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Alignment Overview

Query: NF2848_low_17 (Length: 446)

Name: NF2848_low_17
Description: NF2848
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2848_low_17
NF2848_low_17
[»] chr3 (46 HSPs)
chr3 (78-370)||(47750493-47750785)
chr3 (122-355)||(25322122-25322354)
chr3 (163-343)||(52684620-52684799)
chr3 (163-343)||(21006009-21006188)
chr3 (168-343)||(29916063-29916238)
chr3 (168-343)||(29965216-29965391)
chr3 (198-343)||(20509837-20509981)
chr3 (170-343)||(25701056-25701228)
chr3 (210-343)||(47642299-47642431)
chr3 (126-338)||(28548322-28548531)
chr3 (78-343)||(28968804-28969066)
chr3 (163-343)||(19878749-19878927)
chr3 (78-281)||(13748082-13748284)
chr3 (170-343)||(7899372-7899544)
chr3 (163-343)||(2566916-2567094)
chr3 (122-294)||(212836-213007)
chr3 (122-328)||(983478-983683)
chr3 (163-340)||(45056947-45057123)
chr3 (123-340)||(22289351-22289565)
chr3 (163-314)||(38888743-38888893)
chr3 (78-280)||(19349182-19349384)
chr3 (122-261)||(41741772-41741911)
chr3 (122-280)||(45347907-45348065)
chr3 (183-343)||(48333233-48333391)
chr3 (183-343)||(48334176-48334335)
chr3 (122-294)||(21157365-21157536)
chr3 (122-284)||(30787195-30787353)
chr3 (198-343)||(13352876-13353020)
chr3 (78-294)||(19421764-19421969)
chr3 (122-343)||(39664686-39664909)
chr3 (218-311)||(22311179-22311271)
chr3 (215-343)||(2122980-2123107)
chr3 (218-311)||(28882256-28882348)
chr3 (218-274)||(33241219-33241275)
chr3 (218-343)||(35390156-35390288)
chr3 (218-312)||(42464316-42464409)
chr3 (218-312)||(48123674-48123767)
chr3 (218-311)||(50286923-50287015)
chr3 (232-312)||(28705590-28705669)
chr3 (122-273)||(22610363-22610508)
chr3 (122-273)||(45532149-45532294)
chr3 (78-273)||(52121650-52121838)
chr3 (208-273)||(52504989-52505054)
chr3 (232-312)||(1678870-1678949)
chr3 (218-294)||(10224335-10224410)
chr3 (218-294)||(25936254-25936329)
[»] chr5 (39 HSPs)
chr5 (78-355)||(39796527-39796803)
chr5 (163-343)||(26691910-26692089)
chr5 (163-343)||(26961642-26961821)
chr5 (122-335)||(21251763-21251975)
chr5 (163-343)||(30777056-30777235)
chr5 (168-343)||(3934460-3934634)
chr5 (163-343)||(6242676-6242855)
chr5 (169-343)||(26716544-26716717)
chr5 (169-343)||(26986284-26986457)
chr5 (124-341)||(1921056-1921272)
chr5 (122-317)||(18001583-18001777)
chr5 (78-338)||(27938435-27938693)
chr5 (122-343)||(11907584-11907798)
chr5 (168-343)||(1795664-1795839)
chr5 (126-343)||(22738130-22738339)
chr5 (122-343)||(3701357-3701578)
chr5 (122-294)||(41233637-41233808)
chr5 (122-339)||(9654025-9654242)
chr5 (122-343)||(7629317-7629537)
chr5 (122-343)||(25749877-25750097)
chr5 (122-294)||(42365728-42365899)
chr5 (78-261)||(35745978-35746160)
chr5 (78-292)||(43357344-43357554)
chr5 (123-317)||(34032669-34032858)
chr5 (232-343)||(15066484-15066594)
chr5 (170-281)||(9728063-9728174)
chr5 (122-343)||(27085642-27085864)
chr5 (215-343)||(17137954-17138079)
chr5 (122-294)||(5612078-5612249)
chr5 (122-269)||(30284204-30284352)
chr5 (78-303)||(39689771-39689990)
chr5 (217-342)||(5722271-5722395)
chr5 (215-343)||(14836603-14836731)
chr5 (218-273)||(5985653-5985708)
chr5 (218-273)||(10657333-10657388)
chr5 (218-312)||(30918994-30919087)
chr5 (197-264)||(11694463-11694530)
chr5 (232-312)||(9793146-9793225)
chr5 (218-294)||(26794177-26794252)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (122-351)||(30683286-30683515)
chr4 (163-343)||(52721647-52721826)
chr4 (163-355)||(7952779-7952970)
chr4 (122-343)||(42630083-42630303)
chr4 (122-343)||(47607372-47607592)
chr4 (122-343)||(1177248-1177469)
chr4 (163-343)||(24784665-24784844)
chr4 (163-343)||(24823422-24823601)
chr4 (122-343)||(31945854-31946074)
chr4 (163-343)||(39957981-39958160)
chr4 (122-343)||(51675060-51675278)
chr4 (196-343)||(3108984-3109130)
chr4 (215-343)||(17892541-17892668)
chr4 (215-343)||(24793429-24793556)
chr4 (219-338)||(49470574-49470692)
chr4 (122-343)||(51859066-51859286)
chr4 (221-343)||(36943962-36944083)
chr4 (170-343)||(44521699-44521871)
chr4 (122-337)||(40694347-40694561)
chr4 (215-335)||(258789-258909)
chr4 (196-343)||(55900827-55900973)
chr4 (215-343)||(2586609-2586735)
chr4 (122-311)||(5835279-5835461)
chr4 (78-294)||(5325060-5325269)
chr4 (169-343)||(14614775-14614941)
chr4 (122-273)||(36511557-36511708)
chr4 (78-273)||(14795895-14796084)
chr4 (218-273)||(43509613-43509668)
chr4 (218-273)||(52573073-52573128)
chr4 (218-273)||(28377385-28377440)
chr4 (218-273)||(41146491-41146546)
chr4 (18-47)||(7952664-7952693)
chr4 (221-294)||(22492895-22492967)
chr4 (299-343)||(28377303-28377347)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (78-355)||(40536476-40536751)
chr2 (169-343)||(31235838-31236011)
chr2 (78-343)||(34146473-34146737)
chr2 (122-331)||(35996814-35997022)
chr2 (169-343)||(14824410-14824583)
chr2 (122-323)||(3564131-3564330)
chr2 (122-343)||(1005783-1006003)
chr2 (170-343)||(4562060-4562232)
chr2 (130-317)||(10573801-10573988)
chr2 (122-343)||(5588309-5588529)
chr2 (183-343)||(45158842-45159001)
chr2 (122-337)||(44156875-44157088)
chr2 (183-343)||(24585806-24585966)
chr2 (171-343)||(4355583-4355754)
chr2 (123-343)||(28746288-28746508)
chr2 (198-337)||(12206264-12206402)
chr2 (215-343)||(40431742-40431869)
chr2 (122-261)||(14216861-14217001)
chr2 (215-343)||(35342610-35342737)
chr2 (215-323)||(3545279-3545386)
chr2 (122-343)||(8482540-8482764)
chr2 (124-343)||(9293655-9293877)
chr2 (122-273)||(20537214-20537359)
chr2 (122-343)||(2319568-2319786)
chr2 (218-343)||(18301388-18301516)
chr2 (196-292)||(21104817-21104911)
chr2 (78-273)||(4169563-4169753)
chr2 (218-312)||(40308013-40308106)
chr2 (221-294)||(22485135-22485207)
chr2 (218-273)||(5371448-5371503)
chr2 (218-273)||(12819688-12819743)
chr2 (218-294)||(6125039-6125114)
chr2 (299-343)||(20537132-20537176)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (168-355)||(32797450-32797636)
chr1 (122-343)||(32380686-32380905)
chr1 (122-343)||(9528471-9528691)
chr1 (78-343)||(37922485-37922749)
chr1 (163-343)||(14167340-14167519)
chr1 (163-343)||(24851763-24851942)
chr1 (122-292)||(29862122-29862291)
chr1 (78-343)||(10822665-10822928)
chr1 (122-343)||(9781913-9782135)
chr1 (191-343)||(24589798-24589948)
chr1 (124-337)||(29168224-29168436)
chr1 (122-261)||(15417921-15418061)
chr1 (78-281)||(34096135-34096338)
chr1 (122-281)||(33040712-33040869)
chr1 (163-317)||(3707940-3708097)
chr1 (163-343)||(34432084-34432262)
chr1 (78-294)||(28658444-28658653)
chr1 (215-343)||(36551677-36551803)
chr1 (257-355)||(15417675-15417772)
chr1 (78-273)||(5985061-5985250)
chr1 (78-303)||(28948249-28948468)
chr1 (78-278)||(37346399-37346593)
chr1 (245-343)||(47654957-47655054)
chr1 (218-343)||(13012573-13012701)
chr1 (218-273)||(14334644-14334699)
chr1 (218-273)||(31652992-31653047)
chr1 (218-273)||(43190132-43190187)
chr1 (218-294)||(3427712-3427787)
chr1 (232-312)||(8133020-8133099)
chr1 (122-155)||(3703901-3703934)
chr1 (124-254)||(25257508-25257631)
chr1 (299-343)||(43190050-43190094)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (78-343)||(20182660-20182923)
chr8 (122-343)||(3892235-3892454)
chr8 (163-343)||(40412836-40413015)
chr8 (215-343)||(27968385-27968512)
chr8 (124-343)||(27108802-27109020)
chr8 (163-343)||(8170752-8170931)
chr8 (78-343)||(5817916-5818178)
chr8 (122-343)||(32873-33096)
chr8 (183-343)||(27886470-27886629)
chr8 (183-343)||(27945128-27945287)
chr8 (183-343)||(28025371-28025530)
chr8 (122-323)||(37372543-37372738)
chr8 (170-343)||(7411895-7412067)
chr8 (196-343)||(41098646-41098792)
chr8 (170-292)||(28737842-28737963)
chr8 (78-303)||(19436709-19436927)
chr8 (78-303)||(19572858-19573076)
chr8 (236-343)||(32425207-32425316)
chr8 (78-273)||(12579572-12579761)
chr8 (218-311)||(25022603-25022695)
chr8 (78-312)||(32638257-32638484)
chr8 (78-294)||(28875608-28875817)
chr8 (78-273)||(36484309-36484499)
chr8 (218-273)||(6028978-6029033)
chr8 (78-273)||(37669454-37669643)
chr8 (218-312)||(32877905-32877998)
chr8 (218-312)||(43770881-43770974)
chr8 (208-312)||(45216387-45216490)
chr8 (122-273)||(32760240-32760385)
chr8 (218-273)||(42949555-42949610)
chr8 (218-312)||(5540270-5540363)
chr8 (232-312)||(4246777-4246856)
chr8 (218-273)||(19947552-19947607)
chr8 (299-343)||(6028896-6028940)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (78-343)||(44270010-44270273)
chr7 (122-355)||(35136285-35136517)
chr7 (163-343)||(9249957-9250136)
chr7 (163-343)||(9283507-9283686)
chr7 (163-343)||(25969797-25969976)
chr7 (122-343)||(23078714-23078934)
chr7 (122-343)||(19820602-19820823)
chr7 (78-343)||(554475-554737)
chr7 (163-309)||(11058738-11058883)
chr7 (78-343)||(36413637-36413902)
chr7 (196-343)||(15878103-15878249)
chr7 (122-317)||(21180134-21180329)
chr7 (78-335)||(36763354-36763608)
chr7 (122-343)||(44958942-44959162)
chr7 (221-343)||(1399972-1400093)
chr7 (169-343)||(48153813-48153985)
chr7 (163-335)||(36757658-36757829)
chr7 (163-335)||(36767182-36767353)
chr7 (122-281)||(26973390-26973549)
chr7 (215-329)||(40053573-40053686)
chr7 (122-343)||(21409658-21409877)
chr7 (163-335)||(35160164-35160335)
chr7 (215-343)||(38064961-38065087)
chr7 (232-343)||(23969863-23969973)
chr7 (122-290)||(24956568-24956734)
chr7 (212-343)||(33454360-33454490)
chr7 (218-294)||(47719856-47719931)
chr7 (218-311)||(16563931-16564023)
chr7 (218-311)||(16601639-16601731)
chr7 (218-343)||(19510918-19511046)
chr7 (123-273)||(47237836-47237982)
chr7 (218-273)||(26773269-26773324)
chr7 (218-273)||(39521450-39521505)
chr7 (218-312)||(1042756-1042849)
chr7 (218-312)||(8029146-8029239)
chr7 (122-273)||(4292043-4292188)
chr7 (219-273)||(36661351-36661405)
chr7 (168-238)||(47719762-47719832)
chr7 (221-273)||(27397298-27397350)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (163-343)||(3212862-3213041)
chr6 (163-343)||(32018389-32018568)
chr6 (196-343)||(6707719-6707865)
chr6 (78-281)||(234647-234850)
chr6 (122-334)||(3299339-3299550)
chr6 (122-292)||(13060979-13061149)
chr6 (122-337)||(27084251-27084464)
chr6 (122-343)||(19128424-19128645)
chr6 (170-343)||(11105580-11105752)
chr6 (122-343)||(13044986-13045206)
chr6 (122-343)||(7255214-7255431)
chr6 (215-343)||(10894216-10894344)
chr6 (168-343)||(13607428-13607603)
chr6 (78-280)||(4153124-4153325)
chr6 (196-343)||(26327588-26327734)
chr6 (78-273)||(8357767-8357956)
chr6 (123-343)||(22988749-22988951)
chr6 (123-343)||(23799445-23799647)
chr6 (218-311)||(32130235-32130327)
chr6 (221-312)||(7187957-7188047)
chr6 (299-343)||(31740483-31740527)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (122-278)||(6010-6160)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (169-343)||(202435-202601)
scaffold0005 (78-273)||(43647-43836)
[»] scaffold0285 (2 HSPs)
scaffold0285 (218-343)||(13670-13794)
scaffold0285 (122-155)||(13878-13911)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (218-294)||(29820-29895)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (220-273)||(41276-41329)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 46)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 78 - 370
Target Start/End: Original strand, 47750493 - 47750785
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||        |||||||||||||||||||  |||||||||||||        ||||||||||||||    
T  47750493 aaaaatcaagatacgatacgaccgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaacataattataacaattttttttaatacgcaaatata 47750592  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 276  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47750593 ttaattaacacaagaaaccagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 47750692  T
Q  277 aatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgtacttttcatactttt 370  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47750693 aatattatccc-aaaagagcaccatcaatattatactatatccaaaaggaatattgttagtgttatagtaatataatgttcttttcatactttt 47750785  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 355
Target Start/End: Original strand, 25322122 - 25322354
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||       |||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||| ||||   || |||||| |||    
T  25322122 ttatataattaaatgtataatataattataacaatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccaatcacaggctcatagcatatctaca 25322221  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||    
T  25322222 taaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatatataata-tatcccaaaaagagcactatcaatgttatactatatccaa 25322320  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    || ||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  25322321 aaggaacattgttattgctataataatataatgt 25322354  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52684799 - 52684620
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||     
T  52684799 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtgattag 52684700  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52684699 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcggtgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgttata 52684620  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 21006009 - 21006188
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||   ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  21006009 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcacaggttcgtagcacatcaacatgaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 21006108  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21006109 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttata 21006188  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29916238 - 29916063
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatg-attaatcaa 266  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |    
T  29916238 gcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtcgatcaagagagtgatggattagtcga 29916139  T
Q  267 ttacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29916138 ttacataaacaatat-atcccaaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 29916063  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29965391 - 29965216
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatg-attaatcaa 266  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||| || |    
T  29965391 gcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtcgatcaagagagtgatggattagtcga 29965292  T
Q  267 ttacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29965291 ttacataaacaatat-atcccaaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 29965216  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 198 - 343
Target Start/End: Original strand, 20509837 - 20509981
Alignment:
Q  198 tcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagatta 297  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||  |    
T  20509837 tcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgatgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaggagca 20509935  T
Q  298 ccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20509936 ccatcaatgatatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 20509981  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25701228 - 25701056
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  |||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  25701228 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaggacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 25701129  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || | |||||| |||||||||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25701128 caaacacaata-tatcccaaaaagagcaccgtcagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 25701056  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 210 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47642431 - 47642299
Alignment:
Q  210 aacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgtta 309  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||  | |||||||||||    
T  47642431 aacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaata-tatcacaaaaagagcatcatcaatgtta 47642333  T
Q  310 tactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47642332 tactatatccaaaaagaacattgttagtgttata 47642299  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28548531 - 28548322
Alignment:
Q  126 ataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaa 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |        ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||    
T  28548531 ataattaaatgtacaatataattataaccatttttt--atatgcaaatatattaacaaacataagaaactagtcataggctcgtagcacatcaacataaa 28548434  T
Q  226 tataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaag 325  Q
