatttatcgtgactgttcttatatgactaagtgaagttgt 25368526  T
Q  121 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 216  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| || || |  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  25368527 atgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttgtatgctctcttacttaaaaggtgagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 25368626  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatacta--tgagttat---ttg--cgt--atgagcatg 306  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||  |||||| |||||  ||  ||| ||||   |||  |||  |||  | ||    
T  25368627 aggtagtttatgttgaatgatattgttgattattaatgatcatgttgatgaagtgatgatgaatcttatttgaattatgacttgatcgtgcatggacgtg 25368726  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  25368727 atttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatttgtggagtgatgtcgcattatcgagt 25368826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 95 - 227
Target Start/End: Original strand, 14627658 - 14627791
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  14627658 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtattggatatgacgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaagaaa 14627757  T
Q  194 tacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14627758 tgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14627791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23994032 - 23993858
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23994032 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttg 23993934  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23993933 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 23993858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19628490 - 19628302
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 140  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||| |||||||    ||||| ||||| ||||  |    
T  19628490 tttttgtcggaaatgtttt-ttgagtcatttgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttg 19628396  T
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19628395 aatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 19628302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22867166 - 22866864
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||| ||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22867166 tatttttatatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgtgcatgttctcttatttagaacgtaaag 22867067  T
Q  192 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagtta 290  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||             || |||||||||||||| ||||| ||||  |||||  ||| | ||     
T  22867066 aatgtttgaatgatgaaactatatgagatagtaaatgttga-------------tttttgataatcatgttgatgtggtgataatgaatcttatcatttg 22866980  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
     ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  22866979 attgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatttatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgat 22866880  T
Q  391 gtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| |||||    
T  22866879 ttcgcattattgagtc 22866864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 22226926 - 22227111
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| | |||||||| ||| |||| ||| ||||||| || ||   |||||| |||| |||||||    
T  22226926 ttgatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgatttatttgtgtgtggatatgtttccttggtaatgca 22227025  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22227026 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattttcgagtcctt 22227111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19609310 - 19609191
Alignment:
Q  288 ttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 387  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||    
T  19609310 ttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaatt 19609213  T
Q  388 gttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19609212 gttgtcgcattatcgagtcctt 19609191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 143 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19609442 - 19609350
Alignment:
Q  143 tatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19609442 tatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 19609350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 303 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16084215 - 16084112
Alignment:
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16084215 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttttcgcattatcg 16084116  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  16084115 agtc 16084112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 76 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 26088893 - 26088782
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  26088893 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 26088794  T
Q  174 cttacttagaat 185  Q
    ||||||| ||||    
T  26088793 cttacttggaat 26088782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 220
Target Start/End: Original strand, 21776791 - 21776870
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21776791 atatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21776870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15739043 - 15738945
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  15739043 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtaaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 15738945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25904033 - 25903975
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 149  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25904033 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatg 25903975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 226
Target Start/End: Original strand, 16301107 - 16301178
Alignment:
Q  156 atgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16301107 atgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttga 16301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1554866 - 1554817
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1554866 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 348 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18741203 - 18741146
Alignment:
Q  348 ttggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18741203 ttgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18741146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 16889122 - 16889183
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16889122 tttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 16889183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33323605 - 33323532
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  33323605 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 33323532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 35137326 - 35137399
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  35137326 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 35137399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22846923 - 22846867
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat 367  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||||    
T  22846923 cttgataattcaattgttgtggagataatcaatatatttggaagttatcctttatat 22846867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 413
Target Start/End: Original strand, 256001 - 256384
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  256001 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 256099  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  256100 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 256199  T
Q  229 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  256200 ttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatg-aaatgt 256298  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256299 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 29 - 398
Target Start/End: Original strand, 262607 - 262975
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||   ||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  262607 ccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaatagtcttatgaattgttgtgaccatttttatatgactaagttaagttgtatgaatga 262705  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  262706 atgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgaag 262805  T
Q  229 ttgaatgaca-ttgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  262806 ttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatgagcatgttttcttgataatgc-aatgt 262904  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  262905 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 262975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 124454 - 124762
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  124454 ttatataactaagtgaagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagattggtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 124552  T
Q  199 gaatgg-tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||    
T  124553 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattgggt 124652  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||    
T  124653 gtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcacat 124750  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  124751 tatcgagtcctt 124762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 75855 - 76163
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | |||||| || |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||  |||  ||    
T  75855 ttatataactaagtgcagatgtatgaatggatgattattttggatatgatatttatcatgagatatgtatgtaatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 75953  T
Q  199 gaatgg-tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||| ||    
T  75954 gaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattgagt 76053  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     ||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  76054 gtggacatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcatcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 76151  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  76152 tatcgagtcctt 76163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 193508 - 193303
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || ||     
T  193508 tggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgg 193409  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  193408 gcatgttttcttgttaatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 193311  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  193310 gagtcctt 193303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 193582 - 193515
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 166  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  193582 ttatataactaattgaagttgtatgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 193515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 406
Target Start/End: Original strand, 71539 - 71921
Alignment:
Q  24 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 123  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  71539 ggttgccacttgatacaggttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatgattgttattattcttatatgactaagttaagttatatg 71638  T
Q  124 aatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  71639 aatgaatgattgtattggatataatgtttatcatgagatgtgtacgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaatggtgaaactaaatgtaatagt 71738  T
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  71739 tcatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatgaattatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 71838  T
Q  324 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  71839 atgttgtggagatgatcaatataattgggagttatcctatatattgtggtgaaaattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 71921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 29 - 413
Target Start/End: Original strand, 6453 - 6837
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||  ||||||||| |||||||  ||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6453 ccacttgatatggtttttggtcggaaatggtt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatga 6551  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6552 atgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 6651  T
Q  229 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  6652 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgatttaattgtgtataggcatgttttcttgataatgcaaatga 6751  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6752 tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtagcattatcgagtccttgtac 6837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 25809 - 26200
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25809 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgatgttgt 25907  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25908 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 26007  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||   |||||||||||||||||    
T  26008 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatctgtgtatagacatgttttcttgataat 26107  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26108 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatatttaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 413
Target Start/End: Original strand, 70486 - 70873
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||     
T  70486 ttgccacttgacacggtttttggtcgagaatgtat-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 70584  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  70585 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtacactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 70684  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  70685 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgatttcttgataattcaaa 70784  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70785 tgttgtggagatgattaatataaatgggtgttatcctatatattgaggagaaacttgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 70873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 94 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 93701 - 93527
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaa 193  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  93701 tattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaa 93602  T
Q  194 tacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt 267  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  93601 tgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgt 93527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 21 - 412
Target Start/End: Original strand, 6147927 - 6148315
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| | |||||||  |   |||||||| |||||||||| ||    
T  6147927 gccggtggccacttgatatggtttttggttggaaatgttgtcttgagccaattgtcttatgatttgttgtgacca---ttatatgaataagtgaagtggt 6148023  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6148024 atgatttaatgattgtattggatatgatgtctatcatgaagtgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatacttgaatggtgaaactatatatgat 6148123  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6148124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcttgttttcttgataatg 6148223  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 412  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6148224 taaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctacatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 6148315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 413
Target Start/End: Original strand, 16183094 - 16183489
Alignment:
Q  22 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | ||||||||||||||    
T  16183094 ccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgta 16183192  T
Q  122 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgata 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16183193 tgaatgaatgattgttttggatatgatgtatatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgatgaaactatatgtgata 16183292  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16183293 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgacaatg 16183392  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat----attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183393 caaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgattgaggtgtaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 16183489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 50113218 - 50113602
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  50113218 gccgtttgccacttgacacg--ttttggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatgtttatataactaagtgaagttgt 50113314  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50113315 atgaatgaatgattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatataaagaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 50113414  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50113415 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatg 50113514  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50113515 caaatgttgtggaggtaatcaatataat----tgttgtcctatatattgaggtg-aaattgtggattgttgttgcattatcgagtccttgtac 50113602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Original strand, 22145362 - 22145740
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattctt-atatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||    
T  22145362 ttgccacttgacatagttcttggtcggaaatgttt-cttgagtcaattgtcttatgaattgtcgtgaccattttttatatgactaagttaagttgtatga 22145460  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22145461 atgaatgattgtattggatatgatatttatcatgatatgtgtatgctatcttacttaagatgtaaggaatgcttggatgatgaaactatatgtgatagtt 22145560  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22145561 gatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaatggtgtaggggcatgttttcttgataatgcaaa 22145660  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22145661 -gttgtggagataatcaatataattgggtg-tgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttatcgcattatcgagtc 22145740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 17099789 - 17099397
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17099789 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttataaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttg 17099692  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  17099691 tatgaatgaatgattgtattggatatgatg-ttatcatgtaatgtgtatgcaatcttgcttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgag 17099593  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||| | ||  |||  ||||  |||||||||||||||    
T  17099592 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttataatttgattgtttatggacatgttttcttgata 17099493  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17099492 atgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgctgacgcattatcgagtccttgtac 17099397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13816511 - 13816200
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  13816511 ttatataagtaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 13816412  T
Q  199 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | ||| ||    
T  13816411 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattgtgt 13816312  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13816311 gtgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgagaattgtggattgttgtcgcat 13816212  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  13816211 tatcgagtcctt 13816200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 19571932 - 19572242
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  19571932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 19572031  T
Q  199 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | | ||| ||    
T  19572032 gaattggtgaaactatatgtg-tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattgtgt 19572130  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19572131 gtggccatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcacat 19572230  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  19572231 tatcgagtcctt 19572242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 318695 - 319081
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  318695 gccggtggccacttgatatggtttttggtcaaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 318793  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg- 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||| |||||||||||||||||     
T  318794 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatcagatgtgtatgctatcttacttaaggtgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 318893  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||| | | ||||| ||||||||||||||||    
T  318894 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatgatttaatcgtgtatgggcatgttttcttgata 318993  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  318994 atgcaaatgatgtggaaatgaacaatataattgggtgttatcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 319081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 35122763 - 35122377
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||    
T  35122763 gccgtttgccacttgatacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccaatcgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaaattgt 35122666  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    || |||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||     
T  35122665 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatga 35122566  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  35122565 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatttggttgtgtatggacatgttttcttgata 35122466  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  35122465 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattatgaattgttgtcgcattatcgagtc 35122377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 409
Target Start/End: Original strand, 15860308 - 15860617
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  15860308 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcataagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-tt 15860406  T
Q  199 gaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||    
T  15860407 gaattggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattgtgt 15860506  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
     ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15860507 gtggacatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcat 15860605  T
Q  398 tatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||    
T  15860606 tatcgagtcctt 15860617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8630920 - 8630538
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||| |||||  |||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8630920 gccgtttgccacttgacacggtctttggttgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 8630822  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| |  |  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8630821 atgaatgaatgattgtttgaggcatgatatt-atcatgagatgtgtatgctatcttgttcggaatgtaaggaatgtttgaatggtgaaactatatgtgat 8630723  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8630722 aattgacgttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgtcttcttgataatg 8630623  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  8630622 caaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 8630538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 405
Target Start/End: Original strand, 15469552 - 15469931
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||  |||||  ||| ||| |  ||||||  |||| | ||||| |||||||||||||    
T  15469552 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcctgtatgactaagtgaagttgt 15469650  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||| ||||||    
T  15469651 atgaatgaaagattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatgtga 15469749  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| || || ||||| || |||||||||    
T  15469750 tagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatg-ttccttgataat 15469848  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  15469849 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-aaattgt-gattattgtcgcattatcgagt 15469931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Original strand, 53899605 - 53899989
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  53899605 cggttgccacttgatatggttttggatcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtat 53899703  T
Q  123 gaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtga 219  Q
     |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  53899704 aaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttggaatggtgaaaccatatgaga 53899803  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  53899804 taaatgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtatatggacatgttttcttgataat 53899902  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53899903 gcaaatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatataatgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 53899989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 411
Target Start/End: Original strand, 11198653 - 11199045
Alignment:
Q  22 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||| ||||||||  |||| || |  | |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11198653 ccggttgccacttgatacggtttttagtcagaaatgttc-cttaagtcaattgtcttaagatttatcgtgactattcttatatgactaagtgaggttgta 11198751  T
Q  122 tgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |    
T  11198752 tgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgtttgaaatggtaaaactatatgag 11198851  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  11198852 atagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 11198951  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  11198952 atgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcaagtctttgt 11199045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 98 - 369
