View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2853_1D_low_31 (Length: 225)

Name: NF2853_1D_low_31
Description: NF2853_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2853_1D_low_31
NF2853_1D_low_31
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (17-215)||(31107-31305)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (17-215)||(19404590-19404788)
chr7 (17-209)||(39171423-39171615)
chr7 (17-215)||(37837291-37837489)
chr7 (18-215)||(42978670-42978867)
chr7 (18-209)||(8001380-8001571)
chr7 (17-209)||(12141140-12141333)
chr7 (24-209)||(48316652-48316837)
chr7 (19-202)||(47590384-47590567)
chr7 (17-209)||(34899440-34899632)
chr7 (17-208)||(45349632-45349823)
chr7 (17-209)||(40993223-40993415)
chr7 (17-202)||(48061495-48061680)
chr7 (45-209)||(19296936-19297100)
chr7 (62-210)||(46700100-46700248)
chr7 (59-209)||(9450012-9450162)
chr7 (54-208)||(38798848-38799002)
chr7 (59-215)||(13796804-13796960)
chr7 (67-215)||(25287069-25287217)
chr7 (17-207)||(28044589-28044779)
chr7 (17-208)||(39328627-39328814)
chr7 (24-209)||(30756659-30756844)
chr7 (54-201)||(35133021-35133168)
chr7 (29-192)||(35664980-35665143)
chr7 (62-201)||(28476301-28476439)
chr7 (17-215)||(9977043-9977237)
chr7 (54-201)||(22743018-22743165)
chr7 (59-202)||(25255300-25255443)
chr7 (39-192)||(13592344-13592498)
chr7 (59-202)||(5348467-5348610)
chr7 (104-215)||(5792856-5792967)
chr7 (29-202)||(26623634-26623807)
chr7 (54-187)||(48930795-48930928)
chr7 (17-127)||(28407751-28407861)
chr7 (95-208)||(24770313-24770426)
chr7 (94-202)||(38880487-38880596)
chr7 (101-202)||(39229087-39229188)
chr7 (45-192)||(35261385-35261533)
chr7 (39-192)||(22927705-22927860)
chr7 (39-192)||(23085608-23085763)
chr7 (84-191)||(24069294-24069401)
chr7 (112-201)||(24350767-24350856)
chr7 (61-202)||(41553312-41553452)
chr7 (94-202)||(4999939-5000047)
chr7 (39-192)||(45198868-45199023)
chr7 (39-191)||(2843076-2843230)
chr7 (62-156)||(29617578-29617671)
chr7 (39-192)||(26492452-26492607)
chr7 (39-192)||(32684755-32684910)
chr7 (39-191)||(34773799-34773953)
chr7 (39-191)||(46822103-46822257)
chr7 (117-209)||(28062156-28062248)
chr7 (39-192)||(433526-433681)
chr7 (39-192)||(21266477-21266632)
chr7 (39-192)||(35496010-35496165)
chr7 (112-190)||(26610707-26610785)
chr7 (59-132)||(46822618-46822690)
chr7 (104-188)||(3267137-3267221)
chr7 (75-202)||(11343883-11344009)
chr7 (61-192)||(6558964-6559097)
chr7 (39-192)||(43369609-43369762)
chr7 (32-189)||(48207990-48208150)
chr7 (115-198)||(4530153-4530236)
chr7 (39-192)||(7640610-7640765)
chr7 (39-192)||(17222835-17222990)
chr7 (39-192)||(42066897-42067052)
chr7 (44-192)||(42311367-42311515)
chr7 (112-202)||(5078342-5078432)
chr7 (94-155)||(25068182-25068244)
chr7 (98-187)||(46244166-46244255)
chr7 (141-202)||(1769135-1769196)
chr7 (84-137)||(49148015-49148068)
chr7 (39-91)||(37849029-37849081)
chr7 (95-201)||(27341625-27341730)
chr7 (115-192)||(3224342-3224418)
chr7 (61-192)||(35667089-35667222)
chr7 (101-137)||(3398328-3398364)
chr7 (39-91)||(42408527-42408579)
[»] chr8 (90 HSPs)
chr8 (17-209)||(23230709-23230901)
chr8 (17-202)||(7883072-7883257)
chr8 (17-215)||(16928588-16928786)
chr8 (17-209)||(31013439-31013631)
chr8 (17-215)||(27110296-27110494)
chr8 (17-209)||(37971349-37971545)
chr8 (54-201)||(18890567-18890714)
chr8 (54-209)||(10377755-10377910)
chr8 (39-202)||(15344381-15344544)
chr8 (39-202)||(15433446-15433609)
chr8 (39-202)||(15524750-15524913)
chr8 (17-200)||(30568152-30568335)
chr8 (17-208)||(45445642-45445833)
chr8 (61-215)||(16247098-16247252)
chr8 (17-215)||(14544726-14544932)
chr8 (17-215)||(17693444-17693643)
chr8 (54-201)||(42046295-42046442)
chr8 (24-209)||(7677121-7677306)
chr8 (17-202)||(40618904-40619089)
chr8 (79-207)||(20553134-20553262)
chr8 (54-201)||(41896591-41896738)
chr8 (62-201)||(43833872-43834011)
chr8 (17-215)||(24186492-24186690)
chr8 (62-215)||(3673501-3673654)
chr8 (79-207)||(20559637-20559765)
chr8 (79-207)||(20571199-20571327)
chr8 (54-201)||(14585751-14585898)
chr8 (17-209)||(9637240-9637432)
chr8 (17-200)||(28086643-28086827)
chr8 (39-202)||(1236550-1236713)
chr8 (39-194)||(7198048-7198203)
chr8 (17-209)||(40211131-40211325)
chr8 (59-196)||(8867884-8868024)
chr8 (17-202)||(33214502-33214687)
chr8 (29-202)||(33347364-33347537)
chr8 (17-208)||(25190896-25191089)
chr8 (60-206)||(471038-471186)
chr8 (59-215)||(28897769-28897925)
chr8 (39-202)||(5046826-5046989)
chr8 (94-194)||(39657535-39657635)
chr8 (54-202)||(29617142-29617290)
chr8 (72-202)||(1239283-1239413)
chr8 (39-191)||(14906758-14906912)
chr8 (54-192)||(14916056-14916193)
chr8 (60-210)||(36948312-36948461)
chr8 (17-197)||(27498197-27498376)
chr8 (94-202)||(29939373-29939481)
chr8 (39-166)||(41060116-41060243)
chr8 (79-192)||(8826294-8826407)
chr8 (95-192)||(26469055-26469152)
chr8 (29-192)||(21237873-21238034)
chr8 (39-192)||(29777313-29777468)
chr8 (38-192)||(33342530-33342684)
chr8 (84-202)||(5333502-5333620)
chr8 (39-191)||(23851329-23851483)
chr8 (102-202)||(8443427-8443527)
chr8 (29-196)||(24099099-24099260)
chr8 (101-153)||(41684504-41684556)
chr8 (39-192)||(32724316-32724471)
chr8 (59-198)||(34609913-34610052)
chr8 (39-191)||(4809059-4809213)
chr8 (39-191)||(11464266-11464420)
chr8 (39-191)||(43889959-43890113)
chr8 (39-193)||(34611897-34612053)
chr8 (39-193)||(37565714-37565870)
chr8 (60-145)||(34493132-34493217)
chr8 (39-188)||(9619192-9619343)
chr8 (39-192)||(11725774-11725929)
chr8 (61-180)||(31146969-31147088)
chr8 (39-202)||(3240453-3240616)
chr8 (39-192)||(33896176-33896335)
chr8 (79-155)||(35283256-35283332)
chr8 (78-192)||(27746989-27747103)
chr8 (59-191)||(2655965-2656099)
chr8 (39-128)||(11267167-11267257)
chr8 (100-170)||(18846380-18846450)
chr8 (60-202)||(39646062-39646202)
chr8 (46-182)||(44578134-44578272)
chr8 (19-91)||(8412355-8412427)
chr8 (39-180)||(39152977-39153120)
chr8 (95-150)||(35812797-35812852)
chr8 (84-190)||(14913173-14913279)
chr8 (103-192)||(17949329-17949418)
chr8 (43-192)||(33298949-33299099)
chr8 (111-201)||(34102341-34102430)
chr8 (39-128)||(44099771-44099861)
chr8 (59-128)||(12184436-12184505)
chr8 (59-128)||(12428864-12428933)
chr8 (117-202)||(31634213-31634298)
chr8 (39-91)||(9498434-9498486)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (17-209)||(23128683-23128875)
chr6 (17-209)||(12170533-12170725)
chr6 (17-209)||(606269-606461)
chr6 (17-209)||(3913407-3913599)
chr6 (17-209)||(33053001-33053193)
chr6 (17-208)||(29255279-29255470)
chr6 (19-215)||(30608350-30608546)
chr6 (61-215)||(127728-127880)
chr6 (19-209)||(67836-68026)
chr6 (39-194)||(546111-546266)
chr6 (17-209)||(32327053-32327242)
chr6 (54-201)||(14801900-14802047)
chr6 (39-201)||(30776736-30776898)
chr6 (17-215)||(30894659-30894855)
chr6 (18-209)||(7515037-7515227)
chr6 (22-200)||(34018634-34018812)
chr6 (59-198)||(20225927-20226066)
chr6 (59-198)||(22119911-22120050)
chr6 (19-209)||(29319712-29319903)
chr6 (29-192)||(30493614-30493777)
chr6 (59-191)||(9380106-9380238)
chr6 (75-191)||(1523491-1523607)
chr6 (62-201)||(8102799-8102938)
chr6 (17-127)||(9341484-9341594)
chr6 (102-207)||(4010430-4010535)
chr6 (45-202)||(7976048-7976205)
chr6 (17-160)||(14174904-14175047)
chr6 (17-160)||(14179440-14179583)
chr6 (100-210)||(3355181-3355291)
chr6 (59-192)||(31296902-31297035)
chr6 (39-191)||(4088548-4088702)
chr6 (95-193)||(34185604-34185702)
chr6 (61-202)||(28981249-28981390)
chr6 (39-202)||(1933547-1933710)
chr6 (39-192)||(17237121-17237276)
chr6 (17-120)||(21426519-21426622)
chr6 (59-150)||(32802670-32802761)
chr6 (94-192)||(29743079-29743177)
chr6 (29-192)||(35001677-35001842)
chr6 (84-200)||(528250-528366)
chr6 (84-188)||(31852093-31852197)
chr6 (39-192)||(10228766-10228921)
chr6 (17-120)||(32060030-32060133)
chr6 (39-191)||(7880937-7881091)
chr6 (29-202)||(679181-679353)
chr6 (39-192)||(8196242-8196397)
chr6 (39-189)||(23947152-23947305)
chr6 (39-191)||(8497055-8497210)
chr6 (62-202)||(26588350-26588490)
chr6 (39-192)||(12653031-12653186)
chr6 (39-192)||(16419245-16419400)
chr6 (101-192)||(27097559-27097650)
chr6 (39-192)||(33110698-33110853)
chr6 (39-192)||(33740413-33740568)
chr6 (100-202)||(32191646-32191748)
chr6 (84-143)||(13546601-13546660)
chr6 (100-155)||(14846137-14846192)
chr6 (39-191)||(7875879-7876033)
chr6 (39-191)||(25064324-25064478)
chr6 (39-150)||(12059608-12059720)
chr6 (39-192)||(4984402-4984557)
chr6 (141-192)||(33543561-33543612)
chr6 (117-206)||(31575442-31575529)
chr6 (94-215)||(6957209-6957330)
chr6 (39-186)||(17334846-17334995)
chr6 (110-192)||(8266717-8266799)
chr6 (146-192)||(28635065-28635111)
chr6 (117-192)||(12165926-12166002)
chr6 (60-128)||(30879594-30879662)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (17-209)||(34945456-34945648)
chr5 (17-209)||(13007292-13007484)
chr5 (17-209)||(38597860-38598052)
chr5 (17-209)||(24229617-24229809)
chr5 (17-215)||(13421990-13422188)
chr5 (17-209)||(9113558-9113750)
chr5 (17-215)||(26877942-26878139)
chr5 (17-208)||(11976768-11976959)
chr5 (17-209)||(6011971-6012163)
chr5 (54-209)||(6216961-6217117)
chr5 (19-209)||(25980221-25980410)
chr5 (61-215)||(41630559-41630713)
chr5 (17-202)||(14082229-14082414)
chr5 (54-201)||(28540776-28540923)
chr5 (17-208)||(14726294-14726485)
chr5 (17-215)||(10722818-10723016)
chr5 (19-209)||(26825493-26825683)
chr5 (17-208)||(38007422-38007612)
chr5 (39-201)||(2979161-2979323)
chr5 (39-201)||(19103322-19103484)
chr5 (59-208)||(31391628-31391777)
chr5 (65-215)||(7930234-7930384)
chr5 (17-197)||(15571561-15571741)
chr5 (54-201)||(14211298-14211445)
chr5 (19-208)||(35850863-35851050)
chr5 (60-201)||(39567341-39567482)
chr5 (22-208)||(8096336-8096521)
chr5 (100-215)||(7036276-7036391)
chr5 (39-202)||(8088067-8088230)
chr5 (94-215)||(1409555-1409676)
chr5 (39-202)||(19120982-19121145)
chr5 (84-202)||(35920896-35921014)
chr5 (29-192)||(19259637-19259802)
chr5 (39-186)||(43148822-43148971)
chr5 (39-189)||(7247051-7247203)
chr5 (39-192)||(7150170-7150325)
chr5 (29-166)||(10332392-10332530)
chr5 (45-171)||(11867750-11867876)
chr5 (29-192)||(20257521-20257685)
chr5 (39-192)||(16981379-16981536)
chr5 (39-192)||(27266694-27266849)
chr5 (39-198)||(37985968-37986127)
chr5 (39-192)||(41184275-41184430)
chr5 (39-189)||(7241875-7242028)
chr5 (29-192)||(11768091-11768253)
chr5 (45-192)||(19280787-19280935)
chr5 (39-192)||(21060118-21060273)
chr5 (139-209)||(11073855-11073925)
chr5 (94-192)||(11192459-11192557)
chr5 (39-188)||(3271237-3271388)
chr5 (39-192)||(4954081-4954236)
chr5 (103-191)||(26578342-26578432)
chr5 (94-202)||(38711764-38711872)
chr5 (38-192)||(28235674-28235832)
chr5 (103-192)||(30298296-30298387)
chr5 (44-114)||(8984845-8984915)
chr5 (61-134)||(9762330-9762403)
chr5 (96-192)||(13468688-13468784)
chr5 (49-128)||(15571061-15571141)
chr5 (39-177)||(30298948-30299088)
chr5 (103-192)||(10649733-10649824)
chr5 (39-192)||(35475173-35475328)
chr5 (98-192)||(19100533-19100627)
chr5 (117-192)||(42579977-42580053)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (17-209)||(32766598-32766790)
chr4 (17-209)||(56040479-56040671)
chr4 (18-209)||(2520863-2521054)
chr4 (17-209)||(19853345-19853537)
chr4 (17-209)||(24098902-24099092)
chr4 (39-209)||(22611267-22611437)
chr4 (17-199)||(43510290-43510472)
chr4 (17-209)||(21686075-21686267)
chr4 (25-209)||(53811112-53811295)
chr4 (45-208)||(10496420-10496583)
chr4 (17-209)||(13634199-13634391)
chr4 (17-209)||(21662521-21662713)
chr4 (17-209)||(21671285-21671477)
chr4 (17-209)||(26633504-26633696)
chr4 (60-208)||(53444203-53444351)
chr4 (19-209)||(17949158-17949349)
chr4 (19-209)||(17953010-17953201)
chr4 (59-196)||(33921151-33921288)
chr4 (17-202)||(35348398-35348583)
chr4 (39-207)||(47320267-47320435)
chr4 (59-196)||(45418609-45418748)
chr4 (17-215)||(10258734-10258927)
chr4 (17-215)||(43095706-43095904)
chr4 (59-215)||(9178431-9178587)
chr4 (19-215)||(54021938-54022133)
chr4 (54-209)||(56156512-56156667)
chr4 (84-180)||(29120279-29120375)
chr4 (19-215)||(26090745-26090945)
chr4 (59-201)||(31891162-31891304)
chr4 (94-209)||(4142662-4142777)
chr4 (37-196)||(9048761-9048920)
chr4 (54-209)||(29960819-29960974)
chr4 (54-201)||(36194801-36194947)
chr4 (17-180)||(48257465-48257628)
chr4 (39-201)||(27652036-27652197)
chr4 (94-192)||(36700377-36700475)
chr4 (27-208)||(8670570-8670751)
chr4 (59-201)||(9714004-9714144)
chr4 (59-202)||(51888086-51888229)
chr4 (61-202)||(36161802-36161943)
chr4 (94-202)||(52060833-52060941)
chr4 (78-202)||(52944402-52944526)
chr4 (29-187)||(43853549-43853707)
chr4 (54-199)||(44596756-44596899)
chr4 (39-192)||(9528712-9528867)
chr4 (101-202)||(22038719-22038820)
chr4 (61-202)||(37030352-37030493)
chr4 (45-191)||(6155081-6155233)
chr4 (39-143)||(11299865-11299969)
chr4 (62-194)||(18935881-18936013)
chr4 (62-138)||(37465637-37465713)
chr4 (94-202)||(48351096-48351204)
chr4 (62-192)||(36184632-36184762)
chr4 (39-191)||(51318085-51318239)
chr4 (29-202)||(28857493-28857665)
chr4 (100-201)||(33332485-33332586)
chr4 (54-198)||(12199564-12199707)
chr4 (50-192)||(37188441-37188585)
chr4 (101-192)||(2069497-2069588)
chr4 (39-192)||(6972909-6973064)
chr4 (39-192)||(44947511-44947666)
chr4 (39-191)||(53616485-53616639)
chr4 (45-191)||(2115429-2115577)
chr4 (108-196)||(36204303-36204391)
chr4 (65-153)||(52978884-52978972)
chr4 (60-202)||(22806633-22806769)
chr4 (39-192)||(25273982-25274137)
chr4 (39-192)||(34024273-34024428)
chr4 (39-192)||(38706545-38706700)
chr4 (59-192)||(52097771-52097906)
chr4 (59-180)||(18138769-18138891)
chr4 (79-145)||(22305516-22305582)
chr4 (59-192)||(35964831-35964965)
chr4 (59-180)||(49125982-49126104)
chr4 (29-192)||(4643957-4644122)
chr4 (45-192)||(10389595-10389744)
chr4 (29-138)||(52933794-52933903)
chr4 (54-194)||(1621381-1621514)
chr4 (62-202)||(42032407-42032546)
chr4 (45-128)||(21554651-21554734)
chr4 (44-202)||(22300940-22301099)
chr4 (39-192)||(49410322-49410477)
chr4 (39-172)||(56199215-56199350)
chr4 (39-191)||(9284011-9284165)
chr4 (59-192)||(10359403-10359537)
chr4 (62-201)||(47158317-47158456)
chr4 (115-188)||(51535352-51535424)
chr4 (94-187)||(55228084-55228177)
chr4 (100-192)||(23100778-23100870)
chr4 (17-76)||(4142597-4142656)
chr4 (60-134)||(12493452-12493526)
chr4 (54-132)||(37684018-37684096)
chr4 (60-192)||(43153870-43154004)
chr4 (60-137)||(7008865-7008942)
chr4 (95-191)||(49680638-49680735)
chr4 (60-191)||(50766368-50766501)
chr4 (39-191)||(9145746-9145898)
chr4 (39-91)||(9645359-9645411)
chr4 (79-191)||(26123362-26123474)
chr4 (141-192)||(2624596-2624646)
chr4 (103-192)||(14183901-14183991)
chr4 (95-192)||(32952642-32952740)
chr4 (157-202)||(11894991-11895036)
chr4 (39-91)||(29966528-29966580)
[»] chr3 (104 HSPs)
chr3 (17-197)||(21533642-21533822)
chr3 (20-209)||(6954532-6954721)
chr3 (17-202)||(52922950-52923135)
chr3 (19-207)||(21313101-21313289)
chr3 (17-208)||(48650567-48650758)
chr3 (17-209)||(45568278-45568470)
chr3 (17-209)||(46304354-46304545)
chr3 (17-209)||(9998530-9998722)
chr3 (17-201)||(32701562-32701746)
chr3 (19-202)||(20464805-20464988)
chr3 (17-209)||(21431676-21431870)
chr3 (17-199)||(54149064-54149246)
chr3 (19-209)||(10229539-10229729)
chr3 (17-215)||(33579937-33580135)
chr3 (17-209)||(9797367-9797559)
chr3 (17-209)||(10108299-10108491)
chr3 (54-201)||(51303513-51303660)
chr3 (39-201)||(16235497-16235659)
chr3 (17-209)||(36461270-36461456)
chr3 (17-202)||(43488424-43488608)
chr3 (17-209)||(40556765-40556957)
chr3 (20-215)||(38545856-38546051)
chr3 (17-171)||(4711583-4711737)
chr3 (44-202)||(19339246-19339403)
chr3 (17-209)||(10233133-10233325)
chr3 (40-196)||(42460825-42460981)
chr3 (59-195)||(51923804-51923940)
chr3 (17-215)||(12149616-12149815)
chr3 (54-201)||(21289684-21289831)
chr3 (63-202)||(23799789-23799928)
chr3 (17-215)||(37040826-37041023)
chr3 (19-197)||(40487400-40487578)
chr3 (21-209)||(7448751-7448939)
chr3 (21-209)||(7456893-7457081)
chr3 (54-201)||(8914783-8914930)
chr3 (39-202)||(12050503-12050666)
chr3 (17-208)||(47041881-47042072)
chr3 (39-202)||(53807713-53807876)
chr3 (54-209)||(38859982-38860139)
chr3 (60-209)||(47896215-47896363)
chr3 (30-202)||(14859560-14859732)
chr3 (102-202)||(45424868-45424968)
chr3 (62-201)||(7546686-7546825)
chr3 (61-201)||(27706103-27706243)
chr3 (39-202)||(628778-628941)
chr3 (17-155)||(44959806-44959944)
chr3 (17-202)||(19619784-19619968)
chr3 (29-202)||(50194180-50194353)
chr3 (102-207)||(45425657-45425762)
chr3 (62-202)||(53099860-53099998)
chr3 (29-202)||(35175474-35175647)
chr3 (17-166)||(46220769-46220918)
chr3 (17-141)||(43017019-43017143)
chr3 (60-207)||(41818280-41818427)
chr3 (39-192)||(46178653-46178807)
chr3 (113-202)||(43016925-43017014)
chr3 (17-198)||(20608736-20608913)
chr3 (59-215)||(26275694-26275850)
chr3 (39-192)||(3848754-3848909)
chr3 (23-202)||(18011090-18011269)
chr3 (39-138)||(27856299-27856398)
chr3 (54-201)||(29922128-29922275)
chr3 (54-201)||(29971281-29971428)
chr3 (100-202)||(48199847-48199949)
chr3 (45-192)||(53508306-53508449)
chr3 (39-192)||(17237889-17238044)
chr3 (60-159)||(20987631-20987730)
chr3 (39-192)||(25631361-25631516)
chr3 (39-192)||(29503545-29503700)
chr3 (59-202)||(44805100-44805241)
chr3 (95-188)||(36734584-36734678)
chr3 (39-192)||(25162520-25162675)
chr3 (39-192)||(49552059-49552214)
chr3 (45-202)||(4821877-4822033)
chr3 (114-215)||(20987729-20987830)
chr3 (94-194)||(26716017-26716117)
chr3 (147-215)||(35864895-35864963)
chr3 (60-187)||(3085177-3085304)
chr3 (62-201)||(52115899-52116038)
chr3 (52-133)||(42455688-42455769)
chr3 (65-185)||(9173835-9173955)
chr3 (29-192)||(46934726-46934888)
chr3 (62-192)||(26739235-26739365)
chr3 (39-191)||(36906207-36906361)
chr3 (39-191)||(44907234-44907388)
chr3 (45-192)||(30648560-30648709)
chr3 (131-196)||(31271756-31271821)
chr3 (39-132)||(38142665-38142758)
chr3 (29-192)||(22803106-22803279)
chr3 (29-173)||(24175976-24176118)
chr3 (112-199)||(3656027-3656114)
chr3 (39-180)||(21916569-21916712)
chr3 (109-192)||(30293411-30293494)
chr3 (39-192)||(50611253-50611408)
chr3 (60-138)||(12946843-12946921)
chr3 (100-137)||(7792103-7792140)
chr3 (98-138)||(51487229-51487269)
chr3 (100-191)||(4169875-4169965)
chr3 (62-129)||(47176041-47176108)
chr3 (100-138)||(32246557-32246595)
chr3 (44-88)||(2342638-2342682)
chr3 (148-200)||(27066026-27066078)
chr3 (39-91)||(38440426-38440478)
chr3 (95-193)||(51202145-51202245)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (17-209)||(32580-32772)
[»] chr1 (102 HSPs)
chr1 (17-209)||(44915706-44915898)
chr1 (17-215)||(14872700-14872898)
chr1 (17-209)||(7337496-7337688)
chr1 (17-201)||(15431499-15431683)
chr1 (17-209)||(35484224-35484416)
chr1 (59-209)||(5983903-5984053)
chr1 (45-215)||(7836657-7836827)
chr1 (17-209)||(21947451-21947643)
chr1 (24-202)||(13144652-13144830)
chr1 (17-190)||(31984247-31984420)
chr1 (17-209)||(29738497-29738689)
chr1 (19-215)||(10776296-10776492)
chr1 (17-209)||(32395065-32395256)
chr1 (17-209)||(45415625-45415817)
chr1 (17-180)||(4413210-4413373)
chr1 (60-208)||(23291518-23291666)
chr1 (59-191)||(31317821-31317953)
chr1 (17-215)||(31919049-31919248)
chr1 (17-208)||(34878111-34878302)
chr1 (54-201)||(36775580-36775727)
chr1 (59-201)||(48750260-48750402)
chr1 (17-209)||(49504428-49504620)
chr1 (39-202)||(44543346-44543509)
chr1 (17-155)||(11462315-11462453)
chr1 (29-202)||(47132977-47133150)
chr1 (59-207)||(3228338-3228486)
chr1 (17-193)||(16989454-16989630)
chr1 (17-200)||(27579961-27580144)
chr1 (39-202)||(24583024-24583187)
chr1 (95-209)||(8211822-8211935)
chr1 (17-215)||(39888243-39888441)
chr1 (54-202)||(18939393-18939542)
chr1 (24-202)||(51916515-51916683)
chr1 (39-207)||(35461909-35462072)
chr1 (39-202)||(49626987-49627150)
chr1 (61-202)||(45789615-45789755)
chr1 (39-138)||(24583284-24583383)
chr1 (39-202)||(25564072-25564235)
chr1 (62-201)||(37720027-37720166)
chr1 (17-144)||(51373691-51373818)
chr1 (100-208)||(1742349-1742455)
chr1 (54-201)||(34412962-34413107)
chr1 (84-202)||(32873764-32873882)
chr1 (59-191)||(19060994-19061126)
chr1 (39-193)||(19723403-19723559)
chr1 (39-201)||(16161913-16162065)
chr1 (39-192)||(51871954-51872109)
chr1 (84-190)||(15492373-15492479)
chr1 (48-202)||(32679005-32679159)
chr1 (62-202)||(16262935-16263075)
chr1 (29-191)||(50148462-50148626)
chr1 (17-141)||(50377458-50377582)
chr1 (39-192)||(7342813-7342968)
chr1 (17-200)||(26535425-26535595)
chr1 (29-192)||(5324384-5324548)
chr1 (17-133)||(21687521-21687637)
chr1 (102-202)||(24597242-24597342)
chr1 (39-192)||(9172581-9172736)
chr1 (39-192)||(9180563-9180718)
chr1 (39-192)||(9687040-9687194)
chr1 (39-192)||(9919480-9919634)
chr1 (39-192)||(25406119-25406274)
chr1 (39-192)||(50165934-50166089)
chr1 (39-192)||(51868480-51868635)
chr1 (60-196)||(12635250-12635386)
chr1 (39-193)||(33291253-33291409)
chr1 (100-192)||(43412458-43412550)
chr1 (39-188)||(19715730-19715881)
chr1 (59-202)||(31692342-31692485)
chr1 (39-192)||(45805664-45805818)
chr1 (103-192)||(39987480-39987569)
chr1 (94-202)||(9341800-9341908)
chr1 (54-138)||(34529212-34529296)
chr1 (129-208)||(21686941-21687020)
chr1 (39-114)||(31837005-31837080)
chr1 (39-191)||(40646766-40646921)
chr1 (39-191)||(5701351-5701505)
chr1 (78-202)||(6217717-6217845)
chr1 (102-196)||(13075573-13075667)
chr1 (17-127)||(19596293-19596403)
chr1 (113-202)||(1602163-1602251)
chr1 (39-166)||(34519245-34519374)
chr1 (76-147)||(14489401-14489472)
chr1 (59-181)||(18569166-18569289)
chr1 (29-159)||(31130418-31130549)
chr1 (59-192)||(40880868-40881003)
chr1 (39-192)||(45425901-45426056)
chr1 (39-191)||(7997881-7998035)
chr1 (26-112)||(27456648-27456734)
chr1 (98-188)||(41994515-41994605)
chr1 (59-192)||(48365621-48365755)
chr1 (170-215)||(27456601-27456646)
chr1 (101-202)||(28053634-28053734)
chr1 (39-193)||(32676970-32677121)
chr1 (39-114)||(48217608-48217683)
chr1 (64-155)||(50616555-50616646)
chr1 (64-155)||(50624382-50624473)
chr1 (39-114)||(27914942-27915014)
chr1 (45-192)||(33817009-33817158)
chr1 (45-192)||(33876479-33876628)
chr1 (50-193)||(7311952-7312096)
chr1 (39-91)||(11454131-11454183)
[»] chr2 (97 HSPs)
chr2 (17-209)||(1421750-1421941)
chr2 (17-209)||(4778827-4779019)
chr2 (17-207)||(31788532-31788722)
chr2 (17-209)||(38445240-38445432)
chr2 (17-208)||(18763543-18763734)
chr2 (17-202)||(29173551-29173739)
chr2 (17-215)||(33923773-33923971)
chr2 (17-209)||(25508902-25509094)
chr2 (17-202)||(33585569-33585754)
chr2 (17-209)||(37876440-37876632)
chr2 (17-208)||(1415632-1415823)
chr2 (17-215)||(4903979-4904177)
chr2 (22-207)||(31128624-31128804)
chr2 (17-197)||(5427703-5427883)
chr2 (17-209)||(27097241-27097432)
chr2 (17-199)||(36942956-36943137)
chr2 (17-209)||(7646547-7646744)
chr2 (61-209)||(9169136-9169284)
chr2 (22-209)||(19062187-19062378)
chr2 (17-209)||(29279404-29279596)
chr2 (62-209)||(7677752-7677899)
chr2 (54-201)||(10237087-10237234)
chr2 (22-215)||(8809348-8809540)
chr2 (17-215)||(36691942-36692140)
chr2 (17-209)||(35220399-35220594)
chr2 (54-201)||(3309027-3309174)
chr2 (39-202)||(12554037-12554200)
chr2 (17-202)||(4041428-4041613)
chr2 (17-202)||(11985067-11985252)
chr2 (17-202)||(12677285-12677469)
chr2 (100-209)||(31210524-31210633)
chr2 (59-215)||(19028790-19028946)
chr2 (17-202)||(30399863-30400054)
chr2 (39-202)||(17249003-17249166)
chr2 (17-196)||(17994560-17994743)
chr2 (62-202)||(10929746-10929886)
chr2 (24-209)||(4100419-4100594)
chr2 (94-202)||(4264553-4264661)
chr2 (63-202)||(17151504-17151644)
chr2 (44-196)||(37994371-37994523)
chr2 (39-194)||(14955618-14955773)
chr2 (29-192)||(24461534-24461697)
chr2 (39-199)||(34128540-34128700)
chr2 (59-206)||(28533830-28533977)
chr2 (61-193)||(43396996-43397129)
chr2 (104-215)||(39310774-39310884)
chr2 (61-202)||(32448494-32448638)
chr2 (95-201)||(41694703-41694809)
chr2 (50-194)||(19595767-19595914)
chr2 (29-190)||(33760039-33760200)
chr2 (109-209)||(7448321-7448421)
chr2 (94-202)||(14423406-14423514)
chr2 (39-192)||(9986177-9986332)
chr2 (76-202)||(23933512-23933638)
chr2 (45-191)||(38575326-38575474)
chr2 (54-192)||(16376030-16376168)
chr2 (29-192)||(8805957-8806122)
chr2 (79-199)||(22538203-22538317)
chr2 (39-192)||(84016-84171)
chr2 (59-154)||(18107626-18107721)
chr2 (60-138)||(6358758-6358836)
chr2 (44-192)||(32913331-32913481)
chr2 (39-181)||(17319423-17319566)
chr2 (45-192)||(21570249-21570398)
chr2 (61-202)||(29574506-29574647)
chr2 (39-192)||(20046917-20047072)
chr2 (59-202)||(37416791-37416934)
chr2 (29-192)||(2808298-2808462)
chr2 (39-127)||(4228280-4228369)
chr2 (29-192)||(7015536-7015701)
chr2 (29-202)||(28871634-28871807)
chr2 (95-215)||(42577176-42577296)
chr2 (103-192)||(6173723-6173814)
chr2 (99-190)||(18695147-18695238)
chr2 (38-192)||(25087128-25087283)
chr2 (39-192)||(41431119-41431274)
chr2 (39-191)||(27248986-27249140)
chr2 (75-202)||(12647004-12647128)
chr2 (39-192)||(27477239-27477394)
chr2 (45-192)||(32678952-32679100)
chr2 (78-193)||(33229014-33229131)
chr2 (39-134)||(280946-281042)
chr2 (63-192)||(45128295-45128426)
chr2 (39-192)||(40659767-40659922)
chr2 (59-124)||(41327898-41327963)
chr2 (41-128)||(8971465-8971553)
chr2 (39-91)||(30420863-30420915)
chr2 (59-126)||(19597996-19598063)
chr2 (158-192)||(3240977-3241011)
chr2 (62-144)||(10548326-10548408)
chr2 (61-119)||(34124619-34124677)
chr2 (103-191)||(36234100-36234190)
chr2 (157-215)||(42698675-42698733)
chr2 (39-186)||(4192934-4193083)
chr2 (39-88)||(6174013-6174062)
chr2 (17-81)||(31193170-31193234)
chr2 (52-120)||(42698593-42698661)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (17-215)||(65875-66073)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (17-209)||(15556-15748)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (39-202)||(50847-51010)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (24-208)||(71140-71324)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (17-208)||(1409-1600)
[»] scaffold0128 (1 HSPs)
scaffold0128 (17-200)||(36898-37082)
[»] scaffold0884 (1 HSPs)
scaffold0884 (18-202)||(1807-1991)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (17-215)||(8570-8769)
[»] scaffold0136 (3 HSPs)
scaffold0136 (21-215)||(9879-10073)
scaffold0136 (22-215)||(38111-38306)
scaffold0136 (39-189)||(34617-34767)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (17-202)||(71703-71882)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-202)||(57933-58106)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (39-202)||(6101-6264)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (101-200)||(1736-1835)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (17-195)||(14704-14881)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (36-201)||(1530-1695)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (73-206)||(93174-93307)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (61-192)||(92373-92504)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (39-192)||(16155-16310)
[»] scaffold0495 (1 HSPs)
scaffold0495 (39-192)||(5485-5640)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (108-210)||(25353-25455)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (37-192)||(8778-8935)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (30-202)||(3891-4058)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (84-172)||(4273-4361)
[»] scaffold0603 (1 HSPs)
scaffold0603 (59-202)||(7787-7929)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (60-134)||(26951-27025)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (39-192)||(201208-201363)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (94-139)||(18992-19037)


Alignment Details
Target: scaffold0121 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 31107 - 31305
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31107 acatcagatacaaacatcgcttaaaacgtaaaggatgaatcaacgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctataaata 31206  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31207 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgatgctcaaatcgttgattgaatttgtaattgagtgatgtcgatct 31305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 19404590 - 19404788
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  19404590 acatcagatacgaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcgtgcaacggcaaaaagcctacaaata 19404689  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19404690 atatgataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgacagatgtcaatct 19404788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 39171423 - 39171615
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  39171423 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcatagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 39171522  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39171523 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 39171615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 37837291 - 37837489
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||| ||    
T  37837291 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaagta 37837390  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  37837391 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 37837489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42978867 - 42978670
Alignment:
Q  18 catcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  42978867 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacatataa 42978768  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  42978767 tatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatccttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgttattgactgatgtcgatct 42978670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 8001380 - 8001571
Alignment:
Q  18 catcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  8001380 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataa 8001479  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  8001480 tatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgattccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 8001571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 12141140 - 12141333
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagca-cccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||    
T  12141140 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacaacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaat 12141239  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12141240 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 12141333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 48316652 - 48316837
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48316652 atacaaacatcgctaaaaacctaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 48316751  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48316752 aaaacctaaatcgccgaaatacccatgcttccggatctgcagcgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 48316837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47590567 - 47590384
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  47590567 atcagatataaacatcgctgaaaacgtaaagggtaaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcttacaacggcaaaatgcctacaaataat 47590468  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47590467 atgataaaacctaagtcgccgaaatactcatgcttccggatgtgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattga 47590384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 34899440 - 34899632
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  34899440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 34899539  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34899540 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccgaatttgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 34899632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 45349632 - 45349823
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||||||| | || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  45349632 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 45349731  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45349732 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttccagatctgcaatgttgacgccaaaatcattgcttgaatttgtaattgactgatg 45349823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40993415 - 40993223
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40993415 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacaaata 40993316  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||   ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40993315 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctgaatatgcaacgttgaaatccaaatcttttgttgaatttgtaattgactgatgt 40993223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48061680 - 48061495
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||| |||||||||  || |||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  48061680 acatcaggtacaaacatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 48061581  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48061580 atatgataaaacctaaatcaccgaaatactcatgcttaaggatctgcaacgttgacgctcaaaccattggttgaatttgtaattga 48061495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19297100 - 19296936
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  19297100 taaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagttaccgaaata 19297001  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19297000 cccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 19296936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 46700248 - 46700100
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||   |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46700248 aacaaactcacaacaccctagttaatagcatataacggcaaaatgcctataaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatct 46700149  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtc 210  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  46700148 gcaacgctgatgcccaaatcattgattgaatttgtagttgactgatgtc 46700100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Original strand, 9450012 - 9450162
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||    
T  9450012 gcgaacaaactcacaacacctaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcactaaaatacccatgcttccgga 9450111  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9450112 tctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 9450162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38799002 - 38798848
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  38799002 aatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataagacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaattcacatgctt 38798903  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    || ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38798902 ccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 38798848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Original strand, 13796804 - 13796960
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  13796804 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcacctaaatactcatgcttccgga 13796903  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  13796904 tctgcaacgttgacggtcaaatcattggttgactttgttattgactgatgtcgatct 13796960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 215
Target Start/End: Original strand, 25287069 - 25287217
Alignment:
Q  67 actcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaac 166  Q
    ||||||| || || || ||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     
T  25287069 actcacaacatccgagttaatagcatacaacagcaaaatggctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgctttcagatctgtaat 25287168  T
Q  167 attgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25287169 attgacgctcaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcaatct 25287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Original strand, 28044589 - 28044779
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||| | || ||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||    
T  28044589 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcataacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctaaaaata 28044688  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  28044689 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcaatgcttgaatttataattgattgat 28044779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 39328627 - 39328814
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  39328627 acatcaaatacaaacatcgct-aaaacgtaaaaggtaaatctgcgaacaaattcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 39328725  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
       |||||||| |||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39328726 ---tgataaaacctaagtcaccgagattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 39328814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 30756659 - 30756844
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    ||||||||||  || |||| ||||||| | |||| |||||| |||| ||| |||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30756659 atacaaacatctctaaaaacgtaaaggctgaatctgcgaactaacttacaacacctaagttaacagcataaaacgacaaaatgcctataaataatatgat 30756758  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  30756759 aaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaattattggttgaatttgtaattgactgatgt 30756844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 35133168 - 35133021
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||   ||||| |||||||    
T  35133168 aatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaataatatgatgaaatctaaatcactagaatactcatgctt 35133069  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35133068 ttggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 35133021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 35664980 - 35665143
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35664980 aacatcgctaaaaacgtaaaggagaaatctgtgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaaaaataatatgataaaat 35665079  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||| ||||  |||||| |||||||   | |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35665080 ctaaatcactaaaatacacatgcttatgggtctgcaacattgacgttcaaatcattgattgaat 35665143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28476439 - 28476301
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||    
T  28476439 aacaaactcacagcactcaagttaataacattgcacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccg-aatacccatacttctggatct 28476341  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28476340 gcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattg 28476301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 9977043 - 9977237
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| | ||| ||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  9977043 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaaaaaattcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaaaaata 9977142  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||| |||  |||| |||    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  9977143 atatgataaaatctaactcatcaaaatacacataattccggat----aacgttgacgcccaaatcattgtttgaatttgtaattgactgaagtcgatct 9977237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 22743165 - 22743018
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||| |||||| || |||||||  ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  22743165 aatctgcgaaaaaactcccaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatactcatgctt 22743066  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22743065 ctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtgattg 22743018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25255443 - 25255300
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||||  ||    
T  25255443 gcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaatgatattataaactctaagtcactaaaatgcccatgcttcagga 25255344  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  25255343 tctgcaacatcgatgcccaaataattgattgaatctataattga 25255300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 13592344 - 13592498
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  13592344 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatcgaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 13592443  T
Q  138 cgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  13592444 cagaatacccatgcatccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaat 13592498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Original strand, 5348467 - 5348610
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||  || |  |    
T  5348467 gcgaacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataatatggtaaattctaagtcactgaaatacacatattttcgaa 5348566  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5348567 tctgcaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattga 5348610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 5792967 - 5792856
Alignment:
Q  104 atgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgag 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||     
T  5792967 atgcctataaataatatgataaaatataagtcatcgaaattcttatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgatttaacttgtaattgac 5792868  T
Q  204 tgatgtccatct 215  Q
    ||||||| ||||    
T  5792867 tgatgtcgatct 5792856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 26623634 - 26623807
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||| |||||| |   |||||||||||||||| || |||||||||||| |    
T  26623634 aacatcgcttaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacgctcaagttaatagtatagaacgacaaaatgcctaaaactaatatgataaatt 26623733  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||  ||||||| |||||| ||||||| || ||||||    
T  26623734 ataagccaccgaaatactcatgcttccggatttgcaatatccacgcccatatcattaattgaatatgcaattga 26623807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 48930928 - 48930795
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||| ||    
T  48930928 aatctgcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgccaacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaataccaatgttt 48930829  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgat 187  Q
    |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48930828 ctggatctgcaacgttgacacccaaatcattgat 48930795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 28407751 - 28407861
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  28407751 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtaaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 28407850  T
Q  117 atatgataaaa 127  Q
    |||||||||||    
T  28407851 atatgataaaa 28407861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24770426 - 24770313
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24770426 aacggcaaaatgtctaccaataatatgataaaacctaagtctccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaattt 24770327  T
Q  195 gtaattgagtgatg 208  Q
    || ||||| |||||    
T  24770326 gtgattgactgatg 24770313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 38880487 - 38880596
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataa-tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  38880487 caacgacaaaatgtctacagataagtatgataaaatctaaataactaaaatacgcatgcttccagatctgcaacgttggcacccaaatcattgattgaat 38880586  T
Q  193 ttgtaattga 202  Q
    |||| |||||    
T  38880587 ttgtgattga 38880596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 39229188 - 39229087
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | |||||| |||||||    
T  39229188 aaaatgcctacaaattatatgataaattctaagtccctgaaatacacatgcttccagatctgcaacgtcgacgcccaagtcatcggttgaatctgtaatt 39229089  T
Q  201 ga 202  Q
    ||    
T  39229088 ga 39229087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35261533 - 35261385
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||    
T  35261533 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaatatccaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaat 35261434  T