    ||||| |||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || | ||||||||  | ||||| || ||| ||||||||||||||    
T  28548433 tataaataatattaccgattaagagagtgataattagtcaattacatatacacta-taactcaaaaagagcaacatcagtgatatgctatattcaaaaag 28548335  T
Q  326 aacattgttagtg 338  Q
    |||||||||||||    
T  28548334 aacattgttagtg 28548322  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28969066 - 28968804
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        |||||||  |||||||||| |||||||||| ||        |||| | ||||||||    
T  28969066 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatatatataaatgtacaatataattatacca--ttttttaatatgaaaatatat 28968969  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  ||||  | |||  ||||||||||  ||| || ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  28968968 taacaaacaacataaatcagtcataggctcgtagcacatcaatataaatataaataatattgacaattaatagagtgattattaaccaattacatacaca 28968869  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28968868 atat-atcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 28968804  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 19878749 - 19878927
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |   ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  19878749 aatatgcaaatatattaataaacaaaagaaaccagtcataagttcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 19878848  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||| || || |||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  19878849 tcaattacatacacaata-tat-ccaaaaagagcaccaccagtgctataatatatccaaaaggaatattgttagtgatata 19878927  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 13748082 - 13748284
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||        |||||||||||| |||||| |||||||||||| |       |||| ||||| ||||    
T  13748082 aaaaatcaagatacgatgcggctgggatacgttaataaaaaaatttatataattaa-tgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatat 13748180  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| || |||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  13748181 taacaaacaaaataaaccagttataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacatacaca 13748280  T
Q  278 atat 281  Q
    ||||    
T  13748281 atat 13748284  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 7899372 - 7899544
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  ||||  | |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  7899372 aaatatattaaaaaacaacataaaccagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaatta 7899471  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||    
T  7899472 catacacaata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgttatactacatccaaaagaaacattgctagtgctata 7899544  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 2566916 - 2567094
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| | ||   || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  2566916 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaa-tagtcacaagctcctagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 2567014  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||  || ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  2567015 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcggtgctatgctatatccaaaaagaacattgtatgtgttata 2567094  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 213007 - 212836
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       ||||  ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||  ||| || ||||||     
T  213007 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatacaaatatattaacaaacaaaagaaattagtcataggctcgtaccacatcaacg 212908  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||    
T  212907 taaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagtcaattacatacataata-tatctcaaaaaga 212836  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 983683 - 983478
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||| | |||  |||| |||||| ||||||||| |  |||  | ||||||     
T  983683 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttaataaatatgcaaatacactaacaaacaaaagaaattagtcatagtctcgtagtacatcaacg 983584  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||  ||||||| || |||||||| | |||    
T  983583 taaatataaataatattgacgaataagagagtgatgattaatcaattacatacacaata-tatcataaaaagagcaccatcagtgctatactatgtccaa 983485  T
Q  322 aaagaac 328  Q
    || ||||    
T  983484 aaggaac 983478  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 340
Target Start/End: Original strand, 45056947 - 45057123
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||     
T  45056947 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcttaggctcgtagcgcatcaacataaatataaataatatcaacaattaagagagtgatgattag 45057046  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgtt 340  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| || || |||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  45057047 tcaattacatacacaata-tatcctaaaaagagcaccagcagtgctatactatatacaaaagaaacattgttagtgtt 45057123  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 340
Target Start/End: Original strand, 22289351 - 22289565
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||  |||  | |||||| |    
T  22289351 tatataattaaatgtataatataattataaccatttttt-aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccattcataggctcgtagtacatcaacgt 22289449  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaa 322  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||| |  ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  22289450 aaatataaataatattgacgattaatagagtgatgattattcaattacataccgaata-tatcccaaaaa-aacaccataagtgttatactatatccaaa 22289547  T
Q  323 aagaacattgttagtgtt 340  Q
    |  |||||||||||||||    
T  22289548 agaaacattgttagtgtt 22289565  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 314
Target Start/End: Original strand, 38888743 - 38888893
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| ||||||| |||||  |||| ||||||  |||||| |||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  38888743 aatatgcaaatacattaacaaacaaaagaaatcagtcatgggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagacagtgatgattag 38888842  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||||    
T  38888843 tcaattacatacacaata-tatctcaaaaagagcatcatcaatgttatacta 38888893  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Original strand, 19349182 - 19349384
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |        |||| ||||| |||    
T  19349182 aaaaatcaagatacgatacggctgtgatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccattttttttaatatgcaaacata 19349281  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 276  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  19349282 ttaac-aacaaaagaaactagtcataggctcataacacatcaacataaatataaattatattgacgattaagagagcgacgattagtcaattacatacac 19349380  T
Q  277 aata 280  Q
    ||||    
T  19349381 aata 19349384  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Original strand, 41741772 - 41741911
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |       |||| || ||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  41741772 ttatataataaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcgaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaaca 41741871  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgatta 261  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41741872 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgatta 41741911  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 45348065 - 45347907
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||| ||  ||| || |||||||    
T  45348065 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaatcagtcataagctcgtagcacatcaaca 45347966  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaata 280  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  45347965 taaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacaaacacaata 45347907  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48333391 - 48333233
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||| | | | |||| |||||| |||||||     
T  48333391 aacacaagaaac-agtcataggctcgtagcacatcaacataaatatatataatattgacaattaagagagtgacggtcagtcaactacatacacaatat- 48333294  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||    
T  48333293 atcccgaaaagaacaccatcagtgttatactatatccaaaaggaatattgttagtgctata 48333233  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48334335 - 48334176
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| || | | | | ||||  ||||  |||||| |    
T  48334335 aacacaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatatatataatattgacgattaagagggtaacggtcagtcaacgacatgcacaata-t 48334237  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48334236 atcccgaaaagaacaccatccgtgttatactatatccaaaaagaacattgttagtgctata 48334176  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Original strand, 21157365 - 21157536
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   |       |||| |||||||||||||  |  | ||||||| ||||||| ||   || || |||||||    
T  21157365 ttatataattaaatgtacaatataattatattcatttttttaatatgcaaatatattaacaagtaaaagaaaccagtcatatgctcttagcacatcaaca 21157464  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21157465 taaatatgaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatccccaaaaga 21157536  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 284
Target Start/End: Original strand, 30787195 - 30787353
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| |||||||  ||   || |  ||| || |||||||    
T  30787195 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttt-aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccggt---agactcgtagcacatcaaca 30787290  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattat 284  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30787291 taaatataaataatattaacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaatattat 30787353  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 343
Target Start/End: Original strand, 13352876 - 13353020
Alignment:
Q  198 tcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagatta 297  Q
    ||||||||  ||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  |    
T  13352876 tcataggctcgtagcacatcaacatagatataaataatattgaggattaaaagtatgataattagtcaattacatacacaata-tatcctaaaaacaaca 13352974  T
Q  298 ccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  13352975 ccattaatgatatactatatccaaaaggaacattgttagtgctata 13353020  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19421969 - 19421764
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||||||||| |||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  19421969 aaaaatcaagatacgatgcggctaggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatatacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 19421870  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||          ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19421869 taacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaa----------attgatgcttaagagagtgatgattagtcaattacatacaca 19421780  T
Q  278 atattatcccaaaaaga 294  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19421779 ata-tatcccaaaaaga 19421764  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39664909 - 39664686
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||  || |||||||  ||| ||  ||||||    
T  39664909 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaatcaggcataggctcgtagcacgtcaaca 39664810  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcc----caaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||     ||||| | |||||| | || ||||||||||    
T  39664809 taaatataaataatattgatgattaagagagtgacgatttgtcaattatata-acaata-tatccaaaaaaaaaaaaataccataagtgctatactatat 39664712  T
Q  318 tcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     |||||  |||||||| |||||||||    
T  39664711 ccaaaagaaacattgtcagtgttata 39664686  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22311271 - 22311179
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  22311271 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaaga-tataccaaaaagagcaccatcagtgttata 22311179  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2123107 - 2122980
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||| ||    
T  2123107 atcaacataaatataaataatattgacgattaagtgggtgatgattagtcaattactttcacaata-tatcccaaaaagagcatcataagtgttatatta 2123009  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||  || ||||||||| |||||    
T  2123008 tatccaaaagaaagattgttagtcttata 2122980  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Original strand, 28882256 - 28882348
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  28882256 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 28882348  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33241275 - 33241219
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatat 274  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33241275 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatat 33241219  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35390288 - 35390156
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattacc--------atcaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||   || | ||| |||||||||  |||        ||||||||||    
T  35390288 aacataaatataaataatattgacgattaagagaatgatgattagtcaattacatacgtaa-aatataccaaaaagagcaccagtgtcatatcaatgtta 35390190  T
Q  310 tactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  35390189 tactatatccaaaaggaacattgttaatgttata 35390156  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 42464316 - 42464409
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  42464316 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgttatac 42464409  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48123767 - 48123674
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  48123767 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgctatac 48123674  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Original strand, 50286923 - 50287015
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  50286923 aacataaatataaataatattaacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 50287015  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28705669 - 28705590
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  28705669 taatattgacgattaagagagtggtcattagacaattacatatgcaata-tataccaaaaagagcaccatcaatgttatac 28705590  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 22610363 - 22610508
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| || |        ||| || || ||||    
T  22610363 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagactc------gtagcacattaaca 22610456  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  22610457 taaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacata 22610508  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 45532149 - 45532294
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| || |        ||| || || ||||    
T  45532149 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagactc------gtagcacattaaca 45532242  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  45532243 taaatataaataatattgacgattaagagggtggtcattagtcaattacata 45532294  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52121838 - 52121650
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||| ||||||||||    
T  52121838 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtataatataattataaca-tttttttaatatgcaaatatat 52121740  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  52121739 taacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaacataaatataaatattatttacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 52121650  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 52504989 - 52505054
Alignment:
Q  208 gtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  52504989 gtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 52505054  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Original strand, 1678870 - 1678949
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  1678870 taatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 1678949  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 10224335 - 10224410
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  10224335 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtgctcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 10224410  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 25936254 - 25936329
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  25936254 aacataaatataaacaatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 25936329  T