Target Start/End: Original strand, 47786041 - 47786314
Alignment:
Q  98 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa-agaatac 196  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  47786041 cttatattactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagacgtgtatgctatcttacttagaatgtaagagaatgc 47786140  T
Q  197 ttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgc 295  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||     
T  47786141 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgt 47786240  T
Q  296 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47786241 gtatggacatgctttcttgataatgaaaatgtggtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattg 47786314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 29 - 406
Target Start/End: Original strand, 12350934 - 12351312
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||||||||| || | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12350934 ccactcgatatggtttttgggtcggatatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgtagagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgattg 12351032  T
Q  128 aatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12351033 aatgattgtataaaatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttga 12351132  T
Q  227 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| ||  |  |||||||||||||||||||||||    
T  12351133 tgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgcggacatgttttcttgataatgcaaat 12351232  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12351233 gatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgaattatcgagtc 12351312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 91 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 25057856 - 25057531
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||    
T  25057856 gattattcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtgtatgctatcttacttaagatgta 25057757  T
Q  189 aagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 286  Q
    ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatga 25057657  T
Q  287 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggat 386  Q
     ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  25057656 tttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtagagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gat 25057558  T
Q  387 tgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25057557 tgttgtcgcattatcgagtccttgtac 25057531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 76 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23491530 - 23491202
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| | |||||||||||    
T  23491530 cttatgaattgttgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtgtatgctat 23491431  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    ||||||||  |||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  23491430 cttacttaagatgtaaggaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaa 23491331  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    || |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  23491330 tgatgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtg 23491231  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23491230 gagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 23491202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14297574 - 14297188
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14297574 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14297477  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14297476 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14297377  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14297376 ataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgata 14297277  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14297276 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14297188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 14303201 - 14302815
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| |  | |||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14303201 gccgtttgccacttggtatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgacttatcgtggctattcttatatgactaa-tgaagttgt 14303104  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| |    
T  14303103 atgaatgaatgatattatttggatatgattcttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgattgaaatggtgaaaccatatgag 14303004  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||| || ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14303003 ataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattgatgtggtgataatgagtattatgatttgattgagtatggacatgttttcttgata 14302904  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14302903 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattattgagtc 14302815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14294434 - 14294114
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14294434 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 14294336  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgattt 14294236  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14294235 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattga 14294136  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  14294135 tgtcgcattatcgagtctttgt 14294114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 406
Target Start/End: Original strand, 11062184 - 11062504
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  11062184 gtgactattctcatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatg 11062283  T
Q  187 taaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactat 284  Q
    |||  ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  |||    
T  11062284 taagaaatgcttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcttat 11062383  T
Q  285 gagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtgg 384  Q
    || ||  ||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11062384 gatttgattgtgtatggacatgtttt-ttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgg 11062482  T
Q  385 attgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  11062483 attgatgtcgcattattgagtc 11062504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14300061 - 14299741
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  14300061 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaa-g 14299963  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||  |||||  ||||| ||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgaggttgtgataatgaatcttatgattt 14299863  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
      ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  14299862 gattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctgtatattgtggtgaaaattgtggattga 14299763  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  14299762 tgtcgcattatcgagtctttgt 14299741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40938736 - 40938421
Alignment:
Q  94 tattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||  |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  40938736 tattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgtgtatgttctcttacttataatgtaaag 40938637  T
Q  192 aatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagtta 290  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||  |||||  ||||| ||     
T  40938636 aatgcttgaatggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttgatgtggtgataatgaatcttatgatttg 40938537  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
     ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||| |    
T  40938536 attgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttatggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtaaattggt 40938437  T
Q  391 gtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  40938436 gtcgcattatcgagtc 40938421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 403
Target Start/End: Original strand, 12562563 - 12562944
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| |     | ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12562563 ttgccacttggtacggtttttgggcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttacgttctatcgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgtatgaa 12562661  T
Q  126 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatag 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  12562662 tgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaaggaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtag 12562761  T
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  12562762 ttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtacggacatgttttcttgataatgc 12562861  T
Q  322 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa-ttgtggattgttgtcgcattatcga 403  Q
    || ||||||||| || ||||||||| |||||  || |||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12562862 aattgttgtggagatgatcaatatatttggaatttttcctctatattgtggtgaaaatttgtgaagtgttgtcgcattatcga 12562944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16819802 - 16819597
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || |    
T  16819802 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgt 16819705  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  16819704 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 16819607  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  16819606 tcgagtcctt 16819597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33340740 - 33340534
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |    
T  33340740 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaa 33340641  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  33340640 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 33340542  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  33340541 atcgagtc 33340534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 138 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 18909647 - 18909378
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18909647 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 18909549  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || | |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18909548 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgtggatgttttcttgataatgc-aatgttgtggag 18909452  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909451 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 18909378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15575002 - 15574730
Alignment:
Q  135 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15575002 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15574904  T
Q  234 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15574903 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 15574805  T
Q  334 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15574804 gatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15574730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19945700 - 19945317
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  19945700 ttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtga 19945602  T
Q  125 atgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||| || |||  | ||||||||||||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | | |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19945601 atgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgat 19945503  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19945502 agttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattgtgtatgagcatgttttcttgataat 19945403  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19945402 gcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 19945317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 17957533 - 17957802
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17957533 ttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 17957631  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17957632 gtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggac 17957731  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957732 atgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 17957802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 202 - 406
Target Start/End: Original strand, 51159742 - 51159945
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||     
T  51159742 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtgtatgg 51159841  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  51159842 acatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattggtgtcgcattatc 51159940  T
Q  402 gagtc 406  Q
    |||||    
T  51159941 gagtc 51159945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 53769618 - 53769350
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53769618 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 53769520  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  53769519 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 53769421  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53769420 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 53769350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 135 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15614021 - 15613749
Alignment:
Q  135 gtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaa 233  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15614021 gtattgaatatgatgttcatcatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaa 15613923  T
Q  234 tgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  15613922 tgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtggacatgtttccttggtaatgc-aatgttgtgga 15613824  T
Q  334 aataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
     || || ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15613823 gatgattaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 15613749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22273939 - 22273737
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  22273939 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 22273842  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  22273841 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 22273744  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  22273743 atcgagt 22273737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 8269673 - 8269870
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||    
T  8269673 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgt 8269770  T
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8269771 tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcc 8269868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Original strand, 8276784 - 8276981
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||    
T  8276784 aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgt 8276881  T
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcc 407  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8276882 tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcc 8276979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18909869 - 18909656
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  18909869 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 18909771  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909770 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 18909671  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  18909670 agttgatgttgaatg 18909656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53769840 - 53769627
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  53769840 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 53769742  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53769741 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 53769642  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  53769641 agttgatgttgaatg 53769627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048751
Alignment:
Q  204 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||| |    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggg 2048854  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2048853 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 2048755  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  2048754 agtc 2048751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230751
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| | |||      
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattgtgaatgga 19230854  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19230853 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 19230755  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  19230754 agtc 19230751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Original strand, 2450590 - 2450791
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||     
T  2450590 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgatttattt--gtg 2450686  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  2450687 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 2450784  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  2450785 atcgagt 2450791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 208 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 49231102 - 49230901
Alignment:
Q  208 aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  49231102 aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatg 49231003  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49231002 ttttcttgataatgcaa-tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 49230904  T
Q  407 ctt 409  Q
    |||    
T  49230903 ctt 49230901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22274155 - 22274011
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22274155 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 22274056  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274055 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 22274011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 1468885 - 1469121
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  1468885 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 1468982  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1468983 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 1469079  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1469080 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 1469121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7852705 - 7852499
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||    
T  7852705 gaatagtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattgtgta 7852606  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  7852605 tggacatgttttcttgataatgtaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 7852507  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  7852506 atcgagtc 7852499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 2450374 - 2450518
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2450374 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgggtatgctatcttacttagaatgtaag 2450473  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2450474 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2450518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13837938 - 13837733
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13837938 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgtt--cttgagtcaattgtcttatgatttatggtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 13837841  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13837840 atgaatgaatgtttgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13837741  T
Q  221 agttgatg 228  Q
    ||||||||    
T  13837740 agttgatg 13837733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 16745433 - 16745639
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| || |    
T  16745433 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgac-ttgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattgtgttt 16745531  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||    
T  16745532 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaattgt-gatggttgtcgcatta 16745629  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  16745630 tcgagtcctt 16745639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 214 - 406
Target Start/End: Original strand, 17913527 - 17913717
Alignment:
Q  214 atgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttctt 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||    
T  17913527 atgtgatagttgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatggacatgttttctt 17913626  T
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17913627 gataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattggatgtcgtcctatatattgtgttgacaattgt-gattg-tgtcgcattatctagtc 17913717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16259938 - 16259732
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||     
T  16259938 gaatggtgaagctatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtg 16259839  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16259838 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 16259740  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  16259739 atcgagtc 16259732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 44228354 - 44228115
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44228354 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatg 44228257  T
Q  267 tg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 365  Q
    || ||||| ||||| |||||| ||| | | ||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44228256 tgatgatgatgaatgctatgatttaatcgtgtatgggcatgtttccttggtaatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatat 44228158  T
Q  366 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44228157 attgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 44228115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Original strand, 17957375 - 17957520
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17957375 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatg 17957474  T
Q  187 taaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 231  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957475 taaggaatgcttgaatgggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17957520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 27839573 - 27839394
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  27839573 tgaatgataatgttgattgttgatgatcatgttaatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaa-tgat 27839475  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27839474 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 27839394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 406
Target Start/End: Original strand, 14522580 - 14522775
Alignment:
Q  212 atatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgtttt 310  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| || ||||| ||  ||| ||||| |||||||||    
T  14522580 atatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattgtgtatgggcatgtttt 14522679  T
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14522680 cttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 14522775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30152205 - 30152023
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30152205 ttgatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30152109  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30152108 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30152023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 49231326 - 49231180
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 189  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  49231326 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgttatatgttatcttacttagaatgtaa 49231227  T
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  49231226 ggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgattatgaatga 49231180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16820019 - 16819882
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaa 189  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16820019 gattattcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttatcttacttagaatgtaa 16819920  T
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16819919 ggaatgcttaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17937492 - 17937333
Alignment:
Q  102 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || | |    
T  17937492 tatgactaagtgaagatgtatgaatgaatgattgtattggatacgatgtttatcatattatgtgtatgctatcttacataggatgtaagaaatgctagta 17937393  T
Q  201 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 260  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17937392 ttggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg 17937333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7852993 - 7852777
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||    | | || ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  7852993 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttatgatctatcgcgactatccttatatgactaagtgaagatg 7852895  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgt 217  Q
    | |||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7852894 tgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctattttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgt 7852795  T
Q  218 gatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7852794 gatagttgatgttgaatg 7852777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 275 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 30205274 - 30205137
Alignment:
Q  275 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 374  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  30205274 tgaatactatgaattaattgtgtatgtgcatgttttcttgataaagcaaa-gttgtggagataatcaatataattgggtgttgtccaatatattcaggtg 30205176  T