Q  144 acccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  35261433 acacatgcctccggatctgcaacattgacgtctaaatctttgattgaat 35261385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 22927705 - 22927860
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  22927705 aaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcaaccaagttgatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 22927804  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22927805 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 22927860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23085763 - 23085608
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  23085763 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 23085664  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  23085663 cggaatatccatggtctccagatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaat 23085608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 191
Target Start/End: Original strand, 24069294 - 24069401
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||    
T  24069294 taatagcatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatcctcatgcttccgggtctgcaacgttgacgttcaaatcat 24069393  T
Q  184 tgattgaa 191  Q
    ||||||||    
T  24069394 tgattgaa 24069401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 201
Target Start/End: Original strand, 24350767 - 24350856
Alignment:
Q  112 aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24350767 aaataatatgatgaaatttaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 24350856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Original strand, 41553312 - 41553452
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||| ||||    
T  41553312 gaacaaactcacagcacc-aagttaatagcatacaacggcaaaatacgtataaatgatatgataaaatctaaatcaccaaaatatctatgtttccggatc 41553410  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  41553411 tgcaacgttgacgtccaaatcattaactgaatatgtgattga 41553452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 4999939 - 5000047
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||||||||||    
T  4999939 caacgaaaaaatgtctataaataatatgataaaatttaaatcaccagaatattcatgcttccagatcagcaacgttgaagtccaaataattgattgaatt 5000038  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    |||||||||    
T  5000039 tgtaattga 5000047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 45198868 - 45199023
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||| |   ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  45198868 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgac 45198967  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  45198968 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 45199023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 2843076 - 2843230
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  | |||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  2843076 aaaacgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatctaagctaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 2843175  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2843176 cggaatatccattgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaa 2843230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 156
Target Start/End: Original strand, 29617578 - 29617671
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcca 156  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  29617578 aacaaactcacaacacc-aagttaatagcactcaacaacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtgatcgaaatacccatgtttcca 29617671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26492607 - 26492452
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  26492607 aaaacgtaaaagatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 26492508  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||| | | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26492507 cggaatatccaaggcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 26492452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32684910 - 32684755
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||| ||    
T  32684910 aaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgac 32684811  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32684810 cggaatatccatggcctccagatctgtaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 32684755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 34773953 - 34773799
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||| |   ||||| | |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  34773953 aaaacgtaaaggataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagtatataacgatataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 34773854  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
     | |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34773853 tggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 34773799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 46822257 - 46822103
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |     
T  46822257 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgat 46822158  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || ||||  || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46822157 cggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 46822103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 209
Target Start/End: Original strand, 28062156 - 28062248
Alignment:
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  28062156 atatgataaaacataaatcaccgaaatatctatactttcggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttataattgattgatgt 28062248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 433526 - 433681
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  433526 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 433625  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  ||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  433626 cggaatattcatggcctccggatctgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaat 433681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21266632 - 21266477
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||||||    
T  21266632 aaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcac 21266533  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||  ||| || ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  21266532 cgaaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaat 21266477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 35496010 - 35496165
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||| |||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  35496010 aaaacgtaagggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 35496109  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  35496110 cgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaat 35496165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 190
Target Start/End: Original strand, 26610707 - 26610785
Alignment:
Q  112 aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattga 190  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  26610707 aaataatatgataaattataagtcacccaaataaccatgtttccggatctgcaatatcggcgcccaaatcattgattga 26610785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 132
Target Start/End: Original strand, 46822618 - 46822690
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaa 132  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46822618 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaatgacaaaatg-ctacaaataatatgataaaatctaa 46822690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 188
Target Start/End: Original strand, 3267137 - 3267221
Alignment:
Q  104 atgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  3267137 atgcctaaaaatagtatgataaaatataagtcaccgaaatctccatgctttcggatgtgcaatgttgacgcctaaatcattgatt 3267221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11344009 - 11343883
Alignment:
Q  75 cacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgc 174  Q
    |||| ||| ||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| |||  |||  |||||||||| ||||||     
T  11344009 cacctaagttaatagcatacaacatcaaaatacctacaaataatattgtaaaatataaatcaccaaaatactcatttttcg-gatctgcaacgttgacgt 11343911  T
Q  175 ccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11343910 ccaaatcattaattaaatttgtaattga 11343883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6559097 - 6558964
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccaga 158  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||| | |||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||  |||| | ||| ||    
T  6559097 gaacaaactcatagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcttgcaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccgga 6558998  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6558997 tctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 6558964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 43369609 - 43369762
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| |||||||||||||  |  |||||||| ||| ||  |||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||     
T  43369609 aaaacgtaaaggataaatttgtaaacaaacttacatcatacaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctataaataatatgataaaattaaagtgact 43369708  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
      ||||| ||||| ||| |||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||    
T  43369709 agaatactcatgcatccggatctgcaacgttgatgacaaaaccattgattgaat 43369762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 48208150 - 48207990
Alignment:
Q  32 atagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaa-tagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatc 129  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||| ||||| | ||||||| || ||||| ||| |||||   |||| || |||||| ||||| | ||||||||||||     
T  48208150 atagctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaaaatactcacaacatccaagttaaatagcatataacggcataatgccaacaaaaatatatgataaaatt 48208051  T
Q  130 taagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattg 189  Q
     |||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  48208050 aaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattg 48207990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4530236 - 4530153
Alignment:
Q  115 taatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||| | |||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  4530236 taatatgataaaatctaagttacaaaaatacccatgcttctggatatccaacgtttacgcctaaatcttggattgaatttgtaa 4530153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 7640610 - 7640765
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||| ||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  7640610 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctataaaaatatatgatgaaattaaagtgac 7640709  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| ||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||    
T  7640710 cagaatatccatgacatccagatttgcaatgttgacgcccaaatatttgattgaat 7640765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 17222835 - 17222990
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| || |||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  17222835 aaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttactagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 17222934  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||| || | || ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  17222935 cagaatatccatggccttcaaatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaat 17222990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 42066897 - 42067052
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||   | || |   ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  42066897 aaaacgtaaagaataaatatgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcacatatcggcgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 42066996  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  42066997 cggaatattcatggcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 42067052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42311515 - 42311367
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaa 142  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||   |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  42311515 gtaaaggatgaatttgcgaacaaact--cagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaa 42311418  T
Q  143 tacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  42311417 tatccatgacctccggatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaat 42311367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 202
Target Start/End: Original strand, 5078342 - 5078432
Alignment:
Q  112 aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||| | ||| |||||  |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5078342 aaatagtatgataaaatctaaatcatcaaaatactcatgctttcggatatgcaaagttgacgtccaaatcatttattgaacttgtgattga 5078432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25068244 - 25068182
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctac-aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  25068244 caacgacaaaatgcttactaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaacacccatgcttcc 25068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 187
Target Start/End: Original strand, 46244166 - 46244255
Alignment:
Q  98 gacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| | ||| |||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  46244166 gacaaaatgcctacaaataatatgataaaattaaagtgaccaaaatatcaatgtcttcga-acctgcaacgttgacgctcaaatcattgat 46244255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Original strand, 1769135 - 1769196
Alignment:
Q  141 aatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1769135 aatactcatgcttccagatctgcaacgttcacgttcaaatcattgattgaatctgtgattga 1769196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 137
Target Start/End: Original strand, 49148015 - 49148068
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  49148015 taatagcatacaacgacaaaatgccaacaattaatatgataaaatccaagtcac 49148068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 37849081 - 37849029
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37849081 aaaatgtaaagaataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaatagca 37849029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27341730 - 27341625
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |  ||||| | |  || | |||||||||||||||| | | | | ||||||||||| |    
T  27341730 aacggcaaaatgcctacaaataatattataaaatttaagtcatctgaatactc-tattttcggatctgcaacattgacactcgagttattgattgaatat 27341632  T
Q  195 gtaattg 201  Q
    |||||||    
T  27341631 gtaattg 27341625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 192
Target Start/End: Original strand, 3224342 - 3224418
Alignment:
Q  115 taatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||| ||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||    
T  3224342 taatatgataaaatctaaatcaccataatactcattcttccggatctacaac-ttgacgtcaaaatcattaattgaat 3224418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 35667089 - 35667222
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccaga 158  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||| ||   ||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| | |||  |    
T  35667089 gaacaaactcacgacatccaagttaatatcatataacaacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccgaa 35667188  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35667189 tctgcaacattgacgctcaaatcgttgattgaat 35667222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3398364 - 3398328
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3398364 aaaatgcctaaaaataatatgataaaatctaaatcac 3398328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42408579 - 42408527
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42408579 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagca 42408527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 90)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23230901 - 23230709
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23230901 acatcagatacaaacatcgctaaaagtgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 23230802  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  23230801 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgt 23230709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 7883072 - 7883257
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  7883072 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaata 7883171  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  7883172 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgctgacgtccaaattattgcttgaatttgtaattga 7883257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 16928588 - 16928786
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16928588 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 16928687  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16928688 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccacgctttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 16928786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 31013439 - 31013631
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  31013439 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31013538  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31013539 atatgataaaacttaagtcactgaaatacacatgcttccgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttttaattgactgatgt 31013631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 27110296 - 27110494
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  27110296 acatcagatacaaacatcactaaaaatgcaaaagatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 27110395  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||    
T  27110396 atatgataaaatctaagtcactaaaatacacatgcttccagatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtagttgtctgatgtcaatct 27110494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37971545 - 37971349
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagc----ttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctaca 112  Q
    ||||||||||||||||| ||    | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  37971545 acatcagatacaaacatcgctaattaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaca 37971446  T
Q  113 aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37971445 aataatgtgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 37971349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 18890567 - 18890714
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| ||    
T  18890567 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccataatacctatgttt 18890666  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18890667 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 18890714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10377910 - 10377755
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  10377910 aatctgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgctt 10377811  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    || |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  10377810 ccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgt 10377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15344544 - 15344381
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15344544 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 15344445  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15344444 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 15344381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15433609 - 15433446
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15433609 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 15433510  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15433509 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 15433446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15524913 - 15524750
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15524913 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 15524814  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15524813 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 15524750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 30568152 - 30568335
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  30568152 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 30568251  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  30568252 acatgataaaacctaagtcatcgaaattcacatgcttcaagatcttcaacgttgacgctcaaatcattggttgaatttgtaatt 30568335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 45445642 - 45445833
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||| | | |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  45445642 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacaacaaaatgcctacaaata 45445741  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45445742 atatgataaaatctaagtcaccaaaattcacatgcttccggattttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 45445833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Original strand, 16247098 - 16247252
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||| ||  ||||| || ||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16247098 gaacaaacttactacacccgagttaatagcatacaacggcaaaatgccttcaaataatatgatcaaatctaagtcagcgaaatacccatgcttccggatc 16247197  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  16247198 tgcaacattgatgcccaaatcattgattgaatttgtaattaattgatgtcgatct 16247252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 14544726 - 14544932
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctac----- 111  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||| |||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||         
T  14544726 acatcagatagaaacatcgctaaaaacgtaatggatgaatctgcaaacaaactcacaccatccaagttaatagcaaacaacggcaaaatgcctacaagac 14544825  T
Q  112 ---aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
       ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||    
T  14544826 tacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaaattcccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaataattgatttaacttgtaattgattgatg 14544925  T
Q  209 tccatct 215  Q
    || ||||    
T  14544926 tcgatct 14544932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 17693444 - 17693643
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaa-tgcctacaaat 115  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||  | ||||  ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||||    
T  17693444 acatcaaatacaaacatcgctaaaaatgtaaagagtgaatctacgaccaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaaatgcctacaaat 17693543  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  17693544 aatatgataaaacataagtcatcgaaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 17693643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42046442 - 42046295
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  42046442 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgatgtcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgctt 42046343  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42046342 ctggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 42046295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Original strand, 7677121 - 7677306
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||  | |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7677121 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgtgaacaaagtcacagcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcttacaaataatatgat 7677220  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||    
T  7677221 aaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattggtcgaatctgtaattgactgatgt 7677306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 40618904 - 40619089
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| |||||   || ||| |||||||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||| |||    
T  40618904 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaattgtagatctgcgaacaaacgcacaacccccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacacata 40619003  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40619004 atatgataaaatttaagtctgcgaaatactcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaatttgtaattga 40619089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 20553134 - 20553262
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  20553134 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20553233  T
Q  179 atcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20553234 atcattgcttgaatttgtaattgattgat 20553262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41896738 - 41896591
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  41896738 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatactcatgctt 41896639  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  41896638 ctagatctgcaacgttgatgcctaaatcattaattgaatttgtgattg 41896591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Original strand, 43833872 - 43834011
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  43833872 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaaactaaatcaccagaatactcatgcttctagatct 43833971  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  43833972 gcaacgttgacgtctaaatcattgattgaatttgtgattg 43834011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 24186492 - 24186690
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| | | |||| ||||| ||| |||| || |||||||||| | |||| ||| |||||| |  | ||| ||||||||||| |||||    
T  24186492 acatcatatacaaacatcgataaaaacgtaaaagatgaatctgctaacaaactcataacacctaagttaatagtatacgacggcaaaatgcctataaata 24186591  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  24186592 atatgataaaatttaagtcactgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaattattgattgaacttataattgactgatgtcaatct 24186690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 62 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3673654 - 3673501
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  3673654 aacaaactcacagcatccaagttaataggatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgattaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatct 3673555  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||    
T  3673554 gcaacgttgacgcccaaagcattgatttgatttgtaattgactgatgtcgatct 3673501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 20559637 - 20559765
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  20559637 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20559736  T
Q  179 atcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20559737 atcattgcttgaatttgtaattgattgat 20559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 20571199 - 20571327
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  20571199 caagttaatagcatacaacggcaaaatgcccacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaa 20571298  T
Q  179 atcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20571299 atcattgcttgaatttgtaattgattgat 20571327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14585898 - 14585751
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||    
T  14585898 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaacgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccaggatacccatgctt 14585799  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14585798 ctggatctgcaacgttgacgtccaaatcaatgattgaatttgtgattg 14585751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 9637240 - 9637432
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||| | | || |  |||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  9637240 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtgaaactacgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctaaaaata 9637339  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||    
T  9637340 atatgataaaacctaagttaccgaaatactcatgtttccgaatctgcaacgttgacgctcaaatcattaattgtgtttgtaattaactgatgt 9637432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 28086643 - 28086827
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||| |||  | ||||||||||| || ||  ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28086643 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtagatgatgaatatgtgaacaaactcatagtacttaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 28086742  T
Q  117 atatgataaaatct-aagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||||| ||| || | |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28086743 atatgataaaatctaaaatcactgaaataccaatgtttacggatctgcaacgttgacttccaaatcattgattgaatttgtaatt 28086827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 1236550 - 1236713
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  1236550 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaatagtatgatataatctaaatcacc 1236649  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  1236650 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccagatcattgattgaatatgtgattga 1236713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Original strand, 7198048 - 7198203
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7198048 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacaacacccaaattaatagcatacaacgacaaaattcctgcaaataatatgataaaatctaaatcacc 7198147  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
     |||||  ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  7198148 aaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattgaattt 7198203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 40211131 - 40211325
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatg--taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| |  |||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||| || ||||| ||||||    
T  40211131 acatcagatataaacatcgctaaaaacgcgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacatcacccagattaatagcatacaacggcataatgcttacaaa 40211230  T
Q  115 taatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  40211231 taatatgataaaatccaagtcaacgaaatactcatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaatcgactgatgt 40211325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8868024 - 8867884
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagcta---atagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||   ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||    
T  8868024 gcgaacaaactcacaccacccaagttataaataacatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatatccaagcttcc 8867925  T
Q  156 agatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8867924 agatcttcaactttgatgcccaaatcattgattgaatttgt 8867884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 33214502 - 33214687
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| ||||| |||| | ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||||||   |||| ||||||| ||| |||||    
T  33214502 acattagatataaacgtcgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactaacagcaccaaagttaatagcataaaacggcaaaatgtctaaaaata 33214601  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33214602 atatgataaaacataagtcatcgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattggttgaatttgtaattga 33214687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 33347364 - 33347537
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||| | |||| ||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33347364 aacatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacacctaatttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaatt 33347463  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  33347464 ctgagtcaccgaaatacccatgctttcggatccgcaacgtcgacgcctaaatcattgattgaatctgtgattga 33347537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 25190896 - 25191089
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||    ||||||||||||||||    
T  25190896 acatcagatacaaacattgctaaaatcgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaatagaaaaatgcctacaaata 25190995  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa--atcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||  ||||||| |||||    
T  25190996 atatgataaaacctaagtcatcgcaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatatcattggttgaattcataattgactgatg 25191089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Original strand, 471038 - 471186
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaa--tgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |    
T  471038 cgaacaaaatcacatcacccaagttaataacatacatcgacaaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcatcagaatacccatgcttccgg 471137  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtga 206  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  471138 atctgcaacgttgacgcacaaatcattgattgaatctatgattgagtga 471186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28897925 - 28897769
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||| | ||||||||   || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | || |||||  |    
T  28897925 gcgaacaaactcacaacacccacgttaatagcatagaatgacaaaatgactacaaataatatgataaaatctaagtcatcgaaatttcaatacttccgta 28897826  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  28897825 tctgcaacgtttacgcccaaatcattaattgaacttataattgactgatgtcgatct 28897769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5046989 - 5046826
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5046989 aaaatataaatgataaatcttcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacgataaaatgcctacaaataatatgataaattctaagtcact 5046890  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||  |||| ||    ||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5046889 gaaatattcatgtttatgaatctgcaacgtcgacgtccaaattattgattgaatctgtaattga 5046826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39657635 - 39657535
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39657635 caacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatt 39657536  T
Q  194 t 194  Q
    |    
T  39657535 t 39657535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Original strand, 29617142 - 29617290
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| | ||| ||    
T  29617142 aatctgcgaacaaactcacaacatttaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaataacaatgttt 29617241  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
       |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29617242 atggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 29617290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 202
Target Start/End: Original strand, 1239283 - 1239413
Alignment:
Q  72 cagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattga 171  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| | ||||||  |||||||||| ||||    
T  1239283 cagcacccaagttaatagcatacaacgtcaaaatgcctacaaatagtatgatataatctaaatcaccagaatactcttgcttctggatctgcaacgttga 1239382  T
Q  172 cgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  1239383 cgtccagatcattgattgaatatgtgattga 1239413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 14906758 - 14906912
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  14906758 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 14906857  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14906858 cggaatatccattgcctccaaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 14906912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Original strand, 14916056 - 14916193
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||  |||||||    
T  14916056 aatctgcgaaaaaactcaatgcactcaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaac-aaatattcatgctt 14916154  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14916155 ccggatctgcaacatggacgtccaaatcattgattgaat 14916193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 210
Target Start/End: Original strand, 36948312 - 36948461
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||    ||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||    
T  36948312 cgaacaaactcacaacacccaagttaatagcctacaacagataaatgtctggaaataatatgataaaatctaag-cgccgaaatactcatgcttccggat 36948410  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtc 210  Q
     ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36948411 ttgcaacattgcatcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtc 36948461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 27498197 - 27498376
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaat-gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| | |||| || ||||| |||| | |||||||| | ||| ||   || ||||||||| ||| ||||    
T  27498197 acatcagatacaaacatca-ttaaaatcgtaaagggtgaatctgcaaacaagctcataacacccaagttcataacatataaagacaaaatgtctataaat 27498295  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgta 197  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27498296 aatatgataaaatctaaatcactgaaata-ccatgtttccaaatctgcaatgttgacgcccaaatcattaattgaatttgta 27498376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29939481 - 29939373
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  29939481 caacggcaaaatgactacaaataatatgataaaacctaagtcactgaaatactcatgcttatggatatgcaacgttaacgcccaaatcattggttgaatt 29939382  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
     ||||||||    
T  29939381 agtaattga 29939373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Original strand, 41060116 - 41060243
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  | ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  41060116 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaaattgatagcatacaacaacaaaatggctacaaataatatgataaaatctaagtctat 41060215  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaac 166  Q
    |||||| | |||||| | ||||||||||    
T  41060216 gaaatatctatgctttcggatctgcaac 41060243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8826407 - 8826294
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||  || || |||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  8826407 caagttaatagcatgcaacgataaaatgcctacaagtaatatgataaaaacaaaatcaccagaacacacatgcttccaaatatgcaacgttgatgcccaa 8826308  T
Q  179 atcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||||    
T  8826307 atcattgattgaat 8826294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 26469055 - 26469152
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| | |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26469055 aacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatacacatgcattcagatgcacaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 26469152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21238034 - 21237873
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||| | |||||| |  |||||||||||  |||||||| |||  ||||||||    
T  21238034 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccatgttaataggatacaacgacaaaaatcctacaaacaat--gataaaat 21237937  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||| ||| |  | ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21237936 ctaaatcaacagagtacacatgcttctggatctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaat 21237873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29777468 - 29777313
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||  |||||||    
T  29777468 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctccaaaaatatatgataatattaaagtcac 29777369  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29777368 cggaatatccatggtctccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgattgaat 29777313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33342684 - 33342530
Alignment:
Q  38 taaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtca 136  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||   |||| || |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |    
T  33342684 taaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtga 33342585  T
Q  137 ccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||    
T  33342584 cctgaatactcatgcctccagatctgcaac-gtgacgtccaattctttgattgaat 33342530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5333620 - 5333502
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  5333620 taatagcatacaacaacaaaatgcatacaaataatatgacaaaatctaaatcactagaatactcatgcttctggatctacaacgttgacgcccaaataat 5333521  T
Q  184 tgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  5333520 tgattgaatatgtgattga 5333502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 23851329 - 23851483
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  23851329 aaaaagtaaaagataaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagttac 23851428  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  23851429 cgaaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaa 23851483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 8443427 - 8443527
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8443427 aaatgtctacaaataatatgatcaaatctaaatcaccataataccagtgcttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattg 8443526  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  8443527 a 8443527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 24099099 - 24099260
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||       | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24099099 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcat------ataatttgcctacaaataatatgataaaat 24099192  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||| ||||| |||||  | | ||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  24099193 ctaaatcaccaaaatattctttcttccggatctgcaacgttgacgtacaaatcattgaatgaatttgt 24099260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41684556 - 41684504
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41684556 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgctt 41684504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 32724316 - 32724471
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||  |||| ||    
T  32724316 aaaacgtaaaggataaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagtatataacgacataatgcctacaaaaatataagataagattaaagtgac 32724415  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32724416 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 32724471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 34610052 - 34609913
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||| ||| ||   ||| ||||||||  ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| |  |  |    
T  34610052 gcgaacaaacttacaacatttaagttaatagcattcaacgccaaaatgcctattaataatatgataaaacctaaatcaccggaatactcatgttctcgaa 34609953  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34609952 tctgcaacgttcacgcccaaatcattgattgcatttgtaa 34609913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4809213 - 4809059
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  4809213 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 4809114  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4809113 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatccttgattgaa 4809059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11464420 - 11464266
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  11464420 aaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 11464321  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  11464320 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 11464266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 43889959 - 43890113
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  43889959 aaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaaatcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 43890058  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  43890059 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 43890113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34612053 - 34611897
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| | | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  34612053 aaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaagataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 34611954  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    || |||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  34611953 cggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaatt 34611897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 37565714 - 37565870
