View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2819_low_2 (Length: 526)

Name: NF2819_low_2
Description: NF2819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2819_low_2
NF2819_low_2
[»] chr6 (53 HSPs)
chr6 (235-425)||(29518912-29519102)
chr6 (235-424)||(29518495-29518684)
chr6 (235-424)||(32741171-32741360)
chr6 (234-391)||(3409250-3409407)
chr6 (235-403)||(2378118-2378286)
chr6 (229-401)||(35210190-35210362)
chr6 (249-424)||(16454913-16455088)
chr6 (232-411)||(14748332-14748507)
chr6 (245-424)||(2578420-2578598)
chr6 (235-402)||(3409652-3409819)
chr6 (236-424)||(1846741-1846928)
chr6 (234-402)||(3058217-3058385)
chr6 (235-412)||(3415450-3415629)
chr6 (245-424)||(16454577-16454756)
chr6 (243-401)||(2579872-2580030)
chr6 (245-403)||(2377756-2377914)
chr6 (234-391)||(26544040-26544197)
chr6 (249-424)||(2843560-2843736)
chr6 (245-392)||(16107680-16107827)
chr6 (243-412)||(10074352-10074521)
chr6 (243-414)||(593694-593867)
chr6 (235-401)||(1127352-1127518)
chr6 (243-401)||(10073991-10074149)
chr6 (244-417)||(2578819-2578991)
chr6 (245-422)||(5832007-5832182)
chr6 (243-425)||(10073592-10073772)
chr6 (248-414)||(2579479-2579645)
chr6 (246-386)||(1950200-1950340)
chr6 (246-398)||(6999799-6999951)
chr6 (248-351)||(32460630-32460733)
chr6 (245-424)||(2579087-2579261)
chr6 (249-368)||(9062383-9062501)
chr6 (243-397)||(10911565-10911720)
chr6 (245-400)||(16108065-16108208)
chr6 (243-417)||(12071675-12071849)
chr6 (243-401)||(12092482-12092640)
chr6 (238-363)||(5958641-5958766)
chr6 (243-368)||(6071132-6071257)
chr6 (243-362)||(8481927-8482045)
chr6 (243-417)||(12085018-12085191)
chr6 (247-402)||(17135068-17135223)
chr6 (243-398)||(31714671-31714823)
chr6 (258-359)||(2975567-2975668)
chr6 (263-316)||(35210498-35210551)
chr6 (311-355)||(22605301-22605345)
chr6 (347-394)||(3409405-3409452)
chr6 (311-362)||(11637760-11637811)
chr6 (280-326)||(14789279-14789325)
chr6 (311-355)||(21130103-21130147)
chr6 (374-424)||(2975036-2975086)
chr6 (105-153)||(15707169-15707217)
chr6 (250-362)||(30618656-30618766)
chr6 (319-361)||(11638053-11638095)
[»] chr1 (77 HSPs)
chr1 (235-411)||(44290814-44290991)
chr1 (235-411)||(44290448-44290624)
chr1 (230-401)||(3537599-3537770)
chr1 (235-401)||(41759475-41759641)
chr1 (245-413)||(17294579-17294748)
chr1 (243-403)||(41142372-41142533)
chr1 (235-398)||(48588491-48588654)
chr1 (235-397)||(3550712-3550871)
chr1 (245-402)||(26661521-26661678)
chr1 (243-400)||(41157375-41157532)
chr1 (243-402)||(41156991-41157150)
chr1 (234-424)||(50052001-50052190)
chr1 (243-424)||(31767138-31767319)
chr1 (251-403)||(14318875-14319027)
chr1 (243-411)||(34364507-34364675)
chr1 (244-411)||(40082408-40082574)
chr1 (245-403)||(11977282-11977440)
chr1 (243-393)||(34364925-34365075)
chr1 (237-370)||(32594747-32594880)
chr1 (245-392)||(37556113-37556260)
chr1 (243-402)||(29798199-29798358)
chr1 (243-417)||(3875315-3875489)
chr1 (245-403)||(34649440-34649598)
chr1 (243-424)||(45084382-45084557)
chr1 (243-423)||(37850579-37850758)
chr1 (235-401)||(32168698-32168853)
chr1 (235-402)||(45493973-45494145)
chr1 (243-401)||(5319965-5320123)
chr1 (240-386)||(38804370-38804516)
chr1 (243-412)||(22077484-22077653)
chr1 (247-401)||(9955911-9956067)
chr1 (243-424)||(66449-66630)
chr1 (245-422)||(26661877-26662054)
chr1 (246-392)||(37555733-37555878)
chr1 (243-403)||(24600312-24600472)
chr1 (243-402)||(39066200-39066358)
chr1 (235-322)||(3537226-3537313)
chr1 (243-424)||(41184383-41184583)
chr1 (235-363)||(44043810-44043943)
chr1 (243-424)||(24131965-24132143)
chr1 (249-402)||(5575110-5575261)
chr1 (268-402)||(22077109-22077243)
chr1 (243-412)||(66078-66247)
chr1 (253-393)||(5528762-5528902)
chr1 (243-412)||(22077818-22077986)
chr1 (244-395)||(22793279-22793431)
chr1 (243-422)||(19283434-19283613)
chr1 (245-391)||(45839629-45839779)
chr1 (243-391)||(30630648-30630796)
chr1 (314-409)||(11977015-11977110)
chr1 (243-391)||(44685456-44685605)
chr1 (22-149)||(40049134-40049261)
chr1 (243-324)||(21378118-21378199)
chr1 (22-149)||(35650738-35650865)
chr1 (313-424)||(50051666-50051776)
chr1 (243-361)||(1188628-1188746)
chr1 (270-371)||(4956218-4956321)
chr1 (285-361)||(10351202-10351278)
chr1 (243-361)||(1187404-1187522)
chr1 (342-411)||(21378049-21378118)
chr1 (235-275)||(50051777-50051817)
chr1 (243-290)||(35154150-35154197)
chr1 (243-302)||(50469180-50469239)
chr1 (243-309)||(4878803-4878869)
chr1 (258-400)||(44091909-44092051)
chr1 (292-337)||(41184152-41184197)
chr1 (298-358)||(35154046-35154106)
chr1 (235-308)||(4266875-4266948)
chr1 (342-401)||(4266798-4266855)
chr1 (325-361)||(12466365-12466401)
chr1 (243-275)||(22077248-22077280)
chr1 (252-311)||(30630912-30630972)
chr1 (243-295)||(47379891-47379943)
chr1 (171-234)||(34498148-34498211)
chr1 (316-362)||(9956212-9956258)
chr1 (314-351)||(47380217-47380254)
chr1 (325-361)||(31973375-31973411)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (235-410)||(36178596-36178771)
chr2 (235-424)||(5542602-5542791)
chr2 (235-399)||(37106180-37106344)
chr2 (234-411)||(14745657-14745834)
chr2 (239-412)||(37105920-37106093)
chr2 (245-424)||(6421387-6421566)
chr2 (235-424)||(5542975-5543164)
chr2 (235-414)||(41283462-41283641)
chr2 (245-409)||(15880265-15880429)
chr2 (243-424)||(962598-962778)
chr2 (243-424)||(42514649-42514830)
chr2 (261-424)||(36178148-36178311)
chr2 (243-402)||(35580723-35580881)
chr2 (245-424)||(6712978-6713159)
chr2 (250-401)||(15511495-15511646)
chr2 (245-411)||(36005870-36006035)
chr2 (259-402)||(6422126-6422269)
chr2 (248-399)||(33731653-33731804)
chr2 (235-394)||(14745300-14745460)
chr2 (256-424)||(23346250-23346417)
chr2 (243-400)||(38796619-38796778)
chr2 (243-398)||(40679632-40679787)
chr2 (234-424)||(1769883-1770073)
chr2 (245-402)||(40733519-40733676)
chr2 (247-382)||(28254258-28254391)
chr2 (243-399)||(28531316-28531472)
chr2 (234-350)||(36178320-36178436)
chr2 (243-425)||(7598228-7598410)
chr2 (243-396)||(37632602-37632755)
chr2 (235-396)||(7598601-7598754)
chr2 (254-424)||(40163349-40163520)
chr2 (245-387)||(5367457-5367599)
chr2 (305-423)||(6421793-6421911)
chr2 (245-402)||(40733885-40734041)
chr2 (243-400)||(29676903-29677065)
chr2 (243-350)||(16542449-16542556)
chr2 (243-351)||(31468800-31468904)
chr2 (243-391)||(12529038-12529186)
chr2 (251-401)||(29676543-29676687)
chr2 (243-414)||(16590888-16591054)
chr2 (246-331)||(31899496-31899581)
chr2 (245-402)||(29874022-29874179)
chr2 (243-424)||(30313178-30313358)
chr2 (251-355)||(37895107-37895211)
chr2 (297-411)||(3673122-3673236)
chr2 (246-359)||(31259658-31259774)
chr2 (243-361)||(33561491-33561609)
chr2 (243-321)||(38796298-38796376)
chr2 (243-360)||(30323464-30323581)
chr2 (315-411)||(3672773-3672869)
chr2 (243-361)||(37894732-37894850)
chr2 (305-402)||(6421688-6421785)
chr2 (243-300)||(36785664-36785721)
chr2 (246-401)||(9231252-9231407)
chr2 (259-348)||(28254165-28254254)
chr2 (243-351)||(33953821-33953929)
chr2 (296-388)||(36784273-36784365)
chr2 (244-359)||(31385738-31385853)
chr2 (243-361)||(29873577-29873695)
chr2 (333-424)||(31899080-31899170)
chr2 (246-350)||(12910231-12910335)
chr2 (307-426)||(35580412-35580534)
chr2 (243-350)||(41678419-41678527)
chr2 (285-424)||(30312831-30312971)
chr2 (245-291)||(6421306-6421352)
chr2 (246-399)||(3594180-3594333)
chr2 (297-356)||(25390313-25390372)
chr2 (310-361)||(28226404-28226455)
chr2 (258-305)||(42515031-42515078)
chr2 (243-361)||(33954302-33954419)
chr2 (285-342)||(2336666-2336723)
chr2 (243-279)||(3673085-3673121)
chr2 (313-361)||(8904498-8904546)
chr2 (314-361)||(28226726-28226772)
chr2 (310-359)||(13792536-13792585)
chr2 (243-279)||(3672719-3672755)
[»] chr8 (82 HSPs)
chr8 (235-423)||(3669679-3669867)
chr8 (234-397)||(3670051-3670214)
chr8 (235-424)||(30441073-30441266)
chr8 (245-410)||(3038281-3038446)
chr8 (245-411)||(34835211-34835377)
chr8 (235-411)||(1014234-1014411)
chr8 (245-410)||(34834878-34835043)
chr8 (235-424)||(20870550-20870741)
chr8 (243-391)||(45122067-45122215)
chr8 (235-393)||(1013879-1014037)
chr8 (245-423)||(37544469-37544646)
chr8 (243-411)||(6876852-6877021)
chr8 (245-411)||(40518071-40518239)
chr8 (246-402)||(147454-147610)
chr8 (250-397)||(9482608-9482755)
chr8 (268-414)||(9483174-9483320)
chr8 (243-401)||(9608745-9608903)
chr8 (243-411)||(9309355-9309522)
chr8 (253-424)||(18371970-18372142)
chr8 (245-400)||(33113368-33113523)
chr8 (245-411)||(34835476-34835643)
chr8 (245-411)||(34835742-34835909)
chr8 (245-414)||(30359273-30359443)
chr8 (245-399)||(40518584-40518738)
chr8 (243-413)||(45121898-45122068)
chr8 (245-402)||(1513914-1514071)
chr8 (245-401)||(25561815-25561972)
chr8 (257-402)||(45122638-45122783)
chr8 (237-417)||(40579490-40579670)
chr8 (243-401)||(5915872-5916025)
chr8 (245-397)||(30359611-30359763)
chr8 (250-403)||(70272-70425)
chr8 (243-402)||(45123006-45123165)
chr8 (235-393)||(6731896-6732045)
chr8 (243-401)||(8918764-8918922)
chr8 (243-424)||(41972158-41972341)
chr8 (243-399)||(5420651-5420807)
chr8 (250-424)||(18371637-18371807)
chr8 (243-411)||(9308977-9309149)
chr8 (247-400)||(18380020-18380171)
chr8 (245-394)||(45121663-45121811)
chr8 (250-402)||(6651510-6651653)
chr8 (246-417)||(32640515-32640682)
chr8 (237-402)||(32305478-32305636)
chr8 (425-511)||(39498971-39499057)
chr8 (243-391)||(147829-147968)
chr8 (318-412)||(40579258-40579352)
chr8 (235-321)||(41416251-41416335)
chr8 (243-424)||(4154645-4154824)
chr8 (246-356)||(43274824-43274934)
chr8 (245-361)||(8794113-8794229)
chr8 (243-394)||(9507777-9507933)
chr8 (266-380)||(9609108-9609222)
chr8 (247-347)||(18372988-18373085)
chr8 (243-423)||(9620656-9620834)
chr8 (246-315)||(18372785-18372854)
chr8 (245-351)||(18372656-18372758)
chr8 (246-315)||(18372342-18372411)
chr8 (321-416)||(41129066-41129161)
chr8 (246-333)||(3037776-3037865)
chr8 (247-392)||(43398077-43398225)
chr8 (325-402)||(8919143-8919220)
chr8 (243-392)||(12283873-12284021)
chr8 (253-316)||(25561729-25561792)
chr8 (243-361)||(4154321-4154438)
chr8 (248-348)||(20130454-20130553)
chr8 (243-369)||(5274775-5274901)
chr8 (337-410)||(43274626-43274699)
chr8 (343-422)||(18372262-18372342)
chr8 (320-434)||(20995383-20995497)
chr8 (246-287)||(18372485-18372526)
chr8 (279-335)||(18373236-18373292)
chr8 (246-342)||(40991756-40991852)
chr8 (354-411)||(3037959-3038016)
chr8 (314-351)||(12156708-12156745)
chr8 (324-369)||(16524446-16524491)
chr8 (243-300)||(20995502-20995559)
chr8 (243-320)||(33831978-33832055)
chr8 (297-361)||(40417756-40417820)
chr8 (301-342)||(11442911-11442952)
chr8 (379-411)||(3038042-3038074)
chr8 (243-275)||(18645713-18645745)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (235-414)||(6500443-6500621)
chr5 (243-424)||(40296292-40296473)
chr5 (235-424)||(27502013-27502202)
chr5 (243-423)||(3294993-3295172)
chr5 (235-414)||(6500815-6500993)
chr5 (246-423)||(3295323-3295498)
chr5 (234-423)||(32487385-32487573)
chr5 (243-411)||(15370099-15370267)
chr5 (235-397)||(18603124-18603286)
chr5 (236-402)||(41170627-41170793)
chr5 (235-411)||(624188-624364)
chr5 (240-400)||(36492218-36492378)
chr5 (243-387)||(13415774-13415918)
chr5 (246-414)||(25327938-25328106)
chr5 (235-422)||(9498634-9498820)
chr5 (245-411)||(42405588-42405752)
chr5 (243-402)||(41632782-41632941)
chr5 (244-417)||(299490-299664)
chr5 (250-408)||(11416970-11417128)
chr5 (245-414)||(1028504-1028673)
chr5 (245-413)||(6224198-6224366)
chr5 (253-397)||(34753029-34753173)
chr5 (243-414)||(36568556-36568725)
chr5 (243-402)||(12662651-12662810)
chr5 (245-392)||(26074614-26074761)
chr5 (235-409)||(623810-623984)
chr5 (245-394)||(26075168-26075318)
chr5 (243-392)||(26074155-26074304)
chr5 (269-425)||(15370428-15370584)
chr5 (255-397)||(33747783-33747925)
chr5 (243-401)||(35150007-35150164)
chr5 (235-381)||(5723811-5723957)
chr5 (245-400)||(24489207-24489360)
chr5 (240-366)||(29549290-29549416)
chr5 (245-364)||(26074818-26074938)
chr5 (245-424)||(300961-301132)
chr5 (248-393)||(38427553-38427697)
chr5 (243-402)||(26590909-26591068)
chr5 (245-402)||(35167837-35167994)
chr5 (246-412)||(2411010-2411176)
chr5 (246-375)||(36522263-36522392)
chr5 (235-318)||(7768842-7768925)
chr5 (244-351)||(36521946-36522053)
chr5 (246-424)||(35914852-35915029)
chr5 (245-338)||(42508614-42508707)
chr5 (329-424)||(26899995-26900089)
chr5 (245-323)||(26074320-26074398)
chr5 (243-361)||(31509623-31509742)
chr5 (330-424)||(38427306-38427401)
chr5 (22-113)||(8710220-8710311)
chr5 (246-424)||(41635170-41635346)
chr5 (257-368)||(31509745-31509857)
chr5 (310-361)||(13042606-13042657)
chr5 (245-324)||(39309686-39309764)
chr5 (245-361)||(13786041-13786157)
chr5 (327-379)||(795254-795306)
chr5 (22-113)||(20925178-20925269)
chr5 (300-379)||(36527117-36527196)
chr5 (245-338)||(42524719-42524811)
chr5 (301-361)||(32445943-32446003)
chr5 (310-357)||(13112604-13112651)
chr5 (246-303)||(6225047-6225104)
chr5 (235-283)||(5660290-5660338)
chr5 (301-401)||(13785632-13785732)
chr5 (280-368)||(19275566-19275653)
chr5 (314-381)||(9498343-9498410)
chr5 (323-361)||(13042784-13042822)
chr5 (323-361)||(13112782-13112820)
chr5 (243-285)||(35150747-35150789)
chr5 (243-285)||(35151038-35151080)
chr5 (345-397)||(24489583-24489635)
chr5 (310-361)||(36389016-36389067)
chr5 (325-355)||(5963765-5963795)
chr5 (235-292)||(22298956-22299014)
chr5 (314-355)||(34103625-34103666)
chr5 (246-278)||(13785732-13785764)
chr5 (311-355)||(41341523-41341567)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (243-424)||(1085593-1085774)
chr7 (235-424)||(37532988-37533176)
chr7 (235-424)||(37533341-37533530)
chr7 (243-410)||(23368-23535)
chr7 (250-411)||(11845198-11845359)
chr7 (243-414)||(7517580-7517751)
chr7 (245-412)||(30244272-30244439)
chr7 (243-414)||(22567026-22567196)
chr7 (237-398)||(29157559-29157720)
chr7 (243-403)||(40094772-40094932)
chr7 (245-413)||(45433243-45433411)
chr7 (245-408)||(6054562-6054725)
chr7 (245-424)||(30245079-30245254)
chr7 (243-393)||(36939741-36939891)
chr7 (243-402)||(24177435-24177594)
chr7 (249-424)||(34218011-34218186)
chr7 (243-369)||(7554025-7554151)
chr7 (245-410)||(45434638-45434803)
chr7 (245-424)||(47129097-47129275)
chr7 (245-390)||(45754718-45754862)
chr7 (235-398)||(14681502-14681663)
chr7 (251-391)||(19122740-19122879)
chr7 (248-411)||(30032572-30032735)
chr7 (243-414)||(8128428-8128599)
chr7 (243-362)||(22566702-22566820)
chr7 (243-423)||(36622960-36623140)
chr7 (243-401)||(118299-118459)
chr7 (246-399)||(9901648-9901799)
chr7 (243-363)||(16569196-16569316)
chr7 (243-363)||(16596346-16596466)
chr7 (264-411)||(37167808-37167949)
chr7 (243-402)||(40230290-40230449)
chr7 (243-369)||(1085280-1085407)
chr7 (243-402)||(41854635-41854793)
chr7 (246-378)||(24838724-24838857)
chr7 (285-422)||(30253534-30253667)
chr7 (243-360)||(36534825-36534942)
chr7 (324-424)||(47129450-47129549)
chr7 (246-398)||(20599317-20599471)
chr7 (243-364)||(43241495-43241616)
chr7 (331-423)||(37532729-37532821)
chr7 (243-331)||(28301613-28301701)
chr7 (246-338)||(41910657-41910749)
chr7 (289-399)||(28300255-28300366)
chr7 (243-316)||(30245494-30245567)
chr7 (243-316)||(30255339-30255412)
chr7 (243-313)||(30244701-30244771)
chr7 (243-311)||(36109007-36109075)
chr7 (248-348)||(44361517-44361616)
chr7 (326-400)||(28300569-28300644)
chr7 (310-361)||(21416181-21416232)
chr7 (312-360)||(23569043-23569091)
chr7 (344-424)||(30244453-30244533)
chr7 (344-424)||(30253671-30253751)
chr7 (22-149)||(36356869-36356996)
chr7 (243-361)||(4124128-4124246)
chr7 (344-424)||(30245256-30245336)
chr7 (237-280)||(14681281-14681324)
chr7 (243-293)||(40094502-40094552)
chr7 (310-355)||(21619091-21619136)
chr7 (171-234)||(3316639-3316702)
chr7 (245-295)||(36967335-36967385)
chr7 (243-361)||(37345916-37346036)
chr7 (311-355)||(27391815-27391859)
chr7 (311-390)||(40094424-40094503)
chr7 (338-392)||(4719305-4719359)
chr7 (326-388)||(45755010-45755072)
chr7 (364-425)||(5825561-5825621)
chr7 (285-422)||(15902342-15902478)
chr7 (298-403)||(37393114-37393218)
chr7 (310-350)||(27598052-27598092)
[»] chr4 (105 HSPs)
chr4 (235-414)||(50630740-50630919)
chr4 (235-402)||(55933121-55933288)
chr4 (243-411)||(25483336-25483504)
chr4 (235-403)||(41370349-41370517)
chr4 (245-414)||(36629239-36629408)
chr4 (243-422)||(44620660-44620838)
chr4 (240-403)||(50002423-50002586)
chr4 (243-411)||(54017583-54017751)
chr4 (243-391)||(52884695-52884844)
chr4 (243-411)||(3340807-3340975)
chr4 (245-417)||(39792842-39793014)
chr4 (243-413)||(10245920-10246089)
chr4 (243-425)||(36608635-36608817)
chr4 (243-400)||(1731646-1731803)
chr4 (245-414)||(39404020-39404189)
chr4 (258-391)||(54108928-54109060)
chr4 (245-400)||(39404400-39404555)
chr4 (252-424)||(44621011-44621180)
chr4 (243-424)||(22027936-22028117)
chr4 (234-363)||(49880151-49880280)
chr4 (245-401)||(36572021-36572177)
chr4 (243-402)||(22183261-22183420)
chr4 (252-424)||(44620362-44620531)
chr4 (243-384)||(4955332-4955473)
chr4 (243-424)||(49076807-49076986)
chr4 (253-403)||(54343004-54343147)
chr4 (245-400)||(34646648-34646803)
chr4 (246-400)||(50459724-50459878)
chr4 (262-411)||(54936215-54936363)
chr4 (243-414)||(2740700-2740869)
chr4 (249-424)||(20825842-20826018)
chr4 (243-391)||(52884887-52885038)
chr4 (243-394)||(32941128-32941279)
chr4 (261-403)||(18932745-18932887)
chr4 (243-402)||(22028366-22028527)
chr4 (246-401)||(49302907-49303064)
chr4 (249-396)||(20826223-20826370)
chr4 (244-401)||(16888814-16888971)
chr4 (244-424)||(16889511-16889691)
chr4 (243-398)||(4390102-4390257)
chr4 (258-369)||(45496820-45496931)
chr4 (242-402)||(54108537-54108695)
chr4 (243-424)||(34004560-34004739)
chr4 (243-411)||(49076439-49076604)
chr4 (243-352)||(2741071-2741180)
chr4 (243-401)||(3244449-3244607)
chr4 (245-361)||(41707503-41707618)
chr4 (235-366)||(6975489-6975620)
chr4 (297-402)||(23817678-23817783)
chr4 (283-414)||(43827480-43827610)
chr4 (243-402)||(3341128-3341287)
chr4 (243-361)||(54741216-54741334)
chr4 (294-424)||(31691203-31691335)
chr4 (245-397)||(43174508-43174661)
chr4 (243-424)||(51768035-51768216)
chr4 (245-389)||(19504707-19504842)
chr4 (289-424)||(18879852-18879987)
chr4 (245-400)||(45489331-45489485)
chr4 (256-351)||(54017750-54017845)
chr4 (243-403)||(3700365-3700517)
chr4 (243-402)||(28034229-28034388)
chr4 (245-380)||(40067045-40067181)
chr4 (264-403)||(48111694-48111833)
chr4 (248-361)||(760194-760306)
chr4 (243-332)||(10246347-10246436)
chr4 (265-402)||(3271806-3271948)
chr4 (235-295)||(50788087-50788147)
chr4 (251-309)||(44620304-44620362)
chr4 (285-384)||(15841383-15841482)
chr4 (243-309)||(44621426-44621492)
chr4 (335-411)||(43174233-43174309)
chr4 (310-361)||(11197293-11197344)
chr4 (246-361)||(34544107-34544225)
chr4 (268-424)||(39698919-39699077)
chr4 (243-369)||(23556896-23557022)
chr4 (245-309)||(44620946-44621011)
chr4 (249-402)||(45489711-45489864)
chr4 (357-417)||(11702281-11702341)
chr4 (243-331)||(11348396-11348484)
chr4 (249-361)||(15841023-15841134)
chr4 (310-361)||(10396198-10396249)
chr4 (310-361)||(10396483-10396534)
chr4 (306-424)||(11783528-11783646)
chr4 (310-362)||(922485-922537)
chr4 (311-350)||(1868119-1868158)
chr4 (353-392)||(19895406-19895445)
chr4 (171-217)||(9597831-9597877)
chr4 (301-359)||(11706584-11706641)
chr4 (323-397)||(41370738-41370812)
chr4 (309-355)||(51681604-51681650)
chr4 (235-272)||(18932887-18932924)
chr4 (297-357)||(2891864-2891924)
chr4 (243-291)||(45050601-45050649)
chr4 (310-361)||(11197003-11197054)
chr4 (235-266)||(18933103-18933134)
chr4 (298-341)||(45484774-45484817)
chr4 (287-361)||(31249896-31249970)
chr4 (319-361)||(41707279-41707321)
chr4 (321-359)||(50788034-50788072)
chr4 (243-284)||(11706636-11706677)
chr4 (356-397)||(23817457-23817498)
chr4 (306-339)||(29802604-29802637)
chr4 (235-280)||(41370693-41370738)
chr4 (325-361)||(34946151-34946187)
chr4 (368-412)||(45496675-45496719)
[»] chr3 (85 HSPs)
chr3 (235-402)||(22304561-22304728)
chr3 (245-416)||(43346775-43346947)
chr3 (243-424)||(32589704-32589884)
chr3 (245-402)||(35946524-35946681)
chr3 (245-414)||(37990626-37990795)
chr3 (243-413)||(29644890-29645060)
chr3 (243-412)||(42342377-42342546)
chr3 (245-424)||(37990953-37991133)
chr3 (243-402)||(12114561-12114720)
chr3 (243-424)||(29644558-29644739)
chr3 (243-399)||(15772854-15773010)
chr3 (243-402)||(33803251-33803410)
chr3 (245-411)||(52634678-52634843)
chr3 (235-392)||(39389062-39389219)