Q  375 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30205175 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 30205137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 51159475 - 51159669
Alignment:
Q  43 ttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--g 140  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  |||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||  |    
T  51159475 tttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgactatttttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttg 51159573  T
Q  141 gatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51159574 gatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatga 51159669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17138553 - 17138157
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17138553 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcttttgagccaattgacttatgaattatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttat 17138456  T
Q  121 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 216  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |  ||| || ||| | |||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  17138455 atgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttgcatgttctcttacttaggatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatg 17138356  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat--------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 307  Q
     | |||||| |||| || || |||  |||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||        | ||||| ||| ||| ||| |  ||||     
T  17138355 aggtagttgttgttaaacgatatttatgatgattgatgatcatgttgatgatgtgatgatgaatcttattgaattatgatttaattgtgtaaggacatga 17138256  T
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  17138255 tgtcttgataattcaattgttgtggagatgatcaatatagttgggagttgtcctttatattgaggtgaaaattgtaaagtgatgtcgcattatcgagtc 17138157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 54423145 - 54423001
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttga-gtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatga 124  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  54423145 ttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatggttctttcaagtcaattaccttatgaattgttgtgattactcttatatgactaagtgaagttgtatga 54423048  T
Q  125 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgct 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  54423047 atgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgtgatgtgtatgct 54423001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 12265775 - 12265960
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||  | ||  ||||||| |||| |||||||    
T  12265775 ttgatgttagatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttatttgtctgtggacatgtttccttggtaatgca 12265874  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12265875 a-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12265960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 413
Target Start/End: Original strand, 17523691 - 17523884
Alignment:
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |  |  |||||| ||| || ||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||    
T  17523691 gatagttaatgttgaatgacattattgattattgatgatcatgat--ttggtgatgatgagtagtatgaattaattgtgtatggacatgatttcttgata 17523788  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17523789 atgcacatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattggggtgaaaaccgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 17523884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 205 - 409
Target Start/End: Original strand, 15939725 - 15939930
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 303  Q
    |||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||  ||||||  | || ||    
T  15939725 tgaaactataagtgataattgaagttgaatgactttgttgattgttgataatcaagttatggtgtgaatgatgaatactatgatctatttgtatgtgggc 15939824  T
Q  304 atgtttt-cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |    
T  15939825 atgttttgcttgataattcaa-tgttatggggataatcaatataattgggtgttgtcatatacattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattattg 15939923  T
Q  403 agtcctt 409  Q
    |||||||    
T  15939924 agtcctt 15939930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 223 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5227585 - 5227406
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||| |||||||  |   | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  5227585 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatacatt---tgaattgtatatgagcatgttttcttgataatgca 5227489  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5227488 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 5227406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 266 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10737386 - 10737247
Alignment:
Q  266 gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatat 365  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||| |||||||||||||    
T  10737386 gtgtcatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtgaagatgaacaatacaattgggtgttgtcctatat 10737287  T
Q  366 attgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10737286 attgtggagaaaattgt-tattgttgtcgcattatcgagtc 10737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 311 - 409
Target Start/End: Original strand, 14846034 - 14846131
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14846034 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 14846131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33340949 - 33340812
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  33340949 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 33340850  T
Q  199 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  33340849 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 33340812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 45859884 - 45859709
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45859884 tgaatgatattattgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgtt 45859786  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45859785 gtgaagataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 45859709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 55315252 - 55315085
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaat-gtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  | |||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  55315252 attgttgattgttgataatcaagttgtttgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 55315154  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  55315153 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 55315085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 204 - 318
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031364
Alignment:
Q  204 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||| | ||| |    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaaattgtgaatggg 12031348  T
Q  303 catgttttcttgataa 318  Q
    | ||||||||||||||    
T  12031349 cgtgttttcttgataa 12031364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 346
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935286
Alignment:
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aa 16935264  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatata 346  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  16935265 tgttgtggagataatcaatata 16935286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 310 - 409
Target Start/End: Original strand, 8305693 - 8305790
Alignment:
Q  310 tcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8305693 tcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8305790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 159
Target Start/End: Original strand, 17523552 - 17523690
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||     
T  17523552 gccgtttgccacttgatatggtttttggtcggaaatg-cttcttgagtcaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatatgactaa-tgacgttgc 17523649  T
Q  121 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatga 159  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17523650 atgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatga 17523690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16260261 - 16260014
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||   ||||  |||| |||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16260261 gccgtttgccaattgacacggtctttggtcgaaaatgttt-cttgaactaattgtcttacgaattgtggtgactattcttgtatgactaagtgaagttgt 16260163  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||||||| ||||| |||     ||||| |||||||||| || | || | |  | |||||| |||| | |  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16260162 atgaatgagtgattatat-----atgatatttatcatgagatattgttttccctattacttggaatatgat-aatgcttgaattggtgaaactatatgtg 16260069  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16260068 atagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 311 - 409
Target Start/End: Original strand, 18905171 - 18905267
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18905171 cttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgt-gattgttttcgcattattgagtcctt 18905267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39654925 - 39654757
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| || |||  |||||||||| ||| |||| | |||| |||||   |||||||||||||    
T  39654925 gtgactattcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgtcctcttacttagaat 39654826  T
Q  186 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    || |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39654825 gtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgttgattattgat 39654757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41269098 - 41268931
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaa-tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||||||||||| |||  || || || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  41269098 attgttgattgttgataatcaagttgtctgtgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggtatgttctcttggtaatgcaa-tgttgtggagat 41269000  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || | |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  41268999 aatcaatataattgggtgttgtcctatgtattgagttg-agattgagaaatgttgtcgcattatcgagtc 41268931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 269 - 406
Target Start/End: Original strand, 13976964 - 13977101
Alignment:
Q  269 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 367  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  13976964 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatata 13977062  T
Q  368 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13977063 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13977101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 406
Target Start/End: Original strand, 13956132 - 13956269
Alignment:
Q  269 tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatat- 367  Q
    ||||| |||||||||||| |||  || || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  13956132 tgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaaaataattgggtgttgtcctatatata 13956230  T
Q  368 -tgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     |||| ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13956231 ttgagttgaca-ttgagaattgttgtcgcattatcgagtc 13956269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Original strand, 14843815 - 14843919
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 304  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||    
T  14843815 tgaaactatatgtgatagtgggtgttgaatgatattgttgattggtgataatcaagttattatgtgatgatgaatgctatgatttatttgtgtgtgggca 14843914  T
Q  305 tgttt 309  Q
    |||||    
T  14843915 tgttt 14843919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 314 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12951835 - 12951743
Alignment:
Q  314 gataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  12951835 gataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgagatgatgtcgcattatcgagtc 12951743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15874953 - 15874893
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  15874953 ttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 15874893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38167070 - 38167007
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 139  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38167070 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 38167007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Original strand, 9303753 - 9303802
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9303753 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Original strand, 12031164 - 12031233
Alignment:
Q  98 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12031164 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 12031233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 11330382 - 11330442
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  11330382 ttcttgataatgcaaatgtggtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattg 11330442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 189
Target Start/End: Original strand, 14522487 - 14522538
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaa 189  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14522487 ttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaa 14522538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15516521 - 15516426
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||    
T  15516521 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattttgagttgatgtcgcattatcaagtc 15516426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Original strand, 11883518 - 11883580
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||    
T  11883518 aatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgttgattatcgatgattatgtt 11883580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2049038 - 2048969
Alignment:
Q  98 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2049038 cttatataactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 2048969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10737476 - 10737388
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || | |  ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10737476 ttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttggagtat-gagaatgcctgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 10737388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15516671 - 15516590
Alignment:
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  15516671 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgctgttgaatgatattgttgattattgat 15516590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 38812367 - 38812436
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  38812367 cttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 38812436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 12490105 - 12490177
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  12490105 tttcttgataatgaaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 12490177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14287828 - 14287780
Alignment:
Q  363 tatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14287828 tatattgtggtgaaaattgtggattgatgtcgcattatcgagtctttgt 14287780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19231036 - 19230968
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  19231036 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcataagatgtgta 19230968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39654695 - 39654607
Alignment:
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  39654695 atgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 39654607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 286
Target Start/End: Original strand, 18897982 - 18898045
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 286  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  18897982 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatga 18898045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 406
Target Start/End: Original strand, 11883645 - 11883735
Alignment:
Q  316 taatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||| ||| ||||   || |||||||||||||||||    
T  11883645 taatgctaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtggaaagtgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 11883735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11813586 - 11813553
Alignment:
Q  376 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11813586 aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 11813553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 253
Target Start/End: Original strand, 33370118 - 33370169
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33370118 tggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 33370169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 14060614 - 14060675
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||| || || |||||||| |||||||    
T  14060614 tttcttgataatgcaaatattgtggggatgatcaatatagtttgaagttgtcctttatattg 14060675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 381
Target Start/End: Original strand, 55442145 - 55442218
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattgg-atgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  55442145 ttcttaataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaagatgtcctttatattgttgtgaaaattg 55442218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 378 - 406
Target Start/End: Original strand, 47786311 - 47786339
Alignment:
Q  378 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786311 attgtggattgttgtcgcattatcgagtc 47786339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 50 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 6594 - 6232
Alignment:
Q  50 cggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 149  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594 cggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatg 6496  T
Q  150 tttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 249  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6495 tttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 6396  T
Q  250 tgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataatt 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6395 tgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataatt 6296  T
Q  350 ggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6295 gggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 6232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 1925 - 2317
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||||||    
T  1925 gccgtttgccacttgacacggttttcggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagttgt 2023  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  2024 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtgtatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatgcttgaatgataaaactatatgtgat 2123  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  2124 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataat 2223  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2224 gcaaatgatgtggagataatcaatataagtgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 2317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 12826 - 13217
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||  |||| |||| || ||||  ||| |||||| | |||||||||||||    
T  12826 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcggaaatgttt-cttaaaccaattgtcttaagaattgtggtgaccatttttatataactaagtgaagttgt 12924  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12925 atgaatgaataattttattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttataatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 13024  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  13025 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgacaatg 13124  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13125 caaatgttgttgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattatggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 13217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 400 - 161
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || || |||||  ||||||||| |||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  400 gccggtggccacttgatatggtttttggacggaaatgtttt-ttaagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatgtgactaagtgaatttgt 302  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |  |||||||||||||||||||||    
T  301 atgattgaatgattgtataggatatgatgcttatcatgagaggtgtatgctaccttact-agaatgtaatgaatgttgaaatggtgaaactatatgtgat 203  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 36891794 - 36892185
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  36891794 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattattgtgatcattcttatatgactaagtgaagttgt 36891892  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgat-gtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtg 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36891893 atgattgaaagattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtg 36891991  T
Q  219 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36891992 atagtcgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtga-tgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataa 36892090  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892091 tgaaaatgttgtggagataatcaatataattgggagttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 36892185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22273951 - 22273577
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273951 acttgatatgggttttgataggagatgttttattgagtcaattacctaatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22273852  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22273851 gattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22273753  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  22273752 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgtgcatgttttcttgataatgcgaatgatg 22273653  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22273652 tggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22273577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22283184 - 22282810
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22283184 acttgatatgggttttgattggagatgttttattgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaat 22283085  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22283084 gattgtattggatatgatgtttatcttgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgt 22282986  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22282985 tgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataaagcaaatgatg 22282886  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||| | || |||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22282885 tggagatgaacaatataattaggtgctgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22282810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 4449312 - 4449698
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  4449312 gccgtttgccacttgatatggttttggatcggaaatgttt-cttgggccaattgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgt 4449410  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||| |     
T  4449411 ataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtgaaaccatagga 4449510  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  4449511 gataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatga-ttggttgtgtatggacatgttttcttgata 4449609  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4449610 atgcaaatgttgcgaaaatgatcaatataattggaagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtc 4449698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 29 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 8942715 - 8942334
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8942715 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatga 8942617  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8942616 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttg 8942518  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  8942517 atgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgagcatgttttcttgataatgcaa- 8942419  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8942418 tgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 8942334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 409
Target Start/End: Original strand, 12637255 - 12637633
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12637255 ccacttgacacgttctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggttaagtgaagttgtatgaatga 12637353  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  12637354 atgattgtattggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttg 12637452  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaat 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| |||    
T  12637453 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aat 12637549  T
Q  326 gttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12637550 gttgtggagataatcaatataatggtggtgttatcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12637633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 29 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6878513 - 6878134
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||||||||| || ||||  |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  6878513 ccacttgatatggtttttggtcggaaatattt-cttgagccaattgtcttatgaattgtggtgaccattcttatataactaagtgaagttgtgtgaacga 6878415  T
Q  129 atgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggt-gaaactatatgtgatagttg 225  Q
    || ||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6878414 ataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttg 6878315  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgt-gatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6878314 atgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 6878215  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6878214 ggatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgtggtcgcattatcgagtc 6878134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8887099 - 8886832
