View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2818_high_5 (Length: 375)

Name: NF2818_high_5
Description: NF2818
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2818_high_5
NF2818_high_5
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (9-359)||(17923916-17924266)
[»] chr6 (5 HSPs)
chr6 (10-359)||(12931625-12931974)
chr6 (10-356)||(12957427-12957773)
chr6 (10-359)||(12898916-12899265)
chr6 (10-359)||(12947990-12948339)
chr6 (10-359)||(12906536-12906885)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (10-355)||(10564377-10564722)
chr5 (10-357)||(10763647-10763994)
chr5 (15-356)||(10747534-10747875)
chr5 (15-357)||(10741218-10741560)
chr5 (15-356)||(10611059-10611400)
chr5 (15-356)||(10717459-10717800)
chr5 (15-356)||(11049176-11049517)
chr5 (15-356)||(10580340-10580681)
chr5 (15-356)||(10217268-10217609)
chr5 (18-359)||(10604098-10604439)
chr5 (107-350)||(19606476-19606719)
chr5 (112-359)||(10601201-10601436)
chr5 (130-359)||(7192351-7192580)
chr5 (178-350)||(10558275-10558447)
chr5 (43-357)||(10588974-10589288)
chr5 (105-359)||(10660694-10660948)
chr5 (180-359)||(10652883-10653062)
chr5 (34-358)||(9836866-9837190)
chr5 (131-350)||(10550148-10550367)
chr5 (18-66)||(10601484-10601532)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (21-335)||(31467687-31468001)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (179-239)||(28605089-28605149)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 9 - 359
Target Start/End: Original strand, 17923916 - 17924266
Alignment:
Q  9 gatgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgataggg 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17923916 gatgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgataggg 17924015  T
Q  109 cacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacct 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17924016 catggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacct 17924115  T
Q  209 ctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17924116 ctccttccaacatgttaaaagaaacattcaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtc 17924215  T
Q  309 taaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17924216 taaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 17924266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12931974 - 12931625
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931974 atgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactagcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 12931875  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12931874 atggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcaagtctatttgggttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctc 12931775  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12931774 tccttccaacatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtct 12931675  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12931674 aaatatcgaagacctttgagaaaagtcaaagaggacggtattgttccgtt 12931625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12957773 - 12957427
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12957773 atgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccgcactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgctttgcatgtttcctacccttgatagggc 12957674  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12957673 atggtggtagatgcagatgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttggcttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctc 12957574  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12957573 tccttccaatatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaacgtct 12957474  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12957473 aaatattgaagacctttgagagaagctaaagaggacggtattgttcc 12957427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12899265 - 12898916
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12899265 atgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttacatgtttcctacccttgatagggc 12899166  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12899165 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacagagctttttgtttccaatcacttctatttgcgttgcatttccaaatacaccatttgtcggtacctc 12899066  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12899065 tccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaagtct 12898966  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898965 aaatattgaagacctttaagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 12898916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12948339 - 12947990
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12948339 atgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatccctgctatcaacctgaacttttgttgctttgcatgtttcctaccattgatagggc 12948240  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12948239 atggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacatagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatttgtcggtatctc 12948140  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12948139 tcctaccaacatgttaaaagaaacattcaaatactctaaaacagagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtct 12948040  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12948039 aaatatcgaagacctttgagaaaagtcaaagaggacggtattgttccgtt 12947990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 10 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12906885 - 12906536