chr3 (235-393)||(39934963-39935123)
chr3 (243-411)||(54017806-54017974)
chr3 (243-402)||(25739424-25739583)
chr3 (243-402)||(54018197-54018356)
chr3 (245-398)||(32462903-32463057)
chr3 (243-402)||(41359764-41359919)
chr3 (245-417)||(25755396-25755568)
chr3 (243-399)||(42342092-42342248)
chr3 (235-384)||(4823647-4823796)
chr3 (243-424)||(15773192-15773375)
chr3 (243-402)||(21832344-21832501)
chr3 (235-402)||(50612446-50612618)
chr3 (245-402)||(22303954-22304104)
chr3 (250-372)||(3135102-3135224)
chr3 (245-423)||(3135432-3135617)
chr3 (243-401)||(31190017-31190167)
chr3 (243-403)||(53577364-53577524)
chr3 (243-398)||(45395656-45395811)
chr3 (243-414)||(1634302-1634473)
chr3 (245-424)||(32462536-32462715)
chr3 (243-390)||(39914252-39914399)
chr3 (245-401)||(45901715-45901872)
chr3 (243-361)||(8327904-8328022)
chr3 (244-402)||(53117974-53118131)
chr3 (245-393)||(49336694-49336843)
chr3 (243-402)||(44160546-44160702)
chr3 (243-394)||(9240149-9240300)
chr3 (235-403)||(37726496-37726656)
chr3 (301-398)||(22303662-22303759)
chr3 (245-414)||(33175646-33175820)
chr3 (246-409)||(11661954-11662117)
chr3 (235-397)||(51886553-51886709)
chr3 (253-396)||(42584829-42584970)
chr3 (269-367)||(33362327-33362425)
chr3 (243-361)||(47964558-47964676)
chr3 (235-350)||(3384317-3384432)
chr3 (235-298)||(22304238-22304301)
chr3 (317-402)||(41359490-41359575)
chr3 (243-424)||(39336208-39336387)
chr3 (246-335)||(7767380-7767469)
chr3 (245-361)||(11661537-11661638)
chr3 (246-351)||(46546375-46546480)
chr3 (313-402)||(54017547-54017636)
chr3 (243-299)||(43346650-43346706)
chr3 (243-402)||(47964914-47965073)
chr3 (285-369)||(39336002-39336086)
chr3 (293-353)||(52634990-52635050)
chr3 (352-402)||(22304302-22304352)
chr3 (245-361)||(25991405-25991521)
chr3 (347-414)||(8328374-8328441)
chr3 (310-361)||(53596027-53596078)
chr3 (310-361)||(53596342-53596393)
chr3 (285-390)||(12749211-12749316)
chr3 (298-355)||(17731950-17732007)
chr3 (298-355)||(19033181-19033238)
chr3 (376-424)||(9239946-9239994)
chr3 (246-361)||(25317161-25317276)
chr3 (310-361)||(53596542-53596593)
chr3 (323-410)||(43978856-43978947)
chr3 (310-357)||(48127859-48127906)
chr3 (243-275)||(12747878-12747910)
chr3 (311-355)||(16871005-16871049)
chr3 (311-355)||(17735037-17735081)
chr3 (311-355)||(19036306-19036350)
chr3 (374-413)||(41360125-41360164)
chr3 (325-402)||(7766782-7766857)
chr3 (310-355)||(16143505-16143550)
chr3 (314-355)||(16869843-16869884)
chr3 (248-309)||(36986040-36986101)
chr3 (248-309)||(37011479-37011540)
chr3 (306-342)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (245-403)||(512-670)
scaffold0702 (235-403)||(145-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (245-411)||(1096-1262)
scaffold0391 (290-361)||(1731-1802)
scaffold0391 (243-294)||(3092-3143)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (243-402)||(47360-47519)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (243-392)||(5396-5546)
scaffold0734 (243-392)||(5777-5931)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (243-363)||(5357-5477)
scaffold0078 (243-394)||(4982-5133)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (243-359)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (245-320)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (245-369)||(39459-39582)
scaffold0113 (245-368)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (237-321)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (281-321)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 53)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 235 - 425
Target Start/End: Original strand, 29518912 - 29519102
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518912 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29519011  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29519012 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaacac 29519102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518684
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 29518684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741360
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcctctcataacccaaca 32741360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 391
Target Start/End: Original strand, 3409250 - 3409407
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3409250 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaag 3409349  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3409350 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 2378118 - 2378286
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2378118 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 2378217  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378218 ttttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 2378286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 229 - 401
Target Start/End: Original strand, 35210190 - 35210362
Alignment:
Q  229 agaagctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcc 328  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35210190 agaaactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgcc 35210289  T
Q  329 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  35210290 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcccc 35210362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 249 - 424
Target Start/End: Original strand, 16454913 - 16455088
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16454913 tgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaataggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagt 16455012  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16455013 gtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcataatccaaca 16455088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 232 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14748507 - 14748332
Alignment:
Q  232 agctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 331  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  14748507 agctgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgtta 14748408  T
Q  332 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748407 aggttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 14748332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2578598 - 2578420
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2578598 caagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 2578500  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  2578499 gagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagcccccctcatgacccaaca 2578420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 402
Target Start/End: Original strand, 3409652 - 3409819
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  3409652 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttatt 3409751  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409752 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 3409819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 236 - 424
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846928
Alignment:
Q  236 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 335  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  336 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagcttccc-catgacccaaca 1846928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 402
Target Start/End: Original strand, 3058217 - 3058385
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3058217 ctgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaag 3058316  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3058317 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtccccc 3058385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 235 - 412
Target Start/End: Original strand, 3415450 - 3415629
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415450 tgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 3415549  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgt--tctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3415550 tttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcccccaagctcccct 3415629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454756
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 16454756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579872
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcccc 2579872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377914
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 2377914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 234 - 391
Target Start/End: Original strand, 26544040 - 26544197
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26544040 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaag 26544139  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  26544140 gttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 249 - 424
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843736
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  348 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctaactcccctcatgatccaaca 2843736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 10074521 - 10074352
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10074521 tgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 10074422  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  10074421 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggatagtcccccaggctcccct 10074352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593694
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  343 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    || |||||||  | |||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcccccgagctcccctca 593694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 235 - 401
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127518
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || || |||| |||||||||||  |||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgggtggtcccc 1127518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10074149 - 10073991
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074149 tgcaagggtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 10074050  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    || |||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10074049 aaaagtgtggtgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcccc 10073991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 2578991 - 2578819
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2578991 gcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccataaactcattaccttaaggttttgggta 2578893  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2578892 agagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatga 2578819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832007
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
     ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtccccag-gctcccctcatgacccaa 5832007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 243 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 10073772 - 10073592
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  10073772 tgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattggcttaagattttgggt 10073675  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||| ||| |||||||    
T  10073674 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtccttcaggctcccctcgtgacccaacac 10073592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 248 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 2579645 - 2579479
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2579645 gtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcccataaactcattgccttaaggttttgggtaaaag 2579546  T
Q  348 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||| || |  ||||||||||    
T  2579545 tatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttccacaggctcccctca 2579479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcg 386  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 246 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||| ||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 248 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  348 tgtg 351  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2579261 - 2579087
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||    
T  2579261 caagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----aggaaccataaacccataactttaaggctttggctaa 2579166  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2579165 gagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggt-ccccgagctcccctcatgacccaaca 2579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 249 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgt 368  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 397
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 16108065 - 16108208
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              
T  16108065 caagtgtgagttatatgttccacatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg---------- 16108154  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
      ||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||    
T  16108155 --gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttataacctcgatgtggacggtccc 16108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071675
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcccctaagctcccctcatga 12071675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092482
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| |||||||  |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgggtggtcccc 12092482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958641
Alignment:
Q  238 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 337  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctctcttg 5958641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 368
Target Start/End: Original strand, 6071132 - 6071257
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  6071132 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagatgatccataaactcattgccttaagattttggat 6071231  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgt 368  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||    
T  6071232 aagagtgtggcgtctctctcgcttgt 6071257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Original strand, 8481927 - 8482045
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8481927 tgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgagatgactcataaactcattgccttaagattttgggt 8482025  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctctt 362  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8482026 aagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085018
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||   |||||||||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtctcctaagctcccctcatga 12085018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135068
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 346  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  347 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||  | |||| | |||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtccccc 17135068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    |||||||||| || | | | ||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 258 - 359
Target Start/End: Original strand, 2975567 - 2975668
Alignment:
Q  258 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||    
T  2975567 tatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaagatgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtct 2975666  T
Q  358 ct 359  Q
    ||    
T  2975667 ct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 263 - 316
Target Start/End: Original strand, 35210498 - 35210551
Alignment:
Q  263 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35210498 cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagaggacccat 35210551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 347 - 394
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  347 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 362  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 280 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  280 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 326  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 424
Target Start/End: Original strand, 2975036 - 2975086
Alignment:
Q  374 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2975036 tgttctagcctcgatgtggcaggtcccacgcgctcctctcatgatccaaca 2975086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15707217 - 15707169
Alignment:
Q  105 cacagtcttaacttccatcctgttacggatcatatcttttacctcatca 153  Q
    ||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15707217 cacagtctttacattcatcctgttacgggtcatatcttttacctcatca 15707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618656
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  350 tggtgtctctctt 362  Q
    |||||||||||||    
T  30618668 tggtgtctctctt 30618656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  319 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 8e-84; HSPs: 77)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 235 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44290991 - 44290814
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290991 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 44290892  T
Q  335 ttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290891 ttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 235 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44290624 - 44290448
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290624 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 44290525  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290524 ttttgggtaagagtatggtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 44290448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 230 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3537770 - 3537599
Alignment:
Q  230 gaagctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcct 329  Q
    |||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3537770 gaagttgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggct 3537671  T
Q  330 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537670 taaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 3537599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 401
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759641
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccc 41759641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294748
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgc-ggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtcgcccgagctcccctc 17294748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142533
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  343 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41142533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 235 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 48588654 - 48588491
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||    
T  48588654 tgttggtttgcaagtgtgagttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaagg 48588555  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48588554 ttttgggtaagagtgcggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 235 - 397
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26661678 - 26661521
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26661678 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 26661579  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26661578 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtccccc 26661521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 400
Target Start/End: Original strand, 41157375 - 41157532
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41157375 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagt 41157474  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41157475 aagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccc 41157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157150
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41157150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 234 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 50052190 - 50052001