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Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 8e-62; HSPs: 39)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 355
Target Start/End: Original strand, 39796527 - 39796803
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||        |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||       |||| ||||||||||    
T  39796527 aaaaatcaagatacgatacggtcgggatacgttaataaaaaaaattatatgattaaatgtacaatataattataataatttttttaatatgcaaatatat 39796626  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| | ||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39796627 taacaaacacaagaaaccactcatatgtgcgtatcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatataca 39796726  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  39796727 ata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatctaaaaggaacattgttagttctatagtaatataatgt 39796803  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26692089 - 26691910
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26692089 aatatgcaaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaccacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 26691990  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26691989 tcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 26691910  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26961821 - 26961642
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  26961821 aatatgcaaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaccacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 26961722  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26961721 tcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 26961642  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21251975 - 21251763
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||||    
T  21251975 ttatataagtaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaataaacacaagaaaccagtcaaaggcttgtagcacatcaaca 21251876  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| || |||||||||| |||    
T  21251875 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcgcaaaaagaacaccatcagtgctatactatatccaa 21251777  T
Q  322 aaagaacattgtta 335  Q
    || |||||||||||    
T  21251776 aaggaacattgtta 21251763  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 30777056 - 30777235
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  30777056 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 30777155  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30777156 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 30777235  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Original strand, 3934460 - 3934634
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaat 267  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  3934460 gcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatgaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaat 3934559  T
Q  268 tacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3934560 tacatacacaata-tatctcaaaaagatcatcataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttata 3934634  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 6242676 - 6242855
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |   || || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  6242676 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcatagactcatagcacatcaacattaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 6242775  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| |  ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6242776 tcaattacatacacaata-tataccaaaaaaagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttata 6242855  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26716717 - 26716544
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26716717 caaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatt 26716618  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26716617 acatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataggtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgctata 26716544  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26986457 - 26986284
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  26986457 caaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatt 26986358  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26986357 acatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataggtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgctata 26986284  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1921272 - 1921056
Alignment:
Q  124 atataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacata 223  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||    
T  1921272 atataattaatggtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacata 1921173  T
Q  224 aatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaa 323  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  | |||| |||||||||||||  | ||||| || |||||||||| |||||    
T  1921172 aatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtatattacatgcaaaata-tatcccaaaaagagcatcatcagtgatatactatatccaaaa 1921074  T
Q  324 agaacattgttagtgtta 341  Q
     || ||||||||||||||    
T  1921073 ggatcattgttagtgtta 1921056  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 317
Target Start/End: Original strand, 18001583 - 18001777
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |       |||| | |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| |  |||||||    
T  18001583 ttatataattaaatgtacaatattattataaccattattttaatatgtaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggcttgtagcccatcaaca 18001682  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  18001683 taaatataaataatattgacaagtaagagagtgatgattaatcaattacatatccaata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatat 18001777  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27938693 - 27938435
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |       ||||  |||||||||    
T  27938693 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaa-ttataaaatttaatgtacaatataattataaccatttttttaatatacaaatatat 27938595  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| || |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  27938594 taacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcatatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgataattagtcaattacatacaca 27938495  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtg 338  Q
    ||| |||||||||||||  |||||   || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  27938494 ata-tatcccaaaaagagcaccatacgtgctatactatatccaaaaggaacactgttagtg 27938435  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11907798 - 11907584
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       ||||  ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||    
T  11907798 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatattcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcgtaggctcgtagcacatcaaca 11907699  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||      ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  11907698 taaata------atattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgttatactatatccaa 11907606  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || | |||||||| ||||||||    
T  11907605 aaggtacattgttggtgttata 11907584  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1795839 - 1795664
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaat 267  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1795839 gcaaacatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaat 1795740  T
Q  268 tacatatacaatattatccc-aaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  1795739 tacatatacaata-tatcccaaaaaaaagcaccataagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgctata 1795664  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22738339 - 22738130
Alignment:
Q  126 ataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaa 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  22738339 ataattaaatgtacaatataattataactatttttt-aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaactagtcataggctcgtaacacatcaacataaa 22738241  T
Q  226 tataagtaatattgaagattaagagagtgatga---ttaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaa 322  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||         ||||||||||||||| ||||    
T  22738240 tataaataatattaacgattaagagagtgatgatatttagtcagttacatacacaata-tatcccaaaaag---------aatgttatactatatccaaa 22738151  T
Q  323 aagaacattgttagtgttata 343  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  22738150 aggaacattgttagtgttata 22738130  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3701578 - 3701357
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn--aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaa 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |         |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||| ||||||  ||| |  |||||    
T  3701578 ttatataattaaatgtacaatataattataactatttttttttaatatgcaaatatattaacaaacataagaaatcagttataggctcgtagcgcatcaa 3701479  T
Q  220 cataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattc 319  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||  ||||||| || |||||||||| |    
T  3701478 cataaatataaaaaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatgcacaata-tat-ccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatcc 3701381  T
Q  320 aaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  3701380 aaaaggaacattgttagtgttata 3701357  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41233808 - 41233637
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| | |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  41233808 ttatataattaaatgtacaatataattataactatttttttaatatgtaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggcttgtagcacatcaaca 41233709  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  41233708 taaatataaataatattgacgattaagagcgtgatgattagtcaattacatatacgata-tataccaaaaaga 41233637  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9654242 - 9654025
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||        |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||    
T  9654242 ttatataattaaatgtacaatataattatagcaatttcttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggcttgtggcatatcaac 9654143  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||    
T  9654142 ataaatataagtaatattaacaattaagaaaatgatgattagtcaattgcatacacaata-tatcacaaaaagagcaccattgatgttataatatatcca 9654044  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgt 339  Q
     || ||| |||||||||||    
T  9654043 taaggaatattgttagtgt 9654025  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7629537 - 7629317
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||  |       |||| | ||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||  |||||| |||||||    
T  7629537 ttatataattaaatgtgcagtataactataatcatttttttaatatgaaaatatattaactaacaaaagaaatcattcataggctcgtaacacatcaaca 7629438  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  | ||| | || |||||||||| |||    
T  7629437 taaatataaataatattggcgattaagagagtgatgattagtcaatgacatacacaata-tatcccaaaaagagcatcattagtgctatactatatccaa 7629339  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||   |||||||||||| ||||    
T  7629338 aagatacattgttagtgctata 7629317  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25750097 - 25749877
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |       ||||  ||||||||||||  |||| || |||  ||||||||||  ||| || |||||||    
T  25750097 ttataaaatttaatgtacaatataattataaccatttttttaatatacaaatatattaacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtagcacatcaaca 25749998  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||| | || || ||||||| |||    
T  25749997 taaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatctcaaaaagagcaccataagtgctacactatatccaa 25749899  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  25749898 aatgaacattgttagtgctata 25749877  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Original strand, 42365728 - 42365899
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| | |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||    
T  42365728 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgaaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaaca 42365827  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  42365828 taaatataaataatattgacgattaacagagtgatgattagtcaattagatgcacaata-tatcccaaaaaga 42365899  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 261
Target Start/End: Original strand, 35745978 - 35746160
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  35745978 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaa-ttatataataaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 35746076  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgatta 261  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35746077 taacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacaattaagagagtgatgatta 35746160  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 292
Target Start/End: Original strand, 43357344 - 43357554
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| | ||| ||||    
T  43357344 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaa-ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgtaaacatat 43357442  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||| | |    
T  43357443 taacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgat--gtcaattacatacata 43357540  T
Q  278 atattatcccaaaaa 292  Q
    ||| |||||||||||    
T  43357541 ata-tatcccaaaaa 43357554  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 123 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34032858 - 34032669
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||          ||||  ||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || ||||| ||    
T  34032858 tatataattaaatgtacaatataattataatcttttttttaatatacaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaatat 34032759  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  34032758 aaatataa----tattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatat 34032669  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15066594 - 15066484
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacatt 331  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||| || |||||||||| | ||| |||||||    
T  15066594 taatattgacgattaagagagtaatgattagtcaattacatacacaatat-atcccaaaaagagcaccatcagtgctatactatatccgaaaggaacatt 15066496  T
Q  332 gttagtgttata 343  Q
    ||||||||||||    
T  15066495 gttagtgttata 15066484  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 281
Target Start/End: Original strand, 9728063 - 9728174
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  |||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9728063 aaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagaacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatta 9728162  T
Q  270 catatacaatat 281  Q
    | || |||||||    
T  9728163 cgtacacaatat 9728174  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27085864 - 27085642
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |       | || |||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||    
T  27085864 ttatataattaaatatacaatataattataaccatttttgta-tatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtaataggctcgtagcacatcaaca 27085766  T
Q  222 taaata----taagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||||||    ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||  | || ||||||||||    
T  27085765 taaataattataaataatattgatgattaagaaagtgataattagtcaattacatacacaata-tat-ccaaaaagagcaccacgagtgctatactatat 27085668  T
Q  318 tcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||    
T  27085667 tcaaaatgaacattgttagtgctata 27085642  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 17137954 - 17138079
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||| |||| ||    
T  17137954 atcaacataa-tataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatatatacacaata-tatccc-aaaagagcaccatcaatgctatatta 17138050  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17138051 tatgcaaaaggaacattgttagtgctata 17138079  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Original strand, 5612078 - 5612249
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||   |       |||| |||||||||||||  |  | ||||||| ||||||| ||   || || |||||||    
T  5612078 ttatataattaaatgtacaatataattatattcatttttttaatatgcaaatatattaacaagtaaaagaaaccagtcatatgctcttagcacatcaaca 5612177  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  5612178 taaatatgaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatccccaaaaga 5612249  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 269
Target Start/End: Original strand, 30284204 - 30284352
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |        |||| |||||||||||||  | || |||||||  |||||||||   || || ||||||    
T  30284204 ttatataattaaatgtacaatatagttataaccattttttttaatatgcaaatatattaacaagcaaaagaaaccggtcataggctcctagcacatcaac 30284303  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30284304 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 30284352  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 39689771 - 39689990
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnn-ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||| ||||    
T  39689771 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaagtata 39689870  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 276  Q
    ||||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  39689871 ttaacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacac 39689964  T
Q  277 aatattatcccaaaaagattaccatca 303  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||    
T  39689965 aata-tataccaaaaagagcaccatca 39689990  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 217 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5722395 - 5722271
Alignment:
Q  217 caacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactata 316  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || |||| ||||    
T  5722395 caacataaatataaattatactgacgattaagagaatgatgattagtcgattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgctatattata 5722297  T
Q  317 ttcaaaaagaacattgttagtgttat 342  Q
    | |||||  |||||||||||||||||    
T  5722296 tccaaaataaacattgttagtgttat 5722271  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14836731 - 14836603
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaa-aaagattaccatcaatgttatact 313  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |  ||||| | |||||||||    
T  14836731 atcaacataaatataaataatattgacggttaagagagtgacgattagtcaattacatacaaaata-tatctcaataaaaagcaccataagtgttatact 14836633  T
Q  314 atattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||||  ||| ||||||||| ||||    
T  14836632 atatccaaaagaaactttgttagtgatata 14836603  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 5985653 - 5985708
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5985653 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 5985708  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10657388 - 10657333
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10657388 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 10657333  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30919087 - 30918994
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  30919087 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgttatac 30918994  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11694530 - 11694463
Alignment:
Q  197 gtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatc 264  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11694530 gtcataggctcgtagcacatcaacataagtataaataatattcacgattaagagagtgatgattaatc 11694463  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9793225 - 9793146
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  9793225 taatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 9793146  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 26794177 - 26794252
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  26794177 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtgctcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 26794252  T

