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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF2856-Insertion-4 (Length: 948)
Name: NF2856-Insertion-4
Description: NF2856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF2856-Insertion-4 |
 |  |
|
| [»] chr4 (34 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (54 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr5 (40 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr2 (48 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr6 (32 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (34 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (45 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0494 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0201 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0219 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0513 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0169 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0794 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0199 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1379 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 905; Significance: 0; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 905; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 4775108 - 4774169
Alignment:
| Q |
8 |
ttctttgcacccaaatggtataatatgcttttggacattctttaatttgcacaaaattattggttatatttgtctacatacattatgtgatgtgatattt |
107 |
Q |
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| T |
4775108 |
ttctttgcacccaaatggtataatatgcttttggacattctttaatttgcacaaaattattggttatatttgtctacatacattatgtgatgtgatattt |
4775009 |
T |
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| Q |
108 |
gtgaaggtcacaagttgcaatttgaaacgttgcagcttcttatttatccaaaactataattctatttgatcacgaggacaaaataactcgtcccatgaac |
207 |
Q |
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| T |
4775008 |
gtgaaggtcacaagttgcaatttgaaacgttgcagcttcttatttatccaaaactataattctatttgatcacgaggacaaaataactcgtcccatgaac |
4774909 |
T |
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| Q |
208 |
ttatttccctggtttttaaattatgatttcactttatgatcaagtgattaagcatgtgcaatttaatgtcgccacaaagagtgctgttcctatatgtccc |
307 |
Q |
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| T |
4774908 |
ttatttccctggtttttaaattatgatttcactttatgatcaagtgattaagcatgtgcaatttaatgtcgccacaaagagtgctgttcctatatgcccc |
4774809 |
T |
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| Q |
308 |
ccaccaaaattaaagtcttcgcactttgtttgaagttgtgaacaagttctacaagtaacttcactattgtcttgattagaagtttatgtttggaaaattg |
407 |
Q |
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| T |
4774808 |
ccaccaaaattaaagtcttcgcactttgtttgaagttgtgaacaagttctacaagtaacttcactattgtcttgattagaagtttatgtttagaaaattg |
4774709 |
T |
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| Q |
408 |
ttgttgacacatttcataagctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagttagaatttaaaagttggttgtagttaactgccgaggaa |
507 |
Q |
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| T |
4774708 |
ttgttgacacatttcataagctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagttagaatttaaaaattggctgtagttaactgccgaggaa |
4774609 |
T |
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| Q |
508 |
aacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaagg |
607 |
Q |
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| T |
4774608 |
aacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaagc |
4774509 |
T |
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| Q |
608 |
caatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
707 |
Q |
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| T |
4774508 |
caatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaatcgacatttggttcaaa |
4774409 |
T |
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| Q |
708 |
atacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
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| T |
4774408 |
atacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
4774309 |
T |
 |
| Q |
808 |
atgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataag |
907 |
Q |
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| T |
4774308 |
atgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataag |
4774209 |
T |
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| Q |
908 |
ccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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| T |
4774208 |
ccaagccatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
4774169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 18578684 - 18579140
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
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| T |
18578684 |
agttatctgccgagaaaaacatttatgcagacagtggattctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggctagtttttacttgtaattcaac |
18578783 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
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| T |
18578784 |
cagagtatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcactcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
18578883 |
T |
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| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
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| T |
18578884 |
ccgacatttgattcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
18578983 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
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| T |
18578984 |
attaaatcacttcttacattcaacgcaattgcatatagaactaacatacatatataatatattatcttctaccatattccgaaacataaattcgacgtcg |
18579083 |
T |
 |
| Q |
891 |
ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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| T |
18579084 |
ctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
18579140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 44051106 - 44050657
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
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| T |
44051106 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcaaacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacttgtaattaa |
44051007 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
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|
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| T |
44051006 |
accagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
44050907 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacaca |
783 |
Q |
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| T |
44050906 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacaca |
44050808 |
T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
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|
| T |
44050807 |
tcattaaattaaatccctacttgcattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
44050708 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
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| T |
44050707 |
gacgtcgctatcgtcgcgaataagccaa-acatatagcttgttgttttccat |
44050657 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 10423420 - 10422985
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
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| T |
10423420 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttttgcataaatctaaagcaattccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaa |
10423321 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10423320 |
accagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatac-atatcttttacaattgtccataattaaatta |
10423222 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
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|
|
| T |
10423221 |
aaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaatgtgtccataattaa----------acaactcattacatatcatt |
10423132 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
10423131 |
agattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
10423032 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
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| T |
10423031 |
cgcaatcgccgcgaataagccaagacatatagcttgtcgttttccat |
10422985 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 493 - 948
Target Start/End: Original strand, 38460489 - 38460933
Alignment:
| Q |
493 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaacca |
592 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38460489 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagtcagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaacca |
38460588 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
38460589 |
gagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaattaaacc |
38460688 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaat |
792 |
Q |
| |
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|
| T |
38460689 |
gacatttgattcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatgattatat |
38460778 |
T |
 |
| Q |
793 |
taaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
892 |
Q |
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|
|
| T |
38460779 |
taaatccctacttacattcatcacaattgcatatgcaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattctgaaacataaatccaacgtcgct |
38460878 |
T |
 |
| Q |
893 |
atcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
38460879 |
atcgtctttaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgcattcatct |
38460933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 37395229 - 37394768
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37395229 |
agttaattgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
37395131 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37395130 |
accagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
37395031 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa---caacacatta--caactcattacaca |
783 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| | | | |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37395030 |
aaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacaca |
37394932 |
T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37394931 |
tcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatct |
37394832 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37394831 |
gacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatacaacttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
37394768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 498 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 3408245 - 3407804
Alignment:
| Q |
498 |
tgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatttaaccagag |
595 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3408245 |
tgccgaggaaaactgattatgtagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaaaccagag |
3408147 |
T |
 |
| Q |
596 |
catttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgac |
695 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
3408146 |
catttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgac |
3408047 |
T |
 |
| Q |
696 |
attt-ggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaatta |
794 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3408046 |
attttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaatta |
3407957 |
T |
 |
| Q |
795 |
aatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctat |
894 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
3407956 |
aatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgt |
3407857 |
T |
 |
| Q |
895 |
cgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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cgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgtgtattcatct |
3407804 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 24415393 - 24415678
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Q |
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tttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaac |
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T |
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acattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccacc |
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Q |
| |
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|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |
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acattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccatc |
24415592 |
T |
 |
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atattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagcc--atatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
24415593 |
atattccgaaacataaatgcaacgtcgctatcgtcttcaataagtcaaggcatatatagcttgtcgttttcca-tgtgtattcatct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
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T |
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ttaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatgga |
829 |
Q |
| |
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| ||| | ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
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T |
 |
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929 |
Q |
| |
|
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|
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acgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatctgatgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgtt |
10374529 |
T |
 |
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ttccattgcgtattc |
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Q |
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T |
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Target: chr4; HSP #10
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Target Start/End: Original strand, 49563923 - 49564350
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attatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaa |
49564021 |
T |
 |
| Q |
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tataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaa |
708 |
Q |
| |
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| T |
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tataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatattttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaat |
49564121 |
T |
 |
| Q |
709 |
tacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttaca |
808 |
Q |
| |
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| T |
49564122 |
taaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttaca |
49564211 |
T |
 |
| Q |
809 |
tgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagc |
908 |
Q |
| |
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| T |
49564212 |
ttcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagc |
49564311 |
T |
 |
| Q |
909 |
caagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
49564312 |
aaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Target: chr4; HSP #11
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Q |
| |
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|
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T |
 |
| Q |
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784 |
Q |
| |
|
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| T |
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atcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaattgtccataattaaacaacacattacaactcattacatat |
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T |
 |
| Q |
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cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
846 |
Q |
| |
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|
|
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cattaagttaaatcccaacttacattcatcacaattacatatagaacgaacatacatatata |
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T |
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Target: chr4; HSP #12
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T |
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
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| T |
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ccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgatacaaagtgttcataattaa----------acaattcatttcacatcattaa |
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T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatc |
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Q |
| |
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|
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Target: chr4; HSP #13
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
 |
| Q |
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcata--agcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
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| T |
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caaagcatttccgaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcagtcatataaacaagaaaaatacattatcttttatagtagtcaataattaaatca |
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T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
| ||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||| | ||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |
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|
| T |
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atccgacatttcgttaaaattacacgtatgtttgaaattcatcaaaacattaaagggtgtccataattaaacaacacattacaacatattacatatcatt |
6187007 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
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|
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6187008 |
aaattaaatctctactgacattctacgcatttgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattgctaaacataaatccaatgt |
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T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagc |
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Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
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Target: chr4; HSP #14
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Q |
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T |
 |
| Q |
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aaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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Target: chr4; HSP #15
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T |
 |
| Q |
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accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |
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|
| T |
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aacagagcatttcgaaaggcaaaataatctatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattattcataattaaatca |
50278637 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaccgacatttggttgaaattacacaaacgtttgaaattcat |
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Target: chr4; HSP #16
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|
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T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
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aaccagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcgaacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
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T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51492330 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
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cattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaa |
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T |
 |
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cataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
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|
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aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtaaaatatcttttacaattgttcataattaaat |
19069443 |
T |
 |
| Q |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaat |
735 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19069444 |
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19069492 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
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|
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 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| || | ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
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| |
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 491 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 30043434 - 30043046
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
30043434 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgcagacaataggttttgcataattg--aacca------agccatttt-cgaccagtttttacatgaaattcaac |
30043344 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||||||| | | ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
30043343 |
cagagcatttcaagaggcaatactattcgtacaacatttatactaagtcataaacaagaaaaatgtattatcttttacaattatccataattaaatcaat |
30043244 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
||||| | ||| ||| ||||| | |||||||||| || ||| | ||| | |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
30043243 |
ccgacgtagagttaaaattacacggatgtttgaaatttatcaaaacattaaagagtg-ccataattaaacaacacactacaacacattacatatcgttaa |
30043145 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
889 |
Q |
| |
|
|| ||||| || | |||| | | | | ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30043144 |
atgaaatctctggtgacattctatgaagttgcaaatggaacgaaaatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtc |
30043046 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 504 - 661
Target Start/End: Original strand, 24414909 - 24415066
Alignment:
| Q |
504 |
ggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttcca |
603 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24414909 |
ggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttatcggacagtttttacctgtaattaaaccagaacatttcca |
24415008 |
T |
 |
| Q |
604 |
aaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatat |
661 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24415009 |
aagataatataactcagaaaacatttaaactcaatcataagcaagaaaaatacaatat |
24415066 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Original strand, 44674199 - 44674438
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
589 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||| | | |||||| ||||||||| || |
|
|
| T |
44674199 |
agttaactgccgaggaaatctgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcctttttttggccagttttc-cctgtaattaaa |
44674297 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44674298 |
tcagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
44674397 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
44674398 |
accgacatttggttcaaattacacaaacatttaaaattcat |
44674438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 489 - 730
Target Start/End: Original strand, 37015957 - 37016199
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaac-aattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattt |
587 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| | ||||||| || ||||| ||||||| ||| | || ||||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37015957 |
gtagttaactgcccaggaaatctaattatggaggcagtgagctctgcatcattctaaaacattttcaagtcttttttcagccagtttttacctgtaatta |
37016056 |
T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37016057 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacatcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
37016156 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37016157 |
aaactgacgtttgattcaaattacagaaacgtttgaaattcat |
37016199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21472623 - 21472566
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21472623 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
21472566 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 44561469 - 44561412
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
44561469 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgagaaacacgagtaaaatacgattttg |
44561412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 34154541 - 34154469
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
34154541 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgagaaacacgggtaaaatacatttttgtcccatcggcagtta |
34154469 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6283573 - 6283518
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgt |
457 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6283573 |
aattgttgttgacacatttcatatgactgagaaacacgagtaaaatacgcttttgt |
6283518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 24417554 - 24417503
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacg |
450 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24417554 |
gaaaattgttgttgacacatatcataacgctgagacacacgagtaaaatacg |
24417503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 37959858 - 37959803
Alignment:
| Q |
401 |
aaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgttttt |
455 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37959858 |
aaaattgttgttgacacattacataaggctgaggcacacgagtaaaatacgttttt |
37959803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 958732 - 958674
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
958732 |
gaaaattgatgttgacacattttataaggctgaggcacataagtaaaatacgtttttgt |
958674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29700441 - 29700383
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgt |
457 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29700441 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgaggcacacaagtaaaatacgcttttgt |
29700383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 508 - 566
Target Start/End: Original strand, 51642096 - 51642154
Alignment:
| Q |
508 |
aacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcg |
566 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
51642096 |
aacaattatgcagatagtgggttctgcataattttaaagcattttcaaaccatttttcg |
51642154 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 467
Target Start/End: Original strand, 11494481 - 11494546
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataagc-tgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggca |
467 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
11494481 |
aattgttgtcgacacatttgaaaagggtgagaaacacgagtaaaatacgtttttgtcccctcggca |
11494546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 397 - 457
Target Start/End: Original strand, 51426468 - 51426529
Alignment:
| Q |
397 |
ttggaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgt |
457 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51426468 |
ttggaaaattgttgttgacacgtttcataaggcttaggcacacaagtaaaatacgtttttgt |
51426529 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 1656103 - 1655645
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1656103 |
gtagttaactgccgaggaaaacatttatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcactttcaagccatttttcggccagtttttacctgtaattta |
1656004 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1656003 |
atcagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaatttagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
1655904 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1655903 |
aacggacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaatcgttacatagtatccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
1655804 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1655803 |
aaattaaatcattacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
1655704 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1655703 |
cgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
1655645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 13178144 - 13177691
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13178144 |
agttaactgccgagaaaaacatttatgca-acagtgggttctgcataattataaagcacttccaagccattttttgaccagtttttacctgtaatttaac |
13178046 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13178045 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatatta--tttaaactcagtcataaacaagtaaaatataatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