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12906885 atgataaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatgactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagagc 12906786  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||    
T  12906785 atggtggtagatgcaggtgggaaatgcctccacaaagctttttgtttccaatcaattctatttgggttgaatttccaaataaaccttttgtcggtacctc 12906686  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906685 tccttccaacatgttaaaagaaacattaaaatattccaaaaatgagatattttgcataccatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtct 12906586  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12906585 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 12906536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 10 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10564722 - 10564377
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564722 atgataaatgaaagtatgagaagaaaagaaaccacactaattatcactgccatcaacctgatctttttctgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 10564623  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   ||||| ||    
T  10564622 atggtggtagatgcagctgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttacatttccaaatacaccatttaatggtacatc 10564523  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10564522 tccttccaacatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataacatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtct 10564423  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10564422 aaatatcgaagacctttgagagaagccatagaggacggtattgttc 10564377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 10 - 357
Target Start/End: Original strand, 10763647 - 10763994
Alignment:
Q  10 atgaaaaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggc 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  10763647 atgataaatgaaagtatgagaagaaaagaaaccacgctaactatcactgctatcaacctgaacttgtgtcgttttgcatgtttaatacccttgacagggc 10763746  T
Q  110 acggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctc 209  Q
    | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||    
T  10763747 atgatggtagatgtagccgggaaatacctccacaaagcttcttgtttccagtcacttctatttgggatacatttccaaatacgccatttgttggtacttc 10763846  T
Q  210 tccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtct 309  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10763847 gccttccaacatgttaaaagaaacattcaaatattcttaaacagatatattttgcataacatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtct 10763946  T
Q  310 aaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccg 357  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10763947 aaactttgaagacctttgagagaagccatagaggatggtattgttccg 10763994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 10747534 - 10747875
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||| |||| || || |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  10747534 aaatgaaagtatgagaagaaaaaaaacaacactaactatcactgcgaccaacatgaatttatggtgttttgtgtctttcctacccttgatagggcatggt 10747633  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    |||| ||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| | | |||||||| ||||    
T  10747634 ggtaaatgcagcagcaaaatacctccacaaagcttattgtttccaatcaattctactttggttacatttccaaatacaccattttttggtacctcacctt 10747733  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10747734 ccaacatgttaaaagaaacattcaaatattctaaaacagagatattttgcataacatcaggaattgacccagacaatcgatttcttgaaaggtctaaatg 10747833  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10747834 ttgaagaccttcgagagaagccaaagaggatggtattgttcc 10747875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 15 - 357
Target Start/End: Original strand, 10741218 - 10741560
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | |    
T  10741218 aaatgaaagtatgagcagaaaagaaatcacgctaactatcactgctatcaacttgaaattatgtttttttgcatgtttactatccttgatagggcatgat 10741317  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10741318 ggtagatgcaactctgaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgagatacatttccaaatacaccatttgttggtacctctcctt 10741417  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    |||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10741418 ccaataagttaaaagaaacattcaagtattccaaaccagagatactcttcataacatcaggaattgatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaact 10741517  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccg 357  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  10741518 ttgaagacctttgagagaagccatagaggatggtattgttccg 10741560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10611400 - 10611059
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10611400 aaataaaaatatgagaagaaaagaaaccatgctaactatcactgctatcagcctgaatatatggtgttttgggtgtttcctacccttgatagggcatggt 10611301  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || || |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10611300 gctagatgcagctgagaaatacctccacaaagcttattgtttccaatcattgctactttggatgcatttctaaagacaccatttgtcgggacctcacctt 10611201  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| | |||||||   |||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10611200 ccagcatgttaaaagaaacattcaagtgttctaaacatgagatatcctgcataacatcaggaattgatccagacaattgatttgttgaaaggtctaaata 10611101  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10611100 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggaaggtattgttcc 10611059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 10717459 - 10717800