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||    
T  37565714 aaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaatcaaagtgac 37565813  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    || |||| |||| || | | |||||||||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  37565814 cggaatatccatcgcattcggatctgcaacgttaacgcccaaatctttaattgaatt 37565870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34493217 - 34493132
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatac 145  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  34493217 cgaacaaactcacaaaactcaagttaataacatgcaacgacaaaatgcctatatataatatcataaaatctaattcaccaaaatac 34493132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 9619192 - 9619343
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || ||| | |||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  9619192 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatacttacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 9619291  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  9619292 cggaatatccattgcctccggatctgcaaagttgacgcccaaatctttgatt 9619343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11725929 - 11725774
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||| ||    
T  11725929 aaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgac 11725830  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || | || |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  11725829 cggagtatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaat 11725774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 61 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 31147088 - 31146969
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||  || ||||||||||  ||||||| |||||||| |||  | || | ||||||||| || | ||||||||    
T  31147088 gaacaaactcatatcaaccaagttaatagcacacagcgacaaaatgattacaaatgatatgatagaattaaggtgatcgaaataccaattcatccagatc 31146989  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  31146988 tgcaacattgacgctcaaat 31146969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3240616 - 3240453
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataata--tgataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||   |||| |||||||| |||||| || |  ||||||  ||||| |||    
T  3240616 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgc-tacaaaaaaaaaatgataat-tctaaatca 3240519  T
Q  137 ccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||  ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  3240518 ccagaatacccatacttctggatctgcaacattggcgtccaaatcatcgattgaatatgtgattga 3240453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33896335 - 33896176
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atat----gataaaatctaag 133  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||    ||||||||  |||    
T  33896335 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaaaaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatagataaaattaaag 33896236  T
Q  134 tcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  33896235 tcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 33896176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 35283256 - 35283332
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  35283256 caagttaatagcatacaacgataaaatatatacaaataatatgataaaatctaagtgatcgaaatactcatgcttcc 35283332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Original strand, 27746989 - 27747103
Alignment:
Q  78 ccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgccc 176  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||| |||| ||||    
T  27746989 ccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaa-taaaagtgaccggaatacccatgcatccggatctacaacgttgatgccc 27747087  T
Q  177 aaatcattgattgaat 192  Q
    ||||| ||||||||||    
T  27747088 aaatctttgattgaat 27747103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2656099 - 2655965
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaataccca-tgcttcca 156  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||| |||| ||| ||| |||     
T  2656099 gcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccg 2656000  T
Q  157 gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  2655999 gatctgcgacgttgacacccaaatctttgattgaa 2655965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11267257 - 11267167
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 128  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||    
T  11267257 aaaacgtaaaggatgaaactgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaat 11267167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Original strand, 18846380 - 18846450
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattg 170  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| |||| | ||| ||||||||    
T  18846380 caaaatgcctacaaataatataataaaatctaaatcaccataatactcatgtttccgggtctacaacattg 18846450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 202
Target Start/End: Original strand, 39646062 - 39646202
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| | ||   ||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||   ||||  ||||||| | |||    
T  39646062 cgaacaaactcacaacacccaagttaacaacatataacaacaaaatagctacaaataatatgattaaatttaagtcacaagaata-tcatgctt-cggat 39646159  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     |||||| || | ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39646160 ttgcaacgtttatgcctaaatcattgattgaatatgtaattga 39646202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 46 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 44578272 - 44578134
Alignment:
Q  46 aaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    ||||||| |||| | || |||||| ||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||||    
T  44578272 aaaggatgaatctgtgatcaaacttacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaata 44578173  T
Q  145 cccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatca 182  Q
     ||||| | | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  44578172 tccatgtcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatca 44578134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Original strand, 8412355 - 8412427
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8412355 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagca 8412427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Original strand, 39152977 - 39153120
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat--gataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  | || | ||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||  |||| |    
T  39152977 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcttaacatctaagttaatagcacataacaacataatgcctacaaaaaatatatgataaaattaaagtga 39153076  T
Q  137 ccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
     || ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  39153077 tcggaatacccatgcctccggatctgcaacgctgacacccaaat 39153120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35812852 - 35812797
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg 150  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  35812852 aacgacaaaatatctacaaataatatgataaaattaaagtcactgaaatactcatg 35812797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14913279 - 14913173
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | || | || ||||| ||||| |||  || |||||  |||| || ||||||||    
T  14913279 taatagcatacaacggcaaaatacctacaaataatatgataaaattaaggtgatcggaatacacatgcctcccaatatgcaatgttgatgctcaaatcat 14913180  T
Q  184 tgattga 190  Q
    |||||||    
T  14913179 tgattga 14913173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17949418 - 17949329
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| ||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  17949418 aatgcctacaaata-tatgataaaattaaagtgaccgtaatatccatggcctccggatctggaacgttgacgcccaaatctctgattgaat 17949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33299099 - 33298949
Alignment:
Q  43 tgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaa 141  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||   |||| || |||||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||   |    
T  33299099 tgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgactaga 33299000  T
Q  142 atacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||| ||||| |||  ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||    
T  33298999 atactcatgcatccgtatctgcaacgttgacgaccaaatctttaattgaat 33298949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34102430 - 34102341
Alignment:
Q  111 caaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  ||||  ||||| |||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34102430 caaataatatgataaaatcaaagtaatcagaata-tcatgcctccaaatctgcaatgttgatgcccaaataattgattgaatatgtaattg 34102341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 128
Target Start/End: Original strand, 44099771 - 44099861
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 128  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||    
T  44099771 aaaacgtaaaggatgaatctgctaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcatacaaaaatatatgataaaat 44099861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12184505 - 12184436
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||||||||| || |||||  |||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12184505 gcgaagaaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaataatatgataaaat 12184436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 12428933 - 12428864
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||||||||| || |||||  |||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12428933 gcgaagaaactcacatcatccaagtcaatagcatacaacagcaaaatacctacaaataatatgataaaat 12428864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 202
Target Start/End: Original strand, 31634213 - 31634298
Alignment:
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||||| |||| ||   ||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  31634213 atatgataaaatcaaagtgactagaatacccttgcatccagatttgcaattttgacgcttaaatcattgattaaatatgtaattga 31634298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 9498434 - 9498486
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9498434 aaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagca 9498486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23128875 - 23128683
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23128875 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 23128776  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23128775 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 23128683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12170725 - 12170533
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  12170725 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatatgcgagcaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 12170626  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  12170625 atatgatcaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 12170533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 606461 - 606269
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  606461 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 606362  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  606361 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgatgtccaaatcattggttgaatttataattgactgatgt 606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 3913407 - 3913599
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |  ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3913407 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgcatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 3913506  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3913507 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtctaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 3913599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 33053001 - 33053193
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  33053001 acatcaaatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 33053100  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33053101 atatgataaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 33053193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 29255279 - 29255470
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| |||| || | |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||    |||||||||||||||    
T  29255279 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaatgggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagtgaaatgcctacaaata 29255378  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29255379 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatg 29255470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 30608350 - 30608546
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||  || ||||| |||||| || ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||    
T  30608350 atcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatttgcaaacaatctcacaacatccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaataat 30608449  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  30608450 atgataaaatataagtcaccgaaatacccatgattccagatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattgacttatgtcgatct 30608546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 127880 - 127728
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||    
T  127880 gaacaaactcacagcaaccaagttaatagca--caacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccgaaatactcatgcttccgaatc 127783  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  127782 tgcaacgttgacgcccaaatcattgatcgaatttgtaattgactgatgtcgatct 127728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 67836 - 68026
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||    
T  67836 atcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctataaataat 67935  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  67936 atgataaaacttaagtcgccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttaacgtacaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgt 68026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 546266 - 546111
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  546266 aaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaaccacc 546167  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
      ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  546166 agaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaattt 546111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 32327053 - 32327242
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||||||    
T  32327053 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcat---acggcaaaatgcctacaaata 32327149  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |||||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32327150 atatgataaaacctaaatcaccaaactactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtcaaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 32327242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14802047 - 14801900
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  14802047 aatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccaaaatacacattctt 14801948  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14801947 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 14801900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30776898 - 30776736
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30776898 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 30776799  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
      |||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30776798 agaatacccatgcttctagatttgcaacgttcacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattg 30776736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 30894855 - 30894659
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| || || |||||||||||| ||||| | ||||||  ||||  ||||||| |||||||||    
T  30894855 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgc-aataaactcacagcatccaagttgatagcatacaacagcaaaatgactacaaata 30894757  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30894756 atatgataaaacctaattcatcgaaatacc-atgcttctggatctgtaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 30894659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Original strand, 7515037 - 7515227
Alignment:
Q  18 catcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    ||||||||| ||| || ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||||| ||||||||  || |   |||||||||||||||||    
T  7515037 catcagatataaa-atcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacagaaaccaagttaatagcatacagcagaaaaatgcctacaaataa 7515135  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7515136 tatgataaaacctaagtcaccgacatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgt 7515227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 34018812 - 34018634
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatg 121  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||| ||  ||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||   |||||||||||||||||||||    
T  34018812 agatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtaaatctgcagacaaactcacaacacccaagataataatatacaacagtaaaatgcctacaaataatatg 34018713  T
Q  122 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34018712 ataaaacataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttgtaatt 34018634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20226066 - 20225927
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||   |    
T  20226066 gcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaattctaactcatcgaaatactcatgcttcagaa 20225967  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20225966 tctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaa 20225927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22120050 - 22119911
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||   |    
T  22120050 gcgaacaaactcacaatacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaattctaactcatcgaaatactcatgcttcagaa 22119951  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22119950 tctgcaacgtcggcgccaaaatcattgattgaatttgtaa 22119911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 29319712 - 29319903
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa-taa 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||  |||||  ||||||| |||||| |||    
T  29319712 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcataacaaccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcttacaaaataa 29319811  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29319812 tatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttgcaacgttgacgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 29319903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30493777 - 30493614
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  30493777 aacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaattcacaacacccaggttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaacatgataaaat 30493678  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  30493677 ataaatcaccaaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaat 30493614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9380238 - 9380106
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||   |    
T  9380238 gcgaacaaactcacaacatccaagataatagaatacaacgacaaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcaccaaaatacccatgcttctgaa 9380139  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9380138 tctacaacattgacacacaaatcattgattgaa 9380106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1523607 - 1523491
Alignment:
Q  75 cacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgc 174  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||     
T  1523607 cacccaagttaatagcattccacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgt 1523508  T
Q  175 ccaaatcattgattgaa 191  Q
     ||||||||||||||||    
T  1523507 tcaaatcattgattgaa 1523491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8102938 - 8102799
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||  |||| |||  |||||    
T  8102938 aacaaactcacagcacccaagttaataacattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcatcagaatattcatgtttctggatct 8102839  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  8102838 gcaacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattg 8102799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 9341484 - 9341594
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  9341484 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaaca 9341583  T
Q  117 atatgataaaa 127  Q
    |||||||||||    
T  9341584 atatgataaaa 9341594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Original strand, 4010430 - 4010535
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4010430 aaatgcctataaataatatgataaattctaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgtcaacacccaaatcattgattgaatatgtaattg 4010529  T
Q  202 agtgat 207  Q
    | ||||    
T  4010530 attgat 4010535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Original strand, 7976048 - 7976205
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||||  ||||    
T  7976048 taaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacggtatgataaaatttaaatcaccagaata 7976147  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||    
T  7976148 cccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaataattaattgaatctgtgattga 7976205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 14174904 - 14175047
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  14174904 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14175003  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14175004 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccggatc 14175047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 14179440 - 14179583
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  14179440 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaacagcataaaacggaaaaatgcctacaaata 14179539  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  14179540 atatgataaaacataagtcaccgaaattcacatgcttccggatc 14179583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3355291 - 3355181
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3355291 caaaatgtctccaaacaataggataaaatctaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattcattgaatttataat 3355192  T
Q  200 tgagtgatgtc 210  Q
    ||| |||||||    
T  3355191 tgactgatgtc 3355181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31297035 - 31296902
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||| | || ||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||| ||    
T  31297035 gcgaacaaactcaaatcatccaaattaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatataaatcaccagaatactcatgcttccgga 31296936  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||| |||||| | |||||||  |||||||    
T  31296935 tctgcaacgttgacgtctaaatcatcaattgaat 31296902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4088702 - 4088548
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  4088702 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatggcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 4088603  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4088602 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 4088548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 34185604 - 34185702
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| || | |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  34185604 aacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatacccatgattctagttttgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaatt 34185702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28981390 - 28981249
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||| | ||||    
T  28981390 gaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatacaacaacaaaattcctacaagcaatatgataaaatctaaatgaccaaaatacccatactttcggatc 28981291  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||  |||||| | | |||||||||||||| ||| |||||    
T  28981290 tgcaatgttgacgtcaagatcattgattgaatctgtgattga 28981249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 1933547 - 1933710
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||| ||  ||||||||  ||||   ||||||| || | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  1933547 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcatagtaccgaaattaatagcatacaacagaaaaatgcatatagataatatgataaaatataaatcacc 1933646  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||  |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1933647 agaataatcatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 1933710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 17237121 - 17237276
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  17237121 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacacactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 17237220  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  17237221 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttgattgaat 17237276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 21426519 - 21426622
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  21426519 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaacggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaata 21426618  T
Q  117 atat 120  Q
    ||||    
T  21426619 atat 21426622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32802761 - 32802670
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  32802761 gcgatcaaactcacagcacccaatttaatatcatacaacgataaaatacctacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaaatatccatg 32802670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29743177 - 29743079
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  29743177 caacgacaaaatgcctataaataatatgataagatctaaatcaccagaatactctagcttccggatctgcaacgttgacgcccacgtcattgattgaat 29743079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 35001842 - 35001677
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  35001842 aacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 35001743  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||||||||| ||||  |||| | | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  35001742 ttaaagtcaccggaatattcatgaccttcggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 35001677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 200
Target Start/End: Original strand, 528250 - 528366
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||  || ||||   ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  528250 taatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcactagaatacttatacttcagaatctgcaacgttgacgcccaaataat 528349  T
Q  184 tgattgaatttgtaatt 200  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  528350 tgattaaatatgtaatt 528366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 188
Target Start/End: Original strand, 31852093 - 31852197
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  31852093 taatagcatacaacaacaaaatgtctataaataatatgataaaatttaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaactttgacgttcaaatcat 31852192  T
Q  184 tgatt 188  Q
    |||||    
T  31852193 tgatt 31852197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10228921 - 10228766
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  10228921 aaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 10228822  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  10228821 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 10228766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 32060133 - 32060030
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||  ||||||||   || |||||||||||||||||||    
T  32060133 acatcagatacaaacttcgctaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaacttacaacatccaatttaatagcataaaatgacaaaatgcctacaaata 32060034  T
Q  117 atat 120  Q
    ||||    
T  32060033 atat 32060030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 7880937 - 7881091
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  7880937 aaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 7881036  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7881037 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 7881091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 679353 - 679181
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||  | | ||||||||||||||||    
T  679353 aacattgctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacg-caaaatgtttgcgaataatatgataaaat 679255  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| ||  |  ||||  ||||||||||||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  679254 ctaaatcgtcagaatattcatgcttccagatttgcaaagttggcgctcaaatcattgattgaatatgtgattga 679181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 8196242 - 8196397
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat--gataaaatctaagtca 136  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||  |||| |    
T  8196242 aaaatgtaaaggatgaatttgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaa-aatatgcgataaaattaaagtga 8196340  T
Q  137 ccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||| ||||  ||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8196341 ccggaatatacatggcctccggatctacaacgttgacgcccaaatcgttgattgaat 8196397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 23947152 - 23947305
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaa-gtca 136  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||| ||| || |    
T  23947152 aaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaatttaaagtga 23947251  T
Q  137 ccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattg 189  Q
    ||  |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23947252 ccagaatatccatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatcgttgattg 23947305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8497210 - 8497055
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata--atatgataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| |  ||||||| ||||  |||| |    
T  8497210 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaaatatatgatgaaattaaagtga 8497111  T
Q  137 ccgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||| |||| ||| ||| ||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  8497110 ccggaatatccattgcatcaggatctgcaacgttgccgcccaaatctttgattgaa 8497055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 26588350 - 26588490
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||  || ||||| ||| ||||  ||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||  ||| |    
T  26588350 aacaaactcacgacatccaagttaagagcatacaacagcaaaatgtctaaaaataatatgataaaatcaaaatcacccaaatactcatgcttctggattt 26588449  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  26588450 gcaacgttgacatccaaatcattaattgaatgtgtgattga 26588490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12653186 - 12653031
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  |||  ||    
T  12653186 aaaacgtacaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgataaaattaaagcgac 12653087  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  12653086 cggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaat 12653031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16419400 - 16419245
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||    ||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  16419400 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacaatcaagttaatagcatatgacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 16419301  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  16419300 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 16419245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 27097559 - 27097650
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27097559 aaaatgcctagagataatatgataaaatctaaatcaccaaaatatccatgttttcggatttgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaat 27097650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33110853 - 33110698
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  || || ||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  33110853 aaaacgtaaaggatgaatatgcaaataaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 33110754  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  33110753 cggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaat 33110698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 33740413 - 33740568
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||   |||| || |||||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  33740413 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacattatccaagttaatagcatataacggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtgac 33740512  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||    
T  33740513 cgaaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcttcgattgaat 33740568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Original strand, 32191646 - 32191748
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||| | ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| ||    
T  32191646 caaaatgcctacaaattgtatgataaaatctaaatcaccagaatgctcatgctttcggatatgcaacgttggcgtccaaatcattgattgaatatgtgat 32191745  T
Q  200 tga 202  Q
    |||    
T  32191746 tga 32191748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 143
Target Start/End: Original strand, 13546601 - 13546660
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  13546601 taatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaattctaagtcacctaaat 13546660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 155
Target Start/End: Original strand, 14846137 - 14846192
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  14846137 caaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttcc 14846192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 7875879 - 7876033
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |     
T  7875879 aaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaagtcacagcatccaagttaatagcatataactgcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgat 7875978  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7875979 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 7876033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25064478 - 25064324
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  ||||  |    
T  25064478 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgcc 25064379  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
     |  ||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  25064378 gggcatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaa 25064324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Original strand, 12059608 - 12059720
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctac-aaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||  |||| ||    
T  12059608 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataattcctacaaaaaaatatgataaaattaaagtgac 12059707  T
Q  138 cgaaatacccatg 150  Q
    || |||| |||||    
T  12059708 cggaatatccatg 12059720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 4984402 - 4984557
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| || | ||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |     
T  4984402 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacatcatctaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgat 4984501  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | |||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  4984502 cggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaat 4984557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Original strand, 33543561 - 33543612
Alignment:
Q  141 aatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33543561 aatacccatgcttccggatctgcaacattgacacccaaatttttgattgaat 33543612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 31575442 - 31575529
Alignment:
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtga 206  Q
    |||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || | ||||| || ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31575442 atatgataaaatc--agtgacccaaatacccacgcattcagatttgtaacattgacactcaaattatcgattgaatttgtaattgagtga 31575529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 6957330 - 6957209
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  | |||| ||||  || |  |||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||     
T  6957330 caacggcaaaatgcctacaaatcatgtgataaaatataagtcattggaatatccatattttcgaatctacaacgttgatgcctaaatcattgattgaatc 6957231  T
Q  194 tgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||| ||||| ||| ||| ||||    
T  6957230 tgttattgactgaagtcgatct 6957209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17334995 - 17334846
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  17334995 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 17334896  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattga 186  Q
     | |||| ||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  17334895 tggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacacccaaatctttga 17334846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8266799 - 8266717
Alignment:
Q  110 acaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |  | ||||||| ||| ||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8266799 acaaataatatgataaaattaaagtgattggaatacccttgcctccgggtctacaatgttgacgcccaaatcattgattgaat 8266717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 192
Target Start/End: Original strand, 28635065 - 28635111
Alignment:
Q  146 ccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28635065 ccatgcctccggatctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaat 28635111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12166002 - 12165926
Alignment:
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  12166002 atatgataaaattaaagtgaccggaatatccatagcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaat 12165926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 128
Target Start/End: Original strand, 30879594 - 30879662
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  30879594 cgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacaaaataccaataaataatatgataaaat 30879662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34945648 - 34945456
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  34945648 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctataaata 34945549  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  34945548 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 34945456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13007484 - 13007292
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  13007484 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 13007385  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13007384 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 13007292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38598052 - 38597860
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  38598052 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 38597953  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  38597952 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 38597860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 24229617 - 24229809
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  24229617 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 24229716  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24229717 atatgataaaacctaagtcacagaaatatccatgctaccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 24229809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 13422188 - 13421990
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||  |||||||||||| |||    
T  13422188 acatcatatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacatata 13422089  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  13422088 atatgataaaatataagtcaccgaaatacacatgcttcagaatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgtcgatct 13421990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 9113558 - 9113750
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  9113558 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcagaacacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctacaaata 9113657  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9113658 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 9113750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 26877942 - 26878139
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| | | |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  26877942 acatcatatacaaacattggtaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagata-caacgacaaagtgcctacaaata 26878040  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||    
T  26878041 atatgataaaatctaagtcaccaaaatacccatgcttctggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatatctaattgactgatgtcgatct 26878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 11976768 - 11976959
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||||||||    
T  11976768 acatcagatgcaaacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacataaaacgggaaaatgcctacaaata 11976867  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11976868 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccagatcttcaacgttcacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 11976959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 6011971 - 6012163
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  6011971 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcataaaacggtagaatgcctacaaata 6012070  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6012071 atatgatcaaacttaagtcactgaaatacccatgcttccggatctacaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 6012163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6217117 - 6216961
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgaca-aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgct 152  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6217117 aatctgcgaacaaactcacagcactcaagttaatagcatacaatgacttaaatgcctacaaataatatgataaaatttaagtcaccgaaatacacatgct 6217018  T
Q  153 tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6217017 tccgaatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgt 6216961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25980410 - 25980221
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  25980410 atcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaataat 25980311  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  25980310 atgataaaacttaagtca-cgaaatacccatgcttccgaatctgcaactttgacgcccaaatcattggttgaatttgtagttgactgatgt 25980221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 61 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 41630713 - 41630559
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||     
T  41630713 gaacaaactcacaacacctaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaagtcacggaaatacacatgcttctggatg 41630614  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  41630613 tgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgaagtcgatct 41630559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 14082229 - 14082414
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | |||| |||||||||||| || || | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14082229 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcccatcatcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 14082328  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  14082329 atatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttggttggatttgtaattga 14082414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 28540776 - 28540923