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Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 122 - 351
Target Start/End: Original strand, 30683286 - 30683515
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||  |||||||||||| || ||||| |  ||| |||||||||    
T  30683286 ttatataattaaatgtacaatataattataacaattttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagccatagactcgtagcatatcaac 30683385  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30683386 ataaatataaataatatcgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatatataata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgttatactatattca 30683484  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttatagtaatata 351  Q
    ||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  30683485 aaaggaacattgttagtgctataataatata 30683515  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 52721826 - 52721647
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  52721826 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 52721727  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52721726 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcaatgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 52721647  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 355
Target Start/End: Original strand, 7952779 - 7952970
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||  |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7952779 aatatgcaattatattaacaaacacaagaaaccagtcatacactcgtagcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaaaagagtgatgattaa 7952878  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  7952879 tcaattacatatataata-tatcccaaaaggagcgtcatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgccatagtaataaaatgt 7952970  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 42630083 - 42630303
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||| ||  |||||||| |  ||| || |||||||    
T  42630083 ttatataattaaatatacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaaggaaacagtcatagacacgtatcacatcaaca 42630182  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |  | ||||| ||||||||| ||| |||    
T  42630183 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatccaaaaaaaagcatcatcagtgttatactctatccaa 42630281  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  42630282 aaggaacattgttagtgttata 42630303  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47607592 - 47607372
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||       |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||    
T  47607592 ttatataattaaatgtataatataattataacaatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaaca 47607493  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||    
T  47607492 taaatataaataatattgacgattaagatagtgataattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaa 47607394  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  ||||||||| ||| ||||    
T  47607393 aagaaacattgttggtgctata 47607372  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1177469 - 1177248
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||  |||  | |||||||    
T  1177469 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagaacatcaaca 1177370  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat-taccatcaatgttatactatattca 320  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||| | || |||||||||| ||    
T  1177369 taaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacatacacaatat-atcccaaaaaaaagtaccataagtgctatactatatcca 1177271  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||  ||||||||||||| ||||    
T  1177270 aaagaaacattgttagtgctata 1177248  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24784844 - 24784665
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  24784844 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 24784745  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24784744 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgatagtgctata 24784665  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 24823422 - 24823601
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  24823422 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 24823521  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||  || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24823522 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgatagtgctata 24823601  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 31945854 - 31946074
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |       ||||  ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  31945854 ttataaaatttaatgtacaatataattataaccatttttttaatatacaaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaaca 31945953  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||  ||    
T  31945954 taaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatctaa 31946052  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  31946053 aaggaacattgttagtgctata 31946074  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39958160 - 39957981
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  39958160 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaatcaatcataggctcgtaacacatcgacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 39958061  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  39958060 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcggtgttatactatatctaaaaagaacattgttagtgctata 39957981  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51675278 - 51675060
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |       |||| |||| ||||||||  |||| || |||| ||||||| ||  ||| || |||||||    
T  51675278 ttatataattaaatgtataatataattataaccatttttttaatatgcaa-tatattaacaaacaaaataaacaagtcatatgctcgtagcacatcaaca 51675180  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | ||||||||||||||  |    
T  51675179 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaata-tat-ccaaaaagagaatcataagtgttatactatattaga 51675082  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || ||| |||||||||| ||||    
T  51675081 aaggaatattgttagtgatata 51675060  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 3108984 - 3109130
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  3108984 agtcataggctcgtagcaaatcaacataaatataaataatattgacgattaaaagagtgattattagccaattacatacacaata-tatcccaaaaagag 3109082  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3109083 caccatctgtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 3109130  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17892668 - 17892541
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||  |||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  17892668 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagacaattacatacacaata-taaaccaaaaagagcatcatcagtgttatacta 17892570  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17892569 tattcaaaaggaacattgttagtgttata 17892541  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 24793429 - 24793556
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  24793429 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattagatacacaata-tatcccaaaaagagcatcatcagtgttatacta 24793527  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24793528 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 24793556  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 219 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 49470692 - 49470574
Alignment:
Q  219 acataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatatt 318  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||   | |||||||| ||||||||||     
T  49470692 acataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatacacaatatt-ttccaaaaagtgcatcatcaatgctatactatatc 49470594  T
Q  319 caaaaagaacattgttagtg 338  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  49470593 caaaaggaacattgttagtg 49470574  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 51859286 - 51859066
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| | |||||  |  ||| || |||||||    
T  51859286 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaacaaatcataaactcgtaccacatcaaca 51859187  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||||||  | ||| | || |||||||||| |||    
T  51859186 taaatataaataatattgacgattaagtgggtgatgattagtcaattactttcacaata-tatcacaaaaagagcatcataagtgctatactatatccaa 51859088  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  51859087 aagaaacattgttagtgttata 51859066  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36944083 - 36943962
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||    
T  36944083 ataaatataaataatattgacgattaagagattgattattagccaattacatacacaatat-atcccaaaaagagcatcatcagtgttatactatatcca 36943985  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  36943984 aaaggaacattgttagtattata 36943962  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Original strand, 44521699 - 44521871
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  ||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  44521699 aaatatattaacaaacaaaagaaatcagttatacgctcgtaacacatctacataaatataaataacattgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 44521798  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||| | |||| |||||| |  ||||| | || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  44521799 catacacaa-aatatctcaaaaaaagcaccattagtgctatactatatccaaaaggaacattgttaatgttata 44521871  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 40694561 - 40694347
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||  ||| || |||||||    
T  40694561 ttatataattaaatttagaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaggaaatcagtcataggctcgtagcacatcaaca 40694462  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| |||||||||||||  | ||| | || |||| ||||| |||    
T  40694461 taaatataaataatatcgacaattaagagagtgatgattagtcaattacatacgtaata-tatcccaaaaagagcatcataagtgatatattatatccaa 40694363  T
Q  322 aaagaacattgttagt 337  Q
    ||  ||||||||||||    
T  40694362 aagaaacattgttagt 40694347  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 215 - 335
Target Start/End: Original strand, 258789 - 258909
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  258789 atcaacttaaatataaataatagtgacgattaagagagtgataattagtcaattacatacacaata-tatctcaaaaagagtaccataagtgttatacta 258887  T
Q  315 tattcaaaa-agaacattgtta 335  Q
    ||| |||||  |||||||||||    
T  258888 tatccaaaacggaacattgtta 258909  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 55900827 - 55900973
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| | ||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||     
T  55900827 agtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaattatactcacgattacgagaatgatgattagtcaattacatacacaata-tataccaaaaagag 55900925  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     | ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  55900926 catcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttata 55900973  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2586735 - 2586609
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||   ||  ||||||  | ||||| ||||||| ||    
T  2586735 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatat--acctcaaaagagcatcatcagtgttatatta 2586638  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  2586637 tatccaaaaggaacattgttaatgttata 2586609  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5835461 - 5835279
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||| |        |||||| || ||||    
T  5835461 ttatataattaaatgtataatataattataacattttttttaatatgcaaatatattaacaaacgcaagaaactagactc------gtaacacattaaca 5835368  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | |||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  5835367 taaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatatatcaaaaagagcaccatcaatgttata 5835279  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 5325060 - 5325269
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |       |||| |||| |||||    
T  5325060 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattgtaaccatttttttaatatgcaagtatat 5325159  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| ||      ||  |||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||    
T  5325160 taacaaacacaagaaaccag------gctcgtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtgatcattagtcaattacatacgca 5325253  T
Q  278 atattatcccaaaaaga 294  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  5325254 ata-tataccaaaaaga 5325269  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14614941 - 14614775
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||       ||||||| ||||||    
T  14614941 caaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaa-------atgattagtcaatt 14614849  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||| |||||  || |||||||||| ||||    
T  14614848 acatatacagta-tatcccaaaaagaacatcataaatgttatgttatatccaaaagaaatattgttagtgctata 14614775  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Original strand, 36511557 - 36511708
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |       |||| | ||| |||||||  |||| |||||||  |||||||||  ||| || ||||| |    
T  36511557 ttatataattaaatttacaatataatcataaccatttttttaatatggaaacatattaacaaacaaaagaaaccggtcataggctcgtagcacatcaata 36511656  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
     |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36511657 caaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacata 36511708  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14796084 - 14795895
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||| |||||    
T  14796084 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaagtatat 14795985  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  14795984 taacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 14795895  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 43509613 - 43509668
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  43509613 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 43509668  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 52573128 - 52573073
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  52573128 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 52573073  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 28377440 - 28377385
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28377440 aacataaatataaataatattggcaattaagagagtggtgattagtcaattacata 28377385  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41146546 - 41146491
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  41146546 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtcattagtcaattacata 41146491  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 47
Target Start/End: Original strand, 7952664 - 7952693
Alignment:
Q  18 atgaagtccggatacaagatacgatacggc 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7952664 atgaagtccggatacaagatacgatacggc 7952693  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Original strand, 22492895 - 22492967
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| |||||  |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22492895 ataaatataagtaatattgataataaagaaagtgacaattagtcaattacatatatgata-tatcccaaaaaga 22492967  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28377347 - 28377303
Alignment:
Q  299 catcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  28377347 catcaatgctatattatatccaaaaagaacattgttagtgctata 28377303  T