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||| |||||||   || ||||||||||||||||| | |    
T  10717459 aaatgaaagtatgagcaaaaaaaaaatcacactaaatatcactgctatcaacttgaaattatgtttttttgcactcttactacccttgatagggcatgat 10717558  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10717559 ggtagatgcaactctgaaatacctccacaaagcttatagtttccaatcatgtctatatgggatgcatttgcaaaaacaccatctgttggtacctcacctt 10717658  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||| || |||| || |||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10717659 ccaacatgttaaaagaaacattcaagtgttctaaaccatagattttctgcataacatcaggaattggtccgtacaattgatttcttgaaaggtctaaata 10717758  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    ||  | | | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10717759 tcttaaagccttgagagaagccaaagaggatggtattgttcc 10717800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 11049176 - 11049517
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || | | |||||||||| ||||| ||||||||||| | |    
T  11049176 aaatgaaagtatgataagaaaagaaaccacactaactatcactgataccaacctgaaattatggtttgttgcatgttttctacctttgatagggcatgat 11049275  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    ||||||||||  |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||    
T  11049276 ggtagatgcaaatctgaaatacctccacaaagcttattgtttcctatcattgctacatgggttgcatttccaaagacaccgtttgttggtacctcgcctt 11049375  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | || |||| || ||||||| || ||| |||  ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11049376 ccaacaggttaaaagaaacattcaagtgttttaaaccaaagatattctgtataacatttggaattgatccataaaattgatttctagaaaggtctaaata 11049475  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11049476 taaaagacctttgagcgaagccaaagaggacggtattgttcc 11049517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10580681 - 10580340
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggt 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| || || | ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10580681 aaatgaaagtatgagaagaaaagaaaccacactgactatcatagctatcaacttgaaattatggttttttatatgtttcctacccttgaaagggcatggt 10580582  T
Q  115 ggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcctt 214  Q
    |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || ||||||||||| | | ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10580581 ggtagatgtaactctgaaataccaccacaaagtttattgtttccaattattgctactctggttgcatttccaaagacaccatctgttggtacctcacctt 10580482  T
Q  215 ccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaata 314  Q
    |||||||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| | | |||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  10580481 ccaacatgttaaaagaaacatctaagtattctaaattagagatattttgcataacatcgggatttggtccaaacaatttatttcttgaaatatctaaata 10580382  T
Q  315 tcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  10580381 ccgtagacctttgagagaagcaaaagaggatggtcttgttcc 10580340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Original strand, 10217268 - 10217609
Alignment:
Q  15 aaatgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatc--actgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacg 112  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | || |  | | |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  10217268 aaatgaaagtatgataagaaaagaaaccacactaactatctcactgatatcaacctggaattatagtttgttgcatgtttcctaccgttgatagggcatg 10217367  T
Q  113 gtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctcc 212  Q
     ||  |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||  ||  || |||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||    
T  10217368 atgccagatgcaactctgaaatacctccacaaagcttattgtttccaatcattgttacatg--ttacatttccaaagacaccgtttgttggtacctcccc 10217465  T
Q  213 ttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaa 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||| || ||  |||  ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  10217466 ttccaacatgttaaaagaaacattcaagtgttttaaaccagagatattctgtatgacatttggaattgatccataaaattgatttctggaaaggtctaaa 10217565  T
Q  313 tatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttcc 356  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10217566 tataaaagacctttgagcgaagccaaagaggatggtattgttcc 10217609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10604439 - 10604098
Alignment:
Q  18 tgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggtggt 117  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||      || | |||||  || |||| || ||||| || ||| ||||||    
T  10604439 tgaaagtatgaaaagaaaagacaccacaccaactatcactgctatcaacctgggaaaatgattttttgtgtgcttccaacgcttgacagagcatggtggt 10604340  T
Q  118 agatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttcca 217  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||| |  ||||| |||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||| | ||| || ||||| |||||||    
T  10604339 agatgcaactgtgaaattcctccacaaagcttataatttccgatcattgctacttgggttgcatttcgaaagacaccgtttgttggcacctcaccttcca 10604240  T