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28540776 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggaaaaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccaaaatacccatgctt 28540875  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28540876 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 28540923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 14726294 - 14726485
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||  |   ||||||||||||||||||||||    
T  14726294 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacagcatccaagttaatattataaaacgacaaaatgcctacaaata 14726393  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  14726394 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtgattgactgatg 14726485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 10723016 - 10722818
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||||||||| | | ||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||| ||  || ||  ||||||||||||||||    
T  10723016 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaataacatacagcggaaaaatgcctacaaata 10722917  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| ||||    
T  10722916 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttttggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttttaaatgactgaagtcgatct 10722818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26825683 - 26825493
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  26825683 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 26825584  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||   |||||||||| |   ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26825583 atgataaaacttaagtcaccgaaataaacatgcttatggatctgcaacgtaatcgtacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 26825493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 38007612 - 38007422
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  38007612 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatatgtgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaagg-caaaatgcctacaaata 38007514  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  38007513 atatgataaaacctaattcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgtccaaatcattggttaaatttgtaattgactgatg 38007422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Original strand, 2979161 - 2979323
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2979161 aaaatgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcacaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcacc 2979260  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
      ||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2979261 agaatacccgtgcttctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 2979323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Original strand, 19103322 - 19103484
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  19103322 aaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcatagcaccaaagttaatagcatacaacggaaaaatgcctataaataatatgatgaaatctaaatcacc 19103421  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    | ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19103422 ggaatactcatgcttctggatctgcaatattgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 19103484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 208
Target Start/End: Original strand, 31391628 - 31391777
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  31391628 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacatataatatgataaaacctaagtcaccgaaatactcatccttctgga 31391727  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31391728 tctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 31391777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7930384 - 7930234
Alignment:
Q  65 aaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgca 164  Q
    |||||||||||| ||| | |||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  7930384 aaactcacagcatccaggttaatggtatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagaaacctaaatactcatgcttccggatctgca 7930285  T
Q  165 acattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  7930284 acattgacgctcaaatcattggttgaatttgtaattgactgacgtcgatct 7930234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15571741 - 15571561
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaac-gacaaaatgcctacaaat 115  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| |||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |  |||||| ||| ||||    
T  15571741 acatcagatataaacatcact-aaaacgtaaaggacaaatctacgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaactggaaaaatgtctataaat 15571643  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgta 197  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15571642 aatatgataaaatttaagtcactgaactactcatgcttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattgattgaatttgta 15571561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14211445 - 14211298
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  14211445 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacagaaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgctt 14211346  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14211345 ctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgcatttgtgattg 14211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35851050 - 35850863
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||  | |||||||||||  ||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||| ||||||||    
T  35851050 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatttgtgaacaaactca--gcacccaagttaatagcataaaacggcaaagtgcctgcaaataat 35850953  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35850952 atgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttctggatcttcaacgttgacgcacaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 35850863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39567482 - 39567341
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||  |||    
T  39567482 cgaacaaactcacaacacccaaggtaataacatacaacgacaaaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgtttctggat 39567383  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39567382 ctgcaatgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattg 39567341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 208
Target Start/End: Original strand, 8096336 - 8096521
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatg 121  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || | ||||||||||||||||||||||    
T  8096336 agatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaataatatg 8096435  T
Q  122 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||| |||| |||| ||||| | ||||  ||| | |||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8096436 ataaaacctaaatcactgaaat-cacatggctccggttctgcaatgttgacgctcaaatcattggttgaaattgtaattgattgatg 8096521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7036391 - 7036276
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7036391 caaaattcctacaaacaatatgataaaatctaagtcctcgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcatagattcaatttgtaat 7036292  T
Q  200 tgagtgatgtccatct 215  Q
    ||| | ||||| ||||    
T  7036291 tgacttatgtcgatct 7036276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 8088067 - 8088230
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8088067 aaaaggtaaaagatgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaatagcatacaaaggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 8088166  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | || ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8088167 agaatactcttgtttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 8088230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1409676 - 1409555
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1409676 caacggcaaaatatcttcaaataatatgattaaatctaagtcactaaaatattcatgttttcggatctgcaacattgacgcataaatcattgattgaatt 1409577  T
Q  194 tgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||| ||||||| ||||    
T  1409576 tgtaattgattgatgtcgatct 1409555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19121145 - 19120982
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||  ||||| ||  |||   ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19121145 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatatcatacaagagcaaaacgtctacaaataatatgataaaacctaagtcacc 19121046  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||  |||| ||| ||||||||| | |||||||  || |||||||| ||||||||||||||    
T  19121045 gaaatattcatgtttctagatctgcagcgttgacgcttaagtcattgatagaatttgtaattga 19120982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 35920896 - 35921014
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||| | |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||    
T  35920896 taatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatcaaaatcactagaatatcgatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcat 35920995  T
Q  184 tgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  35920996 tgattgaatctgtgattga 35921014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 19259637 - 19259802
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  19259637 aacatcgctaaaaacgtaaagaataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 19259736  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||| |||| |||| || |   |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19259737 ttaaagtgaccggaatatccatggcctttggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 19259802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43148971 - 43148822
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  43148971 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 43148872  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattga 186  Q
    || |||| |||| || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  43148871 cggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgaggtccaaatctttga 43148822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7247203 - 7247051
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  7247203 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 7247104  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattg 189  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  7247103 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattg 7247051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 7150170 - 7150325
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  7150170 aaaacgtaaagaacaaatctgcgaacaaactcacagcatccaaattaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 7150269  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  7150270 cgaaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 7150325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 166
Target Start/End: Original strand, 10332392 - 10332530
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  10332392 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataaagacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 10332491  T
Q  129 ct-aagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaac 166  Q
    || || ||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10332492 ctaaaatcatcagaatactcatgcttccggatctgcaac 10332530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 11867876 - 11867750
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    ||||| || |||| |||||||| ||||||  ||||||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  11867876 taaagaatgaatctgcgaacaagctcacaatacccaaattaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatataataaaatctaagtaacagaaata 11867777  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattga 171  Q
    |||||| ||   |||||||||| ||||    
T  11867776 cccatgtttttggatctgcaacgttga 11867750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 20257521 - 20257685
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  20257521 aacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 20257620  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  20257621 ttaaagtgaccggaatacccacgtttccggatctacaacgttgacgcgcaaatctttgattgaat 20257685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16981536 - 16981379
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata---atatgataaaatctaagtc 135  Q
    |||| |||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||| | |||||||||||| |   ||||||||||||  |||||    
T  16981536 aaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgatataatgcctacaaaaatatatatgataaaattaaagtc 16981437  T
Q  136 accgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||| |||| ||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16981436 accggaatatccatgacctccggatctgcaacgatgacgcccaaatctttgattgaat 16981379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 27266694 - 27266849
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  27266694 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 27266793  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  27266794 cggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaat 27266849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 198
Target Start/End: Original strand, 37985968 - 37986127
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||| ||| |||| || |||||||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  37985968 aaaacgtaaaagatgaatctgcaaacaaactcacatcattcaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaataatgtgataaattctaagtcact 37986067  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
     ||||||| ||  |||  || ||| ||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  37986068 aaaatacctataattctggacctgtaacttcgacactcaaatcattgattgaatctgtaa 37986127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 41184275 - 41184430
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || ||||||  |||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  41184275 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgccggcaaaaatatatgataaaattaaagtgac 41184374  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     | |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41184375 tggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 41184430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 7242028 - 7241875
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtc-a 136  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||| |    
T  7242028 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaa 7241929  T
Q  137 ccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattg 189  Q
    ||| |||| |||| || ||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  7241928 ccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattg 7241875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11768253 - 11768091
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | |||||||||||    
T  11768253 aacatcgctaaaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagataatagcatataacggcataatggctacaaaaatatatgataaaa 11768154  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||  |||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11768153 ttaaagtgaccataatac--atgcctccagatttgcaacattgacgctcaaatctttgattgaat 11768091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 19280787 - 19280935
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||| |||    
T  19280787 taaatgataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacg-cataatgcctacaaaaatatatgataatattaaagtcaccggaat 19280885  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  19280886 atccatagcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 19280935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 21060118 - 21060273
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||| ||||||| || ||||| | |||| |   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  21060118 aaaacgtaaaggatgaatctacgaacatactcacaacatccaagttgatagaatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 21060217  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21060218 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 21060273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 209
Target Start/End: Original strand, 11073855 - 11073925
Alignment:
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11073855 gaaatacccatgctttcggatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 11073925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11192557 - 11192459
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  |||| | |||||||| |||| |||| ||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  11192557 caacgacaaaatgcttacaaataatacgataaatttaaagtgatcgaaatactcatgtttccggatctacaacgttgacacccaaatcatttattgaat 11192459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 3271237 - 3271388
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||||||||   ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |     
T  3271237 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcataacatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaagtgat 3271336  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  3271337 cggaatatccatggtctcctgatctgcaacgttgacgtccaaatctttgatt 3271388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4954236 - 4954081
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| || | ||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  4954236 aaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacaacatcaaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 4954137  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  ||| || |||  ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4954136 cggaatattcatggcctccgaatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 4954081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26578432 - 26578342
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26578432 aatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatattcattgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatctttgattgaa 26578342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38711872 - 38711764
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||  |||||||||  |||| |||||||  | |||||||| ||||||||| |||||| |||     
T  38711872 caacgacaaaatacctacgaacaatatgataaaattaaagtagccgaaatacttatgcctccagattagtaacattgaagcccaaatctttgattaaata 38711773  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    | |||||||    
T  38711772 tataattga 38711764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28235832 - 28235674
Alignment:
Q  38 taaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagc--aagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagt 134  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||  |   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||    
T  28235832 taaaatgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagt 28235733  T
Q  135 caccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     | ||||||| |||| || ||||||||| || | ||||||||  |||| ||||||||||    
T  28235732 gatcgaaatatccatggcctccagatctacatctttgacgcctgaatctttgattgaat 28235674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30298387 - 30298296
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||  ||| |||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30298387 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtggccggaatatccatggcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 30298296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 8984845 - 8984915
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  8984845 gtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagtatataacgacaaaatgcctacaaa 8984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 61 - 134
Target Start/End: Original strand, 9762330 - 9762403
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagt 134  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9762330 gaacaaactcataacatccaagttaatagctaacaacgacaaagtgtctacaaataatataataaaatcaaagt 9762403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13468784 - 13468688
Alignment:
Q  96 acgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| | | ||||||  ||| ||||  ||||||||| ||||| | | |||||||||||||||    
T  13468784 acgacaaaatgcctacacataatatgataaaactaaagtgatcaaaatactgatgtttccgaatctgcaacgttgacactcgaatcattgattgaat 13468688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 15571141 - 15571061
Alignment:
Q  49 ggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 128  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15571141 ggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaat 15571061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30299088 - 30298948
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| | || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  30299088 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacatactcagaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 30298989  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgccca 177  Q
    |  |||| |||| || |||||||||||||  ||||||||||    
T  30298988 cagaatatccatggcatccagatctgcaatgttgacgccca 30298948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10649824 - 10649733
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  10649824 aatgcctacaaaaacatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaat 10649733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 35475173 - 35475328
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||   |||||| ||||||| || ||||| ||||||||   ||||||   ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  35475173 aaaacgtaaaggatgaatatacgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacgacgttatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 35475272  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     | |||| ||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35475273 tggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 35475328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 192
Target Start/End: Original strand, 19100533 - 19100627
Alignment:
Q  98 gacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| || | ||||| ||||  |  ||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||    
T  19100533 gacaaaatgtctacaaataatatgataaaattaaagtgactggaatactcatgtcttaagatctggaacgttgatgttcaaatcattgattgaat 19100627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42580053 - 42579977
Alignment:
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||  |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  42580053 atatgataaaattaaagtgaccggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 42579977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32766790 - 32766598
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||| | |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32766790 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgcaaagggtgaatctgagaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 32766691  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32766690 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 32766598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 56040479 - 56040671
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  56040479 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 56040578  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  56040579 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgccgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 56040671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2521054 - 2520863
Alignment:
Q  18 catcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  2521054 catcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataa 2520955  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  2520954 tacgataaaatctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgctttaatttgtaattgattgatgt 2520863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 19853345 - 19853537
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||    
T  19853345 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctagaaata 19853444  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19853445 atatgataaaacttaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgagtgatgt 19853537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 24098902 - 24099092
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  24098902 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaagagtggatctgcgaacaaactcacagcacc-aagttaatagcat-caacggcaaaatgcctacaaata 24098999  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24099000 atatgataaaacctaagtcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 24099092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22611437 - 22611267
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22611437 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaatttaataccatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcacc 22611338  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22611337 gaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 22611267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43510472 - 43510290
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  43510472 acatcaaatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatgacatacaacgacaaaatgcctacaaata 43510373  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  43510372 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttcaggatctgcaacattgacgtccaaatcattagtttaatttgtaat 43510290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21686075 - 21686267
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || || |||||||||||||||||    
T  21686075 acatcagatacaaacatcgctacaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacatacagcggcaaaatgcctacaaata 21686174  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  21686175 atatgataaaacctaaatcaccaaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaactgattgatgt 21686267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 53811295 - 53811112
Alignment:
Q  25 tacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgata 124  Q
    |||| |||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53811295 tacatacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaa-ctcacaacacccaagttaatagcatacaacgccaaaatgcctacaaataatatgata 53811197  T
Q  125 aaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  53811196 aaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 53811112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10496583 - 10496420
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10496583 taaaggatgaatctgcgaacaaactcaaagcacccaagttaatagcatacgacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaactcaccgaaata 10496484  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10496483 cccatgcttacggatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 10496420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13634391 - 13634199
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||  |||||||||    
T  13634391 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctccgaacaaattcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaataactacaaata 13634292  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13634291 ataagataaaacctaaatcactgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttgcttgaatttgtaattgattgatgt 13634199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21662713 - 21662521
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||| | | || | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||  |||| || |||||||||    
T  21662713 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21662614  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21662613 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgt 21662521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21671477 - 21671285
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||| | | || | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||||  |||| || |||||||||    
T  21671477 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaaactgcgaacaacctcacaacactcaagttaatagcatacaacaccaaagtgtctacaaata 21671378  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21671377 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattggatttgtaattgactgatgt 21671285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 26633504 - 26633696
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||  |||||  |||||||||| |  ||    
T  26633504 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagctaatagcatacaacggtaaaatgcctatattta 26633603  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  26633604 atatgataaaacctaagtcacagaaatattcatgcttccggatctgcaacattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatcgactgatgt 26633696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 53444351 - 53444203
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  53444351 cgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggaaaaatatctacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggat 53444252  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  53444251 cttcaacattgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 53444203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 17949158 - 17949349
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaa-tgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| |||| ||||    
T  17949158 atcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataa 17949257  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17949258 tatgataaaacctaagtcatcaaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 17949349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 17953010 - 17953201
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaa-tgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||  ||||||||| |||| ||||    
T  17953010 atcagatacaaacatcgctaaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaagaacaaaatgcatacatataa 17953109  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17953110 tatgataaaacctaagtcatcaaaatacccattcttccggatctgcaacgttgacgctccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 17953201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33921288 - 33921151
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  33921288 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaactatacaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcactgaaatacccatgcttccgga 33921189  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33921188 tctgcaacgttgacgctcaaattattgattgaatttgt 33921151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35348583 - 35348398
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||   || | |||||||||||||||||    
T  35348583 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaata 35348484  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  35348483 atatgataaaacctaagtcattgaaattcacatgcttccggatctgcaacgttgacatccagatcattggttgaatttgtaattga 35348398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 47320267 - 47320435
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  47320267 aaaacgtaaagaatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 47320366  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  47320367 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattgactgat 47320435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45418748 - 45418609
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcac--ccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcca 156  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |     
T  45418748 gcgaacaaactcacaacacacccatgttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatactagtgctttcg 45418649  T
Q  157 gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45418648 gatctgcaacgttgatgcccaaatcattgattgaatttgt 45418609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 10258734 - 10258927
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||  ||| | |||     ||||  ||||||| |||||||||    
T  10258734 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaggataaatctatgaacaaactcacaacactaaagttcata-----caacagcaaaatgtctacaaata 10258828  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  10258829 atatgataaaatctaagtcaccaaaatattcatgcttccgggtatgcaacgttggcgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactaatgtcgatct 10258927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43095904 - 43095706
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||| ||||||  || |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||  |||| ||||||| |||||||||     
T  43095904 acatcagatataaacatccctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaaattaatagcatacaactacaaaatacctacaaatg 43095805  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  43095804 atatgataaaatctaagtcagtgaaattctcatgcttccggatctgcactgttgacggccaaatcattgatttaacttgtaattgactgatgtcgatct 43095706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 9178587 - 9178431
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||   ||||||||||    
T  9178587 gcgaacaaactcacgtcacacaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaaccgaagtctctgaaatacttttgcttccaga 9178488  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  9178487 tctgcaacgttgatgctcaaattattgattggatttgtaattgattgatgtcgatct 9178431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 54022133 - 54021938
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||  || ||||  |||||||| ||| | ||  |||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||    
T  54022133 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaataatgaatctacgaacaaattcataacattcaagttaataacatacaacgacaaa-tgtctacaaataat 54022035  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54022034 atgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgttttcggatctgcaacgttgacatccaaatcattgattcaatttgtaattgactgatgtcgatct 54021938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 56156512 - 56156667
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||||   |||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | |||||||    
T  56156512 aatctgcgaacaaactcacaacacccaggtaaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataaattgataaaacataagtcaccgaaattcacatgctt 56156611  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  56156612 ccagatctgcaatgttgacgccccaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 56156667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 29120279 - 29120375
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29120279 taatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagttaccgaaatactcatgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaat 29120375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 26090745 - 26090945
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||| |  |||||| |||||||| ||||  ||||||||  ||||||||| ||  || ||||||||    
T  26090745 atcagatacaaacaacgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtaaacaaattcacagcatccaaattaatagcatacaacgacaatatatctgcaaataat 26090844  T
Q  119 atgataaaat----ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatc 214  Q
    ||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||  || |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  26090845 atgataaaatatatctaagtcaccgaaataccaatgcttccgaatttgcaacgttgacgcccaaatcattagttgaatttataattgactgatgtcgatc 26090944  T
Q  215 t 215  Q
    |    
T  26090945 t 26090945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Original strand, 31891162 - 31891304
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||| ||||||||  ||    
T  31891162 gcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatataatgaaatctaaatcaccagaatactcatgcttctgga 31891261  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    | |||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  31891262 tttgcaacgttgacgcccaaatcatggtttgaatttgtgattg 31891304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 209
Target Start/End: Original strand, 4142662 - 4142777
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  4142662 caacggcaaaatgtctacaaataatatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatt 4142761  T
Q  194 tgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4142762 tgtaattgactgatgt 4142777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9048920 - 9048761
Alignment:
Q  37 ttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtca 136  Q
    |||||| ||||||| | |||| |  |||||||||||| |||||||| | ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9048920 ttaaaacgtaaagggtgaatctgtaaacaaactcacaacacccaagtttatagcacatgacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatttaaatca 9048821  T
Q  137 ccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
     |  |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9048820 tcagaatacccatgttttcagatttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgt 9048761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 29960819 - 29960974
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||   ||| ||    
T  29960819 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaaaagcatacaacggcaaaatgcctacaaatagtatgataaaatctaaatcactaaaatatttatgttt 29960918  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    || |||||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||| ||||||| ||||||    
T  29960919 ccggatctgcaacgttgatgccaaaatcatcggttgaatttataattgattgatgt 29960974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 36194947 - 36194801
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||    
T  36194947 aatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgttt 36194848  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36194847 ctggatctgcaactttgatg-tcaaatcattgattgaatttgtgattg 36194801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 48257465 - 48257628
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||    
T  48257465 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaaaatccaagttaatagcatacaacggcaaaatacctacaaata 48257564  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||| || | |||||| ||| |||||| ||||||    
T  48257565 atatgataaaactcaagtcaccgaaatacccatgttttcggatctgtaacgttgacgtccaaat 48257628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27652197 - 27652036
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||     
T  27652197 aaaacgtataggatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatgaaatctaa-acact 27652099  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
      ||||||||||||||  |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27652098 agaatacccatgcttctggatctgcaacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattg 27652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36700475 - 36700377
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36700475 caacgacaaaatgcttttaaataatatgataaaatttaagtcatcgaaatacccacgcttccagatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaat 36700377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 27 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 8670751 - 8670570
Alignment:
Q  27 caaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaa 126  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| | | |||| |||||  |||||||| || ||||| |||| |||   || | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8670751 caaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaaagaactcacaacagccaagttaattgcacaaaatggcaaaatgccttcaaataatatgataaa 8670652  T
Q  127 atctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
      ||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  8670651 tcctaagtcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 8670570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9714144 - 9714004
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||| | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||   | |||||||||    
T  9714144 gcgaacaaactcacaacactcaagttaacaacatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaattcactagaata--tacgcttccaga 9714047  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9714046 tctgcaacgttgacgcccaaatcgttgattgaatttgtgattg 9714004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Original strand, 51888086 - 51888229
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||    
T  51888086 gcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaatggcaaaacgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatactcatgctttcaga 51888185  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | |||||| || ||  | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  51888186 tatgcaacgttaacatcaaaatcattgattaaatttgtgattga 51888229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 36161943 - 36161802
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| || | ||||    
T  36161943 gaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacgaccaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacgaaaatactcatgttttcggatc 36161844  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    || ||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  36161843 tgtaacgttggcgtccaaatcattgattgaatatgtgattga 36161802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 52060833 - 52060941
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  52060833 caacaacaaaatgcctacaaaaaatatgataaattcaaagtcattgaaatatccatgcttctagatctacaacatcaacgcccaaatcattgattgaatc 52060932  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    |||||||||    
T  52060933 tgtaattga 52060941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 52944526 - 52944402
Alignment:
Q  78 ccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgccca 177  Q
    ||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  52944526 ccaagttaatagcatataactacaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtcca 52944427  T
Q  178 aatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||    
T  52944426 aatcatcgattgaatctgtgattga 52944402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 43853707 - 43853549
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43853707 aacatcgctaaaaatgtaaatggttaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaatgctgacaaataatatgataaaat 43853608  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgat 187  Q
    |||| ||| |  ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  43853607 ctaaatcatcttaatacgcatgcttccgaatctgcaacgttgacgtacaaatcattgat 43853549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44596899 - 44596756
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  44596899 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatagctacaaataatatgataaaatgtaaatcatcgaaatacctatgttt 44596800  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
     |  ||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  44596799 tcgaatcagcaacgttgacgtc--aatcattgattgaatttgtaat 44596756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 9528712 - 9528867
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  9528712 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacattcaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 9528811  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9528812 cggaatatccatgacctccagatctgcaacgttgacggccaaatctttgattgaat 9528867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 22038719 - 22038820
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||| ||| |||    
T  22038719 aaaatgcctacaaatattatgataaaatttaaatcaccgaaatacacatgcttctggatctgcaacattgatgtcaaaatcatttattgaatatgtgatt 22038818  T
Q  201 ga 202  Q
    ||    
T  22038819 ga 22038820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37030493 - 37030352
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||  ||| | | ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||   ||||    
T  37030493 gaacaaatttacagcacccaagttaatagcatacaatggctaaatgtctacaaataatatgataatttctaagtcactgaaatacccatgtttttcgatc 37030394  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| | || | |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  37030393 tgcaacgtcgatgtccaaatcattgattgaatctgtatttga 37030352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Original strand, 6155081 - 6155233