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Target: chr2 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40536751 - 40536476
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||        | ||||||||||||||| | ||||||||||||||       |||| ||||||||||    
T  40536751 aaaaatcaagatacgatacggccgggatacgttaataaaaaaa-taatataattaaatgtagaatataattataacaatttttttaatatgcaaatatat 40536653  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40536652 taacaaacacaagaaaccaatcataggctcgtaaaatatcaacataaatataagtaatattgacgattaaaagagtgatgattagtcaattacatataca 40536553  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |  |||| |||||||||||    
T  40536552 ata-tattccaaaaagagcaccatcaatgttatactatatccaaaaggaacattgtcactactataataatataatgt 40536476  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 31235838 - 31236011
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31235838 caaatatattaacaaacaaaagaaactagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaatt 31235937  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31235938 acatacacaata-tatcccaaaaagagcatcatcaatgatatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 31236011  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34146737 - 34146473
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        |||||||||||||||| || |||||||||||| |       |||| |||||| |||    
T  34146737 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaatttatataattaaatgtgcaatataattataactaattttttaatatgcaaatgtat 34146638  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||| |||  ||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  34146637 taacaaacaaaagaaacaagtattaggatcgtagcatatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacctacaca 34146538  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  34146537 ata-tatcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatccaaaaggaacactgttagtgctata 34146473  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 35997022 - 35996814
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||| |  ||| || |||||||    
T  35997022 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcatagactcgtagcacatcaaca 35996923  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| | ||||||||||||| |||    
T  35996922 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatgcacaata-tatcccaaaaggagcaccataagtgttatactatatccaa 35996824  T
Q  322 aaagaacatt 331  Q
    || |||||||    
T  35996823 aatgaacatt 35996814  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14824583 - 14824410
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  14824583 caaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatt 14824484  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14824483 acatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgctata 14824410  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 3564330 - 3564131
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||   |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  3564330 ttatataattaaatgtacagtataattataaccatttttttaatatttaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaaca 3564231  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||||||||| |||    
T  3564230 taaatataa-taatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattgcatacacaata-tatcccaaaaagagcatcataactgttatactatatccaa 3564133  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1006003 - 1005783
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| |       ||||  ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  1006003 ttataaaatttaatgtacaatataattataaccatttttttaatatacaaatatattaacaaacaaaataaaccagtcataggctcgtagcacatcaaca 1005904  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| | || |||||||||| |||    
T  1005903 taaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcctaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaa 1005805  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || ||| |||||||||||||||    
T  1005804 aaggaatattgttagtgttata 1005783  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4562232 - 4562060
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    ||||||| |||  |||| || |||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4562232 aaatatactaacaaacaaaataaaccagtcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaatta 4562133  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| | |  |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  4562132 catacacaata-tatcccaaaaagagtaccataagtactatactatatccaaaaggaacattgttagtgatata 4562060  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 130 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10573988 - 10573801
Alignment:
Q  130 ttaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatata 229  Q
    |||||||| || ||||||||||||||       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  10573988 ttaaatgtccaatataattataacaatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatata 10573889  T
Q  230 agtaa-tattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  10573888 aataaatattgacgattaagtgagtgatgattagtcaattacatatacaata-tatctcaaaaagagcaccaccaatgatatactatat 10573801  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5588529 - 5588309
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| | |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||  | |||||| |  |||||| |||||||    
T  5588529 ttatatagttaaatgtacaatataattatagccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcaatcatagactcgtaacacatcaaca 5588430  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||| | || |||||| ||| |||    
T  5588429 taaatataaataatattgatgattaagagaatgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccgaagagagcaccataagtgatatactgtatgcaa 5588331  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  ||||||||||||||||||    
T  5588330 aagaaacattgttagtgttata 5588309  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Original strand, 45158842 - 45159001
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||||||||||  |||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |    
T  45158842 aacacaagaaatcagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaata-t 45158940  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||  ||||||  || |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  45158941 ataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacatttttagtgctata 45159001  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 44157088 - 44156875
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  44157088 ttatataattaaatgtataatataattatgaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaaca 44156989  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||   ||||||||||  ||||  | ||||||||||||| ||     
T  44156988 taaatataaataatattgacgattaaaagagtgatgattagtcaattacatacacaacat--acccaaaaagagcaccacaagtgttatactatatccag 44156891  T
Q  322 aaagaacattgttagt 337  Q
    ||  ||||||||||||    
T  44156890 aagaaacattgttagt 44156875  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24585966 - 24585806
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |    
T  24585966 aacaaaagaaacaagtcatatgctcgtagcacataaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgaagattagtcaattacatacagaata-t 24585868  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaag-aacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||||||| |||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24585867 atcccaaaaagagtaccataagtgctatactatatccaaaaagaaacattgttagtgctata 24585806  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 4355754 - 4355583
Alignment:
Q  171 aatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattac 270  Q
    ||||||||||  |||| ||||||  |||||||||   ||| || |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4355754 aatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggttcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgactaagagagtgatgattagtcaattac 4355655  T
Q  271 atatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| | |||| |||||||||||||   |||| | || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  4355654 atacataata-tatcccaaaaagagccccataagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgttata 4355583  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Original strand, 28746288 - 28746508
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||| |||    
T  28746288 tatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtatcacatcagcat 28746387  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcc-caaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| |  ||||| | || |||||||||| |||    
T  28746388 aaatataaataatattgatgattaagagagtgacgattagtcaattacatacacaata-tatccaaaaaaaaagcaccataagtgctatactatatccaa 28746486  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  |||||||||| |||||||    
T  28746487 aagaaacattgttattgttata 28746508  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 198 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12206402 - 12206264
Alignment:
Q  198 tcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagatta 297  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||| ||||| |  |    
T  12206402 tcataggcttgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatacatacaaaata-tatccgaaaaaaagca 12206304  T
Q  298 ccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagt 337  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  12206303 ccatcaatgttatattatatccaaaaggaacattgttagt 12206264  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 40431742 - 40431869
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | ||||| |||||||  ||||||  ||||||||||    
T  40431742 atcaacataaatacaaataatattgatgattaacagagtgatgcttagtcaattacatacacaa-aatatcctaaaaagagcaccatcggtgttatacta 40431840  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40431841 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 40431869  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Original strand, 14216861 - 14217001
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |        |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| |||||||||    
T  14216861 ttatataataaaatgtacaatataattataaccattttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcatatcaac 14216960  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgatta 261  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14216961 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgatta 14217001  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 35342737 - 35342610
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||||  | ||||| ||||||| ||    
T  35342737 atcaaaataaatataaataatattgacgattaagagattgattattagccaattacatacacaatat-atcctaaaaagagcatcatcagtgttatatta 35342639  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35342638 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 35342610  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 215 - 323
Target Start/End: Original strand, 3545279 - 3545386
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||  | ||||| || |||||||    
T  3545279 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgataattaatcaattacatacacaata-tatcctaaaaggagcatcatcagtggtatacta 3545377  T
Q  315 tattcaaaa 323  Q
    ||| |||||    
T  3545378 tatccaaaa 3545386  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 8482540 - 8482764
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||  |||||| | |  ||| |||||||| |    
T  8482540 ttatataattatatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcatggacgtgtagcatatcaaga 8482639  T
Q  222 taaatata---ag-taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    || |||||   || ||||||||  ||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||| ||  ||||||  || ||||||||||    
T  8482640 tatatatatatagataatattgtcgattaagagagtgattattggtcaattacaaacacaatat-atcccaaaacgagcaccatcggtgctatactatat 8482738  T
Q  318 tcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     ||||| ||||||||||| |||||||    
T  8482739 ccaaaaggaacattgttaatgttata 8482764  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9293877 - 9293655
Alignment:
Q  124 atataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacata 223  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||       |||| | |||||||||||  |||| ||||||  | ||||||||  ||| || ||||   ||    
T  9293877 atataattaaatatacaatataattataacaatttttttaatatgtaaatatattaacaaacaaaagaaatcattcataggctcgtagcacatcagtgta 9293778  T
Q  224 aatataagtaatattgaagattaag----agagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattc 319  Q
    ||||||| |||||||||   | |||    ||||||||||||| ||||||| ||  | | || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  9293777 aatataaataatattgattgtcaagtgagagagtgatgattagtcaattaaatgcatatta-tatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatcc 9293679  T
Q  320 aaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  9293678 aaaaagaacattgttagtgctata 9293655  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20537359 - 20537214
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| || |        |||||| || ||||    
T  20537359 ttatataattaaatgtacaatataattatgaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagactc------gtaacacattaaca 20537266  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20537265 taaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 20537214  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2319786 - 2319568
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |        |||| |||||||||||||  || | ||||||| |||||  |||  ||| || ||| ||    
T  2319786 ttatataataaaatgtacaatataattataaccattttttttaatatgcaaatatattaacaaataaaagaaaccagtca--ggctcgtagcacatccac 2319689  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    || ||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||  || | ||||| ||||||||||||  || ||||  | |||||||||| ||    
T  2319688 attaatataaataatattgacgattaaaagaatgatgattagtcaattaattagaaaatat-atcccaaaaagagcac-atcatggatatactatatcca 2319591  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  2319590 aaaggaacattgttagtgttata 2319568  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18301516 - 18301388
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattac----catcaatgttatact 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||    ||||||||||||| |    
T  18301516 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatacatcaatgttatatt 18301418  T
Q  314 atattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18301417 atatccaaaaggaacattgctagtgctata 18301388  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 196 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21104911 - 21104817
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaa 292  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21104911 agtcataggctcgtaatacatcaacataaacataaataatattgacgattaagagagtgatta-taaccaattacatacacaata-tatcccaaaaa 21104817  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 4169563 - 4169753
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnn-ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||    
T  4169563 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatata 4169662  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||  |||||||||||    |||  |||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  4169663 ttaacaaacacaagaaa----tca--ggctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtagtcattagtcaattacata 4169753  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 40308013 - 40308106
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| || ||||||  | ||||||||||||||    
T  40308013 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatactcaata-tataccgaaaagagcatcatcaatgttatac 40308106  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22485207 - 22485135
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  22485207 ataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacacaata-tataccaaaaaga 22485135  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5371503 - 5371448
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5371503 aacataaatatacataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 5371448  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12819743 - 12819688
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  12819743 aacataaatataaataatattgacgattaatagagtggtgattagtcaattacata 12819688  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6125114 - 6125039
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  6125114 aacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 6125039  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20537176 - 20537132
Alignment:
Q  299 catcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20537176 catcaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgctata 20537132  T