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  50052190 ctgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaa 50052091  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  50052090 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctaacctcgatgtggacagtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 50052001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767138
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcccccaagcttccctcatgacccaaca 31767138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 251 - 403
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319027
Alignment:
Q  251 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  351 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccg 14319027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364675
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggatggttccctgagctcccc 34364675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 244 - 411
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082574
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtggatagtcctccgagctcccc 40082574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 11977282 - 11977440
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11977282 caagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 11977381  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977382 gagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 11977440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 393
Target Start/End: Original strand, 34364925 - 34365075
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364925 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggt 34365024  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | || |||| ||||||||||||    
T  34365025 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594747
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  337 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgc 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgc 32594747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 37556113 - 37556260
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37556113 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggta 37556211  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37556212 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798358
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtccccc 29798358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875315
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    |||| ||||| ||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctcccctcatga 3875315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649598
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||| || |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 34649598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084557
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcccccaggcttccctcatgacccaaca 45084557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850579
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggt-cccctagctcccctcatgatccaac 37850579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168698
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcccc 32168698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45494145 - 45493973
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcct 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  45494145 tgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcct 45494046  T
Q  330 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45494045 taaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 45493973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319965
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcccc 5319965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 240 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  240 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcg 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22077653 - 22077484
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22077653 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcgtagccttaaggttttgggt 22077554  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  22077553 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcccccaggctcccct 22077484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 247 - 401
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956067
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgagcggtcccc 9956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66449
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||  ||||||||||||| ||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggttatccaagctcccctcatgacccaaca 66449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661877
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||| ||| |||| |||  ||||||||| ||| ||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaatccttgatgcggatggtctccctagctcccctcgtgacccaa 26661877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 246 - 392
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600312
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggacagttccccg 24600312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066200
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgt-gacggtccccc 39066200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 235 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3537313 - 3537226
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537313 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184383
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag--------- 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttcagcc 41184484  T
Q  334 -----gttttgggtaagagtgtg---gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt-cccccgcgctcccctca-tgatccaac 423  Q
         ||||||||||||||||||    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  41184483 ttaaggttttgggtaagagtgtgatattgtcgctcttacttgtgcggttgttccagcctcgatgtcgacggtccccccgagctcccctcactgatccaac 41184384  T
Q  424 a 424  Q
    |    
T  41184383 a 41184383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44043943 - 44043810
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcc 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  44043943 tgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgtc 44043845  T
Q  329 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043844 ttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131965
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |  ||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||| |||| || || | || |||||||||| ||||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacgatctcctgagcccccctcatgacccaaca 24131965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 249 - 402
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575261
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtggaatgtccccc 5575261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 268 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22077243 - 22077109
Alignment:
Q  268 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 367  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  |||     
T  22077243 atcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcactta 22077144  T
Q  368 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077143 tgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtccccc 22077109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 66247 - 66078
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 340  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  66247 tgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctatggccttaaggttttgg 66148  T
Q  341 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||| | |||||   |||||  || |||||| |||||||||| |||  ||||||| ||||||||    
T  66147 gtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgtagacaatcccccgagctcccct 66078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
     |||||||||  || ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077818
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcctccaggctcccct 22077818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 244 - 395
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacg 395  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283434
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||    |||||||||||| ||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgggaggtccccttgactcccctcatgacccaa 19283434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 391
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30630796 - 30630648
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30630796 tgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagagaacccataaacacattgccttaaagttttgggt 30630697  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||| || ||| || |  ||| || || |||||| |||||||||||    
T  30630696 aagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 314 - 409
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977110
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 409  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcc 11977110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggct-gttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||| ||||||  |||| |||  |||||| || | |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 40049261 - 40049134
Alignment:
Q  22 acacggtcaatcacaaaggagaaaatctccttcttggatctgccaaacaccactggtaaaccaaggtatctagagtgagacatcacagtcttaacttcca 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || | ||    
T  40049261 acacggtcaataacaaaggagaaaatttgcttcttggatctaccaaacaccactggaagacccaggtatttagtatgagacatcacagtctttacattca 40049162  T
Q  122 tcctgttacggatcatatcttttacctc 149  Q
    || |||||| |||||| |||||| ||||    
T  40049161 tcttgttacagatcatttctttttcctc 40049134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378118
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 324  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Original strand, 35650738 - 35650865
Alignment:
Q  22 acacggtcaatcacaaaggagaaaatctccttcttggatctgccaaacaccactggtaaaccaaggtatctagagtgagacatcacagtcttaacttcca 121  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||  || |||||||||||||| |||| ||    
T  35650738 acacgatcaataacaaaggagaaaatttccttcttgaatctaccaaacaccactggaagacctaggtatttagtatgggacatcacagtctttactttca 35650837  T
Q  122 tcctgttacggatcatatcttttacctc 149  Q
    || |||||| |||||| |||||| ||||    
T  35650838 tcttgttacagatcatttctttttcctc 35650865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 313 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051666
Alignment:
Q  313 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgttgttctagcatcgatgtggacggtccccctagctcccct 50051678  T
Q  413 catgatccaaca 424  Q
    | ||| ||||||    
T  50051677 cgtgacccaaca 50051666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188628
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    || ||||||| ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctct 1188628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 270 - 371
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956321
Alignment:
Q  270 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 367  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  368 tgcg 371  Q
    ||||    
T  4956318 tgcg 4956321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 361
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378049
Alignment:
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccctgcgctcccc 21378049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 50051817 - 50051777
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051817 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 50469239 - 50469180
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469239 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 258 - 400
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092051
Alignment:
Q  258 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  358 ctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
     |||  |||||   | |||||| |||||||||| |||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtccc 44092051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  292 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 337  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  298 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 358  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 308  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266798
Alignment:
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcccc 4266798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 361
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 22077280 - 22077248
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077280 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 22077248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  252 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 311  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 47379943 - 47379891
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 295  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  47379943 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaacac 47379891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Original strand, 34498148 - 34498211
Alignment:
Q  171 atcttatgatatataattaaaagcacatcagtgagaaacttgattgctccctcaccttagaagc 234  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  34498148 atcttatgatatattataaaaagtacaccggtgagaaacgtgattgctccctcatcttaaaagc 34498211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 316 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  316 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 362  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380217
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 351  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtg 47380217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 235 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36178771 - 36178596
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178771 tgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 36178672  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  36178671 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacgatcccccgcgctccc 36178596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5542791 - 5542602
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5542791 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaagg 5542692  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5542691 tttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcccccgagctccccccatgatccaaca 5542602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 235 - 399
Target Start/End: Original strand, 37106180 - 37106344
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106180 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagg 37106279  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  37106280 ttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 234 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14745834 - 14745657
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745834 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 14745735  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14745734 gttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 14745657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 239 - 412
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106093
Alignment:
Q  239 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  339 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccct 37106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421566
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 6421566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5543164 - 5542975
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||     
T  5543164 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaga 5543065  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||    
T  5543064 ttttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtaccttgagctccccccatgatccaaca 5542975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283462
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccatgctcccctca 41283462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 409
Target Start/End: Original strand, 15880265 - 15880429
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880265 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 15880364  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 409  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  15880365 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacgttcctccgagctcc 15880429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962778
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctcccgaactcccc-catgatccaaca 962778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514830
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 42514830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 261 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178148
Alignment:
Q  261 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  361 ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 36178148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580723
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35580723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713159
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca-tgatccaaca 424  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgaacttccctcactgatccaaca 6713159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511495
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacgatcccc 15511495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005870
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
     ||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacagtctctcgagctcccc 36005870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 259 - 402
Target Start/End: Original strand, 6422126 - 6422269
Alignment:
Q  259 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 358  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6422126 atgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagaggacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctc 6422225  T
Q  359 tcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6422226 tcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtccccc 6422269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 399
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  348 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 14745460 - 14745300
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745460 tgttggtttgcaactgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaagg 14745361  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||   || | || |||||||||||||||||||||    
T  14745360 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 424
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346417
Alignment:
Q  256 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  356 ctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtcgcccgagctcccctcatgacccaaca 23346417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796619
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  343 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    |||||  ||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtccc 38796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40679787 - 40679632
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40679787 tgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccatcgccttaagattttgggt 40679688  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  40679687 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 424
Target Start/End: Original strand, 1769883 - 1770073
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || |     
T  1769883 ctgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaa 1769982  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    | ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||  |||| ||||||    
T  1769983 gctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtgaacgatcctcctagctcccccaatgacccaaca 1770073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Original strand, 40733519 - 40733676