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacag---cacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaa 141  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  6155081 taaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatagaatctaaatcaccaga 6155180  T
Q  142 ataccca---tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||| | |   ||||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |||||||    
T  6155181 atatctatgttgcttccggatctgcaacgtttacgtctaaatcatcgattgaa 6155233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 143
Target Start/End: Original strand, 11299865 - 11299969
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  11299865 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacataaaacgccaaaatgcctacgaataatatgataaaacataagtcacc 11299964  T
Q  139 gaaat 143  Q
    |||||    
T  11299965 gaaat 11299969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18936013 - 18935881
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |   |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||   |||||    
T  18936013 aacaaactcacaacacccaagttaataacgtacaatagcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacctatgcttttggatct 18935914  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  18935913 gcaacgttgatgcccaaatcattaattgaattt 18935881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 37465713 - 37465637
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37465713 aacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttacaaataatatgataaaatctaaatcacc 37465637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Original strand, 48351096 - 48351204
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| | ||||||     
T  48351096 caacgacaaaatgcatacaaataacatgatacaatctaaatcaccgtaatactcatgcttccagatctgcaacgcggacgtccaaatcataggttgaata 48351195  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    ||| |||||    
T  48351196 tgtgattga 48351204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 36184762 - 36184632
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||  ||||   |||| ||| |||||    
T  36184762 aacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctagaaatagtatgataaaatcaaagtgaccataatatttatgcctcctgatct 36184663  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     |||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  36184662 acaacgttgacaccaaaatcattgattgaat 36184632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 51318239 - 51318085
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  51318239 aaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 51318140  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  51318139 cggaatatccatgacctccggatctgcaacgttgacgcccaaattgttgattgaa 51318085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 28857665 - 28857493
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||   || | |||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  28857665 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagctgccaagttaatagcatataagggcaaaatacctacaaaaaatatgatgaaat 28857566  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| ||||| | | | |||||||||| |||||| ||| ||| || |||||||||  ||||||| ||| |||||    
T  28857565 ctaaatcacc-agaaaaccatgcttccggatctgaaacgttggcgtccaaatcatcaattgaatatgtgattga 28857493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 201
Target Start/End: Original strand, 33332485 - 33332586
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  33332485 caaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaatgcccattcttttggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgat 33332584  T
Q  200 tg 201  Q
    ||    
T  33332585 tg 33332586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 198
Target Start/End: Original strand, 12199564 - 12199707
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | |||||||    
T  12199564 aatctgcgaacaaactcacaacacccaag-taataacatacaacagtaaaatacctacaaataatatgataaattctaagtcgccaaaattctcatgctt 12199662  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    ||  ||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  12199663 ccgaatctgtaacgtcgacgctcaaatctttgattgaatctgtaa 12199707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 192
Target Start/End: Original strand, 37188441 - 37188585
Alignment:
Q  50 gataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctac-aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaataccca 148  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||   || |||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| || | |||| |||    
T  37188441 gataaatctgcgaacacactcacagcatccaagttaatagcatataatgacacaatgcctacaaaattatatgataaaattaaagtgacaggaatatcca 37188540  T
Q  149 t-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37188541 tggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 37188585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 192
Target Start/End: Original strand, 2069497 - 2069588
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  2069497 aaaatgcatacaaataatatgataaaatataaatcaccataatacccatgcttctaaatttgcaacgttgacacccaaataattgattgaat 2069588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6973064 - 6972909
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||||   |||| || ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  6973064 aaaatgtgaaggatgaatctgtgaacaaactcatagcatccaagttaatagcatataacggcataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 6972965  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6972964 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaacctttgattgaat 6972909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44947666 - 44947511
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  44947666 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaataacatataacggcacaatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 44947567  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44947566 cggaatatccatggccttcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 44947511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 53616485 - 53616639
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||| || ||||  |||| ||    
T  53616485 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatataatgaaattaaagtgac 53616584  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  53616585 cggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 53616639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Original strand, 2115429 - 2115577
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| || | |||    
T  2115429 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgactggaat 2115528  T
Q  144 accca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  2115529 atccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaa 2115577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 196
Target Start/End: Original strand, 36204303 - 36204391
Alignment:
Q  108 ctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  |   ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36204303 ctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaatattctctcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgt 36204391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 52978972 - 52978884
Alignment:
Q  65 aaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    ||||||||| || ||||| |||||  |  ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52978972 aaactcacaccatccaagttaataaaatacaatgacaaaataactacaaataatataataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 52978884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22806769 - 22806633
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||      |    
T  22806769 cgaacaaattcatagcatccaagttaataacatacaacaacaaaatgcttacaaataatatgataatatataagtcaccgaaatatttatgct------t 22806676  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22806675 ctacaacattgatgtccaaatcattgattgaatctataattga 22806633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25274137 - 25273982
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  25274137 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatctaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 25274038  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  25274037 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatttttgattgaat 25273982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 34024273 - 34024428
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||  || | ||    
T  34024273 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcttacaaaaatatatgataaaattaaaatgac 34024372  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34024373 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcgttgattgaat 34024428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 38706545 - 38706700
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  38706545 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 38706644  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||| || ||| ||| |||||| |||| ||||||||| | ||||||||    
T  38706645 cgaaatatccatggcctccggatttgcaacgttgatgcccaaatcttcgattgaat 38706700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 52097771 - 52097906
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| |||||| |||||    
T  52097771 gcgaataaactcacaacatccaagttaataccatataacgtcataatgcctacaaagatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatgcatccag 52097870  T
Q  158 atctgcaacattgac-gcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  52097871 atctgcaacgttgacggcccaaatctttgattgaat 52097906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Original strand, 18138769 - 18138891
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||  ||||    
T  18138769 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccag 18138868  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18138869 atctgcaacgttgacgcccaaat 18138891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Original strand, 22305516 - 22305582
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatac 145  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22305516 caagttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaagtcatcaaaatac 22305582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 35964831 - 35964965
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    |||||||| |||||| || ||||| ||||||||   ||| ||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||| || ||||||| ||||| ||| |    
T  35964831 gcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacaacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactgaaatactcatgcctccgg 35964930  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  35964931 atctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 35964965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 180
Target Start/End: Original strand, 49125982 - 49126104
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||| ||||  ||||    
T  49125982 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgactacaaaaatatatgataaaatttaagtgatcggaataccaatgcccccag 49126081  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  49126082 atctgcaacgttgacgcccaaat 49126104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4644122 - 4643957
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaa-ataatatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||   |||| || ||||||||||| |  |||||||||||    
T  4644122 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaagctcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaataatatatgataaaa 4644023  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  || | |||| ||||  |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4644022 ttaaattgaccggaatattcatgacctccggatctgcaactttgacgcccaaatctttgattgaat 4643957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 10389595 - 10389744
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||    
T  10389595 taaaggatgaatccacgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtgatcggaat 10389694  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | |||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  10389695 atccatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatcgttgattgaat 10389744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 138
Target Start/End: Original strand, 52933794 - 52933903
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||  |||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52933794 aacatcgctaaaaatgtaaagcgtaaatctgcgcacaaactcacatcactcaagttaataacatacaaaagcaaaatacctacaaataatatgataaaat 52933893  T
Q  129 ctaagtcacc 138  Q
    |||| |||||    
T  52933894 ctaaatcacc 52933903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 1621381 - 1621514
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||  |||||   ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||    ||    
T  1621381 aatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaattgcatacaacgg--aaatgtctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaataccc----tt 1621474  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1621475 ctggatctgcaacgtt-acgcccaaatcattgattgaattt 1621514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Original strand, 42032407 - 42032546
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| | | |||| ||||||||  |||||    
T  42032407 aacaaactcacaacattcaagttaatagcatacaacggcaaaatggctaccaataatatgataacatctaaatca-caagatactcatgcttctggatct 42032505  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     |||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  42032506 tcaacgttggcacccaaatcatttattgaatatgtgattga 42032546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 128
Target Start/End: Original strand, 21554651 - 21554734
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||  ||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21554651 taaaggatgaatatgcgaacaaactcattgcatccaagttaatagcaaacaagggcaaaatgcctacaaataataagataaaat 21554734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22301099 - 22300940
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgccta-caaataatatgataaaatctaagtcaccgaaa 142  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   | || |||||| ||||  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  22301099 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatatagcggcaaaatacctatgaaaaaatataatgaaatctaaatcaccaaaa 22301000  T
Q  143 tacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||| |||| || | |||||||||| | | || ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  22300999 tactcatgatttcggatctgcaacgtcggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 22300940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49410477 - 49410322
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  49410477 aaaacgtaaaggatgaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 49410378  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     | ||||  ||  || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  49410377 aggaatattcacggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 49410322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 56199350 - 56199215
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||     
T  56199350 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatgtaacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcat 56199251  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgac 172  Q
    || ||||  ||| |||| | |||||||||| |||||    
T  56199250 cggaatattcatggctttcggatctgcaacgttgac 56199215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9284165 - 9284011
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| ||||  |||||||||||||| || ||| | ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  9284165 aaaacgtaaaagatgaatctacgaacaaactcacaacatccatgataatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 9284066  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
     ||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  9284065 tgaaatattcattgcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 9284011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 10359403 - 10359537
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||| || | |||| |||||| || ||    
T  10359403 gcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaaataaagtgactggaatatccatgcctcaag 10359502  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  10359503 atctgcaacgttgatgcccaaatcttttattgaat 10359537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 47158456 - 47158317
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||| ||| |  ||||| ||| ||| |||||||    
T  47158456 aacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaacgataaagtgcatacaaataa-atgataatatctaaatcagcagaatactcatactttcagatct 47158358  T
Q  162 gcaacat--tgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  47158357 gcaa-atgatgacggccaaatcattgattgaatctgtgattg 47158317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51535424 - 51535352
Alignment:
Q  115 taatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  51535424 taatatgataaatt-taaatcaccaaaatacccatgcttatagatctgcaatattgacgcccaattcattgatt 51535352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 55228177 - 55228084
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgat 187  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||   || || ||||||| | ||| | |||| ||||||| ||||||||||||    
T  55228177 caacgacaaaatgtctacaaataatatgattaaatctaaatcacgagaacactcatgctttcggatatacaacgttgacgcgcaaatcattgat 55228084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23100870 - 23100778
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||    | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  23100870 caaaatgcctgcaaataatatgatacaattaaattgaccgaaatacccatgacatcggatctgcaactttgacactcaaatcattgattgaat 23100778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 76
Target Start/End: Original strand, 4142597 - 4142656
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagca 76  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  4142597 acatcaaatacaaacattgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagca 4142656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12493526 - 12493452
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagt 134  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12493526 cgaacaaactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatgagaaaatcaaagt 12493452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 37684096 - 37684018
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaa 132  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||| | | ||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  37684096 aatctgcgaataaactcacaacacctaggttaatagcacacaacgacaaaatgtcaacaaataatatgatataatctaa 37684018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 192
Target Start/End: Original strand, 43153870 - 43154004
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccag 157  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| |||| || ||| |    
T  43153870 cgaacaaactcacaacatccaagttaacagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatatccatggcctccgg 43153969  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  43153970 atctgtaacgttgacgctcaaatctttgattgaat 43154004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 137
Target Start/End: Original strand, 7008865 - 7008942
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7008865 cgaacgaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgtccacaaataatatgataaaatttaaatcac 7008942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 49680735 - 49680638
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||||||||| |  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  49680735 aacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccgaaatatcattgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaa 49680638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Original strand, 50766368 - 50766501
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaataccca-tgcttccag 157  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||| |||| ||| ||| ||| |    
T  50766368 cgaacaaactcacagcattcaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccgg 50766467  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  50766468 atctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaa 50766501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 9145746 - 9145898
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||| | | |||| |||||| |||||||| |||| ||  ||||||||  |||    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  9145746 aaaatgtaaaaggtgaatctgcgaacgaactcacaacacctaaattaatagcatacaaaagtaaaatgcctataaacaatatgatacaatctaaatcacc 9145845  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
      ||||| ||||||||| ||| |  ||| |||| | | |||||||||||||||    
T  9145846 agaatactcatgcttccggatatataacgttgatgtctaaatcattgattgaa 9145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 9645359 - 9645411
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9645359 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagca 9645411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26123474 - 26123362
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| ||||||||  |||| |||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||| |||    
T  26123474 caagttaatagcatacaacaacaatatatctacaaataatatgataaaattaaagtgacaataatactcatgcctccggatttgcaacattgacgcacaa 26123375  T
Q  179 atcattgattgaa 191  Q
     ||||| ||||||    
T  26123374 gtcattcattgaa 26123362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2624646 - 2624596
Alignment:
Q  141 aatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  2624646 aatacccatgct-ccagatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaat 2624596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14183991 - 14183901
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||| ||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14183991 aatgcctacaaaaaatttgataaaattaaagtgaccggaatatccatggtctccggttctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaat 14183901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 32952642 - 32952740
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||  || | |||| |||| |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  32952642 aacgacataatgcctacaaaaatataagataaaattaaattgaccggaatatccatgactccggacctgcaacattgacgctcaaatctttgattgaat 32952740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 11895036 - 11894991
Alignment:
Q  157 gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11895036 gatctgcaatattgtctcccaagtcattgattgaatttgtaattga 11894991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 29966580 - 29966528
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  29966580 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagca 29966528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 21533642 - 21533822
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21533642 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtaaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 21533741  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgta 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  21533742 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaattattggttgaatttgta 21533822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Original strand, 6954532 - 6954721
Alignment:
Q  20 tcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataata 119  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||     
T  6954532 tcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatt 6954631  T
Q  120 tgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6954632 tgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcagcattgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 6954721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 52922950 - 52923135
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  52922950 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcagccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctacaaata 52923049  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52923050 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattga 52923135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21313289 - 21313101
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  21313289 atcagatacaaacaccgctaaaaatgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatggctacaaataat 21313190  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21313189 atgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgatttcagatatgctacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgat 21313101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 48650567 - 48650758
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  48650567 acatcagatacaaatatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 48650666  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  48650667 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcattctttcagatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatttgtaattgattgatg 48650758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 45568278 - 45568470
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  45568278 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 45568377  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  45568378 atatgataaaacctaaatcacccaaatatccatgcttccggatctgcaaagttgacgtccaaatcattgtttgaatttgtaattgattgatgt 45568470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 46304354 - 46304545
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||    
T  46304354 acatcagatacaaacat-gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacggcaacatgcctacatata 46304452  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46304453 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaatgttgacgcctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 46304545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9998722 - 9998530
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  9998722 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 9998623  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |   ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9998622 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttctggatctgcaacgtcatcgtgcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 9998530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 32701746 - 32701562
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||||| ||||||||||||| |||    
T  32701746 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaaaggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttcatagcatacaacggcaaaatgcctacagata 32701647  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32701646 atatcataaaacttaagtcgccgaaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 32701562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 20464805 - 20464988
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||   ||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||    
T  20464805 atcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagagcaaatctgcgaacaaactcatatcacacaagttaatagcatacgacgacaaaatgcacacaaataat 20464904  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20464905 atgataaaatttaagtcaccgaaatactcatgctttcaaatctgcaacattgacgcccaaatcatttattgaatttgtaattga 20464988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21431870 - 21431676
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacata--gcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    |||||||||||||||| |  ||| |||| ||||| | | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  21431870 acatcagatacaaacacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaatctcacagcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaa 21431771  T
Q  115 taatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21431770 taatatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcgttggttgaatttgtaattgactgatgt 21431676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54149246 - 54149064
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | || | |||||| |||||||| |||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  54149246 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaacctgcgaactaactcacatcacccaggttaatagcatacaacgacataatgcctacaaata 54149147  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  54149146 atatgataaaatccaagtcaccgaaatagccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtgaaatttgtaat 54149064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10229729 - 10229539
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  10229729 atcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataat 10229630  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  |||||||   |||||||||| ||  || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10229629 atgataaaacttaagtcaccgaaataatcatgcttttggatctgcaacgttatcgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 10229539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33580135 - 33579937
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||||||  || |||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  33580135 acatcaaatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 33580036  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33580035 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacgtgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 33579937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 9797367 - 9797559
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||||||| | |||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9797367 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatatacaaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 9797466  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9797467 atatgataaaacataaatcacttaaatacccatgcttccggatctgcaacgttaacgttcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 9797559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10108491 - 10108299
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  10108491 acatcaaatacaaacatagctaaaaacgtaaagggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10108392  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||  ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10108391 atatgataaaacttaagtcgccgaaatactcatgcatctggatctgcaacgttatcgttcaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 10108299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 51303513 - 51303660
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  51303513 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgctt 51303612  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51303613 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 51303660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16235659 - 16235497
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  16235659 aaaacgtatagggtaaatctgcgaacaaactcacaccatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaagtaatatgatgaaatctaaatcacc 16235560  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
      ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16235559 agaatacccatgcttcttgatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 16235497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 36461270 - 36461456
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||       |||||||| |||||||||    
T  36461270 acattagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatctgctaacaaactcacagcactcaagttaatagcat------acaaaatggctacaaata 36461363  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36461364 atatgataaaacctaaatcgccgaaatactcatgcttccagatctgtaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 36461456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 43488424 - 43488608
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||| |||||    
T  43488424 acattagatacaaacatcgct-aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaatagcatacaacggcaaaaagcctaaaaata 43488522  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||    
T  43488523 atatgataaaacctaaatcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgttcaaatcattgcttgaatttataattga 43488608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 40556957 - 40556765
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  40556957 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagtgcatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 40556858  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40556857 atatgataaaacttaagtcaccaaaatacacatgcttccggatttacaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 40556765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38546051 - 38545856
Alignment:
Q  20 tcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataata 119  Q
    ||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| | |||||||||| || |||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  38546051 tcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcccaccacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataata 38545952  T
Q  120 tgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| |||||||||| |||| | |||| || | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  38545951 tgataaaacctaagtcacctaaattcgcatgttttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 38545856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 4711737 - 4711583
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || ||||  |||||||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4711737 acatcagatacaaacatcactaaaaacataaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 4711638  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattga 171  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4711637 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttga 4711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19339403 - 19339246
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    ||||| ||| |||| | ||||||||| | || ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19339403 gtaaaagatgaatctgagaacaaacttaaagtacccaagttaataacatacaacgacaaaatgcctacagataatatgataaaatctaagtcac-gaaat 19339305  T
Q  144 acccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19339304 acccatgcttctggatctgcaacattgacacctaaatcattgattgaatttgtaattga 19339246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10233325 - 10233133
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| | |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  10233325 acatcaaatacaaacatagataaaaacataaagggtgaatgtacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 10233226  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||  || | ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10233225 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgtttctggatctgcaacgttatcgtctaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 10233133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 40 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42460981 - 42460825
Alignment:
Q  40 aaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccg 139  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42460981 aaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagtacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacca 42460882  T
Q  140 aaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
     |||   ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42460881 gaatgttcatgcttctgtatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgt 42460825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51923940 - 51923804
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  ||    
T  51923940 gcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttctgga 51923841  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttg 195  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51923840 tctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttg 51923804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 12149616 - 12149815
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcg-gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||   | |||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||| | |    
T  12149616 acatctgatacaagcatagctaaaaacgtaaaggattcattttgggaacaaactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgatt 12149715  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  12149716 aatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatct 12149815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 21289684 - 21289831
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||  |||| ||||||||    
T  21289684 aatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaattaccagaatatccatgctt 21289783  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  21289784 ctagatctgcaacgttgacaccaaaatcattgattgaatttgtgattg 21289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Original strand, 23799789 - 23799928
Alignment:
Q  63 acaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctg 162  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | ||||||    
T  23799789 acaaactcacaacacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcattgaaatactcatgttttcggatctg 23799888  T
Q  163 caacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23799889 caacgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtaattga 23799928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 37041023 - 37040826
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   || |||||||||| ||||| ||    
T  37041023 acatcagatacaaaaatcgctagaaacgtaaagggtaaaactgcgaacaaactcacagcacccaagttaataacataaaatgacaaaatgc-tacaacta 37040925  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| ||||    
T  37040924 atatgattaaatctaagtcaccgaaatactcatgtttctagatcggcaacattcacacccaaatcattgattggatttataattgaccgatgtcaatct 37040826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 40487578 - 40487400
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||||  | |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||    
T  40487578 atcagatacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaataat 40487479  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgta 197  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  40487478 atgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggctgaatttgta 40487400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7448751 - 7448939
Alignment:
Q  21 cagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  || || ||||||| |||||||||||||    
T  7448751 cagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatat 7448850  T
Q  121 gataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7448851 gatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 7448939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7456893 - 7457081
Alignment:
Q  21 cagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat 120  Q
    |||||| |||||| | | |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  || || ||||||| |||||||||||||    
T  7456893 cagatataaacatcgataaaaacgtaaatggtgaatctgcgaacaaactcacatcacctaagttaatagcatacagcggcaaaatgtctacaaataatat 7456992  T
Q  121 gataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7456993 gatgaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatatgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 7457081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8914930 - 8914783
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| ||| |||    
T  8914930 aatctgcgaacaaactcacatcactcaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacacattctt 8914831  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8914830 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 8914783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 12050503 - 12050666
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||| | |||  |||||||||||||||  |  |||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12050503 aaaatgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacactattcaagttaataacatacaacgacaaaatgcttacaaataatatgataaaacctaagtcccc 12050602  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12050603 gaaatactcatgtttccggatctgcaacgttgacacccaaatcattggttgaatttgtaattga 12050666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 47041881 - 47042072
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||   ||||| |||| |||||||||||    
T  47041881 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcatatcacctaagttaatagcataaaacgataaaacgcctacaaata 47041980  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  47041981 atatgatgaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaactgactgatg 47042072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 53807713 - 53807876
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  53807713 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaccacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 53807812  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  53807813 agaatactcttgcttctggatatgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 53807876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 209
Target Start/End: Original strand, 38859982 - 38860139
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaa--atacccatgc 151  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||     
T  38859982 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccaaaatatacccatgt 38860081  T
Q  152 ttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    || | |||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  38860082 tttcggatctgcaacgttgacgaccaagtcattggttgaatttgtaatcgactgatgt 38860139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47896363 - 47896215
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| |||    
T  47896363 cgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgc-tacaaataataagataaaacctaagttatcgaaatattcatgcttccggat 47896265  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  47896264 atgcaacatttacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 47896215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14859732 - 14859560
Alignment:
Q  30 acatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatc 129  Q
    |||| ||| |||||||| ||| | |||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  14859732 acatcgctaaaaatgtatagggtgaatctgctaacaatctcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccaaccaataatacgataaaatc 14859633  T
Q  130 taagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14859632 taaattaccaaaatacccatgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattga 14859560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45424968 - 45424868
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45424968 aaatgcctacaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaagtacccatgattccggatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45424869  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  45424868 a 45424868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 7546825 - 7546686
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||   ||||     
T  7546825 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttttggatcg 7546726  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7546725 gcaacgttgacgctcaaatcattgactgaatttgtgattg 7546686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 27706103 - 27706243
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||   ||||||||||||   |||     
T  27706103 gaacaaactaacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaataaccaggatacccatgcttgtggata 27706202  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27706203 tgcaacgttgacgccgaaatcattgattgaatttgtgattg 27706243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 628778 - 628941