Q  218 acatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcg 317  Q
    |||||||||| |||| |||||| | ||||||   ||||||||| |||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  10604239 acatgttaaaggaaacattcaagtgttctaagctagagatattctgcaaaacatcaggaattggtccatacaattgatttcttgaaatatctaaatattg 10604140  T
Q  318 aagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10604139 tagacctttgagagaagcaaaagaggatggtattgttccgtt 10604098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 350
Target Start/End: Original strand, 19606476 - 19606719
Alignment:
Q  107 ggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtac 206  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||| |    | ||||||||||| ||||| ||| | || ||    
T  19606476 ggcatggtggtaggtgcagatgcgaaatacctccacaaagcttattgttcccggtcactgctaatgcactagcatttccaaagacaccttctttaggaac 19606575  T
Q  207 ctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaagg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||| ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  19606576 ctctccatccaacatgttaaaagaaacattcaagtattctaaaacagaaatattttgcagaacactaggaattgatccagtcaaccgatttcttgatagg 19606675  T
Q  307 tctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtat 350  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  19606676 tctaaatatcgaagacctctaagagaagctaaagaggatggtat 19606719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10601436 - 10601201
Alignment:
Q  112 ggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctc 211  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||| | ||| |  ||||||||||||||| ||||| | ||| || |||||||    
T  10601436 ggtggtagatgcaactgtgaaattcctccacaaagcttgtaatttccaatcaatgctactctggttgcatttccaaagacaccgtttgttggcacctctc 10601337  T
Q  212 cttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaa 311  Q
    |||||||||||||            ||| ||||||||| |||| ||||| | |||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  10601336 cttccaacatgtt------------caagtattctaaaccagatatattctccataacaccaggaattggtccatacaattgatttcttgaaatatctaa 10601249  T
Q  312 atatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10601248 atattgtagacctttgagagcagccaaagaggatggtattgttccgtt 10601201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7192580 - 7192351
Alignment:
Q  130 gaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaag 229  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||  ||||  |||  | | || |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7192580 gaaatacctccacaaagtttattgtttccggtcacagctaacttgcttacatttccaaagacaccttctgttggtacctcgccttccaacatgttgaaag 7192481  T
Q  230 aaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgag 329  Q
    ||| |||||| | ||||||||| || ||||| || | | ||| |||||| | |||| ||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |     
T  7192480 aaacattcaagtgttctaaaactgatatattctgtagaacattaggaattggtccatacaaccgatttcttgacaggtctaaatattgaagacttttaac 7192381  T
Q  330 agaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  7192380 tgaagccaatgaggatggtatggttccgtt 7192351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10558447 - 10558275
Alignment:
Q  178 gcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaa 277  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||  ||| |||||||||| |   | |||||    
T  10558447 gcatttctaaagacaccttcttttggaacctctccatccaacatgttaaatgaaacgttcaagtgttctaaacgagaaatattttgcagaatgttaggaa 10558348  T
Q  278 tagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtat 350  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||| |||||    
T  10558347 ttgatccagacaattgatttcttgacatgtctaaatatcgaagacctcttatataagccaaagaggaaggtat 10558275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 357
Target Start/End: Original strand, 10588974 - 10589288
Alignment:
Q  43 acactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccac 142  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| | ||||||| | ||||  || | ||||||||||| || ||||||||||| |   |||  |||||||    
T  10588974 acactaattatcactgctaccaacttcaacttgaggtgttttgtaggttttataactttgatagggcatggcggtagatgcagctctaaaactcctccac 10589073  T
Q  143 aaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaata 242  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||    | ||||||||  ||| ||||| |   | || ||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||    
T  10589074 aaagcttattgtttccaatcattgctaacctgcttgcattttgaaagacacctttcattggaacctcaccttccaacatgttgaaagatacattgaagta 10589173  T
Q  243 ttctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagag 342  Q
    |||||  | |   ||||| |||| ||    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |    
T  10589174 ttctaggaaaacaatattctgcaaacttgtaggaattgatccagacaactgatttcttgacatgtctaaatattgaagacctttgagagatgccaaagtg 10589273  T
Q  343 gacggtattgttccg 357  Q
     | ||||||||||||    
T  10589274 aaaggtattgttccg 10589288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 359
Target Start/End: Original strand, 10660694 - 10660948
Alignment:
Q  105 agggcacggtggtagatgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggt 204  Q
    |||||| ||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||    | || |||||||||| ||||| ||  | |||    
T  10660694 agggcatggttgtagatgaagctctgaaatacctccacaaagcttattgtttccagtcacaactaacctgcttacatttccaaagacaccttccattggt 10660793  T