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Target: chr1 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32797636 - 32797450
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaat 267  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32797636 gcaagtatattaacaaacacaagaaaccaatcataggctcgtagcatatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagagtgatgattagtcaat 32797537  T
Q  268 tacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32797536 tacatatataata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgatatactatatccaaaatgaacattattagtgttatagtaatataatgt 32797450  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 32380686 - 32380905
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||   |||||||||  ||| || |||||||    
T  32380686 ttatataattaaatgtacaatgtaattataactatttttt-aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcggtcataggctcgtagcacatcaaca 32380784  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  32380785 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcgattacatacataata-tatcccaaaaagagcaccattagtgttatactatattcaa 32380883  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  32380884 aaggaacattgttagtgttata 32380905  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 9528471 - 9528691
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||  | |||||||    
T  9528471 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaataaacaaaagaaactagtcatatgctcgtagtacatcaaca 9528570  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | || |||||||||| |||    
T  9528571 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaaggacatcataagtgctatactatatccaa 9528669  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  ||||| ||||||| ||||    
T  9528670 aagaaacatcgttagtgctata 9528691  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37922749 - 37922485
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        |||||||||||||| |||| |||||||||||| |       |||| |||| |||||    
T  37922749 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatttacaatataattataaccatttttttaatatgcaagtatat 37922650  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| | ||||||||   || || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||| |||    
T  37922649 taacaaacacaagaaaccattcataggctcatatcacatcaacataaatataaataatattggcgattaagagagttataatcaatcaattacatacaca 37922550  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  37922549 ata-tatcccaaaaagagcaccatcaatgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgctata 37922485  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14167519 - 14167340
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  14167519 aatatgcaaatatattaataaacaaaataaattagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattag 14167420  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| |  | |||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  14167419 tcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataagagctatactatatccaaaagatacattgttagtgttata 14167340  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24851942 - 24851763
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24851942 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcattggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattag 24851843  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||   || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24851842 tcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccatttgtgctatactatatccaaaacgaacattgttagtgctata 24851763  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29862291 - 29862122
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  29862291 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacatcaaca 29862192  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaa 292  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  29862191 taaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaa 29862122  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10822928 - 10822665
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |       |||| ||||||||||    
T  10822928 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaatgaaaaaa-ttatataattaaatgtacaatataatcataaccatttttttaatatgcaaatatat 10822830  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||   |||||||||  |||  | || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  10822829 taacaaacaaaagaaaaccgtcataggctcgtagtacatgaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacaca 10822730  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  ||| | | || |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  10822729 ata-tatcccaaaaagagcaccgtaagtgctatactatatccaaaagaaacattgttagtgatata 10822665  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9782135 - 9781913
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||| || |||||||    
T  9782135 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaaca 9782036  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagatt--accatcaatgttatactatattc 319  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||| |    ||||| | || |||||||||| |    
T  9782035 taaatataaataatattgatgattaagagagtgacgattagtcaattacgtacacaatat-atcccaaaaaaaaagcaccataagtgctatactatatcc 9781937  T
Q  320 aaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||    
T  9781936 aaaagaaacattgttagtgctata 9781913  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 191 - 343
Target Start/End: Original strand, 24589798 - 24589948
Alignment:
Q  191 aaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaa 290  Q
    |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||    
T  24589798 aaactagtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattac-tacacaata-tatcttaaa 24589895  T
Q  291 aagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589896 aagagcttcatcaattatatattatattcaaaaagaacattgttagtgttata 24589948  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29168436 - 29168224
Alignment:
Q  124 atataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacata 223  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |       |||| ||||||||||||   |||| ||||||| || |||||||  ||| || |||||||||    
T  29168436 atataattaaatgtagaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattagcaaacaaaagaaaccagccataggctcgtagcacatcaacata 29168337  T
Q  224 aatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaa 323  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  | ||| | || |||||||||| |||||    
T  29168336 aatataaataatatcgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatccaaaaaagagcatcataagtgatatactatatccaaaa 29168238  T
Q  324 agaacattgttagt 337  Q
      ||||||||||||    
T  29168237 gaaacattgttagt 29168224  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15418061 - 15417921
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||  ||| |||||||||    
T  15418061 ttatataattaaatgtacaatataattataacaaatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccggtcataggctcgtatcatatcaac 15417962  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgatta 261  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15417961 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgaagatta 15417921  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Original strand, 34096135 - 34096338
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||        ||||||||||||||||| | |||||||||||  |       |||| ||||| ||||    
T  34096135 aaaaatcaagatacgatacggctgagatatgttaataaaaaaaattatataattaaatgtataatataattataagcatttttttaatatgcaaacatat 34096234  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||| | ||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  34096235 taacaaacaaaagaaaccattcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgacgatcaatcaattacatacaca 34096334  T
Q  278 atat 281  Q
    ||||    
T  34096335 atat 34096338  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33040869 - 33040712
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||    
T  33040869 ttatataattaaatgtacaatataattataaccaattttt-aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaacgagtcataggtttgtagcatatcaaca 33040771  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatat 281  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||    
T  33040770 taaatataaataatattgacgattaagagagtgattattattcaa-tacatacacaatat 33040712  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 317
Target Start/End: Original strand, 3707940 - 3708097
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagt---cataggc-cggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatga 258  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || ||||||||   ||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3707940 aatatgcaaatatattaacaaacaaaataaactagtagtcataggctcgttagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatga 3708039  T
Q  259 ttaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  3708040 ttagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagaggaccaccagtgctatactatat 3708097  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 34432084 - 34432262
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||   || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  34432084 aatatgcaaatatattaacgaacaaaagaaacaa-tcataggctcttagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 34432182  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||| | |  |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  34432183 tcaattacatacacaata-tatctcaaaaagaacaccataagtactatactatatcccaaagaaacattgttagtgttata 34432262  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 28658444 - 28658653
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||| ||||||    
T  28658444 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcagatatat 28658543  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||||||      ||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||    
T  28658544 taacaaacacaagaaactag------gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatatgca 28658637  T
Q  278 atattatcccaaaaaga 294  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  28658638 ata-tataccaaaaaga 28658653  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36551803 - 36551677
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  |  |||| ||||||| ||    
T  36551803 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattgttagccaattacatacacaata-tatcccaaaaagagca-tatcagtgttatatta 36551706  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36551705 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 36551677  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15417772 - 15417675
Alignment:
Q  257 gattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  15417772 gattagtcaattacatatacaatat-atcccaaaaagaggaccatcaatgttatactatatcaaaaaggaacattgttagtgttacggcaatataatgt 15417675  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5985250 - 5985061
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||| ||||||||||    
T  5985250 aaaaatcaagatacgatcgggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataacaatttttttaatatgcaaatatat 5985151  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  ||||||||||||       ||||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||    
T  5985150 taacaaacacaagaaac------caggctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtaaattacata 5985061  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 28948249 - 28948468
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnn-ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||| ||||    
T  28948249 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaagtata 28948348  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 276  Q
    ||||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||    
T  28948349 ttaacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacac 28948442  T
Q  277 aatattatcccaaaaagattaccatca 303  Q
    |||| ||| |||||||||  |||||||    
T  28948443 aata-tataccaaaaagagcaccatca 28948468  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 78 - 278
Target Start/End: Original strand, 37346399 - 37346593
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||| | ||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  37346399 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtataatataattataaccttttttttaatatgcaaatatat 37346498  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  37346499 taacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacaca 37346592  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47655054 - 47654957
Alignment:
Q  245 taagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||  | ||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  47655054 taagagaatgatgattagtcaattacatacacaatat-ataccaaaaagagcatcatcagtgctatattatatccaaaatgaacattgttagtgttata 47654957  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Original strand, 13012573 - 13012701
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattac----catcaatgttatact 313  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||    |||||||||||||||    
T  13012573 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatacatcaatgttatact 13012671  T
Q  314 atattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||  |||| |||||||| ||||| ||||    
T  13012672 atatctaaaaggaacattgctagtgctata 13012701  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14334699 - 14334644
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14334699 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttgattagtcaattacata 14334644  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 31652992 - 31653047
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31652992 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 31653047  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43190187 - 43190132
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43190187 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaaatacata 43190132  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3427787 - 3427712
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  3427787 aacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 3427712  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8133099 - 8133020
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8133099 taatattgacgattaagagagtggtcattagccaattacatatgcaata-tataccaaaaagagcaccatcactgttatac 8133020  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 155
Target Start/End: Original strand, 3703901 - 3703934
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3703901 ttatataattaaatgtacaatataattataacaa 3703934  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25257631 - 25257508
Alignment:
Q  124 atataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacata 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || ||||||    
T  25257631 atataattaaatgtacaatataattataaccatttttt-aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaacata 25257539  T
Q  224 aatataagtaatattgaagattaagagagtg 254  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25257538 aatataaataatattgacgattaagagagtg 25257508  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43190094 - 43190050
Alignment:
Q  299 catcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  43190094 catcaatgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctata 43190050  T

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Target: chr8 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20182923 - 20182660
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||| || | |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  20182923 aaaaatcaagatacgatacggccgagatacgttaataaaaaaa-ttatataattaaatatataatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 20182825  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  20182824 taacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaattacataaaca 20182725  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20182724 ata-tatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 20182660  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3892454 - 3892235
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||    
T  3892454 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttt-aatatgcaaatatattaaataacaaaataaaccagtcataggctcgtaacacatcaaca 3892356  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||| |||    
T  3892355 taaatataaataatattgacgattaagagagcgatgattagtcaattacatacacaata-tatcctaaaaagagcaccataagtgttatactatatccaa 3892257  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  ||||||||||||| ||||    
T  3892256 aagaaacattgttagtgctata 3892235  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40413015 - 40412836
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  40413015 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 40412916  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||  || |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  40412915 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaagagaacattgttagtgctata 40412836  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27968512 - 27968385
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  27968512 atcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcacaaaaagagcaccatcagtgttatacta 27968414  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27968413 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 27968385  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 343
Target Start/End: Original strand, 27108802 - 27109020
Alignment:
Q  124 atataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacata 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||  |||||| |||||||||    
T  27108802 atataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaacctgatcataggctcgtaacacatcaacata 27108901  T
Q  224 aatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaa 323  Q
    | ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||  || || | || |||||||||| |||||    
T  27108902 actataaataatattgacaattaagagagtgatgattagtcaattacatacataata-tatcccaaaaagagcacaataagtgctatactatatccaaaa 27109000  T
Q  324 agaacattgttagtgttata 343  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  27109001 ggaaaattgttagtgttata 27109020  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 8170752 - 8170931
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  8170752 aatatgcaaatatattaccaaacacaagaaaccagtcatgggcttgtagcatatcaacgtaaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 8170851  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8170852 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgctatacaatatccaaaaagaacattggtagtgctata 8170931  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Original strand, 5817916 - 5818178
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  5817916 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaa-ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttt-aatatgcaaatatat 5818013  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| || |||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5818014 taacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtagcatatcaacataaatataaataatattgtccattaagaaagtgatgattagtcaactacatacaca 5818113  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatc-aatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5818114 ata-tatccc-aaaagagcaccatcaaatgctatactatattcaaaaggaacattgttagtgctata 5818178  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33096 - 32873
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  || | ||||||| ||||||| ||  ||| || |||||||    
T  33096 ttatataattaaatgtacaatataattataaccattttttgaatatgcaaacatattaacaaataaaagaaaccagtcatatgctcgtagcacatcaaca 32997  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatc---aatgttatactatatt 318  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |  | ||||   | |||||||||||||     
T  32996 taaatataaataatattgacgattaagagagtgacgattagtcaattacatatacaata-tatccaaaaaaaaaaaacatcataagtgttatactatatc 32898  T
Q  319 caaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||  ||||||||||||||||||    
T  32897 caaaagaaacattgttagtgttata 32873  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27886629 - 27886470
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||| |||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  27886629 aacaaaagaaaccggtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-t 27886531  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  27886530 atcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttata 27886470  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27945287 - 27945128
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||| |||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  27945287 aacaaaagaaaccggtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-t 27945189  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  27945188 atcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttata 27945128  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28025530 - 28025371
Alignment:
Q  183 aacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatatt 282  Q
    |||| |||||||  |||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  28025530 aacaaaagaaaccggtcataggctcgtatcacatcaacataaatataaataatattgacgatcaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-t 28025432  T
Q  283 atcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||||||   |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  28025431 atcacaaaaagagccccatcagtgttatactatatccaaaagaaacattgttagtgttata 28025371  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37372738 - 37372543
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |       ||||  ||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||      ||| |||||||    
T  37372738 ttatataattaaatgtacagtataattaaaaccatttttttaatatacaaatgtattaacaaacaaaagaaaccagtcataggg-----acacatcaaca 37372644  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| | || |||||||||| |||    
T  37372643 taaatataaataatattgacgattaagagaatgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaa 37372545  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7412067 - 7411895
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  ||||  | |||| | ||||||||  ||| || || ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  7412067 aaatatattaacaaacaacataaaccaatcataggctcgtagcacataaacataaatgtaaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattg 7411968  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  7411967 cataaacaata-tatcccaaaaatagcaccatcaatgctatattatatctaaaataaacattgttagtgttata 7411895  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 41098646 - 41098792
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||     
T  41098646 agtcataggctcgtagcacatcaacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatctcaaaaagag 41098744  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     || || | |||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  41098745 cacaattagtgttatactatatctaaaatgtacattgttaatgttata 41098792  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 28737963 - 28737842
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  || | ||||| ||||||||||||  |||  | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28737963 aaatatattaacaaataaaagaatctagtcataggctcgtagaacatcaacataaatataaataacattgacgattaaaagagtgatgattagtcaatta 28737864  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaa 292  Q
    |||| |||||| |||||||||||    
T  28737863 catacacaata-tatcccaaaaa 28737842  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19436927 - 19436709
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||| | ||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  19436927 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtataatataattataaccttttttttaatatgcaaatatat 19436828  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
T  19436827 taacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgca 19436734  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatca 303  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||    
T  19436733 a-aatataccaaaaagagtaccatca 19436709  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 19573076 - 19572858
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||| | ||||||||||||         |||| ||||||||||    
T  19573076 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtataatataattataaccttttttttaatatgcaaatatat 19572977  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||    
T  19572976 taacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgca 19572883  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatca 303  Q
    | | ||| ||||||||| ||||||||    
T  19572882 a-aatataccaaaaagagtaccatca 19572858  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 236 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32425316 - 32425207
Alignment:
Q  236 attgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaac---attg 332  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  32425316 attgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaatat-atccccaaaatagcatcatcaatgttatactatattcaaaaagaacattattg 32425218  T
Q  333 ttagtgttata 343  Q
    |||||||||||    
T  32425217 ttagtgttata 32425207  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 12579572 - 12579761
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  12579572 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 12579671  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  |||||||||||| || |        ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  12579672 taacaaacacaagaaaccagactc------gtagcatattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttcattagtcaattacata 12579761  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25022695 - 25022603
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  25022695 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatatgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 25022603  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 312
Target Start/End: Original strand, 32638257 - 32638484
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||  |       |||| | ||||||||    
T  32638257 aaaaatcaagatacgatacggttgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataatcattcttttaatatgaaaatatat 32638356  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| || | |      ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||    
T  32638357 taacaaacacaagaaaccagactt------gtagcatgttaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgca 32638450  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||| ||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  32638451 ata-tataccaaaaagagcaccatcagtgctatac 32638484  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 294
Target Start/End: Original strand, 28875608 - 28875817
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||  ||||    
T  28875608 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataactatttttttaatatgcaaggatat 28875707  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||    
T  28875708 taacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgca 28875801  T
Q  278 atattatcccaaaaaga 294  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  28875802 ata-tataccaaaaaga 28875817  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36484499 - 36484309
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnn-ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||    
T  36484499 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatata 36484400  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  36484399 ttaacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacata 36484309  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6029033 - 6028978
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6029033 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 6028978  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37669643 - 37669454
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  37669643 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 37669544  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  |||||||||||| ||      ||  |||  | || ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  37669543 taacaaacacaagaaaccag------gctcgtactacattaacataaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacata 37669454  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32877998 - 32877905
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  32877998 aacataaatataaataatattgacgattaatagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 32877905  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 43770881 - 43770974
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  43770881 aacataaatataaataatattgacgattaaaagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 43770974  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Original strand, 45216387 - 45216490
Alignment:
Q  208 gtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgt 307  Q
    |||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||     
T  45216387 gtaacacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcattgc 45216485  T
Q  308 tatac 312  Q
    |||||    
T  45216486 tatac 45216490  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32760385 - 32760240
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| || |        ||| || || ||||    
T  32760385 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagactc------gtagcacattaaca 32760292  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||    
T  32760291 taaatataaataatattgacgattgagagagtggtcattagtcaattacata 32760240  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42949610 - 42949555
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  42949610 aacataaatatacataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 42949555  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5540363 - 5540270
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |  |||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||||||    
T  5540363 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgttcattagtttattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgttatac 5540270  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4246856 - 4246777
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  4246856 taatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaagagcaccatcattgttatac 4246777  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 19947552 - 19947607
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  19947552 aacataaatataaataatattgacgattaacacagtggtgattagtcaattacata 19947607  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6028940 - 6028896
Alignment:
Q  299 catcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  6028940 catcaatgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctata 6028896  T