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8887099 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttaaaatgtaagaaata-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 8887001  T
Q  237 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8887000 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 8886901  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8886900 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttatcgcattatcgagtc 8886832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 22862446 - 22862179
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22862446 ttggatatgatatttatcatgatatatgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatga 22862348  T
Q  237 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
     ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22862347 aattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgagcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 22862248  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22862247 aaacaatataattgagtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 22862179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25600858 - 25600652
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||    
T  25600858 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtat 25600759  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25600758 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgcggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtaaaaattgtggattgttgtcgcatta 25600659  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  25600658 tcgagtc 25600652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 66 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27260592 - 27260274
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27260592 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgattttattggatatgatgtttatcatgagaggtg 27260493  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
T  27260492 tatgctatcatac-tagaatgcaagggatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtt--------------------- 27260415  T
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
     |||||||| |||||||||||| ||  |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  27260414 -gtgtgatgatgaatactatgaattgattgtatatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatggtcaatataattgggagttgtcctata 27260316  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27260315 tattatggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 27260274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 140 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12727010 - 12726741
Alignment:
Q  140 ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgac 237  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | |  ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  12727010 ggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgac 12726911  T
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaata 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  12726910 attgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagata 12726812  T
Q  338 atcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12726811 atcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 12726741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 20014131 - 20013810
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| | | |  | |||||| |||    
T  20014131 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgtttttccc-tattacttggaa 20014033  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatacta 283  Q
    | | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  20014032 tatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatacta 20013934  T
Q  284 tgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 383  Q
    ||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| ||     
T  20013933 tgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatggt- 20013836  T
Q  384 gattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  20013835 gattgttgtcgcattatcgagtcctt 20013810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 14907583 - 14907907
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  14907583 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 14907682  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  14907683 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 14907781  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  14907782 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 14907880  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  14907881 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 14907907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 406
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581402
Alignment:
Q  102 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttg 22581193  T
Q  200 aat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgt 297  Q
    ||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||   |||||  ||||| ||  ||  ||    
T  22581194 aattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttgatgttgtgagaatgaatcttatgatttgattatgt 22581293  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22581294 atggacatgttttcttgataatgcaaacgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcat 22581393  T
Q  398 tatcgagtc 406  Q
    |||||||||    
T  22581394 tatcgagtc 22581402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23819191 - 23818867
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  23819191 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 23819092  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  23819091 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 23818993  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  23818992 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgaaatgg 23818894  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23818893 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 23818867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 34823093 - 34822886
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  34823093 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 34822994  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  34822993 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatta 34822896  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  34822895 tcgagtcctt 34822886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 21275788 - 21275995
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21275788 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21275885  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||||||||||    
T  21275886 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21275984  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  21275985 atcgagtcctt 21275995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 3800375 - 3800581
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  3800375 aatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 3800472  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  3800473 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 3800571  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  3800572 tcgagtcctt 3800581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Original strand, 5889559 - 5889765
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  || |    
T  5889559 aatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtgt 5889656  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  5889657 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatta 5889755  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  5889756 tcgagtcctt 5889765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 199 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 24967195 - 24966987
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||| ||||| | |||    
T  24967195 gaatggtgaaactatatgatatagttaatgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgatttattcgtgta 24967096  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24967095 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtggtcgcatt 24966996  T
Q  399 atcgagtcc 407  Q
    |||||||||    
T  24966995 atcgagtcc 24966987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 21275503 - 21275716
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  21275503 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 21275601  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275602 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 21275701  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  21275702 agttgatgttgaatg 21275716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Original strand, 19888041 - 19888243
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  19888041 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 19888138  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  19888139 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 19888236  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  19888237 atcgagt 19888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 21140771 - 21140569
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  21140771 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 21140674  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||    
T  21140673 tgggcatg-tttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtgaattgttgtcgcatt 21140576  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  21140575 atcgagt 21140569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 12643001 - 12643214
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  12643001 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 12643099  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12643100 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 12643199  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  12643200 agttgatgttgaatg 12643214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 198 - 387
Target Start/End: Original strand, 25877210 - 25877399
Alignment:
Q  198 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt-gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||| |    
T  25877210 tgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattgtg 25877309  T
Q  297 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 387  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877310 tatggccatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggtgaaaattgtggatt 25877399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 12643223 - 12643491
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12643223 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 12643321  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||  |||||||||||| |||||| |||||||||||     
T  12643322 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtggccatgttttcttggtaatgc-aatgttgtggag 12643420  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12643421 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 12643491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 76 - 411
Target Start/End: Original strand, 24572526 - 24572865
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || |||||| ||||||||| | |    
T  24572526 cttatgattgattgagaatattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatgtgtatgttct 24572625  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtga 271  Q
    |||||||||||||| | ||||  ||||| |||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  24572626 cttacttagaatgtgaggaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttgatgttgtga 24572725  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    |  |||||  | ||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| |    
T  24572726 taatgaatcttgtgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtg 24572825  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||    
T  24572826 gtgaaaattgtgaagtgttatcgcattatcgagtctttgt 24572865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 205 - 405
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644442
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||| ||| | ||| |||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattgtgaatgggca 43644342  T
Q  305 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43644343 tgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgag 43644441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 461631 - 461426
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  461631 tggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 461532  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  461531 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 461434  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  461433 gagtcctt 461426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7320450 - 7320174
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7320450 ttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctcttacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatg 7320351  T
Q  236 acattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||  ||||| ||  ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7320350 acattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattttgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggag 7320251  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7320250 attatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattggtgtcgcattatcgagtctttgt 7320174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 405
Target Start/End: Original strand, 24827831 - 24828034
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||     
T  24827831 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatttatttgtgt- 24827929  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
     | |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  24827930 -gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgagattgtggattgttgtcgcatt 24828027  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  24828028 atcgagt 24828034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 42179342 - 42179555
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||| ||||||    
T  42179342 gccgtttgccacttgatacggtttttagtcggaaatgtttt-ttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtggagttgt 42179440  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42179441 atgaatgaatgattgttttggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 42179540  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  42179541 agttgatgttgaatg 42179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 19887825 - 19887969
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19887825 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 19887924  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887925 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 19887969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 11232484 - 11232720
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  11232484 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 11232581  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11232582 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 11232678  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11232679 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 11232720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 22514331 - 22514567
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22514331 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 22514428  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22514429 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 22514525  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22514526 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 22514567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16900361 - 16900207
Alignment:
Q  102 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16900361 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16900262  T
Q  201 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16900261 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16900207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 102 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16993752 - 16993598
Alignment:
Q  102 tatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-a 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |    
T  16993752 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgggtatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaa 16993653  T
Q  201 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataa 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16993652 atggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16993598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Original strand, 20628662 - 20628864
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  20628662 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatg---atgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 20628758  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||    
T  20628759 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtatcgtcctatatattgaggttgaaatagtggattgttgtcacattatc 20628856  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  20628857 gagtcctt 20628864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21140987 - 21140843
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  21140987 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaag 21140888  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21140887 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 21140843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 28973118 - 28972727
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||  |  |  | ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28973118 gccgtttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgggttttatcgtgatcatttttatatgactaagtgaagttgt 28973020  T
Q  121 atgaatgaatg----attgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatat 215  Q
    ||||| |||||    | |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||| ||| |||||| |||| ||| |||||| ||||||| |    
T  28973019 atgaacgaatggccaaatgt--tggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtgatcttacctaggatgtaaggaatgcttaaatggtaaaactatgt 28972922  T
Q  216 gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttg 314  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||| ||||||     
T  28972921 gaggtgtttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgtcgatgttgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatg-tttctta 28972823  T
Q  315 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
     ||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28972822 gtaatgcaaatg-tgtggagatgatcaatatatatggatgttgtcctctatattgtggtgaaaattgtggattggtgtcgcattatcgagtctttgt 28972727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Original strand, 28776932 - 28777168
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  28776932 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 28777029  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28777030 tgtgatgatgaattctatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 28777126  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28777127 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 28777168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 235
Target Start/End: Original strand, 3800036 - 3800195
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 175  Q
    |||||||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800036 cttatgaattttggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatct 3800135  T
Q  176 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800136 tacttagaatgtaaggaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 413
Target Start/End: Original strand, 22691175 - 22691426
Alignment:
Q  161 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcat 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22691175 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcat 22691274  T
Q  260 gttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 358  Q
    |   || || |||||  || || ||||| ||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  22691275 g---atttgatgatgacgagtagtatgatttgattgtgtatagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgt 22691371  T
Q  359 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22691372 cctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 22691426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 161 - 413
Target Start/End: Original strand, 22695822 - 22696073
Alignment:
Q  161 atgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttga-atggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcat 259  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  22695822 atgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcat 22695921  T
Q  260 gttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 358  Q
    |   || || |||||  || || ||||| ||  ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||    
T  22695922 g---atttgatgatgacgagtagtatgatttgattgtgtatagacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgt 22696018  T
Q  359 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22696019 cctatatattgtggtgaaaactgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 22696073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Original strand, 9653983 - 9654296
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 175  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9653983 cttatgaattgttgtgaccattcttgtataactatgtgaagttgtatgaatgaatgat----------atgatatttatcatgagatgtatatgctatct 9654072  T
Q  176 tacttagaatgtaaagaatacttgaatg-gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgg 274  Q
    ||||||  |||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       ||||||||||  | |||||||     
T  9654073 tacttatgatgtaggaaatgcttgaatgagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttga-------taatcatgttgttatgtgatga 9654165  T
Q  275 tgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 374  Q
    |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||  |||||||||| || |    
T  9654166 tgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgttaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgctctatatattgtggag 9654265  T
Q  375 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9654266 aaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 9654296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 23773407 - 23773225
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  23773407 ttgatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 23773311  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23773310 aatgttgtcgagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 23773225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 24686954 - 24687136
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||||||     
T  24686954 ttgatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgta--ggcatgttttcttgataatgc- 24687050  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24687051 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 24687136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 224 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15632269 - 15632088
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15632269 tgatgttgaatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttgataatgcaa 15632170  T
Q  324 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15632169 ttgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgttgagaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 15632088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 89 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25211988 - 25211866
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25211988 gtgactatccttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgta 25211889  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaact 211  Q
    | |||| ||||||||||||||||    
T  25211888 aggaatgcttgaatggtgaaact 25211866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 270226 - 270035
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||  ||||||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  270226 ttgccacttgatatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgagccagttgtcttatgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtataaa 270129  T
Q  126 tgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatg 216  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  270128 tgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgagttgtgtatgctatcttacttagagtgtaaggaatgcttgaaatggtgaaaccatatg 270035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34823309 - 34823165
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  34823309 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 34823211  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34823210 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12727270 - 12727126
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |  |    
T  12727270 gattattcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgctatcttacttggaatat-ga 12727172  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12727171 gaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 303 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 269981 - 269878
Alignment:
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  269981 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgtggtcgcattatcg 269882  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  269881 agtc 269878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 406
Target Start/End: Original strand, 17397894 - 17398061