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||    
T  40733519 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaa 40733618  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||||||    
T  40733619 gagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtccccc 40733676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 346  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  347 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagc 382  Q
    |||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28531472 - 28531316
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28531472 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagaggtcccataaactcattgccttaagattttgggt 28531373  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||| | || ||||||||||||||||| |||||    
T  28531372 aagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36178436 - 36178320
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  36178436 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaag 36178337  T
Q  334 gttttgggtaagagtgt 350  Q
    |||||||||||||||||    
T  36178336 gttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 425
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598410
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    |||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||| ||| |||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccctgatctcccctcgtgacccaacac 7598410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 235 - 396
Target Start/End: Original strand, 7598601 - 7598754
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| |    
T  7598601 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa--------ccttaacg 7598692  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  7598693 tttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163349
Alignment:
Q  254 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg-ccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || | |||||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| || | |||||||  |||| ||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtagatggtctcctgagctccccctatgacccaaca 40163349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 387
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcga 387  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 305 - 423
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421911
Alignment:
Q  305 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgc 404  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||     
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcccccga 6421892  T
Q  405 gctcccctcatgatccaac 423  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  6421893 gctcccctcatgacccaac 6421911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Original strand, 40733885 - 40734041
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| |||| |  ||||||| |||||||||||    
T  40733885 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaagagggctcat-aacctacagccttaaagttttgggtaa 40733983  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40733984 gagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtccccc 40734041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 400
Target Start/End: Original strand, 29676903 - 29677065
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  29676903 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctt 29677002  T
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  29677003 taagtaagagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtccc 29677065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  343 aagagtgt 350  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31468904 - 31468800
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31468904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 31468809  T
Q  343 aagagtgtg 351  Q
    |||||||||    
T  31468808 aagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||  || |||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 251 - 401
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676687
Alignment:
Q  251 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||      ||||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcc------ttttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  351 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcccc 29676687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591054
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggacagtctcccgagctcccctca 16591054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 246 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 331  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874022
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||| |||| ||   ||||||||| || | | |||| ||||||| |||||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtccccc 29874022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 30313178 - 30313358
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30313178 tgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagaggacccaaaaactcattgccttaagattttgggt 30313276  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || || ||| |||| ||| | |||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  30313277 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctggattttgacgatcccccgggctctcctcgtgacccaaca 30313358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  251 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  351 ggtgt 355  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 297 - 411
Target Start/End: Original strand, 3673122 - 3673236
Alignment:
Q  297 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3673122 ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctctcttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 3673221  T
Q  397 tcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||  |||||||    
T  3673222 tccccctggctcccc 3673236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  343 aagagtgtggtgtctct 359  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33561609 - 33561491
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33561609 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggt 33561510  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  33561509 aagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38796376 - 38796298
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38796376 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 360
Target Start/End: Original strand, 30323464 - 30323581
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30323464 tgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgagaggacctataaactcattgccttaaggttttgggt 30323563  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctc 360  Q
    |||||||||| |||||||    
T  30323564 aagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 411
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672869
Alignment:
Q  315 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggttcccctggctcccc 3672869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37894850 - 37894732
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |    
T  37894850 tgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaagactcataaatccattgccttaagattttggtt 37894751  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    || |||||||||| |||||    
T  37894750 aaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 402
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421785
Alignment:
Q  305 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggtacccc 6421785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36785721 - 36785664
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785721 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231407
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||| || |||||||  ||| ||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacgatcccc 9231407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  259 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33953929 - 33953821
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  33953929 tgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctgttgccttaaaattttgggt 33953830  T
Q  343 aagagtgtg 351  Q
    |||||||||    
T  33953829 aagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 296 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  296 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 388  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 244 - 359
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385853
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  344 agagtgtggtgtctct 359  Q
      ||||||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctct 31385853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29873695 - 29873577
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  29873695 tgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtgggaggactcataaactcattgccttaaggttttgagt 29873596  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  29873595 aagagtgtgacgtctctct 29873577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 333 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899080
Alignment:
Q  333 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggt-ccccaagctcccctcatgatccaaca 31899080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 350
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  346 agtgt 350  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580412
Alignment:
Q  307 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccg 403  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | || |  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggttcccccg 35580436  T
Q  404 cgctcccc-tcatgatccaacaca 426  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  35580435 agctccccttcatgacccaacaca 35580412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41678527 - 41678419
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 340  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  41678527 tgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgagaggacccataaa-cctttgccttaaggttttga 41678429  T
Q  341 gtaagagtgt 350  Q
    ||||||||||    
T  41678428 gtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 424
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312971
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct-tgcttgtgcggctgttctagcc 383  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    |||||||| || ||| |||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctctcaatttgtgcggttgctctggcc 30312930  T
Q  384 tcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |  ||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30312931 tgaatgtgggtggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30312971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 245 - 291
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 291  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||| | |||||| | || ||| |  | ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 297 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  297 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 356  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 258 - 305
Target Start/End: Original strand, 42515031 - 42515078
Alignment:
Q  258 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 305  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42515031 tatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954302
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctct 33954302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 342
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Original strand, 3673085 - 3673121
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3673085 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaat 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 361
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  313 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 361
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 359  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 279
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 82)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 235 - 423
Target Start/End: Original strand, 3669679 - 3669867
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3669679 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagg 3669778  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  3669779 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtccccctagctcccctcgtgacccaac 3669867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Original strand, 3670051 - 3670214
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3670051 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaag 3670150  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3670151 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Original strand, 30441073 - 30441266
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcctt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30441073 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcctt 30441172  T
Q  331 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||| ||| ||||||    
T  30441173 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcaccttggctcccctcgtgacccaaca 30441266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038281
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgagctccc 3038281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 34835211 - 34835377
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34835211 caagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaa 34835310  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34835311 gagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 235 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014234
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggttcccccgagctcccc 1014234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835043
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggatgatcccttgcgctccc 34835043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870550
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  333 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcctcctggctcccctcatgacccaaca 20870550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1014037 - 1013879
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  1014037 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagag 1013938  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1013937 ttttgagtaagagtgtgttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544469
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacgat-ccccgagttcccctcatgacccaac 37544469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876852
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 6876852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518239
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 40518239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 246 - 402
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147610
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||  ||||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgggtggtccccc 147610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 250 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 9482755 - 9482608
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  9482755 gtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaagattttgtataagagtg 9482656  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9482655 tggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 268 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483174
Alignment:
Q  268 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 367  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  368 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggttcccatagctcccctca 9483174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608903
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacggccccc 9608903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 9309355 - 9309522
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||    
T  9309355 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggt 9309454  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309455 aagagtgtggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 9309522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371970
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggttcccccgagctcccctcatgacccaaca 18371970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113368
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtccc 33113368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 34835476 - 34835643
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835476 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835575  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34835576 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 34835742 - 34835909
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34835742 caagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaagttttgggta 34835841  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34835842 agagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtccccctggctcccc 34835909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359443
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtggatggttccctcgagctcccctca 30359443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 399
Target Start/End: Original strand, 40518584 - 40518738
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40518584 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaa 40518683  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  40518684 gagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121898
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||| || | ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcccccaggctcccctc 45121898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513914
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
     |||||||| |||||||| | |||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtccccc 1513914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561815
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcccc 25561815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 257 - 402
Target Start/End: Original strand, 45122638 - 45122783
Alignment:
Q  257 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 356  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45122638 atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtc 45122737  T
Q  357 tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45122738 tctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtccccc 45122783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 237 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579490
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 336  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  337 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacgatcctccatgctccccacatga 40579490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916025
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccc 5916025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 30359611 - 30359763
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  30359611 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaa 30359710  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  30359711 gagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtggacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70272
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||  |||| ||||||||||| || ||||||| |||| ||| |||||||| ||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtctcccg 70272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 45123006 - 45123165
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  45123006 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaagatgacccataaacctattttcttaaggttttgggt 45123103  T
Q  343 a--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |  |||||||||||||||||||  ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45123104 aagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtccccc 45123165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Original strand, 6731896 - 6732045