13177948 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13177947 |
ccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccatagttaaacaacacattacaactcattacacattattaa |
13177848 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13177847 |
attaaatccctacttactttcaatgcaattgcatatggaatgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
13177748 |
T |
 |
| Q |
891 |
ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
13177747 |
ctatcgttgcgattaagccaagccatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
13177691 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 491 - 931
Target Start/End: Original strand, 19495101 - 19495544
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
19495101 |
agttaactgccgagaaaaactattatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagctatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
19495200 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19495201 |
cagagcatttccaaaggtaatataattcatacaacatttaaactcagtcataaataagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
19495300 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaa---tcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19495301 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaacgcgtgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaagtcattacacatcat |
19495400 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19495401 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaacg |
19495500 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgtttt |
931 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19495501 |
tcgctatcgtctcgaataagccaaggcatatagcttgccgtttt |
19495544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
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T |
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Q |
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aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatctttttacaattgtccataattaaat |
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T |
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786 |
Q |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattaca----tttacacatca |
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T |
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886 |
Q |
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ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatgtaatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgac |
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T |
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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
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Q |
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T |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
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T |
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aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 489 - 947
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T |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
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Q |
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T |
 |
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888 |
Q |
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aaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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T |
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cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatc |
947 |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #7
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Target Start/End: Original strand, 8459019 - 8459465
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T |
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| Q |
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690 |
Q |
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catagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
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T |
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Q |
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T |
 |
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948 |
Q |
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8459465 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 4518427 - 4517959
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T |
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| |
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T |
 |
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Q |
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T |
 |
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ttacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaaca |
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Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #9
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
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Q |
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caaagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaa |
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T |
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Q |
| |
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T |
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Q |
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ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
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T |
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accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatta |
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T |
 |
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aattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
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Q |
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9710928 |
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T |
 |
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gctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 50113366 - 50113829
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| |
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 |
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tccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 44470023 - 44469576
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788 |
Q |
| |
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T |
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888 |
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T |
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Target: chr1; HSP #13
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T |
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atacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
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T |
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T |
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Target: chr1; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 38689990 - 38690416
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Q |
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aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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Q |
| |
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T |
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cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Target: chr1; HSP #15
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T |
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taaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc |
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Q |
| |
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| |
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T |
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gcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagcc |
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| |
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Target: chr1; HSP #16
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T |
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Q |
| |
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T |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
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aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcatt |
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 |
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aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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 |
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cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
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Target: chr1; HSP #17
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688 |
Q |
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 |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
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| |
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 |
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aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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Q |
| |
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|
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cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
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| |
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||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
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Target: chr1; HSP #18
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Target Start/End: Complemental strand, 20353949 - 20353500
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T |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
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Q |
| |
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taaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattatacatca |
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T |
 |
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787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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Q |
| |
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|
|
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ttaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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T |
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gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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aattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcatt |
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| |
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T |
 |
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acacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacata |
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Q |
| |
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|
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acacatcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacata |
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T |
 |
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aatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
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| |
|
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Target: chr1; HSP #20
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| |
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ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
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Q |
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attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
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| |
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|
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 |
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ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
|
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Q |
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T |
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T |
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T |
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786 |
Q |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Q |
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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|
| T |
15051239 |
aataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaatta |
15051140 |
T |
 |
| Q |
711 |
cacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15051139 |
aacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------actactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
15051053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 547 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 22527650 - 22527467
Alignment:
| Q |
547 |
catttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagca |
646 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| || |
|
|
| T |
22527650 |
catttccaagccttttttcggctagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaaca |
22527551 |
T |
 |
| Q |
647 |
agtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
22527550 |
agataaatacaatatgttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcat |
22527467 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 530 - 730
Target Start/End: Original strand, 94498 - 94698
Alignment:
| Q |
530 |
tctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacattt |
629 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
94498 |
tctgcatcattctaaaacatttccaaggctttttttgaccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattg |
94597 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
729 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
94598 |
aaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca |
94697 |
T |
 |
| Q |
730 |
t |
730 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
94698 |
t |
94698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 491 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 21144643 - 21144405
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaa-ttatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
589 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||| | || |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| | || |
|
|
| T |
21144643 |
agttaagtgccgaggaaaacaaattatgaagacagtgagctctgtatgattctaaaacatttccaagccatttttcggccagtttttatctgtaagtaaa |
21144544 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21144543 |
gcagagaatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtctataattaaatcaa |
21144444 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattc |
728 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
21144443 |
atcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattc |
21144405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 572 - 730
Target Start/End: Original strand, 31780110 - 31780268
Alignment:
| Q |
572 |
tttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
31780110 |
tttttacctgtaattaagccagagcatttcgaatggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaat |
31780209 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31780210 |
tgtccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
31780268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 494 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 471079 - 470842
Alignment:
| Q |
494 |
taactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaacca |
592 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| | | | ||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
471079 |
taactgccgaggaaatctgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaggtcttttttcggccagtttttacctgtaattaaacca |
470980 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| |||| || ||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
470979 |
gagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaacaagataagtacaatatcttttaccattgttcataatttaatcaaacc |
470880 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
470879 |
gacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcat |
470842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 570 - 730
Target Start/End: Original strand, 16281838 - 16281997
Alignment:
| Q |
570 |
agtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttaca |
669 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16281838 |
agtttttac-tgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttaca |
16281936 |
T |
 |
| Q |
670 |
attgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16281937 |
attgtccataattaaattaaaccgacatctggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
16281997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 547 - 730
Target Start/End: Original strand, 19521714 - 19521897
Alignment:
| Q |
547 |
catttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagca |
646 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| |||| | ||||| |||| |||||| | ||||| || |
|
|
| T |
19521714 |
catttccaagccattttttggtcactttttacctgcaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacagcattgaaactcggacataaaca |
19521813 |
T |
 |
| Q |
647 |
agtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19521814 |
agaaaaatactatatcttttacaattgtctataattaaatcaaatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
19521897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 554 - 729
Target Start/End: Original strand, 50617327 - 50617503
Alignment:
| Q |
554 |
aagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||| ||| |||| |
|
|
| T |
50617327 |
aagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaagcacaacattttgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactctgacataaacaaaaaaaa |
50617426 |
T |
 |
| Q |
654 |
t-acaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
729 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
50617427 |
acacaatattttttacaattgtccatatttaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattca |
50617503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 492 - 699
Target Start/End: Complemental strand, 47715089 - 47714890
Alignment:
| Q |
492 |
gttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaacc |
591 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47715089 |
gttaactgctgaggaaagcaattatgcagacagtgggttctgcatagttg--aacca------agccatttttcggctagtttttacctataattcaacc |
47714998 |
T |
 |
| Q |
592 |
agagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaac |
691 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| | | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
47714997 |
agagcatttccagaaacaatattagtcgtacaacatttatactcagtcataaacaacaaaaatacattatcttttatagctgtccataattgaatcaatc |
47714898 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 594 - 662
Target Start/End: Original strand, 29261529 - 29261597
Alignment:
| Q |
594 |
agcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatc |
662 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29261529 |
agcattttcaaaggtaatataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatc |
29261597 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 23359363 - 23359217
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
586 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23359363 |
gtagtaaactgccgaggaaaactgattatacagacagcaagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
23359265 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaact |
634 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
23359264 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaact |
23359217 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Original strand, 19053993 - 19054050
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19053993 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
19054050 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 49927649 - 49927580
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
49927649 |
aattgttgttgacacatttcatatggccgagaaacacgagtaaaatacgtttttgtcccctcggcagtta |
49927580 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 456
Target Start/End: Original strand, 13972001 - 13972055
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13972001 |
aattgttgttgacacatttcataaggctgagaaacacaagtaaaatacgtttttg |
13972055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 1656223 - 1656166
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1656223 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggttgagaaacacgagtaaaatatgtttttg |
1656166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 461
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Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttccc |
461 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11183123 |
aattgttgttgacacatttgataaggctgagaaatacgagtaaaatacgtttttgctccc |
11183182 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 400 - 454
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Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttt |
454 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36076696 |
gaaaattgctgttgacacatttcataaggctgagaaacacaagtaaaatacgtttt |
36076641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 13178269 - 13178199
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
13178269 |
gaaaattgttgttgacacatttcattaggctatgaaac--gagtaaaatacgtttttgctccctcggcagtta |
13178199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 23276244 - 23276175
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
23276244 |
aattgttgttcacgcatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
23276175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 36911803 - 36911737
Alignment:
| Q |
404 |
attgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagt |
469 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||| |
|
|
| T |
36911803 |
attgttgttgacacatttcataaggctgaggcggataagtaaaatacgtttttgtttcctcggcagt |
36911737 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 21944520 - 21944463
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| Q |
399 |
ggaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgttttt |
455 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21944520 |
ggaaaattgttgttgacacatatcataaggctgggacacataaataaaatacgttttt |
21944463 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #53
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Target Start/End: Original strand, 27485008 - 27485065
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| Q |
415 |
cacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
27485008 |
cacatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
27485065 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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Target Start/End: Original strand, 46973138 - 46973195
Alignment:
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Q |
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gaaaattgttgttgacacatttcattaggctgagacacacaagtaaaatacgattttg |
46973195 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 33995160 - 33994714
Alignment:
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Q |
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|
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T |
 |
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33995060 |
cagaacatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
33994961 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
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|
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| T |
33994960 |
ccgacatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcttcaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacat----------tacacatcattaa |
33994871 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33994870 |
attaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattaagaaacataaatccgacgtcg |
33994771 |
T |
 |
| Q |
891 |
ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|
|
| T |
33994770 |
ctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttgtcca-tgcgtattcatct |
33994714 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 24053215 - 24053671
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
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|
|
| T |
24053215 |
agttaactgccgagaaaaacacttatgcagacagtgagttctgcataattgtcaagcattttcaagccatttttcggccagtttttacctgtaatttaac |
24053314 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24053315 |
cagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattacatcaaa |
24053414 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24053415 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacatattacaactcattacacatcattaa |
24053514 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
| |
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|||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24053515 |
attatatccctaattacattcaacgcaattgcatatagaaagaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcg |
24053614 |
T |
 |
| Q |
891 |
ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24053615 |
ctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
24053671 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 24050086 - 24050546
Alignment:
| Q |
489 |
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
24050086 |
gtagttaactatcgacaaaaacatttatgcagatagtgagttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggccagttttcacatgtaattta |
24050185 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24050186 |
accagagcattaccaaaggaaatataacttatacaacatttaaattcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
24050285 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24050286 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtatccataattaaacaacacattacaactcattacacatcatt |
24050385 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata--acatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24050386 |
aaattatatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgac |
24050485 |
T |
 |
| Q |
887 |
gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24050486 |
gtcgctatcgtcttcaattcgccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
24050546 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 546 - 944
Target Start/End: Original strand, 7796694 - 7797081
Alignment:
| Q |
546 |
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645 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||| | |
|
|
| T |
7796694 |
gcatttccaagctatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggttataaac |
7796793 |
T |
 |
| Q |
646 |
aagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatag |
745 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || |
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| T |
7796794 |
aagaaaaatacaatatcttttataattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaag |
7796893 |
T |
 |
| Q |
746 |
tgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatat |
845 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7796894 |
tgtccataattaaacaa----------ctcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatat |
7796983 |
T |
 |
| Q |
846 |
aacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7796984 |
aatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
7797081 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 13563702 - 13564149
Alignment:
| Q |
491 |
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
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agttaactgccgaggagaactgattatgcagacagtgggttctgcataattataaa-catttccaagccattttttcggctagtttttacctgtaattaa |
13563800 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
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|
| T |
13563801 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
13563900 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13563901 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcattaaaacattacaaagtgtccataattaaacaa----------ctcattacacatcatt |