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  628778 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagaatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 628877  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  628878 agaatactcttgcttctggatctacaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 628941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 44959806 - 44959944
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || || |||||||||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  44959806 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaataaactcacagcatccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaata 44959905  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44959906 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgattcc 44959944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19619968 - 19619784
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||| ||| || | ||| |||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| | || |  || ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  19619968 acatcagaaacagacttcgctaaaaacgtaaatgatgaatctgcgatcaaactcaaaacatcttagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 19619869  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19619868 atatgataaaatctaagtcaccgaaattctcatgctt-cggatctacaacgttgacacctaaatcattgattgaacttgtaattga 19619784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 50194180 - 50194353
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  50194180 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgatat 50194279  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  50194280 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaacgttaacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 50194353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 45425762 - 45425657
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45425762 aaatgcctgcaaataatatgataaaatcgaagtcaccgaaatacttatggttccggatctgcaatgttgaagcccaaatcattgattgaatttgtaattg 45425663  T
Q  202 agtgat 207  Q
    | ||||    
T  45425662 attgat 45425657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 53099998 - 53099860
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||||| ||| |    
T  53099998 aacaaactcacaacacc-aagttaataacatacaacgacaaaatgc-tacaaataatatgctaaaatctaagtcactggaattcacatgcttccggatat 53099901  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53099900 gtaacgttgacgcccaaatcattgattgaacttgtaattga 53099860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35175647 - 35175474
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  35175647 aacatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgatgaaat 35175548  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     ||| ||| |  ||||| |||| || | |||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35175547 ataaatcatcagaatactcatgttttcggatctgcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatatgtgattga 35175474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 46220918 - 46220769
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||| ||||||||||  |||| |||  |||||  ||||||||||||||||    
T  46220918 acatcaaatacaaatatcgctaaaaatataaaagaaaaatttgcgaacaaactcgcagcacccaaattaatggcatacaacggtaaaatgcctacaaata 46220819  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaac 166  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  46220818 atatgataaaatctaaatcactgaaataccaatgctttcggatctgcaac 46220769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43017143 - 43017019
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||  | ||| ||||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  43017143 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatatgtgaataaactcacaacacctaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 43017044  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaa 141  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  43017043 atatgataacacctaagtcaccgaa 43017019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 41818427 - 41818280
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||  |||||| ||| ||   |||    
T  41818427 cgaacaaactcacatcaccaatgttaatagcatgcaacaacaaaatgcctacaaataatacgataaaatcaaaaccaccataataccaatgtttttggat 41818328  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  41818327 ctgcaacattgacattcaaatcattgattgaatttgtaaatgattgat 41818280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46178807 - 46178653
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  46178807 aaaacgtaaaagataaaactgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcttacaaaaatatatgataaaataaaagtgac 46178708  T
Q  138 cgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  46178707 cggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaat 46178653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 43017014 - 43016925
Alignment:
Q  113 aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43017014 aataatatgataacacctaagtcaccgaaatgcacatgcatccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattga 43016925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 198
Target Start/End: Original strand, 20608736 - 20608913
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||  | |||  ||| ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||     ||||||||  |||||  |||||| || ||| ||    
T  20608736 acatcagatacaaaattcgctagaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacaacacct----taatagcatacaacggaaaaatgtctgcaagta 20608831  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaa 198  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  20608832 atataataaaatctaaatcaccgaaattctcatgcttccggatctgcaactttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaa 20608913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Original strand, 26275694 - 26275850
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||| ||||| | ||| || ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || |  |    
T  26275694 gcgaataaacttaaagcgccaaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatataagtcactgaaatactcatgttttcgaa 26275793  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  26275794 tctgcaacgttaacaacaaaatcattgattgaatttgtatatgactgatgtcgatct 26275850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 3848754 - 3848909
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | || || |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  3848754 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatatagcggcataatgcctacaaatatatatgataaaattaaagtcac 3848853  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| | || || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  3848854 cggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 3848909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18011269 - 18011090
Alignment:
Q  23 gatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatga 122  Q
    |||||||| || ||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||| | || ||||||  || |||||  ||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  18011269 gatacaaagatcgctaaaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaacttaaagaacccaaattagtagcatacaaccgcaagatacctacaaataatatga 18011170  T
Q  123 taaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | | ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  18011169 ttatatctaagtcactgaaatattcatgcttctggatctgcaacgttgacgcccaagtgattgattgaaattgttattga 18011090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 27856398 - 27856299
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27856398 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatgcaacggaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 27856299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29922275 - 29922128
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |  |||| ||    
T  29922275 aatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccagaacaatcatgttt 29922176  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29922175 ctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattg 29922128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29971428 - 29971281
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| |||||||||||||||    ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |  |||| ||    
T  29971428 aatctgcgaacaaactcacattttccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccagaacaatcatgttt 29971329  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  29971328 ctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatatgtgattg 29971281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 48199949 - 48199847
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||  ||| |||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  48199949 caaaatgcctacagataatatgataaattctaagtcaccgaaatgcacatgcttctggatttgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatttataat 48199850  T
Q  200 tga 202  Q
    |||    
T  48199849 tga 48199847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53508449 - 53508306
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||    
T  53508449 taaagggtgaatctgcgaacaaaatcacaacatccaagttaatagcaa----cgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcattgtaata 53508354  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | |||||||   ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  53508353 ctcatgcttttggatgtgcaaagttgacgtccaaatcattgattgaat 53508306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17238044 - 17237889
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  |||| ||    
T  17238044 aaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgac 17237945  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17237944 cggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 17237889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 20987631 - 20987730
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||    
T  20987631 cgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaactgcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtaactgaaattcttatgcttccagat 20987730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 25631361 - 25631516
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  25631361 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 25631460  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25631461 cggaatatccatggcatccggatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 25631516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29503700 - 29503545
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| | ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  29503700 aaaatgtaaaggatgaatatgcgaacatactcacagaatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 29503601  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29503600 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 29503545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44805241 - 44805100
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | ||    
T  44805241 gcgaacaaactcacat-acccaagttaatagcatacaatgacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatctaaatcaccataatacccatgctctcgga 44805143  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | |||||| |||| | |||||| |||||||| || ||| |||||    
T  44805142 tttgcaacgttga-gtccaaattattgattgcatatgtgattga 44805100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 188
Target Start/End: Original strand, 36734584 - 36734678
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36734584 aacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaaccgaaatactcatgcctccagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgatt 36734678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25162675 - 25162520
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  25162675 aaaacgtaaaggatgaatccgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 25162576  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||| | | ||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  25162575 cggaatatccattacctccggatctgcaacgttgacggtcaaatctttgattgaat 25162520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 49552059 - 49552214
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||||||    
T  49552059 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtcac 49552158  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  49552159 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgatgctcaaatctttgattgaat 49552214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4822033 - 4821877
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||  ||||    
T  4822033 taaagaatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat-taaatcaccagaata 4821935  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||| ||| ||| || ||| |||  | ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  4821934 cccatgcctccggatttgtaacgttggtgtccaaatcatggattgaatatgtgattga 4821877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 215
Target Start/End: Original strand, 20987729 - 20987830
Alignment:
Q  114 ataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccat 213  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||||  |||||| ||    
T  20987729 ataatatgataaaatctaagttactgaaattcttatgcttccagatctgtaacgttgactcccaaatcattgatgtaacttgtaattgaccgatgtcgat 20987828  T
Q  214 ct 215  Q
    ||    
T  20987829 ct 20987830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Original strand, 26716017 - 26716117
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    | |||| ||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26716017 caacgaaaaaatgcttacaaataatatgataaaatataaatcattatagtacctatgattccggatctgcaacgttgacgccaaaatcattgattgaatt 26716116  T
Q  194 t 194  Q
    |    
T  26716117 t 26716117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 215
Target Start/End: Original strand, 35864895 - 35864963
Alignment:
Q  147 catgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35864895 catgcttccagatctgcaatgttaacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgattgatgtcgatct 35864963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 187
Target Start/End: Original strand, 3085177 - 3085304
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |  ||||||| | ||| |  ||    
T  3085177 cgaacaaactcactgcacccaatttaatagcctacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaattctaaatcatcagaatacccctactttcgaat 3085276  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgat 187  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  3085277 ctgcaacgttgacgttcaaatcattgat 3085304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Original strand, 52115899 - 52116038
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||| ||   |||||    
T  52115899 aacaaactcacaacacccaagttaataacatataacaacaaaatgactacaaataatatgatacaatctaaatcattagaatacccatgattttggatct 52115998  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||    
T  52115999 gcaatgttgacgcttaaatcattgattgaatatgtgattg 52116038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 133
Target Start/End: Original strand, 42455688 - 42455769
Alignment:
Q  52 taaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaag 133  Q
    |||||| ||||||||||||||| || | ||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  42455688 taaatctgcgaacaaactcacaacatcgaagttaatagcatacaacgacaaaatgactacaactaatatgattaaatctaag 42455769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9173955 - 9173835
Alignment:
Q  65 aaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgca 164  Q
    |||||||| | ||| ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||  ||| ||||| | ||||||    
T  9173955 aaactcacggaacctaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatcaaatctaaataaccaaaatattcatacttccgggtctgca 9173856  T
Q  165 acattgacgcccaaatcattg 185  Q
    |||||||  | ||||||||||    
T  9173855 acattgatacacaaatcattg 9173835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46934888 - 46934726
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||   ||||||||||| | |||||||||||    
T  46934888 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgac---atgcctacaaaaatatatgataaaa 46934792  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||| |||| |||||   ||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  46934791 ttaaagtgaccggaatatccatgaactccggatctgcaatgttgacgcccaaatcgttgattgaat 46934726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 192
Target Start/End: Original strand, 26739235 - 26739365
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||| ||  ||| |||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |  |||||||| | |||  |||||    
T  26739235 aacaaacttacgacactcaagttaatagcatacaacgccaaaatgcttacaaataatatgataaaatctaaattatcataatacccacgattcttgatct 26739334  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||  ||||| | ||||||||| ||||||    
T  26739335 gcaacgctgacgtcaaaatcattggttgaat 26739365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36906361 - 36906207
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  36906361 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 36906262  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
     | |||| | | ||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36906261 tggaatatctattgcctccggaactgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 36906207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 44907234 - 44907388
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  44907234 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 44907333  T
Q  138 cgaaata-cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || ||||  |  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  44907334 cggaatattcgttgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatatttgattgaa 44907388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 30648560 - 30648709
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| | |||||| ||| | ||||||||||||  |||| ||||||||    
T  30648560 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacatattgcctataaaaatatatgataaaattaaagttaccgaaat 30648659  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||| ||  || ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  30648660 attcatggccgccggatttgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 30648709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 196
Target Start/End: Original strand, 31271756 - 31271821
Alignment:
Q  131 aagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31271756 aagtcactgaactacccatgcttccggatctgcattgttgacgcccaaatctttgattgaatttgt 31271821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 38142758 - 38142665
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaa 132  Q
    |||||||||||| | |||  || |||||||||||||||  |||| |||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38142758 aaaatgtaaagggtgaatatgcaaacaaactcacagcattcaagttaatagtatacaacaataaaatgcctacaaataatatgataagatctaa 38142665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22803279 - 22803106
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | | |||||||||    
T  22803279 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatttgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatacatgataaaa 22803180  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttcca--------gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| | || |||||||||| ||||||        |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  22803179 ttaaagtgatcggaatacccatgtcttccatgcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttgattgaat 22803106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 173
Target Start/End: Original strand, 24175976 - 24176118
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | |||  || ||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||| || |||||| || |||| | ||||||| ||    
T  24175976 aacatcgctaaaaatgtaaagggtgaatttgcaaacaaactcacaatacccaatttaatagcatacaacaactaaatgc-taaaaatga-atgataagat 24176073  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacg 173  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||    
T  24176074 ctaagtcaccgaaatactcgtgttttcagatctgcaacgttgacg 24176118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3656114 - 3656027
Alignment:
Q  112 aaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  ||||  |||  || ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3656114 aaataatatgataagatctaagtcaccgaaatacctatgtttcaggatcaacaatctttacatccaaattattgattgaatttgtaat 3656027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21916712 - 21916569
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||  | || |||  ||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  21916712 aaaatgtaaaggatgaatctgagaacaaactcacatcatccaagttaatagcatacaggggcataatatctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 21916613  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    ||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  21916612 cgaaatatccatggtttccggatctgcaacgttgacgctcaaat 21916569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 192
Target Start/End: Original strand, 30293411 - 30293494
Alignment:
Q  109 tacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||||||| |  | || |||||||||| ||||| |||  || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30293411 tacaaataatatgataaagttaatgtgaccgaaatactcatgcatccgaatttgcaacattgactctcaaatcattgattgaat 30293494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 50611253 - 50611408
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||| || | || ||||| ||||||||   |||   | |||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||    
T  50611253 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaacccatatcatccaagttaatagcatataactgtataatgcctacaaaaacatatgataaaatttaagtgac 50611352  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  50611353 ccgaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatcttcgattgaat 50611408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Original strand, 12946843 - 12946921
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||   || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12946843 cgaacaaattcacaacacccaagttaatagcatataagggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcacc 12946921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 7792103 - 7792140
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7792103 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcac 7792140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 51487269 - 51487229
Alignment:
Q  98 gacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51487269 gacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 51487229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4169965 - 4169875
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    |||||| |||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  4169965 caaaatgtctacaaataatatgataaaatttaaatcattagaataccaatgcttccagatttataacgttgacg-ccaaatcattaattgaa 4169875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 129
Target Start/End: Original strand, 47176041 - 47176108
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatc 129  Q
    |||||||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  47176041 aacaaactcacaacattcaagttaatagcattcaacgactaattacctacaaataatatgataaaatc 47176108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 32246595 - 32246557
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32246595 caaattgcctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 32246557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2342682 - 2342638
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaata 88  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2342682 gtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaata 2342638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27066078 - 27066026
Alignment:
Q  148 atgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    |||||||| ||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27066078 atgcttccggatctacaatgttgacgctcaaataattgattgaatttgtaatt 27066026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Original strand, 38440426 - 38440478
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  38440426 aaaacgtaaaggatgaatctgcgagcaaactcacagcatccaagttaatagca 38440478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 51202145 - 51202245
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||  |||  ||| || ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  51202145 aacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgggatattcatcgcctccggatttgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 51202244  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  51202245 t 51202245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 32580 - 32772
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  32580 acatcagatacaaacatggctaaaaacgtaaagggtgaatctgggaacaaactcacaacactcaagttaatagtatacagcgacaaaatgcctacaaata 32679  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32680 atatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 32772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 102)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44915898 - 44915706
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  44915898 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacatcacccaagtcgatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 44915799  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44915798 atatgataaaatctaagaaaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 44915706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 14872898 - 14872700
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||  || | ||||||| | |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  14872898 acatcacatacaaacatcgcagaagaagtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 14872799  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14872798 atatgataaaacctaagtcaccaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 14872700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 7337496 - 7337688
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  7337496 acatcagatacaaacatcgctaaaaatataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacagccaagttaatagcatgcaacagcaaaatgcctacaaata 7337595  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7337596 atatgataaaaccaaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtgcaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 7337688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 201
Target Start/End: Original strand, 15431499 - 15431683
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  15431499 acatcagatacaaacattgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagtgaatagcatacaacgataaaatgtctacaaata 15431598  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15431599 atatgataaaatctatgtcactgaaatatcaatgctgccagatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 15431683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 35484224 - 35484416
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  35484224 acatcagatacaaacatcgctaaaaatgtaaagggcgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcttacaaata 35484323  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35484324 atatgataaaaccgaaatcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 35484416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5984053 - 5983903
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5984053 gcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccgga 5983954  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5983953 tctgcagcgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 5983903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 215
Target Start/End: Original strand, 7836657 - 7836827
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  7836657 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaatt 7836756  T
Q  145 cccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    | ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7836757 cacatgcctccagatattcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 7836827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 21947451 - 21947643
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||| || | | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  21947451 acatcatatacaaatatcgttaaaaatgtaaagggtaaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataaaatacaacggcaaaatgcctacaaata 21947550  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21947551 atatgataaaacttaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 21947643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 13144652 - 13144830
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| | | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   || | ||||||||||||||||| ||||||    
T  13144652 atacaaacatcgttaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcctacaaatattatgat 13144751  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13144752 aaaatctaagtcactgaaatactcatgctttcagatctgcaaaattgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattga 13144830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31984420 - 31984247
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||| |||| | | |||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||    
T  31984420 acatcaaatacacacattgttaaaaacgtaaagggtaaatctgcgaacaaagtcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcttaaaaata 31984321  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattga 190  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31984320 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacccatgcttccggatttgcaacgttgacgcccaaatcattgattga 31984247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 29738497 - 29738689
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||| | |||||    
T  29738497 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacgaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggccaaatgccaataaata 29738596  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29738597 atatgataacacctaagtcactgaaatacacatgcttccggatttgcaacattgacgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgt 29738689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 10776296 - 10776492
Alignment:
Q  19 atcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataat 118  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||  ||||||||||||||||||     
T  10776296 atcagatgcaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaaattgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagaatacaacagcaaaatgcctacaaataaa 10776395  T
Q  119 atgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  10776396 atgataaaacctaagtcaccgaaatactcatgcttctggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgattggatttgtaattgactgatgtcgatct 10776492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32395256 - 32395065
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||  | | |||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||  || || ||||||||||| |||||    
T  32395256 acatcaaatacaaacaccgttaaaaacgtaaagggtgaatcg-cgaacaaacttacagcacccaagttaatagcatacagcggcaaaatgcctataaata 32395158  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  32395157 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgaatgatgt 32395065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 45415817 - 45415625
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||| | || ||| |||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||  |||||  |  ||||| |||||||||||||||||    
T  45415817 acatcatatacacatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacaacacccaaattaatattatacaacggcaaaatgcctacaaata 45415718  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  45415717 atatgataaaacctaagtcaccgaaatacctatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgagtttgtaattgattgatgt 45415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4413373 - 4413210
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  4413373 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaattcacagcactcaatttaatagcatacaacagcaaaatgcctacaaata 4413274  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaat 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4413273 atatgataaaacctaagtcaccgaaatattcatgcttccggatctgcaacgttgacgcccaaat 4413210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 208
Target Start/End: Original strand, 23291518 - 23291666
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  23291518 cgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatacctccaaataatatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggat 23291617  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23291618 cttcaacgttgatgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 23291666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 31317953 - 31317821
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |     
T  31317953 gcgaacaaactcacatcacccaagttaataggatgcaacgataaaatgcctacaaataatatgataaattctaaatcaccgaaatatccatgcttccggg 31317854  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31317853 tctgtaacgttgacgcccaaatcattgattgaa 31317821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 31919248 - 31919049
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  31919248 acatcatatacaaacttcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcgcaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 31919149  T
Q  117 atatgataaaa-tctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||   ||||||||  |||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  31919148 atatgataaaaccctaagtcactgaaattttcatgcttctggatctgcaacgttgatgctcaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatct 31919049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Original strand, 34878111 - 34878302
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||| ||||| | | |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  34878111 acatcagatggaaacatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgtgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 34878210  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||   | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34878211 atatgataaaacctaagtcactgaatatcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 34878302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 36775580 - 36775727
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  36775580 aatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccgggatacccatgttt 36775679  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36775680 ctggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 36775727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48750402 - 48750260
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||   ||    
T  48750402 gcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgcttatgga 48750303  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48750302 tctgcaacgttgacgcccaaatcattgattaaatttgtgattg 48750260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 49504428 - 49504620
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| |||||||||||| | | |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||| |||||    
T  49504428 acataagatacaaacatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggtaaaatgcctaaaaata 49504527  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
     |||| ||||| | || ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  49504528 ttatgttaaaacccaaatcaccgaaacactcatgcttccggatctgcaacgttgacatccaaatcattgtttgagtttgtaattgattgatgt 49504620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44543509 - 44543346
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  44543509 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcact 44543410  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44543409 agaatactcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 44543346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 155
Target Start/End: Original strand, 11462315 - 11462453
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  11462315 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatctacgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaattcctacaaata 11462414  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11462415 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgtttcc 11462453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 47133150 - 47132977
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47133150 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 47133051  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  47133050 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 47132977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 3228486 - 3228338
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || | ||    
T  3228486 gcgaacaaacacacatcacccaagttaataacatataacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcatcgaaatatccatgatttcgga 3228387  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3228386 tctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgtatttgtaattgactgat 3228338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16989630 - 16989454
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||||||  || |||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  16989630 acatcatatacaaacatcactaaaaacgtaaatggtaaatctgcaaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 16989531  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  16989530 atatgataaaacctaagtcactgaaattcacatgattccggatcttcaaccttgacgctcaaattattggttgaatt 16989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 27579961 - 27580144
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatg-taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    |||||| |||||||||  ||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   || | |||||||| ||  |||    
T  27579961 acatcatatacaaacaacgct-aaaatgataaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaatggcaaaatgcttatgaat 27580059  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27580060 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatactcatgctttcgaatctgcaatgttgacgcccaaatcatttattgaatttgtaatt 27580144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 24583187 - 24583024
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24583187 aaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacatcacccaagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 24583088  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||  | ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24583087 agaatattcttgcttctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 24583024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 95 - 209
Target Start/End: Original strand, 8211822 - 8211935
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  8211822 aacgacaaaatacctacaaataatatgataaaacctaagtcattgaaatacccatgcttccggatctgcaacattgacg-ccagatcattggttgaattt 8211920  T
Q  195 gtaattgagtgatgt 209  Q
    ||| |||| ||||||    
T  8211921 gtatttgactgatgt 8211935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39888441 - 39888243
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||  | |||| ||||| ||||||||| || | ||| ||||||||  |||||| ||||||| || ||| |    
T  39888441 acatcagatacaaacatcactcaaaacgtaaagagtgaatctgcgaataaactcacaacatctaagttaatagcatacaacgataaaatgcatataaaga 39888342  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||   | ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||    
T  39888341 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacctgtgcgctcggatctacaacgtggacgcccaaatcattgattgaagttgtaattgactgaagtcgatct 39888243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 18939542 - 18939393
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaa-tgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgct 152  Q
    |||| ||||||||||||| |  | ||||| ||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  18939542 aatctgcgaacaaactcaaattatccaagttaatagcatacaacgacaaaaatgcctgcaaataatttgataaattctaagtcaccaaaatacacatgct 18939443  T
Q  153 tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18939442 tccagatctgcaacgtcgacgtccaaatcattgattaaatctgtaattga 18939393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 51916515 - 51916683
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| |||||||| ||        |||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  51916515 atacaaacatcgctaaaaatgtaaatgatgaatttgggaacaaactcacaacacccaagtta--------caacgacaaaatgcatgcaaata-tatgat 51916605  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51916606 aaaatctaagtcac-gaaatactcatgcttccgtatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtaattga 51916683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Original strand, 35461909 - 35462072
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||     |  |||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  35461909 aaaatgtaaagggtgaatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatag-----acggacaaaatacctattaataatatgataaaacttaagtcacc 35462003  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  35462004 gaaatacacatgcttccggatctgcaacgttgacgtccgaatcattggtttaatttgtaattgactgat 35462072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49627150 - 49626987
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |    
T  49627150 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaaattaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataagatgatataatctaaatcatc 49627051  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | ||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  49627050 agaatactcttgcttctgcatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattga 49626987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 45789755 - 45789615
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| | ||||||||| ||||    
T  45789755 gaacaaac-cacaacacccaagttaatagcatacaatgacaaaattcctacaaataatataataaattctaagtcaaagaaatgcacatgcttccggatc 45789657  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45789656 tacaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattga 45789615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 24583383 - 24583284
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24583383 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcacc 24583284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 25564235 - 25564072
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    ||||| |||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||  |||| |||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  25564235 aaaatataaagagtaaatccgcgaacaaactcataggacccaagttaataacatacaacaacaaaatatctacaaacaatataataaaatataaatcacc 25564136  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25564135 agaataatcatgcttccagatctgcaatgttgacgcccaaatcattgattgaatctgtgattga 25564072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 201
Target Start/End: Original strand, 37720027 - 37720166
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||   |||||    
T  37720027 aacaaactcacaacacccaagttaatagcattccacagaaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaataaccagaatacccatgcttttggatct 37720126  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  37720127 gcaacgttgacgcccaaatcattaaatgaatttgtgattg 37720166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 144
Target Start/End: Original strand, 51373691 - 51373818
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| |||||||||||| | | |||| ||||||| | ||||  | |||||||||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  51373691 acattagatacaaacatcgataaaaacgtaaagggtgaatctccaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacgacgacaaaatgcctacaaata 51373790  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51373791 atatgataaaatataagtcaccgaaata 51373818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1742455 - 1742349
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1742455 caaaatgcctacaaataatatgataaaacct--gtcaccgaaattcacatgctttcggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaat 1742358  T
Q  200 tgagtgatg 208  Q
    ||| |||||    
T  1742357 tgattgatg 1742349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 34412962 - 34413107