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |  ||||||| |||||||||||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||    
T  17397894 attgttgattgttgataatcaagttgtttctgtgatgatgaatactatgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgttgagat 17397992  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17397993 aatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 17398061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 262
Target Start/End: Original strand, 22787108 - 22787351
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    | |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  22787108 gccgtttgccagttgatacggtaattg-tcggaaatgttc-cttgagtcaattgtcttatgatctatcgtgactattcttatatgactaaatgaagatgt 22787205  T
Q  121 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
     |||||||||  || |||  || ||||||| |||||||| | |||| ||||| | ||||| ||||||||| |  |||||||||| | || |||| |||||    
T  22787206 gtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttaattagaatgtgagaaatacttgaaattgtaaaaccatatg 22787305  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  22787306 aggtagttgatgttgaatgatattgtggattattgatgatcatgtt 22787351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 721257 - 721162
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  721257 cttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgtagtgatgtcgcattatcgagtc 721162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Original strand, 20628580 - 20628647
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 166  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20628580 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaataattatattggatatgatgtttatcatgagatgtgt 20628647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 721407 - 721317
Alignment:
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  721407 tcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgtt 721317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 23822894 - 23822967
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23822894 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23822967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 23824838 - 23824911
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23824838 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23824911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 23831973 - 23832046
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  23831973 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 23832046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 406
Target Start/End: Original strand, 22787408 - 22787506
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||| | ||||  ||| |||||||||||||||||    
T  22787408 tttcttggtaatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagtcgtcctctatattgtggtgaagactgtgagttgatgtcgcattatcgagtc 22787506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 19670515 - 19670576
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19670515 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 19670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22693133 - 22693040
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22693133 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22697780 - 22697687
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| ||||||||    
T  22697780 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa 22697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 253
Target Start/End: Original strand, 24088566 - 24088683
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| ||||   ||||||||||||||| |  |||||||||| |||| | |||||||| | ||||||||||| ||||    
T  24088566 ttggatatgatatttatcataagatgtggtatgtcctcttacttagaatgtgagaaatacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatg 24088665  T
Q  236 acattgttgattattgat 253  Q
    | ||||||||||||||||    
T  24088666 atattgttgattattgat 24088683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22693028 - 22692978
Alignment:
Q  359 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22693028 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22692978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 22697675 - 22697625
Alignment:
Q  359 cctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22697675 cctatatattgaggttgaaattgtggattgttgttgcattatcgagtcctt 22697625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 24088752 - 24088810
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24088752 cttggtaatgcaattgttgtggagataatcaatataattggaagttgtcctttatattg 24088810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 4663 - 4735
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4663 tttcttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 24295958 - 24296031
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  24295958 tttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatatatttgaaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 24296031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 461714 - 461646
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  461714 ttatataactaaatgaagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 461646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Original strand, 3800257 - 3800302
Alignment:
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3800257 agaatgcttgaatagtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatg 3800302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19658739 - 19658678
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| |||||||| |||||||    
T  19658739 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaacatatctggaagttgtcctttatattg 19658678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 138 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12727118 - 12727020
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |||| | | |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12727118 ttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgag-ctatatgtgatagttgatgttgaatg 12727021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 43644158 - 43644226
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43644158 ttatataactaagtgtagttgtatgaatgaatggttatgtgggatatgatgtctatcatgagatgtgta 43644226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Original strand, 137897 - 138286
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  137897 gccggtggcaactcgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaatggtggtgagtaatcttatatgactaagtgaagttgt 137995  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  137996 atgattgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagaagtgtatgctatcttactaa-aatgtaatgaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 138094  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  138095 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgtgtatggacatgttttcttgataat 138194  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
     | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138195 ac-aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaagtg-aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccctgtac 138286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 21 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 87504 - 87127
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||            |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  87504 gccggtggccacttgatatggtttttggtcgaaaatg-tttcttgagccaatt------------gttgtgaccattcttatatgactaagtgaagttgt 87418  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatga-tgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  87417 atgattgaatgattgtattggatatgattgtttatcatgaggtgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgaga 87318  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||||||||||  |||    
T  87317 tagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgatttatttgtgtatggacatgttttcttg--aat 87220  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  87219 gc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttctcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 87127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 26 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10740 - 10351
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10740 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgtgattatttttatatgactaagtgaagttgtataaa 10642  T
Q  126 tgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg-tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatag 222  Q
     ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||  |||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||| || | |||    
T  10641 cgaatggttgtatgttggatatgacgtttatcatagaatgtggtatgtgctcttacttagaatgtaaggaatgattgaatggtaaaactatgtgaggtag 10542  T
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgc 321  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  ||||  ||  ||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  10541 ttgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatatggtgataatgaatcttatgctttgattgtgtatggatatgttttcttgataatgc 10442  T
Q  322 aaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgta 412  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10441 aaatgttgtggagatgatcaatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgta 10351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 358 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 77124 - 77069
Alignment:
Q  358 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77124 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 77069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Original strand, 32287 - 32660
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  32287 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 32386  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32387 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 32484  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32485 tgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 32584  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32585 tggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 32660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 302 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 34147 - 34037
Alignment:
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34147 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 34049  T
Q  402 gagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||    
T  34048 gagtccttgtac 34037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 31 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40557 - 40184
Alignment:
Q  31 acttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaat 130  Q
    |||||||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40557 acttgatatgggttttaatcggagatgttttcttgagtcaattaccttaggaattgttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaat 40458  T
Q  131 gattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40457 gattgtattggatatgatgtttatgatgagatgtgtatgctatcttact-agaatgtaaggaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgt 40360  T
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40359 tgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatggacatgttttcttgataatgcaaatgatg 40260  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40259 tggagatgaacaatataattggctgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 40184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 199 - 413
Target Start/End: Original strand, 38594 - 38807
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  38594 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgta 38693  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  38694 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 38792  T
Q  399 atcgagtccttgtac 413  Q
    |||||||||||||||    
T  38793 atcgagtccttgtac 38807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 87 - 235
Target Start/End: Original strand, 38372 - 38522
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaa 184  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38372 ttgtgattattcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaa 38471  T
Q  185 tgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38472 tgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgttagttgatgttgaatg 38522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 66 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7827 - 7485
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7827 agtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtgtatcatgagatgtg 7728  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7727 tatgctatcttacttagaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 7628  T
Q  265 tgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 363  Q
    ||| |||||| |||||  ||||| ||  ||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||    
T  7627 tgtggtgatgatgaatcttatgatttgattgtgcatggacatgttttcttgataatgcaaatgttttggagatgatcaatataattgggagtggtcctat 7528  T
Q  364 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7527 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 7485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 108 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8424 - 8125
Alignment:
Q  108 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||  |||||| ||||    
T  8424 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtgttggataagatatttatcatgagatgtgtatgttatcttacctaggatgtaagatatgtttgaattggtg 8325  T
Q  207 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||    
T  8324 aaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtatgggcatg 8225  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8224 ttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgttctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3695 - 3318
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  3695 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 3597  T
Q  128 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3596 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 3497  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3496 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 3399  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3398 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 3318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 8309 - 8256
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatga 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||    
T  8309 gccacttgatatggtttttggtcggaaatg-tttcttgagccaattgtcttatga 8256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6303 - 5926
Alignment:
Q  28 gccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatg 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  6303 gccacttgatatggtttttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaata 6205  T
Q  128 aatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6204 aatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatcctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 6105  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   || ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6104 gatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgg--tgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaa 6007  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6006 tgttgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattg-agattgttgtcgcattatcgagtc 5926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1518 - 1336
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  1518 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1418 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtatgatg 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1057
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||    
T  1262 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattgtgtat 1163  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1162 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 1064  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  1063 tcgagtc 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 406
Target Start/End: Original strand, 7781 - 8123
Alignment:
Q  65 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 164  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7781 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 7880  T
Q  165 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtta 263  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  7881 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttg 7980  T
Q  264 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 363  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  7981 atgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtccttt 8080  T
Q  364 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8081 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 65 - 406
Target Start/End: Original strand, 13170 - 13512
Alignment:
Q  65 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgt 164  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  13170 gagtcaattaccgtatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatattgaatatgatgtttatcatgagatgt 13269  T
Q  165 gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtta 263  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  13270 gtatgatatcctacttagaatgtaaggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttg 13369  T
Q  264 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 363  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  13370 atgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtccttt 13469  T
Q  364 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13470 atattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattattgagtc 13512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20351 - 20084
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20351 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 20253  T
Q  237 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20252 cattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 20153  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20152 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 20084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18267 - 18000
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18267 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacctagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 18169  T
Q  237 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||| ||| ||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18168 cattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattgtggatgtgcttgttttcttgataatgcaaatgatgtggagat 18069  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18068 gaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 66 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3692 - 3352
Alignment:
Q  66 agtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtg 165  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3692 agtcaattaccttttgaattgttgtgactactcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtg 3593  T
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaa 264  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3592 tatgatatcttact-ataatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttga 3494  T
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
    |||||||||  |||| |||||| ||  ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  3493 tgtgtgatgaggaatgctatgaattgattgtgtatggacatattttcttgataatgcaaatgttgtggatatgatcaatataattgggagttgtcctata 3394  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3393 tattgtggtgaaaattttgtattgttgttgcattatcgagtc 3352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 40 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21696 - 21351
Alignment:
Q  40 ggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 139  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| | || |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696 ggttttgggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgatttgtcgtgcccattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt 21598  T
Q  140 ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    ||||||||||                    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21597 ggatatgatg--------------------ctatcttacttagaatgtaaggaatgctttaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 21518  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21517 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 21418  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21417 caatataattcggtgttgtcctatatactgaagtgaaaattgtggtttgttgtcgtattatcgagtc 21351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 205 - 406
Target Start/End: Original strand, 129466 - 129668
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 302  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||| || |||||| ||||||| |||||| || || | ||  ||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  129466 tgaaactatatgtgatagttgaggaatgaaggaccttattgattgttgataaccatgttgatatgcggtgacgaatactatgattttaattgtgtatggg 129565  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  129566 catgttttgttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 129664  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  129665 agtc 129668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 129390 - 129451
Alignment:
Q  108 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  129390 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 129451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13275 - 12891
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| || ||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13275 gccggtggccacttgatatggtttttagtcgaaaatgttt-ctcgagccaattgtcttat-aattgtggtgactattcttatatggctaagtgaatttgt 13178  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13177 atgaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacctaggatgtaggaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 13078  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13077 taattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataa 12978  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12977 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 12891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47201 - 46819
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47201 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 47103  T
Q  123 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  47102 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 47003  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  47002 gttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatg 46903  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46902 caaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 60649 - 60267
Alignment:
Q  23 cggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtat 122  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||  ||||| |||||  ||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  60649 cggtggccacttgatatggtttttgggcgaaaatgttta-ttgagccaattgtcttataaattgtggtgactattcttatatgactaagtgaagttgtat 60551  T
Q  123 gaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgata 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  60550 gaatgaatgattgtgttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgcgata 60451  T
Q  222 gttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatg 320  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||| ||||||    
T  60450 gttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttcataatg 60351  T
Q  321 caaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| |||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  60350 caaatgatgtggagatgaacaatat-attgggtgttgtcctatatattgtggtgaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 60267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44513
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  44875 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactatgcttgtatgactaagtgaagttgt 44778  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44777 atgaatgaatgattgtatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 44678  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||    
T  44677 tagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataa 44578  T
Q  319 tgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtg 383  Q
    |||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  44577 tgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtg 44513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 126 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39184 - 38903
Alignment:
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39184 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttg 39085  T
Q  226 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaa 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||    
T  39084 atgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtgtggacatgttttcttgataatgcaaa 38985  T
Q  325 tgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  38984 tgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtgaattgttgttgcattatcgagtc 38903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 78558 - 78241
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||| |||| || | |  | |||||| |||| | | |    
T  78558 attcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgttttccctattacttggaatatga-g 78460  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 290  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgattta 78360  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  78359 tttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgtt 78260  T
Q  391 gtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||    
T  78259 gtcgcattatcgagtcctt 78241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39392 - 39178