13563990 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
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|
|
| T |
13563991 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
13564090 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13564091 |
cgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 506 - 948
Target Start/End: Original strand, 30352504 - 30352938
Alignment:
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506 |
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Q |
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|
|
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30352504 |
aaaacaattatgcagacagtgaattttgcataattgttaagcattttcaagccatttttcgatcagtttttatctgtaaataaatcagagcatttccaaa |
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T |
 |
| Q |
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ggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttca |
705 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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tgcaatataagccatacaacatttaaactcagtcataa--aagaaaaatacaatatcttt-----ttgtccataattaaatcaaaccagcatttggttca |
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T |
 |
| Q |
706 |
aaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctactt |
805 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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aaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacagcacattacaactcattacatatcaataaattaaatctttactt |
30352796 |
T |
 |
| Q |
806 |
acatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaata |
905 |
Q |
| |
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|
| T |
30352797 |
acattcaatgcaattgcatatggaaaaaacatacatatataatatattattttccacaatattccgaaacataaatacgacgtcgctatcgtctttaaca |
30352896 |
T |
 |
| Q |
906 |
agccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |
|
|
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30352897 |
agccaaggcatataacttgccgtttttca-tgcatattcatct |
30352938 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 489 - 898
Target Start/End: Original strand, 25877680 - 25878089
Alignment:
| Q |
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588 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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gtagttaactgccgaggaaaacatttatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaa |
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T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25877780 |
accagagcattttcaaaagcaatataaatcatacaacattgaaacttggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat-- |
25877877 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacaca |
783 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
25877878 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacacg |
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T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
| |
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| |||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25877977 |
tgattatattaaatccctacttaca--catcacaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatcc |
25878074 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtc |
898 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |
|
|
| T |
25878075 |
gacgtcgctatcgtc |
25878089 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 485 - 948
Target Start/End: Original strand, 27863458 - 27863911
Alignment:
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485 |
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582 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| |
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|
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T |
 |
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583 |
aatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataatt |
682 |
Q |
| |
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|
| T |
27863557 |
aattaaaccagaacatttccaaaggcaaaataattcacacaagattgaaactcggacataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataatt |
27863656 |
T |
 |
| Q |
683 |
aaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacac |
782 |
Q |
| |
|
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|
| T |
27863657 |
aaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaa----------ctcattacac |
27863746 |
T |
 |
| Q |
783 |
atcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatc |
882 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
27863747 |
atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccaaaacataaatc |
27863846 |
T |
 |
| Q |
883 |
cgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
27863847 |
cgacgtcgctgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttttca-tgcgtattcatct |
27863911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 34122583 - 34123046
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagcca-tttttcgactagtttttacctgtaatt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34122583 |
gtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctgcataatt-ctaaatattttcaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
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T |
 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
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T |
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781 |
Q |
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| T |
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34122880 |
T |
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Q |
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T |
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Target: chr5; HSP #10
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T |
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T |
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Q |
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T |
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tatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Target: chr5; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 38855776 - 38856223
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Q |
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T |
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Q |
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accgacattttggttaacattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcatt |
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T |
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789 |
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Q |
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T |
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| Q |
889 |
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Q |
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Target: chr5; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 37814641 - 37815090
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Q |
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T |
 |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
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Q |
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T |
 |
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787 |
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Q |
| |
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Target: chr5; HSP #13
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Q |
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T |
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784 |
Q |
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T |
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cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
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1039518 |
cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaactgcatatggtacgaacatacatatataacatattattttccaccatattcc-aaacataaatccg |
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885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Target: chr5; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 11029069 - 11029515
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 |
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accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
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T |
 |
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689 |
aaccgacattt-ggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
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T |
 |
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788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
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Q |
| |
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tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Target: chr5; HSP #15
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 |
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686 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
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787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
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T |
 |
| Q |
887 |
gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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| T |
25890442 |
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Target: chr5; HSP #16
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Q |
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 |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
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 |
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789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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Target: chr5; HSP #17
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| |
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T |
 |
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587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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Q |
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T |
 |
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ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 772 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 14280718 - 14280543
Alignment:
| Q |
772 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccg |
871 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14280718 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccg |
14280619 |
T |
 |
| Q |
872 |
aaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14280618 |
aaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
14280543 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 489 - 730
Target Start/End: Original strand, 38407206 - 38407447
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaa-ttatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattt |
587 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38407206 |
gtagttaactgccgaagaaaacaaattatgtagacagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccatttt-cggccagtttttacctgtaatta |
38407304 |
T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38407305 |
aagcagaacatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagaaaaatacaatatcttttagaattgtccataattaaatc |
38407404 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38407405 |
aaaccggcatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
38407447 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 489 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28388533 - 28388307
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
586 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28388533 |
gtagttaactgccgaagaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataatt-ttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
28388435 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| || | ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28388434 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaattcggacataaacaaaataaatacaatattttttacaattgtccataattaaat |
28388335 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacaca |
714 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
28388334 |
taaaccgacatttggttcaaattacaca |
28388307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 788 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 28387979 - 28387821
Alignment:
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28387979 |
taaattaaatccctacttacaatcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg |
28387880 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28387879 |
tcgctatcgtcgtgaataa-caaaggcatataacttgtcgttttcca-tgtgtattcatct |
28387821 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 493 - 662
Target Start/End: Original strand, 4196618 - 4196788
Alignment:
| Q |
493 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaacca |
592 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4196618 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagctatttttcggtcaatttttacctgtaattaaacca |
4196717 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaag-taaaatacaatatc |
662 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4196718 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaaatacaatatc |
4196788 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 769 - 948
Target Start/End: Original strand, 4196846 - 4197022
Alignment:
| Q |
769 |
acaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatatt |
868 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4196846 |
acaactcattacatatgattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaa--tacatatataatatattattttcgaccatatt |
4196943 |
T |
 |
| Q |
869 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4196944 |
ccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtctttaataagccaaggcatgtagcttgtcgttttcca-tgcatattcatct |
4197022 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 572 - 899
Target Start/End: Original strand, 6267617 - 6267933
Alignment:
| Q |
572 |
tttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| | |
|
|
| T |
6267617 |
tttttacctataattcagccagagcatttccaaaggcaatactagtcgtacaacatttatcctcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaccgt |
6267716 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattaca |
771 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| | || || ||||||||||||| | | | ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6267717 |
tatccataattaaatcaatccgacatttcattaaaattgcaagaatgtttgaaattcatcataacattaaagagtgtccataattaaacaacacattaca |
6267816 |
T |
 |
| Q |
772 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccg |
871 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||| | ||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
6267817 |
t----------atcattaaattaaatctctactgacattctacgcagttgcagatggaacaaaaatacatatataatatattatcttccatcatattccg |
6267906 |
T |
 |
| Q |
872 |
aaacataaatccgacgtcgctatcgtcg |
899 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
6267907 |
-aacataaattcgacgtcgccatcgtcg |
6267933 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 818 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 43179559 - 43179430
Alignment:
| Q |
818 |
attgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccata |
917 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43179559 |
attgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatcaaacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcata |
43179460 |
T |
 |
| Q |
918 |
tagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
43179459 |
tagcttaccgttttcca-tgcgtgttcatct |
43179430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 7762256 - 7762015
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaa-caattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagcc-atttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7762256 |
agttaactgccgaggaaaattgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacattttcaagcctttttttcggccagtttttacctgtaattaa |
7762157 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7762156 |
accaaagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagatagatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
7762057 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7762056 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
7762015 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 554 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 41799716 - 41799541
Alignment:
| Q |
554 |
aagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
41799716 |
aagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacttggacataaacaagaaaaa |
41799617 |
T |
 |
| Q |
654 |
tacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41799616 |
tacaatttt-tttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
41799541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 491 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 43179902 - 43179605
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43179902 |
agttaactgccgaggaaagatattatgcagacagtgggttctgcataattg--aacca------agccattttcggtc-agtttttacctgtaattcaac |
43179812 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||| |||| || |||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
43179811 |
cagagcattttcaaaggcaatactagtcgtacaacatttatactcggtcaaaaacaagaaaaatatattatcttttacacttgtccataattaatacaat |
43179712 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||| |
|
|
| T |
43179711 |
ccaacatttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacgttaaagagtgtccataattaaacaacacattacaacacattatatattgttaa |
43179612 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 615
Target Start/End: Complemental strand, 14280914 - 14280787
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaac-aattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
586 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14280914 |
gtagttaacggccgaggaaatttaattatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
14280816 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataa |
615 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
14280815 |
aaaccagagcatttccaaatgtaatataa |
14280787 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 491 - 540
Target Start/End: Original strand, 31094597 - 31094646
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataatt |
540 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31094597 |
agttaactgccgaagaaaacaattatgcagacagtggattctgcataatt |
31094646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Original strand, 18307192 - 18307260
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataagctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18307192 |
aattgatgttgacacatttcataagatgagaaatacgagtaaaatacgtttttgctccttcggcagtta |
18307260 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 601 - 726
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Alignment:
| Q |
601 |
ccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttg |
700 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||| |||| | |||||| || |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
16440317 |
ccaaaggcaatacaactcatacaccatttataatcagtcataaacaagaacaatacataatattttagaattgaccataattaaatcaatccgatatttc |
16440218 |
T |
 |
| Q |
701 |
gttcaaaatacacaaaagtttgaaat |
726 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||| || |||| |||| |
|
|
| T |
16440217 |
gttaaaattacacgaatgtttaaaat |
16440192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 3603284 - 3603215
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
3603284 |
aattgttgttgacacattgcataaggctgaggcacataagtaaaatacgtttttgctccctcgacagtta |
3603215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Original strand, 24053114 - 24053186
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| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataagct-gagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
24053114 |
gaaaattgttgttgacacatatgataaggtcgagacacataaataaaatacgtttttgttctctcggcagtta |
24053186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
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Alignment:
| Q |
398 |
tggaaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
42537133 |
tggagaattgttgttcacacatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacatttttg |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
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Alignment:
| Q |
398 |
tggaaaattgttgttgacacatttca-taagctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18538476 |
tggaaaattgttgttgacacatttcattaggctgaggcacacaagtaaaatacgattttgccccctcggcagtta |
18538402 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 30611176 - 30611230
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 403 - 456
Target Start/End: Original strand, 30612898 - 30612952
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
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30612898 |
aattgttgttcacacatttgataaggccgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
30612952 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 33993214 - 33993271
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Q |
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gaaaattgcttttgacacatttcataaggttgagaaatacgagtaaaatacgtttttg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 398 - 427
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Q |
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tggaaaattgttgttgacacatttcataag |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 409 - 948
Target Start/End: Original strand, 12905492 - 12906037
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Q |
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T |
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598 |
Q |
| |
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T |
 |
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698 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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ttccaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatt |
12905788 |
T |
 |
| Q |
699 |
tggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatc |
798 |
Q |
| |
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| T |
12905789 |
tggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtcaataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatc |
12905888 |
T |
 |
| Q |
799 |
cctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtc |
898 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
12905889 |
cgtacttacattcaacgcaattgcatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtc |
12905988 |
T |
 |
| Q |
899 |
gcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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| T |
12905989 |
gcgaataagccaaggcatatagcttgttgttttcca-tgcgtattcatct |
12906037 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 43943748 - 43944209
Alignment:
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587 |
Q |
| |
|
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|
|
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43943748 |
gtagttaactgccgaggaaaaacaattatgcagagaatgggttatgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaatta |
43943847 |
T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaa--tataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaa |
685 |
Q |
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| T |
43943848 |
aaccagagcatttccaaaggcaaaatataaatcatacaacattaaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaa |
43943947 |
T |
 |
| Q |
686 |
tcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatc |
785 |
Q |
| |
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| T |
43943948 |
tcaaaccgacatttggttcaaattacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccatgcataaacaacacattacaattcattacacatc |
43944047 |
T |
 |
| Q |
786 |
attaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccga |
885 |
Q |
| |
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|
| T |
43944048 |
attaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatatattatattatcttccaccatattccgaaacataaatctga |
43944147 |
T |
 |
| Q |
886 |
cgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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|
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| T |
43944148 |
cgtcgctatcatcgcgaataagccaatgcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
43944209 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 399 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 45479934 - 45479386
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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588 |
Q |
| |
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| T |
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gtagttaattgccgagaaaattgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagctatttttcggccagtttttacttgtaattta |
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T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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|
| T |
45479734 |
accagagcatttccaaaggcaatataactaatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatca |
45479635 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
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|
|
| T |
45479634 |
aaccgacatttggttcaaaatacaaaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacat----------tacacatcatt |
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T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgc |
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T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
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| |
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|
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| T |
45479444 |
cgatatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgtgtattcatct |
45479386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 489 - 931
Target Start/End: Original strand, 28342582 - 28343015
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588 |
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| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| || | |||||||| | |||||||| |||||||| | |
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|
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T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
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| T |
28342682 |
accagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
28342781 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
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|
| T |
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aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaa----------acaattcattacacatcatt |
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T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccg-aaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
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|
|
| T |
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aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaaacataaatccgacg |
28342971 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgtttt |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28342972 |
tcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgtttt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 493 - 944
Target Start/End: Original strand, 41181474 - 41181914
Alignment:
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|
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ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcatttccaagccattttttgggcagtttttacctgtaattaaacca |
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T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
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| T |
41181574 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataactaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatcaaacc |
41181673 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaat |
792 |
Q |
| |
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| T |
41181674 |
gacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaat |
41181763 |
T |
 |
| Q |
793 |
taaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
892 |
Q |
| |
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|
|
| T |
41181764 |
taaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
41181863 |
T |
 |
| Q |
893 |
atcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
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|
|
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41181864 |
atcgtcgcgtataagccaatgcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Original strand, 24601698 - 24602147
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| |
|
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|
|
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T |
 |
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588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
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|
|
| T |
24601798 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
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T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacac |
782 |
Q |
| |
|
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|
| T |
24601898 |
aaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacac |
24601996 |
T |
 |
| Q |
783 |
atcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatc |
882 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24601997 |
atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatc |
24602094 |
T |
 |
| Q |
883 |
cgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
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|
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24602095 |
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24602147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 24612416 - 24611967
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489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
24612416 |
gtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtggattctacataattcaaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacttgtaatta |
24612317 |
T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24612316 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
24612217 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacac |
782 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| | | | ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24612216 |
aaaccgacatttggttcaaattacacagacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacac |
24612118 |
T |
 |
| Q |
783 |
atcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatc |
882 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24612117 |
atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacat--atatataatatattatcttccaccatattccgaaaaataaatc |
24612020 |
T |
 |
| Q |
883 |
cgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
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|
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24612019 |
cgacgttgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
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Q |
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Target: chr2; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 489 - 948
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa----acaacacattacaactcattacacat |
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Target: chr2; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 491 - 948
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787 |
Q |
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| T |
39798252 |
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39798165 |
T |
 |
| Q |
788 |
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887 |
Q |
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| T |
39798164 |
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39798065 |
T |
 |
| Q |
888 |
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948 |
Q |
| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
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Target Start/End: Complemental strand, 41564482 - 41564055
Alignment:
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Q |
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| T |
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attatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaa |
41564384 |
T |
 |
| Q |
611 |
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708 |
Q |
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T |
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| Q |
709 |
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808 |
Q |
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T |
 |
| Q |
809 |
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908 |
Q |
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| T |
41564193 |
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T |
 |
| Q |
909 |
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948 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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aaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 3795398 - 3795858
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T |
 |
| Q |
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688 |
Q |
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T |
 |
| Q |
689 |
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774 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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| Q |
775 |
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874 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
875 |
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948 |
Q |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 5351746 - 5351296
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T |
 |
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684 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
685 |
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784 |
Q |
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| T |
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5351459 |
T |
 |
| Q |
785 |
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884 |
Q |
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| T |
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cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
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T |
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| Q |
885 |
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948 |
Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 10620034 - 10620482
Alignment:
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588 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
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| T |
10620133 |
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10620231 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
| |
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| T |
10620232 |
taaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatca |
10620321 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
| |
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| T |
10620322 |
ttaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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T |
 |
| Q |
887 |
gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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10620422 |
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10620482 |
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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 209043 - 209493
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Q |
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|
|
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T |
 |
| Q |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
684 |
Q |
| |
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|||||||||||| ||||||| ||||||| | ||| | ||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
685 |
atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
| |
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| T |
209241 |
attaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacat |
209330 |
T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
| |
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| T |
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209430 |
T |
 |
| Q |
885 |
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948 |
Q |
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| T |
209431 |
acgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 489 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 25184844 - 25184606
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gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
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Q |
| |
|
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gtagttaactgccgaggaaaacaattatgtaaacagtgggttctgtataattctaaaacatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaa |
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T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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| T |
25184744 |
accagagtattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
25184645 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt |
727 |
Q |
| |
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| T |
25184644 |
aaccgatatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 572 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 38950496 - 38950232
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671 |
Q |
| |
|
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38950496 |
tttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaat |
38950397 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattaca |
771 |
Q |
| |
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||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| || |
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| T |
38950396 |
tgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------act |
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T |
 |
| Q |
772 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
846 |
Q |
| |
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| T |
38950306 |
actcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaacacaattacatatggaacgaacatacatatata |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 769 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 1150774 - 1150596
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Q |
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acaattcattacacatcattaaattaaatcactacttacattcaatgaaattgcatatggaacgaacatacatatataatatagtatcttccatcatatt |
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T |
 |
| Q |
869 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
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| T |
1150674 |
ccaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcacaaataaaccaaggcgtatagtttgccgttttcca-tgcgtatttatct |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Original strand, 10825279 - 10825519
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agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
589 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
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| T |
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ccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
10825478 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
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| T |
10825479 |
acagacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 530 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 39951143 - 39950943
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tctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacattt |
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Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |
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tctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcgaccagtttttatctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattg |
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 |
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aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
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Q |
| |
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|||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |
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| T |
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aaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattca |
39950944 |
T |
 |
| Q |
730 |
t |
730 |
Q |
| |
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| |
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| T |
39950943 |
t |
39950943 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 554 - 730
Target Start/End: Original strand, 32952855 - 32953031
Alignment:
| Q |
554 |
aagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaa |
653 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||||| ||| | |||| |||| |
|
|
| T |
32952855 |
aagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacatcaacaagaaaaa |
32952954 |
T |
 |
| Q |
654 |
tacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32952955 |
tacaatattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
32953031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 558 - 730
Target Start/End: Original strand, 29398038 - 29398206
Alignment:
| Q |
558 |
catttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaataca |
657 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | |||||| || |||||| |
|
|
| T |
29398038 |
catttttcggccagtttttacctgtaattaaagcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataagaaa----aataca |
29398133 |
T |
 |
| Q |
658 |
atatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29398134 |
atattttttacaattgtccataattaaattaaaccgacatttagttcaaattacacaaatgtttgaaattcat |
29398206 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 512 - 809
Target Start/End: Original strand, 18000315 - 18000603
Alignment:
| Q |
512 |
attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaa |
610 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
18000315 |
attatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatt-ccaaaggtaa |
18000412 |
T |
 |
| Q |
611 |
tataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaa |
708 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | ||| |||||| | ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
18000413 |
tataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaaattaaaccgacatttggttaaaat |
18000512 |
T |
 |
| Q |
709 |
tacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttaca |
808 |
Q |
| |
|
|| ||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000513 |
taaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------actactcattacacatcattaaattaaatccctacttaca |
18000602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 843 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 38949855 - 38949751
Alignment:
| Q |
843 |
tataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtat |
942 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
38949855 |
tataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatataacttgccgttttcca-tgcgtat |
38949757 |
T |
 |
| Q |
943 |
tcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
38949756 |
tcatct |
38949751 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 632 - 752
Target Start/End: Original strand, 3206950 - 3207070
Alignment:
| Q |
632 |
actcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatt |
731 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3206950 |
actcaatcataaacaagaaagatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaaccgacatttagttcaaagtatacaaaagtttgaaattcatc |
3207049 |
T |
 |
| Q |
732 |
aaatcgttacatagtgtccat |
752 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
3207050 |
aaaacgttgcatggtgtccat |
3207070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 554 - 730
Target Start/End: Original strand, 25613328 - 25613503
Alignment:
| Q |
554 |
aagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaa |
653 |
Q |
| |
|
|||||||||| | ||| || |||||||| ||| ||||| | || ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| |
|
|
| T |
25613328 |
aagccattttcagcctatttattacctgtcattcaaccacatcaattccagaggcaatacaactcatacatcatttaaaatcagtcataaacaag-aaaa |
25613426 |
T |
 |
| Q |
654 |
tacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||| ||| |||||||||| ||| ||||||||||| | | ||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
25613427 |
tacataatcttttacaattgaccaaaattaaatcaatcaggcattttgtttaaattacaagaatgtttgaaattcat |
25613503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 770 - 934
Target Start/End: Original strand, 25613533 - 25613697
Alignment:
| Q |
770 |
caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattc |
869 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | |||| | | ||| |||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
25613533 |
caacacattacatatcattacataaaatctctattgacattctatgcacatgcagatggaacgaacacaaagatataatatattatctttaattatattc |
25613632 |
T |
 |
| Q |
870 |
cgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttcca |
934 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
25613633 |
ataaacataaatcctacgtcgctatcgtcacgaataagtcaaggcacatagctcgccgttttcca |
25613697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 635
Target Start/End: Complemental strand, 7189965 - 7189820
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | | ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
7189965 |
gtagttaactgccgaggaaatctgat-tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccaatttttacctgtaattaa |
7189867 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactc |
635 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | || | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7189866 |
accagagcatttcgaaaggcagaacaattcatacaacattgaaactc |
7189820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Original strand, 2917617 - 2917689
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
2917617 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgaggcacaaaagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
2917689 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 493 - 540
Target Start/End: Original strand, 3206842 - 3206889
Alignment:
| Q |
493 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataatt |
540 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3206842 |
ttaactgccgaggaaatcaattatgcagactgtgggttctgcataatt |
3206889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 406 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 43950374 - 43950308
Alignment:
| Q |
406 |
tgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
43950374 |
tgttgttgacacatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacatttttgccccctcggcagtta |
43950308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 34921897 - 34921840
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34921897 |
gaaaattgctattgacacatttcataaggcagagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
34921840 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 41500370 - 41500301
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41500370 |
aattgatgttgacacatttcatatggctgagaaacacgagtaaaatacgcttttgccccctcggcagtta |
41500301 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 396 - 471
Target Start/End: Original strand, 25964734 - 25964810
Alignment:
| Q |
396 |
tttggaaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
25964734 |
tttggagaattgttgttcccacatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacgattttgccccctcggcagtta |
25964810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 842 - 898
Target Start/End: Original strand, 43668499 - 43668555
Alignment:
| Q |
842 |
atataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtc |
898 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
43668499 |
atataatatattatcttcaaccatatgcctaaacataaatcctacgtcactatcgtc |
43668555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 400 - 471
Target Start/End: Original strand, 45475374 - 45475446
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
45475374 |
gaaaattgatgttgacacatttcataaggctgagacacacaagtaaaatacgattttgccccctcggcagtta |
45475446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 401 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 8268887 - 8268816
Alignment:
| Q |
401 |
aaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
8268887 |
aaaattgttgttgacacattttataagactgacgtacattagtaaaatacgattttgtcccctcggcagtta |
8268816 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 406 - 455
Target Start/End: Original strand, 2648057 - 2648107
Alignment:
| Q |
406 |
tgttgttgacacatttcataagct-gagaaacatgagtaaaatacgttttt |
455 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2648057 |
tgttgttgagacatttcataaggttgagaaacacgagtaaaatacgttttt |
2648107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 456
Target Start/End: Original strand, 16580482 - 16580536
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16580482 |
aattgttgttgacacattgcataaggctgagacacacgagtaaaatacatttttg |
16580536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 402 - 455
Target Start/End: Original strand, 19186683 - 19186737
Alignment:
| Q |
402 |
aaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgttttt |
455 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19186683 |
aaattgttgttgacacatatcataaggctgagacacacaagtaaaatacgttttt |
19186737 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 491 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 38950565 - 38950515
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataatt |
540 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
38950565 |
agttaactgccgaggaaatctgattatgcagacagtgggttctgcataatt |
38950515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Original strand, 41181374 - 41181443
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41181374 |
aattgatgttgacacattgcataaggctgaggcacacgagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
41181443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 508 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 29667827 - 29667388
Alignment:
| Q |
508 |
aacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaagg |
607 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
29667827 |
aacatttatgcagacagtgggttttgcataattccaaagcacttccaagccatttttcggccagtttttatctgtaatttaaccagagcattttcaaagg |
29667728 |
T |
 |
| Q |
608 |
caatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
707 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29667727 |
caatataacttatacaacttttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
29667628 |
T |
 |
| Q |
708 |
atacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29667627 |
atacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacacagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
29667528 |
T |
 |
| Q |
808 |
atgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataag |
907 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
29667527 |
attcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattaacttccaccatattccgaaacataaatctgacatcgctatcgtcacgaataag |
29667428 |
T |
 |
| Q |
908 |
ccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29667427 |
ccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
29667388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 23958949 - 23959398
Alignment:
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587 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |
|
|
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23958949 |
gtagttaactgccgagaaaaactggttatgcagacagtggattctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcgaccagattttacctgtaatta |
23959048 |
T |
 |
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588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23959049 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaatc |
23959148 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23959149 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaaca----------cattacacatcat |
23959238 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
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|
|
| T |
23959239 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattatcttacaccatattccgaaacataaatccaacg |
23959338 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|
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| T |
23959339 |
tcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
23959398 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 485 - 932
Target Start/End: Original strand, 29286258 - 29286695
Alignment:
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Q |
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T |
 |
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tttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
684 |
Q |
| |
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29286358 |
ttaaaccagagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacgttgaaactcggtcttaaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa |
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T |
 |
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685 |
atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
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| T |
29286458 |
atcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacat |
29286547 |
T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
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| T |
29286548 |
cattaaattaaacctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
29286647 |
T |
 |
| Q |
885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttc |
932 |
Q |
| |
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|
|
| T |
29286648 |
acgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagtttgccgttttc |
29286695 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 491 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 25141117 - 25140682
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
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agttaactgccgaggaaaacaattatggagacagtgggttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggccaagttttacctgtaattaaac |
25141018 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
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|
| T |
25141017 |
cagaacatttccaaaggcaatataaatcatacaatattgaaactcggccataaacaagaaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
25140918 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
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|
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| T |
25140917 |
ccgacatttggttcaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaacacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaa |
25140828 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacataca-tatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
889 |
Q |
| |
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|
|
| T |
25140827 |
attaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacattatataatatattatctttcaccatattccgaaacataaatgcgacgtc |
25140728 |
T |
 |
| Q |
890 |
gctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
25140727 |
gctatcgtcacgaataagccaaggcatatagcttgccgttttccat |
25140682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 494 - 944
Target Start/End: Original strand, 7537250 - 7537704
Alignment:
| Q |
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592 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7537250 |
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7537349 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