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Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44270273 - 44270010
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||| || | |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  44270273 aaaaatcaagatacgatacggccgagatacgttaataaaaaaa-ttatataattaaatatataatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 44270175  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44270174 taacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagagagtgatgattagtcaattacataaaca 44270075  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44270074 ata-tatcccaaaaagagcaccattaatgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 44270010  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 122 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 35136517 - 35136285
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||| |||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| |  ||| ||||||||||    
T  35136517 ttatataattaaatgtacaatataattataacaatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaataaaccagtcatagactcgtagcatatcaaca 35136418  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||| |||| |||| |||||||||    
T  35136417 taaatataagtaatattggcaattaagagaatgatgattagtcaattacatatacaata-tatctcaaaaagagcatcattaatgctataatatattcaa 35136319  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttatagtaatataatgt 355  Q
    || ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35136318 aatgaacattattagtgctatagtaatataatgt 35136285  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 9249957 - 9250136
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  9249957 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 9250056  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9250057 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 9250136  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Original strand, 9283507 - 9283686
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  9283507 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 9283606  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283607 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 9283686  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25969976 - 25969797
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  25969976 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 25969877  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25969876 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 25969797  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 23078714 - 23078934
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||   || || |||||||    
T  23078714 ttatctaattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccaatcataggctcatagcacatcaaca 23078813  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||| || ||||||||||  ||    
T  23078814 taaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattactcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcatcatcagtgctatactatatcaaa 23078912  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  23078913 aaggaacattgttagtgctata 23078934  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 19820602 - 19820823
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |        |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||   ||| || ||||||    
T  19820602 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttcttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggttcgtagcacatcaac 19820701  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||| ||    
T  19820702 ataaatataaataatattgacgattaaaatagtgatgattagtcaattacatgcacaata-tatctcaaaaagagcaccatcagtattatactatatcca 19820800  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  19820801 aaaggaacattgttagtgctata 19820823  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Original strand, 554475 - 554737
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        |||||||||||  |||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  554475 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataatta--tgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatat 554572  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  554573 taacaaacaaaagaaagcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataagtaatattaacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacaca 554672  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaaga-acattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||  | ||| | || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  554673 ata-tatcccaaaaagagcatcataagtgatatactata-tctaaaagatacattgttagtgttata 554737  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11058883 - 11058738
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  11058883 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaactagtcatagtctggtagcacatcaacataaatataagtaatattgacgattaagagaatgatgatttg 11058784  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgtta 309  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  11058783 tcaattacatatataata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgtta 11058738  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36413902 - 36413637
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatata 176  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |        |||| |||||||||    
T  36413902 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaataaaattatgtaattaaatgaacaatataattataaccattttttttaatatgcaaatata 36413803  T
Q  177 ttaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatac 276  Q
    ||||  |||| ||||||  |||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  36413802 ttaacaaacaaaagaaatcagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgatgattaagtgagtgatgcttaatcaattacatacac 36413703  T
Q  277 aatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| ||||| |||||||  | ||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36413702 aata-tatcctaaaaagagcatcatcggtgttatactatatccaaaaggaacattgttagtgttata 36413637  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 15878103 - 15878249
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  15878103 agtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgattattagccaattacatacacaata-tatcccaaaaagag 15878201  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     | ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15878202 catcatcagtgttatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 15878249  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 122 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21180329 - 21180134
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |        |||| | |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || ||||||    
T  21180329 ttatataattaaatgtacaatataattataaccattttttttaatatgtaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggcttgtagcacatcaac 21180230  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||    
T  21180229 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattagatatacaata-tatcccaaaaagaacatcatcagtgttatactatat 21180134  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 78 - 335
Target Start/End: Original strand, 36763354 - 36763608
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||        ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |       |||| ||||||||||    
T  36763354 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacattaataaaaaaaattatataattaaatgcacaatataat-ataaccatttttttaatatgcaaatatat 36763452  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  36763453 taacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattagtcaattacatacaca 36763552  T
Q  278 atattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgtta 335  Q
    ||| ||| ||||||| |  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36763553 ata-tat-ccaaaaaaagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgtta 36763608  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 44958942 - 44959162
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||   ||| ||||||  ||||||||||  ||| |||||| | |    
T  44958942 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacagacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcatatccata 44959041  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  || || | |||| |||||||| |||    
T  44959042 taaacataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatctcaaaaagagcactatgagtgttgtactatatccaa 44959140  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    || |||||||| ||||| ||||    
T  44959141 aaggaacattgctagtgctata 44959162  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 343
Target Start/End: Original strand, 1399972 - 1400093
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||    
T  1399972 ataaatataaataatattgacgattaagatagtgattattagtcaattacatacacaatat-atcccaaaaagagcatcatcaatgttatactatatcca 1400070  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  1400071 aaaggaacattgttagtgttata 1400093  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48153985 - 48153813
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  48153985 caaatatattaacaaacaaaaaaaac-agtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatggtgacgattaagagagtgatgattagtcaatt 48153887  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||  | ||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  48153886 acatacacaata-tatcccaaaaagagcatcataagtgctatactatatccaaaaggaacattgttagtgctata 48153813  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 335
Target Start/End: Original strand, 36757658 - 36757829
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  36757658 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattag 36757757  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgtta 335  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| || |  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36757758 tcaattacatacataata-tatcccaagaaaagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgtta 36757829  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 163 - 335
Target Start/End: Original strand, 36767182 - 36767353
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||||  ||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  36767182 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagttataggctcgtagcacatcaacataaatataaataacattgatgattaagagagtgatgattag 36767281  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgtta 335  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| || |  ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  36767282 tcaattacatacataata-tatcccaagaaaagcaccatcagtgctatactatatccaaaaggaacattgtta 36767353  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26973549 - 26973390
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||    
T  26973549 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaaca 26973450  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatat 281  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  26973449 taaatataaataatattgacgattaagagagtgacaattactcaattacatatccaatat 26973390  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 215 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40053686 - 40053573
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  40053686 atcaacataaatataaataatattgatgactaagagagtgatgattagtcaattacatatgcaata-tacctcaaaaagagcaccatcagtgttatacta 40053588  T
Q  315 tattcaaaaagaaca 329  Q
    ||| ||||| |||||    
T  40053587 tatccaaaaggaaca 40053573  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21409877 - 21409658
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||| | |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||   || || |||||||    
T  21409877 ttatataattaaatatacaatataattataaccatttttttcatatgaaaatatattaacaaacaaaagaaac-agtcataggctcatagcacatcaaca 21409779  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||| | || |||||||||| |||    
T  21409778 taaatgtaaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaata-tattccaaaaagagcaacataagtgctatactatatccaa 21409680  T
Q  322 aaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||  || |||||||||| ||||    
T  21409679 aagaaatattgttagtgctata 21409658  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35160335 - 35160164
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||| |||| |  ||| || |||||||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||     
T  35160335 aatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagttatagactcgtagcacatcaacataaatataaataacattaataattaagagagtgatgattag 35160236  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgtta 335  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |  ||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  35160235 tcaattacatacacaata-tatcccaaaaaaagcaccattagtgctatactatatccaaaaggaacattgtta 35160164  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38065087 - 38064961
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatacta 314  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||  ||||| | || |||||||    
T  38065087 atcaacataaatataaacaatattgatgattaagatagtcatgattagtcaattacatacgcaata-tatcccaaaaagagcaccat-agtgctatacta 38064990  T
Q  315 tattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38064989 tatccaaaaggaacattgttagtgttata 38064961  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 343
Target Start/End: Original strand, 23969863 - 23969973
Alignment:
Q  232 taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacatt 331  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| | || |||||||||| ||||| |||||||    
T  23969863 taatagtgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaat-ttatcccaaaaagagcaccataagtgctatactatatccaaaaggaacatt 23969961  T
Q  332 gttagtgttata 343  Q
    ||||||| ||||    
T  23969962 gttagtgctata 23969973  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 122 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24956734 - 24956568
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |       |||| ||||||||||||   |||| ||||||  ||||||| ||  |||||| |||||||    
T  24956734 ttatataattaaatgtacagtataattaaaactatttttt-aatatgcaaatatattagcaaacaaaagaaatcagtcatatgctcgtaacacatcaaca 24956636  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaa 290  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  24956635 taaatataaataatattgacaattaatagagtgatgattagtcaattacatacataata-tatcccaaa 24956568  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33454490 - 33454360
Alignment:
Q  212 catatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  || |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||    
T  33454490 catatcaacataaatataaattataccgacgattaagagaatgatgattagtcgattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgctata 33454392  T
Q  312 ctatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  33454391 ttatatccaaaatgaacattgttagtgttata 33454360  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 47719856 - 47719931
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| |||||||||    
T  47719856 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacataata-tataccaaaaaga 47719931  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Original strand, 16563931 - 16564023
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  16563931 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 16564023  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16601731 - 16601639
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  16601731 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 16601639  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19511046 - 19510918
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccat----caatgttatact 313  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || || | |||||||  |||||    ||||||||||||    
T  19511046 aacaaaaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatactcaaaat-atacaaaaaagagcaccatacatcaatgttatact 19510948  T
Q  314 atattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  19510947 atatccaaaaggaacattgctagtgttata 19510918  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 273
Target Start/End: Original strand, 47237836 - 47237982
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |       |||| | |||||||||||  |||| |||||||    || ||||  ||| || || |||||    
T  47237836 tatataactaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatggaaatatattaacaaacataagaaac----caaaggctcgtagcacattaacat 47237931  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  47237932 aaatataaataatattgacgattaagaaagtgatgattagtcaattacata 47237982  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 26773269 - 26773324
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26773269 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 26773324  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 39521505 - 39521450
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  39521505 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattaatcaattacata 39521450  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Original strand, 1042756 - 1042849
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  1042756 aacataaatataaataatattgacaattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 1042849  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8029239 - 8029146
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8029239 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcacttacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttatac 8029146  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4292188 - 4292043
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |        ||| || || ||||    
T  4292188 ttatataattaaatgtataatataattataacattttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaactagactc------gtagcacattaaca 4292095  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  4292094 taaatataaatactattaacgattaagagagtggtgattagtcaattacata 4292043  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36661405 - 36661351
Alignment:
Q  219 acataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  36661405 acataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 36661351  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Original strand, 47719762 - 47719832
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatatt 238  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47719762 gcaaatatatcaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatatt 47719832  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Original strand, 27397298 - 27397350
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  27397298 ataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 27397350  T