Q  205 acctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaa 304  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | || |||||| || ||||| || | | |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||| |    
T  10660794 acctcgccttccaacatgttgaaagatacattcaagtgttttaaaactgatatattctgtagaacatttggaatcggtccagacaatcgatttcctgaca 10660893  T
Q  305 ggtctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
     ||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10660894 agtctagatattgaagacctttaagtgaagccaatgaggatggtatggttccgtt 10660948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 359
Target Start/End: Original strand, 10652883 - 10653062
Alignment:
Q  180 atttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaata 279  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| || ||| |||| | | |||  |||||     
T  10652883 atttccaaagacaccttctttcggtacttctccttccaacatgttgaaagaaacattcaagtgttctaaaactgatatactttgtagaacatttggaatt 10652982  T
Q  280 gatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagagaagccaaagaggacggtattgttccgtt 359  Q
    | |||| ||||  |||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||||||| | ||| || || ||||||||    
T  10652983 ggtccatacaaccgatttcttgacaagtctaaatattgaagacctttaagtgaagccaatgtggatggaatggttccgtt 10653062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 358
Target Start/End: Original strand, 9836866 - 9837190
Alignment:
Q  34 aaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggtggtagatgcaggtgggaaa 133  Q
    ||||||| |||||||| ||  |||||||||||||| || ||||| |||| || | ||||  ||   |||| ||||||||| | ||||||||| |   |||    
T  9836866 aaagaaatcacactaattaatactgctatcaacctaaaattgtggtgttgtgtaggttttataaagttgacagggcacggagatagatgcagctctaaaa 9836965  T
Q  134 tacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaat 233  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||    | ||||||||  ||| |||||||   | || ||||| |||||||||||||| |||||       
T  9836966 ttcctccacagagcttgttgtttccagtcactgataaaccgcttgcatttttaaagacaccattgattggaacctcaccttccaacatgttgaaagatgc 9837065  T
Q  234 attcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgagagaa 333  Q
    ||| || |||||||  | |   |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||     
T  9837066 attgaagtattctaggaaaacaatattttggagaccttcaggaattgatccagacaactgatttctagacatgtctaaatattgaagaactttgagagat 9837165  T
Q  334 gccaaagaggacggtattgttccgt 358  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||    
T  9837166 gccaaagtggaaggtatggttccgt 9837190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10550367 - 10550148
Alignment:
Q  131 aaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaaga 230  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||    | ||||||| ||| ||||| |  || |||||||||||||||| |||||| || ||    
T  10550367 aaattcctccacaaagcttattgtttccaataactgtcattgcactggcatttcgaaagacacctttagttggtacctctccttccagcatgttgaatga 10550268  T
Q  231 aatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaagacctttgaga 330  Q
       ||| || |||||||    ||| |||||||||| | | |  ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||    
T  10550267 tgcattgaagtattctatcgaagaaatattttgcaaaacttttggaattgatccggataattggtttcttgagaggtctaacactcgaagacctttgaga 10550168  T
Q  331 gaagccaaagaggacggtat 350  Q
    ||  |||||||||| |||||    
T  10550167 gattccaaagaggatggtat 10550148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 10601532 - 10601484
Alignment:
Q  18 tgaaagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaac 66  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10601532 tgaaagtatgagaagagaagacaccacaccaactatcactgccatcaac 10601484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 335
Target Start/End: Original strand, 31467687 - 31468001
Alignment:
Q  21 aagtatgagaataaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacctgaacttgtgttgttttgcatgtttcctacccttgatagggcacggtggtaga 120  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |   | ||||||| |||||||   || || | |||||| || |||||     
T  31467687 aagtataagaagaaaagaaaccacactaactatcactgctatcaacttgaaatcacgatgttttgaatgtttctctccttttaaagggcatggaggtagg 31467786  T
Q  121 tgcaggtgggaaatacctccacaaagctttttgtttccaatcacttctatttgggttgcatttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaaca 220  Q
    ||||  |  |||| |||||||||||| || ||||| ||  | ||  | |  |   ||| ||||  ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||    
T  31467787 tgcaattttgaaacacctccacaaaggttattgttgcctgttaccgccacctcacttgaattttgaaagacaccttccgttggtacctcgccttccaaca 31467886  T
Q  221 tgttaaaagaaatattcaaatattctaaaacagagatattttgcataccatcaggaatagatccagacaattgatttcttgaaaggtctaaatatcgaag 320  Q
    |||||||||| | ||| || |||| ||  | ||| |||||||| | ||| | |||||| ||||||||||| || |||| ||| |||||||||| | ||||    
T  31467887 tgttaaaagatacattgaagtattgtaggaaagaaatattttgtagacctttaggaattgatccagacaagtggtttcgtgataggtctaaatgttgaag 31467986  T
Q  321 acctttgagagaagc 335  Q
     ||||| || |||||    
T  31467987 gcctttcagtgaagc 31468001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 28605149 - 28605089
Alignment:
Q  179 catttccaaatacaccatctgtcggtacctctccttccaacatgttaaaagaaatattcaa 239  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  28605149 catttctaaacacaccttcagtcggtacttcaccattcaacatgttaaaagaaatattcaa 28605089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University