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|
|
| T |
7537350 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
7537449 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
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|
| T |
7537450 |
gacatttggttaaaattacacaaacgtttgaaattcatctaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaaatcattgcacatcat |
7537548 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
7537549 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaaatgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
7537648 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
7537649 |
tcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgctgttttcca-tgcgtattc |
7537704 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 493 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 18610242 - 18609810
Alignment:
| Q |
493 |
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592 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
18610242 |
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18610143 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18610142 |
gagcattttcaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacc |
18610043 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaat |
792 |
Q |
| |
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|
|
| T |
18610042 |
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18609953 |
T |
 |
| Q |
793 |
taaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
892 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18609952 |
taaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatataattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgct |
18609853 |
T |
 |
| Q |
893 |
atcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
18609852 |
atcgtctttaataagccaaggcatataacttgtcgttttccat |
18609810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 31151076 - 31150630
Alignment:
| Q |
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Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | |
|
|
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31151076 |
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31150978 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
31150977 |
ccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaaggtaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
31150878 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatta |
789 |
Q |
| |
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|
|
| T |
31150877 |
accgacatttggttccaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatta |
31150788 |
T |
 |
| Q |
790 |
aattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
889 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31150787 |
aattaaatccctacatacattcaacgcaattgcatatcgatcaaacatacatatataatatattatcttccaccatattctaaaacataaatccgacgtc |
31150688 |
T |
 |
| Q |
890 |
gctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
31150687 |
gctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-agcgtattcatct |
31150630 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 489 - 944
Target Start/End: Original strand, 2051087 - 2051545
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||| |||| |||||||| | |||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
2051087 |
gtagttatctgcagaggaaaacaattatgcagacagtgggttatgcataattctaatgcattttcaagcaatttttcggccagtttttatctgtaattaa |
2051186 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2051187 |
aacagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcgatcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatca |
2051286 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa----caacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
| |
|
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|
| T |
2051287 |
aaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgataaaaagtgttaataattaagtgttcataattaaacaactcattacacat |
2051386 |
T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2051387 |
cattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatccg |
2051486 |
T |
 |
| Q |
885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
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|
|
| T |
2051487 |
acgtcgccatcgtcgcgaataagccaagacatataacttgccgttttcca-tgcgtattc |
2051545 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 490 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 28362744 - 28362282
Alignment:
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Q |
| |
|
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|
|
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28362744 |
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T |
 |
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aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
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Q |
| |
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28362645 |
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aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa----caacacattacaactcattacaca |
783 |
Q |
| |
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|
|
| T |
28362545 |
aaaccgacatttggttcaaattacacaaccgattgaaattcaacaaaacgttacaaagtgttcataattaaatgtccatcattaaacaactcattacaca |
28362446 |
T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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| T |
28362445 |
tcattaaattaaatccctacatacattctacacaattgcatatcgatcgaacatacatatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaattc |
28362346 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
28362345 |
gacgtcgctatcatcgcaaataagccaaggcatatagcttgccattttcca-tgcttattcatct |
28362282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 1608353 - 1608802
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
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| |
|
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|
| T |
1608353 |
agttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
1608451 |
T |
 |
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accagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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| |
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T |
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786 |
Q |
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| T |
1608552 |
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1608641 |
T |
 |
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886 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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| |
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T |
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948 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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701 |
Q |
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| T |
26702611 |
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26702513 |
T |
 |
| Q |
702 |
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766 |
Q |
| |
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| T |
26702512 |
ttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaacaca |
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T |
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 |
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aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
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Q |
| |
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| T |
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aaccagaacatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatc |
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T |
 |
| Q |
688 |
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Q |
| |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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gtagttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataattgtaaa-catttccaagccatttttcgaccagtttttacctgtaatta |
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T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
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| T |
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aaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagtttgaaactcggacataataaagataactacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
13382885 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaat |
735 |
Q |
| |
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| T |
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Target: chr6; HSP #15
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Q |
| |
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|
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taaatgaaaccgacatttggttcaaaatgcacaaaatgttgaaattcatcaaaacgttacatagtgtccataattaaacaacacattacaacttatta-- |
2259435 |
T |
 |
| Q |
782 |
catcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaat |
881 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
2259436 |
--------aattaaatccttacttacattcaacgta-ttgcatatggaacaaacatgcatatataatatattattttccaccatatttcgaaacataaat |
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T |
 |
| Q |
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ccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Q |
| |
|
| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |
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|
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Target: chr6; HSP #16
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T |
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
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cagattatttgcaaaggcaattatagtcgtacaacatttatactcagtcataaagaataaaaatacattatcttttacaattgtctataattaaatcaaa |
34230740 |
T |
 |
| Q |
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ccgacatttggttcaaaatacacaaaag-tttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatta |
789 |
Q |
| |
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| T |
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ccgacatttcgttaaaattacatgaatgctttgaaattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatt----------acacatcgtta |
34230830 |
T |
 |
| Q |
790 |
aattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtc |
889 |
Q |
| |
|
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aattaaatctctactaacattctacacagttgcagatggaacgaacatacatatataatatattatcttctaccatattctaaaacataaatcggacgtc |
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T |
 |
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gctatcgtcgcaaataagccaag |
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Q |
| |
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||||| || ||||||||||| |
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|
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34230931 |
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Q |
| |
|
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|
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
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Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
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cagagcattttcaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaa |
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T |
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T |
 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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Q |
| |
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T |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccat |
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Q |
| |
|
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|
|
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18351458 |
taaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccat |
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||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||| |
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T |
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atcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
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3502506 |
atcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||| |
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|
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agtttttacatgtaattaaaccagagcatttccaaagccaatatacctcatacaacatttgcactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttaca |
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T |
 |
| Q |
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attgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8304678 |
attgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa |
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Target: chr6; HSP #21
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||| ||| ||| | || |||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
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|| ||| |||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
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|
| T |
31771655 |
aaagtagatcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatattttttacaattgttcataattaaat |
31771556 |
T |
 |
| Q |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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taaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
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T |
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tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattaca |
771 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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actcattaca |
781 |
Q |
| |
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|||||||| |
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| T |
20448517 |
tatcattaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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tttttacctgttattcaaccagagcatttccagaggcaatacaactcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagt |
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T |
 |
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tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccat |
752 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| | ||| | ||||||||| |
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|
| T |
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tgtccataattaaatcaatccgacattttgttaaaattacaggaatgtttgaaattcatgaaaacattaaagagtgtccat |
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T |
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| T |
19129120 |
tttttacctgtaattaaaccacaacatttccagatgcaataaaactcacacaccatttatactcagtcataaacaag---aatgcattatcttttacagt |
19129216 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgt |
748 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
19129217 |
tgtccataattaaatcaatctgacatttcgttgaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattaaatagtgt |
19129293 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 20436227 - 20436069
Alignment:
| Q |
572 |
tttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| || | ||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| | |
|
|
| T |
20436227 |
tttttacctgttattcaaccagagcatttccagagaaaatacaattcatacaccatttatacttagtcataaacaagaggaatacattatcttttacagt |
20436128 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
20436127 |
tgtccatgattaaatcaatccgacattttattaaaattacatgaatgtttgaaattcat |
20436069 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 819 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 20448480 - 20448388
Alignment:
| Q |
819 |
ttgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaag |
912 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
20448480 |
ttgcaaatgtaacaaacacacatatataatatattatcttcaac-atatacctaaacataaatgaaacgtcgctatcgtcacgaataagccaag |
20448388 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29667885 - 29667828
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
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||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |
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29667885 |
gaaaattgtgtttgacacatttcataaggctgagaaacacgagtaaaatacgcttttg |
29667828 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Original strand, 32026039 - 32026096
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
32026039 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgaggcacacaagtaaaatacgtttttg |
32026096 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 776 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 18351379 - 18351348
Alignment:
| Q |
776 |
attacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18351379 |
attacacatcattaaattaaatccctacttac |
18351348 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 403 - 472
Target Start/End: Original strand, 2405443 - 2405513
Alignment:
| Q |
403 |
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472 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2405443 |
aattgttgttcacacgtttgataaggctgataaacacgagtaaaatacgttttttctccctcggcagttag |
2405513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Original strand, 13479660 - 13479717
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13479660 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgaggcacacaagtaaaatacgcttttg |
13479717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 820 - 912
Target Start/End: Original strand, 19129549 - 19129642
Alignment:
| Q |
820 |
tgcatatggaac-gaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaag |
912 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| | ||||| || |||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
19129549 |
tgcagatggaacagaacacacatatataatatattatattcaatcatatgcctaaacataaatgaaacgtcgcaatcgtcacgaataagccaag |
19129642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 10705309 - 10705765
Alignment:
| Q |
491 |
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590 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10705309 |
agttaactgccgagaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcacttccaagtcatttttcggtcaatttttacatgtaatttaac |
10705408 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10705409 |
caaagcatttctaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
10705508 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10705509 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttaaaattcatcaaaatgttacatagtgtccataattaaacaatacattacaactcattacacatcaataa |
10705608 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10705609 |
attaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattctgaaacataaatccgacgtcg |
10705708 |
T |
 |
| Q |
891 |
ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10705709 |
ctatcgtcttcaattagccaaggcatatagcttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
10705765 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 489 - 944
Target Start/End: Original strand, 34622558 - 34623002
Alignment:
| Q |
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gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
34622558 |
gtagttaacagccaaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacatgtaattaa |
34622657 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34622658 |
accagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaataagaaaaatacaatatattttacaattgtccataattaaatca |
34622757 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34622758 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatt |
34622847 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34622848 |
aaattaaacttctacttacattcaacgcaattgcatatgaaacgaacatacatatataatatattatcttccatcatattccgaaacataaatccgacgt |
34622947 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
34622948 |
cgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
34623002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Original strand, 19044352 - 19044802
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
19044352 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggctagtttttacctgtaattaa |
19044451 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19044452 |
accagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatca |
19044551 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacaca |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| | | | ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
19044552 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaaatcattacaca |
19044650 |
T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19044651 |
tcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatct |
19044750 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
19044751 |
gacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccat |
19044802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 489 - 935
Target Start/End: Complemental strand, 20710284 - 20709834
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
20710284 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagatagtgggttttgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggctagtttttacctgtaattaa |
20710185 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20710184 |
accagagaatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaattgggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccataattaaatca |
20710085 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacaca |
783 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| | | | ||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
20710084 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaaatcattacaca |
20709986 |
T |
 |
| Q |
784 |
tcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatcc |
883 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20709985 |
tcattaaattaaatctctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatatttcgaaacataaatct |
20709886 |
T |
 |
| Q |
884 |
gacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccat |
935 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20709885 |
gacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatataacttgccgttttccat |
20709834 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 47743001 - 47742554
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttc-gactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47743001 |
agttaactgtcgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccatttttttggccagtttttacctgtaattaa |
47742903 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||| |||| | || || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
47742902 |
accagagcattttcaaaggcaaaataattcatacaacattgaaacatggacaaaaacaagataaatgcaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
47742803 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
47742802 |
aaccaacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatcatt |
47742713 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47742712 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
47742613 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47742612 |
cgccatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
47742554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 15070363 - 15069915
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
15070363 |
agttaactgcngaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaaataa |
15070265 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | |||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
15070264 |
accagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
15070165 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacattt-ggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
15070164 |
aaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcat |
15070075 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15070074 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
15069975 |
T |
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Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
15069974 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
15069915 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
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Target Start/End: Complemental strand, 18109781 - 18109358
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T |
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| Q |
614 |
aacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattt-ggttcaaaataca |
712 |
Q |
| |
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aattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacattttggttaaaattaaa |
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T |
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caaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgca |
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Q |
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18109582 |
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T |
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813 |
acgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaag |
912 |
Q |
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18109393 |
T |
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| Q |
913 |
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948 |
Q |
| |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Target Start/End: Original strand, 603862 - 604287
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Q |
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T |
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tataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaata |
710 |
Q |
| |
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aataattcatacaagattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaatcgacatttggttaaaatta |
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T |
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| Q |
711 |
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810 |
Q |
| |
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aacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacatt |
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T |
 |
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811 |
caacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagcca |
910 |
Q |
| |
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| T |
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caacgcaattacatatggaacaaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaa |
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T |
 |
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911 |
agccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 608 - 935
Target Start/End: Original strand, 12111394 - 12111719
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Q |
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T |
 |
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708 |
atacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttac |
807 |
Q |
| |
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ttacaccaaagtttaaaattcatcaaaacgttataaattgtccataattaaacaatacattacaactcattacatatcattaaattaaatccctacttac |
12111593 |
T |
 |
| Q |
808 |
atgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataag |
907 |
Q |
| |
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| T |
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attcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatata--atattattttccaccatattccgaaatataaatccgacgtcgctatcatctttaataaa |
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T |
 |
| Q |
908 |
ccaagccatatagcttgccgttttccat |
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||| |
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|
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 42503851 - 42503403
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
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688 |
Q |
| |
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| T |
42503752 |
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T |
 |
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aaccgacattt-ggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