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  6731896 tgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa---------agtaagagaacccataaattcattgccttaagg 6731986  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6731987 ttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8918922 - 8918764
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8918922 tgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacctattgacttaaggttttgggt 8918823  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||  |||| |||||| |||| || |||| || ||||||||||||||||||||    
T  8918822 aagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcccc 8918764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972341
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtctcccgaactcccc-catgacccaaca 41972341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||||||  ||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 250 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18371807 - 18371637
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18371807 gtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaaca----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtg 18371713  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||| |||||   |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  18371712 tggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtggacggttcccccgagctctcctcatgacccaaca 18371637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309149
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  341 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 9309149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 247 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380020
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 346  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  347 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||||   ||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| |||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtccc 18380020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 45121811 - 45121663
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  45121811 caagtgtgagttgt-tgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaa 45121713  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  45121712 gagtgtgatatctctcttacttatggggttgttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 250 - 402
Target Start/End: Original strand, 6651510 - 6651653
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651510 gtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacccataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtg 6651600  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  6651601 tggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtccccc 6651653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 246 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640515
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc-cccgcgctcccctcatga 417  Q
    ||||| | ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtgagcggtccgccagagctcccctcatga 32640515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 237 - 402
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305636
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  337 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtccccc 32305636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 425 - 511
Target Start/End: Original strand, 39498971 - 39499057
Alignment:
Q  425 cagcatggttcatgagacttggtcttgaagacatagcttcacctggtaaaattgagtttcttccaattttgcgtttattaccaaacc 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39498971 cagcatggttcatgagacttggtcttgaagacatagcttcacctggtaaaattgagtttcttccacttttgcgtttattaccaaacc 39499057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Original strand, 147829 - 147968
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147829 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa---------cccataaacctattgccttaaggttttgggt 147919  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||    
T  147920 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 318 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579258
Alignment:
Q  318 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccccgagctcccct 40579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 235 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 321  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154645
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| || || ||| |||| ||||||   |||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtgagtggtccctcggactcccttcatgacccaaca 4154645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  346 agtgtggtgtc 356  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  345 gagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 337  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| |  || ||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 266 - 380
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  266 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 365  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  366 tgtgcggctgttcta 380  Q
     ||| || |||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18373085 - 18372988
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 346  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  18373085 agtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaaga 18372989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620656
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    |||||| || |||||||||  |||||| || || ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcccccgggctcccctcgtgacccaac 9620656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18372854 - 18372785
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372854 aagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  345 gagtgtg 351  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18372411 - 18372342
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18372411 aagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 416
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129161
Alignment:
Q  321 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatg 416  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcccccaggctcccctcatg 41129161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  247 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    ||| ||||| || ||| || || |||||| || |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 325 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919143
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtccccc 8919143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 392
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 253 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4154438 - 4154321
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  4154438 tgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagag-acccataaactcattgccttaatattttgggt 4154340  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  4154339 aagtgtgtgatgtctctct 4154321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274901
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtg 5274901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 337 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274626
Alignment:
Q  337 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcccccgagctccc 43274626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 343 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372262
Alignment:
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg-tcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggttcccccgagctcccctcatgacccaa 18372262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 320 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995383
Alignment:
Q  320 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| ||| |||  |||||| |  ||||||||| ||| |    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcctagatatgggtggtccctctggctcccctcgtgacc 20995398  T
Q  420 caacacagcatggtt 434  Q
    ||||| | |||||||    
T  20995397 caacatatcatggtt 20995383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 18372526 - 18372485
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372526 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  279 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 342
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037959
Alignment:
Q  354 gtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3037959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 314 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 351  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 324 - 369
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524491
Alignment:
Q  324 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 16524491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 320
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 320  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417756
Alignment:
Q  297 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctct 40417756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  301 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 379 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3038074 - 3038042
Alignment:
Q  379 tagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3038074 tagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 3038042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 275  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 152; Significance: 3e-80; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 235 - 414
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500621
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296292
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaggcctccctcatgacccaaca 40296292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502013
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtccccctagctcccctcatgacccaaca 27502013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3295172 - 3294993
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3295172 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggt 3295074  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3295073 atgagtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtccccctcgctcccctcatgatccaac 3294993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 235 - 414
Target Start/End: Original strand, 6500815 - 6500993
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6500815 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaagg 6500913  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6500914 ttttggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcccccaggctcccctca 6500993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 246 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295323
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctcactcccctcatgatccaac 3295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 234 - 423
Target Start/End: Original strand, 32487385 - 32487573
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487385 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 32487483  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||||    
T  32487484 gttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccaagcttcccccatgacccaac 32487573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370267
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 15370267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 235 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 236 - 402
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170793
Alignment:
Q  236 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 335  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  336 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtccccc 41170793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 235 - 411
Target Start/End: Original strand, 624188 - 624364
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  624188 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgagg 624287  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  624288 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggttccccgagctcccc 624364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492218
Alignment:
Q  240 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccc 36492218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13415918 - 13415774
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13415918 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattaccttaaggttttgggt 13415819  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcga 387  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13415818 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 246 - 414
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328106
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcccccgagctcccctca 25328106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 9498820 - 9498634
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9498820 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaga 9498721  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  9498720 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatg-tgctggtctagcctcaatgtggacggtccccctagctcccctcgtgacccaa 9498634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405588
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 42405588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632941
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtccccc 41632941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 244 - 417
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299664
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatga 417  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcccccggagctcccctcatga 299664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 250 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416970
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 408  Q
    || | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtccccctcgctc 11416970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028504
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1028504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224366
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||  |||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcccccaggctcccctc 6224366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568556
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcccccgagctcccctca 36568556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662651
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtccccc 12662651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 392
Target Start/End: Original strand, 26074614 - 26074761
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074614 caagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26074713  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||  || ||| || || |||| |||||||||||    
T  26074714 gagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 235 - 409
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623984
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 409  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcccccgagctcc 623984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 245 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 343  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26074304 - 26074155
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26074304 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggacccatgaacccattgccttaaggttttgggt 26074205  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| || || |||| |||||||||||    
T  26074204 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 269 - 425
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370584
Alignment:
Q  269 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 368  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  369 gcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccatgctcccctcatgtcccaacac 15370584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 255 - 397
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  255 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  355 tctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150164
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    || ||||||||||||||||  || ||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcccc 35150164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 235 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctag 381  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24489360 - 24489207
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24489360 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga--acccataaacccattgccttaagattttgcgtaa 24489263  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  24489262 gagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtccc 24489207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 240 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549290
Alignment:
Q  240 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 366  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgctt 29549290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26074938 - 26074818
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  26074938 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtaggaggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaa 26074839  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgc 364  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  26074838 agagtgtggcgtctctcttgc 26074818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301132
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| |||  ||||||| |||| ||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcctccgaactcccctaatgacccaaca 301132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 248 - 393
Target Start/End: Original strand, 38427553 - 38427697
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  38427553 gtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gaggacccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagag 38427651  T
Q  348 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    ||||  ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38427652 tgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590909
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtggatggttcccc 26590909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167837
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||| ||||||||   || ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtccccc 35167837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 412
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411176
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    ||||| || ||||| || ||||   |  ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcccccaagctcccct 2411176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36522392 - 36522263
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36522392 aagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagaggaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaag 36522293  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctg 375  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36522292 agtgtggtgtctctctcacttgtgcggctg 36522263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 318
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 318  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36522053 - 36521946
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36522053 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggta 36521954  T
Q  344 agagtgtg 351  Q
    ||||||||    
T  36521953 agagtgtg 36521946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 424
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915029
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    | |||||| |||||||||||| |  |  || || | |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtccccc-agctccgctcatgacccaaca 35915029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 338  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 329 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26899995