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Target: chr6 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3213041 - 3212862
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  3213041 aatatgcaaatatattaacaaacaaaataaatcagtcataggctcgtaacacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 3212942  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3212941 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcatcatcagtgatatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 3212862  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 163 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32018568 - 32018389
Alignment:
Q  163 aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaa 262  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||     
T  32018568 aatatgcaaatatattaacaaacacaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattag 32018469  T
Q  263 tcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32018468 tcaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcggtgctatactatatccaaaaagaacattgttagtgttata 32018389  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Original strand, 6707719 - 6707865
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||     
T  6707719 agtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattaatcaattacatacacaata-catcccaaaaggag 6707817  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6707818 caccatcaatgctatactatatccaaaatgaacattgttagtgttata 6707865  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 78 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 234850 - 234647
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||  |||| ||||    
T  234850 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacagtataattataaccatttttttaatatacaaacatat 234751  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| |||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  234750 taacaaacaaaagaaactagtcatagactcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaactacatacaca 234651  T
Q  278 atat 281  Q
    ||||    
T  234650 atat 234647  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3299550 - 3299339
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       || | |||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||  ||| || |||||||    
T  3299550 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaacatgcaaatatattaacaaacacaataaaccaatcataggctcgtaccacatcaaca 3299451  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| || |||| ||||| |||    
T  3299450 tgaatataaataacattaacgattaagagagtaatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgctataatatatccaa 3299352  T
Q  322 aaagaacattgtt 334  Q
    || ||||||||||    
T  3299351 aaggaacattgtt 3299339  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 292
Target Start/End: Original strand, 13060979 - 13061149
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |        |||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||    
T  13060979 ttatataattaaatgtacaatatgattataaccagttttttcaatatgcaaatatattaataaacaaaagaaacaagtgataggcttgtagcacatcaac 13061078  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaa 292  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13061079 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaa 13061149  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 122 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 27084464 - 27084251
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| |       |||| |||| ||||||||  |||| ||||||| || |||||||  ||| || |||||||    
T  27084464 ttatataattaaatgtataatataattataaccatttttttaatatgcaa-tatattaacaaacaaaagaaaccagccataggctcgtagcacatcaaca 27084366  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||| | ||||||||||||| | |    
T  27084365 taaatataaataatattgacaattaagagagtgatggttagtcaattacatacacaata-tatcccaaaaagagcatcataagtgttatactatatccga 27084267  T
Q  322 aaagaacattgttagt 337  Q
    || |||||||||||||    
T  27084266 aaggaacattgttagt 27084251  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19128645 - 19128424
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||| |||||||  |||| ||||||   |||||||||  |||||| |||||||    
T  19128645 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaacatattaacaaacaaaagaaatcggtcataggctcgtaacacatcaaca 19128546  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagatt-accatcaatgttatactatattca 320  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |   ||||| | ||||||||||||| ||    
T  19128545 taaatataaataatgttgacgattaagagagtgacgattagtcaattacatacacaatat-atccaaaaaaaaagcaccataagtgttatactatatcca 19128447  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||  ||||||||||||| ||||    
T  19128446 aaagaaacattgttagtgctata 19128424  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11105752 - 11105580
Alignment:
Q  170 aaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatta 269  Q
    |||||||||||  ||||  |||||| |||| |||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||    
T  11105752 aaatatattaacaaacaacagaaaccagtcgtaggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggttattagccaatta 11105653  T
Q  270 catatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| | |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  11105652 catacataata-tatcccaaaaagagcaccatcagtgttattttatatccaaaatgaacattgttagtgttata 11105580  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Original strand, 13044986 - 13045206
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnn-aatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaac 220  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| |        |||| |||||||||||||  |||| ||||||| | ||||||||  ||| || ||||||    
T  13044986 ttatatcattaaatgtacaatataattataaccatttttttcaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaacaaatcataggctcgtagcacatcaac 13045085  T
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattca 320  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||| |  ||||||| ||  ||||||||| ||    
T  13045086 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagccaattacatacacaata-tatcctaaaaa-agcaccatcagtgcaatactatatcca 13045183  T
Q  321 aaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||| ||| || ||||||||||||    
T  13045184 aaaggaagatcgttagtgttata 13045206  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 7255431 - 7255214
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||| ||||||  |||||||| |  ||| || |||||||    
T  7255431 ttatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcatagactcgtagcacatcaaca 7255332  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaa 321  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||| ||||||| |||||  || |||| || |||||||||| |||    
T  7255331 ttaatataaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattac----acaata-tatcccacaaagagcacaatcagtgctatactatatccaa 7255237  T
Q  322 aaagaaca-ttgttagtgttata 343  Q
    || ||||| |||||| |||||||    
T  7255236 aaggaacatttgttaatgttata 7255214  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 343
Target Start/End: Original strand, 10894216 - 10894344
Alignment:
Q  215 atcaacataaatataag-taatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatact 313  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||||||| || ||||||    
T  10894216 atcagcataaatataaaataatattgacgattaagagagtgatgattagtcaattacatacacaata-tatcacaaaaagaacaccatcagtgctatact 10894314  T
Q  314 atattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10894315 atatccaaaaggaacattgttagtgctata 10894344  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 343
Target Start/End: Original strand, 13607428 - 13607603
Alignment:
Q  168 gcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataa----atataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaat 263  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13607428 gcaaatatattaacaaacaaaagaaaccagtcataggctcgtaacacttcaacataagtatatataaacaatattgatgattaagagagtgatgattagt 13607527  T
Q  264 caattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||    
T  13607528 caattacatacacaata-tatcccaaaaag---aacatcattgttatattatattcaaaagaaaaattgtaagtgttata 13607603  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 78 - 280
Target Start/End: Original strand, 4153124 - 4153325
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    |||||| |||| |||||||||| | |||||||||||        |||||||||| |||||||| ||||||||||||||       | || ||||||||||    
T  4153124 aaaaattaagatacgatgcggctgtgatacgttaataaaaaaaattatataattgaatgtacaatataattataacaattttttca-tatgcaaatatat 4153222  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatataca 277  Q
    |||  |||| ||||||  ||||||||||   || || |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||| || |||    
T  4153223 taacaaacaaaagaaatcagtcataggctcatagcacatcaacataaatataaataatattaacgattaagagagtgatgatcactcaattacttacaca 4153322  T
Q  278 ata 280  Q
    |||    
T  4153323 ata 4153325  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 196 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26327734 - 26327588
Alignment:
Q  196 agtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagat 295  Q
    ||||||||||  ||| || |||||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||     
T  26327734 agtcataggctcgtagcacatcaacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcagttacatagacaata-tatctcaaaaagag 26327636  T
Q  296 taccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
     || || | |||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||    
T  26327635 cacaattagtgttatactatatctaaaatgtacattgttagtgttata 26327588  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8357956 - 8357767
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| ||||||||||    
T  8357956 aaaaatcaagatacgatacggctgagatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaataggcaaatatat 8357857  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  |||||||||||| || |        ||| || || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  8357856 taacaaacacaagaaaccagactc------gtagcacattaacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 8357767  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Original strand, 22988749 - 22988951
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||      |||||          
T  22988749 tatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggct-----catat------ 22988837  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaa 322  Q
       ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  22988838 ---tataagtaatattgacgattaagcgagtgatgattagtcaaa---atacacaatat-atcccaaaaggaacaccatcagtgttatactgtatccaaa 22988930  T
Q  323 aagaacattgttagtgttata 343  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  22988931 aggaacattgttagtgctata 22988951  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23799647 - 23799445
Alignment:
Q  123 tatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||      |||||          
T  23799647 tatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaaccagtcataggct-----catat------ 23799559  T
Q  223 aaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaa 322  Q
       ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    ||| ||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  23799558 ---tataagtaatattgacgattaagcgagtgatgattagtcaaa---atacacaatat-atcccaaaaggaacaccatcagtgttatactgtatccaaa 23799466  T
Q  323 aagaacattgttagtgttata 343  Q
    | |||||||||||||| ||||    
T  23799465 aggaacattgttagtgctata 23799445  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Original strand, 32130235 - 32130327
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttata 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| | ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  32130235 aacataaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacgcaa-aatataccaaaaagagcaccatcagtgttata 32130327  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Original strand, 7187957 - 7188047
Alignment:
Q  221 ataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatac 312  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  7187957 ataaatataaataatattgacgattaagagagtgatcattagttaattacatacacaata-tataccaaaaagagcaccatcagtgctatac 7188047  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 343
Target Start/End: Original strand, 31740483 - 31740527
Alignment:
Q  299 catcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31740483 catcaatgttatattatatccaaaaggaacattgttagtgctata 31740527  T

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Target: scaffold0250 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6010
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaaca 221  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||        |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |        ||| ||||| ||||    
T  6160 ttatataattaaatgtataatataattataacattttttttaatatgcaaatatattaacaaacacaagaaactagactc------gtatcatattaaca 6067  T
Q  222 taaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaa 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  6066 taaatataaataatattgacgattaagagagtggtgattagtcaattacatacacaa 6010  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 202435 - 202601
Alignment:
Q  169 caaatatattaattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaatt 268  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||       ||||||| ||||||    
T  202435 caaatatattaacaaacaaaagaaatcagtcataggctcgtagcacatcaacataaatataaataatattgacgattaa-------atgattagtcaatt 202527  T
Q  269 acatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatattcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||  ||||| |||||  || |||||||||| ||||    
T  202528 acatatacagta-tatcccaaaaagaacatcataaatgttatgttatatccaaaagaaatattgttagtgctata 202601  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 273
Target Start/End: Original strand, 43647 - 43836
Alignment:
Q  78 aaaaatcaagacacgatgcggccgagatacgttaatnnnnnnnnttatataattaaatgtacagtataattataacaannnnnnnaatacgcaaatatat 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        ||||||||||||||||||| |||||||||||| |       |||| |||| |||||    
T  43647 aaaaatcaagatacgatacggctgggatacgttaataaaaaaaattatataattaaatgtacaatataattataaccatttttttaatatgcaagtatat 43746  T
Q  178 taattaacacaagaaactagtcataggccggtaacatatcaacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    |||  |||||||||||| ||      ||  ||| || || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  43747 taacaaacacaagaaaccag------gctcgtagcacattaatataaatataaataatattgacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 43836  T

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Target: scaffold0285 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13794 - 13670
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaagattaccatcaatgttatactatat 317  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||  ||||||||  || || | |||||||||||||    
T  13794 aacattaatataaataattatgacgattaagagagtgatgattagtcaatgacatacacaata-tatatcaaaaagagcacaattagtgttatactatat 13696  T
Q  318 tcaaaaagaacattgttagtgttata 343  Q
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T  13695 ctaaaatgtacattgttactgttata 13670  T

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Target: scaffold0285; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13911 - 13878
Alignment:
Q  122 ttatataattaaatgtacagtataattataacaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13911 ttatataattaaatgtacaatataattataacaa 13878  T

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Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 294
Target Start/End: Original strand, 29820 - 29895
Alignment:
Q  218 aacataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacatatacaatattatcccaaaaaga 294  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  29820 aacataaatataaataatattaacgattaagagagtggtcattagtcaattacatacgcaata-tataccaaaaaga 29895  T

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Target: scaffold0112 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 273
Target Start/End: Original strand, 41276 - 41329
Alignment:
Q  220 cataaatataagtaatattgaagattaagagagtgatgattaatcaattacata 273  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  41276 cataaatataaataatattaacgattaagagagtggtcattagtcaattacata 41329  T

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