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Q |
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42503652 |
aaccaacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcat |
42503563 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
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| T |
42503562 |
taaattaaatccctacttacattcaacacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
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T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|
|
| T |
42503462 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatgtagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 43619740 - 43620188
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588 |
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| |
|
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|
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 |
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589 |
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686 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
| |
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|
| T |
43619938 |
taaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatca |
43620027 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43620028 |
ttaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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 |
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gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Q |
| |
|
||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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Back To:
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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 30791022 - 30790571
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T |
 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
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Q |
| |
|
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|
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aaaccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatagaatatcttttacaattgttcataattaa |
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T |
 |
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atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
| |
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|
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30790823 |
attaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacat |
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T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
| |
|
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|
|
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cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
30790634 |
T |
 |
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acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 45767875 - 45767425
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Q |
| |
|
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
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Q |
| |
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 |
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Q |
| |
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 |
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785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
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Q |
| |
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|
|
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cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
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 |
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acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 29592839 - 29593010
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T |
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ataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
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|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
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Q |
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|
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|
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tttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttgatttaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaatgttacaaagtatccataattaaatgtc |
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T |
 |
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aacacatta--caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatctt |
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Q |
| |
|
| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
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|
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T |
 |
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ccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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| |
|
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|
|
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ccaccatatttcgaaacataaatttgacgtcgctatcatctttaataaaccaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 40928965 - 40928725
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| |
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589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
40928866 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
40928767 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40928766 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcat |
40928725 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 491 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 34742407 - 34742166
Alignment:
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589 |
Q |
| |
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||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
34742407 |
agttaactgtcgaggaaaacaaattatgcagacagtgaactctgcatgattctaaaacatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaa |
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T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34742307 |
gtagagcatttcgaaaggcaaaa-aattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaa |
34742209 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatta |
732 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
34742208 |
atcgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcatta |
34742166 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 489 - 727
Target Start/End: Original strand, 29592602 - 29592841
Alignment:
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489 |
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586 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29592602 |
gtagttaactgtcgaagaaaactgattatgcagacagtggattctgcataatt-ttaaacatttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
29592700 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29592701 |
aaaccagagcatttccaaaggaaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccataattaaat |
29592800 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt |
727 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29592801 |
taaaccgacatttggttcaaattacacaaacttttgaaatt |
29592841 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Original strand, 5537907 - 5538145
Alignment:
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491 |
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589 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
5537907 |
agttaactgccgaggaaaacaaattatgtagacagtgagctctgcatgattctaaaacattttcaagccatttttcggtcagtttttac--gtaattaaa |
5538004 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5538005 |
gcagagcatttcgaaagggaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaataaaatatcttatacaattgtccataattaaatcaa |
5538104 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5538105 |
accgacatttggttcaaattatacaaacgtttgaaattcat |
5538145 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 530 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 17838607 - 17838407
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530 |
tctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacattt |
629 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
17838607 |
tctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtatttacttgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattg |
17838508 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
729 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
17838507 |
aaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattca |
17838408 |
T |
 |
| Q |
730 |
t |
730 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
17838407 |
t |
17838407 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 13323727 - 13323487
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaa-ttatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
589 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | || ||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13323727 |
agttaactgctgagcaaaacaaattatgcagataatgagctcttcataattctaaaacatttccaagccatttttcgggcagtttttacctgtaattaaa |
13323628 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || |||| | ||||||| || ||||| || ||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
13323627 |
gcagagcatttcgaaaggtaaaataattcatacaacgttgaaactgagacattaacaagaaaaatacaatattttttacaattttccataattaaattaa |
13323528 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13323527 |
accggcatttcgttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
13323487 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 651 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 10522366 - 10522287
Alignment:
| Q |
651 |
aaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
10522366 |
aaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcat |
10522287 |
T |
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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 485 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36186517 - 36186416
Alignment:
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584 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
36186517 |
ggttgcagttaactgccgaggaaaacaattatacatacagtgagttctgcataattctaaagcattttcaagccatttttcggtcagtttttacctgtaa |
36186418 |
T |
 |
| Q |
585 |
tt |
586 |
Q |
| |
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|| |
|
|
| T |
36186417 |
tt |
36186416 |
T |
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Back To:
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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 496 - 615
Target Start/End: Original strand, 12111267 - 12111387
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| Q |
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594 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12111267 |
actgccgaacaaaacaattatgcagataggtgggttatgcataattctaaagcattttcaagttatttttcagtcagtttttacttgtaattaaaccaga |
12111366 |
T |
 |
| Q |
595 |
gcatttccaaaggcaatataa |
615 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12111367 |
gcattttcaaaggcaatataa |
12111387 |
T |
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Target: chr7; HSP #25
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Q |
| |
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|||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
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| T |
19044231 |
aattattgttgacacattgcataaggctgaggcacatgagtaaaatacgtttttgttcactcggcagtta |
19044300 |
T |
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Target: chr7; HSP #26
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| Q |
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
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Q |
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|
|||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
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|
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20710405 |
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T |
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Target: chr7; HSP #27
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| Q |
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
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21190724 |
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21190655 |
T |
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Target: chr7; HSP #28
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
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30355375 |
aattgttgttgacacatttcatatgactgagaaacacgagtaaaatacgcttttgccccctcggcagtta |
30355306 |
T |
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Target: chr7; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 403 - 456
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| Q |
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28980309 |
aattgttgttgacacattgcataaggctgagacacacgagtaaaatacgtttttg |
28980255 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
45361586 |
aattgttgttcccacatttgataaggctaagaaacatgagtaaaatatgtttttgctccctcggcagtta |
45361655 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 36186614 - 36186539
Alignment:
| Q |
397 |
ttggaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
36186614 |
ttggaaaattgttgttgacacattgcataaggctgtgtcacacgagtaaaatacgcttttgccccctcggcagtta |
36186539 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 408 - 448
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ttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaata |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
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10708401 |
ttgttgacacatttcataagactgagaaacacgagtaaaata |
10708360 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
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| Q |
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gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28112776 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggttgagacacacaagtaaaatacgcttttg |
28112833 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
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Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
40590627 |
aattgttgttcccacatttgataaggctgagaaacacgaataaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
40590558 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 66935 - 67391
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agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
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agttaactaccgagaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattgttaagcatttccaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaac |
67034 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67035 |
cagagcaatcccaaatgcaatataattcatacaacatttaaactcacttataaacaagtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaa |
67134 |
T |
 |
| Q |
691 |
ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67135 |
ccgacatttggttcaaactacacaaaagtttgaaattcatcaaaacggtacatagtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
67234 |
T |
 |
| Q |
791 |
attaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
890 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgaaatccctacttacattcaacgcaatcacatatggaacgaacatacatatataatgtattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcg |
67334 |
T |
 |
| Q |
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ctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
67335 |
ctattgtctttaataagccaagacatatagcttgccgtttttca-tgcgtattcatct |
67391 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 489 - 944
Target Start/End: Original strand, 6489388 - 6489847
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
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gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttaccgctaattaa |
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T |
 |
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589 |
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Q |
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T |
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782 |
Q |
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T |
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T |
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T |
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T |
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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| Q |
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783 |
Q |
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4002318 |
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T |
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883 |
Q |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
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| |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
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taaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatca |
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T |
 |
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ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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 |
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887 |
gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
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 |
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aagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatag |
745 |
Q |
| |
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T |
 |
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tgtccatgcataaa---caacacatta--caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacataca |
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 |
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tatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgt |
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| |
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 |
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attcatct |
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attcatct |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 2857994 - 2857547
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| |
|
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T |
 |
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accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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 |
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aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
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Q |
| |
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 |
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aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
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aaattaaatccctacttacattcaacgcaattacatatggaatgaacatacatatataatatattattttccaccattttccgaaacataaatccgacgt |
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T |
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Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
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Target Start/End: Original strand, 36812896 - 36813346
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T |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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Q |
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T |
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caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa---caacacatta--caactcattaca |
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Q |
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T |
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782 |
catcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaat |
881 |
Q |
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T |
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ccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttcca |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 3953227 - 3952779
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Q |
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T |
 |
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ccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
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T |
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aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
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aaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcat |
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T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
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| T |
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taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
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T |
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| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 30943248 - 30943699
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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| Q |
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atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
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| T |
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attaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacat |
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T |
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785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
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| T |
30943537 |
cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
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T |
 |
| Q |
885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
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Target: chr3; HSP #14
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Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 8156569 - 8157017
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| |
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T |
 |
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accagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
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| T |
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8156766 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
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T |
 |
| Q |
787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
| |
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| T |
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ttaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
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T |
 |
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| |
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Q |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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| |
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T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
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| T |
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cagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcagacataaacaagataaatacagtatcttttacaattgtccataagtaaattaaa |
7841356 |
T |
 |
| Q |
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ccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaa |
790 |
Q |
| |
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| T |
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ccgacatttggttaaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattgcacatcattaa |
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T |
 |
| Q |
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attaaatccctacttacatgcaacgcaa |
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Q |
| |
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|
| T |
7841447 |
attaaatccctacttacattcaacgcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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| |
|
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|
|
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acaactcattacacgtcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatagaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatt |
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T |
 |
| Q |
869 |
ccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14402648 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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| |
|
|||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |
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 |
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aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
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aaccagagcatttttaaaggcaaaataattcatacaacattgaaactcggacataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
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T |
 |
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aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Q |
| |
|
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|
|
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
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Q |
| |
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atttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca |
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Q |
| |
|
||||| |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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T |
 |
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tttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Q |
| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
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Target Start/End: Original strand, 47070527 - 47070769
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| |
|
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|
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 |
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aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
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| |
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| T |
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T |
 |
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aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
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||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| |
|
|
| T |
36134255 |
tctgcatcattctaaaacatttccaagctttttttcggccagtttttacctgtaattaaatcagagcatttcgaaaggcaaaataattcatacaacattg |
36134156 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
729 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
36134155 |
aaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattca |
36134056 |
T |
 |
| Q |
730 |
t |
730 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
36134055 |
t |
36134055 |
T |
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Target: chr3; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 491 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 50957704 - 50957460
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
50957704 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataatt-ttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
50957607 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| | ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
50957606 |
atcagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatgaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
50957507 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaat |
735 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
50957506 |
aacagacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaat |
50957460 |
T |
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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 530 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 42166384 - 42166187
Alignment:
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530 |
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629 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
42166384 |
tctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcattttgaaaggcaaaacaattcatacaacattg |
42166285 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt |
727 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
42166284 |
aaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacactaatgtttgaaatt |
42166187 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 491 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 16647185 - 16646946
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| Q |
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589 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||||| || | | |||||| |||||||| || |
|
|
| T |
16647185 |
agttaactgccgaggaaatctaattatgcaggcagtgagctctgcatgattctaaaacatttccaagccattttccggccaatttttatctgtaattaaa |
16647086 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16647085 |
ccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactcagacataaa-aagataaatataatatcttttacgattgtccataattaaatcaa |
16646987 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16646986 |
accgacatttggtttaaattacacaaacgtttgaaattcat |
16646946 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 554 - 730
Target Start/End: Original strand, 2271479 - 2271656
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554 |
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652 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| ||||| | ||||| |||| |||| |
|
|
| T |
2271479 |
aagccttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaacttggacataaacaagataaa |
2271578 |
T |
 |
| Q |
653 |
atacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
2271579 |
atacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattagacaaacgtttaaaattcat |
2271656 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 530 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9473921 - 9473720
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629 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | || | |||||||||| |
|
|
| T |
9473921 |
tctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagatcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattg |
9473822 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattca |
729 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9473821 |
aaactcggacataaacaatataaatacaatatctattacaattatccataattaaatcaaaccgacatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattca |
9473722 |
T |
 |
| Q |
730 |
tt |
731 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
9473721 |
tt |
9473720 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 530 - 727
Target Start/End: Original strand, 52387900 - 52388097
Alignment:
| Q |
530 |
tctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacattt |
629 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |
|
|
| T |
52387900 |
tctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaggcaaaccaattcatacaacattg |
52387999 |
T |
 |
| Q |
630 |
aaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt |
727 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
52388000 |
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52388097 |
T |
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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 489 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14403010 - 14402808
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586 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14403010 |
gtagttaactgccgaggaaaactgattatgca-acagtgagttctgcataattctaaa-catttccaaaccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
14402913 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14402912 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
14402813 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaac |
691 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
14402812 |
taaac |
14402808 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 491 - 635
Target Start/End: Original strand, 2743459 - 2743603
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| Q |
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
2743459 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggt-ctgcataaatgtaaa-catttcgaagccattttttcggccagtttttacttgtaattaa |
2743556 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactc |
635 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
2743557 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactc |
2743603 |
T |
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Target: chr3; HSP #31
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| Q |
666 |
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735 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2743678 |
tacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaat |
2743747 |
T |
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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
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| Q |
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
4004905 |
gtagttaactgccgaggaaatctgat-tgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagcattttttcggccagtttttacatgtaattaa |
4005003 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactc |
635 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | || | |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4005004 |
accagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaacattgaaactc |
4005050 |
T |
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Target: chr3; HSP #33
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| Q |
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456 |
Q |
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|||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |
|
|
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43568860 |
gaaaattgttgttgacacattttataaggctgagaaacacgagtaaaatacgcttttg |
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T |
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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51402534 |
aattgatgttgacacatttcatatggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
51402480 |
T |
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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
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| Q |
404 |
attgttgttgacacatttcataagctg-agaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
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|
|||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42756097 |
attgttgttgacacatttgataaggttcagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
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T |
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Target: chr3; HSP #36
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471 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
45101988 |
ggaaaattgttgtcgacacatttcataaggttgaggcacataagtaaaatacgtttttatcccctcggcagtta |
45101915 |
T |
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Target: chr3; HSP #37
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471 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
66835 |
gaaaactgttgttgacacatttgataaggctgagacacacgagtaaaatacgcttttgccccctcggcagtta |
66907 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7839515 |
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T |
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Target: chr3; HSP #39
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgt |
457 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
34722221 |
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T |
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11380378 |
aattgttgttgacacatttggttaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
11380432 |
T |
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aattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcag |
468 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
44227066 |
aattgttgttcacacatttgataagactgaggaacacgagtaaaatacgattttgcccccacggcag |
44227132 |
T |
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Target: chr3; HSP #43
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471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |
|
|
| T |
2433079 |
aattgttgttgacacattgcataaggctgaggcacacgagtaaaatacgcttttatcccctcggcagtta |
2433010 |
T |
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gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
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gaaaattgttgttgacatatttcataaggctgaggcacataagtaaaatacgattttg |
29918423 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 29967633 - 29967576
Alignment:
| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
29967633 |
gaaaattgttgttgacatatttcataaggctgaggcacataagtaaaatacgattttg |
29967576 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 493 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 43377302 - 43376848
Alignment:
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592 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43377302 |
ttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctacataattctaaagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaacca |
43377203 |
T |
 |
| Q |
593 |
gagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaacc |
692 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43377202 |
gagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatgaaacc |
43377103 |
T |
 |
| Q |
693 |
gacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
43377102 |
gaaatttggttcaagttacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccttaattaagtgtccata-attaaacaactcattacacatcat |
43377004 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
43377003 |
taaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatctgacg |
43376904 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
|
|| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
43376903 |
tcactatcgtcgcgaataaaccaatgcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
43376848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 501 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 4867804 - 4867394
Alignment:
| Q |
501 |
cgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcattt |
600 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4867804 |
cgaggaaaacaactatgcagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaagccattttttggccagtttttacttgtaattaaactagagcattt |
4867705 |
T |
 |
| Q |
601 |
ccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttg |
700 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
4867704 |
ccaaaggcaatataactcatacaacatttaaactcagtcataaacaagaaaaatacaatatctttcaccattgtccataattaaatcaaaccaacatttg |
4867605 |
T |
 |
| Q |
701 |
gttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccc |
800 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4867604 |
atttaaaatacacaaaagtttgaaattcatcaaaacattacatagtctccataattaaacaacagattacaactcattacttatcattaaattaaatccc |
4867505 |
T |
 |
| Q |
801 |
tacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgc |
900 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |
|
|
| T |
4867504 |
tacttacattcaacgcaattggatatggaacgaacatacgtatataatatattattttccaccataatccgaaacataaatccgacgtcgttatcatctc |
4867405 |
T |
 |
| Q |
901 |
aaataagccaa |
911 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
4867404 |
gaataagccaa |
4867394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 500 - 944
Target Start/End: Original strand, 2124248 - 2124698
Alignment:
| Q |
500 |
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596 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||| | | |||||||||| ||| | ||||||||| |
|
|
| T |
2124248 |
ccgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctaatgcatttccaagccatttttcggccactttttacctggaatatttaaaccagagc |
2124347 |
T |
 |
| Q |
597 |
atttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgaca |
696 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2124348 |
atttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatataatatcttttacagttgtccatagttaaatcaaaccgaca |
2124447 |
T |
 |
| Q |
697 |
tttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa---acaacacatt--acaactcattacacatcattaaa |
791 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2124448 |
tttggttcaaattacacaaacatttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaagtgtccata-attaaacaactcattacacatcattaaa |
2124546 |
T |
 |
| Q |
792 |
ttaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgc |
891 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
2124547 |
ttaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaaaatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccaaagtcgc |
2124646 |
T |
 |
| Q |
892 |
tatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattc |
944 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2124647 |
tattgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
2124698 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 647 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 7172182 - 7171882
Alignment:
| Q |
647 |
agtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagt |
746 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7172182 |
agtaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaacccacattttgttcaaaatacacaaaagtttgaaattcatgaaaacgttacatagt |
7172083 |
T |
 |
| Q |
747 |
gtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
846 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7172082 |
gtccataattaaacaacacattacaactcagtacacatcattaaattaaatctctacttacattcaatgcaattgcatatggaacgaacatacatatata |
7171983 |
T |
 |
| Q |
847 |
acatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcat |
946 |
Q |
| |
|
| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7171982 |
atatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgccattttcca-tgcgtattcat |
7171884 |
T |
 |
| Q |
947 |
ct |
948 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
7171883 |
ct |
7171882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 39518 - 39965
Alignment:
| Q |
491 |
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39518 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaattaa |
39616 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| || ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39617 |
accagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaacctcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
39716 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
39717 |
aaccgacatttggttaaaattaaacaaacatttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaa----------ctcattacacatcatt |
39806 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
39807 |
aaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacat |
39906 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||| |||| || ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39907 |
cgccgtcgttgcgaataagcaaagacatatagcttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
39965 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Original strand, 35962368 - 35962815
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
35962368 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcaggcagtgggttctgcataattctaaa-cattttcaagccattttttcggccaatttttacgtgtaattat |
35962466 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
35962467 |
accagagtattacaaaaggcaaaataattcatacaacattaaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatta |
35962566 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
35962567 |
aaccgaaatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgt----gcataattaa------acaactcattgcacatcatt |
35962656 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35962657 |
aaattaaattcctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacgtatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
35962756 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35962757 |
cgctatcgtcgcgaataagccaaggcatatagcttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
35962815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 43679456 - 43679904
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||||||| || ||||||| | ||| ||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
43679456 |
gtagttaactgccgaagaaaataattatacagacagtgggttttgcataattctaaagcatttccaaatcattttttggctaatttttacatgtaattaa |
43679555 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43679556 |
accaaaatatttccaaaggcaatataaatcatacaaaattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
43679655 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatt |
788 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43679656 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtgttcataattaa----------acaactcattacacatcatt |
43679745 |
T |
 |
| Q |
789 |
aaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgt |
888 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
43679746 |
atattaaatccctgcttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgacgt |
43679845 |
T |
 |
| Q |
889 |
cgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
43679846 |
ctctatcgtctttaataagtcaaggcatataacttgtcgttttcca-tgcgtgttcatct |
43679904 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 496 - 948
Target Start/End: Original strand, 23924032 - 23924473
Alignment:
| Q |
496 |
actgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccaga |
594 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
23924032 |
actgccgaggaaaactgattatgcagacaatggattatgcataattctaaa-cattttcaagccatttttcggtcagtttttacctgtaattaaactaga |
23924130 |
T |
 |
| Q |
595 |
gcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccga |
694 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| | ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
23924131 |
gcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaaaaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccga |
23924230 |
T |
 |
| Q |
695 |
catttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaatta |
794 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23924231 |
catttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaa----------ctcattacacatcattaaatta |
23924320 |
T |
 |
| Q |
795 |
aatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctat |
894 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
23924321 |
aatccctacttacattcaacgcaactgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgt |
23924420 |
T |
 |
| Q |
895 |
cgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23924421 |
cgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
23924473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 31960075 - 31959612
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
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Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31960075 |
gtagtaaactgtcgaggaaaactgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaa-catttgcaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
31959977 |
T |
 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
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Q |
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| T |
31959976 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatataagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcatgattaaat |
31959877 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa---caacacatta--caactcattaca |
781 |
Q |
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| T |
31959876 |
taaacccacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaattgtccata-attaaacaactcattaca |
31959778 |
T |
 |
| Q |
782 |
catcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaat |
881 |
Q |
| |
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| T |
31959777 |
catcattaaattaaatccatacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccaaaacataaat |
31959678 |
T |
 |
| Q |
882 |
ccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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31959677 |
ccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
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Target Start/End: Complemental strand, 27237773 - 27237570
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Q |
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ttctttgcacccaaatggtataatatgcttttagacattctttaatttgcacaaaattattggttatatttgtctatatacattatgtgatatgatattt |
27237674 |
T |
 |
| Q |
108 |
gtgaaggtcacaagttgcaatttgaaacgttgcagcttcttatttatccaaaactataattctatttgatcacgaggacaaaataactcgtcccatgaac |
207 |
Q |
| |
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| T |
27237673 |
gtgaaggtcacaagttgcaatttgaaacgttgcagcttcttatttatccaaaactataattctatttgatcacgacgacaaaataacttgtcccatgaac |
27237574 |
T |
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| Q |
208 |
ttat |
211 |
Q |
| |
|
|||| |
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27237573 |
ttat |
27237570 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 7344569 - 7344121
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Q |
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agttaactgccgaggaaatttgattatgcagacagcaggttctgcataattct-aagtatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaa |
7344471 |
T |
 |
| Q |
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ccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
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| T |
7344470 |
ccagagcatttccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatt |
7344371 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
| |
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| T |
7344370 |
aaaccgacatttggttaaaattaaatagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcat |
7344281 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
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| T |
7344280 |
taaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
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T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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| || ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
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ttgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 529 - 948
Target Start/End: Original strand, 30301233 - 30301643
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Q |
| |
|
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T |
 |
| Q |
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atttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaa |
725 |
Q |
| |
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| T |
30301332 |
attgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaa |
30301431 |
T |
 |
| Q |
726 |
ttcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcata |
825 |
Q |
| |
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| T |
30301432 |
ttcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacata |
30301521 |
T |
 |
| Q |
826 |
tggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgc |
925 |
Q |
| |
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| T |
30301522 |
tggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgc |
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T |
 |
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926 |
cgttttccattgcgtattcatct |
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Q |
| |
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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 638 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 22588306 - 22588007
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Q |
| |
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tcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattatccataattaaatcaaaccgacattaggttcaaattacacaaacgtttgaaattgatcaaaacg |
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T |
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837 |
Q |
| |
|
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|
| T |
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22588117 |
T |
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| Q |
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acatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattg |
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Q |
| |
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acatatataatatattatcttccaccatatttcaaaacataaatccgacgtcgctatcgtcttcaattagccaagacatatagcttgccgttttcca-tg |
22588018 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 503 - 852
Target Start/End: Original strand, 39751134 - 39751473
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Q |
| |
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|
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T |
 |
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aaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggt |
702 |
Q |
| |
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aaagacaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaccaagaaaaatacaatatcttttacagttgtccgtaattaaatcaaactgacatttggt |
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T |
 |
| Q |
703 |
tcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatcccta |
802 |
Q |
| |
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39751334 |
tcaaattacacaaacgtttgaaattcatcaaaacgttacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcattaaattaaatcccta |
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T |
 |
| Q |
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cttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatat |
852 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
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cttacattcaacgtaattgcatatggaacgaacatacatatataatatat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
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Target Start/End: Original strand, 32375710 - 32376160
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|
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T |
 |
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taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
684 |
Q |
| |
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| T |
32375809 |
aaaccagagcatt-ccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcgaacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaa |
32375907 |
T |
 |
| Q |
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atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
| |
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|| ||| |||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
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attaaatcgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacat |
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T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32375998 |
cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacatacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
32376097 |
T |
 |
| Q |
885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
32376098 |
acgtcgccatcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgtttccca-tgcgtattcatct |
32376160 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 8419463 - 8419913
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586 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || | |||||||| |||||||| |
|
|
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gtagttaactgccgaggaaatttgattatgcagacaataagttctgcataattct-aagtatttccaagccattttttcggccagtttttatctgtaatt |
8419561 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatac--aacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaa |
684 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8419562 |
aaaccagagcatt-ccaaaggtaatataattcatatgtatgattgaaactcggacataatgaagataaatacaatatcttttacaattgttaataattaa |