Alignment:
Q  329 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcccccaagctcccc-catgacccaaca 26899995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 31509623 - 31509742
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||    
T  31509623 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttgg 31509722  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||| ||| ||||||||||    
T  31509723 taagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 330 - 424
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427401
Alignment:
Q  330 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 424  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcccccgagctcccttcgatgatccaaca 38427401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 8710220 - 8710311
Alignment:
Q  22 acacggtcaatcacaaaggagaaaatctccttcttggatctgccaaacaccactggtaaaccaaggtatctagagtgagacatcacagtctt 113  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8710220 acacggtcaataacaaaagagaaaatctccttcttggatctaccaaacacaactgggaggcccaggtatctagtatgagacatcacagtctt 8710311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635170
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||| || ||||| || |||||  || || |||| | |  |||||||| ||  ||| | |||||||||||||||||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctctatctttaatgtggactgt--ccctcactcccctcatgatccaaca 41635170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 368
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  257 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  356 ctctcttgcttgt 368  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 245 - 324
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 324  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786041
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  344 agagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||| |||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctct 13786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  327 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttct 379  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 20925178 - 20925269
Alignment:
Q  22 acacggtcaatcacaaaggagaaaatctccttcttggatctgccaaacaccactggtaaaccaaggtatctagagtgagacatcacagtctt 113  Q
    |||||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  || ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20925178 acacggccaataacgaaagagaaaatctccttcttggatctaccaaacacaactgggaggcccaggtatctagtatgagacatcacagtctt 20925269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  300 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttct 379  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 338
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 338  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  301 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 357
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 303
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 303  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 283
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 283  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785632
Alignment:
Q  301 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | ||||  || ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtccc 13785633  T
Q  401 c 401  Q
    |    
T  13785632 c 13785632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 368
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  280 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 368  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctag 381  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 361
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  323 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 361
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  323 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 285
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 397
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 355
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 292  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13785764 - 13785732
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785764 aagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 150; Significance: 5e-79; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085593
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctggctcccctcatgacccaaca 1085593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37533176 - 37532988
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37533176 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 37533077  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  37533076 ttttgggtaa-agtgtggtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcccccgcgctcccatcgtgacccaaca 37532988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 235 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533341
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcgtgacccaaca 37533341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23368
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcccccgagctccc 23368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 250 - 411
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845359
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcccccgtgctcccc 11845359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517751
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||| || |||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggtggtccccttggctcccctca 7517751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 245 - 412
Target Start/End: Original strand, 30244272 - 30244439
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244272 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 30244371  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  30244372 gagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccct 30244439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567026
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctca 22567026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 237 - 398
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  337 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | || ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094772
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcccccg 40094772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 413
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433411
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtccccctggctcccctc 45433411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 245 - 408
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054725
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctc 408  Q
    |||||||||||||||| | |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcccccgagctc 6054725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 30245079 - 30245254
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30245079 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 30245178  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  30245179 gagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaaca 30245254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177594
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtccccc 24177594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 249 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218011
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcctccgagctccccccataatccaaca 34218011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Original strand, 7554025 - 7554151
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7554025 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggt 7554124  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7554125 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 7554151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 410
Target Start/End: Original strand, 45434638 - 45434803
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  45434638 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaa 45434737  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  45434738 gagtgtgatgtctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtgatcggtccccctcgctccc 45434803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129275
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggt-ccccgagctcccctcatgatccaaca 47129275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 245 - 390
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 398
Target Start/End: Original strand, 14681502 - 14681663
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14681502 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaagg 14681601  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |  ||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  14681602 ttttgggtaagagtgtggtgtctctc--acaagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 391
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  251 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  351 ggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 248 - 411
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032735
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  348 tgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcccccgagctcccc 30032735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128428
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtgaacagtcccccgcactcccctca 8128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22566820 - 22566702
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566820 tgcaagtgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 22566721  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctctt 362  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22566720 aagagtgtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 423
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623140
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||| |  ||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcccttgagctcccctcatgacccaac 36623140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118299
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  343 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcccc 118299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 246 - 399
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 264 - 411
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167949
Alignment:
Q  264 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  364 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccc 37167949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230290
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||  | | ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggttcccc 40230290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1085407 - 1085280
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1085407 tgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttggg 1085308  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085307 taagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854793
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtccccc 41854793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag-aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttc 378  Q
    |||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 285 - 422
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253667
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| || ||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  385 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcccccgagctcccctcgtgacccaa 30253667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534825
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctc 360  Q
    |||||||||| |||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc 36534825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 324 - 424
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129549
Alignment:
Q  324 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggt-ccccgagctcccctcatgacccaac 47129548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 398
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 343  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 364
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgc 364  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 331 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532729
Alignment:
Q  331 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcctccgcgctcccctcgtgatccaac 37532729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 331  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 246 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910657
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttt 41910657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  289 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcga 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| || |||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  388 tgtggacggtcc 399  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 316
Target Start/End: Original strand, 30245494 - 30245567
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30245494 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 316
Target Start/End: Original strand, 30255339 - 30255412
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 316  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30255339 tgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Original strand, 30244701 - 30244771
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30244701 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 311  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 326 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300569
Alignment:
Q  326 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacgatccc 28300569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  312 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244533
Alignment:
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtccctcaggctcccctcatgacccaaca 30244533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253751
Alignment:
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcccccaggctcccctcatgacccaaca 30253751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 36356996 - 36356869
Alignment:
Q  22 acacggtcaatcacaaaggagaaaatctccttcttggatctgccaaacaccactggtaaaccaaggtatctagagtgagacatcacagtcttaacttcca 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | |  || |||||| |||  || |||||||||||||| || | ||    
T  36356996 acacggtcaataacaaaggagaaaatttccttcttggatctaccaaacaccacatgaaggcctaggtatttagtatgggacatcacagtctttacattca 36356897  T
Q  122 tcctgttacggatcatatcttttacctc 149  Q
    || ||||||  ||||| |||||| ||||    
T  36356896 tcttgttacaaatcatttctttttcctc 36356869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 424
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245336
Alignment:
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcccccatgctccccttatgacccaaca 30245336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 280
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40094552 - 40094502
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094552 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 234
Target Start/End: Original strand, 3316639 - 3316702
Alignment:
Q  171 atcttatgatatataattaaaagcacatcagtgagaaacttgattgctccctcaccttagaagc 234  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3316639 atcttatgatatattattaaaagtataccagtgaggaacttgattgctccctcatcttataagc 3316702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 295  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 37345916 - 37346036
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 340  Q
    ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  37345916 tgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttga 37346015  T
Q  341 gtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||  ||||||||    
T  37346016 gtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 390  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| || || |||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 388
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  326 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 388  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 364 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 5825621 - 5825561
Alignment:
Q  364 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||    
T  5825621 cttgtgcggttgttctagccttgatgtggacggtctcccaagct-ccctcatgacccaacac 5825561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 422
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902478
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||| |  |||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  385 cgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
     |||||||  |||||||||  |||||||| ||| ||||    
T  15902441 ggatgtgggtggtcccccggactcccctcgtgacccaa 15902478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 403
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393218
Alignment:
Q  298 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| || || || |||| |||||||||||||| |    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacgat 37393212  T
Q  398 cccccg 403  Q
    ||||||    
T  37393213 cccccg 37393218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 105)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 50630919 - 50630740
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630919 tgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 50630820  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||    
T  50630819 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtccgcctagctcccctca 50630740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 235 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933121
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 55933121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483504
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctggctcccc 25483504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370517
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 41370517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 36629239 - 36629408
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36629239 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36629338  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  36629339 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccacatgctcccctca 36629408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 243 - 422
Target Start/End: Original strand, 44620660 - 44620838
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  44620660 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaaatagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacc-ataaccttaaggttttgggt 44620758  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaa 422  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44620759 aagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgttatatcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaa 44620838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 240 - 403
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002586
Alignment:
Q  240 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  340 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcccccg 50002586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017583
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtctccctagctcccc 54017583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340975
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtctcctgagctcccc 3340975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792842
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcctctgagctcccctcatga 39792842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246089
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacgctcccccaagctcccctc 10246089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608635