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  |||||   |||||||| || | || ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39392 gccgtttgccacttgacatggtttt-ggtcggaaatgttt-cttgaaccaattgttttatgaattgtggagactattcttgtatgactaagtgaagttgt 39295  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt-ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39294 atgaatgaatgattgtatttggttatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 39195  T
Q  220 tagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  39194 tagttgatgttgaatga 39178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 87 - 333
Target Start/End: Original strand, 20446 - 20692
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatg 186  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20446 ttgtgattattcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatg 20545  T
Q  187 taaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 286  Q
    |||  || | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20546 taagaaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataa 20645  T
Q  287 gttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20646 tttatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaagtgttgtgga 20692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 379 - 409
Target Start/End: Original strand, 20686 - 20716
Alignment:
Q  379 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20686 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 20716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 52361 - 52743
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  52361 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 52458  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  52459 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 52557  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  52558 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataat 52657  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52658 gcgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 52743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Original strand, 56313 - 56695
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  | |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||||||||||||  | |||||||| |    
T  56313 gccgtttgccacttgatatggtttg-gatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattcttatatgacaaggtgaagttat 56410  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  56411 atgattgaatgattgtatccgatatgatgtttatcatgggaggtgtatgctatcttact-agaatgtaatgaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtga 56509  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  56510 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataat 56609  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    || |||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  56610 gcgaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcacattatcgagtc 56695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 403
Target Start/End: Original strand, 13283 - 13660
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||| || | || ||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13283 ttgccacttgacatggtgtttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgttttatgaattgtggagactattcttatatgactaagtgaagttgtatgat 13381  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13382 tgaatgattgtatgggatatgatgcttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagtt 13481  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaa 323  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| || ||  ||| |||||||||||||||||    
T  13482 gatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgggtgtggacatattttcttgataatgcaa 13581  T
Q  324 atgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 403  Q
    ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13582 atgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcga 13660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16311 - 16132
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16311 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 16213  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16212 gtgaagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 237261 - 236874
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || ||||  ||| ||| || | |||||||||||||    
T  237261 gccgtttgccacttgacacggtttttggtcgtaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaatcgtggtgaccatttttacataactaagtgaagttgt 237163  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  237162 atgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgt 237063  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| | |||| ||||| |||||| ||| ||  |||||  ||| ||||||||||    
T  237062 gatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaattatgtatggacatattttcttgat 236963  T
Q  317 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||| | |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  236962 aatgcaaaagatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggtggaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 236874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 271020 - 270813
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactat-gagttatttgcgt 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||| |  ||| ||| ||    
T  271020 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatggttttaattgtgt 270921  T
Q  298 atgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcat 397  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  270920 atgggcatgttttcttgataatgcaaatgatatggagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcat 270822  T
Q  398 tatcgagtc 406  Q
    |||||||||    
T  270821 tatcgagtc 270813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 173; Significance: 8e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 403
Target Start/End: Original strand, 505 - 861
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| || |||||  |||| | || ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  505 ccacttgatatcgttttaggtcggaaatgctt-cttaagccaattgtcttagggattgttgtgaatattcttatatgactaaacgaagttgtatgaatga 603  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgat 227  Q
    ||||||||||||                  | ||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  604 atgattgtattg------------------agatgagtatactatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaac 685  T
Q  228 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  686 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgtatgggcatgatttcttgataatgcaaatgt 785  T
Q  328 tgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 403  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 tgtggaggtaatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 99 - 398
Target Start/End: Original strand, 5770 - 6069
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||   ||    
T  5770 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttttggatatgataattatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaaggttt 5869  T
Q  199 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatg-ttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcg 296  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||| ||| ||| |    
T  5870 gaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattgtg 5969  T
Q  297 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 396  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5970 tgtgggcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgca 6067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 168; Significance: 7e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 28780 - 28574
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||     
T  28780 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtgtgg 28681  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28680 gcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 28582  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  28581 gagtcctt 28574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 29104 - 28857
Alignment:
Q  26 ttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaa 125  Q
    ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29104 ttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgatcattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaa 29006  T
Q  126 tgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29005 tgaatgattgtattggatatgatgattatcatgagatatgtatgctattttacttggaatgtaaggaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagtt 28906  T
Q  225 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  28905 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 91 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28028 - 27714
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |  |    
T  28028 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtaggctatcttacttggaatat-ga 27930  T
Q  191 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtg-atggtgaatactatgagt 288  Q
    |||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | |||| |||||||||||||||| |    
T  27929 gaatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgatt 27831  T
Q  289 tatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattg 388  Q
    || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  27830 taattgtgtatggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattg 27732  T
Q  389 ttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27731 ttgtcgcattatcgagtc 27714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 21 - 409
Target Start/End: Original strand, 14350 - 14735
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||  ||| |||| |||||  |||||  | || |||| || |||| |||  |||||| | |||||||||| ||    
T  14350 gccggtagccacttgacatggtttttggtcaaaaacgttt-cttgaaccaattgtcctaagaattgtggtgactatgtttatataactaagtgaagtggt 14448  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtga 219  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  14449 atgaatggatgattgttttggatatgatatttatcatgggatgtgtatgttatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatatgtga 14547  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||| ||||||||||||    
T  14548 tagttgatgaggagtgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatg-tttcttgataat 14646  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14647 gc-aatgttgtggagataatcaatataattaggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 14735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28394 - 28261
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  28394 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 28295  T
Q  301 agcatgt-tttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
      ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  28294 gacatgtattgcttgataatgcaaatgatgtgga 28261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 40390 - 40257
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  40390 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 40291  T
Q  301 agcatgt-tttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
      ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  40290 gacatgtattgcttgataatgcaaatgatgtgga 40257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28472
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  28545 aatggtgaaattatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40541 - 40468
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  40541 aatggtgaaattatatgtgatatttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Original strand, 23801 - 23862
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  23801 tttcttgataatgcaaatgttatggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 23862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 165; Significance: 5e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 138 - 413
Target Start/End: Original strand, 15064 - 15338
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaat 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||| | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15064 ttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctcttacttggaatatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaat 15162  T
Q  235 gacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaa 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  15163 gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttatttgtgt--gggcatgttttcttgataatgcaa-tgttgtggag 15259  T
Q  335 ataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260 ataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 15338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 14842 - 15055
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14842 gccgtttgccacttgacacggtctttggtcggaaatgttt-cttgaactaattgtcttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgt 14940  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14941 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgtgatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 15040  T
Q  221 agttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||    
T  15041 agttgatgttgaatg 15055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 166 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 14613 - 14364
Alignment:
Q  166 tatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatcatgtta 263  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14613 tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgtta 14514  T
Q  264 atgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctat 363  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  14513 atgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatagacatgatttcttgataatgcaaatattgtggagatgatcaatataattgggtgttgtcctat 14414  T
Q  364 atattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14413 atattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattgtcgagtccttgtac 14364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 142 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 32541 - 32268
Alignment:
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacat 239  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32541 atatgatatttatcatgagatgttgtatgttctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacat 32442  T
Q  240 tgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataat 339  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  32441 tgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatgtacatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagatgat 32342  T
Q  340 caatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32341 caatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtctttgtac 32268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 200 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 95219 - 95006
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  95219 aatggtgaaactatatgtgaaagttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaactgtgtat 95120  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95119 gggcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggagataatcaatataattgagtgttgttctatatattaaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 95020  T
Q  400 tcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||    
T  95019 tcgagtccttgtac 95006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 95545 - 95294
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| |||||| |||||  ||| ||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  95545 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttgtgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 95447  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  95446 atgaatgaatgattgtattggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcctacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgat 95347  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  95346 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 242 - 406
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66907
Alignment:
Q  242 ttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatca 341  Q
    |||||| ||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatca 66843  T
Q  342 atataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  66844 atataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgagaattgttgtcgcattatcgagtc 66907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 54653 - 54330
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  54653 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgtgtatgctat 54554  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    ||||| |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||||||||||||||| ||    
T  54553 cttac-tagaatgtaaggaat-gttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattg-------ttgataatcatgttaatgtgtaat 54463  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  54462 gatgaatactatgatttaattatgaatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtgg 54363  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54362 agaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 54330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 109344 - 109553
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  109344 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattgtgta 109443  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  109444 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 109542  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  109543 atcgagtcctt 109553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 14590 - 14645
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgat 148  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  14590 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgat 14645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 190 - 409
Target Start/End: Original strand, 18831 - 19050
Alignment:
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  18831 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgattt 18930  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
    ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18931 atttgtgcatgtgcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggacatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgtggattgt 19030  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19031 tgtcgcattatcgagtcctt 19050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Original strand, 18510 - 18767
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgatta-ttcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18510 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccaattcttgtatgactaagtgaagttg 18608  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatctt-acttagaatgtaaagaatacttgaatgg-tgaaactatat 215  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||||| |||||||||||    
T  18609 tatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatgtgtatgctatctttacttaggatgtaagaaatgtttgaatggatgaaactatat 18708  T
Q  216 -gtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18709 tgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 76 - 406
Target Start/End: Original strand, 11062 - 11394
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| |  ||||||||| | |||||||||||    
T  11062 cttatgaattgttgtgacaattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgagaagtgtatgctat 11161  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgat 272  Q
    |||||||   |||||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||    
T  11162 cttacttgagatgtaaggaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaat 11261  T
Q  273 ggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgagg 372  Q
    | |||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  11262 gttgaatactatgatttaattatgaatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtcttgtcctatatattgtgg 11361  T
Q  373 tgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  11362 agaaaattgt-gatttttgtcgcattatcgagtc 11394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 138 - 406
Target Start/End: Original strand, 248741 - 249008
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  248741 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagaaatg-ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatga 248839  T
Q  237 cattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  248840 cattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgggcatgttttcttgataatgcagatgatgtgggaat 248939  T
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     | |||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  248940 gaacaatataattgggtgttgtcttatatattgtggagaaaattgt-gatttttgttgcattatcgagtc 249008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 70 - 268
Target Start/End: Original strand, 2925 - 3124
Alignment:
Q  70 aattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  2925 aattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgtttgtattggatatgatgtgtatcatgagatgcgtatg 3024  T
Q  170 ctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg 268  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3025 ctatcttacttagaatgtaaggaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtg 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Original strand, 155618 - 155821
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||     
T  155618 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttattt--gtg 155715  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  155716 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcatt 155814  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  155815 atcgagt 155821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Original strand, 155402 - 155546
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||     
T  155402 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagttatgtatgatatcttacttagaatgtaag 155501  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155502 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 155546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Original strand, 732 - 914
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  732 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 828  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  829 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 267 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 35163 - 35023
Alignment:
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35163 tgtgatgatgaaaactatgatttaattgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 35065  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35064 ttgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 35023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Original strand, 2723 - 3045
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttaga 183  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || || |||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||||| |     
T  2723 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctcttacttggg 2822  T
Q  184 atgtaaagaatactt--gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    || | | ||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2823 atatga-gaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatac 2921  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||    
T  2922 tatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattg 3017  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  3018 tgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 22940 - 23168
Alignment:
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||    
T  22940 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtga 23033  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    |  |||||  ||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23034 taatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataaagcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtg 23133  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23134 gtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 23168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 333
Target Start/End: Original strand, 17485 - 17797
Alignment:
Q  22 ccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgta 121  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17485 ccggtagcaacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactattcttatatggctaagtgaagttgta 17583  T
Q  122 tgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17584 tgaatgaatgattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgat 17683  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  17684 agttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatggacatgttttcttgataat 17783  T
Q  320 gcaaatgttgtgga 333  Q
    ||||||| ||||||    
T  17784 gcaaatgatgtgga 17797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 333
Target Start/End: Original strand, 23903 - 24216
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||||  |||||||||||||    
T  23903 gccggtggccacttgatatggtttttggtcggaaatgtttcct-gaaccaattgtctttcgaattatggtgactatttttatatggctaagtgaagttgt 24001  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtga 219  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24002 atgaatgaataattgtatgagatatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtga 24101  T
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataa 318  Q
    || ||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||  ||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  24102 taattgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattgtgtatggacatattttcttgataa 24201  T
Q  319 tgcaaatgttgtgga 333  Q
    |||||||| ||||||    
T  24202 tgcaaatgatgtgga 24216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 190 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 145438 - 145223
Alignment:
Q  190 agaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt 289  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  145438 agaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattt 145339  T