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  34412962 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaaccgcaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcaccagaatacccatgctt 34413061  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  ||||| |||| |||||| ||  || ||||||||||||||| ||||    
T  34413062 ctggatctacaacgttgacgtcc--attattgattgaatttgtgattg 34413107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 202
Target Start/End: Original strand, 32873764 - 32873882
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||    
T  32873764 taatagcatacaatgacaatatgtctacaaataatatgataaaatcaaagtgatcgaaatacccatgtttctggatctgcaacattgacgcttaaatcat 32873863  T
Q  184 tgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| ||| |||||||||    
T  32873864 tgattaaatgtgtaattga 32873882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19061126 - 19060994
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | | ||||  ||    
T  19061126 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataatctaaatcaccagaatactcttccttctgga 19061027  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  19061026 tctacaacattgatgtccaaattattgattgaa 19060994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19723559 - 19723403
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  19723559 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaataacatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaac 19723460  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||||| |||| || ||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19723459 cgaaatatccatcgcctccggatctgctacgttgacgcccaaatctttgattgaatt 19723403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16162065 - 16161913
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16162065 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcattccacggcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcagc 16161966  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
      |||||||||||||          ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16161965 agaatacccatgctt----------aacgttgacgcccaaatcattgaatgaatttgtgattg 16161913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 51872109 - 51871954
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  51872109 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 51872010  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||    
T  51872009 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatatttgattgaat 51871954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15492479 - 15492373
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcat 183  Q
    ||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15492479 taatagcatacaacggtaaaatgcatacaaataatatgataaaatctaaatcaccataatatccatgctccaggatctgcaacactgacgcccaaatcat 15492380  T
Q  184 tgattga 190  Q
    |||||||    
T  15492379 tgattga 15492373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 202
Target Start/End: Original strand, 32679005 - 32679159
Alignment:
Q  48 aggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaataccc 147  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||| |    
T  32679005 aggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatggcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaatctaaatcaccataatactc 32679104  T
Q  148 atgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||| ||| |||||  ||| || ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  32679105 atgcttccggatttgcaatgttggcgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 32679159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16263075 - 16262935
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    |||||||||||| ||| || | ||||||||   |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| |  ||||| ||||||||| |||||    
T  16263075 aacaaactcacaacactcatgttaatagcataaaacggcaaaatgcatacgaataacatgataaaatctaaatcatcagaatactcatgcttccggatct 16262976  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16262975 gcaacgttgatgcacaaatcattgattgaatatgtgattga 16262935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 50148626 - 50148462
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| |||    
T  50148626 aacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaaacaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaa 50148527  T
Q  128 tctaagtcaccgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    |  |||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  50148526 ttaaagtgaccggaatatccattgcttccggatctgcaacgttgacgcccacatctttgattgaa 50148462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 17 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 50377582 - 50377458
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||  |||||||||||| | |    
T  50377582 acatcagatataaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaaattgcgaacaaactctcagcacccaagttaataacatacgacggaaaaatgcctacagaca 50377483  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaa 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50377482 atatgataaaatctaagtcaccgaa 50377458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7342968 - 7342813
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||  || |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||    
T  7342968 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacatcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcac 7342869  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  7342868 cggaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 7342813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26535595 - 26535425
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||     | ||         |    
T  26535595 acatcagatacaaacatagctaaaaacgtaaatgataaatctacgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaac-----attg--------aa 26535509  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  26535508 gtattataaaatctaagtcaccggaatactcatgcttccggatctgcaacgttgaagcccaaatcattgatttaaattgtaatt 26535425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 5324384 - 5324548
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| |||||| || |||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  5324384 aacatcgctaaaaacgtaaagcatgaatctgcgaacaa-ctcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 5324482  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| ||||||||| ||||| |  || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5324483 ttaaagtgaccgaaatatccatggcccccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 5324548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 21687637 - 21687521
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||| | | |||| || |||||||||||| |||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  21687637 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaaaggtgaatctgctaacaaactcacaacacccaaattaatagcataaaacgagaaaatgcctacaaata 21687538  T
Q  117 atatgataaaatctaag 133  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21687537 atatgataaaacctaag 21687521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 24597242 - 24597342
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| | |  ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24597242 aaatgccaacaaataatattataaagtataagtaatcagaatacccatgcttccggatctacaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttataattg 24597341  T
Q  202 a 202  Q
    |    
T  24597342 a 24597342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9172736 - 9172581
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||  | || || |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||    
T  9172736 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcac 9172637  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| | || || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9172636 cggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 9172581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9180718 - 9180563
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||  | || || |||||||| ||| | ||||||||||||  |||||||    
T  9180718 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcaaatagcggcataatgcctataaaaatatatgataaaattaaagtcac 9180619  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| | || || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9180618 cggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 9180563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 9687040 - 9687194
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  9687040 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 9687139  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  ||| || ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9687140 cggaatattcatggcctctggatctgcaac-ttgacgcccaaatctttgattgaat 9687194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9919634 - 9919480
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | ||||||| ||||  |||||||    
T  9919634 aaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatg-ctacaaaaatatatgatcaaattaaagtcac 9919536  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  ||| || ||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  9919535 cggaatattcatggcctccggatttgcaacattgacgttcaaatctttgattgaat 9919480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 25406119 - 25406274
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  25406119 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 25406218  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||  |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||    
T  25406219 cggaatatccatgacctctggatctgcaacgttgacgtcgaaatctttgattgaat 25406274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 50165934 - 50166089
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  50165934 aaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 50166033  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||||||||| || ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  50166034 cagaatacccatggcctccggatctacaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 50166089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 51868480 - 51868635
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||     
T  51868480 aaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcat 51868579  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  |||| | |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  51868580 cggaatattcatggtctccagatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 51868635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12635386 - 12635250
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||  |||    
T  12635386 cgaacaaactaacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgccttaaaaaaatatgataaaatataaatcgccagaatacccatgcttcgtgat 12635287  T
Q  160 ctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
     || ||   |||||  |||||||||||||||||||||    
T  12635286 atgaaaggctgacgtgcaaatcattgattgaatttgt 12635250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 33291253 - 33291409
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||   ||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  33291253 aaaacgtaaatgatgaatctgctaacaaactcacagcatccaagttaacagcatataacaacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 33291352  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    || |||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  33291353 cggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaatt 33291409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43412550 - 43412458
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  43412550 caaaatacctgcaaataatatgataaaatctagatcaccaaaatacgcatgcttctggatctgcaacgttgactttcaaatcattgattgaat 43412458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 19715730 - 19715881
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  19715730 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 19715829  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    || |||| ||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19715830 cggaatatccattgcctctagatctgcaacgttgacgcccaaatctttgatt 19715881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Original strand, 31692342 - 31692485
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||| |  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||| |||||  ||| ||| | ||    
T  31692342 gcgaacaaactcacaacacccaagtcgatagtatacatcgacaaaatgcatacaaattatatgataaaataaaattcaccaaaatatgcatactttcgga 31692441  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||| ||||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||    
T  31692442 tctacaacattgacatcgaaatcattgattaaatttgttattga 31692485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 45805664 - 45805818
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  45805664 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaata-catataacgacataatacctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 45805762  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  45805763 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaat 45805818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39987569 - 39987480
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  39987569 aatgcctataaaatatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctccggatctgcaacgttgacgcccaattctttgattgaat 39987480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9341908 - 9341800
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |   ||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||     
T  9341908 caacaacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaagtcaccagaatatacatgctcctgaatctgcatcgttgacgtccaaaacattgatggaata 9341809  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    ||| |||||    
T  9341808 tgtgattga 9341800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 34529296 - 34529212
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  34529296 aatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaatagtatacaacaaaaaaatgcctacaaataatgtgataaaatttaaatcacc 34529212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 21687020 - 21686941
Alignment:
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  21687020 ctaagtcaccgaatatcacatgcttccggatcttcaatgttgacgcccaaatcattggttgaatttttaattgagtgatg 21686941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 31837080 - 31837005
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||   |||| || ||||||||||||    
T  31837080 aaaatgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaa 31837005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 40646921 - 40646766
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaa-ctcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||   ||| |    
T  40646921 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattatagtga 40646822  T
Q  137 ccgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    ||  |||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40646821 ccagaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 40646766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5701505 - 5701351
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctaca-aataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||| ||  ||||||| ||||  |||| ||    
T  5701505 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacacaaatatatgatgaaattaaagtgac 5701406  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||  ||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  5701405 cggaatatccattgtctccggatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaa 5701351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Original strand, 6217717 - 6217845
Alignment:
Q  78 ccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac--cgaaat--acccatgcttccagatctgcaacattgacg 173  Q
    ||||| ||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||   || ||  || ||||||| ||||| |||||  |||||     
T  6217717 ccaagttaatagcatacaacggtaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcacgaggatattcactcatgcttacagatatgcaatgttgaca 6217816  T
Q  174 cccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6217817 tccaaatcattgattgaatttgtgattga 6217845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 13075573 - 13075667
Alignment:
Q  102 aaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| ||||  | | |||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  13075573 aaatgcttacaaataatatgataaaatctaaatcactagaatactcatgtcttcggatctgcaacgttgcctcctaaatcattgattgaatttgt 13075667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 127
Target Start/End: Original strand, 19596293 - 19596403
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||| ||||| ||| || ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  19596293 acattagatagaaatatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcgtagcatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 19596392  T
Q  117 atatgataaaa 127  Q
    |||||||||||    
T  19596393 atatgataaaa 19596403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 1602251 - 1602163
Alignment:
Q  113 aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||||| | ||||| || | ||||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1602251 aataatatgataaatt-taagtgactggaatacacgtgcttccggatatgcaacattgatgcctaaatcattgattgaaattgtaattga 1602163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34519374 - 34519245
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||  || |||| ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  34519374 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaggatccaagttaatagcaaataatgacataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 34519275  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaac 166  Q
    || |||| |||| || ||| ||||||||||    
T  34519274 cggaatatccatggcctccggatctgcaac 34519245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14489472 - 14489401
Alignment:
Q  76 acccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaataccc 147  Q
    ||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  14489472 acccaagttaataacatacaacaacaaaatacctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagaataccc 14489401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 181
Target Start/End: Original strand, 18569166 - 18569289
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||| ||||||||| || ||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||  |    
T  18569166 gcgaataaactcacaacatccaaattaatagcatataacgacataatgcctacaaaagtatatgataaaattaaagtgaccggaatacccatgcctctgg 18569265  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatc 181  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18569266 atctgcaacgttgacacccaaatc 18569289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 159
Target Start/End: Original strand, 31130418 - 31130549
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||| |||||| |   ||||||| |||||||||||| | | || ||||||    
T  31130418 aacatcgctaaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcacagcatccaagttaatagaatataacgacataatgcctacaaaaatacataataaaa 31130517  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatgcttccagat 159  Q
    |  |||| |||| || |||||||| |||||||    
T  31130518 ttaaagtgaccggaacacccatgcctccagat 31130549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 40880868 - 40881003
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttcca 156  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||  || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||  |||| ||||| | | |     
T  40880868 gcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacagcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccagaatatccatggccttcg 40880967  T
Q  157 gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40880968 gatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 40881003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 45425901 - 45426056
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||   ||||  | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  45425901 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaataaactcacagcatccaagttaatagcatataacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 45426000  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||  ||| || | | |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  45426001 cgaaatattcatggccttcggatctgcaacgttgacgctcaaatttttgattgaat 45426056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 7998035 - 7997881
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||||||| || ||||| ||||| ||   |||| || |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  7998035 aaaacgtaaaggatgaatctgcaaacaaactcacatcatccaagttaataacatataacggcataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 7997936  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || ||||  || ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  7997935 cggaatattcattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttggttgaa 7997881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 27456734 - 27456648
Alignment:
Q  26 acaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctaca 112  Q
    |||||||| | | |||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  27456734 acaaacatcgttaaaaacgtaaaagatgaatttgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctaca 27456648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 41994605 - 41994515
Alignment:
Q  98 gacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgatt 188  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||| | | ||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41994605 gacaaaattgctacaaataaaatgataaaatctaaatcaccagaatactcgttcttccggattagcaacgttgacgtccaaatcattgatt 41994515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Original strand, 48365621 - 48365755
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| |    ||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||  ||||| || |    
T  48365621 gcgaacaaactcacagcatccaagttaataacttataacgacataattcctacaaaaatatatgataaaattaaagtaatcggaatacttatgctcccgg 48365720  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  48365721 atctgcaacgttgacgttcaaatctttgattgaat 48365755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27456646 - 27456601
Alignment:
Q  170 gacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  27456646 gacgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatct 27456601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 202
Target Start/End: Original strand, 28053634 - 28053734
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||  ||||  | | ||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28053634 aaaatgcctacaaataatatgataaaatcaaagtgatcagaataatcatgtcttcggatatgcgac-ttgacgcctaaataattgattgaatttgtaatt 28053732  T
Q  201 ga 202  Q
    ||    
T  28053733 ga 28053734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 32676970 - 32677121
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||      |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  32676970 aaaacgtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatat-----aacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 32677064  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
     | |||| |||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32677065 tggaatatccatcgcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaatt 32677121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 48217683 - 48217608
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||    
T  48217683 aaaatgtaaaggatgaatttgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacaacataatgcctacaaa 48217608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Original strand, 50616555 - 50616646
Alignment:
Q  64 caaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||| || |||||  | ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||    
T  50616555 caaactcacaacatccaagtcattagcatgcaaaggcaaaatatctacaaataatatgataaaatttaaatcacaaaaatactcatgcttcc 50616646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 155
Target Start/End: Original strand, 50624382 - 50624473
Alignment:
Q  64 caaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttcc 155  Q
    |||||||||| || |||||  | ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||||||||    
T  50624382 caaactcacaacatccaagtcattagcatgcaaaggcaaaatatctacaaataatatgataaaatttaaatcacaaaaatactcatgcttcc 50624473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Original strand, 27914942 - 27915014
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaa 114  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||  ||||||||   ||||||||||| ||||||||    
T  27914942 aaaatgtaaaggatgaatcg---aacaaactcacagcatccaaattaatagcatataacgacaaaatacctacaaa 27915014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 33817009 - 33817158
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   || |||| |||||||||||| | |||||| |||||  |||| |||| |||    
T  33817009 taaaggatgaatccgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaat 33817108  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||| || ||| |||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  33817109 attcatggcctccggatctgcaacgttgatatccaaatctttgattgaat 33817158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 33876479 - 33876628
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| ||   || |||| |||||||||||| | |||||| |||||  |||| |||| |||    
T  33876479 taaaggatgaatccgcgaacaaactcacatcatccaagttaataacatataatgacataatgcctacaaaaatatatgagaaaattaaagtgaccggaat 33876578  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  ||| || ||| |||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||    
T  33876579 attcatggcctccggatctgcaacgttgatatccaaatctttgattgaat 33876628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Original strand, 7311952 - 7312096
Alignment:
Q  50 gataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaataccca 148  Q
    |||||||| ||||||||||| | |  | ||||| |||||| |   |||| || |||||||||||| | |||||||||||   |||| |||||||||| ||    
T  7311952 gataaatctgcgaacaaacttataatatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaactaaagtgaccgaaatactca 7312051  T
Q  149 tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    |||  || |||||||||  |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  7312052 tgcaaccggatctgcaatgttgacgtccaaatctttgtttgaatt 7312096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 11454183 - 11454131
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  11454183 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagca 11454131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 97)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1421941 - 1421750
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1421941 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagg-tgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 1421843  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1421842 atatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 1421750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4779019 - 4778827
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4779019 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaaattaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 4778920  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4778919 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 4778827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 31788722 - 31788532
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  31788722 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 31788623  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31788622 atatgttaaaacctaagtcactgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgat 31788532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38445432 - 38445240
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38445432 acatcagatacaaacattgttaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcaccaaagttaataacatacaatggcaaaatgcctacaaata 38445333  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  38445332 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccacgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaatttactgatgt 38445240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18763734 - 18763543
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  18763734 acatcagatacaaatatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 18763635  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  18763634 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatctgtaacgttgacgcccaaatgattggttgaatttgtaattgattgatg 18763543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 29173551 - 29173739
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  29173551 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaataacatacaacaacaaaatgcatacaaata 29173650  T
Q  117 ---atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29173651 ataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacacccaaataattgattgaatttgtaattga 29173739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 33923971 - 33923773
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||    
T  33923971 acatcagatacaaaaatcgctaaaaaggtaaaaggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcataaaacgacaaaacgcctgcaaata 33923872  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33923871 atatgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 33923773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 25508902 - 25509094
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| | | ||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25508902 acatcatatacaaacatcggtaaaaacataaacgatgaatctgcgaacaaactcacatcacccaagttaataacatacaacggcaaaatgcctacaaata 25509001  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25509002 atacgataaaatctaagtcatcgaaatacccatgtttccggatttgcaacgttgacgcccagatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 25509094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 33585569 - 33585754
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  33585569 acatcagatacaaacatcgttaaaaacgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcatacaaata 33585668  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33585669 atatgataaaacttaaatcaccgaattactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattga 33585754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 37876440 - 37876632
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||| | | |||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||    
T  37876440 acatcaaatacaaacatcgctaaaaacataaatggtgaatctgcgaacaaactcgcatcacccaagttaatagcatacgacggcaaaatgcctacaaata 37876539  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37876540 atatgataaaatttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgcaacgttgatgcccaagtcattggttgaatttgtaattgactgatgt 37876632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1415823 - 1415632
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || || | | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||||||    
T  1415823 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgttaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcattaaacggtaaaatgcctacaaata 1415724  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1415723 atctgataaaacctaagtcaccgaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatg 1415632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 4903979 - 4904177
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  4903979 acatcaaatataaatattgctaaaaacgtaaaggctgaatctacgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacaaata 4904078  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4904079 atatgataaaatctaagtcaccgaaatatccatgcttctggatctgcaacgttgacacccaaatcatcagttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 4904177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 207
Target Start/End: Original strand, 31128624 - 31128804
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatg 121  Q
    ||||||||| ||  || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||      |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31128624 agatacaaatatcactaaaaatgtaaaggattaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatat-----aacggcaaaatgcctacaaataatatg 31128718  T
Q  122 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31128719 ataaaatataagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgcctaaatcattgattgaatttgtaattgactgat 31128804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 5427703 - 5427883
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||| | ||||||    
T  5427703 acatcagatacaaacatcgctaaaagcgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgataaaatgcttgcaaata 5427802  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgta 197  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  5427803 atatgataaaacctaagtcactgaaatacacatacttccggatctgcaacgttgacgcacaagtcattggttgaatttgta 5427883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 27097241 - 27097432
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||| ||  || |||| ||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||| |||||| ||||||||||    
T  27097241 acatcaaatacaaatatctctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacacccaagttaatagtatacaacggcaaaattcctacaaata 27097340  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27097341 atatgataaaacttaagtcaccgaaata-ccatgcttccagatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 27097432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 36942956 - 36943137
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||   ||||||||  || || || ||||||||||||||    
T  36942956 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacatactcacagcacccagattaatagcataca-cggcataatgcctacaaata 36943054  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  36943055 atatgataaaattcaagtcaccgaaatacccatgtttccggatctgcaacgttgacgcccaaatcattggtggaatttgtaat 36943137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7646744 - 7646547
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7646744 acatcaaatataaagatcgctaaaaacgtaaaaggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 7646645  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgccc-----aaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||     |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7646644 atatgataaaacttaagtcaccgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 7646547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 209
Target Start/End: Original strand, 9169136 - 9169284
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9169136 gaacaaactcacagcatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgataagacttaagtcaccgaaatacccatgcttccggatc 9169235  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  9169236 tgcaacgttgacgtccaaatcattcgttgaatttgtaattcactgatgt 9169284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 209
Target Start/End: Original strand, 19062187 - 19062378
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat-----a 116  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||     |    
T  19062187 agatacaaacat-gctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgagcaaactcacatcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaattaaata 19062285  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19062286 atatgataaaacttaagtcaccgaaatacccatgctttcggatctgaaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtaattgactgatgt 19062378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Original strand, 29279404 - 29279596
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||| |||| ||| |||| ||||| | | |||  ||||||||||||||| ||||  || ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  29279404 acatcaaatacagacatcgctaaaaacgtaaatggtgaatatgcgaacaaactcacaacaccatagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 29279503  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  29279504 atatgataaaatttaagtcaccgaaaaactcatgtttccggatctgcaacattgacgcacaaatcattgattgaatttgtaatcgactgatgt 29279596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 209
Target Start/End: Original strand, 7677752 - 7677899
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | |||||    
T  7677752 aacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctaaaaataatatgataaaacctaattcacggaaatacccatgctttcggatct 7677851  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  7677852 gcaacgttgatgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgattgatgt 7677899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Original strand, 10237087 - 10237234
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||    
T  10237087 aatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgatgaaatctaaatcatcagaatacccatgctt 10237186  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10237187 ctggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgtgattg 10237234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8809540 - 8809348
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatg 121  Q
    ||||||||||||  || |||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  8809540 agatacaaacatcactaaaaacgtaaaagatggatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacgacaaaatgtctacta-taatatg 8809442  T
Q  122 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  8809441 ataaaatctaagtcactgaaattctcatgcttccggatctgcaatgttggcgcccaaatcattgattgaacttgtaattgactgatgtcgatct 8809348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36692140 - 36691942
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| | || ||||||| | |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  36692140 acatcagatacaaacatcgctaagaacgtaaagggtgaatctgtgaacaaactcacaacaaccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 36692041  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||   |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  36692040 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgctttaggatctgcaatgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaattgaccgatgtcaatct 36691942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 35220594 - 35220399
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35220594 acatcagatacaaagatcgctaaaaacgtaaagggtgaatatgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 35220495  T
Q  117 -atatgat--aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
       ||| |  || || |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  35220494 cccatgcttcaagatttaagtcacagaaatacccatgctttaagatctgcaaagttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaatggactgatgt 35220399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 3309174 - 3309027
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  3309174 aatctgcgaataaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgactacaaataatatgatgaaatataaatcaccagaatacccatgctt 3309075  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3309074 ctggatctgcaacgttaacgcccaaatcattgattgaatttgtgattg 3309027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 12554037 - 12554200
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||     
T  12554037 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatatcatacaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaacctaagttact 12554136  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||  |  || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12554137 gaaatactcatgcttccaaatatgcaatgtccacacccaaatcattgattgaatctgtaattga 12554200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 4041428 - 4041613
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||||||| || | | |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||  ||||||| |||||||||    
T  4041428 acatcagatacaaaaatcgttaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaatagcatgcaacagcaaaatggctacaaata 4041527  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  4041528 atatgataaagcctaagttatcgaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgagtttgcaattga 4041613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 11985067 - 11985252
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| |||  ||||||||| ||||| || ||||| |||||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  11985067 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaatgatgaatttgcgaacaaattcacaacatccaagttaataggatacaacagcaaaatgcctacaaata 11985166  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  11985167 atatgataaaacctaagtcactgaaatactcattcttctggatctgcaacgttgacacctaaatcattggttgagtttgtaattga 11985252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 12677285 - 12677469
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| | |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||   ||||  ||||||||||||| ||    
T  12677285 acatcagatacaaacatcgctaaaaacataaagggtgaatctgcgaataaactcataatacccaagttaatagcataaaacggaaaaatgcctacaa-ta 12677383  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12677384 atatgataaaacctaagtcaccaaaattcacatgcttccggatcttcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaattga 12677469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 209
Target Start/End: Original strand, 31210524 - 31210633
Alignment:
Q  100 caaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31210524 caaaatgcctacaaataatatgataaaacctaaatcaccgaaatacccatgctttctgatctgcaacgttgacgtccaaatcattgcttgaatttgtaat 31210623  T
Q  200 tgagtgatgt 209  Q
    ||| ||||||    
T  31210624 tgattgatgt 31210633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 215
Target Start/End: Original strand, 19028790 - 19028946
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  19028790 gcgaacaatctcacaacactcaagttaatagcataaaacgaaaaaatgcctacaaatagtatgataaaatctaagttaccgaaatatccatgcttctgga 19028889  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||    
T  19028890 tttgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaatttgtacttgactgaagtcgatct 19028946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 30399863 - 30400054
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||||||| ||| || ||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||| ||| ||||  ||  | ||| |||||||||||||||||    
T  30399863 acatcagatataaatatcgcaaaaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaacttacaacacctaagttaatgacatacgacggcaaaatgcctacaaata 30399962  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcac------cgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||||||||||||        |||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30399963 atatgataaaatctaagtcactaaaaatcaaatactcatgctttcggatctgcaacgttgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 30400054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 17249003 - 17249166
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17249003 aaaacgtaaatgatgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgatataatctaaatcacc 17249102  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| | |||||   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17249103 agaatactcttgcttatggatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 17249166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Original strand, 17994560 - 17994743
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagca----acgacaaaatgcctaca 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||  ||| |||| |||| |||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||    | | |||||||||||||    
T  17994560 acatcagatactaacatcgctacaaacgtaacggatgaatatgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacatacaatggcaaaatgcctaca 17994659  T
Q  113 aataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17994660 aataatatgataaaatttaagtcaccgaaatacctatggttccggatgtgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatttgt 17994743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 10929886 - 10929746
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  10929886 aacaaactcacagcatccaagttaatagcattcaacaacaaaatgcctataaataatatgataaaatttaaatcaccagaatacacatgcttccggatct 10929787  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10929786 gcaacgttgatgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 10929746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 24 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4100594 - 4100419