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaacac 425  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcgtgacccaacac 36608635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 243 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731646
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtccc 1731646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404189
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctcccctca 39404189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 258 - 391
Target Start/End: Original strand, 54108928 - 54109060
Alignment:
Q  258 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54108928 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtct 54109026  T
Q  358 ctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  54109027 ctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Original strand, 39404400 - 39404555
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  39404400 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaa 39404499  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39404500 gaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtccc 39404555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 252 - 424
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621180
Alignment:
Q  252 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 351  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  352 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44621180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 22028117 - 22027936
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22028117 tgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacatattgccttaaggttttgggt 22028018  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || || |||| ||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  22028017 aagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtccctcaggctcccctcatgacccaaca 22027936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 234 - 363
Target Start/End: Original strand, 49880151 - 49880280
Alignment:
Q  234 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49880151 ctgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaag 49880250  T
Q  334 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49880251 gttttgggtaagagcgtggtgtctctcttg 49880280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572177
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcccc 36572177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183261
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22183261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 252 - 424
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620531
Alignment:
Q  252 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 351  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  352 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
     ||| ||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtccc---cgctcctctcatgatccaaca 44620531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 243 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076807
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcccctgagct-ccctcatgacccaaca 49076807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343004
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccg 54343004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646648
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||| | |||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtccc 34646648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 246 - 400
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459878
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  346 agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtccc 50459878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 262 - 411
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936363
Alignment:
Q  262 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  362 tgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
      | | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcccccgagctcccc 54936363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740869
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  || ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcacttgt--ggttgttctagcctcgatatggatggtcccccgagctcccctca 2740869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 249 - 424
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20826018
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc-atgatccaaca 424  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||| || |||||||||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcccccatgctcccttcaatgatccaaca 20826018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 391
Target Start/End: Original strand, 52884887 - 52885038
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884887 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggg 52884986  T
Q  342 taagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||| |||||||  ||||||||  ||||| || || |||||||||||||||    
T  52884987 taagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 261 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18932887 - 18932745
Alignment:
Q  261 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 360  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18932887 gtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctc 18932788  T
Q  361 ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    || |||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  18932787 ttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcccccg 18932745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028366
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 340  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  341 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 22028366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 246 - 401
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303064
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacgatcccc 49303064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 396
Target Start/End: Original strand, 20826223 - 20826370
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  20826223 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagagaacccataaacccatagccttaacattttaggtaagagt 20826322  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    ||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20826323 gtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888814
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcccc 16888814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889511
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||| ||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtccctcgagctccccacgtgacccaaca 16889511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 258 - 369
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496931
Alignment:
Q  258 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  358 ctcttgcttgtg 369  Q
    ||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtg 45496931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 242 - 402
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108695
Alignment:
Q  242 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 340  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  341 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg-cggtccccc 54108695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004560
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtctcccgagctcctctcatgacccaaca 34004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49076604 - 49076439
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  49076604 tgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggt 49076506  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |  || | ||||||| ||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49076505 a--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 49076439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 243 - 352
Target Start/End: Original strand, 2741071 - 2741180
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2741071 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggt 2741170  T
Q  343 aagagtgtgg 352  Q
    ||||||||||    
T  2741171 aagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3244607 - 3244449
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3244607 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaagttttgggt 3244508  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||||  || ||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  3244507 aagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgggcagtcccc 3244449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  345 gagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 235 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 297 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817678
Alignment:
Q  297 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  397 tccccc 402  Q
    ||||||    
T  23817683 tccccc 23817678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 283 - 414
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827610
Alignment:
Q  283 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagc 382  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  383 ctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcccccgagcttccctca 43827610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 3341128 - 3341287
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||    
T  3341128 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactttataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggt 3341227  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||| ||||| ||||  || || || | || || ||||||||| |||||||||||    
T  3341228 aagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggtccccc 3341287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741216
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||| || |||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct 54741216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691335
Alignment:
Q  294 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  392 gacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||| |||  || |||||||  |||| ||||||    
T  31691303 gacgatccttcgagctcccccaatgacccaaca 31691335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 397
Target Start/End: Original strand, 43174508 - 43174661
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| || |||||||    
T  43174508 caagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacacataaacctatgaccttaaagtgttgggta 43174607  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||| |||||||||| || |  || |||| |||||| ||||||||||||    
T  43174608 agagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768035
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || |  ||||||| ||||||||||||||||| |||   || ||||||||| ||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtctcccaaacttccctcatgacccaaca 51768035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 245 - 389
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatg 389  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 424
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879987
Alignment:
Q  289 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgat 388  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  389 gtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||    
T  18879952 gtggacggtcctccgagctcccccaatgacccaaca 18879987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 45489485 - 45489331
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||    
T  45489485 caagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaagagaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaa 45489387  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccc 400  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  45489386 gagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtccc 45489331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 256 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  256 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700517
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |||||| || |||||||||   ||||| || | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtctcccg 3700517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034388
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| ||||| || ||| | || |||||||| ||||||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtccccc 28034388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 380
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttcta 380  Q
    | |||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 264 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111694
Alignment:
Q  264 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  364 cttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |   || || | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcccccg 48111694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 248 - 361
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760306
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  348 tgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctct 760306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 243 - 332
Target Start/End: Original strand, 10246347 - 10246436
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 332  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10246347 tgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaacccatagccttaa 10246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 402
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271948
Alignment:
Q  265 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 360  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  361 -ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
     ||  || || || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 3271948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 235 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 295  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 309
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  251 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || || ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 309
Target Start/End: Original strand, 44621426 - 44621492
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621426 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaaacagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 335 - 411
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174309
Alignment:
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcccccgagctcccc 43174309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 268 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698919
Alignment:
Q  268 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 365  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  366 tgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||| ||||   | |||| |||||| ||||||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcctatgagctctcctcatcatccaaca 39698919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556896
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtg 23556896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 309
Target Start/End: Original strand, 44620946 - 44621011
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620946 caagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489711
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  349 gtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||| |||||   || |||||||| |||||||||| || ||||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtggccgatccccc 45489711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 357 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702281
Alignment:
Q  357 tctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacagtccccctcgctcccctcatga 11702281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 243 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 331  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 249 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  249 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 348  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  349 gtggtgtctctct 361  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783528
Alignment:
Q  306 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcg 405  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||   | || |||||||| |||||||  ||||||||  |    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgggtggtccccctgg 11783547  T
Q  406 ctcccctcatgatccaaca 424  Q
    | |||||||||| ||||||    
T  11783546 cacccctcatgacccaaca 11783528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 362
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 362  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 350
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 350  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 353 - 392
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 217
Target Start/End: Original strand, 9597831 - 9597877
Alignment:
Q  171 atcttatgatatataattaaaagcacatcagtgagaaacttgattgc 217  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9597831 atcttatgatatattattaaaagtacatcggtgagaaacttgattgc 9597877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  301 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 359  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 397
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  323 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| | || ||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 355
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  309 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18932924 - 18932887
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgg 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18932924 tgttggtttgcaagtctgagttatatgtcccacatcgg 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  297 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 291
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 341
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  298 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  287 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  319 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50788034
Alignment:
Q  321 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 359  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctct 50788034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 284  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  356 ctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 339
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  306 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 339  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 280
Target Start/End: Original strand, 41370693 - 41370738
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 280  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370693 tgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 325 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 368 - 412
Target Start/End: Original strand, 45496675 - 45496719
Alignment:
Q  368 tgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  45496675 tgcggttgttctagcctcgatgtagacggtccctcgagctcccct 45496719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 85)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 235 - 402
Target Start/End: Original strand, 22304561 - 22304728
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22304561 tgttggtttgcaagtgtgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaagg 22304660  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22304661 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtccccc 22304728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 245 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346775
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg-cgctcccctcatg 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcctccgaagctcccctcatg 43346775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589884