8419660 |
T |
 |
| Q |
685 |
atcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacat |
784 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |
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| T |
8419661 |
attaaaccgacatttggttaaaattaaacagacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacat |
8419750 |
T |
 |
| Q |
785 |
cattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccg |
884 |
Q |
| |
|
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|
| T |
8419751 |
cattaaattaaatccctacttacattcaatgcaattacatatggaacgaacgtacatatataatatattgtcttccaccatattccgaaacataaatccg |
8419850 |
T |
 |
| Q |
885 |
acgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8419851 |
acgtcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 570 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 22661506 - 22661139
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| |
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|
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22661407 |
T |
 |
| Q |
670 |
attgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacatta |
769 |
Q |
| |
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| T |
22661406 |
gttgtccataattaaatcaaaccgatatttcgttaaaattacacgaatgtttgagattcatcaaaacattaaagagtgtccataattaaacaacacatta |
22661307 |
T |
 |
| Q |
770 |
caactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattc |
869 |
Q |
| |
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| T |
22661306 |
cat----------atcgttaaattaaatctctactgacattctgcgcagttgcatatggaacgaacatacatatataatatatcatcttccaccatattc |
22661217 |
T |
 |
| Q |
870 |
cgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22661216 |
cgaaacatagacccgacgtcgctatcgtcgtgaataagccaaggcatatggcttgccgttttcca-tgcatattcatct |
22661139 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 491 - 700
Target Start/End: Original strand, 23578496 - 23578705
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Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |
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23578595 |
T |
 |
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cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaa |
690 |
Q |
| |
|
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| T |
23578596 |
cagagcatttccaaaggcaatataaattatacaacattgaaactctgtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatcaaa |
23578695 |
T |
 |
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ccgacatttg |
700 |
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| |
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23578696 |
ccgacatttg |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 491 - 833
Target Start/End: Complemental strand, 20549270 - 20548938
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agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaa |
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Q |
| |
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20549270 |
agttaactaccgaggaaaactgattatgcagacagcaagttctgcataattctaaa-catttccaagccatcattcggccagtttttacctgtaattaaa |
20549172 |
T |
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| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaa |
689 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20549171 |
ccagagcatttccaaagacaaaataattcatacaagattgaaactcggatataaacaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaattaa |
20549072 |
T |
 |
| Q |
690 |
accgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcatta |
789 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20549071 |
accgaaatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatcatta |
20548982 |
T |
 |
| Q |
790 |
aattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacga |
833 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20548981 |
aattaaatccttacttacattcaacgcaattgcatatggaacga |
20548938 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 491 - 727
Target Start/End: Original strand, 41743925 - 41744162
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| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaac-aattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
41743925 |
agttaactgccgaagaaaactaattatgcagacagtgggttctgcataatt-ttaaacatttccaagccattttttcggccagtttttacatgtaattaa |
41744023 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
41744024 |
accagagcatttccaaaggcaaaataatttatacaagattgaaactcgaacataaacaagataaatacaatattttttacaattgtccatgattaaatta |
41744123 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaatt |
727 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41744124 |
aaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaatt |
41744162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 776 - 948
Target Start/End: Original strand, 41744160 - 41744331
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776 |
attacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaac |
875 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41744160 |
attacacatcattaaattaagtccctacttacattcaacgcaattgcatatggagcgaatatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaat |
41744259 |
T |
 |
| Q |
876 |
ataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41744260 |
ataaatccgacgtcgctatcgtcatgaataagccaaggcatataacttgtcgttttcca-tgcgtattcatct |
41744331 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 489 - 730
Target Start/End: Original strand, 34366970 - 34367212
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattt |
587 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34366970 |
gtagttaactgccgatgaaatctgattatgcaggcagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaagccttttttcggccagtttttacctgtaatta |
34367069 |
T |
 |
| Q |
588 |
aaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatc |
687 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||| | || | ||||| |||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34367070 |
aaccagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacagcattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatc |
34367169 |
T |
 |
| Q |
688 |
aaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34367170 |
aaaccgacattttgttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
34367212 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 493 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 7172623 - 7172463
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| Q |
493 |
ttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagttttt--acctgtaatttaa |
589 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||| || |||||| || ||||||| || |
|
|
| T |
7172623 |
ttaactgccgagaaaaactgattatgcagacagtggcttctgcataattctaaagcatttccaagccgtttttcaacctgtttttttacttgtaattaaa |
7172524 |
T |
 |
| Q |
590 |
ccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagta |
650 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
7172523 |
ccagagcattttcaaaggcaatataacttatacaacatttaaacttagtcataaacaagta |
7172463 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 570 - 730
Target Start/End: Original strand, 41238989 - 41239149
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| Q |
570 |
agtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttaca |
669 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||| |||| | |||||||||| || ||| | ||||| |||| |||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
41238989 |
agttttaacctgtaattaaagcagagcatttcgaaatgcaaaataattcatacaacattgaatctcggacataaacaagacaaatacaatatcttttaca |
41239088 |
T |
 |
| Q |
670 |
attgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41239089 |
attgttcataattaaatcaaaccgacatttgattcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
41239149 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 844 - 944
Target Start/End: Original strand, 39751659 - 39751758
Alignment:
| Q |
844 |
ataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtatt |
943 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
39751659 |
ataatatattatcttctaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaagacatatagtttgccgttttcca-tgcgtatt |
39751757 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 241 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 27237573 - 27237408
Alignment:
| Q |
241 |
ttatgatcaagtgattaagcatgtgcaatttaatgtcgccacaaagagtgctgttcctatat-----gtcccc--caccaaaattaaa--gtcttcgcac |
331 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | | || ||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
27237573 |
ttatgatcaagtgattaagcatgtgcaatttaatgtcgccacaaagagtgatgttgtcaaaacagaaggccagttcaccaaaattaaaaagtcttggcac |
27237474 |
T |
 |
| Q |
332 |
tttgtttgaagttgtgaacaagttctacaagtaacttcactattgtcttgattagaagtttatgttt |
398 |
Q |
| |
|
|| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27237473 |
tt-gtctgaagttgtgaacaagttctacaagtaacttcactattgtcttgattaaaagtttatgttt |
27237408 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 595 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 30972781 - 30972595
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| Q |
595 |
gcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccga |
694 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||| | | |
|
|
| T |
30972781 |
gcattttcagaggcaatacaactcatacatcatttatactcagtcataaacaagaaaaatacattatcttttacggttgtcgataattaaatcaattcaa |
30972682 |
T |
 |
| Q |
695 |
catttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattaca |
781 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||| | ||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30972681 |
catttcgttaaaattacacgaatgtttgaaattcatcaaaacattacagagtatacataattaaacaacacattacacatcattaca |
30972595 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 730
Target Start/End: Original strand, 31280953 - 31281113
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| Q |
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671 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||| ||||| |||||| | || ||||||| |||| | |||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
31280953 |
tttttacctgtaattcaaccagagcatttccagagacaatacaactcatacaccatttataatcggtcataaacaagaacaatacataatcttttacaat |
31281052 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaa--atacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
31281053 |
tgactgtaattaaatcaatctgacatttcgttaaaattttacacgaatgtttgaaattcat |
31281113 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 491 - 610
Target Start/End: Complemental strand, 1116226 - 1116107
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| Q |
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agttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | || || ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||| | |
|
|
| T |
1116226 |
agttaactgccgagaaaaactgattatgcagacagagggttctgcataattctaaa-caattccaagccattttttcggccagtttt-acctgtaattaa |
1116129 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaa |
610 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1116128 |
accagagcatttccaaaggcaa |
1116107 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 696
Target Start/End: Complemental strand, 29807168 - 29807044
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| Q |
572 |
tttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaat |
671 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| | | |||||||| |||| | | |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
29807168 |
tttttacctgtaattcaaccatagcatttccagaggcaatacaactcatacactatttataataagtcataaacaagaacattacatgatcttttacaat |
29807069 |
T |
 |
| Q |
672 |
tgtccataattaaatcaaaccgaca |
696 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
29807068 |
tgttcataattaaatctatccgaca |
29807044 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 820 - 911
Target Start/End: Original strand, 31281193 - 31281282
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| Q |
820 |
tgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaa |
911 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
31281193 |
tgcagatggaacgaacataaagatataatatattatcttcaaccatattctgaaacataaatcctacgt--ctatcgtcacgaataagccaa |
31281282 |
T |
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Back To:
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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
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Target Start/End: Original strand, 41855306 - 41855359
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| Q |
404 |
attgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41855306 |
attgttgttgacacatttcatatggctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
41855359 |
T |
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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
41858257 |
aattgttgttgacacatttcatatggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
41858188 |
T |
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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40077386 |
aattgttgttgacacatttgataaggctgagaaacacgagtaaaatacgtttttg |
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T |
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataagct-gagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
| T |
5300684 |
aattgttgttgacacatttgataaggttgagaaacacgagtaaaatacgtttttgtcccctcgacagtta |
5300753 |
T |
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Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18441577 |
aattgttgttgacacatttcataaggctgagacacacaagtaaaatacgtttttgccccctcggcagtta |
18441508 |
T |
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Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
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| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataat |
539 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
29807241 |
agttaactgccgaggaaatcaattatacagacagtggcttctacataat |
29807193 |
T |
 |
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Target: chr8; HSP #38
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| Q |
401 |
aaaattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttc |
459 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42602395 |
aaaaatgttgttgacacgtttcatatggctgagaaacacgagtaaaatacatttttgttc |
42602454 |
T |
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| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgttttt |
455 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5304280 |
aattgttgttcacacatttgataaggctgaaaaacacgagtaaaatacgttttt |
5304227 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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| Q |
400 |
gaaaattgttgttgacacatttcataa-gctgagaaacatgagtaaaatacgtttttg |
456 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
7168022 |
gaaaattgttgttgacacatttcataaggctgaggcacacaagtaaaatacgattttg |
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T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcag |
520 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39277473 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcag |
39277444 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0494 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:
Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 491 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 5339 - 4891
Alignment:
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588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
5339 |
agttaactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaga-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaattaa |
5241 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
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|
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| T |
5240 |
accagagcatttccaaaggctaaataattcatacaagattgaaactcggtcataatcaagataaatacaatatcttttacaattgttcataattaaatta |
5141 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacattt-ggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcat |
787 |
Q |
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|
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| T |
5140 |
aaccgacattttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatgaaaacattacaaagtgtccataattaaactac----------tcattacacatcat |
5051 |
T |
 |
| Q |
788 |
taaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
887 |
Q |
| |
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|
|
| T |
5050 |
taaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacg |
4951 |
T |
 |
| Q |
888 |
tcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
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|||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
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| T |
4950 |
tcgccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
4891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 15969 - 15520
Alignment:
| Q |
489 |
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586 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15969 |
gtagttaacttccgaggaaaactgattatgcagacagtgagttctgcataattctaaa-catttctaagccatttgttcggccagtttttacctgtaatt |
15871 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15870 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
15771 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
| |
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|
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| T |
15770 |
taaaccgacatttagttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaaacaac----------tcattacacatca |
15681 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgac |
886 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15680 |
ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatattccgaaacataaatctgac |
15581 |
T |
 |
| Q |
887 |
gtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
15580 |
gtccccgtcgtcgcgaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tacgtattcatct |
15520 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0201 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:
Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 489 - 948
Target Start/End: Original strand, 22462 - 22922
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
586 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22462 |
gtagttaactgccgaggaaaactgattatgca--cagtgagttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccaatttttacctgtaatt |
22558 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22559 |
aaaccagagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcggacataatcaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
22658 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaa---caacacatta--caactcattaca |
781 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| || ||||| ||| ||||||||| ||| | ||||| ||||| ||| ||| | | | |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22659 |
taaaccgacatttggttaaaattaaacaaacgtt-gaaattcatcaaaacattacaaagtgttcataattaagtgtccata-attaaacaactcattaca |
22756 |
T |
 |
| Q |
782 |
catcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaat |
881 |
Q |
| |
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|
|
| T |
22757 |
catcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcaaatggaacgaacatacatatataatataatattttccaccatattctgaaacataaat |
22856 |
T |
 |
| Q |
882 |
ccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22857 |
ccgacgtcgccgtcgtcgcaaataagcaaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
22922 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:
Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 489 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 20126 - 19743
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaaca-attatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccattttt-cgactagtttttacctgtaatt |
586 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20126 |
gtagtttactgccgaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaagcatttccaagcttttttttcggtcagtttttacctgtaatt |
20027 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20026 |
aaaccagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaat |
19927 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataa----acaacacattacaactcattacac |
782 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||| || | ||| || | |||||||||| ||| |
|
|
| T |
19926 |
caaaccgacatttggttcaaattacacaaacgtttaaaattcatcaaaacgttacaaagtggccgtaattaagtgttcataattaaacaactcattgcac |
19827 |
T |
 |
| Q |
783 |
atcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccata |
866 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19826 |
atcattaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgagcatacatatataatatattatcttccaccata |
19743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 864 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 19582 - 19503
Alignment:
| Q |
864 |
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944 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19582 |
atattccgaaacataaatctgacgtcgctatcgtcgcgaataagccaaagcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattc |
19503 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 544 - 946
Target Start/End: Original strand, 21764 - 22144
Alignment:
| Q |
544 |
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643 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
21764 |
aagcatttctaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttccaaaagcaatataaatcatacaatattgaaactc-------- |
21855 |
T |
 |
| Q |
644 |
gcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacat |
743 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |
|
|
| T |
21856 |
----gaaaaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaattacacaaaagtttgaaattcatcaaaacgttaaaa |
21951 |
T |
 |
| Q |
744 |
agtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatat |
843 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21952 |
agtgtccataattaaacaacacattacaactcattacacatcattatattaaatccctacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatat |
22051 |
T |
 |
| Q |
844 |
ataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtatt |
943 |
Q |
| |
|
|| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22052 |
at---------ttttccaccatattccaaaacataaattcgacgtcgctattgtctttaataagccaagacatataacttgtcattttcca-tgcgtatt |
22141 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0513 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:
Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 489 - 842
Target Start/End: Original strand, 8258 - 8602
Alignment:
| Q |
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586 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8258 |
gtagttaactgccaaggaaaactgattatgcagacagtgggttctgcataattctaaa-catttccaagccattttttcggccagtttttacctgtaatt |
8356 |
T |
 |
| Q |
587 |
taaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaat |
686 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||| | ||||| |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
8357 |
aaaccaaagcatttccaaaggcaaaataattcatacaagattgaaactcgggcataatcaagataagtacaatatcttttacaattgttcataattaaat |
8456 |
T |
 |
| Q |
687 |
caaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcattaaatcgttacatagtgtccatgcataaacaacacattacaactcattacacatca |
786 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8457 |
taaaccaacatttggttaaaattaaacaaacgtttgaaattcatcaaaacattacaaagtgtccataattaa----------acaactcattacacatca |
8546 |
T |
 |
| Q |
787 |
ttaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata |
842 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8547 |
ttaaattaaatccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacata |
8602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0169 (Bit Score: 115; Significance: 6e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:
Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 491 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 1695 - 1517
Alignment:
| Q |
491 |
agttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaac |
590 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1695 |
agttaactgctgaggaaaacaattatgcagacagtgggttctgcataattctatagcatttccaagccatttttcggccagtttttacctgtaattaaac |
1596 |
T |
 |
| Q |
591 |
cagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttaca |
669 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1595 |
cagagcatttccaaaggcaatataaatcatacaacattgaaactcggtcataaacaagaaaaatacaatatcttttaca |
1517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 798 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 10978 - 10829
Alignment:
| Q |
798 |
ccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaacataaatccgacgtcgctatcgt |
897 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10978 |
ccctacttacattcaacgcaattgcatatggaacgaacatacaaatataatatattatcttccaccatattctgaaacataaatctgacgtcgctatcgt |
10879 |
T |
 |
| Q |
898 |
cgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10878 |
cacgaataagccaaggcatatagcttgctgttttcca-tgcgtattcatct |
10829 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 489 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 236248 - 236008
Alignment:
| Q |
489 |
gtagttaactgccgaggaaaacaattatgcagacagtggtttctgcataattgttaagcatttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaattta |
588 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||| | || |||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
236248 |
gtagttaactgccgaggaaatctgat-tgcagacagtgagctctgcatcattctaaaacatttccaaaccttttttcgaccagtttttacctgtaattaa |
236150 |
T |
 |
| Q |
589 |
accagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagcaagtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatca |
688 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | || | |||||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236149 |
accagagcatttcgaaaggcaaaacaattcatacaatattgaaactcagacataaacaagataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatca |
236050 |
T |
 |
| Q |
689 |
aaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
236049 |
aatcgacatttggttcaaattacacaaacgtttgaaattcat |
236008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0794 (Bit Score: 106; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0794
Description:
Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 775 - 948
Target Start/End: Complemental strand, 1488 - 1316
Alignment:
| Q |
775 |
cattacacatcattaaattaaatccctacttacatgcaacgcaattgcatatggaacgaacatacatatataacatattatcttccaccatattccgaaa |
874 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
1488 |
cattacacatcattatattaaatccatacttacattcatcacaattgcatatggaacgaacatacatatataatatattattttccaccatatttcaaaa |
1389 |
T |
 |
| Q |
875 |
cataaatccgacgtcgctatcgtcgcaaataagccaagccatatagcttgccgttttccattgcgtattcatct |
948 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1388 |
cataaatccgacgtcgctattgtctttaataagtcaaggcatatagcttgccgttttcca-tgcgtattcatct |
1316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0199 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:
Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 547 - 730
Target Start/End: Original strand, 12521 - 12704
Alignment:
| Q |
547 |
catttcaaagccatttttcgactagtttttacctgtaatttaaccagagcatttccaaaggcaatataacttatacaacatttaaactcagtcataagca |
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Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | || | |||||||||| |||||| | ||||| || |
|
|
| T |
12521 |
catttccaagccttttttcggccagtttttacctgtaattaaaccagagcatttcgaaaagcaaaacaattcatacaacattgaaactcggacataaaca |
12620 |
T |
 |
| Q |
647 |
agtaaaatacaatatcatttacaattgtccataattaaatcaaaccgacatttggttcaaaatacacaaaagtttgaaattcat |
730 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12621 |
agataaatacaatatcttttacaattgtccataattaaatcaaaccgacattttgtttaaattacacaaacgtttaaaattcat |
12704 |
T |
 |
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Target: scaffold1379 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1379
Description:
Target: scaffold1379; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 501
Alignment:
| Q |
403 |
aattgttgttgacacatttcataag-ctgagaaacatgagtaaaatacgtttttgttcccacggcagtta |
471 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |
|
|
| T |
570 |
aattgatgtttacacatttgataagactgagaaacacgagtaaaatacgattttgctccctcggcagtta |
501 |
T |
 |
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