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4100594 atacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacaacacc-aagttaatatcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgat 4100496  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||        ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4100495 aaaacttaagtcaccgaaata-ccatgcttccggatc--------tgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 4100419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4264661 - 4264553
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||||| |||     
T  4264661 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaatttgaagtcatcgaaatacccatgcttccagatttggaacattgactcctaaatcattgattaaatc 4264562  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    |||||||||    
T  4264561 tgtaattga 4264553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17151644 - 17151504
Alignment:
Q  63 acaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaataccc-atgcttccagatct 161  Q
    ||||||||||| ||  |||| ||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  17151644 acaaactcacaacattcaagttaatagcatacaacaacaaaatacctactaataatatgataaattccaagtcaccgaaatacccaatgcttccggatct 17151545  T
Q  162 gcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17151544 acaacgtcgacgcccaaatcattgattgaatctgtaattga 17151504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37994523 - 37994371
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  37994523 gtaaaagatgaatctgcgaacaaactcacaacacccaagttaatagcatataacagcaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccggaat 37994424  T
Q  144 acccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgt 196  Q
    |  | | ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37994423 attctttcttccggatctgcaacgctgacgtccaaatcattcattgaatttgt 37994371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14955773 - 14955618
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14955773 aaaatataaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacacctaagttaataacatacaatgataaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcatc 14955674  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
      ||||| |||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14955673 agaatacacatgtttctggatctgcaacgttgacgctcaaatcattgattgaattt 14955618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24461697 - 24461534
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  24461697 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaacctgcgaacaaactcacaacaccaaagttaatagcatataacgacaaaatacctacaaaaaatatgatgaaat 24461598  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||| ||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||    
T  24461597 ctaaatcaccaaaatactaatgcttccggatctgcaacgttggcgtccaaatcatcgattgaat 24461534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Original strand, 34128540 - 34128700
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||| | |||| || ||||| ||||||  | ||||| ||||| ||  |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |    
T  34128540 aaaatgtaaagggtgaatctgcaaacaacctcacaatatccaagttaataacatactgcgacaaaatgcctataaataatatgataaaatccaagtaatc 34128639  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  34128640 gaaatacccaagatttcagatatgcaacattgacgcccaaataattgattgaatttataat 34128700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 206
Target Start/End: Original strand, 28533830 - 28533977
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| | ||| ||| |||    
T  28533830 gcgaacaaactcacaacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatacctacaaataatatgataaaatccaaatcacccgaatatcaatgtttctaga 28533929  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtga 206  Q
    | |||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  28533930 tttgcaaagttgacgtccaaatcatttattgaatctgtgattgagtga 28533977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 61 - 193
Target Start/End: Original strand, 43396996 - 43397129
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  43396996 gaacaaactaacaacacccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcgtacaaataatatgataaaacctaagtcactgaaattcacatgcttccggatc 43397095  T
Q  161 tgc-aacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    | | ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43397096 ttcaaacgttgacgcccaaatcattggttgaatt 43397129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 104 - 215
Target Start/End: Original strand, 39310774 - 39310884
Alignment:
Q  104 atgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||     
T  39310774 atgcctacaaataatatgataaaatctaagtcactgaaatacccatgcct-cggatgtgcaatgttgatgcccaaatcaatgattgaatttgtaattgac 39310872  T
Q  204 tgatgtccatct 215  Q
    ||| ||| ||||    
T  39310873 tgaagtcgatct 39310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Original strand, 32448494 - 32448638
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat---aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccag 157  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||| |||||  ||||| | ||||||  |    
T  32448494 gaacaaactcacaacatccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaataatatgatataataatctaaatcaccagaatactcttgcttctgg 32448593  T
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32448594 atctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 32448638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 95 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41694809 - 41694703
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  41694809 aacgacaaaatgcctataaataatatgataaaatctaagtcaccagaatctacatgcttctgcatctgcaacgttgatgcccaaatcattgattgaatat 41694710  T
Q  195 gtaattg 201  Q
    |||||||    
T  41694709 gtaattg 41694703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 194
Target Start/End: Original strand, 19595767 - 19595914
Alignment:
Q  50 gataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaata---gcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacc 146  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||   |||  ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||      
T  19595767 gataaatctgcaaacaaactcacagcatccaagttaataatagcatacaaaggcaaaatacctacaaataatatgataaaatcaaaatcatcaaaatatt 19595866  T
Q  147 catgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19595867 catgcttccagatcggcaattttgacgcccaaatcatttattgaattt 19595914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Original strand, 33760039 - 33760200
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| | || |  |||||||| ||||||| |||| |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  33760039 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgagtctgtaaacaaactaacagcacacaagttaatagcttacaacagcaaaatgcctacaaataatatgataagtt 33760138  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattga 190  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33760139 ctaagtcactgaaatacacatgtttatggatctgcaacatcgacgctcaaatcattgattga 33760200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7448421 - 7448321
Alignment:
Q  109 tacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||    
T  7448421 tacaaataatatgataaaacttaagtcactgaaatactcatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaattattggttgaatatgtaattgactgatg 7448322  T
Q  209 t 209  Q
    |    
T  7448321 t 7448321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 14423514 - 14423406
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatt 193  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||     
T  14423514 caacggcaaaatgcctaaatataatatgataaaatctaactaacctaaatacccatgtttctagatttgcaacgttgacgtccaaatcattgattaaatc 14423415  T
Q  194 tgtaattga 202  Q
    |||||||||    
T  14423414 tgtaattga 14423406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 9986177 - 9986332
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  9986177 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 9986276  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  9986277 cggaatacccatggcctccgaatctgcaacgttgacgcccaaatctttaattgaat 9986332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 202
Target Start/End: Original strand, 23933512 - 23933638
Alignment:
Q  76 acccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcc 175  Q
    ||||||| |||||||   ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | || |||||||||||||| || ||| |||||| |    
T  23933512 acccaagttaatagcttacaacggcaaaattcctacaaataatatgataaaatctaaatcaccagattatccatgcttccagatatgtaacgttgacgtc 23933611  T
Q  176 caaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  23933612 caaataattgattgaatctgtgattga 23933638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Original strand, 38575326 - 38575474
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||| |||    
T  38575326 taaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagataatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaat 38575425  T
Q  144 accca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38575426 atccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 38575474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16376168 - 16376030
Alignment:
Q  54 aatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt 153  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||| |||| |||  ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||| |||||||    
T  16376168 aatctgcgaacaaactcacatcatccaagttaatcgcatacaacaccaaaatgactacaaataatatgataaaatttaaatcatcataatacacatgctt 16376069  T
Q  154 ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
        ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16376068 ttgaatctgcaactttgacgccgaaatcattgattgaat 16376030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8806122 - 8805957
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8806122 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaatctcacaacatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaatatatgataaaa 8806023  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| |||| |||| ||||| | |||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  8806022 ttaaagtgaccggaatatccatgacctccgaatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaat 8805957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 199
Target Start/End: Original strand, 22538203 - 22538317
Alignment:
Q  79 caagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaa 178  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||      | |    
T  22538203 caagttaatagcatgcaacgacaaaatatttacaaataatatgataaaatttaagtcacagaaatattcatgcttccatatctgcaacgtt------cga 22538296  T
Q  179 atcattgattgaatttgtaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22538297 atcattgattgaatttgtaat 22538317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 84016 - 84171
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctac-aaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || ||||||||| |||  ||||||||||||  ||||  |    
T  84016 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacgaaaatatatgataaaattaaagtggc 84115  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  84116 cggaatatccatgacatccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 84171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 154
Target Start/End: Original strand, 18107626 - 18107721
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttc 154  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18107626 gcgaacaaactcacaacacgcaagttaataatataaaacgacaaaatgcctacaaataatatgattaattctaagtcatcgaaatacacatgcttc 18107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 138
Target Start/End: Original strand, 6358758 - 6358836
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6358758 cgaaaaaactcacaacacccaagttaatagcatacaacgacaaaatacgtacaaataatatgataaaatctaaatcacc 6358836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32913481 - 32913331
Alignment:
Q  44 gtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaa 142  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||||   |||| || ||||| |||||| | ||||||||||||  |||| |||| ||    
T  32913481 gtaaaggatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcatacaaaaatatatgataaaattaaagtgaccgtaa 32913382  T
Q  143 tacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  32913381 tatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 32913331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17319566 - 17319423
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgccta--caaataatatgataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| ||   ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |    
T  17319566 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacgacatccaagttaataacatataacgacataatgcctatacaaata-tatgataaaattaaagtga 17319468  T
Q  137 ccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatc 181  Q
    ||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||    
T  17319467 ccggaatacccatgctttcggatctgcaacgttgacgctcaaatc 17319423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 21570249 - 21570398
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||||| | |||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||  ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||    
T  21570249 taaaggctgaatctgcgaacaaacttacagcattcaagttaatagcatacaacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgaacggaat 21570348  T
Q  144 acccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21570349 attcatggcctccggatctgcaacattgacgcccaaatctttgattgaat 21570398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 202
Target Start/End: Original strand, 29574506 - 29574647
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||||| |  ||||  ||||||||   || ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||  ||||||||| ||||    
T  29574506 gaacaaactcacaacgtccaaattaatagcatataatgacaaaatgactacaaaaaatatgatgaaatctaaatcatcataatattcatgcttccggatc 29574605  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29574606 tgcaacgttggcgtccaaatcattgattgaatctgtgattga 29574647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 20046917 - 20047072
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||  |   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  20046917 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaaatcacagcatccaagttaataagatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 20047016  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || ||||  ||| || ||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||    
T  20047017 cggaatattcatggcctccggatctgcaacgttgatgtccaaatctttgattgaat 20047072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37416934 - 37416791
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||| | ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||| ||||||||| |     
T  37416934 gcgaacaaacttataacacccaagttaacaacatacaacggcaaaatgtctacaaataatatgataaaatataaatcactagaatacacatgcttccggg 37416835  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37416834 cctgcaatgttgacatccaaatcattgattgaatctgtgattga 37416791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 2808298 - 2808462
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| | |||||| |||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  2808298 aacatcgctaaaaacgtaaaggatgaatctgtgaacaa-ctcacatcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 2808396  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||| | || |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  2808397 ttaaagtgatcggaatatccatggcttccggatctgcaacgttgacgccaaaatctttgattgaat 2808462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 4228369 - 4228280
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  4228369 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaa 4228280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 192
Target Start/End: Original strand, 7015536 - 7015701
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaa 127  Q
    |||| |||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  7015536 aacacagctaaaaacgtaacgaatgaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaa 7015635  T
Q  128 tctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |  |||  || | |||| |||| || | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7015636 ttaaagcgacgggaatatccatggcattcggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 7015701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 28871634 - 28871807
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||| |||||||| ||| | || ||||||||| |    
T  28871634 aacattgctaaaaatataaagggtgaatccacgaacaaactcacagcatccaagttaatagtatacaacggcaaaatgcttacgattagtatgataaatt 28871733  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
     | ||||||  |||||  |||| |||   ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  28871734 ttgagtcactaaaatatacatgattctgaatctgcaacgtcgacgcctaaatcattggttgaatctgtaattga 28871807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 42577296 - 42577176
Alignment:
Q  95 aacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaattt 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    | | | ||||| || |||||||  | |||||| ||| |||||||||    
T  42577296 aacgacaaaatacctacaaataatatgatcaaatcaaagtgaccgaaatatttgttcattcagatttgtaacattgttggccaaattattaattgaattt 42577197  T
Q  195 gtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  42577196 gtaattgattgatgtcaatct 42577176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6173814 - 6173723
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6173814 aatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 6173723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18695238 - 18695147
Alignment:
Q  99 acaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattga 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||   |||||||  ||||  || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18695238 acaaaatgcctataaataatatgataaaattaaagtggtcgaaatattcatggctctagatctgcaacgttgacgaccaaatcattgattga 18695147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 25087283 - 25087128
Alignment:
Q  38 taaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcac 137  Q
    ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| |  ||||||||||||  ||||||||| ||  |||| ||    
T  25087283 taaaacgtaaaggatgaatctgggaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacggcttaatgcctacaaaatatatgataagattaaagtgac 25087184  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
     | |||| ||||| ||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25087183 tggaatatccatggcttctgaatctgcaacgttgacgtccaaatcattgattgaat 25087128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 41431274 - 41431119
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||| |   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||     
T  41431274 aaaacgtaaaggataaatctgcgaataaactcacaacatccaagttaatagtatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcat 41431175  T
Q  138 cgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | ||  |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  41431174 cggaatatccatggtctctggatctgcaacgttgacatccaaatctttgattgaat 41431119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 27248986 - 27249140
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || ||||| |||||| | ||||||| ||||  |||| ||    
T  27248986 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatgcgtacaaaaatatatgatgaaattaaagtgac 27249085  T
Q  138 cgaaataccca-tgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    || |||| ||| ||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  27249086 cggaatatccattgcctcaggatctgcaacgctgacgcccaaatctttgattgaa 27249140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Original strand, 12647004 - 12647128
Alignment:
Q  75 cacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgc 174  Q
    |||||||| ||||||||   |||  ||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  12647004 cacccaagttaatagcatctaacagcaaaatgcctacaaaaaatatg---aaatctaaatcaccaaaatattcatgcttccggatctacaacattggcgt 12647100  T
Q  175 ccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||    
T  12647101 ccaaatgatcgattgaatctgtgattga 12647128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27477394 - 27477239
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||| || ||||| |||||| |   ||||  | |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  27477394 aaaatgtaaatgatgaatctgcgaacatactcacaacatccaagttaatagtatttaacggtataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 27477295  T
Q  138 cgaaatacccatg--cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||||||| | |||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27477294 cgaaatatctatggtcttcc-gatctgcaacgttgatgcccaaatctttgattgaat 27477239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 192
Target Start/End: Original strand, 32678952 - 32679100
Alignment:
Q  45 taaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaat 143  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||    
T  32678952 taaatgatgaatctgcgaacaaactcacaaca-tcaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaat 32679050  T
Q  144 acccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | | || || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  32679051 atctatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 32679100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 33229014 - 33229131
Alignment:
Q  78 ccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcc 175  Q
    ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  |||| || | |||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||    
T  33229014 ccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgactggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgcc 33229113  T
Q  176 caaatcattgattgaatt 193  Q
    |||||| |||||||||||    
T  33229114 caaatctttgattgaatt 33229131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 281042 - 280946
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgac-aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagt 134  Q
    |||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  281042 aaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaaaaatatacaaataatatgataaattctaagt 280946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45128426 - 45128295
Alignment:
Q  63 acaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatc 160  Q
    ||||||||||| || ||||  ||||||||   ||| ||| |||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| ||||    
T  45128426 acaaactcacaacatccaaattaatagcatataacaacataatgtctacaaaaatatatgataaaattaaagtcaccggaatatccatggcttccggatc 45128327  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  45128326 tgcaacgttaacgtccaaatctttgattgaat 45128295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 40659767 - 40659922
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctac--aaataatatgataaaatctaagtca 136  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||  |||||| || || ||||  |||| |    
T  40659767 aaaacgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagcatataacggcataatggctacagaaataa-attatgaaattaaagtga 40659865  T
Q  137 ccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    ||| |||| |||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40659866 ccggaatatccatggcctccggatctccaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 40659922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 41327963 - 41327898
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgata 124  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41327963 gcgaataaactcacatcacctaagttaatagcatacaatgccaaaatgcctacaaataatatgata 41327898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 128
Target Start/End: Original strand, 8971465 - 8971553
Alignment:
Q  41 aatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaat 128  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| || |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  8971465 aatgtaaaggatgaatatgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcataatgtctacaaaaatatatgataaaat 8971553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 30420915 - 30420863
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagca 91  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  30420915 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaatagca 30420863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 19598063 - 19597996
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaa 126  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  19598063 gcgaacaaattcacaacactcaagttaatagcatacaacggtaaaatgtctacaaataatatgataaa 19597996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3241011 - 3240977
Alignment:
Q  158 atctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3241011 atctgcaacattgacgtccaaatcattgattgaat 3240977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 10548408 - 10548326
Alignment:
Q  62 aacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaata 144  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||  |||| |||||||||    
T  10548408 aacaaactcacaacatccaagttaataacatacaacaacaaaatgcctataaataatttgagaaaattaaagtgaccgaaata 10548326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 34124677 - 34124619
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataata 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || | ||||| ||||||| |||||||||||    
T  34124677 gaacaaactcacagcatccaagataataacatgtaacgaaaaaatgcatacaaataata 34124619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36234190 - 36234100
Alignment:
Q  103 aatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaa 191  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||  |||| |||| |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  36234190 aatgcctacaaaaatatatgatgaaattaaagtgaccggaatatccattgcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaa 36234100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 215
Target Start/End: Original strand, 42698675 - 42698733
Alignment:
Q  157 gatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  42698675 gatctgcaacgctgacgtccaaatcactgattgaatttgtaattcactgatgtcgatct 42698733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4193083 - 4192934
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| ||||  |||||| |||||||| | | ||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  4193083 aaaacgtaaaggatgaatctccgaacacactcacagtatctaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 4192984  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattga 186  Q
    || |||| | || || ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4192983 cggaatatctatggcctccggatctgcaacgttgacgctcaaatctttga 4192934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 6174062 - 6174013
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaata 88  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  6174062 aaaatgtaaaggatgaatctgcgaacaaactcacaacatccaagttaata 6174013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 81
Target Start/End: Original strand, 31193170 - 31193234
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaa 81  Q
    |||||||||||||||||  || |||| ||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||||    
T  31193170 acatcagatacaaacatcactaaaaacgtaaagggtgaatttgcgaacaaactcacaacacccaa 31193234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 120
Target Start/End: Original strand, 42698593 - 42698661
Alignment:
Q  52 taaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat 120  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||  | ||||||||||||||||||    
T  42698593 taaatctgcgaataaattcacagcacccaaattaataacatgcaacggtataatgcctacaaataatat 42698661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 111; Significance: 3e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Original strand, 65875 - 66073
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| |||||||||| | | |||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  65875 acatcatatacaaacatcggtaaaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacactcaagttaatagcatacaacgacaaaatgcctacaaata 65974  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  65975 atatgataaaacataagtcaccgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggcacccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgtcgatct 66073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15748 - 15556
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  15748 acatcagttacaaacatcgctaaaaacataaagagtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaata 15649  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgt 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15648 atatgataaaacctaagtcaccgaaatatccatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattgactgatgt 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 51010 - 50847
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51010 aaaatgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaatggcaaaatgcctacaaataatatgataaaacttaagtcacc 50911  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50910 gaaatatccatgcttccggatctgcaacgttgacgtccaaatcattggttgaatttgtaattga 50847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 208
Target Start/End: Original strand, 71140 - 71324
Alignment:
Q  24 atacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgat 123  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||  | |||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  71140 atacaaacatcgctaaaaacgtaaaggattaatctacaaacaaacttacaacacccaagttaatagcatacaacaacaaaatgcctacaaataatataat 71239  T
Q  124 aaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  71240 aaaatctaagtcatcaaaatacccatgcttccggatctgcaacgttgacaccccaatcattgattgaatttataattgactgatg 71324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1600 - 1409
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| || |||||||||||| || ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  1600 acatcagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcataaaacggcaaaatgcctacaaata 1501  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatg 208  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||    
T  1500 atatgataaaacctaaatcaccgaaattcacatgcttctagaactgcaacgttgacgcccaaattattggtcgaatttgtaattgactgatg 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0128 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0128
Description:

Target: scaffold0128; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 37082 - 36898
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcaccc-aagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||  |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   |||  |||||| |||||||||    
T  37082 acatcagatacacacatcgctataaacttaaatgatcaatctacgaacaaactcacaacaccccaagttaatagcataaaacatcaaaatacctacaaat 36983  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36982 aatatgataaaatctaaatcactgaaatacccatgcttccagattagcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 36898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0884 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0884
Description:

Target: scaffold0884; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 202
Target Start/End: Original strand, 1807 - 1991
Alignment:
Q  18 catcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataa 117  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||  ||||  ||||||||||||||||||    
T  1807 catcaggtacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcataacacccaagttaataacatacaacagcaaaatgcctacaaataa 1906  T
Q  118 tatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1907 tatgataaaacctaaatcaccgaaatacttatgttttcggatctgcaacgttgacgcccaaaccattggttgaatttgtaattga 1991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 8769 - 8570
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcg-gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaat 115  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||  ||   | |||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||| |||||||||||| | |    
T  8769 acatctgatacaagcatagctaaaaacgtaaaggattcattttgggaacaaactcacagtacccaacttaatagcatacaacggcaaaatgcctacgatt 8670  T
Q  116 aatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  8669 aatatgataaaacataattcaccgaaatacccattcttccagatctgcaacgttgacgcccaaatcattggttgaatttgtaagagactgatgtcgatct 8570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0136
Description:

Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 9879 - 10073
Alignment:
Q  21 cagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatat 120  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9879 cagatacaaacatcgctaaaaacgtaaagggtgaatctgcgaacaaactcacagcacccaagtcaatagcataaaacggaaaaatgcctacaaataatat 9978  T
Q  121 gataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||| | || |||| ||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9979 gataaaacccaattcactgaaatacacatgtttctggatctgcaacgttgactctcaaatcattggttgaatttgtaattgatcgatgtcgatct 10073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 38306 - 38111
Alignment:
Q  22 agatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatg 121  Q
    ||||||||| || ||  |||| ||||| ||| ||||  ||||||||| || | |||||||| ||||||||   | || |||||| |||||||||||||||    
T  38306 agatacaaatatcgcaaaaaacgtaaatgatgaatctacgaacaaacccataacacccaagttaatagcatatagcg-caaaatccctacaaataatatg 38208  T
Q  122 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgctt---ccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgatgtccatct 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||  |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  38207 ataaaatctaagtcaccgaaatacccatgtttccgccggatcaacaatgttgacacccaaatcatcgattgaatttgtaattgactgaagtctatct 38111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0136; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 34617 - 34767
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||| || | ||| |||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||     
T  34617 aaaatatagaggatgaatctgcgaacaaacttacaacatctaagttaaaggcatacaacaacaaaatgcctacaaataatatgataaaattaaagtgact 34716  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattg 189  Q
    | || || ||||  ||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||    
T  34717 ggaaaactcatgtctccggatttgcaacgttgacgcataaatcattgattg 34767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 71703 - 71882
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  71703 acatcagatacaaacatcgctagaaacgtaaagggtgaatctccgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatacaacggcaaaatgcctacaaata 71802  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||||||||||  ||||||||      |||||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  71803 atatgataaaacttaagtcac------acccatgcttccggatctacaacgttgacatccaaatcattggttgaatttgtaattga 71882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 202
Target Start/End: Original strand, 57933 - 58106
Alignment:
Q  29 aacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaat 128  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  57933 aacatcgctaaaaacgtaaaggataaatctgcgaacaaactcacagcatccaagttaatagcatataacggcaaaatgcctacaaaaaatatgatgaaat 58032  T
Q  129 ctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||    
T  58033 ctaaatcaccagaatactcatgcttccggatctgcaatgttgacgtccaaatcatcgattgaatctgtgattga 58106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6264 - 6101
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcacc 138  Q
    |||||||||| | | |||| || |||||||||||| || ||||| |||||||  | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6264 aaaatgtaaaaggtgaatctgcaaacaaactcacaacatccaagttaatagcttgtaacaacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcacc 6165  T
Q  139 gaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6164 agaatacacatgcttccggatctgcaacattgacatccaaatcattgattgaatatgtgattga 6101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 1736 - 1835
Alignment:
Q  101 aaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1736 aaaatgcctacaaataatatgataaaatataagtcatcgaaatacccatgcttccggatctgcaacgttggtgcccaaatcattgattgaatttgtaatt 1835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 195
Target Start/End: Original strand, 14704 - 14881
Alignment:
Q  17 acatcagatacaaacatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata 116  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||   |||||||| ||||||||    
T  14704 acatcatatacaaacatcactaaaaatataaaggatgaatttgcgaacaaactcacagcacccaagttaatagcatataatagcaaaatgcatacaaata 14803  T
Q  117 atatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttg 195  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||    
T  14804 atatgataaa-tctaagtcatcgaaatactcatgtttccggatctgcaatgttgattcctaaatcattgattgaatttg 14881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 201
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1695
Alignment:
Q  36 cttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtc 135  Q
    ||||||| ||| ||| | |||| ||||||||||||||| || | ||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1530 cttaaaacgtatagggtgaatctgcgaacaaactcacatcatcaaaattaatagcatataacgataaaatgcctacaaataatatgataaaatctaaatc 1629  T
Q  136 accgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattg 201  Q
    |||  |||||||||| |||  ||||| | || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1630 accagaatacccatgtttctggatctactacgttgatacccaaatcattgattgaatttgtgattg 1695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 93307 - 93174
Alignment:
Q  73 agcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgac 172  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||  |||||||||  |||  |||||||||| |||||    
T  93307 agcacccaagttaatagcacacaacaacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatttaaatcaccagaatacccatatttctggatctgcaacgttgac 93208  T
Q  173 gcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtga 206  Q
    | || ||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  93207 gtcctaatcattgattcaatatgtgattgagtga 93174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 192
Target Start/End: Original strand, 92373 - 92504
Alignment:
Q  61 gaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatc 160  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||  ||||||||||||||  ||||    
T  92373 gaacaaactcacatcacttaagttaatagtatgcaacaacaaaatgcctacaaacaatatgataaaatttaaactaccagaatacccatgcttctggatc 92472  T
Q  161 tgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  92473 tacaacgttgacgtccaaatcattgattgaat 92504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 16155 - 16310
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||  |||| ||    
T  16155 aaaacgtaaaggaagaatcagcgaacaaactcacatcatccaagttaatagcatataacgacataatgcctacaaaaatatataataaaattaaagtgac 16254  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16255 cggaatatccatagcctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 16310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0495 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0495
Description:

Target: scaffold0495; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5640 - 5485
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||    
T  5640 aaaacgtaaaggatgaatttgcgaacaaacttacagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtcac 5541  T
Q  138 cgaaatacccat-gcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| |||| || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  5540 cggaatatccatggcctccggatctgcaacgttgacgtccaaatctttgattgaat 5485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25455 - 25353
Alignment:
Q  108 ctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattgagtgat 207  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||   ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  25455 ctacaaataatatgatcaaatctaagtcacagaaatactcatgtttttggatctacaatgttgacgctcaaatcattgatttaatttgtaattaactgat 25356  T
Q  208 gtc 210  Q
    |||    
T  25355 gtc 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8935 - 8778
Alignment:
Q  37 ttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtc 135  Q
    |||||||||||||||| |||  | |||||||||| ||| | ||||| ||||||||   |||| || |||||||||||| | ||||||||||||  ||||     
T  8935 ttaaaatgtaaaggatgaatatgtgaacaaactcgcagtatccaagttaatagcatataacggcataatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtg 8836  T
Q  136 accgaaatacccatgct-tccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    |||  |||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8835 accagaatatccatggtctccggatctgcaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 8778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 202
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4058
Alignment:
Q  30 acatagcttaaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatc 129  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||     || ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3891 acatcgctaaaaatgtaaagggtaaatctgcgatcaaactcccatcatccaagttaatagcat----cggcaaaatgtctacaaataatatgataaaatt 3986  T
Q  130 taagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    ||| |||||  |||| ||||| ||||  || |||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  3987 taaatcaccagaata-ccatgtttccgtatatgcaacgttgacgtctaaatcattggttgaatctgtgattga 4058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4361 - 4273
Alignment:
Q  84 taatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccagatctgcaacattgac 172  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || |||| | |||||||||| |||||    
T  4361 taatagcatccaatgacaaaatgtctacaaataatatgataaaatctaaatcatcaaaatactcaagctttcggatctgcaacgttgac 4273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0603 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0603
Description:

Target: scaffold0603; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7929 - 7787
Alignment:
Q  59 gcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccgaaatacccatgcttccaga 158  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||   |||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||  |||||||||| ||    
T  7929 gcgaacaaactcacaacacccaagttaataacatacaatagcaaaatccctacaaataatatgataaattataactca-ctacattaccatgcttccgga 7831  T
Q  159 tctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaatttgtaattga 202  Q
    | |||||| | ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  7830 tatgcaacgtcgacacccaaataattgatggaatttataattga 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 134
Target Start/End: Original strand, 26951 - 27025
Alignment:
Q  60 cgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagt 134  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||   ||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26951 cgaacaaactcacagcacgcaagttaatagcatataataacaaaatggctacaaataatatgagaaaatcaaagt 27025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 192
Target Start/End: Original strand, 201208 - 201363
Alignment:
Q  39 aaaatgtaaaggataaatcggcgaacaaactcacagcacccaagctaatagcaagcaacgacaaaatgcctacaaata-atatgataaaatctaagtcac 137  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||| |||||||| | ||||  ||||||||   |||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||    
T  201208 aaaatgtaaaggatgaatttgtgaacatactcacagaatccaatttaatagcatataacggcatgatgcctacaaaaatatatgataaaattaaagtgac 201307  T
Q  138 cgaaatacccatg-cttccagatctgcaacattgacgcccaaatcattgattgaat 192  Q
    || |||| ||||| | | | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  201308 cggaatatccatggcctacggatctacaacgttgacgcccaaatctttgattgaat 201363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 139
Target Start/End: Original strand, 18992 - 19037
Alignment:
Q  94 caacgacaaaatgcctacaaataatatgataaaatctaagtcaccg 139  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18992 caacggcaaaatgcatacaaataatatgataaaatccaaatcaccg 19037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University