Q  290 atttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgt 389  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  145338 atttatgtatgggcatgttttcttaataatgcatatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgt 145240  T
Q  390 tgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||||||    
T  145239 tgtcgcattatcgagtc 145223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 145757 - 145502
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||||||    
T  145757 gccggtggccacttgatatggtttttgatcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttgtgaccattattgtatgactaagtgaagttgt 145659  T
Q  121 atgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatat-g 216  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||||| ||||||||||||| |    
T  145658 atgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgtttgaattggtgaaactatattg 145559  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145558 tgatagttgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 147685 - 147482
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat-ttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||  ||| | ||      
T  147685 ggtgaaactatatgtgattgttgatgttgaaggatcttattgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaaattgtgaattg 147586  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  147585 gcatgttttcttgataatgcatatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttttcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatc 147487  T
Q  402 gagtc 406  Q
    |||||    
T  147486 gagtc 147482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 147769 - 147698
Alignment:
Q  98 cttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  147769 cttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 147698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 90147 - 90353
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||     
T  90147 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtg 90246  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||    
T  90247 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtgga---ttgtcgcatt 90342  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  90343 atcgagtcctt 90353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 129281 - 129075
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||||||  || |    
T  129281 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgatttattt--gtgt 129184  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | |||||  |||||||||||||||    
T  129183 gggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgagattgttaattgttgtcgcatta 129085  T
Q  400 tcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||    
T  129084 tcgagtcctt 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 129568 - 129353
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttctt-gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||  ||||| |    | |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  129568 gccgtttgccacttgatacggtttttg-tcggaaatgtttcctttgaaccaattttcttataatctatcgtgactatccttatatgactaagtgaagatg 129470  T
Q  120 tatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtga 219  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  129469 tgtgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatgtgtctgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtga 129370  T
Q  220 tagttgatgttgaatga 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  129369 tagttgatgttgaatga 129353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Original strand, 89938 - 90075
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatactt 198  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  89938 ttatataactaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttttggatatgatatttatcatgagatgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgttt 90037  T
Q  199 gaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||| |||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  90038 gaattggtgaaactatatgatgtggttgatgttgaatg 90075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 78471 - 78410
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  78471 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 78410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 205 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4530
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagc 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || ||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggc 4635  T
Q  304 atgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcga 403  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4634 atgttttcttgataatgcta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcga 4536  T
Q  404 gtcctt 409  Q
    ||||||    
T  4535 gtcctt 4530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 17545 - 17340
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  17545 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattgtgtat 17446  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  17445 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattg-ggattgttgtcgcatta 17347  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  17346 tcgagtc 17340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17764 - 17618
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgta 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17764 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagactgta 17665  T
Q  189 aagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17664 aggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatg 17618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 133; Significance: 6e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 205 - 409
Target Start/End: Original strand, 27781 - 27983
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagca 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| || || |||    
T  27781 tgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgtgtgggca 27880  T
Q  305 tgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgag 404  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27881 tgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcccattatcgag 27978  T
Q  405 tcctt 409  Q
    |||||    
T  27979 tcctt 27983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 27696 - 27763
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27696 ttatataactaagtgcagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgtctatcatgagatgtgta 27763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 399
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2593
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||    
T  2395 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaaatgtgtat 2494  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2495 ggacatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatta 2593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 2162 - 2319
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctat 173  Q
    ||||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2162 cttatgaattgttgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgaaatatgtatgctat 2261  T
Q  174 cttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 231  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 cttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 2319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25915 - 25591
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  25915 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttccctattacttgg 25816  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  25815 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 25717  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |    
T  25716 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatgg 25618  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25617 t-gattgttgtcgcattatcgagtcctt 25591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 87 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 21660 - 21336
Alignment:
Q  87 ttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtg--tatgctatcttacttag 182  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||   | | |  | |||||| |    
T  21660 ttgtgattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgtttttccctattacttgg 21561  T
Q  183 aatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatac 281  Q
    ||| | | |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  21560 aatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatac 21462  T
Q  282 tatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |    
T  21461 tatgatttaattgtgtatgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagtttgacatgg 21363  T
Q  382 tggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21362 t-gattgttatcgcattatcgagtcctt 21336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 146005 - 145616
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttgg-tcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttg 119  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  || |||||||||| ||||||     | |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  146005 gccgtttgccacttgatacggtttttgggtcgaaaacgttc-ctcgagtcaattatcttatgttctatcgtgactattcttatatgactaagtgaagttg 145907  T
Q  120 tatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  145906 tataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatgtgtatgttctcttacttagaatgtaagaaattcttgaattggtaaaactatatg 145807  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 316  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  145806 agatagtggatg-tgaatgacattgttgattattgatgatcatgt-----tgtgataatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgat 145713  T
Q  317 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatata-at-tggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  145712 aatgctaatgttgtggagatgatcaatatatatatggaagttgtcctctatattgtggtgaaaatcgtgaattgatgtcgcattatcaagtctttgt 145616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 95 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 467 - 154
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaag 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||||||| |||| || |    | |||||| |||| |   |    
T  467 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttttcctattacttggaatatgg-g 369  T
Q  192 aatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtta 290  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgattta 269  T
Q  291 tttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgtt 390  Q
     ||  |||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  268 attatgtatggacatattttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataactgggagttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgtt 170  T
Q  391 gtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  169 gtcgcattatcgagtc 154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 2078 - 1873
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| ||| ||| || ||     
T  2078 tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattgtgtgtgg 1979  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1978 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatc 1881  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  1880 gagtcctt 1873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 2152 - 2085
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgt 166  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2152 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattgcatatgatgtttatcatgagatgtgt 2085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Original strand, 6415 - 6620
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatga 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||| || ||     
T  6415 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaattgtgtgtgg 6514  T
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  6515 gcatgttttcttgataatgc-aatg-tgtggagataatcaatataattgggcgtcgtcctatatattgaggttgaaattgtggattattgtcgcattatc 6612  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  6613 gagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6400
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtt-tatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6332 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat-gtggatatgatgttctatcatgagatgtgta 6400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 199 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 6076 - 5874
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  ||     
T  6076 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataatttattt--gtg 5979  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  5978 tgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 5881  T
Q  399 atcgagt 405  Q
    |||||||    
T  5880 atcgagt 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217218
Alignment:
Q  204 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga-gttatttgcgtatgag 302  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattttaattgtgtatggg 217115  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  217116 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattatggagaaaattat-gattgttgtcgcattatcg 217214  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  217215 agtc 217218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 91 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6292 - 6148
Alignment:
Q  91 gattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6292 gattattcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgttatcttacttagaatgtaag 6193  T
Q  191 gaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 gaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 6148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 216932 - 217000
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  216932 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgagggatatgatgtctatcatgagatgtgta 217000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 204 - 409
Target Start/End: Original strand, 2958 - 3163
Alignment:
Q  204 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  |||||| || || |    
T  2958 gtgaaactaaatgtgatagtttatgttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgatctatttgtgtgtggg 3057  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3058 catgttttcttgataatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgagtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcg 3156  T
Q  403 agtcctt 409  Q
    |||||||    
T  3157 agtcctt 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Original strand, 2740 - 2882
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2740 attcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 2839  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2840 atgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 2882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 220 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8771
Alignment:
Q  220 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataat 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  8957 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattgtgtatggacatgttttcttgataat 8858  T
Q  320 gcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8857 gcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 8771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 244
Alignment:
Q  207 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga-tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || || | ||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgatctatttgtgtgtgggtat 347  T
Q  306 gttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  346 gttttcttgataatgtta-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 248  T
Q  406 cctt 409  Q
    ||||    
T  247 cctt 244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 254
Target Start/End: Original strand, 43051 - 43275
Alignment:
Q  29 ccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatga 128  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||  |||||  |||| |||| || |||  |||  |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43051 ccacttgatatgatttttggtcgaaaatgttt-cttgaaccaattgtcttaagaattgtggtggctatgtttatataactaagtgaagttgtatgaatga 43149  T
Q  129 atgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43150 atgattgtattaaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaatcatatgtgatagttgatg 43249  T
Q  229 ttgaatgacattgttgattattgata 254  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  43250 tttaatgacattgttgattattgata 43275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 113652 - 113883
Alignment:
Q  30 cacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaa 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  113652 cacttgataaggtttttggtcggaagtgttc-cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactactcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaa 113750  T
Q  130 tgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatg 228  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  113751 tgattgtattgaatatgatatttatcatgagatgtgtatgctatcttac-tagaatgtaaggaatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatg 113849  T
Q  229 ttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  113850 ttgaatgacattgttgataattgataatcatgtt 113883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 108739 - 108343
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||||  ||||||| |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  108739 gccgtttgccacttgatatggtatt--gtcggaaatgtttctttgagtcaattggcttatgattcatcgtgactattcttatatgattaagtgaagttgt 108642  T
Q  121 atgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgt 217  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  ||| |||||| || | |||||||||      
T  108641 atgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagatatgtatgctatcttacttggaatgtgagaaatgcttgaagtgataaaactatataa 108542  T
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatgt 307  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||  |||||         | ||||| ||  ||| |||||  ||||     
T  108541 ggtagttgatgttgaagaacattgttgattattaatgatcatgatgatgtggtgataatgaatcttatttgaattatgatttgattgtgtatggacatga 108442  T
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||| || ||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||   || |||||||||||||||||    
T  108441 tttcttaataatgcaattgttctggagatgatcaatatatttagaaattgtcctttatattgtggtggaaattgtgaggtgatgtcgcattatcgagtc 108343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Original strand, 6441 - 6620
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6441 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactttgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttgataatgcaa-tgtt 6539  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6540 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgagtcctt 6620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 106297 - 106370
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  106297 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 106370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 41605 - 41399
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||| | |||||| ||| ||| | |    
T  41605 aatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattgtgaa 41506  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  41505 tgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagattaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcatt 41407  T
Q  399 atcgagtc 406  Q
    ||||||||    
T  41406 atcgagtc 41399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 41737 - 41677
Alignment:
Q  175 ttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41737 ttacttagaatgtaaggaatgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 41677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 38213 - 37977
Alignment:
Q  168 tgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg 266  Q
    ||||||||||||| |||| | | |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  38213 tgctatcttacttggaatatga-gaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatg 38116  T
Q  267 tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatata 366  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||  || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38115 tgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc-aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatata 38019  T
Q  367 ttgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| || | ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38018 ttgagttg-agattgtgatttgttgtcgcattatcgagtcctt 37977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 345 - 164
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  345 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 246  T
Q  193 atacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  245 atccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 202 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 86 - 1
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatga 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  86 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40487 - 40291
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||| | |||||    
T  40487 ggtgaaactatatgtgatagttga------atgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattgtgaatgag 40394  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40393 catgttttcttgataatgcaaatgttgtgtagatgaacaatataattgggttttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcg 40295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40559 - 40502
Alignment:
Q  110 agtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgta 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40559 agtggagttgtatgaatgaatgattatgtgggatatgatgtatatcatgaaatgtgta 40502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 69646 - 69456
Alignment:
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgata 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||||    
T  69646 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgata 69547  T
Q  318 atgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcct 408  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  69546 atgcaaatgttgtggagatgatcaatataattgggagttgtcctatatattgtggttaaaattgtgaattgttgtcgcactatcgagtcct 69456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30957 - 30768
Alignment:
Q  218 gatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtg-tgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgat 316  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||    
T  30957 gatagttaatattgaatgacattgttgattattgatgatcttgttcatgtggtgataatgaatgttatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgat 30858  T
Q  317 aatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30857 aatgcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 30768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 89 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6570
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||     
T  6906 gtgactattcatatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 6807  T
Q  186 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 279  Q
    ||||  ||| |||||| || | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||   ||||        
T  6806 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataaggaatctta 6707  T
Q  280 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 374  Q
         | ||||| ||  ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  6706 attgaattatgatttgattgtgtatggacatgttttcttgataattcaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtg 6607  T
Q  375 aaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgt 411  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6606 aaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtctttgt 6570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24128 - 23898
Alignment:
Q  42 tttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattgg 141  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||| || || | || ||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24128 tttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatggattgtggagactattcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtattga 24031  T
Q  142 atatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatt 240  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24030 atatgatgttcatcatgagatgagtatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacatt 23931  T
Q  241 gttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23930 gttgattattgataatcatgttaatgtatgatg 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 76 - 235
Target Start/End: Original strand, 1507 - 1666
Alignment:
Q  76 cttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatct 175  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  1507 cttatgaattgtggtgactattcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctaact 1606  T
Q  176 tacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1607 tacttataatgtaaggaatggttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 406
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2095
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtat 299  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||| |||||| ||  ||| ||||    
T  1889 aatggtgaaaccatatgagataattgttgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattgtgtat 1988  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1989 ggacatgttttcttgataatgcaaatgttgtcgagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgtggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 2088  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    | |||||    
T  2089 tagagtc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1884
Alignment:
Q  65 gagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1817 gagtcaattaccttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgtatga 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 223 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 30223 - 30041