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtccccctcgctcccttcatgatccaaca 32589884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946681
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 35946681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 37990795 - 37990626
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37990795 caagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 37990696  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37990695 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcccccgagctctcctca 37990626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 243 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644890
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctc 29644890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 243 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342377
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccct 412  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccctggctcccct 42342377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990953
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgct-cccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccctcaggctccccctcatgacccaaca 37990953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114561
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtccccc 12114561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 29644739 - 29644558
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29644739 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644640  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||   |||||||| ||| ||||||    
T  29644639 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgtggatggtcccccaaactcccctcgtgacccaaca 29644558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803251
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||| ||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 33803251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634843
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcccccgagctcccc 52634843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39935123 - 39934963
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 332  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39935123 tgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaa 39935024  T
Q  333 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  39935023 agttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 54017974 - 54017806
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54017974 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacctaacgccttaaggttttgggt 54017875  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  54017874 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtccccctggctcccc 54017806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739424
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtccccc 25739424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018197
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 54018197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41359919 - 41359764
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41359919 tgcaagtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 41359824  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41359823 aagaatgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtccccc 41359764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 417
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755568
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatga 417  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcccccgaactcccctcatga 25755568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 42342248 - 42342092
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42342248 tgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggt 42342149  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcc 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42342148 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 384
Target Start/End: Original strand, 4823647 - 4823796
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||     
T  4823647 tgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttataagtaggaggacccataaactcattgccttaaga 4823746  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  4823747 ttttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Original strand, 15773192 - 15773375
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15773192 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggt 15773291  T
Q  343 aagagtgtggtgtctct--cttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||    
T  15773292 aagagtgtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacgatcctcctaactcccctcatgatccaaca 15773375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 21832501 - 21832344
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21832501 tgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagccttaaggttttgggt 21832402  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21832401 aaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtccccc 21832344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 235 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612446
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  330 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtccccc 50612446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 245 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 22304104 - 22303954
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22304104 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 22304012  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22304011 gagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggattgtccccc 22303954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3135224 - 3135102
Alignment:
Q  250 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  3135224 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtg 3135125  T
Q  350 tggtgtctctcttgcttgtgcgg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3135124 tggtgtctctcttgcttgtgcgg 3135102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135432
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaac 423  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctgactctcctcatgacccaac 3135432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 243 - 401
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190167
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacgctcccc 31190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 403
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577524
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcccccg 53577524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 243 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 243 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634302
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | |  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtccccctagctcccctca 1634302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 245 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 32462715 - 32462536
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  32462715 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccataaacctattgctttaaggttttggata 32462616  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||    
T  32462615 agagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacgg-cccccaaactcccctcatgatccaaca 32462536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 390
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgt 390  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 401
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901872
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccc 401  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcccc 45901872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328022
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctct 8328022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117974
Alignment:
Q  244 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  344 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||| ||||||||||  |  ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtccccc 53117974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  345 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgga 393  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160546
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtccccc 44160546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 9240149 - 9240300
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |    
T  9240149 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattaccttaagatttcggat 9240248  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    |||| ||||||||||||||   | |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9240249 aagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726656
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 37726656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  301 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtc 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175646
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 341  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  342 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||| |  ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgggcagtcccccgagctcccctca 33175646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 409
Target Start/End: Original strand, 11661954 - 11662117
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11661954 aagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggtttttgggtaa 11662053  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcc 409  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  11662054 gagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacagtcccacgagctcc 11662117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 235 - 397
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886709
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggt 397  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||| |  |||||||  ||||||||| |||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  253 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  353 tgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacgg 396  Q
    |||  ||||| ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  269 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 367  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47964676 - 47964558
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47964676 tgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 47964577  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  47964576 aagagtgtggcgtctctct 47964558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3384432 - 3384317
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |    
T  3384432 tgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgccttaaag 3384333  T
Q  335 ttttgggtaagagtgt 350  Q
    ||||||||||||||||    
T  3384332 ttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 235 - 298
Target Start/End: Original strand, 22304238 - 22304301
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304238 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 317 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359490
Alignment:
Q  317 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtccccc 41359490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336208
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc-gcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||| || || ||| |||| |||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcccccttggctcccctcgtgatccaaca 39336208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  345 gagtgtggtgtctctct 361  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  346 agtgtg 351  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017547
Alignment:
Q  313 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |  |||| | |||||||||||| |||||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtccccc 54017547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 243 - 299
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964914
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| |  |  |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacgttccccc 47964914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336002
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtg 39336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 353
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  293 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 402
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304352
Alignment:
Q  352 gtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtccccc 22304352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 361
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  345 gagtgtggtgtctctct 361  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 347 - 414
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328441
Alignment:
Q  347 gtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctca 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtcccacgaactcccctca 8328441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 390
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  285 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcct 384  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| || || |||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  385 cgatgt 390  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  298 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  298 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 376 - 424
Target Start/End: Original strand, 9239946 - 9239994
Alignment:
Q  376 ttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctcatgatccaaca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9239946 ttctagcctcgatgtggacggtcccccaagctcccctcatgatccaaca 9239994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 361
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317276
Alignment:
Q  246 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  346 agtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||| |||| |||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctct 25317276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 361
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978856
Alignment:
Q  323 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctccc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcccccgagctccc 43978856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 357  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 243 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  311 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 41360164 - 41360125
Alignment:
Q  374 tgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccctc 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41360164 tgttctagcctcgatgtggacggttccccgggctcccctc 41360125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 325 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766782
Alignment:
Q  325 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   |||||  || ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctc--acttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtccccc 7766782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 310 - 355
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  310 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  314 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 355  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  248 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 306 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  306 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 245 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 512
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcccccg 512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 235 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 308 - 145
Alignment:
Q  235 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||    
T  308 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg 213  T
Q  335 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 403  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212 -tttaggtaagaatgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcccccg 145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 245 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1262 - 1096
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1262 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 1163  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtcccccgcgctcccc 411  Q
    |||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  1162 gagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggttccccaagctcccc 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 290 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  290 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 243 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3092
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3143 tgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 108; Significance: 5e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 243 - 402
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47519
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggacggtccccc 402  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtccccc 47519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 243 - 392
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  342 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 243 - 392
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5931
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  5777 tgcaagtgtgagttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattt 5876  T
Q  338 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtgg 392  Q
    || ||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| | | |||||||||    
T  5877 tgagtaagagtgtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 8e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 243 - 363
Target Start/End: Original strand, 5357 - 5477
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5357 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggat 5456  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttg 363  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5457 aagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 394
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 342  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  343 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggctgttctagcctcgatgtggac 394  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 243 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17614 - 17496
Alignment:
Q  243 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg--ttttgg 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  17614 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttttgg 17515  T
Q  341 gtaagagtgtggtgtctct 359  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17514 gtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 369
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39582
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaa-gttttgggtaa 39556  T
Q  345 gagtg-tggtgtctctcttgcttgtg 369  Q
     |||| ||| ||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtg 39582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Original strand, 39840 - 39963
Alignment:
Q  245 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| ||| ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| |||    
T  39840 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagatgagatataaacttattaccttaaaattttggttaa 39939  T
Q  345 gagtgtggtgtctctcttgcttgt 368  Q
     | |||||||||||||| ||||||    
T  39940 aaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 237 - 321
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  237 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 321  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 281 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  281 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University