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  30223 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 30127  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30126 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcattatcgagtcctt 30041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 160 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 29942
Alignment:
Q  160 aatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga-ttattgataatc 257  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  30127 aatgtgtatgctatcttacttaggatgcaagaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatc 30028  T
Q  258 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaat 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  30027 atgttaatgtgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtatggacatgattttatgataatgcaaatgttgtggagatgatcaat 29942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18410 - 18263
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18410 gccgtttgccacttgatatggattttggtcggaaatgttt-cttgagccaattgtcttatgaattgttatgcctattcttatatgactaactgaagttgt 18312  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18311 atgattgaatgattgatttggatatgatgtttatcatgagatgtgtatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 337 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 27336 - 27260
Alignment:
Q  337 aatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 413  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27336 aatcaatataattgggttttgtcctatatattgaggagaaaattgtgaattgttgtcgcattatcgagtccttgtac 27260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 411
Target Start/End: Original strand, 2540 - 2942
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||   ||||||||||   |||||||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2540 gccgtttgccacttgatacggtatt--gtcggaaatgttcctttgagtcaatcggcttatgaattatcatgactattcttatatgactaagtgaagttgt 2637  T
Q  121 atgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatg 216  Q
    |||| ||||||||| |||  |||| |||||||||||||||  |||| ||||  | ||| |||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||    
T  2638 atgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctctaacttagaatgtaaaaaatgtttgaaatggtaaaactatatg 2737  T
Q  217 tgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcgtatgagcatg 306  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||         | ||| | ||  ||| |||||   |||    
T  2738 aggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgttgtgataatgaatcttatttgaaatataaattgattgtgtatggaaatg 2837  T
Q  307 ttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
     ||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  2838 atttcttgataataaaattgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgaagtgatgtcgcattatcgagtc 2937  T
Q  407 cttgt 411  Q
     ||||    
T  2938 tttgt 2942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 984 - 754
Alignment:
Q  24 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||| |  | |||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  984 ggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgtt--cttgagccaattgtcttatgatttatcgtgactattcttatacgactaagtgaagttgtatg 887  T
Q  124 aatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgat 220  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||  | ||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||  ||| |||||| |||| |||||||||| |||    
T  886 aatgaatgattgtatggtgggtatgatgaatgtcacgagatgtgtatgttctcttacttagactgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgagat 787  T
Q  221 agttgatgttgaatgacattgttgattattgat 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  786 agttaatgttgaatgacattgttgattattgat 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1077 - 935
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1077 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttacttagaatgtaagga 978  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15333 - 15191
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatt--ggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaaga 192  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  15333 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgttattttacttagaatgtaagga 15234  T
Q  193 atacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233 atgcttggatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 15191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 880 - 771
Alignment:
Q  296 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  880 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 782  T
Q  396 attatcgagtc 406  Q
    |||||||||||    
T  781 attatcgagtc 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 296 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 15136 - 15027
Alignment:
Q  296 gtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgc 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15136 gtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgc 15038  T
Q  396 attatcgagtc 406  Q
    |||||||||||    
T  15037 attatcgagtc 15027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12129 - 12021
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||||| ||| || |||||  ||||||| |  ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  12129 gccgtttgccacatgatttggatttttgtcggaaatgttt-cttcagccaattgtcttatgagttattgtgaccattcttgtatgactaagtgaagttgt 12031  T
Q  121 atgaatgaat 130  Q
    ||||||||||    
T  12030 atgaatgaat 12021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 106867 - 106689
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  106867 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 106769  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  106768 tggagataatcaatataattgggtgtcgtcctatatattgaggttgaaactgtggatttttgtcgcattatcgagtcctt 106689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 406
Target Start/End: Original strand, 6577 - 6805
Alignment:
Q  173 tcttacttagaatgtaaagaatacttgaat-ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtga 271  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     ||||    
T  6577 tcttacttagaatgtaagaaatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgtt-----gtga 6670  T
Q  272 tggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag 371  Q
    |  |||||  ||||| ||  ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  6671 taatgaatcttatgatttgattgtgtatggacatgttttcatgataatgcaaattttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgtg 6770  T
Q  372 gtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6771 gtgaaaattgtgaattgatgtcgcattatcgagtc 6805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 187
Target Start/End: Original strand, 5515 - 5676
Alignment:
Q  27 tgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaat 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| |  |  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5515 tgccacttgatacagtttttggtcagaaatgttt-cttgagccaattgtcttaggttttatcgcgattattcttatatgactaagtgaagttgtatgaac 5613  T
Q  127 gaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaatg-tgtatgctatcttacttagaatgt 187  Q
    |||||| | ||  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  5614 gaatgactatatgttggatgtgatg-ttatcatggaatgttgtatgtgctcttacttagaatgt 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 409
Target Start/End: Original strand, 17353 - 17561
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgta 298  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||  ||  || ||     
T  17353 gaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctgtgatgtaactgtgtg 17452  T
Q  299 tgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatt 398  Q
    |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  17453 tagacatgtttccttgataatgcaa-tgttgtggagatgatcaatatcattgggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtcgcatt 17550  T
Q  399 atcgagtcctt 409  Q
    |||||||||||    
T  17551 atcgagtcctt 17561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 205 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7875 - 7673
Alignment:
Q  205 tgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagtt-atttgcgtatgag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | ||| || |||||| ||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| || | ||| ||||| |    
T  7875 tgaaactatatgtgatagttgatgagtggaagaccttattgattgttgataatcatgttgttgtgtggtgatgaatactatgattttaattgtgtatggg 7776  T
Q  303 catgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7775 catgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaactatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgtattatcg 7677  T
Q  403 agtc 406  Q
    ||||    
T  7676 agtc 7673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7960 - 7890
Alignment:
Q  99 ttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7960 ttatataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagatatgatgtctatcatgagatgtgtatg 7890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 223 - 406
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11504
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||  | || |||||||| ||||||||||||    
T  11322 ttgatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattgtatgtgggcatgtttccttgataatgca 11421  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  11422 aatgatgtggagattaacaatataattgggtgtcgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgttgcattatcgagtc 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 203 - 406
Target Start/End: Original strand, 4862 - 5067
Alignment:
Q  203 ggtgaaactatatgtgatagttgatgt-tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttat--ttgcgtat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | ||| || |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||| || |  ||| ||||    
T  4862 ggtgaaactatatgtgatagttgatgagtggaagaccttattgattgttgataatcatgttgatgtgcggtgatgaatactatgatttttaattgtgtat 4961  T
Q  300 gagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcatta 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||     
T  4962 gggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattattgtcgcattg 5060  T
Q  400 tcgagtc 406  Q
    |||||||    
T  5061 tcgagtc 5067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 4788 - 4849
Alignment:
Q  108 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |  || ||||||| |||||||| |||||||||    
T  4788 taagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgagaaatgatgtctatcatgagatgtgtatg 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 51897 - 51719
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttg 329  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||    
T  51897 tgaatgatattgttgattgttgataaccaagttattatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgttg 51799  T
Q  330 tggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  51798 tggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaggttgatattgtgaattgttgtcgcattattgattcctt 51719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 4970 - 4823
Alignment:
Q  258 atgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttg 357  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  4970 atgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattgattgcgtgtgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgtggagatgatcaatataattgggagttg 4871  T
Q  358 tcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagt 405  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  4870 tcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttgtcgtgttatcgagt 4823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 89 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2114
Alignment:
Q  89 gtgattattcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaat 185  Q
    |||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||     
T  2442 gtgactattcatatatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagttctcttacttagaac 2343  T
Q  186 gtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---- 279  Q
    ||||  ||| |||||| || | | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||   ||||        
T  2342 gtaagaaatgcttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttgatgttgtgataaagaatctta 2243  T
Q  280 -----actatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtg 374  Q
         | ||| | ||  ||| |||||   ||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  2242 attaaaatataaattgattgtgtatggaaatgatttcttaataataaaaatgttgtggagatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtg 2143  T
Q  375 aaaattgtggattgttgtcgcattatcga 403  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2142 aaaattgtgaattgatgtcgcattatcga 2114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 281 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 59016 - 58899
Alignment:
Q  281 ctatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59016 ctatgaattatttgtgtatgggcatgttttcttgataatgcaaatgatgcggagatgatcaatataattgggtgtcgtcttatatattgaggtgaaaatt 58917  T
Q  381 gtggattgttgtcgcatt 398  Q
    ||||||||||||||||||    
T  58916 gtggattgttgtcgcatt 58899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 59675 - 59561
Alignment:
Q  147 atgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttga 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||     
T  59675 atgtttatcatgagatgtgtatgatatcttacttagaatgtaaggaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgttgg 59576  T
Q  246 ttattgataatcatg 260  Q
    ||||| || ||||||    
T  59575 ttattaatgatcatg 59561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 59422 - 59375
Alignment:
Q  238 attgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatg 285  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  59422 attgatgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Original strand, 1575 - 1672
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgtgtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1575 ttggatatgatgtttatcatgagatatgtatgctatcttgcatagaatgtaaggaatgcttgaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34466 - 34334
Alignment:
Q  202 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgt-gtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||    
T  34466 tggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgatttaattgtgtatg 34367  T
Q  301 agcatgttttcttgataatgcaaatgttgtgga 333  Q
      ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34366 gacatgttttcttgataatacaaatgatgtgga 34334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 409
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1263
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgtt 328  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||    
T  1078 tgaatgataatgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttgtgtgtgggcatgtttccttggtaatgcaa-tgtt 1176  T
Q  329 gtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgag-gtga-----aaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||     |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1177 gtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgagattgagattgaaattgtgaattgtggtcgcattatcgagtcctt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 223 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5700
Alignment:
Q  223 ttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgca 322  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||  || || ||||||||||||||||||||     
T  5867 ttgattttgtatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttattt--gtgtgggcatgttttcttgataatgc- 5771  T
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattg-gatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtc 393  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  5770 aatgttgttgagataatcaatataatggtggtgttgtcctatatattgagttg-agattgtgaattgttgtc 5700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 302 - 409
Target Start/End: Original strand, 9291 - 9397
Alignment:
Q  302 gcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9291 gcatgtttccttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgctgtcctatatattgaggttgaaattgtggattgttgtagcattatc 9389  T
Q  402 gagtcctt 409  Q
    ||||||||    
T  9390 gagtcctt 9397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 323 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 15073 - 14987
Alignment:
Q  323 aatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073 aatgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctatatattgaagttgaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 14987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 20600 - 20391
Alignment:
Q  207 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcg 296  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||         | ||||| ||  | | |    
T  20600 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaatcttatttgaattatgacttgatcgtg 20501  T
Q  297 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 396  Q
    ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  20500 tatggacgtgatttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgca 20401  T
Q  397 ttatcgagtc 406  Q
    ||||||||||    
T  20400 ttatcgagtc 20391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27429 - 27220
Alignment:
Q  207 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaat---------actatgagttatttgcg 296  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||         | ||||| ||  | | |    
T  27429 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgatgtgatagtgaatcttatttgaattatgacttgatcgtg 27330  T
Q  297 tatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgca 396  Q
    ||||  | || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  27329 tatggacgtgatttcttgataatgcaattgttgtggatatgatcaatatatttggaagttgtcctctatattgtggtgaaaattgtgagttgatgtcgca 27230  T
Q  397 ttatcgagtc 406  Q
    ||||||||||    
T  27229 ttatcgagtc 27220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 406
Target Start/End: Original strand, 4092 - 4218
Alignment:
Q  279 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 378  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  4092 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 4191  T
Q  379 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4192 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 4218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 279 - 406
Target Start/End: Original strand, 48932 - 49058
Alignment:
Q  279 tactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaa 378  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||    
T  48932 tactatgatttaattgtgtatgcgcatgttttcttggtaatgcaaatgatgtggagatgaacaatataatcgggtgttgtcatatatattgaggagaaaa 49031  T
Q  379 ttgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  49032 ttgt-gattcttgtcgcattatcgagtc 49058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4648 - 4534
Alignment:
Q  292 ttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttg 391  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648 ttgcgtatggacatattttattgatgatgcaaatgttgtggagatgatcaaaataattgggagttgtcctatatattgtggtgaaaattgtgaattgttg 4549  T
Q  392 tcgcattatcgagtc 406  Q
    || ||||||||||||    
T  4548 tcacattatcgagtc 4534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 53593 - 53462
Alignment:
Q  21 gccggttgccacttgatacggtttttggtcggaaatgttttcttgagtcaattaccttatgaatggttgtgattattcttatatgattaagtgaagttgt 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| || |||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  53593 gccgtttgccacttgacacggtttt-ggtcggaaatgttt-cttaagccaattgtcttatgaattgttgtgactattcttatatgactaagtgaagttgt 53496  T
Q  121 atgaatgaatgattgtattggatatgatgtttatc 155  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  53495 atgattgaatgattgt-ttgaatgtgatgtttatc 53462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 53203 - 53141
Alignment:
Q  200 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53203 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgatgatcatgtt 53141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53328 - 53279
Alignment:
Q  224 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  53328 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 315 - 406
Target Start/End: Original strand, 197482 - 197572
Alignment:
Q  315 ataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  197482 ataatgcaaatgatgtggagatgaacaatataattgggtgttgtcctatatattgtggagaaaattgt-gattgttgtcgcattatcgagtc 197572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Original strand, 330964 - 331021
Alignment:
Q  95 attcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgt 150  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  330964 attcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgatgt 331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 265 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4603 - 4469
Alignment:
Q  265 tgtgtgatggtgaatactatgagttatttgcgtatgagcatgttttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctata 364  Q
    ||||||||| | |||||| ||| |||  || || || ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4603 tgtgtgatgataaatactgtgatttaactgtgtgtgggcatgttttcttggtaatgcaa-tgttgtggagataatcaatataattgggtgttgtcctata 4505  T
Q  365 tattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatc 401  Q
    |||||| ||  | |||| | |||||||||||||||||    
T  4504 tattga-gtcgagattgagaattgttgtcgcattatc 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4801
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4728 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 4801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 7041 - 7114
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||    
T  7041 tttcttgataatgcaaatgttgtggagatgatcaatataatttgaagttgtcctttatattgttgtgaaaattg 7114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7290
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  7387 ttcttgataatgtaattgttgtagaggtgatcaatatatttggatgttgtcctttatattgttgtggaaattgtggggtgatgtcgcattatcgagtc 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 381
Target Start/End: Original strand, 71655 - 71728
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattg 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||    
T  71655 tttcttgataatgcgaatgttgtggagatgatcaatataattggaaggtgtcctttatattgttgtgaaaattg 71728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3739
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  3667 tttcttgataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 3739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 1030 - 991
Alignment:
Q  370 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1030 aggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtcctt 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 484 - 429
Alignment:
Q  207 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 262  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  484 aaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgtt 429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 6021 - 6116
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaattgtggattgttgtcgcattatcgagtc 406  Q
    |||||||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  6021 cttgataatgaaattgttgtggagattatcaatatatttggaagttgtcctctatattgttgtgaaaattgtgaggtgatgttgcattatcgagtc 6116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4820 - 4759
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  4820 tttcttgagaatgcagatgttgtggagataatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Original strand, 117977 - 118049
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattgaggtgaaaatt 380  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||||    
T  117977 tttcttaataatgcaaatgttgtggaggtgatcaatatatttggaagttgtcctttatattgttgtgaaaatt 118049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 23663 - 23786
Alignment:
Q  138 ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatgctatcttacttagaatgtaaagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatg 235  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| ||||| | |||||||| |||| | |  |||| ||||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  23663 ttggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctcttacttggaatatgagaaataattgaagtggtgaaactatctgatgtagttgatgttgaatg 23762  T
Q  236 acattgttgattattgataatcat 259  Q
    | |||| ||||||||||| |||||    
T  23763 atattgatgattattgatgatcat 23786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 12986 - 12936
Alignment:
Q  308 tttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgt 358  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||    
T  12986 tttcttgataatgctaatgttgtggagatgatcaatataattggaagttgt 12936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 368
Target Start/End: Original strand, 78206 - 78265
Alignment:
Q  309 ttcttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatatt 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| | |||||| ||||||    
T  78206 ttcttgataatgcaattgttgtggagatgatcaatatatttggaggctgtcctttatatt 78265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 249
Target Start/End: Original strand, 6400 - 6450
Alignment:
Q  199 gaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattat 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  6400 gaatggtgaaactatatgacatagttaatgttgaatgatattgatgattat 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 34261 - 34203
Alignment:
Q  311 cttgataatgcaaatgttgtggaaataatcaatataattggatgttgtcctatatattg 369  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  34261 cttgataatgcaattgttgaggagatgatcaatatatttggaagttgtcctttatattg 34203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 230 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2761 - 2696
Alignment:
Q  230 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatg-tgtgatggtgaatactatgagttatttg 294  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2761 tgaatgatattgttgattgttgataatcaagttatttatgtgatgatgaatactatgatttatttg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University